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Unités d`Enseignement

1. Equipe p dagogique Laurent Bergonzini C cile Quantin Pierre Lahitte Fanny XXXX Claire Damesin Universit Paris Sud 11 10 11 2004 143
2. D finition de fossile processus de fossilisation _ Bioc nose et Thanatoc nose autochtonie et allochtonie remaniements Pal o cologie les fossiles indicateurs des environnements du pass fossiles de faci s Pal obiog ographie les fossiles indicateurs pal og ographiques migrations migrations dispersions volution micro et macro volution extinctions th ories volutives PALEONTOLOGIE SYSTEMATIQUE Les invert br s origine et plans d organisation majeurs Pr sentation des principaux groupes syst matiques et leur volution Introduction la micropal ontologie R f rences biblio Raymond Enay Pal ontologie des invert br s Edition Dunod pages 233 Gerard Bignot Introduction la Micropal ontologie Paris France Editions des Archives Contemporaines 2001 Soft Cover 2 Objectif Ce module a pour objectif la d couverte de l piderme de la Terre que constituent les formations superficielles incluant les sols observ es quasiment partout mais g n ralement peu tudi es voire oubli es en g ologie Contenu Les notions d autochtonie et d allochtonie qui sont fondamentales pour comprendre l origine et le devenir des formations superficielles seront tout d abord abord es Les grands types de formations superficielles seront ensuite tudi es en fonction de leur relation avec le substrat 1 alt rites et sols pour les formations autochtones processus d alt ration redistribut
3. TP de 3h TP 1 Un g ne une prot ine l exemple de l h moglobine TP 2 Les pigments de l il de la Drosophile chez diff rents mutants TP 3 Microbiologie r sistance aux antibiotiques chez les bact ries crible mutag n se UV TP 4 Les groupes sanguins TP 5 Polymorphisme v g tal vu par des zymogrammes Travail en ateliers sur diff rents th mes avec recherches bibliographiques Les caract res et les g nes histoire et exercices L origine du polymorphisme Les techniques de microbiologie Les trois conditions des tudes de Mendel et les 3 lois de Mendel Le brassage g n tique li la sexualit Biotechnologies les ferments du lait du pain de la bi re L innovation g n tique transg n se Les organismes mod les en g n tique Le paradoxe de l ADN L ADN pour identifier des membres d une famille ou pour identifier des criminels 10 Le g ne objet ou information 11 Les chromosomes en mitose et m iose I ON LU R D Equipe p dagogique E Espagne MC A Hua Van MC J Girard Bascou MC P Uguen MC F Agn s MC C Lefebvre MC A Boivin MC M Heude MC A Helbling MC Universit Paris Sud 11 10 11 2004 26 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Formation pratique en biotechnologie Biol L1S2 Responsables Robert AUFRERE et Gilles HENCKES UE de d couvert obligatoire pour le cursus Biotechnol
4. TDS test de compl mentation fonctionnelle chez procaryotes et eucaryotes TD6 cartographies simples TD7 transg n se procaryotes et eucaryotes TD8 pedigrees humains TD9 histoire de g nes bact riens TD10 histoire du g ne Master de l il de la drosophile Equipe p dagogique P H Gouyon PR D Coen PR A Sainsard Chanet PR C Astier PR J Girard Bascou MC E Espagne MC A Hua Van MC P Uguen MC A Boivin MC F Agn s MC C Lefebvre MC A Helbling MC M Heude MC Universit Paris Sud 11 10 11 2004 14 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Introduction aux mol cules organiques Chim 151 L1S2 Responsables Christian Girard U E obligatoire Objectifs Description et repr sentation des mol cules en chimie organique D termination de la structure des compos s organiques par spectroscopie Effets lectroniques Volume horaire Total 50 CM 19h TD 19h TP 12h Pr requis Architecture de la mati re de l atome au solide R sum Isom rie de constitution Introduction la nomenclature des compos s organiques St r oisom rie Conformation des compos s acycliques et cycliques cas du cyclohexane Structures chirales nantiom rie Activit optique et rotation sp cifique Configuration absolue R et S Diast r oisom rie Alc nes Z et E Introduction la d termination de la structure des compos s or
5. action des phytohormones TP Pratique des greffes en embryologie exp rimentale chez le X nope 2 s ances quipe p dagogique Responsables Maurice Wegnez et Martin Kreis Responsable TP TD H l ne Courvoisier Autres enseignants Fran ois Agnes Odile Bronchain Laurent Coutte Marianne Delarue Yves Deveaux Aur lie Hua Van Dani le Marchal Fanny Rybak Universit Paris Sud 11 10 11 2004 55 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Ecologie et Biologie quantitative des populations Biol 211 L2S4 Responsable Claire Lavigne U E au choix Objectifs L objectif d un enseignement d Ecologie et Biologie quantitative des populations est mixte Il permettra d abord de faire d couvrir ces disciplines aux tudiants Les tudiants qui ne se dirigent pas vers le parcours de L3 Biologie des organismes et des Ecosyst mes auront ainsi un minimum de connaissances du domaine afin de pouvoir d crypter l information disponible des m dias catastrophes cologiques biodiversit Ce cours sera en outre un pr requis au parcours de L3 Biologie des organismes et des Ecosyst mes La notion de changement d chelle du comportement des individus au fonctionnement des cosyst mes servira de guide tout le long du cours Volume horaire Total 50 CM 30 TD 20 Plan des enseignements CM Introduction l cologie les grandes tapes dans la reconnaissance de l
6. c Hydrostatique atmosph re terrestre et Hydrodynamique Bernoulli d L origine mol culaire de la Pression et de la Temp rature Commentaires Les TP illustrent les principes de l optique Prerequis ma trise des concepts math matiques de base d riv e vecteur fonctions trigonom triques Volume horaire Total 50 CM 21h TD 21h TP 8h Equipe p dagogique R Parentani Universit Paris Sud 11 10 11 2004 16 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Physique g n rale Phys L1S2 Responsable E VELU UE au choix conseill e au cursus bioconcours Objectifs et programme Pr paration au concours B ENSA acquisition des connaissances pr requises pour l entr e dans les coles agronomiques M canique du point nergies cin tique potentielle m canique quilibres Th or mes de l nergie cin tique de l nergie m canique M canique des syst mes moment d une force quilibre d un solide Forces int rieures et ext rieures nergies cin tique potentielle interne m canique Chocs conservation de la quantit de mouvement choc lastique frontal choc mou lectrostatique charges ponctuelles champ et potentiel lectriques Champ uniforme Dip les dip le dans un champ lectrique Conducteurs en quilibre condensateur plan Ph nom nes de transport courant lectrique loi d Ohm effet Joule lois de Kirchhoff Diffusion mol culaire
7. travail de TD par trin me en grands groupes avec co encadrement fiche hebdomadaire de suivi de travail par trin me Ouvrages de r f rence Il n y a pas d ouvrage de r f rence particulier Des r f rences sont indiqu es dans les dossiers et l tudiant pourra consulter les ouvrages g n raux du fond histoire des sciences de la Biblioth que universitaire Equipe p dagogique H l ne Gispert Universit Paris Sud 11 10 11 2004 142 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 STAGE PIURIDISCIPLINAIRE GEOLOGIE ET BIOLOGIE Geos 32B L3S6 Responsable L Bergonzini U E au choix parcours BOE Biologie int grative Titre Stage Naturaliste de biologie g n rale et de sciences de la Terre sur le terrain Objectif Ce module a pour objectif d tudier et de faire d couvrir sur le terrain les objets g ologiques et biologiques dans leurs environnements Ce module a aussi comme objectif d illustrer les enseignements th oriques Contenu 8 jours de stage dans le Cotentin e Pr sentation de roches magmatiques plutonique et volcanique s dimentaires s rie pal ozo que secondaire et quaternaire et m tamorphiques de contact et r gional ainsi que leurs relations structurales e Lecture des enregistrements s dimentaires et reconstitution des environnements Pr requis bases de G ologie 1 et 2 ann es Commentaires LIMITE A 30 ETUDIANTS Responsable L Bergonzini
8. C HULEUX C DREUX Encadrement par intervenants ext rieurs Universit Paris Sud 11 10 11 2004 79 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Semestre 5 Parcours Biologie mol culaire et cellulaire BMC Biologie humaine et sant BHS Biolnformatique et BioStatistiques BIBS et Biologie et Chimie BCH UE type Titre ID Parcours ECTS la UEF Biologie mol culaire Biol300 BMC BHS 5 BIBS 2a UEF Biologie structurale prot ines et acides nucl iques Biol301 BMC BHS 5 BIBS BCH 3a UEF Biochimie m tabolisme nerg tique Biol302 BMC BHS 5 BIBS BCH 3b UEF Chimie orga g n rale et analyse structurale Chim351 BCH 5 4a UEF Formation pratique Biochimie Biologie Mol culaire Biol303 BMC BHS 5 BIBS 4b UEF Chimie orga de synth se 1 Chim352 BCH 5 Sa UEC Chimie organique exp rimentale Chim312b BMC BCH 5 5b 1 UEC Les ondes en biologie PhysB301 BMC BHS 5 5b 2 UEC Physique des syst mes biologiques PhysB352 BMC 5 5c UEC Cha nes de Markov Math390 BMC BIBS 5 5d UEC Analyse des s quences g nomiques Biol344 BMC 5 BIBS en S6 5e UEC Chimie th rapeutique Biol BHS 5 5f UEC Pharmacotechnie Biol BHS 2 5 6a UEO libre BMC BIBS 5 6b UEC Microbiologie clinique Biol BHS 5 6c UEO Sant et Travail Biol345 BHS 5 6d UEC Pharmacom trie Pharmacologie mol culai
9. Contenu des enseignements Travaux pratiques 24 h Etude des fonctions cardiaque respiratoire et musculaire Etude lectrophysiologique de l activit cardiaque lectrocardiographie Adaptation des fonctions cardiaque et respiratoire l effort Histophysiologie des tissus pulmonaires et vasculaires Neurophysiologie Etude du r flexe myotatique Endocrinologie R gulation hormonale de la glyc mie Digestion Analyse nutritionnelle Effet de l acide ursod oxycholique sur le flux biliaire Travaux dirig s 18 h Fonctions cardiaque respiratoire et musculaire Introduction aux techniques d enregistrement lectrocardiographique et lectromyographique Potentiel d action et conductances ioniques Etude des activit s lectrique et m canique du c ur Contr le et modulation de la respiration Fibre pel e Endocrinologie Histophysiologie des glandes endocrines R cepteurs hormonaux et pathologies Digestion Fonction h patique Enseignement int gr 8 h Neurophysiologie M thodes anatomiques d tude du syst me nerveux central M thodes lectrophysiologiques d tude du syst me nerveux central Enseignants D GRIPOIS MC UPS L MERY MC UPS C RAMPON MC UPS Universit Paris Sud 11 10 11 2004 122 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Travaux pratiques en physiologie v g tale Biol 327 L3S6 Responsable Aline MAHE U E au cho
10. Line Duportets Alain Louveaux Dani le Marchal Sophie Nadot et des intervenants ext rieurs IRD CNRS et INRA Universit Paris Sud 11 10 11 2004 24 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Biotechnologies Bio industries Biol 176 L1S2 Responsables Robert AUFRERE Gilles HENCKES UE de d couverte Objectif D couvrir les diff rentes activit s et les diff rents m tiers dans les bio industries au travers d exemples concrets Pr paration des tudiants au DEUST de Biotechnologies et la Licence professionnelle de Biologie Appliqu e l entreprise Volume horaire Total 50h CM 10h TD 40h Programme Etude de filli res produits et proc d s des bio industries Etude de diff rentes fonctions et diff rents postes dans les bio industries Projet personnel tude de cas recherche d un contrat d apprentissage Moyens Conf rences Visite d entreprises TD et ateliers Travaux personnels Equipe p dagogique Robert AUFRERE Gilles HENCKES Universit Paris Sud 11 10 11 2004 25 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 G nes Mutants et Mutations Biol 177 L1 S2 Responsable Eric Espagne Aur lie Hua Van UE de d couverte Objectifs Introduire et discuter les notions de g nes mutants et mutations chez divers organismes Volume horaire Total 50h CM 5h TD 10h TP 35h Plan des enseignements
11. Sant mention Biologie annexe 1 Histoire des sciences HSci203 L3S6 Responsables H l ne Gispert U E de d couverte parcours BOE ecologie Objectifs L objectif de cet enseignement est de conduire tous les tudiants exercer leur r flexion sur les sciences en s appuyant sur leur histoire On cherchera faire saisir les dynamiques au cours de l histoire de la construction des savoirs et des pratiques scientifiques leurs enjeux tant pist mologiques que sociaux tout en tant attentifs la r sonance contemporaine d un tel enseignement Cela conduit recourir une maquette qui permette d engager effectivement les tudiants dans une telle r flexion critique celle ci combinera enseignements magistraux et conduite en TD d un projet de r alisation de poster sur un sujet donn Pr requis aucun R sum Cours magistraux I Grands moments grandes ruptures en histoire des sciences Antiquit Babylone Egypte Gr ce Monde arabe XVIIe et R volution scientifique Travail sur dossier avec finalisation poster en s ances de TD sur un dossier propos par les enseignants relevant d un des 4 th mes r volution scientifique et rupture pist mologique interactions entre disciplines acteurs et institutions exp riences et instrumentation Cours magistraux II Retour sur l histoire de champs disciplinaires questions pist mologiques Aide la r ussite aide au travail universitaire
12. Universit Paris Sud 11 10 11 2004 106 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 PETROLOGIE ENDOGENE ET TECTONIQUE Geos31B L2S5 Responsables Denis SOREL et Bernard PLATEVOET U E au choix pour parcours BOE Biologie int grative Objectif Notions de contraintes et d formations Tectonique cassante et ductile Plis et failles Tectonique et carte g ologique Pr senter les principales disciplines de la p trologie endog ne Donner des tudiants non g ologues pour la plupart une synth se la plus compl te possible sur les manifestations et l origine des processus magmatiques et m tamorphiques terrestres Volume horaire Total 50 CM 25h TD 10h TP 15h deux semaines de formation de type enseignement int gr Contenu S ances d enseignement int gr pr sentant cours et TDTP Cours Contraintes D formation ductile cassante Les plis les failles les charriages types et datation la composition et les propri t s des magmas la cristallisation et l volution des magmas la production des magmas le m tamorphisme principes et grands types de m tamorphisme TP TD Expression cartographique de la tectonique carte topographique carte g ologique Expression des pendages plis et failles sur les cartes g ologiques Structure tabulaire monoclinale pliss e R alisation de coupes g ologiques en terrains pliss s et faill s Datation de la tectonique Les grands groupes de
13. annexe 1 FORMATION PRATIQUE CULTURES CELLULAIRES ET BIO REACTEURS L2 S S4 Responsables Catherine DREUX Karine BLONDEAU U E sp cifique du cursus biotechnologies Objectifs Apprendre utiliser des cultures de cellules eucaryotes dans des conditions st riles Travailler avec soin Acqu rir des comp tences op rationnelles en bioing nierie D velopper initiative prise de responsabilit et sens de l organisation et pr cision Volume horaire Total 90 h TD 20 h TP 70h Contenu des enseignements R alisation d une exp rience alliant techniques de biologie cellulaire et de biochimie cultures de cellules eucaryotes adh rentes ou en milieu liquide d nombrement repiquage transfection s lection surexpression de prot ines et d tection western blot Manipulation de bior acteurs coupl e une HPLC pour l analyse des acides organiques Ma trise des cin tiques et du m tabolisme microbien Production de prot ines recombinantes Equipe p dagogique Catherine DREUX Laure PLANCON ARNOULT Karine BLONDEAU Universit Paris Sud 11 10 11 2004 78 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 APPRENTISSAGE STAGE Biol L2 S3 S4 Responsables Robert AUFRERE et Gilles HENCKES U E sp cifique du cursus biotechnologies Objectifs Responsabiliser l tudiant et donner une grande place au travail personnel Donner une formation en situation r elle dans u
14. antibiotiques color s Apparition de mutants spontan s d Escherichia coli r sistants un antibiotique o Biotransformation Fermentation lactique les bact ries du lait et du yaourt Equipe p dagogique Karine BLONDEAU Florence CONSTANTINESCO Christine HOUSSIN C line KARMAZYN CAMPELLI Corinne LEVI MEYRUEIS Pascale SERVANT Universit Paris Sud 11 10 11 2004 42 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 D couverte du paysagisme Biol 270 L2S3 Responsable Sophie Nadot UE de d couverte Objectifs Cet enseignement est destin faire d couvrir aux tudiants les diff rents aspects du paysagisme un domaine qui va de la conception de jardins l urbanisme Au travers d analyses de documents de sorties de conf rences ainsi que d exercices de dessin et d criture l enseignement propos vise former le regard et offre les bases permettant de comprendre ce qu est le paysage Cette option s adresse ceux qui recherchent une ouverture vers des domaines autres que purement scientifiques Elle peut int resser entre autres les tudiants qui souhaitent pr parer le concours d entr e aux coles de paysage Versailles ou Blois par exemple Volume horaire Total 50h EI 50h Plan des enseignements Qu est ce qu un paysage 3h R flexion sur la d finition du terme paysage Lecture d un paysage les diff rentes approches artistique historique
15. avantages comparatifs Information conomique et sociale tableaux et statistiques descriptives TD e Lecture et discussion de textes discours conomiques actuels ou de r f rence e Expos s oraux TP Contr le des connaissances Examen crit et oral Equipe p dagogique Fabrice Lequeux Universit Paris Sud 11 10 11 2004 69 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 STAGE Biol 216 L2S4 et S3 Responsable HULEUX Claire 2 UE obligatoires OBJECTIF GENERAL aider l orientation et faciliter l insertion professionnelle des tudiants Apprendre les m thodes de recherche de stage D couvrir le monde professionnel ces m thodes de travail ses exigences et ses r alit s Appliquer certaines connaissances th oriques un objectif professionnel Compl ter son projet professionnel et affiner son orientation Acqu rir une d marche scientifique et des techniques Acqu rir une m thodologie pour la r daction du m moire et l expos oral VOLUME HORAIRE et ORGANISATION Total 100 heures projet personnel et m thodologie 25 heures Stage 75 heures PLAN des ENSEIGNEMENTS Projet personnel et m thodologie 25 heures en L2S3 Cours magistral 4 6 heures pr sentation du projet personnel pr sentation des diff rents stages et des techniques de recherche de stage TD 8 TD de 2 heures bilan de connaissances de comp tences et de motivations CV et lettr
16. cutables origines cr ation gestion utilisation e Notion de cahier des charges e Programmation structur e langage de programmation C en traitant des exemples biologiques o Algorithmique Entr es Sorties Variables d claration types utilisation constantes Boucles d finies et ind finies Tests conditionnels conditions logiques Lecture criture de fichiers textes entr es sorties Programmation modulaire Proc dures cr ation utilisation Biblioth ques de programmes Utilisation conjointe de proc dures nouvelles et de proc dures existantes biblioth ques e Edition d un programme compilation tests ex cution e Utilisation et r daction de documentations techniques de programmes Projet personnel TER volume horaire 10h travail en binome e Cr ation d un programme appliqu un sujet scientifique e R daction d un rapport pr sentation du sujet du programme des r sultats e Pr sentation du programme structure fonctionnement sur ordinateur O0 01 00 70 Moyens n cessaires pour cet enseignement Service informatique du b timent 336 avec acc s Linux sur tous les ordinateurs Equipe p dagogique Bruno Bost responsable MC Didier Casane MC Herv Delacroix PR St phane Duquerroy MC Olivier Lespinet MC Kamel Soudani MC Universit Paris Sud 11 10 11 2004 33 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Thermodynamique
17. les discrets Equipe p dagogique Universit Paris Sud 11 10 11 2004 65 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Introduction la Mod lisation en Biologie Biol 280 L2S4 Responsable Michel Laurent UE de d couverte Objectifs La mod lisation des ph nom nes biologiques est une discipline originale et en plein d veloppement qui n cessite de pouvoir franchir les fronti res disciplinaires Un mod le n est pas une simple mise en ordre de l observation Les mod les biologiques modernes cherchent identifier au del des corr lations les liens de causalit susceptibles d exister entre des ph nom nes en apparence disjoints Lorsque la discipline a acquis une maturit suffisante le mod le devient math matique ce qui permet de clarifier les hypoth ses et d en tendre les capacit s d analyse L enseignement propos a un triple but e Donner aux tudiants une m thode de travail alliant le substratum biologique aux outils de traitement math matiques et informatiques e Les familiariser avec le maniement des outils logiciels d di s la mod lisation e Donner une premi re id e de l int r t de la diversit et de la puissance de la mod lisation en biologie Volume horaire Total 50h CM 25h TD 25h Plan des cours enseignement int gr L outil informatique apprentissage de la programmation en langage Scilab L outil math matique introduction aux m thod
18. m canismes r actionnels en Chimie organique Chim 202 Introduction aux techniques de s paration et d analyse Chim 203 R activit en chimie organique Chim 204 partir de PC Volume horaire Total 50h CM 20 h TD 30h Plan des enseignements G n ralit s sur les m canismes de r action Cin tique Contr les cin tique et thermodynamique Principes de Hammond et Curtin Hammett Interm diaires r actionnels carbanions carbocations radicaux et carb nes Acides et bases Rappel historique bref Arrh nius Bronsted Echelle d acidit et quilibres acide base pKa Effets de structure inductifs m som res st riques Effets de solvants Acides et bases de Lewis Analyse structurale Rappel des diff rentes m thodes de spectroscopie Spectroscopie Infra Rouge Spectroscopie RMN 1H Spin nucl aire et cons quences RMN impulsionnelle et Transform e de Fourier D placement chimique int gration relation avec la structure effets inductifs d anisotropie intermol culaires Couplage spin spin valeur des constantes de couplage et structure mol culaire syst mes AB AA BB ABX AMX G om trie mol culaire Caract ristiques g n rales Rappels d analyse conformationnelle barri re d interconversion conformation des syst mes acycliques et cycliques Effet anom re Rappels de st r oisom rie chiralit et diff rents formalismes Prochiralit homotopie nantiotopi
19. m lant cours et TP chaque tudiant sera charg d identifier des souches bact riennes l aide de techniques physiologiques Volume horaire Total 50 h CM 5h TD 10h et TP 35h Plan des enseignements Microbiologie de l eau le milieu aquatique et les techniques d puration de l eau Contr le qualit de l eau de boisson Les techniques de base de la microbiologie Illustration Isolement de souches partir d un chantillon aquatique La structure et l organisation des bact ries Illustration les techniques d observation et de coloration des bact ries Gram Leifson application l identification bact rienne Notions essentielles de m tabolisme bact rien respiration et fermentation m tabolisme des acides amin s Illustration Utilisation des donn es physiologiques pour l identification des bact ries Equipe p dagogique Anne Marie Callen Lo c Morin Universit Paris Sud 11 10 11 2004 124 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Programmation orient e objet Info 329 L3S6 Responsable Patrick Amar Type d U E obligatoire pour parcours BIBS Objectifs Conna tre les bases de la conception objet et ma triser un langage orient objet Java Cet enseignement est plus particuli rement destin aux tudiants du parcours BIBS D autres tudiants pourront tre accueillis dans la limite des places disponibles P
20. objet de tests statistiques ou d ajustement des mod les Equipe p dagogique Marc GIRONDOT Paul LEADLEY Pierre Henri GOUYON professeurs Alain LOUVEAUX Jean Chistophe LATA Peter STREB Kamel SOUDANI Damien BANAS et Claire DAMESIN Ma tres de Conf rences Universit Paris Sud 11 10 11 2004 100 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Evolution et diversit des M tazoaires Biol 308 L3S5 Responsables Laurent Coutte et Line Duportets U E obligatoire parcours BOE Objectifs Etude des principaux taxons des M tazoaires Savoir reconna tre les animaux et avoir les bases pour les positionner dans la phylog nie actuelle Volume horaire Total 50h EI 26h TP 24h Plan des enseignements ET Parmi les principaux taxons des M tazoaires chaque taxon est tudi selon un plan identique place du taxon dans la phylog nie actuelle principales apomorphies caract res g n raux diversit au sein du taxon Taxons tudi s Eponges Cnidaires Ct naires Protostomiens Ecdysozoaires Arthropodes N matodes Spiraliens Plathelminthes Ann lides Mollusques Deut rostomiens Echinodermes poissons Lissamphibiens Oiseaux Squamates Mammif res TP Les TP illustrent et compl tent les connaissances acquises lors des cours et des EI Ils correspondent des tudes morpho anatomiques et physiologiques Ils permettent aussi de mettre en vidence certaines adaptations
21. termination des structures tertiaires Repr sentation et utilisation des structures Classification des structures analyse de topologies Relation s quence structure Introduction l exploitation des s quences gt Interactions prot ines ligands Formalisme m thodes d tudes exemples de structure de complexes gt Enzymes Cin tique M canismes M thodes d tudes Exemples de m canismes catalytiques R gulation Introduction l allost rie Phosphorylation gt Structure des Acides nucl iques Structure et polymorphisme de l ADN Topologie de l ADN Structure de la chromatine Structure et Diversit des ARN Biosynth se des prot ines Equipe P dagogique P Minard M Duguet JM Rossignol G Foucault F Confalonieri Universit Paris Sud 11 10 11 2004 82 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Biochimie m tabolisme nerg tique Biol 302 L3S5 Responsable Pierre Le Mar chal UE obligatoire parcours BMC et BIBS Objectifs Faire acqu rir aux tudiants de niveau L3 les notions sur le m tabolisme cellulaire et l organisation des membranes biologiques n cessaires l acc s dans les divers masters de Biologie de l universit Paris Sud Volume horaire Total 50 h CM 36h TD 14h Plan des enseignements M tabolisme nerg tique animaux et v g taux e Structure et propri t s des sucres e Biosynth se des disaccharides e H t ropolyosides glycoprot
22. thodologies associ es Permettre aux tudiants d acqu rir une formation fondamentale pour les m tiers de la sant et d avoir un pr requis cons quent pour aborder les masters Volume horaire Total 50 h CM 36h TD 14h Plan des enseignements Cours 36h Introduction Connaissances de base et m thodologies 12 h 1 Microscopies marqueurs cytom trie histom trie 2 Cycle cellulaire et cancer 2 M iose 3 G n tique 4 Cytog n tique 5 Biologie mol culaire expression et r gulation des g nes 6 Electrophysiologie Axe hypothalamo hypophyso gonadique 12h Anatomie du cerveau Histologie des neurones et des cellules gliales syst me porte hypophysaire Biologie cellulaire structure et fonction des neurones et des cellules gliales Electrophysiologie tude de la transmission lectrique neuronale Neuroendocrinologie GnRH FSH LH hormones st ro des r cepteurs nucl aires Pathologies neuroendocriniennes et th rapeutiques Appareils g nitaux masculin et f minin 12h D terminisme du sexe Anatomie de l appareil g nital Glandes annexes Glandes mammaires Gonades Biologie cellulaire structure et fonction des cellules germinales et somatiques associ es Empreinte parentale Endocrinologie r le et mode d action des hormones FSH LH hormones st ro des inhibine activine Pathologies de l infertilit cytog n tique et fertilit Travaux dirig s 14 h Analyse d articles
23. tique de fonctionnement e Mesure du m tabolisme de base par calorim trie indirecte o Influence de l administration de glucose sur la glyc mie et l insulin mie du rat e Evaluation des fluctuations des d penses nerg tiques provoqu es par l absorption alimentaire l exposition diff rentes temp ratures ambiantes ou l exercice physique Equipe p dagogique L Cohen D Gripois C Huleux L M ry H Th risod F Vesin Universit Paris Sud 11 10 11 2004 52 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Semestre 4 UE type Titre ID Parcours ECTS 1 UEF Techniques de bases de biologie mol culaire Bio214 Tous 5 2 3a UEC Biologie du d veloppement animal et v g tal Bio210 Tous 5 2 3b UEC Ecologie et biologie quantitative des populations Bio211 Tous 5 2 3c UEC Physiologie animale Bio212 Tous 5 2 3d UEC Grandes fonctions des plantes nutrition et Bio213 Tous 5 reproduction 2 3e UEC Microbiologie Bio215 Tous 5 3f UEF Algorithmique et programmation Info226 BIBS 5 Eco en S6 3g UEF Synth se organique exp rimentale Chim253 BCH 5 4al UEC Energ tique et transformations biologiques en Chim201b Tous 5 milieu aqueux BCH en S3 4a2 UEC R activit des mol cules organiques 2 Chim252 BCH 5 4a3 UEC Chimie bioorganique Chim206b BCH 5
24. 4b UEC Physique des fluides en biologie transport et Phys291 Tous 5 diffusion 4c UEC Alg bre et analyse de donn es Math292 Tous 5 4d1 UEC Introduction la mod lisation en biologie Bio280 Tous 5 4d2 UEC Biologie interdisciplinaire Bio Bioconcours 5 4e UEC La terre processus endog nes et exog nes G os21b Tous 5 4f UEC Economie g n rale Ecog33 Tous 5 5 6 UEO stage Bio216 Tous 10 UE sp cifique du cursus Biotechnologie S3 et S4 UE type Titre ID parcours ECTS 1 UEF G nie Biologique Bio Biotechno 5 2 UEF Chimie organique Bio Biotechno 5 3 UEF Bioinformatique et statistiques Bio Biotechno 5 4 1 UEF Chimie g n rale Chim Biotechno 2 5 4 2 UEO Anglais Biotechno 2 5 5 UEF Microbiologie Bio Tous 5 6 UEF M thodes biochimiques et biophysiques Bio Biotechno 5 7 UEF Formation pratique biologie mol culaire Bio Biotechno 5 8 UEF Formation pratique cultures cellulaires et bio Bio Biotechno 5 r acteurs 9 12 UEF Apprentissage Stage Bio Biotechno 20 Universit Paris Sud 11 10 11 2004 53 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 TECHNIQUES DE BASE DE LA BIOLOGIE MOLECULAIRE Biol 214 L2 S4 Responsables M DuBow U E obligatoire Objectifs Les techniques issues des recherches en biologie mol culaire sont maintenant devenues des techniques universelles pour la plupart des disciplines de la biologie Cette UE a pour but partir des connaissances acquises
25. 5 5d 1 UEC Ethologie Comportement de l animal dans son milieu Biol 171 Tous 5 5d 2 UEC FLORISTIQUE Biol 172 Tous 5 5d 3 UEC DECOUVERTE DES MILIEUX Biol 173 Tous 5 5d 4 UEC Initiation la Recherche sur les Plantes Biol 174 Tous 5 5d 5 UEC Les Insectes dans la Biosph re Biol 175 Tous 5 5d 6 UEC Biotechnologies Bio industries Biol 176 Tous 5 5d 7 UEC G nes Mutants et Mutations Biol 177 Tous 5 5d 8 UEC Formation pratique en biotechnologie Biol Tous 5 6 UEF M THODOLOGIE Biol 122 Tous 5 Cursus Biotechnologies 1 UEF Biotechnologies Bio industries Biol 176 Biotech 5 5 UEF Formation pratique en biotechnologie Biol Biotech 5 6 UEF Techniques de laboratoire Biol Biotech 5 Universit Paris Sud 11 10 11 2004 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Diversit du vivant et volution Biol 120 L1S2 Responsable Line Duportets UE obligatoire tous les parcours de la mention biologie et mention biologie chimie Objectifs L id e g n rale de ce module est de pr senter la diversit du monde vivant en prenant l Evolution comme fil conducteur Un aspect important de ce module concerne les m thodes de reconstruction des phylog nies Dans ce cas l objectif est que les tudiants apprennent les m thodes de bases de reconstruction puissent avoir une vision critique et sachent les utiliser Par ailleurs les TP TD de BA sur les m tazoaires
26. C cile Sicard Roselli U E de d couverte Objectifs familiariser les tudiants avec la chimie exp rimentale et diff rentes techniques d analyse chimique Volume horaire Total 50 CM 14h TD 0 TP 36h R sum Dans un premier temps un aspect th orique devrait permettre l tudiant de conna tre les principes de bases des diff rentes techniques et leurs limites pr cision des mesures seuil de d tection permettant alors le choix d une technique appropri e pour un dosage sp cifique La deuxi me partie sera une approche exp rimentale de m thodes telles que la chromatographie en phase gazeuse liquide ou sur plaque la spectroscopie d absorption UV Visible l absorption infra rouge le dosage par absorption atomique des dosages bas s sur l acido basicit l oxydo r duction ou encore la complexation Travail exp rimental La partie exp rimentale de ce module repr sente 36 heures qui repr sentent 12 s ances de 3h de travail en laboratoire Les diff rents dosages ou analyses seront appliqu s des produits chimiques de la vie courante telles que les cosm tiques par exemple Equipe p dagogique C cile Sicard Roselli Universit Paris Sud 11 10 11 2004 7 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 ENVIRONNEMENT GLOBAL geos1003 L1S1 Responsables Ch Colin U E de d couverte Objectif donner aux tudiants les bases n cessaires la compr hension du fonct
27. Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 TRAVAUX PRATIQUES de Biologie Mol culaire et de Biochimie Biol 342 L3S6 Responsables Marianne DELARUE et Marie No lle RAYMOND U E Obligatoire TP et Enseignement int gr parcours BOE Ecologie Objectifs Illustration du cours Structure Dynamique et Polymorphisme des g nomes Dans un contexte de plantes transg niques utilisation des approches int gr es de Biologie Mol culaire et de Biochimie autour d une probl matique commune Le but est de sensibiliser les tudiants l utilisation de diff rentes techniques pouvant tre coupl es Cet enseignement s adresse tous les tudiants s inscrivant en L3 Biologie des Organismes et des Ecosyst mes Volume horaire 70h 2 semaines compl tes Biologie Mol culaire 30h TP 7h EI Biochimie 24h TP 9h EI Plan des enseignements Biologie Mol culaire Analyse de polymorphisme chez diff rentes lign es de Ma s utilisation de marqueurs microsatellites Recherche d OGM au sein de diff rents lots de graines d Arabidopsis thaliana sauvages et transg niques 1 Extraction d ADN g nomique 2 Amplification du transg ne par PCR 3 Analyse d expression g nique RT PCR Etude de s quences par bio informatique et analyse d articles Biochimie Comparaison des activit s enzymatiques de la phosphoenolpyruvate carboxylase PEPC 1 dans les graines d Arabidopsis tha
28. Mesure de la sensibilit barostatique chez l homme Anatomie fonctionnelle et physiopathologique de la paroi vasculaire Effets de toxiques CO tabac sur le c ur et les vaisseaux Adaptations cardio circulatoires et respiratoires au cours de l effort en conditions de pression normale et modifi es hyperbarie hypobarie Adaptations cardio circulatoires et respiratoires en ambiance thermique modifi e Pr requis PCI 1 Nombre maximum d inscrits 25 Enseignant F Ch ruel MC UPS Universit Paris Sud 11 10 11 2004 131 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Synth se organique exp rimentale Chim354 Responsables Marie George Guillerez Type d U E au choix pour parcours BCH Objectifs Pr requis L3S6 Chimie organique g n rale et analyse structurale Chim 351 Chimie organique de synth se 1 Chim 352 Chimie organique exp rimentale Chim 312 Chimie organique de synth se 2 Chim 353 Volume horaire Total TP 50h Plan des enseignements Synth se de la Gramine R action de Mannich Synth se du phospho nolpyruvate D doublement cin tique enzymatique du 2 octanol Analyse d un dipeptide par le r actif de Sanger Pr paration des et pentac tyl D glucosamines Pr paration du diisopropylid ne D mannitol Synth se de l isopropylid ne glyc rol Pr paration du cinnamate de benzyle R action de Wittig Substitution lectrophile
29. Mme Stucker pid miologiste DR INSERM AN Autre Chimiste Universit Paris Sud 11 10 11 2004 95 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Pharmacom trie Pharmacologie mol culaire et Pharmacocin tique L3SS Responsable Alain GARDIER U E optionnelle Objectifs Donner les connaissances de base de la pharmacologie qui seront n cessaires la formation des biologistes Volume horaire Cours 30 heures TD 20 heures Plan des enseignements gt Les m dicaments action sp cifique Approche fonctionnelle de la caract risation d un ligand L et d un r cepteur R quantification des effets et sp cificit de la liaison L R relation effet dose d un agoniste valuation quantitative d un antagonisme de type comp titif r versible calcul des pA2 Approche par liaison sp cifique de la caract risation d un ligand L et d un r cepteur R Bmax densit et nombre de sites sp cifiques de liaison IC5o ou Ki degr d inhibition de la liaison sp cifique gt Famille de r cepteurs 7 h lices tansmembranaires coupl s aux prot ines G Structure des r cepteurs Structure et fonctions des prot ines G Pluralit des r cepteurs coupl s aux prot ines G trim riques Les petites prot ines G monom riques gt Voies effectrices mises en jeu par les prot ines GI Principaux effecteurs enzymatiques coupl s des r cepteurs par des prot ines G Voie de l ad nylat
30. TP au choix parcours BMC Objectifs Illustrer le contenu de l U E G n tique des organismes procaryotes R aliser sur 2 semaines temps complet des exp riences alliant les techniques de Microbiologie et de G n tique pour l tude d un syst me donn le r gulon maltose d Escherichia coli pr requis G n tique des organismes procaryotes Volume horaire Total 70 h TP 50h TD 20h Contenu des enseignements Dans un premier temps les tudiants pr pareront des TD afin d approfondir les notions fondamentales appliqu es en s ances de TP i transposition ii conjugaison iii compl mentation fonctionnelle iv notion d op ron et syst me de r gulation positive et n gative Les tudiants r aliseront des mutag n ses par transposition chez Escherichia coli afin d isoler des mutants affect s dans le r gulon maltose Une fois ces mutants localis s par conjugaison les g nes mut s seront identifi s par compl mentation fonctionnelle Nombre maximum d inscrits 40 60 20 groupe Contr le des connaissances valuation crite compte rendu Equipe p dagogique Chantal Astier PR C cile Pasternak Sylviane Liotenberg MC L3 S6 Ecophysiologie V g tale 50h Universit Paris Sud 11 10 11 2004 114 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 TP de G n tique d un Eucaryote Biol 343 L3S6 Responsables Marie Claire Daugeron Martine
31. UEO Anglais Tous 5 Universit Paris Sud 11 10 11 2004 30 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Introduction l Analyse G n tique GEN2 Biol 202 L2S3 Responsables Chantal Astier Fabienne Chalvet U E Obligatoire tous les parcours de la mention biologie et mention biologie chimie Objectifs Apprentissage des m thodologies g n tiques appliqu es aux procaryotes et eucaryotes Pr requis Approche g n tique du monde vivant ou PCEM Volume horaire Total 50 h CM 20h TD 30h Plan des enseignements CM G n tique Formelle 16h Mutagen se et cribles Marqueurs et haplotypes Relations g notype ph notype mutations conditionnelles pl iotropie p n trance et expressivit Le g ne d fini par un groupe de compl mentation limite du test Cartographie g n tique Modes de transferts de g nes chez les bact ries Cartographie 3 points et par d l tions procaryotes et eucaryotes R gulation le mod le op ron bact rien Transposition et transformation par des plasmides Syst mes mod les pour les maladies humaines Les interactions g niques et l pig n tique succint G n tique des Populations 4h Introduction la G n tique des Populations TD de 3h TD 1 test de recombinaison TD 2 test de compl mentation TD 3 cartographie 3 points et par d l tions TD 4 D terminisme g n tique de la couleur de l il chez la Drosophile TD 5 mutagen se p
32. cologie scientifique Ecologie du comportement Bases de la dynamique des populations Dynamique d une population homog ne Sans ou avec limitation de ressources Dynamique d une population h t rog ne Mod les proies pr dateurs Esp ces et sp ciations et cologie Notion d esp ce Mod les de sp ciations Biog ographie Introduction Les contraintes de l environnement dans la r partition des esp ces Les contraintes historiques tectonique des plaques Phylog ographie Biodiversit et d veloppement durable Identification des menaces OGM Ecologie des communaut s mise en place des relations trophiques TD Ecologie du comportement insectes sociaux Dynamique des populations 1 2 3 et 4 Biog ographie I zones refuges Biog ographie II phylog ographie Biologie de la conservation d veloppement durable Equipe p dagogique Claire Lavigne B atrice Albert Delphine Sicard Jane Lecomte Emmanuelle Baudry Marc Girondot Universit Paris Sud 11 10 11 2004 56 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Physiologie animale Biol 212 L2S4 Responsables Herv Daniel et Heather McLean U E au choix Objectif Cet enseignement consiste en une introduction aux m thodes et aux concepts de la physiologie animale avec comme types cellulaires principalement tudi s les neurones les cellules gliales gustatives sanguines et r nales Il s attache traiter les interactions fonctionnell
33. de l enzyme Equipe p dagogique Biochimie Fran oise Vesin et H l ne Th risod Biologie Mol culaire C line Karmazyn Campelli Nathalie Oestreicher Universit Paris Sud 11 10 11 2004 108 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Semestre 6 Parcours Biologie mol culaire et cellulaire BMC Biologie humaine et sant BHS Biolnformatique et BioStatistiques BIBS et Biologie et Chimie BCH UE type Titre ID Parcours ECTS 1 UEC Dynamique cellulaire Biol320 BMC BHS 5 BIBS 2a UEC G n tique des organismes procaryotes Biol321 BMC BIBS 5 2b UEC G n tique des Eucaryotes Syst mes mod les et Biol329 BMC BHS 5 G n tique Humaine BIBS 2c UEF Inf rence statistique Math BIBS 3a UEC TP G n tique des organismes procaryotes Biol322 BMC 5 3b UEC TP de g n tique d un eucaryote Biol343 BMC BHS 5 3c UEF Analyse des s quences g nomiques Biol344 BIBS 5 BMC en S5 4a UEC Physiologie cellulaire et int grative Biol323 BMC BHS 5 4b UEC Biologie et physiologie cellulaire et mol culaire Biol324 BMC 5 v g tales 4c UEC Physiologie mol culaire et cellulaire des Biol BMC 5 microorganismes 4d UEF TER TERB50 BIBS 5 4e UEC Chimie orga de synth se 2 Chim353 BCH 5 Sa UEC TP Phy siologie cellula
34. de l nergie utilis e valeur calorifique des diff rents nutriments e Variations du quotient respiratoire en fonction du r gime alimentaire e Analyse nutritionnelle des tudiants tablie sur une ou quelques journ es permettant notamment de comparer apports et d penses nerg tiques 2 Mise en vidence de l adaptation du m tabolisme nerg tique dans le foie et le muscle de rat suivant les conditions physiologiques rat nourri au repos ou soumis un effort physique rat jeun et au repos Le glycog ne e Isolement du glycog ne et dosage par colorim trie e Hydrolyse acide du glycog ne et dosage enzymatique du glucose lib r e Interpr tation et comparaison des 2 m thodes de dosage du glycog ne Le glucose 1 phosphate produit de d gradation du glycog ne e Purification du glucose 1 phosphate sur colonne changeuse d anions et quantification Le lactate e Dosage enzymatique du lactate plasmatique et tude de la lactate d shydrog nase du muscle et du foie 3 M tabolisme du glucose principal support nerg tique du m tabolisme chez l homme e Influence de l administration de glucose sur la glyc mie et l insulin mie du rat e Dosage colorim trique du glucose e Principe du dosage radioimmunologique de l insuline et calculs partir de valeurs obtenues au pr alable au laboratoire Mise en vidence d une boucle r gulatrice 4 Notions de d pense nerg tique de fond et de d pense nerg
35. des disciplines autres Universit Paris Sud 11 10 11 2004 70 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 GENIE BIOLOGIQUE Biol L2 S3 S4 Responsable Armel GUYONVARCH U E sp cifique du cursus biotechnologies Objectif Acqu rir les bases th oriques en biochimie biologie cellulaire et biologie mol culaire Volume horaire Total 50h CM 30 h TD 20 h Contenu des enseignements Equipe p dagogique Armel Guyonvarch Francoise Vesin Claire Huleux Sylvie Gillet H l ne th risot Laure Plan on Universit Paris Sud 11 10 11 2004 71 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 CHIMIE ORGANIQUE Biol L2 S3 S4 Responsable Pierre LE MARECHAL U E sp cifique du cursus biotechnologies Objectifs Etude des grandes fonctions de la chimie organique Volume horaire Total 50h CM 25h TD 25h Contenu de l enseignement St r ochimie repr sentations des mol cules organiques nomenclature conformations et configurations chiralit et activit optique nantiom res et diast r oisom res st r os lectivit et st r osp cificit R activit chimique configuration lectronique des atomes polarit et polarisabilit des liaisons effet inductif effet m som re interm diaires r actionnels acides et bases nucl ophiles et lectrophiles profils nerg tiques des r actions catalyse classification d
36. en L1 de donner aux tudiants les bases th oriques de ces techniques et le champ de leurs applications Ces donn es seront illustr es par des exemples pris dans le domaine de la recherche de la vie conomique ou de la soci t Les limites de ces techniques et les pr cautions prendre dans leur emploi seront plus particuli rement analys es dans la partie Travaux Dirig s Volume horaire Total 50 h CM 20h TD 30h Plan des enseignements Techniques d riv es des connaissances sur les bact riophages enzymes de restriction s paration des fragments d ADN plasmides clonage 6 h Techniques d riv es des connaissances sur les acides nucl iques Southern Northern 2 h Techniques bas es sur la r plication s quencage PCR 4 h Techniques bas es sur la transcription cDNA RT PCR 2 h Techniques bas es sur la traduction synth se in vitro de prot ines 1 h Techniques bas es sur les prot ines Western ELISA Tags 2 h Exemples d application dans la recherche 2 h Exemples d application dans la soci t 3 h Enseignants pressentis DuBow Rossignol Universit Paris Sud 11 10 11 2004 54 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 BIOLOGIE DU D VELOPPEMENT ANIMAL ET V G TAL Biol 210 L2S4 Responsables Maurice Wegnez et Martin Kreis U E au choix Objectifs du cours Le but du module sera de pr senter les concepts de base de la disci
37. en synth se Volume horaire Total 50h TD 2 TP 48h Pr requis Structures et fonctions en Chimie organique Chim 104 Introduction aux m canismes r actionnels en Chimie organique Chim 202 R activit en chimie organique Chim 204 et Chimie organique g n rale et m canismes r actionnels Chim 301 R sum Enseignement exp rimental Techniques G n rales S paration par Extraction des produits issus d une r action de Cannizzaro Distillation et Recristallisation Synth se de la Coumarine R duction du camphre par l hydrure de lithium et d aluminium D hydratation du cyclohexanol en cyclohex ne Pr paration des cis et trans cyclohexane 1 2 diols Organom talliques Pr paration et tude compar e de la r activit et de la s lectivit sur une c tone thyl nique Pr paration du camphre partir du camph ne Utilisation d un groupement protecteur c tal r action d un organomagn sien sur un ester hydrolyse du c tal et d shydratation de l alcool tertiare Equipe p dagogique Philippe Pigeon Universit Paris Sud 11 10 11 2004 87 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Les ondes en biologie PhysB301 L3S5 Responsables M Davier U E de d couverte volume horaire 50h CM 21 h TD 21h TP 8h Contenu Propagation des ondes oscillateurs perturbation dans un milieu onde progressive milieu limite imp dance ondes stationnai
38. et Emmanuel PICARD U E Obligatoire tous les parcours de la mention biologie et mention biologie chimie Objectifs Par l tude de deux mod les biologiques tr s diff rents une plante et un animal amener les tudiants reconna tre l unit et la diversit des modalit s des grands processus biologiques cellulaires et d veloppementaux donner une premi re approche des grandes fonctions r alis es par les organismes adultes pr parer les tudiants aux cours plus sp cialis s par une approche g n rale et int gr e de la Biologie L objectif commun des TP et TD en Biologie V g tale et Animale est de compl ter expliciter et illustrer le cours en suivant au plus pr s sa progression une d marche d enseignement parall le qui se terminera par une s ance de conclusions g n rales commune aux deux disciplines Volume horaire Total 50 h CM 22h TD 3h El 13h TP 12h Plan des enseignements CM Un plan unique et deux cours men s en parall le pour les deux organismes mod le Plante le ch ne et Arabidopsis Animal la grenouille I Pr sentation du mod le positionnement par rapport aux autres organismes animaux ou v g taux plan d organisation niveaux d organisation et pr sentation des cycles de vie Il L organisme adulte tude anatomique et fonctionnelle appareils organes ou grandes fonctions r alis es IIL Reproduction et d veloppement organes reproducteurs gam togen se f
39. et l volution de grandes fonctions comme le syst me circulatoire l appareil urog nital Anatomie g n rale de la blatte appareil digestif et appareil reproducteur gonochorique Appareil Urog nital Souris La reproduction chez les Vert br s Appareil reproducteur hermaphrodite de l escargot Histologie G n ralit s Morphologie de la langoustine structures et fonctions des appendices d un Crustac Nerfs Rachidiens Grenouille Etude d une composante du syst me nerveux Syst me Circulatoire Grenouille mise en vidence de l volution du syst me circulatoire des Vert br s Organisation du syst me nerveux d un protostomien la langoustine Equipe p dagogique Solange Bertrandy H l ne Courvoisier Laurent Coutte Line Duportets Fran oise Jamen Danielle Marchal et Fanny Rybak Universit Paris Sud 11 10 11 2004 101 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Evolution des M tazoaires Biol 312 L3S5 Responsable Laurent Th odore U E obligatoire parcours BOE Biologie int grative Objectifs Comprendre les concepts et m thodes fondamentaux pour l tude de la diversit et de l histoire volutive des M tazoaires Volume horaire Total 50h cours 42 h TP 8h Plan des enseignements D finition position volutive et diversit des M tazoaires Plans d organisation Phylogen se et phylog nies Syst matique et m thodes de r
40. et rayonnement Phys L2S3 Responsable Hagop Sazdjian U E obligatoire pour le cursus bioconcours Objectifs Enseignement de la physique faisant partie du programme pr paratoire du Concours B d ENSA Agronomie S adresse aux tudiants pr parant ce concours Pr requis Programme de physique de Physique Agro de L1 S2 programme de math matiques de L1 S1 et de L1 S2 de la pr paration au concours Volume horaire Total 50 h CM 25 h TD 25h Programme THERMODYNAMIQUE RAYONNEMENT 1 Notions fondamentales de thermodynamiques Grandeurs macroscopiques et microscopiques Variables d etat Agitation thermique Temperature Conservation de l energie Premier principe de la thermodynamique Approximation des gaz parfaits 2 Deuxieme principe de la thermodynamique Transferts d energie Rayonnement des particules Phenomenes irreversibles Notions de microetats et de macroetats Deuxieme principe Entropie 3 Pression et equation d etat des gaz parfaits Pression Equation d etat des gaz parfaits Verifications experimentales Mesure du nombre d Avogadro Equation de l hydrostatique 4 Transformations des systemes Transformations reversibles et irreversibles Transformations isothermes adiabatiques cycliques Fonctions d etat et differentielles totales Degres de liberte Lois de Laplace Coefficients calorimetriques Enthalpie 5 Identite thermodynamique Entropie d un gaz parfait Identite thermodynamique Conditions de
41. films etc Volume horaire Total 50 h CM 5h TD 10h TP 35h Th matiques propos es Intro Historique Eco thologie cologie comportementale G n tique et comportement Hormones et comportement Interactions sociales soci t s animales Communications Comportements alimentaires Comportements sexuels Comportements parentaux Processus cognitifs et apprentissage Ontogen se Ethologie humaine Th me int gratif les oiseaux Ce th me permettra de d velopper diff rents aspects de l thologie des oiseaux en allant d un aspect naturaliste jusqu la neurobiologie Il permettrait de traiter de fa on int grative les questions soulev es dans ce module aspects naturalistes avec sortie sur le terrain relations au milieu communication acoustique entre cong n res comportements de cour bases neurobiologiques et neuroendocriniennes du chant g n tique Equipe enseignante F Rybak H Courvoisier P Le Mar chal L Duportets F Mougel Imbert J Lecomte F Courchamp A C Julliard Universit Paris Sud 11 10 11 2004 20 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 FLORISTIQUE Biol 172 L1S2 Responsable Christian BOCK UE de d couverte Objectifs Cet enseignement est destin faire acqu rir aux tudiants une connaissance concr te de la Flore de la r gion par l acquisition de techniques d identification et d observations concr tes sur le terra
42. l equilibre entre systemes Melanges de gaz parfaits Contact de corps Sources de chaleur Fonctions et potentiels thermodynamiques Fonction enthalpie fonction energie libre ou de Helmholtz fonction enthalpie libre ou de Gibbs potentiel chimique 6 Machines thermiques Inegalite de Carnot Clausius Principe des machines thermiques Cycle de Carnot Exemples de cycles moteurs Machines frigorifiques et pompes a chaleur 7 Changements de phase des corps purs optionnel suivant temps disponible Phases d un corps Diagramme d equilibre entre les phases Vapeurs seches et vapeurs saturantes Courbe de saturation Isothermes Courbes de fusion et de solidification Chaleurs latentes 8 Rayonnement du corps noir Corps noir Formule de Rayleigh Jeans Quantification de l energie et loi de Planck Loi de Stefan Boltzmann Puissance rayonnee Exemple de l equilibre thermique des planetes Mesure des temp ratures a distance 9 Phenomenes de transport devrait etre fait en premiere annee Diffusion moleculaire Lois de Fick Conduction de la chaleur Loi de Fourier Conduction de l lectricit Loi d Ohm Equipe p dagogique Hagop Sazdjian Universit Paris Sud 11 10 11 2004 34 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Math matiques de la mod lisation II Math291 L2S3 Responsables E Gassiat U E au choix Volume horaire Total 50 CM 20h TD 30h Objectifs Donner les outils probabi
43. obligatoire pour parcours BIBS Objectifs Approfondir les connaissances en algorithmique et programmation imp rative Conna tre et manipuler les types de donn es structur es universels en informatique s quences listes arbres graphes Avoir des notions d analyse de la complexit des algorithmes Pr requis UE Biol201 Informatique Appliqu e la Biologie ou quivalent Volume horaire Total 50h CM 15 TD 15 TP 20 Plan des enseignements CM TD Algorithmes classiques de tri des donn es S quences algorithmes basiques de recherche de motifs Listes cha n es diff rentes repr sentations et algorithmes aff rents Arbres et graphes concepts th oriques et structures de donn es associ es Sensibilisation la complexit notions sur les probl mes NP complets et sur l analyse en moyenne d algorithmes TP Les TP donneront l occasion aux tudiants d appliquer les concepts vus en cours TD sur des probl matiques bioinformatiques Le langage de programmation sera le C Equipe p dagogique Patrick Amar MC Alain Denise Pr St phane Vialette MC Universit Paris Sud 11 10 11 2004 60 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Synth se organique exp rimentale Chim253 L2S4 Responsable C Girard Type d U E obligatoire pour parcours BCH Objectifs Introduction la synth se organique Pr requis Introduction aux mol cules or
44. ozonolyse additions radicalaires R actions de substitution et d limination des halog noalcanes E1 E2 SNI et SN2 R actions d additions nucl ophiles sur le carbonyle des ald hydes et c tones Acides carboxyliques et d riv s acidit et r activit des acides et d riv s R actions de substitution en d un carbonyle et r actions de condensation Techniques usuelles en chimie organique exp rimentale 1 Chromatographie Pouvoir rotatoire 2 Point de fusion Recristallisation 3 Distillation 4 Extraction Equipe p dagogique Christian Girard Universit Paris Sud 11 10 11 2004 37 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Energ tique des transformations biologiques en milieu aqueux Chim 201b L2S3 et S4 Responsables Nicolas Dacheux Romuald Drot U E de d couverte Objectifs Application des deux premiers principes de la thermodynamique aux transformations biologiques en milieu aqueux Volume horaire Total 50 CM 18h TD 20h TP 12h Pr requis Aucun R sum Description de l tat macroscopique d un syst me chimique quantit de mati re composition tat physique dans des conditions donn es de temp rature et de pression structure Premier principe Travail chaleur principe de la conservation de l nergie Fonctions d tat nergie interne enthalpie Deuxi me principe de la thermodynamique Fonctions d tat entropie S enthalpie libre G
45. roches volcaniques plutoniques et m tamorphiques Observation des formations sur cartes g ologiques observations d chantillons macroscopiques et microscopiques Pr requis Notions de min ralogie et p trologie l mentaire stratigraphie g ographie physique Commentaire But de l enseignement int gr pr senter les principaux types de structures tectoniques Les visualiser en 3D partir de cartes g ologique 2D Apprendre faire une coupe g ologique Reconstituer l histoire tectonique d une r gion Faire aussi le lien entre les structures et le magmatisme fonds oc aniques arcs volcaniques iles oc aniques Ref Bibliographique Ouvrages de Tectonique Cartographie cartes g ologiques de la France au 1 50 000 BRGM Ouvrages classiques de P trographie Equipe p dagogique Denis SOREL Bernard PLATEVOET X selon nombre de groupes d tudiants Universit Paris Sud 11 10 11 2004 107 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Initiation aux techniques de biologie mol culaire et de biochimie Biol 336 L3 S5 ou S6 Responsables Nathalie Oestreicher Biologie Mol culaire et Fran oise Vesin Biochimie U E au choix parcours BOE Biologie int grative Objectifs Initier les tudiants aux techniques de bases de la biochimie et de la biologie mol culaire les familiariser avec diff rentes notions fondamentales n cessaires la compr hension des exp rienc
46. s lection et l analyse d une descendance haplo de chez la levure Le test de recombinaison Autres TD Cribles positifs et n gatifs de mutants Suppression informationnelle Suppression physiologique Epig n tique Transg n se G n tique Humaine Equipe p dagogique M C Daugeron MC M Heude MC A Boivin MC F Chalvet MC A Helbling MC Universit Paris Sud 11 10 11 2004 115 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Analyse des S quences G nomiques Biol 344 Responsable Michel Termier UE obligatoire pour le parcours BIBS Objectifs faire comprendre les algorithmes d analyse de s quences les plus usuels Volume horaire Total 50 h CM 36 h TD 14h Plan des enseignements avec volume horaire I Bases de donn es Cours TD IT Alignements Algorithme de Smith et Waterman Matrices de substitution PAM et BLOSUM BLAST FASTA heuristiques associ es Annotation Cours TD IHI Complexit de s quence compression entropie de Shannon complexit linguistique Cours IV langages formels automates finis d terministes grammaires r guli res motifs Prosite Cours V recherche de motifs exacts m thode na ve par automates algorithme de Boyer Moore arbre des suffixes d g n rescence Cours TD VI Traces des mutations et de la s lection sur le g nome Biais de codon linguistique Markovienne s quences permut es s quences al atoires
47. thodes de travail qui permettent d une part de se familiariser avec la diversit du monde vivant et d autre part d analyser d une mani re critique les informations disponibles dans les m dias sur les probl mes d actualit OGM th rapie g nique Un autre aspect est d acqu rir des connaissances concernant m tabolites et transporteurs des cellules animales et v g tales Volume horaire Total 50 heures Cours 29h 16 h de Biologie Mol culaire et 13h de Biochimie EI 21h 9 h de Biologie Mol culaire et 12h en Biochimie Plan des enseignements Biologie Mol culaire Structure Dynamique et Polymorphisme des g nomes 1 M thodes d tudes des g nomes et principales caract ristiques structurales M thodes d analyse des g nomes clonage PCR analyse de s quences Complexit des g nomes 4 thaliana O sativa Z mays C elegans H sapiens S cerevisiae E coli Structure de la chromatine et organisation des g nomes s quences codantes duplications d l tions familles multig niques ARNr histones s quences non codantes redondance motifs microsatellites transposons r trotranspossons short and long repeats Structure et expression du g ne exon intron 5 et 3 non traduites promoteur pseudog ne transcription et maturation des ARN traduction et prot ine Applications technologiques introduction la g nomique OGM transg n se 2 Diff rents types de pol
48. tries vectorielles Matrice d un syst me de vecteurs d une application lin aire op ration sur les matrices matrice de passage D t rminant et applications calcul pratique syst me d quations lin aires inversion d une matrice m thode du pivot de Gauss Polyn me caract ristique valeurs propres vecteurs propres diagonalisation sur des exemples de matrices carr es de dimension trois Statistiques Th or me central limite Tests d hypoth ses et intervalles de confiances mod les binomiaux et mod les gaussiens R gression lin aire simple Tests du chi deux Equipe p dagogique Universit Paris Sud 11 10 11 2004 36 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 R activit des mol cules organiques 1 Chim 251 L2S3 Responsables Christian Girard U E de d couverte Objectifs Introduction aux m canismes r actionnels Volume horaire Total 50 CM 17h TD 17h TP 16h Pr requis L1S2 Introduction aux mol cules organiques R sum Equilibre vitesse et m canismes constante d quilibre et enthalpie libre standard diagramme de profil d nergie vitesse de r action constante de vitesse nergie d activation tats de transition interm diaires r actionnels r actions catalys es R actifs nucl ophiles et lectrophiles R actions d addition sur les alc nes et alcynes hydrog nation catalytique additions lectrophiles X2 BH3 HX H20
49. 1 re et 2e lois de Fick une dimension r gime permanent analogie avec la loi d Ohm Volume horaire total 50h CM 25h TD 25h Equipe p dagogique E VELU Universit Paris Sud 11 10 11 2004 17 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 GEOLOGIE LOCALE ET REGIONALE geosi 005 L1S2 Responsables V ronique ANSAN U E de d couverte Objectif Ce module a pour objet l introduction la g ologie l chelle locale et r gionale bas e sur des exemples pris dans le bassin parisien et sa p riph rie On effectuera la reconnaissance des formations g ologiques locales et r gionales Campus d Orsay et vall e de Chevreuse plateau de Saclay de leur g om trie des formes du paysage associ es des ressources en eaux de surface et souterraines de l utilisation de ces mat riaux dans l activit humaine meuli re gr s argile Volume horaire Total 50 CM 23h TD 19h TP 8h Contenu Il s agira de cours TD TP int gr s bas s sur des exemples r gionaux que ce soient l acquisition des bases de la lecture des cartes topographiques et g ologiques relations relief r seau hydrographique distribution de sources lithologie g ologie la r alisation de coupes morpho g ologiques L tudiant r alisera une analyse compl mentaire sur le terrain des formes du paysage g omorphologie en relation avec la lithologie ainsi que l acquisition et le traitement des
50. 10 11 2004 48 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Mise en place du sch ma corporel Biol 281 L2S3 Responsable Fran ois AGNES UE de d couverte Comment se mettent en place les polarit s chez un organisme pluricellulaire Cette question fondamentale de la biologie du D veloppement est abord e par une approche pluridisciplinaire mol culaire g n tique et cellulaire chez plusieurs organismes mod les animaux x nope drosophile n matode et v g taux arabidopsis Objectifs Acqu rir une d marche scientifique et r aliser des exp riences Savoir r diger un compte rendu sous forme d une publication Comprendre un processus de d veloppement en l alt rant Comprendre les notions de diff renciation et de communication cellulaire dans l espace et le temps Comprendre les notions d expression g nique in vivo Comprendre le r le d un g ne dans un processus de d veloppement par le biais de mutants M thodologie Manipulation du vivant Drosophila melanogaster Xenopus laevis Caenorhabditis elegans et Arabidopsis thaliana Perception des plans d organisation embryons adultes Embryologie exp rimentale et analyse de ph notypes D tection du patron d expression de plusieurs g nes R daction d un compte rendu sous forme d article de recherche Pr requis notions de biologie du d veloppement Nombre maximum d inscrits 25 Contr le
51. 206b L2S4 Responsable Ally Aukauloo Type d U E obligatoire pour parcours BCH Objectifs Volume horaire Total 25h CM 12 TD 13 Plan des enseignements Introduction la Chimie Inorganique Place de la chimie inorganique dans le monde du vivant Relation chimie inorganique et chimie de coordination Recherche fondamentale et appliqu e Concepts atomiques utiles Densit de probabilit Formes des orbitales Remplissage lectronique Le tableau p riodique Evolution des propri t s Structures mol culaires Ecriture de Lewis liaison covalente doublet libre Mod le de r pulsion de paire VSEPR Topologie mol culaire Structures des solides Liaison ionique Propri t s Structures typiques Notions de r seau et de maille Propri t s de conduction Mod le de Bande Chimie de coordination I Notion de complexe acide et base de Lewis Nomenclature des ligands g om trique et Green Ligand comme porteur d information chimique application biologique D compte lectronique Inertie et labilit Notion de chimie redox Equipe p dagogique Universit Paris Sud 11 10 11 2004 63 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Physique des fluides en biologie transport et diffusion Phys292 L2S4 Responsables M Davier U E de d couverte Volume horaire Total 50 CM 18h TD 20h TP 12h Ecoulement des fluides fluides parfaits th or me de Bernoul
52. Clotilde Policar Universit Paris Sud 11 10 11 2004 126 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Bases de Donn es et Langages Formels Info225 L3S6 Responsables Christine Froidevaux U E obligatoire parcours BIBS Volume horaire Total 50 CM 24h TD 26h Objectifs Le but de ce cours est de donner d une part les l ments th oriques n cessaires la compr hension des Bases de Donn es et de leur utilisation et d autre part les bases l mentaires de la th orie des langages formels R sum Ce cours comprend deux parties Langages Formels Notions de langages formels et grammaires formelles Hi rarchie de Chomsky Langages r guliers automates et expressions rationnelles Notions de base sur les langages alg briques Bases de Donn es Aspects conception mod le entit association Mod le relationnel Programmation SQL Equipe p dagogique Universit Paris Sud 11 10 11 2004 127 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 BIOLOGIE MOLECULAIRE APPROFONDIE Biol 330 L3 S6 Responsables Michel Duguet et Jean Michel Rossignol U E au choix parcours BMC Objectifs Le but de l UE est de donner aux tudiants qui d sirent poursuivrent leurs tudes en master des connaissances approfondies sur les grands m canismes de la biologie mol culaire Ces donn es seront illustr es par des exemples pris essentiellement dans le do
53. Couplages entre r actions d oxydo r duction et synth se de l ATP phosphorylation oxydative Equipe p dagogique Pierre Le Mar chal Philippe Minard Nicolas Bayan Lisette Cohen Universit Paris Sud 11 10 11 2004 32 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Informatique Appliqu e la Biologie Biol 201 L2S3 Responsable Bruno Bost U E obligatoire Objectifs e d mystifier l outil informatique e former des tudiants imm diatement efficaces devant un ordinateur capables de s adapter aux volutions techniques pr visibles et capables de dialoguer avec des sp cialistes de l informatique e apporter les connaissances de base dans tous les domaines d utilisation de l informatique dans un contexte biologique e mettre en valeur la logique dans l encha nement d instructions ou de commandes e apprendre r diger d chiffrer la documentation technique manuel d utilisation d un programme e initier des logiciels classiques de biologie e familiariser les tudiants la pr sentation d un document scientifique sur ordinateur projet Plan des enseignements avec nb d heures Enseignement int gr en salle informatique volume horaire 40h 2 x 2h 12 x 3h e Introduction r le de l informatique en biologie exemples de logiciel de biologie RasMol e Syst mes d exploitation gestion des r pertoires et fichiers e Fichiers types fichiers de donn es ex
54. Cours TD VII d finition de domaines et de motifs Consensus Matrices pond r es profils HMM Cours TD VIH pr diction de structure sur s quences prot iques Mod le de Chou et Fassmann HCA Cours Pr requis bases de probabilit s et de statistiques Nombre maximum d inscrits selon salles informatiques disponibles Enseignants Michel Termier Guillemette Duchateau Nouyen Olivier Lespinet Universit Paris Sud 11 10 11 2004 L3 S6 5h 3h 7h 3h 2h 3h 6h 3h 5h 3h 5h 2h 3h 116 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Physiologie cellulaire et int grative PCI 1 Biol 323 L3S6 Responsables Danielle Feuvray et Laurence M ry U E th orique optionnelle parcours BMC et BOE Objectifs Il s agit essentiellement d une Physiologie mol culaire et cellulaire dont la compr hension a pour but de faire merger une physiologie int grative allant des chelles mol culaire et cellulaire celles du tissu et de l organe voire de l organisme entier Pr requis Modules de physiologie animale et de biochimie du L2 Volume horaire Total 50h CM 40h TD 10h Contenu des enseignements Fonctions cardiaque et respiratoire 10 h de CM 4h de TD Fonction respiratoire Transport des gaz par le sang M canique ventilatoire et r gulation Physiologie du syst me cardiovasculaire Anatomie fonctionnelle du c ur et tissus cardiaques Notions
55. Equipe p dagogique M Davier Universit Paris Sud 11 10 11 2004 88 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 La Physique des Syst mes Biologiques PhysB352 L3S5 Responsables Roland Mastripollito et Michael DuBow U E de d couverte Ce cours est ouvert aux tudiants en Biologie et en Physique et il pour but de compar comment les Physiciens et les Biologistes posent les questions scientifique d une mani re diff rente sur le m me sujet Plusieurs sujets seront tir s sur les niveaux d organisation ou sur l chelle de grandeur de la litt rature scientifique volume horaire 50h CM 30 TD 20 Qu est ce que la vie chelle plan taire La vie dans l univers La vie sur Mars ou Titan L origine de la vie sur Terre chelle d cosyst me Exemples des pr dateurs proies Pr dictibilit des mod les chelle d Organisme Observation in vivo D tection des tumeurs Les lois d chelle appliqu es aux organismes chelle Cellulaire R seau d interactions intracellulaires Morphologie et morphogen se Communication avec l environnement Mouvement cellulaire chelle Mol culaire Trafic intracellulaire Nanomachines et moteurs mol culaires Equipe p dagogique Michael DuBow Roland Mastripollito Olivier Martin Universit Paris Sud 11 10 11 2004 89 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Cha nes de Markov Math390 L3S5 R
56. Heude U E TP au choix parcours BMC Objectifs TP TD sur les eucaryotes humains compris Le TP commencera par une mutag n se d une souche mutante de levure de boulangerie Des r vertants seront isol s selon deux cribles Ces r vertants seront ensuite analys s par des tests de g n tique classique pour caract riser les diff rents types de r version obtenus Pr requis UE de de GEN et BM du L2 et GEN du L3 du parcours Biologie Cellulaire et Mol culaire Volume horaire 50h de TP TD tal s sur 8 semaines raison de 2 demi journ es s ances de 3h 15 par semaine s ances espac es de 2 ou 3 jours en raison du cycle de l organisme utilis lundi mercredi ou mardi jeudi ou mercredi vendredi Total 50h TD 25h TP 25h Plan des enseignements TP 12 s ances Th me Recherche et analyse de r vertants d une souche mutante de levure de boulangerie selon deux cribles 4 s ances mutag n se aux UV et r colte des deux types de r vertants 4 s ances analyse ph notypiques des r vertants et tests de compl mentation fonctionnelle avec des mutants de r f rence 4 s ances test de recombinaison pour distinguer r version intra ou extrag nique TD qui accompagnent le TP Pr paration du protocole de mutag n se UV et des cribles des r vertants Les diff rents types d v nement l origine des r versions La s lection des diplo des chez la levure Le test de compl mentation Lla
57. Ils d veloppent un projet de bioinformatique faisant appel des concepts et m thodes de math matiques et d informatique pour r soudre un probl me finalit biologique Dans le parcours L BIBS Math matiques ce TER est coupl avec le module Inf rence statistique ou le module Sch mas num riques pour les EDO suivant le choix des tudiants Equipe p dagogique Alain Denise Pr section 27 Marie Anne Poursat MdC section 25 Michel Termier MdC section 65 Universit Paris Sud 11 10 11 2004 120 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Chimie organique de synth se 2 Chim353 L3S6 Responsables Marie George Guillerez Type d U E au choix pour parcours BCH Objectifs R activit de fonctions en chimie organique ainsi que les principaux outils utiles en synth se h t ro l ments groupements protecteurs r arrangements Pr requis Chimie organique g n rale et analyse structurale Chim 351 Chimie organique de synth se 1 Chim 352 Chimie organique exp rimentale Chim 312 Volume horaire Total 50 h CM 22 h TD 28 h Plan des enseignements R arrangements mol culaires Pr sentation g n rale Migration sur un carbone d ficitaire en lectrons r arrangement de Wagner Meerwein exemple en biosynth se des terp nes r arrangements pinacolique et apparent s r arrangement de Wolff r arrangements en milieu basique benzilique Favorskii Migratio
58. Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Annexe 1 Licence de Biologie U E d enseignement Les programmes des UE se trouvent galement sur internet http omphale math u psud fr bpr LICENCE parcoursL html Universit Paris Sud 11 10 11 2004 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Semestre 1 page 2 10 Semestre 2 page 11 29 Semestre 3 page 30 52 Semestre 4 page 53 79 Semestre 5 page 80 108 Semestre 6 page 109 143 Semestre 1 UE type Titre ID Parcours ECTS 1 UEF CYCLES BIOLOGIQUES chez les ANIMAUX et les Biol 110 Tous 5 V G TAUX 2 UEF Biologie Cellulaire et Mol culaire Biol 111 Tous 5 3 UEF Architecture de la mati re de l atome aux Chim101b Tous 5 macromol cules biologiques 4 UEF Math matiques de la mod lisation I Math191 Tous 5 Sa UEC Chimie exp rimentale Chim 152 Tous 5 aussi en S2 5b UEC ENVIRONNEMENT GLOBAL geos1003 tous 3 Sc UEC Structures Fonctions de la cellule l organe Biol 112 Tous 5 5d UEO libre Tous 5 6 1 UEO Projet Professionnel Tous 2 5 6 1 UEF INTRODUCTION A LA GEOLOGIE Geos1001 Tous 2 5 Universit Paris Sud 11 10 11 2004 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 CYCLES BIOLOGIQUES chez les ANIMAUX et les V G TAUX Biol 110 L1S1 Responsables Jean Pierre MULLER Florence MOUGEL
59. M 24 h TD 26 h Plan des enseignements Chimie des alc nes et des alcynes Alc nes Structure R le des substituants Additions X2 HX H20 sels de Hg hydrures de bore RCO3H O3 H2 dihydroxylation carb nes Polym risations R actions en halog nation oxydation Poly nes Additions 1 2 ou 1 4 R action de Diels Alder r gios lectivit Alcynes Structure acidit Additions HX H20 X2 hydrures de bore H2 Organom talliques Li Mg Zn Pr parations R activit D riv s du Cuivre D riv s carbonyl s et analogues R activit g n rale Additions de nucl ophiles oxyg n s soufr s azot s carbon s ylures de phosphore St r os lectivit mod les de Cram et de Felkin Ahn mod le cyclique R actions du carbone en oev bromation nolates et r activit aldolisation et crotonisation namines Oxydation et r duction Baeyer Villiger r duction par les hydrures m talliques et les m taux r ductions de Wolff Kishner Clemmensen Meerwein Ponndorf Verley Acides carboxyliques et d riv s Pr paration des halog nures et des anhydrides d acides et leurs r actions avec nucl ophiles oxyg n s soufr s azot s et carbon s r duction par les hydrures r actions du carbone en Claisen Dieckmann D carboxylation des c toacides Alcools Ethers Comportement d amphot res et r activit g n rale Alkylation acylation formation d ac tal
60. Pr sentations orales et supports power point Histologie cytologie des l ments du syst me reproducteur Causes et effets des perturbations du syst me reproducteur illustration par des cas cliniques Organisation des essais cliniques internationaux Assurance qualit Equipe p dagogique S Brisset A M Courtot D Chesnoy Marchais C Massaad G Tachdjian D Schoevaert M Wahl R Zoroob Universit Paris Sud 11 10 11 2004 129 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Immunologie Biol 331 L3S6 Responsable O N sse P Galanaud UE de d couverte Objectif Apprendre les concepts de base de l immunologie pour comprendre les techniques utilisant les anticorps et pour pr parer l tude des maladies du syst me immunitaire Volume horaire Total 50h CM 25 TD 25 Plan Cours Le concept du soi et non soi les anticorps le compl ment les cellules du syst me immunitaire les organes du syst me immunitaire les m canismes pr sentation d antig ne cytotoxicit TD Diff renciation et isolement des leukocytes migration cytokines th orie de techniques utilisant des anticorps western blot imunogluorescence ELISA immunopr citipation production des anticorps cytom trie en flux Enseignants J Kanellopoulos O N sse P Galanaud Universit Paris Sud 11 10 11 2004 130 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Physi
61. Principales caract ristiques d une r action chimique quation chimique stoechiom trie avancement de r action grandeurs de r action Pr vision du sens des transformations spontan es affinit chimique potentiel chimique tats de r f rence Applications aux r actions biologiques r actions coupl es Loi des quilibres chimiques constante thermodynamique d quilibre Applications aux r actions en solutions aqueuse L eau milieu du monde vivant solvant solut Acide base D finition de pH et d acidit Pr dominance des esp ces Comparaison de deux acides Mesure et calcul des pH Variation de pH au cours de dosage Oxydo r duction Degr d oxydation Ph nom ne de transfert d lectron pile Diff rence de potentiel Electrode et lectrode de r f rence Potentiel standard Equation de Nernst Variation de potentiel en fonction du pH Les exemples seront choisis afin d illustrer les r actions acide base et les r actions redox du milieu vivant Travail exp rimental Chimie en solution Ouvrages de r f rence F Chouaib et al Thermodynamique et Equilibres Chimiques De Boeck Universit P Arnaud cours de Chimie Physique Dunod Equipe p dagogique Nicolas Dacheux Romuald Drot Universit Paris Sud 11 10 11 2004 38 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Physico chimie des eaux naturelles Chim 294 L2S3 Responsables Roger Auger U E de d couvert
62. ajeurs Pr sentation des principaux groupes syst matiques et leur volution Introduction la micropal ontologie microfossiles marins Commentaires L enseignement pratique de ce module s appuie sur un travail personnel d analyse et d observation des tudiants valoris par un contr le continu Ref Bibliographique Isabelle Cojan amp Maurice Renard S dimentologie Edition Masson pages 418 Raymond Enay Pal ontologie des invert br s Edition Dunod pages 233 Gerard Bignot Introduction la Micropal ontologie Paris France Editions des Archives Contemporaines 2001 Soft Cover Equipe p dagogique Christophe COLIN et Giuseppe Siani Universit Paris Sud 11 10 11 2004 104 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 G n tique des populations et quantitative Biol 334 L3S5 etS6 Responsable PH Gouyon P Capy U E obligatoire parcours BOE Ecologie Objectifs Le cours de G n tique des Populations a pour but de donner les bases de cette discipline aux tudiants de 3 ann e Il s agit d abord de leur faire comprendre les notions de population et dans la population de fr quences d un all le et d un g notype On voit ensuite les diff rentes forces qui agissent sur ces fr quences d une part les pressions volutives qui agissent sur les fr quences all liques s lection mutation migration et d rive d autre part les forces qui d cident les fr que
63. aments anti tumoraux Equipe P dagogique Sames SICSIC Guy LEWIN Jean Daniel BRION et collaborateurs Universit Paris Sud 11 10 11 2004 92 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Pharmacotechnie L3S5 Responsable V ronique ROSILIO U E optionnelle Objectifs Donner aux tudiants des connaissances de base en formulation et pharmacotechnie Volume horaire Cours 25 heures Plan des enseignements 1 Introduction au M dicament et au devenir in vivo du principe actif Principe actif excipient Relation entre voie d administration et forme pharmaceutique Phases bio pharmaceutique pharmacocin tique et pharmacodynamique 2 Voies d administration et formes pharmaceutiques sp cifiques Voie parent rale Voie orale Voie rectale Voie cutan e Autres voies 3 Formes pharmaceutiques et formulation Pr formulation Formulation 4 Op rations pharmaceutiques Fabrication de formes s ches Fabrication de formes liquides Fabrication de formes liquides injectables Equipe P dagogique V ronique ROSILIO Universit Paris Sud 11 10 11 2004 93 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Microbiologie clinique Physiopathologie et bases du traitement des maladies infectieuses bact riennes virales parasitaires et fungiques Biol L3S5 Responsable Anne COLLIGNON U E d couverte parcours BHS Objectifs Donner aux tudiant les
64. antes croissance nutrition changes gazeux excr tion maintien Il s agira de re situer les diff rents types cellulaires dans le contexte m me des tissus et organes accomplissant une fonction Les diff rents niveaux d organisation seront tudi s en parall le et de mani re comparative entre des organismes animaux et des organismes v g taux De m me l int gration de ces diff rentes fonctions sera mise en vidence dans les organismes unicellulaires procaryotes et eucaryotes Volume horaire Total 50h EI 24 h TP 21 h TD 5h 1 Introduction g n rale 7h30 Pr sentation des techniques et outils utilis s microscopie photonique lectronique coloration Pr sentation de diff rents types de cellules pr parations coupes Association des cellules en tissus 2 Int gration des grandes fonctions l chelle unicellulaire 3h Fonctionnement de la param cie 3 Croissance et d veloppement 3h tude du m rist me de racine d une plante et de son fonctionnement mise en vidence de la zone mitotique et de la zone d longation 4 Nutrition 10h30 tude du tube digestif de Vert br estomac et de l intestin gr le Relations avec l appareil circulatoire tude de la racine changes membranaires au niveau des cellules tude compar e des ent rocytes Vert br et des poils absorbants de l appareil racinaire des plantes S cr tion prot ique dans le pancr as tude au ni
65. ar transposition chez la Drosophile TD 6 cartographie chez les procaryotes TD 7 Op rons bact riens TD 8 syst me mod le pour les maladies humaines TD 9 G n tique des Populations description et volution des populations TD 10 G n tique des Populations r gimes de reproduction Equipe p dagogique C Astier PR D Coen PR A Sainsard Chanet PR P H Gouyon PR F Chalvet MC S Liotenberg MC S Arnaise MC B Albert MC C Karmazyn MC A M Deneubourg MC J Girard Bascou MC M C Daugeron MC Universit Paris Sud 11 10 11 2004 31 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Biochimie Biol 200 L2S3 Responsable Pierre Le Mar chal U E obligatoire tous les parcours de la mention biologie et mention biologie chimie Volume horaire Total 50h CM 25h TD 25h Objectifs et programme Introduction la structure des mol cules biologiques au m tabolisme nerg tique et l enzymologie Structure et propri t s des acides amin s Structure et fonctions des prot ines Exemple des anticorps Enzymes D finitions Bases de la cin tique enzymatique Inhibitions comp titive et non comp titive Structure des acides nucl iques Structure des compos s osidiques mono et polysaccharides M tabolisme nerg tique Exemples de voies m taboliques et de leur r gulation Notion de transduction des signaux R le central de l ATP
66. aromatique Friedel Crafts Transposition de Beckmann Equipe p dagogique Universit Paris Sud 11 10 11 2004 132 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 M dicaments antiviraux et anticanc reux Biol L3S6 Responsables B Roy L Cohen Type d U E au choix pour parcours BCH Objectifs Cet enseignement a pour but de donner aux tudiants de L3 des notions de pharmacologie en prenant comme exemple des mol cules actives en th rapies anticanc reuse et antivirale et en insistant sur les aspects relation structure activit de ces m dicaments Volume horaire Total 50 h CM 10 h TD 20 h TP 20 h Plan des enseignements CHIMIOTHERAPIE ANTICANCEREUSE e Principes g n raux strat gies anticanc reuses cytotoxicit cycle cellulaire e M dicaments alt rant l ADN agents alkylants chlorm thine nitrosour e agents intercalants daunorubicine doxorubicine d riv s du platine cisplatine carboplatine oxaliplatine agents scindants bl omycine e Antim tabolites analogues nucl osidiques 6 mercaptopurine fludarabine cladribine pentostatine cytarabine S fluorouracile gemcitabine analogues de l acide folique m thotrexate raltitrexed inhibiteurs de la ribonucl otide r ductase hydroxyur e Inhibiteurs de l ADN topoisom rase I ou II Jinot can topot can toposide e Alt ration du fuseau mitotique alcalo des de la pervenche vinblas
67. artie II analyse statistique de r sultats exp rimentaux Introduire l analyse de donn es plut t que des manipulations de lois de probabilit s L accent est mis sur 1 la compr hension de la notion de variable al atoire et de test statistique 2 une attitude critique par rapport aux conditions d application d un test Lien entre histogrammes des donn es et loi d une variable al atoire Description de la loi fonction de r partition esp rance variance Exemples de lois uniforme binomiale gaussienne calcul de probabilit s d v nements calcul de sommes ou calcul d aires Echantillons in galit de Bienaym Tchebychev loi des grands nombres Confrontation des donn es au mod le choix de la loi introduction aux tests par des calculs de P value exemples particuliers chi 2 proportion moyenne Ajustement d une courbe un nuage de points introduction aux mod les de r gression lien entre Partie I et Partie IT Aide la r ussite aide au travail universitaire Proposition d exercices sous WIMS v rification en TD des notes de cours Ouvrages de r f rence Math matiques pour les sciences de la vie de la nature et de la sant J P et F Bertrandias Presses Universitaires de Grenoble Equipe p dagogique M A Poursat et S Lemaire Universit Paris Sud 11 10 11 2004 6 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Chimie exp rimentale Chim 152 L1S1 Responsables
68. aspect sociologique thique en passant par l cologie impact des OGM sur l environnement Cette d couverte se fera sous forme d un enseignement int gr avec des conf rences faisant intervenir des chercheurs d organismes de recherche tels que le CNRS ou l INRA et sous forme de Travaux Pratiques L valuation sera faite par le biais d un travail de recherche bibliographique Il s agit d un enseignement totalement transversal faisant intervenir des disciplines aussi vari es que la microbiologie la biologie mol culaire la biologie cellulaire la biologie v g tale la biologie animale l cologie et la sociologie Volume horaire Total 50 h EI 25h TP 25h Plan des enseignements EI Construction d un Organisme G n tiquement Modifi Pr sentation des diff rents mod les Escherishia coli transformation des plantes par Agrobacterium tumefasciens transformation animale Utilisation des OGM en recherche fondamentale en l agriculture et dans les biotechnologies Conf rences par des chercheurs en agronomie pourquoi produire des plantes et animaux transg niques en biotechnologies utilisation des OGM pour la production de m dicaments ou de cosm tiques et des chercheurs fondamentaux Impact des OGM sur l environnement Introduction aux notions de flux de g nes et de succ s reproducteur sous forme de cours int gr s Perception des OGM par la soci t Conf rences et discussions
69. atifs et reproducteurs Cette UE est adapt e au programme du concours CAPES Volume horaire Total 50h CM 20 TD 20 TP 10 Plan des enseignements Cours 20h e M thodes et outils de classification appliqu s au monde v g tal e Organisation volutive du monde photosynth tique e Diversit et volution de l appareil v g tatif e Diversit et volution de l appareil reproducteur TP TD EI 30h e Diversit volution des appareils v g tatifs et des modes de reproduction chez les Algues Bryophytes Pt ridophytes Gymnospermes e Etude de grandes familles d Angiospermes Poac es Rosac es Fabac es Ast rac es e Evolution de la fleur chez les Angiospermes e Etudes comparatives de pollen Contr le des connaissances examen contr le continu Equipe p dagogique Genevi ve BELLIARD Pr Michel DRON Pr Sophie NADOT MCF C line CHARON MCF Emmanuel PICARD MCF Jacques de BUYSER MCF Dara SIHACHAKR MCF Universit Paris Sud 11 10 11 2004 135 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 G n tique des populations et quantitative Biol 334 L3S6 Responsable PH Gouyon P Capy U E obligatoire parcours BOE Ecologie Objectifs Le cours de G n tique des Populations a pour but de donner les bases de cette discipline aux tudiants de 3 ann e Il s agit d abord de leur faire comprendre les notions de population et dans la popul
70. ation de fr quences d un all le et d un g notype On voit ensuite les diff rentes forces qui agissent sur ces fr quences d une part les pressions volutives qui agissent sur les fr quences all liques s lection mutation migration et d rive d autre part les forces qui d cident les fr quences g notypiques tant donn les fr quences all liques panmixie consanguinit homogamie h t rogamie effet Wahlund Pour chacune de ces forces la mod lisation de base est donn e La combinaison de ces forces permet de comprendre l existence de maladies g n tiques quilibre s lection mutation d une part et celle du polymorphisme s lection s il est stable quilibre mutation d rive s il est neutre d autre part Enfin le d s quilibre de liaison est introduit Tout au long de cette pr sentation on s attache rendre chaque calcul compr hensible traiter des exemples et rappeler autant que faire se peut que le milieu agit sur le ph notype Cet enseignement pr sentera galement la notion de caract re quantitatif en d finissant les diff rentes sources de variation ph notypique On abordera les notions d h ritabilit et de r ponse la s lection Volume horaire Total 50 h CM 24h TD 26h TP 0 Plan des enseignements CM Loi de Hardy Weinberg H r dit li au sexe Base des modules avec s lection Equilibre mutation s lection d rive g n tique Syst mes de repro
71. ation de l expression g nique Voyage d une prot ine du g ne la fonction Introduction l immunologie TD Isolement des cellules Marquages des cellules vivantes ou fix es Culture cellulaire eucaryotes Transfection des cellules eucaryotes cytosquelette adressage des prot ines apoptose prolif ration et cancer recherche personnelle sur un sujet scientifique et expos oral r gulation de l expression des g nes Equipe p dagogique J C Callen M Lemullois O N sse N Oestreicher Universit Paris Sud 11 10 11 2004 139 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Risque chimique et toxicologie de la mol cule la population et l environnement Chim 394 L3S6 Responsables I Masson U E de d couverte parcours BOE ecologie Objectifs Initier aux risques physico chimiques toxiques et cotoxiques li s aux activit s de chimie recherche industrie et leur pr vention Acqu rir des notions de base sur l action des substances trang res x nobiotiques sur l organisme toxicologie et sur l environnement cotoxicologie Volume horaire Total 50 CM 18h TD 20h TP 12h Pr requis UEs de chimie organique et ou bio inorganique et ou de biologie biochimie conseill es R sum Cours Le risque chimique et physico chimique au laboratoire dans la soci t et pour l environnement pr vention des risques r glementation valuation de la
72. ations TD2h 5 R gimes de reproduction TD2h 6 Loi de Hardy Weinberg TD2h 7 Mod les de st rilit m le TD2h 8 G n tique quantitative 1 TD2h 9 G n tique quantitative 2 TD2h 10 G n tique quantitative 3 TD2h 11 Probl mes d Annales d examens TD2h 12 Probl mes d Annales d examens TD2h 13 Probl mes d Annales d examens TD2h Equipe p dagogique PH Gouyon M Solignac P Capy C Lavigne E Baudry D Manicacci B Albert Universit Paris Sud 11 10 11 2004 105 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Probabilit s et statistiques I Math207 L3S5 Responsables M Gu nais U E de d couverte parcours BOE Ecologie Volume horaire Total 50 CM 20h TD 30h R sum Espace de probabilit Notion de mod le d une exp rience al atoire construction d un espace de probabilit espace et probabilite produit independance et probabilites conditionnelles Variables al atoires esp rance et variance lois et repr sentations graphiques lois et mod les classiques Statistiques Loi des grands nombres et probl mes d estimation Introduction aux tests d hypoth ses et intervalles de confiance Th or me Central Limite illustrations introduction aux lois continues Des illustrations sont vues au cours de s ances de travaux pratiques utilisant le langage Matlab Un travail personnel sera demand au cours de ces s ances de TP Equipe p dagogique M Gu nais
73. atique Enseignants D FEUVRAY PR H DANIEL PR M TAOUIS PR D GRIPOIS MC UPS Universit Paris Sud 11 10 11 2004 117 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Biologie et physiologie cellulaire et mol culaire v g tales Biol 324 L3S6 Responsable Dao Xiu Zhou U E au choix parcours BMC Objectifs Ce module compl te en l enrichissant de l UE de L2 Grandes fonctions des plantes en insistant particuli rement sur les r gulations Le but est de s int resser aux m canismes cellulaires et mol culaires qui permettent de comprendre le fonctionnement de la plante en interaction avec le milieu L enseignement de ce module permet aux tudiants d avoir une connaissance de base large et int gr e sur la science du v g tal permettant aux tudiants de facilement s int grer un Master en science v g tale Volume horaire Total 50h CM TD 50 Plan des enseignements M tabolisme carbon et azot Assimilation de soufre et synth se d acides amin s essentiels L oxyg ne dans le m tabolisme v g tal M tabolisme secondaire et la diversit mol culaire chez les plantes Transports d ions et nutrition min rale Hormones v g tales Communication cellulaire Interaction plante environnement abiotique et biotique Phylog n tique ph notypique Equipe p dagogique J L Prioul G Noctor M Kreis D Zhou M Dron S Nadot Universit Paris Sud 11 10 11 2004 118 Lice
74. aux diff rents milieux sous une perspective volutive Cette UE est adapt e au programme du concours CAPES Volume horaire Total 50h CM 5 TD 10 TP 35 Plan des enseignements L enseignement se fera sous forme de Travaux Pratiques avec quelques cours int gr s Une part importante sera donn e au travail personnel encadr sous forme de projets r alis s par groupes de 2 4 tudiants Chaque projet concernera un biotope particulier du parc botanique exemple prairies milieux humides milieux forestiers etc et consistera en une tude de la diversit floristique du milieu suivie d une analyse des caract ristiques morphologiques anatomiques et taxonomiques des esp ces r pertori es Ces projets donneront lieu la r daction d un m moire et une pr sentation orale Une visite des serres tropicales du jardin des serres d Auteuil Paris sera programm e pendant le module afin d illustrer la diversit des adaptations en milieu tropical Besoins mat riels Salle de TP b t 360 quip e en microscopes et loupes binoculaires pour l examen du mat riel v g tal Salle informatique avec acc s internet pour la recherche documentaire Contr le des connaissances r daction d un m moire et pr sentation orale Equipe p dagogique Genevi ve BELLIARD Pr Michel DRON Pr Sophie NADOT MCF C line CHARON MCF Bruno LASCAUX technicien Universit Paris Sud 11 10 11 2004 137 Licence
75. bases scientifiques n cessaires la compr hension des processus physiopathologiques et du traitement des maladies infectieuses bact riennes virales parasitaires et fungiques Former des tudiants pour les masters orientation Sant Volume horaire Total 50 h CM 32 h TD 18 h Plan des enseignements gt Interactions h te microorganismes Portes d entr e modes de transmission modes de diffusion dans l organisme gt tiologie et physiopathologie des principaux syndromes infectieux Infections des voies respiratoires Infections du tube digestif Infections du tractus g nito urinaire Infections du syst me nerveux central Infections syst miques gt Bases th oriques de la chimioth rapie anti infectieuse Antibiotiques Antiviraux Antifungiques Antiparasitaires gt Strat gies de th rapeutique anti infectieuse Equipe p dagogique UFR Pharmacie Chatenay Malabry D partement Microbiologie Anne COLLIGNON Thierry LAMBERT Anne Marie QUERO Laboratoire de Parasitologie et Mycologie Jean Charles GANTIER UFR M decine Kremlin Bic tre Service de Microbiologie Patrice NORDMANN Universit Paris Sud 11 10 11 2004 94 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Ergonomie Sant et Travail Biol 345 L3SS Responsables J Richardson U E d couverte parcours BHS Objectifs Ce module destin aux tudiants en biologie aussi bien qu aux tudiants souhaitant s
76. bstituants sur la r activit et l orientation Substitution nucl ophile m canisme par addition limination par limination addition benzyne sels de diazonium H t rocycles aromatiques H t rocycles pentagonaux Pr paration Paal Knorr Knorr R activit substitution lectrophile comportement de di nes N alkylation du pyrrole porphyrines Indoles pr paration Fischer Bischler Reissert substitution lectrophile H t rocycles azot s hexagonaux Cas de la pyridine pr paration Hantzsch substitution lectrophile substitution nucl ophile substitution sur l azote acidit des m thylpyridines exemple de la biochimie NAD NADP Equipe p dagogique Universit Paris Sud 11 10 11 2004 121 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 TP de physiologie cellulaire et int grative PCI 2 Biol 326 L3S6 Responsable Danielle Feuvray coordinatrice Laurence M ry U E pratique optionnelle parcours BMC BHS et BOE biologie int grative Objectifs Il s agit essentiellement d une Physiologie mol culaire et cellulaire dont la compr hension a pour but de faire merger une physiologie int grative allant des chelles mol culaire et cellulaire celles du tissu et de l organe voire de l organisme entier Pr requis U E de physiologie animale et de biochimie du L2 U E PCI 1 du L3 Volume horaire Total 50 h TP 24h TD 18h FI 8h
77. ces permut es s quences al atoires Cours 5h TD 3h VII d finition de domaines et de motifs Consensus Matrices pond r es profils HMM Cours 5h TD 2h VIH pr diction de structure sur s quences prot iques Mod le de Chou et Fassmann HCA Cours 3h Pr requis bases de probabilit s et de statistiques Nombre maximum d inscrits selon salles informatiques disponibles Enseignants Michel Termier Guillemette Duchateau Nouyen Olivier Lespinet Universit Paris Sud 11 10 11 2004 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Chimie th rapeutique L3S5 Responsable Jean Daniel BRION U E optionnelle Objectifs Donner les connaissances de base de la chimie th rapeutique n cessaires la formation des biologistes NB le suivi des deux UE Pharmacom trie Pharmacologie mol culaire et Pharmacocin tique et Chimie th rapeutique est fortement conseill Volume horaire Cours 30 heures TD mod lisation mol culaire 20 heures Plan des enseignements gt La conception du m dicament Ses tapes essentielles Les voies de la d couverte Les strat gies nouvelles mod lisation mol culaire gt Cibles et grandes classes th rapeutiques Cibles nucl aires et m dicaments intervenant dans les processus hormonaux Cibles bact riennes et virales et m dicaments de l infection Cibles membranaires et m dicaments du syst me nerveux central Cibles cellulaires et m dic
78. ceux qui ne poursuivent pas apr s la LICENCE d emporter un bagage cons quent en Biologie Mol culaire Pour ceux qui poursuivent en MASTER les notions acquises dans cette Unit leurs seront utiles dans une grande vari t de parcours Volume horaire Total 50 h CM 36h TD 14h Plan des enseignements I Les fondements exp rimentaux de la Biologie Mol culaire 8h CM II Grands m canismes de la Biologie Mol culaire Procaryotes et Eucaryotes 24h CM 1 R plication R paration Recombinaison 2 Transcription 3 Traduction HI Biologie Mol culaire des Plantes 4h CM Enseignants pressentis Michael DuBow Pr Michel Duguet Pr Claudine Parquet MC Jean Michel Rossignol Pr Cecile Pasternak Martin Kreis Pr Christian Velot MC Universit Paris Sud 11 10 11 2004 81 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Biologie structurale Prot ines et Acides Nucl iques Biol 301 L3SS Responsable Philippe Minard UE obligatoire parcours BMC et BIBS Objectifs Donner les connaissances de base en biochimie des macromol cules connaissances n c ssaires pour l ensemble des formations en biochimie et biologie cellulaire et mol culaire Volume horaire Cours 32 heures TD 18 heures Plan des enseignements gt Expression et purification des prot ines gt M thodes d analyses et de caract risation gt Structure des prot ines Structure secondaire propri t s pr diction d
79. ch es processus de Poisson cha nes de Markov en temps continu Les TP permettront d aborder l tude par simulations de processus al atoires discrets Aide la r ussite aide au travail universitaire mise disposition d exercices sous WIMS travail sur la r daction de comptes rendus des s ances de simulations Equipe p dagogique S Lemaire Universit Paris Sud 11 10 11 2004 90 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Analyse des S quences G nomiques Biol 344 L3S5 et S6 Responsable Michel Termier UE obligatoire pour le parcours BIBS Objectifs faire comprendre les algorithmes d analyse de s quences les plus usuels Volume horaire Total 50 h CM 36 h TD 14h Plan des enseignements avec volume horaire I Bases de donn es Cours 5h TD 3h IT Alignements Algorithme de Smith et Waterman Matrices de substitution PAM et BLOSUM BLAST FASTA heuristiques associ es Annotation Cours 7h TD 3h IHI Complexit de s quence compression entropie de Shannon complexit linguistique Cours 2h IV langages formels automates finis d terministes grammaires r guli res motifs Prosite Cours 3h V recherche de motifs exacts m thode na ve par automates algorithme de Boyer Moore arbre des suffixes d g n rescence Cours 6h TD 3h VI Traces des mutations et de la s lection sur le g nome Biais de codon linguistique Markovienne s quen
80. compr hension du processus 12h Introduction ludique la phytopathologie au travers d un logiciel interactif de diagnostique et des m thodes de lutte contre les maladies des plantes 6h Transformation de plantes sup rieures via Agrobacterium tumefaciens Notions de base sur les plantes transg niques et production de plantes transg niques de tabac 9h Visites d organismes de recherche et d installations de culture des plantes IBP Ferme du Moulon INRA 4h Equipe p dagogique Marianne DELARUE Delphine SICARD Martine THOMAS Universit Paris Sud 11 10 11 2004 23 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Les Insectes dans la Biosph re diversit et r les Biol 175 L1S2 Responsable Dani le Marchal UE de d couverte I Abondance Diversit et Adaptabilit des Insectes 3h EI 6h TP Les raisons de leur succ s adaptations anatomiques et physiologiques Pr sentation phylog n tique Les m thodes d valuation du nombre d esp ces D veloppement post embryonnaire manipulation et reconnaissance de divers types de larves et nymphes d Holom taboles avec une cl de d termination TP Crit res de reconnaissance des principaux ordres d Insectes utilisation de faunes TP II Place des Insectes dans les cha nes trophiques 3h EI Interactions entre les tres vivants mutualisme neutralisme antagonisme R gimes alimentaires des Insectes phytophagie z
81. condation embryogen se pr coce et mise en place du plan d organisation organogen se et d veloppement post embryonnaire IV Conclusions g n rales EI et TD Biologie V g tale EI 1 Organisation des plantes ligneuses EI 2 Arabidopsis pr sentation du mod le EI 3 Gam togen se m le et femelle chez les plantes EI 4 Sp cificit s de la cellule v g tale Biologie Animale EI 1 Les fonctions vitales EI 2 Le milieu int rieur EI 3 Gam tog n se m le et femelle chez les Amphibiens EI 4 Mise en place du sch ma corporel chez le x nope S ance commune de synth se TD 3h Comparaison organismes animaux et v g taux TP Biologie V g tale TP1 Organisation g n rale d une plante annuelle Le Pois TP2 M rist me structure fonctionement et r le dans la croissance modulaire Biologie Animale TP1 Morpho anatomie de la grenouille adulte Etude du plan d organisation d un vert br TP2 D veloppement embryonnaire du x nope Equipe p dagogique Michel Dron Marc Girondot Jean Pierre Muller Fran ois Agn s Solange Bertrandy Florence Mougel Jacques de Buyser C line Charon Marianne Delarue Marie Dufresne Emmanuel Picard Universit Paris Sud 11 10 11 2004 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Biologie Cellulaire et Mol culaire Biol 111 L1S1 Responsable Leonard Rabinow U E obligatoire Objectifs Introduction aux bases de la biologie cellulaire et mol
82. cons quences des excisions d l ments transposables les diff rents types de suppressions G nie g n tique et Biotechnologie Notion et utilisation de g nes rapporteurs comme outil de recherche microbienne optimisation des souches bact riennes pour la production de mol cules d int r t industriel ou th rapeutique etc Equipe p dagogique Chantal Astier PR C cile Pasternak Sylviane Liotenberg MC Corinne Levi Meyrueis et C line Karmazyn Universit Paris Sud 11 10 11 2004 112 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 G n tique des Eucaryotes Syst mes mod les et G n tique Humaine GEN3 Biol 329 L3S6 Responsable Annie Sainsard Chanet Antoine Boivin U E olbigatoire parcours BHS au choix parcours BMC et BIBS Objectifs Cette UE est consacr e tous les eucaryotes humain compris Des notions introduites en GEN 2 du L2 seront d velopp es comme par exemple la complexit de la relation g notype ph notype Les interactions g niques et leur int r t fonctionnel seront l un des th mes majeurs ainsi que la r gulation de l expression des g nes eucaryotes Des exemples de transmission pig n tique seront galement abord s Tous ces th mes seront abord s par la g n tique classique la g n tique mol culaire et la g n tique inverse Pr requis GEN2 et BM du L2 Volume horaire Total 50h CM 30h TD 20h Plan des enseignements CM s
83. culaire et de la biochimie Volume horaire Total 50h CM 30h TD 20h Plan des enseignements CM 17 s ances de 2 h illustrent les fonctions cellulaires les composantes de la cellule et leur r le fondamental ainsi que le dynamisme de ces processus 10 h Mol cules du vivant liaisons chimiques acides nucl iques acides amin s et prot ines lipides sucres polysaccharides 12 h Biologie de la cellule cycle cellulaire mitose et m iose recombinaison cytosquelette trafic membranaire transformation nerg tique 12h Expression g nique transcription et sa r gulation m tabolisme des ARNm traduction TD 14 s ances de 1h 30 compl tent les cours magistraux 1 3 d entre elles viendront en appui des cours de biochimie et de biologie mol culaire les 2 3 restant sont destin s pr senter les techniques principales en biologie cellulaire illustrer les cours magistraux et mettre en vidence la notion de compartimentation de la cellule eucaryotique r soudre des exercices base exp rimentale permettant d analyser les grandes fonctions cellulaires Equipe p dagogique Jean Claude Callen Marie Hel ne Cuif Anne Marie Deneubourg Pierre Dutuit Michel Jacquet Jean Marc Jallon Martin Kreis Michel Laurent Michel Lemullois Oliver Nusse Leonard Rabinow Martine Thomas Dao Zhou Universit Paris Sud 11 10 11 2004 4 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biolog
84. de m canique cardiaque Circulation coronaire Physiologie du muscle stri cardiaque Structure et ultrastructure Couplage excitation contraction Prot ines contractiles et prot ines r gulatrices de la contraction Physiologie du muscle lisse de la paroi vasculaire Architecture de la paroi Structure et ultrastructure des cellules musculaires lisses Couplage excitation contraction Prot ines contractiles et r gulatrices R le de l endoth lium El ments de neurophysiologie centrale 10h de CM 2 h de TD Mo lle pini re organisation relations avec les centres supraspinaux R flexes somatiques de la mo lle pini re comme voie finale commune Organisation de l enc phale Organisation et physiologie des syst mes sensoriels et des syst mes moteurs Organisation et physiologie du cortex moteur primaire voies pyramidales Voies extrapyramidales aires corticales ganglions de la base centre m senc phalique et bulbaire cervelet Endocrinologie et neuroendocrinologie 12 h de CM 2 h de TD Le complexe hypothalamo hypophysaire La thyro de Les parathyro des Endocrinologie de la reproduction R gulation hormonale du m tabolisme phosphocalcique et du m tabolisme hydro min ral Le pancr as endocrine Les surr nales Les r cepteurs hormonaux Pathologies endocrines M tabolisme et fonction digestive 8 h de CM 2 h de TD Physiologie de la nutrition R gulation de la prise alimentaire Fonction h p
85. de m thodologie pour le cursus Biotechnologie Objectifs Module de formation pratique s adressant aux tudiants d sirant choisir un parcours professionnel DEUST de Biotechnologies Licence Professionnelle de Biologie Appliqu e l entreprise et destin les pr parer leur futur environnement de formation par alternance entreprise ou laboratoire Apprendre r aliser une s rie d exp riences en situation r elle avec soin et rigueur D velopper initiative autonomie prise de responsabilit et sens de l organisation dans ce contexte Volume horaire Total 90h TD 20h TP 70h Contenu des enseignements R alisation d une suite d exp rimentations alliant diff rentes techniques de microbiologie et de biochimie en associant les tudiants la production en masse d une enzyme purifi e Techniques techniques de base de microbiologie et de biochimie production de biomasse par fermentation extraction et purification de prot ines chromatographie lectrophor se tests d activit et de puret quipe p dagogique Robert AUFRERE Gilles HENCKES Sylviane LIOTENBERG Catherine DREUX Claire HULEUX Universit Paris Sud 11 10 11 2004 29 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Semestre 3 UE type Titre ID Parcours ECTS 1 UEF Introduction l Analyse G
86. des clones recombinants ayant ins r le g ne d int r t lacZ A partir du g ne lacZ ainsi isol clonage par PCR dans un vecteur d expression 2 partie en Biochimie Purification de la prot ine correspondante la B galactosidase exprim e partir du plasmide pr alablement construit et analyse de son activit enzymatique Enseignants C cile Pasternak Florence Constantinesco Nicolas Bayan Sylvie Gillet Claudine Parquet H l ne Th risod L Cohen Christian V lot C cile Lagaudri re Claire Huleux Laure Plan on Universit Paris Sud 11 10 11 2004 85 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Chimie organique de synth se 1 Chim352 L2S4 Responsable Marie George Guillerez Type d U E obligatoire pour parcours BCH Objectifs Etude de la r activit des principales fonctions en chimie organique Pr requis Introduction aux mol cules organiques Chim 151 R activit des mol cules organiques 1 Chim 251 R activit des mol cules organiques 2 Chim 252 Synth se organique exp rimentale Chim 253 partir de BC ou Structures et fonctions en Chimie organique Chim 104 Introduction aux m canismes r actionnels en Chimie organique Chim 202 Introduction aux techniques de s paration et d analyse Chim 203 R activit en chimie organique Chim 204 partir de PC Chimie organique g n rale et analyse structurale Chim 351 Volume horaire Total 50 h C
87. des connaissances r daction d un mini article de recherche volume horaire total 50 h CM 5h TD 10h TP 35h Equipe p dagogique F AGNES H COUVOISIER E CULETTO O BRONCHAIN M D LARUE J P MULLER Universit Paris Sud 11 10 11 2004 49 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Physiologie Int grative Biol 279 L2S3 Responsable Heather McLean UE de d couverte Objectif exposer aux tudiants la physiologie en tant que discipline d tude des grandes fonctions animales et humaines L objectif principal de ces enseignements est de montrer que l organisme vivant est un tout dont chaque partie ne peut tre dissoci e de l ensemble malgr la n cessit d une approche r ductionniste Les enseignements sont d compos s de la mani re suivante Physiologie des fonctions autonomes 6h Introduction l anatomie et la pharmacologie du syst me nerveux autonome en prenant comme exemple l influence motionnelle sur la r gulation cardiorespiratoire et la physiologie de l exercice Physiologie des syst mes sensoriels 6h Initiation au le fonctionnement g n ral des syst mes sensoriels suivie par un tude plus profonde des syst mes somesth sique et auditif Une partie de ces enseignements prendra forme d une s ance de travaux pratiques Physiologie comportementale 6h Exploration des tats de vigilance veille et sommeil et le comportement sexuel et ma
88. diants la pratique d un enseignement scientifique Les confronter la r alit d une classe C est dire les amener concevoir puis r aliser au cours d un stage en tablissement scolaire une activit d enseignement scientifique int gr e dans un projet de classe Analyser ensuite les situations p dagogiques rencontr es Volume horaire Total 50h CM 20h TD 30h D roulement des enseignements Information et tude en commun des programmes et instructions officiels sensibilisation ces directives R flexion collective sur l acte d apprendre et l acte d enseigner Information sur les th ories de l apprentissage Travail sur les repr sentations initiales et r flexion sur l importance du travail exp rimental Elaboration d un projet d enseignement scientifique par bin me sous la responsabilit d un tuteur Stage en bin me observation de la classe et mise en uvre du projet R daction d un m moire Pr sentation orale des projets r alis s avec analyse critique des situations p dagogiques rencontr es Capacit d accueil Groupes de 24 tudiants r partis en 12 bin mes Aide la r ussite encadrement de chaque bin me par un enseignant tuteur pour la pr paration du projet et la r daction du m moire Equipe p dagogique Anne Marie Callen et enseignants tuteurs Universit Paris Sud 11 10 11 2004 141 Licence Domaine Sciences Technologie
89. donn es de topographie l aide d instruments de mesures vari s niveaux optiques de pr cision th odolite GPS boussoles d cam tres Pr recquis aucun Commentaires Ce module permet l tudiant de faire le lien entre les observations et les mesures sur le terrain et les cartes ainsi r alis es Ce module permet l tudiant de mieux conna tre son environnement proche Ce module constitue un pr requis pour des modules plus en aval stage de terrain cartographie pal og ographie prospection g ophysique Des sorties sur le campus et en dehors du campus sont pr vues R f rence biblio www geosciences u psud fr ObjectifTerre Index html Equipe p dagogique V ronique Ansan Jean B bien Laure Dupeyrat Christelle Marlin Universit Paris Sud 11 10 11 2004 18 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Analyse et probabilit s Math 194 L1S2 Responsables R Fahlaoui U E de d couverte Objectifs Pr requis Math matiques de la mod lisation I Math191 R sum D veloppements limit s calcul de limites recherche de branches infinies Fractions rationnelles D composition en l ments simples Int grales m thodes de calcul int grations par parties changement de variables Application l tude des variables al atoires densit Equations diff rentielles d ordre 1 D finition d un quivalent calcul de limites suites convergen
90. duction Base de la g n tique quantitative TD Titre de la s ance Type C TD TP 1 Fr quences all liques TD2h 2 Diversit g n tique et biologie de la conservation TD2h 3 Pressions volutives TD2h 4 Simulations sur ordinateurs de l volution de populations TD2h 5 R gimes de reproduction TD2h 6 Loi de Hardy Weinberg TD2h 7 Mod les de st rilit m le TD2h 8 G n tique quantitative 1 TD2h 9 G n tique quantitative 2 TD2h 10 G n tique quantitative 3 TD2h 11 Probl mes d Annales d examens TD2h 12 Probl mes d Annales d examens TD2h 13 Probl mes d Annales d examens TD2h Equipe p dagogique PH Gouyon M Solignac P Capy C Lavigne E Baudry D Manicacci B Albert Universit Paris Sud 11 10 11 2004 136 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Botanique appliqu e aux milieux naturels Biol335 L3S6 Responsable Michel DRON Type d UEF EI TP module court UE obligatoire pour le pracours BOE Ecologie et au choix pour BOE Biologie int grative Objectifs de l UE Ce module constitue une suite logique l UE Botanique syst matique propos e en L3SS Il s agira d exploiter la richesse cologique du Parc Botanique de Launay autrement dit le campus universitaire afin d explorer la diversit floristique des milieux naturels L accent sera port sur les adaptations des organismes photosynth tiques
91. e Objectifs Utilisation exp rimentales des techniques physico chimiques l tudes des eaux naturelles Volume horaire Total 50 CM 10h TD Oh TP 40h Pr requis Aucun R sum Techniques d analyses Physico Chimiques spectroscopie visible spectroscopie atomique chromatographie polarographie potentiom trie et sur la physico chimie des eaux naturelles dissolution pr cipitation Etude bibliographique sur un sujet hydrologique Travail exp rimental Travaux Pratiques d analyse de l eau de la rivi re l Y vette et de la mare l aide d un mat riel moderne spectrom tre d absorption atomique spectrophotom trie U V visible polarographie chromatographie en phase gazeuse etc Equipe p dagogique Roger Auger Universit Paris Sud 11 10 11 2004 39 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 PALEONTOLOGIE et SOLS ET FORMATIONS SUPERFICIELLES Geol 2016 et 2017 L2S3 Responsables Giuseppe Siani et C cile Quantin U E de d couverte Volume horaire Total 50 CM 10 12hTD 5 7h TP 10 6h 1 Objectif L objectif de ce module est de donner aux tudiants une culture de base dans les domaines de la Pal ontologie Contenu Deux aspects de la pal ontologie sont pr sent s PALEONTOLOGIE GENERALE Objectifs m thodes et subdivisions de la Pal ontologie Organismes et milieux diffusion des esp ces conditions d existence Milieux biologiques
92. e syst me lymphatique El ments d immunologie Physiologie r nale 12h Travaux pratiques 18h 1 Batterie de diffusion 2 Activit lectrique du nerf sciatique 3 Potentiel de membrane Exp rimentation Assist e par Ordinateur 4 Physiologie du go t 5 Mesure du volume sanguin et dosage du sodium et du potassium plasmatique 6 Physiologie r nale EAO Travaux dirig s 7 5h 1 Activit ionique 2 Pouvoir tampon du sang 3 Potentiel de la membrane 4 Transports membranaires 5 Exploration fonctionnelle du rein Enseignants H DANIEL PR UPS D GRIPOIS MC UPS H McLEAN MC UPS L MERY MC UPS O MIGNEN MC UPS C RAMPON MC UPS Universit Paris Sud 11 10 11 2004 57 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Grandes Fonctions des Plantes Nutrition et Reproduction Biol 213 L2S4 Responsables U E au choix G Noctor cours A Mah TP TD Volume horaire Total 50h CM 20 h TD TP 30h 1 Comment se nourissent les plantes Cours G Noctor 10h D couverte de la photosynth se Bases physicochimiques de la photosynth se Capture de la lumi re et r actions photochimiques Transfert d lectrons et synth se d ATP Assimilation du CO2 Le cycle de Calvin Rapports photosynth se respiration La photorespiration La photosynth se en C4 Rapports source puits dans la nutrition v g tale Absorption et assimilation des min raux Fixation de
93. e cyclase Voie de la phospholipade C PLC Voie de la phospholipase A2 PLA2 Voie de couplage direct avec les canaux ioniques gt Pharmacocin tique R sorbtion Distribution M tabolisme Elimination principales voies d administration des m dicaments tapes de r sorption de distribution de m tabolisme et d limination des m dicaments param tres de quantification m canismes du passage membranaire des m dicaments et cons quences cin tiques Equipe P dagogique Alain GARDIER Denis DAVID Robert FARINOTTI et coll Universit Paris Sud 11 10 11 2004 96 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 ECOLOGIE FONCTIONNELLE et APPLIQUEE EFA Biol 304 L3S5 Responsables A Louveaux U E Obligatoire parcours BOE Ecologie et au choix pour Biologie int grative UE Commune aux parcours Licence Biologie des Organismes aux Ecosyst mes Licence Professionnelle de Biologie appliqu e l entreprise Objectifs Bases de l cologie fonctionnelle et appliqu e dans la continuit de PUE Ecologie et biologie quantitative des populations du L2S4 et de UE Organisation des Ecosyst mes du L3S3 Pr requis aucun Nombre maximum d inscrits 80 110 20 groupe Volume horaire Total 50h CM30h TD 10h TP 10h Plan des enseignements Cours magistraux La biosph re aspects fonctionnels et globaux Flux de l nergie et de la mati re production primaire et s
94. e de motivation en vue de recherche de stage pr parer un entretien ou comment savoir se pr senter et donner les raisons de son choix de stage comment r diger un rapport de stage et pr parer un expos oral soutenance du projet personnel Stages 75 heures en S4 Les stages peuvent se r aliser dans des domaines vari s comme l cologie la neurobiologie la biochimie la biologie du d veloppement la microbiologie la bioinformatique mais aussi la chimie la communication scientifique l environnement etc Ils se d roulent dans des laboratoires de recherche universitaire ou d organismes de recherche CNRS INRA CEA INSERM mais aussi dans des laboratoires priv s d analyses biologiques en entreprises en cliniques v t rinaires ou encore dans des parcs animaliers ou des parcs r gionaux Certains prennent la forme de stages de terrain ou de stages de sensibilisation aux m tiers de l enseignement UE SME41 SUIVI des STAGES et EVALUATION Chaque tudiant est encadr sur son lieu de stage par un ma tre de stage et est suivi l universit par un enseignant r f rent dont le r le est de suivre le bon d roulement du stage et de noter le m moire et l expos oral de l tudiant Le stage se termine par la r daction d un rapport crit et une soutenance orale au cours de laquelle l tudiant est valu EQUIPE PEDAGOGIQUE Une cinquantaine d enseignants r f rents en biologie plus quelques uns dans
95. e et diast r otopie de centres et de faces Utilisation dans l tude des d shydrog nases NAD M canismes R actionnels Substitutions Nucl ophiles Eliminations Substitutions nucl ophiles G n ralit s SN1 SN2 st r ochimie Influence du groupe partant du nucl ophile de la structure du substrat du solvant du cation associ Comp tition SN1 SN2 SN intramol culaire R arrangements du carbocation Assistance anchim rique Eliminations G n ralit s El E2 Elcb St r ochimie orientation Comp tition substitution limination Influence de la structure du substrat du solvant de la temp rature Principales r actions d limination Double limination alcynes Equipe p dagogique Universit Paris Sud 11 10 11 2004 84 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 FORMATION PRATIQUE BIOCHIMIE BIOLOGIE MOLECULAIRE Biol 303 L3S5 Responsables C cile Pasternak et H l ne Th risod U E de TP obligatoire parcours BMC et BIBS Objectifs Coupler les outils de Biologie Mol culaire et de Biochimie dans l tude d un g ne mod le lacZ et de son produit afin de montrer les int r ts et la compl mentarit de ces 2 approches exp rimentales pour un syst me donn Volume horaire 70 h 2 semaines compl tes Contenu des enseignements 1 partie en Biologie Mol culaire Construction d une banque g nomique d Escherichia coli et s lection
96. e et programmation Info226 Eco 5 BIBS en Universit Paris Sud 11 10 11 2004 109 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 S4 6b UEC Risque chimique et toxicologie Chim394 Eco BCH 5 6c UEC Apprendre enseigner les SVT Biol337 BI 5 6f UEC Histoire des sciences HSci203 BI 5 6g UEC Stage G ologie Biologie G os32B BI 5 Universit Paris Sud 11 10 11 2004 110 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Dynamique cellulaire Biol 320 L3S6 Responsable Oliver N sse U E obligatoire parcours BMC et BHS au choix pour parcours BIBS Objectifs Compr hension de la cellule comme unit dynamique d pendante de int grant la g n tique et la biochimie de ses composantes Volume horaire Total 50h CM 23 TD 18 TP 9 Plan des enseignements CM G nome et programme cellulaire Diff renciation et mort cellulaire Modes de localisation des constituants cellulaires le voyage d une prot ine du g ne la fonction Introduction la signalisation Cytosquelette Morphogen se et polarit Adh sion cellulaire interactions cellulaires formation des tissus et organes partir de cellules Le d placement cellulaire TD Isolement des cellules Marquages des cellules vivantes ou fix es Culture cellulaire eucaryotes M thodes d analyse dynamique du trafic intracellulaire Transfection d
97. eaux L arbre du vivant Les trois domaines bact ries arch es et eucaryotes arbre non racin Diversit des arch es et des bact ries les bact ries photosynth tiques chez les eucaryotes monophylie des m tazoaires monophylie des plantes vertes monophylie des eumyc tes polyphylie des algues importance de la biodiversit des protistes les endosymbioses chloroplastiques l endosymbiose mitochondriale Histoire de la vie sur Terre Histoire rapide de la Terre temp rature volution de l atmosph re l importance de la pal ontologie dates importantes 1 TeS traces de vie de cellules eucaryotes d organismes multicellulaires les res g ologiques ph nom nes d explosion Ediacara Burgess et d extinction Permien KT sortie de l eau apparition des t trapodes et des plantes fleurs Pr sentation des eucaryotes Les algues exemple de regroupement polyphyl tique unit cologique notion de cycle de d veloppement alternance de phases gam tophytique et sporophytique exemples de diff rentes solutions Les plantes terrestres classification des arch goniates le cycle de d veloppement dans les diff rents groupes r duction de la phase gam tophytique Les m tazoaires arbre mol culaire des m tazoaires les ponges les diploblastes les triploblastes les coelomates s paration protostomiens deud rostomiens position des grands phylums mollusques ann lides a
98. econdaire Les grands cycles g ochimiques D mographie natalit mortalit lois de croissance des populations Strat gies d mographiques r et K Fluctuations saisonni res et pluriannuelles Dynamique des populations R gulation densit d pendante mod le de Lotka et Volterra relations proies pr dateurs Ecophysiologie animale et v g tale Adaptations aux contraintes du milieu R ponse des v g taux aux teneurs en nutriments Erosion de la biodiversit et protection des esp ces l homme dans la biosph re Effet de serre pollutions Gestion des ressources naturelles TP et TD D mographie loi de Lotka et Volterra Relations proies pr dateurs Strat gies r et K des Lumbricidae M thodes de mesure de l environnement microclimatologie Ecophysiologie Activit biologique des sols respirom trie Equipe p dagogique Marc GIRONDOT Paul LEADLEY Pierre Henri GOUYON professeurs Alain LOUVEAUX Jean Chistophe LATA Peter STREB Claire DAMESIN Ma tres de Conf rences Universit Paris Sud 11 10 11 2004 97 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Biologie Animale Biol 305 L3S5 Responsable M Girondot U E Obligatoire parcours BOE Ecologie Objectifs La phylog nie des m tazoaires sera d crite ainsi que sa relation avec la classification Ensuite des caract res seront tudi s en utilisant ce canevas phylog n tique et en y int grant des donn es mol culaires d
99. econstruction phylog n tiques Diversit des modalit s d veloppementales Notions homologie feuillet embryonnaire axes blastopore coelome m tam re c phalisation programme de d veloppement Urbilat rien Reproduction Organisation g n rale et mise en place de l appareil reproducteur gam togen se ins mination ovulation R gulation neuroendocrine de la reproduction quelques modes de reproduction originaux parth nogen se oviparit viviparit et ovoviviparit polyembryonie paedogen se D termination du sexe D veloppement embryonnaire Bases du d veloppement embryonnaire des Amniotes mod les aviaire le poulet et euth rien murin et humain Les annexes embryonnaires D veloppement post embryonnaire La mue des Ecdysozoaires Les modalit s de la m tamorphose chez les M tazoaires contr le neuroendocrinien Le t gument structure fonctions renouvellement coloration les phan res et les glandes des Vert br s et les pathologies L appareil respiratoire et les changes gazeux L appareil circulatoire des Vert br s adaptation la vie a rienne L appareil excr teur Diversit d veloppement excr tion azot e et r gulation de l quilibre hydromin ral Structure des organes sensoriels photor ception m canor ception gustation olfaction Communications animales en relation avec le comportement sexuel et teritorial D veloppement et volution Explosion Cambrie
100. es 3 points suivants retracer l histoire volutive des Insectes sous forme d un tableau situer dans l arbre phylog n tique les 3 innovations majeures qui seraient l origine de la radiation volutive des Insectes pr sence d ailes pr sence d un stade chrysalide co volution avec les Angiospermes int r ts et les limites des tudes pal ontologiques TD Evolution du membre chiridien des T trapodes illustration de la notion d homologie structurale et d adaptation du squelette diff rents modes de locomotion chez les Vert br s 3h TD Phylog nie et donn es morpho anatomiques Le but est d apprendre aux tudiants la m thode de reconstruction phylog n tique en r pondant 2 questions les Artiodactyles forment ils un groupe monophyl tique et Les animaux sang chaud forment ils un groupe monophyl tique 3h TD Synth se Cette s ance permettra de faire r fl chir les tudiants l issue des TP et TD sur l ancien arbre et le nouveau Quels sont les caract res pertinents permettant d aboutir au nouvel arbre 1h30 Equipe p dagogique Pierre Capy Dominique DeVienne Sophie Nadot Marie Dufresne Line Duportets Emmanuelle Baudry Solange Bertrandy Laurent Coutte Aur lie Hua Van Fran oise Jamen Claire Lavigne Florence Mougel Fanny Rybak Universit Paris Sud 11 10 11 2004 13 Licence Domaine Sciences Technologie Sa
101. es cellules eucaryotes cytosquelette adressage des prot ines apoptose prolif ration et cancer TP mouvement des cellules immunofluorescence mouvement intracellulaire des prot ines Equipe p dagogique J C Callen M H Cuif M Lemullois O N sse N Oestreicher Universit Paris Sud 11 10 11 2004 111 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 G n tique des organismes procaryotes GEN4 Biol 321 L3S6 Responsable Chantal Astier U E au choix parcours BMC et BIBS Objectifs Acqu rir les connaissances n cessaires la compr hension des m canismes contr lant l expression g nique chez les microorganismes pr requis GEN2 Volume horaire Total 50h CM 20h TD 30h Contenu des enseignements Organisation du mat riel g n tique G nomique comparative des procaryotes organisation des Supprim chromosomes transfert g n tique horizontal il ts de pathog nicit organisation des g nes impliqu s dans la symbiose Organisation en structures op ronales R gulation de l expression des g nes les diff rents niveaux et modes de r gulation r gulateurs transcriptionnels contr le positif et n gatif m canisme d att nuation notion de contr le global etc m canismes de transduction de signal syst mes deux composants r gulation en cascade Mutag n se et suppresseurs m canisme mol culaire de la transposition
102. es d analyse utilis s en biologie Volume horaire Total 50 h CM 25 h TD 25 h Contenu de l enseignement Radioactivit Electrophor se Chromatographie Spectrom trie et fluorim trie Cristallographie des prot ines RMN Spectrom trie de masse Microscopie Enzymologie Cytom trie Equipe p dagogique Nicolas Kellershon H l ne Th risot Sylvie GilLet Universit Paris Sud 11 10 11 2004 76 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 FORMATION PRATIQUE BIOLOGIE MOLECULAIRE Biol L2 S3 S4 Responsables Robert AUFRERE et Gilles HENCKES U E sp cifique du cursus biotechnologies Objectifs Apprendre r aliser une s rie d exp riences en situation r elle avec soin et rigueur D velopper initiative autonomie prise de responsabilit et sens de l organisation dans ce contexte Volume horaire Total 90h TD 20h TP 70h Contenu des enseignements R alisation sur 3 semaines temps complet d une exp rience alliant techniques de biologie mol culaire et de biochimie clonages mol culaires purification d ADN PCR restriction ligature transformation surproduction et purification de prot ines en associant les tudiants la r alisation pratique d une partie d un programme de recherche Equipe p dagogique Robert AUFRERE Gilles HENCKES Universit Paris Sud 11 10 11 2004 11 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie
103. es de calcul num rique Int gration num rique d quations diff rentielles Recherche des racines d un polyn me Application la m thode des isoclines nulles R flexion et exp rimentation sur la notion de mod le en biologie Des syst mes mol culaires aux cosyst mes unicit et polymorphisme des mod les Introduction aux notions d tat stationnaire et d tat d quilibre et leur stabilit par analyse de l article Modelling the dynamics of language death Nature 2003 424 900 Ajustement des param tres d un mod le aux donn es Principe de la r gression lin aire formalismes alg brique et matriciel Exemples biologiques Pond ration statistique et variance en r gression lin aire Principe et application en cin tique enzymatique __ R gression non lin aire principe de la m thode de Newton Application et programmation Utilisation de la fonction datafit de Scilab Exemples biologiques Introduction la mod lisation de syst mes dynamiques Moultistabilit en biologie d finition conditions d existence notion d hyst r se et exemples biologiques op ron lactose autor gulation des facteurs de transcription D un attracteur ponctuel au chaos mod le de Verhulst it ration graphique de l quation logistique Attracteur de Lorentz Chaos cardiaque Du chaos aux fractales Rythmes biologiques exemple des rythmes circadiens et exemple des mod les proies pr dat
104. es entre ces types cellulaires et pr sente galement l environnement liquidien de ces cellules en insistant particuli rement sur la r gulation de l osmolarit du PH et des divers volumes liquidiens extracellulaires Les exemples analys s en d tail feront appel aux divers mod les animaux vert br s et invert br s Volume horaire Total 50 CM 25 5 TD 18 TP 7 5 Plan des enseignements Cours 25 5h Physiologie cellulaire Interactions fonctionnelles entre cellules gliales et neurones Bases et techniques de l lectrophysiologie cellulaire courant impos patch clamp Communications cellulaires signaux lectriques canaux ioniques sodiques et potassiques sous tendant les potentiels d action conductance l mentaire probabilit d ouverture courant global courbes courant voltage inactivation pharmacologie et messagers chimiques tude de la synapse neuromusculaire organisation fonctionnelle r cepteurs ionotropes nicotiniques Un exemple de physiologie sensorielle la sensibilit gustative reconnaissance transduction et codage des saveurs fondamentales 13 5h L environnement liquidien de la cellule Les compartiments liquidiens de l organisme sang lymphe et liquide interstitiel mesures de leur volume de leurs concentrations ioniques changes entre ces compartiments R gulation de l osmolarit du volume et du PH des liquides extracellulaires Le sang L h mostase La lymphe et l
105. es r actions alcanes alc nes et alcynes d rives halog n s alcools ald hydes et c tones acides carboxyliques et d rives Analyses d articles et expos s de biochimie organique Equipe p dagogique Pierre LE MARECHAL Universit Paris Sud 11 10 11 2004 72 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 BIOINFORMATIQUE ET STATISTIQUES Biol L2 S3 S4 Responsable Bruno BOST U E sp cifique du cursus biotechnologies Objectifs Ma triser les m thodes statistiques propres l analyse de r sultats exp rimentaux Utiliser de mani re rationnelle un micro ordinateur comme outil d analyse bases de donn es tableur analyse statistique de recherche d informations banques de donn es sites Internet Volume horaire Total 50h EI 50h Contenu des enseignements M thodes statistiques Internet et des moteurs de recherche Interrogation de banques de donn es biologiques et traitement des s quences ADN Prot ines Equipe p dagogique Bruno BOST Universit Paris Sud 11 10 11 2004 73 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 CHIMIE GENERALE Biol L2 S3 S4 Responsable Christine HOUSSIN U E sp cifique du cursus biotechnologies Objectifs Comprendre les principes r gissant les r actions chimiques de fa on rendre intelligibles les probl mes d nergie ainsi que les notions physico chimiques sous jacentes t
106. es scientifiques Volume horaire Total 50h Biologie Mol culaire TP 23h TD 10 h Biochimie TP 11 h TD 6 h Plan des enseignements TP TD de Biologie Mol culaire Transformation d Escherichia coli et identification des caract ristiques n cessaires un plasmide pour se maintenir dans cet organisme Ce TP permet d aborder les notions de banque d ADN g nomique de s lection et pression de s lection et d exp riences t moins Outils et techniques mis en jeu Digestion par des enzymes de restriction ligature transformation d un organisme tests ph notypiques r sistance sensibilit des antibiotiques r v lation de l activit B galactosidase lectrophor se en gel d agarose Southern blot utilisation de sondes non radioactives TD PCR Marquage d un fragment d ADN Clonage et caract risation d un g ne par diverses techniques de biologie mol culaire TP TD de Biochimie A partir d un extrait bact rien d Escherichia coli purification de la B galactosidase sur r sine changeuse d ions D termination des activit s enzymatiques avant et apr s purification Analyse de l efficacit de l tape de purification calcul du rendement et du facteur de purification Evaluation de la puret de l enzyme lectrophor se sur gel d acrylamide TD Bioinformatique Structure de la Bgalactosidase d termination des param tres cin tiques TD tude de documents importance biologique
107. esponsables S Lemaire U E de d couverte parcours BIBS Objectifs d crire les propri t s des cha nes de Markov homog nes espace d tats fini ou d nombrable qui servent de mod les dans divers domaines de la biologie ex mod les d volution de g notypes mod les d volution mol culaire mod les simples d volution de la taille d une population mod les utilis s pour analyser la r partition des nucl otides d une s quence d ADN Cette tude permettra d introduire les outils math matiques de base servant l tude des processus al atoires discrets Volume horaire Total 50 CM 20h TD 15h TP 15h Pr requis calcul matriciel probabilit s loi d une variable al atoire discr te R sum Vecteurs al atoires discrets loi d un vecteur lois conditionnelles esp rance conditionnelle simulation D finition et exemples de cha nes de Markov Etude de la loi d une cha ne de Markov espace d tats fini l aide du calcul matriciel Etude du temps d atteinte d un tat de la cha ne de Markov Mesures invariantes et r versibilit Classification des cha nes et comportements asymptotiques Propri t s des fonctions g n ratrices et applications l tude des cha nes de Markov et en particulier au processus de Galton Watson Introduction des processus al atoires discrets plus complexes ex cha nes de Markov homog nes d ordre m cha nes de Markov phas es cha nes de Markov ca
108. eurs Mod lisation de processus stochastiques la m thode de Gillespie Principe et applications biologiques Nombre maximum d inscrits 20 Contr le des connaissances examens crit avec documents 2 3 de la note et oral 1 3 de la note quipe p dagogique Michel LAURENT Nicolas KELLERSHOEHN Universit Paris Sud 11 10 11 2004 66 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Biologie interdisciplinaire Bio L2S4 Responsable JP Muller UE de d couverte obligatoire pour le cursus bioconcours Objectifs Compl ments de chimie de maths et de biologie faisant partie du programme pr paratoire du Concours B d ENSA Agronomie et ENV v t rinaire S adresse aux tudiants pr parant ce concours Volume horaire TD 50 heures Plan Chimie 10h Maths 10h Biologie 30 h Equipe p dagogique I Masson Mr Fahlaoui J P Muller Universit Paris Sud 11 10 11 2004 67 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 La terre processus endog nes et exog nes Geos21B L2S4 Responsables Beate ORBERGER U E de d couverte Objectif Donner aux tudiants les bases en Sciences de la Terre afin de comprendre l volution et le fonctionnement g odynamique globale de la plan te Terre et pratiquer les m thodes classiquement utilis es pour son tude Volume horaire Total 50 CM 25h TD 25h Contenu Cristallographie Mi
109. g ographique cologique sociologique etc D couverte du campus d Orsay 6h Les multiples facettes du campus d Orsay Le campus jardin botanique et espace public Le sch ma directeur du campus Art et histoire des jardins 18h L art des jardins de l antiquit nos jours Application visite de trois jardins de styles diff rents Travail personnel sur un jardin Arts plastiques et criture 15h Travail sur la technique du croquis sur la repr sentation en trois dimensions bloc diagramme maquette et sur l criture Travail personnel 8h Evaluation des connaissances Rendus d arts plastiques commentaires d articles comptes rendus de visites projet d am nagement Equipe p dagogique Sophie Nadot MC Orsay Olivier Chauveau responsable des espaces verts et des espaces publics Orsay Boris Menguy paysagiste DPLG Universit Paris Sud 11 10 11 2004 43 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 SPORT NATURE Biol 271 L2S3 Responsable Alain Louveaux UE de d couverte Objectifs Cette UE d couverte est destin e des tudiants qui pratiquent un sport et ont une forte motivation pour les Sciences de la Nature L enseignement est en partenariat entre la Biologie et l UFR STAPS L UE a pour but d associer la pratique d activit s physiques de pleine nature une connaissance du milieu Elle ouvre sur la Licence de Biologie Appliqu e l Entrepr
110. ganiques Chim 151 R activit des mol cules organiques 1 Chim 251 R activit des mol cules organiques 2 Chim 252 Volume horaire Total 50h TP Plan des enseignements Travaux pratiques de synth se organique Alcools et c tones Pr paration d un alcool tertiaire par synth se magn sienne Menthone et menthol tude st r ochimique Synth se de l aspirine et du salicylate de m thyle Synth se de deux fragrances orange et menthe Equipe p dagogique Universit Paris Sud 11 10 11 2004 61 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 R activit des mol cules organiques 2 Chim252 L2S4 Responsable Christian Girard Type d U E obligatoire pour parcours BCH Objectifs Introduction la synth se organique Pr requis Introduction aux mol cules organiques Chim 151 Introduction aux mol cules organiques R activit des mol cules organiques 1 Chim 251 R activit des mol cules organiques 1 Volume horaire Total 25 h CM 12 TD 13 Plan des enseignements Substitutions lectrophiles R actions radicalaires R arrangements mol culaires Etude de quelques groupes fonctionnels biologiquement int ressants amines et leurs d riv s alcools thers oxydes thiols etc Equipe p dagogique Universit Paris Sud 11 10 11 2004 62 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Chimie bioorganique Chim
111. ganiques par spectroscopie D termination des groupements fonctionnels par spectroscopie infrarouge D termination du squelette de la mol cule par r sonance magn tique nucl aire RMN D termination de la masse de la mol cule et sa composition atomique par spectrom trie de masse Effets lectroniques Effets inductif et m som re Aromaticit Effets lectroniques sur l acidit ou la basicit des compos s organiques Travaux exp rimentaux Mod lisation mol culaire Interpr tation de spectre RMN et IR Equipe p dagogique Christian Girard David Bonnaf Universit Paris Sud 11 10 11 2004 15 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Optique M canique Energie Phys160 L1S2 Responsables R Parentani U E au choix R sum contenu 1 Propri t s de la lumi re et optique g om trique a ondes lectro magn tiques longueur d onde photon et relation nergie longueur d onde b Propagation des ondes lumineuses et optique g om trique c Lois de Snell Descartes images optiques et lentilles minces d Applications l oeil le microscope et le pouvoir s parateur 2 M canique a vitesse acc l ration et lois de Newton b Forces et nergie potentielle forces dissipatives c Conservation et non conservation de l nergie d Conservation de l impulsion lors des chocs 3 Applications a le dip le lectrique b le mouvement Brownien des mol cules
112. i re la dynamique des bioc noses et les principes de gestion conservatoire Milieux tudi s Les tudes de terrain n cessiteront des d placements dans la r gion Les principaux milieux envisag s Forestier campus Rambouillet Dul aquicole un ruisseau R marde Un tang Rambouillet Milieu tourbeux et landes tourbeuses Rambouillet Pelouses et prairies PNR Chevreuse Milieux calcaires de la bioc nose pionni re la for t calcaricole Bouville Volume horaire Total 50 h CM 5h TD 10h TP 35h Type d enseignement Etude concr te sur le terrain r colte de donn es syst matiques mesures de param tres environnementaux puis exploitation des donn es en salle Contraintes Activit s group es par journ e journ e sur le terrain 1 2 journ e en salle A r aliser sur avril mai juin Enseignants C BOCK A LOUVEAUX P LE MARECHAL X Hydrobiologie Universit Paris Sud 11 10 11 2004 29 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Initiation la Recherche sur les Plantes Biol 174 L1S2 Responsable Martine THOMAS UE de d couverte Objectifs Cet enseignement a pour but de fournir l tudiant un premier contact avec les diff rents aspects de la recherche sur les plantes Les relations entre la plante et son environnement seront abord es par des approches de g n tique et de physiologie v g tale Ce module comporte un volet exp
113. ie annexe 1 Architecture de la mati re de l atome aux macromol cules biologiques Chim 101b L1S1 Responsables Horst Frohlich U E obligatoire Objectifs Introduction aux mod les de description de la structure lectronique des atomes et mol cules structure mol culaire g n ralit s sur les tats de la mati re Volume horaire Total 50 CM 18h TD 32h Pr requis Aucun R sum Structure de la mati re introduction et mod les Structure lectronique des atomes Quantification des tats et des nergies Orbitales atomiques Classification p riodique des l ments et volution de quelques grandeurs physiques nergie d ionisation affinit lectronique rayon atomique et ionique lectron gativit Structure lectronique et g om trique des mol cules Repr sentation de Lewis r sonance et m som rie Pr vision de la g om trie par la m thode de R pulsion des Paires Electroniques de la couche de Valence VSEPR OM et CH4 C2H4 C2H2 Th orie de la liaison de valence hybridation des OA G n ralit s sur les tats de la mati re liquide solide mati re molle forces intermol culaires applications la description de la structure des macromol cules du vivant Aide la r ussite aide au travail universitaire Colles 4h Equipe p dagogique Horst Frohlich Universit Paris Sud 11 10 11 2004 5 Licence Domaine Sciences Technologie Sant men
114. in campus et environs Volume horaire Total 50 h CM 5h TD 10h TP 35h Programme Les Gymnospermes du campus principaux taxons caract res de reconnaissance biologie place dans les tages de v g tation Pr sentation des principales familles d Angiospermes repr sent es dans la r gion et de leurs esp ces les plus repr sentatives Apiac es Ast rac es Boraginac es Brassicac es Caryophyllac es Cyp rac es Ericac es Euphorbiac es Fabac es Juncac es Lamiac es ex Liliac es et voisines Plantaginac es Poac es Scrophulariac es Solanac es Renonculac es Rosac es Les descriptifs d une esp ce les caract res morphologiques et anatomiques les caract res biologiques type biologique ph nologie biologie florale particularit s de la nutrition les caract res chimiques m tabolisme secondaire nature des r serves utilisations les caract res biog ographiques r partition g ographique tage de v g tation cort ge floristique les caract res aut cologiques climat type d humus propri t s du sol la localisation biotopes formations v g tales groupements v g taux Les plantes comme indicateurs des param tres du milieu Notions sur la conservation et la gestion des esp ces et des bioc noses Enseignement Les connaissances des notions de base sont pr sent es sous forme de cours partir de l tude de documents notions de bi
115. ines e Homopolysaccharides e La transduction des signaux m tabolisme du glycog ne e Vitamines et coenzymes e Glycolyse voie de pentoses phosphate et cycle de Calvin e D carboxylation oxydative du pyruvate cycle de Krebs e Glucon og n se e M tabolisme de l azote e Structure biosynth se et d gradation des acides gras e M tabolisme des phospholipides Biochimie des membranes Lipides membranaires e Prot ines membranaires aspects structuraux e Bio nerg tique e Transports spontan s diffusion passive diffusion facilit e e Cha nes membranaires de transfert d lectrons e ATP synthase e ATPases membranaires e Transports actifs secondaires Equipe p dagogique Pierre Le Mar chal Marc le Maire Nicolas Bayan Claire Huleux Catherine Dreux Laure Plan on Lisette Cohen Universit Paris Sud 11 10 11 2004 83 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Chimie organique g n rale et analyse structurale Chim351 L2S4 Responsable MG Guillerez Type d U E obligatoire pour parcours BCH Objectifs Approfondissement des connaissances de chimie organique g n rale Pr requis Introduction aux mol cules organiques Chim 151 R activit des mol cules organiques 1 Chim 251 R activit des mol cules organiques 2 Chim 252 Synth se organique exp rimentale Chim 253 partir de BC ou Structures et fonctions en Chimie organique Chim 104 Introduction aux
116. ion Biologie annexe 1 M THODOLOGIE Biol 122 L1S2 Responsable Maurice Wegnez U E Obligatoire Objectifs Le but est d am liorer les m thodes d acquisition de connaissances tout en d couvrant une discipline Ce module sera accessible dans diff rentes disciplines au choix de l tudiant Biologie Biologie du D veloppement G n tique Biologie V g tale Chimie Analyse Chimique Plan des enseignements TD 1 Am lioration de la prise de notes e Analyse d images et de figures distinction entre protocole exp rimental et retranscription graphique d une exp rience 3 Recherche d information pertinente sur INTERNET 4 R daction du r sum d un texte 5 Lecture critique d un article de vulgarisation Recherche bibliographique sur un sujet propos par un enseignant ou choisi par l tudiant avec l accord d un enseignant Trois exercices devront tre accomplis par chaque tudiant Rapport crit Prestation orale Poster Volume horaire Total 50 heures quipe p dagogique Fabienne Chalvet Darion Coen Michel Laurent Jean Pierre Muller Jean Louis Prioul Martine Thomas Maurice Wegnez Universit Paris Sud 11 10 11 2004 28 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Techniques de laboratoire Biol L1S2 Responsables Robert AUFRERE et Gilles HENCKES UE de d couverte obligatoire pour le cursus Biotechnologie UE
117. ion de mati re r le environnemental 2 formations glaciaires fluviatiles oliennes et lacustres pour les formations allochtones Leur volution ainsi que leur exploitation ventuelle seront galement abord es Des TD analyses de cartes photographies a riennes bilans d alt ration illustreront ces cours th oriques ainsi qu une sortie sur le campus pr sentant les grands types de sols pr sents ainsi que leur relation avec la v g tation et l occupation humaine Pr requis aucun Equipe p dagogique Giuseppe Siani C cile Quantin Laurent Bergonzini Universit Paris Sud 11 10 11 2004 40 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 La physique et les m thodes exp rimentales en biologie Phys292 L2S3 Responsables R Mastrippolito U E de d couverte Volume horaire Total 50 CM 21h TD 21h TP 8h Contenu Contexte et question de biologie L id e de ou des mesures permettant de r pondre la question et les concepts physiques associ s rappel s o pr sent s suivant les cours Les ordres de grandeurs l exp rience est elle faisable Les d tecteurs et l instrument Des exemples de r sultats vers d autres applications Th mes abord s Des exp riences de Pasteur mod le du microscopique au macroscopique structure d une mol cule cristallo RMN spectro RMN voir une mol cule le tra age radioactif RMN fluorescent Ca d penda
118. ionnement des enveloppes externes afin de pouvoir aborder les principaux enjeux environnementaux du XXI me si cle Contenu Cours 30h TD 20h Pr sentation des enveloppes externes de la Terre circulation oc anique dynamique atmosph rique ph nom nes m t orologiques l eau continental Le bilan radiatif de la plan te Le cycle du carbone et les probl mes li s aux gaz effet de serre Impact de l homme sur les quilibres climatiques Les changements climatiques du pass les cycles glaciaires interglaciaires R ponse de la faune et de la flore aux changements globaux Interactions entre biosph re et climat Le cycle du CO2 et de l H20 dans la cro te et le manteau Interactions entre l hydrosph re et l atmosph re Les ressources nerg tiques les grands enjeux du XXI me si cle Pr requis aucun Volume horaire 50h C 30h TD 20h Equipe p dagogique Christophe Colin Jean B bien Marc Girondot Maurice Pagel Giuseppe Siani Universit Paris Sud 11 10 11 2004 8 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Structures Fonctions de la cellule l organe Biol 112 L1S1 Responsables Jean Claude CALLEN Florence MOUGEL et Jacques de BUYSER UE au choix Objectifs L objectif de cette unit d enseignement est d aborder les grandes fonctions du vivant en les traitant depuis l organisme jusqu au niveau cellulaire On prendra comme fil conducteur les fonctions suiv
119. ire et int grative Biol326 BMC BHS 5 5b UEC Travaux pratiques en physiologie v g tale Biol327 BMC 5 5c UEC Identification des microorganismes Biol BMC 5 Sd UEF Programmation orient e objet Info329 BIBS 5 5c UEC Chimie bioinorganique et bioorganique Chim355 BCH 5 6a UEF Bases de donn es et langages formels Info225 BIBS 5 6b UEC Biologie mol culaire approfondie Biol330 BMC 5 6c UEC Biologie humaine syst me reproducteur Biol BHS 5 6d UEC Immunologie Biol331 BMC BHS 5 6e UEO Physiologie du travail et milieux extr mes Biol BHS 5 6d UEC Synth Orga Exp TP Chim354 BCH 5 6e UEC M dicaments antiviraux et anticanc reux Biol BCH 5 Parcours Biologie des organismes aux cosyst mes BOE cursus Ecologie Eco et Biologie int grative BD UE type Titre ID Cursus ECTS 1 UEF Botanique syst matique Biol333 Eco BI 5 2a UEF Ecophysiologie v g tale Biol332 Eco 5 2b UEF Physiologie cellulaire et int grative Biol323 Eco BI 5 3a UEF G n tique des populations et quantitative Biol334 Eco 5 BI en S5 3b UEF Organisation et fonctionnement des cellules Biol341 BI 4a UEC Botanique appliqu e aux milieux naturels Biol335 Eco BI 5 4b UEC Initiation aux techniques de biologie mol culaire et Biol336 BI 5 biochimie S5 et S6 Sa UEF TP Biologie mol culaire et biochimie Biol342 Eco 5 5b UEF TP Physiologie cellulaire et int grative Biol326 BI 5 6a UEC Algorithmiqu
120. ise option Guide naturaliste L UE est aussi recommand e pour des tudiants qui souhaiteraient s orienter vers un Master en cologie ou se pr parer au m tier de professeur des coles Parcours La suite logique de cette UE d ouverture est le stage de Guillestre en milieu montagnard non tudi Orsay Ce stage adapt du stage de pr paration AGREG C Bock associe activit s naturalistes et sportives Volume horaire Total 50h TP TD 15 heures d cologie de terrain TP 36 heures de sports avec trois sorties mixtes G ologie Biologie Sport Course d Orientation et VTT 6 s ances de 3 heures pour 1 3 th orique et 2 3 pratique Pratique de la course d orientation Parc de Sceaux for t de Verri res for t de Meudon et vall e de Chevreuse Le d veloppement de la motricit sp cifique au VTT TRIAL Escalade 6 s ances de 3 heures reparties en 1 H de th orie et 2H de pratique Structures artificielles d escalade Site de bloc naturel Fontainebleau Les techniques de progression d assurage et de s curit Les notions d entra nement de pr paration physique Ecologie de terrain 5 s ances de 3 heures Connaissance des milieux dans lesquels se pratiquent les activit s de pleine nature Le massif de Fontainebleau G ologie botanique et faune Visite de S nart avec un Ing nieur forestier Etude du milieu aquatique sur une rivi re de l Essonne La R marde Faune benthique fl
121. ix parcours BMC Objectifs illustrer et compl ter le cours correspondant BPCMV Volume horaire Total 50 h CM 5h TD 10h et TP 35h Plan des enseignements TP TD Chloroplaste et r action de Hill 6h Aline Mah Mise en vidence des complexes photochimiques sur gels 6h Aline Mah Respiration v g tale 6h Aline Mah H l ne Vanacker Dosage de m tabolites carbon s et azot s dans des 12h Martine Thomas conditions physiologiques contrast es Isolement s paration et propri t s des anthocyanes 6h Peter Streb Hormones auxines cytokines ABA 6h C line Charon Interaction plante microorg 3h Marie Dufresne et C line Charon Phylog n tique 3h S Nadot Equipe p dagogique C line Charon Marie Dufresne Aline Mah Sophie Nadot Peter Streb Martine Thomas H l ne Vanacker Universit Paris Sud 11 10 11 2004 123 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Identification des microorganismes issus des milieux naturels Biol L3S6 Responsable Lo c Morin U E au choix parcours BMC Objectifs Ce module est destin approfondir l tude de la diversit du monde microbien travers l isolement et l identification de souches bact riennes partir d un milieu aquatique eau pur e Les techniques utilis es feront appel une bonne connaissance de la physiologie des microorganismes et il s agira donc d un enseignement int gr
122. l azote EI TP TD A Mah J Hoarau M Delarue H Vanacker 18 h TP S paration chromatographique de pigments photosynth tiques 6h TP Mesures d changes gazeux 7h EI Laplante et l eau 5h 2 Comment se reproduisent les plantes Cours G Belliard 10h EI TP TD Introduction Place des Angiospermes parmi les V g taux Organisation et fonction de la fleur La double f condation et ses cons quences Totipotence des cellules v g tales et reproduction asexu e Modalit s et r gimes de reproduction sexu e Syst mes favorisant l allogamie et le brassage g n tique Pollinisation transport c est dire diss mination des gam tes m les dans le pollen Importance de la polyplo die chez les plantes fleurs C Charon D Sihachakr E Picard P Dutuit M Dufresne 12h TP TDEtude de la fleur des Dicotyl dones 3h TP TDEtude des inflorescences 3h TP TDEtude de la fleur des Monocotyl dones 3h TP TD Fruits et graines 3h quipe p dagogique G Noctor cours A Mah TP TD ED C Charon TP TD ED Universit Paris Sud 11 10 11 2004 58 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Microbiologie Biol 215 L2S4 Responsable Lo c Morin U E au choix Objectifs Ce module est destin faire d couvrir aux tudiants la diversit du monde microbien dans son ensemble et notamment travers l apport des technologies r centes la compr hension du fonctio
123. la subduction et les fosses oc aniques exemple de la ceinture p ri Pacifique et de la faille de S Andrea La collision et la formation des cha nes de montagne par l exemple de l arc alpin Volcans et s ismes 4 El ments d histoire de la Terre de la condensation du syst me solaire l apparition de l homme diff renciation des enveloppes mouvement des masses continentales les grandes crises et les grandes coupures de l histoire terrestre grandes extinctions biologiques et changements globaux 5 El ments de climatologie l hydrosph re et l atmosph re Pr requis aucun Ref Biblio livres classiques de g ologie g n rale du 1 cycle universitaire Equipe p dagogique Pierre Yves GILLOT et Elisabeth GIBERT Universit Paris Sud 11 10 11 2004 10 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Semestre 2 UE type Titre ID Parcours ECTS 1 UEF Diversit du vivant et volution Biol 120 Tous 3 2 UEF L Approche G n tique du Monde Vivant GEN1 Biol 121 Tous 5 3 UEF Introduction aux mol cules organiques Chim Tous 5 151 4a UEF Optique M canique Energie Phys160 Tous 5 4b UEF Physique g n rale Phys Bioconcours 5 Sa UEC Chimie exp rimentale Chim Tous 9 152 aussi en S1 5b UEC GEOLOGIE LOCALE ET REGIONALE geos1005 Tous 5 5c UEC Analyse et probabilit s Math 194 Tous
124. li application a la circulation sanguine fluides visqueux coulement de Poiseuille mouvement dans un fluide visqueux application a la locomotion animale turbulence Ph nom nes de surface tension superficielle gouttes et bulles surfactant pulmonaire ascension capillaire Transport agitation thermique marche au hasard et diffusion transport passif de mol cules lois de Fick transport de quantit de mouvement et viscosit transport d nergie et quation de la chaleur transport actif sous l effet d un champ ext rieur relation d Einstein entre diffusion et viscosit s dimentation et centrifugation conductivit lectrique Equipe p dagogique M Davier Universit Paris Sud 11 10 11 2004 64 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Alg bre lin aire et analyse des donn es ALAD Math292 L2S4 Responsables E Gassiat U E obligatoire pour parcours BIBS et de d couverte pour les autres parcours de biologie Objectifs Bases d alg bre lin aire utiles pour l tude de tableaux de donn es R sum Espaces Vectoriels Outils de g om trie euclidienne Vecteurs gaussiens Applications lin aires et matrices associ es Mod le lin aire gaussien Inversion des matrices Syst mes lin aires Valeurs propres et vecteurs propres Analyse en composantes principales et lien avec le mod le lin aire Analyse factorielle des correspondances et lien avec les mod
125. liana surexprimant cette enzyme et dans les graines des plantes sauvages correspondantes 2 dans les feuilles d Arabidopsis thaliana et de ma s techniques utilis es dosage spectrophotom trique lectrophor se Le r le de la PEPC dans les voies m taboliques des plantes sup rieures sera d couvert puis analys partir de documents et les bases de l enzymologie seront enseign es en utilisant l outil informatique Equipe p dagogique Marianne Delarue MC Yves Deveaux MC Sylvie Gillet MC Marielle Lepinec MC Philippe Minard PR Marie No lle Raymond MC Philippe Robin MC Universit Paris Sud 11 10 11 2004 138 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Organisation et fonctionnement des cellules Biol 341 L3S6 Responsable Oliver N sse U E obligatoire parcours BOE Biologie int grative Objectifs Compr hension de la cellule comme unit du vivant et composante de tissus Obtention d une base large en biologie cellulaire et mol culaire pour int grer les liens entre la biochimie et la g n tique d une part et la biologie et physiologie des organismes d autre part Volume horaire Total 50h CM 38 TD 12 Plan des enseignements CM Caract ristiques des cellules et virus membranes organelles cytosquelette jonctions Echanges et communications intra et intercellulaires Cycle cellulaire ADN structure fonction maintien et expression R gul
126. ligatoirement tre suivie par les tudiants se destinant suivre les L3 biologie mol culaire et cellulaire ou biologie des organismes et cosyst mes Volume horaire TP 40h TD 10h Plan des enseignements TP Mat riel d tude la pomme de terre ou le bl Contenu du programme analyse histocytologique et cytoenzymatique du mod le biologique dans deux situations physiologiques l organe de r serve et la plantule fractionnement cellulaire des deux organes et caract risation des fractions obtenues purification de diff rentes macromol cules prot ines ADN polysaccharides pigments soit dans l organe de r serve soit dans la plantule mesure de l activit d une ou deux enzymes phosphatase acide amylase tyrosinase trac s de cin tiques de r action analyse de param tres physicochimiques influen ant l activit enzymatique d termination de l activit sp cifique de l une des enzymes pr c demment tudi e apr s dosage des prot ines et comparaison des activit s sp cifiques de cette enzyme dans diff rentes situations physiologiques organe de r serve et plantule mesure des changes gazeux au cours de la germination TD Chaque partie du TP sera pr c d e par des rappels de cours puis compl t e par des exercices en rapport avec le th me tudi Equipe p dagogique J C Callen G Cornic C Huleux M Lemullois Universit Paris Sud 11
127. listes pour construire une m thodologie statistique Analyse de donn es issues de mod les d volution Pr requis Math matiques de la mod lisation I R sum Partie I 30 heures Probabilit s et statistiques Tests d hypoth ses choix et construction tests gaussiens tests du chi2 couples de variables al atoires Partie II 20 heures Equation diff rentielles et m thodes num riques savoir crire une quation associ e un probl me donn conna tre les solutions classiques savoir faire une tude qualitative et ou num rique Exemples de syst mes dynamiques en dimension 2 Aide la r ussite aide au travail universitaire Proposition d exercices sous WIMS Equipe p dagogique Universit Paris Sud 11 10 11 2004 35 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Alg bre et statistiques Math294 L2S3 Responsables R Fahlaoui U E au choix Volume horaire Total 75 CM h TD h TP h Pr requis Math matiques de la mod lisation I Math191 et Analyse et probabilit Math194 R sum Alg bre lin aire Espaces vectoriels sous espaces vectoriels combinaisons lin aires ind pendances lin aires familles g n ratrices familles libres bases sous espaces engendr s droites et plans de l espace Applications lin aires composition d applications lin aires image noyau rang endomorphisme automorphisme projections vectorielles sym
128. maine des eucaryotes Cette UE sera un pr requis pour les tudiants souhaitant int grer la mention G nomes Cellules D veloppement Evolution du master Plan des enseignements Cours introductif comparaison des m canismes de r plication transcription traduction chez les pro et eucaryotes 3 h e R plication de la Chromatine et Division Cellulaire 6 h e R paration recombinaison dans les cellules eucaryotes l ments g n tiques mobiles 9 h e R gulation de l expression des g nes 10 h transcription de la chromatine et maturation des messagers contr le traductionnel e Biologie mol culaire et biotechnologie des cellules v g tales OGM 3 h e Utilisation biotechnologiques si RNA vecteur pIRES etc 2 h e Introduction la G nomique 2 h e Cours r capitulatif les virus eucaryotes mod les d tude de la biologie mol culaire 3 h TD 6 s ances de deux heures 12h Enseignants Pierre Capy Pr C cile Laugaudri re Michael DuBow Pr Cristina Panozzo Michel Duguet Pr Claudine Parquet Martin Kreis Pr Christian Velot Jean Michel Rossignol Pr Universit Paris Sud 11 10 11 2004 128 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Biologie humaine syst me reproducteur Biol L3S6 Responsable A M Courtot UE aux choix parcours BHS Objectifs Amener les tudiants une connaissance largie du syst me reproducteur en analysant les approches et m
129. mentaire externe Dans un second temps les principaux environnements s dimentaires continentaux et marins actuels ainsi que leurs homologues dans l ancien seront pr sent s et replac s dans le cadre de l histoire de l volution de bassins s dimentaires fran ais Le volet pal ontologique comprendra D finition de fossile processus de fossilisation Bioc nose et Thanatoc nose autochtonie et allochtonie remaniements Organismes et milieux diffusion des esp ces conditions d existence Milieux biologiques Pal o cologie les fossiles indicateurs des environnements du pass fossiles de faci s Pal obiog ographie les fossiles indicateurs pal og ographiques migrations migrations dispersions volution micro et macro volution extinctions th ories volutives Biostratigraphie fossiles guide biozonations datum planes Les res g ologiques Pal og ographie m thodologies pal ontologiques g ophysiques et g ologiques Etude des groupes taxonomiques les plus significatifs TP TD Reconnaissance multiscalaire des principales roches s dimentaires Signification faciologique de celles ci de la roche au s diment Les grands groupes de roches seront observ s l chelle de l chantillon et de la lame mince Les exemples seront pr sent s dans leur cadre g ographique et g ologique de leur bassin respectif Pal ontologie syst matique Les invert br s origine et plans d organisation m
130. n ralogie P trologie 10h CM 10h TD reconnaissance des roches et des min raux S dimentologie Pal ontologie Tectonique M tamorphisme 10 CM 10h TD reconnaissance des fossiles et p trologie microscopique Stratigraphie et m thodes de datation 5 h CM 5h TD cartographie g ologique pr requis aucun Equipe p dagogique Beate ORBERGER et X Universit Paris Sud 11 10 11 2004 68 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 ECONOMIE GENERALE Ecog33 L2S4 Responsable Fabrice LEQUEUX U E de d couverte Objectifs Ce cours est une introduction aux Sciences Economiques Son objectif est de fournir aux tudiants les connaissances n cessaires la compr hension des grandes doctrines et des m canismes conomiques Il doit leur permettre d analyser les objectifs et les instruments de la politique conomique actuelle de raisonner et de r agir sur les textes et les discours conomiques relay s par la presse ou la t l vision Volume horaire Total 50h CM 30h TD 20h TP Plan des enseignements CM Le circuit conomique production consommation pargne La monnaie cr ation mon taire agr gats convertibilit taux de change Cycles et conjoncture croissance et crises Le financement de l conomie le budget la fiscalit Le ch mage d finitions et politiques de lutte contre le ch mage Principes d conomie internationale contrainte ext rieure
131. n tique GEN2 Biol 202 Tous 5 2 UEF Biochimie Biol 200 Tous 5 3a UEF Informatique appliqu e la biologie Biol 201 Tous 5 3b UEF Thermodynamique et rayonnement Phys Bioconcours 5 4a UEF Math matiques de la mod lisation 2 Math291 Tous 5 4b UEF Alg bre et statistiques Math294 Bioconcours 5 5a l UEC R activit des mol cules organiques Chim251 Tous 5 aussi en S1 5a 2 UEC Physico chimie des eaux naturelles Chim294 Tous 5 5a 3 UEC Energ tique et transformations biologiques en milieu Chim201b BCH 5 aqueux tous en 54 5a 4 UEC Chimie g n rale et organique Chim Bioconcours 5 5b UEC Pal ontologie g n rale G os2016 Tous 5 Sols et formations et 2017 5c UEC La physique et les m thodes exp rimentales en Phys292 Tous 5 biologie 5d 1 UEC Microbiologie g n rale Biol276 Tous 5 5d 2 UEC D couverte du paysagisme Biol270 Tous 5 5d 3 UEC Sport nature Biol271 Tous 5 5d 4 UEC Ergonomie introduction Biol272 Tous 5 5e l UEC Analyse g n tique chez les microorganismes Biol273 Tous 5 5e 2 UEC Une mol cule de d fense contre les bact ries le Biol274 Tous 5 lysozyme 5e 3 UEC Aspects mol culaires et physiologiques de la Biol275 Tous 5 germination 5e 4 UEC Mise en place du sch ma corporel Biol281 Tous 5 5e 5 UEC Physiologie int grative Biol279 Tous 5 5e 6 UEC OGM entre science et soci t Biol278 Tous 5 5e 7 UEC M tabolisme nerg tique Biol277 Tous 5 6
132. n environnement professionnel Apporter une bonne connaissance du monde de l entreprise pour les apprentis Offrir des possibilit s de formations scientifiques et techniques dans des domaines difficilement accessibles l universit Contribuer la formation humaine de l tudiant apprentissage du travail en commun et relations dans le monde du travail Donner une r elle exp rience professionnelle Volume horaire 875 h 25 semaines effectives Organisation 2 statuts sont possibles pour les tudiants soit un statut d apprenti formation par alternance universit entreprise priv e ou laboratoire de recherche public habilit accorder ce statut soit un statut de stagiaire formation par alternance universit laboratoire public 3 p riodes d alternance de fin octobre fin d cembre 10 semaines de d but mars fin avril 8 semaines de fin juin d but septembre 12 semaines 1 2 Tutorat Un tuteur faisant partie de l quipe p dagogique pour chaque tudiant Le tuteur sera charg de faire le point avec l encadrant ma tre d apprentissage ou ma tre de stage et l tudiant la fin de chaque p riode d alternance 3 4 Contr le des connaissances valuation bas e sur contr le continu valuation par ma tre de stage ou ma tre d apprentissage rapport d activit crit et rapport d activit oral Equipe p dagogique Tutorat Robert AUFRERE Gilles HENCKES S LIOTENBERG
133. n sur un azote d ficitaire en lectrons Hofmann Curtius Beckmann R arrangements p ricycliques Diels Alder st r os lectvit Cope Oxycope Claisen Chimie des h t ro l ments Chimie du Phosphore G n ralit s r actions de Wittig et apparent es st r os lectivit halog nation des alcools r action de Mitsunobu Chimie du Soufre G n ralit s carbanions en du soufre ions sulfonium ylures de soufre sulfoxydes et sulfones Chimie du Silicium G n ralit s noxysilanes synth se et r actions vinylsilanes synth se et r actions stabilisation d un carbocation en allylsilanes synth se et r actions r action de Peterson Groupements protecteurs Crit res g n raux de s lection d un groupement protecteur D protection sets orthogonaux d protection par solvolyse basique modulation de la stabilit par effets st riques ou lectroniques d protection en milieu acide d protection par catalyse aux m taux lourds coupure des liaisons O Si et C Si d protection par limination r ductrice Zn d protection par limination d protection par hydrog nolyse d protection par oxydation d protection par les m taux dissous groupements protecteurs allyliques Compos s aromatiques Rep res de nomenclature Notion d aromaticit Substitution lectrophile m canisme principales r actions SEAr halog nation nitration sulfonation Friedel Crafts effets des su
134. nce Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Physiologie mol culaire et cellulaire des microorganismes Biol L3S6 Responsable G Leblon et N Bayan UE au choix parcours BMC Objectifs Approfondir les notions de biologie mol culaire biochimie et biologie cellulaire en tudiant les mecanismes impliques dans l adaptation des microorganismes leur environnement Volume horaire Total 50h CM 30h TD 20h Plan des enseignements Division cellulaire Communication cellulaire R ponse aux stress __ M tabolismes bact riens Equipe p dagogique C Houssin G Leblon L Morin et N Bayan Universit Paris Sud 11 10 11 2004 119 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Travaux d Etude et de Recherche TERBS0 L3S6 Responsables Alain Denise Michel Termier Type d U E obligatoire pour parcours BIBS Objectifs L objectif de l UE est d appliquer sur une probl matique bioinformatique et ou biostatistique les notions apprises dans les parcours BIBS des L de biologie d informatique et de math matiques Les tudiants des trois fili res participeront ensemble cet enseignement Cet enseignement est destin aux tudiants du parcours BIBS Pr requis Les UE du parcours BIBS Volume horaire Total 50 h Plan des enseignements Les tudiants travaillent par petits groupes pluridisciplinaires sous la responsabilit d un enseignant
135. nces g notypiques tant donn les fr quences all liques panmixie consanguinit homogamie h t rogamie effet Wahlund Pour chacune de ces forces la mod lisation de base est donn e La combinaison de ces forces permet de comprendre l existence de maladies g n tiques quilibre s lection mutation d une part et celle du polymorphisme s lection s il est stable quilibre mutation d rive s il est neutre d autre part Enfin le d s quilibre de liaison est introduit Tout au long de cette pr sentation on s attache rendre chaque calcul compr hensible traiter des exemples et rappeler autant que faire se peut que le milieu agit sur le ph notype Cet enseignement pr sentera galement la notion de caract re quantitatif en d finissant les diff rentes sources de variation ph notypique On abordera les notions d h ritabilit et de r ponse la s lection Volume horaire Total 50 h CM 24h TD 26h TP 0 Plan des enseignements CM Loi de Hardy Weinberg H r dit li au sexe Base des modules avec s lection Equilibre mutation s lection d rive g n tique Syst mes de reproduction Base de la g n tique quantitative TD Titre de la s ance Type C TD TP 1 Fr quences all liques TD2h 2 Diversit g n tique et biologie de la conservation TD2h 3 Pressions volutives TD2h 4 Simulations sur ordinateurs de l volution de popul
136. nctionnement des plantes la Photoinhibition e Eau dans la plante JL Prioul e Echanges gazeux photosynth tiques e Assimilation C3 C4 CAM en relation avec la distribution g ographique e Distribution et r partition des assimilats Relations source puits Biodiversit des relations G Noctor Assimilation de l azote nitrate N2 Interaction azote carbone en relation avec l environnement Environnement et stress oxidatif M tabolisme secondaire TP TD 20h J Hoarau D lavergne A Mah Activit de la nitrate r ductase en relation avec le stress hydrique J Ghashghaie P Streb Caract risation de l tat hydrique foliaire gradient de potentiel hydrique dans une plante J Ghashghaie J Hoarau A Mah Description et fonctionnement stomatiques Enseignants JL Prioul IBP G Noctor IBP G Cornic ESE J Ghashghaie ESE J Hoarau IBP H Vanacker IBP P Streb ESE Universit Paris Sud 11 10 11 2004 134 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Botanique syst matique Biol 333 L3S6 Responsable Michel DRON UE obligatoire parcours BOE Objectifs de VUE Il s agit de pr senter de mani re d taill e la diversit du monde photosynth tique en utilisant un canevas volutif Une attention particuli re sera apport e aux transitions volutives observables au sein de la lign e verte Ceci sera illustr en abordant la diversit des appareils v g t
137. niversit Paris Sud 11 10 11 2004 9 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 INTRODUCTION A LA GEOLOGIE Geos 1001 L1S1 Responsables Pierre Yves GILLOT U E obligatoire pour la fili re BCST INTRODUCTION A LA GEOLOGIE l ments de dynamique et d histoire terrestre Objectifs Pr senter aux tudiants une approche naturaliste qui pr sente le cadre g n ral de la dynamique du globe et retrace les grandes lignes de l histoire de la Terre partir d observations sa surface Volume horaire Total 25 CM 15 h TD 10 h TP Contenu 1 Introduction la dynamique du globe En partant de l observation des alignements d les oc aniques et en raisonnant sur les conditions d volution du volcan l atoll et la construction coralliaire nous identifions les mouvements crustaux les convections mantelliques la subsidence crustale et les conditions de d veloppement de la vie 2 Observation de la d chirure continentale et l ouverture oc anique pr sentation des bassins s dimentaires r sultant de la distension les diff rentes natures s dimentaires et leur distribution spatiale s diments d tritiques et biog niques les s quences stratigraphiques et la pal ontologie les reconstitutions pal og ographiques par l exemple de la marge nord ouest Europ enne le bassin parisien et le cours de la Loire et de la Seine 3 Le mouvement de convergence des masses continentales
138. nne et volution du coelome de la m tam rie des axes de polarit de l identit de position g nes hom otiques des pompes circulatoires des organes visuels Travaux pratiques TP1 histologie TP2 comparaison morphologie m tam rie chez l ar nicole et n r is Equipe p dagogique H l ne Courvoisier Laurent Coutte Line Duportets Fran oise Jamen Danielle Marchal Fanny Rybak Laurent Th odore Universit Paris Sud 11 10 11 2004 102 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Biochimie Biol 309 L3S5 Responsable H Th risod Type d U E obligatoire parcours BOE Biologie int grative Objectifs Cet enseignement est destin des tudiants venant de diff rentes origines et qui ont besoin d un enseignement g n raliste en Biochimie Volume horaire 50h Cours 34h TD 16h Plan des enseignements Cours Prot ines structure et fonction des prot ines exemples enzymologie et r gulations exemples Biochimie des membranes structure et dynamique des membranes transports et couplage nerg tique M tabolisme les grandes voies et leur r gulation Biochimie de la communication cellulaire les hormones neurotransmetteurs ph romones les diff rents types de r cepteurs les diff rentes voies de signalisation exemples la vision l olfaction Biochimie de la contraction musculaire 8 TD de 2h sur chacune des grande
139. nnement des microorganismes L enseignement sera plus particuli rement orient vers les groupes d organismes dont la connaissance est indispensable dans le cadre d une formation de base de biologistes en relation avec la vie quotidienne de citoyen bact ries pathog nes champignons et mycoses virus parasites biotechnologie bact ries des milieux extr mes Volume horaire Total 50 CM 30 TD 20 Plan des enseignements Eubact ries structure et classification milieux de vie biofilms exemples de bact ries pathog nes biotransformations Arch bact ries structure et classification la vie bact rienne dans les milieux extr mes Virologie D couverte et d finition des virus structure cycle viral importance en sant publique en agronomie et dans la recherche Protistologie les grands groupes de protistes vus travers l volution de la cellule eucaryote et notamment les endosymbioses le parasitisme Champignons les champignons filamenteux et les levures exemples de pathog nes biotransformations fermentation alcoolique Pr requis Notions de base de biologie cellulaire Enseignants pr vus Florence Constantinesco Marie Dufresne Mireille Leduc Lo c Morin Jean Michel Rossignol Universit Paris Sud 11 10 11 2004 59 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Algorithmique et programmation Info 226 L2S4 Responsable Alain Denise Type d U E
140. nt s quencer l ADN des m thodes modernes aux m thodes futuristes les r seaux de g nes et leur dynamique puces ADN voir les virus microscopie lectronique l origine des potentiels d action et leur mesure la dynamique des cellules m thodes optiques localiser l expression d un g ne mesurer in vivo une activit enzymatique Equipe p dagogique R Mastrippolito Universit Paris Sud 11 10 11 2004 41 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 MICROBIOLOGIE GENERALE Biol 276 L2S3 Responsables Florence CONSTANTINESCO et Corinne LEVI MEYRUEIS UE de d couverte Objectifs Sensibilisation la microbiologie g n rale Initiation l tude et l application des microorganismes M thodologie exp rimentale Pas de pr requis Volume horaire Total 50 h CM 5h TD 10h TP 35h Plan des enseignements o Manipulations st riles o Croissance microbienne e comment cultiver des microorganismes e courbes de croissance turbidim trie e m thodes de d nombrement e observations microscopiques o Diversit microbienne Comparaison de diff rents microorganismes procaryotes et eucaryotes croissance morphologie m tabolisme Escherichia coli Bacillus subtilis Saccharomyces cerevisiae bact ries lactiques phages o Mode d action et production d antibiotiques Plasmides de r sistance aux antibiotiques Antibiogrammes Streptomyces et production d
141. nt mention Biologie annexe 1 L Approche G n tique du Monde Vivant GENI Biol 121 L1S2 Responsables Pierre Henri Gouyon Jacqueline Girard Bascou U E obligatoire tous les parcours de la mention biologie et mention biologie chimie Objectifs Introduction la g n tique appliqu e aux procaryotes et eucaryotes humain compris Le g ne sera introduit comme unit d information mod le simple o un g ne correspond un produit actif et en terme de position locus La m thodologie g n tique sera pr sent e par ses tests de bases mais sera peu d velopp e Volume horaire Total 50 h CM 20h TD 30h TP 0 Plan des enseignements CM 20h Qu est ce qu un g ne G nomes de procaryotes et d eucaryotes organites compris Haplo die ou diplo die des organismes eucaryotes Polymorphisme Mutations marqueurs mol culaires origine et diversit Dominance r cessivit procaryotes et eucaryotes Int r t du test de compl mentation fonctionnelle Brassage g n tique la m iose Recombinaison g n tique Sexualit chez les eucaryotes et les procaryotes Analyse de pedigrees humains Notion de distance g n tique chez les procaryotes et les eucaryotes Mutagen se Transgen ses cas simples procaryotes et eucaryotes TD de 3h TD1 mutations g notypes et ph notypes procaryotes et eucaryotes TD2 les cons quences g n tiques de la m iose TD3 marqueurs mol culaires TDA4 dominance r cessivit
142. oches en ergonomie Les champs concern s Ergonome en entreprise Ergonomie et handicap Ergonomie et fiabilit humaine Ergonomie et l innovation des produits L volution de l approche travail sant Le champ des relations travail sant Mod les de l homme au travail Charge de travail Contraintes et astreintes Le rapport entre T che et Activit Approche d mographique de la population au travail dans une entreprise Vieillissement de la population Le r le de l Ergonomie dans les diff rents services de l entreprise Ergonomie des Interfaces Homme Machine Conception des interfaces op rateur machine Pr sentation des informations Contr le commande Le mod le traitement de l information Les th ories de l action La notion de syst me et une approche globale Conception des postes de travail Anthropom trie Nombre maximum d inscrits 25 Enseignants J Richardson MC C Teyssedre MC C Briec Intervenant ergonome Universit Paris Sud 11 10 11 2004 45 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 L Analyse G n tique chez les Microorganismes Biol 273 L2S3 Responsable s S Liotenberg UE de d couverte Objectifs Illustrer le contenu de l U E Introduction l Analyse G n tique Le but de cet enseignement est d utiliser les outils de g n tique bact rienne Volume horaire Total 70 h TP 50h TD 20h Contenu des enseignements Cet enseignemen
143. og ographie cologie phylog nie Des sorties sur le terrain campus et environs permettent de situer certaines esp ces dans leur contexte et de pratiquer d terminations et tudes d chantillons en salle P riode d enseignement Etant bas sur l tude concr te d chantillons frais il est n cessaire de situer ce module entre mars et juin Evaluation Evaluation des connaissances de base et de la pratique de d termination Connaissance de plantes communes du campus et de la r gion R alisation d un herbier en temps libre avec commentaires Public concern Fili re enseignement des SVT cologie environnement Enseignants Christian BOCK Laure BARTHES Sophie NADOT Universit Paris Sud 11 10 11 2004 21 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 DECOUVERTE DES MILIEUX Biol 173 L1S2 Responsable Christian BOCK UE de d couverte Objectifs Cet enseignement est destin faire acqu rir aux tudiants une connaissance concr te des bioc noses de quelques milieux typiques de notre r gion et d aborder l tude des contraintes cologiques qui les caract risent Les diff rents aspects envisag s sont la reconnaissance des divers groupes syst matiques les principes et m thodes de d termination des communaut s la mise en vidence des interactions entre constituants de la bioc nose pr sidant aux r seaux trophiques et aux cycles de la mat
144. ogie Objectifs Module de formation pratique s adressant aux tudiants d sirant choisir un parcours professionnel DEUST de Biotechnologies Licence Professionnelle de Biologie Appliqu e l entreprise et destin les pr parer leur futur environnement de formation par alternance entreprise ou laboratoire Formation aux techniques et aux appareillages de base du laboratoire Acquisition de m thodes de travail propres au travail de technicien Entra nement la communication scientifique et technique Volume horaire Total 90 h TD 20h TP 70h Contenu R alisation d une suite d exp rimentations mutagen se d un microorganisme caract risations biochimiques des mutants alliant les diff rentes techniques de base de microbiologie et de biochimie Techniques pes es pipetages dilutions pHm trie travail st rile centrifugation spectrophotom trie microscopie optique M thodes de travail maintenance du laboratoire et de son mat riel r alisation de protocoles exp rimentaux m thodes de calcul laboration de fiches techniques tenue d un cahier de laboratoire analyse critique des r sultats d exp riences initiation l anglais scientifique expos s des travaux oral crit quipe p dagogique Robert AUFRERE Gilles HENCKES Sylviane LIOTENBERG Catherine DREUX Claire HULEUX Universit Paris Sud 11 10 11 2004 27 Licence Domaine Sciences Technologie Sant ment
145. ologie du travail et milieux extr mes Biol L3S6 Responsable F Ch ruel UE de d couverte Objectif Il n est pas rare de rencontrer dans le monde du travail des conditions environnementales prouvantes stressante comme le chaud le froid le confinement des nuisances olfactives sonores l hypobarie l hyperbarie etc Ces conditions de travail forcent l organisme r agir en mettant en place des strat gies et des m canismes physiologiques adaptatifs L objectif de ce module est de mettre en relief certaines de ces adaptations d valuer l astreinte physiologique et de pr venir les risques pour la sant des op rateurs Plan des cours Physiologie du travail et milieux extr mes 40 h CM 10 h TD Energ tique et m tabolisme cellulaire Les Voies m taboliques aux cours de l exercice musculaire D finitions du stress Cat gorisation des stresseurs La prise en charge du stresseur Le syndrome g n ral d adaptation La r action d alarme La phase de r sistance Stress Chronique Epuisement et pathologie Aspects Cognitif du stress Programmation de r ponses sp cifiques L effets d bilitants du stress Les processus douloureux les voies de la douleur Stress et addiction le dopage R gulation de la pression art rielle Contr le des r sistances vasculaire Le syst me nerveux v g tatif Mesure de la tension art rielle p riph rique et centrale analyse du signal au repos et l exercice
146. oophagie saprophagie IHI Relations Plantes Insectes 9h EI 6h TP Phytophagie r actions de d fense des plantes et adaptation des Insectes Pi ces buccales des phytophages TP Ravageurs des cultures et denr es stock es esp ces invasives Pollinisation entomophile Pi ces buccales de l abeille et du papillon Autres adaptations chez l Abeille TP Exemples de co volution plantes Insectes IV Relations intersp cifiques animales 7h 30 EI illustr es par des films et des chantillons Strat gies de d fense des Insectes Insectes h matophages et vecteurs r le dans la transmission du paludisme des trypanosomoses et des filarioses Insectes responsables des myiases Insectes entomophages pr dateurs et parasito des V Relations intrasp cifiques 3h EI Strat gies reproductrices Gr garisation Insectes sociaux VI Les Insectes recycleurs 1h 30 EI 3h TP Coprophagie n crophagie Etude du bois mort et de la liti re sur le campus Utilisation de faunes TP VII La lutte contre les Insectes 7h 30 EI Lutte chimique Lutte biologique et Lutte int gr e Utilisation d OGM discussion autour d articles sur le sujet Travail personnel demand aux tudiants Pr paration d un expos oral sur un th me choisi au d but de l enseignement R troprojecteur ou vid o projecteur seront la disposition des tudiants pour ce travail qui comptera dans l valuation Equipe p dagogique Laurent Coutte
147. ore aquatique et rivulaire Notion de protection des esp ces Gestion des espaces sensibles La faune et la flore ordinaire du Campus Equipe p dagogique e Louveaux MC C Bock PRAG P Maupu PRAG coordinateur STAPS Universit Paris Sud 11 10 11 2004 44 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Ergonomie Introduction Biol 272 L2S3 Responsable J Richardson UE de d couverte Objectifs Ce module a pour objectif d introduire les diff rents champs d action de l ergonomie Chacun est confront par les difficult s d utilisation des quipements sophistiqu s dans leur travail ou leur vie de tous les jours Ces difficult s sont simplement per ues comme un inconv nient ou peuvent plus s rieusement tre l origine des pertes d efficacit au travail ou avoir des effets n fastes pour la sant des personnes Le cours trace l historique de l ergonomie en France et la contribution des diff rentes sciences appliqu es au travail et leur contribution l am lioration des conditions du travail et la qualit de vie de diff rents secteurs de la population Les champs d action de l ergonomie sont aussi bien au niveau de l objet le poste de travail et le produit qu au niveau plus important de l organisation de travail de l entreprise et la place de l op rateur humain dans les syst mes complexes Plan des cours Introduction l ergonomie Une approche historique Diff rentes appr
148. outes les r actions biologiques Volume horaire Total 25 h EI 25 h Contenu des enseignements Thermodynamique R actions d oxydor duction Equilibres acido basiques Solubilit Cin tique des r actions Equipe p dagogique Christine HOUSSIN Universit Paris Sud 11 10 11 2004 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 ANGLAIS L2 S3 S4 Responsable U E sp cifique du cursus biotechnologies Objectifs Ma trise de l anglais scientifique et technique dans un environnement professionnel Volume horaire Total 25h TD 25 h Contenu des enseignements Anglais courant dans un laboratoire de langues et anglais scientifique et technique sous forme d expos s scientifiques et techniques Cet entra nement est compl t au cours de diff rentes activit s int gr es dans les enseignements th oriques et pratiques utilisation de documents en langue anglaise consultations de sites Internet Equipe p dagogique Enseignants du laboratoire de Langues Enseignants vacataires Universit Paris Sud 11 10 11 2004 75 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 METHODES BIOPHYSIQUES ET BIOCHIMIQUES Biol L2 S3 S4 Responsable Nicolas Kellershon U E sp cifique du cursus biotechnologies Objectifs Comprendre les principes sur lesquels reposent le fonctionnement d un certain nombre d instruments ou de certaines m thod
149. pline et les principales modalit s du d veloppement Animaux Drosophile N matode Poisson Z bre X nope Poulet Souris V g taux Arabidopsis Objectifs des Travaux Pratiques et Dirig s Susciter la r flexion des tudiants les former l esprit critique Volume horaire Total 50 heures CM 26 heures TD 18 heures TP 6 heures Plan des enseignements COURS MAGISTRAUX BIOLOGIE DU D VELOPPEMENT ANIMAL Concepts de base Homologie Clone D termination Diff renciation Induction Voie de signalisation Apoptose Mod les Pour chaque mod le les aspects suivants seront trait s e Description du d veloppement e Apport de chaque mod le dans le contexte actuel et historique de la discipline Aspects thiques Seront voqu s galement les probl mes thiques et de soci t qui d coulent des avanc es r centes de la discipline particuli rement en qui concerne les nouvelles possibilit s de clonage BIOLOGIE DU D VELOPPEMENT V G TAL D veloppement de l embryon de la fleur et des fruits fonctionnement du m rist me M canismes mol culaires de l action des phytohormones TD D veloppement et volution de l organe visuel unit ou diversit Les cellules de cr te neurale chim res caille poule Le d veloppement des Insectes Analyse de textes de vulgarisation ayant trait la Biologie du D veloppement D veloppement de l embryon et de la fleur d Arabidopsis Mode d
150. r requis Les UE Informatique appliqu e la Biologie S3 et Algorithmique et programmation S4 Volume horaire Total 50h CM 20h TD 30h Plan des enseignements Bases du g nie logiciel modularit fiabilit lisibilit r utilisabilit M thodologie de conception objet Programmation orient e objet notions de classes d rivation polymorphisme Bases du langage Java types de donn es pointeurs d objets de classe Classes encapsulation packages Principes de la machine virtuelle Java Ramasse miettes Cha ne de compilation Classes d riv es classes abstraites classes non d rivables Polymorphisme typecast Traitement des exceptions Interfaces Conception d interfaces graphiques Threads Les tudiants appliqueront les notions abord es lors d un projet de conception et programmation li une probl matique bioinformatique Equipe p dagogique Patrick Amar MdC section 27 St phane Vialette MdC section 27 Universit Paris Sud 11 10 11 2004 125 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Chimie bio inorganique et bio organique Chim355 L3S6 Responsables Jean Pierre Mahy Type d U E au choix pour parcours BCH Objectifs Chimie des peptides et des prot ines Bases de chimie inorganique exemples d application en chimie bio inorganique m talloprot ines et syst mes bio inspir s Pr requis Chimie inorganique int
151. re et Biol BHS 5 Pharmacocin tique Parcours Biologie des organismes aux cosyst mes BOE cursus Ecologie Eco et Biologie int grative BI UE type Titre ID Cursus ECTS la UEF Organisation des cosyst mes Biol307 Eco BI 5 2a UEF Biologie animale Biol305 Eco 5 2b UEF Evolution des m tazoaires Biol312 BI 5 3a UEF Biologie mol culaire et biochimie Biol306 Eco 5 3b UEF Biochimie Biol309 BI 5 4a UEC G ologie externe s dimentologie et pal ontologie G os30B Eco BI 5 4b UEC G n tique des populations et quantitative Biol334 BI 5 Eco en S6 4c UEF Ecologie fonctionnelle et appliqu e Biol304 Eco BI 5 5 UEF Evolution et diversit des m tazoaires Biol308 Eco BI 5 6a UEC Probabilit s et statistiques 1 Math207 Eco 5 6b UEC Cha nes de Markov Math390 Eco 5 6c UEC P trologie endog ne et tectonique G os31B BI 5 6d UEC Initiation aux techniques de biologie mol culaire et Biol336 BI 5 biochimie S5 et S6 Universit Paris Sud 11 10 11 2004 80 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 BIOLOGIE MOLECULAIRE Biol 300 L3 S5 Responsables Jean Michel Rossignol Michel Duguet UE obligatoire parcours BMC et BIBS Objectifs Amener en 50h de cours et TD les tudiants un niveau de base sur les concepts de la Biologie Moleculaire Ceci doit permettre
152. res effet Doppler Ondes lectromagn tiques structure et propagation spectre des ondes EM lumi re et vision rayonnement infrarouge micro ondes applications en biologie Ondes sonores d placement et pression audition ultrasons chographie et imagerie Interf rence et diffraction superposition d ondes coh rence lames minces diffraction structures p riodiques applications en biologie pouvoir s parateur du microscope et de l oeil couleurs des Morphos et des colibris diffraction des rayons X et structure mol culaire Notion de quantification dualit onde particule ordres de grandeurs d tection des photons et seuil de la vision quantification exemple d une corde vibrante limit e nombres quantiques quantification de l nergie interf rence de photons relations d incertitude de Heisenberg interpr tation probabiliste de la m canique quantique Interaction rayonnement mati re atomes lectrons et noyaux diff rents types de radioactivit d croissance radioactive nergie transf r e par un rayonnement interaction des rayons X et gamma applications st rilisation radioimmunodosages d tecteurs de rayonnement et imagerie Un exemple complexe de propagation d onde l influx nerveux propri t s lectriques des fibres nerveuses r le des lectrolytes transport actif des ions pompe Na K r ponse a un stimulus faible circuit quivalent et propagation stimulus fort fibres my linis es
153. rimental fort voyageant de la plante enti re au niveau mol culaire bas sur une participation active de l tudiant compl t par des visites et des discussions Volume horaire Total 50h CM 8h TD 12h H 7h TP 23h Plan des enseignements L enseignement m lera troitement des notions succinctes de cours permettant aux tudiants d acqu rir ou de retrouver les notions de base n cessaires une participation active des tudiants dans la mise en place et la r alisation des exp riences Les s ances de TD ou EI seront consacr es l analyse et l interpr tation des r sultats exp rimentaux travail de groupe Au moins deux visites d organismes de recherche permettront d illustrer cet enseignement Les th mes choisis permettront d aborder simplement plusieurs grandes fonctions de la vie d une plante La plante et son environnement abiotique Influence de facteurs de l environnement sur le processus de germination Comparaison du comportement de diff rentes esp ces ainsi que de plantes mutantes par rapport aux sauvages 9h Recherche de marqueurs mol culaires associ s au poids du grain chez le haricot Acquisition de bases de g n tique v g tale au travers d applications en am lioration des plantes 10h Les interaction entre la plante et des micro organismes Influence de la symbiose luzerne bact rie Rhizobium sur la fixation de l azote Utilisation de souches bact riennes mutantes pour la
154. roduction la Chimie organom tallique et bioinorganique Chim 206a ou Chim 206c Chimie organique g n rale et analyse structurale Chim 351 Chimie organique de synth se 1 Chim 352 Chimie organique de synth se 2 Chim 353 Volume horaire Total 50 h CM 25 h TD 25 h Plan des enseignements CHIMIE BIO ORGANIQUE Synth se peptidique une introduction Protection des fonctions amines acide et des cha nes lat rales des amino acides M thodes de couplages Synth se en phase liquide sur phase solide Exemples Modifications chimiques des prot ines R actifs r sidu sp cifiques Applications modifications des propri t s physico chimiques pr paration d antig nes immobilisation d enzymes CHIMIE INORGANIQUE Th orie du champ de ligand rappel Th orie des OM Comparaison la th orie du champ cristallin Applications Notion de base de spectroscopie UV visible R activit des complexes de m taux de transition Vers des m canismes dans les m talloprot ines Autres techniques d tudes des m taux en biologie Quelles techniques pour savoir quoi CHIMIE BIO INORGANIQUE R le des m taux en biologie Interaction des m taux avec les macromol cules biologiques prot ines acides nucl iques Catalyse de r actions hydrolytiques prot ases zinc prot ines doigts de zinc ribozymes Catalyse de r actions redox Equipe p dagogique Jean Pierre Mahy Michel Th risod
155. rthropodes chinodermes vert br s utilisation des donn es embryologiques les grands plans d organisation TP et TD Evolution TD Les principes des phylog nies Apr s un bref rappel historique des m thodes de classifications les deux grandes cat gories de m thodes actuellement utilis es pour la reconstruction phylog n tique distances et parcimonie sont illustr es sous forme d exercices Un rappel du vocabulaire associ aux arbres phylog n tiques est fait sous forme de questions aux tudiants notions d homologie d homoplasie de groupe mono para polyphyl tique etc 1h30 TD Syst matique des Ratites Cette s ance illustre l apport des phylog nies mol culaires pour la r solution de probl mes d ordre syst matique avec l exemple du groupe des Ratites oiseaux non volants 1h30 TD Apport des phylog nies en cologie Au cours de cette s ance la notion d volution de caract re tats multiples est abord e l aide d un exercice portant sur l volution du mode de reproduction chez les l zards et les serpents 1h30 Universit Paris Sud 11 10 11 2004 12 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 TD Apport des phylog nies en cologie volutive La notion de corr lation entre caract res est illustr e l aide de l exemple de l volution de la colonialit chez les oiseaux La notion d analyse comparative est abord e Evol
156. s Oxydation des alcools par le chrome VI par les oxydants base de DMSO par le mangan se Groupements protecteurs de la fonction alcool Epoxydes Pr paration poxydation par r actif lectrophile ou nucl ophile effets st riques partir d halohydrines r action de Corey poxydation asym trique de Sharpless des alcools allyliques d doublement cin tique R activit g n rale ouverture nucl ophile par O S N et organom talliques magn siens cuprates lithiens aspects st r ochimiques ouverture lectrophile r arrangement Chimie des compos s azot s Rappels basicit nucl ophilie Propri t s nucl ophiles des amines alkylation acylation attaque nucl ophile sur N attaque nucl ophile sur O diazotation Ions ammonium Imines ions immonium pr paration amination r ductrice caract re nucl ophile caract re lectrophile r action de Mannich biosynth se d alcalo des Enamines quilibre iminium namine dans les r actions enzymatiques aldolase d carboxylase Synth se d amines Equipe p dagogique Universit Paris Sud 11 10 11 2004 86 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Chimie organique exp rimentale Chim 312b L2S5 Responsables Philippe Pigeon U E de d couverte parcours BMC obligatoire parcours BCH Objectifs Approfondissement de l apprentissage des principales techniques de chimie organique et leur mise en oeuvre
157. s BOE version Ecologie et version Biologie Int grative UE Commune aux parcours Licence Biologie des Organismes aux Ecosyst mes Licence Professionnelle de Biologie appliqu e l entreprise Objectifs Apprendre les m thodes de travail sur le terrain Inventaires chantillonnages protocoles exp rimentaux analyse des donn es statistique et interpr tation graphique Volume horaire Total 50h CM 20h TD 6h TP 24h Plan des enseignements Cours magistraux Populations communaut s Les interactions intersp cifiques Comp tition parasitisme mutualisme coop ration co volution Stabilit diversit R silience notion de climax R ponses aux perturbations Esp ces envahissantes dynamique de la biodiversit et cons quences sur les communaut s Erosion de la biodiversit et protection des esp ces L Homme dans la biosph re Effet de serre pollutions Gestion des ressources naturelles TP et TD Etudes th matiques Ecologie des mares et qualit des eaux d une rivi re travail par groupes de 4 5 tudiants M thodes d chantillonnage et d inventaires Etude des sols et peuplements forestiers p dologie et groupements v g taux associ s Microarthropodes du sol Recyclage de la mati re organique Analyse spatiale sur SIG Prise en main du logiciel ArcView et travail sur des donn es de terrain Pour toutes les s ances de TP les donn es acquises sur le terrain font l
158. s parties du cours Au cours des TD des expos s seront faits par les tudiants Le sujet choisi est en relation avec la partie du cours illustrer Equipe p dagogique N Bayan G Foucault H Th risod H van Tilbeurgh MF Vesin Universit Paris Sud 11 10 11 2004 103 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 G ologie externe S dimentologie et pal ontologie Geos30B L2S5 Responsables C Colin G Siani U E au choix pour parcours BOE Biologie int grative Objectif Donner aux tudiants les bases de s dimentologie et de pal ontologie n cessaires afin de reconna tre les environnements s dimentaires de d p t dans l actuel et dans l ancien Reconnaissance tude et origine des roches s dimentaires Les grands processus de formation de transport et de s dimentations des d p ts et leur contenu organog ne sont pr sent s dans leur cadre g ographique et ou pal og ographique Parall lement une tude assez d taill e des m thodes et subdivisions de la pal ontologie sera aussi pr sent e Volume horaire Total 50 CM 35h TD 5h TP 10h Contenu Cours Le volet s dimentologique aborde dans un premier temps tous les processus entrant en jeu dans la gen se des roches s dimentaires ph nom nes d alt ration et d rosion modes de transport et de d p t transformations diag n tiques et vise donner aux tudiants une vue d taill e du cycle s di
159. se r f reront en permanence la phylog nie de ce groupe Dans ces TP TD il a t volontairement choisi de ne traiter en d tail que les arthropodes et les vert br s Les TP TD de BV illustreront essentiellement l volution des cycles de reproduction s xu e des v g taux en relation avec l adaptation au milieu terrestre L objectif g n ral des TP TD est que les tudiants puissent acqu rir des m thodes de travail plut t qu un savoir encyclop dique Volume horaire Total 50 h CM 18h TD 20h TP 12h Plan des enseignements CM Histoire des id es en syst matique Classifications utilitaires classification naturelle Linn Jussieu ordre de la Nature le transformisme Lamarck r volution darwinienne descendance avec modification la th orie neutraliste de l volution Les m thodes de reconstruction phylog n tique La cladistique tats de caract re homologie convergence caract re d riv partag et anc tre hypoth tique commun groupe ext rieur groupes monophyl tique paraphyl tique polyphyl tique principe de parcimonie lecture d un arbre Les m thodes ph n tiques notion de distance comparaison des organismes 2 2 La phylog nie mol culaire Notion de caract re mol culaire absence de polarisation a priori l alignement homologie de site notion d horloge mol culaire neutralisme importance des ARNr artefact d attraction des longues branches importance des r t
160. structure du peptidoglycane les m dicaments base de lysozyme les antibiotiques TP environ 35h o Cultures de bact ries Gram substrat du lysozyme et Gram e Courbe de croissance en l absence ou en pr sence de p nicilline e D nombrement des bact ries sur milieu g los o Extraction et purification du lysozyme partir du blanc d uf de poule e Chromatographie d changes d ions e Mesure d activit enzymatique analyse des param tres influen ant l activit enzymatique concentration en enzyme pH temp rature e Dosage de prot ines e D termination du rendement et du facteur de purification e Contr le de puret du lysozyme par lectrophor se en gel de polyacrylamide SDS o A partir de lysozyme purifi e Dosage des ponts disulfure DTNB e Obtention de cristaux Equipe p dagogique Lisette COHEN Fran oise VESIN H l ne THERISOD Universit Paris Sud 11 10 11 2004 47 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Aspects mol culaires et physiologiques de la germination Biol275 L2S3 Responsables J C Callen et M N Raymond UE de d couverte Objectifs Cet enseignement vise par des approches pratiques pluridisciplinaires mettre en uvre une d marche exp rimentale conduisant la quantification de diff rents processus biologiques dans un mod le v g tal Cette UE ou une quivalente s inspirant de la m me d marche p dagogique devrait ob
161. sur le probl me du transfert de l information entre scientifiques industriels et grand public Projet personnel Recherche bibliographique sur un th me li aux OGM r daction d un m moire et pr sentation orale TP Transformation bact rienne Equipe p dagogique Pierre Capy PR Orsay Jane Lecomte MC Orsay Lo c Morin MC Orsay Sophie Nadot MC Orsay Agn s Ricroch INA PG Robert Ha cour UPMC ainsi que des chercheurs de l INRA de Jouy et de Versailles et de l IBP UPS Universit Paris Sud 11 10 11 2004 51 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Etude physiologique et biochimique du m tabolisme nerg tique dans diff rentes conditions physiologiques Biol 277 L2S3 Responsables L M ry et C Huleux UE de d couverte Objectifs Cet enseignement vise par des approches pratiques pluridisciplinaires mettre en uvre une d marche exp rimentale conduisant la quantification de diff rents processus physiologiques Cette UE ou une quivalente s inspirant de la m me d marche p dagogique devrait obligatoirement tre suivie par les tudiants se destinant suivre les L3 Biologie Mol culaire et Cellulaire ou Biologie des Organismes et Ecosyst mes Volume horaire UE 50 h dont 35 h TP voir ci dessous et 15 h TD rappels de cours exercices et analyses de documents en rapport avec le th me tudi Travaux pratiques 1 Origine
162. t comprend d une part des TD permettant d approfondir les notions fondamentales de l U E Introduction l analyse G n tique et d autre part l application de ces connaissances par une semaine de TP En particulier seront d velopp s i diff rents modes de transfert de l information g n tique chez les bact ries transformation comparaison entre diff rents types bact riens conjugaison conjugaison Hfr interrompue et calcul de distance g n tique entre des marqueurs d auxotrophie transduction ii notion de bact riophage cycles lytiques lysog nie titration du lysat Nombre maximum d inscrits 40 60 20 groupe Contr le des connaissances valuation crite compte rendu et expos oral Equipe p dagogique Chantal Astier PR Sylviane Liotenberg et C cile Pasternak MC Universit Paris Sud 11 10 11 2004 46 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Le lysozyme mol cule de d fense contre les bact ries Biol 274 L2S3 Etude structurale et fonctionnelle Responsables Lisette COHEN et Fran oise VESIN UE de d couverte Objectifs Illustration des relations structure fonction des molecules du vivant travers l exemple du lysozyme Pas de pr requis Volume horaire Total 50 h CM 5h TD 10h TP 35h Plan des enseignements TD environ 15 h pour expliciter le propos des TP dont une s ance de bioinformatique 6h Analyse de documents
163. ternel Fonctions cognitives 9h Expos des approches exp rimentales sur l apprentissage de la m moire Endocrinologie 9h Introduction l endocrinologie en prenant comme exemple le diab te sucr et ses cons quences physiologiques il s agit de la pathologie endocrine la plus r pandue Neuroendocrinologie 2h Initiation la neuroendocrinologie partir de l exemple de la leptine et du neuropeptide Y ou de l hormone antidiur tique ADH et de la pathologie qui lui est associ e le diab te insipide M tabolisme 2h Les grandes voies du m tabolisme inter prandial et du m tabolisme post prandial Nutrition 10h La consommation alimentaire en France La consommation d alcool et son m tabolisme La consommation de cholest rol et des trois grands types d acides gras en relation avec les risques d ath roscl rose premi re cause de mortalit en France Enseignants Mme Feuvray M Gripois M Hars Mme McLean M Taouis Universit Paris Sud 11 10 11 2004 50 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 OGM entre science et soci t Biol 278 L2S3 Responsable Sophie Nadot UE de d couverte Objectifs Nous souhaitons proposer aux tudiants de Licence une d couverte de la notion d Organisme G n tiquement Modifi sous diff rents angles allant de l aspect purement scientifique fabrication d un OGM bact rien v g tal ou animal l
164. tes divergentes suite r currentes S ries termes positifs comparaison s ries et int grales Application l tude des variables al atoires discr tes des couples de variables discr tes Unit de 75h obligatoire pour les tudiants pr parant les concours agro v to Une version all g e de 50h sera ouverte aux autres tudiants Equipe p dagogique Universit Paris Sud 11 10 11 2004 19 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Ethologie Comportement de l animal dans son milieu Biol 171 L1S2 Responsable Fanny Rybak UE de d couverte Objectifs Le module vise veiller les tudiants l thologie en pr sentant l historique les concepts les m thodes et la d marche thologiques Ce module optionnel fera le lien entre l cologie et les neurosciences Dans ce cadre l tude du comportement animal sera pr sent e sous ses diff rents aspects allant du comportement en milieu naturel jusqu aux bases biologiques des comportements avec des exemples pris dans l ensemble du r gne animal Ce module peut tre suivi par les tudiants se destinant une formation en Ecologie en Biologie int grative et en Neurosciences L enseignement sera fait sous forme de cours TD TP et sorties sur le terrain Il est souhaitable que les diff rents th mes soient abord s par un angle de discussions et d analyses de donn es faites par les tudiants sur TP articles
165. tine vincristine vind sine navelbine taxanes palcitaxel e Cytokines interf ron y e R sistance aux anticanc reux CHIMIOTHERAPIE ANTIVIRALE e Classification des infections virales e Cibles virales et ou cellulaires des agents antiviraux ADN polym rases virales h licase NTPase IMP d shydrog nase SAH hydrolase ARN polym rase e Chimioth rapie des infections herp tiques virus de l herp s simplex de type 1 et 2 HSV 1 HSV 2 virus varicelle zona VZV virus d Epstein Barr EBV Cycle de r plication virale Inhibiteurs de P ADN polym rase virale analogues nucl osidiques e Chimioth rapie de l infection VIH cycle de r plication virale inhibiteurs de la r trotranscriptase virale inhibiteurs de la prot ase virale inhibiteurs de l int grase virale inhibiteur de fusion m canismes de r sistance aux antiviraux e Chimioth rapie de l infection VHB Equipe p dagogique B Roy L Cohen P Le Mar chal Universit Paris Sud 11 10 11 2004 133 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Ecophysiologie v g tale Biol 332 L3S6 Responsables Gabriel Cornic Graham Noctor U E obligatoire parcours BOE Ecologie Cours 30h G Cornic e La lumi re apporte l nergie n cessaire la vie des plantes Absorption de la lumi re Fonctionnement d un photosyst me La cha ne de transduction de l nergie e La lumi re est un probl me pour le fo
166. tion Biologie annexe 1 Math matiques de la mod lisation I Math191 L1S1 Responsables M A Poursat et S Lemaire U E obligatoire Objectifs Offrir tous un enseignement qui fournit une nouvelle motivation des maths en biologie Favoriser l acquisition d une d marche de mod lisation pour tudier pr voir interpr ter le comportement de syst mes biologiques Introduire les statistiques quantifier la variabilit exp rimentale et faire en sorte que tous les tudiants aient confront des r sultats exp rimentaux des mod les gr ce aux tests statistiques Volume horaire Total 50 CM 20h TD 30 Pr requis aucun R sum Le fil conducteur de ce module est la mod lisation de ph nom nes biologiques et de donn es exp rimentales Introduction exemples de mod lisation d taill s pour introduire la notion de mod le de courbes et la notion d al atoire li e aux donn es exp rimentales exemples possibles courbes d talonnage d un dosage radioimmunologique courbes d volution et motiver les deux parties du cours Partie I tude de fonctions partir de mod les courants en biologie Variations extremum limites et asymptotes r gularit Calcul de param tres caract ristiques d une courbe fonctions usuelles polynomiales log et exp sin et cos sigmo dales D riv es un peu d optimisation num rique application aux moindres carr s approximation d une courbe par un polyn me P
167. toxicit d une substance de la toxicit in vitro l pid miologie Origine et voies d exposition alimentation polluants COVS exposition professionnelle aux x nobiotiques Notions de pharmacologie Toxicit aigue chronique relation dose effet M tabolisme des x nobiotiques effets cellulaires cibles G notoxicit mutag n se canc rog n se Toxicit pour la reproduction Modulateurs endocriniens Organotoxicit Notions d cotoxicologie les polluants dans l environnement Les TD comporteront en partie un travail personnel de synth se bibliographique l aide desTICE sur lequel portera l valuation Enseignement exp rimental M thodes d analyse chimique et biochimique appliqu es la mise en vidence de x nobiotiques dans l alimentation l environnement ex pesticides dans les eaux Aide la r ussite aide au travail universitaire Etude bibliographique TICE Equipe p dagogique I Masson Universit Paris Sud 11 10 11 2004 140 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 Apprendre enseigner les SVT Biol 337 L3S6 Responsable Anne Marie CALLEN Type d U E au choix parcours BOE Biologie int grative Public Etudiants se dirigeant vers les carri res de l enseignement primaire ou secondaire Pr requis Le module de sensibilisation aux m tiers de l enseignement en L2 S4 est fortement recommand Objectifs Initier les tu
168. trat gies de cribles de mutants diff rents types de mutation de la mutation ponctuelle l amplification de triplets Icons quences des mutations perte ou gain de fonction etc cartographie des g nomes des organismes haplo des l homme les exceptions au test de compl mentation fonctionnelle suppression synergie pistasie col talit r gulation pig n tique m thylation empreinte parentale p n trance expressivit expression ectopique et expression cibl e transg n se interactions g nomes des organites et g nome nucl aire clonage positionnel bases de la th rapie g nique g n tique quantitative TD Cartographie fine par l analyse d asques Recherche de diff rents types de suppresseur chez la levure Deux iso cytochrome c chez la levure R gulation utilisation du galactose chez la levure Transg n se chez la levure D terminisme du sexe chez C norhabditis elegans Mutag n se par transposition chez la Drosophile Clonage positionnel G n tique quantitative Equipe p dagogique A Sainsard Chanet PR D Coen PR J Feunteun PR A Boivin MC M C Daugeron MC M Heude MC F Chalvet MC E Espagne MC A Hua Van MC A Helbling Universit Paris Sud 11 10 11 2004 113 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 TP de G n tique des organismes procaryotes Biol 322 L3S6 Responsable C Pasternak U E de
169. u d veloppement ou de la physiologie pour fournir la vision la plus int grative possible Cet enseignement est plus particuli rement destin aux tudiants du parcours Biologie des organismes aux cosyst mes Ecologie Les travaux pratiques seront assur s dans l UE Evolution et diversit des m tazoaires Volume horaire Total 50h CM 50h TD TP Plan des enseignements CM Historique de la classification de la classification anthropocentrique jusqu au phylocode Phylog nies des m tazoaires et caract res d riv s propres tude des caract res sur les phylog nies parcimonie vraisemblance Etude des caract res par exemple Le membre chiridien Les annexes embryonnaires F condation L appareil urog nital La d termination du sexe Les t guments La viviparit La m tam rie Equipe p dagogique Marc Girondot Pr Laurent Th odore Pr Muriel Perron CR CNRS Universit Paris Sud 11 10 11 2004 98 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 BIOLOGIE MOLECULAIRE ET BIOCHIMIE Biol 306 L3S5 Responsables Martin KREIS et Marie No lle RAYMOND U E Obligatoire parcours BOE Ecologie Objectifs Donner des notions de Biochimie et de Biologie Mol culaire aux tudiants qui se dirigent en L3 dans le parcours Biologie des Organismes et des Ecosyst mes Un aspect important de l UE est de pratiquer un ensemble de d marches et de m
170. uivre la formation d ergonomie a pour objectif d apporter des informations concernant leurs statuts comme employ s dans une entreprise Comment se comporter face aux risques du travail Comment comprendre des risques du travail Comment interpr ter les documents scientifiques et juridiques Chaque salari a des droits et des devoirs par rapport son statut d employ dans l entreprise priv e ou nationalis e La gestion des risques au travail est prise en compte par le droit du travail la sant des personnes est suivie par la m decine du travail et les risques sont valu s partir des tudes pid miologiques qui mettent en relation les facteurs de risques et les pathologies Plan des cours La vie du salari dans l entreprise Droit du Travail Conditions d emploi Inspection du Travail Le contrat du travail Droits et devoirs du salari Les repr sentants des salari s Comit d Hygi ne S curit et Conditions du Travail Harc lement moral Les responsabilit s des employeurs et des employ s par rapport la l gislation Sant au Travail La m decine du travail structure et champs d action Epid miologie industrielle Techniques statistiques Les risques relatifs Les liens causes et effets Les indicateurs de sant Interpr tation des r sultats des tudes pid miologiques Toxicologie M thodes et techniques Valeurs limites Normes Nombre maximum d inscrits 25 Enseignants Mme Saiz Avocate
171. ution des cycles de reproduction chez les organismes photosynth tiques 1h30 Biologie v g tale TP Pr sentation du cycle de vie d une Bryophyte Marchantia polymorpha Le but est travers l observation de diff rents stades pr et post f condation de cette esp ce de reconstituer le cycle de d veloppement complet et de d buter une r flexion sur la notion d adaptation au milieu terrestre 3h TP Evolution des cycles de reproduction sexu e en relation avec l adaptation au milieu terrestre deux exemples seront abord s une foug re homospor e Pt ridophytes et le faux cypr s dor Conif rophytes 3h TD de synth se en reprenant les cycles de d veloppement d j tudi s et quelques autres plus complexes r flexion sur les caract res volutifs associ s l adaptation des v g taux au milieu terrestre 2h Biologie Animale TD Pr sentation des M tazoaires pr sentation des diff rents taxons l aide d chantillons biologiques 3h TP Etude morphologique et anatomique du criquet illustration du plan d organisation d un Arthropode Les diff rents appareils structures et fonctions 3h TP Etude morphologique et anatomique de la souris blanche illustration du plan d organisation des Vert br s Les diff rents appareils structure et fonction 3h TD Analyse d un article illustrant la diversit et l histoire volutive des Insectes 1h30 La s ance permettra d aborder l
172. veau cellulaire Les fonctions exocrines des glandes digestives glandes salivaires foie et pancr as 5 changes gazeux 9h Niveau organe tude compar e du poumon et de la branchie Relations avec l appareil circulatoire changes gazeux au niveau d une feuille Niveau cellule tude des pneumocytes Caract risation des diff rents types de cellules foliaires 6 Excr tion osmor gulation 3h Organisation et fonctionnement du rein de Vert br R le osmor gulateur de la branchie Relations avec l appareil circulatoire 7 Maintien de l organisme 9h Constitution et formation des matrices extracellulaires chez les animaux et les v g taux Le maintien de l appareil a rien chez les v g taux tude de la tige Les tissus secondaires bois et li ge chez les plantes p rennes arbres Posture et mouvement chez les Vert br s fonctionnement int gr squelette muscle et syst me nerveux Relations avec l appareil circulatoire 8 Synth se 5h Coordination des diff rentes fonctions chez les organismes animaux Coordination des diff rentes fonctions chez les organismes v g taux Equipe p dagogique Fran ois AGNES Solange BERTRANDY Line DUPORTETS Dani le MARCHAL Florence MOUGEL Fanny RYBAK Jean Claude CALLEN Janine GRISVARD Michel LEMULLOIS Martine THOMAS Anne Marie DENEUBOURG Pierre DUTUIT Jacques de BUYSER C line CHARON Marianne DELARUE Marie DUFRESNE U
173. ymorphismes mol culaires et leurs r percussions ventuelles sur le ph notype Marqueurs g n tiques notion de marqueur marqueurs biochimiques iso enzymes prot ines totales marqueurs biochimiques RFLP microsatellites AFLP SNP Utilisation des marqueurs en g n tique et g nomique cartes g n tique et physique cartographie de g nes majeurs cartographie et caract risation de g nes effets quantitatifs 3 Statut individuel et exposition environnemental Approches exp rimentales mise en jeu pour identifier le s alt ration s g n tiques responsables de maladies h r ditaires Biochimie Transport et m tabolisme dans les cellules animales et v g tales 1 Structures fonctions et m tabolismes e des polysaccharides cellulose chitine amidon glycog ne e des lipides triglyc rides phospholipides cholest rol 2 Membranes Structure et dynamique des membranes Transports des ions et des m tabolites Conversion d nergie dans les mitochondries et les chloroplastes Equipe p dagogique Martin Kreis PR Dominique de Vienne PR Jean Feunteun PR Yves Devaux MC Marianne Delarue MC Nicolas Bayan MC Marie No lle Raymond MC et Fran oise Vesin MC Universit Paris Sud 11 10 11 2004 99 Licence Domaine Sciences Technologie Sant mention Biologie annexe 1 ORGANISATION DES ECOSYSTEMES ECO Biol 307 L3S5 Responsable Alain LOUVEAUX U E Obligatoire dans parcour

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