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        Amplified MTD™
         Contents
1.                                                                                                                     15  Repeti    o do teste            2 cais                     ace la saias analisa 15          5                                                                                                                                                                                                                                             15  INTERPRETA    O DO TESTE      ssssscsssssssssssessssssessssssssvevessssssseeseauavecessssseeseavevevecesnaeas 17  APRESENTA    O DOS RESULTADOS                                                 17                                                              A E                     18  VALORES ESPERADOS wisissseccsssctsscsiscscscacsscssendetsvacstesssavscssccscetsasscuedsaacsvedsaceversizetesanss 19  COMPORTAMENTO  FUNCIONAL           2 ccseseeceesseeeeeeeseeeenseneeeesseeeeeseneeeesseeeeeessneeenseaes 20  RESOLU    O DE INCIDENTES      c cscsssssssessssssssssssssssesssssssssessavevevecsesseesusvevenseneaeaeaeen 24          5                                                                                                                                                                                                                                       26                                                                                                                                                                                       
2.                                       27  TESTE AMPLIFIED          A DETEC    O DIRECTA DAS 1 AW 12601 601 Rev  001  PT     MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    UTILIZA    O Amplified MTD          UTILIZA    O    O teste Hologic AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS MICOBACT  RIAS DO  COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS  MTD        um teste que utiliza uma  sonda de   cido nucleico dirigida contra um alvo amplificado  permitindo a detec    o in vitro  dos   cidos nucleicos das micobact  rias do complexo Mycobacterium tuberculosis  Este  teste efectua se a partir de amostras provenientes de expectora    es  induzidas ou  expectoradas   de colheitas coletas br  nquicas  lavagens bronco alveolares ou aspira    es  br  nquicas  ou de aspira    es traqueais     ADVERT  NCIA    A efic  cia deste teste n  o foi demonstrada para a detec    o directa de ARNr de   M  tuberculosis a partir de outras amostras cl  nicas  sangue  urina ou fezes  por exemplo    O comportamento funcional do teste MTD foi estudada apenas para as amostras tratadas  com a t  cnica descrita e conservadas respeitando o tempo e temperaturas especificadas   nesta ficha t  cnica     As amostras que derem resultados positivos devem ser colocadas em cultura para  determinar a presen  a eventual de micobact  rias at  picas juntamente com as do complexo  M  tuberculosis permitindo efectuar testes de sensibilidade aos agentes  anti micobacterianos  Devem ser efectuadas culturas para a detec    o de 
3.       EMBALAGEM DE REAGENTES PARA HIBRIDIZA    O    Composi    o da embalagem 50 Test   bioM  rieux ref  39006   Hologic Cat  No  301001F     Reagente de Hibridiza    o  H  1x6ml     ap  s reconstitui    o   Tamp  o de Hibridiza    o  HB  1x6ml  Reagente de Selec    o  S  1x15ml  Tubos de Lise  LT  2 x 25 tubos  Cartas de protec    o  folhas autocolantes  1 pacote    B  Material necess  rio n  o fornecido     Micropipetas capazes de distribuir 25 ul  50 ul  100 ul  200 ul  300 ul e 450 ul  Vortex     gua est  ril  filtrada ou autoclavada  Tubos de cultura   Esferas de vidro est  reis de 3 mm   Tubos para microcentr  fuga com tampas de enroscar   Suporte para tubos reaccionais   Pontas de pipeta com filtro  1 000 ul    Testemunhos Positivos de Amplifica    o  por ex  M  tuberculosis  ATCC 25177  ou ATCC 27294    Testemunhos Negativos de Amplifica    o  por ex  M  gordonae  ATCC 14470  ou M  terrae  ATCC 15755    Lix  via  solu    o de hipoclorito a 5 25     Folhas de protec    o plastificadas para bancada   Pipetas de repeti    o    TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 8 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    Amplified MTD    PROCEDIMENTO       C  Material suplementar disponivel no distribuidor Hologic                                   Cat  No   Sonicador 901104   bioM  rieux ref  39409   Blocos de aquecimento    105524 10554F    42  C  1  C  60  C  1  C  95  C   5C  105524J   bioM  rieux ref  39405  39406  39407   Lumin  
4.     o  Se o teste for  efectuado com al  quotas de enzimas congeladas  coloc   las previamente       TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 13 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    PROCEDIMENTO Amplified MTD          temperatura ambiente  nao descongelar as aliquotas colocando as a uma alta  temperatura  Para homogeneizar as aliquotas descongeladas  aspirar e rejeitar a  solu    o utilizando uma pipeta de repeti    o antes de adicion   la aos tubos de  amplifica    o     6  Transferir os tubos para um bloco de aquecimento ou banho maria a 42     1  C e  deix   los arrefecer durante 5 minutos  N  O DEIXAR OS TUBOS ATINGIREM A  TEMPERATURA AMBIENTE  NAO COBRIR O BANHO MARIA     7  uando os tubos estiverem a 42  C  adicionar 25 ul de Reagente Enzim  tico em cada  tubo utilizando uma pipeta de repeti    o  Sacudir para misturar  Incubar a 42  C  durante 30 minutos  mas n  o mais de 60 minutos     necess  rio utilizar folhas  autocolantes ou tampas durante esta etapa de incuba    o  NAO COBRIR O  BANHO MARIA     8  Ap  s o per  odo de incuba    o de 30 minutos  os tubos cobertos podem ser  conservados a 2  C   8  C durante 2 horas ou a  20  C at   ao dia seguinte  Se forem  conservados a  20  C at   ao dia seguinte  os tubos devem ser totalmente  descongelados    temperatura ambiente ou  no m  ximo  a 60  C antes da etapa de  hibridiza    o  e devem ser  de prefer  ncia  fechados com tampas e n  o com folhas  autocolantes     H
5.   Transferir 450 ul de solu    o de tamp  o fosfato NALC NaOH e 50 ul de  dilui    o de Controlo de Amplifica    o para o tubo correspondente de lise de  micobact  rias  LT  identificado     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 12 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    Amplified MTD    PROCEDIMENTO       3         Se estiverem a ser usados Controlos de Amplifica    o  transferir 450 ul do  recipiente do Controlo de Amplifica    o para o correspondente tubo de lise de  micobact  rias  LT  identificado         Amostras  Transferir 450 ul de cada amostra descontaminada e homogeneizada  do recipiente para o correspondente tubo de lise de micobact  rias  identificado  LT      Fechar os tubos de lise de Micobact  rias  LT  ap  s a adi    o de cada amostra     4  Agitar durante 3 segundos em vortex     Lise das amostras    1     2     Inserir os Tubos de Lise no suporte do sonicador de forma a que a mistura de  reac    o no fundo dos tubos fique imersa  mantendo as tampas fora de   gua   Colocar o suporte no local  OS TUBOS N  O DEVEM  EM CASO ALGUM  TOCAR  NO FUNDO OU NAS PAREDES DO SONICADOR     Colocar o sonicador em funcionamento durante 15 minutos  mas nunca mais de  20 minutos  As amostras e testemunhos assim tratados com ultra sons designam se  por   lisados    NAO UTILIZAR O Vortex PARA AGITAR OS LISADOS     Amplifica    o    1     Identificar os tubos de polipropileno para amplifica    o  12 x 75 mm  escrevendo no  topo
6.   VEIS    RECOMENDA    ES       Controlo negativo de  amplifica    o elevado ou  Controlo negativo de  Processamento da  amostra  2 20 000 RLU     Controlo Positivo de  Amplifica    o Baixo ou  Controlo Positivo de  Processamento da  Amostra   lt  500 000 RLU     Homogeneiza    o insuficiente  ap  s adi    o do Reagente de  Selec    o  S  ou volume  insuficiente de Reagente de  Selec    o     Amplifica    o de contaminantes  introduzidos por falta de  precau    o no decurso da  prepara    o das reac    es     Omiss  o da etapa de  arrefecimento de 5 minutos     Contamina    o do laborat  rio  ou dos reagentes     Omiss  o da limpeza dos tubos  antes da leitura no lumin  metro     Desrespeito das temperaturas  preconizadas na etapa de  amplifica    o     Adi    o do Reagente de  Amplifica    o deitando o l  quido  sobre as paredes do tubo e n  o  directamente no fundo     Homogeneiza    o insuficiente  ap  s adi    o do Reagente de  Hibridiza    o reconstitu  do     Volume excessivo de Reagente  de Selec    o     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS    24    MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    Voltar a homogeneizar correctamente   Respeitar os volumes indicados    Verificar o aparecimento de uma solu    o de  cor rosa uniforme ap  s a agita    o     Deve ter se muito cuidado com a   utiliza    o das pipetas na distribui    o dos  reagentes  Os tubos usados devem ser  descontaminados com uma solu    o de lix  via  a 1 10  como indica do no par  gra
7.   cnicos do laborat  rio  aos erros  de identifica    o das amostras e aos erros de transcri    o dos resultados  Um teste negativo  n  o exclui a presen  a de uma micobact  ria do complexo M  tuberculosis na amostra     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 18 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    Amplified MTD    VALORES ESPERADOS       VALORES ESPERADOS    A  Intervalo dos valores de controlo obtidos no decurso de ensaios cl  nicos    O intervalo dos valores obtidos para os controlos  RLU  no decurso dos ensaios cl  nicos  efectuados em 7 locais  foi           RLU  N 704   Intervalo M  dia  e    556 245 to  Testemunho Positivo de Amplifica    o 2 000 000  gt 2 000 000  Testemunho Negativo de Amplifica    o 904 to 18 754 3 041    B  Intervalo dos valores obtidos para amostras cl  nicas    Para 127 amostras MTD positivas  os valores estavam compreendidos entre  35 777 e  gt  2 000 000 RLU     Para 577 amostras MTD negativas  os valores estavam compreendidos entre  573 e 19 176 RLU     A distribui    o dos resultados em RLU para todas estas amostras  ap  s resolu    o das  discord  ncias  encontra se aqui abaixo  a resolu    o das discord  ncias baseia se na  an  lise de outras amostras  positivas em cultura  provenientes do mesmo paciente  e ou com diagn  stico final do m  dico     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 19 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    COMPORT
8.   e uma especificidade m  dia de 99 6  em rela    o     cultura  O quadro abaixo d   a sensibilidade  especificidade  valor predictivo positivo   VPP  e o valor predictivo negativo  VPN   com intervalos de confian  a de 95   para as  estimativas do comportamento funcional  Todos os dados s  o apresentados ap  s  resolu    o das discord  ncias  baseada na exist  ncia de outras amostras  com cultura  positiva  provenientes do mesmo paciente e ou com diagn  stico final do m  dico     Por paciente                                         Percentagem N  mero Intervalo de  m  dia   Total confian  a de 95   Sensibilidade 93 3  56 60 83 8     98 2   Especificidade 99 1  221 223 96 8     99 9   VPP 96 6  56 58 88 1     99 6   VPN 98 2  221 225 95 5     99 5   Por amostra   Percentagem N  mero Intervalo de  m  dia   Total confian  a de 95   Sensibilidade 90 6  125 138 84 4     94 9   Especificidade 99 6  564 566 98 7     100   VPP 98 4  125 127 94 4     99 8   VPN 97 7  564 577 96 2     98 8   TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 21 AW 12601 601 Rev  001  PT     MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    COMPORTAMENTO FUNCIONAL Amplified MTD          Das 564 amostras com cultura e MTD negativas para o complexo M  tuberculosis    114 amostras continham micobact  rias at  picas  detectadas em cultura  64 provinham  de pacientes em que outras amostras permitiram isolar micobact  rias at  picas em  cultura e 169 provinham de pacientes em que n  o foi isolada nenhuma m
9.   variabilidade das colheitas coleta  aos erros t  cnicos do    TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 2 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    Amplified MTD    PRECAU    ES DE UTILIZA    O       laborat  rio  aos erros de identifica    o das amostras e aos erros de transcri    o dos  resultados     D  O teste destina se apenas    detec    o das micobact  rias do complexo M  tuberculosis  a  partir de amostras preparadas segundo os m  todos NALC NaOH ou NaOH que s  o  recomendados pelos Centers for Disease Control  CDC      Este teste deve ser utilizado  unicamente para amostras concentradas  preparadas a partir de expectora    es   induzidas ou expectoradas   de aspira    es traqueais ou de colheitas coleta br  nquicas   lavagens bronco alveolares ou aspira    es br  nquicas   Quando proceder    suspens  o  da amostra na solu    o de tamp  o fosfato  verificar se a concentra    o de fosfato    de  67 mM        E  Evitar qualquer contacto dos Reagentes de Detec    o   e II  bioM  rieux ref   39300   Cat  No  201791  com a pele  olhos ou mucosas  Caso haja contacto  lavar  com   gua  Se estes reagentes forem entornados  dilu   los com   gua antes de limpar     F  Ter as precau    es habituais na realiza    o deste teste   A prepara    o das amostras  fluidificadas e descontaminadas  bem como as etapas do teste MTD  devem ser  efectuadas respeitando as regras de seguran  a microbiol  gica do n  vel 2       G  Utilizar unicame
10.  C  Reprodutibilidade    O estudo da reprodutibilidade foi efectuado com 25 amostras  intercaladas com  testemunhos de amplifica    o negativos para um total de 50 amostras  O painel de  reprodutibilidade foi testado em quatro locais     No total  100   120 120  das amostras negativas e 98 8    79 80  das amostras  positivas deram os resultados esperados     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 22 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    Amplified MTD    COMPORTAMENTO FUNCIONAL       D  Especificidade analitica    A especificidade do teste MTD foi avaliada com bact  rias  fungos e virus  No caso das  bact  rias e dos fungos  os testes de especificidade incluirem 160 estirpes cepas    151 esp  cies provenientes de 62 g  neros  de micobact  rias muito pr  ximas de   M  tuberculosis  outros microrganismos respons  veis por doen  as respirat  rias  e um  painel filogen  tico de microrganismos da flora comensal do aparelho respirat  rio  As  estirpes cepas tipo eram culturas ATCC  American Type Culture Collection   e   5 estirpes cepas foram fornecidas por laborat  rios de an  lises  Os lisados  preparados a  partir de culturas em crescimento activo  ou de ARNr  em tr  s casos  foram analisados  seguindo o procedimento do teste MTD com cerca de 5 x 10    UFC por teste  S   as  estirpes cepas do complexo M  tuberculosis deram resultados positivos  exceptuando as  estirpes cepas M  celatum e M  tipo terrae     Com concentra    es 
11.  Chem  35 1588 1594    3  Bradley  S T  S L  Reed and A  Catanzaro  1996  Clinical Efficacy of the Amplified Mycobacterium Tuberculosis Direct  Test for the Diagnosis of Pulmonary Tuberculosis  Am  J  Respir  Crit  Care Med  153 1606 1610    4  Centers for Disease Control  1988  United States Morbid  and Mortal  Weekly Rep  37 377 382  387 388    5  Centers for Disease Control and Prevention  and National Institute of Health  May  1993  3rd Edition  Biosafety in  Microbiological and Biomedical Laboratories  pp  93 96    6  Collins  F  M   1989  Mycobacterial disease  immunosuppression  and acquired immunodeficiency syndrome  Clin   Microbiol  Rev  2  360 377    7  Kent  P T  and G P  Kubica  1985  Public Health Mycobacteriology  A Guide for the Level Ill Laboratory  U S  Department  of Public Health and Human Services  Public Health Service  Centers for Disease Control  Atlanta  GA    8  National Committee for Clinical Laboratory Standards  Internal quality control  Principles and definitions  Approved  Guideline  NCCLS document C24 A  Villanova  PA  NCCLS  1991    9  Pitchenik  A E   D  Fertel  and A B  Block  1988  Mycobacterial Disease  Epidemiology  Diagnosis  Treatment  and  Prevention  Clin  Chest Med  9 425 441    10  Roberts  G D   E W  Koneman  and Y K  Kim  1991  Mycobacterium  pp  304 339  In A  Balows  et al   eds    Manual of  Clinical Microbiology  American Society for Microbiology  Washington  D C    11  Simone  P M  and Iseman  M D   1992  Drug resistant Tuber
12.  Colocar 3 a 5 esferas de vidro de 3 mm num tubo de cultura limpo     b  Adicionar 1 a 2 ml de   gua est  ril  Adicionar o conte  do de v  rias ansas  1 ul   de cultura apropriada  Fechar o tubo e agitar v  rias vezes a uma grande  velocidade  utilizando um Vortex     c  Deixar repousar durante 15 minutos     d  Transferir o sobrenadante para um tubo de cultura limpo  Ajustar a turbidez a  1 McFarland utilizando um nefel  metro     e  Diluir a 1 100 a suspens  o  colocando 100 ul da suspens  o a 1 McFarland em  10 ml de   gua est  ril  Fechar e agitar em vortex  Esta    a primeira dilui    o     f  Diluir uma segunda vez a 1 100  colocando 100 ul da dilui    o 1      10 ml         gua est  ril  Fechar e agitar em vortex  Esta    a segunda dilui    o  Esta dilui    o  deve conter aproximadamente 25     150 CFU por 50 ul     Aliquotar e Conservar os Controlos    a  As dilui    es devem ser distribu  das em al  quotas  500 ul   em micro tubos de  centr  fuga de 1 5 ml limpos  com tampas de rosca  As al  quotas destinam se a  uma   nica utiliza    o e podem ser conservadas a    20   C durante 6 meses  ou a    70  C durante 1 ano  N  o utilizar congelador com descongela    o  autom  tica     A utiliza    o do controlo positivo para M  tuberculosis servir   para monitorizar apenas  a falha substancial do reagente  O controlo positivo foi concebido para verificar se  houve excesso de NaOH e de tamp  o fosfato nos reagentes utilizados durante o  procedimento  As varia    es dos proce
13.  MTD          NOTAS    A  Os blocos de aquecimento devem conter po  os previstos para tubos de 12 x 75 mm   Aconselha se a utiliza    o dos blocos de aquecimento      B  Para a conserva    o das al  quotas congeladas recomenda se a utiliza    o de tubos de  microcentr  fuga com tampa  As al  quotas congeladas individualmente podem ser  descongeladas apenas uma vez  N  o devem ser usados congeladores com  descongela    o autom  tica     C  Recomenda se a utiliza    o de frascos de congela    o de 5 ml para a conserva    o das  al  quotas congeladas  As al  quotas congeladas individualmente podem ser  descongeladas apenas uma vez  N  o devem ser usa dos congeladores com  descongela    o autom  tica     D  As performances dos Vortex podem variar consoante o material utilizado podendo  por  isso  ser necess  rio adaptar o tempo de agita    o  Regular a velocidade do aparelho e  seguir as instru    es do   PROCEDIMENTO  par  grafo E    para deixar a mistura de  reac    o atingir a metade superior da parede do tubo     indispens  vel uma boa  homogeneiza    o para obter resultados precisos  O tempo de agita    o pode ir at   15  segundos  sem afectar os resultados     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 26 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    Amplified MTD    BIBLIOGRAFIA       BIBLIOGRAFIA    2  Arnold  L J   P W  Hammond  W A  Wiese  and N C  Nelson  1989  Assay formats involving acridinuim ester labeled  DNA probes  Clin 
14.  a mistura entrar  em contacto com as folhas autocolantes ou com as tampas   Quando a  homogeneiza    o estiver correctamente efectuada  a mistura deve ter uma cor  amarela uniforme     3  Incubar a 60  C durante 15 minutos  mas n  o mais de 20 minutos  num bloco de  aquecimento ou em banho maria     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 14 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    Amplified MTD    PROCEDIMENTO       Selec    o    1     Deteccao    1     O Reagente de Selec    o  S  deve estar    temperatura ambiente antes de come  ar  o teste  Retirar os tubos do banho maria ou do bloco de aquecimento a 60  C e  adicionar 300 ul de Reagente de Selec    o  S  com uma pipeta de repeti    o  Cobrir  os tubos com folhas autocolantes ou com tampas  Agitar num Vortex  a uma  velocidade m  dia  3 vezes durante  pelo menos  1 segundo   Para uma boa  homogeneiza    o dos tubos de reac    o  mant   los na posi    o vertical e deixar a  mistura atingir a metade superior da parede do tubo durante a agita    o  para evitar  qualquer contamina    o n  o deixar a mistura entrar em contacto com as folhas  autocolantes ou com as tampas   Quando a homogeneiza    o estiver  correcta mente efectuada  a mistura deve ter uma cor rosa uniforme     Incubar a 60  C durante 15 minutos  mas n  o mais de 16 minutos  num bloco de  aquecimento ou num banho maria     Retirar os tubos do banho maria ou do bloco de aquecimento  Deixar os tubos  atingirem a 
15.  os n  meros correspondentes aos n  meros de identifica    o dos Tubos de Lise   Identificar igualmente os tubos de amplifica    o para os testemunhos de amplifica    o  positivo e negativo     Introduzir 50 ul de Reagente de Amplifica    o reconstitu  do no fundo de cada tubo  utilizando uma pipeta repetitiva  Adicionar 200 ul de   leo para reac    o de  amplifica    o  O  em cada tubo utilizando uma pipeta de repeti    o     N  O UTILIZAR O VORTEX PARA OS LISADOS  Transferir 25 ul de cada lisado  para o fundo do tubo de amplifica    o correspondente  utilizando uma nova ponta  com filtro para cada transfer  ncia  Os lisados que sobrarem podem ser conservados  a 2  C   8  C durante 7 dias  ou congelados a uma temperatura igual ou inferior a    20  C durante 1 m  s  N  o utilizar congelador com descongela    o autom  tica  Se for  necess  rio efectuar outros testes com os lisados  deix   los atingir previamente a  temperatura ambiente  N  O UTILIZAR O VORTEX PARA OS LISADOS     Incubar os tubos num bloco de aquecimento a 95  C durante 15 minutos  mas n  o  mais de 20 minutos     Preparar a Solu    o Enzim  tica adicionando 1 5 ml de Tamp  o de Dilui    o  Enzim  tica  EDB  ao Reagente Enzim  tico liofilizado  E   Rodar para misturar  N  o  agitar num Vortex  O Reagente Enzim  tico reconstitu  do    utiliz  vel durante um m  s  a 2  C   8  C ou durante dois meses a uma temperatura igual ou inferior a  20  C  se  for distribu  do em al  quotas e congelado  no dia da reconstitui
16. A do complexo de Mycobacterium tuberculosis  Cultura de AFB em crescimento  As amostras podem n  o conter  M  tuberculosis  o resultado pode ser falso negativo devido a baixos  n  meros de M  tuberculosis na presen  a ou aus  ncia de MOTT  ou  o resultado pode ser falso negativo devido a interfer  ncia de inibidores  da amostra     recomendado testar uma nova amostra do paciente se   clinicamente  houver forte suspeita de tuberculose ou se houver  suspeita de inibi    o        LIMITES    Este teste destina se apenas    detec    o das micobact  rias do complexo M  tuberculosis a  partir de amostras preparadas segundo os procedimentos NALC NaOH ou NaOH  recomendados pelo CDC     Este teste s   pode ser efectuado com amostras preparadas a  partir de expectora    es  induzidas ou expectoradas   de colheitas coletas br  nquicas   lavagens bronco alveolares ou aspira    es br  nquicas  ou de aspira    es traqueais     O teste MTD    espec  fico das micobact  rias do complexo M  tuberculosis  ou seja    M  tuberculosis  M  bovis  M  bovis BCG  M  africanum  M  microti e M  canetti  mas n  o as  diferencia entre si      celatum e     tipoterrae podem provocar reac    es cruzadas se  estiverem presentes em concentra    es superiores a 30 UFC por teste  No entanto    M  celatum e M  tipo terrae s  o raramente isoladas em cl  nica     A qualidade dos resultados do teste est   ligada    qualidade da colheita coleta e ao seu  transporte     variabilidade das colheitas coletas  aos erros t
17. AMENTO FUNCIONAL    Amplified MTD          Quadros dos resultados obtidos a partir de amostras  Provenientes de pacientes nao tratados  7 locals   N 704          80 4    BH Cultura NEG  E  Cultura POS    60 7    Numero de amostras       40 7       20 7           lt 7 500 7 500 20K 30K 100K 500K 21M    a a a a a  19 999 29 999 99 999 499 999 999 999    R  sultados da cultura    M  tuberculosis NEG  554 19 0  M  tuberculosis POS 13 0 0             1 0 0 1  4 7 6 108       COMPORTAMENTO FUNCIONAL    A  Avalia    o cl  nica    O comportamento funcional do teste MTD na sua forma original foram avaliadas no  decurso de ensaios cl  nicos efectuados em seis laborat  rios  comparando os resultados  obtidos por exame de esfrega  os com os resultados da cultura  em 6 079 amostras  provenientes de 2 609 pacientes  Entre estas  4 000 amostras provinham de   1 898 pacientes que n  o receberam tratamento anti tuberculose  Os seis locais  representavam zonas geogr  ficas diferentes  cinco hospitais de grandes cidades  americanas  com um servi  o especializado para a tuberculose  e um laborat  rio p  blico     O comportamento funcional do teste MTD na sua forma actual foram avaliadas em sete  locais  comparando os resultados do teste MTD com os resultados da cultura  Os sete  hospitais que participaram no teste representavam zonas geogr  ficas diferentes  seis  hospitais de grandes cidades americanas  com um servi  o especializado para a  tuberculose  e um laborat  rio p  blico nacional de mi
18. HOLOGIC Amplified MTD             TESTE AMPLIFIED PARA A DETECGAO DIRECTA DAS MICOBACTERIAS  DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS             Embalagem de 50 testes   bioM  rieux ref  39006 Hologic Cat  No  301001F           2         OAE E E E SE a 2  ADVERT  NCIA                  2  PRECAU    ES DE UTILIZA    O    ca sscsisssccssiasinenscniannassvsssecisiasnesnsecinesidasennnstdsasousdbisonen 2  INTRODU    O                                       eae 4  PRINCIPIO        5  REAGENTES  Embalagem de 50                                                            nan 5  CONSE AV ACA oases cessed atecutesscensteareerensants Si              6  COLHEITA COLETA  CONSERVAGAO  TRANSPORTE E TRATAMENTO  DAS                                                                                                                                                                                                        7  Colheita coleta e conserva    o da amostra                                                              7  Transporte  sssspenassorserisssanesissiaaaicsiseaicosa asseio siiasodantrssudaiseioidia                       devassa                                    7  Tratamento  descontamina    o e concentra    o                                                    7  Conserva    o das amostras                                                                                  7  MATERIAL ios cas cede ceo ccescecdedcny dususetccscede ex dxcesccceiede vx lisess co alone ssa cas dedesibeceeeeesend
19. OCEDIMENTO   e   NOTAS   para evitar a  contamina    o do laborat  rio com amplicons     M  NUNCA usar novamente as folhas autocolantes e as tampas utilizadas durante uma  etapa anterior  As tampas devem ser eliminadas num recipiente apropriado   imediatamente ap  s t   las retirado  para evitar qualquer contamina    o cruzada  As  folhas autocolantes devem ser aplicadas firmemente no cimo dos tubos reaccionais     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 3 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    INTRODU    O Amplified MTD          N  N  o cobrir o banho maria durante as incuba    es  especialmente se as tampas forem  utilizadas  a condensa    o na tampa pode ser uma fonte de contamina    o      O     necess  rio efectuar uma boa homogeneiza    o em Vortex depois da adi    o do  Reagentes de Selec    o para obter resultados precisos     P     recomendado utilizar uma   rea separada para a etapa de Ensaio de Protec    o de  Hibridiza    o  HPA   Hybridization Protection Assay  para minimizar a contamina    o por  amplicons no ensaio  Esta   rea deve estar separada da   rea onde    efectuada a  prepara    o da amostra  a prepara    o do reagente e a amplifica    o     Q  Para evitar que as   reas do laborat  rio figuem contaminadas por amplicons  o  laborat  rio deve estar organizado de uma forma uni direccional de trabalho  Por  exemplo  efectuar em primeiro lugar a prepara    o da amostra e do reagente numa   rea   em seguida 
20. a amplifica    o noutra  e por   ltimo o HPA noutra   rea  As amostras   equipamento e reagentes n  o devem voltar para a   rea onde foi efectuada uma etapa  anterior  Al  m disso  o pessoal de laborat  rio n  o deve voltar para uma   rea de trabalho  anterior sem ter as devidas precau    es de anti contamina    o  E vivamente  recomendado que a   rea de seguran  a biol  gica usada para o processamento da  amostra n  o seja usada para efectuar o teste MTD     INTRODU    O    O teste MTD utiliza os m  todos TMA  Transcription Mediated Amplification  e HPA   Hybridization Protection Assay   para detectar qualitativamente o ARN riboss  mico  ARNr   das micobact  rias do complexo M  tuberculosis  O teste MTD detecta o ARN dos  organismos cultiv  veis e n  o cultiv  veis  O complexo M  tuberculosis    constitu  do pelas  sub esp  cies M  tuberculosis  M  bovis  M  bovis BCG  M  africanum  M  microti e M               13  O teste MTD detecta todos os microrganismos do complexo M  tuberculosis  No  entanto  M  microti infecta apenas os animais    M  bovis raramente se transmite dos  animais para o homem  M  africanum    respons  vel pela tuberculose pulmonar na Africa                     M  tuberculosis            longe  o mais comum  sendo respons  vel por uma  morbidez significativa no mundo inteiro  O CDC relatou  recentemente  um aumento dos  casos de tuberculose nos pacientes atingidos com SIDA e nos imigrantes  e um aumento  da transmiss  o da doen  a nas popula    es de alto 
21. bacilos    cido   lcool resistentes  BAAR  para precisar que tipo de sub esp  cie do complexo   M  tuberculosis est   presente  M  bovis  por exemplo      No decurso de ensaios cl  nicos  foram submetidas ao teste amostras provenientes de  crian  as  de pacientes VIH positivos e de pacientes infectados com micobact  rias at  picas   No entanto  o n  mero destes ensaios n  o permitiu comparar estatisticamente o  comportamento funcional do teste para estes diferentes grupos     O comportamento funcional do teste em amostras provenientes de pacientes sob  tratamento anti tuberculose  no intuito de efectuar um seguimento terap  utico ou de  confirmar uma cura  n  o foi avaliada     As amostras com muito sangue n  o devem ser analisadas com o dispositivo MTD   PRECAU    ES DE UTILIZA    O    A  Somente para uso em diagn  stico in vitro         O teste MTD    espec  fico para as micobact  rias do complexo M  tuberculosis  ou seja   M  tuberculosis  M  bovis  M  bovis BCG  M  africanum  M  microti  e M canetti  13   mas  n  o as diferencia  M  celatum e M  tipo terrae podem provocar reac    es cruzadas se  estiverem presentes concentra    es superiores a 30 UFC  Unidades Formadoras de  Col  nias  por teste  No entanto  M  celatum e M  tipo terrae s  o raramente isoladas em  cl  nica     C  Um resultado negativo n  o exclui a presen  a de uma micobact  ria do complexo  M  tuberculosis na amostra  A qualidade dos resultados est   ligada    qualidade da  colheita e do seu transporte   
22. cobacteriologia  As amostras  analisadas eram provenientes de pacientes que n  o receberam tratamento  anti tuberculose  132 deram resultados positivos na cultura para as micobact  rias do  complexo M  tuberculosis  MTD detectou 119 destas amostras cultura positivas    7 amostras continham micobact  rias n  o tuberculosas para al  m das M  tuberculosis     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 20 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    Amplified MTD       COMPORTAMENTO FUNCIONAL       AMOSTRAS    PROVENIENTES DE PACIENTES NAO TRATADOS  Compara    o MTD   cultura  N 704        POR PACIENTE   antes da resolu    o das discord  ncias                    Cultura      MTD   54 4  MTD     4 221   POR AMOSTRA        antes da resolu    o das discord  ncias    Cultura  MTD   119 8  MTD     13 564       POR PACIENTE   ap  s resolu    o das discord  ncias           Cultura        MTD   56 2  MTD   4 221          POR PACIENTE   ap  s resolu    o das discord  ncias        Cultura        MTD   125 2  MTD   13 564          Foram incluidos neste estudo pacientes suspeitos de terem uma tuberculose pulmonar  activa  e nao estando sob tratamento  A preval  ncia total dos pacientes que tiveram  uma cultura positiva para M  tuberculosis foi de 20 5      Foram determinadas  por paciente  uma sensibilidade m  dia de 93 3  e uma  especificidade m  dia de 99 1  em rela    o a cultura  Foram determinadas  por amostra   uma sensibilidade m  dia de 90 6
23. culosis  A Deadly and Growing Danger  J  Resp  Dis   13 960 971    12  Wayne  L G   1982  Microbiology of the tubercle bacilli  Am  Rev  Respir  Dis  125  3 pt 2  31 41    13  Van Soolingen  D   et al  1997  A novel pathogenic taxon of the Mycobacterium tuberculosis complex  canetti   characterization of an exceptional isolate from Africa  Intl  J  Syst  Bacteriol  47 1236 1245    14  Kerleguer A   Koeck J  L   Fabre M   G  r  me P   Teyssou R   Herv   V   2002  Application of a Grey Zone for the  Interpretation of The  Amplified Mycobacterium Tuberculosis Direct Test for the Rapid Diagnosis of Respiratory  Tuberculosis     Esm May 2002    15  Coll P  Garrig   M   Moreno C   Marti N   2002   Routine Use of E MTD  Hologic  For Direct Detection of Mycobacterium  Tuberculosis in Clinical Samples   Esm 2002    TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 27 AW 12601 601 Rev  001  PT     Thoracic Society  Medical Section of the American Lung Association  1983  Levels of laboratory services for  mycobacterial diseases  Am  Rev  Respir  Dis  128 213     MICOBACTERIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    Amplified MTD              0     Hologic  Inc   10210 Genetic Center Drive  San Diego  CA 92121 USA    Apoio ao Cliente   1 844 Hologic   1 844 465 6442   customersupport hologic com    Suporte t  cnico   1 888 484 4747  molecularsupport hologic com    Para obter mais informa    es sobre contactos  aceda a www hologic com     Hologic e Amplified MTD s  o marcas comerciais e ou 
24. dimentos no tempo ou nas temperaturas que  podem afectar a efici  ncia da amplifica    o ou a exactid  o do tempo seleccionado  podem n  o ser detectadas utilizando os controlos recomendados  Os controlos  adicionais podem ser testados em conformidade com as directivas ou  recomenda    es especiais     Controlo de inibi    o das amostras    Quando o teste MTD for negativo mas o diagn  stico do m  dico for favor  vel a uma  tuberculose     poss  vel verificar se a amostra cont  m um inibidor  procedendo da  forma seguinte     a  Colocar 50 ul de Tamp  o de Dilui    o das amostras em 2 tubos de lise das  micobact  rias  identificado com testemunho e sem testemunho      b  Introduzir 50 ul de Testemunho Positivo de Amplifica    o e 450 ul de amostra  num tubo  com testemunho   Adicionar 450 ul de amostra num segundo tubo   sem testemunho   Efectuar o teste seguindo o protocolo habitual     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 10 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    Amplified MTD    PROCEDIMENTO       Interpreta    o    Se o numero RLU  Relative Light Units  obtido no lumin  metro com    tubo com  testemunho for  gt  30 000 RLU  a amostra n  o cont  m inibidor de amplifica    o e   aparentemente  n  o cont  m alvo a amplificar  Se o n  mero de RLU obtido com o  tubo com testemunho for    lt  30 000 RLU  a amostra cont  m um inibidor de amplifica    o e uma outra amostra  deve ser analisada  Se o teste repetido do tubo sem t
25. do par  grafo    PROCEDIMENTO  Prepara    o do material    Se se suspeitar de uma  contamina    o do banho maria  proceder do mesmo modo que o acima descrito com  25 ul de   gua do banho maria  na condi    o de esta n  o conter nenhum produto  anti s  ptico     Prepara    o do material    1  A   gua dever   ser desgaseificada para optimizar a transfer  ncia de energia dos  ultra sons     a  Encher o reservat  rio do sonicador com   gua da torneira    temperatura  ambiente at   cerca de 1 cm do bordo     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 11 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    PROCEDIMENTO Amplified MTD          b  Para desgaseificar inteiramente a agua  colocar o sonicador em funcionamento  durante 15 minutos antes do in  cio dos testes     2  Regular um bloco de aquecimento a 95     5C  um outro bloco de aquecimento ou  um banho maria a 60     1  C e ainda outro bloco de aquecimento ou um  banho maria a 42     1       3  Limpar as superf  cies de trabalho  material e pipetas com uma dilui    o 1 2 de lixivia  antes de come  ar a an  lise  Deixar a lix  via actuar durante  pelo menos  15 minutos   Lavar com   gua a superf  cie de trabalho para eliminar os tra  os de lix  via  Cobrir a  superf  cie na qual o teste ser   efectuado com uma folha de protec    o plastificada  para bancada     4  Preparar o lumin  metro Leader  Certificar se de que h   uma quantidade suficiente  de Reagentes de Detec    o   e Il para efect
26. do reservado quando um teste inicial     equ  voco  Um resultado repetido do lisado  gt  30 000    considerado positivo     A  Controlo de qualidade e valida    o de resultados    Os controlos devem dar os seguintes valores   e Controlo negativo de amplifica    o  lt  20 000 RLU  e Controlo positivo de amplifica    o  gt  500 000 RLU  e Testemunho negativo  lt  20 000 RLU  e Testemunho positivo 2 1 000 000 RLU    Os resultados dos testes dos pacientes n  o devem ser fornecidos se os valores do  controlo de teste MTD n  o estiverem dentro destes crit  rios  Consultar a tabela de  RESOLU    O DE INCIDENTES para informa    es complementares     Cada laborat  rio deve determinar os valores alvo para cada controlo em fun    o dos  resultados obtidos para cada s  rie de controlos     B  Resultados de Testes de Pacientes    Se os valores dos controlos n  o estiverem dentro dos valores esperados  os resultados  das amostras de testes de pacientes n  o devem ser validados     Resultados     e  gt  500 000 RLU positivo para o ARNr do complexo M  tuberculosis  e  lt  30 000 RLU negativo para o ARNr do complexo M  tuberculosis  e 30 000 a 499 999 RLU prov  vel rRNA positivo do complexo de M  tuberculosis   repetir para verificar os resultados   Repetir  gt  30 000 RLU positivo para o complexo rRNA para M  tuberculosis  Repetir  lt  30 000 RLU negativo para o complexo rRNA para M  tuberculosis    APRESENTA    O DOS RESULTADOS    Os resultados do teste MTD devem ser interpretados em conjun
27. ensiecesess 7  PROCEDIMENT Ove ea a E A E E A      9  CON        isesi ararnar eusa tht ecte stele nae eeiv eed                   asasnya veniou 9  Prepara    o do                                                                                             11  Prepara    o do                              2                                                                    12  Prepara    o das                                                                                                                 12  Lise das                                                                                                                                                                                             13  Amplifica    o                                                                                                                                                                                                        13                                                                                                                                                                                                                            14                                                                                                                                                                                                                                          15                                                                                                                  
28. ente   leo de amplifica    o    leo para reac    o de amplifica    o   O  1  10          leo de silicone   Reagente Enzim  tico  E  1x1 5ml  Transcriptase inversa e ARN polimerase liofilizadas numa solu    o  ap  s  ap  s reconstitui    o     reconstitui    o  tamp  o HEPES contendo  lt  10   de agente espessante e  2 15 mM de N Acetil L Cisteina    Tamp  o de Dilui    o Enzim  tica  tamp  o de dilui    o das enzimas  1x1 5 ml   EDB   Solu    o tamp  o Tris contendo um surfactante e glicerol    TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 5 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    CONSERVA    O Amplified MTD          EMBALAGEM DE REAGENTES PARA A HIBRIDIZA    O    Nome do reagente Volume  Reagente de Hibridiza    o  H  1x6ml   lt  100 ng frasco de sonda ADN n  o infecciosa conjugada com um  ap  s reconstitui    o     marcador quimioluminescente  liofilizado numa solu    o tamp  o succinato  contendo um agente espessante e um detergente    Tamp  o de Hibridiza    o  HB  1x6ml  Solu    o tamp  o succinato contendo  lt  4   de detergente    Reagente de Selec    o  S  1x15ml  Solu    o tamp  o borato contendo um surfactante    Tubos de Lise  LT  2 x 25 tubos  Esferas de vidro  agente espessante    CONSERVA    O    A  As solu    es ou os componentes n  o reconstitu  dos seguintes devem ser conservados a   2  C  8  C e s  o utiliz  veis at      data de validade indicada    e Tamp  o de Dilui    o das Amostras  SDB    e Reagente de Amplif
29. estemunho for positivo  o  resultado do teste MTD pode considerar se positivo  A explica    o mais plaus  vel  para este tipo de resultado       a variabilidade ligada    amostragem  a primeira amostra n  o continha alvo a  amplificar  enquanto a segunda o continha  O n  mero de RLU do tubo em  testemunho pode ser positivo ou negativo dependendo da amostra conter ou n  o  ARNr de micobact  ria pertencente ao complexo M  tuberculosis     3  Controlo da contamina    o do laborat  rio    Para controlar se o laborat  rio foi contaminado pelos amplicons de M  tuberculosis   proceder como segue     a  Colocar 1 ml de   gua est  ril num tubo limpo  Humidificar uma zaragatoa swab  est  ril de poliester ou dacron com   gua est  ril     b  Esfregar a zaragatoa swab na bancada ou no material a controlar     c  Colocar a zaragatoa swab no tubo e misturar suavemente  Retirar a  zaragatoa swab  espremendo a na parede do tubo  Eliminar a zaragatoa swab  num recipiente contendo uma solu    o de lix  via dilu  da a 1 2  metade de lix  via   metade de   gua      d  Distribuir 25 ul da solu    o obtida num tubo de amplifica    o contendo 50 ul de  Reagente de Amplifica    o e 200 ul de   leo para reac    o de amplifica    o     e  Seguir as instru    es do par  grafo   PROCEDIMENTO   para a amplifica    o e a  detec    o     Interpreta    o    Se os resultados forem  gt  30 000 RLU  a superf  cie analisada est   contaminada e  deve ser descontaminada com                seguindo as instru    es 
30. fo    PROCEDIMENTO    As bancadas  blocos de  aquecimento  banhos maria e pipetas devem  ser descontaminados com uma solu    o de  lix  via dilu  da a 1 2 como indicado no  par  grafo   PROCEDIMENTO       Os tubos devem limpar se com papel  absorvente h  mido que n  o se desfa  a  antes  da leitura no lumin  metro     Verificar a temperatura do banho maria e ou  do bloco de aquecimento e ajust   la  se  necess  rio  para respeitar as temperaturas  preconizadas     Agitar cuidadosamente num Vortex  como  especificado  consultar o par  grafo    Hibridiza    o  2     Verificar a for ma    o de  uma solu    o de cor amarela uniforme ap  s a  agita    o     Verificar a regula    o do volume na pipeta     AW 12601 601 Rev  001  PT     Amplified MTD       RESOLU    O DE INCIDENTES             OBSERVA    O CAUSAS POSS  VEIS RECOMENDA    ES   Desrespeito do tempo preconiza  Respeitar os 15 minutos de incuba    o a 60    do para a etapa de selec    o  C  no decurso da etapa de Selec    o   A temperatura dos tubos desceu a Transferir directamente os tubos do bloco de  menos de 42  C ap  s a incuba    o aquecimento a 95   C para banho maria   bloco     95      de aquecimento    42        Os tubos de passagem do Lavar os tubos com   gua quente como  Reagente de Detec    o est  o indicado no manual de utiliza    o do aparelho   entupidos    TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 25 AW 12601 601 Rev  001  PT     MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    NOTAS Amplified
31. ibridiza    o    1  Reconstituir o Reagente de Hibridiza    o liofilizado  H  com 6 ml de Tamp  o       Hibridiza    o  HB   O Reagente de Hibridiza    o  H  e o Tamp  o de Hibridiza    o   HB  devem estar    temperatura ambiente antes da reconstitui    o  Se o Tamp  o de  Hibridiza    o  HB  foi guardado no frigor  fico  aquec   lo a 60  C  rodando o  lentamente para assegurar que todos os componentes se dissolvem  Agitar num  Vortex at   que a solu    o fique clara  o que pode demorar cerca de um minuto  para  assegurar que todos os componentes est  o dissolvidos  O Reagente de  Hibridiza    o reconstitu  do    utiliz  vel durante um m  s a 2  C   8  C ou durante dois  meses a uma temperatura igual ou inferior a  20  C  se tiver sido distribu  do em  al  quotas e congelado    no dia da reconstitui    o  Se o Reagente de Hibridiza    o  reconstitu  do foi guardado no frigor  fico ou congelado  aquec   lo a 60  C  rodando o  ligeiramente para assegurar que todos os componentes se dissolvem     2  Adicionar 100 ul de Reagente de Hibridiza    o reconstitu  do em cada tubo com uma  pipeta de repeti    o  Cobrir os tubos com folhas autocolantes ou com tampas              os tubos com um Vortex  a uma velocidade m  dia  3 vezes durante  pelos menos    1 segundo   Para uma boa homogeneiza    o dos tubos de reac    o  mant   los na  posi    o vertical e deixar a mistura atingir a metade superior da parede do tubo  durante a agita    o  para evitar qualquer contamina    o n  o deixar
32. ica    o  A    e Tamp  o de Amplifica    o  AB    e Reagente Enzim  tico  E    e Tamp  o de Dilui    o Enzim  tica  EDB    e Reagente de Hibridiza    o  H   O Reagente de Amplifica    o reconstitu  do  A     utiliz  vel durante 2 meses e  conserva se a 2    8  C  O Reagente de Hibridiza    o      e o Reagente Enzim  tico  E   s  o utiliz  veis um m  s a 2  C  8  C ap  s reconstitui    o  ou dois meses a uma  temperatura igual ou inferior a  20  C  se forem distribu  dos em al  quotas e congelados    no dia da reconstitui    o  As al  quotas congeladas devem ser utilizadas no pr  prio dia da  descongela    o  N  o utilizar congelador com descongela    o autom  tica         Os componentes que se seguem devem ser conservados entre 2         25      e s  o  utiliz  veis at      data de validade indicada   e Reagente   leo de amplifica    o  O   e Tamp  o de Hibridiza    o  HB   e Reagente de Selec    o  S   e Tubos de Lise  LT     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 6 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    Amplified MTD    COLHEITA COLETA  CONSERVAGAO  TRANSPORTE E  TRATAMENTO DAS AMOSTRAS       COLHEITA COLETA  CONSERVA    O  TRANSPORTE E  TRATAMENTO DAS AMOSTRAS    Colheita coleta e conserva    o da amostra    As amostras devem ser colocadas em recipientes de pl  stico est  reis e conservadas a  2  C   8  C antes do seu transporte e tratamento  No decurso dos ensaios cl  nicos  as  amostras foram conservadas menos de 4 dia
33. icobact  ria em  cultura     B  Precis  o    Foram analisados  em tr  s locais  dois pain  is de amostras  consistindo em 2 amostras  negativas  2 amostras fracamente positivas     100 UFC  teste  e 2 amostras  moderadamente positivas    1000 UFC  teste   As amostras positivas foram preparadas  adicionando quantidades conhecidas de M  tuberculosis a um pool de amostras  moderadamente inibidor  Tanto as amostras como os testemunhos de amplifica    o  positivo e negativo foram testados em triplicado  duas vezes por dia  durante 3 dias em  tr  s locais     N  o houve variabilidade significativa de resultados de um local para outro ou de um dia  para outro e assim  os resultados dos tr  s locais puderam ser consolidados e  apresentam se aqui abaixo  Os valores de leitura medidos em RLU est  o limitados pela  resolu    o do tubo fotomultiplicador do lumin  metro  Por esta raz  o  os valores  superiores a 2 000 000 RLU foram truncados  Nem os desvios padr  o  nem os  coeficientes de varia    o s  o indicados                          Precis  o  N  mero de   de Intervalo M  dia  observa    es resultados  RLU   RLU   correctos   Amostras 1  108 100  154 103    gt 2 000 000  gt 2 000 000  Positivas fortes  Amostras  108 99 1  16 324    gt 2 000 000   gt 2 000 000  Positivas fracas  Amostras 3  108 100  2 004   5 693 2 689  Negativas  Testemunho 54 100   gt 2 000 000  gt 2 000 000               Testemunho 54 100  2 272   4 241 2 944  negativo        Observou se um resultado negativo    
34. ifica    o     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 15 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    NOTAS Amplified MTD          NOTAS    A  Reagentes    1  O Reagente Enzim  tico n  o deve permanecer a temperatura ambiente mais de  15 minutos ap  s a reconstitui    o     2  O Tamp  o de Hibridiza    o  HB  pode precipitar  Aquecer e agitar o Tamp  o de  Hibridiza    o  HB  ou o Reagente de Hibridiza    o reconstitu  do a 60  C para  dissolver o precipitado     B  Temperatura    1  A amplifica    o  a hibridiza    o e a selec    o s  o reac    es termo dependentes   consequentemente     imperativo manter o banho maria ou o bloco de aquecimento  as temperaturas preconizadas     2  Antes de adicionar o Reagente Enzim  tico  deixar arrefecer os tubos a 42  C durante  5 minutos  Esta temperatura permite obter um comportamento funcional   ptimo de  amplifica    o     3     fundamental respeitar a temperatura para a fase      amplifica    o  42     1   C      C  Tempo     imperativo respeitar os tempos indicados no par  grafo   PROCEDIMENTO       D  Banho maria    1  O n  vel de   gua no banho maria deve manter se de forma a que a mistura de  reagentes no fundo dos tubos esteja imersa  mas que a   gua n  o penetre nos  tubos     2  Durante a fase de amplifica    o  o banho maria n  o deve ser coberto para evitar que  haja condensa    o sobre ou dentro dos tubos     E  Agita    o utilizando um Vortex       importante dispor de uma mis
35. marcas registadas da Hologic  Inc  e ou  respectivas subsidi  rias nos EUA e ou em outros pa  ses     Quaisquer outras marcas comerciais que possam aparecer neste folheto informativo pertencem aos  respectivos propriet  rios            REP    Authorized Representative  EMERGO EUROPE  Molenstraat 15   2513 BH  The Hague   The Netherlands    AW 12601 601 Rev  001  PT     1995   2015 Hologic  Inc  Todos os direitos reservados   2015 03    TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 28 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    
36. metro Leader 50i 103100i   bioM  rieux ref  39400   Embalagem de Reagente de Detec    o 201791   bioM  rieux ref  39300   Controlos de Amplifica    o MTD 301043F   bioM  rieux ref  39223   Suporte de tubos para o sonicador 104027   bioM  rieux ref  39313   Suporte de tubos reaccionais 104769   bioM  rieux ref  39311   Pontas de pipeta longas com filtro  1250 ul  104316   bioM  rieux ref  39315   Tubos em polipropileno  12 x 75 mm 102440   bioM  rieux ref  39308   Tampas em polipropileno para tubos de 12 x 75 mm 400713     bioM  rieux ref  39320     PROCEDIMENTO    Controlos    As c  lulas usadas para o Controlo de Amplifica    o Positivo devem fazer parte do complexo  M  tuberculosis  tal como a H37Ra n  o virulenta  ATCC 25177  ou a H37Rv virulenta   ATCC 27294   As c  lulas usadas para o Controlo Negativo devem ser MOTT  tal como   M  gordonae  ATCC 14470  ou M  terrae  ATCC 15755   Os controlos devem ser  preparados antes de efectuar o teste da amostra     Os controlos devem conter 25     150 CFU por 50 ul para obter uma concentra    o final de  1  10 CFU por amostra  Esta concentra    o deve ser verificada em cultura  Estes controlos  devem ser utilizados na prepara    o dos Controlos de Processamento da Amostra   consultar a Prepara    o da Amostra      TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 9 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    PROCEDIMENTO Amplified MTD          1     Prepara    o recomendada para os Controlos  a 
37. nte o material fornecido ou material de laborat  rio de utiliza    o   nica     H  As bancadas  pipetas e material devem ser descontaminados com uma solu    o de  lix  via dilu  da a 1 2  metade de lix  via  metade de   gua   como descrito no par  grafo     PROCEDIMENTO    Deixar a lix  via actuar durante 15 minutos  depois lavar com   gua  e enxugar para eliminar tra  os de lix  via        Devem ser utilizadas    as pipetas da bancada de trabalho ou as pipetas da c  mara de  fluxo laminar    equipadas de pontas com filtro para efectuar este teste  Devem utilizar se    pontas extra longas para transferir o lisado dos tubos de lise para os tubos de  amplifica    o  Mudar de ponta em cada etapa  Evitar passar por cima dos outros tubos  do suporte  As pontas usadas devem ser imediatamente deitadas num recipiente  destinado aos detritos biol  gicos     J  Quando utilizar uma pipeta de repeti    o para a distribui    o dos reagentes  depois da  introdu    o do lisado nos tubos  evitar tocar no tubo com a ponta da pipeta para reduzir  Os riscos de contamina    o entre tubos  Os reagentes devem ser distribu  dos contra a  parede do tubo para evitar projec    es  O cuidado na distribui    o dos reagentes  permitir   reduzir os riscos de contamina    o cruzada     K  N  o utilizar as mesmas pipetas para as etapas anteriores e posteriores    amplifica    o     L  Depois da leitura dos resultados no lumin  metro  descontaminar os tubos    elimin   los  como descrito nos par  grafos   PR
38. risco   Observa se igualmente     aumento de n  mero de estirpes cepas resistentes  ou seja  multi resistentes aos  anti tuberculostaticos    As consequ  ncias s  o consider  veis no dom  nio da sa  de p  blica     Os m  todos de cultura convencionais permitem observar o crescimento de M  tuberculosis  num prazo de 1 a 8 semanas        O teste MTD permite a detec    o do ARNr das  micobact  rias do complexo M  tuberculosis em 2 5 a 3 5 horas  Mesmo n  o permitindo  efectuar o antibiograma  o teste MTD detecta o M  tuberculosis fi  vel e rapidamente  Isto  permite uma melhor utiliza    o dos servi  os de isolamento dos hospitais  come  ar  rapidamente um tratamento apropriado e prevenir a propaga    o da doen  a gra  as     identifica    o precoce    ao isolamento das pessoas contaminadas     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 4 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    Amplified MTD    PRINC  PIO       PRINC  PIO    O teste MTD    um teste em duas fases  amplifica    o e detec    o  que se efectuam no  mesmo tubo  Primeiro  a sonica    o provoca a liberta    o dos   cidos nucleicos das  micobact  rias  O calor    utilizado para desnaturar estes   cidos nucleicos e romper a  estrutura secund  ria do ARNr  O m  todo de amplifica    o Transcription Mediated  Amplification  TMA  amplifica em seguida um alvo espec  fico do ARNr micobacteriano  atrav  s de um intermedi  rio de ADN  a uma temperatura constante de 42  C  Produzem 
39. s  geralmente  menos de 24 horas  antes do  seu tratamento     Transporte    Transportar as amostras para o laborat  rio o mais rapidamente poss  vel  em conformidade  com as regulamenta    es em vigor     Tratamento  descontamina    o e concentra    o     As amostras com muito sangue n  o devem ser testadas com MTD  Este teste foi concebido  para detectar o ARNr das micobact  rias do complexo M  tuberculosis utilizando amostras  preparadas segundo os m  todos de descontamina    o NALC NaOH ou NaOH utilizando  1  a 1 5  de NaOH durante 15 a 20 minutos e uma centrifuga    o com uma velocidade    gt  3 000 g        Conserva    o das amostras tratadas    As amostras podem ser conservadas  no m  ximo  durante 3 dias a 2  C   8  C antes do  teste  Podem tamb  m conservar se entre  20  C e  70  C durante 6 meses ou mais  N  o  utilizar congeladores com descongela    o autom  tica     MATERIAL    A  Material fornecido    EMBALAGEM DE REAGENTES PARA AMPLIFICA    O    Composi    o da embalagem 50 testes   bioM  rieux ref  39006   Hologic Cat  No  301001F     Tamp  o de Dilui    o das Amostras  SDB  1  2 5       Reagente      Amplifica    o      1x3ml    ap  s reconstitui    o   Tamp  o de Reconstitui    o  AB  1x3ml  Reagente de   leo    leo para reac    o de amplifica    o   O  1x10ml  Reagente Enzim  tico  E  1   1 5 ml    ap  s reconstitui    o   Tamp  o de Dilui    o Enzim  tica  EDB  1   1 5 ml    MICOBACTERIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    MATERIAL    Amplified MTD  
40. se  assim m  ltiplas c  pias de ARNr micobacteriano  amplicons      As sequ  ncias de amplicons de ARNr  espec  ficas das micobact  rias do complexo   M  tuberculosis  s  o detectadas em seguida pelo m  todo de hibridiza    o entre   cidos  nucleicos Hibridization Protection Assay  HPA    da   O Reagente de Hibridiza    o do teste  MTD cont  m uma sonda ADN monocaten  ria conjugada com um marcador  quimioluminescente  Esta sonda    complementar das sequ  ncias de ARN espec  ficas das  micobact  rias do complexo M  tuberculosis  A sonda forma  com estas sequ  ncias  espec  ficas  h  bridos est  veis ARN ADN  Ap  s a etapa de selec    o  o sinal luminoso  emitido pelas sondas hibridizadas    medido no lumin  metro   Leader     REAGENTES  Embalagem de 50 testes     Nota  Para obter informa    es sobre quaisquer declara    es de perigo e de precau    o que  possam estar associadas a estes reagentes  consulte a Biblioteca de fichas de dados de  seguran  a  Safety Data Sheet Library  em www hologic com sds     Os reagentes para o teste MTD s  o fornecidos como segue     EMBALAGEM DE REAGENTES PARA AMPLIFICA    O    Nome do reagente Volume  Tamp  o de Dilui    o das Amostras  SDB  1x2 5ml  Solu    o Tamp  o Tris contendo  lt  3   de detergente   Reagente de Amplifica    o  A  1x3ml  Acidos nucleicos liofilizados numa solu    o tamp  o Tris contendo 5   de  ap  s reconstitui    o   agente espessante   Tamp  o de amplifica    o  AB  1x3ml  Solu    o aquosa contendo conservantes   Reag
41. superiores a 30 UFC por teste  as estirpes cepas de M  celatum e  algumas estirpes cepas de M  tipo terrae deram resultados positivos  26 772 RLU para  M  celatum e de 19 470 a 49 976 RLU para M  tipo terrae      E  Limite de detec    o    Foram detectadas  com o teste MTD  trinta estirpes cepas de M  tuberculosis  provenientes de regi  es geogr  ficas muito variadas  incluindo representantes de  estirpes cepas resistentes e de estirpes cepas sens  veis aos antibi  ticos  O teste MTD  detectou at   1 UFC por teste  de cada uma destas estirpes cepas     F  Teste de sobrecarga    Foram analisados os ARNr de Mycobacterium tuberculosis   com uma concentra    o de  25 fg  equivalente a 5 UFC por teste   na presen  a de cerca de 540 000 UFC por teste   450 ul  dos organismos n  o alvo seguintes  Haemophilus influenzae  Streptococcus  pneumoniae  Legionella pneumophila  Pseudomonas aeruginosa  Mycobacterium  gordonae  M  avium  M  kansasii  M  terrae  Nocardia asteroides  N  otitidis caviarum   Corynebacterium pseudotuberculosis  C  diphtheriae  Gordona sputie Rhodococcus  bronchialis  Todos os resultados foram positivos para o ARNr de M  tuberculosis na  presen  a destes organismos n  oalvo  os quais  portanto  n  o criaram interfer  ncia     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 23 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    RESOLU    O DE INCIDENTES    Amplified MTD        RESOLU    O DE INCIDENTES       OBSERVA    O    CAUSAS POSS
42. temperatura ambiente durante  pelo menos  5 minutos  mas n  o mais de  uma hora  Retirar as folhas autocolantes ou as tampas imediatamente antes da fase  de detec    o     Programar o procedimento apropriado no lumin  metro  Escolher uma leitura de  2 segundos     Para eliminar qualquer res  duo da superf  cie dos tubos  limp   los com um papel  absorvente h  mido que n  o se desfa  a com a humidade  e depois introduzi los no  lumin  metro seguindo as instru    es do manual de utiliza    o  Os tubos devem ser  lidos na hora a seguir    etapa de selec    o     Quando a an  lise tiver terminado  retirar os tubos do lumin  metro     Ap  s a leitura dos tubos  ench   los cuidadosamente com uma solu    o de lix  via   dilu  da a 1 10  um volume de                 9 volumes de   gua  utilizando um esguicho    Deixar a lix  via actuar durante  pelo menos  uma hora antes de eliminar os tubos   para evitar a contamina    o do laborat  rio com amplicons     Os suportes de tubos devem ser descontaminados por imers  o completa numa  solu    o de lix  via dilu  da a 1 2 durante  pelo menos  15 minutos  Em seguida   devem se lavar com   gua e enxugar  ou secar ao ar     Descontaminar o laborat  rio e o material utilizando uma solu    o de lix  via dilu  da  a 1 2     Repeti    o do teste    1     2     Se tiver de repetir o teste  deixar os lisados atingir a temperatura ambiente   NAO UTILIZAR O VORTEX PARA OS LISADOS     Seguir o protocolo de   PROCEDIMENTO   come  ando pela etapa de ampl
43. to com outros dados  cl  nicos e laboratoriais  Deve ser considerada a possibilidade de ser testada uma outra  amostra consoante a suspeita cl  nica existente     Se o resultado de teste MTD inicial for positivo 2 500 000 RLU  ou se o resultado do teste  MTD repetido for positivo 2 30 000 RLU  apresentar os resultados da forma seguinte     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 17 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    LIMITES Amplified MTD             Apresentar  Foi detectado o rRNA do complexo Mycobacterium tuberculosis   Colora    o AFB  positiva ou negativa     Informa    o adicional  Cultura de AFB em crescimento  As amostras podem conter MOTT e  M  tuberculosis ou apenas M  tuberculosis  Este teste n  o deve ser  efectuado isoladamente para o diagn  stico M  tuberculosis  O valor  positivo preditivo para uma amostra com colora    o AFB negativa     mais baixo que para uma amostra com colora    o AFB positiva  Tal     particularmente importante ao testar amostras de popula    es em que  a preval  ncia de M  tuberculosis    baixa e os valores esperados com  m  todos de diagn  stico correspondentes s  o reduzidos        Se o resultado de teste MTD ou a repeti    o deste for negativa  lt  30 000 RLU  apresentar os  resultados da forma seguinte        Apresentar  N  o foi detectado o rRNA do complexo de Mycobacterium  tuberculosis  Colora    o AFB  positiva ou negativa      Informa    o adicional  N  o foi detectado o rRN
44. tura homog  nea durante as etapas de hibridiza    o e de  selec    o  especialmente ap  s a adi    o do Reagente de Hibridiza    o  H  reconstitu  do   a mistura fica com uma cor amarela uniforme  e do Reagente de Selec    o  S     a mistura fica com uma cor rosa uniforme      A agita    o com Vortex permite obter uma suspens  o uniforme  Quando os reagentes  s  o colocados no tubo de reac    o e expostos a uma fonte de energia exterior   produz se uma rota    o r  pida da solu    o    volta do eixo do tubo  Da   resulta uma  suspens  o uniforme  Para que a homogeneiza    o seja correctamente efectuada num  Vortex  os tubos devem segurar se na parte superior e manter se na vertical  O l  quido  deve ent  o atingir a metade superior do tubo durante a agita    o  Durante as etapas de  hibridiza    o e de selec    o  esta agita    o deve efectuar se 3 vezes seguidas e durar   pelo menos  1 segundo de cada vez     TESTE AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS 16 AW 12601 601 Rev  001  PT   MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS    Amplified MTD    INTERPRETA    O DO TESTE       INTERPRETA    O DO TESTE    Os resultados do teste AMPLIFIED PARA A DETEC    O DIRECTA DAS  MICOBACT  RIAS DO COMPLEXO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS  MTD  s  o  interpretados considerando que um resultado negativo inicial   lt  30 000 RLU   um resultado  positivo inicial   gt  500 000 RLU   ou um resultado equ  voco inicial  30 000 a 499 999 RLU    O teste MTD deve ser repetido a partir do lisa
45. uar os testes    que os tubos s  o  correctamente injectados com os reagentes de detec    o  Consultar o Manual de  Utiliza    o do lumin  metro para as instru    es de introdu    o dos Reagentes de  Detec    o  estes reagentes s  o vendidos separadamente      Prepara    o do reagente    Reconstituir o Reagente de Amplifica    o liofilizado  A  no seu frasco  50 testes  com 3 ml  de Tamp  o de Amplifica    o  AB   Homogeneizar num Vortex  Deixar o reagente  reconstitu  do repousar    temperatura ambiente at   ficar claro  O Reagente de Amplifica    o  reconstitu  do pode conservar se durante 2 meses a 2  C   8  C  A solu    o deve ser colocada  a temperatura ambiente antes da utiliza    o     Prepara    o das amostras    1  Identificar um n  mero suficiente de Tubos de Lise de Micobact  rias  LT  para  analisar as amostras  os controlos de amplifica    o positiva e negativa e os  testemunhos de amplifica    o positivo e negativo     Retirar e conservar as tampas    2  Distribuir 50 ul do Tamp  o de Dilui    o das Amostras de Micobact  rias  SDB  em  todos os tubos de lise de Micobact  rias  LT    Proceder como infra descrito em A e B para os controlos e em C para as amostras     A  Procedimento para Testemunhos de amplifica    o    Para cada controlo  adicionar 1 ml de solu    o de NALC NaOH       ml do tamp  o  fosfato utilizado para efectuar o processamento da expectora    o com 1 ml de    gua est  ril no tubo de processamento da amostra        Homogeneizar em vortex     ll
    
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