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1. Auto La visualizzazione viene automaticamente selezionata tra il filtro allelico prescelto o fra tutti All alleli 4 Digit I sommario mostra il risultato allelico a seconda del filtro allelico prescelto Quando si seleziona l opzione All viene automaticamente applicato il filtro 4D 2 Digit I sommario mostra il risultato di gruppo allelico a 2 digit un campo indipendentemente dal filtro allelico prescelto Pagina 63 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 P Group Il sommario mostra i gruppi P definiti nel file WMDA sul sito web http hla alleles org wmda G Group Il sommario mostra i gruppi G definiti nel file WMDA sul sito web http hla alleles org wmda Le opzioni P G Group sceglieranno un gruppo per ogni allele nei risultati senza duplicati Se non esistono nella fattispecie gruppi P G ad es se c solo un allele singolo nel gruppo ufficiale viene riportato quell allele 14 6 4 Codifica NMDP La possibile codifica NMDP viene attribuita sulla base delle possibili combinazioni alleliche se stato selezionato il tasto All Tutti nella visualizzazione dei risultati Se il filtro per gli alleli comuni attivato verr determinata la codifica NMDP solo sulla base degli alleli comuni E possibile modificare questa impostazione selezionando il tasto di aggiornamento Q dopo essere tornati alla visualizzazione con All Tut
2. 41 11 8 Creazione di una lista di lavoro per combistrip tipizzazione On call 42 11 9 invio della lista di lavoro al processore 44 11 10 Importazione di una lista di lavoro eseguita 45 ELIL Esportazione di una IStadi lavoro 46 12 LO STRUMENTO MPRSPOrRsl a 45 12 1 Schermata degli strument one 47 EL Eistadee hott unmne n kri dae 47 12L lnformazioni cagslistrUMEentiRe aac 48 12 2 Aggiunta di un nuovo strumento s sssesessreesreessrresseresreresreresseresseresseresreossreressens 48 12 3 Cancellazione di UNO StrUMENTO 49 12 4 Importazione dei risultati da ROPOT c 49 13 ANALISIDELEIMMAGINE abili 45 13 1 Superimposizione automatica della griglia 50 13 2 Superimposizione manuale della griglia 51 13 3 Misura delvalore dello Spot ara eolie 51 13 4 Rotazione gelIMMmasine sclaaieeaa abati 52 13 4 LAutorotazione gelFimmaginez rcnl rare 52 13 4 2 Rotazione manuale dell immagine i 52 13 5 Valori di riferimento per le sonde di controllo fallite n 54 14 ANALISI DELLE LISTE DI LAVORO iii ire 55 14 1 Barra degli strumenti principali eenei aa a 55 14 2 Visualizzazione della DaS arnir E atei 55 14 3 Inrormazioni SUlLtest TT 56 14 4 Strumenti per ikinterpretaziONe strie 57 14 5 Visualizzazione dei risultati lille llabizi 57 14 6 Assegnazione sei nisultatiz helena 59 JA 6 l Riutat SUE erian a
3. Worklist CS 2013 05 23 13 39 48 Processor Ra a Premere su Start Invio nella finestra di dialogo Verr proposto di stampare un report di layout piastra relative alla lista di lavoro premere S 11 9 Invio della lista di lavoro al processore Una volta creata una lista di lavoro con tutti i test necessari associati questa pu essere inviata per il processamento allo strumento MR SPOT L invio pu avvenire attraverso una rete LAN direttamente a MR SPOT oppure utilizzando una chiavetta USB Automaticamente dopo il salvataggio della lista di lavoro dopo la sua creazione o modifica compare una finestra di dialogo di invio premendo il tasto di cancellazione la lista di lavoro non sar inviata 1 Identificare la lista di lavoro da inviare mediante le funzioni di ricerca e selezione nella schermata di quelle disponibili solo le liste di lavoro contrassegnate dallo stato Initial Iniziato possono essere inviate 2 Cliccare su Send Invia Pagina 44 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 3 Nella finestra di dialogo illustrata selezionare Save to F EEE file Salva su file oppure selezionare un MR SPOT tra send Worklist to Processor quelli disponibili nella lista e premere Start Avvio 3a 3b Worklist 2012 11 05 ABDR naese Send To File zi Send To Ale Mew Processor Invio tramite chiavetta USB Scegliere una destinazione
4. Wiorklist Status 11 3 1 Stato della lista di lavoro Ad ogni lista di lavoro assegnata una condizione di stato in base al livello di processamento Gli stati possibili per HISTO MATCH sono Initial Iniziato Lista di lavoro creata eventualmente sono stati aggiunti dei test in prenotazione Exported Esportato Lista di lavoro in processamento su MR SPOT Imported Importato dati relativi alle immagini dei micropozzetti sono stati importati da MR SPOT Gridded Le immagini sono state analizzate ed stata definita una griglia di sovrapposizione al micropozzetto fotografato per identificare la corretta posizione delle sonde Analysing In analisi Interpretazione dei risultati dalle immagini dei test contenuti nella lista di lavoro Analysed Analizzato Sono stati assegnati dei risultati ai test contenuti nella lista di lavoro e sono in attesa di autorizzazione Il visto bianco indica che alcuni test sono stati gi analizzati e approvati dal tecnico Il visto blu indica che tutti i test sono stati gi analizzati e approvati dal tecnico V Il visto arancione indica che alcuni test sono stati gi autorizzati dal biologo medico Complete Completato Tutti i test sono stati autorizzati visto verde Pagina 36 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 11 4 Creazione di una nuova lista di lavoro E possibile creare una nuova lista di lavoro cliccare sul tasto _ Cre
5. T 190 175 650 Ain 225 ed 195 dan 400 parse 175 125 pnl 200 105 fn 188 650 445 420 175 190 390 peed 500 595 555 Group Allele MM CWD Pagina 79 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Selezionare il tasto Interpret Interpreta 3 eilsoftware analizzer il risultato risultati con zero mismatch e 2 alleli comuni risulteranno evidenziati in verde nel diagramma di interpretazione e saranno mostrati nella finestra dei Risultati suggeriti Risultati con un solo mismatch e 2 alleli comuni risulteranno evidenziati in rosso La cornice colorata attorno al gel indicher la qualit del risultato Verde tipo comune non ambiguo dipende dal filtro selezionato alleli C se si seleziona AII Viola aplotipo raro o due alleli rari dipende dal filtro selezionato nessun allele C se si seleziona AII Giallo risultato ambiguo Rosso nessun risultato Patient 2 ALow A_45441 IMGTv 3 13 1 v Sample ID SSP Status Initial Ca E oo in A US CR ARESE uggested Result Summary A 11 A 33 Serological Equivalent A11 ANull A A19 A33 A Assigned NMDP A 11 XX A 33 XX Possible NMDP A 11 XX A 33 XX l A 11 A 33 x ra CIA 7 NI Hit Table V24 0 l l IMGT 3 13 1 Version 23 06 2014 2 3 Ea 5 6 7 a ware i 84 a ae 17 aa a 2 a33 Lal 190 175 220 x 525 sac 210 np 400 570 200
6. cerchi possono essere spostati utilizzando il mouse ma solo all interno della regione quadrata assegnata ad ogni spot 13 3 Misura del valore dello spot Per ogni spot viene misurato il valore dell intensit e viene sottratto il background Le sonde con spot multipli rientrano nel calcolo di un valore medio Name Ea Can C 38 ee 5i ea I _ I ZI n l11_ a205 o asss 2 Jano _ ooo 3 azis o 62i 129 30 as asso o 7 58 365 AS23__ _ 23 40 MS enni asg r E _____ osso 22 Jamps25 0 00 23 amps 0 80 s_Jaest____ __ oo as Jar p re s Jas o ieo a Jana ooo e a jas D bnan Lo Aamp12015 Je Joso s Jaza Tsss CE rr RZ 33 Jas o es 3a faea O oo as Jass po fpa h H i Wi TI Na I i _tte o soo e k l o _ Close Le sonde positive sono evidenziate con sfondo rosso nella lista e un cerchiolino rosso nell immagine Le sonde negative sono evidenziate con sfondo bianco nella lista e un cerchiolino blu nell immagine Le sonde di controllo sono evidenziate con sfondo verde mentre le sonde che sono state ignorate nell analisi sono evidenziate in nero e un cerchiolino grigio nell immagine Le sonde inattivate nel batch sono individuate da un cerchiolino bianco nell immagine ma non sono Pagina 51 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 elencate nella lista delle sonde Selezionando una sonda nella lista
7. f i nella finestra dei risultati suggeriti oppure nella Assigned NMDP C 03 XX C XX XX finestra principale dei risultati P C03 C 05 4 C 03 C 08 C0387 CE08 10 Pagina 60 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Suggested Result Common Haplotype Se i risultati contemplano solo un allele CWD questi Summary A 26 A 29 saranno mostrati come Common Haplotype ia Aplotipo comune sopra i risultati suggeriti se Assigned NMDP invece non contengono nemmeno un allele CWD a A 26 A 29 veranno mostrati come Suggested Rare Result A 26 01 01 26 17 26 01 03 26 01 04 26 01 06 26 01 07 26 0 i A 20 48 Risultati rari suggeriti A 26 01 05 26 27 A 29 48 A 26 01 15 26 11N 26 47 26 52 iL Cannot Exclude I risultati nella finestra principale possono essere GroupyAllele MM Rank cewp aggiunti o rimossi dalla finestra dei risultati suggeriti a26 A 29 18 o oo utilizzando i tasti e A I tasti blu possono essere a mA 26 01 01 26 17 26 01 03 2 o 00 utilizzati anche per l aggiunta o sottrazione dei mA 26 18 A2348 o 000 risultati a 2 digit e in tal caso l aggiunta rimozione mA 20 12 A 29 46 o 000 sar relativa a tutti gli alleli compresi nel gruppo ERI o o0 Tuttavia saranno manovrabili solo risultati senza Jia o o0 mismatch Y mA 26 74 A 29 48 n nn O A 26 A 29 19 1 149 14 6 2 Filtro per
8. non scegliere un file esistente da sovrascrivere poich si incorrer in errore Assicurarsi che tutti gli utenti abbiano accesso al percorso selezionato Pagina 4 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 E Database Tools Creating Database Viene creato il Database Dopo aver creato o selezionato il file del database saranno visibili gli strumenti User Instance cliccare sulla spunta verde per selezionare il database corrente e ritornare ad HISTO MATCH E Database Tools Data Source SQLEXPRESS File C ExpediteDatabase Histomatch mdf Server A SQLEXPRESS Database Ci ExpediteDatabase HistoMatchDB MDF A questo punto le opzioni disponibili sono e Nuovo Crea un nuovo file database Aggiornamento 3 Aggiorna la versione 1 0 o 1 1 del database alla 1 2 HISTO MATCH 2 1 e successivi Seleziona Seleziona un file database HISTO MATCH esistente e Disconnetti Disconnette dalla modalit User Instance e ritorna alla finestra iniziale degli strumenti di database Pagina 5 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 4 3 2 Modalit Server SOL SQL Server Log on W Use Windows Authentication u Use SQL Server Authentication User Name Password Selezionare un server dal men a tendina se la lista vuota premere il tasto di refresh ksi per ricercare Server SQL disponibil
9. rimuove il file del database selezionato dal server il file pu essere aggiunto quindi a un server differente e Cancella rimuove il database dal server e ogni file associato dai file di sistema e Backup crea un backup del database selezionato e Disconnetti disconnette dal server e ripresenta la finestra iniziale di strumenti di database Ly Con questo tasto si seleziona il database scelto per essere utilizzato con HISTO MATCH e ritorna all avvio del programma HISTO MATCH tale opzione disponibile solo se nella lista selezionata la versione di database 1 2 4 4 Aggiornamento di HISTO MATCH Si consiglia di effettuare un backup del database esistente prima di procedere a questo aggiornamento Pagina 7 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Installare HISTO MATCH dal CD ROM fornito non ci sono particolari precauzione per disinstallare la versione precedente ogni dato immagazzinato non verr rimosso Quando si avvia HISTO MATCH per la prima volta dopo un aggiornamento sarete automaticamente indirizzati alla finestra degli strumenti di database con selezionato il database corrente Modalit User Instance O modalit Server R Database Tools baa r B Database Tools Data Source SQLEXPRESS S Database hmi File C ExpediteDatabase HistoMatchDB MDF 3 Version 1 0 0 Size 4 99 MB erver SQLEXPRESS Database C ExpediteDatabase HistoMatchDB MDF j
10. 6 IMPOSTAZIONI INIZIALI DEL SOFTWARE 6 1 Accesso Il programma viene fornito con accesso per un utente amministratore occore accedere come Admin e con la password Password123 User Admin sign in Premere il tasto Enter o sign in entra L unica funzione disponibile inizialmente per l utente amministratore quella di creare nuovi utenti attraverso il tasto Users Utenti Pagina 11 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 La 4 Cn N v Worldist gt 6 2 Aggiunta di nuovi utenti e assegnazione dei ruoli L applicativo prevede 3 possibili ruoli e Utente pu eseguire le operazioni pi comuni aggiungere campioni e liste di lavoro analizzare i risultati e assegnare gli alleli e Supervisore pu autorizzare i risultati assegnati e Amministratore pu modificare le impostazioni del software e gestire le utenze A un dato utente necessario assegnare uno o pi ruoli ossia i ruoli sono cumulativi e non esclusivi per es nel caso in cui si voglia creare un utente supervisore necessario assegnare sia il ruolo come user che come supervisor 1 Selezionare il tasto Users Utenti Pagina 12 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 6 3 2 Verr visualizzata una lista degli utenti correnti Users Last Login 2305 2010 14 57 Roles Administrator Last
11. inserito un controllo negativo Esso include le sonde di controllo positivo per HLA A esone 2 e 3 HLA B esone 2 e 3 e una sonda che positiva per l esone 2 di HLA DRB1 e HLA DQB1 Il controllo negativo si considera fallito se l intensit degli spot di controllo positivo superiore di 1 5 volte rispetto al background Pagina 64 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 VVUERIDI IU IGFUIVI LEDI Patient 1401v1 test 1 140iv1 test 1 mm 13 molari Tidiri esti CARE HISTO SPOT NEG NO0i 1 IMGT v 0 0 v GHI o RAFA C EA HLA ra Suggested Result Summary NegativeControl PASS Serological Equivalent O Assigned NMOP Possible nmoP DAR I 140ivi test i Results P Hit Table NOOL Ji DI ei Se Group Allele MM Rank CWD 14 7 Ignorare manualmente le sonde Si pu ignorare manualmente una sonda cliccando sopra la barra corrispondente nell istogramma con il tasto destro del mouse e cambiandone lo stato con in uso utilizzando il mouse tasto sx Le sonde ignorate manualmente sono evidenziate in grigio e circondate da un riquadro rosso Marren T In Use Group Allele MM Rank CWD Probe B1136 Specificity Cut Off amp B0 B 55 193 o po na a B 07 02 01 07 23 07 42 07 4i loo IIII T TTT T 7MeMeeee j l 2B 07 37 B 55 01 01 55 01 0 0 00 0 0 amp B 07
12. qui possibile visualizzare la localizzazione attuale del database in uso e le impostazioni di backup solo per installazione di tipo server O BAG neam care User Reports Database Tools Filter l Nomenclature Database C ExpediteDatabase HistoMatchDB MDF Interpretation Installation Server SQLEXPRESS Image Analysis Tools Database Tools Backup Pagina 93
13. 02 01 08 02 01 02 02 01 11 02 01 12 0201 1404 02 09 18 02 01 17 02 01 18 201 198 020121 02 01 2 02 01 24 02 01 28 02 01 24 02 01 27 U2 01 28 02 01 24 02 01 31 02 01 31 A2 01 32 0201 33 02 01 34 02 01 38 02 01 39 02 01 38 02 01 38 02 01 44 02 01 41 02 01 42 02 01 42 0O201 44 DADAS OMIA ODAN OI 020150 020152 02 01 5Y 0201 54 1201 56 02 01 57 012 01 58 02 01 60 02 01 62 02 01 62 12 01 647 02 01 68 02 01 66 02 01 677 02 01 69 02 01 71 02 01 72 2017 O20174 O20176 02 01 79 02 01 79 02 01BU 02 01 81 02 01 84 02 01 884 02 01 86 OZ 20 001 CAIN OZI2N 02 42 D2 4IINI 2 59 OZ E2 2 66 02 67 02 70 ZTN 02 74 02 02 75 OBZ OZ BIN 12 81 02 94N7 02 957 02 97 01 02 99 02 02 ION 02 1064 U2 111 02 138 O2 120 O 121 O21227 02 13 02134 0213 0213 012 140 02 141 2 4 02 150 02 153 01 02 t69 02160 02 IEN 02 IGA 02 PGA 02 166 02 PGU 02 173 02 17 02 17 02 177 02 18 02 187 02 189 02 192 02195 02 197 02 199 02200 A220 1 02 202 02205 02 206 DU 02 20 2 21 1 01 02 21 1 02 02 21 02 21 02 26 02218 0222 02221 02 222N 02 225N 02 227N 02 234 02 235 02 236 02 238 02 240Y 02 24 V 02 242 02250 02 251 2 252 2 26 02257 02295 02259 02270 02 272 Oe 27T2 02274 02 27 02276 2277 02 28 02284 02 285 02 247 02 288 02 291 02 293 02 2590 02294 0229 O2391N 02 302 O2 30SN 12307 02 312 02 31 02 314N 02 316 02 31 W 02 318 02 32 N 02 322 023267 DAI 02327 OZI 02336 023407 0273421 023417 02346 02347 O2 350N 02 35 02 3
14. 1 D gt A 24 A 34 3 A 01 A 34 1 d a A 01 01 01 01 01 02 01 03 01 I 1 amp ON La specificit di una mix si visualizza cliccando col tasto destro del mouse nella colonna relativa 2 3 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 A 34 01 01 A 01 01 01 01 LI 190 175 220 x 525 soc 210 nn 400 570 200 160 dor 225 eg 195 Zso 400 dig 175 125 Tou 200 105 So 188 650 445 420 175 190 390 Yop 500 Group Allele a mas Q AI A341 Speri IMA AAA A wM w n O ii 650 bp A 01 01 01 01 O A 24 A 34 1 _ o sora 01 01 03 MAMO _ A 01 01 04 am aom x 01 01 05 A 01 01 06 hl s A 01 01 07 15 7 Risultati suggeriti Tutti i risultati con zero mismatch vengono automaticamente aggiunti alla finestra dei Risultati suggeriti risultati vengono visualizzati come gruppi a 2 digit con i vari alleli raggruppati sotto iS Summary A 01 A 34 Serological Equivalent A1 A34 Ie Assigned NMDP A 01 AB A 34 AB Ie Possible NMDP A 01 XX A 34 XX 4 A01 A 34 A 01 01 01 01 01 02 01 03 01 04N 01 06 01 09 01 12 01 25 01 01 01 02N 01 01 02 01 01 03 01 01 04 01 01 05 01 01 06 01 01 07 01 01 08 01 A 34 01 01 34 02 01 34 05 34 01 02 34 02 02 34 02 03 34 03 34 04 34 06 34 07 34 09 34 10N Suggested Ambiguous Result Gruppi ambigui di alleli a due digit saranno mostrati Summary A 11 A 23 A 11 A 24 in pi di un gruppo E possibile togliere r
15. 1 Pippi Langstrumpf Do8 Name Pippi Langstrumpf Locus A Patient Id 2 Winnetou DoB Patent Id 3 Rumpelstiltskin Do8 Patent Id 4 John Smith Do8 Patient Id 5 Lena Meyer Do8 Patient Id 6 Michel Svensson Do8 4 X b Premere il tasto New Nuovo nell angolo superiore destro Inserire i dati paziente e premere il tasto alla lista di lavoro Il nuovo paziente sar automaticamente aggiunto Patient Id 12 Name Tom Smith DOB 25 04 1969 asl Gender Male 4 ABO Rhesus CMV Pagina 43 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 3 Salvare la lista di lavoro premendo il tasto al di sotto del layout piastra La lista di lavoro pu essere ora inviata allo strumento direttamente oppure attraverso un file su chiavetta USB si veda la sezione 11 9 Se il procedimento viene cancellato la lista di lavoro non sar inviata ma sar comunque archiviata nel database Worklist ID CS 2013 05 23 13 39 48 Select Patient New Delete Selected Ai Patient Id 1 Pippi Langstrumpf Do8 Patient Id 2 Winnetou Do8 ID 1 Name Pippi Langstrumpf Locus A Patient Id 3 Rumpelstiltskin DoB Patient Id 4 John Smith DoB Patient Id 5 Lena Meyer Dog Patient Id 6 Michel Svensson Do8 PRE ca Send Worklist to Processor
16. 120 15 02 03 02 04 02 07 02 08 08 11 14 15 19 26 3L 44 47 38 60 68 Positive Probes 4 53 59 IZ 24 31 41 42 43 44 63 66 68 76 102 106 110 112 113 Ignored Probes Comments Test History 06 11 2012 06 11 2012 06 11 2012 G3 Result A02 A 02 A 32 A58 A 03 A GE A 30 A30 A 02 A 30 AtA ATA A D2 A 30 A O2 7 A02 B 15 B 35 B 58 E 58 B 07 B 55 B 47 B 47 B 15 B 57 B 15 B 57 B 15 B 40 B 35 B d44 DRB1 01 01 01 DRB1 01 01 01 DRB1 04 05 01 DRB1 15 03 01 01 DRB1 09 01 02 DRB1 13 03 01 DRB1 11 02 01 DRB1 11 03 DRBI 11 03 DRBI 11 03 DRB1 04 07 01 DRB1 08 06 DRB1 01 01 01 DRB1 08 01 01 DRB1 14 04 DRB1 15 02 01 DRB1 04 07 01 DRB1 13 01 01 Refertazione della lista di lavoro Sample HISTO SPOT DR 31 07 2019 Hit Table R069 IMST db 3 8 0 ver 30 08 2012 S60 Suggested Result Display 4D Alleles DRB1 14 04 DRB1 15 02 01 DR1404 DR15 Assigned NMDP DRB1 14 04 DRB1 15 02 DRB1 14 XX DRB1 15 XX BAG BAG BAG Test Interpreted Test Interpreted Gridded BAG ntaHcan 2012 ii 05 ABDR TBAG ar NMDP Batch AlleleDB Date AX02 XX A D2 KX A097 1 3 80 13 11 2012 A 32 01 A 68 02 A 097 1 38 0 13 11 2012 A 03 01 A G68 02 A 097 1 38 0 13 11 2012 A 30 02 A 30 02 A 097 1 3 8 0 13 11 2012 A 02 XH A 30 BD A 097 1 38 0 13 11 2012 A 34 01 A 34 01 A 097 1 3 8 0 13 11 2012 A D2 11 A 30 02 A 097 1 3 8 0 13 11 2012 A 097
17. BAG Healthcare Image Analysis idea ear RAHET HNA Rutorotazione delle immagini de Analisi immagine dick to select and load a Laboratory Logo Strumenti 2 5 12 User Repotts Tools Filter Ambiguity Report Nomenclature SY epo Create Create 1 Month Create 1 Year Interpretation Installati Refertazione delle a Tad Create Create 1 Month Create 1 Year ambiguit viene Paths Database Tools creato un referto dettagliato sulle ambiguit riscontrate via file xml che pu essere inviato al vostro fornitore allo scopo di migliorare la risoluzione dei kit Refertazione della funzionalit di una sonda viene creato un referto con le sonde ignorate automaticamente e manualmente Percorsi Da Paths Reports Filter Nomenclature Interpretation Installation Image Analysis Tools gt Paths Database Tools Default Import Path Default Export Path NMDP File Date WMPDA Archive File CWD Zip File IMGT Allele Zip File 192 0 0 203 users launhardt 192 0 0 203 users launhardt 08 11 2013 C Program Files x86 BAG Healthcare HistoMatch wmda zip C Program Files x86 BAG Healthcare HistoMatch cwd200 zip CA Users launhardt Desktop wmda zip bbbbbb Pagina 92 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Banca dati Percorso di default per importazione mostra il percorso di default per l importazione dei dati kit liste di lavoro c
18. Enabled Abilitato Se deselezionato l utente non sar in grado di accedere Comments Note E possibile inserire commenti relativi all utente 3 Selezionare il tasto OK o Cancel Cancella nel caso non si vogliano salvare le modifiche 4 Il nuovo utente comparir nella lista aggiornata della schermata utenti 8 3 Modifica di un utente Un utente esistente pu essere modificato Le modifiche consistono nel cambio dei ruoli dell utente abilitazione o disabilitazione dell utente aggiunta di eventuali commenti Come modificare un utente 1 Selezionare un utente dalla lista di quelli disponibili e cliccare sull icona Edit Modifica 2 Il nome dell utente non pu essere modificato solo le altre opzioni possono essere cambiate 3 Cliccare OK per salvare o Cancel Cancella per non salvare le modifiche Nota Gli utenti amministratori non possono essere modificati 8 4 Reimpostazione di una password Se un utente ha dimenticato la propria password possibile reimpostarla da parte di un altro utente con ruolo da amministratore 1 Selezionare l utente dalla lista A i OD 2 Cliccare sull icona Reset a 3 La password verr automaticamente impostata come Password123 4 Al prossimo avvio l utente sar in grado di impostare una nuova password Pagina 21 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 8 5 Cancellazione di un utente Non possibile cancellare
19. Molha 550 riassuntivo C HLA C C 04 01 01 01 C 07 04 01 Worklist CS 2013 03 08 evaluation 4 NMDP Serology 4 Cw7 Batch C 042 61 Hit table C042 IMGT db 3 8 0 ver 14 03 2013 Method 550 D HLA DRB1 DRB1 13 DRB1 15 DRB1 14 DRB1 15 Worklist C5 2013 03 08 evaluation 4 NMDP Serology Batch DRB1 074 55 Hit table R074 IMGT db 3 11 0 ver 04 02 2013 Method 550 16 3 Referto del paziente o del campione E possibile creare un referto per paziente dalla pagina con l elenco pazienti schermata blu o con l elenco campioni schermata verde Pagina 90 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 1 Selezionare un paziente campione dall elenco di quelli disponibili 2 Scegliere Report Refertazione Ee Tutti i risultati disponibili per il paziente o il campione selezionato saranno combinati in un unico referto Le informazioni contenute possono essere selezionate nelle impostazioni 17 IMPOSTAZIONI Dal men principale selezionare Setup Impostazioni per accedere alle funzioni di impostazione Per rendere definitive tutte le modifiche nelle impostazioni necessario premere il tasto Save Salva modifiche v Le impostazioni vengono salvate nel PC dell operatore e quindi non sono trasferite ad altri PC collegati in rete In questa schermata sono disponibili le seguenti impostazioni Utenti qui possibile inserire nuovi utenti e modificarne le
20. fino a quando sono contrassegnate dallo stato Initial Iniziato una volta esportate lo stato cambier in Exported Esportato e la lista di lavoro non sar pi modificabile ad eccezione di utenti che possiedano il ruolo di amministratore Per modificare una lista di lavoro esistente identificarla mediante le funzioni di ricerca e selezione nella schermata di quelle disponibili quindi selezionare la lista di proprio interesse e cliccare sul tasto di edit o effettuare il doppio click sul nome della lista di lavoro 11 7 Rapportodiallestimento della lista di lavoro Esistono diversi tipi di rapporti refertabili con HISTO MATCH a seconda delle impostazioni preferenziali dell operatore e a seconda dello stato in cui si trova una lista di lavoro Nel caso in cui una lista di lavoro sia negli stati Initial Iniziato o Exported Esporato HISTO MATCH generer un rapporto di allestimento della lista di lavoro In esso viene mostrata la posizione di ogni test sul layout della piastra e ciascun test contrassegnato da un colore diverso a seconda del locus Worklist Setup Report Worklist ID 2012 11 05 ABDR Report Date 06 11 2012 Worklist Date 06 11 2012 09 14 04 User BAG 1 2 3 3 5 6 7 8 9 10 11 12 PERO ERIN CENONE A TE T TO T A ZN Bs w E a B2 2 2 Me i ie ZE cs zE 3 3 3 p O so ps zm w E 30 za 4 4 4 S Z E Z zE w 5 5 5 ZE Z E DE TE Fs G C E E CE ca cs REBBNIco cu 7 7 7 FERRO ERIN EMMI He w cao sodo 8 s 8 HistoMa
21. oppure digitare l allele in modo completo 106 C 06 02 01 01 C 06 02 01 02 C 06 02 03 C 06 02 04 C 06 02 05 C 06 02 06 C 06 02 07 6 06 02 08 6 06 02 09 C 06 02 10 C 06 02 11 Ra ia RARO C 2S200020 IIIa MM Rank CWDj o 10 1 2670 1 m44 Selezionare la combinazione allelica per la quale si desidera visualizzare il pattern di reazione atteso Le sonde positive sono indicate da una barra nera all altezza dell allele o degli alleli corrispondente le sonde non ben definite restano in grigio Mentre le sonde negative sono indicate da una barra grigia e non vengono assegnate ad alcun allele C 06 02 01 01 C 07 02 01 01 mrmr MnnEeMemems_ E I a a a a a a a a a S Group Allele MM Rank CWDj GA C06 C 07 44 0 po a s mC706 02 01 01 06 02 01 02 0 o 000 r E A S lg zi ci ae i E A e E 1 mC 06 02 01 01 06 02 01 02 0 o 000 pa mC 06 02 01 01 06 02 01 02 0 o 000 o 2706 02 01 01 06 02 01 02 0 o 000 m o Cliccando sul simbolo dell istogramma sotto il campo alleli si pu ridurre l elenco ai soli alleli CWD ala C 04 C 04 01 01 01 C 04 03 01 CU yT C 04 04 01 C 04 05 IT C 04 06 C 04 07 crrsnialata mmal loan mani C 04 08 C 04 09N 14 14 Nomenclatura C 04 10 C 04 13 HISTO MATCH pu utilizzare sia la nomenclatura IMGTv3
22. 02 HLA A 01 amp 24 E possibile passare anche alla visualizzazione dell elenco dei A1 2 HLA A 01 amp 23 risultati Di 2 HLA A 01 amp 03 In questa modalit l operatore pu vedere i risultati in bassa E1 2 HLA A 24 amp 30 RO 92 HART risoluzione di ogni test oltre al tipo di risultato di ogni pozzetto Gi 2 HLA A 02 amp 24 H1 2 HLA A 03 amp 68 A2 2 HLA A 33 amp 68 82 2 HLA A 02 amp 32 C2 2 HLA A 29 amp 32 32 amp D2 2 HLA A 29 amp 32 32 amp E2 2 HLA A 02 amp 24 02 amp _ gt vied neve m MaM 14 3 Informazioni sul test Patient 5 Michel Svensson Sample ID 5 Status Initial 06 11 2012 A 02 XX A 30 XX A 02 A 30 E1 A 06 11 2012 B 15 XX B 57 XX B 15 B 57 E2 B 06 11 2012 DRB1 04 XX DRB1 08 06 DRB1 04 DRB1 08 E3 DRB1 HISTO SPOTA A 108 6 IMGT v 3 15 da IMGT v 2 25 1 IMGT v 2 25 2 IMGTv 2 26 IMGT v 2 27 MGT v 2 28 IMGT v 3 0 IMGT v 3 1 IMGT v 3 2 IMGT v 3 3 IMGT v 3 4 IMGT v 3 5 IMGT v 3 6 IMGT v 3 7 IMGT v 3 8 IMGT v 3 9 IMGT v 3 10 IMGT v 3 11 IMGT v 3 12 IMGT v 3 13 IMGT v 3 13 1 IMGT v gs I Suggested Result Summary A 02 A 30 Serological Equivalent A2 A210 A A30 ANullA O Assigned NMDP A 02 XX A 30 XX Qli A 02 A 30 Dati del paziente e del campione per il test corrente selezionato Cliccando sul tast
23. 08 28_TER_499 506 B2 Patient 500 Name TER 500 DoB e 000 sso dosso a Sample Received 09 09 2014 i v Extraction er tr30 Date Performed 30 08 2014 i cu__0s0 Analyzed By BAG Bats caso Date Analyzed 10 10 2014 AAP L e ese Approved By Date Approved Authorized By Date Authorized Kit_ HISTO SPOT B Batch B 089 36 Expiry 30 12 2015 Hit Table Hit Table B089 IMGT db 3 15 0 ver Method SSO Suggested Result Summary soe B 38 02 01 38 02 02 Filter Display CWD Alleles Group Result B 38 B 46 2 Could Not Exclude B 38 02 04 02 05 02 06 15 18 23 35 43 44 47 48 49 Positive Reactions 9 10 17 24 32 35 39 44 47 51 53 54 55 58 64 73 77 78 84 87 92 93 96 97 99 103 108 109 110 113 117 118 120 124 125 126 127 Ignored Reactions 65 74 86 91 106 111 115 116 Comments E possibile eseguire una interpretazione completa quando la interpretazione ristretta risulta attivata dalla schermata di interpretazione tenendo premuto il tasto Interpreta contemporaneamente al tasto CTRL Pagina 67 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 14 10 Interattivit tra la visualizzazione dei risultati e l immagine del test L apertura della finestra di dettaglio del test array consente all operatore di visualizzare l immagine del test processato e lo stato di ogni singola sonda O BAG neam care SR zo Wor
24. 15 07 47 07 160 B 554 0 000 B8 07 86 B 55 01 01 55 01 0 0g 000 B 07 83 B 55 01 01 55 01 05 o 0 00 ANALA 7 mB 07 79 B 55 01 01 55 01 0 Di seguito la tabella con le possibili impostazioni Vuoto iii La sonda viene esclusa dall analisi Spuntato La sonda viene considerata dall analisi Ombreg bic La sonda viene considerata o meno dall analisi direttamente da parte del software giato Le impostazioni relative alla sonda possono essere modificate anche cliccando con lato sinistro del mouse mentre viene tenuto premuto il tasto CTRL un alternativa utile per ignorare un elevato numero di sonde nell editing di un test Pagina 65 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Per rendere validi i cambiamenti introdotti occorre reinterpretare i risultati 14 8 Funzione di auto edit E possible attivare o disattivare la funzione che automaticamente esegue l editing dei risultati grazie alla finestra Setup alla sezione Interpretation BAG BAG HEALTH CARE User Reports Interpret Setup Filter Default Maximum Mismatches Nomenclature Default Maximum Probes to Ignore gt Interpretation Installation Image Analysis V Display Combined Locus Results Tools e Paths Summary Type 4Digt Database Tools Automatically Edit Results Se attivata le sonde che non hanno il match col pattern di reazione del risultato proposto e determinato come
25. 160 650 380 225 Seo 195 520 400 440 175 125 595 200 105 Sig 188 650 445 420 175 190 390 g 500 595 555 Group Allele MM CWD Q A 11 A 33 1 o R gt A 33 A 33 1 1 O A 11 1 1 gt A768 A 68 1 1 Q KBA 1 0 gt A 33 A 68 1 1 O A 03 A 33 1 1 90 Salvare i risultati e chiudere la finestra con il tasto di salvataggio Save Dopo aver salvato i risultati nella schermata di interpretazione i risultati non verranno comunque cancelati nel caso in cui il campione non venga salvato test possono comunque essere eliminati premendo il tasto Delete rosso Pagina 80 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 15 4 Informazioni sul test Pina j Informazioni relative a campione o paziente Sample ID SSP test 1 Status Initial del test selezionato Cliccando sul tasto di 22 11 2012 A 01 XX A 33 XX A 01 A 33 A espansione a sinistra si mostreranno tutti i risultati tipizzati per questo campione 14 11 2012 B 07 XX B 27 XX B 07 B 27 22 11 2012 DRB1 15 XX DRB1 16 XX DRB1 15 DRB1 16 DRB Dati sul kit e sul batch utilizzato per a e l esecuzione del test selezionato possibile __ __ _ _ _ _ selezionare diverse hit table se disponibili cliccando sul tasto di espansione l Risultati suggeriti autorizzati per il test GIBERT oo Ah A y O Suggested Result selezi
26. 27 9 5 Assegnazione di campioni esistenti 27 9 6 Cancellazione del Pazienti 27 10 GESTIONE DEI CAMPIONI elia 28 10 1 Ricerca di campioni illa 29 10 2 OrdINRM en ollare 29 10 3 Aggiunta di un nuovo campione eerrrrerrrrere rire re serie reni vi vere re reve ni zirenn 29 10 4 Modificazione di un campione gi inserito i 31 10 5 importazione deicampioN i eeii A E 32 10 5 1 Formato del file di importazione noan aa 32 10 5 2 Importazione de HIG a testo nziriri A rasa ea 32 10 6 Visione dei risultati a partire da un campione 33 11 GESTIONE DELLE LISTE DI LAVORO srl 34 11 1 Visualizzazione della lista di lavoro e dati sulla sessione MR SPOT 35 11 2 Ricerca di listed avoroaphaiale aaa 36 11 3 OFalnamento solidale a a an aa 36 I3 Stato dellarlist di IAVOrO ari laico 36 11 4 Creazione di una nuova lista di AVOrO i 37 ILA iIBbiaellalistadiavo ro lilla 37 ILAZ Testdisponibilizazs allieta 38 11 4 3 Aggiunta di un campione con lettore di barcode 38 11 4 4 Creazione del layout della piastra rai 39 11 5 Importazione di una lista di lavoro iniziale 40 Pagina dli BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 11 6 Modifica di una lista di lavoro esistente i 41 11 7 Rapporto di allestimento della lista di lavoro
27. 69N 11 71 11 72 11 73 11 74 11 75 11 76 11 77 11 78N 11 79 11 80 11 81 11 827 11 83 11 847 11 85 11 86 11 87 11 88 11 89 11 21 01 11 92 11 93 11 94 11 957 11 96 11 97 11 99N 11 102 11 103 11 104 1 105 11 107 11 1037 11 109N 11 110 11 111 11 112 11 1137 11 114 11 115N7 11 116 11 117 11 118 11 119 01 11 119 02 11 120 11 1227 11 123 11 124 11 125 11 126 11 127N 11 128 11 129 11 130 11 131 11 132 11 133 N 11 138 11 140 11 141 1 05 33 09 3 01 33 A 33 060 33 33 10 33 11 33 12 33 13 33 14 3 33 10 33 17 33 18 01 33 183 0 3 20 3 33 24 33 25 33 2 gt f 33 30 33 32 01 33 3 33 33 43 33 44 33 45 33 46 33 47 33 48 33 49 33 50 33 52 33 54 33 55 33 50 33 57 33 58 33 59 33 60 33 61 33 62 33 63 33 64 33 65 33 67 33 68 33 70 33 7 142 11 143 11 144 11 145 11 1467 11 147 11 148 11 149 11 150 Z 33 01 04 33 01 05 33 01 06 33 03 03 3 03 3 16 23 17 33 12 01 32 12 23 33 Se un gruppo allelico contiene dei mismatch questi sono evidenziati nella griglia come falsi positive pallino rosso o falsi negative pallino blu Pagina 82 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 ISS 16 17 EE 19 20 21 2 23 A 34 01 01 A 01 01 01 01 LI 190 175 220 525 210 400 570 200 160 650 380 225 560 195 520 400 410 175 125 595 200 105 210 188 650 445 420 175 190 390 200 500 595 555 Group Allele MM CWD O A 24
28. Confirmed 01 09 2011 08 Mr Spot Statedun 01 09 2011 08 Mr Spot Door opened during run __ _ 01 09 2011 09 Mr Spot PrimingPumps 01 09 2011 09 Mr Spot Adding Block Buffer and Denaturing DNA 01 09 2011 09 Mr Spot AspiratingBlok ____________________ 01 09 2011 09 Mr Spot Diluting Sample and Transfering to Reaction Plate 01 09 2011 09 Mr Spot ncubatingwith Hybridization Buffer 01 09 2011 09 Mr Spot CoolingReactionPlate 01 09 2011 09 Mr Spot Aspirating Sample from Reaction Plate 01 09 2011 09 Mr Spot PerformingStringent Washes Instrument Reaction Plate E lt Sample Plate sin N 11 20 00 _ _ nt Pagina 35 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 11 2 Ricerca di liste di lavoro E possibile effettuare una ricerca di lista di lavoro nell apposito campo Worklist ID Inserire i criteri di ricerca nel campo apposito e premere enter o cliccare il tasto P E possibile ricercare le liste di lavoro tramite un ID Le liste di lavoro che corrispondono al criterio di ricerca selezionato saranno mostrate in un elenco sottostante 11 3 Ordinamento E possibile ordinare le liste di lavoro cliccando sul men a tendina Sort by Ordina per E possibile invertire la direzione dell ordinamento cliccando nuovamente sul campo scelto A Assigned To
29. DATABASE 4 1 Installazione di HISTO MATCH HISTO MATCH viene fornito su CD L applicativo viene installato automaticamente all inserimento del CD nel proprio computer Nel caso in cui l installazione non si avvii automaticamente possibile lanciare il programma setup exe contenuto nel drive del CD Non necessaria una particolare configurazione per l installazione tutti i prerequisiti NET Framework e Server SQL verranno installati automaticamente 4 2 Database HISTO MATCH utilizza come server database il server SOL Con il CD di installazione viene fornita anche la versione SQL Server Express 2008 R2 Con tale versione le dimensioni del database sono limitate a 10 GB Il server pu essere configurato per operare in modalit User Instance o in modalit Server Il database pu essere salvato in qualsiasi destinazione sul vostro PC ma il percorso dovrebbe essere reso accessibile a tutti gli utenti le versioni precedenti di HISTO MATCH utilizzavano il percorso C ExpediteDatabase 4 2 1 Modalit User Instance Questa modalit consente una semplice configurazione ed utilizzo del database e minimizza la quantit di risorse richiesta dal computer quando HISTO MATCH non in funzione ma richiede un po pi tempo durante l inizializzazione di HISTO MATCH Poich i file del database non vengono utilizzati quando HISTO MATCH non funzionante il backup consiste semplicemente nella copia dei file del databse
30. DQB1 03 DQB1 03 DQB1 03 E Serological Equivalent DQA1 O DQB1 04 Assigned NMDP DQA1 03 01 DQA1 03 01 _ Possible NMDP_DQA1 03 01 DQA1 03 BNS1 Cannot Exclude DQA1 03 01 01 DQA1 03 01 01 Coeliac EA DQ8 Z liakie Risiko hoch DQA1 05 01 02 a Hit Toble V6 0 IMGT 3 13 1 105 485 235 90 200 205 235 Group Allele DQA1 03 1 DQAT 03 DQA1 05 1 DQA1 05 1 DQA1 03 DQA1 05 4 DQA1 02 DQA1 03 1 16 REFERTAZIONE User Report Setup gt Reports mai a Filter Print Assigned NMDP Codes Nomenclature L Print Possible NMDP Codes Interpretation m i dite Print Serological Equivalents Installation Si Image Analysis Print Image Tools Y Print Low Resolution Result Paths L Print High Resolution Results Ll Print Audit Print Reagents Print Not Excluded Alleles Print Comments Database Tools Print Positive Reactions Print Ignored Reactions Summarize Samples Ll Print Compact Worklist Print Uncombined DRB1 345 results Version 18 03 2013 Nella schermata delle liste di lavoro se si preme su Report Referta quando una data lista di lavoro si trova in uno stato diverso da quello iniziale verr generato un referto di tipizzazione Il referto prodotto dipende dalle impostazioni definite nelle opzioni di impostazione Se si seleziona Riassunto campioni o Stampa lista di lavoro compatta verr pro
31. HISTO SPOT SSO ogni kit pu avere pi lotti e Kit es HISTO SPOT A definisce il locus che si intende analizzare e Lotto es A084 A085 definisce lo schema spaziale e le specificit delle sonde legate sul fondo dei pozzetti reattivi di ciascun kit Ogni singolo lotto pu essere prodotto in batch differenti e Batch es A085 1 A085 2 A085 3 definisce la reattivit di ogni sonda rispetto alle sonde di controllo specifico per ogni data produzione ed caratterizzato da una precisa data di scadenza Alcune sonde potrebbero risultare disattivate in alcuni batch del medesimo lotto Questa informazione pu essere desunta dal CD lotto specifico incluso nel kit Hit table Excel file Quando si crea un test per l analisi nella lista di lavoro richiesto solo il nome del kit le informazioni relative al batch sono trasmesse tramite lettura del codice a barre presente sulla confezione della strip coi pozzetti reattivi e vengono richieste in fase di preparazione dello strumento per la seduta analitica 3 5 Kite lotti SSP All interno del database presente una gamma di file per i kit HISTO TYPE SSP ogni kit pu contenere lotti multipli e Kit es HISTO TYPEA low definisce il locus che si intende analizzare e Lotto es 145A1 146A2 identifica un lotto di produzione con uno specifico set di primer Pagina 2 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 4 INSTALLAZIONE E GESTIONE DEL
32. Hit Table B084 IMGT 3 15 0 Version 27 02 2014 E a a Group Allele MM Rank CWD 0 GG B15 8 57 94 RF a B 15 02 01 15 0203 150204 0 00 3 02 01 15 02 03 15 02 04 15 02 06 15 02 07 15 88 15 139 15 214 15 223 15 301 15 302N 7 01 01 57 01 05 57 01 06 57 01 07 57 01 09 57 01 11 57 01 13 57 01 14 57 01 15 57 06 57 18 57 21 57 23 57 29 57 3 1 57 33 57 34 57 35 57 36 57 37 57 40 57 447 57 47 57 48 57 50 57 54 57 55 57 61 2B 15213 B 57 01 01 57010 0 oo mB 15 194 B 57 01 01 57 01 0 0 000 o 7 mB 15 02 08 B 57 01 01 57 01 n nm di Se un gruppo allelico contiene dei mismatch questi saranno evidenziati nella griglia come falsi positivi pallino rosso o falsi negativi pallino blu Pagina 58 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Hit Table B089 IMGT 3 15 0 Version 08 04 2014 Eeee a Aaea eN a aa aeee rae Lul Group Allele MM Rank CWD gt B 18 B 40 3 2 1867 B 18 B 40 75 3 nem a 8 18 03 B 40 01 01 40 01 02 3 1577 ee E k B 18 03 B 40 43 3 16 77 Dd tS e B 18 02 18 18 18 4401 B 40 31677 e o B 18 14 B 40 43 3 4869 La colonna contrassegnata come MM indica il numero di mismatch relativi a ogni singolo risultato La colonna contrassegnata come Rank fornisce un valore di distanza dei mismatch dal valore di cutoff Valori inferiori indicano un mismatch o
33. Login 22 04 2010 12 56 Roles Supervisor ser 3 Selezionare Add Aggiungi nuovo utente 4 Inserire i dettagli dell utente User Name Nome utente sar il nome con cui verr effettuato l accesso in modo univoco 5 Selezionare Roles Ruoli dal men a tendina Edit User E User QaAdministrator Supervisor Selezionare OK per salvare o Cancel Cancella per non salvare le modifiche 7 Nella lista degli utenti comparir anche il nuovo nominativo 8 Selezionare Log Off Uscita per uscire dalla schermata utenti 9 E ora possibile accedere con il nuovo utente tutti gli utenti nuovi inseriti hanno inizialmente una password di default che Password123 Cambio della password utente 1 Accedere con il nome utente e la password assegnata Pagina 13 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 sign in 2 Cliccare Setup m 4 7 d d Home Patients Samples Wiorklists Kits 3 Inserire la password attuale la nuova password e confermare quest ultima User Reports Current Password eeeeeesesee Filter Nomenclature Interpretation Confirm Password e00000000 New Password 000000000 Installation Image Analysis VA Loos Database Tools 4 Selezionare il tasto OK per salvare le modifiche A 5 Cliccare Close Chiudi per tornare alla schermata iniziale 6 4 Importazione dei kit Le versioni di kit e batch vengono gestite trami
34. Sample ID 12 11 2013 Status Initial Tests A HISTO SPOT HISTO TYPE HLA A HLA DRBI HLA DRB345 HLA DQ HLA DPBI Coeliac 2 Cliccare sulla intestazione campione per espandere la finestra per l inserimento delle informazioni Lal Patient Id qE Sample ID ID univoco del campione L inserimento obbligatorio per attivare il tasto Save Salva Date Received Impostare la data attuale pu essere poi modificata Extraction Metodo di estrazione del DNA Comments Utilizzare il tasto Add Aggiungi per aggiungere dei commenti 3 Cliccare sul tasto di espansione e aggiungere i test al campione Pagina 30 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 16720 ein Patient Id Name 5 DoB Sample ID 03 2013 4 12 11 2013 Status Initial Tests AA HISTO SPOTA A Status Initial Date 12 11 2013 13 20 23 Worklist HISTO SPOTB B Status Initial Date 12 11 2013 13 20 33 Worklist PLE O Status Initial Date 12 11 2013 13 20 34 Worklist HLA DRBI HLA DRB345 HLA DQ HLA DPBI 4 Utilizzando il tasto di espansione del campione possibile visualizzare ulteriori informazioni relative al paziente Le informazioni possono essere inserite utilizzando la schermata pazienti Patient Id 5 Cliccare Save Salva cad per salvare le modifiche o Close Chiudi lo per non modificare 10 4 Modificazione di un campione gi
35. di Megiorni and Pizzuti Journal of Biomedical Science 2012 19 88 Pagina 74 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 CIO FIEIRA Cano _ n HLA DQE1 Suggested Result DOB1 03 DOB1 03 Summary DQ8 Coeliac Risk High Coeliac Risk High HLA DQA1 Suggested Result DQA1 03 DOA1 05 a chain B1034 DOA1 03 DOB1 X DOA1 x Nella nuova modalit di visualizzazione viene mostrato un diagramma con le possibili molecule DQ e il rischio associato per celiachia La schermata viene modificata nella modalit usuale con DOA1 e DQB1 cliccando sulle frecce nell angolo superiore destro della finestra dei risultati come descritto nel prossimo paragrafo m A 14 19 2 Interpretazione DQB1 DOA1 Cliccando sulle frecce nell angolo superiore sinistro della finestra dei risultati lo schermo mostra lo schermo tradizionale di interpretazione per DOA1 e DOB1 I 1 DO4I 02 01 DQA1 05 01 01 01 DOB1 02 01 01 DOB1 03 03 02 01 DOB1 02 01 01 DO81 03 03 02 01 DOsI 02 01 DQA1 05 01 01 01 Entrambi i loci possono essere interpretati insieme o ciascuno separatamente Se viene selezionato uno dei loci vengono filtrate anche le sonde nell istogramma dei risultati cio solo quelle specifiche per DOA1 o DQB1 Worklist ID W 2014 04 07_Patient_ v Patient Sample ID W 2014 04 07_Patient_ B5 Status Initial Cs FE XL HLA DQA1 Suggested Result HISTO SPOT DQ DQB1 024 7 IMGT v
36. dove salvare il file Copiare il file nella chiavetta USB Inserire la chiavetta USB nella porta corrispondente di MR SPOT Su MR SPOT cliccare in corrispondenza di Worklist Liste di lavoro Cliccare Import Importa La lista di lavoro ora disponibile per essere eseguita Invio diretto tramite MR SPOT Scegliere un MR SPOT dalla lista di quelli disponibili Cliccare Start Avvio La lista di lavoro sar disponibile su MR SPOT 4 Dopo che l invio stato completato il software chieder di stampare un rapporto di layout della lista di lavoro cliccare Yes oppure No 5 Lo stato della lista di lavoro sar aggiornato come Exported Esportato 11 10 Importazione di una lista di lavoro eseguita 11 10 1 Importazione tramite chiavetta USB Dopo che una lista di lavoro stata eseguita sullo strumento MR SPOT necessario importarla con le immagini dei pozzetti ci pu essere effettuato utilizzando una chiavetta di memoria USB Dallo strumento MR SPOT esportare la lista di lavoro su una chiavetta USB Verr salvato sulla chiavetta USB un file della lista di lavoro insieme a una directory contenente tutte le immagini dei micropozzetti Inserire la chiavetta USB nel PC con installato l applicativo HISTO MATCH Sulla finestra principale cliccare Import Importa o cliccare lo stesso comando nella finestra delle liste di lavoro Selezionare il file xml della lista di lavoro file e cliccare su
37. e la successiva gestione dei dati interpretati 1 1 Limitazioni del software L applicativo HISTO MATCH stato sviluppato per fornire supporto agli utenti esperti nell analisi di tipizzazioni HLA nella forma di risultati suggeriti Tuttavia qualsiasi risultato clinico o diagnostico dovrebbe essere accuratamente valutato da personale qualificato nell analisi di tipizzazione HLA per confermarne la correttezza L applicativo va inteso come un aiuto per i risultati suggeriti ma non dovrebbe essere utilizzato come unico metodo per determinare i risultati 2 PREREQUISITI 2 1 Hardware L applicazione eseguibile su qualsiasi piattaforma PC recente purch presenti i seguenti requisiti minimi e 2GBdi RAM e Una risoluzione video minima di 1280 x 1024 e Un processore multi core 2 GHz e Spazio sufficiente su disco fisso per il database una lista di lavoro con 96 test con relativi risultati ed immagini occupa circa 15 MB di spazio all interno del database 2 2 Sistema operativo L applicativo HISTO MATCH lavora con Microsoft Net Framework v4 0 i sistemi operativi Microsoft sia a 32 che 64 bit che supportano questo framework sono e Windows XP e Windows Vista e Windows 7 e Windows 8 richiesto SQL Server 2012 Express edition L applicativo richiede inoltre un database server SQL per immagazzinare dati risultati ed immagini nel CD fornito compreso Microsoft SQL Server 2005 Express edition ed sufficiente per una install
38. gli alleli comuni Nella finestra dei risultati suggeriti possibile scegliere tra visualizzazione di tutti gli alleli o solo di quelli comuni Il filtro per gli alleli comuni pu essere selezionato cliccando col tasto destro del mouse sul bottone rosso e selezionando una delle opzioni che sono mostrate nella finestrella Il filtro selezionato comparir sul bottone All Tutti vengono mostrati i risultati come indicato nella sezione 14 6 1 4D E una lista di alleli comuni basati sui dati di popolazione desunti da www allelefrequencies net In questa lista saranno inclusi gli alleli con una frequenza 2 0 5 in qualsiasi popolazione di numerosit 2 1000 Gli alleli in questa lista saranno solitamente tipizzati in modo non ambiguo a 4 digit utilizzando filtro e HISTO SPOT 4D kit Il Pagina 61 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 filtro provvisorio sar infatti rimosso quando i kit HISTO SPOT saranno in grado di risolvere tutti gli alleli Common C C Questa lista contiene tutti gli alleli comuni inclusi nel catalogo catalogo CWD2 0 0 Mack SJ et al Common and well documented HKA alleles 2012 update to the CWD catalogue Tissue Antigens 81 4 183 257 2013 CWD Questa lista contiene tutti gli alleli in lista nel catalogo CWD2 0 0 User Una lista di alleli comuni definiti dall utente L utilizzo dei filtri cambier i risultati nel modo seguente nel campo dei risultat
39. il campione dalla lista sono mostrati solo i campioni non assegnati ai pazienti 7 tac A ate 151092013 4 Cliccare OK ES n Loci DQB1 Date 15 09 2011 5 Il campione selezionato verr aggiunto al paziente 7 Loci A Date 15 09 2011 fi Lod B Date 15 09 2011 ij f Lod C Date 15 09 2011 9 6 Cancellazione dei pazienti Pagina 27 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 E possibile cancellare un paziente dal database selezionandolo dalla schermata di ricerca pazienti e cliccando sul tasto Delete Elimina il Cliccare Yes per dare la conferma di cancellazione Tutti i campioni associati e test Delete Patient Mew Patient and all related Samples MILE AS i cono ine prenotati saranno cancellati La cancellazione del paziente non avviene se esiste gi su una data worklist un test No associato Solo utenti con ruolo di supervisore possono cancellare i pazienti 10 GESTIONE DEI CAMPIONI Nel software HISTO MATCH con il termine campione si intende un campione realmente esistente provetta Come per una provetta realmente esistente possibile eseguire molti test differenti su uno stesso campione inserito in HISTO MATCH A differenza delle provette per i campioni inseriti non necessario che siano appartenenti a un determinato paziente Selezionando il tasto Samples Campioni dal men principale verr mostrata la schermata di ricerca
40. inserito 1 Ricercare il campione da modificare attraverso la funzione di ricerca nella schermata campioni 2 Cliccare sul tasto Edit Modifica o fare un doppio click sul campione nella lista 3 Verr mostrata la schermata di modificazione del paziente Tutti i campi possono essere modificati 4 Il campo ID pu essere modificato da un supervisore ma non pu restare vuoto 5 Nel caso di inserimento di ID gi presente verr visualizzato un messaggio d errore Una volta inserito un nuovo campione o modificati i suoi dati possibile accedere ad altre schermate del software utilizzando il men principale che si trova in basso sullo schermo Ci consente di modificare campioni multipli o campioni ed altri dati in contemporanea campioni su Pagina 31 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 cui si stanno eseguendo delle modifiche risulteranno inclusi in una lista aperta di pazienti Open Samples Per tornare al campione da modificare fare doppio click sul campione nella lista Open Samples Sort by JBi f JB2 f LS1 7 JB1 Patient John Brown date 17 11 2010 y Patient John Brown date 17 11 2010 y Patient John Brown date 17 11 2010 r Patient Not Assigned date 17 11 2010 10 5 Importazione dei campioni Un modo veloce per inserire pazienti campioni e test associati quello di importare i dati da un file di testo 10 5 1 Formato del file di importazione Il file di testo do
41. lavoro che si intende importare nel software e cliccare su Import Importa La lista di lavoro selezionata verr importata in HISTO MATCH e le immagini trasferite al database Da questo momento in avanti sar possibile selezionare la lista di lavoro dalla finestra relativa grigia e procedere con l analisi e l interpretazione Pagina 49 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 13 ANALISI DELL IMMAGINE HISTO MATCH esegue automaticamente l analisi delle immagini prese da ciascun pozzetto test non appena una lista di lavoro viene importata nel software l analisi si compone di due fasi nella prima avviene la superimposizione della griglia all array delle sonde allo scopo di identificare le sonde stesse con la dimensione e la posizione degli spot nella seconda il software calcola il valore di ogni spot sulla base dell intensit della colorazione e le dimensioni applicando un algoritmo correttivo per il background 13 1 Superimposizione automatica della griglia Quando una lista di lavoro viene importata le immagini vengono analizzate automaticamente Questa immagine mostra il software che procede allo superimposizione della griglia per l interpretazione se il pozzetto di colore rosso significa che attualmente in fase di analisi se blu significa che la prima fase di superimposizione della griglia stata completata Per ogni pozzetto il software impiega circa 3 secondi Una v
42. lista di lavoro Aggiungi Importa una lista di lavoro Importa Referta la lista di lavoro selezionata Referto Esporta la lista di lavoro selezionata Esporta Modifica il layout la lista di lavoro selezionata Modifica Cancella la lista di lavoro selezionata Cancella SENSE Le Analizza la lista di lavoro selezionata Analizza Invia la lista di lavoro selezionata a MR SPOT Invia Pagina 34 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 11 1 Visualizzazione della lista di lavoro e dati sulla sessione MR SPOT Cliccando sulla freccia a destra della lista di lavoro evidenziata possibile accedere alla visione dettagliata del layout della piastra eseguita Worklists 1 La freccia Vedi log apre i dati di registro della lista di lavoro comprensivi di grafico delle Di temperature dei vari moduli macchina durante il LLLLLOOO LLLLLOOCO test VOLO 00000000 DDD i i OC SOO000OO SDK OOV0V00000 DDD DK VO VOOOOO CNG VE Imager Version firmware 3015 driver 84022187 fpga 2828 API 33620 Brightness 15 Contrast 2 2 Exposure 60 Gamma 1 5 Gain 1 5 Date Machine Message 01 09 2011 08 Mr Spot Plate layout confirmed a 01 09 2011 08 Mr Spot Regentsentered___________ 01 09 2011 08 Mr Spot Checklist 1 Confirmed __ 01 09 2011 08 Mr Spot Checklist 2 Confirmed 01 09 2011 08 Mr Spot Checklist 3
43. modifica della lista di lavoro l utente pu accedere a qualsiasi altra parte del programma Histo Match cliccando su una delle icone delle funzioni disponibili nel men principale nella parte bassa dello schermo L utente potr tornare alla visualizzazione precedente cliccando sulla funzione corrispondente alla schermata delle liste di lavoro Tutte le liste di lavoro aperte saranno elencate nella lista Open Worklist Liste di lavoro aperte con un doppio clic sulla lista di interesse possibile ritornare alla schermata del layout piastra e introdurre nuove modifiche 11 5 Importazione di una lista di lavoro iniziale Esiste anche un metodo veloce per creare una lista di lavoro tramite importazione della lista stessa da un file di testo csv Il file deve contenere le informazioni organizzate in campi e sono riconoscibili di Histo Match due possibili formati 1 ID Paziente Nome Cognome Data nascita ID campione Locus 2 ID Campione Locus I Test worklist 2 csv Editor Ogni campo dev essere separato dal successivo da una Datei Bearbeiten Format Ansicht s i nu 7 strip 1 tabulazione o da una virgola per pozzetti vuoti utilizzare il 1 ui Smith 1 A i 2 30 Jones 2 A cancelletto Si possono inserire commenti nella lista di 3 David Mill 3 A lavoro nel file di testo che non verranno importati facendo iniziare la riga che li contiene con il simbolo Il nome del i Sstrip file sar l ID della list
44. nella realt la probabilit inferiore a un milionesimo l interpretazione pu essere ridotta al confronto dei Pagina 66 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 pattern che includono almeno un allele non raro Ci riduce i tempi di interpretazione di un test per il locus B da 20 30 secondi circa a 2 3 secondi e utilizzer meno memoria La conseguenza per i risultati sar a nessun match cercato per combinazione di due alleli rari b gli alleli rari che sono possibili solo in combinazione con un altro allele rare non saranno elencati nella sezione Non si possono escludere del risultato e o referto Quando viene eseguita una interpretazione ristretta l intestazione del sommario risultato sar in rosso Gs JE auo ni Suggested Result summary B 38 02 01 B 46 01 01 SS Equivalent B38 Bw4 B B46 Bw BNul 8 _______ _ Assigned NMDP B 38XX B 46 X 0 Possiblenmop_ B 38 XX B 46 XX B 38 02 01 B 46 01 01 Cannot Exclude B 38 02 02 02 04 02 05 02 06 15 18 23 35 43 44 47 48 49 46 01 03 01 04 01 06 01 07 01 08 01 09 01 10 01 117 01 12 01 13 01 14 01 15 09 15N 20 22 23 24 21 28 34 36 37 38 39 42 44 45 4G 48 49 52 53 54 55N 56 57 Nel referto di tipizzazione sar mostrato un asterisco accanto al filtro selezionato HISTO MATCH Worklist OBAG Lacan B2 Sample W 2014 08 28 TER 499 506 Worklist W 2014
45. sonda solo nel test selezionato in ogni test incluso nella lista di lavoro o utilizzare il nuovo cutoff per tutti i test che sono eseguiti utilizzando anche in futuro il batch in questione Muovere il cursore di aggiustamento del livello di cut off nella direzione desiderata Sono disponibili diverse opzioni Cancel Cancella Abortire tutte le modifiche ai cutoff nella schermata attuale Apply Applica Applicare la modifica del cutoff al test selezionato Apply to Worklist Applica a lista di lavoro Applica la modifica del cutoff a tutti i test che utilizzano questo batch nella lista di lavoro Apply To Batch Applica al batch Tutti i test futuri che utilizzano questo batch considereranno il cutoff modificato Reset To Default Reimposta Pagina 69 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Reimposta il valore di cutoff al valore indicato dal produttore Tutti i cambiamenti introdotti nei cutoff vengono memorizzati nello storico RETE Probes History Comment Date User Change Old New 21 04 2010 14 32 User Test Interpreted 23 04 2010 10 27 User Test Interpreted 21 04 2010 14 32 User Test Interpreted 21 04 2010 14 32 User Probe 21 A692 InUse Auto 26 04 2010 14 49 User Test Authorization Un Authorized Authorized 23 04 2010 14 12 User Removing Matched Author 26 04 2010 12 30 User Test Interpreted 23 04 2010 10 12 User Removing Matched Author 23 04 2010 10 27 User Test Interpreted
46. un utente ma possibile disabilitarlo 8 6 Cambio della password Ogni utente pu modificare la propria password scegliendo il tasto Setup dal men principale l opzione di modifica compare gi nella prima pagina della nuova schermata gt User Reports Current Password eeeeeeseeso Filter Nomenclature Interpretation Confirm Password eeeeeeeee New Password eeeeeeeee Installation d Image Analysis e Le password sono case sensitive quindi Password non la stessa cosa di password i campi New Password Nuova Password e Confirm Password Conferma Password devono corrispondere in questo modo si eviteranno errori durante la creazione della nuova password Per confermare le modifiche premere OK v Pagina 22 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 9 GESTIONE PAZIENTI L inserimento dei pazienti opzionale nel software HISTO MATCH non quindi necessario utilizzare i dati dei pazienti per inserire dei campioni o definire i test di una seduta analitica sebbene naturalmente il raggruppamento di pi campioni in relazione a uno stesso paziente pu essere utile Per accedere alla schermata pazienti dal men principale cliccare sul tasto Patients Pazienti Nella schermata compariranno tutti i pazienti sinora inseriti nel software Patients Search Open Patients i Patenti v Patient ID 1 Name Peter Muller Crea un
47. verr evidenziato anche lo spot nell immagine e viceversa Il tasto Ga consente di ripetere le fasi di calcolo su tutti gli spot Il tasto ES consente di ripetere la rilevazione degli spot e la misurazione dei valori d intensit re Il tasto consente di effettuare la rotazione manuale dell immagine si veda la sezione 13 4 Il tasto consente di visualizzare il pozzetto senza griglie e cerchi di interpretazione 13 4 Rotazione dell immagine Quando si eseguono dei test singoli su MR SPOT pur con la massima attenzione da parte dell operatore i pozzetti saranno inevitabilmente soggetti a rotazione nella piastra ove vengono alloggiati Quindi l immagine pu non essere riconosciuta automaticamente dal software senza una precedente correzione dell orientamento 13 4 1 Autorotazione dell immagine Nelle impostazioni di base la funzione di autorotazione disattivata per cui il software tenter di effettuare la superimposizione della griglia senza rotazione Si consiglia di mantenere tale impostazione nel caso in cui non si utilizzino pozzetti spezzati singolarmente dato che a volte le immagini possono erroneamente essere ruotate dal software anche senza necessit Per le strip combi l autorotazione una funzione automaticamente attivata Se la funzione attivata il software cercher di trovare un angolo di rotazione subito dopo l importazione delle immagini Quindi ruoter l immagine ed eseguir l
48. volta visualizzati gli alleli completi quelli comuni saranno visualizzati in grassetto verde quelli well documented in grassetto blu in base al catalogo CWD2 0 0 con il tasto E possibile togliere questi risultati da quelli suggeriti Se le sonde di controllo risultano molto deboli verr visualizzato il messaggio di avviso indicato a fianco E possibile comunque tentare di forzare l interpretare utilizzando il tasto Interpret Interpreta D X v dl Esegue l interpretazione del test selezionato Numero massimo di sonde che verranno ignorate dall algoritmo durante la ricerca del risultato con alleli comuni Il valore di default 10 e pu essere modificato nelle impostazioni Saranno mostrati solo i risultati con un massimo numero di mismatch pari al valore qui impostato Il valore di default 1 e pu essere modificato nelle impostazioni Mostra l immagine del pozzetto test con la griglia sovrapposta consente all operatore di muovere i cerchi di interpretazione e o la griglia manualmente Cancella i risultati per il test selezionato Approva il test da parte del tecnico Effettua la validazione svalidazione dei risultati solo col ruolo di Supervisore Questa parte della schermata di analisi mostra i risultati ottenuti dall interpretazione Con le impostazioni standard verranno mostrati i risultati possibili a 2 digit e il numero di mismatch se presenti che l algoritmo di calcolo ha considerato
49. 0 445 425 175 190 390 160 500 A 01 A 02 1 A 01 A 33 4 A 01 A 68 1 Selezionare la combinazione allelica per la quale si desidera visualizzare il pattern di reazione atteso Le reazioni positive sono indicate da una barra nera all altezza dell allele o degli alleli corrispondente le reazioni non ben definite restano in grigio Mentre le reazioni negative sono indicate da una barra grigia e non vengono assegnate ad alcun allele Resuts MARON Meommere aaa Hit Table V20 2 IMGT 3 6 0 1 Version 26 06 2012 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 PISE 15 16 17 18 19 20 21 22 23 A 01 01 01 01 A 33 03 01 TITTI P Me Lal 650 380 225 525 195 520 405 415 175 125 600 200 105 200 175 650 445 425 175 190 390 160 500 Group Allele mm cwDp A 01 A 33 1 O A 01 A 02 1 1 gt A 01 A 33 4 1 1 gt 1 A 01 A 68 1 15 11 Storico e commenti La cronologia di modifiche ai test e i commenti vengono applicati con le medesime modalit viste per i test SSO si vedano le sezioni 14 17 e 14 18 15 12 Interpretazione dei risultati con HISTO TYPE Celiac Disease Kit 15 12 1 Visualizzazione in modalit celiac disease Il kit HISTO TYPE SSP per celiac disease comprende una combinazione di alleli associati a malattia per DQB1 DQA1 e DRB1 Pertanto i risultati appaiono in modo diverso rispetto a quelli per i kit di Pagina 85 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instr
50. 01 01 01 03 13 03 01 02 03 21 03 22 03 27 03 42 DOB1 03 02 01 DQ81 03 01 04 DOBI DQ81 03 02 01 DOB1 03 19 DOA1 03 DQA1 05 DQB1 03 02 02 DQB1 03 19 Suggested Result PAi 15 Eh re ne TOODGDOO0ODOL m T Version 16 04 2013 SA a a a a i Co i Gi a i Ga a Group Allele MM Rank CWDj DQB1 03 DQB1 03 29 o w DQA1 03 DOA1 05 1 o 1000 DQB1 03 DOB1 03 31 1 DQA1 03 DQA1 05 3 1 VEVIEVIEV Vengono visualizzate tutte le sonde per DQA1 DQB1 e nell istogramma dei risultati nella parte inferiore dello schermo sono incluse tutte le combinazioni alleliche possibili per entrambi i loci Tutte le stringhe di alleliche consistenti con un pattern di reazione senza mismatch e che contengono almeno un allele comune filtro 4D vengono trasferiti nel campo dei risultati Gli alleli associati a celiachia sono evidenziati in giallo Il sommario mostra il nome della possibile molecola DQ associata a malattia celiaca Premendo il bottone nell angolo superiore destro del campo risultati Seelac k Summary DQ8 Coeliac Risk High DQA1 03 01 01 DOA1 05 05 01 01 05 08 05 09 05 05 01 02 05 05 01 03 05 11 DQB1 03 01 01 01 03 13 03 01 02 03 21 03 22 03 27 03 42 DQB1 03 02 01 DQ81 03 01 04 DOB1 03 02 01 DQB1 03 02 01 DQB1 03 19 DQB1 03 02 02 DQB1 03 19 si cambia la visualizzazione dell aplotipo e il risk assignement per celiachia sulla base
51. 05 04 03 32 DOB1 03 13 DQB 1 020201 03 02 02 03 02 04 03 02 06 03 02 07 03 02 08 03 02 09 03 05 03 DOB1 0302I0 03 02 02 03 02 04 03 02 06 03 02 07 03 02 08 03 02 09 03 05 03 03 05 04 03 32 HLA DQAI z DQB1 03 02 01 03 02 02 03 02 04 03 02 06 03 02 07 03 02 08 03 02 09 03 05 03 03 05 04 03 32 DQB1 03 02 01 03 02 02 03 02 04 03 02 06 03 02 07 03 02 08 03 02 09 03 05 03 03 05 04 03 32 DOA1 03 01 01 DOA1 03 01 01 1 Suggested Result DQA1 03 DQA1 03 DQA1 05 i Results la Hit Table V6 0 IMGT 3 134 171 220 200 140 177 CWD Group Allele MM DQ81 03 DQ81 03 35 DRB1 04 DRB1 08 1 DQB1 02 DQB1 03 2 DQB1 03 2 DRB1 04 1 DOB1 03 DOB1 04 3 DOA1 03 1 Version 18 03 2013 800 150 140 150 105 200 185 120 95 145 135 135 105 485 235 90 200 205 235 Pagina 86 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Vengono mostrate tutte le reazioni per DRB1 DQB1 e DQA1 con la inclusione di tutte le possibili combinazioni alleliche per i vari loci nella parte inferiore sinistra dello schermo Tutte le combinazioni alleliche che sono consistenti con il pattern di reazione in assenza di mismatch e che contengono al meno un allele comune allele C vengono mostrate nel campo dei risultati Facendo click sulle frecce nell angolo superiore destro del campo risultati si apre un dettaglio sui risul
52. 1 3 80 13 11 2012 B 15 01 B 35 01 B 075 1 3 8 0 13 11 2012 B 58 01 B 58 02 B076 1 3 8 0 13 11 2012 B 07 05 B 55 02 B 075 1 3 8 0 13 11 2012 B076 1 3 8 0 13 11 2012 B 15 XX B 57 XX B 076 1 3 8 0 13 11 2012 B 15 02 B 57 01 B076 1 3 8 0 13 11 2012 B 15 10 E 40 02 B 076 1 3 8 0 13 11 2012 B 35 03 B 44 02 B076 1 1 80 13 11 2012 DRB1 01 01 DRB1 01 01 DRB1 069 3 380 13 11 2012 DRB1 04 05 DRB1 15 03 DRB1 069 3 3 80 13 11 2012 DRB1 09 01 DRB1 13 03 DRB1069 3 380 13 142012 DRBI ILEC DRB1 11 03 DREL 069 3 3 80 13 11 2012 DRB1 04 07 DRBI 08 06 DRB1069 3 380 13 11 2012 DRB1 01 01 DRB1 08 0i DRB1 069 3 3 80 13 11 2012 DRB1 14 04 DRB1 15 02 DRB1069 3 3 80 13 11 2012 DRB1 04 07 DRBI 13 01 DRB1 069 3 3 80 13 11 2012 Questa tipologia di referto contiene una prima pagina contenente il dettaglio della corsa analitica e dei reagenti utilizzati nella seduta Seguono poi pagine singole per ogni test L informazione qui mostrata pu essere impostazioni sommario dipendono dalle impostazioni di visualizzazione scelte nella schermata di interpretazione o nelle impostazioni filtro allelico ed opzioni del sommario risultati risultati selezionata mostrati Pagina 89 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Worklist O BAG Hamer W 2014 08 28 TER 499 506 Sample Worklist W 2014 08 28_TER_499 506 A1 Patient Name DoB Sample Received 10 09 2014 Extraction Date Performed 30 08 2014 Analyzed By BAG D
53. 12 03 32 UserBAG Low DNA Concentration Sticky Se viene selezionato il tasto Sticky comparir una nota con la data per indicare che stato aggiunto un commento Ci sar visibile anche nella schermata dei risultati Results obes MRO Commens gt Hit Table A097 IMGT 3 8 0 Version 01 10 2012 Mnane nor CA Group allle MM Rank cwo EN F If 3 rey 02 A 02 8 10 00 PI Li o Q scoz atoz18 1 Isa m ele gt A 02 A 02 41 2 25 68 2 n Pagina 73 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 14 19 Interpretazione dei risultati del kit HISTO SPOT Coeliac Disease e DOB14D DOA1 14 19 1 Visualizzazione risultati per celiachia Il kit per la tipizzazione degli alleli associati a malattia celiaca combina i test DQB1 e DOA1 in un solo pozzetto La visualizzazione di tali risultati differente da quella ottenuta con i kit per singolo locus Inoltre lo schermo mostra i risultati in considerazione dell associazione alla malattia celiaca La visualizzazione di default la seguente a i 3 2013 05 02 CD Q022 C1 Status Initial re lt 200 GIF RIAD o ii Coeliac Worklist ID 2013 05 02 CD Q022 rs JEGA sc gt ir il Suggested Result Summary DQ8 Coeliac Risk High DOB1 03 DOB1 03 DQA1 03 01 01 DOA1 05 05 01 04 05 08 05 09 05 05 01 02 05 05 01 03 05 11 HLA DQAT DQB1 03
54. 12 04 2010 15 19 12 04 2010 12 49 12 04 2010 13 29 12 04 2010 13 28 12 04 2010 13 28 12 04 2010 13 27 12 04 2010 13 28 12 04 2010 13 26 f file name Files of type Kit Files xml v 5 file vengono caricati e il contenuto mostrato nella tabella sulla schermata L operazione pu richiedere qualche tempo Si prega di attendere fino alla comparsa dei batch file importati nella lista I Kit Import j Name Allel DE Pogos i Updated Updated Updated Updated Updated Updated Updated Updated Updated Updated Updated Updated Updated Updated Status Updated Updated O No Updated rr I Updated i 00 Updated e LI Updated O Updated ui Updated o Updated E Updated o Updated Lo rr _ 19 Updated n E Updated O DI Updated O Updated S 6 Cliccare Save Salva lt 4 per salvare i risultati nel database o Cancel Cancella x per annullare l importazione x Una volta importati i kit resteranno sempre visualizzati una volta entrati nella schermata database disponibili per ogni lotto sono elencati ad ogni batch sono evidenziati in giallo se viene utilizzata l ultima versione disponibile del database oppure in rosso se viene usata una versione vecchia E possibile cambiare il database di riferimento cliccando sul corrispondente numero di versione ci modificher automaticamente il riferimento di tutti i batch relativi a un dato lotto ad es da B084 1 a B084 4 Pag
55. 13 12 11 2013 Status Initial HISTO SPOT A A Status Initial Date 12 11 2013 13 02 34 Worldist HISTO SPOTB B Status Initial Date 12 11 2013 13 02 36 Worklist ge HISTO SPOT C C Status Initial Date 12 11 2013 13 02 37 Worlkdist 6 Espandere il campo campioni per inserire le informazioni relative Sample ID 1 mu 05 11 2012 Status Initial Sample ID Dei Ea e 05 11 2012 Date Collected 05 11 2012 Sample ID ID campione ID univoco del campione obbligatorio Date received Data ricevimento esame Impostare la data attuale poi pu essere modificata Extraction Estrazione Metodo di estrazione del DNA Comments Commenti Utilizzare il tasto Add per aggiungere commenti 7 Il nuovo campione verr inserito nella lista preesistente per un dato paziente 7 Patient 1 Patient Id 1 Name Janet Jackson 3 DoB 25 04 1969 00 00 00 g Samples a p1 ETETE Patient Janet Jackson Date 05 11 2012 Oltre ai test prenotati possibile modificare i dati del campione cliccando sul tasto Edit Modifica Pe o effettuando un doppio click sul campione presente in lista 8 Cliccare su Save Salva fees per salvare le informazioni relative al paziente e al campione nel database oppure cliccare Close Chiudi Lo per non accettare le modifiche introdotte Pagina 26 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 9 4 Modificazione di un paz
56. 16 Not Typed ALow A_454A1 IMGTv 3 13 1 Summary Serological Equivalent y Q Assigned NMDP Sd Possible NMDP Cannot Exclude Hit Table V24 0 IMGT 3 13 1 Version 23 06 2014 1 2 5 6 7 8 9 IO i a 42 1A 14 1 16 17 18 19 20 2 22 og Lal 190 175 220 525 210 400 570 200 160 650 380 225 560 195 520 400 410 175 125 595 200 105 210 188 650 445 420 175 190 390 200 500 595 555 Group Allele MM CWD s Inserire le reazioni positive cliccando sulla band near vuota nel gel o effettuando doppio clic sulla lane E possibile rimuoverle cliccando nuovamente Le reazioni positive risulteranno evidenziate in verde nel diagramma di interpretazione nella finestra al di sotto del gel E inoltre possibile inserire reazioni positive cliccando sulla mix nel diagramma Una mancata amplificazione pu essere indicata selezionando la banda di controllo della mix in tal caso sul diagramma sar evidenziata in grigio Le mix inattivate in questo modo saranno ignorate dall interpretazione Patient hg SamplelD SSP Status Initial i amara emam 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 Not Typed Alow A_454A1 IMGT v 3 13 1 Summary Serological Equivalent Assigned NMDP KG Possible NMDP Cannot Exclude Hit Table V24 0 x IMGT 3 13 1 Version 23 06 2014 i 5 _ _ _ _ n rs i e alslel7z e8 o a 1 1 1 a is 16 17 18 19 20688022
57. 17 23 19Q v 4 Assigned NMDP A 03 01 A 23 01 Cannot Exclude A 03 01 01 01 01 01 02N 01 01 03 01 02 01 03 01 04 01 05 01 07 01 08 01 09 01 10 Il 01 11 01 12 01 137 01 14 01 157 01 16 01 17 01 18 01 19 01 20 01 21 01 22 01 23 v b Cannot Exclude A 03 01 01 02N 01 01 03 01 02 01 03 01 04 01 05 01 07 01 08 01 09 01 10 01 11 a 01 124 01 134 01 14 01 15 01 16 01 17 01 18 01 19 01 20 01 21 01 227 01 23 01 24 E possibile decidere l impostazione di default per il filtro utilizzato nell interpretazione accedendo a Setup Impostazioni Nella stessa schermata le liste degli alleli comuni possono essere revisionate e pu essere modificata una lista definita dall utente g BAG HEALTH CARE HISTO MATCH 2 0 User s reports Default Results Filter gt Filter Nomenclature Interpretation Display CWD Alleles Installation Image Analysis Tools 3 Display User Defined Alleles Database Tools lt Display All Alleles 3 Display 4D Alleles CWD amp Core Alleles i HLA DRB1 Allele DRB1 01 01 01 DRB1 01 02 01 DRB1 01 03 DRB1 03 01 01 DRB1 03 02 01 DRB1 04 01 01 DRB1 04 02 DRB1 04 03 01 DRB1 04 04 Pagina 62 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 E possibile manualmente aggiungere o cancellare gli alleli dalla lista definita dall utente utilizzando il campo Allele e i tasti Add Aggiungi e D
58. 3 1 D C I pDA 5 DOD A 5OVEA5AG 3500 e e DD r AEE ALIA DE MO Sa E e w A pym i at a Summary DQA1 01 02 01 01 DQA1 01 03 01 01 Serological Equivalent DQA1 Assigned NMDP DQA1 01 CYZ DOA1 01 DB Possible NMDP DQA1 01 CYZ DQA1 01 D8 DQA1 01 DQA1 01 J i y Sl E o J DOO n _ bel Cannot Exclude IMGT 3 13 1 Version 06 11 2013 n our o uw AY NANOA NMM N N ON w Group Allele MM Rank CWD Dato DOAN 0 000 Ta E A DOATOIAD 1 Mi AGT UO GI CO O O A GC O DQA1 01 DOA1 01 1 1 674 I2 kE Pagina 75 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 E possibile inattivare la visualizzazione combinata dalla Seni Interpret Setup finestra Setup e sezione Interpretation togliendo la Filter Default Maximum Mismatches ici Nomenclature i ica spunta al campo Display Combined Locus Results interpretation installation Automatically Edit Results Image Analysis L Display Combined Locus Results Tools Database Tools Se le sonde di controllo di uno dei due loci sono fallite il test sar evidenziato con il pozzetto grigio rosso e l altro test della coppia sar ancora interpretabile Worklist ID W 2014 04 03 Patient Patient n v HISTO SPOT B1 024 7 IMGT v 3 13 1 v Sample ID W 2014 04 03 _Patie
59. 4 2 2 Modalit server SQL Questa modalit consente al database di essere condiviso attraverso una rete e poich il programma in funzione come un Server il database disponibile in qualsiasi momento anche quando HISTO MATCH non in funzione l utilizzo di questa modalit consente un avvio pi veloce del programma ma richiede una maggior quantit di risorse Pagina 3 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 4 3 Installazione iniziale del database Quando si avvia HISTO MATCH per la prima volta comparir una finestra denominata Database Tools E Database Tools i A DI E User Instance File Name SQL Server Server Log on x Use Windows Authentication J Use SQL Server Authentication M User Name Password A questo punto dovete decidere se desiderate operare in modalit User Instance o Server SQL la modalit di default nelle versioni di HISTO MATCH precedenti alla v 2 era User Instance 4 3 1 Modalit User Instance a_i User Instance File Name Le due opzioni disponibili sono e Apri per selezionare un Database HISTO MATCH gi esistente scegliere questa opzione se c gi un database esistente che volete utilizzare selezionando il file dalla finestra di dialogo e Nuovo per creare un nuovo database Scegliere una destinazione e un nome al file non utilizzare spazi vuoti nel nome del file
60. 5 02 356N 02 357 012 360 02 36 1 02 362 02 363 02 364 12 365 02 367 CA IY 02372 02 374 OAI 02377 002 378 O2379 02 350 C2 381 02387 02354 072 385 C2359 02389 02390 02 39 17 02 39 02 395N 12 396 02 397 HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Se nelle impostazioni stato selezionato il comando Stampa risultati in alta risoluzione verranno stampate tutte le possibili stringhe di alleli e il referto potr essere composto da parecchie pagine per ogni campione Gli alleli C sono stampati con un carattere maggiore e sottolineati gli WD intermedio mentre gli alleli alleli hanno un carattere rari sono stampati con caratteri pi piccoli DIBAGH entHcane Collected 08 03 2013 HISTO MATCH Sample Report Ext 516 ample ID Patient Patient Name Ext 516 Sample Received 08 03 2013 12 03 03 17 Extraction Method Quando viene selezionato il LA Type u 72 A2 HLA A A 03 01 01 01 A 31 01 02 comando Stampa CAMPIONI Worklist CS 2013 03 08 evaluation 4 k i i Serology A3 A31 nelle impostazioni tutti i risultati Batch A 101 59 Hit table A101 IMGT db 3 8 0 ver 31 01 2013 dui dello stesso campione in questa B2 HLA B B 15 18 01 B 35 03 01 lista di lavoro saranno combinati Worklist CS 2013 03 08 evaluation 4 NMDP Serology 571 86 835 Bw6 e verr stampato un referto Batch B 0783 65 Hit table B078 IMGT db 3 8 0 ver 13 03 2013
61. AANO 1A cei Test Authorization Authocred in Authonred 26 04 2010 16 01 CutOff Change 13 A251 1 18 13 4251 0 45 14 12 Specificit delle sonde Per visualizzare le specificit di una sonda cliccare sulla barra relativa nell istogramma con il tasto tn In Use Probe R13c Spedificity destro e selezionare Specificit della probe xxx cut off Si aprir una finestra con l elenco degli alleli che reagiscono con una data sonda HISTO MATCH Ag Probe 40 Specifici STOP O BAG nea care pe R Worklist ID W 2012 10 18 Patient 2 01 GO BOSS v Sample 1D W 20 A 02 19 HISTO SPOTA A093 3 IMGT v 3 8 0 w a 4 CE el Suggested Re Summary A 02 152 Serological Equivalent a2jA 02 309 le A Possible NMOP A702 A 24 XX S T Version 10 10 2012 aes sieggyagsagegsssRaaNsnnaaRuasnLgnaneas O MA A O2 A 24 348 O 0 00 iaa 6 ASU 4 348 o 10 00 21 d i Soraa i e l E gt A 02 A 23 17 i 027 533 H Pagina 70 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 14 13 Visualizzazione del pattern di reattivit di un allele Durante l analisi di interpretazione pu essere utile visualizzare il pattern di reazione di certi alleli o combinazioni alleliche Iniziare a digitare parte dell allele per il quale si desidera visualizzare il pattern di reattivit nel campo vuoto Si pu raffinare la ricerca scorrendo attraverso la lista
62. ASE i 3 4 1 installazione di HISTO MATCH assisi trio ai 3 4 2 Da DA E EE i 3 4 3 Installazione iniziale del databaSe iii 4 4 3 1 Modalita User Instat Eses Eai 4 4 3 2 Modalita SERVO ta 6 4 4 Aggiornamento di HISTO MATCH isiiriisssrirsvisrniererinrsnirsearini trsnice iarainn 7 4 5 Creazione di un nuovo database ii 8 4 5 1 Modalit User INStance ia 9 4 5 2 Modala SENEE aaa 9 4 5 3 Mostra il nome del database corrente i 10 AVVIO DI HISTOMATCH gli ri 11 6 IMPOSTAZIONI INIZIALI DEL Software i 11 6 1 ACCESSO iii one 11 6 2 Aggiunta di nuovi utenti e assegnazione dei ruoli e 12 6 3 Cambio della password Utente anea a ENa 13 6 4 IMPOrRAszIone deli ia 14 6 5 Ricerca Qer Dath ila 17 6 6 Ordinamento dei batch ii 18 7 SCHERMATA INIZIALE reni 19 7 1 HEDDE seieren e 20 8 CESHONE VIENI aiar ii 20 Pagina ii BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 8 1 La schermata Utenti aisen 20 8 2 Aggiunta di UM NUOVO UTENTE isana E ENA 21 8 3 Modifics drun Utente seorsan E lia 21 8 4 Rempostaz one drunai Pass WOTA aarin N 21 8 5 Cancellazione diuUnmuUtente esenee a a A 22 8 6 CimMmbodela Dass WOA aranne E A N 22 9 GESTIONE PAZIENTI lcd 23 9 1 RICErca del PaZIenll online 24 9 2 ordinament brio one RR 24 9 4 Modificazione di un paziente gi inserito i
63. Bja Mi 0 Pi 00 Available HLA B Tests Mike Jones Michel Svensson Pippi Langstrumpf Peter Muller Jim Brown John Smith JS 1 2 MB 12 09 201 e che possono essere prenotati nella lista di lavoro il tasto New Nuovo aprir una nuova finestra di dialogo e consentir di aggiungere qualsiasi test proposto dalla lista Il tasto Import Importa m invece consente di importare un file csv che contenga altri test che si desidera direttamente aggiungere alla lista dei test disponibili Cliccando sul tasto x verranno cancellati i test proposti e senza risultato associato e cliccando sul tasto Donald Duck DD 1 P E B 12 09 201 amp di aprir la finestra di modifiche al campione dove sar possibile prenotare o cancellare test Se si desidera aggiungere i campioni importati direttamente alla lista di lavoro selezionare l opzione in basso a sinistra i Automaticaliy Add Imported Samples 11 4 3 Aggiunta di un campione con lettore di barcode Quando viene aperta la finestra di creazione di una nuova lista di lavoro possibile aggiungere campioni con un lettore barcode basta leggere il barcode con la finestra aperta Si aprir automaticamente una finestra per il nuovo campione e il barcode verr inserito come ID campione Procedere quindi con l aggiunta dai test che si vogliono prenotare gt Worklist ID W 2011 11 15 11 24 14 V Available Tests Patient Sample Locus
64. Date gt gt Selected x 11125894777 Patient Id Name Do8 x Sample ID 11125894777 1 15 11 2011 Status Initial Tests y A Status Initial Date 15 11 2011 10 24 30 Worklist j B Status Initial Date 15 11 2011 10 24 31 Worklist j DRBI Status Initial Date 15 11 2011 10 24 32 Worklist BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 11 4 4 Creazione del layout della piastra Questa finestra di controllo mostra il layout della piastra per la nuova lista di lavoro Le caselle nere rappresentano i pozzetti vuoti disponibili per la prenotazione di nuovi test mentre le caselle colorate rappresentano pozzetti in cui sono gi stati prenotati test ogni colore associato a un locus differente Esistono diverse modalit per l inserimento di nuovi test in una lista di lavoro Doppio click Effettuando un doppio click del mouse sul test nella lista di quelli disponibili lo stesso verr aggiunto alla piastra nella prima posizione successiva disponibile HISTOMATCH raggrupper i test sullo stesso locus nella stessa strip Trascinamento Uno o pi test selezionati nella lista di quelli disponibili possono essere trascinati su una qualsiasi posizione evidenziata in nero nel layout della piastra che rappresenta la lista di lavoro In questo modo possibile creare delle strip con una miscela di loci a piacimento dell operatore E anche possibile spostare successiv
65. O BAG tam CARE El HISTO MATCH CE IVD Istruzioni per l uso VERSIONE 14 2015 CAMBIAMENTI RISPETTO ALLE VERSIONI PRECEDENTI Versione Data 12 2014 17 06 2014 13 2014 09 10 2014 14 2015 06 01 2015 BAG Health Care GmbH AmtsgerichtsstraBe 1 5 35423 Lich Germany Tel 49 0 6404 925 0 Fax 49 0 6404 925 250 Versione SW HISTO MATCH V2 4 HISTO MATCH V2 4 1 HISTO MATCH V2 5 www bag healthcare com info bag healthcare com Descrizione Aggiornamento miglioramenti vari Eliminazioni bug software aumento nella velocit di interpretazione interpretazione ristretta modifica dello stato di ambiguit eliminazione di batch inutilizzati Migliorata visualizzazione dei risultati differenziazione tra le classi di alleli CWD nelle schermate di analisi e referti algoritmo di interpretazione migliorato Auftragsannahme Ordering Tel 49 0 6404 925 450 Fax 49 0 6404 925 460 verkauf bag healthcare com Customer Service Tel 49 0 6404 925 125 Fax 49 0 6404 925 421 service bag healthcare com BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 INDICE 1 IRtFOOUZIONE cn 1 2 Perea Hare 1 2 1 HiN calo 1 2 2 Sistema QD VO ria 1 3 STRUTTURA DEL SOFTWARE HISTO MATCH iii 2 dal Pa2IGNUe CIMPION Lina 2 3 2 Lte dravo O elia rin 2 3 3 ES See E A 2 3 4 Kit Joti epN SO ia 2 3 5 KEELT P oa E iii 2 4 InstallaZionE E GESTIONE DEL DATAB
66. OK La lista di lavoro verr importata e le immagini salvate direttamente nel database HISTO MATCH effettuer in automatico il gridding delle immagini l interpretazione dei risultati e aprir la finestra di analisi delle liste di lavoro allo scopo di rivedere i risultati Pagina 45 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 11 10 2 Importazione tramite rete Una lista di lavoro processata pu essere importata direttamente attraverso una rete LAN utilizzando la funzione Import Worklist Importa lista di lavoro presente sulla schermata viola di gestione degli strumenti collegati si veda il capitolo 12 4 o dalla schermata delle liste di lavoro una icona relativa a MR SPOT comparir al fianco della lista di lavoro attualmente in processa mento l icona lampeggiante indica che pronta per l importazione cliccando sull icona sar possibile importare direttamente senza passare dalla schermata degli strumenti collegati 11 11 Esportazione di una lista di lavoro Per le liste di lavoro che sono state analizzate disponibile la funzione di esportazione Sono disponibili quattro formati di esportazione Text Export i risultati dei test presenti nella lista di lavoro vengono salvati in un file di testo il cui formato molto semplice Posizione del test o ID campione Risultato in bassa ris Risultato in alta ris per ogni test sulla lista di lavoro CSV Export come nel caso preceden
67. S 20 125 274 22 26 125 274 26 L 30 125 274 42 49 125 274 9Y A Y QJ L 15 125 274 8 I D A E 12 B 7 S 12 71 A P E NG 77 94 Y 100 96 N Y 100 un Dani A mel Z AQ 110 AC Cuan 2 NC cCrinn Cliccando sul tasto Probes Sonde verr mostrata la tabella con l elenco delle sonde In essa sono contenute le informazioni relative all intensit della sonda alla sonda di controllo usata come riferimento al cutoff considerato nel calcolo Muovendo il mouse sopra la barra di intensit viene mostrato il calcolo utilizzato per determinare il valore della sonda Nelle due ultime colonne vengono indicati il sito di legame della sonda e l esone Pagina 72 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 14 17 Storico ARE REST Hitoy mm Date User Change Old New 23 09 2011 16 43 Kristin Test Authorization Un Authorized Authorized 23 09 2011 16 47 Kristin Technical Authorization Un Authorized Authorized 28 09 2011 16 47 Kristin Test Interpreted 10 23 09 2011 16 47 Kristin Probe 35 B844 In Use False 28 09 2011 11 53 Kristin Test Interpreted 23 09 2011 11 44 Kristin Gridded In questa finestra vengono mostrati tutte le modifiche effettuate dall operatore per ogni test 14 18 Commenti ai risultati Utilizzare questa finestra per aggiungere eventuali commenti sui risultati Premere il tasto Add Aggiungi commento FI MRa Probes ONT Comments r g Date 13 11 2012
68. STO MATCH 4 5 2 Modalit Server Database Tools lina Eh RE Version 1 0 0 Size 4 99 MB e Selezionare Nuovo si _ 8 Create Database e Inserire un unico nome del database la finestra di testo sar bordata in rosso se il nome del database non unico o assente Pagina 9 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Nella finestra di dialogo Save file selezionare una destinazione e nome per il nuovo file e Verr creato un nuovo database vuoto e Gliutenti kit dati di installazione ed impostazioni esistenti saranno copiati al nuovo database e Selezionare sl per scegliere il nuovo database e proseguire con l avvio di HISTO MATCH 4 5 3 Mostra il nome del database corrente Il nome del database correntemente in uso pu essere visualizzato in qualsiasi schermata cliccando sul numero di versione di HISTO MATCH nell angolo superiore destro HISTO MATCH HISTO MATCH 2 0 1 18 BAG 02 2013 5 AVVIO DI HISTOMATCH Dopo l installazione viene creata una icona di avvio sul desktop del computer e un collegamento dal men Start di Windows Per avviare il programma cliccare su una delle due posizioni Come illustrato nella schermata di avvio il programma tenter di connettersi al database locale Pagina 10 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 HISTO MATCI Versioni 20 Copyright 2012 MC Diagnostics Ltd
69. a di lavoro in HISTO MATCH John Da 1 HLA B H H H H H NH Jo Jones 3 HLA B 3 David Mil 3 HLA B Un file templato di modello in formato Excel disponibile dall area web Service BAG http service bag healthcare com Utilizzando il templato il foglio di lavoro in excel verr convertito nel corretto formato csv Richiedere i dati di accesso all area web Service BAG al vostro distributore locale PatientiD ID paziente Si tratta dell ID univoco del paziente FirstName amp LastName Nome e Cognome Il nome del paziente DoB data di nascita Data di nascita del paziente deve combaciare col formato data impostato SampleID ID campione Si tratta dell ID univoco del campione Locus Si tratta dei test disponibili ad es A HLA A HLA A e analogamente B C DRB1 DRB345 DQB1 DPB1 o COE Il file di testo pu essere importato utilizzando il bottone Import Importa nella schermata principale oppure il tasto i nella schermata grigia delle liste di lavoro Nel campo di richiesta del file di importazione selezionare CSV Worklist e identificare la lista di lavoro d interesse Dopo l importazione verr mostrata la schermata di modifica della lista di lavoro Pagina 40 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 11 6 Modifica di una lista di lavoro esistente Le liste di lavoro possono essere modificate solo fino al momento in cui vengono esportate ossia
70. a nuova lista di lavoro nella schermata delle liste di lavoro Verr mostrato lo schema di layout gt Worklist ID W 2011 09 27 17 46 22 V Available Tests Patient Sample Locus Date na HLA A Tests R John Smith Available HLA B Tests John Smith 27 09 20 Jo Jones 27 09 20 David Bowie 27 09 201 i ii I ii ijl i w i Donald Duck 12 09 201 Jim Brown 12 09 20 John Smith 12 09 20 Lena Meyer 2 09 20 Mike Jones 12 09 201 Michel Svensson 12 09 201 Pippi Langstrumpf 12 09 201 Available HLA C Tests Donald Duck 12 09 201 Jim Brown 12 09 20 John Smith 12 09 20 Lena Meyer 12 09 20 Mike Jones 12 09 20 Michel Svensson 12 09 201 v 4 y Selected x 11 4 1 ID della lista di lavoro In automatico viene creato un ID per la lista di lavoro da parte di HISTO MATCH ma pu essere modificato a seconda delle proprie esigenze L ID deve essere univoco Espandendo il campo dei commenti possibile aggiungere delle note dopo aver selezionato il tasto Add Aggiungi Worklist ID 2012_11_05 ABDR Comments A Pagina 37 BAG Health Care GmbH 11 4 2 Test disponibili HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 gt Worklist ID W 2011 09 13 14 12 11 Questa finestra di controllo mostra i test al momento disponibili v Available Tests Patient Sample Locus Date Available HLA A Tests Donald Duck Jim Brown John Smith m Ba Mi e
71. a superimposizione La funzione pu essere attivata nella schermata Setup 1 Scegliere Setup dal men principale Home Patients Samples Worklists z i Processors 2 Selezionare Image Analysis Analisi immagine 3 Spuntare Auto Rotate Images Autorotazione immagini g BAG HEALTH CARE mao P User Reports Image Analysis nie MAuto Rotate Images Interpretation Installation Image Analysis Tools Database Tools 13 4 2 Rotazione manuale dell immagine Pagina 52 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Le immagini possono essere ruotate manualmente nella finestra View Array Visualizza immagine Array Quest operazione potrebbe rendersi necessaria nel caso in cui la funzione di autorotazione disattivata o l orientamento automatico non stato finalizzato 1 Nella schermata di analisi delle liste di lavoro scegliere View Array Vedi Array Worklist ID 2012_11_05 ABDR Pikkis i A a bo Sample ID 1 Status Initial Suggested Result sEm x lt y A 02 A 02 DISSET ESS OOOO OOOOOOO0OO OOSOOoSoSoSoOoO OOOOO0OOOO OOOOOOOO OOo Slesia Siess B g g g g g O g 3 L immagine pi grande mostra il match delle sonde effettuato con la miglior rotazione possibile rilevata dal software Scegliere manualmente l immagine con la corretta rotazione Gli spot in conseguenza della rotazione dovrebbero essere allineati orizzo
72. aiar 60 o2 Fo PErgiPalie Co nisi 61 14 6 3 Opzioni di visualizzazione del campo di sommario 63 1464 Codilica NMD P lalla 64 Pagina iv BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 ld 6 5 Eguivalentiserologici aciceelca 64 14 6 6 Visualizzazione risultati per DPB1 i 64 14 6 7 Controllo nes4atVvo L a Liliaceae 64 14 7 lenorare manualmente esond essa alata 65 14 8 FUNZIONE GLAUTO 60 tirratnra ioni 66 14 9 Esecuzione di un interpretazione ristretta i 66 14 10 Interattivit tra la visualizzazione dei risultati e l immagine del test 66 14 11 Visualizzazione della reattivit di una sonda e modifica al cutoff 69 1412 Specificitadelle sonde ulllliaila 70 14 13 Visualizzazione del pattern di reattivit di un allele 71 4 44 Nomencaturna a liceali lai 71 14 15 Autorizzazione Ger tisullaliali al 72 ld lo Dettagli delle sonde aaa 72 lab SON CO ii li aa lia ale 73 1418 Commentirarrisultati ene 73 14 19 Interpretazione risultati del kit HISTO SPOT Coeliac Disease e DQB14D DOA1 74 14 19 1 Visualizzazione risultati per celiachia 74 14 192 Interpretazione DOBI DOAL aisi 75 15 INTERPRETAZIONE DI TEST HISTO TIPE SSP aggirarsi 77 15 1 limportazione di n typing Ksenia AE 77 15 2 Definizione di pazienti campioni e test i 77 15 3 Interpretazione del
73. amente all interno del layout della piastra i vari test a proprio piacimento in qualsiasi posizione vuota disponibile Aggiunta di un locus Cliccando sul tasto a fianco del nome che identifica il locus possibile aggiungere tutti i test disponibili per l analisi di quel dato locus test verranno in automatico aggiunti alle strip con ciascuna strip assegnata a un locus diverso e in numero pari ai test necessari Per cancellare i test dal layout piastra selezionare il test sul layout cliccandoci sopra Viene attivata la finestra di controllo Selected Test Test selezionato fe GO Questa finestra di controllo pu essere espansa per mostrare pi informazioni relative al test selezionato Sample JB 1 Cliccando sul tasto Remove Elimina verr D cancellato il test dalla lista di lavoro ed andr ad aggiungersi a tutti gli altri presenti nella lista di quelli disponibili E possibile effettuare tale operazione anche trascinando il test dal layout alla lista dei test disponibili Pagina 39 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Cliccando su Save Salva aa verranno salvati i cambiamenti alla lista di lavoro e si aprir la finestra di dialogo per l invio della lista di lavoro allo strumento si veda la sezione 11 9 Cliccando su Cancel Cancella gt E modifica introdotta verr abortita e verr chiusa la finestra di visualizzazione In qualsiasi momento durante la
74. ate Analyzed 07 11 2014 Approved By Date Approved Authorized By Date Authorized Kit HIST O SPOT A Batch 112 9 Expiry 11 2015 Hit Table Hit Table A112 IMGT db 3 15 0 ver 25 04 2014 Method SSO Suggested Result Summary A 01 A 02 Filter Display All Alleles Group Result A D1 A 02 Allelic Result 2 A 01 01 01 01 01 04N 01 09 a ot 01 0218 0t 01 02 01 01 08 01 01 05 01 01 08 01 01 07 01019 010140 MOAN Ltd MAIS 01 01 17 01 01 18 01 01 18 01 01 24 01 0Y21 01 01 221 01 01 24 01 01 24 01 01 27 01 01 29 01 03 34 01 01 23 01 01 38 01 01 38 01 01 281 01 01 39 01 01 40 01014 1 01 07 AY 01 01 32 01 07 44 01 01 457 01 01 48 DOSU 01 01 53 01 01 84 DEOLSG POLST OLOLA DI1INI 01 TGA 01 18 01 22 01 24 01 20 01 32 01 38 01351 01 38 01 37 01 38 01 BN 01 40 01 41 01 42 01 44 01 48 01 47 01 48 01 50 OVSINI OTSIN OSE 01 55 DESEN 01 STNI 01 58 01 68 01 81 GY DTS OBI 01 TO DIF OT 01 78 01 77 OTE TN OBN 01 81 01 82 01 84 01 88 01 86 0187 01 58 01 90 01 91 01 92 01 92 01 94 01 98 01 97 01 100 01 101 01 10 01 105 01 198 01 107 01 10 O11 10 01 111 01112 01 1132 01 115 01 116 01 117 01 118 OY 120 01121 O1 122 O1 123N 01 12 01125 01 129 OTIN DIIN ON TIN 01 137 0 138 01 139 Ot TAU 01 14 01 142 01 144 01 130 A 02 01 01 01 02 01 04 02 09 02 20 01 02 24 01 02 29 02 30 02 33 02 34 02 53N 02 74 01 02 93 02 96 02 119 02 123 02 01 01 02L 0201 01 04 02 01 021 02 01 06 02 01 06 02 01 07
75. azione locale o di una rete costituita da un massimo di 10 computer client Nel caso in cui sia necessario avere l applicativo disponibile per un numero maggiore di utenti o laddove la quantit dei dati si presume possa eccedere il limite di 4 GB necessaria la versione completa del Server SQL L applicativo pu essere in alternativa direttamente collegato via LAN allo strumento MR SPOT Pagina 1 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 3 STRUTTURA DEL SOFTWARE HISTO MATCH 3 1 Pazienti e campioni HISTO MATCH pu conservare informazioni riguardo ai campioni obbligatorie e opzionali quelle relative ai pazienti associati a un determinato campione 3 2 Liste di lavoro SSO Per procedere ad un analisi necessario creare un test da associare a un determinato campione ed aggiungere il test alla lista di lavoro Una lista di lavoro un gruppo di test che verranno processati in blocco dallo strumento MR SPOT Ogni lista di lavoro pu contenere qualsiasi combinazione di test della gamma HISTO SPOT SSO 3 3 Test SSP Per eseguire un analisi di tipizzazione SSP necessario creare un campione ed aggiungergli un test con il lotto in uso Effettuando un doppio click sul test si aprir una finestra di interpretazione Per informazioni pi dettagliate consultare il capitolo 15 del presente manuale 3 4 Kit lotti e batch SSO All interno del database si trovano i file relativi ai diversi kit
76. campioni che risulter vuota la prima volta che viene aperta f Samples Open Samples Sort By m Crea un nuovo campione Add Modifica campione selezionato Edit Pagina 28 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 m Cancella campione selezionato Delete b ul Importa campioni da file Importi ia Referta il campione selezionato Report 10 1 Ricerca di campioni E possibile effettuare una ricerca dei pazienti nell apposito campo Inserire il nome nel campo di ricerca e premere enter o cliccare il tasto P E possibile ricercare i campioni tramite ID o nome paziente campioni che corrispondono al criterio di ricerca selezionato saranno mostrati in una lista sottostante Samples 10 2 Ordinamento E possibile ordinare la lista dei pazienti cliccando sul men a tendina Sort by Ordina per E possibile invertire la direzione dell ordinamento cliccando nuovamente sul campo scelto 10 3 Aggiunta di un nuovo campione I campioni possono essere inseriti via importazione di un file di testo si veda oltre o aggiunti individualmente come viene qui di seguito descritto 1 Selezionare il tasto Add Aggiungi ha schermata di ricerca dei campioni E necessario inserire un ID campione prima di aggiungere qualsiasi test Pagina 29 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 T Patient Id Name bi 3 DoBi
77. corretto 2 CWD vengono automaticamente poste nello stato inattivo Quindi le sonde che erano automaticamente ignorate durante la fase iniziale di interpretazione ma che corrispondono al pattern di reazione del risultato assegnato alla fine vengono riattivate e utilizzate per l interpretazione Ci consente di ridurre le ambiguit dovute alla minor risoluzione determinato dall ignorare sonde che reagiscono correttamente 14 9 Esecuzione di un interpretazione ristretta Questa funzione consente di aumentare di molto la velocit di interpretazione ignorando le combinazioni di due alleli rari L interpretazione ristretta di default inattiva ma pu essere attivata entrando in Impostazioni Setup e Interpretazione User Reports Interpret Setup Filter Default Maximum Mismatches 1 Nomenclature Default Maximum Probes to Ignore ET interpretation Installation Image Analysis Display Combined Locus Results Tools j i Paths Y Perform Restricted Interpretion L Automatically Edit Results Database Tools Summary Type 4 Digit 5 Nell interpretazione classica tutti i pattern di reazione possibili desunti dalla hit table vengono confrontati con il pattern di sonde positive ottenuto per calcolare il risultato possibile Ci implica una notevole mole di dati circa 1 5 milioni di combinazioni possibili per il locus B Dato che la combinazione di due alleli rari estremamente improbabile che si verifichi
78. dalla finestra principale verr visualizzata la schermata degli strumenti collegati al PC w Mr Spot trp ocMMPoi7iiitio Crestet 11 11 2010 Performed 11 11 2010 il RUN 2 11 10 10 pa a Crested 11112010 Perfom d 1111200 TEST 12 11 10 m z p DRY RUN 15 11 10 Crested 1511 2010 Performed 15 11 2010 RUN 2 12 11 10 Crestet 12 11 2010 Performed 12 11 2010 2010 11 22 FAST Crested 22 11 2010 Performed 22 11 2010 2010 11 19 C022 SAMPLE Crested 19 11 2010 Performed 19 11 2010 Questa schermata composta da tre parti 12 1 1 Lista degli strumenti Questa finestra di controllo mostra l elenco degli strumenti attualmente collegati al software e fornisce le funzioni per l aggiunta hea o la cancellazione Ga Pagina 47 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 12 1 2 Strumento selezionato Selected Processor Questa finestra di controllo mostra lo strumento attualmente selezionato fra quelli disponibili nell elenco e consente di riconnettersi nel caso in cui sia stato perso il collegamento premendo il Workdists tasto di riconnessione ici di importare una lista 21 01 2011 iaia di lavoro eseguita dallo strumento G di 230910 l ni cancellare una lista di lavoro 20 01 2011 Dote Crest 9 2001 2011 Date Performeg 20 01 2013 16 11 2010 Date Crested 16 11 2010 Date Performegd 16 11 2010 15 11 10 TWT Dote Cre
79. di analisi mostra i risultati ottenuti dall interpretazione Con le impostazioni standard verranno mostrati i risultati possibili a 2 digit il numero di mismatch se presenti che l algoritmo di calcolo ha considerato per fornire un dato risultato la frequenza degli Pagina 81 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 alleli colonna CWD in verde gli alleli C in blu gli alleli WD in grigio gli alleli rari t z alba s8 7 E 14 180089 15 16 17 48 10 MR 01 LJ 1907 175 650 pia 225 195 Lig 400 on 175 125 fia 200 105 ei 138 650 445 420 175 190 390 sud 500 GrmupAllele MM Ew sa a AA o 0 E A 33 A3301 6 pei CI ami 10 gt A SB ATGE 1 O aai i 0 1 A 33 AESH 1 0 EF il E A D3 A3301 1 0 6 ADR AHNE i 6 N ARTT ASTI 1 A A211 A SADI i_ bai is i Vengono mostrate le mix di primer insieme alle dimensioni della banda positive Le mix di primer che risultano positive sono evidenziate in verde risultati con zero mismatch e che includono combinazioni di due alleli comuni sono evidenziati in verde dipende dal filtro selezionato risultati con un solo mismatch che includono una combinazione di due alleli comuni sono evidenziati in rosso Le dimensioni della tabella possono essere modificate con il tasto slider nell angolo in basso a sinistra o ruotando la rotella del mouse e contemporaneamente tenendo premuto il tasto CTRL Il numero tra parentesi do
80. dotto un referto standard in formato ridotto per la lista di lavoro in esame il campione o il paziente selezionato si veda oltre La modifica delle altre opzioni non avr alcun effetto sui referti riassuntivi Se si seleziona Print Uncombined DRB1 345 results i risultati per questi loci saranno riportati separatamente Pagina 88 BAG Health Care GmbH 16 1 Referto riassuntivo HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Tale referto mostra il risultato di ogni singolo test su singola riga e contiene le seguenti informazioni Posizione ID Risultato a 2 digit o a pi digit con filtro allelico attivato kit batch versione IMGT data di analisi Il referto occupa al massimo 3 pagine lista di lavoro con 96 test Questo referto verr prodotto se si seleziona il comando Stampa lista di lavoro compatta nelle impostazioni alla sezione Referti Worklist 2012 11 05 ABDR Date 06 11 2012 Sample ID j Ln edi RI run ei HH Da g 1 2 3 4 5 7 E 16 2 HISTO MATCH Worklist Position Worklist 2012_11_05 ABDR G3 Patient Mame Petar Pan DoB Sample Received 06 11 2012 Extraction Date Performed Analyzed By BAG Date Analyzed 06 11 2012 Approved By Date Approved Authorized By Date Authorized Kit aten Expiry Hit Table Method Filter Summary Serology Possible NMDP Group Result DRBI1 14 DRB1 15 Could Not Exclude DRB1 14 50 61
81. e La disponibilit delle diverse funzioni dipende dal tipo di ruolo assegnato a ciascun utente Il men consente l accesso alle seguenti funzioni Home Inizio Reindirizza l utente alla schermata iniziale Patients Pazienti Indirizza l utente verso la schermata pazienti Samples Campioni Indirizza l utente verso la schermata campioni Worklists Liste di lavoro Indirizza l utente verso la schermata delle liste di lavoro Kits Indirizza l utente verso la schermata kit Users Utenti Indirizza l utente verso la schermata utenti Processors Strumenti Indirizza l utente verso la schermata di controllo MR SPOT Setup Consente l accesso alle opzioni di impostazione Log Off Uscita Disconnette l utente attuale 8 GESTIONE UTENTI Il sistema richiede che ogni utente sia registrado con nome di accesso e password univoci Agli utenti inoltre necessario assegnare almeno uno dei tre ruoli disponibili 8 1 La schermata utenti In questa finestra possibile visualizzare tutti gli utenti che possono accedere al software Users Pagina 20 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 8 2 Aggiunta di un nuovo utente 1 Cliccare sull icona Add Aggiungi 2 Compilare la finestra di dialogo Edit User Modifica utente Cee Ver Name Nome utente Nome di accesso dell utente Roles Ruoli Selezionare i ruoli desiderati K User DQAdministrator e Supervisor
82. elete Cancella In alternativa possibile importare una lista completa da un file di testo con il tasto E anche possibile copiare gli alleli sia dalla lista CWD o 4D e incollarli nella lista definita dall utente utilizzando i tasti i comandi standard di windows ctrl a seleziona tutto ctrl c copia ctrl v incolla g BAG HEALTH CARE ua DE ea Default Results Filter A Filter Da Nomenclature Display All Alleles Interpretation Display CWD Alleles Installation Dee Image Analysis Display 4D Alleles Tools 2 Display User Defined Alleles Database pE CWD amp Core Alleles C 9 Allele DRB1 01 02 01 Allele MDRB1 01 01 01 14 6 3 Opzioni di visualizzazione del campo di sommario Esistono diverse opzioni per la visualizzazione dei risultati nel campo del riassunto risultati Le impostazioni di default possono essere selezionate nella finestra Setup della sezione Interpretazione o per il singolo test nella finestra di interpretazione cliccando col tasto destro del mouse sul bottone blu User Reports Interpret Setup Filter Default Maximum Mismatches Nomenclature Default Maximum Probes to Ignore interpretation installation H Automatically Edit Results Image Analysis Display Combined Locus Results Tools Paths Perform Restricted Interpretion Database Tools Summary Type Auto Auto 4 Digit 2 Digit P Group G Group
83. fettua automaticamente la superimposizione i della griglia di interpretazione Interpret All Interpreta tutti i test non ancora analizzati alle 14 2 Visualizzazione della piastra Viene mostrato lo stato di ogni test nella piastra eseguita Passaggio al pozzetto precedente successivo o al prossimo risultato ambiguo non definito Navigation buttons Verde risultato non ambiguo con alleli comuni S i Sd E DI 5Ee9Y 5EC Viola aplotipo comune o risultati rari cdl dC CECE ZA Pm ED per gt L n di e SE Sr Giallo risultato ambiguo alleli comuni o rari non valido per DPB1 gogg K hi SAAS ha Rosso nessun risultato ES J ia n w ji nm E DI I ll O Q i dt r i psv i i pl Grigio rosso le sonde di controllo sono fallite per uno dei loci del test combinato DQB1 DQAI1 o per celiachia mi 006 J O f i i A g SE fy 1 i U ine i E1 g dii i Toe i OOO Il e la ta _ nil Pre lr Pagina 55 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Il segno di visto indica che il risultato stato autorizzato L operatore pu vedere i dettagli del singolo test cliccando sul pozzetto relativo Il colore in background di ogni test indica il locus Ga Interpret All Ilole Statu Group B1 2 HLA A 02 amp 03 Ci
84. i definite per i campioni e i test si veda la sezione 11 5 10 6 Visione dei risultati a partire da un campione E possibile visionare i risultati relativi a test eseguiti per un determinato campione identificare il campione di interesse ed espandere la schermata dei relativi test quindi evidenziare il test di interesse facendo un doppio click o selezionando il tasto verde Interpret si aprir uno schermo con l interpretazione del test per dettagli si veda la sezione 14 A103 SCORE B1 Patient Id Name i DoB Sample ID A103 SCORE B1 l Status Initial 24 23 09 2013 Tests e HISTO SPOT A A A 02 03 01 A 29 01 01 01 Status Analysed Date 23 09 2013 07 11 16 Worklist A103 SCORE B1 HLA DRB HLA DQB1 HLA DPBI Pagina 33 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 11 GESTIONE DELLE LISTE DI LAVORO HISTO MATCH organizza i test in prenotazione e che devono essere analizzati o sono nt stati analizzati in una lista di lavoro che pu contenere fino a 96 test organizzati in formato che ricalca quello della micropiastra Cliccare su Worklist Lista di lavoro dal men principale per aprire la schermata delle liste di lavoro Verranno mostrate tutte le liste di lavoro salvate nel database fino alla data attuale i Worklists P Open Worklists W 2011 0908 09 41 58 Gabs Analysed Status 14 09 2011 Status Initial Aggiungi una nuova
85. i in una rete locale l operazione potrebbe richiedere qualche minuto per essere completata E inoltre possibile direttamente inserire un nome del server manualmente se richiesto Selezionare la modalit di autenticazione a seconda della configurazione del server il nome utente e la password se richiesti Selezionare il tasto di connessione per provare a connettersi Se il tutto funziona verr tentato di trovare dei database di HISTO MATCH sul server r R Database Tools DE Ek Getting Databases ss i b S Tutti i database saranno mostrati in una lista e saranno disponibili varie opzioni Pagina 6 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Data Source John PC SQLEXPRESS i Database 1 0 3 Version 1 1 0 Size 1072 00 MB Server John PC SQLEXPRESS Database e Rinnova rinnova la lista dei database dal server e Nuovo crea un nuovo database E necessario indicare un nome unico del database selezionare un nuovo nome del file utilizzare il tasto di browsing per selezionare il file assicurarsi che il file venga creato in una destinazione a cui tutti gli utenti possano avere accesso e Aggiorna questa opzione disponibile se il database selezionato una versione 1 0 o 1 1 che verr cos aggiornata alla versione 1 2 per HISTO MATCH 2 1 e successivi e Aggiungi aggiunge un file di database esistente al server e Rimuovi
86. i nome numero batch lotto o locus Solo i batch corrispondenti ai criteri impostati saranno mostrati nella lista sottostante 6 6 Ordinamento dei batch E possibile modificare l ordine nella lista selezionata cliccando su Ordina per e selezionando il campo di interesse Selezionando nuovamente viene invertita la direzione di ordinamento nella lista Pagina 18 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 7 SCHERMATA INIZIALE E E amp A Patients Samples Worklists Processors Setup Log Off E possibile tornare alla schermata iniziale in qualsiasi momento cliccando sulla relativa icona in basso a sinistra Le funzioni principali accessibili dalla schermata iniziale sono le seguenti Search Cerca Consente l accesso alle funzioni di ricerca generali New Nuova Crea una nuova lista di lavoro SSO Combistrip Lista di lavoro combinata Crea una nuova lista di lavoro con test di tipizzazione on call Import Importa Importa un file csv oppure una lista di lavoro processata da MR SPOT e New sample Nuovo campione Crea un nuovo campione Pagina 19 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 7 1 Il men principale A R 7 l Home Patients Samples Worklists kits sen Processors Setup Log Off pi H du f si y T C Il men principale accessibile da diverse schermate all interno del softwar
87. i saranno mostrate solo le combinazioni di due alleli comuni come risultato ad alta risoluzione Sotto questo campo c una lista di alleli rare che non possono essere esclusi Dopo aver premuto il tast di refresh il codice NMDP e l equivalente serologico mostrati si riferiscono solo agli alleli comuni Lo stato di ambiguit del test evidenziato con colore giallo del pozzetto e dall intestazione del sommario risultati viene modificato conseguentemente al filtro applicato nel caso in cui l ambiguit coinvolga un allele raro Se non c ambiguit una volta selezionato il filtro scelto il pozzetto muta colore da giallo a verde e il sommario risultati non avr pi l indicazione di un risultato ambiguo nell intestazione Scegliendo Tutti lo stato del test torna nuovamente ambiguo 10 I RO GEO Suggested Ambiguous Result EO E so Suggested Result l Summary A 03 A 23 serclogical Equivaen 75A bd lo Assigned NMDP A 03 01 A 23 01 Possible NMDP A 03 01 01 01 A 23 01 01 Summary A 03 A 23 A 03 Serological Equivalent A3 A23 Bw4 lo BICI Possible NMDP A 03 01 01 01 03 01 01 03 03 01 03 03 17 01 03 21N 03 22 01 03 26 A A 03 01 01 01 03 01 01 03 03 01 03 03 17 01 03 21N 03 22 01 03 26 A l_____x dA A 03 01 01 01 03 01 01 03 03 01 03 03 17 01 03 21N 03 22 01 03 26 A 23 15 A 03 01 02 A 23 01 01 23 03 01 23 06 23 17 23 19Q A 03 08 A 23 01 01 23 03 01 23 06 23
88. idist ID W 2012 10 18 Patient W 2012 10 18 D3 E Sample ID W 2012 10 18 D3 Status Initial a PMR Xx y y Suggested Result Common Haplotype Summary i Serological COL ZZZ sso ld RA Cannot Exclude C 04 18 31 43 53 58 65 07 01 02 01 03 01 04 01 05 01 06 01 l 01 22 01 24 07 09 16 21 24 30 35 36 44 52 57 58 59 65 69 Hit Table C042 IMGT 3 8 0 sro pna gzosdnyassaanbie MT TT pa Probe Cw319 2 Specificity C 04 01 01 01 04 07 i 30 18 2 09 C 04 01 01 01 04 07 i 30 18 1 00 C La sonda evidenziata da un bordo arancione nella tabella dei risultati verr evidenziata anche nella finestra dell array nel pozzetto con un quadratino rosso e viceversa Il colore di ogni cerchio indica lo stato otype della sonda Verde sonda di controllo S Blu sonda negativa Rosso sonda positiva Nero sonda ignorata 01 03 01 04 01 05 01 06 01 5 36 44 52 57 58 59 65 69 Bianco sonda inattiva non funzionante Spostandosi in modalit di visualizzazione dei risultati sul test successivo automaticamente avverr anche lo spostamento sull immagine dell array del III WII pozzetto successivo E quindi utile lasciare aperta la finestra con l immagine RW I E In use Probe Cw319 2 Specificity Cut Off nta dell array del pozzetto durante tutto il processo di interpreta
89. iente gi inserito Per modificare un paziente gi inserito nel database Ricercare il paziente da modificare Cliccare sul tasto Edit Modifica o fare un doppio click sul nome del paziente nella lista Verr mostrata la schermata di modificazione del paziente Sb UU N E Tutti i campi possono essere modificati E possibile aggiornare inserendo nuovi campioni e o test Una volta inserito un nuovo paziente o modificati i suoi dati possibile accedere ad altre schermate del software utilizzando il men principale che si trova in basso sullo schermo Ci consente di modificare pazienti multipli o pazienti ed altre informazioni in contemporanea pazienti su cui si stanno eseguendo delle modifiche risulteranno inclusi in una lista aperta di pazienti Open Patient Per tornare al paziente da modificare fare doppio click sul nome d interesse L Patients Se Open Patients PatientID v BE i Pi t T ID 1 2 Name Peter M ller Patient ID 2 Name John Smith Name Jim Brown Name Lena Meyer Name Donald Duck Name Michel Svensson Name Pippi Langstrumpf Name Mike Jones 9 5 Assegnazione di campioni esistenti Quando si aggiunge o modifica un paziente possibile assegnare campioni gi esistenti dal database 1 Selezionare il paziente da modificare cliccare Edit Modifica ben o fare doppio click sul nome del paziente 2 Cliccare il tasto Select Scegli le a Select a Sample 3 Selezionare
90. ina 16 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 225 1 2 25 2 2 26 2 27 2 28 30 3 1 32 33 3 4 3 5 3 6 3 7 3 8 39 3 10 A l pi Gen AR QBI Batch Name 1QB1 018 2 PRO Verfalisdatum 30 0 05 20 Di4 I MGT FDB 225 1 22 25 2 2 2 62 227 7 2 28 B 303 1 323 3 34 353 6 3 7 Db DS 0 Bati ch Name B 075 4 I file kit per SSO ed SSP possono essere discriminati dal tipo di icona al HISTO SPOT SSO kit i HISTO SPOT On Call Typing kit BE HISTO TYPE SSP kit HISTO SPOT Coeliac Disease Kit Se si selezionano le icone B nell angolo superiore destro della schermata possibile passare dalla visualizzazione in modalit elenco a quella in modalit icone o viceversa go Pr B Low B081 D008 aoa E sa A Low Psr F 2 _ f i o T mon le saro E owa l bagal o am B078 Bozz I HISTO SPOT A A097 Batches A0974 a 037 2 e Neil In quest ultima modalit vengono mostrati tutti i lotti disponibili Dopo aver cliccato sul simbolo si mostrano tutti i batch disponibili per il lotto corrispondente 6 5 Ricerca dei batch E possibile ricercare i file batch di interesse utilizzando la barra di ricerca Locus BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Inserire i criteri di ricerca nella barra e premere il tasto di invio o l icona con la lente di ingrandimento P I batch verranno elencati in ordine d
91. isultati Serological Equivalent A1I ANUIVA A23 x ANUW amp ________ singoli cliccando sul tasto RE nella finestra dei Assigned NMDP A 11 XX A XX XX o o gt A 11 A 23 risultati suggeriti oppure nella finestra principale dei dali risultati Pagina 83 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Suggested Rare Result Se i risultati contemplano solo un allele comune Summary A 01 A 03 questi saranno mostrati come Common Haplotype ce A Aplotipo comune sopra i risultati suggeriti se 4 A 01 A 03 invece non contengono nemmeno un allele comune i veranno mostrati come Suggested Rare Result Risultati rari suggeriti I risultati nella finestra principale possono essere in OPE iii AI EAB aggiunti o rimossi dalla finestra dei risultati oaan anig g E suggeriti utilizzando i tasti e tasti blu mA 03 01 01 01 03 01 01 03 0 o e possono essere utilizzati anche per l aggiunta o qnA703 18 03 127 03 135 A111 o r sottrazione dei risultati a 2 digit e in tal caso l aggiunta rimozione sar relativa a tutti gli alleli compresi nel gruppo Tuttavia saranno manovrabili solo risultati senza mismatch 15 8 Filtro peralleli comuni codifica NMDP ed equivalenti serologici Il filtro per gli alleli comuni i codici NMDP e gli equivalenti serologici vengono applicati allo stesso modo di quanto visto per i risultati in SSO si vedano le
92. isultati per i singoli loci pu essere mostrato o nascosto cliccando sulle frecce nell angolo superiore destroy della finestra dei risultati lE Tutte le opzioni per interpretazione e le opzioni per l utilizzo dei filtri di alleli comuni sono disponibili come descritto nei capitoli 15 3 15 10 Patient RE Celiac Disease DOBI 41751 IMGT v 3 13 1 T Sample ID celiac Status Initial GA MEC HLA DRBI1 c7 HLA DQE1 Suggested Result Suggested Ambiguous Result DRB1 04 01 01 04 02 01 04 03 01 04 04 01 04 05 01 04 06 01 04 07 DQB1 03 02 01 DOBI1 03 02 01 DO81 03 02 01 DOB1 03 03 02 01 li DQE1 03 02 01 DQE1 04 01 01 04 02 01 HLA DQA1 Coeliac Suggested Result DRB1 04 01 01 04 02 01 04 03 01 04 04 01 04 05 01 04 06 01 1 DQOA 03 01 01 DOA1 03 01 01 DOB1 03 02 01 DOB1 03 02 01 Pagina 87 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Tutti e tre i loci possono essere analizzati insieme o separatamente Se viene selezionato uno dei loci verr applicato un analogo filtro anche nell istogramma dei risultati ossia solo le mix specifiche per DRB1 DOA1 o DQB1 Patient Sample ID celiac Status Initial C3 E Lxi Celiac Disease DQBI_417S1 IMGT v 3 13 1 HLA DQA1 Suggested Result 17 18 19 20 21 22 23 HLA DQBI z Suggested Ambiguous Result Summary DQA1 03 01 01 DQA1 03 01 01 DQ81 02 DQB1 03 DQB1 03
93. liccando sul simbolo del percorso lo stesso pu essere modificato a piacimento Percorso di default per esportazione mostra il percorso di default per l esportazione dei dati liste di lavoro risultati dei test refertazione delle tipizzazioni cliccando sul simbolo del percorso lo stesso pu essere modificato a piacimento File dati NMDP mostra la data del file NMDP in uso Cliccando sul sibmolo del percorso lo stesso per la importazione di un nuovo database NMDP pu essere modificato a piacimento File archivio WMDA mostra il percorso di default per la directory WMDA zip che contiene le informazioni per gli equivalenti serologici i gruppi P e G disponibili su http hla alleles org cliccando sul simbolo del percorso lo stesso pu essere modificato a piacimento File ZIP CWD mostra il percorso di default per la directory che contiene gli alleli CWD2 0 0 cliccando sul simbolo del percorso lo stesso pu essere modificato a piacimento IMGT Allele File mostra il percorso di default per la directory WMDA zip che contiene le informazioni per gli alleli HLA utilizzati per creare database IMGT pi vecchi disponibili http hla alleles org cliccando sul simbolo del percorso lo stesso pu essere modificato a piacimento La directory WMDA zip verr aggiornata con ogni nuova release degli alleli per i kit in uso e sar disponibile dal sito server di download per i clienti all indirizzo http service bag healthcare com
94. menti per l operatore che deve eseguire la tipizzazione HLA L interpretazione automatica deve pertanto sempre essere visionata e controllata anche in riferimento alla plausibilit del risultato da parte di personale esperto prima di procedere alla refertazione di un risultato clinico 14 6 1 Risultati suggeriti Tutti i risultati con mismatch pari a 0 vengono automaticamente aggiunti alla finestra Suggested Result Risultato suggerito risultati sono mostrati come gruppi allelici a 2 digit con i diversi alleli in alta risoluzione raggruppati al di sotto del valore a 2 digit Suggested Result Summary B 38 B 46 Serological Equivalent 838 Bw4 B 846 wo ENul ____ _ Q Assigned NMDP B 38 XX B 46 XX Possible NMDP B 38 XX B 46 xX 4 B 38 B 46 5 B 38 02 01 38 02 02 38 02 05 38 0406 38 15 38 18 3843 38 47 3848 7 38 49 B 46 011 01 46 01 03 46 01 04 46 01 06 46 01 07 46 01 08 46 01 09 46 01 10 46 01 12 46 01 13 46 01 14 46 01 15 46 15N 46 20 46 23 46 2 B 38 02 01 38 02 02 35 02 05 36 02 06 38 15 38 18 36 43 36 47 30 40 30 49 B 46 01 11 46 28 B 38 02 01 38 02 02 35 02 05 38 02 06 38 15 38 18 38 43 36 47 3848 30 40 Suggested Ambiguous Result Gruppi ambigui di alleli a due digit saranno Summary 03 C 05 C 03 C 08 mostrati in pi di un gruppo E possibile 1 i oo aaa a togliere risultati singoli cliccando sul tasto io Serological Equivalent Cw10 Cw3 Cw9 CwNull Cw Cw5 CwNulliCw
95. nt A5 Status Initial sali Dardano GORE PEARFA HLA DQA1 HLA DQB1 D A E3 alto a AD tn TC OGO GO e ni pa Near Control Probes Failed Suggested Result a DQ81 03 DQB1 06 Summary Serological Equivalent Assigned NMDP Possible nMpP pb ato O DODO 0 C3 DA O OOO OOO I E DO0O0O0O0O C DI DO O Cannot Exclude Hit Table Q024 IMGT 3 13 1 Version 06 11 2013 Group Allele MM Rank CWD I due loci verrano refertati separatamente sui report di tipizzazione e nei diversi formati di esportazione Pagina 76 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 15 INTERPRETAZIONE DI TEST HISTO TYPE SSP 15 1 Importazione di un typing kit I typing kit per HISTO TYPE SSP vengono importati in HISTO MATCH con la stessa procedura prevista per i kit HISTO SPOT SSO si veda la sezione 6 4 Il tutto potrebbe richiedere alcuni secondi fino a quando saranno mostrati tutti i file dei kit nella finestra di importazione 15 2 Definizione di pazienti campioni e test AU O 1 7 Home Patients Samples Processors Setup Log Off Selezionare nella schermata prinicipale New Sample Nuovo campione Comparir una finestra dove sar possibile inserire le informazioni relative al campione e si potranno aggiungere i relativi test SSP In alternativa definire o selezionare un campione che pu o meno appartenere a
96. ntalmente e verticalmente e le sonde marker devono essere nell orientamento corretto Se nella lista delle immagini piccole non disponibile la rotazione corretta nella prima immagine piccola possibile regolare con un angolo pi fine di rotazione con il comando di scorrimento Summary A 02 A 02 Serological Equivalent A2 Assigned NMDP_ A 02 05 A 02 05g Cannot Exdude Pagina 53 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Muovendo il comando di scorrimento si effettua la rotazione desiderata Per ottenere una rotazione minima dell immagine cliccare col tasto sinistro del mouse sulla linea sopra o sotto lo slider Ogni singolo clic ruota l immagine di un grado nella rispettiva direzione Cliccare quindi al centro dell immagine ruotata per procedere con una nuova interpretazione Il software eseguir automaticamente una nuova sovrapposizione di griglia sull immagine Chiudere la finestra e reinterpretare il test 13 5 Valori di riferimento per le sonde di controllo fallite Il software HISTO MATCH programmato per invalidare ogni test con una intensit nelle sonde di controllo inferiore a un incremento del 10 rispetto al segnale del background Test singoli contenenti segnali delle sonde di controllo al di fuori del range 40 140 potrebbero essere soggetti a risultati di sonde false positive negative e dovrebbero pertanto essere documentati e controllati atte
97. ntamente prima di validarli come previsto dagli standard EFI sezione L7 1 vers 6 Pagina 54 BAG Health Care GmbH 14 Worklist ID SCORE data 110213 HISTO MATCH Software Patient Instruzioni per l uso 14 2015 ANALISI DELLE LISTE DI LAVORO y d 31 v Sample ID SCORE data 110213 A1 Status Initial Bi i Suggested Result gt u Summary B 15 01 01 01 B 35 01 01 01 B 15 01 01 01 B 35 41 Serological Equivalent B62 Bw6 B35 Bw6 B62 Bw6 B35 Bw6 l U i Assigned NMDP B 15 01 B 35 YBT K O Possible NMDP 8 15 XX B 35 XX B 15 01 01 01 B 35 01 01 01 B 15 01 01 01 B 35 41 OOO DO DODOD Oo0o0500DDD ella an i i ogi DE 5 SOS gt e CO000D0DO O 7 O 00 O O O ot Exclude B 15 01 01 02N 01 03 01 04 01 06 01 07 01 08 01 09 E 10 01 11 01 12 oi E 01 14 AL ol 167 ol Au o1 18 0120 oe pai TE 3 DO c __91 23 01 24 01 25 01 27 01 28 01 29 01 30 01 31 05 01 05 02 20 26N 27 gl Hit Table B079 IMGT 3 11 0 Version 07 02 2013 Group Allele MM Rank CWD F 15 B 35 448 000 e O gt B 35 B 35 1 gt gt 8715 B 35 1527 B 15 B 15 2 14 1 Barradegli strumenti principali se Visualizzazione Consente di passare dalla visualizzazione dei piastra lista risultati in formato piastra a quella in formato elenco Grid All J Ef
98. nuovo paziente Modifica paziente selezionato Cancella paziente selezionato Referta paziente selezionato Pagina 23 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 9 1 Ricerca dei pazienti E possibile effettuare una ricerca dei pazienti nell apposito campo Patients 1 Inserire il nome nel campo di ricerca e premere enter o cliccare il tasto P E possibile ricercare i pazienti tramite nome o ID i pazienti che corrispondono al criterio di ricerca selezionato saranno mostrati in una lista sottostante 9 2 Ordinamento E possibile ordinare la lista dei pazienti cliccando sul men a tendina Sort by Ordina per E possibile invertire la direzione dell ordinamento cliccando nuovamente sul campo scelto 9 3 Inserimento di un nuovo paziente pazienti possono essere inseriti via importazione di un file di testo insieme alle informazioni relative ai campioni si veda il paragrafo relativo alla gestione dei campioni per i dettagli Il metodo qui descritto consente l aggiunta di un singolo paziente con campioni e test multipli 1 Selezionare il tasto Add Aggiungi 2 Comparir lo schermo per l editing del paziente Patient New Patient Patient Id New Patient Name New Name a si DoB Espansione campo paziente Espansione campo campione 3 Selezionare il campo dei pazienti per mostrare le informazioni relative cliccando sull intestazione
99. o di espansione amp Verranno mostrati tutti i risultati di tipizzazione di questo campione Dati sul kit e sul batch utilizzato per l esecuzione del test selezionato possibile selezionare diverse hit table se disponibili cliccando sul tasto di espansione Risultati suggeriti autorizzati per il test selezionato raggruppati a gruppi di 2 digit il nome completo dell allele pu essere visualizzato cliccando sul tasto di espansione alla sinistra dei risultati In alternativa qui saranno visualizzati gli alleli filtrati si veda la sezione 14 6 2 e 14 6 3 Pagina 56 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Suggested Result Summary A 02 A 30 Serological Equivalent A2 A30 O Assigned NMDP A 02 06 A 30 02 Q Possible NMDP A A A 02 A 30 A 02 06 01 02 06 03 02 06 06 02 06 08 02 06 09 02 06 10 02 06 11 02 10 02 28 02 61 02 72 A 30 02 01 30 02 02 30 02 04 30 12 30 32 30 33 30 34 30 45 30 50 30 51 30 61 A 02 06 04 A 30 02 01 30 02 02 30 02 04 30 12 30 32 30 33 30 34 30 45 30 50 30 51 30 61 Control probes have failed Summary Cannot exdude 14 4 Strumenti per l interpretazione a ec Interpretazione he Massimo numero pars di sonde ignorate A E Massimo numero consentito di B mismatch Vedi Array Cancella na Validazione Validazione risultato 14 5 Visualizzazione dei risultati Una
100. o versione precedente e l impostazione valida sia per la finestra dei risultati suggeriti o per l elenco nella finestra principale La visualizzazione pu essere modificata in Impostazioni scegliendo poi Nomenclature Pagina 71 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 14 15 Autorizzazione dei risultati I Una volta che un risultato stato analizzato pu essere approvato da parte di un operatore qualsiasi es tecnico premendo il tasto FAI test approvati saranno indicati da un segno di visto bianco L approvazione tecnica non obbligatoria In una seconda fase anche possibile o gi da subito autorizzare un risultato premendo il tasto IL ma ci sar possibile solo per chi ha ruolo di supervisore Il risultato verr validato e il software passer automaticamente a selezionare il test successivo risultati autorizzati vengono identificati con una spunta nella visualizzazione della piastra e nell elenco dei risultati Premendo nuovamente il tasto IL i risultati risulteranno svalidati Lista di lavoro approvata Lista di lavoro autorizzata Worklist ID W 2011 09 08_09 41 58 Worklist ID W 2011 09 08_09 41 58 1a IID mH 00000000 JOO 0O 00 00 00 00 000 Lo stato di autorizzazione indicato nella schermata delle liste di lavoro si veda la sezione 11 3 1 14 16 Dettagli delle sonde TEES o E Normalised Signal Probe signal Control Signal 125 274 15
101. ohn pc sglexpress Database In entrambi i casi necessario aggiornare il database prima di poter proseguire questo processo aggiorner il database e manterr i dati esistenti Questo procedimento irreversibile e una volta completato non potr essere revertito 4 5 Creazione di un nuovo database Quando il database sta diventanto troppo pesante vicino al limite di 10 GB possible creareuna nuovo database vuoto All avvio di HISTO MATCH tenere premuto il tasto Ctrl prima che si inizializzi del tutto comparir la seguente finestra di dialogo HISTO MATCH Versioni 20 e si E Reset Defaults Copyright 2019 80 agnese Tu Scegliere l opzione Seleziona Database A seconda della configurazione impostata precedentemente comparir la finestra User instance o SQL Server Pagina 8 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 4 5 1 Modalit User Instance r E Database Tools scifi Data Source SQLEXPRESS File C ExpediteDatabase HistoMatchDB MDF oDe CSa Ea sa e Selezionare Nuovo e Nella finestra di dialogo Save file selezionare una nuova destinazione e nome non lasciare spazi vuoti nel nome del file database e Verr creato un nuovo database vuoto e Gliutenti kit dati di installazione ed impostazioni esistenti saranno copiati al nuovo database e Selezionare iu her scegliere il nuovo database e proseguire con l avvio di HI
102. olta completata la prima fase iniziera quella dell interpretazione dei dati E possibile interrompere l analisi in ogni momento utilizzando il tasto Cancel Cancella Verr comunque portata a termine la superimposizione della griglia sul pozzetto in analisi in quel momento La prima fase pu essere riavviata in qualsiasi momento utilizzando la funzione Grid All nella schermata dell analisi delle liste di lavoro Pagina 50 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 13 2 Superimposizione manuale della griglia La superimposizione della griglia per l interpretazione pu Det y ino fanno RITIRI nin anioni pos BI e co o a mito 60 6 dvi essere effettuata manualmente utilizzando la funzione View 080 Cde Array Vedi array nella schermata di analisi della lista di Soa eee lavoro La griglia pu essere aggiustata trascinando i ELECE CCC E ii ii oeat e oo o quadratini bianchi Per ogni spot viene assegnata una regione e e oett eo della griglia i confini sono indicati dalla linea punteggiata Il ALLL LOLLO i a a sirio e cerchio verde identifica un dato spot e le dimensioni sono 6 stabilite automaticamente in base alle dimensioni della lu i reazione Il background viene misurato in pi punti attorno LIL 3 l l 1 nt CIAOO m OE e i e allo spot e in caso di background considerati anomali la regione verr marcata in rosso e lo spot non verr considerato nell analisi
103. onato raggruppati a gruppi di 2 digit i Summary A 26 A 29 nome completo dell allele pu essere Serological Equivalent A26 A A29 ANull A O visualizzato cliccando sul tasto di espansione nisi NMDP A 26 MKDW A 29 XX Possible NMDP A 26 MKDW A 29 XX alla sinistra dei risultati 4 A 26 A 29 A 26 09 26 91 A 29 01 01 01 29 02 01 01 29 04 29 09 29 10 29 12 29 01 01 02N 29 01 02 29 01 03 29 01 04 29 02 01 C Una volta visualizzati gli alleli completi quelli Common C saranno in verde quelli Well u Documented WD in blu con il tasto possibile togliere questi risultati da quelli suggeriti In alternativa verranno mostrati gli alleli filtrati si veda la sezione 14 6 2 15 5 Strumenti per l interpretazione aM x vy Interpretazione Esegue l interpretazione del test selezionato Massimo numero consentito di mismatch Vedi Array B Saranno mostrati solo i risultati con un massimo i numero di mismatch pari al valore qui impostato Mostra l immagine del pozzetto test con la griglia sovrapposta consente all operatore di muovere i cerchi di interpretazione e o la griglia manualmente Cancella i risultati per il test selezionato JE Cancella Validazione Approva il test da parte del tecnico Effettua la validazione svalidazione dei risultati solo col ruolo di Supervisore Validazione risultato 15 6 Visualizzazione dei risultati Questa parte della schermata
104. password si veda la sezione 6 3 Referti qui possibile impostare le informazioni sul referto si veda la sezione 16 Filtra qui possibile scegliere il filtro allelico ed eventualmente modificare gli alleli nel filtro definito dall utente si veda la sezione 14 6 2 Nomenclatura qui possibile scegliere tra modalit Auto visualizza gli alleli come definito nella hit table di riferimento o Versione 3 visualizza gli alleli secondo la versione 3 indipendentemente dalla hit table di riferimento Interpretazione qui possibile definire i parametri di default per l interpretazione automatica repors Interpret Setup Filter Default Maximum Mismatches 1 3 Nomenclature Default Maximum Probes to Ignore WET a Interpretation i talatah Automatically Edit Results Image Analysis V Display Combined Locus Results Tools Paths Summary Type Auto x Database Tools ARO 4 Digit 2 Digit P Group G Group Si vedano le sezioni 14 4 14 6 3 14 8 e 14 19 per maggiori dettagli Pagina 91 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Intestazione qui possibile inserire informazioni stampabili su referto come ID ed intestazione del laboratorio E anche possibile caricare un logo che comparir sul referto HISTO MATCH JBAG mamca User Reports Installation Filter Nomenclature Lab ID 1234567890 Interpretation Installation Lab Name
105. per fornire un dato risultato Pagina 57 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Resutts MEMEEM SHERRI PENERIMA Hit Table B084 IMGT 3 15 0 Version 27 02 2014 l N Mener FMPRPEMA Tmn oa Group Allele MM Rank cwp D B 15 B 57 94 5 Era s m 8135 865704 maA l es IIIII I I I l gt B 15 B 58 5 1 gt B 15 B 57 133 1 Le intensit delle sonde vengono ordinate in base alla differenza rispetto al valore di cutoff con un istogramma in cui le barre pi alte corrispondono alle sonde con risultato pi positivo di colore rosso e le barre pi basse corrispondono alle sonde con risultato pi negativo di colore blu Le sonde evidenziate in verde sono quelle di controllo Risultati con zero mismatch e che includono una combinazione con due alleli comuni sono evidenziati in verde risultati con un solo mismatch e che includono una combinazione con due alleli comuni sono evidenziati in rosso si consiglia all operatore di controllare anche questi Il numero tra parentesi dopo il risultato a 2 digit indica il numero di possibili combinazioni alleliche incluse in questo gruppo Cliccando sul tasto di espansione nella prima colonna della griglia verranno mostrati tutti i risultati in alta risoluzione con gli alleli compresi nel gruppo indicato a due digit Muovendo il mouse sopra il nome degli alleli mostrer l elenco completo degli alleli nel gruppo
106. po il risultato a 2 digit indica il numero di possibili stringhe alleliche incluse in questa linea Cliccando sul tasto di espansione nella prima colonna della griglia compariranno tutti gli alleli di quel gruppo Muovendosi con il mouse sopra i nomi degli alleli verranno mostrati gli alleli stessi 190 175 220 gt 525 10s 210 jon 400 570 200 160 650 3807 225 560 195 5207 400 410 175 125 95 200 105 54o 188 650 445 420 175 190 390 op 500 595 555 Group Allele MM CWD ASA A33 1 o o mA 11 01 01 11 02 01 11 03 11 0 D 11 01 01 11 02 01 11 03 11 04 11 05 11 08 11 09 11 10 11 12 11 29 11 30 11 01 02 11 01 03 11 01 04 11 01 05 11 01 06 11 01 07 11 01 08 11 01 09 11 01 10 11 01 11 11 01 12 11 01 13 11 01 14 11 01 15 11 01 16 f11 01 17 11 01 18 11 01 19 11 01 20 11 01 21 11 01 22 11 01 23 11 01 24 11 01 25 11 01 26 11 01 27 11 01 28 11 01 29 11 01 30 11 01 31 11 01 32 11 01 33 11 01 34 11 01 35 11 01 36 11 01 37 11 01 38 11 1 01 41 11 01 42 11 01 43 11 01 44 11 01 45 11 01 46 11 01 47 11 01 48 11 01 50 11 02 02 11 02 03 11 02 04 11 067 11 07 11 11 11 13 11 14 11 15 01 11 15 02 11 16 11 20 11 21N 11 22 11 23 11 24 01 11 24 02 11 25 11 26 11 27 11 31 11 32 11 33 01 11 33 02 11 34 11 36 11 37 11 38 11 39 11 41 11 42 11 44 11 45 11 46 11 47 11 487 11 49 11 51 11 52Q 11 54 11 55 11 56 11 58 11 59 11 60 11 61 11 627 11 63 11 64 11 55 11 66 11 67 11 68 11
107. sezioni 14 6 2 14 6 4 e 14 6 5 15 9 Opzioni di visualizzazione nel campo del sommario risultati Le opzioni di visualizzazione per il campo del sommario risultati sono le stesse che per i risultati SSO si veda la sezione 14 6 3 15 10 Visualizzazione del pattern di reattivit di un allele Nell interpretazione potrebbe essere utile visualizzare il pattern di reazione di certi alleli o combinazioni alleliche Iniziare a digitare parte dell allele di cui si desidera visualizzare il pattern nel campo vuoto E possibile raffinare la ricerca scegliendolo dalla lista proposta o digitarlo completamente Pagina 84 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Patient SSP test 1 SSP testi Sample ID SSP test 1 Status Initial am x v T el Suggested Result Summary A 01 A 33 Serological Equivalent A1 ANull A A19 A33 A Alow 247A1 IMGT v 3 6 0 1 4 A 02 332 10 11 12 13 14 15 16 A 03 33 A 11 01 33 A 11 33 01 A 11 33 02 A 23 33 A 24 02 33 A 24 133 A 24 33 A 26 33 i A 30 33 ia A 31 33 AA 32 33 A 33 01 01 A 33 01 02 33 gg Assigned NMDP A 01 XX A 33 XX A 01 A 33 Possible NMDP A 01 XX A 33 XX Cannot Exclude B 18 27 C 04 14 68 IMGT 3 6 0 1 Version 26 06 2012 6 7 8 9 30 11 12 13 R i 16 17 38 19 2 2 2 23 650 380 225 525 195 520 405 415 175 125 600 200 105 200 175 65
108. si apre la finestra di editing Cliccando una seconda volta la finestra viene compressa Pagina 24 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Patient 1 Patient Id 1 Name Janet Jackson Profile Address Patient Id 1 Name DoB Gender Patient ID ID paziente L ID paziente dev essere univoco l informazione obbligatoria Full Name Nome completo Il nome del paziente ad es Mario Rossi Date of Birth Data nascita Inserire una data nel campo o cliccare sul calendario per selezionarla Address Indirizzo Utilizzare i tasti Add Edit Delete per aggiungere un indirizzo del paziente VA 4 Selezionare l intestazione campioni per aggiungere un campione cliccando sull intestazione si apre la finestra di editing Cliccando una seconda volta la finestra viene compressa 5 Cliccare Add Aggiungi Lit per aggiungere un nuovo campione Si apre una finestra campione con un ID campione analogamente a quanto gi visto per l ID paziente modificabile In questa finestra si possono aggiungere sia test HISTO SPOT che HISTO TYPE E possibile aggiungere quanti test si desidera E anche possibile cancellare un test selezionandolo e premendo il tasto Delete Cancella Una volta completata la prenotazione test cliccare sul tasto Save Salva ka Pagina 25 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Sample ID 01 20
109. sted 15 11 2010 Date Performed 15 11 2010 2010 09 21 Copenhagen i Dote Crented 21 09 2010 Date Performed 21 09 2010 2011 09 15 ABDRDQ Dote Crestet1 15 09 2011 Date Performed 15 09 2011 12 1 3 Informazioni dagli strumenti 23 04 2010 11 35 27 Mr Spot User Entering Machine Setup Questa finestra di controllo mostra la lista dei messaggi relativi a tutti gli strumenti connessi al software 12 2 Aggiunta di un nuovo strumento Di seguito si riporta la procedura per l aggiunta di un nuovo strumento connesso via LAN 1 Nell elenco degli strumenti cliccare su Add Aggiungi Connect to Mr Spot Cancel 2 Nell indirizzo del server digitare il nome utilizzato in rete o l indirizzo IP dello strumento il nome di default per la rete Mr Spot 3 Lasciare il valore della porta impostato ad 8001 4 Cliccare OK 5 Il software tenter di connettersi allo strumento In caso di successo esso verr aggiunto alla lista degli strumenti connessi in caso di insuccesso sar comunque fornita l opzione di aggiungerlo ugualmente all elenco Pagina 48 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 12 3 Cancellazione di uno strumento Selezionare lo strumento da cancellare dall elenco cliccare il tasto Delete Cancella Lo strumento verr rimosso dall elenco 12 4 Importazione dei risultati da MR SPOT Nella finestra di controllo di un dato strumento selezionare la lista di
110. t table Nel caso in cui la ricerca di corrispondenza non fornisca un risultato con 2 alleli comuni verranno escluse man mano le sonde con valori pi vicine al valore di cutoff e verr effettuata una nuova interpretazione Questo schema verr ripetuto fino a quando viene trovato un risultato con 2 alleli comuni o fino al raggiungimento del numero massimo di probe ignorabili assegnato Questo risultato verr mostrato con le sonde che sono state ignorate evidenziate in grigio al centro della tabella Il software ricerca il risultato comune che dipendente dal filtro allelico applicato Pagina 59 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 4D Vengono ignorate sonde fino a quando non vengono trovati 2 alleli 4D C CWD Vengono ignorate sonde fino a quando non vengono trovati due alleli C User Vengono ignorate sonde fino a quando due qualsiasi degli alleli definiti dall utente non vengono trovati AII Vengono ignorate sonde fino a quando non vengono trovati 2 alleli 4D IMGT 3 15 0 Version 08 04 2014 mrn Group Allele MMj Rank CWDj O B 38 B 46 13 o 0o n O B 38 B 46 17 1 2520 Risultati con zero mismatch e che includono una combinazione di due alleli comuni sono evidenziati in verde Risultati con un solo mismatch e che contengono due alleli comuni sono evidenziati in rosso Avvertenza i risultati evidenziati dall interpretazione automatica sono suggeri
111. tati corrispondenti L apertura del campo risultati Coeliac mostra la seguente finestra Gli alleli associate con malattia celiaca Summary DQ8 Z liakie Risiko hoch DRB1 04 01 01 04 02 01 04 03 01 04 03 02 04 04 01 04 05 01 04 06 01 04 07 01 04 08 01 DQB1 03 02 01 03 02 02 03 02 04 03 02 06 03 02 07 03 02 08 03 02 09 03 05 03 03 05 04 03 DQB1 03 13 DQB1 03 02 01 03 02 02 03 02 04 03 02 06 03 02 07 03 02 08 03 02 09 03 0 DQ81 03 02 01 03 02 02 03 02 04 03 02 06 03 02 07 03 02 08 03 02 09 03 05 03 03 05 DQB1 03 02 01 03 02 02 03 02 04 03 02 06 03 02 07 03 02 08 03 02 09 03 05 03 03 0 DQB1 03 02 01 03 02 02 03 02 04 03 02 06 03 02 07 03 02 08 03 02 09 03 05 03 03 DOA1 03 01 01 DOA1 03 01 01 1 sono evidenziati in giallo Il sommario indica il nome della possibile molecola HLA associata a malattia celiaca Premendo il bottone nell angolo superiore N destroy del campo risultati possibile passare alla visualizzazione per aplotipo Questa modalit visualizza un diagramma Conliae con le possibili molecole DQ e il rischio Summary DQ8 Z liakie Risiko hoch Coeliac Risk High assegnato relativamente alla malattia celiaca L assegnazione del rischio per malattia celiaca basato sulla pubblicazione di Megiorni and Pizzuti Journal of Biomedical Science 2012 19 88 15 12 2 Visualizzazione in modalit DRB1 DQB1 DOA1 Il dettaglio sui r
112. tch Page 1of1 Pagina 41 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 11 8 Creazione di una lista di lavoro per combistrip tipizzazione On call Selezionare Combistrip Worklist Lista di lavoro combinata dalla schermata iniziale Worklist ID CS 2013 05 23 13 39 48 Select Patient New Delete EA STO Pagina 42 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 1 Assegnare un ID alla lista di lavoro HISTO MATCH crea in automatico un ID che pu comunque essere modificato come si desidera L ID della lista di lavoro dev essere univoco 2 Selezionare ed aggiungere un paziente utilizzando la funzione Search a o creandone una nuova b a Posizionare il cursore nel campo di ricerca e premere il tasto di invio o cliccare sul tasto D per mostrare tutti i pazienti disponibili E anche possibile selezionare criteri di ricerca in questo campo per rendere pi semplice l identificazione di uno specifico paziente Il paziente selezionato verr aggiunto alla lista di lavoro con un doppio click o attraverso un drag amp drop Sar possibile rimuovere i pazienti individuandoli nel layout di piastra e premento il tasto Delete Cancella nell angolo superiore destro La creazione di nuovi pazienti descritta nella sezione 9 Worklist ID CS 2013 05 23 13 39 48 Select Patient New Delete Selected A1 Patient id 1 ID
113. te dei file XML Un file singolo pu contenere informazioni relative a pi kit lotti e batch Il file contiene la informazioni che definiscono la posizione delle probe nell array del pozzetto test e le intensit mediante cut off richieste per interpretare correttamente i risultati 1 Accedere al programma 2 Selezionare Kits o i PP Rg a Patents Samples Worklists Kts cars Processore Lt Log Of Appena installato il programma non presenta ancora dei kit Pagina 14 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Sono disponibili le seguenti funzioni Cal Importa un nuovo batch Mostra la hit table per il batch selezionato Mostra i cut off per il batch selezionato Genera hit table con database IMGT precedenti Mostra nasconde i batch scaduti B Elimina i batch selezionati possibile solo se un batch scaduto Allinea tutti i batch per l utilizzo con l ultima versione database 3 Cliccare su Import Importa 4 Nella finestra di dialogo selezionare uno o pi file kit da importare e cliccare su Open Apri E n m Pagina 15 BAG Health Care GmbH Name si HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Date modified Type E B032 xmI EF B033 2 xmI E B033xmI FE B043 xml EDQ010 xmI XML D XML D XMLD XML D XML D XML D XML D XML D XML D XML D XML D 12 04 2010 13 06 12 04 2010 13 08 12 04 2010 13 10
114. te viene creato un file di testo con i risultati in codice NMDP e i risultati assegnati dall utente Technical Export Package viene esportato il file della lista di lavoro xml contenente alcune informazioni sull analisi gi eseguita e le immagini dei pozzetti SCORE Export i risultati interpretati vengono esportati in un file che pu essere a sua volta importato nella versione completa del software SCORE E possibile esportare una intera lista di lavoro o singoli test solamente Per ottenere i risultati in SCORE comunque necessario utilizzare i file typing kit per i batch impiegati sono disponibili dall area web Service BAG Questa funzione stata prevista per coloro che desiderino combinare risultati ottenuti con metodiche differenti Attenzione SCORE non pu essere utilizzato per la interpretazione delle immagini ottenute col sistema HISTO SPOT 2 Select Tests to Export Hem Export tk 1D Locus Status Result C042 03 Scored C Suggested R C 07 C 07 0042 03 Score d C Suggested R C 06 C 06 0042 03 Scored C Suggested R C 15 C 15 0042 03 Scored C Suggested R C 05 C 05 C042 03 Score d C Suggested R C 01 C 03 0042 03 Scored C Suggested R C 07 C 08 C042 03 Scored C Suggested R C 05 C 05 0042 03 Score d C Suggested R C 12 C 12 Pagina 46 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 12 LO STRUMENTO MR SPOT 12 1 Schermata degli strumenti Selezionando Processors Strumenti
115. testHISTOTYPESSP lle 79 15 4 INFORMAZIONI SUTTEST serrato ati ri 81 15 5 Strumenti per Interpretazione iaia 81 15 6 Visualizzazione gerrisultati sralaileilllii ai 81 15 7 RISUltatiSUSgerniticile ela 83 15 8 Filtro per alleli comuni codifica NMDP ed equivalenti serologici 84 15 9 Opzioni di visualizzazione nel campo del sommario risultati 84 15 10 Visualizzazione del pattern di reattivit di un allele 84 1511 StOFICOSiCOMMENtI ili 85 15 12 Interpretazione dei risultati con HISTO TYPE Celiac Disease Kit 85 15 12 1 Visualizzazione in modalit celiac disease ii 85 Pagina V BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 15 12 2 Visualizzazione in modalit DRB1 DQB1 DOA1 87 16 REFERTAZIONE puri 88 16 1 Referto FaASSUnDLIVo eenen o e a 89 16 2 Refertazione della lista di AVOrO 89 16 3 Referto del paziente o del campione i 90 17 INPO STA AON eaa mai 91 Pagina vi BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 1 INTRODUZIONE Il presente documento contiene informazioni relative all installazione e l utilizzo del software HISTO MATCH Il software HISTO MATCH stato sviluppato per l interpretazione dei risultati di tipizzazione ottenuti con il sistema HISTO SPOT SSO e o con i kit HISTO TYPE SSP
116. ti E possibile visualizzare quali alleli sono codificati NMDP muovendo il mouse sopra il campo del risultato le codifiche NMDP vengono aggiornate regolarmente Gli ultimi aggiornamenti sono disponibili come file nel sito http bioinformatics nmdp org HLA Allele Codes Allele Codes aspx E anche possibile abbonarsi a una mailing list per ottenere in automatico gli aggiornamenti Il file numer v3 txt dovr essere copiato in qualche percorso nel PC e importato in HISTO MATCH nella finestra Setup e Paths Percorsi 14 6 5 Equivalenti serologici Gli equivalenti serologici sono attribuiti sulla base di tutti gli alleli possibili se stato selezionato il tasto All Tutti nella visualizzazione dei risultati Se viene attivato un filtro allelico i risultati serologici saranno ridotti a quelli degli alleli comuni possibili solamente Dopo essere tornati alla visualizzazione con All Tutti possibile modificare questa impostazione premendo sul tasto di aggiornamento o 14 6 6 Visualizzazione risultati per DPB1 Le ambiguit a due digit un campo non vengono mostrate come pallino giallo per il locus DPB1 poich a causa della denominazione degli alleli DPB1 molti dei gruppi allelici a 2 digit contengono uno o due alleli solamente il concetto non consistente Tutti i risultati con 2 alleli comuni perci vengono visualizzati con un pallino verde 14 6 7 Controllo negativo Nel kit HISTO SPOT On Call Typing cod 726070
117. ttenuto con sonde che hanno reagito debolmente ossia mismatch meno consistenti Con il risultato a soli 2 digit il valore indicato corrisponde a quello migliore ottenuto per gli alleli in alta risoluzione nel gruppo La colonna contrassegnata con CWD indica il numero di aplotipi comuni con riferimento al catalogo CWD2 0 0 nei risultati possibili suggeriti Il cerchio verde indica i risultati con 2 alleli comuni C il cerchio blu quelli con 2 alleli well documented WD il cerchio grigio indica due alleli rari Se il cerchio per met verde e met blu siamo in presenza di un allele C e uno WD Nella riga con il solo risultato raggruppato a 2 digit il valore indicato corrisponde a quello migliore ottenuto per gli alleli in alta risoluzione nel gruppo Cliccando sul tasto in cima ad ogni colonna i risultati verranno ordinati secondo il parametro rispettivo Gruppo Allele MM Rank o CWD Cliccando una seconda volta l ordinamento viene invertito Le dimensioni dei risultati possono essere modificate tenendo premuto il tasto CTRL e ruotando la rotella del mouse in contemporanea Se il software ha ignorato durante l applicazione dell algoritmo determinate sonde queste saranno evidenziate in grigio 14 6 Assegnazione dei risultati HISTO MATCH interpreta i risultati ottenuti utilizzando i valori misurati per ogni sonda nell immagine ed effettuando una ricerca di corrispondenza fra il pattern di positivit ottenuto e pattern predefiniti nelle hi
118. un paziente partendo dalla schermata di gestione pazienti o campioni si vedano le sezioni 9 e 10 Aggiungere quindi un nuovo test HISTO TYPE SSP Si aprir una finestra con i kit disponibili per il locus selezionato Pagina 77 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Patient Id Name DoB Sample ID 05 2013 R va 13 11 2013 Status Initial A Low A Status Initial Date 13 11 2013 08 49 11 Worklist B Low B Status Initial Date 13 11 2013 08 49 17 Worldist PSE Locus DRB Batch Name DRB_136D1 IMGT DB 3 9 Expiry Date 31 03 2013 Created 13 11 2013 Selezionare il batch che si sta utilizzando e premere il tasto Save Salva asi Il test assegnato comparir nella lista dei test disponibili per il campione in esame Per inserire i risultati possibile aprire lo schermo di interpretazione sia con un doppio clic dalla finestra dei test o premendo il tasto di Interpret Interpretazione EES comparir un gel virtuale in cui sono inseribili le reazioni positive E anche possibile cancellare i test con il tasto rosso Delete Cancella Pagina 78 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 15 3 Interpretazione dei test HISTO TYPE SSP E possibile inserire le reazioni positive all interno del gel virtuale nella schermata di interpretazione Patient Sample ID SSP Status Initial Alea ram ooe i 7 8 9 10 11 12 13 14 15
119. uzioni per l uso 14 2015 tipizzazione di un singolo locus Inoltre la schermata mostra i risultati nell ambito dell associazione con malattia celiaca La visualizzazione di default la seguente Patient Sample ID SSP B Status Initial 3 I nas ne D Celiac Disease DQB1_316S1 IMGT v 3 13 1 7 8 9 10 11 12 13 14 Coeliac Pal HLA DRB1 c7 Not Typed Summary DQX x Coeliac Risk Extremely Low LI HLA DQB1 a Not Typed HLA DQA1 a Not Typed IMGT 3 13 1 Version 23 06 2014 220 200 140 syed 800 150 140 150 105 200 185 120 95 145 135 135 105 485 235 90 200 205 235 Group Allele MM CWD Dopo aver inserito le reazioni positive e aver eseguito l interpretazione vengono mostrati i risultati e definito il rischio di malattia celiaca nel campo del sommario loci possono essere anche interpretati separatamente espandendo il campo dei risultati sulla parte destra Patient seen v amp Celiac Disease DQB1_417S1 IMGT v 3 13 1 v Sample ID celiac Status Initial me GM N ao D 8 9 10 11 12 13 14 15 16 Coeliac z HLA DQB1 E Suggested Ambiguous Result DQB1 02 DQ81 03 DQ81 03 DQ81 03 DQB1 03 DQB1 03 g DQB1 04 Summary DQ8 Z liakie Risiko hoch DRB1 04 01 01 04 02 01 04 03 01 04 03 02 04 04 01 04 05 01 04 06 01 04 07 01 04 08 01 1 DaB 1 020201 03 02 02 03 02 04 03 02 06 03 02 07 03 02 08 03 02 09 03 05 03 03
120. vrebbe contenere un elenco di dati e i dati possono essere in due formati 1 ID Paziente Nome Cognome Data di nascita ID Campione Locus 2 ID Campione Locus Ogni dato dev essere separato da una tabulazione o una virgola PatientiD ID paziente ID univoco del paziente FirstName amp LastName Nome e cognome Nome del paziente DoB Data di nascita utilizzando formato data locale su PC SampleID ID campione ID univoco del campione Locus Il locus HLA da testare ad es A HLA A HLA A e cos via anche per B C DRB1 DRB345 DQB1 DPB1 o COE per malattia celiaca L ID paziente dev essere univoco se nel database esiste gi un ID allora verranno confrontati il nome e la data di nascita se sono identici verr aggiunto il nuovo dato al paziente altrimenti verr visualizzato un messaggio d errore L ID campione dev essere univoco se nel database esiste gi un ID il nuovo test sar aggiunto al campione gi esistente nel database 10 5 2 Importazione del file di testo 1 Cliccare Import Importa sulla schermata dei voi 2 Selezionare il file di testo da importare 3 campioni importati saranno mostrati nella lista Pagina 32 BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 Il file di testo pu essere anche importato direttamente dalla schermata di creazione delle liste di lavoro si veda la sezione 11 4 E inoltre possibile importare una lista di lavoro con posizion
121. zione Le dimensioni dei risultati possono essere modificate tenendo premuto il tasto CTRL e ruotando la rotella del mouse in contemporanea Pagina 68 HISTO MATCH BAG Health Care GmbH HISTO MATCH Software Instruzioni per l uso 14 2015 14 11 Visualizzazione della reattivit di una sonda e modifica al cutoff La reattivit di una sonda in relazione al cut off pu essere visualizzata per tutti i test eseguiti nella lista di lavoro in esame Per aprire la finestra dei cut off cliccare sull istogramma della sonda con il Fa in Use Probe R13c Specdificity tasto destro del mouse e quindi su Cut Off cut off Vengono mostrate le intensit della sonda in tutti i test inclusi nella lista di lavoro La linea orizzontale rossa rappresenta il livello del cut off Il pozzetto in esame aperto nell interpretazione risulta evidenziato in bianco Nei pozzetti laddove la sonda stata ignorata automaticamente o manualmente risulteranno delle barre vuote Questa statistica rappresenta un utile strumento per valutare la qualit di una sonda in generale e decidere se ignorarla o meno durante l interpretazione W 2014 05 23 _14 22 32 E10 n Cut Off Multiplier Probe 69 A1239x2 Default 0 42 Batch A 108 6 Cancel Apply Apply To Worklist Apply To Batch Reset To Default i i La z kej L operatore pu anche modificare i cutoff per ogni singola sonda c anche l opzione per assegnare il nuovo cutoff alla

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