Informe de Progreso Técnico y Financiero Donaciones para la
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1. de pasantes universitarios Se realiz un concurso abierto a los estudiantes de la Licenciatura de Biolog a de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Buenos Aires Se presentaron 60 postulantes Reuniones de seguimiento y seminarios Todos los lunes se realiza una breve reuni n de seguimiento interno seguida de un seminario de actualizaci n abierto al p blico En estos seminarios se leen y discuten trabajos cient ficos metodol gicos sobre temas afines a la actividad de los pasantes Programa de Organizaci n de Sistemas Nacionales de Grandes Instrumentos y Bases de Datos http www cicyt mincyt gov ar cicyt_lineas_accion htm Improve the fauna database of the Biodiversity Information Network by adding the data on mammals of special value of the NEA http www oas org dsd IABIN Component2 Argentina APN SM ValorEspecial htm http www macn secyt gov ar Investigacion proyectos inv_pro_colecciones_seminarios php Digitalizaci n de registros Los pasantes universitarios digitalizan registros del libro de inventarios o directamente de espec menes de las colecciones utilizando una interfaz de carga de datos aplicaci n Aurora Cada pasante trabaja 20 horas semanales distribuidas de acuerdo a su disponibilidad A los pasantes que digitalizaron directamente espec menes de las colecciones en vez de libros de inventarios se les asignaron conjuntos de espec menes preferentemente de Parques Nacionales d2. mediante el uso del Tapirlink XML Client ser a recomendable suministrar un ejemplo y su correspondiente descripci n para que el usuario pueda adaptarlo a sus recursos y comprobar su funcionamiento La adaptaci n del archivo XML provisto en el cliente es lo que se realiz para verificar el funcionamiento de los recursos agregados del MACN El tutorial no es expl cito acerca del registro en UDDI podr a aclararse que no es necesario para la SSTN 4 Fondos de Contrapartida adjunto el Reporte de gastos de contrapartida en tabla de Excel Adjuntado como 1raRENDICION MACN IABIN xls rendici n original enviada por separado por aminsitradora de fondos 5 Reporte Financiero adjunto el Reporte de gastos en tabla de Excel Adjuntado como lraContrapartida MACN IABIN xls rendici n original enviada por separado por aminsitradora de fondos 6 Anexos Anexo 1 Campos del proceso de georreferenciaci n Pa s Provincia Departamento Localidad Lugar citado Protocolo FuenteDeLasCoordenadas Unidad de las coordenadas PrecisionDeLasCoordenadas LatitudDecimal LongitudDecimal Datum DistanciaMaximaDelError UnidadesDeLaDistancia ExtensionDeLaEntidad ObservacionesAcercaDeLasCoordenadas ObservacionesAcercaDeLaLocalidad SistemaOriginalDeCoordenadas NoGoerreferenciadoPorque GeorreferenciadoPor FechaGeorreferenciacion lt m s varios identificadores internos y valores originales gt Anexo 2 Campos del proceso de validaci n taxon
3. mica Phyllum Clase Orden Familia Genero Especie Subespecie AutorTaxon CertezaTaxon FuenteDeValidacion FechaDeValidacion ValidadoPor lt m s varios identificadores internos y valores originales gt
4. se implementen las consultas durante junio de 2009 La implementaci n de los esquemas de trabajo sobre tablas externas ha demorado el proceso de georreferenciaci n y validaci n taxon mica En compensaci n hemos enfatizado en la digitalizaci n de nuevos registros Estos valores se equilibrar n a medida que avanza el proyecto Notas sobre el tutorial de TapirLink Para la instalaci n de datos de TapirLink se sigui el Manual de instalaci n y configuraci n del proveedor preparado por Ivette Fern ndez de Febrero de 2008 La instalaci n del software requerido por el proveedor no present dificultad Con respecto a la configuraci n del C mo colocar valores de campos ausentes en Observaciones y Mapa Darwin Core Aurora y abreviaturas para campos no implementados http www macn secyt gov ar Investigacion proyectos inv_pro_colecciones_georef php proveedor ser a muy til contar con un documento donde se muestre un ejemplo completo y funcional donde pueda observarse el contenido de cada uno de tems requeridos En los ejemplos provistos existen campos sin informaci n solo puede encontrarse la descripci n del mismo y a algunos tems del ejemplo no puede accederse Si bien el mapeo de los campos se realiz sin dificultad al realizar los test se obtuvieron errores debido a que los nombres de las bases en MySQL conten an guiones esto se solucion eliminando los mismos En la operaci n search
5. Informe de Progreso T cnico y Financiero Donaciones para la Digitalizaci n de Datos Red Tem tica de Especies y Espec menes od htnmoioun e soe Booveradad abin S lapi Informatizaci n de las colecciones del Museo Argentino de Ciencias Naturales con nfasis en registros de Parques Nacionales de Argentina Preparado por Mart n J Ram rez 12 Jun 2009 Resumen Ejecutivo Este reporte cubre el periodo 1 de Febrero 30 Abril 2009 Se convirtieron registros en papel o previamente digitalizados a formato digital de acuerdo a est ndares de interoperabilidad Se reporta un total de 37152 registros 14254 nuevos registros m s 22898 registros previamente digitalizados Estos registros est n integrados a las bases de datos institucionales y son libremente accesibles a trav s de TapirLink Los principales desaf os fueron la implementaci n de flujos de trabajo en paralelo de validaci n taxon mica y georreferenciaci n y afrontar la carga de datos a n cuando ciertos campos no est n implementados en la herramienta de captura Executive Report This report covers between 1 February and 30 April 2009 We converted records in paper or previously digitized to a digital format according to standards of interoperability We report a total of 3715 14254 new records pus 22898 records previously digitized Those records were integrated to the institutional data bases and are freely accessible via TapirLink The main ch
6. allenges to overcome were the implementation of parallel workflows for taxonomic validation and georeferencing and the digitization of data when the appropriate fields are not implemented in the tool to capture data 1 Resultados de los productos programados y alcances del proyecto Las bases de datos de las colecciones del Museo se manejan con la aplicaci n Aurora desarrollada en nuestra instituci n Los campos internos de nuestras bases se mapearon a proveedores TapirLink e Colecci n Nacional de Herpetolog a MACN He TapiLink http 168 96 62 13 tapirlink tapir php macnhe 14254 registros digitalizados Estos registros fueron tipeados por los data entry a partir del libro de inventario e Colecci n Nacional de Mastozoolog a MACN Ma TapirLink http 168 96 62 13 tapirlink tapir php macnma 22898 registros previamente digitalizados adecuados a est ndares Estos registros fueron levemente adecuados al formato requerido por la SSTN En este periodo se produjo la georreferenciaci n de la mayor parte de los registros e Se produjo un template MS Excel para el proceso en paralelo de validaci n taxon mica vinculando determinaciones con nombres cient ficos aceptados e Se configur el servidor de datos para los proveedores TapilLink Se recurri a la experiencia de Renato Mazzanti CENPAT Trelew Argentina en la resoluci n de problemas de configuraci n que exced an la documentaci n del proveedor e Se adopt un pr
7. e Argentina Limpieza de registros previamente digitalizados Las tablas a limpiar se distribuyen en formato MS Excel con los identificadores nicos originales Los datos corregidos se tipean en campos de destino conforme a los formatos requeridos Las modificaciones se incorporan nuevamente a las bases mediante consultas de MS Access ad hoc utilizando los identificadores nicos Algunas tareas de limpieza de datos son realizadas a nivel administrador directamente sobre las tablas Dado que es m s eficiente procesar bloques enteros del mismo origen y todav a se est trabajando sobre un bloque grande de m s de 13 000 registros en este primer informe se cubre el cupo comprometido con registros nuevos Georreferenciaci n Se adopt un protocolo levemente modificado del de MANIS Los registros de espec menes y localidades fueron obtenidos mediante consultas y preparados en planillas MS Excel El georreferenciador agrega los datos de coordenadas geogr ficas error metadatos asociados y dispone de campos para corregir y uniformar los datos geogr ficos originales Los datos se incorporar n a las bases originales del mismo modo que en el tem anterior Validaci n taxon mica Los pasantes que ingresan espec menes directamente de la colecci n de Aracnolog a tuvieron acceso a la fuente de autoridad taxon mica m s actual y coordinaron la consistencia entre nombres y determinaciones con ayuda del curador Las determinaciones de Mastozool
8. el desarrollo y la estructura de datos La desventaja es que hay que implementar cada funcionalidad y mantener el c digo Al ser una aplicaci n peque a el aprendizaje es r pido pero la funcionalidad es limitada Problema 1 Campos no implementados Dado que no existen aplicaciones perfectas el proceso de digitalizaci n debe realizarse a n cuando ciertos datos no pueden cargarse de la manera ideal Esto lo hemos encarado implementando un modo estereotipado de colocar los datos en un campo de texto libre de manera que puedan ser parseados eficientemente a medida que los campos son incorporados a la aplicaci n Problema 2 Georreferenciaci n La aplicaci n Aurora todav a no soporta todos los datos y metadatos generados por el proceso de georreferenciaci n Anexo 1 Mientras se implementan estos campos en la aplicaci n estos datos se mantendr n en tablas externas vinculadas a la base mediante identificadores nicos Los datos de georreferenciaci n se incorporar n a la consulta que alimenta al proveedor TapirLink durante Junio Problema 3 Validaci n taxon mica La aplicaci n Aurora todav a no soporta un historial de determinaciones para cada registro ni sinonimias en la tabla taxon mica Mientras se implementan algunas de estas funciones los datos dela validaci n taxon mica Anexo 2 se tratar n como en el caso de georreferenciaci n Los nombres cient ficos validados se expondr n en en proveedor TapirLink luego de que
9. og a fueron validadas o actualizadas seg n la ltima edici n del cat logo de mam feros en un proceso en paralelo Se produjeron las planillas para validaci n taxon mica de Herpetolog a y est n avanzadas las de datos previos de Aracnolog a Instalaci n del proveedor TapirLink Se instalaron Apache Web Server Int rprete Php y Mysql server en el servidor de la instituci n Se instal el proveedor de datos Tapirlink configurando para cada recurso los Metadata Datasource Tables Localfilter Mapping y Settings requeridos Se implementaron consultas que mapean los datos de nuestras bases en el formato requerido por el proveedor DarwinCore http www macn secyt gov ar Investigacion proyectos inv_pro_colecciones_georef php 5 Mammal Networked Information System http manisnet org The World Spider Catalog Version 9 5 http research amnh org entomology spiders catalog 7 Wilson amp Reader s Mammal Species of the World 3rd edition 2005 http www bucknell edu MSW37 3 Lecciones aprendidas problemas y soluciones viables La eficiencia de carga de datos y consistencia de contenidos depende de la existencia de herramientas de carga y manejo de datos Al inicio de este proyecto en 2008 las herramientas m s promisorias Specify Ara estaban en fase de desarrollo por lo que continuamos desarrollando nuestra propia aplicaci n Aurora La ventaja de una aplicaci n propia es que tenemos soporte propio control d
10. otocolo de georreferenciaci n levemente modificado de protocolos existentes e La experiencia adquirida durante este trabajo fue muy til en las discusiones para delinear el Sistema Nacional de Datos Biol gicos de Argentina de inminente creaci n Adem s de los recursos y avances reportados arriba se progres en los siguientes elementos que formar n parte de los siguientes reportes a medida que cumplan las revisiones internas e Conversi n de una base de datos de la Colecci n Nacional de Aracnolog a unos 13000 registros que deben adecuarse al formato Aurora y Darwin Core 2 Estado Avanzado falta procesar el campo de Notas en texto libre que se desglosa en muchos otros campos pendiente de georreferenciaci n e Georreferenciaci n de la Colecci n Nacional de Mastozoolog a Estado 75 completa Se avanz en acuerdos de colaboraci n con un proyecto de la Administraci n de Parques Nacionales que utilizar a nuestros datos en el corto plazo e Digitalizaci n de 2400 nuevos registros de la Colecci n Nacional de Aracnolog a Estado En l nea en TapitLink http 168 96 62 13 tapirlink tapir php macnar pendiente de validaci n taxon mica y georreferenciaci n e Digitalizaci n de unos 3000 registros de las Colecciones Nacionales de Ornitolog a e Invertebrados que se reportar n en los pr ximos informes 2 Metodolog a empleada y actividades llevadas a cabo para alcanzar los productos programados Selecci n
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