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ObServe 2
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1. partir duquel on r alisera l insertion en base centrale de sorte ce qu elle devienne sa base locale active 2 tablir la connexion la base centrale et r aliser l insertion La qualit des donn es d observation et la finalisation des mar es est normalement de la responsabilit de l observateur N anmoins il est opportun que le gestionnaire des donn es proc de galement des v rifications avant d ins rer en base centrale Au minimum les v rifications suivantes doivent tre faites V rifier les donn es du mieux que possible au minimum v rifier que l encha nement des routes et des activit s semble correct nombre dates et heures V rifier que tous les formulaires sont cl tur s Sinon tous les cl turer avec le bouton Cl turer y compris le formulaire mar e 27 Le logiciel de saisie met en uvre de nombreux m canismes pour garantir une certaine qualit de donn es N anmoins chaque organisme utilisant ObServe devrait tablir sa propre cha ne de v rification de l information et d finir les contr les attribu s l observateur au gestionnaire de donn es ou toute autre personne entrant dans le workflow 19 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration 12 3 Sch ma de principe d une insertion Les tapes cl d une insertion sont les suivantes 1 Connexion la base centrale 2 S lection des mar es de la base locale active renseign e exporter 3 Synchr
2. Annuler Pr c dent Suivant Illustration 5 Assistant de r allocation des droits des r les de connexion PostgreSQL 5 Cliquer sur Suivant puis sur le dernier cran sur Utiliser 6 Apr s quelques secondes de traitement le processus se termine et les droits des utilisateurs ont t r appliqu s 8 Mise jour des donn es de r f rence d une base centrale depuis une autre base centrale r diger 9 Mise jour des donn es de r f rence d une base locale partir de la base centrale 9 1 Quand mettre jour A tout moment il est possible de mettre jour les donn es de r f rence d une base locale en tablissant une connexion avec la base centrale m me si la base locale mettre jour contient des donn es th matiques 1 e des mar es Cela permet par exemple de r cup rer de nouveaux bateaux de nouveaux observateurs ou de nouvelles esp ces dans un base dans laquelle des saisies 15 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration ont d j t commenc es et de poursuivre le travail en exploitant ces nouvelles entr es 9 2 Proc dure 1 Cliquer sur Actions Synchroniser le r f rentiel 2 Se laisser guider par l assistant Si des mises jour sont n cessaires l assistant proposera par s curit de faire une sauvegarde de la base locale avant d y faire toute modification En fin de processus l assistant r capitule les modifications qui
3. BMEc 490Mo 16 43 Action Annuler le changement de source de donn es termin e Illustration 6 Assistant d insertion de donn es dans la base centrale tape de configuration 3 S lectionner la ou les mar es exporter vers la base centrale Pour s lectionner toutes les mar es d un programme cliquer sur le programme Les mar es qui seront export es s affichent en bleu Les mar es affich es en noir ne seront pas export es Cliquer sur Suivant L cran de synchronisation du r f rentiel s ouvre Observe Administrateur v 2 2 Eichi Source de de Actio Navigai Configur Aid C Aucune source de donn es charg e Calculer les donn es Sauvegarde locale Exporter R sum Configurations Synchronisation R f rentiel Etape 2 7 S lection des donn es Programme DCR IRD E 10 03 2011 CABELLOU O Description de l tape S lection des donn es pour effectuer les op rations Annuler J lt Pr c dent J 8 Suivant Action Changement de source de donn es termin e 16 58 Illustration 7 Assistant d insertion de donn es dans la base centrale tape de s lection des mar es 21 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration 4 Confirmer l op ration de synchronisation du r f rentiel Le r f rentiel est synchronis et le rapport de synchronisation s affiche Cliquer sur Suivant L cran de calcul de donn es s affi
4. Ing nieur Pascal cauquil ird fr 33 4 99 57 32 15 CRH informatique Av Jean Monnet responsable du 34200 S te projet ObServe FRANCE Laurent FLOCH Administrateur Laurent floch ird fr 33 4 99 57 32 20 CRH des donn es Av Jean Monnet 34200 S te FRANCE Alain DAMIANO Gestionnaire Alain damiano ird fr 33 4 99 57 32 16 CRH des Av Jean Monnet embarquements 34200 S te d ob t observateurs FRANCE Code Lutin 25 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration info codelutin com 33 2 40 50 29 28 44 bd des Pas Enchant s 44230 Saint S bastien Sur Loire FRANCE 26 29 ANNEXES Sch ma du syst me d information dans son ensemble Dans ce manuel seul le logiciel de saisie dition visualisation a t trait Il s ins re en r alit dans un syst me d information int gr incluant une base de donn es centrale pourvue de fonctions d analyse spatiale et une syst me de synchronisation automatique des donn es entre logiciel et base centrale Voici un sch ma d ensemble Online mode Central data base Synchronization D 544 VAE Illustration 11 Sch ma d ensemble du syst me d information int gr ObServe Probl mes connus Refus d acc s la base de donn es Un bogue provoque parfois l affichage d une erreur lors de certaines actions Cette erreur est sans cons quences sur le bon fonctionnement du logiciel et l tat de la base de donn es Il s
5. jour des donn es de r f rence de la base centrale 17 ObServe 2 Manuel d installation et d administration 11 1Principes de gestion des donn es de r f rence ss 17 1A 2PrOCEdUre a C CIN EN ds sens STA ARN a tm ne 18 11 3Proc dure d activation d sactivation ses mt An Ne nano 18 12 Exporter la les mar e s d une base locale vers la base centrale 18 12 1Quand exporter vers la base centrale 2 42 nel a Rue 18 12 2 Travail preparat IPS Re na RS des Ans 19 12 3Sch ma de principe d une Sete tata ut detente At 19 12 4Proc dur d insertion sn nina n e nee 20 13 Exporter des mar es de la base centrale vers une base locale 24 13 1 Risques COMMAMLCI Een 9 lt 04560 E AN an eds este 24 1639 US de PR RER E SR ER RETIRE Te RER 24 133 BTOCE TUE ES Si co 25 F CONMAETS en e ASS ne ne NENE VANA SNR RSN nm nt 25 3 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration 1 Introduction ObServe est un syst me d information destin l observation embarqu e de la p che thoni re la senne Il a t con u au sein de l Observatoire Thonier un quipe de l Institut de Recherche pour le D veloppement IRD en charge du suivi de la p che thoni re tropicale fran aise et d velopp par la soci t Code Lutin Le syst me est constitu de deux modules Une base de donn es centrale h berg e sur un serveur PostgreSQL version 8 ou plus quip e optionnellement de fonctions spatiales PostGIS et d une con
6. 3 Param tres de connexion en annexe dede la mise jour 14 http observe labs libre entreprise org 10 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration 3 Mettre jour le raccourci sur le bureau 6 Migration de la base centrale vers une version sup rieure 6 1 Quand faut il migrer Il faut migrer une base centrale lorsqu une nouvelle version du logiciel s accompagne d un changement de version du mod le de donn es ce qui n est pas syst matique Cette information est g n ralement donn e sur la liste de diffusion des utilisateurs d ObServe 6 2 Proc dure Un changement de version du mod le de donn es s accompagne toujours d une nouvelle version du logiciel Pour proc der la migration du mod le de la base centrale il faut utiliser la nouvelle version de l application Il faut donc l avoir install e au pr alable sur un ordinateur cf section pr c dente La migration d une base centrale vers une version sup rieure se d roule en deux tapes 1 Mise jour du mod le et migration des donn es 2 R application des param tres de s curit 1 e droits des utilisateurs On proc de la migration en d marrant le logiciel ObServe dans un mode particulier le mode migration Un script de d marrage propre ce mode est fourni avec la distribution Mode d emploi 1 Se rendre dans le r pertoire d installation du logiciel dans le sous r pertoire obstuna admin 2 Ex cuter le script up
7. 7678668 Des donn es ont t modifi es et la base locale doit tre sauv e Le r f rentiel de votre base locale n est pas jour mais aucun conflit d tect Op ration termin e le 21 03 2011 17 10 51 O Description de l tape Synchronizer le r f rentiel depuis la base centrale Pr c dent J 8 Suivant a Action Changement de source de donn es termin e 17 10 Illustration 8 Assistant d insertion de donn es dans la base centrale rapport de synchronisation 5 Confirmer l op ration de calcul de donn es Les donn es calculables sont calcul es et le rapport de calcul s affiche Cliquer sur Suivant Si la base locale doit tre modifi e suite la synchronisation du r f rentiel l cran de sauvegarde s affiche 6 Confirmer la sauvegarde de la base locale puis cliquer sur Suivant L cran r capitulatif des mar es ins rer et leur statut d j pr sente ou absente dans la base centrale s affiche 22 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration Observe Administrateur v 2 2 o Navigai Configur Aid CJ Aucune source de donn es charg e Fichi Source de dc Actio N Configurations la S lection des donn es Synchronisation R f rentiel garde locale Exporter Calculer les donn es Sauveqgai cale Des donn es ont t modifi es et la base locale doit tre sauv e L op ration de synchronisation du r f rentie
8. IRD UMR EME Observatoire Thonier OBSERVE 2 SYST ME INT GR DE GESTION DES OBSERVATIONS EMBARQU ES DE P CHE THONNI RE LA SENNE MANUEL D INSTALLATION ET D ADMINISTRATION Auteur Pascal CAUQUIL Date de cr ation 09 03 11 R vision 310 g n r e le 04 04 11 par Pascal CAUQUIL ObServe 2 Manuel d installation et d administration Table des mati res J M Gotar alein te s sen 2140241212 nt nt RS URMESR NAN ERS 4 2 Terminologien Re A Re AR ET cn Re M nr sa 4 3 Installation de la base de donn es centrales ss tn etes 6 3 L BT T QUUS La on ae 00601A anne a debath sad anet int e Aea EEE IAN ete ia 6 3 2Installati n partir d tenu Sn Ree A SEDE T 3 3Installation depuis la sauvegarde d une autre base centrale 7 3 4 optionnel Installation des fonctions PostGIS rn r rr nr ran 7 3 5 optionnel Activation de la s curisation SSL 7 4 Premi re installation du logiciel sur un ordinateur 7 4 Pr requis Mat riels siens nn te ne th Get lise 4 4 2Diasnostic d Java menus dant ne AR r LG ARNA GR rires T 4 3 Tnstall tion d Javas ccssar e iaaea RES ska a SRS dde P der e E Den abie eN 8 4 3 180u8 MS WOW Sn nn tend nt 4 Ope apt ane EAT Aa tn NA Reed tete 8 4 3 25005 LN nets M ne ee Re are Ne teste dns CN En 8 AS And OBS ESS RSS in area a e a a a cn NE 8 A5 Test de l ADDICATON est Rene tn ea sn E A A Sn AN E ne ent nn 9 45 1So s MS Windows sodann iaaa iea ane A
9. Il n est pas n cessaire de l installer Si la r ponse indique une version inf rieure 1 6 0 11 ou est du type Il faut alors installer la derni re version de Java 4 3 Installation de Java Si le diagnostic pr c dent a conclu que Java n tait pas install ou jour il faut installer la derni re version adapt e au syst me MS Windows ou Linux 32 ou 64 bits 4 3 1 Sous MS Windows 1 T l charger l archive d installation Oracle Java JRE 6 32 ou 64 bits selon votre syst me sur le site d Oracle 2 Proc der l installation en veillant d s lectionner de pr f rence les offres partenaires d Oracle telles que la barre Yahoo 3 V rifier que l installation s est correctement effectu e en ouvrant une ligne de commande et en tapant La version install e devrait s afficher Sous Windows 7 il arrive que l installation de d roule correctement mais que la commande ne donne toujours pas le bon r sultat Il faut alors localiser le r pertoire d installation du fichier java exe et rajouter son chemin dans la variable d environnement syst me PATH La commande devrait pr sent retourner la version de Java install e 4 3 2 Sous Linux Utiliser le syst me de gestion des paquets du syst me Tester ensuite l installation avec NN M me si la version install e est suffisante mais pas totalement jour il est toujours bon de mettre jour Java avec la versio
10. Java n est pas bien install 4 5 3 Recherche des probl mes Si l application ne d marre pas en ex cutant le fichier go la raison la plus probable est que Java n est pas correctement install Pour cerner le probl me on peut lancer le fichier go depuis la ligne de commande terminal On pourra ainsi lire les messages d erreur 4 6 Cr ation d un raccourci sur le bureau Une fois que l application fonctionne cr er sur le bureau un raccourci vers le fichier go et le nommer ObServe 5 Mise jour de la version du logiciel sur un ordinateur Ce cas se pr sente lorsque ObServe est d j install sur une ordinateur et qu on veut le remplacer par une version sup rieure Lors du d marrage de la nouvelle version le logiciel va alors demander s il trouve une base locale existante et si c est n cessaire l autorisation de migrer la base locale de l ancienne vers la nouvelle version 11 Param tres de connexion en annexe de ce document 12 http observe labs libre entreprise org 9 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration 5 1 Sauvegarder la base locale Si des donn es avaient t saisies avec la version pr c dente et qu elles n avaient pas t sauvegard es il faut le faire maintenant 1 Lancer ObServe 2 Utiliser la fonction Source de donn es Sauver la base pour g n rer une sauvegarde 5 2 Installer la nouvelle version 1 T l charger le fichier ZIP d installatio
11. ateur a remis au gestionnaire des donn es l ordinateur qu il a utilis pour ses saisies et ses donn es se trouvent toujours dans la base locale active du logiciel ObServe install sur cet ordinateur Dans ce cas on pourra simplement connecter cet ordinateur au r seau et tablir la connexion la base centrale directement depuis l ordinateur qui a t utilis par l observateur L observateur a remis au gestionnaire des donn es l ordinateur qu il a utilis pour ses saisies et ses donn es se trouvent toujours dans la base locale active du logiciel ObServe install sur cet ordinateur mais on souhaite r aliser l insertion en base centrale depuis un autre ordinateur par exemple parce que l ordinateur de l observateur ne peut pas tre connect au r seau Dans ce cas il faut 1 Sauver la base locale active sous forme d une base locale sauvegard e avec la fonction Source de donn es sauver la base 2 Transf rer le fichier de sauvegarde sur l ordinateur depuis lequel on souhaite r aliser l insertion 3 Restaurer cette base sur le logiciel ObServe de cet ordinateur de sorte ce qu elle devienne sa base locale active renseign e 4 tablir la connexion la base centrale et r aliser l insertion L observateur a remis ses donn es au gestionnaire sous forme d une base locale sauvegard e fichier sql gz Dans ce cas il faut 1 Restaurer cette base sur le logiciel ObServe de l ordinateur
12. ation 4 Assistant de migration de version de base centrale tape 2 5 Cliquer sur Suivant puis sur le dernier cran sur Utiliser Apr s quelques minutes de traitement le processus se termine et la base centrale se retrouve jour 7 R allouer les droits des utilisateurs sur la base centrale 7 1 Quand r allouer les droits Mettre jour les droits des utilisateurs sur la base centrale est utile dans trois situations Une nouvelle base centrale a t cr e soit par une installation partir de rien soit par la restauration d une sauvegarde d une autre base centrale mais tous les r les au sens PostgreSQL requis pour cette nouvelle base n existaient pas au moment de la cr ation Le processus de cr ation ou de restauration n a donc pas pu allouer correctement les droits lors de son ex cution et il faut les r allouer a posteriori De nouveaux r les PostgreSQL ont t cr s auxquels on veut accorder des droits sur une base centrale ObServe pr existante par exemple le droit de lire les donn es ou bien de les administrer L assistant de r allocation des droits va permettre de les lister et de leur accorder les droits souhait s sur la base 13 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration Pour diverses raisons les param tres de s curit ne sont pas corrects sur la base centrale L assistant de r allocation des droits permet d y rem dier L op ration de mainte
13. che Observe Administrateur v 2 2 Fichi Source de dc Actio Navigai Configur Aid C B Aucune source de donn es charg e Calculer les donn es Sauvegarde locale Exporter R sum ie S lection des donn es le Synchronisation R f rentiel chronisation R f rentiel L op ration lt Synchronisation R f rentiel gt est termin e Progression globale Cr ation du diff rentiel pour le r f rentiel Syst me observ Cr ation du diff rentiel pour le r f rentiel Type de balise Cr ation du diff rentiel pour le r f rentiel Type d objet cr ation du diff rentiel pour le r f rentiel Vent beaufort Des donn es ont t supprim es du r ferentiel distant 9 objet s fr ird observe entities referentiel Observateur 1296737206944 0 471391731153635 fr ird observe entities referentiel Observateur 1299511084055 0 13979532682957104 fr ird observe entities referentiel Observateur 1299511132522 0 47488553151N 2496 fr ird observe entities referentiel Observateur 1299511146626 0 51773757606 fr ird observe entities referentiel Observateur 1299511162645 0 2652631592887629 fr ird observe entities referentiel Observateur 1299511181544 0 06951021785291356 frird observe entities referentiel Observateur 1299511196596 0 9150100296527914 I fr ird observe entities referentiel Observateur 1299511217074 0 08616179469119378 fr ird observe entities referentiel Observateur 1299511236753 0 933081286
14. d administration Etre restaur e partir d un fichier sql gz On obtient alors une base locale active vierge ou renseign e suivant le contenu de la base locale sauvegard e utilis e pour la restauration Base locale vierge Une base locale vierge est une base vide sans mar es Par contre elle contient toujours les donn es de r f rence Une base locale vierge peut tre active au sauvegard e Base locale renseign e Une base locale renseign e est une base locale qui contient toutes les donn es de r f rence come une base locale vierge plus des donn es d observation mar es Une base locale renseign e peut tre active au sauvegard e Base locale active C est la base de donn e de travail par d faut celle qui est ouverte automatiquement lorsque le logiciel d marre Elle n est pas transportable tant qu elle n a pas t sauv e sous forme d un fichier autonome et transportable avec le menu Source de donn es sauver la base Une base locale active peut tre vierge ou renseign e Base locale sauv e ou sauvegard e C est une base locale active qui a t sauv e sous forme d un fichier autonome et transportable avec le menu Source de donn es sauver la base Une base locale sauvegard e peut tre vierge ou renseign e Version de l application et version du mod le de donn es Le syst me ObServe volue r guli rement ce qui conduit des num ros de versi
15. date obstuna f L assistant de migration s affiche 15 la r ciproque est fausse 16 update obstuna sh sous Linux update obstuna bat sous MS Windows 11 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration Mise jour d obstuna Configuration N FN Etape 1 3 Configuration Configurer la base distante utiliser Url jdbc postgresqgl fumot proto mpl ird fr obstuna Login pcauquil Mot de passe paa a a a a a a e a a M mode ssl lopt observe 2 2 observe admin cli 2 2 ssl obstuna jks M Conserver le param trage Valide _ Connexion r ussie Certificat ssl opt observe 2 2 observe admin cli 2 2 ssl obstuna jks Droits R f rentiel Lecture Ecriture Donn es observateur Lecture Ecriture FPE O Description 3 a R a Veuillez configurer votre connexion la base distante Avant de pouvoir poursuivre vous devez valider la connexion Illustration 3 Assistant de migration de version de base centrale tape 1 3 Indiquer les param tres de connexion de la base migrer adresse JDBC identifiant mot de passe certificat SSL le cas ch ant Valider et cliquer sur Suivant 4 Sur l cran suivant sont list s tous les r les i e utilisateurs existants sur le serveur PostgreSQL Pour chacun indiquer les droits qu il aura sur la base de donn es centrale d ObServe Les possibilit s sont Non utilis R f rentiel Utilisateur Technic
16. depuis la sauvegarde d une autre base centrale r diger 3 4 optionnel Installation des fonctions PostGIS r diger 3 5 optionnel Activation de la s curisation SSL r diger 4 Premi re installation du logiciel sur un ordinateur 4 1 Pr requis mat riels Pour fonctionner correctement ObServe n cessite un ordinateur de bureau portable ou tablette fonctionnant sous MS Windows toutes versions partir d XP ou Linux une r solution d cran de 1440 900 pixels pour une utilisation en mode horizontal et de 1280 800 en mode vertical 1 Go de RAM sous Linux et MS Windows XP 2 Go sous MS Windows Vista ou sup rieur 4 2 Diagnostic de Java ObServe est d velopp en Java et n cessite au minimum une JVM Oracle Java 1 6 0 11 Pour savoir si Java est d j install et quelle version ouvrir une ligne de commande terminal et taper java version 4 Noter que PostgreSQL est nettement moins performant sur les syst mes MS Windows 5 Le mode vertical est r serv aux tablettes En dessous de ces r solutions le logiciel fonctionnera mais sera peu confortable 6 ObServe utilise un th me graphique introduit partir de la version 1 6 0 11 Avec les versions inf rieures de Java 1 6 le logiciel fonctionnera mais son apparence graphique ne sera pas optimale 7 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration Si la r ponse est du type Java est install en version 1 6 0 24
17. el autorise d exporter des mar es de la base centrale dans des bases locales Dans un contexte multi organismes dans lequel le syst me serait d ploy dans chaque institut et dans lequel chacun administrerait sa propre base centrale le retour de mar es des bases centrales vers les bases locales permet premi rement d utiliser ces derni res comme vecteur de transport de mar es entre les bases centrales des multiples sites o le syst me ObServe est d ploy Une mar e export dans une base locale depuis une base centrale peut tre r ins r e dans une autre base centrale par exemple celle d un autre organisme Deuxi mement dans le cadre de mutualisations de donn es entre organismes cela permet de constituer une base centrale commune qui peut tre ph m re ou durable partir des donn es des bases centrales de chacun Une telle base peut par exemple servir de base de donn es de r f rence chelle sup rieure ou bien servir des analyses de donn es communes inter organismes 13 3 Proc dure r diger 14 Contacts L quipe d ObServe est l coute des utilisateurs Les retours qui seront formul s positifs ou n gatifs ainsi que les d clarations de bogues seront tudi s et permettront de faire progresser le logiciel IRD Observatoire Thonier Pierre Directeur Pierre chavance ird fr 33 4 99 57 32 54 CRH CHAVANCE Av Jean Monnet 34200 S te FRANCE Pascal CAUQUIL
18. f rence de la base centrale th matique Mise jour des donn es de r f rence d une base locale partir de la base centrale th matique Exporter la les mar e s d une base locale vers la base centrale th matique Exporter des mar es de la base centrale vers une base locale Les points not s informatique sont des op rations techniques exceptionnelles qui concernent l administrateur informatique les points not s th matique sont des op rations de routine qui ne n cessitent pas de comp tences informatiques et qui peuvent tre r alis es par le gestionnaire des donn es 2 Terminologie Programme Un programme d observation est une unit de regroupement de mar es Un programme est g n ralement d fini par une p riode temporelle ex 2011 2013 un financement une ou des zones g ographiques un pays un protocole d observation 4 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration Mar e Une mar e est une p riode pass e en mer par un bateau d finie par un d part et un retour au port Une mar e est rattach e un et un seul programme et est constitu e de une ou plusieurs routes Donn es de r f rence r f rentiel et donn es th matiques Les bases de donn es d ObServe contiennent deux sous ensembles les donn es de r f rence et les donn es th matiques Les donn es th matiques sont les observations Elles repr sentent le fruit du travail de l observateur P
19. i le delta indique des suppression d l ments dans la base centrale qui sont pas utilis s par les donn es th matiques de la base locale les conflits sont signal s et une interface graphique permettra l op rateur de les r soudre la vol e Chaque donn e de r f rence peut tre active ou inactive Une donn e active peut tre utilis e par les observateurs dans les formulaires de saisie a contrario une donn e inactive ne peut pas tre utilis e pour de nouvelles saisies 1 e elle n apparait pas dans les listes de choix des formulaires de saisie D sactiver une donn e de r f rence est utile lorsque des donn es th matiques anciennes pr sentes en base centrale y font appel elle doit donc absolument rester en base mais qu elle ne doit plus tre utilis e pour les nouvelles mar es par exemple parce que cette donn e a disparu du protocole d observation en cours La suppression d une donn e de r f rence doit tre rarissime Elle ne peut avoir lieu que lorsqu aucune donn e th matique n y fait r f rence Lorsqu une donn e de r f rence ne doit plus tre utilis e par les observateurs on pr f rera g n ralement la d sactiver 17 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration 11 2 Proc dure d dition 1 Ouvrir le logiciel de saisie 2 Cliquer sur Source de donn es Changer la source de donn es L assistant Changer la source de donn es s ouvre 3 Dans la sec
20. ien 17 Non utilis le r le n aura aucun droit sur la base 18 R f rentiel le r le aura seulement le droit de lire et rapatrier les donn es de r f rence Un tel compte est employ pour g n rer une nouvelle base locale partir de la base centrale ou encore pour synchroniser le r f rentiel d une base locale avec celui de la base centrale 19 Utilisateur le r le aura le droit de lire et uniquement lire toutes les donn es de la base donn es de r f rence et donn es th matiques Un tel compte est employ pour consulter les donn es sans risque de les alt rer 20 Technicien le r le aura un acc s complet en lecture criture Un tel r le est employ pour administrer les donn es modification des donn es de r f rence exportation des donn es d une base locale vers la base centrale modification et suppression des donn es de la base centrale Il doit tre utilis avec pr cautions 12 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration Mise jour d obstuna Configuration S curit Propri taire de la base pcauquil R le Non utilis R f rentiel Utilisateur Technicien dbaBalb w LJ dbaLegu w dbaSard M devot M expleguna M invbalbaya M inviotc M invleguna M M U O invsardara Ifloch referentiel DEOOGOBE BEL O Description Mise en place de la s curit annuler Pr c dent D Suivant Tllustr
21. inux update security obstuna bat sous MS Windows 22 Non utilis le r le n aura aucun droit sur la base 23 R f rentiel le r le aura seulement le droit de lire et rapatrier les donn es de r f rence Un tel compte est employ pour g n rer une nouvelle base locale partir de la base centrale ou encore pour synchroniser le r f rentiel d une base locale avec celui de la base centrale 24 Utilisateur le r le aura le droit de lire et uniquement lire toutes les donn es de la base donn es de r f rence et donn es th matiques Un tel compte est employ pour consulter les donn es sans risque de les alt rer 25 Technicien le r le aura un acc s complet en lecture criture Un tel r le est employ pour administrer les donn es modification des donn es de r f rence exportation des donn es d une base locale vers la base centrale modification et suppression des donn es de la base centrale Il doit tre utilis avec pr cautions 14 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration Mise jour d obstuna Configuration S curit Propri taire de la base pcauquil R le Non utilis R f rentiel Utilisateur Technicien dbaBalb dbaLegu dbaSard LJ devot UU UU M M M expleguna M invbalbaya M inviotc M invleguna M v U O invsardara Ifloch referentiel DOCOOEL Description Mise en place de la s curit
22. l a engendr e des modifications V Sauver la base locale R pertoire home pcauquil observe backup obstuna ocal 2011 03 21 16 42 45 sq gz Fichier D marrer l op ration lt Sauvegarde de la base locale gt O Description de l tape Sauver les modifications sur votre base source a Annuler lt Pr c dent gt Suivant Action Changement de source de donn es termin e Illustration 9 Assistant d insertion de donn es dans la base centrale tape de sauvegarde de la base locale 7 En fonction de l information de pr sence absence en base centrale confirmer ou infirmer avec les cases cocher d di es l insertion de chaque mar e de la base locale dans la base centrale Cliquer sur Suivant L cran de lancement de l insertion s affiche 17 12 8 Confirmer l insertion en cliquant sur le bouton Exporter les donn es observateur L insertion s op re et le rapport s affiche 23 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration Observe Administrateur v 2 2 Fichi Source de dc Actio Navigai Configur Aid C Aucune source de donn es charg e Configuration S lection des donn es Synchronisation R f rentiel Calculer les donn es Sauvegarde locale R sum Pr parer l op ration lt Exporter les donn es observateurs gt IQ Description de l tape Exporter les donn es observateurs vers la base cen
23. n es en cliquant sur le bouton Configurer de la section Configuration de la base de r f rence Renseigner les param tres habituels adresse JDBC identifiant mot de passe certificat SSL le cas ch ant et cliquer sur Suivant L cran de s lection des mar es exporter s affiche 28 Des conflits de donn es de r f rence ne peuvent survenir que si des entr es de r f rentiel ont t supprim es dans la base centrale entre le d part et le retour de l observateur et si les entr es supprim es ont t utilis es durant cette p riode par cet observateur 20 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration Observe Administrateur v 2 2 Etape 1 7 Configuration Configuration des op rations Op rations effectuer M Synchronisation R f rentiel J Exporter J Calculer les donn es Configuration de la base source LL lt Base source lt locale nome pcauquil observe db obstuna gt amp Configurer Droits R f rentiel Lecture Donn es observateur Lecture Ecriture Configuration de la base de r f rence r Aucune base de r f rence d finie p Source de donn es non configur e Vous devez poss der les droits d critures sur les donn es de la base distante Description de l tape Configuration des op rations et sources de donn es utiliser Q Annuler 4 Pr c dent D Suivant
24. n de la version la plus jour de pr f rence depuis le serveur FTP de l Observatoire Thonier ou d faut sur le site officiel du projet v observe gt observe cli 2 1 gt observe cli 2 2 Illustration 1 Contenu du dossier observe pendant la mise jour 2 D compresser cette archive directement dans le dossier observe d j existant et dans lequel la version pr c dente tait install e On se retrouve alors avec les deux versions install es dans le r pertorie observe 3 Lancer la nouvelle version avec le fichier go 4 Si le programme le demande accepter de migrer les donn es de l ancienne vers la nouvelle version 5 R aliser une sauvegarde de cette nouvelle base avec la fonction Source de donn es Sauver la base 6 Fermer l application A l issue de cette op ration les donn es de la base locale saisie avec la pr c dente version doivent s afficher correctement dans la nouvelle version La migration des donn es s est alors d roul e avec succ s 5 3 Supprimer l ancienne version Si la migration de la base locale ancienne version s est ben d roul e il n y a plus de raison de conserver de traces de la version pr c dente 1 Supprimer le r pertorie d installation de l ancienne version 2 Supprimer la sauvegarde de la base locale effectu e par s curit au d but de ce processus v observe gt observe cli 2 2 Illustration 2 Contenu du dossier observe l issue 1
25. n la plus r cente Adresse des t l chargements http www java com fr download Exemple de chemin ajouter c Program Files x86 Java Jre1 6 0 24 bin 10 On acc de cette variable par Panneau de configuration Syt me Avanc Variables d environnement Variables syst me ObServe 2 Manuel d installation et d administration 4 4 Installation d ObServe 1 Cr er un r pertoire observe qui aura pour but de contenir les versions successives du logiciel Sous MS Windows on pr conise de cr er ce dossier la racine du lecteur c Sous Linux Ubuntu on pr conise de cr er ce dossier dans opt 2 T l charger le fichier ZIP d installation de la version la plus jour de pr f rence depuis le serveur FTP de l Observatoire Thonier ou d faut sur le site officiel du projet 3 D compresser cette archive directement dans le dossier observe pr c demment cr Ainsi sous MS Windows ObServe se retrouvera install ici C observe observe cli x x Sous Linux ObServe se retrouvera install ici opt oserve observe cli x x 4 5 Test de l application 4 5 1 Sous MS Windows Dans le r pertoire d installation double cliquer sur le fichier go bat L application doit se lancer Dans le cas contraire Java n est pas bien install 4 5 2 Sous Linux Dans le r pertoire d installation double cliquer sur le fichier go sh L application doit se lancer Dans le cas contraire
26. nance Migration de la base centrale vers une version sup rieure qui vient d tre abord e regroupe d une part une mise jour du mod le et des donn es et d autre part la r allocation des droits des utilisateurs L op ration R allouer les droits des utilisateurs sur la base centrale dont il est question pr sent consiste ne jouer que la partie r allocation des droits des utilisateurs Le processus est donc similaire au pr c dent la partie mise jour du mod le et des donn es en moins 7 2 Proc dure On proc de la r allocation des droits en d marrant l application ObServe dans un mode particulier le mode mise jour de la s curit Un script de d marrage propre ce mode est fourni avec le logiciel Mode d emploi 1 Se rendre dans le r pertoire d installation du logiciel dans le sous r pertoire obstuna admin 2 Ex cuter le script update security obstuna L assistant de mise jour des droits s affiche 3 Indiquer les param tres de connexion de la base adresse JDBC identifiant mot de passe certificat SSL le cas ch ant Valider et cliquer sur Suivant 4 Sur l cran suivant sont list s tous les r les 1 e utilisateurs existants sur le serveur PostgreSQL Pour chacun indiquer les droits qu il aura sur la base de donn es centrale d ObServe Les possibilit s sont Non utilis R f rentiel Utilisateur Technicien 21 update security obstuna sh sous L
27. nexion s curis e SSL Un logiciel de saisie modification consultation des donn es install sur autant d ordinateurs que n cessaire Ces ordinateurs peuvent tre des ordinateurs de bureau portables ou tablettes quip s de MS Windows toute version partir de Windows XP ou Linux Le logiciel dispose de fonctions de synchronisation des donn es de r f rence et th matiques avec la base centrale Il est par ailleurs multiplateforme d velopp en Java il fonctionne sous MS Windows toutes versions et Linux Sa conception le rend robuste face aux volutions futures des syst mes d exploitation Enfin il est con u pour fonctionner sur ordinateurs de bureau portables et tablettes Ce document aborde plusieurs aspects de l administration du syst me qui suivant les besoins peuvent tre consid r s ind pendamment informatique Installation de la base de donn es centrale informatique Premi re installation du logiciel sur un ordinateur informatique Mise jour de la version du logiciel sur un ordinateur informatique Migration de la base centrale vers une version sup rieure informatique Mettre jour les droits des utilisateurs sur la base centrale informatique Mise jour des donn es de r f rence d une base centrale depuis une autre base centrale th matique Migration d une base locale vers une version sup rieure th matique Mise jour des donn es de r
28. nine 9 412552 8 OS LIENS a 12 1277 20 2 1 M NS DRA dass E EE de A 9 4 5 3Recherche des probl meS s ssisssssrsestssdvssdss sr assessor ds srssdissddds sider ssees dvs in ars RSi retees 9 4 6Cr ation d un raccourci sur le DUTCAU sssssressrerrsrrrsrrrrrrsrrrsrrrrrsrrrsrrrrrsr nr rr rs nrrrsr esse sen nn rr nn rr rr rena 9 5 Mise jour de la version du logiciel sur un ordinateur 9 5 1Sauvegarder la base lose et nee en nd st eee ne 9 5 2Installer la nouvelle version eee nimes 10 5 3Supprimet l ancienne Verso his ne ire ere re eee Mon nnc EN dane 10 6 Migration de la base centrale vers une version sup rieure 11 6 1Quand faut il migrer Pire nana R free a tre 11 O52PrOCE 161 q aonn aa 5 c e SENAST A Sak eV aE E A R n 11 7 R allouer les droits des utilisateurs sur la base centrale 13 TA QUand r allouer Tes OISE nan a sc A ane are 13 T APFOC QUTO A e e ct dE SR 14 8 Mise jour des donn es de r f rence d une base centrale depuis une autre base centrale 15 9 Mise jour des donn es de r f rence d une base locale partir de la base centrale 15 9 TQuand mettre JOV se Lt A EAE animent teste 15 D DU HA ROLE LA EE LRT 0 OSA CRA TC S EEE ARA AAC R SRS SA CRA Sergi 16 10 Migration d une base locale vers une version sup rieure 16 LO TQuand migrer Ls 2262h20 a e di ent dnn d EIS endi 16 10 2Proc d r d Migratioh 2222ingn siin ee en Eee R NAR rs SA ds ANS da a ne 16 11 Mise
29. nt o une mar e est en base centrale ce sont les donn es de la base centrale qui font r f rence et la base locale d origine doit tre oubli e 10 2 Proc dure de migration Pour migrer une base locale en version sup rieure il suffit de l ouvrir avec la version la plus jour du logiciel ObServe Le logiciel d tecte alors automatiquement le delta entre la version du mod le de donn es de la base locale et la version de mod le pour lequel il est con u et proposera si n cessaire d effectuer la migration On pourra alors soit ins rer les mar es dans la base centrale 26 En vertu du principe de non redondance et de gestion centralis e des donn es 16 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration soit sauvegarder cette base active pr sent migr e sous forme d une base locale sauvegard e avec la fonction Source de donn es Sauver la base 11 Mise jour des donn es de r f rence de la base centrale 11 1 Principes de gestion des donn es de r f rence La modification des donn es de r f rence si elle est facile n est pas anodine Tout ajout de donn e de r f rence et plus encore toute suppression peuvent tre lourds de cons quence sur la pertinence des donn es th matiques Chaque modification doit tre m rement r fl chie Cette mise en garde tant pos e la gestion saine des donn es de r f rence fait partie des concepts cl s du fonctionnement d ObSe
30. on successifs Il faut noter cependant que version du mod le de donn es et version du logiciel voluent semi ind pendamment Cela signifie qu un changement de version du logiciel n implique pas n cessairement une migration des bases de donn es centrale ou locales contrario lorsque le mod le de donn es volue la version du logiciel change n cessairement Lorsque la version du mod le de donn es change il faut obligatoirement migrer les bases locales processus automatique d clench automatiquement l ouverture d une base de version obsol te avec la nouvelle version du logiciel et la base centrale processus automatique mais qui doit tre d clench manuellement depuis la nouvelle version du logiciel 3 Installation de la base de donn es centrale 3 1 Pr requis Installer la base de donn es centrale n cessite d avoir disposition un serveur PostgreSQL 8 x sous 3 ObServe n a pas encore t test sur PostgreSQL 9 6 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration Unix Linux ou MS Windows Par ailleurs l extension PostGIS pour PostgreSQL doit tre install e si l on souhaite disposer des fonctions d analyse spatiale Le mode SSL de PostgreSQL doit tre correctement configur et activ sur le serveur si l on souhaite que la communication entre la base de donn es centrale et les logiciels soit crypt e 3 2 Installation partir de rien r diger 3 3 Installation
31. onisation du r f rentiel de la base locale avec celui de la base centrale et r solution des conflits ventuels 4 Lancement de la proc dure de calcul de donn es au cas o l observateur ne l aurait pas lanc e lui m me 5 Sauvegarde de la base locale dans le cas o la synchronisation du r f rentiel a engendr des modifications dans cette base locale 6 Exportation La synchronisation du r f rentiel local avec le r f rentiel distant est indispensable pour assurer une insertion en base centrale sans risque de corruption des donn es Le for age de la proc dure de calcul avant insertion assure que les donn es de la base centrale seront dans l tat le plus complet possible Si la ou une des mar e s que l on tente d ins rer existe nt d j dans la base centrale le syst me demandera soit d craser celle s qui est sont d j dans la base centrale soit d ignorer l insertion de la version de la base locale 12 4 Proc dure d insertion On consid re dans cette section que les mar es ins rer en base centrale sont dans la base locale active du logiciel ObServe de l ordinateur qui va tre utilis pour l insertion cf section Travail pr paratoire La proc dure d insertion en base centrale est alors la suivante 1 Lancer l assistant d insertion avec le menu Actions Exporter vers ObsTuna 2 Configurer la connexion la base de r f rence 1 e La base centrale destinataire des don
32. ont t apport es la base locale 10 Migration d une base locale vers une version sup rieure Cette proc dure est enti rement automatis e et n est pr sent e qu titre informatif 10 1 Quand migrer La migration d une base locale dans une version sup rieure n est r ellement n cessaire que dans le cas suivant Un observateur embarque une date t0 avec la version n0 du mod le de donn es Le mod le de donn es volue une date t1 t1 gt t0 en version n1 alors que l observateur est toujours en mission d observation avec un mod le de donn es en version n0 L observateur rentre de mission une date t2 t2 gt t1 gt t0 avec une base locale renseign e qui est toujours en version n0 Or le mod le de donn es de la base centrale est pass entre temps en version nl Pour pouvoir ins rer la les mar e s de cet observateur dans la base centrale il va d abord falloir migrer sa base locale renseign e en version n1 Plus anecdotique il peut ventuellement tre utile de migrer une ancienne base locale renseign e sauvegard e en fichier sql gz avec la fonction Source de donn es Sauver la base et archiv e vers la version la plus jour afin de pouvoir l ouvrir avec le logiciel ObServe le plus jour N anmoins cette situation devrait tre caduque puisque toute mar e d une base locale renseign e se retrouve tr s rapidement dans la base centrale partir du mome
33. our assurer leur int grit ainsi que leur homog n it avec les donn es th matiques d autres mar es les donn es th matiques font r f rence des listes de codes les donn es de r f rence Par exemple la liste des codes esp ces des codes bateaux et des cat gories de poids de thon font partie des donn es de r f rence Elles sont invariables et toujours pr sentes dans les bases Base locale Chaque ordinateur de saisie quip d ObServe dispose en fait de deux l ments le logiciel de saisie install sur le long terme et qui ne change pas except lors d un changement de version Son r pertoire d installation peut tre quelconque une base de donn es dite base locale laquelle le logiciel se connecte de mani re transparente pour ins rer lire modifier supprimer des donn es Cette base locale se trouve toujours dans le r pertoire personnel de l utilisateur dans un r pertoire cach nomm observe Cela signifie que si plusieurs utilisateurs utilisent un m me ordinateur avec leur compte Windows ou Linux respectif ils disposerons chacun de leur propre base de donn es En d autres termes les donn es de l un seront invisibles pour les autres Ceci signifie aussi que si un utilisateur utilise par m garde au autre compte pour se connecter son ordinateur que celui avec le quel il a commenc une saisie ObServe il ne trouvera pas ses donn es Lorsque ObServe est install sur un ordinate
34. rve Les m canismes de synchronisation inter bases rendent leur modification ais e et leur corruption impossible Les principes sont les suivants L dition ajout modification suppression activation d sactivation des donn es de r f rence se fait exclusivement dans la base centrale Le logiciel fournit des interfaces graphiques pour pouvoir r aliser ces op rations simplement uniquement lorsqu il est connect la base centrale via un compte utilisateur disposant des droits d administration En mode base locale ou bien connect la base centrale via un compte utilisateur qui ne dispose pas des droits d administration ces interfaces se limitent la visualisation des donn es de r f rence Le r f rentiel des bases locales est mis jour par connexion la base centrale Ce processus est automatis On peut indiff remment mettre jour le r f rentiel d une base locale vierge ou renseign e Avant toute exportation de donn es d un base locale vers la base centrale une synchronisation du r f rentiel de la base locale avec celui de la base centrale est syst matiquement effectu e Si le delta indique des ajouts ou des modifications d l ments pr existants dans la base centrale par rapport la base locale ou bien des suppressions d l ments qui ne sont pas utilis s par les donn es th matiques de la base locale aucun conflit n a lieu et l exportation est enti rement automatique S
35. t la suppression sera refus e 11 3 Proc dure d activation d sactivation Qu une donn e de r f rence soit utilis e ou pas par des donn es th matiques il est toujours possible de l activer ou de la d sactiver Contrairement une suppression cette op ration est sans grosses cons quences et est toujours r versible Pour d sactiver une donn e de r f rence i e la rendre invisible dans les formulaires de saisie ou pour l activer 1 e la rendre utilisable 1 Se rendre sur le formulaire d dition de la donn e concern e comme pour l diter 2 Choisir le statut d sir dans la liste d roulante pr vue cet effet 12 Exporter la les mar e s d une base locale vers la base centrale 12 1 Quand exporter vers la base centrale Lorsqu un observateur termine une mar e ou une mission regroupant plusieurs mar es ses donn es doivent tre ins r es dans la base centrale Tout logiciel ObServe install sur un ordinateur dispose d une fonction qui permet d ins rer les mar es de sa base locale active 1 e les mar es qui sont charg es automatiquement au d marrage du 18 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration logiciel dans la base centrale Cela signifie que pour ins rer des mar es en base centrale celles ci doivent figurer dans la base locale active d un logiciel ObServe 12 2 Travail pr paratoire Pour ins rer des mar es en base centrale trois cas se pr sentent L observ
36. tion Type de source de donn es s lectionner Utiliser une base distante puis cliquer sur Suivant L cran suivant demande les param tres de connexion la base centrale 4 Indiquer les param tres de connexion adresse JDBC identifiant mot de passe et certificat SSL le cas ch ant Cliquer sur Valider la connexion puis si la connexion est valide cliquer sur Suivant puis Utiliser Le logiciel se connecte la base centrale et affiche ses donn es 5 Dans l arbre de navigation d rouler la section R f rentiel Tous les types de donn es de r f rence apparaissent alors 6 Cliquer sur le type de donn es de r f rence diter La liste des donn es de ce type apparaissent alors dans la fen tre de donn es 7 Pour ajouter une nouvelle donn e de r f rence cette liste cliquer sur Ajouter compl ter le formulaire et terminer par Enregistrer La nouvelle donn e appara t alors dans la liste 8 Pour modifier une donn e de r f rence existante dans cette liste par exemple son libell ou une de ses valeurs num riques associ es cliquer dessus puis cliquer sur Modifier L cran qui suit affiche toutes les donn es modifiables Faire les modifications souhait es et terminer par Enregistrer 9 Pour supprimer une donn e de r f rence existante cliquer sur Supprimer Si des donn es th matiques lui font r f rence le syst me le signalera e
37. trale J Action Changement de source de donn es termin e Illustration 10 Assistant d insertion de donn es dans la base centrale tape d insertion Annuler lt Pr c dent 9 Fermer l assistant On peut v rifier que l insertion s est bien d roul e en changeant la source de donn es du logiciel et en se connectant la base centrale pour visualiser son contenu 13 Exporter des mar es de la base centrale vers une base locale 13 1 Risques connaitre Le respect scrupuleux des principes de non redondance et de gestion centralis e de l information interdit normalement le retour d informations de la base centrale vers une base locale Comme toute base locale peut tre modifi e l aide du logiciel ObServe cela pr sente le risque de voir na tre plusieurs versions branches d une m me mar e sans pouvoir par la suite fusionner ces diff rentes versions corrections afin de les r ins rer dans la base centrale Si une mar e n cessite des corrections alors elles doivent tre faites directement sur la base centrale par l administrateur des donn es Idem pour la consultation des donn es qui devrait toujours se faire depuis la base centrale Consulter des donn es depuis des bases locales ne garantit pas qu elles soient identiques aux donn es de la base centrale faisant office de r f rence 24 29 ObServe 2 Manuel d installation et d administration 13 2 Int r t N anmoins le logici
38. uffit de fermer la fen tre d erreur et de retenter l action pr c dente pour outrepasser le probl me Ce bogue ce d clenche assez rarement et sera corrig dans la prochaine version du logiciel
39. ur pour la premi re fois la base locale est absente et le logiciel ne peut pas travailler Il exige alors de cr er une nouvelle base locale On peut cr er cette base locale soit en effectuant une connexion la base centrale C est la m thode recommand e mais elle n cessite une connexion r seau au serveur qui h berge la base centrale soit en important un fichier de base locale sauvegard e au format sql gz C est la solution de secours lorsqu on ne dispose pas de connexion r seau au serveur de la base centrale Cela n cessite d avoir g n r au pr alable une base locale et de l avoir sauvegard e avec la fonction Source de donn es sauver la base de la barre de menu Une base locale peut Etre g n r e partir d une base centrale On obtient alors une base locale vierge active Etre sauv e sous forme d un fichier autonome et portable d extension sql gz On obtient alors une base locale sauvegard e vierge ou renseign e suivant le contenu de la base locale active au moment de la sauvegarde 1 N anmoins on conseille d utiliser C observe observe xxx y y sous Windows et opt observe observe xxx y y sous Linux Ubuntu de sorte localiser facilement le r pertoire d installation d une machine l autre en cas de besoin 2 R seau interne si l ordinateur et le serveur de la base centrale son sur le m me r seau ou Internet s ils sont distants 5 29 ObServe 2 Manuel d installation et
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