publication de données de biodiversité au gbif atelier de nouakchott
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1. 829 W 19 540266666666668 12 11381666666666 Azougui Adrar 20 30 N 1371 20 5 13 166666666666666 1500 usageKey 2440447 scientificName Tursiops truncatus g canonicalName Tursiops truncatus rank SPECIES synonym false tee 1 11 D NE order Cetacea family Delphinidae genus Tursiops species kingdomKey 1 phylumKey 44 classKey 359 orderKey 733 m genusKey 2440446 speciesKey 2440447 class Mammalia name gt LRMgazetteer lt name gt t dast RMg azetteer type string gt lt simplefield type stri lame gt Amogjar pass lt name 1on gt Adrar lt description document gt lt kml gt N 7 PR PARER LA PUBLICATION PR REQUIS Les donn es publier doivent tre Sous forme lectronique et dans un format exploitable Structur es et compr hensibles par une machine eg CSV JSON SQL XML expliqu es amp document es nettoy es amp valid es pr filtr es ou filtrables pour la publication identifiables de mani re unique et durable C est la partie la plus laborieuse du processus de publication 7 PR PARER LA PUBLICATION OCCURRENCE IDS Les bonnes pratiques suivre Ils doivent tre uniques dans le jeu de donn es 2 Ils doivent tre stables dans le temps Ils devraient tre uniques globalement eg urn MRBIF ENS HNM 040661 voir IPT v2 1 Promoting the use of stable occur2. PUBLICATION DE DONN ES DE BIODIVERSIT AU GBIF ATELIER DE NOUAKCHOTT MAURITANIE 2 3 SEPTEMBRE 2014 4 dip www gbif org hebae 1 rm O Oo CONTENU Les Principes du GBIF Pourquoi publier ses donn es R les des intervenants Propri t intellectuelle Que peut on publier Les donn es sensibles Pr parer la publication Comment publier Acc s aux donn es Utilisations 1 PRINCIPES DU GBIF Rendre accessible l ensemble des donn es primaires L acc s est rapide libre et gratuit L diteur de donn es d cide lui m me de ce qu il publie et des ventuelles restrictions d utilisation Les droits de propri t intellectuelle ne sont en rien modifi s par la publication au GBIF L diteur est seul garant de la qualit et de la p r nnit des donn es voir GBIF and Open Access 1 PRINCIPES DU GBIF ENGAGEMENTS DES DIFF RENTS ACTEURS Les pays signataires du Protocol d accord MoU s engagent mettre en oeuvre un noeud national afin de d velopper r seau dans le pays en y approuvant des institutions d sireuses de publier des donn es Les diteurs signent un accord de partage Les utilisateurs signent un accord d utilisation 1 PRINCIPES DU GBIF ACCORD DE PARTAGE Biodiversity data accessible via the GBIF network are openly and universally avai
3. arwin Core Archive Components Descriptor file i VernacularNames txt ZIP 2 Basis of Resource speciesProfile txt EML DwC Archive Taxon or Occurrence XML Metadata Document EN Extensions References txt DarwinCore Star Schema Distribution txt 9 ACCES AUX DONN ES Login or Create a new account News Community About Global Biodiversity Information Facility 449 696 555 1 454 694 15 321 626 Sharing biodiversity Providing evidence for Collaborating as a data for re use research and decisions global community Learn about GBIF Using data through GBIF Current Participants Publish your data through GBIF Enabling biodiversity science How GBIF is funded Technical infrastructure Supporting global targets Enhancing capacity a Search news items and information pages Pr requis 1 Cr er un compte sur www gbif org 2 Accepter l accord d utilisation 9 ACCES AUX DONN ES RECHERCHER DES DONN ES Search occurrences 25 694 results Configure Y Add a filter Camelus dromedarius Linnaeus 1758 a ervation 4 2014 Published in iNaturalist research grade observations Eidolon helvum Kerr 1792 auritania 10 2013 Published iNaturalist research grade observations 2 2012 Nemichthys scolopaceus Richardson 1848 Exemple 25 694 occurrences pour la Mauritanie 9 ACCES AUX DONN ES T L CHARGER DES DONN ES 7 GBIF ORG News Community About cor Free and open a
4. ccess to biodiversity data Occurrence Download Download started d r1 Your download 0005665 140711145354668 is running Please expect 10 to 15 minutes for the download to complete A notification email with a link to download the results will be sent to the following addresses once ready aheugheb ulb ac be In your user home you can also see the status and link to all your requested downloads Please visit this page to obtain information of how to use the downloaded data JOIN THE COMMUNITY WHO S PARTICIPATING KEY DOCUMENTS FOR DEVELOPERS 9 ACCES AUX DONN ES REVOIR SES T L CHARGEMENTS GBIF ORG enr Free and open access to biodiversity data Data News Community About andre Heughebaert 3 4 3 Your Downloads FILTER Country Mauritania STATUS Ready for download 5 3 MB 25 694 records 194 datasets CREATED 12 ao t 2014 FILTER TaxoN Milvus milvus Linnaeus 1758 STATUS Ready for download 5 9 MB 44 721 records 356 datasets CREATED 12 ao t 2014 TaxoN Milvus milvus Linnaeus 1758 Ready for download 3 2 MB 22 114 records 354 datasets 14 avr 2014 9 ACCES AUX DONN ES FAVORIS Date de modification Taille Type Tous mes fichiers citations txt aujourd hui 15 47 23 Ko texte zi Bureau gt dataset aujourd hui 15 54 Dossier 2 meta xml aujourd hui 15 47 34 Ko XML document 1 aheugheb 2 metadata xml aujourd hui 15 47 44Ko XML
5. document Applications multimedia txt aujourd hui 15 47 77 Ko X texte T l chargements occurrence txt aujourd hui 15 47 18 4 Mo texte rights txt aujourd hui 15 47 32 Ka texte TAGS verbatim txt aujourd hui 15 47 12 1 Mo texte Citations txt Comment citer les sources des donn es Occurrence txt Donn es index es par GBIF Rights txt Eventuelles restrictions d utilisation Verbatim txt Donn es telles que publi es par l diteur 10 UTILISATIONS Recherche bas e sur des donn es extraites du GBIF Quelques exemples sur le portail du GBIF e Les articles scientifiques via Mendeley GBIF Public Library eg publications d auteurs belges 10 UTILISATIONS La publication des donn es offre de nouvelles perspectives e Au niveau national elle d cloisonne les chercheurs et les disciplines les d partements et les institutions e Au niveau international elle permet de mieux g rer certaines probl matiques eg esp ces migratrices esp ces invasives et zones frontali res MERCI POUR VOTRE PARTICIPATION Andr Heughebaert Noeud Belge du GBIF a heughebaert biodiversity be Biodiversity be 67 GBIF www gbif org Fait avec reveal js HTML Presentations made easy
6. ent par le GBIF respecte les conditions fix es par les diteurs de donn es qui d cident d affilier leurs bases de donn es au GBIF 4 PROPRI T INTELLECTUELLE MENTION DE LA SOURCE e Le GBIF doit s assurer que l diteur d tenteur des donn es est bel et bien mentionn et que les mentions de source sont maintenues lors des utilisations ult rieures des donn es 4 PROPRI T INTELLECTUELLE DROITS DE PROPRI T INTELLECTUELLE SUR LES OUTILS APPLICABLES LA BIODIVERSIT Le GBIF peut revendiquer les droits de propri t intellectuelle appropri s existants des instances nationales concern es sur tous les outils comme des moteurs de recherche ou d autres produits logiciels con us par le GBIF dans l ex cution de son programme de travail 4 PROPRI T INTELLECTUELLE TRANSFERT DE TECHNOLOGIES Les participants reconnaissent que sous r serve des droits de propri t intellectuelle pertinents GBIF doit s efforcer de promouvoir le transfert non exclusif selon des modalit s mutuellement convenues et des tablissements de recherche surtout dans les pays en d veloppement des technologies informatiques qui sont disponibles en particulier en ce qui concerne les programmes de formation et de renforcement des capacit s voir Protocol d accord 4 8 5 QUE PEUT ON PUBLIER e Des occurrences 2 Specimens de Collection Observations e Des listes d esp ces checklists e Des meta donn es s
7. eules eg si les donn es sont pas num ris es voir comment publier au GBIF 5 QUE PEUT ON PUBLIER des descriptions d esp ces des mesures des chantillons des documents multim dia des s quences ADN e des liens vers d autres sites voir les extensions au DarwinCore 6 LES DONN ES SENSIBLES Qu est ce qu une donn e sensible Toute donn e dont la publication est probl matique e Pour l esp ce en question eg braconnage Pour l observateur ou le collectionneur eg l gislation e Pour l auteur ou son institution eg embargo sur r sultats non publi s 6 LES DONN ES SENSIBLES Que faire des donn es sensibles Ne pas les publier m tadonn es seulement Ne les publier que partiellement les donn es non probl matiques Omission ou floutage des coordonn es eg grille 10x10km Identifier le genre plut t que l esp ce 7 PR PARER LA PUBLICATION HOLOTYPUS 9 002 130 T gum fw Pa Africum Flor hetan One IO RELL 2 p FT 68 s gt E 4 e AT Fa 7 PR PARER LA PUBLICATION r gion localit coordonn es latitude longitude incertitude Aggui Adrar 21 10 N 166666666666668 13 116666666666667 1500 Amogjar pass AURIS ee Oh 12546 20 5559555553 33559555 12 9 1500 Atar Adrar 20931784 1390 20 516666666666666 13 05 1500 Ain xad ete 12 06
8. lable to all users within the framework of the GBIF Data Use Agreement and with the terms and conditions that the Data Publisher has identified in its metadata GBIF does not assert any intellectual property rights in the data that is made available through its network The Data Publisher warrants that they have made the necessary agreements with the original owners of the data that it can make the data available through GBIF network The Data Publisher makes reasonable efforts to ensure that the data they serve are accurate Responsibility regarding the restriction of access to sensitive data resides with the Data Publisher The Data Publisher includes stable and unique identifiers in their data so that the owner of the data is known and for other necessary purposes GBIF Secretariat may cache a copy and serve full or partial data further to other users together with the terms and conditions for use set by the Data Publisher Queries of such data through the GBIF Secretariat are reported to the Data Publisher Data Publishers are endorsed by a GBIF Participant if applicable before their metadata is made available by the GBIF Secretariat GBIF Secretariat is not liable or responsible nor are its employees or contractors for the data contents or their use or for any loss damage claim cost or expense however it may arise from an inability to use the GBIF network 1 PRINCIPES DU GBIF ACCORD D UTILISATION The quality a
9. mm e des Auteurs et de leurs Institutions S offrir de nouvelles opportunit s de collaboration Permettre de nouvelles recherches d utiliser gratuitement les donn es publiques d j receuillies e Rapatrier les connaissances dans leur pays d origine Etre citer par la publication d un data paper 2 POURQUOI PUBLIER SES DONN ES Everything Show Donn es historiques XIX XX 173 millions d occurrences 25 de specimens 2 POURQUOI PUBLIER SES DONN ES Donn es r centes XXI 207 millions d occurrences lt 4 de specimens 3 R LES DES INTERVENANTS ta Resource Institution C T 58 Data Owner Servers i Node Manager Technical Contact Technical Contact 3 R LES DES INTERVENANTS e Dans l Institution Auteur s des donn es Contact Technique Contact Administratif e Au Noeud national Gestionnaire du Noeud Technicien s Au Secr tariat D veloppeurs Support 4 PROPRI T INTELLECTUELLE Le GBIF encourage la libre diffusion des donn es sur la biodiversit et plus particuli rement ne revendique aucun droit de propri t sur le contenu des bases de donn es constitu es par d autres organismes et subs quemment affili es au GBIF cherche dans toute la mesure du possible rendre librement et facilement accessibles avec un minimum de restrictions leur r utilisation toutes les donn es command es cr es ou constitu es directem
10. nd completeness of data cannot be guaranteed Users employ these data at their own risk Users shall respect restrictions of access to sensitive data In order to make attribution of use for owners of the data possible the identifier of ownership of data must be retained with every data record Users must publicly acknowledge in conjunction with the use of the data the Data Publishers whose biodiversity data they have used Data Publishers may require additional attribution of specific collections within their institution Users must comply with additional terms and conditions of use set by the Data Publisher Where these exist they will be available through the metadata associated with the data 1 PRINCIPES DU GBIF EVOLUTION PROCHAINE La situation actuelle est assez complexe et difficile appliquer Les diteurs seront amen s choisir une license de type Creative Commons Le Secr tariat pr pare avec la communaut un code de conduite pour les diteurs et les utilisateurs Un m canisme de citation via le syst me Digital Object Identifier DOI est l tude voir Consultations sur les Licenses et d adoption des diteurs 2 POURQUOI PUBLIER SES F DONNEES 2 POURQUOI PUBLIER SES DONN ES Inventorier la Biodiversit du pays Comprendre son volution et enrayer son d clin D cider sur base de connaissances scientifiques Renforcer la cr dibilit des travaux publications et augmenter la reno
11. rencelDs 7 PR PARER LA PUBLICATION LES OUTILS RECOMMAND S un bon diteur de texte eg Atom Emacs jEdit Vim QuantumGIS SQLite LibreOffice OpenRefine les webservices du GBIF 8 COMMENT PUBLIER Which f data hich type of data Metadata Metadata Metadata p m m Taxonomic Occurrence Dataset Data Data GBIFS developed tools Community tools Select a tool Ns 2 re Integrated Spreadsheet DiGIR Publishing Toolkit Processor Publish your data 222 gt 723 LS LAS Register with GBIF ED 26 I WORK Discovery through the Portal 8 COMMENT PUBLIER OUTILS RECOMMAND S e Outils d velopp s par GBIF P T Integrated Publishing Toolkit DarwinCore Assistant 2011 Spreadsheet Processor 2011 e Les autres outils BioCASe 2010 Digi 2004 8 COMMENT PUBLIER D monstration de publication des donn es avec l Integrated Publication Toolkit voir IPT v2 1 Manuel d utilisateur 8 COMMENT PUBLIER LES M TADONN ES Base Titre Description Type Langue Contact G o Coordonn es Description Taxo Nom scientifique Rang Description Tempo Dates Type Mots Cl s Projet 8 COMMENT PUBLIER LES DONN ES Type Occurrences liste d esp ces ou metadonn es seules Conversion quasi automatique en DarwinCore D
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