habitat pour les organismes aquatiques
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1. Orth D J amp Vigneux E Eds Bull Fr P che Piscic 337 338 339 303 308 Guay J C Boisclair D Rioux D Leclerc M Lapointe M amp Le gendre P 2000 Development and validation of numerical ha bitat models for juveniles of Atlantic salmon Salmo salar Can J Fish Aquat Sci 57 2065 2075 Haury J Ombredane D amp Baglini re J L 1991 L habitat de la truite commune Salmo trutta en cours d eau In La truite biolo gie et cologie INRA publ Paris Baglini re et Maisse Eds 47 95 Heggenes J 1990 Habitat utilization and preferences in juvenile Atlantic salmon Salmo salar in streams Reg Riv Res amp Ma nag 5 341 354 f Heggenes J amp Saltveit S J 1990 Seasonal and spatial microha bitat selection and segregation in young Atlantic salmon Salmo salar L in a Norwegian river J Fish Biol 36 707 720 Heggenes J Baglini re J L amp Cunjak R A 1999 Spatial niche variability for young Atlantic salmon Salmo salar and brown trout S trutta in heterogeneous streams Ecol Freshwat Fish 8 1 21 Fig 5 Exemple d une courbe de preferenda repr sentation quantitative des r sultats Fig 5 Example of a preference curve quantitative representation of the results 9 MOD LES BIOLOGIQUES D HABITAT AVEC ProCURVE 337 Heland 1991 Organisation sociale et territorialit chez la truite commune immature au cours de l ontog n se In L2. ponc tuelle sont pr pond rants pour expliquer la pr sence de l esp ce par rapport d autres l ments Le micro habitat constitue donc l unit d habitat l mentaire et correspond l emplacement que peut occuper l indivi du si les conditions lui conviennent L utilisation de la m thode des microhabitats n cessite de conna tre les pr f rences d habitat de l individu pour les variables physiques consid r es Les courbes de preferenda d habitat Baldrige amp Amos 1982 et les profils colo giques Daget amp Godron 1982 repr sentent les mo d les biologiques les plus fr quemment utilis s Bo vee 1982 Sheppard amp Johnson 1985 Pouilly 1994 Mastrorillo 1997 Roussel et al 1999 Guay et al 2000 Les profils cologiques sont consid r s comme un indice de s lection et d utilisation de l habitat pour l esp ce et le stade tudi s En revanche les courbes de preferenda renseignent sur les pr f rences intrin s ques des individus vis vis des facteurs physiques de l environnement Avec la multiplication de ce type d tudes est appa rue la n cessit de disposer d outils performants et conviviaux proposant la gestion de jeux de donn es importants et l aide la r alisation de calculs complexes et fastidieux Sanlaville Boisson et al 1995 Fonctionnant sous l environnement Win dowsTM le logiciel ProCURVE a t d velopp dans ce sens Il est le premi
3. ritable outil d exploration des populations aqua Ajout Fe sis Rs ina mr tiques Le logiciel ouvre ainsi la voie de nouvelles in vestigations par exemple sur des populations d inver t br s aquatiques ou de poissons tropicaux dont les exigences cologiques sont encore m connues Les courbes de preferenda d habitat expriment des pr f rences moyennes et sont suppos es tre appli cables dans tous les cours d eau Bovee 1982 Les mod les prescrits par d autres auteurs Pouilly 1994 Lamouroux et al 1999 sont couramment appliqu s une chelle globale mais ne sont pas toujours adapt s des conditions locales particuli res La disponibilit de courbes g n ralistes ne doit pas faire oublier que la re pr sentativit des mod les biologiques est un d termi nant essentiel de leur qualit en tant qu outils de pr diction En effet il ne faut pas n gliger l existence de sp cificit s au niveau des cours d eau pouvant entra ner des adaptations comportementales l chelle de la population Heggenes 1990 Heggenes amp Salveit 1990 ou des diff rences de r ponses individuelles N slund et al 1993 Ainsi dans le cadre d une tude chelle r duite de la capacit d accueil Raleigh et al 1984 pr conisent l utilisation de courbes tablies Fig 3 Gestion des stades de d veloppement par mod les d exp rience Fig 3 Management of the stages of developme
4. 1312 1326 Mastrorillo S 1997 Profils cologiques du Vairon Phoxinus phoxinus L de la Loche franche Barbatula barbatula L et du Goujon Gobio gobio L l chelle du microhabitat dans trois ri vi res pyr n ennes Th se doc Institut National Polytechnique de Toulouse 106 p Mastrorillo S Dauba F amp Belaud A 1996 Utilisation des mi crohabitats par le vairon le goujon et la loche franche dans trois rivi res du sud ouest de la France Ann Limnol 32 1 11 Nakache J P 1973 Influence du codage des donn es en analyse factorielle des correspondances Etude d un exemple pratique m dical Rev Stat Appl 21 2 57 70 Nasl nd I Milbrink G Eriksson O amp Holmgren S 1993 Im portance of habitat productivity differences competition and pre dation for the migratory behaviour of Artic charr Oikos 66 538 546 Nelva A Persat H amp Chessel D 1979 Une nouvelle m thode d tude des peuplements ichtyologiques dans les grands cours d eau par chantillonnage ponctuel d abondance C R Acad Sci III Vie Paris S rie D 289 1295 1298 rience 56 Fig 6 Exemple de repr sentation d un profil cologique mise en classe qualitative Fig 6 Representation of a microhabitat profile qualitative categories 338 N MENGIN A THOREL H LIEBIG G SEGURA 10 Persat H amp Copp G H 1989 Electrofishing and Point Abundan ce Sampling for the ich
5. 93 Baldrige J E amp Amos D 1982 A technique for determining fish habitat suitability criteria a comparison between habitat utiliza tion and habitat availability Zn Symposium on acquisition and uti lisation of aquatic habitat inventory information Bethesda MD Western Division of American Fisheries Society 251 258 Baran P 1995 Analyse de la variabilit des truites communes Salmo trutta L dans les Pyr n es centrales fran aises Influen ce des chelles d h t rog n it d habitat Th se doc Institut Na tional Polytechnique de Toulouse 147 p Bengen D 1992 Contribution la typologie fonctionnelle des bras morts de la Garonne Approches physico chimiques et ich tyologiques Th se doc Institut National Polytechnique de Tou louse 164 p Bovee K D 1982 A guide to stream habitat analysis using Ins tream Flow Incremental Methodology instream Flow Info Pap n 12 Washington DC FWS OBS 82 26 US Fish and Wildlife Service 248 p Fig 4 Exemple de repr sentation d une courbe de preferenda de granulom trie globale chaque substrat repr sente une modalit semi quantitative Fig 4 A preference curve of total granulometry representation each substrate represents a se mi quantitative category 336 N MENGIN A THOREL H LIEBIG G SEGURA 8 Bult T P Haedrich R L amp Schneider D C 1998 New technique describing spatial scaling and habitat selection in ri
6. Ann Limnol 38 4 2002 329 338 Note technique Technical note ProCURVE logiciel de calcul des preier enas d habitat pour les organismes aquatiques N Mengin 2 A Thorel H Liebigl 3 G Segura Mots cl s logiciel mod les biologiques microhabitats profils cologiques courbes de pr f rences d habitat Les mod les biologiques constituent un l ment fondamental de la m thode des microhabitats pour l valuation de la capaci t d accueil potentielle des cours d eau vis vis des organismes aquatiques Avec l importance croissante de la probl matique habitat dans les tudes d impact est apparue la n cessit de disposer d outils informatiques performants pour la r alisation des calculs complexes et fastidieux qui en d coulent ProCURVE est un logiciel enti rement d di la construction de courbes de preferenda et de profils cologiques pour les organismes aquatiques Il labore ces mod les biologiques en accompagnant l uti lisateur dans une d marche analytique logique et rigoureuse Le logiciel permet une gestion ais e des donn es La souplesse de la base de donn es relationnelles lui conf re de nombreuses possibilit s d analyses lin aires ou transversales Son ouverture sur les bases de donn es externes permet d envisager le traitement de donn es d j disponibles dans la bibliographie Les variables cologiques utilis es commun ment sont fournies par d faut mais l utilisateur
7. JPETIT BRAS DE CILAOS GH ARIVIERE DES MARSOUINS AFEA SAINT BENOIT a AA TAKAMAKA BFA CASCADE BFEJPLAT PROFOND BHBIPLAT PROFOND 2 Fig 1 Menu principal du logiciel ProCURVE Fig 1 Main menu of ProCURVE a AR Fig 2 Gestion des EPA Saisie des donn es physiques info physiques et des donn es biologiques info biologiques Fig 2 Management of the Point Abundance Sampling physical data info physiques and biological data info biolo giques 334 N MENGIN A THOREL H LIEBIG G SEGURA 6 3 5 D dition des r sultats ProCURVE est dot d une interface graphique per formante Les graphes et tableaux sont directement mis en forme et standardis s Figs 4 5 et 6 ProCURVE permet galement l exportation des donn es brutes et des r sultats vers des tableurs et lo giciels de statistiques pour r aliser une mise en forme particuli re ou un traitement compl mentaire Ainsi les courbes de preferenda peuvent tre export es pour tre int gr es aux logiciels d valuation et de simula tion de la capacit d accueil des cours d eau tels que EVHAO Ginot 1995 ou CAFCA Ichthyo Sys 1993 pour tous les organismes aquatiques 4 Discussion et conclusion Les profils cologiques sont couramment utilis s dans la description des relations entre les poissons et leur habitat Avec ProCURVE leur r alisation en est grandement facilit e L utilisateur dispose ainsi d un v
8. a la possibilit de les configurer selon ses besoins Les r sultats g n r s sont visualis s directement Ils peuvent tre sauvegard s sous forme graphique ou export s au format des principaux tableurs pour un traitement compl mentaire ProCURVE software to calculate habitat preferences of aquatic organisms Keywords software biological models microhabitats ecological profiles habitat preferences Biological models are a major element of the Instream Flow Incremental Methodology for habitat simulation of aquatic orga nisms in streams Complex and tedious calculations are required for the growing importance of the habitat set of problems in impact studies This situation emphasizes the need of powerful data processing tools to process this kind of data ProOCURVE software is a entirely dedicated to the construction of preference curves and microhabitat profiles for the aquatic organisms It works out these biological models by leading the user in a logical and rigorous analytical process The software allows an easy management of the data The flexibility of the relational database confers many possibilities of linear or transverse analyses Its connection to external databases allows for processing of data already available in the bibliography Ecological variables com monly used are provided by default but may also be configured by the user Results produced are directly displayed and can be stored in graphic form or be exported in s
9. a truite biolo gie et cologie INRA publ Paris Baglini re et Maisse Eds 121 149 Ichthyo Sys 1993 CAFCA version 1 1 application informatique de la m thode des microhabitats manuel d utilisation Dr mil Lafage Ichthyo Sys Environnement 43 p Ichthyo Sys 1995 WINFISH version 2 7 progiciel de traitement des donn es de p che manuel d utilisation Dr mil Lafage Ich thyo Sys Environnement 85 p Lamouroux N Capra H Pouilly M amp Souchon Y 1999 Fish habitat preferences in large streams southern France Freshwat Biol 42 673 687 La Voie IV W J amp Hubert W A 1996 Use of three types of stream margin habitat by age 0 brown trout late in the growing season Hydrobiologia 317 89 95 Liebig H 1998 Etude sur le recrutement de la truite commune Salmo trutta L d une rivi re de moyenne montagne Pyr n es ari geoises 09 Effets de la gestion par clus es d une centrale hydro lectrique Approches in situ et exp rimentales Th se doc Institut National Polytechnique de Toulouse 201 p Malavoi J R 1989 Typologie des faci s d coulement ou unit s morphodynamiques des cours d eau haute nergie Bull Fr Piscic 315 189 210 Profil cologique exp Foon EN us k pepa Mallet J P Lamouroux N Sagnes P amp Persat H 2000 Habitat preferences of European grayling in a medium size stream the Ain river France J Fish Biol 56
10. ability of use for depth velocity and substrate by subyearling coho salmon and steelhead in lake Ontario tributary streams N Amer J Fish Manag 5 277 282 Souchon Y 1994 Mise en situation tat d avancement des re cherches sur la mod lisation de l habitat des poissons en France In Colloque franco qu becois sur l int gration des technologies modernes la gestion des poissons dulcicoles et amphihalins Montr al 31 mai 03 juin 1992 115 124 Souchon Y Trocherie F Fragnoud E amp Lacombe C 1989 Les mod les num riques des microhabitats des poissons applications et nouveaux d veloppements Rev Sci Eau 2 807 830 Th venet A amp Statzner B 1999 Linking fluvial fish community to physical habitat in large woody debris sampling effort accu racy and precision Archiv Hydrobiol 145 57 77 Weddle G K amp Kessler R K 1993 A square meter electrofishing sampler for benthic riffle fishes J North Am Benthol Soc 12 291 301
11. e param trique choisie on peut obtenir deux familles de courbes de preferenda et de profils soit des courbes de granulom trie globa le pour chaque type de substrat repr sentant une moda lit semi quantitative soit des courbes obtenues pour chaque type de substrat avec comme pour les autres param tres une mise en classe qualitative du recou vrement Enfin l utilisateur est amen s lectionner l esp ce et le stade tudier Il est commun ment admis que l utilisation de l habitat par le poisson varie selon son ge ou son stade de d veloppement Heland 1991 La Voie IV amp Hubert 1996 Liebig 1998 Mallet et al 2000 ProCURVE permet de travailler directement sur l ge des organismes aquatiques par exemple ob tenu partir de lecture d cailles ou par morphom trie mais galement et avec une grande facilit par l interm diaire d une mise en classe des tailles Cette derni re consiste en la cr ation de stades de d velop pement d finis simplement par la saisie de bornes de tailles Fig 3 3 4 La r alisation des calculs Un calcul correspond l analyse des donn es selon les indications fournies par un mod le d exp rience d velopp sur la base d une configuration pr d finie Chaque mod le peut tre stock dans une liste d exp riences pour une utilisation ult rieure Concr tement cette op ration revient s lectionner l un des mod les sauvegard s ainsi
12. er logiciel enti rement d di l laboration de courbes de preferenda et de profils cologiques pour les organismes aquatiques Ses fonc tionnalit s lui permettent de g rer les donn es r col t es sur le terrain ou d exploiter des bases de donn es tierces d analyser des donn es d habitat et de construire ais ment des mod les biologiques profils et courbes selon diff rents protocoles de calcul L en semble de ces fonctions est accessible partir d une interface logique et conviviale bas e sur la notion d exp rience et l interpr tation graphique La sim plification des proc dures de s lection des param tres et de r alisation des calculs qui en r sulte procure l utilisateur une enti re libert de gestion de ses champs d hypoth ses 2 Rappel m thodologique La d finition d un plan d chantillonnage adapt et complet garantit l obtention d un jeu de donn es fiable et repr sentatif La m thode de l Echantillonnage Ponctuel d Abon dance EPA par p che lectrique Nelva et al 1979 est adapt e l tude des preferenda d habitat des pois sons Copp amp Penaz 1988 Persat amp Copp 1989 Ben gen 1992 Mastrorillo et al 1996 Elle permet l explo ration d un grand nombre d habitats Heggenes amp Saltveit 1990 ainsi que la standardisation des chan tillons Cette m thode o chaque point d chantillon nage est consid r comme l un
13. ion d habitat dis ponible qui est susceptible d influencer son utilisation Delacoste 1995 Liebig 1998 Les valeurs P de pr f rences d habitat physique pour chaque point sont calcul es l aide de la relation suivante Fragnoud 1987 P Ni Nb F N nombre de poissons associ s la classe de taille i N nombre total de poissons F nombre de points d chantillonnage associ s la modalit i du param tre consid r F nombre total de points d chantillonnage La fr quence de la classe pr sentant la plus forte va leur est ramen e 1 Cette classe repr sente l optimum pour cette variable d habitat Les autres classes sont pond r es dans le rapport inverse de la fr quence de cette classe Pour un param tre donn les individus montrent une pr f rence d autant plus marqu e pour une modalit que la valeur calcul e correspondante est lev e Les courbes de preferenda d habitat permettent de calculer par la m thode des microhabitats une note de qualit d habitat valeur d habitat ou VHA pour le secteur tudi en les couplant un mod le hydraulique qui permet de reconstituer les variables physiques rete nues avec le d bit transitant dans le tron on consid r Souchon et al 1989 3 Pr sentation du logiciel ProCURVE 3 1 Configuration du logiciel ProCURVE est fourni par d faut avec tous les para m tres classiquement utilis s pour l labora
14. it spatio temporelle de base r pond parfaitement aux imp ratifs de cr ation des mod les biologiques car elle permet d obtenir une image r elle et instantan e de l occupation de l habitat par le poisson Liebig 1998 A partir des donn es ainsi r colt es les relations entre l organisme aquatique chantillonn pour un stade donn et son habitat d fini par les variables en vironnementales prises en compte peuvent tre tra duites sous la forme de profils cologiques et ou de courbes de preferenda d habitat Les profils cologiques sont d finis par la combinai son d un ensemble de param tres essentiellement phy siques qui d terminent en chaque point d un cours d eau l espace de vie des poissons Souchon 1994 Les principaux l ments de cet espace sont les va riables descriptives de l hydromorphologie Les pro fils cologiques sont bas s sur la pr sence ou l absen ce du poisson selon les variables du milieu Ils appor tent principalement une information sur l utilisation de l habitat pour un stade de l esp ce consid r e En d autres termes ils d finissent les exigences colo giques d une esp ce pour un facteur donn Daget amp Godron 1982 La valeur d un profil pour un facteur ou variable est calcul e partir de la relation sui vante 3 MOD LES BIOLOGIQUES D HABITAT AVEC ProCURVE 331 Vi F Foot V valeur du profil pour la modalit i du para
15. m tre F fr quence de l esp ce dans la modalit i Fot fr quence de l esp ce sur l ensemble des rele v s Le profil cologique est pr sent graphiquement sous forme d histogramme les valeurs positives indi quent une utilisation de la modalit par les poissons alors que les valeurs n gatives signalent au contraire un vitement Nous avons ici pr sent une m thode d chantillonnage partir de donn es physiques ponc tuelles pour tablir ces profils Ceci est statistiquement reconnu mais pourrait tre biologiquement discutable Bain et al 1985 Weddle amp Kessler 1993 Th venet amp Stazner 1999 Tenir compte de l environnement im m diat du point focal et des contrastes physiques peut aussi rev tir une certaine importance Cependant il ne s agit pas de prendre parti pour une m thode vis vis d une autre mais de pr senter les bases n cessaires l tablissement de ce type de mod le biologique par le logiciel Les courbes de preferenda d habitat mat rialisent les besoins des organismes aquatiques compte tenu de l habitat disponible Elles sont bas es sur la comparai son de l abondance des poissons et des caract ristiques physiques du milieu et tiennent compte du fait que les individus s lectionnent les zones les plus favorables parmi celles qui leur sont disponibles Les courbes comparent l habitat utilis et l habitat disponible et sont donc ind pendantes de la proport
16. nt by experimental models 7 MOD LES BIOLOGIQUES D HABITAT AVEC ProCURVE 335 partir de donn es locales Les courbes ainsi obtenues seront d autant plus pertinentes qu elles sont bas es sur les stades de d veloppement d termin s finement par l utilisateur au cours d une approche locale Liebig 1998 Gr ce ProCURVE il est maintenant possible d explorer avec rapidit et facilit un vaste champ d hypoth ses afin de s lectionner la combinaison de param tres la plus efficiente aboutissant au calcul du mod le le plus pertinent L utilisateur n est donc plus limit l utilisation de mod les rigides voire inadap t s ses besoins Il faut cependant garder l esprit que l int r t des courbes ainsi obtenues d pend de la qualit des don n es recueillies sur le terrain La facilit d obtention des r sultats ne doit pas faire oublier la pr pond rance des donn es brutes Comme le souligne Delacoste 1995 l tablissement d un mod le ne doit pas consti tuer une finalit Il n est qu un outil d aide la d ci sion en mati re de gestion et d aide l analyse des pro cessus cologiques Remerciements Nous tenons remercier S Mastrorillo pour ses remarques et commentaires pertinents Travaux cit s Bain M B Finn J T amp Booke H E 1985 A quantitative method for sampling riverine microhabitats by electrofishing N Am J Fish Manag 5 489 4
17. preadsheat format for complementary processing 1 Ichthyo Sys Environnement 29 all e de Sauveterre F 31280 Dr mil Lafage France 2 Centre d Ecologie des Syst mes Aquatiques Continentaux UMR CNRS C5576 118 route de Narbonne F 31062 Toulouse cedex 4 France 3 Corresponding author E mail info isenvironnement com Article available at http www limnology journal org or http dx doi org 10 1051 limn 2002027 330 N MENGIN A THOREL H LIEBIG G SEGURA 2 1 Introduction La prise en compte de l habitat des organismes aqua tiques se g n ralise dans le cadre des tudes environ nementales afin d appr hender l influence des activi t s anthropiques sur les cours d eau Les m thodes de mod lisation des habitats et des preferenda sp ci fiques connues sous le nom de m thodes des micro habitats sont aujourd hui couramment utilis es pour les esp ces de salmonid s et leur usage tend s tendre tous les organismes aquatiques La m tho de consiste estimer la capacit d accueil potentielle des cours d eau pour un stade de d veloppement d une esp ce en couplant deux mod les un mod le biolo gique qui d crit les relations entre une esp ce un sta de donn et les variables physiques de son habitat et un mod le hydraulique qui reprend les principales composantes de la structure physique de l habitat Souchon et al 1989 Les facteurs cologiques agissant l chelle
18. que le jeu de donn es traiter Des tests de sont effectu s pour chaque type de repr sentation profil ou courbe afin de rechercher les relations significatives entre les classes de variables et la pr sence ou l abondance de l esp ce Ce test permet de d terminer si la distribution des organismes aqua tiques s effectue de mani re al atoire ou s lective pour le param tre tudi Et par cons quent il indique si les courbes et les profils obtenus sont utilisables par exemple dans le cadre d une tude de la capacit d ac cueil de l habitat d une rivi re Dans le cas o le test ne serait pas significatif l utilisateur peut modifier son mod le d exp rience en choisir un autre dans la liste ou en cr er un nouveau sans perte de temps De m me gr ce l analyse visuelle l utilisateur a la possibilit d effectuer imm diatement d autres calculs si les r sultats obtenus ne sont pas satisfaisants Cette op ration s av re particuli rement laborieuse sans lai de de cet outil Gr ce ProCURVE il est possible en quelques instants de modifier les bornes de mise en classe de la variable physique analys e de revenir sur les valeurs des bornes des stades de d veloppement ou de se r f rer d autres valeurs issues de la bibliogra phie jusqu l obtention de r sultats biologiquement coh rents 5 MOD LES BIOLOGIQUES D HABITAT AVEC ProCURVE 333 um ProCURVE Z I EFE
19. s partir d autres bases de donn es environnementales telles que CAFCA ou WINFISH Ichthyo Sys 1993 1995 ou tout autre logiciel compatible SANDRE Se cr tariat d Administration Nationale des Donn es Re latives l Eau Le choix d un syst me de gestion de base de donn es relationnelles comme plate forme de d veloppement pour ProCURVE garantit l E long terme des donn es sauvegard es 332 N MENGIN A THOREL H LIEBIG G SEGURA 4 Les informations issues d un chantillonnage sont int gr es la base de donn es ProCURVE par l inter m diaire d onglets d finissant deux jeux de donn es compl mentaires Le jeu des informations physiques comprend les variables physiques mesur es soit par d faut granulom trie vitesses de courant profon deur Le jeu de donn es biologiques comprend par d faut les param tres esp ce longueur totale et sexe des individus captur s Fig 2 3 3 Les mod les d exp rience L exploitation des donn es enregistr es passe par la d finition d exp rience Chaque exp rience d crit pr cis ment l ensemble des param tres utilis s dans les calculs A partir de menus clairs et conviviaux l utili sateur choisit des modalit s pour les param tres tes ter qu il enregistre sous la forme d un mod le d exp rience Une fois sauvegard le mod l est utilis pour r aliser des calculs Il peut galement tre appliqu de nouveau
20. thyology of large rivers In Developments in Electrofishing Fishing News Books Oxford Cowx I Ed Blackwell Scientific Publishing 203 215 Poizat G 1993 Echelle d observation et variabilit des abon dances de juv niles de poissons dans un secteur aval du Rh ne Th se doc Univ C Bernard Lyon 1 217 p Pouilly M 1994 Relations entre l habitat physique et les pois sons des zones cyprinid s rh ophiles dans trois cours d eau du bassin rh danien vers une simulation de la capacit d accueil pour les peuplements Th se doc Universit de Lyon I Cemagref Bea Lhq Lyon 256 p Raleigh R F Zuckerman L D amp Nelson P C 1984 Habitat sui tability index models and instream flow suitability curves brown trout US Fish and Wildlife Service Biological Services Program FWS OBS 82 10 71 124 p Roussel J M Bardonnet A amp Claude A 1999 Microhabitats of brown trout when feeding on drift and when resting in lowland salmonid brook effects on Weighted Usable Area Archiv Hy drobiol 146 4 413 429 Sanlaville Boisson C Olivier J M Simier M Changeux T Poizat G Torre F amp Belliard J 1995 Les bases de donn es outils de stockage et d exploitation des chantillonnages piscicoles In Colloque Habitat Poissons Gaudin P Souchon Y Orth D J amp Vigneux E Eds Bull Fr P che Piscic 337 338 339 418 p Sheppard J D amp Johnson J H 1985 Prob
21. tion des mod les d habitat piscicoles en France m tropolitaine Gr ce au menu de configuration l utilisateur peut personnaliser le logiciel selon ses besoins Ces modifi cations affectent un ensemble de ressources dont d pendront les calculs ult rieurs L utilisateur peut par exemple modifier ou cr er des listes d esp ces en fonction de la zone d tude choisir ou cr er des chelles granulom triques par d faut Cailleux 1954 ou Wentworth modifi e Souchon et al 1989 s lectionner ou cr er des classifications de faci s d coulement par d faut Malavoi 1989 ou Dela coste et al 1995 Cette fonctionnalit autorise la cr ation la modification ou la suppression de toute va riable discr te ou continue en n fonction des besoins de P utilisateur Par exemple l adaptation de ProCURVE pour l la boration des courbes d habitat de la faune piscicole de la R union n a demand que la saisie d une nouvelle liste d esp ces tropicales et la prise en compte dans le jeu de variables des particularit s morphodynamiques des rivi res p rennes de l le caract ris es par une hy drologie cyclonique 3 2 La gestion des donn es Le logiciel ProCURVE int gre une base de donn es qui permet la gestion compl te des donn es d habitat r colt es sur le terrain Celles ci peuvent provenir d une acquisition par le biais d un masque de saisie convivial Fig 1 ou bien tre exploit e
22. verine habi tats Reg Riv Res amp Manag 14 107 118 Cailleux A 1954 Limites dimensionnelles des noms des frac tions granulom triques Bull Soc G ol Fr 4 643 646 Copp G H amp Penaz M 1988 Ecology of fish spawning and nur sery zones in floodplain using a new sampling approach Hydro biologia 169 209 224 Daget P amp Godron M 1982 Analyse de l cologie des esp ces dans les communaut s Paris Masson Ed 163 p Delacoste M 1995 Analyse de la variabilit spatiale de la repro duction de la truite commune Salmo trutta L Etude F chelle du micro et du macrohabitat dans six rivi res des Pyr n es cen trales fran aises Th se doc Institut National Polytechnique de Toulouse 133 p Delacoste M Baran P Lek S amp Lascaux J M 1995 Classifica tion et cl de d termination des faci s d coulement en rivi re de montagne In Colloque Habitat Poissons Gaudin P Souchon Y Orth D J amp Vigneux E Eds Bull Fr P che Piscic 337 338 339 149 156 Fragnoud E 1987 Pr f rences d habitat de la truite fario Salmo trutta fario L 1758 en rivi re quelques cours d eau du Sud Est de la France Th se de 3 me cycle Universit Lyon I 433 p Courbe de preferenda exp rience 59 Ginot V 1995 EVHA un logiciel d valuation de l habitat du poisson sous Windows In Colloque Habitat Poissons Gaudin P Souchon Y
23. x jeux de donn es avec le m me param trage Dans l tude des relations habitat poissons l chelle d approche rev t une importance cruciale Haury et al 1991 Baran 1995 Bult et al 1998 Heggenes et al 1999 Ce facteur est pris en compte dans ProCURVE L utilisateur peut choisir l chelle spatiale qui lui convient par la s lection des cours d eau des stations d tude ou des faci s d coulement d sir s L chelle temporelle est galement prise en compte par le choix des campagnes d chantillonnage Cette d marche scalaire logique autorise la cr ation d analyses trans versales ouvrant ainsi des possibilit s de comparaison entre secteurs cologiques ou entre cours d eau Poizat 1993 L utilisateur doit ensuite choisir le param tre abio tique analyser parmi ceux disponibles dans la confi guration Pour les calculs les variables quantitatives ou continues doivent tre d coup es en modalit s qua litatives La d finition des classes pour la variable s lectionn e est pr pond rante pour l obtention de r sul tats coh rents L utilisateur a le choix de la d finition des modalit s dont le nombre doit si possible tre le v Ces modalit s pr sent es sous forme d histo grammes doivent avoir des effectifs d observations suffisants Nakache 1973 Dans le cas d une variable discr te telle que la granulom trie exprim e en recou vrement relatif selon l chell
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