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Réalisation d`un Système de Gestion de Base de données et d

1. N NA Pr levement Station R sultats PRELEVEMENT_LIST ENGIN id collec list lt pi gt NO lt O gt id engin ph l gt Type_Pr l vement A100 nom_engin VA80 ent VABO caract_engin VA100 l taille_eng N8 4 FPE E comment VASO WS pk_engin lt pi gt Bi liste despr l vements A engin pour prelever zi d Ee PRELEVEMENT id prelevement lt pi gt NO lt O gt 1 profondeur N4 1 A i pk_prelevement lt pi gt KR o E NIVEAU A niveau de pr l vement id niveau lt pi gt Ee an posa Type_limite A50 i y comment VA50 4 prelevement sur la station pk niveau lt pi gt d 1 n STATION 2 id station lt pi gt NO lt O gt A sultat _bio du pr l vement date station D mms comment VA50 resultat_prelevement Y y pk station lt pi gt tn 0 1 g meteo_station RESULTAT_BIO 2 d id biom trie lt pi gt NO lt O gt num faisceau N10 LTA N5 BA N5 IA N5 LTI N5 e Bl N5 Il N5 g LTJ N5 BJ N5 1 1 RESULTATS 1 IJ N5 BL WS dealt zm lt 0 a gf id meteo lt pi gt N10 lt O gt val_champs N6 ai l descrip meer VA25 comment VA50 pk biom trie lt pi gt comment VASO pk resultats lt pi gt pk station lt pi gt sa Mat riels M thodes R sultats RESULTAT BIO 1
2. DEBARD STEPHANE MASTER 2 SIG ET GESTION DE L ESPACE Universit Jean MONNET St Etienne Ann e 2005 R alisation d un Syst me de Gestion de Base de donn es et d information g ographique d di a la surveillance de l herbier de Posidonies en M diterran e CNRS UMR 5600 RE R F N AM Universit Jean Monnet Saint Etienne 1 P UMR 5600 CNRS Environnement Ville Soci t RSJ gt e y Ma tre de stage Mr Bruno ANDRAL Ifremer centre de Toulon la Seyne mer Direction de l environnement et du littoral VA Fiche analytique Stagiaire DEBARD St phane S O Organisme d accueil Ifremer DEL TL ZP de Br gaillon 83500 La Seyne sur mer Responsable de stage Mr Bruno ANDRAL Sujet du stage Mise en place d une base de donn es pour la surveillance des herbiers de Posidonies sur le littoral m diterran en Interpr tation des donn es sous Syst me d information G ographique Dur e 20 mars 2005 au 8 septembre 2005 Cadre Master 2 SIG et Gestion de l espace Universit Jean Monnet St Etienne Enise R sum L herbier de posidonies est consid r en M diterran e comme un indicateur de r f rence sur la qualit des eaux littorales Le suivi de cet herbier par les scientifiques engendre un grand nombre de donn es ll a t alors n cessaire de cr er un outil de stockage de ces donn es pour leur gestion et leur valorisation Commentaire Photo Campagne Mytilos avril mai
3. E E E El 69 21 FRDC7e D Le Brusc LS 7 98 21 FRDC7e 0 Le Brusc L 8 94 16 FRDC4 0 Martigues LI 9104 24 FRDC 0 Th oules LI 24 FRDC 0 Bormes Ll LEERD 0 Cavalaire LS E 1 E 1 E 1 P 1 E IF 1 E n E 1 E Ent M Ii tb PK sur 45 Figure 22 Liaisons des points avec les tables g ographiques E KE E El E KE E 43 080167 43091717 13305 4351383 43101917 43172632 57911 57821 50135 Kam 6 300 65022 A el La structure des donn es est donc la suivante un champ CODE BASSIN dans la table POINT permet de renseigner a quel Bassin de la table BASSIN appartient le point un champ CODE SITE dans la table BASSIN permet de renseigner quel site de la table SITE appartient le point un champ CODE REGION dans la table SITE permet de renseigner quelle R gion de la table REGION appartient le point un champ CODE MASSE EAU dans la table POINT permet de renseigner a quelle masse d eau DCE de la table MASSE D EAU DCE appartient le point et un champ CODE ZONE dans la table POINT permet de renseigner quelle zone homog ne de la table ZONE HOMOGENE appartient le point R gion gt Site Bassin Point Zone homog ne Point Masse d eau DCE Point Point Cette structure des donn es spatiales se traduit physiquement par les tables suivantes REGION liste des r gions SITES liste des sites Quadrige BASSIN liste des
4. 2 2 LE RESEAU DE SURVEILLANCE POSIDONIES Le R seau de Surveillance Posidonies RSP a t cr e pour r pondre la n cessit d une surveillance de l herbier de Posidonies long terme de la partie sup rieure de l herbier entre O et 10 m et de sa partie inf rieure entre 20 et 35 m L objectif du R seau de Surveillance Posidonies est de cr er un outil fiable et durable au service des gestionnaires du milieu littoral Les m thodes d investigation du RSP constituent une r f rence en M diterran e et servent en ltalie en Espagne et en Gr ce 2 2 1 Programmes et partenaires Le RSP regroupe plusieurs partenaires Ce sont des administrations des services d concentr es de l Etat des bureaux d tudes des associations ou des universitaires scientifiques Le RSP a d but en 1984 par la collaboration entre les administrations concern es par la gestion du littoral les lus de la r gion PACA et les scientifiques Ce sont 33 sites qui sont ainsi surveill s avec succ s depuis plus de 20 ans Neuf sites sur les Bouches du Rh ne 16 sites dans le Var 8 sites dans les Alpes maritimes Depuis 2002 la Corse est entr e dans ce r seau gr ce un partenariat entre l Office de l Environnement Corse la DIREN et l Agence de l Eau RMC Actuellement 10 sites de surveillance sont suivi et le r seau devrait comporter terme 30 sites r partit sur tout le littoral Corse Financeur du projet Ma tre d ouvrage La r gion
5. Donn es spatiales Programme Personne R sultats Donn es temporelles Figure 23 Ordre de saisie des donn es 5 4 L EXTRACTION DES DONNEES L extraction des donn es est r alis l aide des requ tes Access Pour exploiter la base de donn es partir des donn es saisies il a t n cessaire de cr er des structures d interrogations de la base pour obtenir une information sur la qualit des herbiers et indirectement sur la qualit des eaux ll a t n cessaire d interroger la base et de d finir de mani re pr cise le type de requ te utiliser Le but est d obtenir des regroupements de r sultats fournissant une information utile et pertinente pouvant r pondre aux enjeux notamment la DCE dont les imp ratifs sont cours terme et d extraire des jeux de donn es pouvant int grer des entit s g ographiques pour tre interpr t s sous logiciel SIG Il sera ainsi possible d obtenir des cartes d informations sur la qualit des herbiers l aide de logiciel SIG cf 6 1 En r gle g n ral l ensemble des donn es extraites de la base correspondent un point une date et un jeu de coordonn es g ographiques pour l exportation des donn es dans la g odatabase 5 4 1 Les requ tes dans Access Il est possible dans Access d extraire des donn es sur une table sur plusieurs tables sur des requ tes d ja effectu es ou sur la combinaison de tables et de requ te Access utilise le langage SQL pour in
6. Ils disposent chacun d une base de donn es identique avec une proc dure de copie Maitre vers Client et r ciproquement 1 2 5 Les r seaux Le r seau interne permet de relier les diff rents PC du laboratoire en offrant l acc s une partition commune tous les agents du laboratoire N Sur cette partition sont class s des Ve fichiers d int r t communs aux agents du laboratoire Les r seaux permettent galement de se connecter a certains p riph riques comme les imprimantes Au niveau national un r seau Intranet existe ll permet entre autre de ce connecter a des serveurs nationaux d changer des fichiers via des transferts FTP ou d interroger des bases de donn es tels que le serveur SEXTANT http w3 ifremer friisisextanti qui a pour objectif de mettre en commun et disposition des donn es g ographiques de r f rences int ressant les diff rentes quipes ll apporte aussi un support aux quipes IFREMER pour l utilisation des donn es et de logiciels g ographiques Le r seau national permet aussi de ce connecter QUADRIGE Le r seau permet de la m me mani re en utilisant le r seau INTERNET de ce connecter des bases de donn es externes comme la plate forme IGN du Comit R gional de l Information GEographique CRIGE http http www crige paca ore 1 l objectif est de mettre disposition de ses adh rents des donn es g ographiques l chelle de la r gion PACA 1 2 6 Les logiciels
7. M thode balisage photographie ix situ sonar o balayage lat ral 26 27 voir aussi 15 Structure des faisceaux 72 Cnt res mesur s type nombre taille des feuilles surface foliaire Coefficient A biomasse pr sence de n crose M thode 9 10 11 12 voir aussi 615 ER y TE H pe EEN Crit res mesur s Faune flore diversit biologique M thode 8 28 29 30 Composition chimique et biochimique 28 Crit res mesur s composition l mentaire CH P biochimie glucide protide lipide compos s ph noliques enzymes de stress M thode 12 31 32 33 34 Structure de la matte 72 Cnt res mesur s Pr sence de chenaux d intermatte tombants de matte morte d chaussement envasement biodiversit de l endofaune homog n it paisseur r sistance et compacit de la matte rhizomes plagiotropes composition physico chimie N M thode 13 14 15 16 seen Contamination 24 Cnt res mesur s m taux radio l ments M thode ICPS spectrophotom trie 12 25 Mesures de datation 60 Crit res mesur s L pidochronologie plastochrome intervalle nombre de feuilles annuel vitesse de croissance pal o floraisons production primaire M thode 17 18 19 20 21 voir aussi 615 Figure 10 Param tres utilis s pour appr hender l tat de sant d un herbier Posidonia ocea
8. am nagement du port de plaisance C Rayon rejets urbains et ferme aquacole Le Lavandou LS Zone sensible proximit du port du Lavandou et de l missaire Porquerolles LS Zone interm diaire impact des mouillages forains forte rosion des mattes et d placements s dimentaires Toulon LS1 Zone sensible proximit rejet Toulon Sici distance 1300 m et pression de chalutage mais galement mouvements s dimentaires importants hydrodynamisme Toulon LS2 Zone sensible pr sence rejet Toulon Sici distance 3100 m remaniements s dimentaires hydrodynamisme Toulon LI Zone sensible proximit rejet Toulon distance de 1400 m et pratique du gangui qui entra ne une d gradation importante du balisage li e au chalutage ill gal Cannes LS Zone interm diaire littoral totalement artificialis par les am nagements zone d ancien rejet mouvements s dimentaires Grimaud LS Zone de r f rence mais pression de mouillage plaisance hydrodynamisme et d placements s dimentaires induisant une rosion importante de l herbier Grimaud Ll Zone de r f rence mais contexte de turbidit g n rale du Golfe de Saint Tropez les de Lerins Zone de r f rence mais pression de mouillage des plaisanciers hydrodynamisme rosion et d placements s dimentaires impact de la pose des c bles EDF et d veloppement important de Caulerpa taxifolia Saint Ayqgulf LI Zone sensible d bouch du fleuve Argens proximit
9. e l ensemble du syst me d informations de l lfremer g ographie administrative organisation taxons e un r f rentiel propre Quadrige param tre point de pr l vement unit s de mesure engin 2 des donn es relatives aux programmes et strat gies participant l organisation des programmes de la surveillance 2 Applicatifs d velopp pour la consultation la saisie et l extraction des donn es aa 3 des donn es th matiques station pr l vement chantillon mesure 3 2 4 La base Posidonie et Quadrige Quadrige devrait terme int grer de nouvelles donn es issues d autres r seaux de surveillance notamment ceux mis en uvre dans le cadre de la DCE Pour cela et pour faciliter les transferts de donn es entre les deux bases automatisation la nouvelle base de donn es doit tre en partie mod lis e en suivant l art re principale de Quadrige voir Figure 12 Sch ma de comparaison entre les donn es g r es par la base RSP et Quadrige L objectif terme de stockage des donn es DCE concernant la qualit de l herbier dans Quadrige a incit la mod lisation suivre l architecture de Quadrige Les principales tables de Quadrige sont retrouv es dans le mod le de la base Seules les tables ECHANTILLON RESULTAT DENOMBREMENT et TAXONS n y figurent pas En effet pour les pr l vements il n y a pas d chantillonnage sur la partie du pr l vement D autr
10. Alpes C te d Azur Ifremer Quadrige 2 Ifremer Brest R gion Provence Alpes C te d Azur R cup ration des donn es num ris es des donn es papiers et rapports de synthese Prise de connaissance avec la m thodologie de surveillance des herbiers tablis dans le cadre du R seau de Surveillance Posidonie Validation des attentes de la DCE envers la base de donn es RSP pour r pondre a la caract risation des masses d eau c ti re D finition des descripteurs R cup ration de donn es sur supports papiers Rapport de Synth se pr sentation de l aspect administratif et organisationnel du RSP et renseignements sur les diff rentes personnes rencontrer Pr sentation PPT de la refonte de Quadrige Discussion sur l organisation de la base RSP et des param tres pouvant tre pris en compte dans Quadrige Nouveau rendez vous fix pour une correction du mod le conceptuel de donn es RSP et une pr sentation de l interface utilisateur de Quadrige Pr sentation PPT du mod le de base de donn es RSP version initiale Pr sence des acteurs du REBENT Bretagne Comparaison entre les bases de donn es RSP Quadrige et MARBEN 2 0 et correction du mod le de base de donn es Programme Interreg IIl B Posidonia Participation au s minaire d ouverture sur la Mise en coh rence le d veloppement l harmonisation et la validation de m thodes d valuation de la qualit du milieu littoral par le sui
11. Francour o S Gobert i G Lepoint i A Meinesz o H Molenaar o H M Mansour p P Panayotidis q A Peirano r G Pergent a L Piazzi c M Pirrotta k G Relini s J Romero t J L Sanchez Lizaso u R Semroud h P Shembri f A Shili v A Tomasello k B Velimirov w 2005 Descriptors of Posidonia oceanica meadows Use and application DAMIER Elodie Septembre 2002 Synth se de la contamination chimique du littoral m diterran en GAUTHIER Emilie 2004 Marben 2 0 Guide de l utilisateur LEMAR CNRS Base de donn es sur le r seau REBENT R seau Benthique GIS POSIDONIE Direction D partementale de l Equipement 83Service Maritime 13Conseil G n ral 06 janvier 2004 LE RESEAU DE SURVEILLANCE POSIDONIES DE LA REGION PROVENCE ALPES COTE D AZUR RESULTATS DU SUIVI 2003 HUGUET Antoine 2004 PROJET Quadrige Cahier des charges Exigences fonctionnelles IFREMER D partement DYNamique de l Environnement Cotier Service Valorisation de l information pour la gestion int gr e et la surveillance J Denis G Herv F Deneux D Sauzade laboratoire c tier Ifremer Toulon P Bonhomme G Bernard Ch F Boudouresque A Leriche E Charbonnel L Le Direac h GIS Posidonie Marseille f vrier 2003 Guide m thodologique pour la cartographie des bioc noses marines MAIWENN Le Borgne Septembre 2003 Etude pr alable au REBENT M diterran en PERGENT G rard PERGENT MARTINI Christine BOUDOURESQUE Charles Francois 199
12. PERGENT MARTINI BOUDOURESQUE 1995 Ou La densit des faisceaux de feuilles se mesure dans une bande de 10 m de large environ situ e en amont au dessus du balisage la densit est mesur e dans un quadrat de 30 x 30 cm 10 mesures sont faites au hasard si l herbier se pr sente sous forme de t ches les mesures sont faites uniquement dans les t ches Ce param tre reste constant tout au long de l ann e et d pend peu de la p riode laquelle il est r alis m me si la division foliaire se fait en automne ou au printemps Ces mesures permettent de classer l herbier en diff rents types suivant sa densit GIRAUD 1977 Il faut tenir compte bien videmment de l h t rog n it de l herbier pour que ces mesures trouvent leur valeur SINNASSAMY J M BERTRANDY M C BOUDOURESQUE C F FORET P LECCIA M EINESZ A PERGENT G PERGENT MARTINI C RAGAZZI M RICO V 1991 2 3 2 Le Recouvrement Pourcentage de couverture du substrat par les frondaisons de Posidonie Oceanica par rapport aux zones non couverte Il n existe pas de m thode standardis e pour mesurer ce param tre bien que plusieurs m thodes aient t propos es Cristiani 1980 Romero Martinengo 1985 Francour et al 1999 La m thode la plus employ e repose sur une valuation directe du recouvrement en plong e en utilisant un pas de progression de 5 10 d une surface donn e ou l utilisation d une paque en PVC transparente de 30 cm de
13. PERGENT MARTINI BOUDOURESQUE 1995 2 3 4 Le pourcentage de rhizomes plagiotropes Les faisceaux plagiotropes sont caract ris s par une croissance marqu e dans le plan horizontal et parall lement au substrat Les axes plagiotropes sont les axes qui servent la plante coloniser le substrat En limite d herbier ou en bordure des t ches la pr sence de nombreux rhizomes plagiotropes est un indice de vitalit de l herbier Inversement un pourcentage lev de rhizomes plagiotropes au sein m me de l herbier peut traduire une pression de mouillage lev e Le protocole de suivi n a pas t retrouv 2 3 5 La limite inf rieure Outre sa position bathym trique on distingue as 1 les limites progressives caract ris es par la pr sence de rhizomes horizontaux dispos s horizontalement par rapport au sens de la pente L herbier n difie pas de matte mais traduit une am lioration au moins momentan e de la qualit des eaux 2 les limites brusques caract ris es par la pr sence de rhizomes partiellement verticaux mais sans dification de matte Pas de mattes mortes Elle correspondent souvent la stabilisation des conditions du milieu transparence des eaux Ales limites rosives caract ris es par la pr sence de matte mortes Ce r sultat r sulte de fond qui rodent l herbier et interdisent toute progression L hydrodynamisme semble donc tre a l origine de cette limite 4 les limites r gressives
14. Pr sence de matte morte et de quelques faisceaux t moins en avant de cette limite Elles traduisent ainsi une remont de l herbier Ces limites traduisent ainsi une remont e de l herbier sont assez r pandu et correspondent a une augmentation de la turbidit moyenne des eaux PERGENT PERGENT MARTINI BOUDOURESQUE 1995 oul tes e Mega NT e N VAN M AE Al NI i Ge S 4 2 ji 4 Figure 7 Diff rents types de limites inf rieures de l herbier a Posidonie Oceanica d apr s MEINEZ et LAURENT 1978 modifi par BOUDOURESQUE 2 3 6 La profondeur Calcul partir d un profondim tre lectronique avec une pr cision de l ordre de 10 cm Compte tenu de la mar e en m diterran e la pr cision est de l ordre de 0 5 m La profondeur est mesur au niveau de chacunes des balises et une moyenne globale par site est calcul EOL 2004 Ce param tre est g n ralement utilis lors du balisage des limites et n entre pas dans les caract ristiques de qualification des herbiers 2 3 7 Mesures en laboratoire Lors des missions de terrains des mesures biom triques sont pratiqu s en laboratoire partir de pr l vements de faisceaux de posidonies Elles portent sur l analyse ph nologique et Val l pidochronologique d une dizaine de faisceaux orthotropes et sur l analyse granulom trique et la teneur en mati re organique du s diment Ces deux derniers l ments ne seront pas d velopp dans ce rap
15. cartes etc PROGRAM Liste des programmes de recherche associ s aux donn es SOURCE PERSONNE Liste des personnes responsable rattach s au programme et DES DONNEES aux donn es Par ex Chef de mission DATA STRATEGY Table de liaison entre les programmes les points suivis et la date de pr l vement STATION STATION Dates de sorties sur chaque point stations STATION PRELEVEMENT Association d un Engin de pr l vement un pr l vement un point et une date donn e PRELEV LIST Liste des pr l vements libell pr l vement MATERIEL amp METHODES NIVEAU Liste des niveaux de pr l vements ENGINS Liste des engins d chantillonnage utilis s RESULTAT R sultats des mesures associ s un point une date et un param tre RESULTAT BIOM R sultats des mesures sur la biom trie des feuilles associ s un point une date et un param tre PARAMETRES Liste des param tres mesurables sur les herbiers RESULTATS METHODE Liste des m thodes d analyses UNIT Liste des unit s de mesures Liste des types d unit volume m trique masse UNIT_TYP 5 2 LE MODELE CONCEPTUEL DE DONNEES Le mod le conceptuel de donn es MCD et le mod le physique de donn es MPD ont t con us l aide du logiciel POWER AMC Sybase L environnement de mod lisation de PowerAMC prend en charge plusieurs types de mod les Le Mod le Conceptuel de Donn es qui permet de mod liser la structure g
16. cf Figure 30 La seconde solution a t de travailler directement sous Arcgis c est dire de cr er une g odatabase et d exporter cette g odatabase d Arcgis a Access par les outils d exportation classique d Arcgis L avantage de la premi re m thode est de pouvoir exploiter les atouts d un logiciel r pandu offrant la possibilit de cr er des requ tes d imprimer des formats d tats et de saisir de mani re tr s conviviale les donn es au travers de formulaire mais aussi d acc der directement aux donn es de la base par l interm diaire d une g odatabase sans cr er de lien ODBC ou une autre passerelle beaucoup moins pratique Ce choix se justifie plus d un titre gain de temps facilit d utilisation souplesse et possibilit s de g n ralisation de la m thode Cette solution laisse la libert tous les utilisateurs de pouvoir utiliser la base de donn es et de saisir les donn es sans n cessairement se servir d Arcgis Logiciel que tous les partenaires ne poss dent pas Il est donc beaucoup plus facile de partager la base entre les diff rents partenaires L originalit de la g odatabase est qu elle permet de mettre jour directement les tables partir d ARCGIS modifications d entit s ou suppression et d acc der directement des formulaires Microsoft Access via le document ArcMap associ cf 86 2 5 Les droits d administration de la g odatabase devront tre g r s par les administrateurs poss da
17. e Nantes Bouin L Houmeau i Ke vd Si ge social La Tremblade BR Centres k E Stations rattach es y y Autres implantations Arcachon m Montpeller Le Bidart da gt l j S j Ka alavas be O ouion l A San Giuliago M Uy Figure 1 Implantation de l Ifremer sur le territoire m tropolitain Vs 1 1 2 Organisation L Ifremer s articule autour de trois grandes structures La Direction des Programmes et de la Strat gie DPS qui anime et coordonne les activit s scientifiques et technologiques th mes programmes projets actions La Direction des Op rations DOP laquelle sont rattach es les unit s centres d partements laboratoires Les Directions fonctionnelles Affaires Financi res Affaires Juridiques Communication Op rations et Moyens Navals Ressources Humaines et Valorisation C est la Direction des Op rations DOP qui assure l ex cution des programmes lfremer 1 2 L IFREMER EN MEDITERRANEE Les quipes de l Ifremer sont implant es dans les trois r gions de la fa ade m diterran enne fran aise qui se r partissent sur 5 sites et couvrent les principaux domaines suivants en Provence Alpes C te d Azur le Centre de Toulon La Seyne pour l intervention sous marine profonde et l environnement littoral en Languedoc Roussillon la station de Palavas pour la pisciculture marine et la conchyliculture la station de S te pour l halieutique et l environnement littoral et l
18. odatabase Posidonie Il est compos de la base de donn es au format mdb reconnu par Arcgis comme g odatabase personnelle Sodatab X Contenu Aper u M tadonn es G o atabase A BDPosidonie mdb Name Type y annotation 3 BDPosidonie mdb G odatabase personnelle LA point_anno Sch donn es_r f rences E reseau_posid_w84 42 donn es_r sultats E 2003 GJ mesures_sig_ph no E resultat_2001 Jeu de classe d entit s Annotation Jeu de classe d entit s donn es de EE BASSIN EE DATA STRATEGY EE ENGIN EE MASSE_D_EAU_DCE EE METEO EE METHODE EE PARAMETRE EE PERSONNE EE PHOTO EE POINT EE POSITION EE PRELEVEMENT 2 PRELEVEMENT_LIST E PROGRAM EE REGION 3 RESULTAT_BIO EE RESULTATS EE SITE E STATION EE TYPE_LIMITE EE UNIT_TYPE EE UNITE E XYSIG_PH N EE ZONE_HOMOGENE Jeu de classe d entit s r sultats Donn es g or f renc es Liste des tables pr sentes dans la base Dossiers suppl mentaires pa D A II Temnnraire Figure 33 Organisation des donn es au sein de la g odatabase sl 6 2 2 1 1 Les jeux de classes d entit s Le jeu de classe d entit s Annotation comprend les annotations que l utilisateur souhaite conserver Elles peuvent tre reli es a un projet A chaque fois qu un projet sera ouvert ou a chaque nouvelle carte l utilisateur fera appel cette classe d entit Par d faut on retrouve dans la classes dente anno
19. pour la Gestion Int gr e et la Surveillance Quadrige doit r pondre aux engagements europ ens en particulier dans le cadre de la directive Cadre sur Eau DCE ou au niveau sanitaire dans le cadre de r glement en mati re de contr le sanitaire effectu dans les zones de production conchylicoles Parmi les nouvelles fonctionnalit s attendues de Quadrige 2 on peut citer l ouverture de nouveaux r seaux de surveillance REBENT REMORA MOREST REPER RSL a prise en compte des donn es spatialis es et de fonctionnalit s cartographiques La diffusion des donn es et de produits de valorisation aupr s du grand public Les changes de donn es qualifi es entre partenaires nationaux La refonte reprend l ensemble des l ments de Quadrige que ce soit l aspect base de donn es ou les aspects applicatifs II s agit de reprendre le mod le de donn es en y int grant de nouveaux l ments en modifiant ceux existant pour les adapter de nouveaux besoins et enfin en s int grant de mani re la plus intime au syst me d information global de l Ifremer LDAP gestion des missions SEXTANT r f rentiels divers de reprendre l ensemble des applicatifs pour y int grer notamment des fonctionnalit s cartographiques pour l extraction visualisation HUGUET Antoine 2004 3 2 3 Les donn es g r es par Quadrige Quadrige g re trois grands types de donn es 1 des donn es de r f rence li es
20. situ en arri re des balises sont r alis es afin d obtenir une image aussi pr cise que possible de cette limite Des observations quand a la profondeur moyenne de la limite et le type viennent compl ter ce plan La profondeur est mesur e au niveau de chaque balise l aide d un profondim tre lectronique Vyper SuntoO pr cision 10 cm La mesure s effectue au pied de chaque balise Cette mesure permet de mettre en vidence d ventuels mouvements s dimentaires 2 3 LISTE ET DESCRIPTION DES PRINCIPAUX PARAMETRES MESUREES SUR LES HERBIERS DE POSIDONIES Cette liste recense les principaux param tres g n ralement mesur s sur les points de surveillance des herbiers de Posidonies L ensemble de ces mesures peut toutefois varier selon les programmes mis en place Les param tres d crits ci dessous sont issus d entretiens avec les diff rents partenaires du r seau principalement les scientifiques ou de recherches bibliographiques Cette liste est non exhaustive 2 3 1 La Densit C est le nombre de faisceaux par unit de surface Nombre de faisceaux m tre carr La densit est calcul e en r gle g n rale au niveau de chacune des balises partir de trois mesures successives l aide d un quadrat d pos sur la couverture de l herbier G n ralement ce quadrat est de 40 x 40 cm de cot et peut tre ramen 20 x 20 cm de cot pour mesurer les herbiers se pr sentant sous la forme de touffe PERGENT
21. titives et n cessitent donc des structures rapides d acc s Ce type de requ te peut r pondre cette demande Extraction sur la table RESULTAT Extraction de tous les param tres mesur s une date ou ann e les programmes sont organis s en r gle g n ral tous les trois ans pour le RSP donc les donn es sont associ es une ann e et les extractions sont effectu es par ann e et sur un point de surveillance donn e On obtient ainsi la liste des param tres la taille du pr l vement les valeurs et le code couleur de la table RESULTAT Pour extraire l ann e d une date il est n cessaire de saisir dans le crit re de s lection de la requ te Ann e INOM du CHAMPS 2004 http www cathyastuce com access requ_grille htm sl e Extraction des valeurs pour plusieurs param tres par point sur plusieurs ann es Permet d valuer l volution des valeurs suivant le type de param tre mesur s pour chacun des retours le point Du fait de l volution tr s lente de l herbier de Posidonie par rapport aux param tres mesur s croissance des rhizomes de 3 a 7 centim tres par an les mesures scientifiques sont effectu es sur des p riodes de trois ans Cette requ te permet donc d obtenir par des courbes de croissances l volution du param tre sur des ann es successives Bien entendu ce type de r sultat reste approximatif puisque l volution des param tres mesur s d pend aussi entre autres des conditions
22. La base de donn es SIG du syst me t exploit jusqu en 2003 sous le logiciel de syst mes d information g ographiques ArcView version 3 2a d ESRI compl t de ses extensions comme Image AnalysisO pour le traitement d image de 3D AnalystO version 1 0a Network Analyst version 1 0b et Spatial AnalystO version 1 1 Le service s est quip du logiciel Arcgis 8 3 et tend a faire migrer depuis quelques ann es la base de donn es vers le logiciel Arcgis 8 3 Diff rentes applications ont t d velopp es par Ifremer DEL AO Direction de l Environnement et du Littoral Applications Op rationnelles r pondant a des besoins sp cifiques Ex Ad lie Application pour la vid o sous marine D autres logiciels compl tent la partie software du syst me des fins de traitements statistique et spatial des donn es 1 2 7 Architecture de la base de donn es SI TL 1 2 7 1 La base de donn es SIRS Physiquement la base de donn es g n rale est d velopp e sur le Disque Dur DD ma tre dans 2 r pertoires principaux qui sont e SIRS Syst me d Information R f rence Spatiale pour les donn es purement SIG contient l ensemble des donn es lisibles directement et indirectement par convertisseur de donn es par ArcView ou Arcgis c est dire les donn es graphiques de type point ligne polygone e DATA pour les donn es pouvant tre li es un projet contient les informations associ es aux projets photos tab
23. PACA CQEL 13 Le GIS Posidonies CQEL 83 RS DS e CQEL OG LL DOEN ll Tableau 1 Premi re phase du RSP 1984 1999 Le GIS Posidonie Association loi de 1901 cr e en 1982 regroupant les universitaires m diterran ens coordonne les r seaux de surveillance des herbiers tant au niveau r gional qu au niveau local Il est divis en 3 centres respectivement bas s l Universit de Marseille A CQEL 13 DDE services maritimes cellule qualit des eaux du littoral dans les bouches du Rh ne CQEL 83 DDE services maritimes cellule qualit des eaux du littoral dans le var CQEL 06 DDE services maritimes cellules qualit des eaux du littoral des Alpes Maritimes g DQECV Conseil g n ral des Alpes maritimes Direction Qualit de l environnement et du cadre de vie A al coordonn e par C F BOUDOURESQUE a l Universit de Nice coordonn e par A MEINESZ et a l Universit de Corte coordonn e par C PERGENT La r gion PACA CQEL 13 LeGISPosidonies Agence de l eau RMC CQEL 83 oo ooo y IO O POCOS IS OE li Tableau 2 Deuxieme phase du RSP 1999 a 2004 Financeur du projet La r gion PACA CQEL 13 CRIGE Agence de l eau RMC CQEL 83 RS RE CQEL 06 PS BE oo LDOECN ee DIREN Corse GIS Posidonie Corse Tableau 3 Participant en 2004 Le CRIGE PACA Centre R gional de l Information G ographique Il centralise les donn es et les mets disposition sur le site du CRIGE Les do
24. Pour le pourcentage de rhizomes plagiotropes Function fintervalle2 ByVal Valeur As Double _ Optional ByVal Espacelntervalle As Double 25 As String Dim 11 As Long Dim 12 As Long 1 Valeur 1 Espacelntervalle Espacelntervalle If Valeur lt 30 Then 2 11 Espacelntervalle 1 fintervalle2 3 Elself Valeur gt 30 And Valeur lt 70 Then 2 11 Espacelntervalle 1 fintervalle2 2 Else 2 11 Espacelntervalle 1 fintervalle2 1 End If End Function Pour la densit Function fintervalle3 ByVal Valeur As Double _ Optional ByVal Espacelntervalle As Double 25 As String Dim 11 As Long Dim 12 As Long 1 Valeur 1 Espacelntervalle Espacelntervalle If Valeur lt 50 Then 2 11 Espacelntervalle 1 fIntervalle3 5 Elself Valeur gt 50 And Valeur lt 150 Then 2 11 Espacelntervalle 1 fIntervalle3 4 Elself Valeur gt 150 And Valeur lt 300 Then 2 11 Espacelntervalle 1 fIntervalle3 3 Elself Valeur gt 300 And Valeur lt 400 Then 2 11 Espacelntervalle 1 fIntervalle3 2 Elself Valeur gt 400 And Valeur lt 700 Then 2 11 Espacelntervalle 1 fIntervalle3 1 Val Elself Valeur gt 700 Then 2 11 Espacelntervalle 1 fIntervalle3 1 End If End Function A chaque param tre correspond une fonction stock e dans un module g n ral du projet BDPosidonie Les requ te SQL cr ent un nouveau champs appel groupe et appel la fonction p
25. ayant perdu leur apex GIRAUD 1977 LAI Surface foliaire LAI par faisceaux Surface foliaire densit LAI par m tre carr Attention le terme LAI r f re uniquement la deuxi me valeur Normalement le LAI par faisceau est la surface foliaire ou SF mais cela n est souvent pas indiqu dans les tableaux Excel Figure 28 Gestion des donn es sur la biom trie foliaire Was SYSTEME D INFORMATION GEOGRAPHIQUE LA GEODATABASE ORGANISATION DES DONNEES AU SEIN DE LA GEODATABASE CREATION D UNE SYMBOLOGIE ET DE DIAGRAMMES RESULTATS CARTOGRAPHIQUES Mots cl s Structuration de donn es G odatabase Symbologie Exploitation cartographique 6 LE LIEN AVEC LE SYSTEME D INFORMATION GEOGRAPHIQUE 6 1 LA GEODATABASE 6 1 1 D finition La g odatabase est un mod le de donn es permettant de repr senter des informations g ographiques l aide des technologies standard de bases de donn es relationnelles La g odatabase prend en charge le stockage et la gestion des informations g ographiques dans des tables du syst me de gestion de bases de donn es relationnelles standard Accessibles par tous les utilisateurs ArcGIS elles utilisent la structure de fichiers de base de donn es Microsoft Jet Engine pour conserver les donn es SIG dans des bases de donn es Ce sont des espaces de travail base de fichiers et renferment des bases de donn es dont la taille ne d passe pas 2 Go Ce type de g odatabase es
26. bassins Quadrige ZONE HOMOGENE liste des bassins Quadrige MASSE D EAU DCE liste des bassins Quadrige POINT liste des points La table point est rattach un outils de positionnement dont la liste recense tous les moyens de positionnement GPS cartes ll se trouve dans la table POSITION Chaque point poss de des coordonn es g ographiques qui ont t mesur es partir de cet outils 5 3 3 3 Source de donn es Afin de pouvoir obtenir des informations sur la mani re dont la donn e a t obtenue il est indispensable de pouvoir a tout instant retrouver la source d une donn e Pour cela tout r sultat entr dans la base est rattach a un programme d tude ou de recherche a une source ou une personne est rattach a un organisme Ce responsable est indiqu dans cette table comme personne ressource pour toute information relative aux donn es Cette personne ressource fait partie de la liste des personnes physiques stock es dans la table PERSON de la base Le choix du programme permet de renseigner a partir de quel programme les donn es sont obtenues Cette structure des donn es se traduit physiquement par les tables suivantes e PERSONN PROGRAMME 9 3 3 4 Strat gie spatiale et strat gie temporelle MA 5 3 3 4 1 La table DATA STRATEGY Pour relier ces tables et tablir le lien avec les donn es spatiales la table DATA STRATEGY strat gie des donn es constitue la premi re tape de la
27. c t divis en 9 carr s de 10 cm de c t selon la m thodologie de GRAVEZ et A 1995 G n ralement l observation se fait in situ une certaines distance de l herbier par les plongeurs Ce param tre peut tre entach d impr cision notamment li es l appr ciation de Vas l observateur 10 a 20 d erreur et de la saison ou s effectue la mesure variation de la longueur des feuilles PERGENT PERGENT MARTINI BOUDOURESQUE 1995 2 3 3 Le D chaussement Le d chaussement est le calcul de la distance entre le point v g tatif de la feuille et la surface du s diment En r gle g n rale cinq mesures sont effectu es au niveau de chaque balise a l aide d un r glet gradu tous les 5 mm EOL 2004 CH See dE e o L 2 L t Gab ie A vi d Ve TH DD H D chaussement L Th 35 CR i e Zei e r CAE D ZER H Ir Hi chansseme ent Figure 6 D finition de la hauteur de d chaussement des rhizomes de Posidonia Oceanica d apr s Boudouresque et al 1980 Le d chaussement permet l herbier de lutter contre l enfouissement li la s dimentation et aboutit la construction de matte Le d chaussement des rhizomes traduit un d ficit s dimentaire dans l herbier Ce param tre est a utiliser avec pr caution puisqu il peut varier tr s rapidement en fonction des conditions m t orologiques Param tre tr s li aux donn es L pidochronologiques PERGENT
28. d autres donn es tels que le recouvrement le d chaussement Utilis dans le cadre du RSP Elle a t d velopp de mani re ce que les utilisateurs puissent avoir un outils simple de saisie de leurs donn es de terrain par l interm diaire d une interface de saisie La base de donn es est simplement prot g par un mot de passe ll sera possible par la suite de d finir des administrateurs et des utilisateurs selon les droits accord s aux diff rentes personnes Il sera donc n cessaire d tablir une liste de personne ayant des droits d administrations et de d finir de fa on pr cise le lieu de stockage de la base par exemple sur serveur ou sur un poste de travail La suite de ce document explique la m thodologie employ e pour la mod lisation et d crit de fa on d taill s l architecture g n rale de la base liste des tables et des relations de la base 5 1 L ARCHITECTURE DE LA BASE 5 1 1 La mod lisation Le mod le de base de donn es suit les deux principaux enjeux pris en compte dans le cadre de cette tude Les crit res retenus dans le cadre de la DCE sont ceux stock s en priorit dans la base de donn es et l architecture est r alis en suivant le mod le de la base de donn es Quadrige La base de donn e laisse la possibilit aux diff rents administrateurs de modifier les param tres param trage de nouvelles requ tes modification ou cr ation des formulaires de Saisie et des champs pr sen
29. d ordre institutionnel scientifique ou professionnel qui l am nent op rer et collaborer avec de nombreux partenaires ex GIS Posidonie COM tant au niveau local r gional que national voire international 1 2 4 SI TL Outil de gestion des donn es littorales Le laboratoire environnement ressources de Toulon a inscrit dans ses programmes d activit s depuis 1997 le d veloppement d un systeme d information pour l environnement littoral de la fa ade m diterran enne et plus particuli rement de la r gion PACA le SI TL Le d veloppement de cet outil r pond a un besoin interne du laboratoire de restitution cartographique de ses donn es et informations afin de l aider a am liorer ses t ches courantes d tude d avis d assistance et d expertise Progressivement le laboratoire s est dot des moyens n cessaires tant au niveau humains que mat riels pour satisfaire a cette demande ll a ainsi travaill d une part au plan m thodologique la d finition l organisation et la mise en forme des donn es de la base du syst me et d autre part au plan informatique la conception et la mise en oeuvre d une configuration appropri e pour partager et exploiter ces donn es A l origine l id e ma tresse tait de concevoir un produit compact et amovible qui contiendrait a la fois les donn es n cessaires aux besoins du laboratoire les logiciels SIG et les projets SIG permettant ainsi l change de toutes
30. de la richesse des eaux littorales en M diterran e Figure 5 Herbiers de Posidonies vo 2 1 3 R le de bioindicateur L utilisation de bioindicateurs est aujourd hui un moyen d investigation des plus appropri s dans toute la recherche d cologie appliqu e en g n ral et en cotoxicologie Ces bioindicateurs permettent notamment d valuer l importance et la variation de la qualit transparence oxyg nation et ou de la contamination du milieu marin polluants chimiques d origine min rale ou organique mati res organiques Pergent G Abiven T Hauden S Mimault B Pasqualini V Patrone J Pergent Martini C 2004 Particuli rement sensible la pollution et aux agressions li es aux activit s humaines l herbier de posidonies rend compte par sa pr sence et sa vitalit de la qualit des eaux qui d rivent au dessus de lui Comme tout v g tal Posidonia oceanica a besoin de lumi re pour effectuer sa photosynth se son extension bathym trique maximale limite inf rieure d pends essentiellement de la quantit de lumi re re ue sur le fond et donc de la transparence moyenne des eaux Boudouresque Meinesz 1982 Par exemple dans les zones o la transparence de leau est maximale les auteurs signalent des limites g n ralement situ es plus de 35 m de profondeur Augier amp Boudouresque 1979 Colantoni et al 1982 Borg amp Schembri 1995 en revanche lorsque la transparence des eau
31. de rejets urbains et de plages restructur es contexte de turbidit effet r manent des am nagements de port Fr jus hydrodynamisme Villefranche sur mer Ll Zone interm diaire restructuration du rivage mouillage plaisance rejets d eaux pluviales et pr sence de Caulerpa taxifolia et de Caulerpa racemosa Carry LS Zone interm diaire proximit rejet missaire d placements s dimentaires li s l hydrodynamisme rivi re de retour Eze LI Zone de r f rence faible turbidit mais pr sence d un petit port abri Limite d herbier la plus profonde des sites RSP du d partement La Ciotat LS Zone sensible proximit du port rechargement des plages remaniements s dimentaires importants anciens am nagements des plages alv olaires La Ciotat LI Zone de r f rence herbier le plus profond des sites RSP des Bouches du Rh ne mais contexte de turbidit Marseille LS Zone interm diaire anciens impacts des am nagements du Prado rejets pluviaux de l Huveaune Balisage install dans un herbier relique morcel en quelques taches de Posidonies sur des mattes mortes Marseille LI Zone interm diaire contexte de turbidit anciens am nagements des plages et rejets pluviaux de l Huveaune St Tropez LI Zone interm diaire contexte de turbidit anciens am nagements des plages et rejets pluviaux de l Huveaune Table des illustrations Figure 1 Implantation de l Ifremer sur le terri
32. diment Epiphytes Limite Du point de vue descriptif l engin utilis et la mani re dont il est utilis doivent tre renseign s La table ENGIN contient la liste des engins de pr l vement disponibles ainsi que leur taille Dans la plupart des cas chaque pr l vement aura la m me taille que celle de l engin La taille de l engin utilis est importante renseigner puisque des r sultats de pr l vement peuvent avoir des significations diff rentes selon le type d engin utilis Par exemple si la densit est mesur partir d un quadrat de 30 30 cm ou 40 40 cm alors le r sultat devra tre li l engin pour viter les erreurs d interpr tation dans les r sultats 5 3 3 6 R sultats o Pour chaque station on obtient une s rie de r sultat Mat riel et m thode Les tables contenant les r sultats sont structur es sur le mod le de la base de donn es QUADRIGE version 1 L ordre chronologique de saisie est donc le suivant 1 Un param tre mesur le param tre est choisi dans une liste contenue dans la table PARAMETRE de mani re uniformiser la nomenclature des param tres et optimiser les requ tes e Une m thode d analyse elle correspond aux manipulations effectu es sur le pr l vement pour obtenir le r sultat Les m thodes d analyses disponibles sont list es dans la table METHODE 2 Une ou plusieurs valeurs num riques Les valeurs saisies dans la table RESULTAT sont repr sent es sous
33. diterran e Fran aise de rassembler l ensemble des donn es relative la surveillance de l herbier de Posidonies dans le cadre du RSP ou de la DCE La principale difficult dans la r alisation de ce projet a t de concevoir un outil de stockage de donn es sur une dur e restreinte d initier un projet a la base et de le mener terme puisque aucune mod lisation de base de donn es n avait t d velopp auparavant et de travailler avec une diversit de partenaires tablis sur tout le littoral M diterran en La seconde difficult a t la recherche des donn es de les rassembler et de synth tiser l ensemble pour permettre leur saisie dans la base Les donn es taient nombreuses dispers es et stock es dans des formats extr ment vari s La partie base de donn es est op rationnelle au niveau de la saisie ainsi qu au niveau des outils d extraction simple Actuellement elle contient des jeux de donn es complets dont la source est connue Ainsi ces donn es fournissent partir des requ tes Access une information compl te en r ponse aux objectifs Les outils actuel permettent entre autre de r pondre aux diff rents enjeux notamment l int gration des donn es Posidonies Quadrige sans n cessairement passer par le d veloppement d application sp cifique et la DCE en permettant l extraction d un indice globale a partir des donn es brutes L volution des diff rents enjeux notamment de la DCE et de
34. donn es Ferme la page Quitter la base Access Extraction des donn es Extraction sur les donn es brutes Donn es par point et par date Type de donn es Densit Recouvrement D chaussement Rhizames plagintranes Donn es sur la biom trie foliaire par point et par date Type de donn es Longueur Largeur Longueur de la base des EST e feuilles 1 Attention vous deve Donn es Synth tiques re le nom du point et la date de pr l vement Toute saisie mal orthographi ou ne sultats ez connait respectant pas le type de caract res Majuscules ou minuscules ne donnera pas de r s d accueil et permet d acc der la structure de la base L SAINT ETIENNE Sortir du menu Avant de lancer la requ te il faut parar requ te dans le menu te en mode cr ation Se rapporter au manuel de l utilisateur Apr s chaque extraction il est possible d exporter la table au Format dbf et l integrer la g odatabase du logiciel SIG pour l interpr tation nn es moyennes Points RSP _ Zones homog nes SDAGE Bassins par r gion Quadrige HE Sites par r gion Quadrige Liste des masses d eau DCE Recouvrement D chaussement 2 Rhizomes plagiotropes 2 Densit Lal A E Surface foliaire 2 A gt ni Ce type de requ te extrait partir de calcul un indice globale sur la qualit des masses d eau bas s
35. es WGS84 World G od sique Syst me est utilis par le r seau satellitaire GPS La normalisation du Lambert 93 l chelle de la France devra alors tre pris en compte dans la base Mas Niveau 3 Classification de la donn e selon le fournisseur auquel elle appartient AERMC Agence de l Eau Rh ne M dit rran e Corse Euromaps SHOM DIREN Niveau 4 Ensembles des fichiers li s au dossier Enfin les objets g ographiques sont class s selon le type informatique qu ils rev tent distingu s par les d nominations suivantes raster image raster de type photo a rienne ou image satellite shapelin dossier de fichiers d objets lignes des shapes ArcView shapepol dossier de fichiers d objets polygones des shapes ArcView shapept dossier de fichiers d objets points des shapes ArcView Cette organisation permet d viter toute redondance dans les fichiers et un foisonnement inutile de la base LC legend e El 5 Lima_br q Niveau 1 E Niveau 2 E E Gen A E 4 bdcarto El LH canari_2 Ca cle E dee E FA Diren Niveau 3 Niveau 4 Figure 3 Sch ma d organisation du SIRS PRESENTATION DU PROJET LA SURVEILLANCE DE L HERBIER DE POSIDONIE LES ENJEUX METHODOLOGIE Mots cl s R seau de surveillance Points de Surveillance Param tres et descripteurs Bioindicateur Enjeux Conduite de projet 2 LA SURVEILLANCE DE L HERBIER DE POSIDO
36. existe une classe d entit nomm mesures sig ph no Cette classe d entit correspond la requ te Access param tr es par l utilisateur C est un exemple d utilisation du script formulaire pour acc der au formulaire de la requ te en cours Cf 8 6 2 5 6 2 2 1 2 Principe d utilisation du jeu de classes d entit s donn es r sultats La cr ation d une classe d entit peut tre r alis e de deux mani res La premi re est de s lectionner par un click droit de la souris le fichier dbf souhait pr sent dans le dossier temporaire puis de choisir cr er une classe d entit s et A partir d une table XY p Tumor Aper u Metadonnees EE PROGRAM A E REGION Name 2001 dbf EE RESULTAT_BIO Type Table dBASE EE RESULTATS EE SITE EE STATION EE TYPE_LIMITE EE UNIT_TYPE EE UNITE EE ZONE_HOMOGENE Qi Projets LG Temporaire El nni dhf Es Copier Ctrl C F H IMAG x Supprimer CT Quadr CA VBmysdl Renommer F2 ml Copie def Exporter b corse txt languedoc Cr er une classe d entit s A partir d une table gy paca txt 3 master SIG t Ka G ocoder des adresses LG Nouveau doss SS 3 8 opensvgmaps Propri t s m A JI Dranr arm ation Figure 34 Cr ation d une classe d entit s sl Ensuite dans la boite de dialogue cr er une classe d entit il faut s lectionner les coordonn es du champs X et les coordonn es du champs Y choisir la
37. iles de Lerins ROUES EEE Grimaud LE ZE Larry L5 D SS Cassis LE Grimaud CLI ac St Tropez Ll Cap Corse Macinaggio d Marseille 117 Cavalaire lz pa gt ne EE pe mt Cavalaire LI a e hi II S eg E Ciotat LS Bee LeLlavandou LS D Cap Corse Sisco L5 CH 2 Le Brusc LS ll aa wf Bormes Li y Cap Corse sagro LI o rie Le Brusc Ll 1 RT i G Fe IQierolles LS F F L o W E SE Bastia Toga LI oulon Bastia 2rinella LIJ Bastia Bi guglia Sud LS i Plaine Orientale 2 am polora 13 s E i Plaine Orientale Bravone ILI Plaine Orientale Fum orbu LS Plaine Srentale olenzara L ds RAR 0012545 s0 F5 100 a WE kilo m tre s Ka A D I e n D A j r GA Surveillance de l herbier de Posidonies en m diterran e W CES VW SA j H Des r alis par DEBARD St phane 26 06 2006 Source Bremer DELTL IGN SE RMC Euromap i eniai ANNEXE 2 LOCALISATION DES 33 POINTS DE SURVEILLANCE DE L HERBIER DE POSIDONIE DU RSP ET INVENTAIRES DES PRINCIPALES NUISANCES ET FACTEURS DE RISQUES POUR CHAQUE SITE LE LONG DU LITTORAL DE LA REGION PACA IN CHARBONNEL ET AL 2000 LES 33 POINTS DE SURVEILLANCE DU RSP en R gion Provence Alpes C te d Azur Inventaire des principaux types de nuisances rencontr s et proche ou lointain Mouillages forains Zone de r f renc on d puration A plaisanciers one de r f rence ts s dimentaire Echelle de profondeur L
38. le type texte du fait des diff rences qu il peut y avoir dans le choix du type de donn es mesur es Par exemple la densit est une valeur num rique alors que la limite inf rieure est renseign sous la forme d un texte de type r gression progression ou stable M Les donn es sur les mesures moyennes table RESULTAT C est le cas des pr l vements de Densit Quadrat 0 2 0 3 Recouvrement etc ou M Les donn es sur la biom trie des feuilles table RESULTAT BIOM C est le cas des pr l vements de faisceaux longueur largeur foliaire Chaque r sultats quelle que soit la table est d fini par M Une unit de mesure l unit est choisie dans la liste propos e par la table UNITE Chaque unit est d finie par son nom son symbole et un type d unit masse volume choisi dans la liste de la table UNIT TYP La table UNIT TYP n est pas accessible directement par l interface utilisateur puisque chaque unit correspond directement a un type d unit Cette table est pr sente pour effectu un type de requ te sp cifique Par exemple si l on veut acc der toutes les donn es de longueur ou toutes les donn es de densit R gion Quadrige Site Quadrige Bassin Quadrige Zone homog ne Masse d Eau DCE Strat gie spatiale Engin d chantillonnage Strat gie temporelle Niveau Pr l vement R sultats des mesures R sultats sur la biom trie des
39. les informations qui y sont attach es Actuellement le syst me est op rationnel aussi bien en terme d organisation de la base que d exploitation au moyen de proc dures d di es Le parc informatique Le parc informatique d di dont la vocation est de servir prioritairement SI TL est constitu de trois PC fixes un ma tre et deux clients et un portable Poste Ma tre Pentium lll NEC cadenc 800 Mhz 256 Mo de m moire 60 Go de disque dur partionn Poste Client Pentium II NEC cadenc 560 Mhz 256 Mo de m moire 36 Go de disque dur partionn Poste Client II Pentium Il NEC cadenc a 266 Mhz 128 Mo de m moire 13 Go de disque dur partionn Portable Pentium ll DELL portable cadenc a 200 Mhz 48 Mo de m moire 3 2 Go de disque dur cran 13 carte r seau Les postes de travail sont reli s a des p riph riques d entr es et de sorties e deux crans de 21 pouces et un de 19 pouces une imprimante XeroxworkCentre24 PCL 6 Laser couleur format A3 et A4 e une imprimante laser noir et blanc Hewlett Packard laser Jet IIl format Ad un scanner AGFA studio star 1200 dpi e lecteurs CD Rom graveur Le syst me d exploitation utilis sur la plate forme est Windows XP professionnel Les trois postes sont reli s des disques r seau pour l change et la sauvegarde des fichiers Ces PC fonctionnent de fa on ind pendante ne r pondant pas au principe ma tre client
40. maximum que 7 sous formulaires li s Cependant il na pas t n cessaire dans le cadre de la saisie des donn es de cr er plus de 5 sous formulaires li s Nous avons utilis trois s ries de formulaires et de sous formulaires La premi re s rie correspond la saisie des donn es spatiales et temporelles voir Ordre de saisie dans la base la deuxi me s rie correspond au choix des pr l vements pour une station et la troisi me s rie permet la saisie des r sultats un formulaire p re pour la saisie des donn es g n rales et un pour la saisie des donn es sur la biom trie foliaire Fen tre Base de donn es E Base de gestion des donn es de l herbier de Posidonies RN e r EN BDPosidonie Base de EES B n Nouveau X 22 T EE m Objets Logos SC GDB_ReplicaDatasets GDB_Replicas GDB_SpatialRefs GDB_StringDomains GDB_Subtypes pp Top T polagies GDB_TopoRules GDB_UserMetadata GDB_ValidRules MASSE_D_EAU_DCE mesures_sig_ph no mesures_sig_ph no_Shape_Index Groupes A r EEE EEE Ouvre le PRELEVEMENT PRELEVEMENT_LIST sommaire de la Leben e N Ouvre le choix d action sur la base Ouvre le choix des listes de donn es de r f rences Acc s au manuel d utilisation de BDRSP orse anguedoc Roussillon Provence Alpes C te d Azur R gion 2 agence deleau Provence Al C te d Az mes qn ee Ue Hhiance des herbiers de F E Extraction des
41. n rale d une application de donn es sans tenir compte des consid rations logicielles ou des contraintes relatives au stockage des donn es Le Mod le Physique de Donn es pour mod liser la structure physique g n rale d une base de donn es en tenant compte des consid rations logicielles ou des contraintes relatives au stockage des donn es Il est donc possible de cr er le MCD partir de ce logiciel d automatiser la cr ation du MPD partir du MCD et d tablir un lien entre le mod le et le logiciel de gestion de base de donn es en l occurrence Access La base de donn es a donc t cr e partir de ce logiciel Les champs et les relations entre les tables sont d finis dans Power AMC Deux param tres n ont pas t conserv s lors de la cr ation l application de l int grit r f rentielle propre Access et la mise en place des cl s primaires dans les identifiants de la table En effet dans Access il est n cessaire de d finir physiquement la cl primaire en appliquant un ic ne au niveau du champs Le mod le Physique de donn es de la base et le lien interpr t en langage SQL entre Power AMC et Access n cessaire a la cr ation de la base sont pr sent en annexe 4 Donn es Spatiales Points Bassin point site _bassin
42. r f rence spatiale des coordonn es et s lectionner le fichier en sortie Dans la boite de dialogue Enregistrement des donn es donnez un nom de sortie au fichier et s lectionnez dans le Type Classe d entit de g odatabase personnelle Cette proc dure permet de stocker le nouveau fichier de formes dans une classe dente et l enregistre dans la g odatabase BD Posidonie Le nom peut tre par exemple r sultat 2004 La seconde solution est de cr er la classe d entit dans le jeu de classe d entit et de la remplacer lors de la cr ation de la couche partir des coordonn es X et Y Pour voir appara tre la nouvelle classe d entit il est n cessaire d actualiser l arborescence d Arccatalog dans le menu Affichage Actualiser L inconv nient est qu Arcgis ne stocke pas la nouvelle classe d entit dans le jeu de classe d entit s lectionn Il faut la s lectionner et la d placer vers le jeu de classes d entit s donn es r sultats ll est n cessaire aussi que la nouvelle classe d entit soit dans le m me systeme de projection que le jeu de classe d entit s en l occurrence le Lambert 2 tendue Km de R f rence spatiale ax Champs en entr e S yst me de coordonn es Domaine Nr 181 z A alsir Von NTF_Lambert_II_ tendu Enregistrement des donn es D tails d Dose Regarder E BDPosidonie mdb un nom tails de s
43. s lection de plage de valeur partir des r sultats moyens extraits pour le recouvrement la densit le pourcentage de rhizomes plagiotropes il a t n cessaire d interpr ter les r sultats obtenus Des plages de valeurs ont t d fini d apr s les grilles d interpr tations de la qualit des herbiers de Posidonies voir annexe 5 La proc dure a t d effectuer des requ tes sur les requ tes moyennes de chacun des param tres de d velopper un Script VBA Visual Basic Application de calcul d indice dans un module g n ral Ce script permet de cr er un nouveau champs dans la requ te s lection pour affecter chaque enregistrement de la requ te une valeur calcul partir des grilles de qualit Ce script recherche dans l ensemble des enregistrements des plages de valeurs et cr e un nouveau champs dans la requ te appel Groupe contenant un indice correspondant la plage de valeur allant de 0 5 selon le param tre voulu VBScript Pour le recouvrement Option Compare Database Function fintervalle ByVal Valeur As Double _ Optional ByVal Espacelntervalle As Double 25 As String Dim 11 As Long Dim 12 As Long 1 Valeur 1 Espacelntervalle Espacelntervalle If Valeur lt 20 Then 2 11 Espacelntervalle 1 fintervalle 3 Elself Valeur gt 20 And Valeur lt 70 Then 2 11 Espacelntervalle 1 fintervalle 2 Else 2 11 Espacelntervalle 1 fintervalle 1 End If End Function
44. tableaux excel Nb A c Nombre de feuilles adultes cass es Nb A Nombre de feuilles adultes Lg A Longueur moyenne des feuilles adultes LB Longueur moyenne de la base de la feuille adulte en mm La A Largeur moyenne des feuilles adultes Coef A Pourcentage de feuille adultes ayant perdu leur apex GIRAUD 1977 Nb A c Nb A 100 LAI A Surface foliaire LAI par faisceaux des adultes Nb A Lg A La A en cm faisceau SF Ad Surface foliaire densit LAI par m tre carr des adultes en m m Il faut donc transformer la surface foliaire par faisceau en cm en m NbI c Nombre de feuilles interm diaires cass es Nb I Nombre de feuilles interm diaires Lg I Longueur des feuilles interm diaires La I Largueur moyenne des feuilles interm diaires Coef I Pourcentage de feuille interm diaire ayant perdu leur apex GIRAUD 1977 Nb I c Nb 1 100 LAI I Surface foliaire LAI en faisceaux des interm diaires SF Int Surface foliaire densit LAI en m tre carr des interm diaires Nb I Lg I La D 100 Nb J Nombre de juv niles Coef T Pourcentage de feuille totales ayant perdu leur apex GIRAUD 1977 Nb Ac Nb Ic Nb A Nb I LAI T Surface foliaire globale SF ad SF int Champs du tableau r capitulatif Nb total feuilles Nombre total de feuilles Nb feuilles cass es Nombre total de feuilles cass es le terme cass est privil gier par rapport au terme coup qui
45. tr es avec filtres de saisie Les requ tes param tr es par l utilisateur Les requ tes analyses crois es nl 5 4 2 1 L extraction des donn es brutes Pour obtenir une information coh rente le type de requ te cr e doit suivre l architecture de la base c est dire l ordre de strat gie spatiale et temporelle Les donn es sont rattach es un point une date Chaque donn es obtenues est donc li ce point et cette date Dans chaque requ te il est donc n cessaire de prendre en compte le point et la date ll est alors possible d obtenir des r sultats pour un point ou plusieurs points et une ou plusieurs dates de pr l vement Ensuite sur chaque requ te il est possible de cr er des filtres par s lection sur les enregistrements voulus 5 4 2 1 1 Les requ tes param tr es avec filtres de saisie Ce type de requ te propose l utilisateur une requ te orient c est dire qu l issue de son ex cution les param tres retenus ont d j t param tr s en mode cr ation dans la requ te L utilisateur n a donc pas besoin de param trer sa requ te Ceci l avantage de lancer rapidement les requ tes les plus r p titives et vite l utilisateur de cr er des requ tes en mode cr ation s il ne conna t pas Access L inconv nient est qu au lancement de la requ te il doit saisir des valeurs dans des bo tes de dialogues en s lectionnant un point et une date ll est alors n cessaire de saisi
46. tronconique Le diam tre moyen d une balise est de 20 cm pour une hauteur de 13 cm soit un poids moyen de 20 kg Chaque balise est perc e par trois trous ce qui permet un ancrage sur le fond par trois tiges m talliques d 1 m tre de long et de 12 mm de diam tre Premi re quipe D limitation de l emplacement du balisage Figure 7 Caract ristiques des balises utilis es en limite inf rieure mise en place par un plongeur Charbonnel et al 2000 Onze balises sont dispos es tous les cinq m tres le long de la limite de l herbier Chaque balise est num rot e l aide d une plaquette en PVC et munie d un flotteur pour faciliter son rep rage sur le fond Figure 8 Des piquets photos tige m tallique sont positionn s en aval de chaque balise afin de garantir la reproductibilit des conditions de prises de vues au cours du temps L orientation des balises les unes par rapport aux autres de m me que celle du piquet photo par rapport la balise sont relev es l aide d un compas corrig pr alablement terre La pr cision de la mesure d orientation est estim e a 5 L ensemble de ces mesures permet de r aliser un plan c t pr cis au 1 100 me du balisage En outre ces orientations et distances permettent lors des suivis ult rieurs des balisages de remettre en place la ou les balises ventuellement d plac es par les ancres ou le Va passage d arts trainants Des photographies de l herbier
47. 2 L herbier de Posidonies pris en compte dans le cadre de la DCE en tant qu l ment de qualit biologique Du fait de l importance des herbiers de Posidonies en M diterran e et des nombreuses tudes dont ils ont fait l objet c est tout naturellement qu ils ont t retenus comme l un des l ments de qualit biologique ils sont a m me de renseigner sur le bon tat cologique des masses d eau c ti re et plus particuli rement sur le substrat meuble L adoption de la DCE a donc renforc la n cessit d une surveillance des herbiers de Posidonies La DCE pr conise d utiliser des bioindicateurs et l extraction d un indice globale capable de caract riser l tat g n ral des masses d eau La notion de bon tat tat cologique physicochimie biologie tat chimique normes usages Tr s bon Bon Moyen se Mauvais Figure 9 D finition de la notion de bon tat au sens de la DCE Dans le cadre du suivi des herbiers de Posidonies l indice sera tabli a partir de plusieurs param tres dont certains sont d ores et d j utilis s pour appr hender la vitalit d un herbier Ils devront avoir des temps de r ponses relativement faibles ce qui permet d envisager leur utilisation au titre du contr le de surveillance de la DCE Correctement renseign s ils permettront d identifier une r ponse de l herbier suite une modification des conditions environnementales Les mesures sur les herbie
48. 2005 N O Europe http www ifremer fr medicis projets mytilos html REMERCIEMENTS Je voudrais tout d abord remercier Mr Bruno ANDRAL Ifremer LER PAC La Seyne mer pour m avoir accept lors de ce stage de six mois au laboratoire de l environnement c tier de l Ifremer de la Seyne mer pour m avoir soutenu et accompagn dans toutes les d marches que jai pu entreprendre pour mener a bien ce projet pour m avoir facilit les rencontres avec des personnes aux comp tences diverses mais aussi pour m avoir offert la possibilit de participer la campagne MYTILOS en m diterran e bord du navire oc anographique l Europe de l Ifremer Je voudrais aussi remercier Mr Didier SAUZADE lfremer LER PAC La Seyne mer chef du laboratoire environnement ressource pour m avoir accueilli dans son quipe Je remercie Mr Thierry JOLIVEAU et Mr Eric FAVIER respectivement de l universit Jean Monnet et de l Enise ainsi que tous les intervenants du Master 2 SIG et gestion de l espace pour la qualit et la diversit de la formation Je remercie galement Antoine HUGUET Chef de Projet Quadrige DCB DYNECO VIGIES Ifremer de Nantes et Emilie GAUTHIER DCB DYNECO VIGIES Ifremer de Brest pour m avoir orient dans mes recherches et pour m avoir transmis leurs comp tences en gestion et mod lisation de bases de donn es Je remercie aussi Mme Corinne TOMASINO Ifremer LER PAC La Seyne mer pour son aide sur les Systemes d Informa
49. 38 Nuances dans la couleur des indices pour la DCE ccccnnnnninicaconononcnonononnnnnnnnnnnnnanananannononnnnnos 85 rasa DA SEA a ee 85 BIBLIOGRAPHIE Anonyme 2004 Etude et Observatoire du Littoral EOL R seau de surveillance Posidonies D partement des Alpes Maritimes ANDRAL B TOMASINO Corinne Octobre 2004 RINBIO R seau Int grateurs Biologiques Evaluation de la contamination chimique des eaux bas e sur l utilisation de stations artificielles de moules en M diterran e r sultats de la campagne 2003 BOISSERY Pierre septembre 2004 DIRECTIVE CADRE SUR L EAU 2000 60 CE Mise en uvre des r seaux de surveillance du bassin RHONE MEDITERRANEE CORSE Eaux coti res suivi de phan rogames note techniques proposition d un indice globale Posidonie IGP BOISSERY Pierre PERGENT Christine Avril 2005 document Chapitre 16 L herbier de Posidonies et la Directive Cadre sur l Eau BOUDOURESQUE Charles Francois DIVIACCO Giovanni MEINESZ Alexandre PERGENT G rard PERGENT MARTINI Christine TUNISI Leonardo Avril 2004 La gestion des herbiers de posidonies en m diterran e nord occidentale Projet d ouvrage RAMOGE C Pergent Martini a V Leoni a V Pasqualini a G D Ardizzone b E Balestri c R Bedini d A Belluscio b T Belsher e J Borg f C F Boudouresque g S Boumaza h J M Bouquegneau i M C Buia j S Calvo k J Cebrian E Charbonnel g F Cinelli c A Cossu m G Di Maida k B Dural n P
50. 4 1 1 La phase initiale ou exploratoire 4 1 1 1 Pr paration du projet Les l ments ont t class s par ordre chronologique d avancement du projet faire connaissance avec les intervenants Organismes gestionnaires associations scientifiques et tous les participants au programme Faire un inventaire des diff rents partenaires d finir les r les et les personnes rencontrer faire un historique du r seau et une synth se de l tat actuel prendre connaissance et faire une analyse approfondie des enjeux principaux dans lesquels la base de donn es RSP peut jouer un r le SDDE DCE REBENT Quadrige Prendre connaissance avec l architecture des donn es Quadrige faire un inventaire Extrait du cours MASTER II SIG et Gestion de l Espace J P SABATIER D http www commentcamarche net projet projetintro php3 Vs d taill des axes de refonte de la base de donn es Examiner les principaux enjeux de la DCE et du projet REBENT en m diterran e Etablir le lien entre le RSP et les diff rents enjeux ci dessous 4 1 1 2 Rencontre avec les diff rents partenaires et analyse de l existant Analyse de l existant Faire un inventaire des donn es existantes D crire le type de donn es la qualit des donn es et la nature des documents rencontr s Analyse des besoins Inventaire et qualification des besoins D termination des produits en sorties Qu attendent tils de la base de donn e
51. 5 MESOGEE Utilisation de l herbier a Posidonia oceanica comme indicateur biologique de la qualit du milieu littoral en m diterran e Etat des connaissances Pergent G Abiven T Hauden S Mimault B Pasqualini V Patrone J Pergent Martini C 2004 Mise en oeuvre d un R seau de Surveillance Posidonies le long du littoral de la Corse Premi re phase Cap Corse Porto Vecchio Contrat Office de l Environnement de la Corse et GIS Posidonie Centre de Corse GIS Posidonie Publ Corte 1 108 SINNASSAMY J M BERTRANDY M C BOUDOURESQUE C F FORET P LECCIA M EINESZ A PERGENT G PERGENT MARTINI C RAGAZZI M RICO V 1991 R seau de surveillance Posidonies M thodologie du R seau de Surveillance Posidonies Bilan et perspectives GIS Posidonie publ Marseille Fr 1 36
52. COM le GIS Posidonie Endoume Cort la STARESO Corse se poursuivent dans le cadre d tudes et de programmes de recherche men s en commun Il en est de m me de sa collaboration fructueuse et d j ancienne avec l Agence de l Eau RMC Celle ci se traduit aussi par l tablissement de liens avec les autres gestionnaires du littoral impliqu s dans le cadre du d veloppement du R seau Littoral M diterran en RLM 1 2 2 1 Mandat Le mandat du laboratoire le conduit mener des missions de collecte de donn es dans le cadre de la surveillance de la qualit du milieu d tudes de salubrit d avis et d expertises au profit des organismes publics et des professionnels des ressources marines Des activit s sp cifiques concernent aussi des tudes sur le d veloppement et la mise en oeuvre d outils d aide la gestion de la zone c ti re Le d veloppement de ce p le de comp tence a deux origines l environnement strat gique du laboratoire et l importance ainsi que la diversit d exp riences de son encadrement 1 2 2 2 Comp tence g ographique La comp tence g ographique du laboratoire correspond au littoral de la r gion Provence Alpes C te d Azur PACA qui s tend d Ouest en Est du Petit Rh ne la fronti re italienne Ce territoire comprend les d partement littoraux des Bouches du Rh ne 13 du Var 83 et des Alpes Maritimes 06 soit un lin aire c tier d environ 460 km 2 MENTOR Suena ZG DO Car
53. D source point A200 pk point lt pi gt o o appartient au programme In k 1 n d N PERSONNE id personne lt pi gt NO lt O gt WS E pers_name VA20 apourpoint pers_sumame VA20 i organism VA25 In status VA20 E adresse VA25 e CH N6 DATA STRATEGY ar A25 1 1 id strategy lt pi gt NO lt O gt phone_nb VA15 4 E pk strategy lt pi gt mail A50 eae comment VA50 F pk_personne lt pi gt 1 1 1 1 a pour drategie N a pour personne responsable y 1 1 Pa F TYPE_POSITION Es d position lt pi gt N2 lt O gt Y type position VA40 lAn Wa pk position lt pi gt e STATION 1 id station lt pi gt NO lt O gt date station D comment VA50 pk station lt pi gt ss 5 3 L NTERFACE UTILISATEUR 5 3 1 Outils utilis s Afin de rendre la base facile d utilisation une interface utilisateur a t d velopp e Access offre la possibilit de cr er des formulaires et des sous formulaires li s pour simplifier la saisie l extraction et la consultation des donn es Access utilise Microsoft Visual Basic comme langage de programmation ll est possible de rajouter des objets comme des boutons de contr le li a des macros ou toute une multitude de contr le utilis dans le langage de programmation orient objet Liste de choix zones liste modifiable Un sous formulaire est un formulaire ins r li dans un autre formulaire Le formulaire primaire est appel formulaire princ
54. DE LA BASE cines cana icono EE 44 5 1 1 Lamode lsaton non rana nara rra rra rra nnnnncnnnns 44 12 Les principaux criteres retenus a a ane so eee et anti 45 5 1 2 1 Structure de la base liste des tables et des relatnonsg 45 5 1 2 1 1 Les tables de donn es g ographiques oooooononnononooooonoonooono nono o nono nonnnnnannnnnnrrnrrnc rra 46 5 1 2 1 2 Les tables mterm diares nor non no nnn nor nn nor n nan nn oran nro nor nc nncnnannns 46 5 1 2 1 3 Les tables de liste de donn es 47 lid LESS tales de EE 48 5 1 2 1 5 Les tables r sultats o ooccoocoocnocnncnncnnonnonnocnnnnnnn non nor noo nnr nora non ron nor n rn nn nana nnacnnncnncnns 49 52 LE MODELE CONCEPTUEL DE DONNEES seess KKK KEN RER KEN KEREN KEREN KEE RER REN 51 Sd EINTEERFACE UTILISATEUR en senc commen snedoane nes ecnemensecocccrese ces 56 5 3 1 Outils utilis s oa 56 5 3 2 Les liaisons entre les formulaires et les sous formulaires 59 5 3 3 Ordre de saisie dans la base oococcoocnccnocnocnncnnonnocnncnnonnnononnonnno noo noo non nro rn ee eeneeneenemeeeneenees 61 5 3 3 1 Donn es ferrans AANEREN 62 A DORE ET 62 5 3 3 3 Source de donn es 63 5 3 3 4 Strat gie spatiale et strat gie temporelle 63 obs ia table DATA STRAT TOU EE 63 5 3 3 4 2 La table STATION 64 5 3 3 5 Les donnees e UE 64 5 3 3 5 1 Mat riels et M tbodes non non nono non non ron r non nan nnnnnnnnacnns 64 5 3 3 6 R sultats 64 34 IPF EXTRACTIO
55. Densit Ou Recouvr Ou Figure 24 Sch ma d organisation d une requ te param tr 5 4 2 2 Les requ tes avec champs calcul s Afin d obtenir une information pr cise sur les donn es de la base d autres requ tes ont t cr e Elles ne sont pas toutes accessibles par l interface de saisie ll a fallu rechercher le type de requ tes pouvant r pondre aux enjeux Voir 3 et aux diff rents utilisateurs selon les besoins qu ils en ont Il a t aussi n cessaire de cr er des requ tes pour permettrent l exploitation des donn es notamment des donn es sur la biom trie des feuilles En effet c est partir de la biom trie des feuilles que la surface foliaire est calcul e Voir 2 3 7 ll a donc fallu d finir une proc dure d extraction pour obtenir cette valeur Ves L utilisateur ouvre une requ te en mode cr ation et une requ te en mode feuille de donn es avec des champs calcul s Elles sont accessibles par l interface utilisateur dans un menu d di l extraction des donn es moyennes enregistr es dans le menu requ te de la base Access et sont d ja param tr es Les types d extractions sont Extraction des valeurs moyennes de densit de recouvrement de d chaussement et de pourcentage de rhizomes plagiotropes Ce type d extraction est r alis par point et par date de pr l vement Bas partir d une requ te s lection elle permet de calculer partir des donn es brutes saisies dans la
56. E CODE SITE CODE REGION ka LIBELLE LIBELLE_SITE DESCRIPTION DESCRIPTION COMMENT CODE_REGION L_REGION C_PAYS_REGION CODE POINT CODE BASSIN CODE ZONE CODE MASSE D EAU CODE PHOTO POINT ID_ STATION NOM_POINT DATA STRATEGY ID PROGRAM ACTIVITE In 1 1 ID STRATEGY LAT_NORD_WGS84 il 1 1 E LONG_EST_WGS84 CODE POINT LAT NORD _L2E CONME LAT_EST_L2E N BATHYMETRIE SOURCE POINT DAT MIS PLACE 1 n COMMENT C Table du sous formulaire 1 PROGRAM ID_PROGRAM E Table du sous formulaire 2 NOM_PROGRAM Table du sous formulaire 3 Table du sous formulaire 4 I Figure 19 Liaisons entre les tables pr sentes dans le sous formulaire Vs Dans notre exemple le formulaire ne poss de aucun champ aucune table Le 1 sous formulaire affich en mode feuille de donn es contient la table REGION Le CODE REGION n est pas affich l utilisateur mais est pr sent dans la structure du sous formulaire Le deuxieme sous formulaire pr sente les points suivis ll est donc bas sur la table POINT Le troisieme sous formulaire est bas sur la table STATION Relation 1 er sous formulaire 2 eme sous formulaire points r gion Champ p re CODE REGION cl primaire de la table Champ fils CODE REGION cl externe de la table SITE reli e la table REGION Le 1 er sous formulaire r gion est bas sur la table REGION Il est reli au sous formulaire Points par la table SITE C est donc sa cl prim
57. ION ID_ STRATEGY CODE REGION CODE_POINT 1 1 ID_LIMIT ID_PERSON 1 1 ID_UNIT_TYP TYPE_UNIT COMMENT SOURCE_POINT ia ID PERSON DAT_MIS_PLACE PERS_NAME COMMENT PROGRAM PERS_SURNAME ID_ PROGRAM SEH NOM PROGRAM SONS CODE_MASSE D EAU ID_IFREMER AREA PERIMETER MASDO_LITT LEGEND Code couleur employ STRATEGIE DONNEES TEMPORELLE RESULTATS SPATIALES STATION STRATEGIE SPATIALE Mod le physique des donn es CLE_EXTERNE fa on dont les donn es sont reli es les unes aux autres Le sc h ma ci contre signifie les tables 1 et 2 sont reli es par le CHAMP 2A chaque enregistrement de la table 1 correspond au moins 1 enre gistrements dans la table 2 mais il peut y correspondre plusieurs n enregistrements 3Chaque enregistrement de la table 2 correspond au moins 1 mais 1 seul enregistrement de la table 1 ANNEXE 5 Les grilles de qualit s La densit en fonction de la profondeur 2 Classification de l herbier en fonction de la profondeur Prof en metres DA densit anormale DSI densit sub normale inf rieure DN densit normale en gras DSS densit sub normale sup rieure d apr s Pergent Martini 1994 et Pergent ef al 1995 CODE COULEUR ER so oo CT A A A PA A E Kl z o mors o AE w o wom o AE o em o a e o rom gt m o mom o a on o mom o gt O d Zi a e o mes gt gt 7 lt 327 96 lt gt 320 BEE
58. Il y a aujourd hui pres d une vingtaine de sites en France laboratoires c tiers Ifremer et partenaires qui ont la possibilit de se connecter Quadrige et de mettre jour la base suivant les droits qui leur ont t attribu s Ceci repr sente potentiellement 200 utilisateurs HUGUET Antoine 2004 Trois outils distincts ont t d velopp s Ils s adressent des publics diff rents up outil de saisie pure pour les profils amen s faire de la mise jour un outil de gestion des tables de r f rence normalement d di l administration un outil d di a l extraction disponible pour tous Cet outil d extraction est unanimement reconnu comme puissant et complet Il permet des requ tes multicrit res puissantes et un choix tr s large pour le contenu des extractions ce jour la base de donn es atteint un volume de plus de 2 millions de r sultats Au fur et mesure cette banque de donn es est compl t e et enrichie par des saisies quasiment quotidiennes pour les programmes d j bancaris s HUGUET Antoine 2004 3 2 2 La refonte de Quadrige en Quadrige Un vaste projet de refonte de la base Quadrige Quadrige a r cemment t programm par l Ifremer ll d bute partir de mars 2004 et se poursuivra jusqu en 2007 Le responsable du projet est Antoine HUGUET chef de projet au centre Ifremer de Nantes D partement DYNamique de l Environnement C tier au service Valorisation de l Information
59. MESUREES SUR LES HERBIERS EECHER 25 2 3 1 D e IE 25 292 L Re CON TM RP A ee 25 BEA EAT AAA A 26 2 3 4 Le pourcentage de rhizomes plagiotropnes 26 2 0 EE aida 26 2 3 6 La eet tr cur EE 27 2 3 Mestres CR ADO O E pee NRA 21 2 3 8 HEEN 29 3 CES ENJEUX tada 30 Sil EXDIRECTIECADRESUK TE E DE 30 3 1 1 Les LAD D 30 las L herbier de Posidonies pris en compte dans le cadre de la DCE en tant ou l ment de awae o A A e o OE a ce tt ne 30 32 QUADRIGE ET QUADRIGE E 33 3 21 Presentation de OUa E e EEN E AA EREE E EE 33 3 2 2 La refonte de Quadrige en Quadrige reel 34 3 2 3 Les donn es g r es par Ouadrige rennes 34 3 2 4 La base Posidonie et Quadrige rene nn nnnnne nana 35 AA LE PROJET REBENT EN MEDITERRANEE seesssonmenmenenenssnnssnenesesssnnse 37 3 3 1 PSS RO E EE E E EEA 37 3 3 2 Le RSP et l projet REBENT en M diterran e rior 37 4 METHODOLOGIE APPLIQUE AU PROJET CONDUITE DE PROJET 39 4 1 PROJET ET METHODE DE CONDUITE DE PROJET ooocccccococccccoccoccnacanacacanacanacococoooos 39 4 1 1 La phase initiale ou exploratoire EE 39 4 1 1 1 PrO O a E A EE A E 39 S 4 1 1 2 Rencontre avec les diff rents partenaires et analyse de l existant 40 4 1 2 D ed ei 40 4 1 3 Ordre chronologique et sch ma d organisation ccccccccncnncnnnccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnononoss 41 5 LA BASE DE DONNEES POSIDONIES en 44 5 1 D ARCHITECTURE
60. METRIE FOLIAIRE PARAMETRE PARAMETRE METHODE SUPPORT Sch ma de donn es g r es par la base RSP CAMPAGNE RESULTATS 7 STAT PREL RESULTAT DENOMBREMENTS POSITION POINT SITE BASSIN HYDRO REGION D PARTEMENT STRATEGIE STRATEGIE DATE PROGRAMME INTERVENANT POINT TAXON NIVEAU TAXON PARAMETRE PARAMETRE METHODE SUPPORT Sch ma de donn es g r es par Ouadrige Figure 12 Sch ma de comparaison entre les donn es g r es par la base RSP et Quadrige 36 3 3 LE PROJET REBENT EN MEDITERRANEE 3 3 1 Pr sentation Le projet REBENT a pour vocation nationale l observation des bioc noses marines c ti res Il doit r pondre aux besoins de connaissance et de suivi du milieu marin Les demandes justifiants sa mise en place sont l application de la directive europ enne Habitats qui porte sur la r alisation de cartes des habitats et sur la d finition de leurs indicateurs de suivi l application de la directive cadre Eau qui prenant en compte la composition et l abondance de la flore et de la faune benthique cherche a valuer l tat cologique d une Masse d Eau RS la mise en place de plans d urgence et l valuation de l impact en cas de pollution accidentelle La connaissance du domaine benthique inventaire des esp ces et des bioc noses forte valeur cologique et la surveillance de son volution moyen et long terme doit galement permettre de mieu
61. N DES DONNEES genee oi n Onia E ES anian 67 5 4 1 Les e EE E 67 5 4 2 oa AAA A 67 5 4 2 1 extraction des donnees DO EE 68 5 4 2 1 1 Les requ tes param tr es avec filtres de saisie 68 5 4 2 1 2 Les requ tes param tr es par Iuplsateur nan rnnrrnararannno 68 5 4 2 2 Les reguctes avec champs calcul s EE 69 5 4 2 3 Les requ tes de s lection de plage de valeur 70 6 LE LIEN AVEC LE SYSTEME D INFORMATION GEOGRAPHIQUE 77 Gl LAGroODATABAS E sata E ocio coi oenelalaiess 77 6 1 1 DO E E E E 71 6 1 2 Structuration des donn es au sein d une g odatabase VV m 6 1 2 1 Jeu de classes d entit s Feature Data Set E 71 6 1 2 2 Classes d entit s Feature WE 77 6 1 2 3 a e 78 6 1 2 4 MiS AAA PP 78 6 2 LA GEODATABASE SUR LA SURVEILLANCE DES HERBIERS DE POSIDONIES 78 JA ii A 78 6 2 2 GEIER des O E e en EE EA IE 80 VAAN Ledossier Geodatabase e 81 02 2 Y O A SSA 82 6 2 2 1 2 Principe d utilisation du jeu de classes d entit s donn es r sultats 82 6 2 3 EA o o o EAEE SE E E E EEEE 83 6 2 3 1 DO 83 6 2 3 2 Type symbologie utilis e dans la base RSb 84 6 2 4 SOS e e PP PCE E 85 6 2 5 Les formulaires Access dans ArcMap oooooonnnnnnnnnncnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnonononnnnnnnnnnnnnnonnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnoss 86 CONCLUSION ANNEXES A INTRODUCTION La Posidonie Posidonia oceanica est une espece end mique a la M diterran e C est une phan rogame marine c est dire une p
62. NIES 2 1 POURQUOI SURVEILLER LES HERBIERS DE POSIDONIES La majeure partie du littoral m diterran en est de plus en plus soumise a des pressions anthropiques diverses am nagements littoraux rejets d eaux us es insuffisamment pur es d veloppement des activit s baln aires exploitation des ressources vivantes Ces impacts g n ralement concentr s en saison estivale sont de nature a hypoth quer son patrimoine naturel et g n rent de nombreux conflits d usages 2 1 1 Biologie Posidonia oceanica est une magnoliophyte marine plante fleurs end mique de la mer M diterran e elle constitue de vastes prairies sous marines appel es herbiers qui se d veloppent entre la surface et 30 40 m de profondeur La formation des herbiers leur dynamique et leur densit d pendent troitement du milieu environnant nature du substrat hydrodynamisme transparence des eaux impacts humains MOLINIER amp PICARD 1952 BOUDOURESQUE amp MEINEZ 1982 Les feuilles de Posidonia oceanica mesurent g n ralement de 40 80 cm de long et 1 cm de large elles sont regroup es en faisceaux de 4 8 feuilles l apex d un axe appel rhizome tige souterraine prolongeant les racines qui descendent plus de 70 cm de profondeur BOUDOURESQUE amp MEINEZ 1982 Les rhizomes pr sentent une croissance horizontale rhizomes plagiotropes ou verticale rhizomes orthotropes Le type de croissance est fonction de l espace disponibl
63. R gt fa so mem gt ao o mem gt EIRE EX CRISE lt 213 3256549 gt 1 619285 gt eo e mean oje esen Aeon e mem gt ja efem efes e mm oja emae Ao e mmn gt a e mes ESA T IlT Out o PIII Tg TT Tg o y E E E AER ajos mor Je o aj Vos Le taux de recouvrement Interpr tation de la vitalit de l herbier en fonction des pourcentages moyens de recouvrement d apr s Charbomel ef al 2000 Pourcentage de recouvrement valeurs CODE seuils ane eme re Inf rieur a 40 Inf rieur 2 Faible recouvrement 40 80 20 L 50 Recouvrement moyen Sup rieur 80 Sup rieur 850 Fort recouvrement Le pourcentage de rhizomes plagiotropes Interpr tation de la vitalit de l herbier tendance la progression en fonction des pourcentages moyens mesur s le long des limites deier d apr s Charbonnel ef a 2000 Pourcentage de rhizomes plagiotropes Valeurs seuls Inf rieur 30 a avec peu ou pas de progression L g re tendance a la progression Sup rieur a 70 Nette tendance la progression 30 a 70 96 Annexe 6 Liste des points du RSP PACA Antibes Ll Zone sensible rejets urbains contexte g n ral de turbidit fleuve Var courant liguro proven al Cassis LS Zone interm diaire lessivage du bassin versant et proximit missaire hydrodynamisme lev rosion et d placements s dimentaires Cas
64. S Limite sup rieure 0 40 m hdke DCE parpolt Le H o 5 10 SR KR d HEHEH EE teg Cap Core Machaggi dh Cap Core co LE Cap Core Sago dh T i F ba tte Toca Li ba W re Ia L h Bas taB kgia Sad LE Fale TE itak am Lei loro Ln bie re itak Bros dh b ie retak lime Br LS Ple re ta ok zara Ls L gende L i HD ELE gt Wkbkr t r dAn Hber ku ade Hermer akri Hrbler en b La Hemer en t r bol C parement Source Te me r Aec CE Par EME IGN F alke parD ERS F0 SE plat em er 2005 al ANNEXE 3 LISTE DES PARAMETRES MESURES SUR LA BIOMETRIE FOLIAIRE A Feuille Adulte selon GIRAUD 1977 donc munie d une base et d un limbe I Feuille Interm diaires selon GIRAUD 1977 donc d pourvue de base et dont la taille du limbe est sup rieure 5 cm J Feuille Juv niles selon GIRAUD 1977 donc d pourvue de base et dont la taille du limbe est inf rieure ou gale 5 cm LT Longueur totale de la feuille en mm B Longueur de la base de la feuille adulte en mm IF Largeur totale de la feuille en mm appr ci e 0 5 mm pr s Coef A Pourcentage de feuille ayant perdu leur apex GIRAUD 1977 LAI Surface foliaire LAI par faisceaux Surface foliaire densit LAI par m tre carr Attention le terme LAI r f re uniquement a la deuxi me valeur Normalement le LAI par faisceau est la surface foliaire ou SF mais cela n est souvent pas indiqu dans les
65. TATION DE L ORGANISME D ACCUEIL 1 1 L IFREMER 1 1 1 Pr sentation L Ifremer est un tablissement public caract re industriel et commercial EPIC ll a t cr par un d cret du 5 juin 1984 par la fusion de l ISTPM Institut Scientifique et Technique des P ches Maritimes et du CNEXO Centre National pour l Exploitation des Oc ans Etablissement public caract re industriel et commercial l Ifremer est plac sous la tutelle conjointe des minist res charg s de la Recherche de l Agriculture et de la P che de l Equipement des Transports et du Logement et de l Environnement Les missions de l Ifremer sont de M conna tre valuer mettre en valeur rationaliser l exploitation des ressources de l oc an M am liorer la connaissance les m thodes de protection et de restauration de l environnement marin cr er et g rer des quipements d int r t g n ral M favoriser le d veloppement socio conomique du monde maritime apporter son concours l tat aux professions maritimes aux autres organismes scientifiques techniques et conomiques L institut compte environ 1 380 salari s Ifremer et 320 salari s de l armateur Genavir Il dispose de 78 laboratoires ou services de recherche r partis dans 24 stations ou centres sur le littoral m tropolitain et dans les DOM TOM DE 7 A ei 8 e l Port en Bessin Y Paris ssy les Moulineaux Argenton MH M sub aio Bres Concarneau _Lorient La Trinite Y
66. Unit Mixte de Recherche de Montpellier associant l Ifremer le CNRS et l Universit Montpellier 2 la DRIIVI D fense et R sistances des Invert br s Marins en Corse la station de Bastia pour l environnement littoral Le Centre avec ses stations rattach es regroupe environ 180 agents Ifremer ing nieurs chercheurs techniciens et administratifs appartenant la Direction des Navires Oc anographiques et de l intervention Sous marine DNIS la Direction des Technologies Marines et des Syst mes d Informations TMS la Direction de l Environnement Littoral DEL et la Direction des Ressources Vivantes DRV En outre sur le site de La Seyne le GIE GENAVIR filiale de l Ifremer est charg de la gestion des moyens navals et regroupe 50 agents appartenant au D partement des Engins Sous Marins DESM 1 2 1 Le centre Ifremer de Toulon La Seyne C est en 1971 qu a t d cid e la cr ation sur la fa ade m diterran enne fran aise d un Centre vou principalement aux recherches en mati re de technologie d intervention grande profondeur Implant dans l aire toulonnaise sur le territoire de la commune de La Seyne sur Mer il a t construit sur des terrains gagn s sur la mer dans la zone industrialo portuaire de Br gaillon Ce lieu d implantation a t retenu pour des raisons d ordres g ographique et historique g ographique car l troitesse du plateau continental au large du d partement du Var perme
67. able POINT fait partie de la liste des tables interm diaires car les informations g ographiques Coordonn es Latitude et Longitude qu elle contient nous permet de la positionner dans la liste des tables de donn es g ographiques La table PR LEVEMENT Pour Quadrige le pr l vement est la partie repr sentative du milieu en un endroit donn partie isol e pour permettre son chantillonnage De fa on g n rale le pr l vement r sulte de la mise en uvre fructueuse d un et d un seul engin de pr l vement Pour le RSP les pr l vements correspondent l utilisation d un engin de pr l vement pour une station lls correspondent donc une partie repr sentative du milieu en un endroit donn e Un pr l vement va tre r alis partir d un engin et d un seul Le type de pr l vement est choisi partir de la table PRELEVEMENT LIST qui contient la liste des pr l vements possible S Disponible en Intranet l adresse suivante http w3 ifremer fr sextant v2 jsp recherche jsp as Par exemple la mesure de densit l aide d un quadrat effectu au point X la date T constitue un pr levement Un engin est toujours reli a un pr levement et un pr levement ne correspond qu a un seul engin Par station peuvent tre effectu s plusieurs pr levements 1 pr l vement sur la couverture de l herbier dans 1 quadrat de 0 3 m e 1 pr l vement sur les rhizomes l aide d un r glet gradu tous
68. aire qui servira de champ p re et la cl externe correspondante de la table SITE qui servira de champ fils Cette organisation permet l utilisateur de ne s lectionner que les points du r seau appartenant a la r gion Relation 2 me sous formulaire 3 sous formulaire points station Champ p re CODE POINT cl primaire de la table Champ fils CODE POINT cl externe de la table DATA STRATEGY reli e la table POINT Pour effectuer la relation entre la table POINT du 2 me sous formulaire et la table STATION du 3 il faut ins rer la table DATA STRATEGY et le champ CODE _ POINT qu elle contient Le 3 sous formulaire stations est bas sur la table STATION Il est reli au sous formulaire Points par la table DATA STRATEGY C est donc sa cl primaire qui servira de champ p re et la cl externe correspondante de la table DATA STRATEGY qui servira de champ fils Relation 3 sous formulaire 4 sous formulaire stations pr l vement pour la deuxi me s rie de formulaire Champ p re ID STATION cl primaire de la table STATION Champ fils ID STATION cl externe dans la table PRELEVEMENT Pour effectuer la relation entre la table STATION du 3 me sous formulaire et la table PRELEVEMENT du 4 me sous formulaire il faut se servir du champ ID PRELEVEMENT qu elle contient C est donc sa cl primaire qui servira de champ p re et la cl externe correspondante d
69. base de SIRS repr sentent la r f rence de la base de donn es du fait de leur fiabilit et p rennit Cet ensemble contient M les donn es constitutives du r f rentiel g ographique a terre mer M des donn es du r f rentiel th matique descriptives de l espace c tier dans ses composantes naturelles caract ristiques biophysiques et anthropiques caract ristiques socio conomiques Principe 3 les autres donn es en cr ation sont destin es devenir des donn es sources d s lors qu elles auront subi les proc dures de qualification requises Un dossier L gende compl te ce niveau Il contient l ensemble des l gendes rattach es aux projets avl Niveau 2 Classification de la donn e en fonction de sa projection g ographique Les producteurs de donn es de r f rence utilisant diff rents syst me de projection la base de donn es SIRS est organis e de la mani re suivante dd syst me de coordonn es en longitude et latitude en degr s d cimaux destin tre projet par les fonctionnalit s d ArcView en particulier dans un des syst mes suivants Lambert2e projection en lambert 2 tendu utilis e comme r f rence afin d tre compatible avec les donn es g ographiques utilis es globalement l Ifremer Lambert projection en lambert 4 utilis e pour la Corse Europe50 ou WGS84 projection utilis e pour les cartes marines SHOM Syst me de coordonn
70. cha ne de saisie des r sultats Elle permet d tablir la liaison entre les donn es spatiales et les donn es temporelles Elle permet aussi de lister les points suivis par chaque programme par l interm diaire des requ tes 3 Les donn es relev es sur le terrain sont li es la source de donn es programme qui comprend un point d tude strat gie spatiale Chaque point est suivi une ou plusieurs dates Strat gie temporelle 5 3 3 4 2 La table STATION Pour chaque point suivi dans le cadre d un programme donn une strat gie temporelle est tablie Cette strat gie est stock e dans la table STATION une station un programme un point une date 1 DATA STRATEGY 1 date La table station correspond donc l association d un point et d une date 5 3 3 5 Les donn es sp cifiques Pour chaque point et date station des pr l vements sont effectu s selon certaines m thodes mat riels et m thodes et aboutissent une s rie de r sultat Mat riel et m thode 5 3 3 5 1 Mat riels et M thodes Apr s avoir list les points et entr les dates de plong es sur chacun de ces points il faut indiquer quels pr l vements ont t effectu s Les pr l vements stock s dans la table PRELEVEMENT sont reli s une station un point une date Le nom du pr l vement est choisi dans une liste situ e dans la table PRELEVEMENT LIST Rhizomes Couverture de l herbier Faisceaux S
71. correspondait une manip sp cifique Coefficient A global Pourcentage de feuilles adultes et interm diaires ayant perdues leur apex Nb moyen feuilles fx Nombre moyen de feuilles par faisceau el Coefficient A fx Pourcentage de feuilles adultes ayant perdu leur apex par faisceaux Long moyenne mm Longueur moyenne des feuilles adultes Long base mm Longueur moyenne de la base des feuilles adultes larg moyenne Largeur moyenne des feuilles adultes L A I fais cm Surface foliaire par faisceaux LAI m m Leaf Area Index par m tre carr LAI photo fais cm Surface foliaire photosynth tique par faisceaux ignorer LAI photo m m Leaf Area Index photosynth tique par m tre carr ignorer Long moyenne F1 mm Longueur moyenne de la feuille adulte de rang 1 ignorer L base F1 Longueur de la base feuille adulte de rang 1 ignorer Larg Moy F1 Largueur moyenne de la feuille adulte de rang 1 ignorer Long moyenne Fle Longueur moyenne de la feuille adulte de rang 1 enti re ignorer Long Base Fle Longueur de la base de la feuille adulte de rang 1 enti re ignorer Surf moy f cm F1 Surface moyenne par feuille adulte de rang 1 ignorer Surf photo moy f cm F1 Surface photosynth tique moyenne par feuille adulte de rang 1 ignorer Commentaires Les mesures de densit de d chaussement et de recouvrement sont mesur es sur chaqu une des bal
72. dans la base n cessitent de d finir des droits d administrations sur la base pour qu elle puisse garder son int grit et pour permettre la qualification et la validation des donn es ANNEXE 1 Synth se de l volution de la dynamique de l herbier de Posidonie sur les 33 sites du R seau de Surveillance Posidonies au cours des six retours successifs p riodes 1988 1990 1991 1993 1994 1996 et 1997 1999 2000 2002 2003 LS limite sup rieure Ll limite inf rieure Progression peu importante AA importante R gression N peu importante MY importante YY tres importante Stabilit gt donn es non interpr tables PREMIER SECOND TROISIEME QUATRIEME CINQUIEME SIXIEME MISE EN RETOUR RETOUR RETOUR RETOUR RETOUR RETOUR SITES PLACE 1988 1990 1991 1993 1994 1996 1997 1999 2000 2002 2003 BOUCHES DU RHONE 9 sites Cy TS s a s e ee Gm w s s ICI oa CI ICI aa D pe e gt Co e e e e VAR 16 sites Bra Ps a e e gt a 2 2 Br UD w 72 e a es se zem a AA Ces mer are Cem EE AA Borne D D ss DE Baie de Cavalaire LS 1987 2 Baie de Cavalaire LI 1988 EEEN ALPES MARITIMES 8 sites ms ES re AO Aube E rm ST E gt SS ra e ss egpende Points du r seau de surveillance E C partements E lWbsses d eau OCE E Cannes LS Goltde Juan Li b a Ei l gt
73. dopt e le 23 octobre 2000 Texte majeur qui engage les pays de l Union Europ enne dans un objectif de reconqu te de la qualit de l eau et des milieux aquatiques Son ambition les milieux aquatiques cours d eau plans d eau lacs eaux souterraines eaux littorales et interm diaires doivent tre en bon tat cologique d ici 2015 La r gion PACA travail l chelle des districts hydrographiques en l occurrence le district Rh ne et c tiers m diterran ens et le district Corse La DCE fixe comme principales ch ances dans chacun de ces districts hydrographiques l laboration d un tat des lieux d ici fin 2004 d un plan de gestion d ici 2009 qui fixera notamment les objectifs atteindre pour 2015 En France le plan de gestion consistera en une modification du SDAGE sch ma directeur d am nagement et de gestion des eaux d un programme de mesures d finir d ici 2009 Objectif Caract ristiques majeures Une obligation de bon tat cologique de Une gestion de l eau par districts un ou toutes les eaux en 2015 pour les tats plusieurs bassins hydrographiques membres de l Union Europ enne Des plans de gestion et des programmes de mesures de protection utilisation restauration Des programmes de contr le de surveillance op rationnel d enqu te Une valuation conomique x D Transparence vis vis du public Tableau 4 DCE Principales caract ristiques 3 1
74. e Lignes contenant les m mes champs Les classes d entit s sont des tables contenant des champs Shape Domaine D finit un jeu ou une plage de valeurs valides pour un Champ Classe de relations Associe les objets d une classe ou d une table d entit s ty aux objets d une autre classe ou table d entit s Les classes de relations peuvent diposer de champs utilisateurs Figure 29 Liste des donn es stock es dans une g odatabase Ce type d organisation va permettre de structurer les donn es du RSP et de stocker les informations dans ces jeux de clases d entit La suite de ce document d crit la structuration de la g odatabase et l exploitation de la base de donn es Access dans le SIG 6 2 LA GEODATABASE SUR LA SURVEILLANCE DES HERBIERS DE POSIDONIES 6 2 1 Architecture g n rale De retour de mission toutes les donn es acquises sur le terrain ont vocation tre int gr es dans le systeme d information La saisie des donn es se fait par l interface utilisateur d velopp dans Access et l exploitation cartographique par l interm diaire de la g odatabase compos de dossiers et de jeux de classes d entit sous Arcgis Vr Les donn es terrain tant tres nombreuses deux solutions auraient pu tre envisag es La premi re a donc consist cr er dans un premier temps la base avec un SGBD relationnel classique tel que Microsoft Access et d tablir une liaison avec un logiciel SIG en l occurrence ArcGIS 8 3
75. e de la lumi re et de l importance des apports s dimentaires permettant ainsi la plante de lutter contre l enfouissement Les rhizomes les racines et le s diment qui colmate les interstices constituent un ensemble extr mement compact que l on nomme matte Les fleurs sont hermaphrodites La floraison qui se produit g n ralement l automne Septembre Novembre n a pas lieu toutes les ann es et son intensit est variable suivant les saisons BOUDOURESQUE Charles Francois DIVIACCO Giovanni MEINESZ Alexandre PERGENT G rard PERGENT MARTINI Christine TUNISI Leonardo Avril 2004 Figure 4 Faisceaux et rhizomes de Posidonies 2 1 2 Ecologie L herbier de Posidonies joue un r le essentiel au niveau cologique par la production et l exportation de grandes quantit s de mati re v g tale la production d oxyg ne c est aussi le lieu de fray re de nurseries ou d habitat permanent pour des milliers d esp ces animales et v g tales p le de diversit PERGENT G rard PERGENT MARTINI Christine BOUDOURESQUE Charles Francois 1995 Par l importance de sa production primaire par la richesse de sa flore de sa faune de ses piphytes par son r le d terminant pour l ensemble des quilibres biologiques et s dimentologiques du littoral l herbier de Posidonies est actuellement consid r comme l cosyst me pivot de la M diterran e Vincent GRAVEZ Professeur Charles Fran ois BOUDOURESQUE et constituent la base
76. e la table PRELEVEMENT qui servira de champ fils Pour voir de quelle fa on sont reli s les sous formulaires entre eux il faut en s lectionner un affichez les propri t s et regardez dans l onglet Donn es le champ p re champ du 1 sous formulaire servant de liaison et le champ fils champ servant de liaison dans le 2 sous formulaire sont indiqu s Champs fils Objet source CODE REGION formulaire auquel CODE_REGION S est rattach le sous formulaire Champs pere Figure 20 Propri t s d un sous formulaire 5 3 3 Ordre de saisie dans la base Donn es terrain Figure 21 Sch ma d organisation de la base rl A l image de MARBEN 2 0 Cf 3 3 2 et pour bien comprendre la proc dure de saisie des donn es dans la base il a t d fini une architecture de saisie des donn es On divise les donn es en diff rents groupes les donn es terrains les donn es spatiales et les donn es sp cifiques Les donn es terrains correspondent aux diff rentes donn es obtenus lors des plong es sur le terrain un point donn e et dans le cadre d un programme RSP Corse RSP PACA ll existe plusieurs types de programme Les donn es spatiales correspondent a la liste des zones g ographiques et des points surveill s Les donn es sp cifiques la surveillance de l herbier correspondent aux donn es mat riels m thodes et r sultats La base est reli e au travers de diff rents module
77. e m ss SEH r XY5IG_PH N de la Projection Lambert Conformal Conic cp donn es_r sultats Fake Esti 600000 000000 donn es _r f rences Couche projection DT cu E octionn E andard_Parallel_2 47 s le conne Scale_Factor 1 000000 Latitude_Of_Origin 46 800000 Linear Unit Meter 1 000000 v S lection S lectionne un syst me de coordonn es pr d fini Importe un syst me de coordonn es et des domaines X Y Z et M depuis un jeu de donn es g ographiques existant 2 N Se MO me d donn es z Ch O 1X d an S ouveau e S AE SE onn es Mee re 2001 Horn Modifie les propri t s du syst me de r coordonn es s l lectiorm RE R l l ti n Type Classes d entit s de g odatabase personnelle Annuler a SEIECTIO EE Se Effacer Revient un syst me de coordonn es inconnu Classes d entit s de g odatabase pers cle de la istrer sous 7 Enregistre le syst me de coordonn es oler id ArcSDE Ch oisir proj e ction OK Annuler Appliquer Cl as S e D D r r D D D Figure 35 Appliquer une r f rence spatiale Figure 36 Enregistrement de la nouvelle L affichage et l exploitation des donn es se fait avec Arcmap Le bouton de contr le a situ dans le menu d Arccatalog permet d acc der directement a ArcMap Dans ArcMap il faut se connecter a la nouvelle couche et afficher les classes d entit s 6 2 3 La symbologie 6 2 3 1 D finition La symbologie a t cr e pour r pondre entre autre la demande de la DCE Cf 83 1 2 ma
78. e part il ny a pas non plus de r sultat de d nombrement sur les pr l vements Ex Comptage du phytoplancton dans le cadre du REPHY qui aboutit a des concentrations d esp ces Pour la table TAXON la notion d esp ces Taxons n est pas prise en compte terme d autres param tres comme le pr l vement de s diment ou la mesure sur les Epiphytes pourront int grer cette notion d chantillon ou de d nombrement La table RESULTAT BIOM n est pas dans la base de donn es Quadrige ces donn es auraient pu tre stock es dans la m me table en l occurrence la table RESULTAT Dans ce cas le param tre aurait t mesures sur les feuilles la m thode la biom trie foliaire et l unit mm etc L ajout de cette table a t n cessaire pour faciliter la saisie et l extraction des donn es sur la biom trie foliaire partir des fichiers Excel Ces donn es stock es dans des tableaux peuvent tre facilement int gr es la base par un simple copier coller L extraction se basant uniquement sur cette table est aussi plus simple et le r sultat de la requ te peut tre coller dans les tableaux Excel pour obtenir la surface foliaire Cette table ne r pond pas vraiment l architecture de Quadrige POSITION POINT REGION SITE BASSIN ZONES HOMOGENES MASSES D EAU DCE ENGIN STRATEGIE TYPE LIMITE STRATEGIE SPATIAL STRATEGIE TEMPORELLE DATE PERSONNE PROGRAMME POINT PRELEVEMENT RESULTAT RESULTAT BIO
79. environnantes m t o v nements saisonniers e Extraction des donn es par r gion et par programme Ce type d extraction permet d obtenir des r sultats pour programme ou source de donn es pour une r gion donn e Par Exemple pour le R seau de Surveillance Corse ou le R seau de Surveillance de la R gion PACA On a alors la possibilit d obtenir une information sur tous les pr l vements qui ont t effectu s sur l ann e par programme et par point Strat gie spatiale et temporelle e Extraction des donn es par niveau de pr l vement La DCE se base sur trois param tres et sur la limite des 15 m voir 3 1 2 Il est donc n cessaire de cr er une requ te permettant d extraire les donn es par niveau de pr l vement On obtient donc l ensemble des donn es sur les points une date donn e Si mesure_ph no_ SIG Requ te S lection DATA_STR STATION PARAMETRE ha 1 y al RESULTATS CODE_POINT 00 ID_STRATEGY ID_STATION ID_PARAMETI CODE_BASSIN CODE_POINT ID_STRATEGY TYPE_PARAM COMMENT ID_PERSONNE LIBELLE PAR ID_LIMITE COMMENT ID_PROGRAM DATE STATION COMMENT LAT_NORD_WGS84 LONG_EST_WGS84 PRELEVEMENT ID_PRELEVEMENT UNITE PRELEVEMENT_LIST _ Mo ouwen e d ID_STATION 2 ID_COLLEC_LIST ID_COLLEC_LIST pur TYPE_PRELEVEMENT PROFONDEUR ID_UNIT_TYP COMMENT COMMENT NOM_UNITE SYMBOLE _UN Y RE e EE TEE EE EH Champ CODE_COULEUR Table Op ration Afficher Crit res
80. est un ensemble homog ne d entit s Toutes les entit s d une m me classe ont la m me g om trie point polyligne polygone et les m mes attributs Ces attributs sont stock s dans la table de la classe d entit Une classe d entit peut tre stock e en dehors d un jeu de classe d entit s La notion de classe d entit est similaire a la notion de fichier de forme shapefile l http www esrifrance fr produit iso album wia ch03 geodatabase new version pdf Al GL33 Table Les tables stockent les objets repr sentant des entit s non spatiales Une table peut tre reli e ou jointe a des tables ou des classes d entit s de la m me g odatabase 6 1 2 4 Classes d annotations Les annotations dans une g odatabase sont stock es dans des classes d entit s sp ciales appel es classes d annotations Toutes les entit s d une classe d annotations poss dent une position g ographique et des attributs et peuvent se trouver l int rieur d un jeu de classes d entit s ou d une classe d annotations autonome Jeu de classes d entit s f Contient des classes d entit s reli es spatialement si des objets de topologie par des objets de r seau Les classes d entit s d un jeu de classes d entit s ont une r f rence spatiale Se Classe d entit s Table avec un champ Shape contenant des points des SR lignes ou des polygones pour les entit s g ographiques Chaque ligne est une entit Tabl
81. id biom trie lt pi gt NO lt O gt num faisceau N10 LTA N5 BA N5 IA N5 LTI N5 BI N5 Il N5 11 18 N5 UNITE_TYPE 7 BJ N5 A IJ N5 id unit type lt pi gt I lt O gt ra BL type_unit A50 e Gees i Zoe comment VASO Es ose ee Be pk biom trie lt pi gt S Y J A n 4 e pe Ee E ai D D resultbio_unit type d unit 7 ES N G d resultbio m thode p y resultbio param tres 8 Y J y 1 1 d Eh d UNITE METRODE PARAMETRE id unit lt pi gt N3 lt O gt E Su SCH SE id parametre lt pi gt N4 lt O gt nom unit VA7O e Aen belle param tre VA100 symbole unit VA20 Sp cp engin N2 type_param tre A50 pk_unite lt pi gt descrip_method A100 comment Kee e o A50 pk_parametre lt pi gt On comment VA50 pk_methode lt pi gt On 0 n UME bes d m thode utilis e N a param tre mesur ei 11 RESULTATS 2 Ba va champs NG Ba comment VA50 pk resultats lt pi gt sa Strat gie Station Point Pr levements R sultats POINT 1 i PROGRAMME id_point lt pi gt SI lt O gt nom_point VA50 ID program lt pi gt lat Nord _WGS84 N15 Program_name Jong E WGS84 N15 Descrip_program Lat Nord 12e N10 3 pk program lt pi gt Lat Est 12e N10 3 bathym trie N5 1 caract A255 1 1 der obs N5 typ_lim A3 dat ms place
82. ie temporelle la date de pr l vement La table DATA STRATEGY permet alors de relier la table POINT et la table STATION d finissant la strat gie employ e dans le cadre d un programme Plusieurs points peuvent correspondre plusieurs dates et plusieurs dates peuvent correspondre plusieurs points La table DATA STRATEGY est indispensable l organisation de la base puisqu un mod le relationnel autorisent les relations plusieurs plusieurs mais il est n cessaire de cr er une table interm diaire pour pouvoir appliquer ce type de relation 5 1 2 1 5 Les tables r sultats Ce sont les tables RESULTAT et RESULTAT BIOM Ces tables contiennent l ensemble des donn es relatives aux op rations effectu es sur chaque site La table RESULTAT contient l ensemble des donn es concernant les param tres tel que la densit la surface foliaire le d chaussement etc La table RESULTAT BIOM contient des donn es concernant la biom trie des feuilles Tableau r capitulatif des diff rentes tables de la base de donn es HOMOGENES Cadre sur l Eau H r SITE Table des sites tablis dans Quadrige BASSIN DONNEES SPATIALES Table des bassins Quadrige plus petites entit s g ographiques que les sites de l chelle d une plage ou d une pointe rocheuse POINT Table des points du R seau de Surveillance Posidonies RSP couples de coordonn es g ographiques POSITION Liste des moyens de positionnement des points GPS
83. ipal formulaire principal formulaire qui contient un ou plusieurs sous formulaires et le formulaire qu il contient sous formulaire Une combinaison formulaire sous formulaire correspond une liaison formulaire hi rarchique ou formulaire p re fils ES Choix de pr l vement Quadrat 0 2 m Plaine Orientale Campoloro Plaine Orientale Fiurn orbu Plaine Orientale Solenzara Cap Corse Macinaggio Cap Corse Sagro Bastia Toga Formulaire Sous formulairel R gion E C ___ Sous formulaire2 Nom de point Sous formulaire3 Date de la station C Sous formulaire4 Pr l vement Figure 16 Le principe des formulaires et sous formulaires dans Access ss On retrouve deux types de formulaire dans la base de donn es Les formulaires p res qui contiennent des boutons de contr les et toutes les informations concernant le formulaire les protocoles suivre pour la saisie des donn es etc Les formulaires et les sous formulaires permettent pour la plupart la saisie des donn es Ces formulaires sont pr sent s en mode feuilles de donn es Plusieurs boutons ont t cr er pour faciliter l acc s aux diff rents menus ou formulaires de saisies Ils sont en g n ral li s une macro Pour la saisie des donn es nous avons cr e une combinaison de formulaires et de sous formulaires li s les uns aux autres par les clefs primaires et les clefs secondaires des tables L inconv nient est OU Access n accepte au
84. is aussi pour permettre une valuation de la qualit des herbiers dans le cadre d autres programme Ceci permet de stocker un r f rentiel de symbologies et faciliter la proc dure de cr ation de symbologie dans la cr ation de nouveaux projets Elle est bas e sur les grilles de qualit de l herbier de posidonies labor es par les scientifiques voir annexe Chaque symbole correspond une plage de r sultat Cr ation d une symbologie La symbologie permet d affecter des graduations de couleur et des graduations sur la g om trie des objets de type ponctuels lin aires et surfaciques Dans la base Posidonie la symbologie est stock e dans le dossier L gende sous la forme de fichier de couche lyr L utilisation de ces fichiers peuvent tre tr s fr quente Cette organisation en dossiers permet d avoir un acc s simple et rapide aux fichiers lyr lorsque l utilisateur est connect a la g odatabase notamment pour les proc dures r p titives 6 2 3 2 Type symbologie utilis e dans la base RSP Les param tres retenus et associ s une symbologie sont La densit Le pourcentage de rhizomes plagiotropes La surface foliaire Le taux de recouvrement Le d chaussement Indice DCE La symbologie doit pouvoir fournir une information sur la qualit des herbiers en se servant des valeurs extraites de la base de donn es et repr senter les donn es partir d une graduation hi rarchique des symboles En r gle g n
85. ises de la limite On calcul ensuite la moyenne pour chaqu une de ces valeurs Eole 2004 R seau de Surveillance de la Posidonie Cette liste des param tres sur la biom trie foliaire t cr er partir de recherches bibliographiques et corrig s par le responsable scientifique du RSP Corse Prof G rard Pergent Universit de Corse amp GIS Posidonie et Christine Pergent Martini Universit de Corse amp GIS Posidonie Exemple de tableau Excel pour le stockage des donn es sur la biom trie foliaire Densit herbier Nombre faisceaux Longueur coupure XSito i S y Si ml fremer SE SAINT ETIENNE Annexe 4 Le modele physique de donn es REGION POSITION NIVEAU PRELEV_LIST ID_COLLECT _LIST ID_POSITION POSITION COMMENT CODE_REGION L_REGION C_PAYS_REGIO N ID_NIVEAU NOM_LIMIT METHODE 1n JID_METHODE NOM_METHODE 1 1 I 1 n NOM_ENGIN_UTILISE DESCRIPTION METHOD COMMENT CODE REGION LIBELLE SITE PRELEVEMENT RESULTAT DESCRIPTION STATION ID_PRELEVEMENT ID_RESULT COMMENT ID_STATION ID_PARAMETRE ID_STATION ID_ENGIN 1 1 ID_UNITE 1 1 D COLLECT_LIST n PD_PRELEVEMENT PARAMETERS PROFONDEUR IT Ip METHODE COMMENT VAL_CHAMPS COMMENT 1 1 1 1 1 RESULTAT_BIO ID_BIOMETRIE ID_UNITE In 10 STATION ID PRELEVEMENT ID PARAMETRE ID METHODE NUM_FAISCEAU 1 1 LT B CASSE COMMENT CODE_POINT CODE BASSIN CODE ZONE In CODE BASSIN CODE SITE LIBELLE DESCRIPT
86. iterran e consiste principalement f d rer les travaux concernant l tude des bioc noses littorales sur l ensemble de la fa ade m diterran enne r gions Corse PACA et Languedoc Roussillon Le r seau benthique M diterran e dont l A P S Avant Projet Sommaire est en cours de r daction se positionne comme aa un r seau th matique rassemblant l ensemble de la communaut scientifique concern e une plate forme de communication en vue de mutualiser l information existante un cadre de normalisation pour la cartographie des bioc noses benthiques et incluant notamment la bancarisation des donn es un outil permettant de d terminer des tats de r f rence et de f d rer un syst me de suivi des volutions La base de donn es posidonies doit alors se positionner comme un outil de stockage d exploitation et de valorisation des donn es pouvant r pondre la d marche du projet REBENT 4 METHODOLOGIE APPLIQUE AU PROJET CONDUITE DE PROJET 4 1 PROJET ET METHODE DE CONDUITE DE PROJET Avant toute mod lisation il a fallu d finir une m thode de travail et appliquer une m thode de conduite de projet Le but est d tablir et de suivre une d marche planifi pour mener terme le projet un projet petit ou grand n cessite de la m thode pour sa mise en uvre a Un projet est un ensemble d actions entreprendre afin de r pondre un besoin d fini dans des d lais fix s action tempo
87. k est bas sur la pond ration des valeurs calcul es pour l ensemble des trois param tres et recalcul en pourcentage Chaque param tre est pond r selon un pourcentage qui sera d finir Par d faut Densit 0 50 Le recouvrement 0 25 Surface foliaire 0 25 Cette pond ration va d pendre de l importance du param tre et sera d fini par les scientifiques dans le cadre de la DCE Le calcul est obtenu gr ce au g n rateur d expression Access La formule g n ral est donc INDICE DCE Requ te recouvrement Groupe 5 Surfacefoliaire Groupe 2 Requ te densit Groupe 8 15 100 5 La taille de l engin et l unit ne sont pas pris en compte puisque le calcul est effectu e sur l indice qui prend d j en compte ces champs Va Si indice Requ te S lection Ea lx Gs z D Jastia Toga LI 2004 1104021 1771990 D Premi re requ te sur les Bastia Arinella LI 2004 1184362 61 333333333 donn es brutes E Bastia Biguglia Sud Ls 2004 1190276 175034 32 O Cap Corse Macinaggio LI 004 1164005 1 Ed E Cap Corse Sagro Ll 2004 1105954 LO 0 PPEDGPEDGD E Cap Corse sisco Lo 2004 1 42 B6bbbbhb7 F Plaine Orientale Bravone LE 2004 1 Ed O Plaine Orientale Campoloro LS 1194634 1731924 S E Plaine Orientale Fiurn orbu LS 1191130 1692764 25 333333333 H Plaine Orientale Solenzara LS 2004 1100495 1677248 Enr Ma y LA sur 10 Champs ca
88. lante a fleur Elle constitue de grandes prairies appel es herbiers jusqu environ 40 m tres de profondeur sur une superficie totale de 37 000 km L herbier Posidonia Oceanica constitue la base de la richesse des eaux littorales en M diterran e par les surfaces qu il occupe le r le essentiel qu il joue au niveau cologique par son action au niveau des quilibres littoraux mais surtout parce qu il constitue un puissant int grateur de la qualit globale des eaux marines L int r t cologique de cet herbier et le suivi effectu depuis de nombreuses ann es par les scientifiques ont incit les administrations concern es par la gestion du littoral les lus de la r gion PACA et les scientifiques cr er le R seau de Surveillance Posidonie RSP et pour utiliser l herbier comme un bioindicateur de la qualit du milieu marin Ce r seau a d but en 1984 Ce sont 33 sites qui sont ainsi surveill s depuis plus de 20 ans Neuf sites sur les Bouches du Rh ne 16 sites dans le Var 8 sites dans les Alpes maritimes Depuis 2002 la Corse participe ce r seau avec 10 sites de surveillance et devrait comporter terme 30 sites r partit sur tout le littoral Corse Depuis 1984 six programmes ont t amen s terme et au total six retours se sont d roul s sur l ensemble des points de surveillance en r gion PACA L ensemble des donn es r cup r es ont t stock s sous diff rents formats et ont fait partie de nombreux
89. lcul partir de l indice sur chaque param tre Figure 25 Les requ tes avec champs calcul s Requ te_recouvrement Requ te_rhizom_plagio E ARA gt Groupe NOM_POINT EE oo oo e Groupe Groupe Table Requ te recouvrer Requ te recouvrer Requ te recouvrer Requ te recouvrer Requ te recouvrer Requ te rhizom pl Requ te densit Op ration Regroupement Regroupement Regroupement Regroupement Regroupement Regroupement Regroupement Regroupement m ooo o IIIu Afficher AE Crit res Ou INDICE_DCE Requ te_recouwrement Groupe 5 Requ te_rhizom_plag SE io Groupe 2 Requ te_densit Groupe 8 15 Effacer lal gt lt lt Et Ou Pas Comme Coller Aide Tables DEI Requ tes EI Formulaires Etats Fonctions Constantes Op rateurs Expressions communes Figure 27 G n rateur d expression S A I S I GRILLES DE QUALITES E Recouvrement Densit de Rhizomes plagiotropes etc Surface foliaire E X T R A C T I O N kl Donn es brutes STOCKAGE Base de donn es Access Interpr tation de la vitalit de l herbier en fonction des pourcentages moyens de recoumenent d apr s Charbonnel a a 2000 Pourcentage de recouvrement valeurs CODE sails COULEUR In rnew 20 Faible recowrerrert 3 DWD Recouvrement moyen 2 Sup rieur a Fort recourre
90. le standardis LEFEVRE et al 1984 SINNASSAMY et al 1991 altitude objectif heure angle r solution contraste etc A partir de ces clich s un traitement par orthophotoplan permet le redressement des photographies pour corriger les d formations dues aux erreurs de parallaxe Ce traitement permet la superposition des photographies sur le fond de carte ainsi que la comparaison des jeux de photographies successives L objectif n est pas de cartographier in extenso la zone photographi e mais de rep rer de fa on tr s pr cise certaines structures remarquables susceptibles d voluer Des v rit s terrain permettent ensuite de s lectionner et de pr ciser les limites de ces structures remarquables herbier Posidonia oceanica matte morte de P oceanica tombants de mattes intermattes sable roche etc ref GIS POSIDONIE Service Maritime 13 Direction D partementale de l Equipement 83 Conseil G n ral 06 2003 Des mesures sur la contamination chimique analyse des m taux Elles portent sur les tissus foliaires limbe feuille adultes feuille interm diaire Ces mesures n ont pas t encore bien d finires et il n existe pas encore de protocole standardis dans le cadre du RSP as 3 LES ENJEUX 3 1 LA DIRECTIVE CADRE SUR L EAU 3 1 1 Les enjeux de la DCE La directive 2000 60 tablissant un cadre pour une politique communautaire dans le domaine de l eau dite directive cadre sur l eau DCE a t a
91. leaux de donn es etc c est dire l information descriptive ou compl mentaire des pr c dentes Un r pertoires Projet compl te cette architecture il contient les diff rents projets ArcView labor s pour les besoins du laboratoire 1 2 7 2 Gestion de la base de donn es SIRS La base de donn es SIRS s organise selon trois niveaux hi rarchis s la donn e est d abord class e selon un niveau de qualit niveau 1 ces donn es g ographiques sont ensuite class es selon leur type projection niveau 2 enfin elles sont class es selon leur type de format informatique niveau 3 Niveau 1 Classification qualitative de la donn e La gestion de la base de donn es de SI TL s appuie sur quelques principes de base qui relevent de la qualit des donn es et de leur classification lls permettent de pr ciser le statut des donn es comme suit Principe 1 les donn es sont r pertori es selon un niveau de qualit qui les classes en donn es dites sources et en donn es dites de cr ation les donn es sources sont des donn es consid r es de r f rence fournies en g n ral par des producteurs nationaux Ces donn es qualifi es sont ainsi directement exploitables dans le SIG les donn es de cr ation sont des donn es qui sont en cours de normalisation par application d une proc dure de qualification et sont stock es dans un fichier nomm TEMP Principe 2 les donn es sources qui constituent la
92. les 5 mm 1 pr l vement de 10 ou 20 faisceaux par point l aide de la main ou un autre outil Le total est donc de X pr l vements par station dans sa globalit La table STATION Pour Quadrige c est l ensemble d op rations r alis es pour un programme sur un point de pr l vement a un moment donn e Date Heure La dur e de la station peut tre variable pendant un temps donn e il peut y avoir une ou plusieurs stations r alis es selon la pr cision espace temps recherch e par le programme Pour le RSP une station correspond un ensemble d op ration effectu sur un point dans le cadre d un programme une date donn e la date de pr l vement La strat gie retenue dans le cadre du RSP est un suivi bas sur un programme tabli tous les trois ans ou plong e durant lesquels sont effectu s des pr l vements scientifiques L intervalle de temps entre deux retours scientifiques est de 3 ans Ces retours correspondent une valuation g n rale du site notamment au niveau du balisage Les plong es de nettoyage des balises ne sont pas prises en compte dans la base de donn es ces plong es sont r alis es sur le site chaque ann e pour faire un tat des lieux et un nettoyage du site aucune valeur scientifique n est mesur e 5 1 2 1 5 Les tables de liste de donn es Ce sont les tables PARAMETRE METHODE ENGIN UNITE TYPE UNITE PRELEVEMENT LIST NIVEAU et PERSONNE La table PARAMETRE C est la
93. liste des param tres mesur s lors d un pr l vement La table METHODE C est la liste des m thodes utilis es pour obtenir un r sultat La table ENGIN C est la liste des outils de pr l vement Cette table permet donc de d finir le lieu de pr l vement sur le point La table UNITE C est la liste des unit s pour chaque valeurs r sultats pr sent dans la base La table PRELEVEMENT LIST rassemble l ensemble des types de pr l vement pouvant tre effectuer La table NIVEAU est la liste des niveaux de pr l vements La table PERSON stocke les personnes responsables du programme ou des donn es saisies dans la base Elles contiennent les informations utiles la saisie des donn es et sont souvent repr sent es dans l interface utilisateur Access par des champs sous forme de liste de donn es NOM_ENGIN Mam A Pas dengin Guadrat 0 2 m Quadrat 0 3 m Gluadrat 0 4 mf Carottier Tamis D E Protondim tre lectronique Figure 15 Liste modifiable Il est possible de consulter ces tables en passant par le menu liste de donn es de la base Access qui pr sente de mani re conviviale les listes sous forme de formulaires ll est possible de supprimer ou de modifier une valeur mais terme lorsque les droits d administrations seront d finis et les listes de donn es valid es seul les administrateurs auront les droits de modification sur ces tables Si un enregistrement d une table de r f rence est su
94. maliser l ensemble des donn es al Une proposition de classes d tats est indiqu ci dessous P Boissery septembre 2004 Proposition de classes d tat Herbier en tres bon tat Herbier en bon tat Herbier atteint Herbier d grad Herbier tr s d grade Figure 11 Classes d tats pour la DCE 3 2 QUADRIGE ET QUADRIGE 3 2 1 Pr sentation de Quadrige Quadrige est la base de donn e nationale sur les r seaux de surveillance de la qualit des eaux du littoral Quadrige constitue un l ment du syst me d information sur l eau SIE et ce titre contribue aux travaux du Secr tariat d Administration National des Donn es Relatives l Eau SANDRE Cette base est nationale et comprend notamment les r seaux nationaux mise en uvre par l Ifremer REMI R seau de surveillance microbiologique et bact riologique du milieu marin REPHY R seau de surveillance du phytoplancton et des phycotoxines RNO R seau national d observation de la qualit du milieu IGA Impact des grands am nagements Suivi cologique de l impact thermique des centres de productions nucl aires d lectricit s install es sur le littoral Les premi res donn es datent de 1974 pour la qualit g n rale et les contaminants 1987 pour le phytoplancton et les phyco toxines 1987 pour la microbiologie Les laboratoires c tiers saisissent leurs donn es et suite une validation sur leur qualit en autorisent l acc s
95. nica et pourcentage d utilisation r ponses de 25 institutions de recherche crit res mesur s et m thodes d acquisition 1 Lefevre et a 1984 2 Pasqualini et al 1997 3 Mc Kenzie et al 2003 4 Pasqualini et al 2005 5 Balduzzi et al 1981 6 Cinelli et al 1984 7 Morri 1991 8 Buia et al 2003 9 Giraud 1977 10 Giralld 1979 11 Drew amp Jupp 1976 12 Romero et al 2005 13 Blanc 1956 14 Clairefond et Jettdy De Grissac 1979 15 Willsie 1987 16 Pergent et al 1995 17 Pergent 1990 18 Duarte 1991 19 Cebrian et al 1994 20 Mateo et al 1997 21 Pergent et al 1989 22 Panayotidis et al 1981 23 Romero 1986 24 Duarte amp Kirkman 2003 25 PergentMartini et al 1999 26 Ramos Martos amp Ramos Espla 1989 27 Pasqualini et a1 2000 28 BlancVemet 1984 29 Russo amp Vinci 1991 30 Harmelin Vivien amp Francour 1992 31 Hamoutene et al 1995 32 Ferrat et a1 2002 33 Mateo amp Sabat 1993 34 Gobert et al 1995 Trois param tres ont t s lectionn s en ce sens lors de la r union d Ispra WFD MED GIG F vrier 2005 La densit Le recouvrement La surface foliaire par faisceau qui int gre l ensemble des variables ph nologiques La DCE introduit un nouveau niveau de mesure On parle de limite des 15 m Ce niveau de profondeur est un niveau de r f rence utilis dans le cadre d autres r seaux et permet ainsi de nor
96. nn es sont t l chargeables gratuitement et renseignent sur les 33 sites du r seau de surveillance PACA partir de fichier shape et de document pdf EOL Etude et Observatoire du Littoral E O L se situe en amont des Bureaux d Etudes dans une position d assistance aux communes C est un observatoire pluridisciplinaire de la frange littorale active entre l arri re dune et la limite de la zone de mobilit des s diments OEC Office de l environnement Corse EPIC Cr en 1992 l OEC est au service de la Collectivit Territoriale de Corse pour la mise en valeur la gestion l animation et la promotion du patrimoine de la Corse protection et gestion des espaces et des quilibres naturels des esp ces v g tales et animales des milieux aquatiques et marins 2 2 2 La liste des points du RSP Le choix des sites respecte d une part la couverture g ographique homog ne entre les diff rents points de surveillance et d autre part l quit de la distribution entre les zones sensibles les zones interm diaires et les zones de r f rences Les zones sensibles correspondent des rejets en mer rejet la c te missaire court missaires moyenne profondeur des d bouch de rivi res ou de vallons des zones forte occupation du lin aire de c te des zones hydrodynamisme modifi restructuration du rivage d p ts de dragage d charges la mer Les zones de r f rences sont les zones dites d herbier s
97. ns lequel peuvent tre stock les photos de chaque point et accessible dans Arcmap par la cr ation d hyperliens Les hyperliens permettent comme leur nom l indique d acc der des documents ou des pages hypertextes en cliquant sur les entit s l aide de l outil hyperlien de la barre d outils standard d ArcGIS Il existe deux mani res diff rentes de d finir un hyperlien pour les entit s d une couche ArcGIS 8 3 documents saisie des avantages inconv nients li s par entit donn es li es Hyperliens un seul par Saisie manuelle liens Saisie manuelle d finis champ des semiautomatiques l aide de enregistrements et champs par champs configurables selon un champ de la table attributaire Hyperliens un plusieurs manuelle par simplicit d utilisation saisie manuelle dynamiques entit s liaison rapide d une n cessite de entit plusieurs sp cifier le documents li s champ stockant l information escompt e Les hyperliens stock s dans un champs sont cr er uniquement a partir d Arcgis lls peuvent donc tre associ a une classe d entit r sultats et tablir le lien avec une carte au format image bmp jpeg Les hyperliens dynamiques peuvent tre cr e dans Access au niveau de chaque enregistrement ou directement dans Arcgis dans le champs d di lhyperlien Le dossier L gende l image de la base de donn es de l Ifremer il contient les l gendes stock es sous forme de lyr 6 2 2 1 Le dossier G
98. nt l ensemble des droits sur cette base de donn es afin de garantir l homog n it des donn es leur pertinence et leur qualification Ces droits sont d finis dans Access Arcgis respectera aussi ces droits d administration cf 5 EC formulaires de saisie donn es g or f rencees 3GBD GEODATABASE relationnel personnelle T a 6 Ma Microsoft Office CA re a ACCESS su IS t e format d tat requ tes ef analyses spatlales Figure 30 Organisation et exploitation des donn es envisag es L inconv nient principal est qu une g odatabase personnelle ne peut supporter qu un maximum de 2 GO A terme la solution sera donc de cr er plusieurs g odatabases personnelles rassembl es dans un seul dossier et accessible simultan men La suite de ce document d taille les diff rentes tapes n cessaires la repr sentation des donn es de terrain dans le SIG dans le cadre des programmes de suivi de l herbier de Posidonies Les solutions propos es tiennent compte de la structuration des donn es de la g odatabase et de la base de donn es de type relationnelle Vs 6 2 2 Structuration des donn es Pour cr er la g odatabase sous Arcgis 8 3 il est n cessaire de travailler avec Arccatalog ArcCatalog est une application orient e donn es pour la gestion la localisation et la navigation dans les donn es spatiales Avec ArcCatalog il est possible de cr er et d administrer les ba
99. o Zen ed 100 000 S50 DOC D S okamre DEBADO Figure 2 Comp tences g ographiques 1 2 3 Pr sentation du laboratoire L quipe est constitu e de 15 personnes il comprend e 8 cadres g n ralistes de l environnement c tier et pr sentent des cursus tr s divers qui par leurs compl mentarit s font la richesse du laboratoire et lui permettent d tre particuli rement bien arm pour aborder les tudes int gr es au service de la gestion de la zone c ti re e 5 techniciens leurs diverses comp tences permettent de couvrir les domaines d intervention de terrain de l instrumentation de l analytique et de l informatique e 2 administratifs ils assurent les t ches de secr tariat et de gestion L quipe peut b n ficier de l aide de CDD accueillis en renfort de l quipe en place justifi par des v nements exceptionnels ou en remplacement de personnel Dans le cadre de l exercice de ses diff rents m tiers le personnel du laboratoire b n ficie r guli rement de formations sp cialis es A l inverse il peut tre amen prodiguer des cours ou des conf rences ou participer des sessions de formation en tant que formateur Enfin il assure fr quemment des t ches d encadrement de doctorants ou de stagiaires Le laboratoire est dot de nombreux moyens mat riels adapt s aux exigences de r alisation de ses programmes d activit s ex embarcation scaphandrier Ill s inscrit dans des r seaux
100. on aux termes de la loi du 3 janvier 1986 qui nonce les principes relatifs l am nagement la protection et la mise en valeur du littoral Cette loi littoral peut permettre la pr servation d un herbier ou d une partie d herbier qui pr sente un int r t cologique ou s av re indispensable au maintient de l quilibre biologique Platini 2000 Ces mesures de protection d passent largement le contexte national puisque Posidonia oceanica est prot g e dans le cadre des conventions internationales puisqu elle figure dans les annexes de la Convention de Berne Platini 2000 dans la liste des esp ces en danger ou menac es du Protocole relatif aux Aires Sp cialement Prot g es et la Diversit Biologique en M diterran e de la Convention de 1 d 7 y S Branche de la toxicologie concern e par l tude des effets toxiques caus s par des polluants naturels ou de synth se sur les constituants des cosyst mes animaux incluant l homme v g taux et microbiens dans une approche int gr e A Ml Barcelone Anonyme 1998 ou dans l annexe 1 de la Directive de l Union Europ enne du 21 mai 1992 92 43 CEE sur la conservation des habitats naturels et de la faune et la flore sauvage d nomm e Directive Habitats Enfin les herbiers marins sont pris en compte par l Unesco depuis la conf rence de Rio en 1992 Pergent G Abiven T Hauden S Mimault B Pasqualini V Patrone J Pergent Martini C 2004
101. ononononnnnnnnnnnananrn nono nnnnnss 58 Figure 18 G n rateur de requ te pour la liaison entre les sous formulaires 59 Figure 19 Liaisons entre les tables pr sentent dans le sous formulaire 59 Fig re 20 EENEG 6l Fisure 21 Schomad orcamsation de E 6l Figure 22 Liaisons des points avec les tables g ographiques 62 Fisure 25 Eeer 66 Figure 24 Sch ma d organisation d une requ te param tr ooocnncnncncnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnanenininininnnnns 69 Figure 23 Los roguctes avec champs CARS a er aan en na ao ie 73 EE EI 73 ee EE EE 73 Figure 28 Fonctionnement du syst me d information ssesgeogeegedogeegdse eege Eegeregie 74 Figure 29 Gestion des donn es sur la biom trie Tolame ono nnnnos Ze Figure 30 Liste des donn es stock es dans une g odatabase 000000nonnonneneeosssessesssssssoseeeeeeesssssssssssssreen 78 Figure 31 Organisation et exploitation des donn es envisgagecg non nnnnnnnos 79 Figure 32 Organisation des dossiers et de la g odatabase nono nono 80 Figure 33 Organisation des donn es au sein de la oe odatabase 81 Prisure o4 Creaton d une classes deal a a a ee 82 Figure 35 Appliquer une r f rence spatiale Figure 36 Enregistrement de la nouvelle couche 83 Figure 37 Nuances dans la couleur des indices par param tre occcccccnnnnnnncnnnnnnonnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnonnnnnnnananans 84 Figure
102. ouleur des indices par param tre sa La symbologie de l indice DCE L indice global est calcul dans Access l aide d une requ te cf 5 4 et partir des trois crit res DCE Le r sultat de ce calcul correspond un pourcentage par point La combinaison des trois crit res Densit le recouvrement et la Surface foliaire si la valeur est gale 25 alors la couleur est orange caract ristique d une mauvaise qualit de l herbier ll est donc n cessaire de d finir des classes de symbologie pour les r sultats obtenus et param trer dans Arcgis des plages de couleur suivant les valeurs extraites La symbologie cr e est stock dans le dossier L gende pour lui permettre d tre r utilis lors de futures extractions indices Suivant le calibrage des valeurs extraites de la base indice _D E INDICE DCE Herbier tr s d grad Herbier d grad Herbier atteint Herbier en bon tat Herbier en tr s bon tat o 2 Figure 38 Nuances dans la couleur des indices pour la DCE 6 2 4 Les diagrammes Arcgis offre la possibilit de cr er des diagrammes a partir d un champs d une table attributaire d une ou de plusieurs couches Les diagrammes propos s par Arcgis sont nombreux Parmi les plus courants on a Le diagramme en b tons pour repr senter les groupes de couleurs d une table en fonction des points de surveillance auxquels ils correspondent Les couleurs seront repr sent en ordonn es e
103. our remplir le champs avec la valeur correspondante Requ te SQL SELECT fintervalle recouvrement AS Groupe FROM recouvrement ORDER BY Val fintervalle recouvrement SELECT fintervalle3 Densit AS Groupe FROM densit ORDER BY Val fIntervalle3 Densit SELECT fIntervalle2 Rhizomes plagiotropes AS Groupe FROM Rhizomes _ plagio ORDER BY Val fintervalle2 Rhizomes_plagiotropes e Extraction d un indice globale pour la caract risation des masses d eau DCE Ce type d extraction permet de calculer un indice globale partir des trois param tres pris en compte dans le cadre de la DCE Il est n cessaire que les trois param tres aient une valeur dans la table r sultat Cette requ te est effectu partir de champs calcul es dans les pr c dentes requ tes L inconv nient d un tel r sultat est qu il est n cessaire de param trer d ex cuter les requ tes de champs calcul s pour les trois crit res DCE puisque cette requ te se base sur le r sultat des requ tes sur les donn es brutes terme une macro pourra tre d velopp pour faciliter cette proc dure L extraction consiste utiliser les trois param tres La densit le recouvrement et la Surface foliaire L indice n tant pas encore d fini dans le cadre de la DCE seulement trois crit res retenu voir 3 1 2 il na pas t possible de d terminer la formule g n rale pour le calcul de cet l indice Par d faut la formule stoc
104. port puisqu ils ne sont pas retenu actuellement pour tre stock dans la base de donn es A terme la base de donn es RSP pourra int gr ce type de donn es Du fait de la variabilit intrins que de Posidonia oceanica il est n cessaire pour chaque pr l vement d tudier un nombre suffisant de faisceaux foliaires 10 20 Pergent G Abiven T Hauden S Mimault B Pasqualini V Patrone J Pergent Martini C 2004 Les pr l vements se font en amont de deux ou trois balises On pr l ve les rhizomes tous les 2 ou 3 m tres et on pr l ve le premier rhizome rencontr GIS POSIDONIE Direction D partementale de l Equipement 83 Service Maritime 13 Conseil G n ral 06 janvier 2004 Les mesures L pidochronologiques Quand les feuilles de Posidonia oceanica meurent seul le limbe tombe Le p tiole reste attach sur le rhizome caille L paisseur de ces cailles varie de facon cyclique en fonction de leur rang d insertion sur le rhizome Ces cycles ont une p riodicit annuelle avec un maximum et un minimum d paisseur par an Par analogie avec la dendrochronologie l tude de ces variations cycliques est appel e l pidochronologie Boudouresque et al 1983 La L pidochronologie n est pas t pris en compte dans la base de donn es d la complexit des donn es Ces mesures n ont pas encore de protocole de suivi bien d fini Les mesures ph nologiques Par d finition les faisceaux de posidonies
105. pprim ceci s applique a toutes les donn es rattach es cet enregistrement par l application de l int grit r f rentielle et de la suppression en cascade des enregistrements associ s L int grit r f rentielle est un syst me de r gles garantissant que les relations entre les enregistrements sont valides et que l on n efface pas ou ne modifie pas par erreur des donn es li es Le principal inconv nient est qu il est n cessaire de re param trer les filtres de zones liste de donn es dans les formulaires de saisies 5 1 2 1 4 Les tables de strat gie C est la table DATA STRATEGY Pour Quadrige La strat gie d finit a priori ce que devront tre les donn es pr sentes dans la base en fonction du programme l origine de la collecte des donn es Il s agit de la liste des param tres a mesurer sur chaque point de pr levement ainsi que des m thodes pr conis es pour chacun de ces param tres La strat gie permet ainsi d aider a la saisie des donn es sur un point en personnalisant les crans et facilite la consultation rapide du contenu th orique de la base Pour la base RSP la table DATA_STRATEGY entre dans le cadre de la strat gie employ e par le programme RSP C est a dire qu elle permet de relier la strat gie spatiale et la strat gie temporelle et facilite ainsi la saisie des r sultats dans l interface utilisateur La strat gie spatiale permet de d finir le lieu de pr l vement et la strat g
106. r des valeurs de champs en respectant bien la structure du champ recherch orthographe majuscules et minuscules tirets Deux types de requ tes param tr es avec filtres de saisie sont propos s Les requ tes pour extraction les donn es de la table RESULTAT et les requ tes pour l extraction des donn es relatives la biom trie foliaire de la table RESULTAT BIOM Dans les deux cas il est n cessaire de saisir le nom du point la date de la station dans des boites de dialogue ou filtres de saisie La particularit de l extraction des donn es sur la biom trie foliaire est qu il est possible d obtenir les valeurs pour un point et une date d appliquer des filtres sur les valeurs et de copier coller le r sultat de la requ te dans un tableau Excel pour effectuer des calculs voir Annexe 3 5 4 2 1 2 Les requ tes param tr es par l utilisateur Lorsqu elle est ex cut e en mode cr ation l utilisateur peut alors saisir les param tres qu il souhaite les tables de la requ te les champs l application de filtres sur les champs les op rations etc Les tables les champs et les relations entrant dans la requ te sont d j d finis Par d faut la derni re requ te effectu es est encore pr sente si l utilisateur relance la requ te Ceci peut tre utile s il souhaite ne modifier qu un seul champs ou appliquer nouveau filtre de saisie Dans le cadre du RSP les informations extraites de la base peuvent tre souvent r p
107. raire avec un d but et une fin mobilisant des ressources identifi es humaines et mat rielles durant sa r alisation ll devient donc n cessaire avant tout d marrage du projet de le planifier On appelle livrables les r sultats attendus du projet La difficult dans la conduite du projet r side en grande partie dans la multiplicit des acteurs qu il mobilise En effet contrairement aux projets personnels ou aux projets internes faible envergure pour lesquels le besoin et la r ponse ce besoin peuvent tre r alis s par la m me personne ou par un nombre limit d intervenants dans un projet au sens professionnel du terme l expression du besoin et la satisfaction de ce besoin sont port s par des acteurs g n ralement distincts De cette mani re il est n cessaire de s assurer tout au long du projet que le produit en cours de r alisation correspond clairement aux attentes du client La base de donn es du R seau de Surveillance Posidonie a t tablie la demande de plusieurs partenaires et les donn es stocker dans la base peuvent provenir de diff rents producteurs de donn es Pour prendre en compte tous les param tres de ce projet il a donc t n cessaire d tablir un plan de travail pour mener le terme La mod lisation de la base a n cessit deux phases tablies en r gle g n rale dans le cadre d une conduite de projet La phase initiale ou exploratoire et la phase de synth se
108. rale et pour toutes les grilles de qualit la couleur rouge repr sente un herbier en mauvaise sant et li une valeur de groupe le plus lev et la couleur verte repr sente un herbier en bonne sant pour un code couleur faible Rouge Mauvaise qualit Bonne qualit Termes repris de la DCE Les diff rents types de symbologie vont tre La symbologie pour chaque param tre La symbologie est cr e dans Arcgis partir du menu propri t s de la couche symbologie Ensuite suffit d importer le fichier de couches lyr par la boite de dialogue symbologie pour appliquer la nouvelle symbologie la couche s lectionn Le style de symbologie utilis s pour la g odatabase est un style quantit couleurs gradu es le champs est la valeur calcul et le nombre de classes d pend du param tre puisque le nombre de couleur d pend du nombre de classes d finies pour ce param tre Par exemple on aura 4 classes pour la densit et 3 classes pour le recouvrement Une symbologie est donc appliqu pour le de rhizomes plagiotrope le recouvrement la densit la surface foliaire et le d chaussement rhizomes_plagiotropes moyenne rhizomes_plagiotropes Herbier g n ralement stable avec peu ou pas de progression o L g re tendance la progression Mette tendance la progression recouyrement_mowvenne taux_ de recouvrement Faible recouvrement 2 Recouvrement moyen Fort recouvrement Figure 37 Nuances dans la c
109. rapports de synth se Pour optimiser la gestion et la valorisation des donn es concernant l herbier de Posidonies en M diterran e notamment pour r pondre aux objectifs de la nouvelle Directive Cadre sur l Eau DCE plusieurs partenaires ont souhait apr s concertation rassembler structurer et automatiser le traitement de leur donn es Compte tenu de ses comp tences dans le domaine de la gestion des donn es de ses r seaux de surveillance l Ifremer s est propos de mod liser la base Les principaux objectifs du stage ont t d tablir une m thodologie de travail pour planifier le projet de mod liser une base de donn es relationnelle pouvant stocker l ensemble des donn es existantes et pouvant int grer les donn es futures du r seau r fl chir une adaptation du mod le aux diff rents enjeux notamment pour r pondre la d marche de la DCE et la mise en coh rence du mod le avec la nouvelle organisation de Quadrige Base de donn es utilis par l Ifremer pour stocker ses donn es Le troisi me objectif a t de faciliter l utilisation de la base principalement au niveau de la saisie et de l extraction des donn es l image de la base de donn es MARBEN 2 0 Base de donn es biologique utilis par Ifremer sur la fa ade atlantique Enfin le dernier objectif a t d tablir un syst me simple d utilisation pour l exploitation des donn es dans un Syst me d Information G ographique SIG 1 PRESEN
110. rieure Cap Sagro Limite inf rieure Macinaggio Limite sup rieure Fium Orbu Limite sup rieure Campoloro Limite sup rieure Solenzara Limite inf rieure Toga Limite inf rieure Bravone Limite inf rieure Arinella SITES DE SURVEILLANCE al Herbiers de r f rence Limite sup rieure Roccapina Limite inf rieure Les Lavezzi Limite inf rieure Secteur Est Limite inf rieure Valinco Herbiers soumis une ferme aquacole Limite sup rieure Campomoro Limite inf rieure La Parata Herbiers soumis une grande agglom ration Limite sup rieure Golfe Porto Vecchio et installations portuaires Limite inf rieure La Chiappa Herbiers soumis au passage de c bles sous marins Limite sup rieure Cala di Sciumara Herbiers soumis une installation de Thalassoth rapie Limite sup rieure Porticcio Voir annexe 1 Tableau des retours sur les sites de surveillances Voir annexe 6 Les points de surveillance du RSP PACA 2 2 3 Protocole de suivi Le protocole d crit ci dessous est le protocole suivi dans le cadre du RSP Corse En r gle g n rale ce protocole a t tabli dans le cadre du RSP et est g n ralis tous les suivis entrant dans le programme du RSP La surveillance de la limite inf rieure est r alis e par la mise en place de rep res fixes sur le fond au contact de l herbier selon la technique de Meinesz 1977a Figure 7 Figure 8 Les balises sont en b ton prise marine de forme
111. ristiques Boudouresque amp Meinesz 1982 8 La dendrochronologie est une technique qui permet de dater avec une grande pr cision les sites arch ologiques qui contiennent du bois Elle se pr te particuli rement la datation des pi ces de bois issues de fouilles sous marines Eaux pauvres en substances nutritives 10 Organismes fix s sur la plante Vas HH Feuilles Adultes Feuilles Interm diaires A nz AE ve EE EN z A T VU da Hp Haerz Wb be Ee Feuilles Juveniles Brams Figure 8 M thode de dissection des faisceaux et rhizomes de Posidonia oceanica pour l tude l pidochronologique M maximuM d paisseur m minimum d paisseur Rh rhizome Br bract e Pf p doncule floral Le rang des cailles est indiqu La difficult principale li e l utilisation de ces param tres r side dans le fait qu ils montrent des variations saisonni res tr s marqu es et qu ils doivent tre mesur s au cours d un cycle annuel ou compar s des pr l vements effectu s la m me p riode de l ann e PERGENT PERGENT MARTINI BOUDOURESQUE 1995 2 3 8 Autres param tres La limite sup rieure Le suivi de la limite sup rieure permet d appr cier et de quantifier les nuisances d aux activit s humaines am nagements rejets d eaux us es ancrages La surveillance est r alis e en limite sup rieure par des prises de vues a riennes selon un protoco
112. rojet SIG pour une exploitation fiable des donn es al Concevoir Le Mod le Conceptuel de Donn e MCD et du Mod le Physique de Donn e MPD L interface de saisie sous Access Les requ tes ces requ tes doivent tre compatible avec la base et fournir des l ments percutants sur le suivi des herbiers V rifier si le mod le r pond bien aux objectifs fix s Tester l op rabilit du mod le avec un jeu de donn es Interface de saisie requ tes Le lien cartographique entre la base de donn e et le SIG Impl menter la base de donn es avec l ensemble des donn es disponibles Etablir des cartes d informations repr sentatives des donn es terrains 4 1 3 Ordre chronologique et sch ma d organisation 1 PHASE EXPLORATOIRE Collecte d informations ETUDE PR ALABLE ANALYSE ANALYSE DE L EXISTANT DES BESOINS et ou 2 PHASE DE SYNTHESE ETUDE R sultats de l exploration DE FAISABILITE 3 PHASE DE PROPOSITION Figure 13 Sch ma d organisation de la conduite de projet Avril Mai Mai juin Juillet Septembre Phase initiale Phase de synth se Rencontre avec les partenaires Figure 14 Diff rentes phase dans la cr ation de la base Avancement du projet PERSONNE 06 et 7 04 2005 10 05 2005 22 04 2005 1 06 2005 16 et 17 06 2005 16 et 17 07 2005 GIS Posidonie Corse Agence de l Eau Rh ne M diterran e Corse R gion Provence
113. rrert 1 CODE COULEU R ttal oa MADE APE ethernet DRE dudd dn 8 lalola EHHE ptit HHH u als alulal un n lalal ele a njal aj e dall o OA dad MES u alalalalalalu a alulala els y aalo 1 dudd hs is hf ss din slalulilsla aloja as SES MOORE DORA BREA o tHE tetet t ttet Donn es spatiales temporelles et sources Profondeur l Position g ographique Niveau de pr l vement a TT GEODATABASE Esri Arcgis 8 3 S gt Exploitation cartographique 2 raw H r r gt La surface foliaire est calcul partir des donn es biom triques 7 Donn es sur la biom trie des feuilles PARAMETRE LT Cass TYPE DE Transfert des donn es Excel FEUILLES ae euros sii au Adultes Longueur totale Longueur de la Largeur de la Cass ou brout Ge TE RESULTAT BIOM Interm diaires de la feuille base de la feuille Juv niles feuille Par faisceaux Adultes Interm diaires Juv niles Nombre de cass ll Nombre total Longueur moyenne ll ee foliaire L A tais cm Longueur moyenne de la base de la feuille G LALm m Largeur moyenne ll Coefficient A LAI LOTO AXE D finition LT Longueur totale de la feuille en mm B Longueur de la base de la feuille adulte en mm I Largeur totale de la feuille en mm Coef A Pourcentage de feuille
114. rs de Posidonies se feront sur la limite des 15 m Les limites sup rieures et inf rieures ne seront pas pris en compte Cette limite correspond la profondeur du pr l vement On parlera plus d un niveau de mesure ou niveau de r f rence puisqu il est utilis par d autres r seaux Le pourcentage dans l utilisation des param tres mesur s sur l herbier au niveau Europ en r ponse de 25 institutions de recherches est indiqu ci dessous Masse Eau C ti re La maille d analyse de la DCE est la masse d eau Une masse d eau est un tron on de cours d eau ou un lac un tang une portion d eaux c ti res tout ou partie d un ou plusieurs aquif res d une taille suffisante qu prend en compte des caract ristiques biologiques et physico chimiques homog nes al Densit 88 Limite sup rieure 80 Crit res mesur s Profondeur position g ographique type M thode disponible transect photographie a rienne balisage 1 2 3 4 voir aussi 615 Recouvrement 50 1 K l M thode Observation visuelle d une surface d limit e M thode Comptage sur une surface fixe et d limit e 22 23 24 voir aussi 615 i ou non de 1 25 m 8 25 voir aussi 15 Couverture piphytique 76 Crit res mesur s biomasse diversit M thode d nombrement identification Limite inf rieure 88 Y 5 6 7 8 A egen i nit res mesur s Profondeur position g ographique ce
115. s A qui va servir le projet Mesure de l int r t que repr sente la base pour chaque partenaire Analyse des enjeux rencontre avec les principaux gestionnaires administrateurs chef de projet et informaticiens li s au projet pour d terminer leurs objectifs et pour tablir la mise en uvre du projet quoi va servir la base Comment va elle tre utilis Discussion sur l inventaire des points flous rencontr lors de la phase initiale 4 1 2 La phase de synth se Faire une synth se De l ensemble des entretiens De l ensemble des donn es r cup r es listing des param tres mesur s et des champs pouvant entrer dans la base D taill e des principaux enjeux DCE Quadrige en prenant en compte les remarques des partenaires Etablir Une comparaison entre les donn es issues des diff rents fournisseurs de donn es Une hi rarchisation des besoins Une correspondance entre les donn es r cup r es les besoins exprim s par chaque partenaire et les enjeux pour obtenir une coh rence de la base de donn es D finir Les champs retenu pouvant entrer dans la base de donn es en accord avec les partenaires Les produits de sortie pour r pondre aux enjeux Linteraction avec le Syst me d Information G ographique pour une exploitation cartographique des donn es issues de la base Cr ation d une g odatabase personnelle ou projets ind pendants comment construire un p
116. s reli s les uns aux autres par les diff rents cadres d obtention des donn es 5 3 3 1 Donn es terrains o Les donn es terrains regroupent les donn es spatiales et les programmes Les donn es ont donc un lien troit tabli entre le lieu au niveau duquel sont effectu es les mesures et la source de donn es d o proviennent ces donn es 5 3 3 2 Donn es spatiales De mani re repr senter les donn es g or f renc es dans un SIG l unit fonctionnelle des donn es spatiales est le point auquel tous les r sultats sont rattach s Dans le cadre du RSP la strat gie spatiale retenue est de suivre un point qui appartient un BASSIN qui appartient obligatoirement un SITE et qui appartient obligatoirement une REGION Un point appartient aussi une ZONE HOMOGENE et une MASSE D EAU DCE Dans l interface de saisie le choix d une r gion affiche l ensemble des points rattach s cette r gion Il n est pas n cessaire de choisir chaque fois la zone laqu elle appartient le point puisque celle ci est d j d fini dans la table point ou peut tre d fini dans la proc dure d ajout de point cf 5 3 E POINT Table If Eo0E zm CODE BASSIN CODE ZONE CODE MASSE EAU D 1109 2 FROC9 4 D Antibes L Dn 297 21 FRDC7b 0 Cassis LS 43201167 397 21 FRDC7b 0 Cassis LI 43 2065 4101 23 FRDC7f 0 Giens L5 43 06552 5101 23 FRDC7f 0 Giens LI 43 0456 Cl primaire et cl s secondaires
117. s grilles de qualit va terme obliger une modification des outils de calcul d indice de qualit IlI sera alors n cessaire de modifier certaines structures de la base principalement au niveau du module VBA d interpr tation des codes couleurs et au niveau des requ tes SQL bas es sur ce module La base de donn es et l outil SIG ont t con us de mani re simple et n ont pas n cessit le d veloppement d applications sp cifiques La base est associ un manuel de l utilisateur ll est donc possible de la r organiser et de la faire voluer simplement sans qu il n y ait de perte d information De plus le stockage de nouvelles donn es lorsqu elles seront d finis L pidochronologie Taxonomie etc pourront tre contenus dans la base simplement en ajoutant de nouveaux param tres partir des formulaires de listes de donn es La partie SIG a t test partir de donn es du R seau de Surveillance Posidonies GIS Posidonie Corse Les cartes d informations cr es sur le littoral Corse ne refl tent pas v ritablement des donn es terrains puisque les enjeux n ont pas encore t d fini clairement fin 2015 et ne peuvent tre utilis actuellement comme support d information pouvant r pondre la DCE Ces cartes permettent d avoir une id e g n rale de l herbier et la g odatabase est pour l instant destin e une utilisation local Un point important reste cependant r soudre La valeur des donn es pr sentent
118. ses de donn es spatiales ArcCatalog est le systeme au sein duquel les utilisateurs d finissent leur sch ma de donn es sp cifient et utilisent les m tadonn es La g odatabase est contenue dans un dossier constitu de cinq sous dossiers G odatabase posidonie Projet temporaire photo et l gendes Dossiers fils G odatabase Posidonie Dossier p re Base Posidonie Projet Temporaire photo X Contenu A f u M tadonn es AN Circ 2000 A donn es Corse HP CN Temporaire Dossier a Projets Dossier O G odatabase_Posidonie Dossier Arborescence 3 G odatabase_Posidonie 1 Projets d Arccatalog 3 Temporaire IMAG_BASE A Quadrige R gion Bassin Site A YEmwceal Dossier s lectionn e Figure 32 Organisation des dossiers et de la g odatabase Le dossier G odatabase Posidonie contient la G odatabase c est dire la base de donn es Access et les tables qui la compose Le dossier Projet contient l ensemble des Projets r alis es partir des donn es de la base et des donn es de r f rences voir Structure de la base liste des tables et des relations Ces donn es sont les donn es issues des diff rents fournisseurs de donn es Elles peuvent correspondre par exemple aux donn es sources du SIRS de l ifremer Le dossier Temporaire contient l ensemble des fichiers export au format dbf Ces fichiers sont issus de l extraction des donn es effectu es Access Le dossier PHOTO da
119. sis LI Zone de r f rence mais pr sence lointaine du port de Cassis et de l missaire urbain Giens LS Zone sensible rosion du tombolo d ficit s dimentaire et rejet tr slointain de l missaire Giens LI Zone interm diaire pression de chalutage par les ganguis importante destruction du premier balisage de 1986 hydrodynamisme et mouvements s dimentaires importants Le Brusc LS Zone de r f rence exempte de tout impact anthropique majeur mais influencede hydrodynamisme et proximit du port des Embiez Existence d un vaste r cif barri re de Posidonies tres forte valeur cologiqueet patrimoniale Le Brusc LI Zone de r f rence mais contexte de turbidit importante et rejet lointain de l missaire Martigues LI Zone sensible proximit du complexe industrialo portuaire de Fos Lav ra et contexte g n ral de turbidit flux rhodanien Th oules Ll Zone sensible proximit embouchure cours d eau Siagne et Argenti re turbidit et envasement am nagements littoraux et pr sence de Caulerpa taxifolia Bormes Ll Zone de r f rence mais pratique du chalutage ganguis et mouvements s dimentaires Limite inf rieure la plus profonde 37 5 m des sites du RSP Cavalaire LS Zone de r f rence mais pression de mouillages forains et hydrodynamisme induisant une rosion importante de l herbier Cavalaire LI Zone interm diaire am nagements portuaires et rejets urbains Golf de Juan LI Zone sensible
120. sont des groupements de feuille 6 7 en g n ral par faisceau nervures parall les La feuille adulte est pourvue d un p tiole et d une base engainante les feuilles interm diaires sont sans p tiole et de longueur sup rieure 50 mm et les feuilles juv niles sont sans p tiole et de longueur inf rieure 50 mm cf listes des champs du RSP Corse Corrig Les mesures de biom trie foliaire fournissent des renseignements sur la vitalit de l herbier Elles permettent de calculer diff rents champs notamment la surface foliaire et le coefficient A La surface foliaire L A l fais cm et le Leaf Area Index LAI m m apportent des renseignements quand la vitalit de la plante Par exemple dans des secteurs tr s oligotrophes les valeurs relev es sont tr s faibles Sardaigne in Rico 8 Pergent 1990 et Pergent Martini amp Pergent 1991 Inversement si ponctuellement l apport en nutriments est trop important on assiste une comp tition entre Posidonia oceanica et ses piphytes qui conduit g n ralement une diminution de la surface foliaire par faisceau Pergent G Abiven T Hauden S Mimault B Pasqualini V Patrone J Pergent Martini C 2004 Le Coefficient A est en mesure de nous informer sur la pression exerc e par les herbivores sur le milieu car les marques de broutage laiss es sur les feuilles par certains d entre eux le poisson Sarpa salpa ou l oursin Paracentrotus lfvildus sont caract
121. t aussi t retenus Le d chaussement Le taux de recouvrement Le ype de limite La d termination de ces crit res permet de d finir en priorit les champs composant les tables notamment au niveau des tables de r f rence et r sultats Le type de donn es retenus sont les donn es brutes issues de relev s de terrain Par exemple pour la densit une mesure est effectu e au niveau de chacune des balise C est donc l ensemble de ces donn es stocker dans la base La moyenne globale qui permet la caract risation de l herbier sera calcul partir de requ tes directement accessibles dans l interface de saisie 5 1 2 1 Structure de la base liste des tables et des relations La base de donn es est une base de donn es relationnelle Elle est compos e de plusieurs tables d pendantes les unes aux autres toutes reli es par des relations un plusieurs auxquelles est appliqu e l int grit r f rentielle Cf manuel de l utilisateur ll ny a pas de tables isol es Seules les tables issues de la g odatabase personnelle ne poss dent pas de relation avec les autres tables Elles sont pr sentes dans la structure de la base et sont troitement li es la g odatabase terme ces tables pourront tre reli es aux autres tables La suppression d une de ces tables entra ne la perte de la structure g n rale de la g odatabase La base de donn es est compos e de 22 tables r unies en cinq groupes Les
122. t id al pour travailler sur des projets SIG dont les jeux de donn es sont de taille restreinte et avec des petits groupes de travail Il devient donc n cessaire d utiliser plusieurs g odatabases personnelles pour la collecte de donn es Les g odatabases personnelles ne peuvent tre modifi es que par un utilisateur la fois Le versionnement n est pas pris en charge 6 1 2 Structuration des donn es au sein d une g odatabase La g odatabase stocke des objets qui peuvent tre des entit s spatiales ou non Une g odatabase peut tre constitu e d une collection de jeux de classes d entit s Feature DataSet de classes d entit s Feature Class de tables de rasters Contrairement a une couverture le sch ma d une g odatabase n est pas pr d fini L utilisateur peut organiser les tables les classes d entit s et les jeux de classes d entit s comme il le souhaite La g odatabase est stock e dans un fichier mdb dans le cas d une g odatabase personnelle 6 1 2 1 Jeu de classes d entit s Feature Data Set C est un ensemble de classes d entit s ayant des relations topologiques entre elles ventuellement des relations entre ces classes Toutes les classes d entit s appartenant a un m me jeu de classes d entit s sont stock es avec la m me r f rence spatiale datum projection 6 1 2 2 Classes d entit s Feature Class Les classes d entit s stockent les objets repr sentant des entit s spatiales C
123. t le nom des points sur laxe des abscisses Indice DCE par point 80 Figure 39 Diagramme 1 Le diagramme en ligne sert repr senter l volution de l herbier au cours des ann es pour un param tre extrait de la base Selon les donn es extraites de la base il est alors possible d adapter le type de diagramme selon les valeur du code couleur 6 2 5 Les formulaires Access dans ArcMap Ces formulaires ont l avantage d offrir un acces simple aux donn es de visualiser des requ tes dans une interface conviviale et d effectuer des filtres de requ te directement dans ArcMap En effet le site support d ESRI France propose un script permettant d afficher un formulaire Access contenu dans une g odatabase personnelle au format Microsoft Access galement Pour fonctionner ce script n cessite que le nom de l entit sur laquelle porte la liaison soit identique au nom du formulaire le formulaire et l entit figurant tous les deux au sein de la m me g odatabase Les formulaires de saisie peuvent donc tre directement accessible dans Arcmap par des classes d entit s stock es dans le m me jeu de classe d entit donn es de r f rences La saisie des donn es est donc possible via ce module SS http support esrifrance fr outilsscripts arcgis arcmap geodatabase formulaireaccess formulaireaccess html ss CONCLUSION La base de donn es cr e permet pour la premi re fois l chelle de la M
124. t un acc s rapide des fonds importants o peuvent tre test s les nouveaux quipements sous marins historique car la pr sence de la Marine Nationale a permis cette r gion d acqu rir un savoir faire de haut niveau dans le domaine des technologies marines se traduisant par de nombreuses possibilit s de coop ration et de sous traitance Mo Le Centre h berge d une part le D partement des Engins Sous Marins de GENAVIR qui op re les engins de l Ifremer et d autre part des antennes d organismes ext rieurs dont l activit n cessite une implantation en zone littorale L Institut de Protection et de S ret Nucl aire IPSN du Commissariat l Energie Atomique CEA le Centre Oc anologique de Marseille COM l Institut National des Sciences de l Univers INSU l Universit de Toulon et du Var et le Centre de Documentation de Recherche et d Exp rimentations sur les pollutions accidentelles des eaux CEDRE 1 2 2 Le laboratoire c tier DEL TL Le stage se d roule au centre Ifremer de la Seyne sur mer au Laboratoire Environnement Ressource Ifremer LER PAC sous la tutelle de Mr Bruno ANDRAL PDG DOP LER LERPAC Le laboratoire entretient des relations de partenariat fortes avec les institutions r gionales Agence de l eau RMC Conseil R gional DIREN d partementales Conseil G n ral et locales municipalit s Les collaborations scientifiques avec notamment le Centre d Oc anologie de Marseille
125. table RESULTAT les r sultats moyens de chaque param tre par point et par date Ce type de requ te est directement accessible par l interface de saisie L utilisateur peut param trer sa requ te ou appliquer des filtres de saisies par exemple s lectionner un point e Extraction des donn es relatives la biom trie foliaire pour obtenir la surface foliaire En r gle g n rale sur chaque station un pr l vement d une vingtaine de faisceaux est effectu en vue de mesures biom triques sur les feuilles Cf 8 2 3 7 Ce type de mesures permet de calculer le coefficient A et le LAI ou surface foliaire param tre pris en compte dans le cadre de la DCE Cette requ te permet d extraire l ensemble des valeurs sur la biom trie des feuilles une date donn e et de calculer la surface foliaire suivant les donn es brutes pr sentent dans la table RESULTAT BIOM Le r sultat est obtenu par point une date donn e Le calcul se base sur une premi re requ te permettant d extraire l ensemble des donn es brutes par point par date et sur un param tre s lectionn Ex Appliquer un filtre pour le param tre Densit Recouvrement etc dans le crit re de la requ te Une deuxi me requ te bas e sur la premi re permet d obtenir la surface foliaire Le calcul est bas sur la moyenne des champs obtenus par l interm diaire de la premi re requ te L cart type peut tre aussi obtenu dans un nouveau champs 5 4 2 3 Les requ tes de
126. table ou en progression 7 http www crige paca org aa 2 2 2 1 En R gion PACA DEPARTEMENT Bouches du Rh ne SITES DE SURVEILLANCE Martigues Ponteau LI 20 m Carry le Rouet LS 10 m LI 30 m Marseille LS8 5 m LI 26 5 m Cassis LS 10 m LI 24 m La Ciotat LS 10 5 m LI 33 m Var Le Brusc LS 4 m LI 31 m Toulon Cap Sici LS 13 m LS 12 m LI 27 5 m Giens LS 6 m LI 32 m Porquerolles LS 6 m Bormes LI 37 5 m Lavandou LS 14 m Baie de Cavalaire LS 6 m LI 36 m Saint Tropez LI 37 m Grimaud LS 2 5 m LI 21 m Saint A ygulf LI 18 m Alpes Maritimes Th oule LI 13 m Cannes LS 6 m les de Lerins LS 7 m Golfe Juan LI 31m Antibes LI 20 m Villefranche mer LS 8 m LI 16 m Eze LI 32 m W Nouveaux sites phase initiale en 1994 ou 1995 M LS Limite Sup rieure M LI Limite Inf rieure 2 2 2 2 En Corse SITUATION ENVIRONNEMENTALE Herbiers de r f rence Cap Corse et plaine orientale Herbiers soumis un fort hydrodynamisme Herbiers soumis aux rejets d un fleuve c tier Herbiers soumis des am nagements littoraux Herbiers soumis une grande agglom ration Herbiers soumis l action des chaluts Herbiers soumis aux rejets d un missaire urbain Futurs points propos s dans le cadre du RSP Corse SITUATION ENVIRONNEMENTALE SITES DE SURVEILLANCE Limite sup rieure Sisco Limite sup rieure Biguglia Sud Limite inf
127. tables de r f rences pour le positionnement g ographique des points certaines correspondent aux tables de donn es de r f rence dans Quadrige 3 2 3 les tables interm diaires ce sont les tables sur lesquels l ensemble des partenaires peuvent avoir un droit de modification les tables de liste de donn es qui stockent les donn es pr d finis dans le cadre de la surveillance de l herbier la table strat gie qui permet de d finir la strat gie spatiale et la strat gie temporelle 5 3 3 4 et les tables r sultats qui stockent l ensemble des r sultats 17 C est la base de donn es la plus couramment utilis e sur les r seaux locaux Une base de donn es relationnelle divise les donn es en leurs unit s les plus l mentaires organise ces unit s en tables et forme des associations entre diff rentes tables as SS Les tables de donn es g ographiques Ce sont les tables REGION BASSIN SITE POINT MASSE D EAU_DCE ZONE HOMOGENE La liste des champs pr sents dans certaines de ces tables sont issues de diff rents partenaires elles ne peuvent subir aucune modification sans l accord du producteur de la donn e REGION BASSIN SITE MASSE D EAU DCE ZONE HOMOGENE Pour Quadrige Les donn es de r f rence sont les donn es sur lesquelles on ne fait aucun traitement C est typiquement le cas des donn es mises disposition via SEXTANT Elles peuvent provenir de l IGN du SHOM Agence de l Eau etc Les
128. tables de donn es g ographiques contiennent en partie des donn es de r f rences Elles correspondent aux donn es issues de l Agence de l eau Masses d eau DCE de l Ifremer du SDAGE pour les zones homog nes etc La Table POINT Par d finition un point de pr l vement est un lieu g ographique th orique ou il est pr vu de mettre en uvre un engin de pr l vement lors d une station ll est localis de fa on unique par ses coordonn es g ographiques latitude longitude L ensemble des points est pr sent dans la base et rassembl s dans une unique table POINT Il est possible de consulter ces tables en passant par le menu liste de donn es de la base Access Cette table fait partie de cette liste puisque elle contient la localisation g ographique pr cise des points de surveillance Elle ne fait pas partie des donn es de r f rence puisque les points sont d finis dans le cadre du RSP les points du RSP PACA ont t d finis dans le cadre du RSP PACA et les points du RSP Corse ont t d fini dans le cadre du RSP Corse par ensemble des partenaires 5 1 2 1 2 Les tables interm diaires Ce sont les tables PRELEVEMENTS et STATION Pour Quadrige les donn es des tables interm diaires sont les donn es sur lesquelles des partenaires sont producteur ou peuvent tre amen s a faire des modifications cr ation et modification d entit s C est le cas tout particuli rement des tables PRELEVEMENTS ou STATION La t
129. tation la liste des annotations pour l ensemble du RSP pour le RSP Corse et la liste de annotations pour le RSP PACA L chelle de r f rence d fini pour les classes d annotations est de 1 2000000 avec pour unit le m tre les coordonn es des points sont en Lambert 2 tendue Cette chelle correspond a une chelle de r f rence puisqu elle contient l ensemble des points du R seau Le jeu de classe d entit s donn es r f rences correspond au stockage des donn es de r f rences Ces donn es sont des fichiers de formes ESRI shp a laquelle est rattach la table attributaire Les donn es de r f rences sont les donn es tels que la couche points du R seau de Surveillance Cette classe d entit contient par d faut la couche points RSP points RSP_PACA et points RSP Corse Cette classe d entit permet de stocker les donn es spatiales communes tous En effet la base de donn es de l Ifremer SIRS ne peuvent tre utilis par tous les partenaires Chaque utilisateurs peut cr er ses projets sur sa base de donn es propre Cette classe d entit permet donc de stocker des couches de r f rences partag es accessibles par tous les utilisateurs et pouvant tre rattach a des projets mxd stock s dans le dossier projet Le jeux de classe d entit donn es r sultats correspond au stockage des tables dbf issues des extractions Access Ces couches des tables dbf enregistr es dans le dossier temporaire Par d faut il
130. terroger la base Il existe diff rents types de requ te Une requ te S lection extrait des donn es d une ou plusieurs tables l aide de crit res sp cifi s par l utilisateur et les affiches dans l ordre voulu Une requ te param tr e est une requ te qui lors de son ex cution affiche une bo te de dialogue qui vous invite lui transmettre des informations telles que des crit res ou des valeurs ins rer dans un champ Une requ te Analyse crois e affiche des valeurs r sum es sommes comptes et moyennes issues d un champ d une table et les regroupe selon un ensemble de faits dont la liste appara t dans la partie gauche de la feuille de donn es et selon un autre ensemble de faits dont la liste figure dans la partie sup rieure de la feuille de donn es Une requ te action est une requ te capable de modifier un grand nombre d enregistrements en une seule op ration Il existe quatre types de requ tes action les requ tes Suppression Mise jour Ajout et Cr ation de table Ce type de requ te peut tre utilis dans la base RSP pour mettre jour un champ non renseign dans une table Une requ te SQL est une requ te cr e en utilisant une instruction SQL Parmi les requ tes SQL sp cifiques on trouve la requ te Union la requ te SQL directe la requ te D finition des donn es et la sous requ te 5 4 2 Les extractions de la base Nous avons utilis s trois types de requ tes Les requ tes param
131. tion G ographique Je remercie galement toute l quipe du laboratoire c tier pour m avoir int gr au sein de leur quipe pour leur disponibilit et pour l ambiance conviviale qu ils ont apport s tout au long de mon stage 1 PRESENTATION DE L ORGANISME D ACCUEIL EERR ERKENNEN 9 E A N Ae E 9 1 1 1 PS AO E EE E E E 9 1 1 2 Oai e ra A EE E E EE E EEE 10 12 LIFREMEREN MEDITERRANBE eege 10 1 2 1 Le Centre Hremerde Toulon La SO ME en 10 122 IEN ee OS cone DELL aa ae acts ie nn 11 kk AEN E 11 12 22 COMP LENCE e reel TE 11 12 Presentation GA DOM ea A te ce ere 12 1 2 4 SI TL Outil de gestion des donn es littorales ooononnnncccncnnnnananananananananananarnnrnnrnnnrncnnnarnnnnno 13 1 2 5 PA A 13 1 2 6 IER Te E 14 eg Architecture de la base de donn es STT 14 LZA eelere 14 1272 Gestion de la base de donn es SIRS cococcccncccccnnnonononnonnonnnnannnnnonnnnnnnnnnnrnnrrrnrrnrrrrrrrrnrnn 15 2 LA SURVEILLANCE DE L HERBIER DE POSIDONIES EE 18 2 1 POURQUOI SURVEILLER LES HERBIERS DE POSIDONIES o occcccccccncnnnccnnononcncncnnonocos 18 ZN PPP A E E AS 18 2 12 A a e PE E E E TE NS 19 2 1 o a et ete 20 2 1 4 L gislation str PONTOM ECC ai 20 2 2 LE RESEAU DE SURVEILLANCE POSIDONIES sssssssseesesssesseseenessnsssnnssee 21 2210 Prosrammes EE 21 222 ES ESS pon RSR ee a en ae ias 22 2 22 RO RC A E E E A E 23 EE e e EE 23 SS A A In A 24 2 3 LISTE ET DESCRIPTION DES PRINCIPAUX PARAMETRES
132. toire m tropolan 9 Figure 2 Competences B DBTADRIQUES toni 12 Figure 3 Sch ma d organisation du SIRS inner 16 Figure 4 Faisceaux et rhizomes de Posidonies ss 19 Poue E Ee capos 19 Figure 6 D finition de la hauteur de d chaussement des rhizomes de Posidonia Oceanica d apr s Boudontesque UR EEN 26 Figure 7 Diff rents types de limites inf rieures de l herbier Posidonie Oceanica c ooocoooocccnnncnnnnnannnn css 27 Figure 8 M thode de dissection des faisceaux et rhizomes de Posidonia oceanica pour l tude l pidochronologique M maximuM d paisseur m minimum d paisseur Rh rhizome 29 Figure 9 D finition de la notion de bon tat au sens de la DCE 31 Figure 10 Param tres utilis s pour appr hender l tat de sant d un herbier Posidonia oceanica et pourcentage d utilisation r ponses de 25 institutions de recherche crit res mesur s et m thodes AE e DEE 32 Ier aer PSS DO DCE E E E 33 Figure 12 Sch ma de comparaison entre les donn es g r es par la base RSP et Quadrige 36 Figure 13 Sch ma d organisation de la conduite de projet 41 Figure 14 Diff rentes phase dans la cr ation de la base 000oooononnnonnnneneessssssssssssssosseereeeeesssssssssssssssseeen 41 Freire 15 Liste e EE 48 Figure 16 Le principe des formulaires et sous formulaires dans Access 56 Figure 17 Pr sentation du sommaire de l interface utilisateur cooonnnnnucucooononoooonnnn
133. ts dans la tables selon les volutions envisag es concernant la DCE ou selon les besoins envisag es D un autre c t l architecture g n rale elle reste fig e l image de Quadrige En effet si la base de donn es doit subir une modification dans sa structure c est dire au niveau des tables ou des relations essentiellement pour les tables de r f rences alors elle devra tre modifi e de mani re adapt e pour ne pas qu elle perde de sa valeur et l information qu elle porte L importance des donn es insiste donc prendre des pr cautions pour viter toute suppression ou modification de table pouvant entra ner la perte des jeux de donn es qu elle contient 6 ce sont les tables constituant l architecture principale de la base de donn es _ Va 5 1 2 Les principaux criteres retenus Avant toute mod lisation il a fallu d terminer quels allaient tre les param tres et le type de donn es retenus dans la base de donn es en se basant sur les jeux de donn es r cup r es sur l ensemble des entretiens et sur les recherches bibliographiques Les crit res stock s en priorit dans la base de donn es sont ceux retenus lors de la r union d Ispra WFD MED GIG F vrier 2005 Ce sont 1 La densit 2 Le pourcentage de rhizomes plagiotropes 3 La surface foliaire par faisceau qui int gre l ensemble des variables ph nologiques D autres param tres mesur s dans le cadre des diff rents programmes on
134. ur le recouvrement moyen la densit et le de rhizomes plagiotropes Figure 17 Pr sentation du sommaire de l interface utilisateur Pr l vements K M thodes utilis es Personnes responsable des donn es Param tres Es Engins de Pr levement AFFICHE LES GRILLES D INTERPRETATIONS A Il est possible partir de ces menus de modifier d ajouter et de supprimer une valeur Il a t aussi n cessaire de cr er un menu de consultation des donn es avec un formulaire p re li a un sous formulaire de liste de donn es pour afficher les donn es disponibles dans les tables liste de donn es Param tre pr l vement engins ou d autres tables Point et table de donn es g ographique etc Ces formulaires permettent aussi d effectuer des modifications des suppressions ou d ajouter de nouveaux enregistrements directement par cette interface 5 3 2 Les liaisons entre les formulaires et les sous formulaires el Instruction SQL G n rateur de requ te ME PERSONNE STATION DATA_STR PROGRAM ID PROGRAM NOM_PROGRAM AAA AAA S AAA AAA AAA EE Champ 10 STRATEGY CODE_POINT DATA STRATEGY_I DD PROGRAM STATION ID_STAT 1D PERSONNE DATE_ STATION ORGANISM Table DATA STRATEGY DATA STRATEGY DATA STRATEGY DATA STRATEGY STATION STATION STATION PERSONNE AAA AAA AAA EA ESA Afficher Crit res Figure 18 G n rateur de requ te pour la liaison entre les sous formulaires 11 cODE_BASSIN CODE_SIT
135. vi de l herbier de Posidonia oceanica Tableau 5 Chronologie des principaux v nements Universit de Corte Corse Centre Ifremer de Toulon La Seyne HOTEL de R gion R gion PACA Marseille Centre Ifremer de Toulon La Seyne sur mer Centre Ifremer de NANTES HOTEL de R gion R gion PACA Marseille Mme Christine PERGENTMARTINI Mr Pierre BOISSERY Mme Val rie RAIMONDINO Mr Antoine HUGUET Chef de Projet Quadrige 2 Mme Claire ROLLET Mr Antoine HUGUET Mme Emilie GAUTHIER Trois r gions m diterran ennes Catalogne PACA et Ligurie 22 LA BASE DE DONNEES DE SURVEILLANCE DE L HERBIER DE POSIDONIES LA MODELISATION L NTERFACE UTILISATEUR ORGANISATION ET ORDRE DE SAISIE L EXTRACTION DES DONNEES PRINCIPE ET FONCTIONNEMENT DU MODELE Mots cl s Mod le conceptuel de donn es Tables et relations Stockage des donn es Syst me d information 9 LA BASE DE DONNEES POSIDONIES La base de donn es RSP a t cr e pour r pondre aux besoins des gestionnaires et scientifiques en terme de gestion des donn es sur l herbier de Posidonies issues d une part du programme RPS et d autre part des anciens programmes de recherche th ses etc dont les donn es n taient pas num ris es La base permet de stocker les principales donn es brutes recueillis sur le terrain et prisent en compte dans le cadre de la DCE voir La Directive cadre sur l eau ainsi que
136. x comprendre la r ponse des cosyst mes aux diff rents types de pressions pollutions accidentelles l accident de l Erika a motiv la cr ation du REBENT ou chroniques changements climatiques introductions d esp ces activit s anthropiques et de produire des mod les cologiques Le projet mis en uvre par l Ifremer est aujourd hui en pleine phase op rationnelle en Bretagne Il en est au stade d avant projet en Manche Est en Gascogne et en M diterran e terme une fois l architecture nationale du r seau labor e les donn es produites sur les diff rentes fa ades pourront faire l objet d analyses et de comparaisons afin notamment d identifier des tendances volutives locales ou globales des bioc noses ll doit permettre de fournir des donn es standardis es comparables entre les diff rentes fa ades m tropolitaines En Bretagne l architecture du r seau est con ue selon trois approches embo t es avec un niveau de pr cision croissant Une approche zonale g n rale permettant d offrir un minimum d information homog ne en tout point et une vision synth tique une approche sectorielle r alis e sur des sites de tailles restreinte une approche stationnelle permettant de recueillir des donn es selon des protocoles standardis s sur des points de r f rence appartenant des habitats et des peuplements prioritaires 3 3 2 Le RSP et le projet REBENT en M diterran e L objectif du projet REBENT en M d
137. x diminue on assiste une remont e de la limite inf rieure qui peut s tablir entre 10 et 15 m c est notamment le cas proximit du d bouch de fleuves c tiers ou du rejet en mer d missaires urbains ou industriels Astier 1984 Darmoul 1988 Pergent Martini amp Pergent 1993 Les scientifiques se basent alors sur un panel de descripteurs cf 2 3 IIs peuvent ainsi poser un diagnostic de l tat g n ral de l herbier et mieux cerner l incidence potentielle de telle ou telle nuisance d origine anthropique PERGENT G ABIVEN T HAUDEN S MIMAULT B PASQUALINI V PATRONE J PERGENT MARTINI C 2004 2 1 4 L gislation sur Posidonia oceanica En France la protection l gale de Posidonia oceanica s int gre dans le cadre de la loi du 10 juillet 1976 relative la protection de la nature et de son d cret d application du 25 novembre 1977 Cette protection est officialis e par l arr t du 19 juillet 1988 relatif la liste des esp ces v g tales marines prot g es qui sp cifie sont interdits en tout temps et sur tout le territoire m tropolitain la destruction la coupe l arrachage la mutilation la cueillette ou l enl vement le colportage l utilisation la mise en vente la vente ou l achat de tout ou partie des sp cimens sauvages des esp ces ci apr s num r es Posidonia oceanica et Cymodocea nodosa Pergent 1991 En dehors de l esp ce elle m me les herbiers b n ficient d une protecti

Réalisation d`un Système de Gestion de Base de données et d

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