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BioMate 3S - Fisher UK Extranet

1. 15 Confsuritions deporte cellul s s 44 fans ses M ae ane 15 Initialisation du porte cellules 24 3 ain sauter daladaa sans seras 18 Changement de porte cellules so hrs dansent nest es 19 Installation du porte cellules 6 positions et du porte cellules position UNIQUE 2 ren nee LUN dre ne De nie re E nt tbe 19 Retrait du porte cellules 6 positions et du porte cellules position ungues PP PR AR ER Tes dr AE tns 21 Installation de porte cellules accessoires 21 Installation de l imprimante interne facultatif 22 Chargement du papier dans l imprimante interne 23 Imprimantes externes os donne en Ces ns eu es N 24 R glage du positionneur d chantillons 25 AUTO NN TE a a EE E E ET PE EEE DER LE D Re DL 25 AUTOA RS o AE N S E I AE NEE SEEEN 25 Single Cell Holder Porte cellules position unique 25 Manual 6 Manuel 62 54 are RAA LEUR DAMES 26 Correction de Celles ss uno ones dino a a 27 C trection decellules iarr rise mean deep des DERRE EE G 27 D finition des longueurs d onde pour le mode Discrete nms Nm dTe e ra E TA NNE A A a T E E AA re 29 Gestion des tests stock s 31 Motdepass lopiciel nnn renei a E Ta line ent Are 31 Attribution d un nom unitest di de ais nd des dan 31 Enregistrement d un tests dinde es bin tune en hu Spia 32 Chargement des
2. More parameters ored Tests Pour configurer les param tres de test 1 Mettez en surbrillance le param tre souhait 2 Pour configurer chaque param tre appuyez sur Enter Entr e puis s lectionnez une valeur ou saisissez les valeurs l aide du clavier num rique 3 Appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test sous un nouveau nom ou Run Test Ex cuter le test pour commencer mesurer le blanc et les chantillons Mesure d chantillons Vous pouvez mesurer les chantillons automatiquement ou l aide du porte cellules position unique 104 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 21 Bio tests Tests des acides nucl iques Mesure d chantillons automatique option Auto 6 ou Auto 3 Pour mesurer automatiquement les chantillons 1 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Placez le blanc talon et les chantillons dans leurs positions de cellule comme indiqu par le logiciel DNA RNA 260 280 15 Test Name DNA RNA 260 280 Abs Abs Abs IDH 26Onm 280nm Ref UL Insert blank into position B Insert sample 1 into position 1 Press ENTER to measure 3 Appuyez sur Enter Entr e Faites d filer les diff rentes mesures d chantillon l aide des touches fl che vers le haut et fl che vers le bas du clavier DNA RNA 260 280 15 Test Name DNA RNA 260 280 Abs Abs Abs IDH Z60nm 280nm Ref UL 1 0 064 0 0
3. Data File Name Nom de fichier de donn es Permet de saisir un nom pour le fichier de donn es lorsque l option d enregistrement automatique AutoSave est activ e ON Date Cell Correction Dater la correction de cellule Permet d afficher la date laquelle les donn es de correction de cellule des cuves ont t recueillies pour la derni re fois Date Standards Measured Dater la mesure des standards Permet d afficher la date laquelle les standards ont t mesur s pour la derni re fois l aide de l instrument Tests Standard Curve Courbe standard Date Time Setup R glage de la date l heure Permet de r gler la date et l heure de l instrument Utility Utilitaire Delay Time Temps d attente Permet de saisir l intervalle de temps entre le lancement du test et la premi re mesure garantit l quilibrage de l chantillon ADV A T C ATC avanc et Kinetics Cin tique Delete Character Supprimer le caract re Permet de supprimer le dernier caract re du nom saisi Test Name Nom de test et Edit Units Modifier Unit s Delete File Supprimer le fichier Permet de supprimer un fichier de test ou de donn es partir r pertoire des tests stock s Stored Tests Directory Utility Utilitaire Delete Name Supprimer le nom Delete nm Supprimer Nm Permet de supprimer le nom entier pour permettre d en saisir un nouveau Test Name Nom
4. 2 Pour configurer chaque param tre appuyez sur Enter Entr e puis s lectionnez une valeur ou saisissez les valeurs l aide du clavier num rique 3 Appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test sous un nouveau nom ou Run Test Ex cuter le test pour commencer mesurer le blanc et les chantillons Mesure d un balayage de spectre de fond Une fois l cran DNA RNA with Scan 260 280 ADN ARN avec balayage 260 280 ou DNA RNA with Scan 260 230 ADN ARN avec balayage 260 230 affich suivez la proc dure ci apr s pour mesurer un balayage de spectre de fond Remarque Si un porte cellules 6 positions est install assurez vous d avoir plac le blanc dans la position B L instrument utilise toujours la position B pour mesurer le spectre de fond Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 107 21 Bio tests Tests des acides nucl iques Pour mesurer un balayage de spectre de fond 1 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test L cran de mesure DNA with Scan ADN avec balayage s affiche DNA RNA with Scan 260 28 16 16 RENTE Test Name DN scan 260 280 BLA 3 000 0 100 Yave length Baseline Tabular Baseline 2 Placez le blanc talon dans la position B 3 Appuyez sur Collect Baseline Mesurer le spectre de fond Mesure d chantillons option Single Cell Holder Porte cellules position unique Auto 6 ou Auto 3 Une foi
5. 2008 2009 Thermo Fisher Scientific Inc Tous droits r serv s Microsoft Windows Vista Windows NT et Excel sont des marques ou des marques d pos es de Microsoft Corporation aux tats Unis et ou dans d autres pays Clorox est une marque de commerce ou une marque d pos e de The Clorox Company aux tats Unis et ou dans d autres pays Triton est une marque de commerce ou une marque d pos e de Union Carbide aux tats Unis et ou dans d autres pays Pyrex est une marque de commerce ou une marque d pos e de Corning Incorporatewd aux tats Unis et ou dans d autres pays Toutes les autres marques sont la propri t de Thermo Fisher Scientific Inc et de ses filiales Pour obtenir une assistance technique contactez Pour obtenir une assistance technique internationale contactez Thermo Fisher Scientific 5225 Verona Road Thermo Fisher Scientific Madison WI 53711 4495 tats Unis T l phone 1 608 273 5017 T l phone 1 800 532 4752 E mail support madison thermofisher com E mail us techsupport analyze thermofisher com Site Internet http www thermo com spectroscopy Site Internet http www thermo com spectroscopy Thermo Fisher Scientific Inc fournit le pr sent document ses clients lors de l achat d un produit pour qu ils puissent s y reporter dans le cadre de l utilisation de celui ci Ce document est une uvre prot g e par les lois en vigueur sur la propri t intellectuelle Sa reproduction partielle ou
6. Pour configurer plusieurs tests l aide de la fonction SmartStart 1 Appuyez sur Stored Tests Tests stock s pour afficher la liste des tests disponibles 2 Mettez en surbrillance le premier test souhait 3 Appuyez sur Select Test S lectionner le test pour ajouter le test au menu SmartStart Ajoutez des tests jusqu ce que vous ayez s lectionn tous les tests souhait s 4 Appuyez sur Esc chap jusqu ce que vous reveniez sur l cran Bio Tests Bio tests Remarque Vous pouvez mettre maintenant l instrument hors tension puis le remettre sous tension Lorsque l instrument red marre la liste des tests s lectionn s s affiche Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 21 Bio tests Tests des acides nucl iques Tests des acides nucl iques Thermo Scientific Vous pouvez utiliser ces m thodes pour d terminer la concentration et la puret des acides nucl iques d un chantillon donn Conc en ADN ARN 260 Ce test simple est destin valuer la quantification des acides nucl iques Avec cette m thode la concentration des acides nucl iques est d termin e en multipliant l absorbance 260 Nm par un facteur 50 par d faut Un utilitaire de facteur de dilution peut tre utilis pour calculer la concentration de la solution m re ADN ARN 260 280 Ce test est destin d terminer la fois la concentration et la puret des acides nucl iques l aide des longueurs
7. Si un porte cellules 6 positions est install appuyez sur les boutons de changement de cellule pour repositionner le porte cellules et mesurer les autres standards manuellement Lorsque tous les standards ont t mesur s l cran Standards reportez vous la section Utilisation de l cran Standards la page 84 indique l absorbance de chaque standard ainsi que la pente le point d intersection et le coefficient de corr lation de la courbe standard Utilisation de l cran Standards Vous trouverez ci dessous un exemple de l cran Standards avec les r sultats de mesure Standard Curve 15 50 4Feb02 Test Name AMMONIA Cell 5 Std Conc Abs ppm 660 Onm 1 0 120 0 087 2 0 200 0 140 3 0 250 0 152 4 0 400 0 268 5 0 500 0 312 Curve Fit Linear Slope 0 6091 Std Dev 0 011 Intercept 0 01272 Corr Coeff 0 995 Page 1 Standards 1 5 p Test Standards Test 84 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 19 Mesures de concentration Application Standard Curve Courbe standard Mesure d chantillons Vous pouvez utiliser cet cran dans les cas suivants Affichage des donn es de la courbe standard dans un graphique appuyez sur View Graph Afficher le graphique Enregistrement d un test appuyez sur Save Test Enregistrer le test Modification d une courbe standard appuyez sur Edit Standards Modifier les standards Mesure d chantillons appuyez sur Run Test Ex cuter le test
8. Statistics Statistiques Permet d activer et de d sactiver les statistiques option Statistiques activ e ON permet de calculer la moyenne et l cart type des r sultats les registres de statistiques sont effac s lorsque l option Statistiques est d sactiv e OFF et ou que l instrument est mis hors tension et ou que les param tres de test sont modifi s et ou lorsque le test est enregistr ou r enregistr tous les types de test l exception de Kinetics Cin tique Scanning Balayage Multiwavelength Longueurs d onde multiples Std Concentration Concentration standard Permet de saisir la concentration de la substance analyser dans la solution standard Stop wavelength Longueur d onde de fin Manuel d utilisation du BioMate 3S Permet de saisir la longueur d onde de fin pour un balayage Tests Scanning Balayage uniquement Thermo Scientific Thermo Scientific Param tre Stored Tests Directory R pertoire des tests stock s 24 Param tres Description Permet d afficher la liste des tests stock s dans l instrument Utility Utilitaire Tabular Tableau Permet d afficher la liste des donn es recueillies Kinetics Cin tique Scanning Balayage Test Name Nom de test Tm value Valeur Tm Permet l utilisateur de saisir un nom alphanum rique comprenant 16 caract res maximum pour le test le nom figurera sur l impression des donn es et en cas
9. DE 2 y 2 La L instrument calcule l aire situ e sous la courbe pour les longueurs d onde s lectionn es Pour s lectionner d autres longueurs d onde appuyez sur Next Cursor Curseur suivant pour activer la ligne de curseur suivante S lectionnez la longueur d onde en appuyant sur Cursor et Cursor Appuyez sur Set Options D finir les options pour acc der la fen tre de d finition des options Mettez en surbrillance Factor Facteur Entrez le facteur souhait puis appuyez sur Enter Entr e Mettez en surbrillance Calculation baseline Spectre de fond de calcul Appuyez sur Enter Entr e pour basculer entre Zero Z ro et Tangent Tangente Appuyez sur Esc chap pour revenir l cran Area Under the Curve Aire situ e sous la courbe L instrument calcule l aire situ e sous une courbe pour les longueurs d onde le facteur et la m thode de calcul s lectionn s Manuel d utilisation du BioMate 3S 63 14 Acquisition Affichage et manipulation des donn es du balayage Affichage et remise l chelle des donn es de balayage repr sent es dans un tableau Lorsque vous manipulez des donn es de balayage repr sent es dans un tableau vous devez appuyer sur Edit Data Modifier les donn es avant d effectuer toute autre action sur les donn es Scanning 10 05 15Feb02 Test Name FILTER BLANK Yave length bs 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 e 0 IDH
10. Insert blank into position B Insert sample 1 into position 1 Press ENTER to measure 3 Appuyez sur Enter Entr e L instrument mesure le blanc puis les chantillons et affiche les mesures d chantillon RNA 15 29 26Mar08 Test Name RN Cell Abs RNA IDH 260nm pg mL 1 0 272 10 88 2 0 833 33 32 3 1 111 44 44 age 1 Samples 1 3 T Samples Vous pouvez utiliser cet cran pour e Mesurer des chantillons suppl mentaires appuyez sur Measure Samples Mesurer les chantillons Mesure d chantillons l aide du porte cellules position unique Ke Pour mesurer les chantillons l aide du porte cellule position unique 1 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Placez le blanc talon dans le porte cellules 3 Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc 102 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 21 Bio tests Tests des acides nucl iques RNA 15 30 26Mar08 Test Name RN Abs RNA IDH 260nm pg mL D a RS Blank 4 Retirez le blanc talon 5 Ins rez l chantillon 6 Appuyez sur Measure Samples Mesurer les chantillons RNA 15 29 26Mar08 Test Name RN Cell Abs RNA IDH 260nm pg mL C TT Samples Vous pouvez utiliser cet cran pour e Mesurer des chantillons suppl mentaires appuyez sur Measure Samples Mesurer les chantillons ADN ARN 260 280 et ADN ARN 260 230 Ces tests fonctionnent quasim
11. la section Param tres Pour les valeurs par d faut reportez vous la section Calculs pour Logiciel Bio Tests Pour commencer mettez en surbrillance Protein Tests Tests prot iques puis appuyez sur Enter Entr e Mettez ensuite en surbrillance Warburg Christian puis appuyez sur Enter Entr e L cran des param tres de l analyse de Warburg Christian s affiche Warburg Christian avelength 1 avelength 2 actor 280 actor 260 Dilution Multiplier calculated nits Sample Positioner umber of Samples More parameters Configuration des param tres de test Pour configurer les param tres de test 1 Mettez en surbrillance le param tre souhait 2 Pour configurer chaque param tre appuyez sur Enter Entr e puis s lectionnez une valeur ou saisissez les valeurs l aide du clavier num rique 3 Une fois les param tres configur s appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test sous un nouveau nom ou sur Run Test Ex cuter le test pour commencer mesurer le blanc et les chantillons 128 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific Mesure de l chantillon Thermo Scientific 21 Bio tests Mesure des prot ines Vous pouvez mesurer les chantillons automatiquement ou l aide du porte cellules position unique Mesure d chantillons automatique option Auto 6 ou Auto 3 R Le 1 2 Pour mesurer automatiquement les chantillons A
12. Appuyez sur Start Test Lancer le test Vous pouvez appuyer sur Stop Test Arr ter le test pour arr ter le test Le sous programme du test d impression s affiche en m me temps que les r sultats imprim s En cas d chec du test suivez les recommandations ci dessous 148 Manuel d utilisation du BioM Assurez vous que l imprimante interne est s lectionn e comme p riph rique d impression dans l cran Utility Utilitaire Assurez vous que l imprimante interne est correctement install e Revenez l cran principal puis appuyez sur Enter Entr e Si le papier ne bouge pas il se peut que l imprimante ne soit pas correctement install e Assurez vous que le papier thermique a t introduit avec le c t thermique vers la t te d impression la surface ext rieure du rouleau est la surface thermique Pour plus d informations sur le d pannage contactez votre repr sentant commercial ou votre repr sentant du service apr s vente local ou contactez nous vous trouverez nos coordonn es au d but de ce document ate 3S Thermo Scientific Maintenance Le spectrophotom tre est solide et fiable Par cons quent la maintenance p riodique reste minime Cette section aborde les points suivants e Entretien p riodique e Remplacement du fusible AVERTISSEMENT Lorsque l instrument est utilis sans le capot l op rateur risque d tre expos des tensions potentiellement dangereuses et un r
13. Mesure d chantillons l Pour mesurer automatiquement les chantillons l aide de la courbe d talonnage option Auto 6 ou Auto 3 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test Installez le blanc et les chantillons Appuyez sur Enter Entr e L cran Standard Curve Courbe standard indique l absorbance et la concentration de chaque chantillon Pour basculer entre l affichage dans un tableau et dans un graphique appuyez sur View Graph Tabular Vue graphique tableau Standard Curve 16 05 4Feb02 at Name AMMONIA 0 1 ppm Curve Fit Linear Slope 0 6091 Std Dev 0 011 Intercept 0 01272 Corr Coeff 0 995 To e OE LE Test Fit Test Pour mesurer manuellement les chantillons option Manual 6 Manuel 6 ou Single Cell Holder Porte cellules position unique Appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Installez le blanc et les chantillons Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 85 19 Mesures de concentration Application Standard Curve Courbe standard Modification d une courbe standard 3 Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Si un porte cellules 6 positions est install celui ci passe sur la position B pour mesurer le blanc et revient ensuite sur sa pr c dente position 4 Appuyez sur Measure Samples Mesurer les chantillons Si un porte cellules 6 positions est install appuyez sur les boutons de changement de cellule pour repositionner le porte
14. Positionneur d chantillons appuyez sur Enter Entr e pour afficher la liste de s lection Mettez en surbrillance l l ment appropri puis appuyez sur Enter Entr e Advanced 2T C 17 05 28Feb07 Test Name Measurement Mo Wave length Ref Wavelengt Ref Wavelengt Delay Time mi Conc of Standa Factor nits Sample Positio Number of Samp Unit More parameter Press T or 4 to select Press ENTER Press T or 4 t TN EO Unit Bascule activation d sactivation Apr s avoir mis en surbrillance le param tre AutoPrint Impression auto par exemple appuyez sur Enter Entr e pour basculer sur la valeur oppos e 8 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 2 Configuration de l instrument Configuration des param tres de l utilitaire Saisie alphanum rique Apr s avoir mis en surbrillance le param tre Test Name Nom du test par exemple appuyez sur Enter Entr e L cran Name Entry Saisie du nom s affiche Mettez en surbrillance le caract re souhait puis appuyez sur Add Character Ajouter le caract re Lorsque vous avez termin appuyez sur Accept Name Accepter le nom Create Test Nane 17 25 28Feb07 ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUUVUXYZ0123456789 abcdefghijkimnopqrstuvuxuz pO Test Name Copper Test 1 Press f or 1 to select character Press Accept Name to save the test Name Character Character Name Configuration des param tres de l utilitaire Thermo Scien
15. Verrouillage d verrouillage Pour verrouiller ou d verrouiller un test mettez en surbrillance le test en question puis appuyez sur Lock Unlock Verrouiller d verrouiller Saisissez le mot de passe puis appuyez sur Enter Utility Test Directory 9 31 22Feb07 Protein Tests Lowry Micro Read only BCA Standard Read only BCA Micro Read only Biuret Read only Direct UV 280 Read only Direct UV 205 Read only Yarburg Christian Read only Cell Growth Cell Growth Read only Scanning ssay5i Z2Feb07 More tests Press f or 4 to select test a T i TT Test Test Test Remarque Pour verrouiller ou d verrouiller l acc s au fichier vous devez saisir le mot de passe logiciel de ce manuel Suppression d un test Thermo Scientific Pour supprimer un test mettez en surbrillance le test en question puis appuyez sur Delete Test Supprimer le test Manuel d utilisation du BioMate 3S 35 6 Gestion des tests stock s Suppression d un test 36 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific ES S SmartStart La fonction SmartStart vous permet de personnaliser le spectrophotom tre en pla ant les m thodes de test les plus fr quemment utilis es dans le premier menu Une fois l initialisation de l instrument termin e un menu simple r pertoriant uniquement les tests SmartStart s affiche Si vous ne s lectionnez qu un seul texte en tant que test SmartStart l instrument une fois mis sous te
16. ress or to select item to change CUT LR LE Test Tests Test Param tre Description Delay Time Saisissez l intervalle de temps entre le lancement du test et la Temps d attente premi re mesure garantit l quilibrage de l chantillon Adv Interval Time Saisissez l intervalle entre des relev s r p t s Temps d intervalle Measure Blank Permet de s lectionner la fr quence de remise z ro de Mesurer le blanc l instrument touche de fonction Une fois ou tous les relev s 2 Lorsque les param tres sont configur s appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test ou sur Run Test Ex cuter le test pour mesurer un blanc ou un chantillon Remarque Si la correction de cellules est activ e ON vous devez d abord ex cuter l application de configuration de la correction pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons Remarque Si l option Auto Save Data Enregistrement auto des donn es est activ e ON vous devez d abord saisir un nom de fichier de donn es pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 91 20 cin tique Mesure d chantillons Mesure d chantillons Remarque Si un changeur de cellule 6 positions est install placez le blanc dans la position B et l chantillon d
17. 1 Baseline collected 15Feb02 data Graph mm m data Pour utiliser toutes les donn es de balayage Une fois le tableau des donn es de balayage affich sur l cran de modification appuyez sur Use All Data Utiliser toutes les donn es Pour s lectionner des longueurs d onde de d but et de fin sp cifiques 1 Une fois le tableau des donn es de balayage affich sur l cran de modification mettez en surbrillance le point de donn es appropri dans le tableau 2 Appuyez sur Start nm Nm de d but ou End nm Nm de fin L instrument met en surbrillance les points de donn es s lectionn s Pour afficher le trac en fonction des points de donn es s lectionn s appuyez sur Graph Graphique 64 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific MA Longueurs d onde multiples L application Multiwavelength Longueurs d onde multiples vous permet de mesurer plusieurs longueurs d onde fixes C est une alternative rapide au balayage dans le cas o les longueurs d onde consid r es sont bien connues Utilisez l application Multiwavelength Longueurs d onde multiples dans les cas suivants e Rappel d un test e Configuration des param tres de test e Correction de cellules e Ajout de longueurs d onde et de facteurs e Suppression de longueurs d onde et de facteurs e Prise de mesures Pour commencer appuyez sur Test mettez en surbrillance Multiwavelength Longueurs d onde multiples puis appuye
18. 1 0 en option 174 instruments Absorbance A f Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific A Calculs du calculateur d oligonucl otides Calcul Param tres de saisie Formule Unit s affich es Nbre de bases S quence r p titive de A T D compte du nombre total de bases Longueur ou U GetC saisies nombre de bases Taux ou Utilisez la s quence AT U GC Nbredobae ciel Pourcentage pourcentage de saisie ci dessus GC GC Nbre total de AT ou U GC Poids mol culaire Nbre d unit s A nbre d unit s T nbre d unit s G nbre d unit s C nbre d unit s U Si l entr e n inclut pas d unit s U Poids mol culaire 312 2 x A 303 2 x T 329 2 x G 289 2 x C 18 02 Si l entr e inclut des unit s U Poids mol culaire 329 2 x A 306 2 x U 345 2 x G 305 2 x C 18 02 Poids mol culaire x Da M Absorptivit Nbre d unit s A nbre d unit s T Si l entr e n inclut pas d unit s U Coefficient 260 nbre d unit s G nbre d unit s C 369 15 200 x A 8 400 x T d extinction nbre d unit s U 12 010 x G 7 050 x C Mcm Si l entr e inclut des unit s U E0 15 200 x A 9 900 x U 12 010 x G 7 050 x C Facteur de N A Poids mol culaire x 10 ug mL conversion Coefficient d extinction Calcul de T Nbre d unit s A nbre d unit s T T 2 A T G C Oligonucl otides nbre d unit s G nbre d unit s C
19. IMPORTANT Si le fusible saute en permanence cela peut tre d un grave probl me li l instrument Contactez l assistance technique dans les plus brefs d lais Pour remplacer le fusible 1 Mettez l instrument hors tension et d branchez le de la prise murale ou de la multiprise 2 Positionnez l instrument de fa on pouvoir acc der au module d entr e d alimentation situ l arri re de l instrument Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 23 Maintenance Remplacement du fusible 3 Retirez le cordon d alimentation 4 Ins rez un tournevis plat dans l encoche situ e sur le capot des fusibles et faites levier pour retirer le capot 5 Retirez le porte fusible l aide d un tournevis plat 6 D cliquetez les deux fusibles pour les retirer 7 Ins rez les fusibles neufs jusqu ce qu ils s enclenchent en position 8 Remettez en place le capot des fusibles 9 Remettez en place le cordon d alimentation 10 Rebranchez l instrument dans la prise murale ou sur la multiprise puis mettez le sous tension Remarque Si le fusible saute nouveau contactez votre distributeur ou l assistance technique Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 153 23 Maintenance Remplacement du fusible 154 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific SE Param tres Param tre Description x Permet de saisir des op rateurs math matique en mode Calculatrice Ut
20. Sequence Base Base Sequence Une fois que vous avez termin appuyez sur Accept Sequence Accepter la s quence L cran suivant affiche des informations sur les propri t s de la s quence saisie Manuel d utilisation du BioMate 3S 111 21 Bio tests Tests des acides nucl iques Dligos 16 42 26Mar08 Test Name Oligo Calc ase Sequence CTTTGAACATTCCCTAGGC Number of bases z 50 00 DNA MY 5 P03 6107 MU RNA 4648 260 DNA 196580 RNA 165700 DNA Factor 31 07 RNA Factor 28 05 BR ET TE Sequence Calc Test e Appuyez sur Esc chap pour revenir l cran des m thodes 4 Appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test sous un nouveau nom ou Run Test Ex cuter le test pour commencer mesurer le blanc et les chantillons Mesure d chantillons Vous pouvez mesurer les chantillons automatiquement ou l aide du porte cellules position unique Mesure d chantillons automatique option Auto 6 ou Auto 3 Pour mesurer automatiquement les chantillons 1 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Placez le blanc et les chantillons dans leurs positions de cellule comme indiqu par le logiciel DNA Oligo calculator Test Name Oligos calc Abs Oligos Oligos IDH 260nm pg mL pM pL Insert blank into position B Insert sample 1 into position 1 Press ENTER to measure 3 Appuyez sur Enter Entr e 112 Manuel d utilisa
21. Standards avelength Repeatability esolution Photometric ccuracy oise Measurement Stray Light Internal Printer Test ress f or to select test Liste de contr le de d pannage En cas d chec d un test de v rification des performances suivez la proc dure ci dessous pour diagnostiquer des probl mes courants Si un test continue d chouer malgr les recommandations ci dessous reportez vous la liste de d pannage du test en cours d ex cution incluse avec la description de chaque test Assurez vous que e Vous avez effectu correctement la proc dure de test e Les filtres et les standards sont propres e La porte du compartiment chantillons est ferm e pendant le test e Le compartiment chantillons n est pas obstru Le porte cellules quip est correctement install Si le porte cellules 6 positions est install lancez le test une fois avec la porte du compartiment chantillons ouverte pour v rifier que le porte cellules se d place sans incident e Les diagnostics de mise sous tension ne signalent aucun probl me apr s la mise sous hors tension de l instrument e La lampe est allum e e Le compartiment de la lampe n est pas obstru AVERTISSEMENT N ouvrez pas le compartiment de la lampe si l instrument est sous tension AVERTISSEMENT Ne mettez pas l instrument sous tension si le compartiment de la lampe est ouvert 138 Manuel d utilisation du BioMate 3S Therm
22. chantillons Un porte cellules 6 positions peut accueillir cinq chantillons Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Si un porte cellules 6 positions est install celui ci passe sur la position B pour mesurer le blanc et revient ensuite sur sa pr c dente position Manuel d utilisation du BioMate 3S 75 17 Diff rence d absorbance Mesure d chantillons Absorbance Difference 13 39 14Feb02 Test Name TEST 9 Cell 1 bs Abs bs Result ID 429 0 630 0 Ref UL ppm Measure Blam oo o d ES 4 Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Si un porte cellules 6 positions est install appuyez sur les boutons de changement de cellule pour repositionner le porte cellules et mesurer les autres chantillons manuellement 76 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific ES M thode 3 points L application 3 Point Net M thode 3 points vous permet de d terminer la hauteur d un pic en fonction de la pente d un spectre de fond dessin entre deux longueurs d onde de chaque c t du pic Ce type d analyse est utile lorsqu il est n cessaire de conna tre pr cis ment la hauteur de pic pour un test donn Un facteur peut tre multipli par la hauteur de pic mesur e pour exprimer la concentration de la substance analyser dans les unit s de concentration appropri es Utilisez l application 3 Point Net M thode 3 points dans les cas suivants e Rappel d un test e Configuration des param tre
23. d une longueur maximale de 20 bases Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 175 27 Calculs du calculateur d oligonucl otides Calcul Calcul de T hybrides ADN ADN Param tres de saisie Formule e Nbre d unit s A nbre T 81 5C 16 6 log Na d unit s T 1 0 7 Na 0 51 GC nbre d unit s G nbre 500 L P 0 63 formamide d unit s C e M molarit du cation e Fraction GC fraction de G et C form pourcentage de formamide dans l chantillon e L nbre de paires de bases e P pourcentage de discordance Unit s affich es C Calcul de T hybrides ADN ARN e Nbre d unit s A nbre T 67 C 16 6 log Na d unit s T 1 0 7 Na 0 8 GC nbre d unit s G nbre 500 L P 0 5 formamide d unit s C e M molarit du cation e Fraction GC fraction de G etC e form pourcentage de formamide dans l chantillon e L nbre de paires de bases e P pourcentage de discordance Calcul de T hybrides ARN ARN e nbre d unit s A nbre T 78 C 16 6 log Na d unit s T 1 0 7 Na 0 7 GC nbre d unit s G nbre 500 L P 0 35 formamide d unit s C e M molarit du cation e Fraction GC fraction de G et C form pourcentage de formamide dans l chantillon e L nbre de paires de bases e P pourcentage de discordance Conversion ug MI et poids mol culaire partir du test Ol
24. de cellules est activ e Thermo Scientific Gestion des tests stock s L instrument utilise des fichiers de m thode de test qui contiennent toutes les valeurs des param tres n cessaires pour ex cuter un test notamment les param tres d alignement du changeur de cellule et des accessoires install s Apr s avoir d fini les param tres d un test vous pouvez sp cifier un nom de test unique et enregistrer le test Vous pouvez ensuite restaurer le test et l ex cuter sans avoir red finir ses param tres Lorsque vous mettez l instrument hors tension le test en cours est assur par la batterie de secours Lorsque vous remettez l instrument sous tension l alignement du porte cellules et les valeurs de tous les param tres sont les m mes que lors de la derni re utilisation de l instrument Si vous chargez un test enregistr les valeurs de tous les param tres de ce test remplacent les valeurs courantes des param tres de test Mot de passe logiciel Ce mot de passe vous permet de verrouiller les configurations de test param tres de test afin qu elles ne puissent pas tre cras es ni supprim es Il vous permet galement de lever la s curit afin de modifier les param tres de test Pour plus d informations sur le verrouillage d un test reportez vous la section Verrouillage d verrouillage Remarque Ce mot de passe ne peut pas tre modifi Mot de passe 4363797 Remarque Les tests stock s sur u
25. la page 37 Create Test Nane 1 42pm 7Aug09 Include as a SmartStart test Do not include as a SmartStart test Press T or L to select Press ENTER Press ESC to exit ress or to select character ress ccept Name to save the test 6 Mettez en surbrillance l option SmartStart appropri e puis appuyez sur Enter Entr e pour enregistrer le test Chargement des fichiers de test Vous pouvez charger les fichiers de test via la m moire interne partir de l cran Utility Utilitaire Pour charger les fichiers de test 1 Pour acc der tous les fichiers de test appuyez sur Utility Utilitaire 2 Mettez en surbrillance Stored Tests Directory R pertoire des tests stock s puis appuyez sur Enter Entr e 34 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific Utility Test Directory DNA 260 230 DNA with Scan 260 280 Read only DNA with Scan 260 230 Read only dsDNA Read only ssDNA RN Read only Oligos Centered factor Read only Oligos calc factor Read only Direct UV 260 Protein Tests Bradford Standard Bradford Micro Loury Standard Read only Read only Read only Read only 6 Gestion des tests stock s Verrouillage d verrouillage ore tests ress or to select test Remarque Pour afficher les tests stock s pour un type de test donn appuyez sur Test s lectionnez un type de test puis appuyez sur Stored Tests Tests stock s
26. s lectionnez le temps d intervalle et la dur e d ex cution totale en cons quence Pour commencer appuyez sur le bouton Test mettez en surbrillance Kinetics Cin tique puis appuyez sur Enter Entr e Rappel d un test Pour rappeler un test 1 Dans l cran Kinetics Cin tique appuyez sur Stored Tests Tests stock s 2 Mettez en surbrillance le test rappeler puis appuyez sur Enter Entr e Kinetics ef Wavelength Correction Delay Time min sec Interval Time min sec 0 01 Total Run Time hr min sec 0 05 00 ah Blank Once isplay Result Rate Factor On More parameters ress f or to select item to change CT TEST Tests Test Cet cran vous permet d effectuer les t ches suivantes e Configuration des param tres de test e Configuration de la correction de cellules e Enregistrement d un test e Affichage de la liste des tests stock s e Mesure d un blanc e Mesure d chantillons Configuration des param tres de test Pour configurer les param tres de test 1 Dans l cran Kinetics Cin tique mettez en surbrillance le param tre souhait 90 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 20 cin tique Configuration des param tres de test Kinetics ef Wavelength Correction Delay Time min sec Interval Time min sec Total Run Time Chr min sec Aie Blank isplay Result Rate Factor More parameters
27. surbrillance le point de donn es appropri dans le tableau Appuyez sur Start Time Heure de d but ou End Time Heure de fin pour afficher le taux et le r sultat recalcul s 96 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific Bio tests L instrument vous permet d effectuer une multitude de tests courants visant caract riser les chantillons dans le laboratoire des sciences de la vie Ces tests sont class s dans les cat gories suivantes Quantification et puret des acides nucl iques Quantification des prot ines e Analyse de la croissance des cellules e Calculs des param tres des oligonucl otides Les param tres par d faut des bio tests d crits dans ce chapitre sont d finis en usine toutefois ces param tres peuvent tre facilement modifi s pour r pondre aux besoins de votre laboratoire Pour modifier les param tres indiquez un autre nom pour le test et enregistrez les nouveaux param tres Pour commencer appuyez sur Test Dans l cran Test Types Types de test mettez en surbrillance Bio Tests Bio tests puis appuyez sur Enter Entr e La liste des cat gories de bio tests s affiche Bio Tests 16 14 21Feb07 ucleic cid Tests Protein Tests Cell Growth Oligo Calculator Start Tests Tests ATC Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 97 21 Bio tests Fonction SmartStart Tableau des param tres Vous trouverez la liste des param tres utilis s pour chaque
28. tres configur s appuyez sur Run Test Ex cuter le test Installez le blanc et les chantillons Si un porte cellules 6 positions est install placez le blanc dans la position B Le porte cellules peut accueillir cinq chantillons Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Si un porte cellules 6 positions est install celui ci passe sur la position B pour mesurer le blanc et revient ensuite sur sa pr c dente position Une fois la liste des longueurs d onde et des facteurs affich e appuyez sur Measure Samples Mesurer les chantillons pour mesurer et afficher l absorbance pour chaque longueur d onde Si vous avez param tr le mode de mesure sur Concentration Factor Concentration facteur la concentration calcul e pour chaque longueur d onde s affiche galement Si un porte cellules 6 positions est install appuyez sur Cell Position Position de cellule pour repositionner le porte cellules et mesurer manuellement les autres chantillons 68 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific SH Rapport d absorbance L application Absorbance Ratio Rapport d absorbance vous permet de mesurer le rapport d absorption de deux longueurs d onde diff rentes La correction de longueur d onde de r f rence est disponible pour carter les effets d une matrice d chantillon G n ralement utilis avec les applications de contr le qualit l application de rapport d absorbance offre un test de
29. tres de test 1 Mettez en surbrillance le param tre souhait 2 Pour configurer chaque param tre appuyez sur Enter Entr e puis s lectionnez une valeur ou saisissez les valeurs l aide du clavier num rique 3 Une fois les param tres configur s appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test sous un nouveau nom ou sur Run Test Ex cuter le test pour commencer mesurer le blanc et les chantillons Mesure de l chantillon Thermo Scientific Vous pouvez mesurer les chantillons automatiquement ou l aide du porte cellules position unique Mesure de standards automatique option Auto 6 ou Auto 3 Pour mesurer automatiquement les standards 1 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Placez le blanc et les chantillons dans les positions de cellule appropri es Manuel d utilisation du BioMate 3S 125 21 Bio tests Mesure des prot ines Protein Conc 280 Test Name Protein Conc 2 11 48 4fpr08 Abs Protein IDH 280nm mg mL Insert blank into position B Insert sample 1 into position 1 Press ENTER to measure 3 Appuyez sur Enter Entr e L instrument mesure le blanc puis les chantillons et affiche leur absorbance et leur concentration Protein Conc 280 Test Name Protein Conc Abs Protein IDH 280nm mg mL Sample Vous pouvez utiliser cet cran pour e Mesurer des chantillons suppl mentaires appuyez sur Measure Sample Mes
30. Graph Permet de manipuler le graphique Modifier le graphique Scanning Balayage Edit Scale Permet de modifier les chelles des axes du graphique et Modifier l chelle d afficher chaque point de donn es Scanning Balayage Factor Facteur Permet de saisir un facteur pour la conversion d une r f rence en r sultat Abs x Facteur 1 R sultat de concentration Abs min x Facteur 2 R sultat cin tique Peut tre saisi ou calcul partir des valeurs de concentration et d absorbance en mode ADV A T C ATC avanc Factor 1 Facteur 1 Manuel d utilisation du BioMate 3S Permet de saisir un facteur pour la conversion d une r f rence en r sultat Abs LO1 x Facteur R sultat Tests Abs Ratio Rapport d absorbance Abs Diff Diff rence d absorbance Multiwavelength Longueurs d onde multiples Thermo Scientific Thermo Scientific Param tre Factor 2 Facteur 2 24 Param tres Description Permet de saisir un facteur pour la conversion d une r f rence en r sultat Abs LO2 x Facteur R sultat Tests Abs Ratio Rapport d absorbance Abs Diff Diff rence d absorbance Multiwavelength Longueurs d onde multiples Factor 3 31 Facteur 3 31 Permet de saisir un facteur pour la conversion d une r f rence en r sultat Abs LO3 31 x Facteur R sultat Tests Multiwavelength Longueurs d onde multiples Graph Graphique Affiche le graphique des donn es recu
31. Ouvrez la porte du compartiment chantillons et laissez la reposer sur sa charni re 2 Ins rez avec pr caution et d une main le porte cellules dans le compartiment chantillons en le mettant bien droit Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 19 3 Accessoires Porte cellules et accessoires des porte cellules Figure 1 Porte cellules 6 positions Vis serrage main imperdable 8e Figure 2 Porte cellules position unique Vis serrage main imperdables Porte cellules position unique Trou de la broche d alignement 3 Serrez de l autre main la ou les vis imperdables 4 Refermez la porte du compartiment chantillons 20 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 3 Accessoires Porte cellules et accessoires des porte cellules Remarque Si le porte cellules n est pas correctement align vous ne pourrez pas serrer les vis serrage main Retrait du porte cellules 6 positions et du porte cellules position unique Pour retirer le porte cellules 6 positions et le porte cellules position unique 1 Ouvrez la porte du compartiment chantillons et laissez la reposer sur sa charni re 2 Desserrez d une main la vis imperdable 3 Tirez avec l autre main le porte cellules vers le haut et d gagez le du compartiment chantillons 4 Refermez la porte du compartiment chantillons Installation de porte cellules accessoires Assurez vous qu
32. Tests stock s 2 Mettez en surbrillance le test rappeler puis appuyez sur Enter Entr e Pour d finir les param tres d une courbe standard 1 Placez les standards dans leurs positions de cellule 2 D finissez les param tres de mesure des standards Pour la liste compl te reportez vous la section Param tres la page 155 a Renseignez les champs Test Name Nom de test Wavelength Longueur d onde 82 Manuel d utilisation du BioMate 3S Reference Wavelength Correction Correction de longueur d onde de r f rence et Reference Wavelength Longueur d onde de r f rence Renseignez les champs Curve Fit Adaptation de la courbe Units Unit s et Sample Positioner Positionneur d chantillons Renseignez les champs Number of Standards Nombre de standards et Number of 2 Samples Nombre d chantillons Saisissez les limites inf rieures et sup rieures Renseignez les champs Statistics Statistiques et AutoPrint Impression auto Lancez la correction de cellules Thermo Scientific 19 Mesures de concentration Application Standard Curve Courbe standard Mesure des standards d une courbe standard Mesure des standards d une courbe standard Pour mesurer automatiquement les standards option Auto 6 ou Auto 3 1 Installez le blanc et les standards 2 Lorsque les param tres sont corrects appuyez sur Run Standards Ex cuter les standards Standard Curve 15 39 4Feb02 Test Nam
33. assurer qu il choue bien chaque fois e Assurez vous que tous les filtres en cours d utilisation sont d finis pour mesurer la lumi re diffus e aux longueurs d onde sp cifiques e V rifiez que les filtres sont plac s dans les positions de cellule appropri es e Pour plus d informations sur le d pannage contactez votre repr sentant commercial ou votre repr sentant du service apr s vente local ou contactez nous vous trouverez nos coordonn es au d but de ce document Manuel d utilisation du BioMate 3S 147 22 V rification des performances Imprimante interne Imprimante interne Ce test vous permet de v rifier que l imprimante interne fonctionne correctement Vous devez avoir install une imprimante interne pour pouvoir ex cuter ce test L ex cution de ce test ne vous prend pas plus de 20 secondes apr s avoir appuyez sur Stop Arr t R 1 Pour ex cuter le test Internal Printer Imprimante interne Dans l cran Utility Utilitaire v rifiez que l imprimante interne est correctement install e et s lectionn e Si n cessaire appuyez sur Utility Utilitaire puis s lectionnez l imprimante interne Dans l cran Performance Verification V rification des performances mettez en surbrillance Internal Printer Test Test de l imprimante interne Appuyez sur Enter Entr e Performance Verification 16 57 2Mar07 Internal Printer Test Press Start Test to start printer test
34. cellules et mesurer les autres chantillons manuellement Lorsque l instrument a mesur tous les chantillons l cran Standards indique l absorbance et la concentration de chaque chantillon Modification d une courbe standard Vous pouvez modifier la concentration d un standard d une courbe standard En outre vous pouvez modifier le nombre de standards s lectionner une autre adaptation de courbe ou supprimer des points de la courbe Standard Cur 11 31am 21Jan01 Test Name STANDARDCURUE Edit Concentration Add Standard Delete Clear Measurements Reset Standards Press T or to select Press ENTER Curve Fit Linear Slope 0 002877 Std Dev 0 017 Intercept 0 002364 Corr Conis 0 985 Page 1 of 0 Standards L Press f or to view data lt Pour modifier la concentration d un standard 1 Une fois la courbe standard affich e mettez en surbrillance le standard modifier puis appuyez sur Edit Standards Modifier les standards 2 Mettez en surbrillance Edit Concentration Modifier la concentration puis appuyez sur Enter Entr e 3 Appuyez sur Edit Conc Modifier la conc ou sur une touche num rot e 4 Saisissez la valeur de concentration dans le champ Entry Saisie 5 Appuyez sur Enter Entr e 86 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 19 Mesures de concentration Application Standard Curve Courbe standard Modification d une courbe standard Pour ajouter un standard
35. ci apr s Remarque Si la correction de cellules est activ e ON vous devez d abord ex cuter l application de configuration de la correction pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons Remarque Si l option Auto Save Data Enregistrement auto des donn es est activ e ON vous devez d abord saisir un nom de fichier de donn es pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons Ajout de longueurs d onde et de facteurs 66 Remarque Vous ne pouvez saisir des facteurs que lorsque le mode de mesure est param tr sur Concentration Factor Concentration facteur Pour ajouter des longueurs d onde et des facteurs 1 Appuyez sur Set nms D finir Nm Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 15 Longueurs d onde multiples Prise de mesures Multiwavelength Test Name WLH nm Factor 1 340 0 56 85 2 532 0 630 8 3 633 0 0 052 age 1 ress or to vieu data 2 Mettez en surbrillance une position qui correspondra la premi re paire longueur d onde facteur 3 Appuyez sur Add nm Ajouter Nm 4 Saisissez une valeur pour la longueur d onde et le facteur puis appuyez sur Enter Entr e 5 Lorsque les valeurs sont correctes appuyez sur Add nm Ajouter Nm 6 Poursuivez jusqu ce que vous ayez saisi des valeurs pour toutes les longueurs
36. classiques de 260 Nm et 280 Nm Cette m thode de test r alise une mesure de l absorption de longueur d onde fixe 260 Nm et 280 Nm et d termine la concentration des acides nucl iques en multipliant l absorbance 260 Nm par un facteur 50 par d faut La puret est bas e sur le rapport 260 280 Une correction de longueur d onde de r f rence est disponible pour corriger un d calage de spectre de fond 320 Nm par d faut Un utilitaire de facteur de dilution peut tre utilis pour calculer la concentration de la solution m re ADN ARN 260 230 Ce test est destin d terminer la fois la concentration et la puret des acides nucl iques en pr sence de ph nol qui absorbe consid rablement 230 Nm Cette m thode de test r alise une mesure de l absorption de longueur d onde fixe 260 Nm et 230 Nm et d termine la concentration des acides nucl iques en multipliant l absorbance 260 Nm par un facteur 50 par d faut La puret est bas e sur le rapport 260 230 Une correction de longueur d onde de r f rence est disponible pour corriger un d calage de spectre de fond 320 Nm par d faut Un utilitaire de facteur de dilution peut tre utilis pour calculer la concentration de la solution m re ADN ARN avec balayage 260 280 Ce test est destin d terminer la fois la concentration et la puret des acides nucl iques l aide des longueurs classiques de 260 Nm et 280 Nm Cette m thode de test mesure l
37. dans un graphique et non dans un tableau 1 Une fois la courbe standard modifier affich e dans un graphique appuyez sur Change Fit Changer d adaptation Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 87 19 Mesures de concentration Application Standard Curve Courbe standard Modification d une courbe standard Standard Curve 16 21 4Feb02 Name AMMONIA BLANK Linear Through Zero Linear Regr 2nd Order Linear Regr 3rd Order Linear Regr 4th Order Segmented Press f or 4 to select Press ENTER 0 1 ppm 0 538 Curve Fit Linear Slope 0 6091 Std Dev 0 011 Intercept 0 01272 Corr Coeff 0 995 Oo T T T 2 Mettez en surbrillance l adaptation de courbe utiliser pour la courbe standard puis appuyez sur Enter Entr e L instrument applique l adaptation de courbe s lectionn e aux donn es et affiche la nouvelle adaptation 88 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific Cin tique L application Kinetics Cin tique vous permet de mesurer le changement d absorbance d chantillon en terme de dur e Le logiciel de contr le local permet de d terminer un taux lin aire pour une r gion donn e Ce taux peut tre d fini apr s l acquisition des donn es Fr quemment utilis dans le domaine de la cin tique enzymatique un facteur peut tre multipli par la pente d adaptation du taux lin aire pour d terminer l activit Le contr le logiciel par ordinateur vous pe
38. de test et Edit Units Modifier Unit s Permet de retirer une longueur d onde et un facteur de la liste tests Multiwavelength Longueurs d onde multiples et certains tests Performance Verification V rification des performances Diluent Volume Permet de saisir le volume de diluant ajout avant la mesure Volume de diluant multiplicateur de dilution pour certains bio tests Dilution Multiplier Permet d afficher le facteur utilis pour corriger la dilution Multiplicateur de d chantillon dilution Manuel d utilisation du BioMate 3S 157 24 Param tres 158 Param tre Display Activity Afficher l activit Description Permet d indiquer si les r sultats doivent int grer la concentration des prot ines DNA e 260 ADN 260 Permet de calculer le coefficient d extinction DNA Factor Permet de saisir le facteur utilis pour calculer la concentration Facteur d ADN d ADN Bio tests DNA ADN Edit Modifier Permet de modifier une longueur d onde ou un facteur de la liste Tests Multiwavelength Longueurs d onde multiples et certains tests Performance Verification V rification des performances Edit Curve Permet de manipuler le graphique Modifier la courbe Kinetics Cin tique Edit Data Permet de s lectionner une partie des donn es d un tableau Modifier les donn es pour recalculer un r sultat Kinetics Cin tique et Scanning Balayage Edit
39. des Y de fa on ce que toutes les donn es apparaissent sur le trac Pour utiliser le bouton Cursor Curseur 1 Une fois vos donn es de balayage repr sent es sur l cran de modification de l chelle appuyez sur Cursor Curseur Scanning 13 36 20Jun02 Test Name Filter BLANK 0 730 Yave length 500 Yave length Abs 415 2 Appuyez sur Cursor pour modifier la valeur de longueur d onde minimale souhait e Appuyez sur Set Min X D finir X mini pour redessiner le trac en fonction de la nouvelle valeur de longueur d onde minimale Manuel d utilisation du BioMate 3S 59 14 Acquisition Affichage et manipulation des donn es du balayage 3 Appuyez sur Cursor et sur Set Max X pour d finir la nouvelle longueur d onde maximale Pour utiliser la fonction Manual Scale Mise l chelle manuelle 1 Appuyez sur Manual Scale Mise l chelle manuelle pour afficher les options de mise l chelle manuelle Scanning 9 01 15Feb02 Test Name FILTER BLANK 2 220 Yave length 500 0 IDH 1 Baseline collected 15Feb02 2 Pour d finir la valeur minimale et maximale de l axe des X ou des Y appuyez sur Min Y Y mini Max Y Y maxi Min X X mini ou Max X X maxi 3 Saisissez la valeur appropri e puis appuyez sur Min Y Y mini Max Y Y maxi Min X X mini ou Max X X maxi pour accepter la valeur L instrument redessine le trac en fonction des valeurs minimales et maximales saisies R a
40. des unit s de base Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific Fonction calculatrice Ke Le 1 Thermo Scientific Pour utiliser la fonction calculatrice Dans le menu Utility Utilitaire mettez en surbrillance Calculator Calculatrice puis appuyez sur Entr e Utilisez le clavier num rique pour saisir la valeur souhait e Appuyez sur la fonction souhait e x ou Saisissez la deuxi me valeur souhait e puis appuyez sur Entr e Remarque Vous ne pouvez additionner soustraire multiplier ou diviser que deux lignes de chiffres la fois Utility 9 23am 14Mar07 Software R Instrument Manuel d utilisation du BioMate 3S 4y 9 Fonction calculatrice 42 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific ES ER Mesures d absorbance et de pourcentage de transmittance ATC de base Le mode Basic ATC ATC de base met l instrument en mode mesure instantan e Il suffit l utilisateur de se rendre c t de l instrument d ins rer un chantillon et de mesurer celui ci Selon que le mode est param tr sur Absorbance A Transmittance T ou Concentration le r sultat s affiche ainsi que le type de mesure la date et l heure la longueur d onde et la position de cellule utilis e pour la mesure Pour basculer entre le mode Absorbance Transmittance et Concentration appuyez sur Change Mode Changer de mode Vous pouvez basculer d un mode l autr
41. e par les interactions avec des groupes d acides amin s charg s positivement dans la prot ine Par cons quent le complexe interagit essentiellement avec les r sidus basiques de la prot ine comme l histidine l arginine et la lysine et moindre ampleur avec la tyrosine le tryptophane et la ph nylalanine Manuel d utilisation du BioMate 3S 115 21 Bio tests Mesure des prot ines Pierce micro BCA Micro m thode BCA de Pierce Ce test est une formulation d acide bicinchoninique compatible aux d tergents qui permet la d tection colorim trique et la quantification totale des prot ines Adaptation du test BCA la micro m thode BCA a t optimis e pour tre utilis e avec des chantillons de prot ines dilu es 0 5 ug ml 20 pg ml La m thode pr programm e utilise une longueur d onde d analyse de 562 Nm et int gre des standards pr programm s dont la plage de concentration se situe entre 0 2 ug ml et 200 ug ml Biuret Le test de Biuret est similaire au test de Lowry toutefois il implique une seule incubation et n cessite une plus grande quantit de prot ines pour l analyse Pendant le test un complexe de coloration pourpre mesur 545 Nm se forme en pr sence de prot ines La courbe d talonnage est lin aire pour ce test et se compose de standards dont la plage de concentration se situe entre 2 pg ml et 10 pg ml Protein Conc 280 Conc de prot ines 280 Cette m thode directe qui permet
42. effectuer une remise l chelle et un recalcul Une fois les donn es cin tiques collect es vous pouvez utiliser toutes les donn es pour le calcul du taux ou s lectionner des heures de d but et de fin sp cifiques Lorsque vous modifiez les heures de d but et de fin ou que vous s lectionnez toutes les donn es l instrument recalcule et affiche le nouveau taux de r action et le nouveau r sultat Dans l cran de modification vous pouvez e Utiliser toutes les donn es pour recalculer les r sultats e S lectionner des heures de d but et de fin sp cifiques pour le calcul du taux et recalculer les r sultats Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 95 20 Cin tique Remise l chelle et recalcul des r sultats cin tiques affich s dans un tableau Ke Kinetics 12 57 30Jan01 Test Name KINETICS Cell 1 HH MM SS bs Delta Lin 0 0 0 0 0 0 0 IDH min bs Result 1 0 000 0 013 Press f or for more data data Graph Time Time data Pour utiliser toutes les donn es en vue de calculer le taux de r action Une fois le tableau des donn es cin tiques affich sur l cran de modification appuyez sur Use All Data Utiliser toutes les donn es L instrument calcule et affiche le taux Pour s lectionner des heures de d but et de fin sp cifiques pour le calcul du taux Une fois le tableau des donn es cin tiques affich sur l cran de modification mettez en
43. f rence soustraite des valeurs d absorbance tablies Un utilitaire de facteur de dilution peut tre utilis pour calculer la concentration de la solution m re ADNSsb Ce test simple est destin valuer la quantification de l ADN simple brin Avec cette m thode la concentration d ADNSsb est d termin e en multipliant l absorbance 260 Nm par un facteur 33 par d faut Un utilitaire de facteur de dilution peut tre utilis pour calculer la concentration de la solution m re ARN Ce test simple est destin valuer la quantification d ARN Avec cette m thode la concentration d ARN est d termin e en multipliant l absorbance 260 Nm par un facteur 40 par d faut Un utilitaire de facteur de dilution peut tre utilis pour calculer la concentration de la solution m re Oligonucl otides facteur saisi Ce test simple est destin valuer la quantification des oligonucl otides courts d une longueur de 40 bases maximum Avec cette m thode la concentration des oligonucl otides est d termin e en multipliant l absorbance 260 Nm par un facteur 38 par d faut Ce facteur peut tre facilement remplac par un facteur de concentration connu Un utilitaire de facteur de dilution peut tre utilis pour calculer la concentration de la solution m re Oligos Oligonucl otides facteur calc Mesure l absorbance 260 Nm et calcule la concentration d oligonucl otides calcule la concentration en fo
44. fichiers de test nnn d fendant nat aa atte 34 Verrouillage d verrouillage ess atlas tute date deb D Ee ES 35 Suppression d un test sus rames Ga ie are s an 35 SmartStart ceecee Lt D tent tra te 37 Unit s de concentration escargot 39 D finition des unit s de concentration 2 4eme eue 39 Cr ation d unit s personnalis es Es LAS ELA SU DAS DANS EN 40 Fonction calculatrice 5 22 8eme ua nn gite en au aura m Mesures d absorbance et de pourcentage de transmittance ATC de base43 R glage de la longueur d ondes sise screen can dent ais 44 Mes re dun biens ne rs e de da E a aE Da 44 Thermo Scientific Thermo Scientific Chapitre 11 Chapitre 12 Chapitre 13 Chapitre 14 Chapitre 15 Table des mati res Mesure d chantill ns sean ul tels es tt AA 44 Mesures d absorbance et de pourcentage de transmittance ATC avanc 45 Rappel d un tests ue pes DA dre ee eme date 45 Configuration des param tres d teste 2h h ane en en nn ed 46 PISE AE mesures PR La SR DO DT D AA AA Ar AN 46 Mesures de concentration de base ATC de base 41 Mesures de concentration de bases faut def os unuara 47 Configuration de la longueur d onde et du mode 48 Utilisation de l option Conc Std Conc st pour mesurer la concentration 48 Utilisation de l option Conc Factor Conc facteur pour mesurer la COEUR San Ted Man ADR RSS ue E TA te 49 Mesure d chantillons 50 Mesures de concent
45. finies Pour ex cuter le test Photometric Accuracy Pr cision photom trique Appuyez sur Start Test Lancer le test Les r sultats indiquent la r ussite ou l chec du test pour chaque longueur d onde Performance Validation 11 44 15Feb02 Photometric ccuracy H nm Expected Tol Meas AT z T AT Result 1 590 0 10 1 ERDA CEE 2 590 0 9 4 1 2 9 4 Pass Place Standards 1 2 in positions 1 2 Press Start Test or Press ESC to save test to bs Std Std Test En cas d chec du test suivez les recommandations ci dessous e R p tez le test deux fois pour vous assurer qu il choue bien chaque fois e Suivez les recommandations fournies avec la documentation de r f rence du standard e Pour plus d informations sur le d pannage contactez votre repr sentant commercial ou votre repr sentant du service apr s vente local ou contactez nous vous trouverez nos coordonn es au d but de ce document Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 145 22 V rification des performances Bruit Bruit Ce test mesure la quantit de bruit 340 Nm Tous les param tres de ce test sont d termin s par les caract ristiques de l instrument et ne peuvent pas tre modifi s par l utilisateur Lors de l ex cution du test de bruit n oubliez pas les points suivants Effectuez la mesure OA avec le porte cellules vide Vous pouvez ventuellement effectuer la mesure 2A avec un filtre 2A Pour ex cuter le test Noi
46. longueur d onde Ce test mesure la capacit du spectrophotom tre revenir une longueur d onde identique de fa on r p t e Ce test utilise la lampe au x non interne Les lampes au x non ont une forte ligne fondamentale 529 nm Cette ligne qui est une propri t essentielle du x non sert de standard fondamental Lorsque vous ex cutez le test standard interne rappelez vous que Les longueurs d onde et les valeurs de tol rance sont pr configur es et ne peuvent pas tre modifi es e Le porte cellules doit tre vide Pour ex cuter le test de r p tabilit de longueur d onde 1 Mettez en surbrillance Wavelength Repeatability R p tabilit de longueur d onde puis appuyez sur Entr e 2 Appuyez sur Start Test Lancer le test Les r sultats indiquent la r ussite ou l chec du test pour chaque longueur d onde Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 141 22 V rification des performances R solution Lor Tornanco Verification 16 33 2Mar07 avelength Repeatability inimum Maximum Peak to Peak Result 29 2 529 3 0 1 Pass ake sure the Blank position is empty ress Start Test ooo oo o d Tee Test En cas d chec du test suivez les recommandations ci dessous e R p tez le test deux fois pour vous assurer qu il choue bien chaque fois e Pour plus d informations sur le d pannage contactez l assistance technique R solution Ce test mesure la capacit du spec
47. measure Oo T T S Installez le blanc et les chantillons Appuyez sur Enter Entr e Pour prendre manuellement des mesures option Manual 6 Manuel 6 ou Single Cell Holder Porte cellules position unique Appuyez sur Run Test Ex cuter le test 3 Point Net 9 26 4Feb02 Test Name 3_PTNET Cell 1 Abs bs bs Result IDH 630 0 660 0 680 0 pg mL Bo o EE Blank Manuel d utilisation du BioMate 3S 79 18 M thode 3 points Prise de mesures 2 Installez le blanc et les chantillons Si un porte cellules 6 positions est install placez le blanc dans la position B Le porte cellules peut accueillir cinq chantillons 3 Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Si un porte cellules 6 positions est install celui ci passe sur la position B pour mesurer le blanc et revient ensuite sa position de cellule 4 Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Si un porte cellules 6 positions est install appuyez sur les boutons de changement de cellule pour repositionner le porte cellules et mesurer les autres chantillons manuellement 80 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific A Mesures de concentration Application Standard Curve Courbe standard L application Standard Curve Courbe standard vous permet d effectuer une exp rience d analyse quantitative l aide d une courbe d talonnage multipoint Une courbe d talonnage se compose de standards de concentration bien
48. nL Add Standard pes e Delete Standard 1 25 00 Reset Standards 2 50 00 3 250 0 Press T or L to select 4 500 0 Press ENTER 5 750 0 age 1 of 2 Standards 1 5 ress f or to vieu data Mesure des standards en vue de la pr paration d une courbe standard Thermo Scientific Vous pouvez mesurer les chantillons automatiquement ou l aide du porte cellules position unique Mesure automatique des standards option Auto 6 ou Auto 3 Pour mesurer automatiquement les standards 1 Dans l cran Standards appuyez sur Measure Standards Mesurer les standards 2 Placez le blanc et les standards dans les positions de cellule appropri es conform ment aux instructions affich es l cran Coomassie Bradford Std Test Name Bradford Std Std Conc Abs pg mL 595nm Insert blank into position B Insert standards 1 5 into positions 1 5 Press ENTER to measure Manuel d utilisation du BioMate 3S 119 3 Appuyez sur Enter Entr e Lorsque le blanc et les standards ont t mesur s l cran Standards indique l absorbance de chaque standard ainsi que la pente le point d intersection et le coefficient de corr lation de la courbe standard Coomassie Bradford Std Test Name Bradford Std Std Conc Abs py mL Curve Fit a2 8E 07 ai a a0 0 0015 Std Dev 4 47E 04 Standards 1 L talonnage est termin Vous pouvez utiliser cet cran pour e Modifier les standar
49. positions B 2 et 4 Porte cellules cylindrique de longueur de trajet de 50 mm Idd OI installer dans les positions B 2 et 4 Porte cellules rectangulaire de longueur de trajet de 100 mm 16 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 3 Accessoires Porte cellules et accessoires des porte cellules Syst me de changeur de cellule Syst me cellule unique Impossible d utiliser des cellules de longueur de trajet de 100 mm avec un positionneur de cellules Porte cellules cylindrique de longueur de trajet de 100 mm Impossible d utiliser des cellules de longueur de trajet de 100 mm avec un positionneur de cellules S gt Porte film filtre fins installer dans les positions B 2 et 4 Porte filtre lentille r glable installer dans les positions B 2 et 4 Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 17 3 Accessoires Porte cellules et accessoires des porte cellules Syst me de changeur de cellule Syst me cellule unique Syst mes combinatoires non applicable installer dans les positions B 2 et 4 Initialisation du porte cellules 18 Lorsque vous appuyez sur Run Test Ex cuter le test pour effectuer une mesure l instrument affiche le message Calibrating and Checking Turret Please Wait Calibrage et v rification de la tourelle veuillez patienter lorsqu il tente d initialiser le changeur de cellule sur la
50. pour mesurer un blanc ou des chantillons Remarque Si la correction de cellules est activ e ON vous devez d abord ex cuter l application de configuration de la correction pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons Remarque Si l option Auto Save Data Enregistrement auto des donn es est activ e ON vous devez d abord saisir un nom de fichier de donn es pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons 74 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 17 Diff rence d absorbance Mesure d chantillons Mesure d chantillons Absorbance Difference 13 29 14Feb02 Test Name TEST 9 BLANK Abs Abs Result Abs ID 429 0 630 0 Ref UL ppm Insert samples 1 5 into positions 1 5 Press ENTER to measure Oo T T S R Le Pour mesurer automatiquement les chantillons option Auto 6 ou Auto 3 1 Dans l cran Absorbance Difference Diff rence d absorbance appuyez sur Run Test Thermo Scientific Ex cuter le test Installez le blanc et les chantillons Appuyez sur Enter Entr e Pour mesurer manuellement les chantillons option Manual 6 Manuel 6 ou Single Cell Holder Porte cellules position unique Dans l cran Absorbance Difference Diff rence d absorbance appuyez sur Run Test Ex cuter le test Installez le blanc et les
51. pr programm s pour ce test se situe entre 1 ug ml et 1500 ug ml BCA Standard M thode standard BCA Ce test brevet par Pierce Biotechnology qui fait partie de Thermo Fisher Scientific reste un test fondamental car il permet de mesurer avec pr cision la concentration de prot ines dans des chantillons biologiques Il combine la r duction bien connue de Cu Cul par prot ine dans un milieu alcalin la d tection colorim trique ultrasensible et s lective du cation cuivreux Cu par l acide bicinchoninique BCA Le complexe BCA de coloration pourpre peut tre mesur n importe quelle longueur d onde entre 550 Nm et 570 Nm avec une perte de signal minimale Alors que ce test est lin aire sur une large plage de concentration les courbes d talonnage sont repr sent es au mieux sous la forme de courbes de deuxi me ordre La m thode pr programm e utilise une longueur d onde d analyse de 562 Nm et int gre des standards pr programm s dont la plage de concentration se situe entre 25 ug ml et 2000 pg ml Pierce 660 nm Le Pierce 660 nm Protein Assay utilise un complexe teinture m tal exclusif qui se lie aux prot ines dans des conditions d acidit provoquant un d calage du maximum d absorption de la teinture qui est mesur e 660 nm Le complexe teinture m tal est brun rouge et devient vert lorsque les prot ines se lient Ce changement de couleur est d la d protonation de la teinture pH faible facilit
52. revenir l cran pr c dent Permet de supprimer le dernier caract re saisi Manuel d utilisation du BioMate 3S 3 1 Pr sentation du spectrophotom tre Porte cellules Touche ou bouton Fonction e Permet de valider les valeurs mises en surbrillance saisies ou s lectionn es e Permet de passer au param tre ou l cran suivant e Permet de lancer l impression de la m thode ou des r sultats sur l imprimante s lectionn e e Si l option PC est s lectionn e pour l imprimante permet d envoyer la m thode ou les r sultats vers le port USB e Permet d afficher un menu des applications logicielles Permet d afficher l cran Utility Utilitaire e Permet de contr ler l emplacement du curseur e Permet de mettre en surbrillance la valeur ou l option pour la s lection Permet de saisir des chiffres un point d cimal et un signe moins pour les valeurs 60000 e000 0000 0000 e Touches de changement de cellule e Permet de s lectionner la position du porte cellules mesurer e B blanc et 1 5 positions des chantillons A iti 7 ili i e positions en cas d utilisation du mode Auto 3 Porte cellules Votre instrument inclut un porte cellules 6 positions et un porte cellules position unique 4 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 1 Pr sentation du spectrophotom tre S lection et positionnement des cuves Porte cellules 6 pos
53. s affiche Ajout de standards Lorsque vous ajoutez un standard vous devez d finir chaque fois trois valeurs la longueur d onde l absorbance ou le pourcentage de transmittance et la valeur de tol rance Pour ajouter un standard 1 Appuyez sur Add Std Ajouter un standard puis saisissez la valeur de longueur d onde dans le champ Entry Saisie 2 Appuyez sur Enter Entr e ou sur Add nm Ajouter Nm pour ajouter la longueur d onde la liste 3 Saisissez la valeur d absorbance ou de pourcentage de transmittance pour la longueur d onde saisie dans le champ Entry Saisie 4 Appuyez sur Enter Entr e 5 Saisissez la tol rance pour la longueur d onde saisie dans le champ Entry Saisie 6 Appuyez sur Enter Entr e L cran de test affiche les valeurs que vous venez de saisir pour ce standard 7 Appuyez sur Start Test Lancer le test pour commencer la mesure ou sur Esc chap pour enregistrer le test 144 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 22 V rification des performances Pr cision photom trique Suppression de standards Pour supprimer un standard 1 Mettez en surbrillance le standard souhait 2 Appuyez sur Delete Std Supprimer le standard Ex cution du test Dans l cran Photometric Accuracy Pr cision photom trique assurez vous que les valeurs des longueurs d onde et d absorbance ou de pourcentage de transmittance et que les tol rances sont correctement d
54. test et des informations de r f rence dans le chapitre Param tres Vous pouvez utiliser cette liste en r f rence lors de la configuration des param tres Fonction SmartStart 98 La fonction SmartStart vous permet de s lectionner les m thodes que vous utilisez le plus fr quemment afin de les visualiser sur le premier cran qui s affiche lorsque vous mettez l instrument sous tension Si votre laboratoire n effectue qu un seul test utilisez SmartStart pour s lectionner ce test afin de le visualiser chaque fois que vous mettez l instrument sous tension De la m me fa on si vous avez plusieurs tests effectuer vous pouvez utiliser la fonction SmartStart pour s lectionner ces tests afin de visualiser la liste des tests d s que vous mettez l instrument sous tension Pour configurer un seul test l aide de la fonction SmartStart 1 Dans l cran Bio Tests Bio tests appuyez sur Stored Tests Tests stock s pour afficher la liste des tests disponibles 2 Mettez en surbrillance le test souhait 3 Appuyez sur Select Test S lectionner le test pour ajouter le test au menu SmartStart Une fl che gt indique le test s lectionn 4 Appuyez sur Load Test Charger le test pour afficher l cran des param tres du test Remarque ce stade vous pouvez mettre l instrument hors tension puis le remettre sous tension Lorsque l instrument red marre l cran de param tres du test s lectionn s affiche
55. un cas vous mesurez un standard et que dans l autre vous saisissez un facteur Configuration de la longueur d onde et du mode Pour configurer la longueur d onde et le mode 1 Appuyez sur Set nm D finir Nm ou sur n importe quelle touche num rot e pour configurer la longueur d onde 2 Saisissez la longueur d onde pour la prise des mesures puis appuyez nouveau sur Set nm D finir Nm 3 Appuyez sur Change Mode Changer de mode jusqu ce que le mode de mesure souhait Concentration with Standard Concentration avec standard ou Concentration with Factor Concentration avec facteur s affiche Utilisation de l option Conc Std Conc st pour mesurer la concentration Dans ce mode un chantillon standard dont la concentration est connue est utilis pour d terminer la concentration des chantillons La concentration des chantillons inconnus est d termin e de fa on ratiom trique partir du standard mesur La mesure peut tre exprim e math matiquement de la fa on suivante Concentration standard Concentration chantillon Abs T du standard Abs T d chantillon inconnu o la concentration standard est pr cis ment connue l absorbance et le pourcentage de transmittance du standard et de l chantillon inconnu sont mesur s et la concentration de l chantillon est calcul e Pour utiliser l option Conc Std Conc st pour mesurer la concentration 1 Si n cessaire appuyez sur Change Mode Change
56. vous voulez rappeler et appuyez sur Enter Entr e Les param tres du test s lectionn s affichent Cet cran vous permet d effectuer les t ches suivantes e Configuration des param tres de Test e Configuration de la correction de cellules Scanning Start Wavelength Stop Wavelength 500 Onm Sample Positioner Auto 6 Scan Speed Fast Interval 1 0nm Cell Correction Off IDH O 0FF 1 uto Print On uto Save Data Off ress f or to select item to change e Cu Tests Test Remarque Pour basculer entre l affichage dans un tableau et dans un graphique appuyez sur Graph Tabular Graphique tableau Configuration des param tres de Test Ke La 1 2 Pour configurer les param tres de test Mettez en surbrillance le param tre souhait Lorsque les param tres sont configur s appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test ou sur Run Test Ex cuter le test pour mesurer un blanc ou un chantillon Remarque Si la correction de cellules est activ e ON vous devez d abord ex cuter l application de configuration de la correction pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons 56 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 14 Acquisition Mesure d un balayage de spectre de fond Remarque Si l option Auto Save Data Enregistrement auto des donn es est activ e ON v
57. 1 Une fois la courbe standard affich e appuyez sur Edit Standards Modifier les standards 2 Mettez en surbrillance Add Standard Ajouter un standard 3 Saisissez la valeur de concentration du standard suppl mentaire dans le champ Entry Saisie 4 Appuyez sur Enter Entr e 5 Appuyez sur Measure Standards Mesurer les standards pour remesurer tous les standards Pour supprimer un standard 1 Une fois la courbe standard affich e mettez en surbrillance le standard supprimer puis appuyez sur Edit Standards Modifier les standards 2 Mettez en surbrillance Delete Standard Supprimer le standard puis appuyez sur Enter Entr e lt Pour effacer des mesures 1 Une fois la courbe standard affich e appuyez sur Edit Standards Modifier les standards 2 Mettez en surbrillance Clear Measurements Effacer les mesures puis appuyez sur Enter Entr e Toutes les mesures d absorbance sont supprim es de l cran lt Pour r initialiser les standards 1 Une fois la courbe standard affich e appuyez sur Edit Standards Modifier les standards 2 Mettez en surbrillance Reset Standards R initialiser les standards puis appuyez sur Enter Entr e Tous les standards et toutes les mesures sont supprim s de l cran Pour s lectionner une autre adaptation de courbe pour une courbe standard Remarque Pour modifier l adaptation de courbe pour une courbe standard vous devez afficher celle ci
58. 208 uuaeuus a 66 Suppression de longueurs d onde et de facteurs 67 Priseid TESTER o sose Mans Dee aa a a a a a Es 67 Manuel d utilisation du BioMate 3S v Table des mati res vi Chapitre 16 Chapitre 17 Chapitre 18 Chapitre 19 Chapitre 20 Chapitre 21 Manuel d utilisation du BioMate 3S Rapport d absorbance 69 Rappel d un tests sent ranlens Free esei aeiaai Ea His 69 Configuration des param tres de test 4 an ile sn la en nn AE 70 Mesure d chantillons sise anne rar a Red ae rate 71 Diff rence d absorbance 73 Rappel d un tests Ternir neted ea as Aaa et yi ai ia dre 74 Utilisation de l cran Absorbance Ratio Rapport d absorbance 74 Configuration des param tres de test is ta Ru tres 74 Mesure d chantillons ss 8 irese n es af nee dt As 75 M thode 3 points 171 Rappel d un testa noss turser eroian skas PE TT ET aaa aA 78 Configuration des param tres deteste en Rue at en ne 78 Prisede mesures AD RSA Ne at E Dao NRA Sur RL A 79 Mesures de concentration Application Standard Curve Courbe standard 81 Rappel d une courbe standard ses sauts fre tcate tel sata 4 etes danes 82 D finition des param tres d une courbe standard 82 Mesure des standards d une courbe standard 83 Utilisation d
59. 58 0 045 Conc Ratio pg mL 1 462 0 950 C T TE Sample Vous pouvez utiliser cet cran pour e Mesurer des chantillons suppl mentaires appuyez sur Measure Samples Mesurer les chantillons Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 105 21 Bio tests Tests des acides nucl iques Mesure d chantillons manuelle l aide d un porte cellules position unique Pour mesurer manuellement les chantillons 1 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Placez le blanc talon dans le porte cellules 3 Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc DNA RNA 260 280 15 55 26Mar08 Test Name DNA RNA 260 280 Abs Abs Abs IDH Z60nm Z80nm Ref UL Bo RE ES EE Blank 4 Retirez le blanc talon 5 Ins rez l chantillon 6 Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Vous pouvez utiliser cet cran pour e Mesurer des chantillons suppl mentaires appuyez sur Measure Samples Mesurer les chantillons ADN ARN avec balayage 260 280 et ADN ARN avec balayage 260 230 Le test d ADN ARN avec balayage int gre deux m thodes qui fonctionnent quasiment de la m me fa on La seule diff rence r side dans les longueurs d onde utilis es lors de l analyse Dans les deux cas un balayage est effectu entre 225 Nm et 325 Nm L un des tests mesure l absorbance 260 Nm et 280 Nm alors que l autre mesure l absorbance 260 Nm et 230 Nm La puret des acides nucl ique
60. A E 2 propos du clavier abus dede 3 Portecellules neni eane e a e e e a ee e 4 Porte cellules 6 positions 254 disshesdisines ae heenes ees 5 Porte cellules position que se hassan ARE ends 5 S lection et positionnement des cuyes n u uu ne das dis reparer 5 Dimensions res is die tennis E etre ini 6 Chapitre2 Configuration de l instrument 7 Saisie des valeurs de param tres Li PURES ENS Ne ARE 7 Saisie AUM FIQUE aatar a E pere tienne nie persan 7 S l ctio d s En Ad eee E stone aires 8 Bascule activation d sactivation dus creed ends ee dess 8 Saisie alphanum rique mesrine te bas ie ne ele 9 Configuration des param tres de l utilitaire 4 44 uriveseessnes 9 R glage de la date et de l heuie sessdiarissaets line this 10 Mode PASSES Rd a E ONR Ron not 11 Configuration du d lai d expiration du spectre de fond 12 R glage du contraste de l cran sis sens dise te messe tomes ei 12 Configuration de l imprimante interne 22e sine pete 13 D finition des param tres de l utilitaire de l imprimante 13 Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S iii Table des mati res Chapitre 3 Chapitre 4 Chapitre 5 Chapitre 6 Chapitre 7 Chapitre 8 Chapitre 9 Chapitre 10 iv Manuel d utilisation du BioMate 3S AGCeSSOIreS oane eee na ue nets abus A CRU ARE ue 15 Porte cellules et accessoires des porte cellules
61. BioMate 3S 39 8 Unit s de concentration D finition des unit s de concentration lt Pour s lectionner les unit s 1 Mettez en surbrillance Units Unit s puis appuyez sur Enter Entr e Advanced 2T C 10 09 14Feb02 Test Name ppm Measurement Mol ppb Wavelength g L Delay Time mi mg L Conc of Standa mg mL Factor pg mL Sample Positio More parameter Press T or to select Press ENTER Press f or to select item to change Al Ooo i dea O 2 Mettez en surbrillance l unit s lectionner puis appuyez sur Enter Cr ation d unit s personnalis es 40 Outre les unit s de concentration de base vous pouvez cr er une unit de concentration personnalis e et ajouter cette unit la liste Cette unit de concentration personnalis e peut tre modifi e le cas ch ant Remarque Une seule unit de concentration personnalis e la fois est disponible dans la liste Pour cr er des unit s personnalis es 1 Ouvrez la fen tre Units Selection S lection des unit s puis appuyez sur Edit Unit Modifier Unit Cet cran vous permet e De supprimer le nom d une unit e De supprimer un caract re du nom d une unit De A W p e D ajouter un caract re au nom d une unit e D accepter le nom d une unit 2 Suivez les tapes 2 4 de la section Attribution d un nom un test la page 31 La nouvelle unit personnalis e appara t dans la liste
62. DN 109 Configuration des param tres at aa had dedans 110 Mesure d chantillons ee Ad ae 112 M sut ides DOR he den AS Pan ee u e aaie nas An 114 M thodes de test prot ique colorim triques 117 Configuration des param tres de test pour une courbe standard 118 Mesure des standards en vue de la pr paration d une courbe SARA ES A a ne D RS SR Sr A Ne 119 Mesure d chantillons prot iques ss este tint ni abat 122 Tests UV difEGtss seana done eonan Eka SE Re Rite 124 Configuration des param tres d teste ne A ras nn Ars 125 Mesure de l chantillon SU ae A ED 125 NAT DU CASA RSR TL data it ados Vases 128 Configuration des param tres de test aa LS LE Me Le 128 Mesure de l chantilonss ss tesb os ia pit stars ae 129 Croissance de cellule she Lt dns fase Sri te 131 Configuration des param tres de test uu simans nent hu des 132 Utilisation du facteur de correction se ess AU ET ARS DAS 132 Mesure de l chantillon sus tanst a A n ae 132 Calculateur d oligonucl otides ss ee ete ie fon drmuttea sat 135 Chapitre 22 V rification des performances 137 Acc s aux tests de v rification des performances 137 Liste de contr le de d pannage Less annee ntm nn eta 138 Pr cision de longueur d onde Interne 139 Pr cision de longueur d onde Standard 42m ssmeusse 140 R p tabil
63. Manuel 6 Permet de mesurer un blanc et jusqu cinq chantillons sans avoir changer de place aux cuves plac es dans le changeur de cellule Les boutons de changement de cellule permettent d avancer le changeur de cellule jusqu la position appropri e pour la prochaine mesure Placez le blanc dans la position B et vos autres chantillons dans les autres positions de cellule Quel que soit son positionnement le porte cellules va automatiquement sur la position B et mesure le blanc lorsque vous appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Toutefois vous pouvez utiliser les boutons de changement de cellule pour s lectionner un autre emplacement pour la mesure Remarque Lorsque le changeur de cellule est install l instrument consid re toujours que le mat riel plac dans la position B est le blanc Cela signifie que m me apr s avoir mesur pour la premi re fois votre blanc vous ne pouvez placer des chantillons que dans les positions 1 5 26 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific ES Correction de cellules Tous les crans de configuration de test permettent d acc der l option de correction de cellules Remarque L option de correction de cellules n est pas rendue active partir de l cran Main Basic ATC Principal ATC de base Remarque L option n est active que lorsque le porte cellules 6 positions est param tr sur Auto 6 ou Auto 3 Elle n est pas active lorsque le por
64. N Courbe standard non lin aire valide Thermo Scientific 25 Calculs logiciels Calcul Calcul s Si ce n est pas le cas on distinguera plusieurs solutions dans le domaine sp cifi et le message Curve cannot be used to determine sample concentrations it may produce ambiguous results Impossible d utiliser la courbe pour d terminer les concentrations d chantillon Risque de r sultats ambigus s affichera easuren ansonaance N lors de la visualisation de la courbe Courbe standard non lin aire non valide Statistics 5 Statistiques Xy y cas g n ral de N n 1 r gression lin aire O N Degr du polyn me ISSXY r a pa a L JSQX SQY Le calcul du coefficient de corr lation s applique uniquement aux courbes de r gression lin aire de premier ordre polyn mes du premier degr Mod le de r gression lin aire y SYY a SXY par z ro N I Rapport d absorbance Abs AbsA ADS ef AbsA Abs Abs ou Diff rence d absorbance Thermo Scientific R sultat AbsA factor 1 Abs factor 2 ou AbsA Abs factor 1 4bs2 AbsA factor 2 Manuel d utilisation du BioMate 3S 169 25 Calculs logiciels Calcul Calcul s Graphiques M thode 3 points Absorbance corrig e du spectre de fond A 4 di Ar CORRECTED PEAK HEIGHT ABSORBANCE ke WAVELENGTH Absorbance par la m thode 3 poi
65. S 23 3 Accessoires Imprimantes externes Imprimantes externes Votre spectrophotom tre peut effectuer des impressions vers des imprimantes de bureau externes compatibles avec le format HP PCL 5 0 et version ult rieure Remarque Le format PCL ne prend pas en charge les imprimantes HP Windows Pour lancer une impression vers une imprimante raccordez le c ble USB l imprimante et au port USB situ l arri re de l instrument reportez vous la section Connecteurs la page 2 Remarque L instrument est compatible avec la plupart des imprimantes HP PCL certaines marques autres que la marque HP seront prises en charge Si l imprimante n est pas achet e aupr s de nos services il est de votre responsabilit de d terminer la compatibilit de l imprimante avec l instrument Pour plus d informations contactez l assistance technique ou votre repr sentant commercial 24 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific R glage du positionneur d chantillons Auto 6 Auto 3 Le spectrophotom tre vous permet d utiliser diff rents porte cellules et accessoires pour prendre des mesures Lorsque vous s lectionnez vos param tres de test vous s lectionnez le type de mesure requis et vous indiquez le nombre d chantillons Vous avez le choix entre les options de mesure suivantes Permet de mesurer un blanc et jusqu cinq chantillons sans avoir changer de place aux cuves plac es dans l
66. T C ATC avanc appuyez sur Stored Tests Tests stock s 2 Mettez en surbrillance le test que vous voulez rappeler et appuyez sur Enter Entr e Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 45 11 Mesures d absorbance et de pourcentage de transmittance ATC avanc Configuration des param tres de test Utilisez cet cran dans les cas suivants e Configuration des param tres de test e Correction de cellules e Enregistrement d un test e Affichage de la liste des tests stock s e Prise de mesures Configuration des param tres de test Pour configurer les param tres de test 1 Mettez en surbrillance le param tre souhait Certains param tres n apparaissent que si vous s lectionnez l un des modes de concentration alors que d autres apparaissent quel que soit le mode de mesure s lectionn Pour la liste compl te reportez vous la section Param tres la page 155 2 Lorsque les param tres sont configur s appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test ou Measure Sample Mesurer l chantillon pour mesurer un blanc ou des chantillons Prise de mesures Pour prendre automatiquement des mesures option Auto 6 ou Auto 3 1 Appuyez sur Run Sample Ex cuter l chantillon 2 Installez le blanc et les chantillons 3 Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Pour prendre manuellement des mesures option Manual 6 Manuel 6 ou Single Cell Holder Porte c
67. Test Charger le test Lock Unlock Verrouiller d verrouiller Permet de charger le test en surbrillance partir du r pertoire des tests stock s Stored Tests Directory dans la m moire active et de configurer l instrument sur les param tres de ce test Utility Utilitaire Permet de prot ger les tests stock s contre toute suppression ou alt ration accidentelle l utilisateur doit saisir un mot de passe pour pouvoir verrouiller ou d verrouiller le fichier Utility Utilitaire Low High Limits Limites inf rieures sup rieures Permet de saisir les limites inf rieures et sup rieures acceptables en dehors desquelles le r sultat est signal comme Low Faible ou High lev Tests Adv A T C ATC avanc Std Curve Courbe standard Abs Ratio Rapport d absorbance Abs Diff Diff rence d absorbance Kinetics Cin tique 3 Pt Net M thode 3 points et certains bio tests Math Manuel d utilisation du BioMate 3S Permet d acc der des fonctions de manipulation du graphique Scanning Balayage Thermo Scientific Thermo Scientific Param tre Measure Blank Mesurer le blanc touche de fonction 24 Param tres Description Permet de lancer la mesure du blanc Measure Blank Mesurer le blanc param tre de test Permet de s lectionner la fr quence de remise z ro de l instrument Une fois ou tous les relev s Kinetics Cin tique Measuremen
68. X maxi pour accepter la valeur L instrument redessine le trac en se basant sur la valeur minimale et maximale saisies puis affiche le taux et le r sultat recalcul s Poursuivez ainsi jusqu ce que vous ayez saisi toutes les valeurs modifier Pour utiliser la fonction Cursor Curseur Une fois les donn es cin tiques affich es sur l cran de modification appuyez sur Cursor Curseur pour afficher les options du curseur 94 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 20 cin tique Remise l chelle et recalcul des r sultats cin tiques affich s dans un tableau Kinetics 3 35pn 27Jan01 Test Name ENZYME BLANK 0 740 0 583 Time 3 00 Time Abs 1 30 0 644 2 Appuyez sur Cursor Curseur ou Cursor Curseur pour positionner la ligne de curseur sur le point appropri du graphique Les donn es du point s lectionn s affichent 3 Lorsque la ligne de curseur est correctement positionn e appuyez sur Set Min X D finir X mini ou Set Max X D finir X maxi pour accepter le point s lectionn L instrument redessine le trac en se basant sur la valeur minimale et maximale s lectionn es puis affiche le taux et le r sultat recalcul s Remise l chelle et recalcul des r sultats cin tiques affich s dans un tableau Lorsque les r sultats cin tiques sont repr sent s dans un tableau vous devez d abord appuyer sur Edit Data Modifier les donn es pour pouvoir
69. absorbance via un balayage effectu entre 225 Nm et 325 Nm La concentration des acides nucl iques est d termin e en multipliant l absorbance 260 Nm par un facteur 50 par d faut La puret est bas e sur le rapport 260 280 Une correction de longueur d onde de r f rence est disponible pour corriger un d calage de spectre de fond 320 Nm par d faut Une fois mises en uvre toutes les donn es de balayage sont tablies sur la base de l absorbance la longueur d onde de r f rence soustraite des valeurs d absorbance tablies Un utilitaire de facteur de dilution peut tre utilis pour calculer la concentration de la solution m re ADN ARN avec balayage 260 230 Ce test est destin d terminer la fois la concentration et la puret des acides nucl iques en pr sence de ph nol qui absorbe consid rablement 230 Nm Cette m thode de test mesure l absorbance via un balayage effectu entre 225 Nm et 325 Nm La concentration des acides nucl iques est d termin e en multipliant l absorbance 260 Nm par un facteur 50 par d faut La puret est bas e sur le rapport 260 230 Manuel d utilisation du BioMate 3S 99 21 Bio tests Tests des acides nucl iques Une correction de longueur d onde de r f rence est disponible pour corriger un d calage de spectre de fond 320 Nm par d faut Une fois mises en uvre toutes les donn es de balayage sont tablies sur la base de l absorbance la longueur d onde de r
70. alayer un chantillon 1 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test Si un porte cellules 6 positions est install placez l chantillon dans la position de cellule n 1 2 Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Remarque Pour basculer entre l affichage dans un tableau et dans un graphique appuyez sur Graph Tabular Graphique tableau Remarque Si l option Auto Save Data Enregistrement auto des donn es est activ e ON vous devez d abord saisir un nom de fichier de donn es pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons Scanning 13 28 20Jun02 Test Name Filter BLANK 0 730 Yave length 500 IDH 1 Baseline collected 20Jun02 Baseline p Sample Affichage et manipulation des donn es du balayage L application Scanning Balayage vous permet d afficher les r sultats sous la forme d un graphique ou d un tableau et de manipuler ces r sultats Lorsque vous manipulez des donn es de balayage repr sent es dans un graphique appuyez sur Edit Graph Modifier le graphique avant d appliquer d autres fonctions au donn es L cran de modification du graphique vous permet d effectuer les t ches suivantes e Remise l chelle des donn es de balayage graphiques e D termination de la hauteur de pic l aide de l quation de la m thode 3 points e R alisation de calculs sur les donn es de balayage e D nomination des pics et des c
71. ans la position de cellule n 1 L instrument utilise toujours la position de cellule n 1 pour balayer l chantillon Pour mesurer des chantillons 1 Dans l cran Kinetics Cin tique appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Si un porte cellules 6 positions est install placez le blanc dans la position B et l chantillon dans la position n 1 3 Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Une fois la mesure r alis e les donn es et le taux cin tiques s affichent 4 Si un porte cellules position unique est install appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc pour mesurer le blanc ins rez votre chantillon puis appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Une fois la mesure r alis e les donn es et le taux cin tiques s affichent Kinetics 3 05pm 27Jan01 Test Name ENZYME Enie 1 0 740 0 583 Tine 3 00 IDH A min Result 1 0 050 22 69 Te LE TE p Sample Pour basculer entre l affichage dans un tableau et dans un graphique appuyez sur Graph Tabular Graphique tableau Dans le cas d un affichage dans un graphique vous pouvez appuyez sur Edit Graph Modifier le graphique puis sur Cursor Curseur pour d placer la ligne de curseur d une position l autre sur le trac Lorsque vous d placez le curseur les valeurs taux et r sultat correspondent aux valeurs du point sur lequel le curseur est positionn 92 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 20 cin
72. ard 100 0 Factor 1587 Units C More parameters Press f or to select item to change Standard Test Tests Test Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 51 13 Mesures de concentration ATC avanc Rappel d un test Rappel d un test Pour rappeler un test 1 Appuyez sur Stored Tests Tests stock s 2 Mettez en surbrillance le test puis appuyez sur Enter Entr e ou sur Load Test Charger le test pour afficher les param tres du test s lectionn Configuration des param tres de test Pour configurer les param tres de test 1 Mettez en surbrillance le param tre souhait Certains param tres n apparaissent que si vous s lectionnez un mode de concentration alors que d autres apparaissent quel que soit le mode de mesure s lectionn Pour la liste compl te reportez vous la section Param tres 2 Lorsque les param tres sont d finis appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test ou sur Run Standard Ex cuter le standard pour mesurer un standard si le mode Conc Std Conc st est s lectionn ou appuyez sur Run Test Lancer le test si le mode Conc Factor Conc facteur est s lectionn Mesure d un standard Pour mesurer automatiquement un standard option Auto 6 ou Auto 3 1 Apr s avoir configur le mode de mesure sur Conc Std Conc st appuyez sur Run Standard Ex cuter le standard Advanced 2T C 10 17 20Feb02 Test Name STANDARD TEST BLANK C
73. aux sp cifications du fabricant et utilisez la plage recommand e Remarque La longueur de trajet des tubes essais n est pas aussi bien d finie que celle des cuves carr es Autres recommandations Positionnez les cuves et les tubes essais de fa on ce que les c t s ajour s soient situ s en face du faisceau lumineux En d autres termes l un de ces c t s doit faire face la partie avant de l instrument et l autre la partie arri re Remarque Placez toujours les tubes essais dans l instrument en les orientant de la m me fa on vers le faisceau lumineux Un rep re d alignement situ sur les tube essais vous permet d orienter correctement et uniform ment les tubes Lors de l utilisation de cellules petite ouverture petit volume e Utilisez toujours des cellules masquage noir e Utilisez la m me cellule ou cuve pour votre blanc et vos chantillons Dimensions Z La figure ci dessous illustre la position du faisceau lumineux l int rieur de l instrument Beam size specifications are shown below e Distance entre la partie inf rieure de la cuve et le centre du faisceau dimension Z 8 5 mm Dimensions du faisceau 2 mm largeur par 7 mm hauteur 8 5 mm 2 mm 6 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific Configuration de l instrument La configuration de l instrument s applique aux l ments suivants e Saisie des valeurs de param tres e Configura
74. ayonnement d ultraviolets UV Par cons quent il est conseill de faire effectuer les proc dures n cessitant le retrait du capot de l instrument et le remplacement des composants lectriques uniquement par des techniciens agr s Afin de garantir votre s curit et celle de l instrument veillez contacter un technicien agr pour toute proc dure d entretien que vous pr f rez ne pas effectuer par vous m me Entretien p riodique L entretien p riodique du spectrophotom tre ne n cessite pas beaucoup de temps Pour r duire le temps de maintenance et accro tre la dur e de vie et les performances de votre instrument respectez les recommandations suivantes e _ Remettez toujours en place le capot anti poussi re lorsque l instrument n est pas sous tension pour viter que de la poussi re ne p n tre l int rieur de l instrument ou ne recouvre l instrument e N utilisez ou ne stockez pas l instrument dans un environnement corrosif e Nettoyez les poussi res et tout d versement de produit pr sents sur la partie ext rieure de l instrument et notamment sur le clavier l aide d un chiffon doux Il est possible d utiliser le cas ch ant de l eau de l alcool isopropylique et tout autre agent nettoyant courant de laboratoire Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 149 23 Maintenance Entretien p riodique e _ Nettoyez toujours tout d versement de produit imm diatement pour viter d endommag
75. bouton de changement de cellule pour placer le porte cellules sur la position de mesure La mesure d absorbance ABS ou de pourcentage de transmittance T s affiche l cran Si un porte cellules position unique est install retirez le blanc et placez l chantillon dans le porte cellules La mesure d absorbance ou de pourcentage de transmittance s affiche l cran 44 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific oo A Mesures d absorbance et de pourcentage de transmittance ATC avanc Le mode Advanced A T C ATC avanc vous permet d effectuer des mesures d absorbance et de pourcentage de transmittance qui incluent la Correction des cellules ou un d lai de mesure or d automatiser la mesure d chantillons multiples avec un changeur de cellules Ce chapitre se compose des sections suivantes e S lection du mode de mesure Absorbance ou Transmittance e Correction de cellules e Rappel d un test e Configuration des param tres de test e Prise de mesures Pour commencer appuyez sur Test mettez en surbrillance Advanced A T C ATC avanc puis appuyez sur Enter Entr e Advanced zT C 11 42 4Feb02 Measurement Mode Absorbance Wave length 546 Onm Delay Time min sec 0 00 Sample Positioner Auto 6 Number of Samples 1 More paraneters Press T or 4 to select item to change ave ored Run Test Teste Test Rappel d un test Pour rappeler un test 1 Dans l cran Advanced A
76. c Accessoires Ce chapitre d crit bri vement les accessoires d chantillonnage et syst me disponibles pour votre spectrophotom tre Une description compl te et des consignes d utilisation sont fournies avec chaque accessoire Vous pouvez installer ou retirer ces accessoires sans avoir mettre l instrument hors tension Porte cellules et accessoires des porte cellules L instrument est livr avec le porte cellules 6 positions install en usine et le porte cellules position unique La proc dure de retrait et d installation de ces porte cellules et de leurs accessoires est d crite ci dessous Configurations de porte cellules Le tableau ci apr s r pertorie les porte cellules disponibles et leurs accessoires Vous pouvez installer ou retirer les accessoires sans avoir mettre l instrument hors tension Syst me de changeur de cellule Syst me cellule unique Porte cellules standard Syst mes de porte cellules accessoires Contr le de temp rature du recirculateur cellule unique Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 15 3 Accessoires Porte cellules et accessoires des porte cellules Syst me de changeur de cellule Syst me cellule unique ED DT Porte tubes essai installer dans les positions B 2 et 4 ES installer dans les positions B 2 et 4 Porte cellules rectangulaire de longueur de trajet de 50 mm aad Oh installer dans les
77. ce 280 nm est principalement due aux cha nes lat rales aromatiques des synthons acides amin s de prot ines Les acides nucl iques montrent une absorption lev e 260 nm par cons quent une formule simple peut tre utilis e pour estimer la concentration des prot ines tout en soustrayant la contribution en acides nucl iques La concentration des prot ines obtenue est exprim e en mg ml Une correction du spectre de fond 320 Nm est disponible en option pour corriger les d calages de spectre caus s par la diffusion par les impuret s Un utilitaire de facteur de dilution peut tre utilis pour calculer la concentration de la solution m re On distingue deux types de m thode de test prot ique les tests UV direct et les tests colorim triques Les tests colorim triques incluent plusieurs tests qui sont similaires De la m me fa on les m thodes directes sont galement tr s similaires Pour identifier la proc dure de test appropri e reportez vous au tableau ci dessous 116 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 21 Bio tests Mesure des prot ines Tests UV direct Tests calorim triques Conc des prot ines M thode standard de Coomassie Bradford 280 Conc des prot ines Micro m thode de Coomassie Bradford 205 Warburg Christian M thode standard de Lowry M thode de Lowry modifi e par Pierce M thode standard BCA Micro m thode BCA de Pierce Biuret Pierce 660
78. ce puis appuyez sur Enter Entr e Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 29 5 Correction de cellules Correction de cellules 30 Manuel d utilisation du BioMate 3S Cell Correction 3 12pm 24Jan01 Correction Mode Discrete nns Date Corrected gt Entry Enter Number of Samples 1 5 4 Appuyez sur Set nms D finir Nm pour s lectionner les longueurs d onde pour lesquelles la correction de cellules sera effectu e La liste des longueurs d onde s affiche Cell Correction 15 33 26Jun02 BLANK nm 1 600 2 540 3 450 Entry Enter Wavelength 190 1100 Remarque Mettez en correspondance les cellules pour toutes les longueurs d onde d analyse Une mise en correspondance trouv e pour une longueur d onde ne garantit pas une mise en correspondance pour toutes les autres longueurs d onde 5 Mettez en surbrillance la position correspondant la premi re longueur d onde 6 Appuyez sur Add nm Ajouter Nm 7 Saisissez la valeur de la longueur d onde puis appuyez sur Enter Entr e 8 Apr s avoir saisi toutes les longueurs d onde appuyez sur Run Corr Lancer la correction pour lancer la correction de cellules L application mesure les autres cellules par rapport au blanc puis enregistre stocke et date les mesures partir de ces mesures l application tablit les facteurs de correction requis lesquels sont automatiquement appliqu s pendant tous les tests ult rieurs si la correction
79. chelle auto pour modifier l chelle afficher le nouveau graphique et recalculer les r sultats e Utiliser la mise l chelle manuelle pour modifier l chelle afficher le nouveau graphique et recalculer les r sultats e Utiliser le curseur pour s lectionner la nouvelle valeur minimale et maximale de l axe des X et recalculer les r sultats Pour utiliser la mise l chelle auto Une fois les donn es cin tiques affich es sur l cran Edit Graph Modifier le graphique 2 appuyez sur Auto Scale Mise l chelle auto Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 93 20 cin tique Rappel et recalcul des r sultats cin tiques affich s dans un graphique L instrument ajuste la valeur minimale et maximale de l axe des X et des Y de fa on ce que toutes les donn es apparaissent sur le trac L instrument recalcule et affiche galement les r sultats en prenant en compte toutes les donn es R kod Pour utiliser la mise l chelle manuelle 1 Une fois les donn es cin tiques affich es sur l cran de modification appuyez sur Manual Scale Mise l chelle manuelle pour afficher les options de mise l chelle manuelle Kinetics 3 24pm 27Jan01 Test Name ENZYME BLANK 0 740 a 0 583 Time IDH A min Result 1 0 050 22 69 3 00 Saisissez la valeur minimale et maximale appropri e pour l axe des X ou des Y puis appuyez sur Min Y Y mini Max Y Y maxi Min X X mini ou Max X
80. connus Une adaptation de cette courbe standard permet de mesurer la concentration des chantillons Utilisez l application Standard Curve Courbe standard dans les cas suivants e Cr ation d une courbe standard configuration des param tres puis mesure des standards de la courbe e Correction de cellules e Mesure d chantillons Affichage des donn es de la courbe d talonnage choix entre l affichage dans un graphique ou dans un tableau e Modification d une courbe standard modification du nombre de standards s lection d une autre adaptation de courbe ou suppression de points de la courbe Affichage et enregistrement des donn es d chantillon mesur es l aide de la courbe standard Pour commencer appuyez sur Test mettez en surbrillance Standard Curve Courbe standard puis appuyez sur Enter Entr e Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 81 19 Mesures de concentration Application Standard Curve Courbe standard Rappel d une courbe standard Standard Curve 15 28 4Feb02 BLANK Test Name AMMON I Date Standards Measured Wavelength 660 Onm Ref Wavelength Correction Off Curve Fit Linear Number of Standards 5 Number of Samples More parameters Press f or 1 to select item to change PNR RE NN Standards Test Tests Rappel d une courbe standard D finition des param tres d une courbe standard Pour rappeler une courbe standard 1 Appuyez sur Stored Tests
81. cteur Mesure d chantillons Si le changeur de cellule 6 positions est install placez l chantillon mesurer dans l une des positions de cellules puis appuyez sur le bouton de positionnement des cellules appropri pour positionner le changeur de cellule sur la position de mesure La mesure s affiche Si le changeur de cellule position unique est install retirez le blanc puis placez l chantillon dans le changeur de cellule La mesure s affiche 50 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific A Mesures de concentration ATC avance Utilisez le mode Advanced A T C ATC avanc pour mesurer la concentration dans les cas suivants e S lection d un mode de mesure concentration with one standard concentration avec un standard ou concentration with a factor concentration avec un facteur e Rappel d un test e Configuration des param tres de test e Mesure d un standard ou Saisie d un facteur uniquement si vous s lectionnez le mode concentration with one standard concentration avec un standard ou concentration with a factor concentration avec un facteur e Mesure d un blanc e Mesures d chantillons Pour commencer appuyez sur Test mettez en surbrillance Advanced A T C ATC avanc puis appuyez sur Enter Entr e Advanced 2T C 15 40 26Jun02 Test Name alala Measurement Mode Conc Std Wavelength 546nm Ref Wavelength Correction Off Delay Time min sec 0 00 Conc of Stand
82. d enregistrement du test s affichera sur l cran Utility Test Directory R pertoire des tests d utilitaire disponible pour tous les tests Permet de calculer la temp rature de fusion Test Oligos Oligonucl otides Total Run Time Dur e d ex cution totale Units Unit s Permet de saisir la dur e entre Le lancement de l ex cution et la fin du test est gal Temps d attente Temps d intervalle Temps de mesure Kinetics Cin tique Permet de s lectionner ou de cr er des libell s d unit s pour les r sultats tous les tests stock s l exception des tests Abs Ratio Rapport d absorbance Scanning Balayage Cell Growth Croissance de cellule Unselect Test D s lectionner le test Permet de supprimer le symbole gt en regard du nom de test en surbrillance pour retirer le test du menu SmartStart Utility Stored Tests Directory R pertoire des tests d utilitaire stock s Wavelength Longueur d onde Permet de saisir les valeurs des longueurs d onde d analyse Manuel d utilisation du BioMate 3S 165 24 Param tres 166 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific A Calculs logiciels Calcul Calcul s Graphiques Courbes standard Sommes partielles SX 5x SY y SXX 2x SYY Zy SXY ZAD SOX A SX sx SOY En nue sy N SXY SX SY O x1 Concentration du standard i y1 Absorbance du standard i N n
83. d onde et tous les facteurs Suppression de longueurs d onde et de facteurs Pour supprimer des longueurs d onde et des facteurs 1 Appuyez sur Set nms D finir Nm Remarque Si aucune valeur de longueur d onde n a t saisie les colonnes correspondant aux longueurs d onde et aux facteurs seront vides 2 Mettez en surbrillance la premi re paire longueur d onde facteur supprimer 3 Appuyez sur Delete nm Supprimer Nm Prise de mesures Vous pouvez acc der l application Multiwavelength Longueurs d onde multiples partir de l cran Set nms D finir Nm illustr ci dessus ou de l cran de configuration de l application Multiwavelength Longueurs d onde multiples Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 67 15 Longueurs d onde multiples Prise de mesures Ke D Pour prendre automatiquement des mesures option Auto 6 ou Auto 3 1 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test pour afficher l cran de mesure Multiwavelength Longueurs d onde multiples Multiwavelength 4 46pm 18Feb02 Test Name BLANK IDH 1 Result nm Abs Insert sample 1 into position 1 Press ENTER to measure Oo T T S Installez le blanc et les chantillons Appuyez sur Enter Pour prendre manuellement des mesures option Manual 6 Manuel 6 ou Single Cell Holder Porte cellules position unique Une fois l cran Multiwavelength Longueurs d onde multiples affich et les param
84. dards indique l absorbance de chaque standard ainsi que la pente le point d intersection et le coefficient de corr lation de la courbe standard Coomassie Bradford Std Test Name Bradford Std Std Conc Abs pg mL Curve Fit 2nd Order a2 8E 07 0 00392 a0 0 0015 st Dev 4 47E 04 age 1 Standards 1 4 CES TEE Bal Test Standards L talonnage est termin Vous pouvez utiliser cet cran pour e Modifier les standards appuyez sur Edit Standards Modifier les standards e Afficher un graphique des donn es de la courbe standard appuyez sur View Graph Afficher le graphique e Enregistrer la courbe standard appuyez sur Save Test Enregistrer le test e Mesurer vos chantillons appuyez sur Run Test Ex cuter le test Mesure d chantillons prot iques Vous pouvez mesurer les chantillons automatiquement ou l aide du porte cellules position unique Mesure de standards automatique option Auto 6 ou Auto 3 Pour mesurer automatiquement les standards 1 Dans l cran Standards appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Placez le blanc et les chantillons dans les positions de cellule appropri es conform ment aux instructions affich es l cran 122 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 21 Bio tests Mesure des prot ines Coomassie Bradford Std Test Name Bradford Std Abs Result IDH 595nm pg mL Insert blank into position B Inser
85. de d terminer la concentration des prot ines mesure l absorbance de l chantillon 280 Nm Cette m thode de test mesure l absorption des longueurs d onde fixes 280 Nm et d termine la concentration des prot ines en multipliant cette valeur par un facteur 1 par d faut La concentration des prot ines obtenue est exprim e en mg ml Une correction du spectre de fond 320 Nm est disponible en option pour corriger les d calages de spectre dus la diffusion par les impuret s Un utilitaire de facteur de dilution peut tre utilis pour calculer la concentration de la solution m re Protein Conc 205 Conc de prot ines 205 Cette m thode directe qui permet de d terminer la concentration des prot ines mesure l absorbance de l chantillon 205 Nm Cette m thode de test mesure l absorption des longueurs d onde fixes 205 Nm et d termine la concentration des prot ines en multipliant cette valeur par un facteur 31 par d faut La concentration des prot ines obtenue est exprim e en mg ml Une correction du spectre de fond 320 Nm est disponible en option pour corriger les d calages de spectre caus s par la diffusion par les impuret s Un utilitaire de facteur de dilution peut tre utilis pour calculer la concentration de la solution m re Warburg Christian La m thode de Warburg Christian permet de d terminer la concentration des prot ines en pr sence de la concentration d acides nucl iques L absorban
86. diagnostic pratique et rapide concernant la qualit d chantillon Utilisez l application Absorbance Ratio Rapport d absorbance dans les cas suivants e Rappel d un test e Configuration des param tres de test e Correction de cellules e Mesure d un blanc e Mesure d chantillons Pour commencer appuyez sur Test mettez en surbrillance Absorbance Ratio Rapport d absorbance puis appuyez sur Enter Entr e Rappel d un test Absorbance Ratio 10 32 20Feb02 BLANK Test Name CARE Wavelength 1 269 Onm Wavelength 2 280 Onm Ref Wavelength Correction Off Sanple Positioner Auto 6 Number of Samples 5 More paraneters Press T or to select item to change CUT Re Det Test Tests Test Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 69 16 Rapport d absorbance Configuration des param tres de test Pour rappeler un test 1 Dans l cran Absorbance Ratio Rapport d absorbance appuyez sur Stored Tests Tests stock s 2 Mettez en surbrillance le test rappeler puis appuyez sur Enter Entr e Cet cran vous permet d effectuer les t ches suivantes e Configuration des param tres de test e Correction de cellules e Enregistrement d un test Affichage de la liste des tests stock s Mesure d un blanc Configuration des param tres de test Pour configurer les param tres de test 1 Dans l cran Absorbance Ratio Rapport d absorbance mettez en surbrillance le param tre souhait 2 Lorsque l
87. dommages permanents e Utilisez uniquement un chiffon du papier pour lentille ou un chiffon fin et doux pour nettoyer les surfaces optiques La plupart des produits en papier mouchoirs serviettes etc se composent de fibres de bois qui peuvent endommager la cellule la fin de la journ e assurez vous que toutes les cellules ont t nettoy es et stock es dans un r cipient adapt une fois s ches Terme Acide dilu Definition Acide nitrique dilu lt 10 Acide Acide hydrochlorique 5M ou acide nitrique 5M reportez vous la remarque ci dessous Rin age au solvant Rin age avec du solvant utilis l origine pour solvater votre substance analyser Rin age abondant l eau Utilisation d eau pure par exemple eau d min ralis e eau distill e osmose inverse et r alisation de 10 rin ages au minimum D tergent Utilisation d un d tergent pH neutre Triton X 100 si possible pour un rin age l acide dilu rin age l eau pour retirer les r sidus Remarque N utilisez pas d acide nitrique 5M avec une cellule recouverte d une couche anti r flectrice Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 151 23 Maintenance Remplacement du fusible IMPORTANT Il n est pas recommand d utiliser un bain ultrasons pour nettoyer vos cellules Chaque bain g n re une fr quence diff rente par cons quent si votre bain ultrasons util
88. dre Longueur d onde ug mL Bradford d termin par la m thode des moindres carr s analytique 595 nm Std D viation standard affich e Standards par d faut de 25 125 250 500 750 1000 1500 2000 Coomassie Ajustement de courbe d talonnage de second ordre Longueur d onde ug mL Bradford d termin par la m thode des moindres carr s analytique 595 nm Micro D viation standard affich e Standards par d faut de 2 5 5 0 10 0 15 0 20 0 25 0 Pierce 660 nm Ajustement de courbe d talonnage de second ordre Longueur d onde ug mL Protein Assay d termin par la m thode des moindres carr s analytique 660 nm D viation standard affich e Standards par d faut de 125 250 500 750 1000 1500 2000 Lowry Ajustement de courbe d talonnage de second ordre Longueur d onde ug mL standard d termin par la m thode des moindres carr s analytique 550 nm m thode standard de D viation standard affich e Standards par d faut de 0 Lowry 100 200 500 1000 2000 M thode de Ajustement de courbe d talonnage de second ordre Longueur d onde ug mL Lowry modifi e d termin par la m thode des moindres carr s analytique 750 nm par Pierce D viation standard affich e Standards par d faut de 1 0 5 0 25 0 125 250 500 750 1000 1500 BCA standard Ajustement de courbe d talonnage de second ordre Longueur d onde ug mL M thode d termin par la m thode des moindres carr s analytique 562 nm standard BCA D viation standard af
89. ds appuyez sur Edit Standards Modifier les standards e Afficher un graphique des donn es de la courbe standard appuyez sur View Graph Afficher le graphique e Enregistrer la courbe standard appuyez sur Save Test Enregistrer le test e Mesurer les chantillons appuyez sur Run Test Ex cuter le test Mesure de standards manuelle l aide du porte cellules position unique Pour mesurer manuellement les standards 1 Dans l cran Standards appuyez sur Measure Standards Mesurer les standards 2 Ins rez l chantillon blanc dans le porte cellules position unique 3 Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc 21 Bio tests Mesure des prot ines Coomassie Bradford Std 11 07 4 pr08 Test Name Bradford Std Std Conc Abs pg mL 595nm 4 Appuyez sur Measure Standard Mesurer le standard Coomassie Bradford Std 11 09 4 pr08 Test Name Bradford Std Std Conc bs pg mL 595nm 5 Pour ins rer le standard appropri suivez les instructions qui s affichent l cran Coomassie Bradford Std 11 12 4 pr08 Test Name Bradford Std Std Conc bs pg mL 595nm 1 25 00 2 50 00 3 75 00 4 100 0 Insert standard 1 Press ENTER to measure Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 121 21 Bio tests Mesure des prot ines 6 Pour mesurer le standard appuyez sur Enter Entr e L cran Stan
90. e chaque fois que vous visualisez l option Change Mode Changer de mode Absorbance 16 03 31Jan02 0 476 660 nm E EEE Blank Mode Lorsque le mode Basic ATC ATC de base est param tr sur Absorbance ou Transmittance les possibilit s suivantes sont votre disposition e R glage de la longueur d onde e Mesure d un blanc e Mesure d chantillons Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 43 10 Mesures d absorbance et de pourcentage de transmittance ATC de base R glage de la longueur d onde R glage de la longueur d onde Pour r gler la longueur d onde 1 Appuyez sur Set nm D finir Nm ou sur n importe quelle touche num rot e pour r gler la longueur d onde Absorbance 17 25 Jos 0 219 E Enn Enter Wavelength 190 1100 2 Saisir la longueur d onde pour la prise de mesures puis appuyez nouveau sur Set nm D finir Nm Mesure d un blanc Pour mesurer un blanc 1 Placez le blanc dans le porte cellules Si un changeur de cellule 6 positions est install placez le blanc dans la position B 2 Pour saisir une valeur d absorbance ou de transmittance pour le blanc appuyez sur une touche num rot e puis saisissez la valeur souhait e dans le champ Entry Saisie 3 Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Mesure d chantillons Si un changeur de cellule 6 positions est install placez les chantillons dans les positions de cellule puis appuyez sur le
91. e Diff rence d absorbance puis appuyez sur Enter Entr e Absorbance Difference 12 52 3Jan02 Test Name Wavelength 1 546 Onm Wavelength 2 546 Onm Ref Wavelength Correction Off Factor 1 1 000 Factor 2 1 000 Units Sanple Positioner Auto 6 Number of Samples 1 ore parameters Press T or 4 to select item to change CUT RS TER T Test Tests Test Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 73 17 Diff rence d absorbance Rappel d un test Rappel d un test Pour rappeler un test 1 Dans l cran Absorbance Ratio Rapport d absorbance reportez vous la section Utilisation de l cran Absorbance Ratio Rapport d absorbance la page 74 appuyez sur Stored Tests Tests stock s 2 Mettez en surbrillance le test rappeler puis appuyez sur Enter Entr e Utilisation de l cran Absorbance Ratio Rapport d absorbance Utilisez cet cran dans les cas suivants e Configuration des param tres de test e Correction de cellules e Enregistrement d un test e Affichage de la liste des tests stock s Mesure d un blanc e Mesure d chantillons Configuration des param tres de test Pour configurer les param tres de test 1 Dans l cran Absorbance Ratio Rapport d absorbance mettez en surbrillance le param tre configurer 2 Lorsque les param tres sont configur s appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test ou Run Test Ex cuter le test
92. e AMMONIA BLANK Std Conc Abs ppm 660 Onm Entry Enter a number 0 001 to 9999 3 Renseignez le champ Entry concentration Saisir la concentration puis appuyez sur Enter Entr e 4 Appuyez sur Measure Standards Mesurer les standards L cran Standards indique l absorbance de chaque standard ainsi que la pente le point d intersection et le coefficient de corr lation de la courbe standard Pour mesurer manuellement les standards option Manual 6 Manuel 6 ou Single Cell Holder Porte cellules position uniquel 1 Installez le blanc et les standards 2 Lorsque les param tres sont corrects appuyez sur Run Standards Ex cuter les standards Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 83 19 Mesures de concentration Application Standard Curve Courbe standard Mesure des standards d une courbe standard Standard Curve 12 50 14Feb02 Test Name AMMONIA BLANK Std Conc bs mg L 660 Onm 1 25 00 2 45 00 3 55 00 4 75 00 5 100 0 Page 1 Standards 1 5 PTE Der Blank Test Standards 3 Renseignez le champ Entry concentration Saisir la concentration 4 Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Si un porte cellules 6 positions est install celui ci passe sur la position B pour mesurer le blanc et revient ensuite sur sa pr c dente position 5 Appuyez sur Measure Standards Mesurer les standards
93. e changeur de cellule L instrument mesure automatiquement le blanc et avance le changeur de cellule pour mesurer les chantillons restants Permet de mesurer un blanc et deux chantillons sans avoir changer de place aux cuves plac es dans le changeur de cellule L instrument mesure automatiquement le blanc et avance le changeur de cellule pour mesurer les chantillons plac s en positions 2 et 4 Single Cell Holder Porte cellules position unique Thermo Scientific Placez le blanc dans le porte cellules mesurez le placez un chantillon dans le porte cellules puis mesurez votre chantillon Ce processus est compl tement manuel Les boutons de position des cellules ne fonctionnent pas lorsque vous s lectionnez l option Single Cell Holder Porte cellules position unique Remarque Lorsque vous s lectionnez cette option le changeur 6 cellules peut fonctionner comme un porte cellules position unique ce qui vous permet de mesurer uniquement une cellule Toutefois nous vous conseillons d utiliser le porte cellules position unique pour les accessoires qui requi rent un niveau lev de r p tabilit de positionnement tels que l accessoire nanoCell les microcellules petite ouverture le module de couplage des sondes fibres optiques et les cellules flux utilis es avec un syst me Sipper Manuel d utilisation du BioMate 3S 25 4 R glage du positionneur d chantillons Manual 6 Manuel 6 Manual 6
94. e est de 595 Nm et la courbe d talonnage est de deuxi me ordre La micro version de ce test est pr programm e pour les standards dont la plage de concentration se situe entre 2 5 ug ml et 25 pg ml Lowry Standard M thode standard de Lowry Depuis de nombreuses ann es le test de Lowry est la m thode colorim trique la plus cit e pour d terminer la concentration des prot ines Du fait d une importante d pendance aux limites de pH l int r t d utilisation de ce test qui repose sur la r duction du r actif de Folin Ciocalteu est restreint La longueur d onde optimale pour ce test est de 550 Nm Ce test produit une courbe d talonnage de deuxi me ordre La version standard de ce test est pr programm e pour les standards dont la plage de concentration se situe entre 100 ug ml et 2000 ug ml Pierce Modified Lowry M thode de Lowry modifi e par Pierce Pierce a d velopp une formulation modifi e de la m thode de Lowry id ale pour les utilisateurs souhaitant tirer au mieux avantage d un produit pr formul stable Cette m thode am liore consid rablement la stabilit et l int r t d utilisation de la m thode de Lowry Une corr lation de pr s de 100 est obtenue entre les courbes de r ponse color es tablies avec la m thode de Lowry modifi e et la m thode de Lowry d origine Cette m thode mesure l absorbance 750 Nm et utilise une courbe d talonnage de deuxi me ordre La plage de concentration des standards
95. e l cran Standards ide dpt een debut see 84 Mesure d chantillons he ne den dents de a tee 85 Modification d une courbe standard sfr eine ae ira 86 Gin tig e ssa iiien ae a a ee e a E 89 Rappel d Un testaa E A E E a E RT E T E Se nt 90 Configuration des param tres de test Lane ere see eee 90 Mesure d chanulions sore neei vaiet im es E poat Vei E poi 92 Rappel et recalcul des r sultats cin tiques affich s dans un graphique 93 Remise l chelle et recalcul des r sultats cin tiques affich s dans un ble n errs opea a O en aaa E or EE e 95 Bio tests as te aa a E de a E E E E AER 97 Fonction SmartStart 98 Thermo Scientific Table des mati res Tests des acides nucl iques 44 saintes a nee 99 Tests de conc ADN ARN 260 d ADN5b d ARN et d oligonucl otides facteur Asera a A se nn Sn en Pan ne ns ae era ten 100 Configuration des param tres d test serpent ns bat anne 101 Mesure d chantillons Le unes Gains pans se 101 ADN ARN 260 280 et ADN ARN 260 230 103 Mesure d chantillons sors a ane sad eat A 104 ADN ARN avec balayage 260 280 et ADN ARN avec balayage EL P EEEE Re ne E den er 106 Mesure d un balayage de spectre de fond 107 Mesure d chantillons option Single Cell Holder Porte cellules position unique Auto 6 ou Auto 3 4 nous purent purent ee 108 Calculateur d oligonucl otides d A
96. e vous disposez d un ch ssis de porte cellules appropri Remarque Pour utiliser des cellules d une longueur de trajet de 100 mm vous devez installer le ch ssis du porte cellules position unique Pour prendre connaissance des diff rents accessoires de porte cellules qui peuvent tre cr s pour votre instrument reportez vous la section Configurations de porte cellules la page 15 Chaque porte cellules doit tre install sur un ch ssis mono cellule ou un ch ssis multi cellules Pour ce faire retirez le s porte cellules fix s sur le ch ssis Chaque porte cellule est dot d une vis imperdable situ e sur sa partie inf rieure Cette vis permet de fixer le porte cellules sur le ch ssis l aide d un tournevis plat desserrez la vis imperdable du ch ssis et soulevez le porte cellule pour le d gager du ch ssis Placez le nouveau porte cellule dans la position appropri e et fixez le sur le ch ssis l aide de la vis imperdable Remarque Vous ne pouvez installer que trois porte cellules accessoires Veillez les installer dans les positions B 2 et 4 Remarque Retirez le ch ssis de l instrument avant de retirer ou d installer des porte cellules Pour savoir comment installer l ensemble des accessoires quip s dans votre instrument reportez vous la section Installation du porte cellules 6 positions et du porte cellules position unique la page 19 Thermo Scientific Manue
97. eillies Kinetics Cin tique Scanning Balayage ID N ID Permet de saisir l identifiant num rique de la mesure incr mentations automatiques pendant le test jusqu l arr t param tr sur 0 Instrument Serial Number Num ro de s rie de l instrument Intercept Point d intersection Permet d afficher le num ro de s rie de l instrument Utility Utilitaire Permet de saisir le point au niveau duquel la ligne traverse l axe des Y Abs o conc 0 Interval Intervalle Interval Time Temps d intervalle Permet de saisir la plage de longueurs d onde entre les points de donn es Tests Scanning Balayage uniquement Permet de saisir l intervalle entre des relev s r p t s Kinetics Cin tique uniquement Manuel d utilisation du BioMate 3S 159 24 Param tres 160 Param tre Linearity Value Valeur de lin arit Description Permet de saisir une valeur de lin arit Kinetics Cin tique uniquement Pour vous aider d terminer la lin arit de la r action pendant la mesure l instrument met votre disposition un param tre de lin arit Il s agit de l cart entre les changements d absorbance de deux mesures comme illustr dans l exemple suivant Temps Abs AA Lin arit 1 l 2 2 l 3 29 09 P 4 38 09 P 5 46 08 P 6 52 06 F La lin arit est la valeur AA entre les calculs AA P Pass R ussite et F Fail chec Load
98. ellules position unique 1 Appuyez sur Run Sample Ex cuter l chantillon 2 Lorsque vous y tes invit placez le blanc et les chantillons dans le porte cellules Si le porte cellules 6 positions est install placez le blanc en position B et les chantillons aux positions 1 5 3 Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Si un porte cellules 6 positions est install celui ci passe sur la position B pour mesurer le blanc et revient ensuite sur sa pr c dente position 4 Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon La mesure de l chantillon s affiche Si un porte cellules 6 positions est install appuyez sur les boutons de changement de cellule pour repositionner le porte cellules et mesurer les autres chantillons manuellement 46 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific Mesures de concentration de base ATC de base Ce chapitre se compose des sections suivantes e Mesures de concentration de base e Utilisation de l option Conc Std Conc st pour mesurer la concentration e Utilisation de l option Conc Factor Conc facteur pour mesurer la concentration e Mesure d chantillons Mesures de concentration de base Le mode Basic ATC ATC de base vous permet d effectuer des mesures de concentration de base Ce mode de concentration de base s av re utile dans le cas de comparaisons tr s simples qui ne n cessitent pas de courbe standard Vous ne pouvez pas enregistrer les donn es da
99. em to change Set nms cor 6 Si vous avez s lectionn le mode Scan Balayage l tape pr c dente d finissez les valeurs Start Wavelength Longueur d onde de d but et Stop Wavelength Longueur d onde de fin 7 Appuyez sur Run Corr Lancer la correction pour lancer la correction de cellules Si vous avez s lectionn le mode Discrete nms Nm discrets d finissez d abord les longueurs d onde en suivant les proc dures ci apr s puis la correction de cellules L option de correction de cellules permet de mesurer les autres cellules par rapport au blanc puis d enregistrer de stocker et de dater les mesures partir de ces mesures l option de correction de cellules tablit les facteurs de correction requis lesquels sont automatiquement appliqu s pendant tous les tests ult rieurs si la correction de cellules est activ e D finition des longueurs d onde pour le mode Discrete nms Nm discrets Pour d finir des longueurs d onde pour le mode Discrete nms Nm discrets 1 Mettez en surbrillance Sample Positioner Positionneur d chantillons puis appuyez sur Enter Entr e pour configurer ce param tre sur Auto 3 en cas d utilisation de trois grands porte cellules ou Auto 6 en cas d utilisation de six petits porte cellules 2 Mettez Number of Matched Cuvettes Nombre de cuves mises en correspondance puis appuyez sur Enter Entr e 3 D finissez le nombre de cellules mettre en correspondan
100. ent de la m me fa on La seule diff rence r side dans les longueurs d onde utilis es lors de l analyse L un des tests mesure l absorbance 260 Nm et 280 Nm alors que l autre mesure l absorbance 260 Nm et 230 Nm Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 103 21 Bio tests Tests des acides nucl iques La puret des acides nucl iques est g n ralement mesur e via le rapport 260 230 en cas d utilisation du ph nol dans le processus d extraction des acides nucl iques Le ph nol se caract rise par une absorbance lev e 230 Nm et cette m thode de test permet de le d tecter facilement Pour une description des param tres reportez vous la section Param tres Pour les valeurs par d faut reportez vous la section Calculs pour Logiciel Bio Tests Pour commencer mettez en surbrillance Nucleic Acid Tests Tests des acides nucl iques dans l cran Bio Tests Bio tests puis appuyez sur Enter Entr e La liste des tests des acides nucl iques s affiche Mettez en surbrillance DNA RNA 260 280 ADN ARN 260 280 puis appuyez sur Enter Entr e Remarque Les crans ci dessous pr sentent les param tres du test ADN ARN 260 280 Pour le test ADN ARN 260 230 la longueur d onde 2 est configur e sur 230 Nm DNA RNA 260 280 Test Name avelength 1 avelength 2 ef Wavelength Correction On ef Wavelength 320nm actor 50 00 nits py mL Sample Positioner Auto 6 umber of Samples 1
101. eportez vous la section Param tres Pour les valeurs par d faut reportez vous la section Calculs pour Logiciel Bio Tests Pour commencer mettez en surbrillance Oligo Calculator Calculateur d oligonucl otides puis appuyez sur Enter Entr e L cran Oligos Oligonucl otides s affiche R Le 1 Thermo Scientific Pour utiliser le calculateur d oligonucl otides Appuyez sur Base Sequence S quence de bases S lectionnez le caract re appropri pour la base que vous voulez saisir Appuyez sur Add Base Ajouter une base Lorsque la s quence de bases est correcte appuyez sur Accept Sequence Accepter la s quence L instrument calcule et affiche les r sultats Manuel d utilisation du BioMate 3S 135 21 Bio tests Calculateur d oligonucl otides Oligos 16 42 26Mar08 Test Name Oligo Calc ase Sequen CTTTGAACATTCCCTAGGC Number of bases 0 x 50 00 DNA MWU 5 P03 6107 MU RNA 4648 260 DNA 196580 RNA 165700 DNA Factor 31 07 RNA Factor 28 05 Rate Le TT Sequence Calc Test 5 Pour d terminer le T th orique de la s quence appuyez sur Tm Calc Calcul du Tm L cran de calcul du T s affiche Dligos 13 37 4Apr08 Base Sequen CCTTTGAACATTCCCTAGGC up to 20 bases only 60 Tm CDNA DNA 55 2 Tm CDN A RNA 60 2 Tm CRN A RNA 66 sequence lo O Sequence 6 Saisissez le pourcentage de formamide et le pourcentage de s
102. er le test Le menu principal s affichera la mise sous tension Pour configurer plusieurs tests SmartStart Suivez les tapes 1 3 de la proc dure ci avant qui permet de configurer un seul test SmartStart S lectionnez les tests souhait s La fl che gt indique les tests s lectionn s pour le menu SmartStart Appuyez sur Esc Echap pour revenir l cran Utility Utilitaire ou mettez l instrument hors tension Remarque Pour supprimer des tests du menu SmartStart reportez vous la PP P proc dure ci dessus qui permet de d s lectionner un test 38 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific EE ER Unites de concentration Ce chapitre se compose des sections suivantes e D finition des unit s de concentration e Cr ation d unit s personnalis es D finition des unit s de concentration Les tests de concentration et de cin tique incluent un param tre pour les unit s qui permet de marquer les r sultats Le spectrophotom tre int gre un ensemble d unit s de concentration de base Tous les programmes du spectrophotom tre utilisent la m me liste d unit s de base e C concentration pg L ppm e M L ppb e mM L e g L e JU e mg L e pM uL e mg mL e ng uL Vous pouvez aussi cr er des unit s personnalis es pour plus d informations reportez vous Cr ation d unit s personnalis es la page 40 Thermo Scientific Manuel d utilisation du
103. er l instrument ou r duire les risques d endommagement En cas de d versement d acides ou de bases concentr es ou m me d hydrocarbures sur l instrument nettoyez imm diatement la zone touch e Nettoyage et entretien des cellules V rifiez soigneusement l tat des cuves et des cellules utilis es pour mesurer les chantillons Si des cellules sont br ch es fissur es ou ray es elles doivent tre mises au rebut et remplac es par des cellules neuves V rifiez que l int rieur et l ext rieur de vos cuves sont propres pour garantir la qualit de vos r sultats 1 une substance contaminante risque d absorber la lumi re et d entra ner des r sultats d absorbance faussement lev s 2 la pr sence de contaminants dans la cellule peut entra ner une r action chimique avec les r actifs ou les standards introduits ult rieurement dans la cellule Les m thodes de nettoyage d pendent dans une certaine mesure de la nature de la substance contaminante Il est important d identifier la substance r siduelle pr sente dans la cellule qui doit tre retir e Pour des conseils concernant les m thodes de nettoyage les solvants et les produits reportez vous au tableau ci dessous Solvants Exemples M thodes de nettoyage conseill es Aqueux Prot ines biologie ADN e Eau chaude avec d tergent e Rin age l acide nitrique dilu lt 10 e Rin age abondant l eau Aqueux Solutions salines e Rin age l acide nit
104. erformance Validation 13 33 1Feb02 Wavelength ccuracy Standards Expected Tolerance Measured Result nm nm nm 399 0 2 525 0 2 Place Standard 1 in position 1 Press Start Test or Press ESC to save test Test Pour ajouter une longueur d onde 1 Appuyez sur Add nm Ajouter Nm puis saisissez la valeur de la longueur d onde dans le champ Entry Saisie 2 Appuyez nouveau sur Add nm Ajouter Nm pour ajouter la longueur d onde la liste 3 Saisissez la tol rance de la longueur d onde saisie dans le champ Entry Saisie 4 Appuyez sur Enter Entr e 140 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 22 V rification des performances R p tabilit de longueur d onde Pour supprimer une longueur d onde 1 Mettez en surbrillance la longueur d onde appropri e 2 Appuyez sur Delete nm Supprimer Nm Pour ex cuter le test 1 V rifiez que les longueurs d onde et les tol rances sont correctement configur es 2 Appuyez sur Start Test Lancer le test Les r sultats indiquent la r ussite ou l chec du test pour chaque longueur d onde En cas d chec du test suivez les recommandations ci dessous e R p tez le test deux fois pour vous assurer qu il choue bien chaque fois e Assurez vous que les valeurs cibles et de tol rance que vous avez saisies pour la longueur d onde talonn e sont identiques aux valeurs du standard figurant sur le certificat d talonnage R p tabilit de
105. es 6 positions peut accueillir cinq chantillons 3 Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Si un porte cellules 6 positions est install celui ci passe sur la position B pour mesurer le blanc et revient ensuite sur sa pr c dente position 4 Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Si un porte cellules 6 positions est install appuyez sur les boutons de changement de cellule pour repositionner le porte cellules et mesurer les autres chantillons manuellement Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 71 16 Rapport d absorbance Mesure d chantillons 72 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific A Diff rence d absorbance L application Absorbance Difference Diff rence d absorbance vous permet de mesurer la diff rence d absorption pour deux longueurs d onde diff rentes La correction de longueur d onde de r f rence est disponible pour carter les effets d une matrice d chantillon G n ralement utilis e avec les applications de contr le qualit l application de diff rence d absorbance offre un test de diagnostic pratique et rapide concernant la qualit d chantillon Utilisez l application Absorbance Difference Diff rence d absorbance dans les cas suivants e Rappel d un test e Configuration des param tres de test e Correction de cellules e Mesure d un blanc e Mesure d chantillons Pour commencer appuyez sur Test mettez en surbrillance Absorbance Differenc
106. es absorbances et les tol rances de longueur d onde sont pr configur es mais vous devez modifier ces valeurs afin qu elles soient identiques celles figurant sur le certificat d talonnage fourni avec vos standards Remarque Vous pouvez afficher les tol rances de ce test en termes d absorbance ou de pourcentage de transmittance Lors de l ex cution du test Pr cision photom trique n oubliez pas les points suivants e Les standards de pr cision photom trique doivent tre talonn s sur les valeurs d absorbance connues aux longueurs d onde sp cifi es e Mesurez les standards dans l ordre suivant lequel ils apparaissent sur l cran de test e Vous pouvez utilisez jusqu cinq standards Pour afficher l cran Photometric Accuracy Pr cision photom trique 1 Mettez en surbrillance Photometric Accuracy Pr cision photom trique 2 Appuyez sur Enter Entr e Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 143 22 V rification des performances Pr cision photom trique erformance Verification 16 46 2Mar07 hotometric ccuracy nm Expected Tol Meas AT 2T zT Result 1 590 0 50 000 1 200 2 590 0 10 000 1 200 Place Standards 1 2 in positions 1 2 to bs Std Std Test S lection du mode Pour basculer du mode Absorbance au mode Pourcentage de transmittance appuyez sur Change to T Passer sur T ou sur Change to ABS Passer sur ABS jusqu ce que le mode appropri
107. es param tres de test pour une courbe standard Pour configurer les param tres de test pour une courbe standard 1 Mettez en surbrillance le param tre souhait 2 Appuyez sur Enter Entr e pour modifier le param tre et s lectionner la valeur appropri e ou modifier la valeur l aide du clavier num rique R p tez cette proc dure pour les autres param tres le cas ch ant Pour une description des param tres reportez vous la section Param tres Pour les valeurs par d faut reportez vous la section Calculs pour Logiciel Bio Tests 3 Appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test sous un nouveau nom ou Run Test Ex cuter le test pour commencer mesurer le blanc et les standards 4 Appuyez sur Run Standards Ex cuter les standards pour afficher l cran Standards Coomassie Bradford Std Test Name Bradford Std Std Conc Abs pg nL age 1 of 2 Standards 1 5 Press f or to vieu data TES RE Test Standards Standards 118 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 21 Bio tests Mesure des prot ines 5 Pour modifier des valeurs de concentration ajouter un standard supprimer un standard ou r initialiser les standards c est dire supprimer tous les standards s lectionnez le standard modifier puis appuyez sur Edit Standards Modifier les standards Coomassie Bradford Std Test Name Bradford Std Std Conc Edit Concentration pg
108. es param tres sont configur s appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test ou Run Test Ex cuter le test pour mesurer un blanc ou des chantillons Remarque Si la correction de cellules est activ e ON vous devez d abord ex cuter l application de configuration de la correction pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons Remarque Si l option Auto Save Data Enregistrement auto des donn es est activ e ON vous devez d abord saisir un nom de fichier de donn es pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons 70 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 16 Rapport d absorbance Mesure d chantillons Mesure d chantillons Absorbance Ratio 13 14 14Feb02 Test Name BLANK Abs Abs Abs ID 660 0 640 0 Ref UL Result Insert samples 1 5 into positions 1 5 Press ENTER to measure Oo RS T Pour mesurer automatiquement les chantillons option Auto 6 ou Auto 3 1 Installez le blanc et les chantillons 2 Appuyez sur Enter Entr e Pour mesurer manuellement les chantillons option Manual 6 Manuel 6 ou Single Cell Holder Porte cellules position unique 1 Dans l cran Absorbance Ratio Rapport d absorbance appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Installez le blanc et l chantillon Un porte cellul
109. esurer automatiquement un chantillon option Auto 6 ou Auto 8 Appuyez sur Run Test Lancer le test Lorsque vous y tes invit placez le blanc et les chantillons dans leurs positions de cellules puis appuyez sur Enter Entr e L instrument mesure le blanc et les chantillons et affiche les mesures d chantillon Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon pour mesurer d autres chantillons Manuel d utilisation du BioMate 3S 53 13 Mesures de concentration ATC avanc Mesures d chantillons Pour mesurer manuellement les chantillons option Manual 6 Manuel 6 ou Single Cell Holder Porte cellules position unique Appuyez sur Run Test Lancer le test Ins rez le blanc et l chantillon Un porte cellules 6 positions peut accueillir cinq chantillons Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Si un porte cellules 6 positions est install celui ci passe sur la position B pour mesurer le blanc et revient ensuite sur sa pr c dente position Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Si un porte cellules 6 positions est install appuyez sur les boutons de changement de cellule pour repositionner le porte cellules et mesurer les autres chantillons manuellement 54 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific ES Acquisition L application de balayage de longueur d onde vous permet de mesurer l absorption ou le pourcentage du spectre de transmis
110. fich e Standards par d faut de 25 125 250 500 750 1000 1500 2000 M thode Micro Ajustement de courbe d talonnage de second ordre Longueur d onde ug mL BCA de Pierce Thermo Scientific d termin par la m thode des moindres carr s D viation standard affich e analytique 562 nm Standards par d faut de 0 5 1 0 2 5 5 0 10 0 20 0 40 0 200 Manuel d utilisation du BioMate 3S 173 26 Calculs pour Logiciel Bio Tests Test Name Nom 2 Unit s Ae lect Calcul s Param tres par d faut r sultat M thode de Courbe d talonnage de premier ordre avec ajustement Longueur d onde mg mL Biuret interception z ro force d termin par la m thode des analytique 550 nm moindres carr s Standards par d faut de 0 2 0 4 0 6 0 8 0 10 0 UV directs T dant vol ha A1 280 nm mg mL 280 Facteur de dilution D1 2 0 vol chantillon Eacteur280 1 0 vol chantillon Conc Facteur x A D UV directs A1 205 nm mg mL 205 Facteur de dilution D1 vol diluant vol chantillon Facteur205 31 vol chantillon Conc Facteur x A D M thode de nn hf A1 280 nm mg mL Warburg Facteur de dilution D1 e EURE A2 260 nm Christian vol chantillon fI 1 55 Concentration en prot ines CA f gt 4 f P f2 0 76 Croissance Absorbance multipli e par le facteur en option saisi par A1 600 nm Abs cellulaire l utilisateur pour normalisation entre les diff rents f1
111. ics Cin tique et Scanning Balayage Auto 6 tourelle mise en mouvement automatiquement B 1 2 3 4 5 remise z ro syst matique de la position B puis passage la position 1 pour lancer la mesure Sample Volume Volume d chantillon Permet de saisir le volume total de l chantillon Multiplicateur de dilution pour certains bio tests Save Test Enregistrer le test Permet d enregistrer tous les param tres du test en cours dans la m moire interne en vue d un rappel ult rieur tous les tests Scan speed Vitesse de balayage Screen Contrast Contraste de l cran Permet de s lectionner la vitesse Nm min d un balayage Slow Lente Medium Moyenne Fast Rapide Tests Scanning Balayage uniquement Permet de modifier le contraste entre le fond et le texte et d am liorer ainsi la visibilit de l affichage Utility Utilitaire Select Test S lectionner le test Identifie le nom de test en surbrillance par le symbole gt pour inclure le test dans le menu SmartStart Utility Stored Tests Directory R pertoire des tests d utilitaire stock s Set Max X D finir X maxi Set Min X D finir X mini Permet de d finir la position du curseur sur le graphique sous les valeurs mini et maxi de l axe des X pour recalculer le taux Kinetics Cin tique Set nms D finir Nm Permet de saisir et de modifier les valeurs de longueur d onde et de facteur Manue
112. ier calculated 1 000 Sample Positioner Auto 6 umber of Samples 1 More parameters Base Sequence Press f or to select item to change Re Sequence Test Tests Configuration des param tres Pour configurer les param tres 1 Mettez en surbrillance le param tre souhait 2 Pour configurer chaque param tre appuyez sur Enter Entr e puis s lectionnez une valeur ou saisissez les valeurs l aide du clavier num rique 3 Saisissez la s quence de bases a Appuyez sur le bouton Base Sequence S quence de bases pour afficher l cran Base Sequence S quence de bases b Appuyez nouveau sur Base Sequence S quence de bases pour afficher l cran de modification Base Sequence S quence de bases 110 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific Thermo Scientific C 21 Bio tests Tests des acides nucl iques Dligos 16 35 26Mar08 Base Sequence Number of bases DNA MY 5 P03 U RNA M 260 DNA RNA DNA Factor RNA Factor PP ES Sequence Calc Appuyez sur Add Base Ajouter une base pour ajouter la base la s quence Appuyez sur Delete Sequence Supprimer la s quence pour effacer l ensemble de la s quence Appuyez sur Delete Base Supprimer la base pour effacer la derni re base saisie Oligos 16 37 26Mar08 Test Name Oligo Calc A 9 T G U Base Sequence CCTTTGAACATTCCCTAGGC Press f or to select character
113. igo calc factor pmol uL ug mL x 1000 Oligonucl otides facteur de DNA Mol Wt calcul 176 Manuel d utilisation du BioMate 3S pmol uL Thermo Scientific
114. ility Utilitaire Formamide Permet de saisir le pourcentage de formamide contenu dans P g de formamide l chantillon Test Oligos Oligonucl otides GC Permet de calculer le pourcentage des paires GC contenues dans l chantillon Test Oligos Oligonucl otides Mismatch Permet de saisir la valeur de discordance pour calculer Tm de discordance Test Oligos Oligonucl otides of lamp life used de Permet d afficher une estimation du pourcentage de dur e de dur e de vie consomm e de vie consomm e de la lampe sur la base d une dur e de vie de la lampe cinq ans d une lampe type Utility Utilitaire 3 Pt Net Permet de calculer la hauteur de pic du spectre de fond M thode 3 points tangentiel du graphique Scanning Balayage Absorbance Permet de saisir la valeur d absorbance Accept Name Permet d accepter le nom qui a t saisi Accepter le nom Test Name Nom de test et Edit Units Modifier Unit s Add Character Permet d ajouter un caract re en surbrillance lors de la saisie Ajouter un caract re du nom Test Name Nom de test et Edit Units Modifier Unit s Add nm Ajouter Nm Permet d ajouter une longueur d onde et un facteur la liste des tests Multiwavelength Longueurs d onde multiples et de certains tests Performance Verification V rification des performances Area Aire Permet de calculer l aire situ e sous le pic dans le graphique Scanni
115. imilitude le cas ch ant qui seront utilis s pour calculer le Tp Les valeurs de T calcul es s affichent 136 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific S A V rification des performances La v rification des performances vous permet de v rifier les performances de votre instrument concernant les tests suivants e Pr cision de longueur d onde Interne e Pr cision de longueur d onde Standard e R p tabilit de longueur d onde e R solution e Pr cision photom trique e Bruit e Lumi re diffus e e Imprimante interne Effectuez les tests appropri s r guli rement et tenez jour un fichier journal des r sultats afin de mettre en vidence la fiabilit de l instrument et d identifier d ventuels probl mes de performances Remarque Si une imprimante est install e et sous tension l instrument imprime automatique les r sultats du test Vous pouvez galement appuyer sur Print Imprimer pour imprimer un autre exemplaire des r sultats Acc s aux tests de v rification des performances Pour acc der aux tests de v rification des performances 1 Appuyez sur Tests 2 Mettez en surbrillance Performance Verification V rification des performances puis appuyez sur Enter Entr e Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 137 22 V rification des performances Liste de contr le de d pannage Performance Verification 4 21pm S ug09 avelength Accuracy
116. int grale est interdite sans l accord crit de Thermo Fisher Scientific Inc Le contenu de ce document peut tre modifi sans pr avis Toutes les informations techniques contenues dans le pr sent document sont fournies titre de r f rence uniquement Les configurations et sp cifications qui y sont indiqu es pr valent sur toute autre information pr c demment communiqu e l acheteur Par ailleurs Thermo Fisher Scientific Inc ne garantit pas l exhaustivit l exactitude des informations fournies ni que le pr sent document est exempt d erreur et d cline toute responsabilit pour les erreurs omissions dommages ou pertes li s l utilisation de ce document m me dans le cas o les instructions qu il contient seraient scrupuleusement respect es Ce document ne fait pas partie int grante d un quelconque contrat de vente pass entre Thermo Fisher Scientific Inc et un acheteur Ce document ne r git ou ne modifie en aucune mani re les Conditions de vente lesquelles r gissent la r solution de tous les conflits pouvant survenir entre ces deux documents Historique des versions Oo Tm Table des mati res Pr late sinus a a eE EE E ENER ix Mises en garde de s curit et autres avis sp ciaux ix Chapitre 1 Pr sentation du spectrophotom tre 1 Composants du spectrophotom tre ssvaishiousasbedes assises 1 Connecteurs ss ns e a E a A E E E A E S
117. ion du BioMate 3S 1 1 Pr sentation du spectrophotom tre Composants du spectrophotom tre Connecteurs Les connecteurs sont situ s l arri re de l instrument EEE EEE EEE Port de communication USB Port imprimante USB Compartiment fusibles Connecteur d alimentation en courant alternatif Interrupteur marche arr t AVERTISSEMENT Pour viter tout risque d lectrocution avant de d brancher le cordon d alimentation du connecteur de l instrument veillez mettre l instrument hors tension et le d brancher de la prise murale ou de la multiprise 2 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific propos du clavier Thermo Scientific Test Name Wavelength 1 Haverengih 2 Factor 1 Factor 2 Units anple Positioner Number of Samples ore parameters Absorbance Difference f Wavelength Correction Press T or to select item to change ave ore SE 3Jan 1 Pr sentation du spectrophotom tre Composants du spectrophotom tre Test Touche ou bouton 0000 Touches de fonction Tests un Test Fonction Appel es touches de fonction Permettent d ex cuter la fonction sp cifique qui appara t au dessus de chaque touche Les fonctions varieront selon l cran logiciel Certaines touches de fonction peuvent ne pas tre actives Permet d effacer la valeur en cours de saisie Permet de
118. ionn es 4 Pour s lectionner d autres longueurs d onde appuyez sur Next Cursor Curseur suivant y pour activer la ligne de curseur au centre et droite S lectionnez les longueurs d onde en appuyant sur Cursor et Cursor R p tez l op ration jusqu ce que vous ayez s lectionn les trois longueurs d onde 5 Appuyez sur Enter Factor Saisir le facteur pour acc der la zone de d finition du facteur Saisissez le facteur souhait puis appuyez sur Enter Entr e L instrument calcule la valeur de l absorbance via la m thode 3 points pour les longueurs P P d onde s lectionn es et multiplie cette valeur par le facteur s lectionn P P 62 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 14 Acquisition Affichage et manipulation des donn es du balayage Calcul de l aire situ e sous une courbe Thermo Scientific Pour calculer l aire situ e sous une courbe Une fois vos donn es de balayage affich es sur l cran de modification du graphique appuyez sur Math Appuyez sur Area Aire pour afficher l cran de mesure Area Under the Curve Aire situ e sous la courbe Scanning 13 50 20Jun02 Test Name Filter BLANK 440 460 0 075 0 060 0 730 0 000 425 Yave length 500 Area Tangent 4 933 Factor 1 000 n e ex Options Cursor Cursor Appuyez sur Cursor et Cursor pour positionner la ligne de curseur gauche sur la valeur de longueur d onde souhait e LE
119. ise la m me fr quence de r sonance qu une cellule celle ci se brisera Si une cellule a t nettoy e l aide d un bain ultrasons la garantie du fabricant devient caduque IMPORTANT Ne s chez pas les cellules l aide d un four Les microcellules d analyse peuvent tre nettoy es de la fa on suivante e Rin age avec un solvant apr s utilisation e Aspiration travers la cellule des acides ou bases dilu es des d tergents non r sistants ou du Clorox par petites touches e Stockage de la cellule apr s l avoir remplie d eau distill e Nettoyage des vitres du compartiment chantillons N utilisez pas d ac tone ni de substance abrasive pour nettoyer les vitres du compartiment chantillons Utilisez la place une solution nettoyante non abrasive de laboratoire par exemple une solution nettoyante pour cellule du commerce de l eau distill e ou de l alcool Utilisez le liquide et un chiffon doux non pelucheux pour nettoyer les vitres N appliquez pas une trop forte pression Vous risqueriez d endommager les vitres Assurez vous de retirer toutes les traces de doigts Remplacement du fusible 152 Le fusible se trouve dans le module d entr e d alimentation situ au centre du panneau arri re de l instrument e 120 VCA 2 5 A Slo Blo e 240 VCA 1 25 A Slo Blo 2 requis IMPORTANT Le fusible de l instrument doit tre remplac par un fusible de m me type et m me puissance
120. it de longueur d onde 141 R SOHONE 855 aan para Pt E de ns AO CR 142 Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S vii Table des mati res viii Chapitre 23 Chapitre 24 Chapitre 25 Chapitre 26 Chapitre 27 Manuel d utilisation du BioMate 3S Pr cision photom trique ns 4 eee des tabs net Elite ne 143 S l ction du mod s stesia ie hide SOLS 144 Ajour destandards ispre aaa e a e o a a n ba ia 144 Suppression de standards o oo onun uneer 145 Ex cution d teste kire ds se nin one e i ER 145 Priit eieae i magaan ayan ane Sa a aA a a a a a EA 146 Lumi re diffusen nian se meen E N T A O E A A NE 147 Ex cution du test eena o GE sales MP E 147 Imprimante interess ie cieee M en E E E io ei oe 148 Maintenant nannan a eR n Enine EE sans 149 Entretien p nodique is A een ousi na i ANS die e i ER h 149 Nettoyage et entretien des cellules olien Rens 2 150 Nettoyage des vitres du compartiment chantillons 152 Remplacement du fusible cu fra sut es don BD dite c 152 Param tres nn ne er aiaa A EE 155 Caleuis 1ogic ls 5 se a Net 167 Calculs pour Logiciel Bio Tests 171 Calculs du calculateur d oligonucl otides 175 Thermo Scientific Pr face Nous vous remercions pour votre achat d un spectrophotom tre Thermo Scientific Nos spectrophotom tres pr sentent des caract ristiq
121. itions Remarque Si l option de m thode Cell Positioner Positionneur de cellules est param tr e sur Auto 6 l instrument tente d initialiser le positionneur de cellules chaque fois que vous appuyez sur Run Test Ex cuter le test pour commencer une mesure Si un porte cellules position unique est install le message Error Single Cell Holder found Use Single Cell Holder Erreur porte cellules position unique d tect Utiliser le porte cellule position unique s affiche Appuyez sur Accept Change Accepter la modification pour poursuivre la mesure avec une seule cellule ou installez le changeur 6 cellules et appuyez sur Cancel Change Annuler la modification Pour une liste plus d taill e des accessoires disponibles reportez vous la nomenclature S lection et positionnement des cuves La plage de longueurs d onde compatible avec les diff rents types de cellules d pend du mat riel utilis Type de cellule Longueur d onde Verre optique 360 nm gt 1100 nm Verre borosilicat 330 nm gt 1100 nm Jetable Quartz 190 nm gt 1100 nm Polystyr ne gt 340 nm M thacrylate gt 300 nm Acrylique gt 280 nm Transparent aux UV gt 220 nm Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 5 1 Pr sentation du spectrophotom tre Dimensions Z Remarque Reportez vous
122. l s lectionn Remarque Il est possible de calculer et d afficher jusqu neuf pics et creux Lissage des donn es Si votre balayage indique un bruit d chantillonnage vous pouvez lisser les donn es l aide de la fonction de lissage Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 61 14 Acquisition Affichage et manipulation des donn es du balayage lt Pour lisser les donn es Une fois les donn es de balayage affich es sur l cran de modification du graphique appuyez sur Smoothing On Lissage Activation D termination de la hauteur de pic l aide de l quation de la m thode 3 points Pour d terminer des mesures l aide de la m thode 3 points 1 Une fois vos donn es de balayage affich es sur l cran de modification du graphique appuyez sur Math 2 Appuyez sur 3 Pt Net M thode 3 points L cran de mesure via la m thode 3 points affiche les options du curseur et trois lignes de curseur correspondant la longueur d onde gauche au centre et droite Scanning 13 45 20Jun02 Test Name Filter BLANK 407 415 425 0 045 0 384 0 041 0 400 0 020 400 Yave length 435 3 Pt Net Value 0 341 Factor 1 000 n nter ex Factor Cursor Cursor 3 Appuyez sur Cursor et Cursor pour positionner la ligne de curseur gauche sur la valeur de longueur d onde souhait e L instrument calcule l absorbance via la m thode 3 points pour les longueurs d onde s lect
123. l d utilisation du BioMate 3S 163 24 Param tres 164 Param tre Set Options D finir les options Description Permet de s lectionner l entr e de facteur ou le spectre de fond pour calculer le p rim tre du graphique situ sous le pic Scanning Balayage Setup correction Correction de configuration Permet de lancer la proc dure de recueil des donn es n cessaires pour corriger les carts d absorbance entre les cuves tous les types de test Slope Pente Permet de saisir la valeur AAbs AConcentration Type de test Standard Curve Courbe standard Smoothing Lissage Permet d activer et de d sactiver le lissage des donn es Scanning Balayage Software Revision R vision logicielle SRE tolerance Tol rance SRE Affiche la version du micrologiciel de l instrument Utility Utilitaire Lumi re diffus e minimale acceptable Standard Concentrations Concentrations du standard Permet de saisir la concentration des standards servant g n rer la courbe standard du test Standby Veille Permet de s lectionner le temps coul depuis la derni re frappe de touche ou la derni re activit de l instrument mise hors tension de l unit pour conomiser la dur e de vie de la lampe Utility Utilitaire Start wavelength Longueur d onde de d but Permet de saisir la longueur d onde de d but pour un balayage Tests Scanning Balayage uniquement
124. l d utilisation du BioMate 3S 21 3 Accessoires Installation de l imprimante interne facultatif Installation de l imprimante interne facultatif PRECAUTION Pour viter tout risque d lectrocution Avant d installer l imprimante interne mettez l instrument hors tension et d branchez le cordon d alimentation de la prise Vis imperdable situ e sur la porte de la lampe Retrait de la porte de la charni re Raccordement des c bles l imprimante Charni re Pour installer l imprimante interne 1 Desserrez la vis imperdable situ e sur la porte de la lampe Pour ce faire faites la pivoter d 1 4 de tour dans le sens antihoraire 2 Ouvrez la porte de la lampe 3 Utilisez un stylo ou un tournevis pour soulever les pattes qui maintiennent la porte sur la charni re 4 Faites glisser la porte en dehors de la charni re 5 Retirez l imprimante quip e imprimante install e sur la porte accessoire de son emballage 6 Abaissez la charni re pour viter qu elle ne g ne 7 Branchez les c bles et positionnez les l aide d un petit tournevis Les connecteurs ne s enfichent que d une seule fa on Chaque connecteur a une forme qui ressemble celle d un D V rifiez que le c t du connecteur muni de contacts m talliques brillants fait face la porte en plastique et non l imprimante 8 Utilisez le clip situ sur la charni re pour fixer les c bles 9 R installez la porte de l impri
125. lisation de calculs sur les donn es de balayage Vous pouvez modifier votre graphique en r alisant des calculs sur les donn es Dans l cran Edit Graph Modifier le graphique appuyez sur Math L cran Math permet d effectuer les t ches suivantes e D nomination des pics et des creux e Lissage des donn es e Calcul de l aire situ e sous une courbe e D termination de la hauteur de pic l aide de l quation de la m thode 3 points 60 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 14 Acquisition Affichage et manipulation des donn es du balayage Scanning 9 15 15Feb02 Test Name FILTER BLANK 2 220 Yave length 500 0 IDH 1 Baseline collected 15Feb02 Off Net Valleys D nomination des pics et des creux Pour d nommer des creux et des pics 1 Une fois le balayage affich sur l cran de modification du graphique appuyez sur Math Scanning 13 40 20Jun02 Test Name Filter BLANK 0 730 f Label Peaks Off Label Valleys Off Features 1 a Press T or L to select Press ENTER to change Press ESC to exit 0 000 Yave length IDH 1 Baseline collected 20Jun02 2 Appuyez sur Peaks amp Valleys Pics et creux pour afficher la fen tre Label Peaks and Valleys D nommer les pics et les creux 3 S lectionnez le type de libell afficher puis appuyez sur Enter Entr e L instrument d nomme les l ments s lectionn s sur le trac des donn es de balayage en utilisant le type de libel
126. lle au bout de 15 minutes d inactivit Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 11 2 Configuration de l instrument Configuration des param tres de l utilitaire Configuration du d lai d expiration du spectre de fond Si vous comptez effectuer des balayages sur vos chantillons vous pouvez d finir un d lai pendant lequel un spectre de fond pr lev sera valide Ceci est particuli rement utile lorsque les mesures sont effectu es dans un environnement de production subissant plusieurs changements ou lorsque la nature du blanc change consid rablement avec le temps Pour d finir le d lai d expiration du spectre de fond 1 Mettez en surbrillance Baseline Expiration hr min Expiration du spectre de fond hr min puis appuyez sur Enter Entr e Utility 3 47am 16Mar07 Softuare Revision 1 200 Instrument Serial Number 2M74123005 Printer Internal Date Time Setup 3 47am 16Mar07 db i 4 of lamp life used Screen Contrast 2 Saisissez le d lai souhait dans le champ Entry baseline expiration time Saisir le d lai d expiration du spectre de fond puis appuyez sur Enter R glage du contraste de l cran Pour faciliter la lecture des l ments affich s l cran vous pouvez r gler le contraste de l cran de l instrument Pour r gler le contraste de l cran f4 1 Mettez en surbrillance Screen Contrast Contraste de l cran puis appuyez sur Enter Entr e 12 Manuel d utilisa
127. mante en la faisant glisser dans la charni re 10 Refermez la porte de la lampe 11 Serrez la vis imperdable de la porte de l imprimante pour maintenir la porte en position 22 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 3 Accessoires Installation de l imprimante interne facultatif Chargement du papier dans l imprimante interne Support du Fente de chargement du papier rouleau d alimentation Patte Ic ne indiquant le sens d introduction du papier Remarque Assurez vous que les supports du rouleau d alimentation papier sont positionn s comme indiqu ci dessus Lorsqu ils sont correctement install s ils s encastrent dans la partie sup rieure de l instrument Pour charger le papier dans l imprimante interne 1 Coupez le papier de fa on ce que ses bords soient r guliers Remarque Les fl ches situ es sur les supports du rouleau d alimentation papier indiquent le sens d introduction du papier 2 Ins rez le papier droit dans la fente de chargement du papier L imprimante saisit l extr mit du papier et le fait avancer 3 En mode Basic ATC ATC de base appuyez sur Enter Entr e lorsque le papier s arr te pour poursuivre l insertion du papier jusqu ce que celui ci sorte de la fente de sortie du papier 4 Tirez vers l ext rieur les pattes situ es sur les supports du rouleau d alimentation papier et fixez le papier sur la tige Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3
128. mineux N de position de cellule uniquement avec une tourelle auto Change Mode Permet de basculer entre les diff rents modes de mesure Changer de mode Mode Basic A T C ATC de base et certains tests Change to Abs Performance Verification V rification des performances Passer en mode Abs Change to T Passer en mode T Collect Baseline Mesurer Permet de lancer la mesure du spectre de fond le spectre de fond Scanning Balayage uniquement Concentration Permet de d finir la valeur de concentration Conc of Standard Permet d afficher la valeur de concentration saisie Conc du standard Mode Adv A T C ATC avanc Correction Mode Mode de correction Manuel d utilisation du BioMate 3S Permet de s lectionner le mode de correction de cellules Discrete nms Nm discrets ou Scan Balayage Thermo Scientific Thermo Scientific Param tre Cursor Curseur 24 Param tres Description Permet de passer en mode de suivi du curseur pour visualiser les points de donn es dans le graphique Kinetics Cin tique Scanning Balayage Cursor Curseur Cursor Curseur Permet de d placer le curseur vers la droite ou la gauche sur le graphique et d afficher les donn es de chaque point Kinetics Cin tique Scanning Balayage Curve Fit Adaptation de courbe Permet de s lectionner le type de calcul d adaptation de ligne Tests Standard Curve Courbe standard
129. mple Vous pouvez utiliser cet cran pour 325 e Mesurer un nouveau spectre de fond appuyez sur Collect Baseline Mesurer le spectre de fond e Afficher les donn es du balayage dans un tableau appuyez sur Tabular Tableau e Mesurer des chantillons suppl mentaires appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Calculateur d oligonucl otides d ADN Le calculateur Oligos facteur Calc calcule le poids mol culaire le coefficient d extinction et un facteur de concentration pour un ADN et un ARN oligonucl otides courts lt 40 m res en fonction de la s quence que vous avez saisie Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 109 21 Bio tests Tests des acides nucl iques Ce facteur de concentration permet de calculer la concentration des oligonucl otides dans votre chantillon partir de la mesure d absorbance Pour une description des param tres reportez vous la section Param tres Pour les valeurs par d faut reportez vous la section Calculs pour Logiciel Bio Tests Pour commencer mettez en surbrillance Nucleic Acid Tests Tests des acides nucl iques puis appuyez sur Enter Entr e La liste des tests des acides nucl iques s affiche Mettez en surbrillance le test souhait puis appuyez sur Enter Entr e L cran de param tre Oligos calc factor Oligonucl otides facteur de calcul s affiche DNA Oligo calculator DETTE OINEETIES Dilution Multipl
130. n en acide Necklace A A D 325 nm f J i A1 260 nm Ratio aa A2 280 nm en option we Paraf Aref 320 nm en option f1 50 vol dil 0 vol ch 0 ADN ARN 1 di I chantill Lancer longueur d onde pg mL 260 230 Facteur de dilution D1 Ni UMP OR T ORAAL 225 nm avec balayage vol chantillon Arr ter longueur d onde Concentration en acide Necklace A A JED 325 nm f f A pr A1 260 nm Ratio F A A2 230 nm a ef Aref 320 nm en option fl 49 1 vol dil 0 vol ch 1 ssADN Ldil aii A1 260 nm ug mL Facteur de dilution D1 E CNP ERRENCS FacteurssADN 33 vol chantillon Conc Facteur xx x A D ARN Ldi chantill A1 260 nm pg mL Facteur de dilution D1 2 UONE FENOL CONUN Panter ARN 40 vol chantillon Conc Facteur gya x A D Oligos A1 260 nm ug mL facteur saisi Facteur de dilution D1 vol diluant vol chantillon FacteurOligos 38 vol chantillon Conc Facteurs x A D Calculateur E E R h A1 260 nm ug mL d oligonucl otide Facteur de dilution D1 7 Aan 2 anlon FacteurCalc facteur s d ADN vol chantillon calcul par le Calculateur Conc Facteur x A D f d oligonucl otides 172 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 26 Calculs pour Logiciel Bio Tests Test Name Nom z Unit s Je lecti Calcul s Param tres par d faut FRS ltnt Coomassie Ajustement de courbe d talonnage de second or
131. n p riph rique de stockage USB ne peuvent pas tre verrouill s ni d verrouill s Attribution d un nom un test Thermo Scientific Lors de l enregistrement d un test d finissez un nom de fichier en utilisant huit caract res alphanum riques lt Pour donner un nom un test 1 Apr s avoir d fini les param tres de test mettez en surbrillance Test Name Nom de test puis appuyez sur Enter Entr e Manuel d utilisation du BioMate 3S 31 6 Gestion des tests stock s Enregistrement d un test Create Test Name 12 21 21Feb07 BCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVUXY20123456789 abcdefghijkimnopgrstuvuxuz _ x pO H Test Name ress f or to select character ress ccept Name to save the test Character Name Cet cran vous permet e De supprimer le nom d un test e De supprimer un caract re du nom e D ajouter un caract re au nom e D accepter le nom 2 Mettez en surbrillance le premier caract re du nom de test puis appuyez sur Add Character Ajouter un caract re 3 Continuez s lectionner et ajouter des caract res jusqu ce vous ayez termin de saisir le nom 4 Appuyez sur Accept Name Accepter le nom Enregistrement d un test Apr s avoir configur une m thode vous avez le choix entre deux options d enregistrement du test La m thode de test peut tre enregistr e via un p riph rique de stockage externe raccord au port USB frontal ou via la m moire interne du spectrophotom
132. nction de l absorbance et du facteur de concentration ou en fonction de l absorbance et du facteur de concentration d termin par le calculateur d oligonucl otides Plusieurs de ces cat gories incluent diff rents tests qui sont similaires Par cons quent les proc dures ci apr s n int grent pas d exemples d cran pour chaque test Par exemple les param tres sont les m mes pour les tests ADNsb ARN et Conc ADN ARN 260 nm toutefois le facteur utilis pour convertir l absorbance en concentration est diff rent De la m me fa on les param tres sont les m mes pour la mesure UV direct des tests d oligonucl otides mais les facteurs utilis s pour convertir l absorbance en concentration sont diff rents Pour la liste compl te des param tres et des calculs de chaque test reportez vous la section Param tres Calculs logiciels Calculs pour Logiciel Bio Tests ou Calculs du calculateur d oligonucl otides Tests de conc ADN ARN 260 d ADNsb d ARN et d oligonucl otides facteur saisi Ces m thodes de test sont configur es et ex cut es l aide des m mes param tres Pour une description des param tres reportez vous la section Param tres Pour les valeurs par d faut reportez vous la section Calculs pour Logiciel Bio Tests 100 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 21 Bio tests Tests des acides nucl iques Pour commencer mettez en surbrillance Nucleic Acid Tests Tests des acides nucl iq
133. nexion USB Lorsque vous activez le PC comme tant le p riph rique d impression les donn es ASCII sont envoy es vers le PC via la connexion USB Aucun graphique n est envoy Un programme doit tre install sur le PC pour pouvoir capturer et utiliser les donn es non fourni Manuel d utilisation du BioMate 3S 13 2 Configuration de l instrument Configuration de l imprimante interne Pour que l instrument puisse afficher correctement les informations envoy es vers l imprimante s lectionnez l appareil appropri Pour d finir les param tres de l utilitaire de l imprimante 1 Appuyez sur Utility Utilitaire 2 Mettez en surbrillance Printer Imprimante puis appuyez sur Enter Entr e Utility 4 11pn S Aug09 Softuare Revision 4 0004 Instrument Serial Number 2R01234567 Internal PC External Press f or 1 to select Press ENTER to change Press ESC to exit tored Tests Directory SB Drive Files Calculator ress or to select parameter 3 S lectionnez l imprimante puis appuyez sur Enter jusqu ce que l option On Activ s affiche 4 Appuyez sur Esc chap pour enregistrer les param tres Remarque Le texte et les graphiques peuvent tre imprim s via l imprimante interne et une imprimante externe branch e sur le port USB Seul le texte pas les graphiques peut tre imprim via la connexion USB d un ordinateur 14 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientifi
134. ng Balayage Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 155 24 Param tres 156 Param tre AutoPrint Impression auto Description Permet d activer et de d sactiver l impression automatique Autoscale Mise l chelle auto Permet de remettre l chelle le graphique en fonction des plages de valeurs d origine de l axe des X et des Y Kinetics Cin tique Scanning Balayage Base Sequence S quence de bases S quence des bases contenues dans l chantillon Tests Oligos calc factor Oligonucl otides facteur de calcul Baseline Expiration Expiration du spectre de fond Permet de saisir le d lai au bout duquel le spectre de fond des tests de balayage devra tre remesur Utility Utilitaire Beeper Bip sonore Permet d activer et de d sactiver le signal sonore qui retentit chaque pression d une touche Utility Utilitaire Calculation Baseline Spectre de fond de calcul Permet de s lectionner le spectre de fond z ro ou le spectre de fond tangentiel pour calculer l aire situ e sous le pic dans le graphique Scanning Balayage Calculator Calculatrice Correction des cellules Permet de passer en mode calculatrice Utility Utilitaire Permet de s lectionner l option de correction automatique des carts d absorption entre les cuves tous les types de test Cell Position Affiche la position plac e sur le trajet lu
135. nm Protein Assay Pour la liste compl te de tous les param tres de chaque test et la liste des calculs utilis s pour les tests reportez vous la section Param tres Pour les valeurs par d faut reportez vous la section Calculs pour Logiciel Bio Tests M thodes de test prot ique colorim triques Thermo Scientific Remarque Les crans ci dessous illustrent les param tres de la m thode standard de Coomassie Bradford Tous les autres tests prot iques colorim triques fonctionnent d une fa on similaire Pour commencer mettez en surbrillance Protein Tests Tests prot iques dans l cran Bio Tests Bio tests puis appuyez sur Enter Entr e La liste des tests prot iques s affiche Mettez en surbrillance le test souhait puis appuyez sur Enter Entr e Protein Tests 8 11 4Apr08 oomassie Bradford Std Coonmassie Bradford Micro Loury Standard Pierce Modified Lowry BCA Standard Pierce Micro BCA tn Biuret Protein Conc 280 Protein Conc 205 Warburg Christian Press f or to select BR SRE Tests ATC Une fois qu une m thode a t s lectionn e l cran de param tres appropri s affiche vous trouverez ci dessous l exemple de l cran de la m thode de Coomassie Bradford Manuel d utilisation du BioMate 3S 117 21 Bio tests Mesure des prot ines Sample Positioner ore parameters Press ft or to select item to change PAR 7 o Standards Test Tests Configuration d
136. ns cette application ni les facteurs utilis s lorsqu un seul standard est mesur Pour obtenir une meilleure pr cision et pouvoir enregistrer et rappeler des m thodes et des donn es utilisez le mode Standard Curve Courbe standard d crit dans la section Mesures de concentration Application Standard Curve Courbe standard la page 81 La mesure de la concentration l aide du mode Basic ATC ATC de base est similaire la mesure de l absorbance ou du pourcentage de transmittance Le mode Basic ATC ATC de base vous permet de mesurer la concentration en utilisant soit un facteur soit un standard pour convertir des relev s d absorbance en unit s de concentration e Lorsque vous utilisez un facteur indiquez le facteur et les unit s de concentration e Lorsque vous utilisez un standard indiquez la concentration du standard et mesurez son absorbance Lorsque le mode Basic ATC ATC de base est param tr sur Conc Std Conc st ou Conc Factor Conc facteur vous pouvez effectuer ces t ches e Configuration de la longueur d onde et du mode e Mesure d un blanc e Mesure d un standard ou saisie d un facteur e Mesure d chantillons Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 47 12 Mesures de concentration de base ATC de base Configuration de la longueur d onde et du mode La proc dure suivre pour prendre des mesures dans ces deux modes est similaire la seule diff rence r sidant dans le fait que dans
137. nsion charge automatiquement ce test et se pr pare effectuer imm diatement la mesure Si vous s lectionnez plusieurs tests en tant que tests SmartStart l instrument une fois mis sous tension affiche automatiquement un menu qui r pertorie uniquement ces tests Remarque Vous pouvez toujours acc der au menu principal par d faut en appuyant sur Test Pour configurer un seul test SmartStart 1 Appuyez sur Utility Utilitaire pour afficher l cran Utility Utility 11 04 28Feb07 Software Revision 0 014b Instrument Serial Number rinter Off Date Time Setup 11 04 28Feb07 beeper 4 of lamp life used creen Contrast ress or to select parameter 2 Mettez en surbrillance Stored Tests Directory R pertoire des tests stock s puis appuyez sur Enter Entr e 3 Mettez en surbrillance le test appropri puis appuyez sur Select Test S lectionner le test Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 37 7 SmartStart La fl che gt indique que le test a t s lectionn pour le menu SmartStart Appuyez sur Esc chap pour revenir l cran Utility Utility ou mettez l instrument hors tension Pour d s lectionner un test Appuyez sur Utility Utilitaire Mettez en surbrillance Stored Tests Directory R pertoire des tests stock s puis appuyez sur Enter Entr e Mettez en surbrillance le test supprimer puis appuyez sur Unselect Test D s lectionn
138. ntillons inconnus est d termin e de fa on ratiom trique partir du facteur saisi La mesure peut tre exprim e math matiquement de la fa on suivante Abs T of Sample Factor Concentration of Sample Abs T de l chantillon Facteur Concentration de l chantillon o le facteur est saisi l absorbance le pourcentage de transmittance de l chantillon sont mesur s et la concentration de l chantillon est calcul e Manuel d utilisation du BioMate 3S 49 12 Mesures de concentration de base ATC de base Mesure d chantillons Pour utiliser l option Conc Factor Conc facteur pour mesurer la concentration Si n cessaire appuyez sur Change Mode Changer de mode pour passer en mode Conc With Factor Conc avec facteur Appuyez sur Units Factor Unit s facteur pour configurer le facteur et s lectionner les unit s Conc with Factor 15 29 6Mar01 Factor 45 Units C Press f or 1 to select item to change nr SL SEE Factor Units Appuyez sur Enter Factor Saisir le facteur Saisissez la valeur du facteur souhait Appuyez sur Enter Factor Saisir le facteur pour accepter le facteur et revenir l cran sur lequel s affichent le facteur et les unit s Appuyez sur Select Units S lectionner les unit s Mettez en surbrillance l unit appropri e dans la liste puis appuyez sur Enter Entr e Appuyez sur Esc chap pour revenir l cran Conc With Factor Conc avec fa
139. nts courbe d chantillon M thode 3 points Absorbance corrig e du spectre de fond ASTM E169 04 j a Le E AT 4 170 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 2 Calculs pour Logiciel Bio Tests Test Name Nom 7 a Unit s de test Calcul s Param tres par d faut re Conc a E NET A1 260 nm ug mL ADN ARN Facteur de dilution D1 MR nr Ar f 320 nm en option vol chantillon 2 fI 50 Concentration en acides nucl iques vol dil 0 pa A A D vol ch 1 Ratio E Aref ADN ARN T E A1 260 nm ug mL 260 280 Facteur de dilution D1 Vani vor Chantilfon A2 _ 280 nm vol chantillon Ar f 320 nm en option Concentration en acides nucl iques fl 50 JA liD vol dil 0 A A vol ch 1 Ratio 27 Aref ADN ARN P TENET A1 260 nm ug mL 260 230 Facteur de dilution D1 Re 2 _ antinon Ap 230 nm vol chantillon Ar f 320 nm en option Concentration en acide Necklace A A ED 7 fl 50 AA vol dil 0 Ratio Fi a vol ch 1 27 Aref Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 171 26 Calculs pour Logiciel Bio Tests Test Name Nom 2 Unit s fe leci Calcul s Param tres par d faut rat ADN ARN Lancer longueur d onde pg mL 260 280 Facteur de dilution D1 POL AATA VR EALO 225 nm avec balayage vol chantillon Arr ter longueur d onde Concentratio
140. o Scientific 22 V rification des performances Pr cision de longueur d onde Interne Pr cision de longueur d onde Interne Ce test rep re les pics de la lampe x non interne et affiche les longueurs d onde attendues et mesur es pour les pics Une lampe x non a des lignes fondamentales solides 229 nm 529 nm et 883 nm Ces lignes sont une propri t essentielle du x non et servent de standard Lorsque vous ex cutez le test standard interne rappelez vous que e Les longueurs d onde et les valeurs de tol rance sont pr configur es et ne peuvent pas tre modifi es e Le porte cellules doit tre vide Pour ex cuter le test Wavelength Accuracy Internal Pr cision de longueur d onde Interne 1 Mettez en surbrillance Wavelength Accuracy Internal et appuyez sur Enter Entr e 2 Appuyez sur Start Test Lancer le test Les r sultats indiquent la r ussite ou l chec du test pour chaque longueur d onde Standard Curve 12 50 14Feb02 Test Name AMMONIA BLANK Std Conc Abs mg L 660 Onm 1 25 00 2 45 00 3 55 00 4 75 00 5 100 0 Page 1 Standards 1 5 SET ea Blank Test Standards En cas d chec du test suivez les recommandations ci dessous e R p tez le test deux fois pour vous assurer qu il choue bien chaque fois e Pour plus d informations sur le d pannage contactez l assistance technique Thermo Scien
141. ock s Prise de mesures Configuration des param tres de test Pour configurer les param tres de test 1 Mettez en surbrillance le param tre souhait 2 Lorsque les param tres sont configur s appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test ou Run Test Ex cuter le test pour mesurer un blanc ou des chantillons Remarque Si la correction de cellules est activ e ON vous devez d abord ex cuter l application de configuration de la correction pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons Remarque Si l option Auto Save Data Enregistrement auto des donn es est activ e ON vous devez d abord saisir un nom de fichier de donn es pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons 78 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 18 M thode 3 points Prise de mesures Prise de mesures Ke Le Pour prendre automatiquement des mesures option Auto 6 ou Auto 3 1 Une fois l cran 3 Point Net Setup Configuration de la m thode 3 points affich et les Thermo Scientific param tres configur s appuyez sur Run Test Ex cuter le test pour afficher l cran de mesure 3 Point Net M thode 3 points 3 Point Net 10 25 15Feb02 Test Name BILIRUBIN BLANK Abs Abs bs Result ID 429 0 515 0 630 0 C Insert sample 1 into position 1 Press ENTER to
142. ombre de standards R gression lin aire A A c cas g n ral O A absorbance c concentration A c est d fini par une quation du type suivant A c a 4c4 a3c3 a2c2 a1c a0 O a0 point d intersection de l axe des Y a1l a4 coefficients Les coefficients sont calcul s l aide de la m thode des moindres carr s Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 167 25 Calculs logiciels Calcul Calcul s R gression lin aire A a1 c par z ro O A absorbance c concentration al pente La pente est calcul e de la fa on suivante al SXY SXX Ce mod le requiert les conditions suivantes e La pente n est pas gale z ro ou l infini e Au moins un point de donn es standard avec une concentration gt 0 e Absorbance du blanc de concentration 0 OA Mod le segment Le mod le segment requiert les conditions suivantes e Donn es relatives deux points de donn es standard au minimum avec des concentrations et des absorbances diff rentes Les pentes de tous les segments doivent tre ascendantes positives ou descendantes n gatives Graphiques Validit des courbes A c1 gt A c2 pour tous les cas c1 gt c2 standard ou A c1 lt A c2 pour tous les cas c1 gt c2 O A absorbance cl c2 concentration 168 Manuel d utilisation du BioMate 3S A3SORBANCE MEASURED RANGE ABSORBANCE ABSI UNDEPNED CONCEN CALCULATED JINCGENMATNIO
143. on du test Thermo Scientific Ce test mesure la lumi re diffus e aux longueurs d onde s lectionn es et compare les mesures aux valeurs attendues Les longueurs d onde et les valeurs attendues sont pr configur es et ne peuvent pas tre modifi es L ex cution de test de la lumi re diffus e prend environ 30 secondes Lorsque de l ex cution de ce test n oubliez pas les points suivants Les standards de lumi re diffus e doivent tre d finis pour mesurer la lumi re diffus e 220 nm 340 nm et 400 nm pourcentage de transmittance lt 0 1 la longueur d onde consid r e e La position B doit tre vide e Utilisez la position n 1 pour le standard de lumi re diffus e 220 nm SRE 220 ou quivalent e Utilisez la position n 2 pour le standard de lumi re diffus e 340 nm SRE 340 ou quivalent e Utilisez la position n 3 pour le standard de lumi re diffus e 400 nm SRE 400 ou quivalent Dans l cran Stray Light Lumi re diffus e assurez vous que les longueurs d onde et les tol rances sont correctement d finies Pour ex cuter le test Stray Light Lumi re diffus e 1 Mettez en surbrillance Stray Light Lumi re diffus e 2 Appuyez sur Enter Entr e 3 Appuyez sur Start Test Lancer le test Les r sultats indiquent la r ussite ou l chec du test pour chaque longueur d onde En cas d chec du test suivez les recommandations ci dessous e R p tez le test deux fois pour vous
144. onc Abs Factor ppb 650 0nm calculated e E Entry Enter a number 0 001 to 9999 2 Saisissez la concentration du standard puis appuyez sur Enter Entr e 52 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 13 Mesures de concentration ATC avanc Saisie d un facteur Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Ins rez le blanc et le standard Appuyez sur Enter pour mesurer le blanc et les chantillons et afficher l absorbance et le facteur calcul Pour mesurer manuellement un standard option Manual 6 Manuel 6 ou Single Cell Holder Porte cellules position uniquel Appuyez sur Run Standard Ex cuter le standard Saisissez la concentration du standard puis appuyez sur Enter Entr e Installez le blanc et le standard Appuyez sur Measure Blank Mesurer l chantillon Si un porte cellules 6 positions est install celui ci passe sur la position B pour mesurer le blanc et revient ensuite sur sa pr c dente position Appuyez sur Measure Standard Mesurer le standard L instrument mesure l absorbance du standard et affiche l absorbance et le facteur calcul Saisie d un facteur R La Pour saisir un facteur Mettez en surbrillance Factor Facteur Pour modifier le facteur saisissez le facteur appropri Pour modifier les unit s mettez en surbrillance Units Unit s pus s lectionnez les unit s appropri es Mesures d chantillons Thermo Scientific Pour m
145. osition unique Ke Pour mesurer manuellement les chantillons 1 Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 133 21 Bio tests Croissance de cellule Cell Grouth 13 28 4Apr08 Test Name Cell Growth Abs IDH 600nm Blank 2 Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Cell Grouth 13 28 4Apr08 Test Name Cell Growth Abs IDH 600nm CRETE Blank Sample L instrument mesure les chantillons et affiche leur absorbance et leur concentration Cell Grouth 13 31 44pr08 Test Name Cell Growth Abs IDH 600nm 1 0 329 C o TE Sample 134 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 21 Bio tests Calculateur d oligonucl otides Vous pouvez utiliser cet cran pour e Mesurer un nouveau blanc appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc e Mesurer des chantillons suppl mentaires appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Calculateur d oligonucl otides Le calculateur d oligonucl otides calcule les donn es suivantes pour une s quence de base que vous allez saisir Nombre de bases Rapport GC Poids mol culaire Coefficient d extinction ou d absorptivit molaire Facteur de conversion de l absorbance des nucl otides une concentration de 260 Nm Tm pour les oligonucl otides de 40 bases maximum pour les hybrides ADN ADN ADN ARN et ARN ARN Pour une description des param tres r
146. otein IDH 280nm mg mL 1 0 381 0 381 Sample Vous pouvez utiliser cet cran pour e Mesurer un nouveau blanc appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc e Mesurer des chantillons suppl mentaires appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Croissance de cellule La mesure de la croissance de cellule utilise l absorbance 600 Nm pour indiquer l volution de la croissance de cellule dans un chantillon Cette application vous permet de suivre l volution d une croissance en indiquant les dur es d inoculation et d induction ainsi que d autres tapes importantes du processus Pour commencer mettez en surbrillance Cell Growth Croissance de cellule puis appuyez sur Enter Entr e L cran de configuration Cell Growth Croissance de cellule s affiche Cell Growth ID O 0FF 1 ow High Limits 999979999 tatistics Off ress or to select item to change CT T E TE Test Tests Test Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 131 21 Bio tests Croissance de cellule Configuration des param tres de test Pour configurer les param tres de test 1 Mettez en surbrillance le param tre souhait 2 Pour configurer chaque param tre appuyez sur Enter Entr e puis s lectionnez une valeur ou saisissez les valeurs l aide du clavier num rique 3 Une fois les param tres configur s appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le tes
147. ous devez d abord saisir un nom de fichier de donn es pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons Mesure d un balayage de spectre de fond Remarque Si un porte cellules 6 positions est install assurez vous d avoir plac le blanc dans la position B L instrument utilise toujours la position B pour mesurer le spectre de fond Pour mesurer un balayage de spectre de fond 1 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Placez le blanc dans la position B Scanning 15 30 14Feb02 Test Name Cell 1 3 000 f 0 400 0 Yave length 500 0 IDH 1 Baseline Tabular Baseline 3 Appuyez sur Collect Baseline Mesurer le spectre de fond Lorsque le spectrophotom tre mesure le spectre de fond un message d tat s affiche Ce message indique l tat d avancement du balayage Une fois le spectre de fond mesur ce message dispara t Remarque Pour basculer entre l affichage dans un tableau et dans un graphique appuyez sur Graph Tabular Graphique tableau Balayage d un chantillon Remarque Si un porte cellules 6 positions est install assurez vous d avoir plac l chantillon dans la position de cellule n 1 L instrument utilise toujours cette position pour balayer l chantillon Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 57 14 Acquisition Affichage et manipulation des donn es du balayage Pour b
148. position du blanc Si un porte cellules position unique a t install le message Error Single Cell Holder found Use Single Cell Holder Erreur porte cellules position unique d tect Utiliser le porte cellule position unique s affiche Appuyez sur Accept Change Accepter la modification pour continuer ou installez le changeur de cellule et appuyez sur Cancel Change Annuler la modification Si le porte cellules 6 positions a t install il est initialis sur la position B Une fois le changeur de cellule initialis l instrument affiche l cran du recueil de donn es pour le test Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 3 Accessoires Porte cellules et accessoires des porte cellules Remarque Si vous tes sur cet cran et que vous retirez le changeur de cellule et appuyez sur Run Sample Ex cuter l chantillon l instrument affiche le message Fatal Error 8 Press Esc to return to main menu Erreur fatale 8 Appuyez sur chap pour revenir au menu principal Appuyez sur Esc chap pour revenir l cran du menu des param tres du test Appuyez sur Run Test Ex cuter le test L instrument affiche d sormais le message Calibrating and Checking Turret Please Wait Calibrage et v rification de la tourelle veuillez patientez pour indiquer qu il tente d initialiser le positionneur de cellules sur la position du blanc Si le changeur de cellule ne se trouve pa
149. ppuyez sur Run Test Ex cuter le test Placez le blanc et les chantillons dans les positions de cellule appropri es Uarburg Christian 12 16 4 pr08 Test Name WarburgChristian Abs Abs Conc IDH 280nm 260nm C Insert blank into position B Insert sample 1 into position 1 Press ENTER to measure Appuyez sur Enter Entr e L instrument mesure le blanc puis les chantillons et affiche leur absorbance et leur concentration Harburg Christian Test Name HarburgChristian Abs Abs Conc IDH 280nm Z260nm C 1 0 439 0 776 CT TEE Sample Manuel d utilisation du BioMate 3S 129 21 Bio tests Mesure des prot ines Mesure d chantillons manuelle l aide d un porte cellules position unique lt Pour mesurer manuellement les chantillons 1 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Harburg Christian 12 21 4 pr08 Test Name WarburgChristian Abs Abs Conc IDH 280nm 260nm C D r a E E E Blank 3 Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Protein Conc 280 11 59 4 pr08 Test Name Protein Conc 2 Abs Protein IDH 280nm mg mL Blank Sample L instrument mesure les chantillons et affiche leur absorbance et leur concentration 130 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 21 Bio tests Croissance de cellule Protein Conc 280 12 01 4 pr08 Test Name Protein Conc 2 Abs Pr
150. r de mode pour passer en mode Concentration with Standard Concentration avec standard 48 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 12 Mesures de concentration de base ATC de base Utilisation de l option Conc Factor Conc facteur pour mesurer la concentration Conc Std 16 15 31Jan02 Factor 1 Std 1 C BLANK 0 478C 660 nm PSE EE A Blank Standard Mode Si un changeur de cellule 6 positions est install placez le blanc dans la position B et le standard dans la position 1 2 Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Si le changeur de cellule position unique est install retirez le blanc et placez le standard dans le changeur de cellule 3 Appuyez sur Units Standard Unit s standard pour configurer les unit s et mesurer le standard 4 Appuyez sur Enter Conc Saisir la conc saisissez la valeur de la concentration du standard puis appuyez sur Enter Entr e 5 Appuyez sur Select Units S lectionner les unit s mettez en surbrillance l unit appropri e dans la liste puis appuyez sur Enter 6 Appuyez sur Measure Standard Mesurer le standard L instrument mesure l absorbance du standard et affiche l absorbance et le facteur calcul Utilisation de l option Conc Factor Conc facteur pour mesurer la concentration Thermo Scientific Dans ce mode un facteur de concentration est utilis pour d terminer la concentration des chantillons La concentration des cha
151. raphique Scanning Balayage Nombre de bases Permet de saisir le nombre de bases dans l oligonucl otide Test Oligos Oligonucl otides Number of Matched Permet de saisir le nombre de cuves pour lesquelles le Cuvettes Nombre de cuves de r f rence programme de correction sera effectu 5 au maximum Manuel d utilisation du BioMate 3S 161 24 Param tres 162 Param tre Number of Samples Nombre d chantillons Description Permet de saisir le nombre d chantillons mesurer pendant le test Pas disponible avec Kinetics Cin tique ou Scanning Balayage Number of Standards Nombre de standards Permet de saisir le nombre de standards mesurer pour la courbe de standard Printer Imprimante Permet de s lectionner le mode de sortie internal interne RS 232 Parallel parall le Utility Utilitaire Printout Contrast Contraste des impressions Permet de modifier la luminosit de l impression et d am liorer ainsi la visibilit des copies papier g n r es par l imprimante interne Utility Utilitaire Protein Factor Facteur des prot ines Permet de saisir le facteur utilis pour calculer la concentration des prot ines Bio tests DNA ADN Ref Wavelength Longueurs d onde de r f Permet de saisir une valeur de longueur d onde de r f rence 8 pour chaque mesure rapport e permet de mesurer la longueur d onde d analyse et de r f rence Mes
152. ration ATC avanc 51 Rappel AN 10 ET EAE ED K aE Ee 52 Configuration des param tres deteste dessus de nm dit 52 Mes re d um standard tonene an E A LR A E 52 Saisie d un facteur POSE TT US AT UN RAS CU CN 53 Mesures d chantillons ns da Lars ue Les che ait tee nd 53 ACQUISITION 5 50e von nn nr uen tee romanes mnt 55 Rappeld m tests LA ANA AE es Re ns nn re 56 Configuration des param tres de Tests sente satire ste 56 Mesure d un balayage de spectre de fond 44e sets 57 Balayage d un chantillon ses nes cnens tin hier eus 57 Affichage et manipulation des donn es du balayage 58 Remise l chelle des donn es de balayage graphiques 59 R alisation de calculs sur les donn es de balayage 60 D nomination des pics et des Creux 24454 ransheutantues ar 61 Lise des donn es ses ia ie ie EE E Ets AUS 61 D termination de la hauteur de pic l aide de l quation de la m thode S HOIHES essri Ce An ee e a e tn aa 62 Calcul de l aire situ e sous une courbe 63 Affichage et remise l chelle des donn es de balayage repr sent es dans um tabletes siar ET DES ST ET A e AA 64 Longueurs d onde multiples 65 Rappel d un te ae tuaa n eE GEAR EE De An N A S E 65 Configuration des param tres de t st sa daniel tease pen 66 Ajout de longueurs d onde et de facteurs 2 44
153. reux 58 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 14 Acquisition Affichage et manipulation des donn es du balayage Remise l chelle des donn es de balayage graphiques Thermo Scientific Vous pouvez modifier automatiquement ou manuellement l chelle du trac de vos donn es de balayage Lorsque vous s lectionnez Auto Scale Mise l chelle auto l instrument met l chelle l axe des X et des Y de fa on ce que toutes les donn es apparaissent sur le trac Lorsque vous s lectionnez Manual Scale Mise l chelle manuelle vous s lectionnez une valeur minimale et maximale pour les axes Lorsque vous modifiez l chelle l instrument recalcule et affiche le nouveau trac des donn es Appuyez sur Edit Scale Modifier l chelle pour modifier l chelle Dans l cran de 2 modification de l chelle vous pouvez e Utiliser l option Auto Scale Mise l chelle auto pour modifier l chelle et afficher le nouveau graphique e Utiliser l option Manual Scale Mise l chelle manuelle pour modifier l chelle et afficher le nouveau graphique e Utiliser le curseur pour identifier des points sp cifiques de l axe des X Pour utiliser la fonction Auto Scale Mise l chelle auto Une fois vos donn es de balayage repr sent es sur l cran de modification de l chelle appuyez sur Auto Scale Mise l chelle auto L instrument ajuste la valeur minimale et maximale de l axe des X et
154. rique dilu lt 10 e Rin age abondant l eau Aqueux Solutions basiques e Eau chaude avec d tergent e Rin age l acide nitrique dilu lt 10 e Rin age abondant l eau Organiques Hydrocarbures petites e Rin age au solvant organique mol cules huiles e Eau chaude avec d tergent e _ Rin age l acide nitrique dilu lt 10 e Rin age abondant l eau Organiques Solutions alcooliques e Rin age avec un alcool similaire l ac tone ou avec tout autre solvant e Rin age abondant l eau 150 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 23 Maintenance Entretien p riodique Solvants Exemples M thodes de nettoyage conseill es Organiques Solutions acides e Rin age au solvant organique Fau chaude avec d tergent e Rin age l acide nitrique dilu lt 10 e Rin age abondant l eau Organiques Hydrocarbures petites e Rin age au solvant organique mol cules huiles e Eau chaude avec d tergent e Rin age l acide nitrique dilu lt 10 e Rin age abondant l eau IMPORTANT II est primordial de veiller au bon nettoyage de la cellule afin de garantir une longue dur e de vie e Ne stockez jamais les cuves long terme dans un bain marie ou un bain de solvant entre chaque utilisation Si le solvant que vous utilisez s che les impuret s pr sentes dans l eau ou le solvant peuvent se d poser l int rieur de la cellule et occasionner des
155. rmet d tendre consid rablement les capacit s cin tiques de votre instrument e La cin tique parall le multicellules vous permet de contr ler simultan ment jusqu cinq r actions L acquisition tendue des donn es cin tique permet de d passer la limite de 400 points de donn es du logiciel int gr e Le contr le logiciel rationalise l utilisation d applications informatiques plus complexes pour l analyse des donn es cin tiques une fois celles ci recueillies Utilisez l application Kinetics Cin tique dans les cas suivants e Rappel d un test e Configuration des param tres de test e Correction de cellules e Mesure d un blanc e Mesure d chantillons e Rappel et recalcul des r sultats cin tiques affich s dans un graphique e Remise l chelle et recalcul des r sultats cin tiques affich s dans un tableau e Modification de l chelle du graphique Vous pouvez afficher les donn es dans un graphique ou dans un tableau et ex cuter les m mes fonctions dans les deux cas Toutefois l emplacement des touches de fonction d pend du type d affichage Remarque L application Kinetics Cin tique vous permet de mesurer uniquement un chantillon la fois Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 89 20 Cin tique Rappel d un test Remarque L application Kinetics Cin tique vous permet de collecter jusqu 400 points de donn es par ex cution Une fois les param tres de test configur s
156. s de test e Correction de cellules e Prise de mesures Pour commencer appuyez sur Test mettez en surbrillance 3 Point Net M thode 3 points puis appuyez sur Enter Entr e 3 Point Net 10 11 15Feb02 BLANK Test Name BILIRUBIN avelength 1 545 Onm Wavelength 2 546 Onm Wavelength 3 547 Onm Factor 1 000 Units C Sanple Positioner Auto 6 Number of Samples 1 More paraneters Press T or 4 to select item to change rte Test Tests Test Remarque Si la correction de cellules est activ e ON vous devez d abord ex cuter l application de configuration de la correction pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 71 18 M thode 3 points Rappel d un test Remarque Si l option Auto Save Data Enregistrement auto des donn es est activ e ON vous devez d abord saisir un nom de fichier de donn es pour pouvoir acc der aux options Run Test Ex cuter le test ou Measure Samples Mesurer les chantillons Rappel d un test Pour rappeler un test 1 Appuyez sur Stored Tests Tests stock s 2 Mettez en surbrillance le test rappeler puis appuyez sur Enter Entr e pour afficher ses param tres Cet cran vous permet d effectuer les t ches suivantes e Configuration des param tres de test e Correction de cellules e Enregistrement d un test e Affichage de la liste des tests st
157. s encore dans le compartiment chantillons l instrument affiche le message Error Single Cell Holder Found Use Single Cell Holder Erreur porte cellules position unique d tect Utiliser le porte cellules position unique Appuyez sur Cancel Change Annuler la modification et r installez le changeur de cellule ou appuyez sur Accept Change Accepter la modification pour continuer utiliser le porte cellules position unique Pour viter l affichage du message d erreur fatale chaque retrait du changeur de cellule revenez toujours sur le menu principal ou le menu des param tres du test avant de proc der au retrait Changement de porte cellules Pour e utiliser des cellules ayant une longueur de trajet longue cylindriques ou rectangulaires e utiliser des tubes essais e mesurer des chantillons solides plac s dans le porte filtre e r guler la temp rature chantillon via un recirculateur de liquide externe vous devez installer les porte cellules appropri s Le porte cellules 6 positions install sur le spectrophotom tre peut tre facilement retir pour installer un porte cellules accessoire Reportez vous la section Retrait du porte cellules 6 positions et du porte cellules position unique la page 21 Installation du porte cellules 6 positions et du porte cellules position unique Pour installer le porte cellules 6 positions et le porte cellules position unique 1
158. s est g n ralement mesur e via le rapport 260 230 en cas d utilisation du ph nol dans le processus d extraction des acides nucl iques Le ph n ol se caract rise par une absorbance lev e 230 Nm et cette m thode de test permet de le d tecter facilement Pour une description des param tres reportez vous la section Param tres Pour les valeurs par d faut reportez vous la section Calculs pour Logiciel Bio Tests 106 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 21 Bio tests Tests des acides nucl iques Pour commencer mettez en surbrillance Nucleic Acid Tests Tests des acides nucl iques dans l cran Bio Tests Bio tests puis appuyez sur Enter Entr e La liste des tests des acides nucl iques s affiche Mettez en surbrillance DNA RNA with Scan 260 280 ADN ARN avec balayage 260 280 L cran des param tres du test d ADN ARN avec balayage 260 280 s affiche Remarque Les crans ci dessous pr sentent les param tres du test ADN ARN avec balayage 260 280 Pour le test ADN ARN avec balayage 260 230 la longueur d onde 2 est configur e sur 230 Nm DNA RNA with Scan 260 28 16 28 26Mar08 ef Wavelength Correction ef Wavelength 320nm actor 50 00 Dilution Multiplier calculated 1 000 More parameters ress or to select item to change ave ored Run Tests Pour configurer les param tres de test 1 Mettez en surbrillance le param tre souhait
159. s l cran DNA RNA with Scan 260 280 ADN ARN avec balayage 260 280 ou DNA RNA with Scan ADN ARN avec balayage 260 230 affich suivez la proc dure ci apr s pour mesurer l chantillon Si un porte cellules 6 positions est install assurez vous d avoir plac l chantillon dans la P P P position de cellule n 1 Remarque L instrument utilise toujours la position de cellule n 1 pour mesurer l chantillon Pour mesurer des chantillons option Single Cell Holder Porte cellules position unique Auto 6 ou Auto 3 1 Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Une fois le balayage d absorbance mesur l instrument affiche un graphique du balayage ainsi que le num ro d identification d chantillon le rapport ADN la concentration d ADN et la concentration des prot ines 108 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 21 Bio tests Tests des acides nucl iques DNA RNA with Scan 260 28 16 20 26Mar08 Test Name DN scan 260 280 Cell 3 000 0 100 Yave length ol lec Measure Cele RE Remarque Pour basculer entre l affichage dans un tableau et dans un graphique appuyez sur Graph Graphique ou Tabular Tableau DNA RNA with Scan 2607 28 16 29 26Mar08 Test Name DN scan 260 280 260 280 0 229 0 120 0 240 0 020 225 Yave length Ref Wavelength Correction 0 045 ID Ratio Conc pg mL 2 1 908 11 33 RE rne E Baseline Sa
160. se Measurement Mesure du bruit Mettez en surbrillance Noise Measurement Mesure du bruit Appuyez sur Enter Entr e Performance Validation 11 54 15Feb02 Noise Measurement eO Peak to Peak Meas Result Tolerance Abs 230 0nm lt 0 002 0 000 Pass 340 0nm lt 0 001 0 000 Pass eZ2 Peak to Peak Meas Result Tolerance Abs 230 Onm lt 0 003 0 000 Pass 340 Onm lt 0 002 0 000 Pass Make sure the Blank position is empty Place ZA filter in Cell Position 1 Press Start Test p Te Test Avec la position Blanc B vide ins rez le filtre 2A dans la position n 1 Ignorez les r sultats du test 2A si vous n avez pas de filtre install dans la position n 1 Appuyez sur Start Test Lancer le test Les r sultats indiquent la r ussite ou l chec du test pour chaque longueur d onde En cas d chec du test suivez les recommandations ci dessous R p tez le test deux fois pour vous assurer qu il choue bien chaque fois Assurez vous d avoir laiss l instrument pr chauffer pendant au moins 30 minutes avec le mode Veille d sactiv Pour plus d informations sur le d pannage contactez votre repr sentant commercial ou votre repr sentant du service apr s vente local ou contactez nous vous trouverez nos coordonn es au d but de ce document 146 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 22 V rification des performances Lumi re diffus e Lumi re diffus e Ex cuti
161. sion d un chantillon Vous pouvez utiliser les balayages pour d terminer les longueurs d onde maximales ou valuer la qualit d un mat riel Utilisez l application Scanning Balayage dans les cas suivants e Rappel d un test e Configuration des param tres de Test e Correction de cellules e Mesure d un balayage de spectre de fond e Balayage d un chantillon e Affichage et manipulation des donn es du balayage e Remise l chelle des donn es de balayage graphiques e D termination de la hauteur de pic l aide de l quation de la m thode 3 points e Calcul de l aire situ e sous une courbe e D nomination des pics et des creux Remarque L application Scanning Balayage ne vous permet de mesurer qu un seul chantillon la fois Les options Auto 6 Auto 3 et Manual 6 Manuel 6 ne sont pas disponibles avec les mesures balay es Remarque Pour configurer un d lai d expiration pour le spectre de fond appuyez sur Utility Utilitaire puis mettez en surbrillance Baseline Expiration Expiration du spectre de fond Appuyez sur Enter Entr e et saisissez la valeur souhait e Pour commencer appuyez sur Test mettez en surbrillance Scanning Balayage puis appuyez sur Enter Entr e Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 55 14 Acquisition Rappel d un test Rappel d un test R Le l 2 Pour rappeler un test Appuyez sur Stored Tests Tests stock s Mettez en surbrillance le test que
162. sitioner Positionneur de cellules position unique La prise de mesures de croissance de cellule significatives requiert une pratique r guli re du m lange qui permet de s assurer que tous les composants de la croissance sont suspendus dans la cuve Par cons quent il est recommand de ne pas effectuer les mesures de croissance de cellules l aide de changeurs de cellule automatis s Pour obtenir des donn es les plus pr cises possible mesurez les chantillons les uns apr s les autres Une d cantation irr guli re dans le temps affectera les mesures multicellules 132 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 21 Bio tests Croissance de cellule Ke Pour mesurer automatiquement les chantillons 1 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Installez le blanc et les chantillons dans les positions de cellule appropri es Cell Growth Test Name Cell Growth Abs IDH 600nm Insert blank into position B Insert sample 1 into position 1 Press ENTER to measure 3 Appuyez sur Enter Entr e L instrument mesure le blanc puis les chantillons et affiche leur absorbance et leur concentration Cell Grouth Test Name Cell Growth Abs 600nm IDH PRE E gt Sample Vous pouvez utiliser cet cran pour e Mesurer des chantillons suppl mentaires appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Mesure d chantillons manuelle l aide d un porte cellules p
163. t Mode Mode de mesure Permet de s lectionner le type de donn es photom triques recueillies pendant une mesure Absorbance pourcentage de transmittance concentration A T C ATC Kinetics Cin tique Scanning Balayage Multiwavelength Longueurs d onde multiples Measure Samples Mesurer les chantillons Permet de lancer la mesure des chantillons Max X Maxi X Permet de saisir la valeur maximale de l axe des X pour une remise l chelle manuelle du graphique Kinetics Cin tique Scanning Balayage Max Y Maxi Y Permet de saisir la valeur maximale de l axe des Y pour une remise l chelle manuelle du graphique Kinetics Cin tique Scanning Balayage Min X Mini X Permet de saisir la valeur minimale de l axe des X pour une remise l chelle manuelle du graphique Kinetics Cin tique Scanning Balayage Min Y Mini Y Permet de saisir la valeur minimale de l axe des Y pour une remise l chelle manuelle du graphique Kinetics Cin tique Scanning Balayage Molarity of cation Molarit du cation Permet de saisir la molarit du sodium Na dans le m lange d incubation Calcul du Tp dans les tests Oligos Oligonucl otides Next Cursor Curseur suivant Permet de s lectionner un point de curseur dans les fonctions l aide de plusieurs param trages de curseur calculs balayage p rim tre et balayage m thode 3 points dans le g
164. t l absorbance d une solution pour d terminer la concentration des prot ines Les m thodes colorim triques reposent sur l ajout d un r actif de prot ine et permettent de quantifier la pr sence de prot ine l aide de l absorbance dans la r gion visible Protein Tests 8 11 4pr08 oomassie Bradford Std Coonassie Bradford Micro Loury Standard Pierce Modified Lowry BCA Standard Pierce Micro BCA tm Biuret Protein Conc 280 Protein Conc 205 Warburg Christian ress f or to select CU TE Tests ATC 114 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific Thermo Scientific 21 Bio tests Mesure des prot ines Coomassie Bradford Std M thode standard de Coomassie Bradford Le test de Coomassie Bradford est une m thode colorim trique bien connue qui permet de d terminer q qui p la concentration des prot ines Le colorant passe d un brun rouge un bleu en pr sence de prot ines par cons quent la longueur d onde optimale pour le test est de 595 Nm Ce test produit une courbe d talonnage de deuxi me ordre La version standard de ce test est pr programm e pour les standards dont la plage de concentration se situe entre 25 pg ml et 2000 ug ml Coomassie Bradford Micro Micro m thode de Coomassie Bradford La micro version de ce test est destin e mesurer des concentrations de prot ines inf rieures au format de test standard Comme pour la m thode standard la longueur d onde d analys
165. t samples 1 4 into positions 1 4 Press ENTER to measure 3 Appuyez sur Enter Entr e L instrument mesure le blanc puis les chantillons et affiche leur absorbance et leur concentration Coomassie Bradford Std Test Name Bradford Std Abs Result IDH 595nm pg mL 1 0 096 25 00 2 0 192 50 00 3 0 289 75 34 4 0 382 100 0 les 1 4 EEA p Samples Vous pouvez utiliser cet cran pour e 1 Sam a e Afficher un graphique des donn es de la courbe standard appuyez sur View Graph Afficher le graphique e Mesurer des chantillons suppl mentaires appuyez sur Measure Samples Mesurer les chantillons Mesure de standards manuelle l aide du porte cellules position unique Pour mesurer manuellement les standards 1 Dans l cran Standards appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Installez le blanc dans le porte cellules Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 123 21 Bio tests Mesure des prot ines 3 Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Coomassie Bradford Std 11 28 4 pr08 Test Name Bradford Std Abs Result IDH 595nm pg mL CRIE Blank p 4 Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Coomassie Bradford Std 11 31 4 pr08 Test Name Bradford Std Abs Result IDH 595nm pg mL 1 0 324 84 58 Page 1 Sam le 1 Se ML Blank Sample Vous pouvez utiliser cet cran pour e Mesurer un nouveau blanc appu
166. t sous un nouveau nom ou sur Run Test Ex cuter le test pour commencer mesurer le blanc et les chantillons Utilisation du facteur de correction Si vous utilisez plusieurs spectrophotom tres de diff rents fabricants il se peut que les relev s obtenus diff rent consid rablement les uns des autres selon l instrument utilis Cette diff rence est due au fait que certains instruments utilisent diff rents types de syst me optique et sch mas de d tection pour recueillir les donn es Si vous utilisez diff rents spectrophotom tres et que vous souhaitez comparer les donn es d un autre instrument utilisez l option du facteur de correction Le facteur de correction vous permet de mettre l chelle les relev s obtenus avec votre instrument Thermo Scientific par rapport un autre spectrophotom tre de votre laboratoire Mesurez simplement la diff rence entre les deux instruments et utilisez le facteur pour neutraliser cette diff rence Pour plus d informations contactez votre responsable commercial Une fois les param tres configur s appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test sous un nouveau nom ou sur Run Test Ex cuter le test pour commencer mesurer le blanc et les chantillons Mesure de l chantillon Vous pouvez mesurer les chantillons automatiquement ou l aide du porte cellules position unique Mesure d chantillons automatique option Manual 6 Manuel 6 ou Single Cell Po
167. te cellules est param tr sur 1 Cell 1 cellule ou Manual 6 Manuel 6 ni lorsque le porte cellules position unique est install Avant de lancer la correction de cellules e Nettoyez l int rieur et l ext rieur de toutes les cellules mettre en correspondance e Remplissez les cellules d eau distill e ou de toute autre solution blanc puis placez les dans le compartiment chantillons reportez vous la section S lection et positionnement des cuves la page 5 Placez la cuve blanc dans la position B du changeur de cellule Correction de cellules Pour lancer la correction de cellules 1 Chargez le type de test ou le test stock Advanced A 2T C ef Wavelength Correction On ef Wavelength 545 Onm Delay Time min sec 0 00 Sample Positioner Auto 6 umber of Samples 1 More parameters Press f or to select item to change ave ored Run Tests Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 27 5 Correction de cellules Correction de cellules 2 Si l option Cell Correction Correction de cellules n est pas visible mettez en surbrillance More parameters Param tres suppl mentaires puis appuyez sur Enter Entr e 3 Mettez Cell Correction Correction de cellules en surbrillance puis appuyez sur Enter Advanced 2T C ell Correction Correction ID O 0FF ow High Limits tatistics More parameters Cell Correc
168. ter 4 Appuyez sur Set Year R gler l ann e saisissez l ann e puis appuyez sur Enter 5 Appuyez sur Esc chap pour enregistrer les param tres Pour s lectionner le format de l heure Vous pouvez configurer l instrument de fa on ce que l heure s affiche au format am pm ou au format 24 heures Pour modifier le format mettez en surbrillance Time Format Format de l heure puis appuyez sur Enter Entr e jusqu ce que le format souhait AM PM ou 24 heures apparaisse 10 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific Ke D Mode Veille 2 Configuration de l instrument Configuration des param tres de l utilitaire Pour r gler l heure Mettez en surbrillance Set Time R gler l heure puis appuyez sur Enter Entr e Pour r gler l heure appuyez sur Set Hour R gler l heure saisissez l heure puis appuyez sur Enter Entr e Pour r gler les minutes appuyez sur Set Minute R gler les minutes saisissez les minutes puis appuyez sur Enter Entr e Pour s lectionner AM ou PM si vous avez r gl l heure sur le format AM PM appuyez sur Set AM PM R gler sur AM PM jusqu ce que le param tre appropri apparaisse Remarque Vos modifications sont automatiquement enregistr es m me pendant la mise hors tension par la batterie de secours Pour prolonger la dur e de vie de la lampe x non le spectrophotom tre GENESYS a t pr configur en usine pour passer en mode vei
169. tific Le menu Utility Utilitaire vous permet de d finir certains param tres de mat riel de non test tels que la date et l heure la mise en veille le contraste de l cran et la configuration de l imprimante Vous pouvez galement acc der un r pertoire qui contient tous les tests stock s et la fonction calculatrice Vous ne pouvez pas d finir les param tres de l utilitaire ni changer d utilitaire lorsque l instrument effectue une mesure e Appuyez sur Utility Utilitaire sur le clavier Utility 4 09pm S ug09 Softuare Revision 4 of lamp life used Screen Contrast rintout Contrast Stored Tests Directory SB Drive Files Calculator Press f or to select parameter Manuel d utilisation du BioMate 3S 9 2 Configuration de l instrument Configuration des param tres de l utilitaire R glage de la date et de l heure Mettez en surbrillance Date Time Setup R glage de la date de l heure puis appuyez sur Enter Entr e Utility 3 39pm 16Mar07 Time Format Set Time 3 39pm ress or to select item to change Vous pouvez modifier le format de la date et de l heure et l heure Pour r gler la date 1 Mettez en surbrillance Set Date R gler la date puis appuyez sur Enter Entr e 2 Appuyez sur Set Date R gler la date saisissez la date puis appuyez sur Enter 3 Appuyez sur Set Month R gler le mois mettez en surbrillance le mois appropri puis appuyez sur En
170. tific Manuel d utilisation du BioMate 3S 139 22 V rification des performances Pr cision de longueur d onde Standard Pr cision de longueur d onde Standard Ce test mesure l absorbance d un standard de pr cision de longueur d onde et compare l emplacement des pics avec des valeurs pr cis ment connues pour cinq longueurs d onde maximum Par d faut les tests de pr cision de longueur d onde sont effectu s en mode Absorbance toutefois ce test peut galement tre effectu en mode Pourcentage de transmittance Des longueurs d onde et des tol rances types sont incluses dans le micrologiciel mais il est possible de modifier ces valeurs de fa on ce qu elles soient conformes au certificat d talonnage fourni avec vos standards Lors de l ex cution du test de pr cision de longueur d onde n oubliez pas les points suivants Les standards de pr cision de longueur d onde doivent tre d finis pour mesurer la pr cision de longueur d onde des longueurs d onde donn es e Utilisez un porte cellules vide comme blanc e Mesurez les standards afin qu ils soient r pertori s dans l cran de test e Vous pouvez mesurer le standard de longueur d onde pour cinq longueurs d onde uniquement Pour ex cuter le test Wavelength Accuracy Standards Pr cision de longueur d onde Standards Mettez en surbrillance Wavelength Accuracy Standards Pr cision de longueur d onde Standards puis appuyez sur Enter Entr e P
171. tion Not Calculated Press f or to select item to change ored Tests La correction de cellules est maintenant activ e Le mot On Activ le montre Remarque Lorsque la correction de cellules est activ e des lignes de param tres suppl mentaires sont ajout es sur l cran au dessus de la ligne Cell Correction Correction de cellules Si la ligne Cell Correction Correction de cellules n est plus visible mettez en surbrillance More Parameters Param tres suppl mentaires puis appuyez sur Enter Entr e 4 Mettez en surbrillance Setup Correction Correction de cellules puis appuyez sur Enter Entr e 5 Mettez en surbrillance Correction Mode Mode de correction puis appuyez sur Enter Entr e pour param trer le mode de correction sur l une des options suivantes Scan Balayage La correction de cellules est effectu e sur un blanc et une seule cellule chantillon pour la gamme de longueurs d onde d finie pour le mode Scanning Balayage Nm discrets La correction de cellules est effectu e sur un blanc et jusqu cinq cellules chantillons pour un maximum de 31 longueurs d onde discr tes sp cifi es par l utilisateur 28 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 5 Correction de cellules Correction de cellules Cell Correction 4 35am 21Jan01 BLANK orrection Mode Discrete nns Date Corrected Sanple Positioner Auto 6 Number of Matched Cuvettes 1 Press f or 1 to select it
172. tion des param tres de l utilitaire e Mode Veille e Configuration de l imprimante interne Saisie des valeurs de param tres Les sections suivantes d crivent l utilisation du clavier qui permet de d finir les valeurs des menus et des commandes Ces sections donnent des instructions pour les l ments suivants e Saisie num rique e S lection des menus e Bascule activation d sactivation e Saisie alphanum rique Saisie num rique Apr s avoir mis en surbrillance le param tre Wavelength Longueur d onde par exemple vous pouvez saisir la valeur num rique de ce param tre Une fen tre de saisie avec la plage de valeurs autoris e s affiche Saisissez une valeur puis appuyez sur Enter Entr e Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 7 2 Configuration de l instrument Saisie des valeurs de param tres Advanced 2T C 17 02 28Feb07 BLANK Test Name Copper Measurement Mode Conc Std avelength G46nm Ref Wavelength Correction On Ref Wavelength 320nm Delay Time min sec 0 00 Conc of Standard Undef ined Factor Undef ined Units C Sanple Positioner Auto 6 Number of Samples Entry 7 Enter Wavelength 190 1100 Vous pouvez galement appuyer sur Enter Entr e pour afficher la fen tre de saisie et la plage de valeurs autoris e Saisissez ensuite une valeur et appuyez sur Enter Entr e S lection des menus Apr s avoir mis en surbrillance le param tre Units Unit s ou Sample Positioner
173. tion du BioMate 3S Thermo Scientific 2 Configuration de l instrument Configuration de l imprimante interne Utility 3 48am 16Mar07 Software Revision 1 200 Instrument Serial Number 2M74123005 rinter Internal ate Time Setup 3 48am 16Mar07 tandby 15 min aseline Expiration Chr min Off Press f for darker contrast Press L for lighter contrast Press ESC to exit 2 R glez le contraste en suivant les instructions affich es l cran 3 Appuyez sur Esc chap Configuration de l imprimante interne Pour configurer l imprimante interne vous devez d finir ses param tres internes et charger le papier Pour configurer l imprimante interne 1 Installez l imprimante interne Si vous avez command l imprimante interne s par ment vous devez l installer Pour conna tre la proc dure suivre reportez vous la section Installation de l imprimante interne facultatif la page 22 du chapitre Accessoires 2 Chargement du papier dans l imprimante Pour conna tre la proc dure suivre reportez vous la section Chargement du papier dans l imprimante interne la page 23 du chapitre Accessoires D finition des param tres de l utilitaire de l imprimante Thermo Scientific Les impressions papier peuvent tre lanc es partir de l imprimante interne et d une imprimante USB reli e l instrument Le texte ASCII et les graphiques peuvent tre envoy s vers un ordinateur via une con
174. tion du BioMate 3S Thermo Scientific 21 Bio tests Tests des acides nucl iques L instrument mesure le blanc puis les chantillons et affiche l absorbance et la concentration des oligonucl otides en ug mL et pmol uL DNA Oligo calculator Test Name Oligos calc Abs Oligos Oligos IDH 260nm pg nL pM pL e 1 Sample 1 Ooo TS Sample Vous pouvez utiliser cet cran pour a e Mesurer des chantillons suppl mentaires appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Mesure d chantillons l aide du porte cellules position unique Pour mesurer les chantillons l aide du porte cellules position unique 1 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Placez le blanc talon dans le porte cellules Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc Retirez le blanc talon Ins rez l chantillon SN OU A o Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 113 21 Bio tests Mesure des prot ines DNA Oligo calculator Test Name Oligos calc Abs Oligos Oligos IDH 260nm pg mL pM pL Ca TT Sample Vous pouvez utiliser cet cran pour e Mesurer des chantillons suppl mentaires appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Mesure des prot ines Les m thodes UV direct et colorim triques suivantes permettent de d terminer la concentration des prot ines Les tests UV direct utilisen
175. tique Rappel et recalcul des r sultats cin tiques affich s dans un graphique Rappel et recalcul des r sultats cin tiques affich s dans un graphique L application Kinetics Cin tique vous permet d afficher les r sultats sous la forme d un graphique ou d un tableau et de manipuler ces r sultats Lorsque vos r sultats sont affich s vous pouvez modifier la plage horaire heure de d but et de fin L instrument recalcule alors le taux de r action Lorsque les r sultats cin tiques sont repr sent s dans un graphique vous devez d abord appuyer sur Edit Graph Modifier le graphique pour pouvoir effectuer une remise l chelle et un recalcul Kinetics 3 29pn 18Feb02 Test Name ENZYME born mi 1 850 0 840 Tine 3 00 IDH Abs nin Result 1 0 251 1756 Cursor Seale Scale Data Vous pouvez modifier automatiquement ou manuellement l chelle du trac des donn es cin tiques Lorsque vous s lectionnez Auto Scale Mise l chelle auto l instrument met l chelle automatiquement l axe des X et des Y de fa on ce que toutes les donn es apparaissent sur le trac Lorsque vous s lectionnez Manual Scale Mise l chelle manuelle vous s lectionnez une valeur minimale et maximale pour l axe des X et des Y chaque fois que vous modifiez l chelle l instrument recalcule et affiche le nouveau taux de r action et le nouveau r sultat Dans l cran de modification vous pouvez e Utiliser la mise l
176. tre 32 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific Thermo Scientific 6 Gestion des tests stock s Enregistrement d un test Scanning Start Wavelength Stop Wavelength Sample Positioner Scan Speed Interval Cell Correction IDH O 0FF uto Print uto Save Data ored Tests Pour enregistrer un test dans la biblioth que de l instrument 1 Appuyez sur Save Test Enregistrer le test Une invite appara t Save as an internal test Save test to the USB drive Save test to internal and USB Press f or to select Press ENTER Press ESC to exit Cell Co IDH O 0FF 1 uto Print On uto Save Data Off ress or to select item to change 2 S lectionnez l emplacement appropri puis appuyez sur Enter Entr e 3 Cr ez ou saisissez un nom pour le test Suivez la proc dure d crite dans la section Attribution d un nom un test la page 31 Manuel d utilisation du BioMate 3S 33 6 Gestion des tests stock s Chargement des fichiers de test Create Test Nane 1 39pm 7Aug09 ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVUXYZ20123456789 abcdefghijkimnopqrsuvuxyz _ 7 p Test Name Cobalt Press f or L to select character Press Accept Name to save the test RE Tor lomitterl AR Name Character Character Name 4 Appuyez sur Accept Name Accepter le nom 5 Indiquez si le test est inclure comme un test SmartStart Reportez vous la section SmartStart
177. trophotom tre r soudre les fonctionnalit s adjacentes dans un spectre Ce test est r alis l aide d une solution de tolu ne 0 02 v v dans de l hexane et n cessite un blanc d hexane Lors de l ex cution d un test standard interne rappelez vous que les longueurs d onde et les valeurs de tol rance sont pr configur es et ne peuvent tre modifi es Pour ex cuter le test de r solution 1 Mettez en surbrillance Resolution R solution et appuyez sur Enter Entr e Assurez vous que l hexane est en position blanc et que le tolu ne dans l hexane est dans la cellule 1 142 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 22 V rification des performances Pr cision photom trique FerTornanca Verification 16 37 2Mar07 esolution Maximum Minimum Ratio Result 0 100 0 037 2 672 Pass Place Hexane in the Blank position Place Toluene in Hexane in Cell 1 ress Start Test 2 Appuyez sur Start Test Lancer le test Les r sultats indiquent la r ussite ou l chec du test pour chaque longueur d onde En cas d chec du test suivez les recommandations ci dessous e _ R p tez le test deux fois pour vous assurer qu il choue bien chaque fois e Pour plus d informations sur le d pannage contactez l assistance technique Pr cision photom trique Ce test mesure l absorbance ou le pourcentage de transmittance d un ensemble de standards et compare les r sultats des tol rances donn es L
178. ues puis appuyez sur Enter Entr e La liste des tests des acides nucl iques s affiche Mettez en surbrillance le test souhait puis appuyez sur Enter Entr e L cran des param tres des tests de conc ADN ARN 260 d ADNsb d ARN ou d oligonucl otides facteur saisi s affiche Remarque L cran ci dessous pr sente les param tres du test ARN Sample Positioner umber of Samples More parameters Configuration des param tres de test Pour configurer les param tres de test 1 Mettez en surbrillance le param tre souhait 2 Pour configurer chaque param tre appuyez sur Enter Entr e puis s lectionnez une valeur ou saisissez les valeurs l aide du clavier num rique 3 Appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test sous un nouveau nom ou Run Test Ex cuter le test pour commencer mesurer le blanc et les chantillons Mesure d chantillons Vous pouvez mesurer les chantillons automatiquement ou l aide du porte cellules position unique Mesure d chantillons automatique option Auto 6 ou Auto 3 Pour mesurer automatiquement les chantillons 1 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Placez le blanc et les chantillons dans leurs positions de cellule comme indiqu par le logiciel Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 101 21 Bio tests Tests des acides nucl iques RNA Test Name RN Abs RNA IDH 260nm pg mL
179. ues mat rielles avanc es et sont compatibles avec une vaste gamme d accessoires Mises en garde de s curit et autres avis sp ciaux Assurez vous de suivre toutes les consignes de s curit pr sent es dans ce manuel Les mises en garde de s curit et autres avis sp ciaux apparaissent dans des encadr s Ils incluent notamment ce qui suit Remarque Les remarques contiennent des informations suppl mentaires utiles IMPORTANT Les instructions pr c d es de la mention Important permettent d viter d endommager la partie mat rielle du syst me ou de perdre des donn es PRECAUTION Indique une situation dangereuse qui si elle n est pas vit e peut causer des blessures l g res ou mod r es AVERTISSEMENT Indique une situation dangereuse qui si elle n est pas vit e peut entra ner la mort ou des blessures graves Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S ix Pr face x Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific ES ER Pr sentation du spectrophotometre Ce chapitre d crit les l ments suivants e Composants du spectrophotom tre e Porte cellules e S lection et positionnement des cuves e Dimensions Z Composants du spectrophotom tre Les principaux composants ext rieurs d un instrument type sont identifi s ci dessous Compartiment chantillons Port USB Bo tier de l imprimante en option Clavier Thermo Scientific Manuel d utilisat
180. ure rapport e Absorbance la longueur d onde d analyse Absorbance la 8 y longueur d onde de r f rence Ref Wavelength Correction Correction de longueurs d onde de r f Permet d activer ou de d sactiver la correction de longueurs d onde de r f rence Run Corr Permet de lancer le recueil des donn es relatives aux cuves pour Ex cuter la correction la correction de cellules Run Standard Permet d ouvrir l cran de saisie Standards Ex cuter le standard Run Test Ex cuter le test Permet d ouvrir l cran de recueil des donn es tous les tests Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific Thermo Scientific Param tre Sample Positioner Positionneur d chantillons 24 Param tres Description Permet de s lectionner le type de positionneur 1 Cell 1 cellule aucun mouvement effectue une remise z ro et mesure l chantillon dans la m me position Pas disponible avec Kinetics Cin tique et Scanning Balayage Manual 6 Manuel 6 changeur de cellules mis en mouvement par pression de boutons remise z ro syst matique de la position B puis retour la position configur e pour lancer la mesure Pas disponible avec Kinetics Cin tique et Scanning Balayage Auto 3 tourelle mise en mouvement automatiquement B 2 4 remise z ro syst matique de la position B puis passage la position 2 pour lancer la mesure Pas disponible avec Kinet
181. urer l chantillon Mesure de standards manuelle l aide du porte cellules position unique Ke Pour mesurer manuellement les standards 1 Appuyez sur Run Test Ex cuter le test 2 Appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc 126 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific Thermo Scientific 21 Bio tests Mesure des prot ines Protein Conc 280 11 59 4Apr08 Test Name Protein Conc 2 bs Protein IDH 280nm mg mL Blank Appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Protein Conc 280 11 59 4Apr08 Test Name Protein Conc 2 Abs Protein IDH 280nm mg mL CRETE Blank Sample L instrument mesure les chantillons et affiche leur absorbance et leur concentration Protein Conc 280 12 01 4 pr08 Test Name Protein Conc 2 Abs Protein IDH 280nm mg mL 1 0 381 0 381 RS EL 2 Sample Manuel d utilisation du BioMate 3S 127 21 Bio tests Mesure des prot ines Vous pouvez utiliser cet cran pour e Mesurer un nouveau blanc appuyez sur Measure Blank Mesurer le blanc e Mesurer des chantillons suppl mentaires appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Warburg Christian L analyse de Warburg Christian utilise une mesure de diff rence d absorbance 280 Nm et 260 Nm pour d terminer la concentration des prot ines d un chantillon contenant une contamination en acides nucl iques Pour une description des param tres reportez vous
182. yez sur Measure Blank Mesurer le blanc e Afficher un graphique des donn es de la courbe standard appuyez sur View Graph Afficher le graphique e Mesurer des chantillons suppl mentaires appuyez sur Measure Sample Mesurer l chantillon Tests UV direct Les tests UV direct d terminent la concentration des prot ines en fonction de l absorbance 280 Nm ou 205 Nm Pour une description des param tres reportez vous la section Param tres Pour les valeurs par d faut reportez vous la section Calculs pour Logiciel Bio Tests 124 Manuel d utilisation du BioMate 3S Thermo Scientific 21 Bio tests Mesure des prot ines Pour commencer mettez en surbrillance Protein Tests Tests prot iques puis appuyez sur Enter Entr e Mettez ensuite en surbrillance Direct UV 280 UV direct 280 puis appuyez sur Enter Entr e L cran des param tres Direct UV 280 UV direct 280 s affiche Remarque Les crans ci dessous illustrent les param tres des tests de la concentration des prot ines 280 Les param tres des tests de la concentration des prot ines 205 peuvent tre ajust s de la m me fa on Protein Conc 280 Protein Conc 2 Default 1 ef Wavelength Correction actor 1 000 Dilution Multiplier calculated 1 000 nits mg mL Sample Positioner Auto 6 umber of Samples 1 More parameters Configuration des param tres de test Pour configurer les param
183. z sur Enter Entr e Multiwavelength 10 30 22Feb07 BLANK Measurement Mode Absorbance Sample Positioner Auto 6 Number of Samples 1 Cell Correction Off IDH O 0FF 1 Press f or 4 to select item to change Set nns fest Teste Rappel d un test Pour rappeler un test 1 Appuyez sur Stored Tests Tests stock s 2 Mettez en surbrillance le test rappeler puis appuyez sur Enter Entr e pour afficher ses param tres Thermo Scientific Manuel d utilisation du BioMate 3S 65 15 Longueurs d onde multiples Configuration des param tres de test Cet cran vous permet d effectuer les t ches suivantes e Configuration des param tres de test e Correction de cellules e Enregistrement d un test Affichage de la liste des tests stock s e Prise de mesures Configuration des param tres de test Pour configurer les param tres de test Dans l cran Multiwavelength Longueurs d onde multiples mettez en surbrillance le 8 g P param tre souhait Pour savoir comment ajouter ou supprimer des longueurs d onde et des facteurs reportez vous aux proc dures ci apr s Si vous avez s lectionn pr c demment les longueurs d onde mesurer appuyez sur Save Test Enregistrer le test pour enregistrer le test ou sur Run Test Ex cuter le test pour mesurer un blanc ou des chantillons Si vous n avez pas s lectionn les longueurs d onde vous pouvez ajouter des longueurs d onde et des facteurs comme indiqu

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