logiciel anagene
Contents
1. M thodes amp Techniques Sciences de la Vie et de la Terre Lyc e tienne Oehmichen MODE D EMPLOI LoGiciEz ANAGENE d Les ic nes de la barre d outils et les bulles d aide Les ic nes de la barre d outils Les bulles d aide CNDP INRP Anag ne Affichage des s quences 4 Fichier Edition Traiter Options Fen tre Aide SeS BUS imEX ru2x On EN IE ebu rpe oe nna odak Fiod les fen tres Convertir les s guences Grand curseur Couper Convertir Code g n tique Enr gistrer EE opus RSR Information Pour vous aider une bulle d aide Th mes d tude Graphique de ressemblance s affiche sur l objet point par le curseur de la souris Banque de s quences Comparer les s quences Action enzymatique Actions relatives l dition des s quences par Fichier Ouvrir ou S lectionner cette s quence dans l un des r pertoires d Anag ne Banque de s quences Th mes d tude Programmes et documents Pour traiter une s quence elle doit tre au pr alable s lectionn e Utiliser le menu traiter gt f Agir sur la barre de d filement horizontal On peut comparer les s quences ou convertir ces s quences Changer d chelle de lecture 0 10 0 3 Gi ETES EE UMR bas de 1 Nucl otides F1 1 1 pas de 3 Acides Amin s Hb A nucl ique alj 2 aTe Cliquer sur les boutons de d calage Le bouton de s lection affiche une fl che rouge Hb nucl ique Cliquer sur le bouton de2. position d un codon d longation position d un codon stop Option 3 Traduction des phases ouvertes de lecture affiche dans les 3 cadres de lecture les diff rentes s quences peptidiques possibles Peptidique Nucl ique ADN ou ARN Affiche les diff rentes s quences possibles compte tenu de la d g n rescence du code g n tique Comparer des s quences La comparaison des s quences ne peut se faire que sur au minimum 2 s quences de m me nature La s quence r f rence sera toujours plac e en premier La comparaison simple est utilis e pour comparer deux all les d un m me g ne ou des s quences homologues gt lecture d taill e 1 r f rence Au niveau des autres s quences symbole des identit s La comparaison par alignements avec discontinuit s est utilis e pour comparer Cette comparaison privil gier lors de la comparaison des sites de restriction gt lecture globale Sur la ligne sup rieure symbole des identit s espace symbole des diff rences 1 r f rence Au niveau des autres s quences symbole des identit s _ symbole des manques les changements sont affich s en clair GJ S informer sur la s quence s lectionn e Utiliser le menu informations informations sur la ligne point e pour obtenir des informations sur la s quence s lectionn e par rapport la s quence choisie comme r f rence ATTENTION La s quence de r f rence est toujour
3. s lection Hb 4 prot ique La s quence s lectionn e s inscrit sur fond blanc S lection 142 lir Elle est qualifi e de ligne point e Cliquer sur l chelle gradu e pour basculer de l chelle pas de 1 l chelle pas de 3 ex d calage de 2 vers la droite pour cr er un d calage positif ou n gatif Mettre en place d un curseur Changer la s quence de r f rence CACAT ACTI S lectionner la largeur donner au grand curseur et cliquer sur S lectionner la s quence placer en r f rence et LHisLeuThri aieo a Le Cliquer sur pour la remonter en premi re ligne J Harl M thodes amp Techniques Sciences de la Vie et de la Terre Lyc e tienne Oehmichen MODE D EMPLOI LoGiciEz ANAGENE d LICENCE PAYANTE Actions relatives aux traitements des s quences Ea Convertir des s quences Cette fonction peut tre appliqu e sur les s quences nucl iques et peptidiques et simultan ment sur plusieurs s quences si elles sont de m me nature TYPE DE CONVERSION RM RER s Remarques relatives l affichage obtenu S quence s lectionn e obtention des 2 s quences compl mentaires de ADN Transcription R trotranscription Option 1 Traduction simple Nucl ique ADN ou Peptidique Option 2 Positions des phases ouvertes de lecture affiche dans les 3 cadres de lecture les positions des diff rents codons ARN 3 options gt gt gt position d un codon d initiation
4. s plac e en premier Cf changer la s quence de r f rence Travailler avec les enzymes de restriction Repr sentation graphique des sites de restriction Le mode tableau affiche le nombre de sites de restriction pour plusieurs enzymes S lectionner au pr alable une ou plusieurs s quences d ADN Le mode graphique affiche la carte de restriction Charger les enzymes de restriction partir d un fichier Cliquer sur ajouter puis OK Les sites de restriction s affichent en rouge Choisir le type de repr sentation Cliquer sur OK Pour observer le mode de coupure de l enzyme faire glisser le curseur vert sur le trait rouge mat rialisant la localisation du site de restriction Afficher le tableau du code g n tique gt Tableau de correspondance des codons de ARNm avec les acides amin s Attention Les fen tres ouvertes sont parfois masqu es car empil es les unes sur les autres Utiliser le menu Fen tre Mosa que J Harl
Download Pdf Manuals
Related Search