Fiche protocole :
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1. tats d un caract re en cliquant sur la colonne du caract re dans la matrice de caract res Deux boutons utiles pour annuler la derni re action SA pour afficher sur l arbre l tat des caract res Construire un arbre partir de donn es mol culaires Il faut d abords ouvrir un tableau de mol cules S lectionner les mol cules voulues en cliquant sur le nom des esp ces ou par le bouton tout s lectionner Si besoin mais cela vous sera alors pr cis aligner les mol cules en cliquant sur le bouton Aligner On peut alors Afficher automatiquement l arbre calcul par le logiciel Arbre Afficher la matrice des distances Matrice des distances La matrice des distances donne les valeurs utilis es par le logiciel pour construire l arbre Entre deux esp ces une valeur de distance est calcul e partir de la comparaison des s quences de la mol cule chez les deux esp ces Plus les s quences diff rent plus la valeur est importante Lyc e Descartes Antony2. Phylog ne mode d emploi simplifi 1 1 Fiche protocole Logiciel Phylog ne Phylog ne est un logiciel gratuit permettant de r aliser des phylog mies c est dire d tablir des relations de parent s entre des organismes Pour cela Phylog ne dispose d un vaste ensemble de donn es sur de nombreuses esp ces mode de vie morphologie anatomie ainsi que des donn es mol culaires s quences de g nes et de prot ines Phylog ne fait partie des logiciels dont l utilisation peut tre demand e l occasion de l Evaluation des Capacit s Exp rimentales en Terminale S Phylog ne est r alis et distribu par l INRP http www inrp fr Acces biotic evolut phylogene accueil htm Ouvrir un tableau Phylog ne a besoin de donn es pour pouvoir tre utilis Deux types de fichiers sont principalement utilisables les tableaux de mol cules pour ces comparaisons mol culaires aln les tableaux de caract res pour des comparaisons morpho anatomiques tab ces tableaux correspondent ce que l on appelle des matrices de caract res Pour cela Fichier gt Ouvrir gt Tableau de caract re ou Tableau de mol cules Observer une esp ce Choisir Observer A partir d un tableau de caract res on peut observer un esp ce soit en la s lectionnant dans la liste en bas gauche soit en EE cliquant sur l ic ne ci contre pour aboutir une page pr sentant toutes les esp ces du tableau GHA Les
3. menus d filant situ s en bas permettent de choisir les donn es visualis es image de l esp ce donn es sur son mode de vie de reproduction anatomie de ses membres de ses t guments de son c ur etc Les esp ces pr sentant la lettre F c t de leur image sont des esp ces fossiles Comparer des esp ces Choisir Comparer On peut alors s lectionner comme pour observer une esp ce de une quatre esp ces diff rentes Attention aux esp ces fossiles certaines donn es ne sont pas disponibles R aliser des tableaux de caract res personnalis s Une fois un tableau de caract res ouvert cliquer sur le bouton Ef facer Puis s lectionner les esp ces d sir es partir de leurs images et les caract res voulus partir de la liste pr sent e Remplir alors le tableau Aller sur chaque case et choisir la valeur du caract re parmi celles propos es Une aide est fournie chaque fois en bas droite Cliquer sur v rifier et corriger si besoin les cases erron es sont entour es de rouge Construire un arbre partir de donn es anatomiques Il faut d abords avoir un tableau de caract re soit fourni soit personnalis sans erreur Choisir Arbre Un arbre appara t On peut alors d placer des esp ces en maintenant le bouton gauche de la souris enfonc sur la branche de l esp ce pour l amener l endroit qui semble le plus pertinent faire appara tre les
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