NanoDrop 2000/2000c Spektralphotometer
Contents
1. 6404 Polling Tel 43 0 5238 84 169 info peqlab at www peqlab at oe UK PEQLAB Lid Southampton SO31 7ZN Freephone UK 0808 202 1302 info peqlab co uk www peqlab co uk a VWR company USA PEQLAB LLC Wilmington DE 19810 Toll Free US 877 737 5220 info peqlab us www peqlab us Creating the future together2. WARTUNG DES KUVETTEN S Y STEMS o 4 5 5 DIAGNOSE UND FEHLERBEHEBUNG 2u 0usssssnsnnsnsssnsnnsnsssnsnnsnsnsnsnnsnsssnsnnsnsssnsnnsnnnnnsnnsnsnsnsnnsnnnsnsnnsnsnsnsnnsnnsnnsnnsnnsnnse 5 6 INTENSIT TENKONTROLEE ads 5 6 Probetellef Kalibrier ngsk ntrolle 4 2ur0 it Ei ATT acia 5 7 Kiivettenkalibriertmeskontrolle sc s cf sssisssscscpassscessssnaesencessdueanes igaueuncy n Esnas EPES R aptecuses tpausuong aseuenses igaususaieupancepevtsepennagsasteseigegeds 5 8 CONTACT TECHNICAL SUPPORT KONTAKTDATEN DES TECHNICAL SUPPORT cccsssceeesseeeceeeaeeeseseeceeececeseeeseesaeseeseseseeeaees 5 8 Section 1 Introduction 1 Einleitung Geratebeschreibung Das innovative Thermo Scientific NanoDrop 2000 2000c UV Vis Spektralphotometer verf gt ber ein einzigartiges Probenhaltesystem das Messungen in einem Probenvolumen von 0 5 2 ul ohne Verwendung von K vetten oder Kapillaren erm glicht Aufgrund des sagenhaften linearen Messbereichs von 2 15000 ng ul dsDNA wird das Verd nnen der zu vermessenden Probe in Zukunft berfl ssig Dadurch entfallen zeitaufw ndige und fehlerbehaftete Pipettierschritte und geh ren somit der Vergangenheit an Nach der Messung wird die Probe einfach mit einem Papiertuch entfernt Dar ber hinaus erm glicht der temperierbare und mit einer R hrfunktion ausgestattete K vettenschacht f r Standardk vetten unterschiedlichste Messungen von Enzymkinetiken und Zellsuspensionen Das Probenhal
3. die Software geschlossen wird w hrend ein Workbook noch ge ffnet ist wird beim n chsten Start der Software der Benutzer gefragt ob er Daten zum Workbook hinzuf gen m chte Das Hinzuf gen von Daten zu einem Workbook das zuvor durch die Software geschlossen wurde wird durch das Offnen des Workbook durch den My Data Task Bar beendet Kolorimetrische Anwendungen bieten verschiedene M glichkeiten beim Hinzuf gen von Probendaten zu vorherigen Workbooks Die folgende Abbildung zeigt ein Beispiel f r eine Nachricht die erscheint wenn ein kolorimetrisches Workbook ge ffnet wird The workbook 2009_02_13_Protein BCA uses a standard curve Would you like to Start a new workbook Start a new workbook using the concentration values from this workbook Start a new workbook using the standard curve from this workbook Append new measurements to this workbook Es wird empfohlen dass der Benutzer den Richtlinien des Herstellers des Assays folgt bevor er neue Daten zum Workbook hinzuf gt 2 6 Section 2 Software Reprocess Aufarbeitung Das Reprocess Feature ist im oberen linken Bildschrimbreich der Report Seite f r einige Anwendungen verf gbar Dieses Feature berechnet eine Probenkonzentration basierend auf der Auswahl von alternativen Basiskorrekturwellenl ngen Konzentrationseinheiten und oder Probentypen Dieses Feature wird nicht zur Umbenennung von Proben verwendet Ein Reprocess Feld ist als Report Konfi
4. exportieren will Spectrum Excel XML Spreadsheet xml speichert die Absorptionswerte zusammen mit den dazugeh rigen Wellenl ngen der markierten Proben ab Wenn mehrere Proben markiert sind werden die Absorptionswerte f r jede Wellenl nge in einem separaten Worksheet innerhalb einer Excel Datei abgespeichert Spectrum Tab Separated Values tsv speichert die Absorptionswerte zusammen mit den dazugeh rigen Wellenl ngen der markierten Proben ab welches von Excel oder Notepad ge ffnet werden kann Mehrere Proben werden folgerichtig in einer Spalte abgespeichert Spectra New Workbook twbk speichert die ausgew hlten Probendaten in einem neuem Workbook ab dass durch die NanoDrop 2000 2000c Software wieder ge ffnet werden kann ND Legacy tsv speichert die Absorptionswerte f r die entsprechenden Wellenl ngen zusammen mit den spezifischen konfigurierten Bereichen in einem Report ab welches durch Notepad oder Excel ge ffnet werden kann Es ist wichtig den Report zuvor zu konfigurieren um die Information anzeigen zu k nnen die man exportieren will Hinweis Die Spektren aus New Workbook twbk and ND Legacy tsv Optionen sind nicht f r kinetische Messungen verf gbar Falls der Computer nicht erkennt dass die xml files Dateien mit Excel ge ffnet werden sollen ist es notwendig die exportierte Datei File innerhalb der Excel Anwendung zu ffnen Anf gen von Daten zu fr heren Workbooks Wenn
5. w hlen ob Eckdaten wie der Name der Organisation ein Logo das Datum und oder die Zeit in der Kopfzeile angezeigt werden soll Zu den Fu zeilenoptionen geh ren Texterg nzungen und Seitenzahlen Die Auswahl wird auf allen ausgedrucken Reports f r alle Anwendungen und benutzerdefinierten Verfahren angezeigt Mit dem Page Setup Knopf k nnen Sie das Fenster f r Papiergr e und Druckr nder aufrufen e Preferences bestimmt ob die Standardeinstellungen f r Anwendungen und Reports von jedem Benutzer einzeln verwendet wir oder von allen Benutzern gemeinsam benutzt wird Wenn Sie den Support Dymo Label printer ausw hlen wird das Ger t zum Ausdrucken der Reports verwendet Schnelltasten Tastenkombinationen Keyboard Shortcuts werden unter diesem Tab Registerkarte ausgew hlt Die Standardeinstellung sind die klassischen Tastenkombinationen des NanoDrop e Accounts bestimmt welche Benutzer oder Benutzergruppen die Erlaubnis haben Reports zu ndern oder zu konfigurieren Zus tzlich wird die geregelt ob Dateien berschrieben und Datenverzeichnisse ge ndert werden d rfen 2 7 Section 3 Applications 3 Applications Schnellstart 1 W hlen Sie aus der rechten Softwareseite die entsprechende Applikation durch einen Doppleklick aus Klicken Sie vor einer Messung Add to report um die Probendaten in einem Workbook zu speichern 2 F hren Sie mit einem geeigneten Puffer eine Blindprobe Blank durch Pedestal O
6. Data verwaltet die Datenarchivierung und wiederherstellung Sammeldaten werden durch den Nutzer bestimmte Workbooks gespeichert Siehe Daten und Account Management f r weitere Details e Diagnose ruft die Intensti ten und Kalibrationspr fungsbildschirme auf Siehe Diagnose und Fehlerbehebung f r weitere Informationen e Optionen beinhaltet 4 Tabs welche detailiert unter Daten und Accountmanagement beschrieben werden Task Bars Optionen die nach dem ffnen von spezifischen Anwendungen verf gbar sind Measure spezifizierte Anwendung zeigt die zuletzt gew hlte Anwendung e Reports beinhaltet die drei folgende Tabs Reports zeigt eine Tabelle von gesammelten Probendaten mit Spektralprofil von ausgew hlten Daten Configuration w hlt die anzuzeigende Spalte und die Reihenfolge aus in der die Spalten erscheinen Print w hlt die Informationen die im gedruckten Bericht enthalten sind aus und definiert den Seitenaufbau Desweiteren kann eingestellt werden wie die ausgedruckten Graphen innerhalb des Berichts angezeigt werden sollen Oligo Calc nur f r Nucleins ure and Micro Array Anwendungen berechnet das Molek lgewicht den Extinktionskoeffizienten Konzentrationsfaktoren und Schmelzpunkte f r bestimmte Nukleins uresequenzen Siehe Oligo Calc innerhalb Nukleins ure und Micro Array f r weitere Informationen e Dye Chrom Editor nur f r Micro Array und Protein amp Labels erm glicht dem Ben
7. Dose um bersch ssige Fusseln aus der Membran zu entfernen Um die Effektivit t der Aufbereitung zu berpr fen pipettieren Sie ein 1ul dH20 auf den unteren Probenteller und pr fen Sie visuell die Form des Wassertropfens a Flacher Tropfen Runder Tropfen Rekonditionierung n tig Rekonditionierung nicht n tig Eine Alternative zur Verwendung vom PR 1 Kit ist es die Probenteller wiefolgt aufzubereiten 1 Falten Sie ein sauberes und trockenes Labortuch mehrmals um seine Dicke zu vergr ern 2 Dr cken Sie das Labortuch auf dem unternen Probenteller fest nach unten und polieren reiben Sie mindestens 50mal energisch Das Labortuch kann w rend des Vorgangs rei en und muss vielleicht mehrmals neu gefaltetet werden Der oberere Probenteller sollte auch poliert werden seien Sie jedoch vorsichtig dass Sie nicht zu viel Krraft auf den oberen Hebel legen Benutzen Sie Druckluft aus der Dose um bersch ssige Fusseln aus der Membran zu entfernen 4 4 Section 8 Appendices L sungsmittelvertr glichkeit Die NanoDrop 2000 2000c Spektralphotometer Probenteller sind mit den meisten typischen L sungsmitteln die in Life Science Laboren verwendet werden kompatibel Dazu geh ren Methanol Ethanol n Propanol Isopropanol Butanol Azeton Ether Chloroform Kohlenstofftetrachloride DMSO DMF Azetonitril THF Methylbenzol Hexan Benzol Natronlauge Natriumhypochlorid Bleichmittel verd nntes HCI verd nntes HNOs verd nn
8. Requirements Es ist entscheidend sicherzustellen dass das Volumen der Probe ausreichend ist damit das Licht bei der Durchf hrung der Messung einen repr sentativen Anteil der Probe durchqueren kann Der optische Strahl 2 mm ist auf 8 5 mm ber den Boden der K vette gerichtet F r Volumen Empfehlung wenden Sie sich bitte an den K vetten Hersteller Benutzung der K vette 1 Geben Sie die Probe in die K vette und vergewissern Sie sich dass das Volumen ausreichend ist um den Strahlengang sicherzustellen 2 ffnen Sie den Messarm und stellen Sie die K vette in das Ger t Achten Sie beim Einsetzen der K vette auf die Richtung des Strahlengangs angezeigt durch den Richtungspfeil 3 Der Messarm muss in die untere Position abgesenkt werden um die K vettenmessung durchzuf hren 4 Um die Spektralmessung einzuleiten benutzen Sie bitte die Software auf ihren Computer 5 Wenn die Messung abgeschlossen ist entfernen Sie bitte die K vette Section 2 Software 2 Software Computer Anforderungen Microsoft Windows XP Vista oder Windows 7 Betriebsystem 1 5GHz Prozessor oder h her CD ROM Laufwerk 1 GB RAM oder mehr 2 GB wenn Windows Vista oder Windows 7 verwendet wird 40 MB of freier Speicherplatz auf der Festplatte Freier USB Port Das Ger t wird ber ein USB Kabel mit dem Computer verbunden Software Installation Die Systemsoftware muss auf den Computer geladen warden bevor das USB Kabel angeschlos
9. Thermo peglab SCLENTIFIC a VWR company NanoDrop 2000 2000c Spektralphotometer V1 0 Kurzanleitung V0314 Creating the future together Table of Contents 1 EINLEITUNG cccsscsscsscssssscscsssssecsessnssecsesssssscssssesessssssnsssnsescnsescsessossesssssssssnsssssseansossosesssessseaasessoseansossossonsscsessonsoesoes 1 1 GERATEBESCHREIB UNC 2 2000 Base anal Aa da tad 1 1 GERATESPEZIEIKA TIONEN Ada ne dto o adoos tda e dein peed tes 1 1 SAMPLE RETENTION PEDESTAL MEASUREMENTS scccesseceeseeeeeceseceeseaeeeseseecenseaececeneeceeaaeeeseaeecseseaececeaeeeseaaeecseaseseeeeeesenseaeenes 1 2 Basisbenutzung des Messarms uuruuesesssssessernnenennenneenennonnnnnennonnnnnennonnnnnennonnennensonennensonnesnensonessensenessensonesnensennessennennessennenesennonn 1 3 KUVETIENMESSUNGEN acc Sue es evades a NEE EEE DE ENGEREN NEE runter E ac 1 3 Basisbenutzun s der K vette aus sale i 1 4 ZESOEFT WARE OA PRE CREO O TO 2 1 COMPUTER ANFORDERUNGEN nee lidad lao aaa toni 2 1 SOFTWARE INSTALLATION ccs sscs eenecaes sue csepennea spapeeecs tbessstteus dpeedeaavaceineceadescbceasnent as tedlecstasteatets ievetsbaceeseascauas cedeesegicensesedetsncestasnevsse 2 1 SOFTWARE FEATURES uam in Baia rein le EL eta sveceteaue ats 2 2 Linker AUS Olot Bene nenne leer 2 2 IDATA AND A CCOUNT MAANAGEMENT r ee so cnadetaarsacgvneastabanganweadarecdecsteedevouse qreeyecsteeaauetasasnehecdbateassee patio 2 5 MIDA A a a E EEO E TUE eek
10. anoDrop 2000 2000c Spektralphotometers zu best tigen Es ist ungef hr 10mal mehr konzentriert als andere komerziell verf gbare K2Cr207 L sungen die dazu verwendet werden die Kalibrierung von Standardspektralphotometer zu best tigen Sie ist entweder bei Thermo Fisher Scientific oder bei ihren lokalen H ndler verf gbar Lesen Sie das zu dem Fl schchen mitgelieferte Sicherheitsdatenblatt und ergreifen Sie entsprechende Laborsicherheitsma nahmen Probeteller Kalibrierungskontrolle 1 Stellen Sie sicher dass der Probenteller sauber ist und dass eine 1 uL Wasserprobe auf dem unteren Probenteller aufperlt 2 ffnen Sie die NanoDrop 2000 2000c Software benutzen Sie den Diagnostics Task Bar und w hlen Sie Calibration Check 3 Geben Sie den aktuellen Ziel Absorptionskoeffizient welcher auf dem CF 1 Fl schchen angeben ist in das entsprechende Feld wie in folgender Abbildung gezeigt wird ein Diagnostics o File Help Print Reset Target At 87 Measurement rn 350 Cormechonnm 600 Repicates 10 ManoDrop ET u Onm O2mm 01mm 200070006 0148 0074 2143 0 072 Se The instrument ls working within specifications 0142 00 4 Bringen Sie 1 uL des dH20 auf den Probenteller auf senken Sie den Hebel und dr cken Sie auf Blank 5 Wischen Sie den oberen und unteren Probenteller mit einem trockenen Labortuch ab 6 Sch tteln Sie das CF 1 Fl schchen energisch damit sich die L sung vermischt Vergewissern Si
11. as Verh ltnis deutlich niedriger ist kann dies auf das Vorhandensein von Verunreinigungen hindeuten Baseline correction falls ausgew hlt ist die Standardwellenl nge f r Normalisierungen 340 nm Der Benutzer kann manuell eine andere Wellenl nge f r die Normalisierung der Daten eingeben In diesem Fall wird Grundlinie automatisch auf den Absorpationkoeffizientenwert bei der ausgew hlen Wellenl nge eingestellt Alle angegebenen Wellenl ngendaten beziehen sich auf diese Werte Hinweis Falls eine Grunlinienkorrektur nicht ausgew hlt wurde kann die Bandbreite Spektren von der Grundlinie abgesetzt sein und die berechnete Konzentration ndert sich dementsprechend Making Nucleic Acid Measurements Nucleins uremessungen durchf hren 1 2 W hlen Sie die Nucleins ure Anwendung aus dem Hauptmen Wenn das Fenster der Wellenl ngen berpr fung erscheint stellen Sie sicher dass der Hebel geschossen ist und dr cken Sie OK W hlen Sie die Art der Probe die gemessen werden soll Die Standardeinstellung ist DNA 50 W hlen Sie die Konzentrationsleinheiten aus der Aufklappliste neben dem farblich markierten Konzentrations Feld Die Standarteinheiten sin ng ul Eine Standardwellenl nge von 340 nm wird automatisch f r eine Normalisierung verwendet W hlen Sie entweder eine alternative Bezugswellenl nge oder deaktivieren Sie das baseline correction Basislinienkorrektur Feld um keine Spektralnormalisierung durchzu
12. ationen die mit dem ausgew hlten Spaltenbereich verbunden sind werden in die Exportdateien eingef gt e Print f gt eine berschrift und Untertitel zum Report hinzu Verfahrensinformationen und Spektralgraphen k nnen mit der Reportaufstellung ausgedruckt werden Drei Symbole erscheinen im oberen linken Fensterbereich wenn der Reports Task Bar ausgew hlt ist e Preview erlaubt eine bersicht des Reports vor dem Drucken Durch Benutzung der Optionen Taskleiste oder des Print Symbols zeigt die Vorschau die ausgew hlten Kopf und Fu zeilenparameter an Siehe Data and Account Management f r weitere Informationen e Print sendet den Report zum Standard Drucker e Export speichert einen Report entweder in einem xml file tsv oder twbk file ab Die spezifische Optionen beinhalten 2 5 Section 2 Software Report Excel XML Spreadsheet xml speichert den Report in einem Format dass von Excel ge ffnet werden kann Nur die im Report angezeigten Spalten werden bei dieser Anwendung gespeichert Es ist wichtig den Report zuvor zu konfigurieren um die Information anzeigen zu k nnen die man exportieren will Report Tab Separated Values tsv speichert den Report in einem Format dass von Notepad oder Excel ge ffnet werden kann Nur die im Report angezeigten Spalten werden bei dieser Anwendung gespeichert Es ist wichtig den Report zuvor zu konfigurieren um die Information anzeigen zu k nnen die man
13. ben f r Blindproben beschrieben und dr cken Sie auf Measure Hinweis Ein frisches Aliquot der Probe sollte f r die Messung verwendet werden 3 12 Section 8 Appendices 4 Wartung und Pflege Garantie Alle von Thermo Fisher Scientific hergestellten NanoDrop Spectralphotometer und Zubeh rteile bestizen eine zweijahrige Garantie gegen Fabrikationsfehler Sicherheit Die Bedienung des Gerates ohne Abdeckung setzt den Benutzer scharfe Metallkanten und feinen Glasfasern aus Mit dem Entfernen der Abdeckung erlischt auch die Garantie Das NanoDrop 2000 2000c wurde nur f r den Indoor Berieb unter folgenden Bedingungen entwickelt e Temperatur 15 35 e Luftfeutigkeit 35 65 Hinweis Das NanoDrop 2000 2000c wird mit einem 12V Netzteil geliefert Benutzen Sie nur das Netzteil das mit dem Ger t geliefert wurde Schlie en Sie dieses Kabel an einer ordungsgem geerdeten Steckdose an Benutzung des Instruments in einer Art und Weise die nicht vom Hersteller angegeben wurde kann den Schutz durch das mitgelieferte Netzkabel und Netzteil beeinflussen Das Netzteil kann w hrend das Ger t nicht verwendet wird im NanoDrop 2000 2000c angeschlossen bleiben Wenn das Ger t angeschlossen aber nicht verwendet wird betr gt der Stromverbrauch 5 W und die Blitzlampe steht nicht unter Spannung Das Instrument besitzt keine Netzschalter Es wird empfohlen dass das Ger t so aufgestellt wird dass das Netzteil einfach am Ger t selb
14. chert Vista C Users Public Public Documents Thermo Autosave CalibCheck XP C Documents and Settings AllUsers Documents Thermo NanoDrop2000 Autosave CalibCheck K vettenkalibrierungskontrolle Obwohl kein spezielles K vettenkalibrierungskontrollverfahren f r den NanoDrop 2000c verf gbar ist empfehlen wir den Gebrauch von 10 T und 50 T Neutralfiltern wie diejenigen von Thermo Scientific um die Leistung zu berpr fen Contact Technical Support Kontaktdaten des Technical Support Falls es Ihnen nach den oben genannte Probleml sungstipps nicht gelungen ist Ihr Problem zu l sen kontaktieren Sie bitte den Technical Support zur Unterst tzung Au erhalb der USA und Kanada kontaktieren Sie ihren lokalen NanoDrop H ndler Thermo Fisher Scientific 3411 Silverside Road Bancroft Building Suite 100 Wilmington DE 19810 U S A Telephone 302 479 7707 Fax 302 792 7155 E mail nanodrop thermofisher com www nanodrop com Bitte halten Sie die Seriennummer Ihres Ger tes bereit welche Sie auf den Boden des Gr tes finden Zus tzlich sind Screenshots von Anwendungen und Intensitatskonroll JPGs eine gro e Hilfe um Ihr Problem zu erkennen E mailen Sie dies als Anhang zum Technical Support Au erhalb der USA und Kanada kontaktieren Sie ihren lokalen NanoDrop H ndler 5 8 D PEQLAB Biotechnologie GmbH 91052 Erlangen Freecall D 0800 100 20 16 info peqlab de www peqlab de p e Q a b Aa AT PEQIAB Biotechnologie GmbH
15. der Nucleins ureanwendungen sind f r alle Probenteller und Kivettenmessungen auf eine 1 0 cm 10 0 mm langen Schichtdicke genormt Bildschirm Features Im rechten Fensterbereich werden die speziellen Features f r Nukleins ure Anwendungen angezeigt Task Bars im linken Fensterbereich die nicht unten beschrieben werden sind in Software Overview beschrieben Nucleic Acid 0 x File Help Load your sample and press the measure button Yo 2 Measure Print Blank Re Blank 120 fD Sampie ID dsDNA Pedestal E Add to report ns C Overtay spectra lt lt Type OM gt 60 00 Small sample volume 7 Use cuvette tos Cone AS ngul 100 A260 10 mm path 9 691 A280 10 mm path 8 048 200 280 1 92 280 230 208 E Baseline correci n 340 nm s 3 ma 2 337nm 0 000Abs Die Kurve zeigt die Daten f r die aktuelle Messung auf eine 10 mm Schichtdicke genormt an Die folgende Features befinden sich rechts von der Spektraldarsellung e Sample ID Feld in dem die Proben ID Kennung eingegeben wird Die Proben ID Kennung sollte vor jeder Messung eingegeben werden 3 10 Section 3 Applications Type eine Aufklappliste aus der die Art der Nucleins ure die gemessen wird ausw hlt werden kann Die Optionen beinhalten DNA 50 f r dsDNA RNA 40 f r RNA und ssDNA 33 f r Einzelstrang DNA Zus tzlich steht die Optionen Oligo DNA und Oligo RNA zur Verf gung bei denen ausgehend von de
16. e sich dass sich die gesamte L sung im unteren Teil der Ampulle befindet bevor Sie das Fl schchen vorsichtig aufbrechen Hinweis Das CF 1 Kalibrierungsfluid wird in einem Einwegflaschchen geliefert CF 1 muss innerhalb einer Stunde nach dem Offnen des Fl schchens aufgebraucht werden Umweltaussetzungen oder Ubertragung des Fluids in einen anderen Beh lter k nnen zu erheblichen Konzentrations nderungen f hren 5 7 Section 8 Appendices 7 Folgen Sie den Bildschirmaufforderungen im Customer Guidance Leitfaden Benutzen Sie 1 uL Aliquots der Kalibrierungsl sung und wiederholen Sie die Messung 10 mal Nach der 10 Messung werden die Ergebnisse der Kalibrierungskontrolle auf dem Bildschirm angezeigt 8 Falls das Ger t die Kalibrierungskontrolle nicht bestanden hat wiederholen Sie schleunigst das Verfahren mit 2 uL Probe Falls das Verfahren mit 1 uL Volumen nicht aber mit 2 uL Volumen bestanden wird ist das ein Anhaltspunkt daf r dass Wegl ngen innerhalb der Anforderungen liegen jedoch die Probenteller wahrscheinlich nicht konditioniert sind Siehe Pedestal Reconditioning f r weitere Informationen Falls das Ger t auch die Kalibrierungskontrolle mit 2 uL Probe nicht besteht ist eine Nachkalibrierung notwendig Kontaktieren Sie den Technical Support Au erhalb der USA und Kanada kontaktieren Sie ihren lokalen NanoDrop H ndler Eine JPG vom Endergebnis wird automatisch auf dem Hard Driver unter folgendem Ort gespei
17. een 2 5 Reports use arena ssstandsdigsYdetessscounsscapeicednssscovnsebapsnshinsss dp etesapesedngss spies inesach T S 2 5 Autosave files automatisch gespeicherte Dateien cc ecceececseeseesceseeeeeceeeeseesaeesaeeeceesececaecaeceseceaeeeeeeeseeeeaeesaeseaeeaeecneeeneeaa 2 7 Options Optionen iss sec ues ett Hs Di eda ed A EN A eee a ea Be 2 7 3 APPLICATIONS u sussussussnssussnssnssnssnssnsnnsnnsnnsnnennsnnssnennsnsnsnennsnnssnennsnsssnsnnsnsssnenssnsssnenssnsssnsnnsnsssnsnssssssnsnsssssnnsnnssnsnnsnnssnsnnen 3 8 S CHNEDTS TAR Tit A in ea s 3 8 MESSBEREICHE si A ERO AN 3 8 NUKLEINS URE a a AS Oseas Oise 3 10 U tA ee RR RE ER ED RER ENGEN 3 10 Bildschirm Features caritas EBENE SEE SHE es Ra ER AI Se al sh 3 10 Making Nucleic Acid Measurements Nucleins uremessungen durchf hren 2u200n00nnesnennennennennennenennenene nennen 3 11 4 WARTUNG UND PFLEGE cussessussnssessnssnssnssnsnnsnnsnnsnnsnsssnsnnsnnnsnsnnsnnssnsnnsnsssnsnnsnnssnsnnsnsnsnsnssnsssnsnssnnssnennsnsssnsnnsnssnnsnnssnnnnen 4 1 GARANTIE ans a nd CRAG BA i A A ES 4 1 SICHERHEIT u eisen A a o 4 1 PFLEGE DES SAMPLE RETENTION SYSTEMS euren oi ia tocezssei evan ducesde neve e Diack notte tada iria labia silo ias 4 2 REINS UMN G5 sess des sse0s tp cdeires ces teas tapar 4 2 Rekonditionierung des Probentellers eceeceescesseeseesscesceeeeeeeceeeseesceeseeeeeceeesueceseceseecceceeseesaeeseeeseceaeseceeeeeeeecaeeeaaeeaeeeeeeneeeneeea 4 4
18. en wird ein neues Workbook f r die markierte Anwendung auf dem rechten Fensterbereich ge ffnet Wenn sie Open ausw hlen wird das ausgew hlte Workbook ge ffnet und die dazugeh rige Anwendung wird gestartet Zus tzliche Messungen k nnen zum ge ffneten Workbook hinzugef gt werden Die f nf quick Links unterhalb der New und Open Symbole sind Verkn pfungen auf archivierte Arbeitsmappen die dann im rechten Fensterbereich angezeigt werden Ein Doppelklick auf ein Workbook ffnet die Datei und erlaubt zus tzliche Messungen anzuh ngen Hinweis Der Add to Report Knopf muss zuvor ausgew hlt werden um Messungen von einer Probe zum Workbook hinzuzuf gen Reports Reports sind vom Benutzer konfigurierte Tabellen die Probendaten anzeigen Ein Report kann durch das Dr cken des Report Task Bars ge ffnet werden Drei Tabs erscheinen im linken Fensterbereich wenn der Report Task Bar ausgew hlt ist e Report zeigt die im ge ffneten Workbook gespeicherten Probendaten an Ein Graph zeigt das Spektrum der Probe die in der Report Aufstellung markiert wurde im unteren Teil der Seite an Wenn keine Probe markiert ist wird das Spektrum der obersten Probe der Aufstellung angezeigt Mehrere Spektren k nnen durch das Markieren der Probendaten in der Report Aufstellung angezeigt werden e Configuration w hlt die Reportspalte aus die angezeigt werden soll und die Reihenfolge in welcher die Anwendungen erscheinen sollen Nur die Inform
19. en NanoDrop H ndler 4 3 Section 8 Appendices Rekonditionierung des Probentellers Sowohl das Bradford Reagenz als auch andere Buffer die Tenside enthalten k nnen die Messoberflache sch digen so dass die Fl ssigkeitss ule mit einer 1 ul Probe nicht gut gebildet wird Benutzen Sie das Nanodrop Reconditionierungskit als schnelles Mittel zur Aufarbeitung der Messoberfl chen wenn die Oberfl chen eigenschaften beineintr chtigt worden sind und die Fl ssigkeitss ule w hrend der Messung bricht Diese wird die Oberfl che wiederherstellen und erm glicht die Bildung der Fl ssigkeitss ule Ablauf 1 ffnen Sie das Fl schchen mit dem PR 1 Inhalt und verwenden Sie den Applikator der im Kit mitgeliefert wurde um die eine Stecknagel gro e Menge aufzunehmen 2 Tragen Sie eine sehr d nne und gleichm ige Schicht PR 1 auf die glatte Oberschicht des unteren und oberen Probentelles auf 3 Warten Sie 30 Sekunden damit das PR 1 trocknen kann 4 Falten Sie ein sauberes und trockenen Labortuch auf ein Viertel zusammen und entfernen Sie das PR 1 indem Sie ber die Oberfl che des unteren und oberen Probentellers reiben bis alle Reste des PR 1 entfernt sind N Er eo Hinweis Die schwarzen R ckst nde von dem entfernten PR 1 auf dem Labortuch sind normal Das Rekonditionierungsverfahren ist erst dann abgeschlossen sobald das Labortuch keine schwarzen R ckst nde mehr zeigt Benutzen Sie Druckluft aus der
20. f hren W hlen Sie Add to report zum Bericht hinzuf gen um alle Messungen automatisch zum aktuellen Report hinzuzuf gen Die Standardeinstellung ist dass alle Proben zu Berichten hinzugef gt werden Das Add to report Kontrollfeld muss vor den Messungen ausgew hlt werden um die Porbendaten in einem Workbook zu speichern W hlen Sie Overlay spectra berlagerung der Spektren um mehrere Spektren zur selben Zeit anzuzeigen 3 11 Section 3 Applications 8 Um eine Blindprobe zu erstellen benutzen Sie bitte den geeigneten Puffer Die Blankl sung ist in der Regel der Puffer in dem das Molek l f r das Sie sich interessieren gel st ist Diese L sung sollte den selben pH Wert und eine hnliche lonenkonzentration wie die Probenl sung besitzen Probentellermessung Pipettieren Sie 1 2 uL von der entsprechenden Blindprobenl sung auf den unteren Probenteller schlie en Sie den Hebel und dr cken Sie den Blank Knopf KuUvettenoption nur f r Model 2000c Legen Sie die K vette ein beachten Sie hierbei die Richtung des Lichts die von dem Pfeil angezeigt wird Der optische Strahlengang 2 mm ist auf 8 5 mm ber den Boden der K vette gerichtet Wenden Sie sich f r Volumen Empfehlungen an den K vettenhersteller Hinweis Der Hebel muss f r alle Messungen geschlossen werden auch f r K vettenmessungen 8 Geben Sie eine Proben ID Kennung in das entsprechende Feld ein laden Sie die erste Probe wie o
21. g ul dsDNA 750 ng ul dsDNA 2 1 kg Alle NanoDrop Instrumente sind durch CE und UL CSA Normen zugelassen Patente Die im NanoDrop 2000 2000c Spektralphotometer verwendete Probenhaltetechnik ist unter den US Patenten 6 628 382 und 6 809 826 gesch tzt Andere Patente sind angemeldet Section 1 Introduction Sample Retention Pedestal Measurements Eine 1 2 uL gro e Probe wird auf die untere Messungsoberflache des Ger ts pipettiert Kleinere Probe von lediglich 0 5 uL Volumen k nnen f r Nucleins uren und Protein A280 Proben genutzt werden Ein optisches Lichtleiterkabel die Empfangsfaser ist in die untere Messoberfl che integriert Ein zweites optisches Fasernkabel die absendende Faser wird mit der fl ssigen Probe in Ber hrung gebracht sodass die Fl ssigkeit den Abstand zwischen den zwei Enden der Fasern durch eine Fl ssigkeitss ule berbr ckt W hrend der Messung werden durch eine Xenon Blitzlichtlampe Lichtblitze durch die Probe geschickt die anschlie end durch ein Spektralphotometer verwessen wird Anschlie end werden die generierten Daten durch eine Computer basierenden Software verrechnet und die Daten in workbook files twbk auf dem Computer abgespeichert Pedestal Sample Size Requirements Obwohl das Volumen der Probe nicht entscheidend ist ist es wichtig dass eine Fl ssigkeitss ule beim Gebrauch des Mikrovolumenmessplatzes gebildet wird damit die Wegl nge zwischen der oberen und unteren Lichtleite
22. gurationsoption verf gbar Hinweis Ver nderte Probendaten werden im aktuellen Bericht als neuer Dateneingang abgespeichert Sie werden nicht in einem Auto Save Workbook gespeichert Renaming a sample Umbenennung einer Probe Eine Proben ID kann jederzeit abge ndert werden indem man den Namen im Report markiert und dann die Proben ID berschreibt Autosave files automatisch gespeicherte Dateien Alle Daten au er die kinetischen Messungen werden automatisch als Autosave files twbk zu den folgenden Orten abh ngig von Betriebssystem ihres Computers gespeichert Vista C Users Public Public Documents Thermo Autosavel Software Application XP C Documents and Settings All Users Shared Documents Thermo NanoDrop2000 Autosavel Software Application Wenn ein Auto Save Workbook ge ffnet wurde muss es zun chst in der Software geschlossen werden bevor neue Messungen f r diese Anwendungsart vorgenommen werden k nnen Options Optionen Es gibt vier Tabs Registerkarten innerhalb des Options Task Bar e Applications f gt neue Gruppen hinzu und legt fest welche Anwendungen und Verfahren innerhalb jeder Gruppe zugeordnet sind Um eine neue Gruppe hinzuzuf gen gebend Sie den gew nschten Gruppennamen ein und dr cken Sie auf Add Ziehen Sie eine oder mehrere Anwendungen zu einer beliebig leeren Schaltfl che um das Erscheinungsbild anzupassen e Report Master Page durch Benutzen dieses Tabs Registerkarte k nnen Sie
23. inweis Obwohl vielleicht nicht alle Reportdateien angezeigt werden wenn Sie eine Autosave Datei ffnen sind alle Datenfelder f r das Technical Support Team wiederherstellbar Help Suchbare Hilfe Dateien k nnen von jedem beliebigen Bildschirm mit den Tasten Strg m Strg h oder der F1 Taste aufgerufen werden Siehe Preferences unter Data and Account Management f r weitere Informationen ber Tastenkombinationen Eine PDF Version der NanoDrop 2000 Bedienungsanleitung steht unter dem Windows Startmen zur Verf gung Die About Option unter dem Help Men zeigt spezifische Informationen ber die aktuelle Softwareversion und das Ger t an 2 3 Section 2 Software Ger teeinstellungen des linken Bildschirmbereichs Add to Report zeigt an ob man die Probenwerte zum aktuellen Bericht hinzuf gen will Obwohl alle Daten in einer Auto Save Datei gespeichert werden und zu einem sp teren Zeitpunkt wieder abgerufen werden k nnen sollte Add to Report als eine regelm ige Basis zur einfachen Datenabfrage ausgew hlt werden W hlen Sie Add to Report vor einer Messung aus um die Proben in einem Bericht und einem Workbook zu speichern Overlay spectra zeigt multiple Spektren an Ein Fadenkreuz wird angezeigt und steht in Verbindung mit den neusten Probenmessungen Wenn Overlay spectra ausgew hlt ist klicken Sie auf ein Spectrum um das Fadenkreuz mit dem Spektrum zu verkn pfen Die belegten Proben ID we
24. ista Operating system Das NanoDrop 2000 2000c Spektralphotometer sollte jetzt f r die Benutzung bereit sein Falls die Software nicht richtig startet siehe Diagnostics and Troubleshooting f r m gliche L sungen Es erscheinen regelm ig Upgrades der Software zum Downloaden Besuchen Sie unsere Webseite f r die neueste Software Kabelverbindung Um Messungen mit dem Ger t durchzuf hren verbinden Sie das USB Kabel mit dem Ger t und dem Computer Schlie en Sie das12V Netzteil an und verbinden Sie es mit dem Stromeingang an der R ckseite des Ger tes Das Netzteil kann auch am NanoDrop 2000 2000c angeschlossen bleiben wenn das Ger t nicht genutzt wird Wenn das Ger t im Standby Modus ist liegt der Stromverbrauch bei 5 W und die Blitzlampe steht nicht unter Spannung Das Ger t verf gt ber eine LED Lampe an der Oberseite des DC Netzanschlusses welche den 12V Stromempfang anzeigt 2 1 Section 2 Software Software Features Die NanoDrop 2000 2000c Software ist in einen linken und einen rechten Ausschnitt unterteilt Taskbars und Action Buttons liegen auf dem linken Ausschnitt w hrend der rechte Ausschnitt entweder das Hauptmen oder die Datenerfassungsbildschirme zeigt Linker Ausschnitt Task Bars Task Bars Optionen die im Software Startup angezeigt werden e Home zeigt das Hauptmen mit den Anwendungen die f r bestimmte Gruppen verf gbar sind an Die voreingestellte Gruppe ist Klassik e My
25. le 30 Minuten eine neue Blindprobe durchzuf hren wenn Sie viele Proben durchf hren Nach 30 Minuten wird die Zeit seit der letzten Blindprobenmessung in der unteren Statusleiste angezeigt Messbereiche Approximate Typical Reproducibility Sample Type Lower Detection Limit Upper Detection Limit 5 replicates SD ng uL CV 0 4 ng uL cuvette lt 15 000 ng uL dsDNA gt 100 ng uL 2 2 ng uL pedestal 2 100 ng uL 2 ng uL Microarray 0 4 ng uL cuvette 750 ng ul dsDNA gt 100 ng uL 2 0 10 mg mL purified BSA Protein A280 pedestal 400 mg mL purified BSA 0 10 10 mg mL 0 10mg mL gt 10 0 010 mg mL purified BSA mg mL 2 0 10 mg mL purified BSA pedestal 0 010 mg mL purified BSA cuvette Proteine amp Labels 20 mg mL purified BSA 0 10 10mg mL 0 10mg mL 3 8 Section 3 Applications 0 2 mg mL BCA 20 1 reagent sample volume 8 0 mg mL 2 over entire range 01 mg mL 0 01 mg mL over entire range 1 1 reagent sample volume 0 20 mg mL Modified Lowry 2 over entire range 0 2 mg mL 4 0 mg mL Bradford 100 ug mL 100 500 ug mL 25ug mL 50 1 reagent sample volume 8000 ug mL 500 8000 ug mL 5 15 ug mL 15 50 ug mL 4 ug mL 1 1 reagent sample volume 100 ug uL 50 125 ug mL 5 50 ug ml 50 125 ug ml 50 125 ug mL 3 ug ml 15 1 reagent sample volume gt 125 ug ml gt 125 ug mL 2 Pierce 660 nm 25 ug ml 25 125 ug ml 25 125 ug mL 3 ug ml 7 5 1 reagent samp
26. le volume gt 125 ug ml gt 125 ug mL 2 Cy3 Cy3 5 Alexa sample range 0 20 4 0 pmol ul Fluor 555 and 0 20 pmol ul Alexa Fluor 660 sample range gt 4 0 pmol ul 2 sample range 0 12 2 4 pmol ul 0 12 pmol ul sample range gt 2 4 pmol ul 2 Alexa Fluor 488 sample range 0 40 8 0 pmol ul and Alexa Fluor 0 40 pmol ul 594 Cy5 Cy5 5 and Alexa Fluor 647 sample range gt 8 0 pmol ul 2 sample range 0 30 6 0 pmol ul Alexa Fluor 546 0 30 pmol ul sample range gt 6 0 pmol ul 2 Hinweis Messbereiche die f r Farbstoffe angegeben wurden sind spezifisch f r Mikrovolumenmessungen 3 9 Section 3 Applications Nukleinsaure Ubersicht Nukleins uren k nnen einfach auf Konzentration und Qualit t durch Benutzung des NanoDrop 2000 2000c Spektralphotometers berpr ft werden Um Nukleins ureproben zu messen w hlen Sie die Nukleins ure Anwendung auf der Startseite aus Die allgemein akzeptierten Extinktionskoeffizient f r Nucleins uren sind e Doppelstrang DNA 50 ng cm uL e Einzelstrang DNA 33 ng cm uL e RNA 40 ng cm uL Wenn der Mikrovolumen Modus ausgew hlt ist benutzt das NanoDrop 2000 2000c Spektralphotomerter Schichtdicken zwischen 1 0 und 0 05 mm um Messungen von konzentrierten Proben ohne Verd nnung zu erm glichen Hinweis Die Daten der Absorption die im Report gezeigt werden werden so gespeichert wie sie im Software Bildschirm angezeigt werden Die Absorptionswerte
27. nmessung mit dH20 durchzuf hren Zus tzliche Reinigung Wenn ein strengeres Reinigungsprotokol verlangt wird z B bei getrockneten Proteinen ersetzen Sie das dH20 durch 0 5M HCI Folgen Sie den oben beschriebenen Reinigungsschritten Anschlie end wiederholen Sie es mit 3 5 uL dH20 Dekontamination Sollte eine Desinfektion notwendig sein verwenden Sie eine 0 5 Natriumhypochloritl sung um sicherzustellen dass kein biologisch aktives Material auf den Messoberfl chen zur ckbleibt Anschlie end wiederholen Sie die Reinigung mit 3 5 uL dH O Die Verwendung von chemischen Reinigungsmitteln und Isopropylalkohol wird nicht empfohlen da dies zu einer Sch digung der Messoberfl che f hren kann Falls eine L sung verwendet wird die einen der Stoffe beinhaltet ist es unbedingt notwendig anschlie end die Messoberfl che mit 3 5 uL dH2O zu reinigen Hinweis Verwenden Sie keine Spritzen oder Sprays um dH20 oder andere Fl ssigkeiten auf die Oberfl che des Ger tes aufzutragen 4 2 Section 8 Appendices Die Membran um den Probenteller ist fest mit dem Gr t verbunden Versuchen Sie nicht die Membran f r die Reinigung abzunehmen Vermeiden Sie l ngere Einwirkung von HCI Alkohol Bleichmittel Aceton oder anderen L semitteln an der Membran da der Klebstoff beeintr chtigt werden k nnte Falls die Membran locker wird kontaktieren Sie bitte den Technical Support Au erhalb der USA oder Kanada kontaktieren Sie bitte Ihr
28. oberen und unteren Probenteller wird automatisch erzeugt und die Messung wird durchgef hrt 3 Wenn die Messung abgeschlossen ist ffnen Sie den Messarm und wischen Sie die Probe sowohl vom oberen als auch unteren Messplatz Benutzen Sie hierf r ein trockenes und fusselfreies Laborwischtuch Einfaches Abwischen verhindert dass die Probe bei anschlie enden Messungen bertragen wird und die Konzentrationen verf lscht pel 9 K vettenmessungen Das NanoDrop 2000c akzeptiert 10 mm bis 48 mm gro e K vetten Zum Messen Ihrer Proben benutzen Sie bitte Mikro Halbmikro oder Ultramikrok vetten wir empfehlen das Benutzen von abgedeckten K vetten Abgedeckte K vetten helfen dass das gesamte Licht welches auf den Detektor trifft die Probe durchquert hat Bei unabgedeckten K vetten kann es vorkommen dass Licht auf den Detektor trifft welches nicht die Probe durchquert hat Un masked Eppendorf Uvette Starna masked micro cuvette F r die Messung von Proben mit einer analytischen Wellenl nge im UV lt 340 nm benutzen Sie bitte K vetten die aus Quarz hergestellt wurden da diese UV Wellenl ngen durchl ssig sind Obwohl manche Hersteller UV transparente Einwegk vetten aus Plastik anbieten sind selbst die besten unter ihnen bei einer Wellenl nge von unter 220 nm nicht transparent Die meisten K vetten aus Plastik oder Glas blocken UV Wellenl ngen vollkommen Section 1 Introduction Cuvette Sample Size
29. ption Pobenteller Optionen Pipettieren Sie 1 2 uL von der Blankl sung auf den unteren Probenteller schlie en Sie den Hebel und dr cken Sie auf Blank Cuvette Option K rvettenoption nur f r Model 2000c W hlen Sie Use Cuvette Legen Sie die K vette ein beachten Sie dabei die Richtung des Lichtstrahls der durch den Pfeil angezeigt wird Der optische Lichtsstrahl 2 mm ist auf 8 5 mm ber den Boden der K vette gerichtet Wenden Sie sich an der K vettenherstellter f r Volumenempfehlungen Hinweis Der Hebel muss f r alle Messungen geschlossen werden auch f r K vettenmessungen Es wird empfohlen dass die K vette zun chst vom Ger t entfernt wird um eine Mikrovolumenmessung durchzuf hren um sicherzustellen dass der Messarm in eine einwandfreie Positon bewegt werden kann 3 Wischen Sie die Blindprobe mit einem trockenen faserfreien Labortuch von dem Mikrovolumenmessplatz ab Geben Sie die Proben ID Kennung in das entsprechende Feld ein Pipettieren Sie 1ul der Probe und klicken Sie auf Measure Hinweis Ein frisches Aliquote der Probe sollte f r jede Messung verwendet werden Nach der Messung Wischen Sie einfach mit einem trockenen faserfreien Tuch ber den oberen und unteren Probenteller und das Ger t ist f r die n chste Messung bereit Wenn Sie die K vettenoption benutzen entfernen Sie die K vette Obwohl es nicht notwendig ist zwischen jeder Probe eine Blindprobe durchzuf hren wird empfohlen al
30. r berbr ckt ist Der entscheidende Faktor f r die Oberfl chenspannung des Tropfens sind die Wasserstoffbr ckenbindung der Wassermolek le in der L sung Grunds tzlich k nnen alle Zusatzstoffe einschlie lich Proteine DNA RNA Puffer Salze und Detergenzien die Oberfl chenspannung reduzieren Obwohl ein 1 uL Volumen f r die meisten Probenmessungen ausreichend ist gew hrleistet eine Erh hung auf 2 uL Volumen eine exakte S ulenbildung der Proben mit reduzierter Oberfl chenspannung Die Erfahrung zeigt dass die folgenden Volumen ausreichen um eine hohe Reproduzierbarkeit der Daten zu garantieren Nukleins uren in fl ssiger L sung 1 uL Aufgereinigte Proteine 2 uL Bradford BCA Lowry und Protein Pierce 660 nm Assays 2 uL Zellsuspensionen 2 uL Es wird empfohlen eine Prazisions Pipette mit Prazisionsspitzen zu verwenden um zu gewahrleisten dass ausreichend Probe 1 2 uL abgegeben wird Andere Pipetten 0 10 ul und gr er sind nicht so gut f r die Abgabe von 1 uL gro en Volumen geeignet Falls Sie unsicher ber die Eigenschaften der Probe oder der Genauigkeit der Pipette sind wird eine Probe mit 2 uL Volumen empfohlen Section 1 Introduction Benutzung des Messarms 1 ffnen Sie den Messarm und pipettieren Sie die Probe auf den unteren Messplatz iil j 2 SchlieBen Sie den Messarm und benutzen Sie die Software am Computer um eine Spektralmessung einzuleiten Die Fl ssigkeitss ule zwischen dem
31. r benutzerdefinierte Basensequenzen der Extinktionskoeffizient berechnet wir Die kundenspezifische Option erlaubt dem Benutzer einen Extinktionskoeffizienten zwischen 15 und 150 einzugeben Conc Konzentrationen basierend auf den Absorptionskoeffizienten von 260 nm und den Standard oder benutzerdefinierten Extinktionskoeffizienten Konzentrationseinheiten k nnen von der danebenliegenden Auswahlfeld ausgew hlt werden Siehe Nucleic Acid Calculations f r mehr Details A260 zeigt den Absorptionskoeffizienten bei 260 nm auf eine 10 mm Schichtdicke genormt A280 zeigt den Absorptionskoeffizienten bei 280 nm auf eine 10 mm Schichtdicke genormt 260 280 Verh ltnis des Absorptionskoeffizienten bei 260 zu 280 nm Das Verh ltnis des Absorptionskoeffizienten bei 260 und 280 nm wird verwendet um den Reinheitsgrad der DNA und RNA zu beurteilen Ein Verh ltnis von 1 8 wird in der Regel als rein f r DNA angesehen ein Verh ltnis von 2 0 wird in der Regel als rein f r RNA angesehen Ist das Verh ltnis in jedem Fall deutlich niedriger kann dies auf das Vorhandensein von Protein Phenol oder andere Verunreinigungen die stark absorbieren bei oder nahe 280 nm hindeuten 260 230 Verh ltnis des Absorptionskoeffizienten bei 260 zu 230 nm Die Werte f r reine Nucleins ure bei einer Messung von 260 230 nm sind meistens h her als entsprechende Werte einer Messung von 260 280 nm Die Werte liegen gew hnlich 1 8 2 2 Falls d
32. rden in der oberen linken H lfte des Graphen angezeigt Die neuste Probe die gemessen wurde erscheint ganz oben auf der Legende und ist rot markiert Durch das Dr cken auf ein anderes Spektrum erscheint die dazugeh rige Proben ID in rot Wenn Overlay Spectra nicht verwendet wird wird der Bildschirm von allen Spektren gel scht wenn eine neue Messung durchgef hrt wird Kleine Probevolumen nur f r Nukleins ure und Protein A280 Anwendungen erlaubt Messungen von nur 0 5 uL wenn die Proben 10 mm von quivalenten Absorptionswert von 3 0 oder h her haben z B gt 150 ng pL dsDNA Benuzung der K vette nur bei NanoDrop 2000c Model erm glicht K vettenmessungen Optionen die f r die K vettenmessung verf gbar sind Pathlength beinhaltet Schichtdicken von 10 5 2 und 1 mm Stir speed R hrgeschwindigkeit Geschwindigkeitseinstellungen reichen von 1 10 Die Standardeinstellung ist OFF Heat to 37 C Auf 37C erhitzen Heizt den K vettenschacht auf 37 0 5 auf Wenn es ausgew hlt ist wird die aktuelle Temperatur der K vette im unteren Teil des Bildschirms angezeigt Es kann zwischen 1 10 Minuten dauern bis der K vettenhalter 37 erreicht hat Die Zeit die die Probe ben tigt um 378 zu erreichen h ngt von der Anfan gstemperatur der Probe ab Die Heizung ist in der Standardeinstellung ausgeschaltet Hinweis Falls Sie zu einer anderen Anwendung wechseln wird die Heizung ausgeschaltet Die Heiz
33. sen wird Administrator Zugang ist notwendig um die Software zu installieren Um die Betriebssoftware richtig zu installieren folgen Sie bitte den nachstehenden Schritten 1 Schlie en Sie alle Programme und stellen Sie sicher dass das USB Kabel ausgesteckt ist Legen Sie die Software CD in das CD Laufwerk ein Das Software Installationsmen sollte automatisch erscheinen starten Falls die Installation nicht automatisch gestartet wird klicken Sie auf Start und w hlen Ausf hren Im Dialogfeld Ausf hren geben Sie x Set up ein wobei das x ihr Computer Laufwerk bezeichnet Dr cken Sie OK Befolgen Sie die Anweisungen auf dem Bildschirm um die Installation abzuschlie en Anschlie end verbinden Sie das USB Kabel Wenn der Neue Hardware gefunden Assistent erscheint wird das Windows XP SP2 Betriebssystem fragen ob Sie die Suche nach geeigneter Software erlauben wollen W hlen Sie Nein jetzt diesmal nicht Found New Hardware Wizard 27 Found New Hardware es Welcome to the Found New Windows needs to install driver software for your Thermo Hardware Wizard Scientific NanoDrop Product OL tall driver software recommended W e you through the process of soft fo installing driver software Ask me again Windows will Don t shov Your d is message again for ti vice will not function until you install d driver software Cancel Intro Page Windows XP SP2 V
34. st oder an der Wand abgezogen werden kann 4 1 Section 8 Appendices Pflege des Sample Retention Systems Reinigung Die Pflege des NanoDrop 2000 2000c beruht in erster Linie auf einer regelm igen gr ndlichen Reinigung der Probenteller Nach jeder Einzelmessung sollten beide Probenteller unbedingt mit einem sauberen trockenen und flusenfreien Labortuch gr ndlich abgewischt werden um Proben bertragung zu unterbinden und Ablagerungen von R ckst nden zu verhindern Obwohl es nicht zwingend notwendig ist kann 2 ul Wasser zum Reinigen der Messungsoberfl che nach hoch konzentrierten Proben verwendet werden um sicherzustellen dass keine Probenreste auf einem der Messungsoberfl chen beibehalten werden 1 2 Pipetieren Sie 3 5 uL von dH20 auf die untere Messoberflache Schlie en Sie den oberen Arm um eine Fl ssigkeitss ule auszubilden lassen Sie diese ca 2 3 Minuten bestehen Wischen Sie das Wasser mit einem sauberen Labortuch von beiden Probentellern Zwischen den Messungen Nach Abschluss jeder Probenmessung wischen Sie die Probe mit einem sauberen trockenen und flusenfreien Labortuch von beiden Probentellern um Proben bertragung zu unterbinden und Anlagerungen von R ckst nden zu verhindern Es ist nicht notwendig mit dH20 zwischen den Probenmessungen zu reinigen Zwischen den Benzutzern Es wird empfohlen eine abschlie ende Reinigung der Messungsoberfl chen vor der ersten und nach der letzten Probe
35. te File Men leiste welche die folgende Auswahl beinhaltet New Workbook ffnet eine neue Arbeitsmappe Die aktuelle Arbeitsmappe wird automatisch geschlossen und gespeichert Close Workbook and go home schlie t die aktuelle Arbeitsmappe und kehrt zur Startseite zur ck Alle Daten werden automatisch gespeichert wenn eine Arbeitsmappe geschlossen wird Close All Workbooks and go home schlie t alle ge ffneten Arbeitsmappen alle Anwendungen und Verfahren und kehrt zur Startseite zur ck Print Report druckt den aktuellen Bericht am Standarddrucker aus Verwendung der aktuellen Einstellungen als Standard legt alle aktuellen Einstellungen wie z B Probentype Einheitentype Korrekturwellenl nge und die Auswahl des Probenteller K vettenmodus als Standard fest jedes Mal wenn eine neue Arbeitsmappe f r diese Anwendung ge ffnet wird Falls ausgew hlt werden auch die Berichtskonfigurationsfelder als Standard gesetzt Diese Option ist ein nutzvolles Werkzeug welches dazu genutzt werden kann um individuelle Benutzereinstellungen innerhalb jeder Anwendung und Verfahren festzulegen E mail current workbook f gt das aktuelle Workbook automatisch an eine neue Email an Wenn Sie Daten an den NanoDrop products technical support senden benutzen Sie bitte den My Data task bar um die entsprechende Autosave Datei zu suchen ffnen Sie die Datei mit der NanoDrop 2000 2000c software und senden Sie sie zum Technical Support H
36. te Essigs ure Alle Formen von Fluorwasserstoffs ure HF sind inkompatibel da das Fluorid Ion das Quarzfaserkablel aufl st Lassen Sie nicht zu dass Alkohol Bleichmittel Aceton oder andere L sungsmittel sich l nger als eine Minute auf der Membran befindet da sonst der Klebstoff negativ beeinflusst wird Falls die Dichtung locker wird kontaktrieren Sie bitte den Technical Support Kontaktieren Sie ihren lokalen H ndler f r Kundenservice und Technical Support au erhalb der US und Kanada Wartung des K vetten Systems Der K vettenhalterblock sollte von bersch ssigen Fuseln durch den Gebrauch von Druckluft gereinigt werden Falls irgenwelche Fl ssigkeit in den Block geraten verwenden Sie am besten ein Labortuch oder Laborwattest bchen um die Fl ssigkeit aufzuwischen Hinweis Spritzen Sie keine L sungsmittel in den K vettenhalter da die Fl ssigkeit in das Ger t tr pfeln k nnte Folgen Sie den Empfelungen des jeweiligen spezifischen K vettenherstellers f r die Reinigung und Wartung der K vetten K vetten mit Kratzern im Strahlengang sollten nicht verwendet werden Vergwissern Sie sich dass alle optischen Oberfl chen frei von Fingerabdr cken und Fusseln sind bevor Sie die K vette einsetzen 4 5 Section 8 Appendices 5 Diagnose und Fehlerbehebung Der Diagnostics Task Bar beinhaltet die Intensitats und Kalibrierungskontrolle Die Intensitatenkontrolle bestatigt dass das interne Spektrometer
37. tesystem nutzt die Oberfl chenspannung der Probe um eine Fl ssigkeitss ule zwischen zwei optischen Fasern auszubilden W rend der Messung wird ein vollst ndiges Absorptionsspektrum ber den gesamten Wellenl ngenbereich 190 840 nm aufgenommen und dargestellt Mit dem NanoDrop 2000 2000c Spektralphotometer haben Sie die M glichkeit bis zu 200mal h her konzentrierte Proben zu messen als mit herk mmlichen K vettenphotometern Ger tespezifikationen NanoDrop 2000 2000c Mikrovolumensystem Minimale Probenmenge Spektraler Bereich Optischer Weg Wellenlangengenauigkeit Bandbreite Absorptionsbereich Prazision der Absorption Messgenauigkeit der Absorption Lichtquelle Detektor Messbereich dsDNA Messbereich Bradford Messbereich Proteine BSA Abmessungen Gewicht Leistung Betrieb Standby Stromversorgung Betriebsysteme NanoDrop 2000c K vettensystem Zentrumsh he Temperierbarkeit R hrgeschwindigkeiten Schichtdicken Detektionslimit Maximale Konzentration Gewicht 0 5 uL 190 840 nm 1 mm 0 2 mm 0 1 mm 0 05 mm 1 nm lt 1 8 nm FWHM Hg 253 7 nm 0 02 300 10 mm quivalente Absorption 0 002 A optischer Weg 1 mm 2 bei Absorption 0 76 bei 257 nm Xenon Blitzlampe Silizium CCD Chip 2 15000 ng ul 15 8000 ng ml 0 10 400 mg ml 14x19x20cm 2 0 kg 18W 5W 12V Windows XP Vista und Windows 7 8 5 mm 37 0 50 150 850 RPM 10 5 2 und 1 mm 0 4 n
38. uL dH20 auf den unteren Probenteller auf 2 Senken Sie den oberen Probenarm um eine Fl ssigkeitss ule zu bilden lassen Sie es 2 3 Minuten in dieser Position verweilen 3 Wischen Sie das Wasser mit einem sauberen und trockenen Labortuch vom unteren und oberen Probenteller Falls ein gelbes Dreieck oben links in der Spektaldarstellung f r den Vorspannungsindikator Bias angezeigt wird berpr fen Sie bitte dass das Ger t sich nicht in einer kalten Umgebung befindet Lassen Sie das Ger t auf Raumtemperatur aufw rmen und wiederholen Sie die Intensit tenkontrolle Falls weiterhin Probleme bestehen mailen Sie das Ergebnis der Intensit tenkontrolle dem Technical Support Au erhalb der USA oder Kanada kontaktieren Sie bitte ihren NanoDrop H ndler Die Spekren werden automatisch als JPG Datei an folgenden Ort gespeichert Vista C Users Public Public Documents Thermo AutosavelintCheck XP C Documents and Settings AllUsers Documents Thermo NanoDrop2000 Autosavel lntCheck 5 6 Section 8 Appendices Kalibrierungskontrolle Es wird empfohlen die Kalibrierungskontrolle alle sechs Monate durchzuf hren um sicherzustellen dass das Ger t innerhalb der Spezifikationen arbeitet Ein Fl schchen von Thermo Scientific s Kalibrierungsl sung ist erforderlich um die berpr fung der Kalilbrierung zu starten CF 1 ist eine w ssrige Kaliumdichromat K2Cr207 L sung die dazu verwendet wird die Exaktheit der Schichtdicken des N
39. ung wird jedoch nicht abgeschaltet wenn Mikrovolumenmessungen im gleichen Messmodul durchgef hrt werden 2 4 Section 2 Software Data and Account Management My Data Die Daten der Probenmessungen sind in Workbooks festgehalten die an einem benutzerspezifischen Ort gespeichert werden k nnen Benutzen Sie die Navigationsleiste um den Ordner zu finden in dem das Workbook nach dem Sie suchen gespeichert ist File Help N E E Application Data A Start a new workbook or select a stored workbook to load To sort list click on a column header A Q Cones a O 9 Desktop New Open ooo a de es Application Filename Sample mode Date Samples a Wwaritbook id E ocal Settings Active workbook folder Sa Proteins amp Labels 2009_02_17_Proteins amp Labels twbk 2 17 2008 12 25 47 PM 1 My default workbook folder a 9 207 Protein A280 2009_02_17_Protein A280 twbk 2 17 2009 12 25 07 PM 1 ug System default workbook folder Q 2008 Micro Aray 2009_02_17_Micro Array twbk 2 17 2009 12 22 08 PM customer data My Documents folder LabVIEW Data Default Method 2009_02_17_Classic_Default Method twbk Pedestal 2 17 2009 8 07 52 AM 2 amp My Data Sources Default kinetics method 2009_02_17_Classic_Default kinetics method twbk Cuvette 2 17 2009 7 43 40 AM Autosave folder My eBooks m PA Mu Mestinn Filas Es gibt 2 Symbole im oberen linken Fensterbereich wenn der My Data Task Bar ausgew hlt wurde Wenn Sie New ausw hl
40. utzer die Eingabe und Bearbeitung von neuen Farbstoffen in Zusammenhang von vordefinierten Farbstoffen Siehe Dye Chrom bearbeiten innerhalb Protein amp Labels f r weitere Informationen e Editoroptionen innerhalb Methodenditor definiert die vorhandenen Optionen f r die Bearbeitungsmethoden Siehe Methodenditor f r weitere Informationen Action Buttons Die folgenden vier Aktionssymbole werden oben auf dem linken Ausschnitt angezeigt wenn eine Anwendung ge ffnet ist e Measure initialisiert die Messung einer Probe Der grauhinterlegte Knopf wird nach durchgef hrter Blank Messung gr n e Print Screen druckt eine Kopie des Spektrums und der gemessenen Daten e Blank initialisiert die Referenzmessung Ein Blank muss vor der Probenmessung durchgef hrt werden e Re Blank Erm glicht die Verwendung einer neuen Referenz die f r die Konzentrationsberechnung verwendet wird 2 2 Section 2 Software Die folgenden vier Aktionssymbole nur werden oben auf dem Ausschnitt angezeigt wenn Method Editor oder Kinetics Editor ausgew hlt ist e New startet einen neuen Assistenten mit dem Sie der Reihe nach durch den Prozess der Erstellung einer neuen Methode geleitet werden e Save speichert die neuen Methoden in der Liste der aktuell ausgew hlten Gruppe e Measure ffnet eine neue erstellte Methode e Delete l scht eine Methode Auswahlm glichkeiten am linken Panel Optionen der Men leis
41. wie erwartet funktioniert Die Kalibrierungskontrolle best tigt dass das Ger t innerhalb der eingestelleten Schichtdicken arbeitet Intensit tenkontrolle Schlie en Sie den Probenhebel nach unten und dr cken Sie auf Measure um eine Intensit tenkontrolle durchzuf hren Diagnostics File Help Ensure both pedestal measurement surfaces are clean and dry lower the arm and click Measure For optimal results do not place a cuvette in the a instrument during the intensity check Measure Print Ei NinoDrao 26800002 F01281 2000 2000c General information 0 Recalbrate Wavelengths upon measure o De di 2 Vis h O Use akernate path Detector Bias 976 89 WL Shift 0 02 Additional Info Wavelength Accuracy Max Single Offset 0 95 Xe Monitored Peaks f 484 43 nm 483 58 260 70 nm 260 04 362 41 nm 361 58 823 16 nm 823 11 529 20 nm 528 75 Intensihy IM A ij Vv Y i Aaw 1 UN A Wa Mus Falls gelbe Dreiecke oben links in der Spektraldarstellung entweder f r den sichtbaren oder f r den UV Indikator angezeigt werden reinigen Sie bitte den Probenteller wie unten beschrieben und wiederholen Sie die Intensit tenkontrolle Ein Cleaning and Reconditioning Guide kann ber das Kapitel Appendices des NanoDrop 2000 User Manual PDF abgerufen werden Es wird empfohelen dieses Bedienungsankleitung auszudrucken und in der N he des Ger tes zur Einsicht auszulegen 1 Tragen Sie 3 5
Download Pdf Manuals
Related Search