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Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae

1. 3 1 4 Non infect 696 577 1273 Non infect S O 0 1 1 Non infect 0 1 1 Non infect S O 16 9 25 Non infect S O S O 1 0 1 Non infect S O 2 2 4 Non infect S O S O 0 1 Non infect 11 10 21 Non infect S O 0 1 1 Non infect 1 1 2 Non infect S O 0 1 1 Non infect S O S O S O 1 0 1 Non infect S O 5 4 9 Non infect 1 1 2 Total 811 640 1451 RS A pm T c C omcc A ccc H sm s a Sympt symptomatique Asympt asymptomatique S O chantillon non obtenu ou non disponible pour un test Le symbole gal indique des r sultats quivoques ou ind termin s apr s r analyse FS couvillon endocervical f minin FU urine f minine PVS couvillon vaginal collect par la patiente CVS couvillon vaginal collect par un clinicien Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 56 502185FR R v E Performance clinique du test avec les DTS Systems Tableau 7e R sultats de l tude clinique des chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt provenant de patients infect s par N gonorrhoeae couvillon endocervical tat des sympt mes bb AMO pd MONEDA Test GC APTIMA Symptomati
2. GEN PROBE APT MA Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae Pour diagnostic in vitro R serv l exportation am ricaine uniquement Informations g n rales 2 Usage pr vu 2535363 EU eee ETUR EORR eme ROS AUS BOR 2 R sum et explication du test 2 Principes de la proc dure 3 Avertissements et pr cautions 4 Conditions de conservation et de manipulation des r actifs 7 Collecte et conservation des chantillons 8 Interpr tation du test QC R sultats patients 38 Limites 2228558 Me etuer Ex E ciae a te es 41 R sultats des tudes cliniques 43 Valeurs attendues pour les DTS Systems 44 Performance clinique du test avec les DTS Systems 47 Concordance des chantillons cliniques pour le TIGRIS DTS System 64 Performance analytique du TIGRIS DTS System 68 Performance analytique du PANTHER System 72 Bibliographie tret Roo oae Dorn tems a Do es a e oe 74 DTS a TIGRIS DTS Systems oria een 10 TIGRIS DTS System 23 R actifs et mat riels fournis ssssssusss 10 R actifs et mat riels fournis 23
3. 20 C et puis analys s au jours 0 200 et 400 Tous les chantillons ensemenc s ont r uni les crit res d acceptation savoir une concordance sup rieure 95 concernant les r sultats attendus Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 63 502185FR R v E Concordance des chantillons cliniques pour le TIGRIS DTS System Concordance avec le TIGRIS DTS System La concordance entre les r sultats du test GC APTIMA g n r s par le TIGRIS DTS System enti rement automatique et les DTS Systems semi automatiques a t valu e en testant les chantillons endocervicaux et ur traux m les sur couvillon d urine masculins et f minins vaginaux sur couvillon et de frottis en milieu liquide PreservCyt Chacun des chantillons cliniques a t test individuellement avec le test GC APTIMA sur le TIGRIS DTS System et les DTS Systems chez Gen Probe L ordre des tests n tait pas al atoire Les chantillons identifi s pour l inclusion ont t test s avec le TIGRIS DTS System et suivis de tests sur les DTS Systems tude de la concordance des chantillons cliniques endocervicaux et ur traux m les sur couvillon d urine masculins et f minins vaginaux sur couvillon et de frottis en milieu liquide PreservCyt Des sujets masculins et f minins se rendant dans des cliniques pour MST des centres de planning familial et des gyn cologues obst triciens de huit sites g ographiquement divers avec des pr valences d infectio
4. Performance analytique des DTS Systems Tableau 11 Sp cificit analytique Organisme Organisme Organisme Achromobacter xerosis Escherichia coli Neisseria mucosa 3 Acinetobacter calcoaceticus Flavobacterium meningosepticum Neisseria sicca 3 Acinetobacter lwoffi Fusobacterium nucleatum Neisseria subflava 14 Actinomyces israelii Gardnerella vaginalis Neisseria perflava Actinomyces pyogenes Gemella haemolysans Neisseria polysaccharea Aerococcus viridans Haemophilus ducreyi Paracoccus denitrificans Aeromonas hydrophila Haemophilus influenzae Peptostreptococcus anaerobius Agrobacterium radiobacter Virus de l herp s simplex Peptostreptococcus productus Alcaligenes faecalis Virus de l herp s simplex II Plesiomonas shigelloides Bacillus subtilis Papillomavirus 16 Propionibacterium acnes Bacteriodes fragilis Kingella dentrificans Proteus mirabilis Bacteriodes ureolyticus Kingella kingae Proteus vulgaris Bifidobacterium adolescentis Klebsiella oxytoca Providencia stuartii Bifidobacterium brevi Klebsiella pneumoniae Pseudomonas aeruginosa Branhamella catarrhalis Lactobacillus acidophilus Pseudomonas fluorescens Brevibacterium linens Lactobacillus brevis Pseudomonas putida Campylobacter jejuni Lactobacillus jensonii Rahnella aquatilis Candida albicans
5. Ureaplasma urealyticum Entercoccus faecalis Neisseria elongata 3 Vibrio parahaemolyticus Entercoccus faecium Neisseria flava Yersinia enterocolitica Erwinia herbicola Neisseria flavescens 2 Erysipelothrix rhusiopathiae Neisseria lactamica 9 EE EE NONEM a OEC OECUO TNNCUNCECN NUN CC ccc NC ow cGNET C C C MMC KCN ON COMME GN CC MEC c gr Oc n nombre de souches test es Tous les organismes test s ont donn un r sultat n gatif avec le test GC APTIMA Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 61 502185FR R v E Performance analytique des DTS Systems Substances interf rentes Les substances interf rentes suivantes ont t ensemenc es individuellement dans des chantillons d couvillon et de solution PreservCyt sang 10 gel contraceptif spermicide hydratant anesth siant h morroidal huile corporelle poudre cr me anti fongique lubrifiants vaginaux spray intime et leucocytes 1 0 x 10 cellules mL Les substances interf rentes suivantes ont t ensemenc es individuellement dans des chantillons d urine sang 30 96 analytes d urine prot ines glucose c tones bilirubine nitrates urobilinog ne pH 4 acide pH 9 alcalin leucocytes 1 0 x 10 cellules mL d bris cellulaires vitamines min raux ac taminoph ne aspirine et ibuprof ne Toutes ces substances ont t test es pour une interf re
6. j Jetez le collet de reconstitution et le flacon Figure 1 tape 8 1 ES 3 4 eQ x t3 FA Le 6 7 UJ Ke J Figure 1 Proc dure de reconstitution pour les DTS Systems 2 Les r actifs de sonde GC d amplification GC et enzymatiques pr c demment reconstitu s doivent parvenir temp rature ambiante 15 C 30 C avant d entreprendre un test Si le r actif sonde contient un pr cipit qui ne se dissolve pas temp rature ambiante chauffez le 62 C pendant 1 2 minutes Apr s cela le r actif sonde peut tre utilis m me s il reste des pr cipit s r siduels M langez par retournement en veillant ne pas former de mousse Remarque Ces retournements devront tre effectu s chaque fois qu un pr cipit se forme dans la solution que ce soit par chauffage 62 C ou par r chauffement temp rature ambiante 3 Pr paration de la solution de r actif de capture de cible GC working Target Capture Reagent wTCR GC a Transf rez 20 mL de TCR GC dans un r cipient propre et sec de la taille appropri e et r serv cet effet b A l aide d un micro pipeteur ajoutez 200 uL de TCR B dans le TCR GC Tournez d licatement la solution pour bien la m langer Mettez une tiquette sur ce r cipient Notez les initiales de l op rateur la date de pr paration et les deux num ros de lot Remarque Pour un petit nombre de r actions chantillons et
7. kemme 189 de E 1 50 95 4 100 89 6 100 95 8 100 Ecouvillon m TT 108 Romme due 9 g 50 95 1 100 94 0 100 97 3 100 100 974 98 6 Fous Fermes e 33 9 1 ud 89 1 100 86 5 99 9 92 5 100 ci 98 5 100 99 2 Homme 1907 499 Si 91 8 100 94 4 100 95 8 100 100 100 100 PreservCyt Femme 51 40 0 0 11 91 2 100 71 5 100 93 0 100 indique un r sultat positif un r sultat n gatif IC intervalle de confiance chantillons endocervicaux et vaginaux sur couvillon combin s Un r sultat discordant pour les chantillons vaginaux sur couvillon Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 502185FR R v E Concordance des chantillons cliniques pour le TIGRIS DTS System tude de pr cision Les effets de plusieurs facteurs sur la variabilit de la performance du test GC APTIMA sur le TIGRIS DTS System ont t valu s en utilisant des panels de reproductibilit MST constitu s de 12 membres Les membres des panels contenaient de 0 250 000 fg de rRNA GC test Le panel comportait des membres avec des concentrations de CT d une sensibilit analytique revendiqu e de 250 fg de rRNA GC test Les panels ont t test s dans l un des sites de test externes et chez Gen Probe en utilisant deux lots de r actifs de test GC APTIMA Chez Gen Probe deux op rateurs ont effectu chacun 3 listes de travail valides par lot de r actifs sur chacun des 2 instruments du TIGRIS DTS System Sur le site de t
8. valides i positifs positifs TIGRIS 1 787 0 0 00 0 00 0 38 TIGRIS 2 791 1 0 13 0 00 0 70 TIGRIS 3 792 4 0 51 0 14 0 29 Tee 2370 5 0 21 0 07 0 49 instruments CC OO a Aucun r sultat GC faussement positif n a t d tect avec l appareil TIGRIS DTS System 1 directement apr s un r sultat positif avec une valeur cible lev e b Un r sultat GC faussement positif a t d tect avec l appareil TIGRIS DTS System 2 directement apr s un r sultat positif avec une valeur cible lev e c Trois r sultats GC faussement positifs ont t d tect s avec l appareil TIGRIS DTS System 3 directement apr s un r sultat positif avec une valeur cible lev e Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 71 502185FR R v E Performance analytique du PANTHER System tude de la concordance du panel clinique ensemenc Des chantillons individuels d urine dont les r sultats taient n gatifs ont t ensemenc s avec GC afin de constituer un panel de 120 chantillons positifs pour GC Les membres du panel positif pour GC ont t ensemenc s avec 12 5 CFU mL 125 CFU mL ou 1250 CFU mL soit 25 fg test 250 fg test ou 2500 fg test De plus 120 chantillons d urine n gatifs pour GC ont t collect s Les panels positifs et n gatifs ont t analys s sur trois PANTHER Systems et trois TIGRIS DTS Systems Le pourcentage de concordance positive entre le PANTHER System et le TIGRIS DTS System tait de 100 avec une bo
9. 5 0 0 0 297 6 0 5 2 364 Tous 1 0 16 1647 Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 44 502185FR R v E Valeurs attendues pour les DTS Systems Valeurs pr dictives positives et n gatives des taux de pr valence hypoth tiques en Am rique du Nord Les valeurs pr dictives positives et n gatives PPV et NPV estim es pour les diff rents taux de pr valence hypoth tiques en utilisant le test GC APTIMA sont indiqu es au tableau 2 Ces calculs sont bas s sur la pr valence hypoth tique d une sensibilit et d une sp cificit g n rales calcul es d apr s l tat d infection des patients La sensibilit et sp cificit g n rales pour GC taient respectivement de 97 6 et 99 3 tableau 2 Les PPV et NPV r elles pour les chantillons endocervicaux vaginaux et ur traux m les collect s par des cliniciens l aide d un couvillon des chantillons collect s par la patiente l aide d un couvillon vaginal et des chantillons d urine masculins et f minins sont indiqu es au tableau 6 pour chaque site clinique et de mani re globale Les PPV et NPV r elles des chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt sont indiqu es au tableau 6a Tableau 2 Valeurs pr dictives positives et n gatives des taux de pr valence hypoth tiques en Am rique du Nord Taux de pr valence hypoth tique Sensibilit Sp cificit PPV NPV 1 97 6 99 3 58 7 100 0 2 97 6 99 3
10. Conform ment aux directives de d pistage de Chlamydia trachomatis et Neisseria gonorrhoeae publi es en 2002 les CDC recommandent un certain nombre d options de suivi apr s un test de d pistage positif si l on peut s attendre une valeur pr dictive posiitve faible ou si un r sultat faussement positif risque d entrainer de s rieuses r percussions psychosociales ou l gales 1 L une des ces options de tests suppl mentaires peut consister utiliser un test d amplification de l acide nucl ique autoris par la FDA qui utiliserait une autre cible que celle du test initial Les tests GC APTIMA et APTIMA COMBO 2 ciblent chacun la sous unit 16S de rRNA pour la capture et la d tection La capture de cible est similaire dans les deux tests cette diff rence toutefois que le test GC APTIMA reconna t une r gion diff rente de la sous unit 16S de rRNA pour la d tection de celle du test APTIMA COMBO 2 Principes de la proc dure Le test GC APTIMA associe les techniques de la capture de cible de la TMA et du HPA Les chantillons sont collect s et transf r s dans leurs tubes de transport d chantillon respectifs La solution de transport de ces tubes lib re la cible rRNA et l emp che de se d t riorer pendant la p riode de conservation Lorsque le test GC APTIMA est effectu en laboratoire la mol cule rRNA cible est isol e des chantillons en utilisant un oligom re de capture par la m thode dite de capture de cib
11. chantillons d urine masculins et f minins Kit de collecte d chantillons couvillon vaginal APTIMA Kit de transfert d chantillons APTIMA utiliser avec les chantillons gyn cologiques collect s dans la solution PreservCyt Instructions de collecte R f rez vous la notice du test correspondant au kit de collecte d chantillons utilis pour toute instruction Transport et conservation des chantillons avant le test 1 chantillons sur couvillon a Une fois l couvillon collect transportez le et conservez le dans le tube de transport d chantillon sur couvillon entre 2 C et 30 C jusqu la r alisation du test Les chantillons doivent tre test s avec le test GC APTIMA dans les 60 jours qui suivent leur collecte Si une dur e de conservation sup rieure est n cessaire congelez entre 20 C et 70 C pendant 12 mois maximum apr s la collecte voir Etudes de la stabilit des chantillons 2 chantillons d urine a Les chantillons d urine qui sont encore dans le r cipient de collecte principal doivent tre transport s au laboratoire une temp rature de 2 C 30 C Transf rez l chantillon d urine dans le tube de transport pour chantillons d urine dans les 24 heures qui suivent sa collecte Conserver entre 2 C et 30 C et testez dans les 30 jours qui suivent la collecte b Une fois collect s transporter les chantillons d urine trait s dans le tube de transport
12. de d tergent Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 10 502185FR R v E DTS Systems La bo te r frig r e comprend galement les articles suivants plateau de stockage conserver entre 2 C et 30 C d s la r ception Symbole Composant Quantit S R actif de s lection APTIMA 1x31mL 600 mM de solution tamponn e de borate contenant un surfactant Collets de reconstitution 3 Cartes de protection 1 paquet Boite non r frig r e pour test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae Boite 2 sur 2 conserver entre 15 C et 30 C d s la r ception Symbole Composant Quantit TCR R actif de capture de cible GC APTIMA 1x22mL Solution saline tamponn e contenant une phase solide et des oligom res de capture W Solution de lavage APTIMA 1x402mL 10 mM de solution tamponn e HEPES contenant lt 2 de d tergent DF Tampon APTIMA pour solution de d sactivation 1 x 402 mL 800 mM de solution tamponn e de bicarbonate O R actif huileux APTIMA 1 x 24 6 mL Huile de silicone Mat riel requis mais disponible s par ment Remarque Le mat riel disponible aupr s de Gen Probe est indiqu par des r f rences catalogue sauf indication contraire R f rence LEADER HC luminom tre 104747 01 Syst me de capture de cible GEN PROBE 104555 Target Capture System TCS Incubateurs et vortexeurs 2 vortexeurs multi tubes 102160 3 bain maries circulateurs 104586 62 C1 0420 21 0 62 CT
13. taient test s une concentration de 10 vol vol de sang dans les chantillons sur couvillon les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt ou de 30 vol vol de sang dans les chantillons d urine Tous les chantillons ne contenant pas de cible ont t identifi s correctement comme n gatifs Ces r sultats sont identiques ceux d montr s pour les DTS Systems lorsque les m mes quantit s de sang leur sont rajout es La pr sence de sang dans les chantillons sur couvillon de PreservCyt et d urine des niveaux bien sup rieurs ceux attendus lors du recueil normal d chantillons n a pas interf r avec les r sultats produits par le PANTHER System tudes de contamination par transfert pour le PANTHER System Afin d tablir que le PANTHER System minimise les risques de r sultats faussement positifs li s une contamination par transfert une tude analytique a t r alis e sur plusieurs s ries et sur trois syst mes PANTHER l aide de panels ensemenc s La contamination de transfert a t valu e en r partissant des chantillons avec un titre lev de GC parmi les chantillons n gatifs environ 20 du total Les s ries comprenaient des regroupements d chantillons fortement positifs et des regroupements d chantillons n gatifs ainsi que des chantillons fortement positifs isol s dispos s de mani re sp cifique dans la s rie Les chantillons titre lev s taient pr pa
14. 100 97 4 100 7 54 12 0 42 O 22 2 100 73 5 100 100 91 6 100 100 100 8 S O S O S O S O S O S O S O S O S O S O Tous 575 171 10 393 1 299 99 4 96 8 100 97 5 95 5 98 8 94 5 99 7 Homme 1 252 53 1 198 0 210 100 93 3 100 99 5 97 2 100 98 1 100 2 353 68 3 280 2 19 8 97 1 90 1 99 7 98 9 96 9 99 8 95 8 99 3 3 4 0 0 4 0 00 S O 100 39 8 100 S O 100 4 S O S O S O S O S O S O S O S O S O S O Urine 5 200 8 3 189 0 40 100 63 1 100 98 4 95 5 99 7 72 7 100 6 305 39 2 264 0 128 100 91 0 100 99 2 97 3 99 9 95 1 100 7 207 12 0 195 0 5 8 100 73 5 100 100 98 1 100 100 100 8 SO SO SO SO SO SO S O S O S O S O Tous 1321 180 9 1130 2 13 8 98 9 96 1 99 9 99 2 98 5 99 6 95 2 99 8 Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 50 502185FR R v E Performance clinique du test avec les DTS Systems Tableau 6 Sensibilit sp cificit et valeurs pr dictives du test GC APTIMA compar es l tat d infection des patients par site clinique et de mani re globale pour les couvillons ur traux m les les chantillons d urine masculins les couvillons endocervicaux f minins les chantillons d urine f minins les couvillons vaginaux collect s par des patientes asymptomatiques et les couvillons vaginaux collect s par des cliniciens suite chantillon Site N TP FP TN FN Pon pne dC id js p 1 226 12 2 212 0 53 100 735 100 99 1
15. C et 30 C Solution de reconstitution de l amplification GC APTIMA Solution de reconstitution enzymatique APTIMA Solution de reconstitution de sonde GC APTIMA R actif de s lection APTIMA C Les r actifs suivants sont stables lorsqu ils sont conserv s entre 15 C et 30 C temp rature ambiante R actif de capture de cible GC APTIMA Solution de lavage APTIMA Tampon APTIMA pour solution de d sactivation R actif huileux APTIMA D La pr paration de r actif de capture de cible GC working Target Capture Reagent WTCR GC est stable pendant 60 jours lorsqu elle est conserv e entre 15 C et 30 C Ne pas r frig rer E Une fois reconstitu s le r actif enzymatique le r actif d amplification GC et le r actif sonde GC restent stables pendant 60 jours s ils sont conserv s entre 2 C et 8 C F Jetez tout r actif reconstitu et WTCR non utilis au bout de 60 jours ou apr s la date de p remption du lot de r f rence si celle ci survient avant G Les contr les restent stables jusqu la date indiqu e sur les flacons H Les r actifs des flacons pour 50 tests restent stables pendant 48 heures lorsqu ils sont conserv s int gr s dans le TIGRIS DTS System l La stabilit bord des r actifs dans les flacons de 100 tests stock s bord du TIGRIS DTS System est de 96 heures J La stabilit bord des r actifs stock s bord du PANTHER System est de 72 heures K Le r actif sonde GC et le r actif s
16. Jetez le collet de reconstitution et le flacon en verre Figure 2 tape 8 Avertissement vitez de faire de la mousse en reconstituant les r actifs La mousse interf re avec le d tecteur de niveau du TIGRIS DTS System 1 2 N Dy d NAG A f js M E M N 9 Figure 2 Proc dure de reconstitution pour le TIGRIS DTS System 2 Pr parez la solution de travail TCR GC WTCR GC pour le kit de 100 tests a b f g Associez les flacons de TCR GC et de TCR B appropri s V rifiez les num ros de lot des r actifs sur la fiche de code barres du lot de r f rence pour vous assurer que les r actifs appropri s du kit se correspondent Ouvrez le flacon de TCR GC et posez le bouchon sur une surface de travail propre et couverte Retirez le bouchon du flacon de TCR B et versez la totalit du contenu dans le flacon de TCR GC Il est normal qu une petite quantit de liquide reste dans le flacon de TCR B Rebouchez le flacon de TCR GC et agitez d licatement la solution pour m langer le contenu Evitez de cr er de la mousse pendant cette tape Inscrivez les initiales de l op rateur ainsi que la date du jour sur l tiquette Jetez le flacon de TCR B et son bouchon 3 Pr parez la solution de travail TCR GC WTCR GC pour le kit de 50 tests a b Associez les flacons de TCR GC et de TCR B appropri s V rifiez les num ros de lot des r actifs sur l
17. Ne pas remplir nouveau les flacons de r actif Le PANTHER System reconna t et rejette les flacons qui ont t remplis nouveau D Manipulation des chantillons 1 Laissez les contr les ainsi que les chantillons parvenir temp rature ambiante avant toute proc dure 2 Ne pas vortexer les chantillons 3 Confirmez visuellement que chaque tube chantillon r pond un des crit res suivants a La pr sence d un seul couvillon de collecte APTIMA bleu dans un tube de transport d chantillons sur couvillon unisexe b La pr sence d un seul couvillon de collecte APTIMA rose dans un tube de transport d chantillons sur couvillon vaginal c Un volume final d urine situ entre les lignes de remplissage noires d un tube de transport d chantillons d urine d L absence d un couvillon dans l APTIMA tube de transport d chantillons APTIMA specimen transport tube pour les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt 4 Inspecter les tubes d chantillon avant de les charger dans le portoir a Siun tube de transport contient des bulles dans l espace situ entre le liquide et le bouchon centrifugez le tube pendant 5 minutes 420 FCR pour liminer les bulles b Sile tube de transport pr sente un volume inf rieur celui g n ralement obtenu lorsque les instructions de collecte ont t respect es centrifugez le tube pendant 5 minutes 420 FCR pour s assurer qu il ne reste pas de liqu
18. boucher et de reboucher des chantillons qui ont d j t test s les tubes de transport d chantillons doivent tre centrifug s pendant 5 minutes 420 FCR force centrifuge relative pour faire descendre la totalit du liquide au fond du tube vitez les projections et les contaminations crois es Remarque Le transport des chantillons doit s effectuer conform ment aux r glementations nationales et internationales applicables relatives au transport Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 9 502185FR R v E DTS Systems DTS Systems Les r actifs du test GC APTIMA sont num r s ci dessous pour les DTS Systems Les symboles d identification des r actifs figurent galement c t du nom du r actif DTS a m R actifs et mat riels fournis Kit de test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 100 tests 2 boites r f rence 301091 Boite r frig r e pour test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae Boite 1 sur 2 conserver entre 2 C et 8 C d s la r ception Symbole Composant Quantit A R actif d amplification GC APTIMA 1 flacon Acides nucl iques d shydrat s non infectieux dans une solution tamponn e contenant 5 de diluant E R actif enzymatique APTIMA 1 flacon Transcriptase inverse et polym rase RNA d shydrat es dans une solution tamponn e HEPES contenant lt 10 de diluant P R actif sonde GC APTIMA 1 flacon Sondes DNA chimiluminescentes non infectieuses d shydrat e
19. fond tous les r actifs par retournement en douceur avant de les charger sur le syst me Veillez viter la formation de mousse pendant le retournement des r actifs C Pr paration des r actifs pour les r actifs pr c demment reconstitu s 1 Les r actifs de sonde GC d amplification GC et enzymatiques pr c demment reconstitu s doivent parvenir temp rature ambiante entre 15 C et 30 C avant le d but du test 2 Sile r actif sonde GC reconstitu contient un pr cipit qui ne se remet pas en solution temp rature ambiante chauffer le flacon bouch une temp rature n exc dant pas 62 C pendant 1 2 minutes Apr s cela le r actif sonde GC peut tre utilis m me s il reste des pr cipit s r siduels M langez le r actif sonde GC par retournement en veillant ne pas former de mousse avant de le charger sur le syst me 3 M langez fond chaque r actif par retournement en douceur avant de le charger sur le syst me Veillez viter la formation de mousse pendant le retournement des r actifs 4 Ne pas remplir nouveau les flacons de r actif Le TIGRIS DTS System reconnait et rejette les flacons qui ont t remplis nouveau D Manipulation des chantillons 1 Laissez les contr les ainsi que les chantillons parvenir temp rature ambiante avant toute proc dure 2 Ne pas vortexer les chantillons 3 Confirmez visuellement que chaque tube chantillon r pond un des crit
20. gatif GC et du Contr le positif GC Contr le n gatif CT peuvent tre plac s n importe quelle position sur le portoir ou dans n importe quelle colonne du compartiment chantillons Le pipetage des chantillons des patients d butera lorsqu une des deux conditions suivantes aura t remplie a Une paire de contr les est en cours de traitement par le syst me b Des r sultats valid s ont t enregistr s sur le syst me pour les contr les 2 D s que le pipetage des tubes des contr les a t r alis et que ces derniers sont en cours de traitement pour un kit de r actifs d fini l analyse d chantillons des patients peut se poursuivre pendant 24 heures avec ce m me kit sauf si a Les contr les sont invalides b Le kit de r actifs associ aux contr les est enlev du syst me c La dur e de stabilit du kit de r actifs associ aux contr les a t d pass e 3 Chaque tube de contr le APTIMA est pr vu pour un seul test Les tentatives de pipetage r p t es plus d une fois partir d un m me tube peuvent entra ner des erreurs de traitement B Temp rature La temp rature ambiante est d finie comme se situant entre 15 C et 30 C C Poudre sur les gants Comme avec tout syst me de r actif l exc s de poudre sur certains gants peut entrainer la contamination des tubes ouverts Il est recommand d utiliser des gants sans poudre Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 36 502185FR R
21. re unit TTU Si ces contr les sont plac s dans la mauvaise position la s rie chouera Tout contr le suppl mentaire doit tre entr en tant qu chantillon de patient et l op rateur veillera ce qu il soit acceptable Le contr le positif pour CT sert de contr le n gatif au test GC APTIMA B Pipetage des contr les et chantillons Le volume de contr le ou d chantillon ajout au tube r actionnel doit tre de 400 uL 100 uL Il est recommand d inspecter visuellement le volume pipet dans le tube r actionnel pour veiller ce que le volume transf r soit ad quat Le volume de contr le ou d chantillon doit tre ad quat pour obtenir des r sultats pr cis Si le volume pipet n est pas suffisant pipetez nouveau le wTCR GC ainsi que le contr le ou l chantillon dans un nouveau tube r actionnel C R actifs La solution de reconstitution de sonde peut se pr cipiter pendant la conservation Si tel est le cas chauffez la solution de reconstitution de sonde 62 C pendant 1 2 minutes Apr s cette tape la solution de reconstitution de sonde peut tre utilis e m me s il reste des pr cipit s de r sidus Une fois la remise en suspension obtenue m langez le flacon d licatement par retournement en veillant ne pas former de mousse D Temp rature 1 Les tapes de capture de cible d amplification d hybridation et de s lection d pendent de la temp rature Il est donc imp ratif que les
22. v E PANTHER System D Protocole de contr le de la contamination en laboratoire pour le PANTHER System Il existe plusieurs facteurs pr cis pouvant contribuer la contamination notamment le volume de tests la direction du sens du travail la pr valence de maladies et diverses activit s de laboratoire Ces facteurs doivent tre pris en compte lors de l tablissement de la fr quence du contr le des contaminations Les intervalles de contr le de la contamination doivent tre d finis en fonction des pratiques et proc dures propres chaque laboratoire Pour surveiller la contamination du laboratoire il est possible d effectuer la proc dure suivante au moyen du kit de collecte d chantillons couvillon unisexe APTIMA pour chantillons endocervicaux et ur traux m les sur couvillon 1 Marquez les tubes de transport des couvillons avec les num ros correspondants aux zones tester 2 Retirez l couvillon de collecte d chantillon couvillon tige bleue avec imprim vert de son emballage humidifiez l couvillon dans le milieu du tube de transport de l couvillon et couvillonnez la zone d sign e d un geste circulaire 3 Ins rez imm diatement l couvillon dans le tube de transport 4 Cassez d licatement la tige de l couvillon sur la ligne de score en vitant toute projection du contenu 5 Rebouchez herm tiquement le tube de transport de l couvillon 6 R p tez les tapes 2 5 pour to
23. 1 3 s parateurs pour bain marie 104627 OU 2 bains chaleur s che vortexeurs SB100 SB100 Dry heat bath vortexer 105524 Des bains SB100 suppl mentaires peuvent tre n cessaires si le volume de tests augmente APTIMA Auto Detect Kit 301048 2 pipeteurs r p tition eppendorf Repeater Plus pipettors 105725 2 pipeteurs 1000 uL RAININ PR1000 901715 Pipeteur eppendorf 20 200 uL 105726 Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 11 502185FR R v E DTS Systems R f rence Embouts pour pipeteur r p tition 2 5 mL 21 381 329 Embouts pour pipeteur r p tition 5 0 mL 21 381 330 Embouts pour pipeteur r p tition 25 0 mL 21 381 115 Embouts style P1000 105049 embout de diam tre sp cial disponible uniquement chez Gen Probe Embouts de pipette de 20 uL 200 uL 705512 Fisher Unit s de dix tubes Ten Tube Units TTU TU0022 Cassettes de dix embouts Ten Tip Cassettes TTC 104578 Kit de collecte d chantillons couvillon unisexe APTIMA pour 301041 chantillons endocervicaux et ur traux m les sur couvillon Kit de collecte d chantillons d urine APTIMA pour chantillons 301040 d urine masculins et f minins Tubes de transport d chantillons d urine APTIMA pour chantillons 105575 d urine masculins et f minins Kit de collecte d chantillons couvillon vaginal APTIMA 301162 Kit de transfert d chantillons APTIMA 301154C Solution talon SysCheck 301078 Javel solution d hypochlorite de so
24. 100 97 4 100 M diane 2500 30 100 100 Elev e 250 000 30 100 100 Non test sur les deux syst mes en raison du volume insuffisant de l chantillon Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 69 502185FR R v E Performance analytique du TIGRIS DTS System Tableau 14 tude clinique de la concordance des panels enrichis avec du rRNA GC suite Concentration de concordance Echantillon Membre du panel fg de rRNA test R plicats concordance concordance globale entre TIGRIS et TIGRIS DTS DTS IC 95 Sans cible 0 12 100 100 Tr s faible 25 30 13 3 4 30 100 tude initiale Faible 250 30 80 24 30 100 75 8 67 5 82 8 M diane 2500 30 100 100 Elev e 250 000 30 100 100 Sans cible 0 18 100 100 Tr s faible 25 30 96 7 29 30 100 d Suivi 1 Faible 250 30 100 100 99 3 96 0 100 M diane 2500 30 100 100 Elev e 250 000 30 100 100 Sans cible 0 18 100 100 Tr s faible 25 30 90 27 30 100 Suivi 2 Faible 250 30 100 100 97 8 93 8 99 5 M diane 2500 30 100 100 Elev e 250 000 30 100 100 Sans cible 0 12 100 100 Tr s faible 25 30 100 100 a Faible 250 30 100 100 100 97 2 100 M diane 2500 30 100 100 Elev e 250 000 30 100 100 Non test sur les deux syst mes en raison du volume insuffisant de l chantillon tude de l quivalence de la sp cificit analytique Pour un test d amplification de l acide nucl ique la sp cificit analytiqu
25. 25 fg test 250 fg test et 2500 fg test conc rRNA quivalentes de 12 5 IFU mL 125 IFU mL et 1250 IFU mL Les quivalents rRNA taient calcul s d apr s la taille du g nome et le rapport DNA RNA estim par cellule pour chaque organisme Ces panels ont t analys s sur trois appareils PANTHER en r plicats de 96 et en utilisant deux lots de r actifs La concordance positive avec les r sultats attendus a t calcul e La concordance avec les r sultats attendus tait de 100 IC 95 96 96 2 100 96 pour tous les panels d urine de 100 96 IC 95 96 96 2 100 96 pour tous les panels de frottis en milieu liquide PreservCyt et de 100 IC 95 96 96 1 100 96 pour tous les panels STM Le seuil de sensibilit analytique pour ce test est de 125 CFU mL Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 72 502185FR R v E Performance analytique du PANTHER System tude de reproductibilit La pr cision du test GC APTIMA a t valu e sur trois syst mes PANTHER et avec deux lots de kits GC APTIMA pendant une p riode de 24 jours Les panels ont t constitu s par enrichissement du STM avec du rRNA GC aux concentrations pr sent es dans le tableau 17 Les op rateurs ont effectu deux s ries d analyses par jour chaque chantillon de panels tant pr sent en duplicat dans les s ries La concordance avec les r sultats attendus a t calcul et la pr cision du test a t estim selon les directives NCCLS
26. 5a Sensibilit et sp cificit du test GC APTIMA compar es l tat d infection des patients par tat des sympt mes et dans l ensemble pour les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt tat des R sultats GC APTIMAde l Gy J Sensibilit Sp cificit sympt mes la solution PreservCyt IC 95 IC 95 Positif 7 0 0 2 EN 100 7 7 99 4 350 352 Symptomatique N gatif 0 0 0 350 59 0 100 98 0 99 9 Total 7 0 0 352 Positif 5 0 1 1 E 83 3 5 6 99 8 1280 1282 Asymptomatique N gatif 1 0 5 1275 85 9 99 6 99 4 100 Total 6 0 6 1276 Positif 12 0 1 3 92 3 12 13 99 8 1630 1634 Tous N gatif 1 0 5 1625 64 0 99 8 99 4 99 9 Total 13 0 6 1628 oS lILORV LA CLLL IAKI L OVE EQV oA AAALIDULE ELL CEGi b EEZGCCUbBLALILLILALAKOLIILLLIILLIIIIIIOYILLILLLlOKORALAOOOOT TUOGXY SGCCZG kLOLELILILILOIIANGNYLL Z GL o kMOOVLOL L6UVenn LU KLELC ALOU GIGS a PeAe amp l R sultat positif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test APTIMA COMBO 2 R sultat positif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test GC APTIMA R sultat positif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test APTIMA COMBO 2 R sultat n gatif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test GC APTIMA R sultat n gatif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test APTIMA COM
27. 7 992 98 6 99 6 C TP vrai positif FP faux positif TN vrai n gatif FN faux n gatif R sultats pour GC obtenus avec le test APTIMA COMBO 2 nbre de r sultats positifs nbre d chantillons test s a 2 10 b 1 4 c 1 5 d 2 9 e 5 8 f 2 5 g 7 13 h 1 2 i 1 1 j 2 3 k 3 4 1 8 11 m 6 7 n 3 4 o 9 11 Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 48 502185FR R v E Performance clinique du test avec les DTS Systems tude clinique des chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt Une tude clinique prospective multicentrique a t effectu e pour valuer l utilisation du milieu de transport PreservCyt un composant du ThinPrep 2000 System comme milieu alternatif pour les chantillons gyn cologiques dans la d tection de N gonorrhoeae par le test GC APTIMA Mille six cent quarante sept 1647 femmes symptomatiques et asymptomatiques se rendant chez des gyn cologues obst triciens des dispensaires et des cliniques pour femmes et pour MST ont t valu es lors de l tude clinique Sur ces sujets 1288 taient des sujets asymptomatiques et 359 des sujets symptomatiques Tableau 7e Les sujets ont t enr l s dans des sites o la pr valence de GC s chelonnait de 0 0 5 0 Tableau 6a Deux chantillons ont t collect s pour chaque sujet ligible un chantillon de frottis en milieu liquide PreservCyt et un chantillon endocervical sur couvillon Les chantillons de frotti
28. 74 1 100 0 5 97 6 99 3 88 1 99 9 10 97 6 99 3 94 0 99 7 15 97 6 99 3 96 1 99 6 20 97 6 99 3 97 2 99 4 25 97 6 99 3 97 9 99 2 30 97 6 99 3 98 4 99 0 Distribution des RLU dans le test GC APTIMA La figure 4 pr sente la distribution des RLU pour le test GC APTIMA pour les types d chantillon suivants analys s lors de l tude clinique des chantillons endocervicaux vaginaux et ur traux m les collect s par un clinicien l aide d un couvillon et des chantillons d urine masculins et f minins collect s par la patients provenant de patients symptomatiques et des chantillons endocervicaux et vaginaux collect s par un clinicien l aide d un couvillon des chantillons vaginaux collect s par les patientes et des chantillons d urine masculins et f minins provenant de patients asymptomatiques Le tableau 3 r sume la distribution des RLU pour la totalit des r sultats positifs et la totalit des r sultats n gatifs de m me que les r sultats faussement positifs et faussement n gatifs concernant l tat d infection des patients pour ces types d chantillon Parmi certains types d chantillons on note une tendance vers une proportion croissante de r sultats vraiment positifs lorsque les valeurs RLU augmentent Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 45 502185FR R v E Valeurs attendues pour les DTS Systems 7000 lu 6122 6000 J 1 H 5000 E N gatif RLU faiblement Positif
29. DTS System ou le PANTHER System seront signal es comme tant non valides i Conform ment aux directives des CDC La r alisation de tests de routine suppl mentaires doit tre envisag e chez les personnes dont les tests de d pistage de CT ou GC se sont r v l s positifs lorsque les informations sur le facteur de risque ou les sondages indiquent que la pr valence est faible donnant lieu une PPV plus basse par ex lt 90 96 Consultez les directives des CDC pour de plus amples d tails sur les tests compl mentaires et la prise en charge des patients apr s un test de d pistage positif 1 A Consultez le tableau 3 pour les r sultats de la distribution des RLU La magnitude des RLU n est pas indicative de la quantit d organismes dans l chantillon Dans la limite inf rieure positive les donn es sugg rent d interpr ter ces r sultats positifs avec pr caution sachant qu il est plus vraisemblable d obtenir un r sultat faussement positif que vraiment positif B R sultats du contr le de qualit et acceptabilit Le contr le n gatif APTIMA pour GC portant l tiquette CONTROL CT PCT CONTROL GC NGC et le contr le positif APTIMA pour GC portant l tiquette CONTROL GC PGC CONTROL CT NCT servent de contr le pour les tapes de capture de cible d amplification et de d tection du test Selon les recommandations ou exigences en vigueur dans votre pays ou aupr s des organismes d accr dita
30. E Equivoque positive i 9 4000 i i o 1 o i Q 8 3000 i s Z 1 I 2000 J I 1000 408 54 24 16 8 4 45 10 13 23 21 uud E S i lt _ p o N o S S S S S B X De S S S S S S S E E a E V E PF d o o o o L k 3 id S PS e M y a o N RLUs x1000 Figure 4 Fr quence de la distribution des RLU pour le test GC APTIMA Tableau 3 Distribution des RLU dans le test GC APTIMA RLU x 1000 Total de r sultats o 10 20 30 40 50 100 1000 2000 3000 4000 5000 euo 10 20 30 40 50 100 1000 2000 3000 4000 5000 6000 pagos dad 45 10 13 23 21 116 408 Total de r sultats faussement 35 6 2 4 0 3 0 positifs cvs 1 5 3 0 1 0 2 0 PVS 0 2 0 0 1 0 1 0 FS 2 12 1 0 0 0 0 0 MS 1 9 0 1 0 0 0 0 FU 0 2 0 0 1 0 0 0 MU 0 5 2 1 1 0 0 0 n gatifs 6122 54 24 16 8 Total de r sultats faussement 7 2 1 2 1 n gatifs CVS 2 0 0 0 0 PVS 0 0 0 0 0 FS 0 0 0 1 1 MS 0 1 0 0 0 FU 3 1 1 1 0 MU 2 0 0 0 0 EEE EE EEE UN CVS couvillon vaginal collect par un clinicien PVS couvillon vaginal collect par la patiente patientes asymptomatiques uniquement FS couvillon endocervical f minin MS couvillon ur tral masculin patients symptomatiques uniquement FU urine f min
31. EP5 A2 14 Le nombre total de r plicats par panel tait de 96 Le tableau 17 donne les donn es de pr cision concernant des mesures RLU pour ce qui est des valeurs moyennes de l cart type SD du coefficient de variation CV et du pourcentage de concordance avec les r sultats attendus pour les calculs de variabilit entre instruments entre lots entre s ries et au sein d une m me s rie Tableau 17 Pr cision du PANTHER System pour le test GC APTIMA GC RLU s SETS Entre lots P upe serea Intra s rie Total moy DA instruments l autre Matrice CFU N mL enne Concord gp CV SD CV SD CV SD CV SD cv x 1000 x1000 x1000 x1000 x1000 x1000 0 96 3 100 0 0 0 0 0 0 201 728 2 72 5 m 12 5 96 3951 100 215 14 54 0 0 0 0 56824 144 6076 154 125 95 5839 100 370 7 63 0 0 0 0 77258 132 8567 147 1250 96 6207 100 338 25 54 0 0 0 0 78764 127 857 2 13 8 0 95 3 100 0 9 21 6 0 81 255 077 242 243 763 28 878 m 12 5 96 3460 100 0 0 19584 57 11327 3 3 20753 6 307 89 rine 125 96 6047 100 158 67 2 6 17032 2 8 0 0 20624 34 31 5 1 1250 96 6737 100 218 35 32 238 49 3 5 6622 1 176 72 26 3744 5 6 0 95 6 100 19 33 6 0 0 0 54 95 596 1052 6 3 111 2 12 5 96 3358 100 2579 77 0 0 0 O 48545 145 5497 164 PreservCyt 125 96 5272 100 243 09 4 6 20189 3 8 0 0 75172 143 8154 155 1250 96 5945 100 35595 6 5106 09 0 O 75935 128 8402 14 1 Remarque La variabilit de certains facteurs peut tre nu
32. MU 7 urine masculine Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 53 502185FR R v E Performance clinique du test avec les DTS Systems Tableau 7b R sultats des chantillons d urine masculins collect s chez des sujets infect s ou non infect s par N gonorrhoeae selon l tat d infection des patients Pr test TS 2 s TESTOS APTIMA o oiei du patient MS MU MS MU MU Sympt Asympt Infect 164 8 172 Infect 1 0 1 Infect 3 1 4 Infect 1 0 1 Infect 2 0 2 Infect 1 1 2 Non infect 0 1 1 Non infect 2 13 15 Non infect 1 0 1 Non infect 1 0 1 Non infect 0 1 1 Non infect 1 1 2 Non infect 2 2 4 Non infect 3 1 4 Non infect 2 1 3 Non infect 0 3 3 Non infect 386 691 1077 Non infect 1 2 3 Non infect S O 1 4 5 Non infect 1 4 5 Non infect 1 1 2 Non infect 0 1 1 Non infect S O 0 1 1 Non infect 2 6 8 Non infect 0 2 2 Total 576 745 1321 SN Sympt symptomatique Asympt asymptomatique S O chantillon non obtenu ou non disponible pour un test Le symbole gal indique des r sultats quivoques ou ind termin s apr s r analyse MS couvillon ur thr
33. R sultat n gatif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test GC APTIMA Un r sultat discordant a t obtenu pour un chantillon un r sultat quivoque pour l chantillon endocervical sur couvillon avec le test APTIMA COMBO 2 et un r sultat positif avec le test GC APTIMA Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 502185FR R v E Performance clinique du test avec les DTS Systems Table 7a R sultats des couvillons ur traux m les collect s chez des sujets symptomatiques infect s ou non infect s par N gonorrhoeae selon l tat d infection des patients tat d infection Test pts 2 NAAT 2 Test GC APTIMA du patient MS MU MS MU MS Infect 164 Infect z 1 Infect 3 3 Infect E 1 Infect B FS 2 Infect s 1 Non infect t x pa 2 Non infect z a 1 Non infect E 5 1 Non infect B z 1 Non infect a 2 4 E 2 Non infect z z 3 Non infect S 2 Non infect E 386 Non infect z 1 Non infect D S O E 1 Non infect E d 1 Non infect z 2 x Non infect E z 2 Total 576 a I a M S S O chantillon non obtenu ou non disponible pour un test Le symbole gal indique des r sultats quivoques ou ind termin s apr s r analyse MS couvillon ur thral m le symptomatique
34. System Operator s Manual pour les caract ristiques techniques Gants jetables talon SysCheck pour talonnage 301078 Bouchons p n trables APTIMA 105668 Bouchons de rechange non p n trables 103036A Bouchons de rechange pour les kits de 100 tests Solutions de reconstitution des r actifs d amplification enzymatiques et de sonde CL0041 100 bouchons R actif TCR et r actif de s lection 501604 100 bouchons Bouchons de rechange pour les kits de 50 tests Solutions de reconstitution des r actifs d amplification enzymatiques et de sonde 501603 100 bouchons R actif TCR et r actif de s lection 501604 100 bouchons Mat riel optionnel R f rence Kit de contr les APTIMA 301110 Activateur de javel GEN PROBE 302101 pour le nettoyage courant des surfaces et des appareils Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 25 502185FR R v E TIGRIS DTS System Proc dure de test pour le TIGRIS DTS System Remarque Consultez le Manuel de l op rateur du TIGRIS DTS System TIGRIS DTS System Operator s Manual pour de plus amples informations sur la proc dure avec ce syst me A Pr paration de la zone de travail Nettoyez les surfaces de travail o les r actifs et les chantillons doivent tre pr par s Nettoyez les surfaces de travail avec une solution d hypochlorite de sodium dos e de 2 5 3 5 0 35 M 0 5 M Laissez la solution d hypochlorite de sodium au contact des surfaces pendant au moi
35. bains marie soient maintenus dans des plages de temp rature pr cises 2 La temp rature ambiante est d finie comme se situant entre 15 C et 30 C 3 Les tapes de d tection du test doivent tre effectu es entre 18 C et 28 C E Dur e Les r actions de capture de cible d amplification d hybridation et de s lection sont toutes fonction du temps coul Respectez les dur es indiqu es dans la Proc dure de test avec les DTS Systems F Agitation au vortex La qualit de l agitation au vortex est importante pour assurer la bonne performance du test GC APTIMA Si l agitation au vortex est effectu e de mani re ad quate la suspension tourne de mani re circulaire une vitesse capable de faire monter la solution dans la moiti sup rieure du tube Cette manipulation agitation au vortex est maintenue pendant une dur e pr cise Pour vortexer des r actions r glez la vitesse du vortexeur m langeur tourbillon multi tubes sur le r glage le plus bas fixez solidement le portoir en place et mettez en marche Augmentez lentement la vitesse jusqu ce que le liquide atteigne la moiti sup rieure du tube Vortexez pendant 10 secondes la dur e recommand e ou jusqu l obtention d une teinte uniforme Ensuite tournez la vitesse sur le r glage le plus bas avant d teindre le vortexeur m langeur tourbillon multi tubes et de retirer le portoir Les m langes r actionnels ne doivent jamais toucher les cartes d
36. contr les utilisez la formule suivante pour calculer les volumes de TCR GC et TCHR B Volume du TCR mL nombre de r actions 5 r actions suppl mentaires x 0 1 mL Volume du TCR B mL Volume du TCR mL 100 C Capture de cible Le pipeteur r p tition utilis pour la capture de cible et l amplification doit tre r serv ces tapes uniquement Consultez Avertissements et pr cautions pour de plus amples informations Pr paration du portoir 1 Laissez les contr les ainsi que les chantillons parvenir temp rature ambiante avant toute proc dure 2 Ne pas vortexer les chantillons Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 14 502185FR R v E DTS Systems 3 Confirmez visuellement que chaque tube chantillon r pond un des crit res suivants a La pr sence d un seul couvillon de collecte APTIMA bleu dans un tube de transport d chantillons sur couvillon unisexe b La pr sence d un seul couvillon de collecte APTIMA rose dans un tube de transport d chantillons sur couvillon vaginal c Un volume final d urine situ entre les lignes de remplissage noires d un tube de transport d chantillons d urine d L absence d un couvillon dans l APTIMA tube de transport d chantillons APTIMA specimen transport tube pour les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt 4 V rifiez les tubes de transport avant de les perforer a Siun tube de transport contient de
37. d chantillons couvillon unisexe APTIMA pour chantillons endocervicaux et ur traux m les sur couvillon 1 Marquez les tubes de transport des couvillons avec les num ros correspondants aux zones tester 2 Retirez l couvillon de collecte d chantillon couvillon tige bleue avec imprim vert de son emballage humidifiez l couvillon dans le milieu du tube de transport de l couvillon et couvillonnez la zone d sign e d un geste circulaire 3 Introduisez imm diatement l couvillon dans un tube de transport 4 Cassez d licatement la tige de l couvillon sur la ligne de score en vitant toute projection du contenu 5 Rebouchez herm tiquement le tube de transport de l couvillon R p tez les tapes 2 5 pour toutes les zones couvillonner 7 Analysez l couvillon l aide du test GC APTIMA selon la Proc dure de test avec les DTS Systems Si les r sultats sont positifs ou quivoques pour GC consultez nterpr tation du test QC R sultats patients il est possible que la surface soit contamin e et elle doit alors tre d contamin e la javel selon les recommandations indiqu es la section Pr paration du mat riel sous Proc dure de test avec les DTS Systems D Remarque Si l on soup onne le bain marie d tre contamin il est possible de le tester en suivant la proc dure de test d chantillons d urine et en ajoutant 2 0 mL d eau dans un tube de transport d chantillon
38. d chantillons d urine APTIMA entre 2 C et 30 C et les conserver entre 2 C et 30 C jusqu la r alisation du test Les chantillons d urine trait s doivent tre test s avec le test GC APTIMA dans les 30 jours qui suivent leur collecte Si une dur e de conservation sup rieure est n cessaire congeler entre 20 C et 70 C pendant 12 mois maximum apr s la collecte voir Etudes de la stabilit des chantillons Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 8 502185FR R v E Informations g n rales 3 chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt a Les chantillons de frottis en solution PreservCyt destin s aux tests GC doivent tre trait s en ce qui concerne la cytologie et ou transf r s dans un tube de transfert d chantillon APTIMA dans les 30 jours qui suivent leur collecte lorsqu ils sont conserv s entre 2 C et 30 C reportez vous la section tudes de la stabilit des chantillons b Sila proc dure de retrait d aliquot ThinPrep est utilis e reportez vous L annexe du Manuel de l op rateur du processeur ThinPrep 2000 ou ThinPrep 3000 pour des instructions relatives au retrait d aliquots Transf rez 1 mL de l aliquot retir dans un tube de transfert d chantillon APTIMA conform ment aux instructions de la notice du kit de transfert d chantillons APTIMA c Sil chantillon est test apr s analyse sur le processeur ThinPrep 2000 traitez l chantillon de frottis en solution Pre
39. d amplification GC APTIMA 1 flacon 2 flacons Acides nucl iques d shydrat s non infectieux dans une solution tamponn e contenant lt 5 de diluant E R actif enzymatique APTIMA 1 flacon 2 flacons Transcriptase inverse et polym rase HNA d shydrat es dans une solution tamponn e HEPES contenant 10 de diluant P R actif sonde GC APTIMA 1 flacon 2 flacons Sondes DNA chimiluminescentes non infectieuses d shydrat es dans une solution tamponn e de succinate contenant 5 de d tergent TCR B R actif de capture de cible B APTIMA 1x0 30mL 2x0 143mL Acide nucl ique non infectieux dans une solution tamponn e contenant 5 de d tergent Collets de reconstitution 6 Boite non r frig r e pour test APTIMA Neisseria gonorrhoeae Boite 2 sur 2 conserver entre 15 C et 30 C d s la r ception Quantit Symbole Composant Kit de 100 Kit de 2 x 50 tests tests AR Solution de reconstitution de l amplification 1x 11 9 mL 2x6 4mL GC APTIMA Solution aqueuse contenant des conservateurs ER Solution de reconstitution enzymatique APTIMA 1x6 3mL 2x3 3mL Solution tamponn e HEPES contenant un surfactant et du glyc rol PR Solution de reconstitution de sonde GC APTIMA 1x15 2mL 2x7 7mL Solution tamponn e de succinate contenant lt 5 de d tergent Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 23 502185FR R v E TIGRIS DTS System Bo te non r frig r e pour test APTIMA Neisseria gonor
40. d urine et pools d chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt ont t pr par s avec 250 fg test de rRNA GC et 60 r plicats ont t test s sur le TIGRIS DTS System Le pourcentage de positivit IC 95 95 sur le TIGRIS DTS System tait de 100 96 95 1 100 pour les chantillons endocervicaux sur couvillon de 100 95 1 100 pour les chantillons vaginaux sur couvillon de 100 95 1 100 pour les chantillons d urine et de 100 95 1 100 pour les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt tude clinique des panels enrichis avec du rRNA GC L tude clinique des panels enrichis avec du rRNA GC a permis d valuer la concordance entre les deux syst mes en utilisant six panels cliniques de GC pr par s par Gen Probe et enrichis avec de 0 250 000 fg de rRNA test de GC Les panels cliniques de GC ont t cr s avec des chantillons endocervicaux sur couvillon vaginaux sur couvillon ur traux sur couvillon d urine masculins d urine f minins et de frottis en milieu liquide PreservCyt ayant donn des r sultats GC APTIMA n gatifs sur les DTS Systems lorsqu ils ont t test s chez Gen Probe Les chantillons n gatifs ont t group s par type d chantillon enrichis ou non enrichis avec du rRNA GC et aliquot s comme r plicats de chacun des membres du panel Les r plicats de chacun des 6 membres du panel avec des taux d enrichissement en rRNA diff rents ont t combin s
41. de contr le des maladies Centers for Disease Control des tats Unis ont recens sur le territoire am ricain un nombre de nouveaux cas d infections GC estim 309 341 100 8 pour 100 000 personnes 2 N gonorrhoeae est l agent responsable des maladies gonococciques Les Neisseria sont des diplocoques Gram n gatifs non motiles La majorit des infections gonococciques prennent la forme d infections du tractus g nital inf rieur d nu es de complications et peuvent tre asymptomatiques Toutefois si elles ne sont pas trait es chez la femme ces infections peuvent remonter vers l ut rus et provoquer des infections g nitales hautes PID Ces infections g nitales hautes PID se manifestent sous forme d endom trites de salpingites de p ritonites pelviennes et d abc s ovario tubaires Un faible pourcentage des personnes souffrant d infections gonococciques peut d velopper des infections gonococciques diss min es DGI 8 11 Le diagnostic conventionnel de l infection GC n cessite l isolation de l organisme dans un milieu s lectif ou l observation des diplocoques sur des frottis coloration de Gram 9 Les m thodes de culture peuvent offrir une bonne sensibilit clinique mais elles d pendent fortement de la qualit de la manipulation des chantillons De mauvaises conditions de conservation ou de transport des chantillons peuvent affecter la viabilit des organismes et donner des r sultats faussement n gat
42. des chantillons endocervicaux vaginaux et ur traux masculins sur couvillon des chantillons d urine masculins et f minins et des chantillons de frottis en solution PreservCyt n a pas valu e chez des adolescents de moins de 16 ans V Ne pas utiliser ce kit apr s la date de p remption W Ne pas changer m langer ou combiner les r actifs de kits portant diff rents num ros de lots Il est possible d utiliser les contr les et les solutions provenant de kits APTIMA portant diff rents num ros de lots Recommandations sp cifiques aux DTS Systems X Des pointes de pipette munies de filtres hydrophobes doivent tre utilis es Au moins deux pipeteurs r p tition doivent tre d di s une utilisation pour ce test un premier pour les tapes de capture de cible et d amplification et un deuxi me pour les tapes HPA Deux micro pipeteurs doivent tre d di s une utilisation pour ce test un premier pour le transfert des chantillons et un deuxi me pour la pr paration des r actifs Tous les pipeteurs doivent tre r guli rement nettoy s conform ment aux instructions indiqu es sous Proc dure de test avec les DTS Systems Hemarques concernant la proc dure Y Si vous utilisez des pipeteurs r p tition pour ajouter des r actifs ne touchez pas le tube avec l embout de la pipette afin d viter toute contamination d un tube l autre Z Un m lange ad quat est n cessaire pour obtenir des r sulta
43. ensemenc s ont t divis s entre deux op rateurs Les op rateurs ont vortex les flacons puis transf r 14 aliquots de 1 0 mL chacun par flacon dans 14 tubes de transfert APTIMA conform ment la notice du test du kit de transfert d chantillons APTIMA Les op rateurs ne connaissaient pas les titres des chantillons Chacun des chantillons frottis STM obtenu a t test une fois avec le test GC APTIMA Au total cinq s ries ont t effectu es sur une p riode de cinq jours et 140 r sultats ont t obtenus pour les taux de CFU de 0 1 0 5 et 50 136 r sultats taient valides et 4 invalides pour le panel de contr le n gatif Les r sultats invalides taient dus au mauvais placement d une TTU dans le Leader HC Les r sultats sont r sum s au Tableau 10 Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 58 502185FR R v E Performance clinique du test avec les DTS Systems Tableau 10 Donn es de pr cision du test GC APTIMA dans un m me laboratoire pour PreservCyt en utilisant un panel de pr cision de 4 membres contenant entre 0 et 500 cellules GC de CFU mL Moy Pour un m me D un jour D un op rateur rs Total Membre CFU mL CFU Con Con enne op rateur l autre l autre du panel PreservCyt s rie cordant cord RLU CV SD CV SD CV SD cv x 1000 x1000 x1000 x1000 x1000 9 A 1 0 1 140 39 27 9 313 7 758 3 241 7 132 5 422 0 0 0 0 769 8 245 4 B 5 0 5 140 113 80 7 1211
44. est indiqu par des r f rences catalogue sauf indication contraire R f rence TIGRIS DTS System 105118 Kit de solutions pour test APTIMA APTIMA Assay Fluids Kit 302382 solution de lavage APTIMA tampon APTIMA pour solution de d sactivation et r actif huileux APTIMA APTIMA Auto Detect Kit 301048 Kit de conservateur de liquide systeme APTIMA 302380 Embouts 1000 pL conducteurs d tecteurs de liquide 10612513 Tecan Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 24 502185FR R v E TIGRIS DTS System R f rence Kit pour s ries TIGRIS DTS System comprenant 301191 Unit s multi tube MTU 104772 02 Kit de sacs pour MTU embouts usag s 900907 D flecteurs de d chets pour MTU 900931 Couvre d chets pour MTU 105523 Kit de transfert d chantillons APTIMA 301154C utiliser avec des chantillons dans la solution PreservCyt Kit de collecte d chantillons couvillon vaginal APTIMA 301162 Kit de collecte d chantillons couvillon unisexe APTIMA pour 301041 chantillons endocervicaux et ur traux m les sur couvillon Kit de collecte d chantillons d urine APTIMA pour chantillons 301040 d urine masculins et f minins Tubes de transport d chantillons d urine APTIMA pour chantillons 105575 d urine masculins et f minins Javel solution d hypochlorite de sodium dos e de 5 7 96 0 7 M 1 0 M Eau pour le TIGRIS DTS System consultez le Manuel de l op rateur du TIGRIS DTS System TIGRIS DTS
45. et d urine masculins et f minins et de frottis en milieu liquide PreservCyt devraient tre similaires compte tenu des r sultats concordants Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 65 502185FR R v E Concordance des chantillons cliniques pour le TIGRIS DTS System Tableau 12 tude de la concordance des chantillons cliniques concordances positives n gatives et globales par tat de sympt mes de de de tat des chantillon Saxo DTS DTS DTS DTS concordance concordance concordance sympt mes 3 x TIGRIS TIGRIS TIGRIS TIGRIS positive n gative globale IC 95 IC 95 IC 95 3 100 100 100 FEMME de 39 5 o 33 93 5 100 89 4 100 95 9 100 Ecouvillon 0 100 100 Homme lt 93 i 9 xd 24 6 100 87 2 100 96 1 100 100 100 100 Sympt Femme lt lt 47 24 0 23 85 8 100 852 100 92 5 100 s 98 4 100 98 6 FON 9 9D l p 2 91 2 100 66 4 100 92 3 100 100 100 100 PreservCyt Femme 34 28 0 0 6 87 7 100 54 1 100 89 7 100 100 944 97 6 1 d Fe 23 9 1 r 85 2 100 72 7 99 9 87 1 99 9 Ecouvillon m 0 100 Homme ed o 0 33 59 0 100 89 4 100 91 2 100 100 93 8 96 0 Asympt Femme 29 g 1 13 66 4 100 69 8 99 8 79 6 99 9 ri 100 100 100 Homme 60 o 93 47 8 100 93 5 100 94 0 100 100 100 100 PreservCyt Femme 17 12 0 0 5 73 5 100 47 8 100 80 5 100 100 98 0 99 2 1 x
46. et test s avec des chantillons inconnus Les chantillons utilis s comme contr les de la pr paration doivent tre conserv s manipul s et test s conform ment la notice de test Les contr les de la pr paration des chantillons doivent tre interpr t s de la m me mani re que celle recommand e pour les chantillons de patients Voir R sultats des tests de patients sous Interpr tation du test QC R sultats patients Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 39 502185FR R v E Interpr tation du test QC R sultats patients D R sultats des tests de patients 1 Siles contr les utilis s lors d une s rie ne donnent pas les r sultats attendus les r sultats des tests des chantillons des patients faisant partie de la m me s rie ne doivent pas tre valid s 2 R sultats des chantillons sur couvillon d urine et de frottis en milieu liquide PreservCyt Voir Hemarques ci dessous a R sultats initiaux GC Pos Positif pour rRNA GC GC N g Pr sum n gatif pour le rRNA de GC GC Equiv L chantillon devra tre test nouveau Non valide L chantillon devra tre test nouveau b R sultats apr s r analyse GC Pos Positif pour le rRNA de GC GC N g Pr sum n gatif pour le rRNA de GC Ind termin un nouvel chantillon devra tre GC Equiv A collect Ind termin un nouvel chantillon devra tre Non valide collect Les
47. indique CONTROL GC PGC CONTROL CT NCT 2 Chaque tube de contr le APTIMA est pr vu pour un seul test Les tentatives de pipeter plus d une fois partir du tube peuvent entra ner des erreurs d insuffisance de volume B Temp rature La temp rature ambiante est d finie comme se situant entre 15 C et 30 C C Poudre sur les gants Comme avec tout syst me de r actif l exc s de poudre sur certains gants peut entrainer la contamination des tubes ouverts Il est recommand d utiliser des gants sans poudre D Protocole de contr le de la contamination en laboratoire pour le TIGRIS DTS System Il existe plusieurs facteurs pr cis pouvant contribuer la contamination notamment le volume de tests la direction du sens du travail la pr valence de maladies et diverses activit s de laboratoire Ces facteurs doivent tre pris en compte lors de l tablissement de la fr quence du contr le des contaminations Les intervalles de contr le de la contamination doivent tre d finis en fonction des pratiques et proc dures propres chaque laboratoire Pour surveiller la contamination du laboratoire il est possible d effectuer la proc dure suivante au moyen du kit de collecte d chantillons couvillon unisexe APTIMA pour chantillons endocervicaux et ur traux m les sur couvillon 1 Marquez les tubes de transport des couvillons avec les num ros correspondants aux zones tester 2 Retirez l couvillon de
48. le test essuyez les plans de travail et les pipeteurs avec une solution dhypochlorite de sodium dos e de 2 5 3 5 0 35 M 0 5 M Laissez la solution d hypochlorite de sodium au contact des surfaces pendant au moins 1 minute puis rincez l eau Ne pas laisser s cher la solution d hypochlorite de sodium Couvrez la surface de la paillasse sur laquelle le test sera effectu avec des protections de paillasse de laboratoire absorbantes avec envers plastifi 3 Placez un nombre suffisant de cassettes dix embouts dans le syst me de capture de cible Target Capture System TCS V rifiez que la bouteille de solution de lavage du TCS est remplie avec la solution de lavage APTIMA et que la rampe d aspiration est branch e sur la pompe vide Se r f rer au Manuel de l op rateur du syst me de capture de cible Target Capture System Operator s Manual B Reconstitution des r actifs Remarque La reconstitution des r actifs doit tre effectu e avant d entreprenare le transfert des chantillons 1 Afin de reconstituer le r actif d amplification GC le r actif enzymatique et le r actif sonde GC m langez la solution de reconstitution aux flacons de r actif lyophilis Si les solutions de reconstitution sont r frig r es laissez leur temp rature s quilibrer temp rature ambiante avant de les utiliser a Mettez la solution de reconstitution appropri e avec le r actif lyophilis Les tiquettes ont diff rent
49. ont t utilis s comme NAAT de r f rence pour d terminer l tat d infection de chaque sujet L analyse des chantillons a t effectu e soit sur le site d enr lement des sujets soit dans un site d analyse externe Tous les calculs de performance ont t bas s sur le nombre total d chantillons endocervicaux vaginaux et ur traux m les collect s par un clinicien l aide d un couvillon ainsi que les chantillons d urine masculins et f minins du test GC APTIMA compar s un algorithme de l tat d infection des patients pour chaque sexe Dans l algorithme la d signation d un sujet comme tant infect ou non infect par GC tait bas e sur les r sultats des chantillons sur couvillon ou d urine du test APTIMA COMBO 2 disponible dans le commerce ainsi que de l autre NAAT disponible dans le commerce Les sujets taient consid r s infect s par GC si deux des quatre chantillons sur couvillon et d urine taient positifs avec le test APTIMA COMBO 2 et l autre NAAT de r f rence un chantillon testant positif dans chaque NAAT Les sujets taient consid r s non infect s si moins de deux r sultats NAAT de r f rence taient positifs La culture n a pas t utilis e comme test de r f rence Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 47 502185FR R v E Performance clinique du test avec les DTS Systems Au total 7653 r sultats de test GC APTIMA ont t utilis s pour calculer la sensibilit et la s
50. r cipients d chantillons et ne pas passer au dessus d un r cipient ouvert en jetant le mat riel usag Changez de gants en cas de contact avec l chantillon Q Si le laboratoire recoit un tube de transport d chantillons sur couvillon sans couvillon avec deux couvillons un couvillon de nettoyage ou un couvillon non fourni par Gen Probe l chantillon doit tre rejet Avant de rejeter un tube de transport d chantillons sans couvillon v rifiez qu il ne s agit pas d un tube de transfert d chantillons APTIMA tant donn que ce type de tube ne comporte pas d couvillon R Concernant les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt effectuer leur collecte conform ment aux instructions du fabricant Les aliquots qui ont t retir s ult rieurement du flacon PreservCyt pour tre analys s au moyen du test GC APTIMA doivent tre trait s en utilisant uniquement le kit de transfert d chantillons APTIMA S Si le bouchon d un tube de transport APTIMA venait tre perfor le liquide pourrait s couler sous certaines conditions Suivez les instructions de la Proc dure de test appropri e afin d viter cette situation Recommandations concernant les tests T La performance des chantillons collect s l aide d un couvillon vaginal n a pas t valu e chez les femmes enceintes Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 5 502185FR R v E Informations g n rales U La performance
51. r sultats des chantillons valeur RLU faiblement positive sont inclus dans cette cat gorie Voir Interpr tation du test QC R sultats patients ci dessus Hemarques Le premier r sultat valide et non quivoque pour chaque analyte est celui qui doit tre valid l est conseill de consid rer attentivement les donn es de performance pour interpr ter les r sultats du test GC APTIMA pour les individus asymptomatiques ou tout individu venant d une population faible pr valence d infection Un r sultat n gatif n exclut pas la pr sence d une infection GC tant donn que la qualit des r sultats d pend de la collecte des chantillons de l absence d inhibiteurs et de l obtention d une quantit de rRNA suffisante pour tre d tect e Les r sultats des tests peuvent tre affect s par une collecte impropre des chantillons une mauvaise conservation des chantillons une erreur technique ou une confusion entre chantillons ou des concentrations de la cible inf rieures au seuil de d tection du test Le test d un chantillon endocervical est recommand pour les patientes cliniquement soupconn es d infection Chlamydia ou gonococcique Si un frottis et un couvillon endocervical sont collect s l chantillon de frottis en milieu liquide PreservCyt doit tre collect avant l chantillon endocervical sur couvillon Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 40 502185FR R v E Limites A L
52. res suivants a La pr sence d un seul couvillon de collecte APTIMA bleu dans un tube de transport d chantillons sur couvillon unisexe b La pr sence d un seul couvillon de collecte APTIMA rose dans un tube de transport d chantillons sur couvillon vaginal c Un volume final d urine situ entre les lignes de remplissage noires d un tube de transport d chantillons d urine d L absence d un couvillon dans l APTIMA tube de transport d chantillons APTIMA specimen transport tube pour les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt 4 Inspectez les tubes d chantillon avant de les charger dans le portoir a Siun tube d chantillon contient des bulles dans l espace situ entre le liquide et le bouchon centrifugez le tube pendant 5 minutes 420 FCR pour liminer les bulles b Sile tube d chantillon pr sente un volume inf rieur celui g n ralement obtenu lorsque les instructions de collecte ont t respect es centrifugez le tube pendant 5 minutes 420 FCR pour vous assurer qu il n y a pas de liquide dans le bouchon Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 28 502185FR R v E TIGRIS DTS System c Si le niveau de liquide dans un tube de transport d urine ne se situe pas entre les deux lignes indicatrices noires l chantillon doit tre rejet Ne pas perforer un tube trop rempli d Si un chantillon d urine contient des pr cipit s chauffez l chantillon 37 C jusqu 5 mi
53. 1 1031 3 852 169 8 14 0 150 4 12 4 1056 0 87 2 C 500 50 140 140 100 5636 8 220 7 3 9 135 7 2 4 0 0 0 0 259 1 4 6 D 0 0 136 136 100 1 2 0 5 S O 0 S O 0 3 S O 0 6 S O y a eu quatre r sultats invalides dus au mauvais placement d une TTU dans le Leader HC Remarque La variabilit de certains facteurs peut tre num riquement n gative ph nom ne pouvant survenir si la variabilit due ces facteurs est tr s minime Si tel est le cas la variabilit telle que mesur e avec SD et CV est r gl e sur z ro 12 S O sans objet pour les membres n gatifs du panel Op rateur S rie Les chantillons offrant des r sultats discordants ont t inclus dans l analyse de variabilit du signal Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 59 502185FR R v E Performance analytique des DTS Systems Performance analytique des DTS Systems Consultez la section Performance analytique du TIGRIS DTS System apr s le chapitre Concordance des chantillons cliniques pour le TIGRIS DTS System pour la performance analytique sp cifique au TIGRIS DTS System Consultez la section Performance analytique du PANTHER System pour la performance analytique sp cifique au PANTHER System Sensibilit analytique La sensibilit analytique N gonorrhoeae seuil de d tection a t d termin e en comparant directement les dilutions de 51 isolats cliniques diff rents en culture cellulaire et avec le test GC APTIMA La sensibilit analytiqu
54. 1 4 100 7 68 0 0 68 0 0 0 S O 100 947 100 S O 100 8 43 0 0 43 0 00 S O 100 918 100 S O 100 Tous 620 21 4 604 0 3 3 100 839 100 99 3 98 3 99 8 84 0 100 1 227 12 2 213 0 5 3 100 73 100 99 1 96 7 99 9 857 100 2 197 30 3 163 1 15 7 96 8 83 3 99 9 982 94 8 99 6 909 994 3 13 4 0 109 0 35 100 398 100 100 967 100 100 100 Collect eur 4 263 5 3 255 0 19 100 478 100 98 8 96 6 99 8 62 5 100 par un LER 5 199 2 0 197 0 10 100 158 100 100 98 100 100 100 elinicten 6 295 19 3 272 1 68 950 75 1 99 9 98 9 96 8 99 8 86 4 99 6 7 102 0 0 102 0 00 S O 100 964 100 S O 100 8 50 1 0 49 0 20 100 25 100 100 92 7 100 100 100 2 Tous 1446 73 11 1360 5 2 97 3 90 7 99 7 99 2 98 6 99 6 86 9 99 9 TP vrai positif FP faux positif TN vrai n gatif FN faux n gatif Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 51 502185FR R v E Performance clinique du test avec les DTS Systems Tableau 6a Sensibilit sp cificit et valeurs pr dictives du test GC APTIMA compar es l tat d infection des patients par site clinique et de mani re globale pour les chantillons de de frottis en milieu liquide PreservCyt R sultats GC APTIMA de la Pr v Sensibilit IC Sp cificit IC o 5 Site ten l l 95 95 PPV NPV PreservCyt Positif 5 0 0 0 E 100 5 5 100 95 95 1 N gatif 0 0 0 95 5 0 47 8 100 9
55. 6 2 100 100 100 Total 5 0 0 95 Positif 1 0 0 0 NTTT 100 1 1 100 123 123 2 N gatif 0 0 0 123 0 8 2 5 100 97 0 100 100 100 Total 1 0 0 123 Positif 4 0 0 0 EU 80 0 4 5 100 470 470 3 N gatif 0 0 470 1 1 28 4 99 5 99 2 100 100 99 8 Total 5 0 0 470 Positif 1 0 0 3 PUR 100 1 1 99 0 283 286 4 N gatif 0 0 3 280 0 3 2 5 100 97 0 99 8 25 0 100 Total 1 0 3 283 Positif 0 0 0 0 EURO 100 297 297 5 N gatif 0 0 0 297 0 0 S O 98 8 100 S O 100 Total 0 0 0 297 Positif 1 0 1 0 100 1 1 99 7 362 363 6 N gatif 0 0 2 360 0 3 2 5 100 98 5 100 50 0 100 Total 1 0 3 360 Positif 12 0 1 3 TETE 92 3 12 13 99 8 1630 1634 TOUS N gatif 1 0 5 1625 0 8 64 0 99 8 99 4 99 9 75 0 99 9 Total 13 0 6 1628 S O sans objet R sultat positif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test APTIMA COMBO 2 R sultat positif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test GC APTIMA R sultat positif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test APTIMA COMBO 2 R sultat n gatif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test GC APTIMA R sultat n gatif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test APTIMA COMBO 2 R sultat positif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test GC APTIMA R sultat n gatif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test APTIMA COMBO 2
56. 811 640 1451 Sympt symptomatique Asympt asymptomatique S O chantillon non obtenu ou non disponible pour un test Le symbole gal indique des r sultats quivoques ou ind termin s apr s r analyse FS couvillon endocervical f minin FU urine f minine Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 55 502185FR R v E Performance clinique du test avec les DTS Systems Tableau 7d R sultats des couvillons vaginaux chez des sujets infect s ou non infect s par N gonorrhoeae selon l tat d infection des patients NAAT 1 a ion Test APTIMA COMBO 2 NAAT 2 Test GC APTIMA tat des sympt mes zm du patient FS FU FS FU PVS CVS Sympt Asympt Infect 43 15 58 Infect 1 0 1 Infect 1 0 1 Infect S O 0 1 1 Infect 2 2 4 Infect S O 1 0 1 Infect 1 1 2 Infect 1 1 2 Infect 1 0 1 Infect 2 1 3 Infect 1 0 1 Infect 0 1 1 Infect 0 1 1 Infect 1 0 1 Non infect 5 1 6 Non infect 1 0 1 Non infect 1 0 1 Non infect 5 2 7 Non infect 0 1 1 Non infect 2 1 3 Non infect 2 1 3 Non infect 3 1 4 Non infect
57. 96 7 99 9 85 7 100 2 197 29 3 164 1 15 2 96 7 82 8 99 9 982 94 8 99 6 906 994 3 114 4 1 109 0 35 100 398 100 99 1 950 100 80 0 100 4 260 5 1 254 0 1 9 100 478 100 99 6 978 100 83 3 100 couvillon 5 19 2 1 196 0 1 0 100 158 100 99 5 972 100 66 100 6 294 19 5 269 1 68 95 0 75 1 99 9 982 958 994 792 99 6 7 10 0 0 102 0 090 S O 100 964 100 S O 100 8 48 0 47 O 21 100 25 100 100 92 5 100 100 100 Tous 1440 72 13 1353 2 54 97 3 90 6 99 7 99 0 98 4 99 5 847 99 9 Femme 1 227 11 2 213 1 5 3 917 61 5 99 8 99 1 96 7 99 9 84 66 99 5 2 198 30 0 167 1 15 7 968 83 3 99 9 100 978 100 100 994 3 113 4 0 109 0 35 100 39 100 100 96 7 100 100 100 4 265 5 0 260 0 19 100 478 100 100 986 100 100 100 Urine 5 19 2 0 197 0 1 0 100 158 100 100 98 100 100 100 6 296 16 1 275 4 68 800 56 3 94 3 99 6 98 0 100 94 1 986 7 402 0 0 10 0 00 S O 100 96 4 100 S O 100 8 49 1 0 48 0 20 100 25 100 100 926 100 100 100 Tous 1449 69 3 1371 6 52 920 83 4 97 0 99 8 994 100 95 8 99 6 1 70 5 1 64 0 7 1 100 478 100 98 917 100 83 3 100 2 46 7 1 38 0 152 100 590 100 974 86 5 99 9 87 5 100 3 45 2 0 43 0 44 100 158 100 100 918 100 100 100 Collggg couvillon 4 152 1 0 151 0 07 100 25 100 100 97 66 100 100 100 par la Mice 5 130 1 0 129 0 08 100 25 100 100 972 100 100 100 patiente tique 6 75 5 2 68 0 67 100 478 100 97 1 90 1 99 7 7
58. APTIMA COMBO 2 DTS LEADER PANTHER SB100 et TIGRIS sont des marques d pos es de Gen Probe Incorporated eppendorf stylis et REPEATER sont des marques de commerce d Eppendorf AG PRESERVCYT et THINPREP sont des marques commerciales de Hologic Inc KOVA TROL est une marque de commerce de Hycor Biomedical Inc RAININ est une marque de commerce de Rainin Instrument LLC TECAN et FREEDOM EVO sont des marques de commerce de Tecan Group AG Tout autre nom de marque pouvant apparaitre sur cette notice de test appartient son propri taire respectif 2003 2013 Gen Probe Incorporated 502185FR R v E 2013 04 Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 75 502185FR R v E
59. BO 2 R sultat positif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test GC APTIMA l R sultat n gatif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test APTIMA COMBO 2 R sultat n gatif d chantillon endocervical sur couvillon avec le test GC APTIMA Un r sultat discordant a t obtenu pour un chantillon un r sultat quivoque pour l chantillon endocervical sur couvillon avec le test APTIMA COMBO 2 et un r sultat positif avec le test GC APTIMA Tableau 6 Sensibilit sp cificit et valeurs pr dictives du test GC APTIMA compar es l tat d infection des patients par site clinique et de mani re globale pour les couvillons ur traux m les les chantillons d urine masculins les couvillons endocervicaux f minins les chantillons d urine f minins les couvillons vaginaux collect s par des patientes asymptomatiques et les couvillons vaginaux collect s par des cliniciens Pr v Sensibilit Sp cificit PPV NPV IC 95 IC 95 96 145 49 0 96 0 33 8 3100 927 100 100 96 2 100 100 100 177 66 8 102 1 37 9 98 5 920 100 292 7 86 2 96 8 89 2 99 0 chantillon Site N TP FP TN FN 1 2 3 SO SO SO SO SO SO S O S O S O S O 4 S O SO SO S O SO SO S O S O S O S O couvillon 5 49 7 1 41 O 14 3 100 59 0 100 97 6 87 4 99 9 87 5 100 6 150 37 1 112 0 24 7 100 90 5 100 99 1 95 2
60. Couvre d chets PANTHER Ou Kit pour s ries PANTHER Contient les MTU les sacs d chets les solutions et auto detect Embouts 1000 uL conducteurs d tecteurs de liquide Kit de transfert d chantillons APTIMA utiliser avec des chantillons dans la solution PreservCyt Kit de collecte d chantillons couvillon vaginal APTIMA Kit de collecte d chantillons couvillon unisexe APTIMA pour chantillons endocervicaux et ur traux m les sur couvillon Kit de collecte d chantillons d urine APTIMA pour chantillons d urine masculins et f minins Tubes de transport d chantillons d urine APTIMA pour chantillons d urine masculins et f minins Javel solution d hypochlorite de sodium dos e de 5 7 96 0 7 M 1 0 M Gants jetables R f rence 303095 303014 1000 tests 303013 1000 tests 104772 02 902731 902714 303096 5000 tests 10612513 Tecan 301154C 301162 301041 301040 105575 Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 32 502185FR R v E PANTHER System Solution talon SysCheck 301078 Bouchons p n trables APTIMA 105668 Bouchons de rechange non p n trables 103036A Bouchons de rechange pour les kits de 100 tests Solutions de reconstitution des r actifs d amplification enzymatiques et de sonde CL0041 100 bouchons R actif TCR et r actif de s lection 501604 100 bouchons Mat riel optionnel R f rence Kit de contr les APTIMA 301110 Activateur de
61. IS DTS System Tableau 13 Donn es de pr cision pour le TIGRIS DTS System uds D un op rateur D une liste de Dans une m me Conc fg de Moyenne Deun stes ias l autre Dun tora lautre travail Pautre liste de travail n RLU rRNA par Concord 1 x 1000 SD 0 SD 0 SD 0 SD 0 SD 0 test x 1000 cV x 1000 CV x 1000 CV x 1000 CV x 1000 cV 0 859 4 6 100 1 7 S O 0 0 S O 0 3 S O 0 7 S O 2 7 S O 250 429 4148 100 236 5 7 170 4 1 212 5 1 94 9 2 3 222 5 3 2500 429 5361 99 8 275 5 1 145 2 7 273 5 1 25 1 0 5 482 9 0 25000 430 5871 100 325 5 5 163 2 8 303 5 2 106 1 8 176 3 0 250000 431 6037 100 317 5 2 167 2 8 303 5 0 126 2 1 186 3 1 ER a gt 2 O e cU m RS I Concord concordance Conc concentration CV coefficient de variation S O ne s applique pas aux chantillons n gatifs RLU unit relative de lumi re SD cart type Des valeurs SD et CV sont tablies 0 et 0 0 respectivement selon le mod le des effets al atoires si la variabilit due cette source par rapport aux erreurs al atoires et ou la variation d autres sources est num riquement n gative y a eu 4 chantillons exclus de cette analyse pour cause de r sultats finaux invalides De plus il manquait 1 r plicat de chaque membre de panel n gatif pour GC dans une liste de travail y a eu 3 chantillons exclus de cette analyse pour cause de r sultats fina
62. L de solution d hypochorite de sodium dos e de 0 5 0 7 0 07 M 0 1 M ou si vous le pr f rez dos e de 2 5 3 5 0 35 M 0 5 M dans la cuve d amorcage Aspirez la totalit de la solution au moyen de la rampe d aspiration c Versez au moins 100 mL d eau d sionis e dans la cuve d amorgage Aspirez la totalit de l eau au moyen de la rampe d aspiration d Ejectez les embouts dans leur TTC d origine e Laissez fonctionner la pompe d aspiration jusqu ce que la tubulure de la rampe soit s che pour viter tout refoulement f D contaminez les surfaces de la rampe d aspiration comme expliqu sous Unit TCS 3 R cipient d chets TCS Retirez le flacon d chets du syst me de capture de cible Target Capture System une fois par semaine ou lorsqu il est rempli 25 96 a teignez la pompe vide et laissez sa pression s quilibrer b D branchez les raccords d connexion rapide entre le flacon d chets et le flacon de trop plein ainsi que le flacon d chets et la rampe d aspiration Retirez le flacon d chets du boitier de pi ge vide Retirez le bouchon et ajoutez avec pr caution 400 mL de solution d hypochlorite de sodium dos e de 5 7 0 7 M 1 0 M dans le flacon ou 1 L si vous utilisez un flacon d chets de 10 L Remarque Cette manipulation peut tre effectu e sous une hotte pour viter de lib rer des manations dans le laboratoire e Rebouchez l
63. Lactobacillus lactis Rhodospirillum rubrum Candida glabrata Legionella pneumophila 2 Saccharomyces cerevisiae Candida parapsilosis Leuconostoc paramensenteroides Salmonella minnesota Candida tropicalis Listeria monocytogenes Salmonella typhimurium Chlamydia pneumoniae Micrococcus luteus Serratia marcescens Chlamydia psittaci 2 Moraxella lacunata Staphylococcus saprophyticus Chromobacterium violaceum Moraxella osloensis Staphylococcus aureus Citrobacter freundii Morganella morganii Staphylococcus epidermidis Clostridium perfringens Mycobacterium smegmatis Streptococcus agalactiae Corynebacterium genitalium Mycoplasma genitalium Streptococcus bovis Corynebacterium xerosis Mycoplasma hominis Streptococcus mitis Cryptococcus neoformans meningitidis S rogroupe A Streptococcus mutans Cytom galovirus meningitidis S rogroupe B Streptococcus pneumoniae Deinococcus radiodurans meningitidis S rogroupe C 4 Streptococcus pyogenes Derxia gummosa meningitidis S rogroupe D Streptococcus salivarius Eikenella corrodens meningitidis S rogroupe Y Streptococcus sanguis Enterobacter aerogenes N N N N N N meningitidis S rogroupe W135 Streptomyces griseinus Enterobacter cloacae Neisseria cinerea 4 Trichomonas vaginalis Entercoccus avium Neisseria dentrificans
64. Lelogiciel de test APTIMA value automatiquement les contr les selon les crit res ci dessus et indique que la s rie a PASS R ussi ou a FAIL chec si les crit res de contr le de la s rie ne sont pas r unis 2 Sile Run Status tat de la s rie indique FAIL chec tous les r sultats des tests d une m me s rie sont invalides et ne doivent pas tre pris en compte 3 Chaque laboratoire devra mettre en place des proc dures de contr le appropri es pour r pondre aux exigences des r glementations CLIA paragraphe 493 1256 Remarque Voir D pannage ou appeler le Service technique de Gen Probe pour toute assistance avec des contr les hors normes sur les DTS Systems 4 L un des param tres du TIGRIS DTS System permet chaque site de pr ciser une fr quence de s rie encadr e de contr les o des jeux de contr le suppl mentaires peuvent tre plac s des intervalles d finis dans la liste de travail Si ce param tre est pr cis le TIGRIS DTS System exigera de placer un jeu de contr les apr s le nombre d fini d chantillons de la s rie encadr e de contr les Le TIGRIS DTS System value automatiquement chacun des contr les de la liste de travail en fonction des crit res ci dessus et invalide tous les chantillons dans la ou les s ries encadr es de contr les affect s si les crit res de contr le ne sont pas r unis Consultez le Manuel de l op rateur du TIGRIS DTS System TIGRIS DTS System Operat
65. Mat riel requis mais disponible s par ment 11 Mat riel requis mais disponible s par ment 24 Mat riel optionnel ssssseseeeenenes 12 Mat riel optionnel ssssssseenemene 25 Proc dure de test avec les DTS Systems 13 Proc dure de test pour le TIGRIS DTS System 26 Remarques concernant la proc dure 19 Remarques concernant la proc dure 30 EEE PANTHER PANTHER System eene 31 R actifs et mat riels fournis 31 Mat riel requis mais disponible s par ment 32 Mat riel optionnel essssssseseeseeeseeeee 33 Proc dure de test pour le PANTHER System 33 Remarques concernant la proc dure 36 502185FR R v E Informations g n rales Usage pr vu Le test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae est un test par sonde d acide nucl ique pour l amplification de cible qui utilise la capture de cible pour la d tection qualitative in vitro du RNA ribosomique rRNA de Neisseria gonorrhoeae GC afin de faciliter le diagnostic des infections gonococciques de l appareil g nito urinaire au moyen du TIGRIS DTS System du PANTHER System ou de l instrumentation semi automatique des DTS Systems comme indiqu Ce test peut tre employ pour analyser les ch
66. NA 16S de GC via des formes interm diaires de DNA On utilise un seul jeu d amorces pour chaque mol cule cible La d tection des s quences du produit de l amplification du rRNA amplicon s effectue par l hybridation de l acide nucl ique Une sonde DNA chimiluminescente monocat naire qui est compl mentaire une r gion de l amplicon cible est marqu e avec une mol cule d ester d acridinium La sonde DNA marqu e se combine l amplicon pour former des hybrides RNA DNA stables Le r actif de Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 3 502185FR R v E Informations g n rales s lection diff rencie la sonde hybrid e de celle qui ne l est pas liminant ainsi la g n ration de signal par la sonde non hybrid e Lors de l tape de d tection la lumi re mise par les hybrides RNA DNA marqu s est mesur e en signaux de photons dans le luminom tre et exprim e en unit s relatives de lumi re RLU Avertissements et pr cautions A Pour diagnostic in vitro B Pour tout avertissement pr caution ou proc dure compl mentaire concernant le contr le de la contamination avec le TIGRIS DTS System consultez le Manuel de l op rateur du TIGRIS DTS System TIGRIS DTS System Operator s Manual C Pour tout avertissement pr caution ou proc dure compl mentaire concernant le contr le de la contamination avec le PANTHER System consulter le Manuel de l op rateur du PANTHER System PANTHER System Operator s Manual Recommanda
67. a fiche de code barres du lot de r f rence pour vous assurer que les r actifs appropri s du kit se correspondent Ouvrez le flacon de TCR GC et posez le bouchon sur une surface de travail propre et couverte Ouvrez le flacon de TCR B et posez le bouchon sur une surface de travail propre et couverte Retirez la pipette de transfert de son emballage Transf rez environ 2 mL de TCR GC dans le flacon de TCR B Ne pas jeter la pipette de transfert ce stade Rebouchez le flacon de TCR B et m langez par retournements Transf rez la solution de wTCR GC de la bouteille TCR B dans la bouteille TCR GC R p tez l tape h plusieurs fois jusqu ce que tout le m lange du flacon de TCR B soit transf r de nouveau dans le flacon de TCR GC Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 27 502185FR R v E TIGRIS DTS System j Rebouchezle flacon de TCR GC et agitez d licatement la solution pour m langer le contenu Evitez de cr er de la mousse pendant cette tape k Notez les initiales de l op rateur ainsi que la date du jour sur l tiquette Notez le num ro de lot du TCR B l Jetez le flacon de TCR B et son bouchon Jetez la pipette de transfert 4 Pr paration du r actif de s lection a V rifiez que le num ro de lot sur le flacon de r actif correspond celui sur la fiche de code barres du lot de r f rence b Notez les initiales de l op rateur ainsi que la date du jour sur l tiquette Remarque M langer
68. al m le MU urine masculine Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 54 502185FR R v E Performance clinique du test avec les DTS Systems Tableau 7c R sultats des couvillons endocervicaux f minins et des chantillons d urine f minins chez des sujets infect s ou non infect s par N gonorrhoeae selon l tat d infection des patients durai Ta AETMA CS 2 NART 2 JOSEP SS APTA ruis d du patient FS FU FS FU FS FU Sympt Asympt Infect 43 16 59 Infect 2 0 2 Infect 2 1 3 Infect 0 1 1 Infect S O 1 0 1 Infect 1 1 2 Infect 1 1 2 Infect 1 0 1 Infect 0 1 1 Infect 2 0 2 Infect 1 0 1 Infect 0 1 1 Infect 0 1 1 Infect 1 0 1 Non infect 4 1 5 Non infect 1 0 1 Non infect 1 0 1 Non infect 1 0 1 Non infect 5 2 7 Non infect 2 2 4 Non infect 1 2 3 Non infect 1 0 1 Non infect 718 589 1307 Non infect 1 0 1 Non infect S O 2 3 5 Non infect 11 11 22 Non infect 1 1 2 Non infect S O S O 1 1 2 Non infect S O S O 5 4 9 Non infect 1 1 2 Total
69. ante pendant 30 5 minutes 16 Placez le portoir sur la base magn tique TCS pendant 5 10 minutes 17 Amorcez la conduite de la pompe du poste de distribution en pompant la solution de lavage APTIMA dans la rampe de distribution Pompez une quantit suffisante de liquide dans le syst me afin qu il ne reste aucune bulle d air dans les tubulures et que les dix t tes dispensent un flux r gulier de liquide 18 Mettez la pompe vide en marche et d branchez la rampe d aspiration du premier connecteur situ entre la rampe d aspiration et le flacon pi ge V rifiez que la jauge de d pression soit conforme la sp cification du test pour les fuites L obtention de ce chiffre peut prendre 15 secondes Rebranchez la rampe d aspiration et v rifiez que la jauge de d pression soit conforme la sp cification du niveau de d pression N teignez pas la pompe vide avant que toutes les tapes de la capture de cible soient termin es et que la tubulure de la rampe d aspiration soit s che 19 Fixez fermement la rampe d aspiration au premier jeu d embouts Aspirez la totalit du liquide en abaissant les embouts dans la premi re unit TTU jusqu ce qu ils touchent bri vement le fond des tubes Ne pas maintenir les embouts en contact avec le fond des tubes 20 Une fois l aspiration termin e jectez les embouts dans leur TTC d origine Recommencez les tapes d aspiration pour les unit s TTU restantes en utilisant un embout par cha
70. antillons suivants provenant d individus symptomatiques chantillons endocervicaux vaginaux et ur traux m les collect s par un clinicien l aide d un couvillon chantillons d urine f minins et masculins Ce test peut tre employ pour analyser les chantillons suivants provenant d individus asymptomatiques chantillons endocervicaux et vaginaux collect s par un clinicien l aide d un couvillon chantillons collect s par la patiente l aide d un couvillon vaginal chantillons d urine f minins et masculins Ce test est galement destin tre utilis pour l analyse d chantillons gyn cologiques provenant aussi bien de patientes symptomatiques et asymptomatiques Ces chantillons cervicaux collect s dans les flacons de solution PreservCyt peuvent tre test s avant ou apr s le traitement du frottis L analyse des chantillons apr s traitement du frottis est limit e aux seuls chantillons trait s avec le syst me ThinPrep 2000 Les chantillons collect s par la patiente l aide d un couvillon vaginal repr sentent une option de d pistage chez la femme lorsqu un examen pelvien n est pas autrement indiqu Le kit de collecte d chantillons couvillon vaginal n est pas pr vu pour une utilisation domicile R sum et explication du test Les infections Neisseria gonorrhoeae repr sentent l une des maladies sexuellement transmissibles les plus fr quentes au monde En 2010 les Centres
71. at d infection du patient a donc t class comme non infect n 1 Le tableau 7e r sume la fr quence des r sultats du test pour les chantillons endocervicaux sur couvillon test s avec le test APTIMA COMBO 2 et le test GC APTIMA Le tableau 5a indique les sensibilit s et sp cificit s du test GC APTIMA par tat des sympt mes et de mani re globale La sensibilit g n rale tait de 92 3 12 13 Chez les sujets symptomatiques et asymptomatiques les sensibilit s taient respectivement de 100 96 7 7 et 83 3 5 6 La sp cificit g n rale tait de 99 8 1630 1634 Chez les sujets symptomatiques et asymptomatiques les sp cificit s taient respectivement de 99 4 350 352 et 99 8 96 1280 1282 Le tableau 6a indique les sensibilit s et sp cificit s du test GC APTIMA par site de collecte d chantillons et de mani re globale Les sensibilit s s chelonnaient de 80 0 100 96 Les sp cificit s s chelonnaient de 99 0 100 96 Tableau 5 Distribution du dispositif d chantillonnage cervical utilis pour les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt Dispositif d chantillonnage cervical Site clinique de collecte Ti Total utilis 1 2 3 4 5 Spatule cytobrosse 0 124 475 287 57 364 1307 Dispositif endocervical de type balai 100 0 0 0 240 0 340 Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 49 502185FR R v E Performance clinique du test avec les DTS Systems Tableau
72. autre Pautre Pautre Concentration N RLU 1000 Concord SD cv D Cv SD cv un cv SD cy 0 0 0 0 0 x 1000 9 x 1000 9 x 1000 9 x 1000 9 x 1000 9 N g 0 fg mL 540 11 7 99 8 2333 S O 0 S O 0 S O 4 3 S O 0 S O Faible 608 625 fg mL 324 5574 4 99 7 617 2 11 1 189 2 3 4 518 1 9 3 311 3 5 6 527 4 9 5 M d 6082 fg mL 108 6502 6 100 138 8 2 1 0 0 0 481 9 7 4 514 8 7 9 579 4 8 9 lev 12 500 fg mL 324 6786 0 100 270 3 4 0 0 0 0 581 3 8 6 410 7 6 1 647 1 9 5 SD cart type CV pourcentage du coefficient de variation Concord pourcentage de concordance S O ne s applique pas pour un analyte n gatif Remarque La variabilit de certains facteurs peut tre num riquement n gative ph nom ne pouvant survenir si la variabilit due ces facteurs est tr s minime Si tel est le cas la variabilit telle que mesur e avec SD et CV est r gl e sur z ro 12 La pr cision dans un m me laboratoire pour un chantillon de frottis en milieude liquide PreservCyt avec le test GC APTIMA a t d termin e en ensemengant les flacons de PreservCyt avec 20 CFU de GC par flacon 0 1 CFU par r action et 100 CFU de GC par flacon 0 5 CFU par r action Les flacons contenant 10 000 CFU de GC CFU par flacon 50 CFU par r action et les flacons de PreservCyt non ensemenc s ont t test s comme contr les positifs et n gatifs Dix flacons ensemenc s diff rents taux de CFU et dix flacons non
73. cher debout et non invers s l Contamination des tests 1 L introduction de substances contaminantes peut survenir si le protocole de test n est pas rigoureusement respect 2 Les TTU doivent tre d contamin es dans une solution de d sactivation comme indiqu dans le paragraphe D tection Ne pas r utiliser les unit s TTU 3 Effectuez une d contamination r guli re du mat riel et des surfaces de travail comme expliqu ci dessus dans le paragraphe D contamination sous Remarques concernant la proc dure 4 Comme avec tout syst me de r actif l exc s de poudre sur certains gants peut entra ner la contamination des tubes ouverts Il est recommand d utiliser des gants sans poudre Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 21 502185FR R v E DTS Systems J Protocole de contr le de la contamination en laboratoire pour les DTS Systems Il existe plusieurs facteurs pr cis pouvant contribuer la contamination notamment le volume de tests la direction du sens du travail la pr valence de maladies et diverses activit s de laboratoire Ces facteurs doivent tre pris en compte lors de l tablissement de la fr quence du contr le des contaminations Les intervalles de contr le de la contamination doivent tre d finis en fonction des pratiques et proc dures propres chaque laboratoire Pour surveiller la contamination du laboratoire il est possible d effectuer la proc dure suivante au moyen du kit de collecte
74. collecte d chantillon couvillon tige bleue avec imprim vert de son emballage humidifiez l couvillon dans le milieu du tube de transport de l couvillon et couvillonnez la zone d sign e d un geste circulaire 3 Introduisez imm diatement l couvillon dans un tube de transport 4 Cassez d licatement la tige de l couvillon sur la ligne de score en vitant toute projection du contenu 5 Rebouchez herm tiquement le tube de transport de l couvillon 6 R p tez les tapes 2 5 pour toutes les zones couvillonner Si les r sultats sont positifs ou quivoques pour GC consultez nterpr tation du test QC R sultats patients Pour des renseignements suppl mentaires au sujet du contr le de la contamination sp cifiques au TIGRIS DTS System consultez le Manuel de l op rateur du TIGRIS DTS System TIGRIS DTS System Operator s Manual Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 30 502185FR R v E PANTHER System PANTHER System PA ER s E Les r actifs du test GC APTIMA sont num r s ci dessous pour le PANTHER System Les symboles d identification des r actifs figurent galement c t du nom du r actif R actifs et mat riels fournis Kit de test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 100 tests 2 boites et 1 kit de contr les r f rence 302927 Boite r frig r e pour test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae Boite 1 sur 2 conserver entre 2 C et 8 C d s la r ception Symbole Co
75. cordance des chantillons cliniques pour le TIGRIS DTS System symptomatiques asymptomatiques et tous tait de 100 Concernant les chantillons d urine f minins la concordance globale pour les sujets symptomatiques tait de 100 96 de 96 0 24 25 pour les sujets asymptomatiques et de 98 6 71 72 pour tous Concernant les chantillons d urine masculins la concordance globale pour les sujets symptomatiques tait de 98 6 69 70 de 100 pour les sujets asymptomatiques et de 99 2 129 130 pour tous Concernant les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt la concordance globale pour les sujets symptomatiques asymptomatiques et tous tait de 100 En raison du nombre relativement plus petit d chantillons de sujets asymptomatiques ces conclusions peuvent ne pas s tendre aux tests du TIGRIS DTS System pour le test GC APTIMA avec les chantillons de sujets asymptomatiques Se r f rer au tableau 4 pour les estimations de la performance du test GC APTIMA concernant les chantillons endocervicaux sur couvillon vaginaux sur couvillon ur traux m les sur couvillon et d urine masculins et f minins et au tableau 5a pour les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt test s sur les DTS Systems Les estimations de la performance clinique pour le TIGRIS DTS System avec les chantillons endocervicaux sur couvillon vaginaux sur couvillon ur traux m les sur couvillon
76. dante et posez le bouchon sur une surface de travail propre et couverte e Tout en tenant la bouteille de solution de reconstitution au dessus de la paillasse ins rez fermement l autre extr mit du collet de reconstitution dans l ouverture de la bouteille Figure 2 Etape 2 f Retourner lentement les flacons assembl s Laisser la solution s couler depuis le flacon en plastique dans le flacon en verre Figure 2 Etape 3 g Faites tournoyer d licatement la solution dans le flacon pour la m langer vitez de faire de la mousse dans le flacon pendant cette manipulation Figure 2 Etape 4 h Attendez que le r actif lyophilis se dissolve puis retournez nouveau les flacons assembl s en les inclinant un angle de 45 pour minimiser la formation de mousse Figure 2 Etape 5 Laissez la totalit du liquide retourner dans le flacon en plastique i Retirez le collet de reconstitution et le flacon en verre Figure 2 tape 6 j Rebouchez le flacon Retirez et jetez l tiquette sup rieure sur les flacons pour 50 tests Inscrivez les initiales de l op rateur la date de reconstitution ainsi que le num ro de lot du r actif lyophilis sur l tiquette restante Figure 2 Etape 7 Pour les flacons de 100 tests inscrire les initiales de l op rateur et la date de reconstitution directement sur l tiquette voir Figure 3 Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 26 502185FR R v E k TIGRIS DTS System
77. de mani re cr er un panel clinique de chaque type d chantillon Chaque panel contenait un total de 132 r plicats Les donn es initiales des chantillons d urine masculins et f minins indiquent que certains des membres du panel contenant un taux de rRNA inf rieur au seuil de sensibilit analytique revendiqu ont donn des r sultats n gatifs inattendus sur le TIGRIS DTS System Deux tudes de suivi ont t r alis es pour d montrer et confirmer la concordance avec les r sultats attendus dans les panels d chantillons d urine masculins et f minins enrichis Le plan de l tude original combinait des chantillons n gatifs dans un seul pool principal Le plan de l tude de suivi pour les chantillons d urine masculins et f minins a t modifi Les chantillons ont t aliquot s en mini pools n gatifs confirm s pour cr er les panels positifs et n gatifs Cent trente huit r plicats ont t cr s pour chaque panel Le tableau 14 indique le pourcentage de concordance de chaque concentration de rRNA dans les panels respectifs des couvillons endocervicaux couvillons vaginaux couvillons ur traux m les chantillons d urine masculins chantillons d urine f minins et de frottis en milieu liquide PreservCyt avec les r sultats GC attendus pour le TIGRIS DTS System et les DTS Systems La concentration s chelonnait de 1 log en dessous 3 logs au dessus des 250 fg de rRNA test pour GC Le tableau 14 indique
78. dium dos e de 5 7 96 0 7 M 1 0 M R cipients standard pour la collecte d urine sans conservateurs R cipient plastique large couvercle Bouchons p n trables APTIMA 105668 Bouchons de rechange non p n trables 103036A Mat riel optionnel R f rence Kit de contr les APTIMA 301110 Solutions APTIMA 302002C Solution de lavage APTIMA tampon APTIMA pour solution de d sactivation et r actif huileux APTIMA Activateur de javel GEN PROBE 302101 pour le nettoyage courant des surfaces et des appareils Panel d essai STD 102325 Embouts 1000 uL conductibles d tecteurs de liquide 10612513 Tecan TECAN Freedom EVO 100 4 comprenant 900932 Platine APTIMA COMBO 2 pour DTS 800 Systems Platine 105200 R servoir r actif quart de module de 40 mL 104765 R servoir r actif divis en deux quart de module de 19 mL x 2 104763 Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 12 502185FR R v E DTS Systems Proc dure de test avec les DTS Systems A Pr paration du mat riel 1 Pr parez un premier bain marie 62 C 1 C pour la capture de cible et l hybridation des amorces un second bain marie 42 C 1 C pour l amplification et un troisi me 62 C 1 C pour le test HPA Si vous utilisez le bain chaleur s che vortexeur SB100 SB100 Dry Heat Bath Vortexer r f rez vous la fiche d application du bain chaleur s che vortexeur SB100 fiche d application SB 100 2 Avant d entreprendre
79. donn que le syst me de transport utilis pour ce test ne permet pas l valuation microscopique de la qualit des chantillons il est n cessaire que les cliniciens soient form s aux techniques de collecte d chantillons appropri es Consultez la notice du kit de collecte d chantillons APTIMA correspondante G L chec ou la r ussite d une th rapie ne peut tre d termin par le test GC APTIMA tant donn que les acides nucl iques peuvent persister apr s une th rapie antimicrobienne appropri e H Les r sultats du test GC APTIMA doivent tre interpr t s en conjonction avec les autres donn es de laboratoire et cliniques dont dispose le clinicien l Un r sultat n gatif n exclut pas une ventuelle infection tant donn que les r sultats d pendent la qualit de la collecte de l chantillon Les r sultats des tests peuvent tre affect s par une collecte impropre des chantillons une mauvaise conservation des chantillons une erreur technique une confusion entre chantillons ou des niveaux de cible inf rieurs au seuil de d tection du test J Le test GC APTIMA fournit des r sultats qualitatifs Il n est donc pas possible d tablir une corr lation entre la magnitude d un signal de test positif et le nombre d organismes dans un chantillon K Concernant les tudes cliniques des chantillons vaginaux endocervicaux et ur traux masculins sur couvillon et les chantillons d urine les caract rist
80. e ce moment l Pour cr er une liste de travail r f rez vous au Manuel de l op rateur du logiciel de test APTIMA APTIMA Assay Software Operator s Manual 8 M langer fond la solution wTCR GC A l aide du pipeteur r p tition ajoutez 100 uL dans chaque tube r actionnel 9 Le premier tube r actionnel doit contenir le contr le n gatif et le second le contr le positif a L tiquette du contr le n gatif du test GC APTIMA est rose Le texte de l tiquette d signe le contr le n gatif comme suit CONTROL CT PCT CONTROL GC NGC L tiquette du contr le positif du test GC APTIMA est bleu vert Le texte de l tiquette d signe le contr le positif comme suit CONTROL GC PGC CONTROL CT NCT b Tenez le tube de contr le n gatif tube avec tiquette rose d une main ou laissez le dans un portoir A l aide d un micro pipeteur perforez le bouchon en veillant ne pas enfoncer l embout au fond du tube Ajoutez 400 uL de contr le n gatif tube avec tiquette rose au premier tube r actionnel En proc dant de la m me mani re et l aide d un nouvel embout de pipette ajoutez 400 uL de contr le positif tube avec tiquette bleue verte au second tube r actionnel Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 15 502185FR R v E DTS Systems 10 Continuez la pr paration du portoir en ajoutant 400 pL de chaque chantillon dans les tubes r actionnels restants Utilisez un nouvel embout de pi
81. e concernant les organismes individuels est largement d termin e par la chimie du test par ex s quences d olignucl otides plut t que par la plate forme tant donn que les r actifs du test GC APTIMA sont identiques entre le TIGRIS DTS System et les DTS Systems les exp rimentations de sp cificit analytique sur le TIGRIS DTS System taient destin es porter sur les isolats de culture les plus complexes Parmi ces organismes figuraient ceux qui sont connus pour avoir une r activit crois e dans d autres tests d amplification Vingt quatre 24 isolats de culture ont t s lectionn s dans le panel d organismes du Tableau 11 y compris 17 organismes qui sont tr s troitement apparent s GC Tous les organismes test s ont donn des r sultats n gatifs l exception d un r sultat faussement positif 1 648 Le cas a t observ avec C pneumoniae o 1 r plicat sur les 27 test s a donn un r sultat faux Les tests de r p tition n ont pas support la r activit crois e avec cet organisme C pneumoniae tant donn qu aucun test positif n a t observ avec les 6 r plicats de test suppl mentaires Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 70 502185FR R v E Performance analytique du TIGRIS DTS System tude de l quivalence des substances interf rentes Le sang total une substance que l on trouve couramment dans les chantillons urog nitaux et connue pour interf rer avec certains tests d ampl
82. e flacon d chets et tournez d licatement le contenu jusqu l obtention d un m lange homog ne Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 20 502185FR R v E DTS Systems f Laissez le flacon d chets reposer pendant 15 minutes puis jetez le contenu d chets g Rincez le flacon d chets l eau pour liminer tout r sidu ventuel h Rebouchez le flacon vide et mettez le dans le boitier du pi ge vide Fixez le raccord d connexion rapide sur l unit TCS Jetez avec pr caution les deux gants 4 Unit TCS Essuyez les surfaces de l unit TCS la rampe d aspiration et la surface des embouts d jection du tampon de lavage avec des serviettes en papier humidifi es l aide d une solution d hypochlorite de sodium dos e de 2 5 3 5 0 35 M 0 5 M Faites suivre l tape de javellisation par un rin age l eau puis s chez compl tement les surfaces avec des serviettes en papier 5 Portoirs Faites submerger les portoirs dans une solution d hypochlorite de sodium dos e de 2 5 96 3 5 0 35 M 0 5 M en veillant ce qu ils soient recouverts par la solution d hypochlorite de sodium Maintenez les portoirs immerg s pendant 10 minutes Toute exposition plus longue endommagerait les portoirs Rincez soigneusement les portoirs l eau et placez les sur un tampon absorbant propre avant de les laisser s cher parfaitement l air libre Pour prolonger la dur e de vie des portoirs faites les s
83. e protection Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 19 502185FR R v E DTS Systems G Bains marie 1 Le niveau d eau des bains marie doit avoir une profondeur de 3 8 5 cm 1 5 2 0 po mesur e depuis le plateau de support m tallique fond du bain marie jusqu la surface de l eau Cette pr caution permettra d assurer un transfert de chaleur ad quat 2 Pour viter toute contamination crois e les bains marie doivent tre r serv s une tape pr cise du test H D contamination 1 Surfaces et pipeteurs Les surfaces des paillasses et les pipeteurs du laboratoire doivent tre d contamin s r guli rement avec une solution d hypochlorite de sodium dos e de 2 5 3 5 0 35 M 0 5 M Laissez la solution d hypochlorite de sodium au contact des surfaces pendant au moins 1 minute puis rincez l eau Ne pas laisser s cher la solution d hypochlorite de sodium Les solutions base de chlore peuvent piquer le m tal et le mat riel Rincez soigneusement le mat riel pass l eau de javel pour viter toute piq re de corrosion 2 Rampe d aspiration TCS a Placez une nouvelle TTC dans le portoir TTC Mettez la pompe vide en marche Fixez la rampe d aspiration aux embouts de la TTC Aspirez enti rement la solution de lavage restant dans la cuve d amorcage du poste de distribution de solution de lavage Placez la rampe de distribution de fa on ce qu elle ne g ne pas b Versez au moins 100 m
84. e revendiqu e pour le test est de 50 CFU test 362 CFU couvillon 250 CFU mL d urine et 487 5 CFU mL en milieu PreservCyt Sp cificit analytique Un total de 154 isolats de culture a t valu l aide du test GC APTIMA Ces isolats comprenaient 86 organismes pouvant tre isol s du tractus urog nital et 68 organismes suppl mentaires qui repr sentent un croisement phylog n tique d organismes Les organismes test s comprenaient des bact ries champignons levures parasites et virus Tous les organismes l exception de C psittaci C pneumoniae U urealyticum et les virus ont t test s 1 0 x 10 cellules test dans le milieu de transport d urine KOVA Trol et 60 organismes l ont t dans le milieu de transport d couvillons Les organismes Chlamydia et Neisseria ont t test s dans le milieu PreservCyt C psittaci VR601 a t test 8 0 x 10 cellules test et C psittaci VR125 1 0 x 10 cellules test C pneumoniae a t test 4 0 x 10 cellules test et U urealyticum 6 7 x 10 cellules test La pr sence de virus a t d termin e de la mani re suivante a virus Herpes simplex 2 5 x 10 TCIDsp test b virus Herpes simplex Il 6 0 x 10 TCIDao test c papillomavirus humain 16 2 9 x 10 copies de DNA test et d cytom galovirus 4 8 x 10 cellules test La liste des organismes test s est indiqu e au Tableau 11 Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 60 502185FR R v E
85. ec les DTS Systems Tableau 1 Pr valence de N gonorrhoeae par site clinique et de mani re globale selon les r sultats obtenus avec le test GC APTIMA nbre positifs nbre test s Site MS MU FS FU PVS cvs 1 214 54 252 214 54 252 6 1 14 22 5 7 13 280 6 4 14 219 61 14 230 26 5 93 351 20 4 71 354 46 4 32 199 15 0 30 200 16 2 32 198 16 6 33 199 0 0 0 4 0 0 0 4 44 5 114 35 4 113 36 411 35 4 113 S O S O 2 3 6 266 19 5 270 2 2 6 267 3 0 8 269 5 5 11 200 55 11 200 45 3 199 10 24199 10 2 99 10 2 199 14 5 44 304 413 4 41 305 82 24 7204 57 17 200 8 3 24 200 75 22 295 58 12 207 58 12 207 o o 0 102 oo 0102 oo 0102 oo 0 102 S O S O 20 1 9 20 1 49 2 1 148 20 1 51 Tous 16 2 214 1318 14 3 189 1322 5 9 85 1452 4 9 72 1459 5 8 83 1434 5 8 84 1458 o N aj A OJ N MS couvillon ur tral masculin MU urine masculine FS couvillon endocervical f minin FU urine f minine PVS couvillon vaginal collect par la patiente CVS couvillon vaginal collect par un clinicien Tableau 1a Pr valence de N gonorrhoeae par site clinique et de mani re globale selon les les r sultats obtenus avec le test GC APTIMA en utilisant les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt Site nbre positifs nbre test s 1 5 0 5 100 2 0 8 1 124 3 0 8 4 475 4 1 4 4 287
86. ec son r actif lyophilis V rifiez que la solution de reconstitution et le r actif ont des tiquettes de couleur identiques avant de mettre en place le collet de reconstitution b V rifiez les num ros de lot sur la fiche de code barres du lot de r f rence pour vous assurer que les r actifs sont associ s correctement c Ouvrez le r actif lyophilis et ins rez fermement l extr mit encoche du collet de reconstitution dans l ouverture du flacon Figure 3 Etape 1 d Ouvrez la solution de reconstitution correspondante et posez le bouchon sur une surface de travail propre et couverte Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 33 502185FR R v E PANTHER System k Tout en tenant la bouteille de solution de reconstitution sur la paillasse ins rez fermement l autre extr mit du collet de reconstitution dans la bouteille Figure 3 tape 2 Retourner lentement les flacons assembl s Laissez la solution s couler depuis la bouteille en plastique vers le flacon en verre Figure 3 Etape 3 Faites tournoyer en douceur la solution dans le flacon pour la m langer vitez de faire de la mousse en faisant tournoyer le flacon Figure 3 Etape 4 Attendez que le r actif lyophilis soit dissout puis retournez nouveau les flacons assembl s en les inclinant un angle de 45 pour minimiser la formation de mousse Figure 3 Etape 5 Laissez la totalit du liquide retourner dans le flacon en plastique R
87. elvien n est pas autrement indiqu P L utilisation d chantillons collect s par la patiente l aide d un couvillon vaginal est limit e aux centres de soins de sant o des conseils un soutien sont offerts pour expliquer les proc dures et pr cautions d emploi Q Le test GC APTIMA n a pas t valid pour tre utilis avec des chantillons collect s par la patiente l aide d un couvillon vaginal domicile R La performance des chantillons sur couvillon vaginal n a pas t valu e chez les femmes enceintes S La performance des chantillons endocervicaux vaginaux et ur traux masculins sur couvillon des chantillons d urine masculins et f minins et des chantillons de frottis en solution PreservCyt n a pas valu e chez des adolescents de moins de 16 ans T Le test des chantillons ur traux sur couvillon de sujets masculins asymptomatiques n est pas recommand en raison du faible coefficient de pr vision d un r sultat positif observ dans l tude clinique U La performance du TIGRIS DTS System n a pas t d termin e des altitudes sup rieures 2240 m tres Des v rifications volum triques ainsi que des tudes sp cifiques au test suppl mentaires seront effectu es avant ou dans le cadre du processus d installation et d acceptation pour les laboratoires situ s une altitude sup rieure 2240 m tres V La performance du PANTHER System n a pas t d termin e des al
88. ent positives pour GC pour toutes les dur es et temp ratures Les donn es destin s confirmer les conditions de transport et de conservation recommand es pour les chantillons d urine ont t g n r es avec des chantillons d urine f minins et masculins n gatifs Les chantillons d urine ont t enrichis avec GC une concentration finale de 100 CFU par r action Les chantillons d urine enrichis ont t maintenus 30 C pendant 24 heures avant d tre ajout s au milieu de transport d urine urine transport media UTM Les chantillons UTM ont t maintenus 4 C et 30 C et test s en triple aux jours 1 14 32 et 35 Les chantillons UTM ont galement t conserv s 20 C et 70 C et test s en triple aux jours 1 35 et 109 Tous les r plicats taient positifs pour GC avec les chantillons UTM maintenus 4 C et 70 C Lorsque les chantillons UTM ont t maintenus 30 C 94 des r plicats ont t positifs pour GC au jour 35 Lorsque les chantillons UTM ont t maintenus 20 C 98 des r plicats ont t positifs pour GC au jour 109 B chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt Les donn es destin es confirmer les conditions d exp dition et de conservation recommand es pour les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt ont t g n r es partir d chantillons de frottis liquides trait s et non trait s Pour les chantillons non trait s quat
89. est externe 2 op rateurs ont effectu 3 listes de travail valides chacun par lot de r actifs sur 1 instrument du TIGRIS DTS System Une liste de travail consistait en contr les de s rie et six panels de 12 membres Les chantillons ayant des r sultats initiaux invalides ou quivoques n ont pas t test s nouveau Onze chantillons ont donn des r sultats finaux invalides et ont t exclus des analyses de reproductibilit La reproductibilit a t d termin e en calculant la concordance entre les r sultats finaux du test et le r sultat attendu pour chaque membre du panel La reproductibilit a galement t valu e en calculant le SD cart type et le coefficient de variation CV du signal concernant les sites op rateurs lots et listes de travail Les CV n ont pas t calcul s pour les membres des panels n gatifs GC en raison des valeurs de signal faibles qui pourraient th oriquement quivaloir z ro Le tableau 13 donne les r sultats de la reproductibilit Tous les r sultats du test GC APTIMA sur le TIGRIS DTS System concordaient avec les r sultats pr vus pour les membres du panel contenant 0 250 25 000 et 250 000 fg de rRNA GC test Pour les membres du panel contenant 2500 fg de rRNA GC test la concordance avec les r sultats pr vus tait de 99 8 Les valeurs CV taient inf rieures ou gales 9 0 96 Ces donn es indiquent une reproductibilit excellente du test GC APTIMA avec le TIGR
90. ests comparatifs provenaient d individus symptomatiques Les chantillons ayant des r sultats initiaux invalides ou quivoques ont t test s nouveau en utilisant le m me syst me que celui sur lequel les r sultats ont t g n r s Trois chantillons d urine f minin 1 vaginal sur couvillon et 1 ur tral m le sur couvillon qui avaient donn initialement des r sultats quivoques sur le DTS Systems ont tous donn des r sultats valides apr s un nouveau test Un chantillon d urine masculin et 1 chantillon d urine f minin qui avaient donn initialement des r sultats quivoques sur le TIGRIS DTS System ont donn des r sultats valides apr s un nouveau test Le tableau 12 montre les concordances positives n gatives et globales pour tous les r sultats appari s de chaque type d chantillon par tat symptomatique Bien que les chantillons sur couvillon f minins couvillons endocervicaux et vaginaux combin s ne soient pas quilibr s par rapport aux chantillons positifs et n gatifs des sujets symptomatiques la concordance globale chez les sujets symptomatiques tait de 100 96 de 97 6 40 41 chez les sujets asymptomatiques et la concordance globale pour tous symptomatiques et asymptomatiques combin s tait de 99 2 128 129 Concernant les chantillons ur traux m les sur couvillon la concordance globale pour les sujets Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 64 502185FR R v E Con
91. etirez le collet de reconstitution et le flacon en verre Figure 3 tape 6 Rebouchez la bouteille en plastique Notez les initiales de l op rateur et la date de reconstitution sur l tiquette Figure 3 Etape 7 Jeter le collet et le flacon Figure 3 tape 8 Avertissement vitez de faire de la mousse en reconstituant les r actifs La mousse interf re avec le d tecteur de niveau du PANTHER System 1 7 CN gt 3 4 d Ng 5 6 Figure 3 Proc dure de reconstitution pour le PANTHER System 2 Pr parez la solution de travail du r actif de capture de cible GC working Target Capture Reagent wTCR GC a b Associez les flacons de TCR GC et de TCR B appropri s V rifiez les num ros de lot des r actifs sur la fiche de code barres du lot de r f rence pour vous assurer que les r actifs appropri s du kit se correspondent Ouvrez le flacon de TCR GC et posez le bouchon sur une surface de travail propre et couverte Retirez le bouchon du flacon de TCR B et versez la totalit du contenu dans le flacon de TCR GC Il est normal qu une petite quantit de liquide reste dans le flacon de TCR B Rebouchez le flacon de TCR GC et agitez d licatement la solution pour m langer le contenu Evitez de cr er de la mousse pendant cette tape Notez les initiales de l op rateur ainsi que la date du jour sur l tiquette Jetez le flacon de TCR B et son bouchon Te
92. fin de l ncubation de l tape de s lection g Pr parez une solution de d sactivation en m langeant un volume quivalent d hypochlorite de sodium dos de 5 7 0 7 M 1 0 M et de tampon APTIMA pour solution de d sactivation dans un r cipient en plastique quip d un grand couvercle Mettez une tiquette et inscrivez la date de p remption sur le r cipient en plastique La solution de d sactivation reste stable pendant 4 semaines temp rature ambiante Jetez la solution de d sactivation une fois les 4 semaines coul es ou apr s avoir d sactiv 100 chantillons trait s si cela survient avant h Apr s avoir retir les unit s TTU utilis es du luminom tre placez les dans le r cipient de solution de d sactivation Laissez les unit s TTU dans le r cipient pendant 15 minutes avant de les jeter Le responsable du laboratoire devra avoir tabli des m thodes de manipulation et d limination des d chets ad quates Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 18 502185FR R v E DTS Systems Remarques concernant la proc dure A Contr les Pour fonctionner correctement avec le logiciel de test APTIMA le contr le n gatif pour GC qui porte l tiquette CONTROL CT PCT CONTROL GC NGC doit se trouver la premi re position de la premi re unit TTU Le contr le positif pour GC qui porte l tiquette CONTROL GC PGC CONTROL CT NCT doit se trouver la seconde position de la premi
93. galement le pourcentage de concordance globale de l tude des panels cliniques entre le TIGRIS DTS System et les DTS Systems Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 68 502185FR R v E Performance analytique du TIGRIS DTS System Tableau 14 tude clinique de la concordance des panels enrichis avec du rRNA GC Concentration de concordance Echantillon Membre du panel fg de rRNA test R plicats concordance concordance globale entre TIGRIS et TIGRIS DTS DTS IC 95 Sans cible 0 12 100 100 Tr s faible 25 30 100 100 Endocervical Faible 250 30 100 100 100 97 2 100 M diane 2500 30 100 100 Elev e 250 000 30 100 100 Sans cible 0 12 100 100 Tr s faible 25 29 100 100 couvillon Vaginal Faible 250 30 100 100 100 97 2 100 M diane 2500 30 100 100 Elev e 250 000 30 100 100 Sans cible 0 12 100 100 Tr s faible 25 30 100 100 Ur tral Faible 250 30 100 100 100 97 2 100 M diane 2500 30 100 100 Elev e 250 000 30 100 100 Sans cible 0 12 100 100 Tr s faible 25 30 i0 100 tude initiale Faible 250 30 100 100 91 7 85 6 95 8 M diane 2500 30 100 100 Elev e 250 000 30 100 100 Sans cible 0 18 100 100 Urine Tr s faible 25 30 100 100 Homme Suivi 1 Faible 250 30 100 100 100 97 4 100 M diane 2500 30 100 100 Elev e 250 000 30 100 100 Sans cible 0 18 100 100 Tr s faible 25 30 100 100 Suivi 2 Faible 250 30 100 100
94. ide dans le bouchon c Sile niveau de liquide dans un tube de transport d urine ne se situe pas entre les deux lignes indicatrices noires l chantillon doit tre rejet Ne pas perforer un tube trop rempli d Si un chantillon d urine contient un pr cipit chauffer l chantillon 37 C jusqu 5 minutes maximum Si le pr cipit ne se dissolve pas v rifiez visuellement qu il n interf re pas avec l obtention de l chantillon Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 35 502185FR R v E PANTHER System Remarque Le non respect des tapes 4a 4c peut entra ner l coulement de liquide par le bouchon du tube d chantillon Remarque Il est possible de tester jusqu 3 aliquots distincts provenant de chaque tube d chantillon Les tentatives de pipetage de plus de 3 aliquots d un tube d chantillon peuvent entra ner des erreurs de traitement E Pr paration du syst me 1 Configurez le syst me selon les instructions du PANTHER System Operator s Manual Manuel de l op rateur du PANTHER System et les Remarques concernant la proc dure Veillez ce que des portoirs r actifs et des adaptateurs TCR de taille appropri e soient utilis s 2 Chargez les chantillons Remarques concernant la proc dure A Contr les 1 Une paire de contr les doit tre utilis e pour permettre au logiciel de test APTIMA de fonctionner correctement Sur le PANTHER System les tubes du Contr le positif CT Contr le n
95. ification a t utilis pour d montrer que le TIGRIS DTS System tol re des taux de substances potentiellement interf rentes similaires ceux du DTS Systems Du sang frais a t ajout aux pools d chantillons cliniques et vaginaux sur couvillon d urine et de frottis en milieu liquide PreservCyt puis test s pour rechercher une ventuelle interf rence au test en l absence et en pr sence de la cible GC avec un rRNA estim quivalent 50 CFU de GC test 250 fg test Les quivalents rRNA ont t calcul s d apr s la taille du g nome et le ratio estim DNA RNA cellule de chaque organisme Les chantillons ont t test s sur deux TIGRIS DTS Systems Tous les chantillons contenant l acide nucl ique cible taient positifs lorsqu ils ont t test s un taux de sang de 10 dans les chantillons cliniques sur couvillon vaginaux sur couvillon et de frottis en milieu liquide PreservCyt et de 30 de sang dans les chantillons d urine Tous les chantillons qui ne contenaient pas la cible taient n gatifs pour GC Ces r sultats indiquent que aux concentrations test es le sang total n affecte vraisemblablement pas les r sultats de GC sur le TIGRIS DTS System tudes de la contamination de transfert pour le TIGRIS DTS System Afin d tablir que le TIGRIS DTS System minimise les risques de r sultats faussement positifs li s une contamination de transfert une tude a t r alis e l aide de panel
96. ifs En outre des techniques d chantillonnages m diocres du mat riel d chantillonnage toxique et l inhibition de la croissance par des composants de s cr tion corporelle peuvent galement entrainer des r sultats faussement n gatifs 3 10 Hormis les cultures les m thodes couramment utilis es pour la d tection de GC comprennent les tests de sonde DNA directs ainsi que les tests d amplification de l acide nucl ique Nucleic Acid Amplification Test NAAT Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 2 502185FR R v E Informations g n rales La premi re g n ration de NAAT pour GC pr sentait des probl mes techniques qui en ont limit la performance Ces probl mes taient notamment li s des difficult s de traitement des chantillons et leur inhibition pouvant introduire des r sultats faussement n gatifs 6 Le test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae Test GC APTIMA est un NAAT de deuxi me g n ration qui utilise les techniques de capture de cible d amplification par transcription Transcription Mediated Amplification TMA ainsi que le test de protection contre l hybridation Hybridization Protection Assay HPA pour simplifier le traitement des chantillons amplifier le rRNA cible et d tecter l amplicon Des tudes r centes comparant la performance et l inhibition des chantillons avec divers syst mes d amplification ont d montr les avantages des techniques de capture de cible de TMA et de HPA 4 7
97. ine MU urine masculine La colonne gris e indique une zone quivoque Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 46 502185FR R v E Performance clinique du test avec les DTS Systems Performance clinique du test avec les DTS Systems Consultez Concordance des chantillons cliniques pour le TIGRIS DTS System apr s la section Performance analytique des DTS Systems pour la performance analytique sp cifique au TIGRIS DTS System tude clinique des chantillons endocervicaux sur couvillon ur traux m les sur couvillon vaginaux sur couvillon et d urine Des chantillons endocervicaux vaginaux et ur traux m les collect s par un clinicien l aide d un couvillon des chantillons collect s par la patiente l aide d un couvillon vaginal et des chantillons d urine masculins et f minins ont t collect s aupr s de 2787 sujets masculins et f minins symptomatiques et asymptomatiques se rendant chez des gyn cologues obst triciens des cliniques de traitement des maladies sexuellement transmissibles MST ainsi que des centres pour adolescents et de planning familial dans huit sites cliniques g ographiquement diversifi s en Am rique du Nord Les sujets ont t class s symptomatiques si des sympt mes tels que des pertes dysuries et douleurs pelviennes ont t signal s par le sujet Les sujets ont t class s comme asymptomatiques s ils n ont fait tat d aucun sympt me Sur les 1392 sujets asympto
98. infection in urogenital samples obtained by invasive and noninvasive methods J Clin Microbiol 36 2666 2670 21 Toye B W Woods M Bobrowska and K Ramotar 1998 Inhibition of PCR in genital and urine specimens submitted for Chlamydia trachomatis testing J Clin Microbiol 36 2356 2358 22 Verkooyen R P A Luijendijk W M Huisman W H F Goessens J A J W Kluytmans J H Rijsoort Vos and H A Verbrugh 1996 Detection of PCR inhibitors in cervical specimens by using the AMPLICOR Chlamydia trachomatis assay J Clin Microbiol 34 3072 3074 23 Vincelette J J Schirm M Bogard A Bourgault D Luijt A Bianchi P C Van Voorst Vader A Butcher and M Rosenstraus 1999 Multicenter evaluation of the fully automated COBAS AMPLICOR PCR test for detection of Chlamydia trachomatis in urogenital specimens J Clin Microbiol 37 74 80 sl CE Gen Probe Incorporated San Diego CA 92121 EMERGO EUROPE Pour nous contacter aux tats Unis et dans d autres pays Molenstraat 15 Service Client 1 858 410 8002 2513 BH La H customerservice gen probe com y ca Haye Service Client 1 858 410 8002 Pays Bas customerservice gen probe com Service technique 1 858 410 8511 technicalsupport gen probe com Num ro d appel gratuit partir des Etats Unis et du Canada Service Client 1 800 523 5001 Service technique 1 888 484 4747 www gen probe com GEN PROBE GEN PROBE et son logo APTIMA APTIMA et son logo
99. iques de performance de la d tection de GC sont obtenues chez des populations forte pr valence d infection Des r sultats positifs chez des populations faible pr valence doivent tre interpr t s avec prudence sachant que la probabilit d obtenir des r sultats faux positifs peut tre sup rieure celle d obtenir des r sultats vrais positifs Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 41 502185FR R v E L Concernant les tudes cliniques des chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt la performance du test GC APTIMA dans la d tection de GC provient essentiellement de populations faible pr valence d infection N anmoins des r sultats positifs dans des populations faible pr valence doivent tre interpr t s avec prudence sachant que le nombre de r sultats faussement positifs peut tre sup rieur celui des r sultats vraiment positifs M La performance du kit de transfert d chantillons APTIMA n a pas t valu e pour ce qui est de l analyse d un m me chantillon de frottis en solution PreservCyt avant et apr s l analyse par le syst me ThinPrep N Les chantillons de frottis en solution PreservCyt trait s par des instruments autres que le processeur ThinPrep 2000 n ont pas t valu s par rapport leur utilisation dans des tests APTIMA O Les chantillons collect s par la patiente l aide d un couvillon vaginal offrent une option de d pistage chez les femmes lorsqu un examen p
100. javel GEN PROBE 302101 pour le nettoyage courant des surfaces et des appareils Proc dure de test pour le PANTHER System Remarque Consultez le Manuel de l op rateur du PANTHER System PANTHER System Operator s Manual pour de plus amples informations sur la proc dure du PANTHER System A Pr paration de la zone de travail 1 Nettoyez les surfaces de travail o les r actifs et les chantillons doivent tre pr par s Nettoyez les surfaces de travail avec une solution d hypochlorite de sodium dos e de 2 5 96 3 5 0 35 M 0 5 M Laissez la solution d hypochlorite de sodium au contact des surfaces pendant au moins 1 minute puis rincez l eau Ne pas laisser s cher la solution d hypochlorite de sodium Couvrez la surface de la paillasse sur laquelle les r actifs et les chantillons seront pr par s avec des protections de paillasse de laboratoire absorbantes propres avec envers plastifi B Reconstitution des r actifs Pr paration d un nouveau kit Remarque La reconstitution des r actifs doit tre effectu e avant d entreprendre toute t che sur le PANTHER System 1 Afin de reconstituer les r actifs d amplification GC enzymatiques GC et de sonde GC m langez la solution de reconstitution aux bouteilles de r actif lyophilis Si elles ont t r frig r es laissez les solutions de reconstitution parvenir temp rature ambiante avant l emploi a Faites correspondre chaque solution de reconstitution av
101. l Tous les m langes r actionnels doivent maintenant avoir une teinte rouge b Couvrez les tubes avec une carte de protection vortexez pendant 10 secondes ou jusqu l obtention d une teinte uniforme et incubez le portoir dans un bain marie 62 C 1 C pendant 10 1 minutes c Retirez le portoir du bain marie 3 D tection La d tection doit tre effectu e entre 18 C et 28 C a Incubez le portoir entre 18 C et 28 C pendant 15 3 minutes Remarque Cette plage de temp rature est indispensable pour la performance du test b Pour utiliser le LEADER HC Luminometer et le logiciel de test APTIMA r f rez vous au Manuel de l op rateur du luminom tre LEADER HC LEADER HC Luminometer Operator s Manual ainsi qu au Manuel de l op rateur du logiciel de test APTIMA APTIMA Assay Software Operator s Manual V rifiez que les volumes d Auto Detect 1 et 2 sont suffisants pour effectuer les tests Pr parez le LEADER HC Luminometer en pla ant une unit TTU vide dans la position de cassette num ro 1 et effectuez le protocole Wash Lavage e Chargez les unit s TTU dans le luminom tre f Connectez vous l ordinateur Cliquez sur New Run nouvelle s rie choisissez APTIMA GC Assay Protocol protocole de test GC APTIMA et entrez le nombre de tubes contr les et chantillons Cliquez sur Next suivant pour commencer la s rie Remarque La s rie doit tre compl t e dans les 2 heures qui suivent la
102. l Microbiology Laboratory ASM PRESS FEBRUARY 1997 6 Farrel D J 1999 Evaluation of AMPLICOR Neisseria gonorrhoeae PCR using cppB nested PCR and 168 rRNA PCR J Clin Microbiol 37 386 390 7T Gaydos C A T C Quinn D Willis A Weissfeld E W Hook D H Martin D V Ferraro and J Schachter 2003 Performance of the APTIMA Combo 2 Assay for Detection of Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae in Female Urine and Endocervical Swab Specimens J Clin Microbiol 41 304 309 8 Holmes K K H H Handsfield S P Wang B B Wentworth M Turck J B Anderson and E R Alexander 1975 Etiology of nongonococcal urethritis NEJM 292 1199 1205 9 Hooklll E W and H H Handsfield 1999 Gonococcal Infections in the Adult p 458 In K Holmes et al eds Sexually Transmitted Diseases McGraw Hill New York N Y 10 Krauss S J R C Geller G H Perkins and D L Rhoden 1976 Interference of Neisseria gonorrhoeae growth by other bacterial species J Clin Microbiol 4 288 295 11 Masi A T and B I Eisenstein 1981 Disseminated Gonococcal Infections DGI and Gonococcal Arthritis GCA II Clinical Manifestations Diagnosis Complications Treatment and Prevention Semin Arthritis Rheum 10 173 12 National Committee for Clinical Laboratory Standards 1999 NCCLS EP5 A Evaluation of Precision Performance of Clinical Chemistry Devices Approved Guideline Vol 19 No 2 13 National Committee for C
103. le l aide de microparticules magn tiques L oligom re de capture contient une s quence compl mentaire une r gion pr cise de la mol cule cible de m me qu une cha ne de r sidus de d oxyad nosine Lors de l tape d hybridation la r gion sp cifique de la s quence de l oligom re de capture se fixe sur une r gion pr cise de la mol cule cible Le complexe oligom re capture de cible est ensuite captur hors de la solution en ramenant la temp rature de la r action temp rature ambiante Cette r duction de temp rature permet l hybridation de se produire entre la r gion d soxyad nosine de l oligom re de capture et les mol cules poly d soxythimidines li es covalentement aux particules magn tiques Les microparticules y compris les mol cules cible captur es auxquelles elles sont li es sont attir es vers la paroi du tube r action par des aimants et le surnageant est aspir Les particules sont lav es afin d liminer la matrice r siduelle de l chantillon qui peut contenir des inhibiteurs de la r action d amplification Une fois les tapes de capture de cible termin es les chantillons sont pr ts l amplification Les tests d amplification de cible reposent sur la capacit des amorces d oligonucl otides compl mentaires de tremper sp cifiquement et de permettre l amplification enzymatique des brins de l acide nucl ique cible La r action TMA de Gen Probe r plique une r gion sp cifique du rR
104. linical Laboratory Standards 2002 NCCLS EP12 A User Protocol for Evaluation of Qualitative Test Performance Approved Guideline for additional guidance on appropriate internal quality control testing practices 14 National Committee for Clinical Laboratory Standards 2004 NCCLS EP5 A2 Evaluation of Precision Performance of Quantitative Measurement Methods Approved Guideline 2nd edition Vol 24 No 25 Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 74 502185FR R v E Bibliographie 15 Peterson E M V Darrow J Blanding S Aarnaes and L M de La Maza 1997 Reproducibility problems with the AMPLICOR PCR Chlamydia trachomatis test J Clin Microbiol 35 957 959 16 Schachter J 1985 Chlamydiae Psittacosis Lymphogranuloma Venereum Trachoma group p 856 862 In E H Lennette et al ed Manual of Clinical Microbiology 4 ed American Society for Microbiology Washington D C 17 Schachter J and M Grossman 1981 Chlamydial infections Ann Rev Med 32 45 61 18 Schachter J 1978 Medical progress chlamydial infections third of three parts NEJM 298 540 549 19 Schachter J E C Hill E B King V R Coleman P Jones and K F Meyer 1975 Chlamydial infection in women with cervical dysplasia Am J Obstet Gynecol 123 753 757 20 Stary A E Schuh M Kerschbaumer B Gotz and H Lee 1998 Performance of transcription mediated amplification and Ligase chain reaction assays for detection of chlamydial
105. m riquement n gative ph nom ne pouvant survenir si la variabilit due ces facteurs est tr s minime Dans ces cas SD 0 et CV 0 pr sence d un r plicat invalide sur 96 ce r plicat n a pas t r analys Sp cificit analytique La sp cificit analytique n a pas t valu e sur le PANTHER System Veuillez consulter l Etude de l quivalence de la sp cificit analytique sous Performance analytique du TIGRIS DTS System tude de l quivalence des substances interf rentes Le sang une substance que l on trouve couramment dans les chantillons urog nitaux peut interf rer avec certains tests d amplification Le degr d interf rence ventuel produit par la pr sence de sang a t d termin en utilisant du sang entier Du sang frais a t ajout aux pools cliniques d chantillons vaginaux sur couvillon d urine de frottis en milieu liquide PreservCyt trait s ou aux chantillons d urine et puis test s pour rechercher une ventuelle interf rence au test en l absence et en pr sence de GC La concentration quivalente de rRNA estim e de 125 GC CFU mL 250 fg test a t utilis e comme concentration cible car elle correspond au seuil de sensibilit analytique du test Les chantillons ont t analys s sur le PANTHER System Tous les chantillons contenant de l acide nucl ique cible taient Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 73 502185FR R v E Bibliographie positifs lorsqu ils
106. matiques enr l s dans l tude 2 avaient moins de 16 ans 237 entre 16 et 20 ans 423 entre 21 et 25 ans et 730 avaient plus de 25 ans Sur les 1395 sujets symptomatiques participant l tude 211 avaient entre 16 et 20 ans 494 entre 21 et 25 ans et 690 avaient plus de 25 ans Trois chantillons ont t collect s aupr s de chacun des 1322 sujets masculins ligibles Cinq chantillons ont t collect s aupr s de chacun des 1465 sujets f minins ligibles Chez les sujets masculins deux couvillons ur traux al atoires ont t collect s suivis d un chantillon d urine Chez les sujets f minins un chantillon d urine a t collect suivi par un chantillon collect par la patiente l aide d un couvillon vaginal un chantillon collect par un clinicien l aide d un couvillon vaginal et deux chantillons endocervicaux al atoires sur couvillon Les r sultats du test GC et du test APTIMA COMBO 2 ont t g n r s pour les deux couvillons vaginaux un couvillon endocervical un couvillon ur tral m le et un aliquot d urine masculine et f minine Les couvillons endocervicaux et ur traux m les ainsi que l aliquot d urine masculine et f minine restants ont t test s en utilisant un autre test NAAT du commerce Les chantillons endocervicaux et ur traux m les sur couvillon et les chantillons d urine masculins et f minins test s avec le test APTIMA COMBO 2 et l autre test NAAT du commerce
107. mposant Quantit A R actif d amplification GC APTIMA 1 flacon Acides nucl iques d shydrat s non infectieux dans une solution tamponn e contenant 5 de diluant E R actif enzymatique GC APTIMA 1 flacon Transcriptase inverse et polym rase RNA d shydrat es dans une solution tamponn e HEPES contenant lt 10 de diluant P R actif sonde GC APTIMA 1 flacon Sondes DNA chimiluminescentes non infectieuses d shydrat es dans une solution tamponn e de succinate contenant 5 de d tergent TCR B R actif de capture de cible B GC APTIMA 1x0 30 mL Acides nucl iques non infectieux dans une solution tamponn e contenant 5 6 de d tergent Boite non r frig r e pour test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae Boite 2 sur 2 conserver entre 15 C et 30 C d s la r ception Symbole Composant Quantit AR Solution de reconstitution de l amplification GC APTIMA 1x 11 9 mL Solution aqueuse contenant des conservateurs ER Solution de reconstitution enzymatique GC APTIMA 1x6 3mL Solution tamponn e HEPES contenant un surfactant et du glyc rol PR Solution de reconstitution de sonde GC APTIMA 1x15 2 mL Solution tamponn e de succinate contenant 5 de d tergent S R actif de s lection GC APTIMA 1x43 0 mL 600 mM de solution tamponn e de borate contenant un surfactant TCR R actif de capture de cible GC APTIMA 1x 26 0 mL Solution saline tamponn e contenant une phase solide et des oligom re
108. n GC s chelonnant de faibles lev es ont contribu aux chantillons endocervicaux et ur traux m les sur couvillon d urine masculins et f minins vaginaux sur couvillon et de frottis en milieu liquide PreservCyt Les chantillons ont t transf r s directement chez Gen Probe pour tre test s Chez Gen Probe les chantillons endocervicaux sur couvillon ur traux m les sur couvillon et d urine masculins et f minins ont d abord t analys s avec le test APTIMA COMBO 2 sur le TIGRIS DTS System Les chantillons vaginaux sur couvillon et de frottis en milieu liquide PreservCyt ont t analys s avec le test APTIMA COMBO 2 sur les DTS Systems Les chantillons dont les r sultats d finitifs taient invalides ou quivoques n ont pas t retenus pour l tude de la concordance des chantillons cliniques GC APTIMA Cent vingt neuf chantillons d couvillons f minins 70 endocervicaux et 59 vaginaux 133 d couvillons ur traux m les 72 d urine f minins 130 d urine masculins et 51 de frottis en milieu liquide PreservCyt avec des r sultats positifs et n gatifs au test GC APTIMA COMBO 2 ont t s lectionn s pour des tests comparatifs entre le TIGRIS DTS System et les DTS Systems avec le test GC APTIMA La majorit des chantillons 88 chantillons d couvillons f minins 93 d couvillons masculins 47 d urine f minins 70 d urine masculins et 34 de frottis en milieu PreservCyt figurant dans les t
109. nce ventuelle au test en l absence et en pr sence de GC pour un rRNA estim quivalent 50 cellules test de GC 250 fg test Les quivalents rRNA ont t calcul s d apr s la taille du g nome et le ratio estim DNA RNA cellule de chaque organisme I n a t relev aucune interf rence avec l ensemble des substances test es Aucun inhibiteur d amplification n a t observ dans le test GC APTIMA R cup ration Escherichia coli Gardnerella vaginalis Lactobacillus acidophilus Bacteroides ureolyticus et Staphylococcus epidermidis 1 0 x 10 cellules test ont t ajout s aux chantillons contenant l quivalent rRNA d environ 50 cellules de GC 250 fg Ces ajouts n ont pas interf r avec l amplification ou la d tection de rRNA GC en utilisant le test GC APTIMA tudes de la stabilit des chantillons A chantillons sur couvillon et d urine Les donn es destin es confirmer les conditions de transport et de conservation recommand es pour les chantillons endocervicaux ur traux et vaginaux collect s l aide d un couvillon ont t g n r es avec des chantillons sur couvillon n gatifs group s Les chantillons group s ont t enrichis avec GC une concentration finale de 50 CFU par r action Les chantillons enrichis ont t maintenus 70 C 20 C 4 C et 30 C Ces chantillons ont t test s en duplicata aux jours 0 20 77 et 117 Toutes les conditions de test tai
110. nnel depuis la pr paration des r actifs vers le test HPA Les chantillons le mat riel et les r actifs ne doivent pas tre ramen s l o une tape pr c dente a t effectu e De la m me mani re le personnel ne devrait pas retourner dans les zones de travail des tapes pr c dentes sans s entourer de pr cautions ad quates pour viter toute contamination Recommandations concernant les chantillons J Concernant les chantillons endocervicaux et ur traux m les collect s l aide d un couvillon n utiliser que le kit de collecte d chantillons couvillon unisexe pour chantillons endocervicaux et ur traux m les sur couvillon APTIMA Concernant la collecte des chantillons d urine n utiliser que le kit de collecte d chantillons d urine Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 4 502185FR R v E Informations g n rales APTIMA pour chantillons d urine masculins et f minins Concernant les chantillons collect s par la patiente ou par le clinicien l aide d un couvillon vaginal n utiliser que le kit de collecte d chantillons couvillon vaginal APTIMA K Les dates de p remption figurant sur les kits de collecte concernent le site de collecte et non l tablissement effectuant les tests Les chantillons collect s avant la date de p remption du kit de collecte puis transport s et conserv s conform ment la notice du test sont valides pour tre test s m me si la date de p remp
111. ns 1 minute puis rincez l eau Ne pas laisser s cher la solution d hypochlorite de sodium Couvrez la surface de la paillasse sur laquelle les r actifs et les chantillons seront pr par s avec des protections de paillasse de laboratoire absorbantes propres avec envers plastifi B Reconstitution des r actifs Pr paration d un nouveau kit Remarque La reconstitution des r actifs doit tre effectu e avant d entreprendre toute t che sur le TIGRIS DTS System 1 Pour reconstituer le r actif d amplification GC le r actif enzymatique et le r actif sonde GC pour les kits de 100 tests et de 50 tests m langez la solution de reconstitution aux flacons de r actif lyophilis Si les solutions de reconstitution sont r frig r es laissez leur temp rature s quilibrer temp rature ambiante avant de les utiliser a Faites correspondre chaque solution de reconstitution avec son r actif lyophilis V rifiez que la solution de reconstitution et le r actif lyophilis ont des tiquettes de couleur correspondantes avant de mettre en place le collet de reconstitution b V rifiez les num ros de lot sur la fiche de code barres du lot de r f rence pour vous assurer que les r actifs sont associ s correctement c Ouvrez le r actif lyophilis et ins rez fermement l extr mit encoche du collet de reconstitution dans l ouverture du flacon Figure 2 Etape 1 d Ouvrez la bouteille de solution de reconstitution correspon
112. nte orange 7 Couvrez imm diatement les tubes avec une nouvelle carte de protection retirez le portoir du bain marie et m langez les tubes r actionnels en agitant d licatement le portoir manuellement 8 Faites incuber le portoir dans un bain marie 42 C 1 C pendant 60 15 minutes en E Test de protection contre l hybridation HPA Si vous utilisez le bain chaleur s che vortexeur SB100 SB100 Dry Heat Bath Vortexer r f rez vous la fiche d application du SB100 Le pipeteur r p tition utilis pour l hybridation et la s lection doit tre r serv ces tapes uniquement Voir Avertissements et pr cautions 1 Hybridation a Retirez le portoir du bain marie et transf rez le dans la zone de test HPA A l aide du pipeteur r p tition ajoutez 100 uL du r actif sonde GC reconstitu dans chaque tube r actionnel Tous les m langes r actionnels doivent maintenant avoir une teinte jaune b Couvrez les tubes avec une carte de protection et vortexez les sur le vortexeur m langeur tourbillon multi tubes c Faites incuber le portoir dans un bain marie 62 C 1 C pendant 20 5 minutes Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 17 502185FR R v E DTS Systems d Retirez le portoir du bain marie et laissez incuber temp rature ambiante pendant 5 1 minutes 2 S lection a A l aide du pipeteur r p tition ajoutez 250 uL de r actif de s lection dans chaque tube r actionne
113. ntillon 21 Placez la rampe de distribution sur chaque TTU et l aide de la pompe du poste de distribution versez 1 0 mL de solution de lavage APTIMA dans chacun des tubes de l unit TTU 22 Couvrez les tubes avec une carte de protection et retirez le portoir de la base magn tique TCS Vortexez le portoir une fois sur le vortexeur m langeur tourbillon 1 Consultez la Fiche des sp cifications de d pression du syst me de capture de cible situ e au verso du Manuel de l op rateur du syst me de capture de cible Target Capture System Operator s Manual ou contactez le Service technique Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 16 502185FR R v E DTS Systems multi tubes Pour plus de d tails consultez Agitation au vortex sous Remarques concernant la proc dure 23 Placez le portoir sur la base magn tique TCS pendant 5 10 minutes 24 Aspirez tout le liquide comme dans les tapes 19 et 20 25 Apr s l aspiration finale retirez le portoir de la base magn tique du TCS et inspectez visuellement les tubes pour v rifier que le liquide a t totalement aspir et que tous les tubes contiennent des culots de billes magn tiques S il reste visiblement du liquide remettez le portoir sur la base magn tique TCS pendant 2 minutes et refaites l aspiration pour cette unit TTU en prenant les m mes embouts que ceux utilis s pr c demment avec chaque chantillon Remarque Si une bille de particule magn tique est
114. nutes Si le pr cipit ne se dissolve pas v rifiez visuellement qu il n interf re pas avec l obtention de l chantillon Remarque Le non respect des tapes 4a 4c peut entra ner l coulement de liquide par le bouchon du tube d chantillon Remarque Il est possible de tester jusqu 3 aliquots distincts provenant de chaque tube d chantillon Les tentatives de pipeter plus de 3 aliquots du tube d chantillon peuvent entra ner des erreurs d insuffisance de volume E Pr paration du syst me Configurez le syst me et la liste de travail selon les instructions du TIGRIS DTS System Operator s Manual Manuel de l op rateur du TIGRIS DTS System et de la section Remarques concernant la proc dure Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 29 502185FR R v E TIGRIS DTS System Remarques concernant la proc dure A Contr les 1 Pour travailler correctement avec le logiciel de test APTIMA pour le TIGRIS DTS System des contr les avant et de fin sont n cessaires Le Contr le positif CT Contr le n gatif GC doit tre plac dans la premi re position et l avant derni re position d une liste de travail L tiquette de ce contr le est rose Le texte de l tiquette indique CONTROL CT PCT CONTROL GC NGC Le Contr le positif GC Contr le n gatif CT doit tre plac dans la seconde position et la derni re position d une liste de travail Le contr le porte une tiquette bleu vert Le texte de l tiquette
115. onde GC reconstitu sont photosensibles Conservez les r actifs l abri de la lumi re L Lorsqu ils parviennent temp rature ambiante certains tubes de contr le peuvent tre troubles ou contenir des pr cipit s La turbidit ou la pr cipitation associ e ces contr les n en affecte pas la performance Les contr les peuvent tre utilis s en tant limpides ou troubles pr cipit s Si l on souhaite travailler avec des contr les limpides il Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 7 502185FR R v E Informations g n rales est possible d acc l rer la solubilisation en les incubant aux valeurs maximales de la plage de temp rature ambiante 15 C 30 C M Ne pas congeler les r actifs Collecte et conservation des chantillons Le test GC APTIMA est con u pour d tecter la pr sence de GC dans les chantillons endocervicaux vaginaux et ur traux m les collect s par un clinicien l aide d un couvillon les chantillons collect s par la patiente l aide d un couvillon vaginal les chantillons d ur ine f minins et masculins et les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt La performance avec des chantillons autres que ceux collect s avec les kits de collecte d chantillons suivants n a pas t valu e Kit de collecte d chantillons couvillon unisexe APTIMA pour chantillons endocervicaux et ur traux m les sur couvillon Kit de collecte d urine APTIMA pour
116. ons collect s par la patiente l aide d un couvillon vaginal et des chantillons d urine masculins et f minins Elle a aussi valu la pr cision du test GC APTIMA dans des conditions de r alisation conformes aux directives NCCLS 12 La seconde investigation clinique a tabli la sensibilit la sp cificit et les valeurs pr dictives du test GC APTIMA en utilisant le milieu de transport PreservCyt composant du ThinPrep 2000 System Les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt Pap ont t galement valu s pour leur pr cision en laboratoire avec le test GC APTIMA Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 43 502185FR R v E Valeurs attendues pour les DTS Systems Pr valence La pr valence d infections GC dans les populations de patients d pend des facteurs de risque tels que l ge le sexe la pr sence de sympt mes le type de clinique et la m thode de test Un r sum de la pr valence de GC en Am rique du Nord par type d chantillon et selon les d terminations du test GC APTIMA figure dans les tableaux 1 et 1a pour deux investigations cliniques Pour des informations sur les caract ristiques de performance de l chantillon clinique consultez la section tude clinique des chantillons endocervicaux Sur couvillon ur traux m les sur couvillon vaginaux sur couvillon et d urine et Etude clinique des chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt sous Performance clinique du test av
117. or s Manual pour de plus amples d tails 5 Les contr les n gatifs peuvent se r v ler inefficaces pour surveiller la contamination al atoire de transfert Voir Performance analytique du TIGRIS DTS System pour consulter les r sultats d une tude analytique sur la contamination de transfert avec une valeur cible lev e qui a t effectu e pour d montrer le contr le de la contamination de transfert sur le TIGRIS DTS System Voir Performance analytique du PANTHER System pour consulter les r sultats d une tude analytique sur la contamination de transfert avec une valeur cible lev e qui a t effectu e pour d montrer le contr le de la contamination de transfert sur le PANTHER System C Contr le de la pr paration des chantillons facultatif Le contr le n gatif APTIMA pour GC portant l tiquette CONTROL CT PCT CONTROL GC NGC et le contr le positif APTIMA pour GC portant l tiquette CONTROL GC PGC CONTROL CT NCT servent de contr le pour les tapes de capture de cible d amplification et de d tection du test et doivent tre inclus dans chaque s rie du test Si on le souhaite des contr les de la lyse cellulaire et de la stabilisation de RNA peuvent tre test s conform ment aux recommandations ou exigences des organismes d accr ditation concern s ou encore selon les proc dures de laboratoire individuelles Les chantillons positifs connus peuvent servir de contr le s ils sont pr par s
118. p cificit La sensibilit et la sp cificit GC par sexe type d chantillon et tat des sympt mes sont pr sent es au tableau 4 Le tableau 6 indique la sensibilit la sp cificit et les valeurs pr dictives du test GC APTIMA compar l tat d infection des patients pour chaque site clinique et de mani re globale Les tableaux 7a 7e r sument le nombre de r sultats obtenus pour des sujets symptomatiques et asymptomatiques d sign s comme infect s ou non infect s GC selon l algorithme de l tat d infection des patients Sur les 2787 sujets participant l tude 15 d entre eux avaient un tat d infection GC inconnu Les sujets ont t d sign s comme ayant un tat d infection inconnu si des r sultats incomplets emp chaient de d terminer de mani re concluante leur tat d infection Les r sultats obtenus aupr s de ces sujets n ont pas t inclus dans les calculs de performance Sur les 7704 r sultats de test GC APTIMA 22 chantillons 0 29 96 avaient initialement donn des r sultats de test invalides ou quivoques Apr s avoir test de nouveau ces chantillons 4 d entre eux sont rest s quivoques et ont t exclus des analyses Les 18 chantillons restants ont produit des r sultats de test valides apr s avoir t de nouveau test s et ont donc t utilis dans les calculs de la performance clinique Tableau 4 Sensibilit et sp cificit du test GC APTIMA compar es l tat d infec
119. pette pour chaque chantillon et contr le Le volume d chantillon ou de contr le pouvant tre ajout un tube r actionnel est de 400 uL x 100 uL Pour de plus amples d tails consultez Pipetage des contr les et chantillons sous Remarques concernant la proc dure Capture de cible L utilisation du syst me de capture de cible Target Capture System Gen Probe est d crite dans le Manuel de l op rateur du syst me de capture de cible Target Capture System Operator s Manual Si vous utilisez le bain chaleur s che vortexeur SB100 SB100 Dry Heat Bath Vortexer r f rez vous la fiche d application du SB100 11 Couvrez les TTU avec des cartes de protection et agitez d licatement le portoir manuellement Ne pas vortexer Faites incuber le portoir 62 C 1 C dans un bain marie pendant 30 5 minutes 12 Retirez le portoir du bain marie et s chez le fond des tubes sur un mat riau absorbant 13 V rifiez que les cartes de protection sont fermement positionn es Au besoin remplacez les par de nouvelles cartes de protection et fermez herm tiquement les TTU 14 Vortexez le portoir pendant 60 secondes sur le vortexeur m langeur tourbillon multi tubes Pour plus de d tails consultez Agitation au vortex sous Hemarques concernant la proc dure Le portoir doit tre vortex dans les 2 minutes qui suivent son retrait du bain marie 15 Sans retirer les cartes de protection incubez le portoir temp rature ambi
120. que Asymptomatique Infect Positif Positif 7 6 Non infect N gatif N gatif 352 1276 Non infect N gatif Positif 0 5 Non infect Equivoque Positif 0 1 Total 359 1288 Distribution des RLU des contr les APTIMA La distribution des RLU pour le Contr le positif GC Contr le n gatif CT APTIMA et le Contr le positif CT Contr le n gatif GC APTIMA pour toutes les s ries de test GC APTIMA effectu es lors des tudes d chantillons cliniques est pr sent e au tableau 8 Tableau 8 Distribution des RLU des contr les APTIMA lors des tudes cliniques d chantillons comprenant les tudes des chantillons endocervicaux vaginaux et ur traux m les sur couvillon des chantillons d urine masculins et f minins et des chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt RLU x 1000 tude clinique o des tude clinique des MORE OM Statistiques chantillons de chantillons sur frottis en milieu Rens liquide PreservCyt d urine N 193 218 Moyenne 5048 4561 SD 1071 1295 Maximum 6765 6791 Contr le positif GC contr le n gatif CT Se ea SAE M diane 5175 4859 25 centile 4645 3804 Minimum 229 158 N 193 218 Moyenne 2 15 2 60 SD 2 20 2 80 Maximum 20 29 Contr le positif CT contr le n gatif GC TUE 5 3 M diane 2 2 25 centile 1 2 Minimum 0 1 Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 57 502185FR R v E Performance clinique du te
121. r s en ajoutant du rRNA de GC dans du STM pour obtenir une concentration finale de 5 x 10 fg rRNA r action conc quivalente de rRNA de 2 5 x 10 CFU mL L analyse a t r alis e pour 5 s ries sur trois syst mes PANTHER pour au total 2923 chantillons n gatifs Le taux de contamination de transfert global tait de O 96 avec un intervalle de confiance de 95 96 0 0 1 96 Au total 17 chantillons n gatifs de s ries ayant un titre lev ont t signal s comme invalides et exclus des calculs Bibliographie 1 Centers for Disease Control and Prevention 2002 Screening Tests to Detect Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae infections United States Morbid and Mortal Weekly Rep 51 RR 15 2 Centers for Disease Control and Prevention 2011 Sexually Transmitted Disease Surveillance 2010 Atlanta GA U S Department of Health and Human Services November 3 Ching S H Lee E W Hook IIl M R Jacobs and J Zenilman 1995 Ligase chain reaction for detection of Neisseria gonorrhoeae in urogenital swabs J Clin Microbiol 33 3111 3114 4 Chong S D Jang X Song J Mahony A Petrick P Barriga and M Chernesky 2003 Specimen Processing and Concentration of Chlamydia trachomatis Added Can Influence False Negative Rates in the LCx Assay but Not in the APTIMA Combo 2 Assay When Testing for Inhibitors J Clin Microbiol 41 778 782 CUMITECH 31 Verification and Validation of Procedures in the Clinica
122. re pools d chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt ont t test s apr s avoir t conserv s dans le flacon Cytyc pour solutions de Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 62 502185FR R v E Performance analytique des DTS Systems PreservCyt Chaque pool d chantillon a t ensemenc avec 50 100 CFU de GC test maintenu 2 C 10 C et 30 C puis test d apr s la base de r f rence et aux jours 5 7 8 14 18 21 25 et 36 Tous les chantillons ensemenc s taient positifs pour GC pour toutes les dur es et temp ratures Pour les chantillons trait s quatre pools d chantillons de la solution PreservCyt ont t utilis s pour d terminer la stabilit des chantillons trait s 2 C et 30 C Chaque pool d chantillon n gatif a t ensemenc avec 50 100 CFU de GC test puis test d apr s la base de r f rence Avant le traitement les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt ont t conserv s 30 C pendant sept 7 jours pour simuler le laps de temps entre la collecte des chantillons le traitement et l exp dition des frottis dans un laboratoire de tests microbiologiques Apr s sept jours 30 C des aliquots de 1 mL de chaque pool ont t transf r s dans un tube de transfert d chantillons APTIMA et test es d apr s la base de r f rence avant d tre plac s 2 C 10 C et 30 C Les chantillons trait s ont t test s apr s 17 jou
123. rhoeae Bo te 2 sur 2 conserver entre 15 C et 30 C d s la r ception Quantit Symbole Composant Kit de 100 Kit de 2 x 50 tests tests S R actif de s lection APTIMA 1x43 0 mL 2x20mL 600 mM de solution tamponn e de borate contenant un surfactant TCR R actif de capture de cible GC APTIMA 1x 26 0 mL 2x17mL Solution saline tamponn e contenant une phase solide et des oligom res de capture Collets de reconstitution 3 Pipettes de transfert 2 Fiche de code barres du lot de r f rence 1 fiche 1 fiche Kit de contr les APTIMA conserver entre 2 C et 8 C d s la r ception Symbole Composant Quantit PGC Contr le positif GC contr le n gatif CT APTIMA 5x1 7 mL NCT Acide nucl ique GC non infectieux dans une solution tamponn e contenant 5 de d tergent Chaque chantillon de 400 uL contient la quantit de rRNA estim e quivalente 50 cellules GC 250 fg test PCT Contr le positif CT contr le n gatif GC APTIMA 5x1 7 mL NGC Acide nucl ique CT non infectieux dans une solution tamponn e contenant 5 de d tergent Chaque chantillon de 400 uL contient la quantit de rRNA estim e quivalente 1 IFU de CT 5 fg test Les quivalents rRNA ont t calcul s d apr s la taille du g nome et le ratio estim DNA RNA cellule de chaque organisme Mat riel requis mais disponible s par ment Remarque Le mat riel disponible aupr s de Gen Probe
124. rne inf rieure de l intervalle de confiance 95 situ e 98 9 Le pourcentage de concordance n gative entre le PANTHER System et le TIGRIS DTS System tait de 100 avec une borne inf rieure de l intervalle de confiance 95 situ e 98 9 Les r sultats de cette tude sont pr sent es dans le tableau 16 Tableau 16 tude de la concordance du panel clinique ensemenc concordance avec les r sultats attendus pour GC Concentration OE TIGRIS PANTHER Membre du panel R plicats k CFU mL fgltest de concordance de concordance Tr s faiblement positif 12 5 25 117 100 100 Faiblement positif 125 250 120 100 100 Moyennement positif 1250 2500 120 100 100 N gatif 0 0 360 100 100 Pourcentage de concordance globale positive entre TIGRIS DTS System et PANTHER System IC 95 100 98 9 100 Pourcentage de concordance globale n gative entre TIGRIS DTS System et PANTHER System IC 95 100 98 9 100 tude de sensibilit analytique La sensibilit analytique du test GC APTIMA a t valu e en utilisant trois matrices d chantillons repr sentatives Ces derni res se composaient d urine trait e avec du milieu de transport d urine urine transport medium UTM du milieu liquide pour frottis PreservCyt dilu avec du milieu de transport pour couvillon swab transport medium STM et du STM Des pools de ces trois matrices ont t ensemenc s avec du rRNA GC aux concentrations suivantes
125. rs de conservation 30 C et 36 jours de conservation entre 2 C et 10 C Tous les chantillons ensemenc s taient positifs pour GC pour toutes les dur es et temp ratures Les donn es destin es confirmer des temp ratures de conservation plus longues ont t g n r es partir de quatre pools d chantillons n gatifs trait s avec la solution PreservCyt et test s des temp ratures inf rieures z ro Chaque pool a t ensemenc avec de 50 100 CFU de GC test puis test d apr s la base de r f rence Chaque pool a tout d abord t plac 30 C pendant 14 jours puis conserv 20 C ou 70 C sur 106 jours Tous les chantillons ensemenc s taient positifs pour GC pour toutes les dur es et temp ratures C Etude de stabilit suppl mentaire des chantillons congel s 20 C Les donn es destin es valider les conditions de conservation 20 C pr conis es pour les chantillons endocervicaux sur couvillon ur traux sur couvillon vaginaux sur couvillon d urine f minins et masculins et de frottis en milieu liquide PreservCyt ont t obtenues l aide de 90 chantillons pour chaque type ayant produit un r sultat n gatif Parmi ces chantillons 30 d entre eux ont t ensemenc s avec GC un taux de 50 CFU par r action 30 chantillons ont t ensemenc s un taux de 5 CFU et 30 chantillons n ont pas t ensemenc s Les chantillons ont t conserv s
126. s enrichis sur trois TIGRIS DTS Systems L tude a utilis 20 des chantillons avec une valeur cible lev e contenant 1 0 x 10 cellules r action qui ont t al atoirement r partis parmi les 80 d chantillons n gatifs contenant le milieu de transport de l couvillon Dans l tude 576 chantillons avec une valeur cible lev e et 2376 chantillons n gatifs ont t test s sur les trois TIGRIS DTS Systems Le tableau 15 indique que le taux de contamination de transfert global tait en moyenne de 0 21 5 2370 Au total 6 chantillons n gatifs ont t signal s comme invalides et exclus des calculs Une analyse s par e a t effectu e sur un sous ensemble de la population de l tude constitu des chantillons n gatifs ayant imm diatement suivi des r sultats positifs avec une valeur cible lev e Le taux de contamination de transfert de ce sous ensemble de population tait en moyenne de 0 95 4 422 Concernant les r sultats faussement positifs de ce sous ensemble le taux de contamination de transfert variait de 0 2 16 sur les trois TIGRIS DTS Systems Ces r sultats ont d montr que la contamination est minimis e sur le TIGRIS DTS System Tableau 15 R sum de la contamination de transfert globale avec le TIGRIS DTS System Nbre total de Nbre de tests de r sultats GC RS r sultats GC Intervalles de confiance Instrument n gatifs faussement 4 faussement Ha IC 95
127. s bulles dans l espace situ entre le liquide et le bouchon centrifugez le tube pendant 5 minutes 420 FCR pour liminer les bulles b Sile tube de transport pr sente un volume inf rieur celui g n ralement obtenu lorsque les instructions de collecte ont t respect es centrifugez le tube pendant 5 minutes 420 FCR pour s assurer qu il ne reste pas de liquide dans le bouchon c Sile niveau de liquide dans un tube de transport d urine ne se situe pas entre les deux lignes indicatrices noires l chantillon doit tre rejet Ne pas perforer un tube trop rempli d Si un chantillon d urine contient un pr cipit chauffer l chantillon 37 C jusqu 5 minutes maximum Si le pr cipit ne se dissolve pas v rifiez visuellement qu il n interf re pas avec l obtention de l chantillon Remarque Le non respect des tapes 4a 4c peut entra ner l coulement de liquide par le bouchon du tube d chantillon 5 Si des chantillons munis de bouchons standard non p n trables sont test s ils doivent tre centrifug s pendant 5 minutes 420 FCR force centrifuge relative pour que la totalit du liquide s coule au fond du tube avant de le d boucher vitez les projections et les contaminations crois es 6 Placez un nombre suffisant d unit s de dix tubes TTU pour les contr les et chantillons dans le portoir pour unit s de dix tubes TTU 7 Si vous d sirez tablir une liste de travail faites l
128. s codes couleur afin de pouvoir tre correctement associ es b Ouvrez le flacon de r actif lyophilis et ins rez fermement l extr mit encoche du collet de reconstitution dans l ouverture du flacon Figure 1 Etape 1 c Ouvrez la bouteille de solution de reconstitution correspondante et posez le bouchon sur une surface de travail propre et couverte d Tout en tenant la bouteille de solution de reconstitution au dessus de la paillasse ins rez fermement l autre extr mit du collet de reconstitution dans l ouverture de la bouteille Figure 1 Etape 2 e Retournez d licatement l assemblage bouteille flacon Laissez la solution s couler depuis la bouteille dans le flacon Figure 1 Etape 3 f Faites tournoyer d licatement la solution dans le flacon pour la m langer Veillez viter de faire de la mousse dans le flacon pendant cette manipulation Figure 1 tape 4 g Attendez que le r actif lyophilis se dissolve puis retournez nouveau l assemblage bouteille flacon en l inclinant un angle de 45 pour minimiser la formation de mousse Figure 1 tape 5 Laissez la totalit du liquide retourner dans la bouteille h Retirez le collet de reconstitution de la bouteille Figure 1 tape 6 i Rebouchez la bouteille Inscrivez les initiales de l op rateur ainsi que la date de reconstitution sur l tiquette Figure 1 Etape 7 Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 13 502185FR R v E DTS Systems
129. s d urine K D pannage 1 Des valeurs de contr le positif faibles peuvent tre dues des temp ratures incorrectes lors des diff rentes tapes du test ou un temps de s lection ayant d pass la dur e recommand e lors de l tape de s lection 2 Des bruits de fond lev s peuvent survenir si le temps de s lection de l tape de s lection est court la s lection de temp rature est incorrecte ou en cas de m lange insuffisant apr s l ajout du r actif de s lection 3 Sile contr le n gatif APTIMA pour GC portant l tiquette CONTROL CT PCT CONTROL GC NGC est positif ou quivoque pour GC consultez la section Contamination des tests sous Remarques concernant la proc dure pour de plus amples informations Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 22 502185FR R v E TIGRIS DTS System TIGRIS Les r actifs du test GC APTIMA sont num r s ci dessous pour le DTS TIGRIS DTS System Les symboles d identification des r actifs figurent galement c t du nom du r actif R actifs et mat riels fournis Kit de test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 100 tests 2 bo tes et 1 kit de contr les r f rence 303092 2 x 50 tests 2 boites et 1 kit de contr les r f rence 302225 Boite r frig r e pour test APTIMA Neisseria gonorrhoeae Boite 1 sur 2 conserver entre 2 C et 8 C d s la r ception Quantit Symbole Composant Kit de 100 Kit de 2 x 50 tests tests A R actif
130. s dans une solution tamponn e de succinate contenant lt 5 de d tergent TCR B R actif de capture de cible B APTIMA 1x0 35 mL Acide nucl ique non infectieux dans une solution tamponn e contenant lt 5 de d tergent PGC Contr le positif GC contr le n gatif CT APTIMA 3x1 7mL NCT Acide nucl ique GC non infectieux dans une solution tamponn e contenant lt 5 de d tergent Chaque chantillon de 400 uL contient la quantit de rRNA estim e quivalente 50 cellules GC 250 fg test PCT Contr le positif CT contr le n gatif GC APTIMA 3x1 7 mL NGC Acide nucl ique CT non infectieux dans une solution tamponn e contenant 5 de d tergent Chaque chantillon de 400 uL contient la quantit de rRNA estim e quivalente 1 IFU de CT 5 fg test Les quivalents rRNA ont t calcul s d apr s la taille du g nome et le ratio estim DNA RNA cellule de chaque organisme La boite r frig r e comprend galement les articles suivants plateau de stockage conserver entre 2 C et 30 C d s la r ception Symbole Composant Quantit AR Solution de reconstitution de l amplification GC APTIMA 1x9 3 mL Solution aqueuse contenant des conservateurs ER Solution de reconstitution enzymatique APTIMA 1x3 3mL Solution tamponn e HEPES contenant un surfactant et du glyc rol PR Solution de reconstitution de sonde GC APTIMA 1x 12 4 mL Solution tamponn e de succinate contenant 5
131. s de capture Collets de reconstitution 3 Fiche de code barres du lot de r f rence 1 fiche Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 31 502185FR R v E PANTHER System Kit de contr les APTIMA conserver entre 2 C et 8 C d s la r ception Symbole Composant Quantit PGC Contr le positif GC contr le n gatif CT APTIMA 5x1 7mL NCT Acide nucl ique GC non infectieux dans une solution tamponn e contenant lt 5 de d tergent Chaque chantillon de 400 uL contient le rRNA estim quivalent 50 cellules de GC 250 fg test PCT Contr le positif CT contr le n gatif GC APTIMA 5x1 7 mL NGC Acide nucl ique CT non infectieux dans une solution tamponn e contenant lt 5 de d tergent Chaque chantillon de 400 uL contient le rRNA estim quivalent 1 IFU unit de formation des inclusions de CT 5 fg test Les quivalents rRNA ont t calcul s d apr s la taille du g nome et le ratio estim DNA RNA cellule de chaque organisme Mat riel requis mais disponible s par ment Remarque Le mat riel disponible aupr s de Gen Probe est indiqu par des r f rences catalogue sauf indication contraire PANTHER System Kit de solutions pour test APTIMA APTIMA Assay Fluids Kit solution de lavage APTIMA tampon APTIMA pour solution de d sactivation et r actif huileux APTIMA APTIMA Auto Detect Kit Unit s multi tube MTU Kit de sacs d chets PANTHER
132. s en milieu liquide PreservCyt ont t collect s au moyen d une spatule cytobrosse ou d un dispositif d chantillonnage cervical en brosse de type balai La distribution des dispositifs d chantillonnage cervical est r sum e au tableau 5 par site de collecte d chantillons et de mani re globale Les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt ont t trait s conform ment au Manuel de l op rateur du processeur ThinPrep 2000 ThinPrep 2000 Processor Operator s Manual et la notice du test du kit de transfert d chantillons APTIMA Apr s traitement de l chantillon de frottis en milieu liquide PreservCyt avec le processus ThinPrep 2000 l chantillon a t transf r dans le kit de transfert d chantillons APTIMA avec le test GC APTIMA La sensibilit et la sp cificit du test GC APTIMA avec les chantillons de frottis en milieu liquide PreservCyt ont t calcul es en comparant les r sultats l tat d infection des patients L algorithme comprenait les r sultats du test APTIMA COMBO 2 et du test GC APTIMA pour les chantillons endocervicaux sur couvillon Les deux NAAT de r f rence devaient tre positifs pour tablir l infection d un patient Au moins un NAAT de r f rence devait tre n gatif pour tablir que le patient n tait pas infect Le r sultat quivoque obtenu avec un NAAT de r f rence a t consid r discordant avec le test d investigation dans le calcul de la performance et l t
133. servCyt conform ment au Manuel de l op rateur du processeur ThinPrep 2000 et la notice du kit de transfert d chantillons APTIMA Transf rez 1 mL du liquide restant dans le flacon de solution PreservCyt dans un tube de transfert d chantillon APTIMA conform ment la notice du kit de transfert d chantillons APTIMA d Une fois l chantillon de frottis en milieu liquide PreservCyt Pap transf r dans le tube de transfert d chantillon APTIMA il doit tre test avec le test GC APTIMA dans les 30 jours s il est conserv entre 2 C et 8 C ou 14 jours s il est conserv entre 15 C et 30 C Si une dur e de conservation plus longue est n cessaire congelez le entre 20 C et 70 C jusqu 12 mois maximum apr s son transfert voir tudes de la stabilit des chantillons C Conservation des chantillons apr s les tests 1 Les chantillons qui ont t test s doivent tre rang s dans un portoir en position verticale 2 Lestubes de transport d chantillons doivent tre recouverts avec une nouvelle barri re de film plastique ou d aluminium propre 3 Si certains des chantillons test s doivent tre congel s ou envoy s retirez les bouchons p n trables et placez de nouveaux bouchons non p n trables sur les tubes de transport d chantillons Si les chantillons doivent tre envoy s dans un autre tablissement pour y tre test s les temp ratures recommand es doivent tre maintenues Avant de d
134. st APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 34 502185FR R v E PANTHER System 3 Pr paration du r actif de s lection a V rifiez que le num ro de lot sur le flacon de r actif correspond celui sur la fiche de code barres du lot de r f rence b Notez les initiales de l op rateur ainsi que la date du jour sur l tiquette Remarque M langez fond le r actif de sonde GC d amplification GC enzymatique GC et de s lection GC par retournement en douceur avant de le charger sur le syst me Veillez viter la formation de mousse pendant le retournement des r actifs C Pr paration des r actifs pour les r actifs pr c demment reconstitu s 1 Les r actifs sonde d amplification et enzymatiques pr c demment reconstitu s doivent parvenir temp rature ambiante entre 15 C et 30 C avant le d but du test 2 Sile r actif sonde GC reconstitu contient un pr cipit qui ne se remet pas en solution temp rature ambiante chauffer le flacon bouch une temp rature n exc dant pas 62 C pendant 1 2 minutes Apr s cela le r actif sonde GC peut tre utilis m me s il reste des pr cipit s r siduels M langez le r actif sonde GC par retournement en veillant ne pas former de mousse avant de le charger sur le syst me 3 M langez fond chaque r actif par retournement en douceur avant de le charger sur le syst me Veillez viter la formation de mousse pendant le retournement des r actifs 4
135. st avec les DTS Systems tude de pr cision L tude de pr cision du test GC APTIMA c d reproductibilit a t valu e dans deux sites cliniques externes et chez Gen Probe L tude de pr cision du test GC APTIMA a t valu e sur trois lots de kit de test GC APTIMA trois sites d tudes six op rateurs et 108 s ries de test GC APTIMA Deux op rateurs dans chacun des trois sites de test ont effectu un total de six s ries de test GC APTIMA par lot de kit pour un total de 36 s ries par lot de kit Chaque s rie tait compos e d un panel de pr cision de 12 membres contenant de 0 2433 fg test de rRNA GC La reproductibilit du test a t tablie en utilisant un milieu de transport des couvillons enrichi avec rRNA La reproductibilit lors des tests d chantillons sur couvillon et urinaires contenant l organisme cible n a pas t d termin e Le Tableau 9 indique les donn es RLU de pr cision en termes de Moyenne d Ecart type SD de Coefficient de variation CV et de pourcentage de concordance avec les r sultats attendus pour les calculs de variabilit entre sites entre lots entre op rateurs entre s ries et dans une m me s rie Tableau 9 Donn es de pr cision du test GC APTIMA en utilisant un panel de pr cision de 12 membres contenant de 0 2433 fg test de rHNA GC a D un site Sos D un op rateur D une s rie Intra s rie D un lot l autre Moyenne P
136. tion des contr les suppl mentaire pour la lyse cellulaire et la stabilisation du RNA peuvent tre requis Le contr le positif pour GC portant l tiquette CONTROL GC PGC CONTROL CT NCT contient du rRNA GC non infectieux Si des contr les suppl mentaires sont souhait s ils peuvent tre command s sous forme de kit La bonne pr paration des chantillons se confirme visuellement par la pr sence d un seul couvillon de collecte APTIMA dans un tube de transport d chantillons sur couvillon ou par un volume final d urine situ entre les lignes indicatrices noires d un tube de transport d chantillons d urine ou encore par l absence d un couvillon dans le tube de transport d chantillons APTIMA pour les chantillons de frottis en milieu liquide Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 38 502185FR R v E Interpr tation du test QC R sultats patients Les contr les positifs doivent produire les r sultats de test suivants Contr le Total de RLU x 1000 R sultat GC Contr le positif CT contr le n gatif GC Contr le positif GC contr le n gatif CT 0 et 50 N gatif 2 100 et lt 12 000 Positif Un r sultat RLU de z ro 0 x 1000 sur le rapport de la s rie correspond une valeur comprise entre z ro et 999 RLU Les valeurs RLU inf rieures 160 sur les DTS Systems ou 690 sur le TIGRIS DTS System ou le PANTHER System seront signal es comme tant non valides 1
137. tion des patients par tat des sympt mes et dans l ensemble pour les couvillons ur traux m les les chantillons d urine masculins les couvillons endocervicaux f minins les chantillons d urine f minins les couvillons vaginaux collect s par des patientes asymptomatiques et les couvillons vaginaux collect s par des cliniciens chantillon Ftat des N TP FP TN FN Sensibilit IC 95 Sp cificit IC 95 sympt mes cou Villon SYmptomatique 575 171 10 393 1 99 4 96 8 100 97 95 5 98 8 TRUE Symptomatique 576 171 400 1 99 4 96 8 100 990 97 5 99 Urine ri 745 9 5 7890 1 90 0 55 5 99 7 993 98 4 99 8 Tous 1321 180 9 11330 2 98 9 96 1 99 9 992 98 5 99 6 Symptomatique 805 52 8 744 1 98 1 89 9 100 989 97 9 99 cou villon Do 635 20 5 609 1 95 2 76 2 99 9 992 98 1 99 7 Tous 1440 72 13 1353 2 97 3 90 6 99 7 990 98 4 99 5 Femme Symptomatique 810 48 2 755 5 90 6 79 3 96 9 99 99 0 100 Urine E CUT 639 21 1 616 1 95 5 77 2 99 9 99 8 99 1 100 Tous 1449 69 3 1371 6 92 00 834 970 998 994 100 Collect cou UON par la villon d Pe 629 21 4 64 o0 100 83 9 100 99 3 98 3 99 8 patiente vaginal 3 Symptomatique 809 52 7 749 1 98 1 89 9 100 99 98 1 99 6 Collect cou ne parun villon p A 637 21 4 61 1 955 77 2 99 9 993 98 3 99 8 clinicien vaginal q Tous 1446 73 11 1360 2 97 3 90 7 99
138. tion du tube de collecte est d pass e L La solution PreservCyt a t valid e en tant que milieu alternatif pour l analyse par le test GC APTIMA Les chantillons de frottis en solution PreservCyt trait s avec le processeur ThinPrep 3000 ou d autres instruments n ont pas t valu s pour la d tection de Neisseria gonorrhoeae au moyen du test APTIMA GC M Une fois l urine vers e dans le tube de transport d urine le niveau de liquide de ce tube doit se situer entre les deux lignes indicatrices noires sur l tiquette du tube Dans le cas contraire l chantillon doit tre rejet N Observez des conditions de conservation ad quates pendant le transport des chantillons pour pr server leur int grit La stabilit des chantillons dans des conditions de transport autres que celles recommand es n a pas t valu e O Les chantillons peuvent tre infectieux Utilisez les Pr cautions universelles en effectuant ce test Le responsable du laboratoire devra avoir tabli des m thodes de manipulation et d limination des d chets ad quates Seul le personnel ayant re u une formation ad quate pour manipuler des substances infectieuses devrait tre autoris effectuer cette proc dure de diagnostic P vitez toute contamination crois e lors des tapes de manipulation des chantillons Les chantillons peuvent contenir des taux d organismes tr s importants Veiller viter tout contact entre les diff rents
139. tions concernant les laboratoires D N utilisez que le mat riel de laboratoire jetable fourni ou recommand E Prenez les pr cautions de laboratoire habituelles Ne pas manger boire ou fumer dans les zones de travail signal es Portez des gants jetables sans poudre des lunettes de protection et des blouses de laboratoire pour manipuler les chantillons et les r actifs du kit Lavez vous bien les mains apr s avoir manipul les chantillons et r actifs du kit F Avertissement produits irritants et corrosifs viter tout contact d Auto Detect 1 et Auto Detect 2 avec la peau les yeux et les muqueuses En cas de contact de ces liquides avec la peau ou les yeux lavez la zone affect e l eau En cas de d versement de ces liquides diluer le produit r pandu l eau avant de l essuyer G Les plans de travail pipettes et tout autre mat riel doivent tre r guli rement d contamin s avec une solution d hypochlorite de sodium dos e de 2 5 3 5 96 0 35 M 0 5 M Recommandations sp cifiques aux DTS Systems H Il est fortement recommand de r server un espace de travail sp cifique au test HPA pour minimiser la contamination par l amplicon lors du test Cette zone de travail devrait tre loign e du lieu de pr paration du r actif de capture de cible et d amplification l Pour viter la contamination des diff rentes zones du laboratoire par l amplicon le sens de travail du laboratoire devrait tre unidirectio
140. titudes sup rieures 2000 m tres W Il n existe aucune preuve de la d gradation des acides nucl iques dans la solution PreservCyt Si un chantillon de frottis en milieu liquide PreservCyt contient une faible quantit de mat riel cellulaire de GC il peut se produire une distribution irr guli re de ce mat riel cellulaire De m me lorsqu on le compare l chantillonnage direct avec le milieu de transport d chantillons APTIMA le volume additionnel de la solution PreservCyt donne des dilutions plus importantes du mat riel chantillonn Ces facteurs peuvent affecter la capacit d tecter des petites quantit s d organismes dans le mat riel collect Si les r sultats n gatifs de l chantillon ne correspondent pas l impression clinique il peut tre n cessaire d utiliser un nouvel chantillon X Les clients doivent valider ind pendamment un processus de transfert LIS Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 42 502185FR R v E R sultats des tudes cliniques R sultats des tudes cliniques Les caract ristiques de performance du test GC APTIMA ont t tablies au cours de deux investigations cliniques r alis es en Am rique du Nord La premi re investigation clinique a tabli la sensibilit la sp cificit et les valeurs pr dictives du test GC APTIMA en utilisant des chantillons endocervicaux vaginaux et ur traux m les collect s par un clinicien l aide d un couvillon des chantill
141. ts de test pr cis Pour de plus amples d tails consultez les Proc dure de test avec les DTS Systems Remarques concernant la proc dure AA R servez des bains marie distincts aux tapes de capture de cible d amplification et HPA lors du test AB La reproductibilit du test a t tablie en utilisant le milieu de transport des couvillons ensemenc avec rRNA La reproductibilit lors des tests d chantillons sur couvillon et urinaires contenant l organisme cible n a pas t d termin e AC Les cartes de protection doivent tre jet es dans le r cipient d chets imm diatement apr s avoir t retir es des tubes r actionnels Des cartes de protections neuves doivent toujours tre utilis es elles ne doivent jamais tre r utilis es d une tape l autre Les cartes de protection doivent tre fermement appos es sur le dessus de tous les tubes r actionnels Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 6 502185FR R v E Informations g n rales Conditions de conservation et de manipulation des r actifs A Les r actifs suivants sont stables lorsqu ils sont conserv s entre 2 C et 8 C r frig r s R actif d amplification GC APTIMA R actif enzymatique APTIMA R actif sonde GC APTIMA R actif de capture de cible B APTIMA Contr le positif GC contr le n gatif CT APTIMA Contr le positif CT contr le n gatif GC APTIMA B Les r actifs suivants restent stables lorsqu ils sont conserv s entre 2
142. utes les zones couvillonner Si les r sultats sont positifs ou non probants pour GC reportez vous la section Interpr tation du test QC R sultats patients Pour des informations suppl mentaires sur le contr le de la contamination sp cifiques au PANTHER System contactez le Service technique de Gen Probe Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 37 502185FR R v E Interpr tation du test QC R sultats patients Interpr tation du test QC R sultats patients A Interpr tation des tests Les r sultats des tests sont interpr t s automatiquement par le logiciel de test APTIMA en utilisant le protocole GC Un r sultat de test peut tre n gatif quivoque positif ou invalide tel que d termin par le nombre total de RLU dans l tape de d tection voir ci dessous Un r sultat de test peut tre invalide si l un des param tres RLU se situe en dehors des seuils normalement pr vus Si les premiers r sultats du test sont quivoques ou non valides le test doit tre refait Interpr tation des tests Total de RLU x 1000 N gatif 0 50 Equivoque 50 100 RLU faiblement positif 100 lt 2000 Positif 2000 lt 12 000 Non valide 0 ou gt 12 000 D AAOAAQEAEA E EE Un r sultat RLU de z ro 0 x 1000 sur le rapport de la s rie correspond une valeur comprise entre z ro et 999 RLU Les valeurs RLU inf rieures 160 sur les DTS Systems ou 690 sur le TIGRIS
143. utilisation de ce test est limit e au personnel ayant t form la proc dure Le non respect des instructions figurant dans cette notice peut donner lieu des r sultats erron s B Les effets de l utilisation de tampons hygi niques de toilettes vaginales et l impact des variables de la collecte des chantillons n ont pas t valu s pour la d tection de GC C La pr sence de mucus dans les chantillons endocervicaux n interf re pas avec la d tection de GC par le test GC APTIMA Toutefois pour assurer l obtention d chantillons endocervicaux corrects l exc s de mucus doit tre retir D L chantillonnage des chantillons d urine vaginaux sur couvillon et de frottis en milieu liquide PreservCyt n est pas destin remplacer les examens cervicaux et les chantillons endocervicaux dans le diagnostic des infections urog nitales chez la femme Les patientes peuvent souffrir de cervicites ur trites infections urinaires ou infections vaginales dues d autres causes ou des infections parall les par d autres agents E Le test GC APTIMA n est pas pr vu pour l valuation d abus sexuels pr sum s ou d autres fins m dico l gales Pour les patients chez qui des r sultats faussement positifs peuvent avoir un impact psychosocial n faste le CDC recommande d effectuer un nouveau test avec une autre m thode 1 F La fiabilit des r sultats d pend de la qualit de la collecte des chantillons tant
144. ux invalides y a eu 2 chantillons exclus de cette analyse pour cause de r sultats finaux invalides De plus il manquait 1 r plicat de chaque membre de panel n gatif avec 2500 fg de rRNA GC test dans deux listes de travail et 1 liste de travail comportait un r plicat suppl mentaire d un membre du panel avec 2500 fg rRNA GC test y a eu 2 chantillons exclus de cette analyse pour cause de r sultats finaux invalides De plus une liste de travail comportait 1 r plicat suppl mentaire d un membre du panel avec 25 000 fg de rRNA GC test II manquait galement cette m me liste de travail 1 r plicat d un autre membre du panel avec 25 000 fg de rRNA GC test manquait une liste de travail 1 r plicat d un membre du panel avec 250 000 fg de rRNA GC test Remarque Les chantillons dont les r sultats aux tests taient invalides ont t exclus L analyse de variabilit du signal comporte des chantillons avec des r sultats discordants Test APTIMA pour Neisseria gonorrhoeae 67 502185FR R v E Performance analytique du TIGRIS DTS System Performance analytique du TIGRIS DTS System Consultez la section Performance analytique du PANTHER System pour la performance analytique sp cifique au PANTHER System tude de l quivalence de la sensibilit analytique Les panels de sensibilit des pools d chantillons endocervicaux sur couvillon pools d chantillons vaginaux sur couvillon pools d chantillons
145. visible une fois l aspiration termin e le tube peut tre accept Si aucune bille n est visible l chantillon doit tre test nouveau Si le m me chantillon ne contient pas de bille de particule magn tique dans cette tape et lors d une s rie ult rieure ceci peut indiquer un probleme li l chantillon Il est alors recommand d effectuer une nouvelle collecte de l chantillon D Amplification Si vous utilisez le bain chaleur s che vortexeur SB100 SB100 Dry Heat Bath Vortexer r f rez vous la fiche d application du SB100 1 A l aide du pipeteur r p tition ajoutez 75 uL du r actif d amplification GC reconstitu dans chaque tube r actionnel Tous les m langes r actionnels du portoir doivent maintenant tre rouges 2 A l aide du pipeteur r p tition ajoutez 200 uL de r actif huileux dans chaque tube r actionnel 3 Couvrez les tubes avec une carte de protection et vortexez les sur le vortexeur m langeur tourbillon multi tubes 4 Faites incuber le portoir dans un bain marie 62 C 1 C pendant 10 5 minutes Transf rez le portoir dans un bain marie 42 C 1 C et incubez pendant 5 2 minutes 6 Une fois le portoir dans le bain marie retirez soigneusement la carte de protection et l aide du pipeteur r p tition ajoutez 25 pL du r actif enzymatique reconstitu dans chaque tube r actionnel Tous les m langes r actionnels doivent maintenant avoir une tei

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