31326 CASTANET TOLOSAN CAHIER DES CLAUSES
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1. Mesure de la vitesse d acquisition d une image en 512x512 D rive en XY et fonction du temps Test de repositionnement des l ments de d placement XYZ Test de co localisation avec des billes fluorescentes dans 3 couleurs GINEAN UMS 1337 TWB microscopie fluorescence2. en service par le titulaire interviendra dans un d lai maximum de 20 jours compter de la date de livraison Une d cision tablie par l INRA validera la mise en service du mat riel 3 5 Formation du personnel de TWB Une proposition pour la formation du personnel l utilisation du mat riel sera propos e et chiffr e elle comprendra Une proposition de formation d utilisateurs sur site pour 5 6 personnes Une proposition de formation pour un ing nieur sur site 3 6 Garantie et maintenance Offre de base Pour cet quipement la garantie contractuelle comprend pi ces main d uvre et d placements sur une p riode de 36 mois incluant la premi re ann e de garantie l gale Option 3 L entreprise chiffrera en option le co t d une extension de garantie pi ces main d uvre et d placements pour une p riode suppl mentaire d un an Dans son devis l entreprise pr cisera les tarifs et d lais pour les interventions d urgence ainsi que les tarifs horaires pour les op rations de maintenance ou de r paration avec co ts de d placement 3 7 Admission du mat riel Le titulaire proc dera l admission et aux v rifications des performances de l appareil dans un d lai de 20 jours compter de la mise en service Un PV validant l admission et la formation des utilisateurs sera tabli Les tests op r s devront valider les contr les suivants V rification de la puissance des lasers
3. fluorescence droit champ large Eclairage fond clair halog ne 100W minimum Le Z sera motoris et un syst me piezzo quipera l objectif 60x Le condenseur sera motoris Platine motoris e XY avec encodeur pour la correction de d placement Tourelle d objectifs motoris e Dispositif pifluorescence motoris Eclairage fluo LED au moins 6 LED avec filtres interchangeables Cubes fluo simple bande pour une large gamme de fluorochromes DAPI CFP RFP GFP fluoresc ine YFP TMR TRITC mCherry Alexa 594 Cy5 Syto9 Nile Red IP T te imagerie double sortie cam ra avec s lecteur de lumi re motoris et zoom optique sur l une des sorties Objectif plan qualit fluo 10x sec 20x sec 40x immersion Objectif plan apochromatique qualit fluo 60x immersion et 100x immersion Ouverture num rique au moins gale 1 4 pour ces 2 objectifs Contraste interf rentiel DIC pour le 40x 60 et 100x Une cam ra num rique noir et blanc type SCMOS 5 millions de pixels demeure Une cam ra num rique CCD couleur 5 millions de pixels demeure La plateforme devra tre volutive vers la technique du FRET et du FRAP Partie informatique gt gt L ordinateur et le logiciel pour la capture d image seront dimensionn s et fournis dans l offre Deux moniteurs de 22 pouces ou un moniteur de 30 pouces sera fournis dans l offre Le logiciel sera fourni avec 2 licences une active install e sur le poste d acquis
4. GES 3 1 Objet du march Le pr sent march porte sur la fourniture la livraison l installation et la mise en service d un microscope champ large fluorescence et la formation du personnel des plateformes de TWB 1 utilisation de ce mat riel L appareil sera utilis pour l analyse de cellules bact riennes de levures ou de champignon filamenteux entre lame et lamelle 3 2 Forme de la r ponse Chaque fournisseur pourra r pondre conform ment au r glement de la consultation le candidat fournira un dossier complet d crivant a aa e Devis d taill avec les caract ristiques techniques du mat riel e Une proposition pour la prise en charge de l installation de cet quipement dans les locaux D lais de livraison D lai d intervention du service apr s vente en cas de panne Un devis pour la maintenance Un manuel d utilisation au format papier Un manuel contenant les consignes de s curit au format papier et informatis Le mat riel livr devra b n ficier d une garantie pi ces main d uvre et d placements selon les conditions d crites dans le pr sent document article 3 6 e Une proposition de solution pour la formation du personnel l utilisation du mat riel comme d crit l article 3 5 ci dessous INRA SCIENCE amp IMPACT UMS 1337 TWB microscopie fluorescence 3 3 Caract ristiques techniques Partie miscroscope VVVVVVVYVYY VV V V VVY Microscope
5. TT SCIENCE amp IMPACT Institut National de la Recherche Agronomique Centre de Toulouse 31326 CASTANET TOLOSAN CAHIER DES CLAUSES TECHNIQUES PARTICULIERES C C T P Personne publique contractante Institut National de la Recherche Agronomique Centre de recherches de Toulouse 24 Chemin de Borde Rouge CS 52627 31326 CASTANET TOLOSAN Cedex OBJET Acquisition d un microscope fluorescence champ large SCIENCE amp IMPACT UMS 1337 TWB microscopie fluorescence Table des mati res ARTICLE 1 CONTEXTE GENERA assises osie dinae ner AR ACA GRADEC re ia eE a NEEE e EEE EEK 1 1 Pr sentation de FINRA S acciones teneur tn ersteenne a adaa tete mere creme n es 1 2 Pr sentation de PUMS 1337 TWB iii 2 ARTICLE 2 INTERET SCIENTIFIQUE ET DEFINITION DES BESOINS cc ccciciciiicici cici ii iiiceea ieii 3 ARTICLE 3 CAHIER DES CHARGES se 22402 c t Cefd est tie tnina etes eieiei eiaa eaS 3 1 Objet dU march eesriide srar aaa I TEER EN OAAR 3 2 Form de la r ponse Ni mnt ANAS EEE ESE 3 3 Caract ristiques techniques 3 4 Livraison et installation sur site sens 3 5 Formation du personnel de TWB iii 3 6 Garantie et maintenance sister ennemie durant einen nnite te 3 7 Admissi Ndu mat rie Nssimi ainai an a e a ained ea oE a EE Eae iaa SEST SENES IMPACT UMS 1337 TWB microscopie fluorescence ARTICLE 1 CONTEXTE GENERAL 1 1 Pr sentation de l INRA L Institut Na
6. e faisabilit jusqu au pilote pr industriel SEET Soca Pur UMS 1337 TWB microscopie fluorescence 2 ARTICLE 2 INTERET SCIENTIFIQUE ET DEFINITION DES BESOINS Le bon fonctionnement des plateformes de TWB n cessite la pr sence de services plateforme communs permettant d assurer les t ches basales de routine Les syst mes de microscopie fluorescence font partie de l quipement commun central et seront exploit s par les diff rentes activit s de TWB Ces syst mes permettront l analyse de prot ines fluorescentes de type Green Fluorescent Protein GFP et de divers marquages fluorescents au sein de cellules Il s agira notamment de d tecter des mol cules d ARN uniques par la d tection de Fluorescent In Situ Hybridisation FISH La m thode dite Single Molecule RNA FISH d tecte et quantifie des ARN messagers ARNm ou d autres mol cules d ARN longues au sein d une population de cellules isol es ou au sein d une fine couche de tissu Les cibles peuvent tre visualis es de mani re reproductible par l hybridation de multiples sondes oligonucl otidiques courtes marqu es individuellement La liaison d un nombre de sondes marqu es de mani re fluorescente allant jusqu 48 sondes sur une mol cule d ARNm unique fournit suffisamment de fluorescence pour d tecter de mani re fid le et localiser chaque ARNm cible dans un champ de microscope fluorescence champ large 3 ARTICLE 3 CAHIER DES CHAR
7. ition et une passive pour un poste d port de retraitement des images Le logiciel permettra le pilotage du microscope l acquisition d image et l analyse d image L analyse d image permettra des mesures prenant en compte les dimensions spatiales en X Y et Z le temps les longueurs d onde et l intensit de fluorescence Le logiciel permettra la co localisation la reconstruction 3D la d convolution et la r alisation de mosa ques de plusieurs champs Le logiciel devra inclure de base des modules permettant les acquisitions FRET et FRAP Les proc dures logicielles de calibration interne doivent tre accessibles et le personnel sur la plateforme est form pour comprendre le r sultat des tests fournis Les nouvelles versions du logiciel sont fournir titre gracieux durant 10 ans Options Option 1 sera propos e une table anti vibratoire L air comprim 5 bar tant disponible au laboratoire Option 2 Module permettant des acquisitions haut d bit type HCS 3 4 Livraison et installation sur site Le mat riel sera install et mis en service dans les locaux de TWB sur le site du Canal Biotech au rez de chauss e E S SCIENCE amp IMPACT UMS 1337 TWB microscopie fluorescence TWB Parc Technologique du canal 3 rue des satellites 31400 Toulouse La livraison du mat riel interviendra entre le 15 Octobre 2013 et le 5 Novembre 2013 Un PV tabli par l INRA validera la livraison du mat riel La mise
8. le d expertise en biotechnologies blanches au niveau national voire international Sur la base des comp tences du Laboratoire d Ing nierie des Syst mes Biologiques et des proc d s LISBP de l INSA Toulouse les axes de recherche majeurs abord s au sein des plateformes de TWB sont centr s sur la mise en place de proc d s de bioconversions utilisant du carbone d origine renouvelable Le travail de TWB est bas sur l utilisation de l ing nierie m tabolique de l ing nierie enzymatique et de l ing nierie des consortia microbiens TWB int gre 6 plateformes techniques une plateforme de sciences humaines et sociale et collabore activement avec plusieurs plateaux technique des plateformes GenoToul Actuellement en cours d installation les plateformes TWB seront quip es de moyens techniques performants comprenant de l quipement analytique chromatographie spectrom trie de masse des automates d di s la r alisation d op rations haut et tr s haut d bit enzymologie culture criblage et biologie mol culaire un parc de fermenteurs originaux et des quipements associ s des plateformes de services communs p riph riques Autoclaves purification de prot ines incubateurs Les plateformes techniques de TWB seront hautement interconnect es et permettront de r aliser des projets de recherches collaboratifs travers une approche globale permettant de travailler depuis le niveau du concept d
9. tional de la Recherche Agronomique INRA fond en 1946 est un organisme de recherche scientifique publique finalis e plac sous la double tutelle du minist re de l Enseignement sup rieur et de la Recherche et du minist re de l Alimentation de l Agriculture et de la P che Ses recherches concernent les questions li es l agriculture l alimentation et la s curit des aliments l environnement et la gestion des territoires avec un accent tout particulier en faveur du d veloppement durable Ses missions g n rales sont de produire et de diffuser des connaissances scientifiques de concevoir des innovations et des savoir faire pour la soci t d clairer par son expertise les d cisions des acteurs publics et priv s de d velopper la culture scientifique et technique et participer au d bat science soci t de former la recherche et par la recherche 1 2 Pr sentation de PUMS 1337 TWB L Unit mixte de service UMS 1337 Toulouse White Biotechnology TWB a t officiellement cr e le 01 04 2011 par le regroupement de 2 membres fondateurs l INRA et l Institut National des Sciences Appliqu es INSA de Toulouse La cr ation de cette UMS fait suite la nomination de TWB au programme d investissement d avenir 2010 de l Agence Nationale pour la Recherche dans la cat gorie d monstrateur pr industriel Cette infrastructure projette de devenir moyen terme un p
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