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RAPPORT ANNUEL 2005

1. Besoins et th matiques S minaire de fin de projet S2E ARGOS Ouagadougou avril 2005 Jeanne I J Polcher K Ginoux A Diedhiou JB Duchemin AMMA Health impacts Atelier Health and Environment Commission Europ enne Bruxelles juin 2005 CERMES PNLP SNIS IRI OMS Coop ration Fran aise FRP Sahel Outils pour la sant publique Atelier RBM Sahel Niamey juillet 2005 46 10 Grais RF MJ Ferrari ACK Conlan C Dubray A Djibo F Fermon JP Guthmann KA Alberti P Strebel I Jeanne BS Hersh PJ Guerin ON Bjornstad BT Grenfell Measles Vaccination in Epidemic Contexts Journ e scientifique Epicentre Paris Mai 2005 Jeanne I Health and Climate Scale in time scale in space XVI Congr s International Medicine and Health in the Tropics Marseille septembre 2005 Jeanne I Defossez A Rajot JL Kiari KK Kalache M Boisier P Health and climate dust and meningitis Atelier Climat et sant de l Acmad Niamey 22 au 25 novembre 2005 Jeanne I amp Thomson M Utility of GIS and ARGOS data collection systems for the monitoring and early warning of epidemics Colloque International Challenges in the African Meningitis Belt Communication orale Niamey 26 29 novembre 2005 23 Jeanne I Defossez A Rajot JL Kan KK Kalache M Boisier P Dust and Meningitis first preliminary results 1 conf rence internationale AMMA 28 au 2 d cembre 2005 Ngor Dakar Jeanne I Healt
2. des milliers de cas Par contre hors contexte d pid mie comme en 2005 le pneumocoque est le principal agent en cause Le traitement le plus souvent utilis le chloramph nicol injectable en dose unique recommand en situation d pid mie de m ningite m ningocoques n est pas un traitement de choix pour le pneumocoque Or l analyse des donn es montre que la majorit des suspicions de m ningite sont trait es de mani re indiscrimin e par chloramph nicol S il est peu probable qu on puisse baisser fortement la l talit des m ningites m ningocoques qui est globalement voisine de celle qu on observe dans les pays d velopp s il y a un gros potentiel d am lioration de la l talit des m ningites pneumocoque 16 Cette tude montre clairement que les recommandations pour la prise en charge des m ningites sont r valuer pour une meilleure adaptation aux diff rentes tiologies et au contexte pid miologique Elle illustre aussi la n cessit imp rieuse d am liorer les capacit s de diagnostic au plus pr s du malade pour porter l indication th rapeutique sur des crit res objectifs Enfin elle illustre le poids tr s sous estim que repr sentent les m ningites pneumocoque sur la sant publique Figure 3 Evolution des cas de m ningites selon l tiologie Niger 2005 700 600 500 5 400 300 Z S 200 p L talit L talit 34 5 L
3. Corty JF Guillerm M Alberti KP Pinoges L Guerin PJ amp Legros D 2005 Ceftriaxone as effective as long acting chloramphenicol in short course treatment of meningococcal meningitis during epidemics a randomised non inferiority study Lancet 366 308 13 Mindadou H Sidikou F Boisier P amp Chanteau S 2005 Pr valence de la m ningite tuberculeuse l h pital de Niamey Niger Bulletin de la Soci t de Pathologie Exotique 99 39 40 Chanteau S et Nato F 2005 Diagnostic rapide des maladies bact riennes potentiel pid mique M decine et Maladies Infectieuses 35 Suppl 2 S100 2 Chanteau S Sidikou F Djibo S Moussa A Mindadou H amp Boisier P 2006 Scaling up of PCR based surveillance of bacterial meningitis in the African meningitis belt indisputable benefits of multiplex PCR assay in Niger Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene sous presse Djibo S Njanpop Lafourcade BM Boisier P Moussa A Kobo G Sidikou F Hien A Bieboure G Aguilera J F Parent du Chatelet I amp Chanteau S 2006 Evaluation of the Pastorex Meningitis kit for the rapid identification of Neisseria meningitidis serogroups A and W135 Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene sous presse Borel T Rose AN Guillerm M Sidikou F Gerstl S Djibo A Chanteau S amp Gu rin PJ 2006 Sensitivity and specificity of the Pastorex latex agglutination test for Neisseria meningitidi
4. Genetics amp Evolution 5 340 8 Rasolofo Razanamparany V Quirin R Rapaoliarijaona A Rakotoaritahina H Vololonirina EJ Rasolovanalona T Ferdinand S Sola C Rastogi N Ramarokoto H amp Chanteau S 2006 Usefulness of restriction fragment lenght polymorphism and spoligotyping for epidemiological studies of Mycobacterium bovis in Madagscar description of new genotypes Vet Microbiology 114 sous presse Dubray C A Gervelmeyer A Djibo I Jeanne F Fermon RF Grais amp PJ Guerin 2006 Late vaccination reinforcement during a measles epidemic in Niamey Niger 2003 2004 Vaccine sous presse Ouwe Missi Oukem Boyer O Mezui Me Ndong J Boda C Lamine I Labrousse F Bisser S amp Bouteille B 2006 The vervet monkey Chlorocebus aethiops as an experimental model for Trypanosoma brucei gambiense human African trypanosomiasis a clinical biological and pathological study Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene in press 2 Communications orales ou affich es 2 1 M ningites l Chanteau S amp Nato F Diagnostic rapide des maladies bact riennes potentiel pid mique Journ es Nationales d Infectiologie Soci t Fran aise d Infectiologie Communication orale Nice France Juin 2005 Djibo S Chippaux J P Boisier P Moussa A Sidikou F Kourna M amp Chanteau S Bacterial meningitis in infants under 1 year old in Niamey Niger from 1996 to 2005 XVI me Congr s
5. emploi pour la riposte aux pid mies doit tre justifi par un diagnostic pr cis du s rogroupe en cause La surveillance microbiologique des m ningites bact riennes est donc plus n cessaire que jamais alors que les laboratoires restent rares et sous quip s Le d veloppement de nouveaux outils pour un diagnostic simple et rapide r alisable si possible au lit du malade est donc un enjeu majeur Alors que l objectif principal de la lutte contre les m ningites est de diminuer la mortalit qu elles induisent on s apercoit que celle ci est tr s mal connue Sa mesure ainsi que l identification des l ments qui l expliquent comme la r sistance des germes aux antibiotiques sont des objectifs op rationnels de premi re importance pour la sant publique Concernant l histoire naturelle de l infection m ningocoques de nombreux points restent mal document s comme les facteurs de risque de d velopper une forme invasive quand la grande majorit des infections est asymptomatique 1 Surveillance microbiologique des m ningites bact riennes Le CERMES est le laboratoire national de r f rence pour les m ningites au Niger En 2002 a la suite du transfert des techniques de diagnostic mol culaire des m ningites N meningitidis A pneumoniae et H influenzae par l Unit des Neisseria de l Institut Pasteur la surveillance microbiologique des m ningites bact riennes au Niger a t tendue a la plus grande partie d
6. s fin 2004 ont t achev s en Mai 2005 La r ception des premiers quipements r actifs et petits mat riels s est faite tr s lentement Le CERMES a affect au LNR un surveillant de laboratoire temps partiel et recrut un ing nieur biologiste en attendant l affectation de personnel suppl mentaire Les premi res activit s du LNR ont d marr en juillet 2005 Le CERMES n a pas re u de cr dits suppl mentaires pour supporter les charges structurelles li es au fonctionnement de ce nouveau laboratoire Les proc dures administratives complexes ne permettent pas un fonctionnement 37 harmonieux du LNR A la fin de l ann e 2005 le LNR n tait pas en mesure d assurer toutes les missions qui lui ont t confi es 1 Suivi biologique des patients de I Initiative Nig rienne d Acc s aux ARV INAARV Il s agit d une activit subventionn e par l INAARV Les r actifs et consommables sont fournis par la Direction des Pharmacies et Laboratoire du Minist re de la Sant Publique Le CERMES re oit les pr l vements Cette activit n a pu d marrer que le 15 juillet 2005 d s la fin des travaux de r fection du laboratoire Malgr quelques difficult s li es au manque de moyens de fonctionnement nous avons pu traiter les 936 analyses demand es par les diff rents centres prescripteurs 2 Enqu tes de s ropr valence VIH S ropr valence chez les femmes enceintes et les prostitu es des zones d inte
7. ses activit s de terrain au troisi me trimestre 2004 en m me temps que les programmes de lutte du Burkina Faso et du Mali L objectif principal du PNLBG est le contr le de la morbidit due la schistosomose et la strat gie pour l atteindre est l administration annuelle aux populations risque d une dose unique de praziquantel produit tr s efficace bon march et bien tol r Le traitement ne d barrasse que temporairement de leurs parasites les individus vivant en zone de transmission mais il permet que les sujets infect s ne soient jamais porteurs d une charge de parasites suffisamment importante pour induire les complications qui font la gravit de cette affection 35 1 Evaluation de l efficacit du Programme National de Lutte contre la Schistosomose et les G ohelminthes L tape de recueil des donn es de r f rence avant toute intervention s est poursuivie en avril et mai 2005 dans la r gion de Tahoua zone d extension du programme national de lutte Les enfants de 7 8 et 11 ans de 4 nouveaux villages ont t inclus dans le suivi de cohorte 80 par tranche d age et par village portant a 8 le nombre des villages suivis Les indicateurs cliniques parasitologiques et chographiques ont t recueillis et des informations sur la pr valence de l infection a Plasmodium falciparum ont t ajout es au protocole initial pour mieux documenter les tiologies de l an mie et l association entre
8. 4 villages dans chacune des 3 zones bioclimatiques du Niger Pr valence parasitaire Saison s che fraiche n Saison s che chaude n Zone In Gall pr saharien 0 7 150 4 7 126 Zone Tessaoua sah lien 26 1 594 25 2 147 Zone Gaya soudanien 25 5 525 28 8 511 Sur le plan de la dynamique temporelle le suivi des deux villages Dantiandou et Banizoumbou dans la zone sah lienne de Dantiandou montre un renforcement de la pr valence parasitaire pendant la saison des pluies mais variable selon les ann es figure 2 avec des valeurs minimales proches de celles enregistr es dans les autres stations sauf la station de In Gall Pr valence parasitaire Zone de Dantiandou A Tn A Zindarou Lu ren HP 0 aout oct dec fev avri jun aout oct dec fev avr jun aout oct 2003 2003 2003 2004 2004 2004 2004 2004 2004 2005 2005 2005 2005 2005 Figure 2 Pr valence parasitaire population g n rale dans les villages de Dantiandou et Banizoumbou Fl ches grises pics de pr cipitations Polymorphisme des souches de Plasmodium falciparum Nous avons utilis la m thode d analyse du polymorphisme de taille des fragments amplifi s des g nes MSP 1 et MSP 2 Mais depuis 2005 pour une meilleure pr cision et une meilleure sensibilit pour les pics mineurs nous avons introduit des sondes marqu es au fluorochrome pour les deux familles all liques de MSP2 3D7 et FC27 Le polymorphisme des s
9. Direction de Surveillance et de Contr le Epid miologique DSCE du Minist re de la Sant Ce syst me de surveillance est l un des plus performant des pays de la ceinture africaine de la m ningite Cependant les donn es restent trop agr g es dans l espace et dans le temps par rapport a la r solution des images qui nous sont fournies L tude des relations avec le climat et les poussi res par l obtention de donn es satellites et stationnaires se fait en collaboration avec des scientifiques de la chimie de l atmosph re Nous avons d velopp des animations automatis es des cartes des poussi res et de cartes des cas de m ningites la m me chelle Nous avons analys les relations dans le temps et dans l espace des pics maximum de poussi res et les augmentations de cas de m ningites l chelle de la semaine depuis 1995 servant aussi dans le cadre au projet AMMA EU Les premiers r sultats ont t pr sent s lors du colloque international sur les m ningites Niamey en novembre 2005 RBM Sahel Faire Reculer le Paludisme au Sahel Le projet RBM Sahel s inscrit dans un axe de recherche sur la transmission du paludisme Les activit s de l Unit SEC se font en troite collaboration avec l Unit de Parasitologie pour les donn es sur la morbidit et la transmission palustre La base de donn es sera int gr e dans un SIG corr l aux diff rentes informations g or f renc es que nous avons obtenu par aille
10. Sant Environnement Climat SEC sont le Paludisme et les M ningites Les activit s de l unit depuis 3 ans ont consist a e mettre en place les outils et les moyens n cessaires l analyse spatiale et temporelle de la transmission du paludisme et de l incidence des cas de m ningites e recueillir des informations environnementales et climatiques des chelles compatibles avec les donn es sanitaires dans le temps et dans l espace e tablir des collaborations avec les organismes sp cialis s afin d identifier et d obtenir les param tres climatiques et environnementaux les plus pertinents En ce qui concerne le paludisme cet axe de recherche b n ficie de plusieurs financements compl mentaires correspondant des volets diff rents L objectif g n ral est l tude des relations entre l environnement et le paludisme et leurs applications pour l valuation du risque pid mique et le contr le de la maladie L Unit SEC travaille troitement avec l Unit Parasitologie pour le volet sur la transmission Quant la m ningite au Sahel l influence du facteur saisonnier sur l apparition des cas et des pid mies est vidente Si dans la dynamique des pid mies de m ningites l mergence d un nouveau clone de m ningocoque et les caract ristiques des populations ont un r le majeur niveau socio conomique immunit densit mouvements les m canismes par lesquels des facteurs climatiques pourra
11. Soumis La r partition du budget 2005 par source de financement figure dans le tableau 2 Subvention de Etat 100 000 000 FCFA 17 63 Recettes propres 50 000 000 FCFA 8 81 Financement de la recherche 417 368 666 FCFA 73 56 dont 91 200 827 FCFA de report 2004 sur 2005 2 2 Le budget r alis Les r alisations 2005 hors report 2004 sont de 432 837 978 CFA 90 9 des pr visions soit e Subventions Etat 73 023 millions r alis s sur 100 M soit 73 e Recettes propres 47 303 millions r alis s sur 50 M soit 94 60 e Projets de recherches 312 511 millions r alis s sur 326 167 millions soit 95 81 La subvention de l Etat a t port e 100 millions dont 73 M vers s en 2005 et 18 75 M en 2006 Elle reste insuffisante pour couvrir les charges structurelles de l tablissement 150 M Ainsi le total budget disponible de 2005 est de 567 368 666 CFA dont 87 sont repr sent s par les cr dits g n r s gr ce au dynamisme des quipes et la pertinence des projets Dans les fonds re us en 2005 pour la recherche 312 511 611 figure le financement indirect par l Institut Pasteur de moyens de communication satellite antenne abonnement 21 526 462 F CFA et un nouveau projet OMNI Global Fund pour le suivi de la morbidit palustre apr s la campagne nationale de distribution de moustiquaires Les recettes propres sont constitu es en majeure partie par un contrat d expert
12. au CSI difficile au del de 5 km D pen VE UN AN a ai ES SR EU 29 ESA EPIDEMIO A notre demande European Spatial Agency ESA a fourni des produits finis issus de la t l d tection pour valuer leur utilit dans l analyse les relations entre les param tres environnementaux et le paludisme et les m ningites Ces produits d une valeur globale de 750000 sont les suivants e Cartographie urbaine de Niamey au 1 25 000 partir des images SPOT 5 XS 10 m et Panchromatique 5 m e Mod le num rique de terrain de nos 11 sites d tude 50 m de r solution au sol et 25 m de pr cision altim trique e Cartographies des eaux de surface pendant le maximum de la saison des pluies et le maximum de la saison s che r solution spatiale de 50 m tablies partir des images MERIS e Cartographies de couverture du sol de moyenne r solution e Cartographies des nuages de poussi res de l Afrique de l Ouest 5 km de r solution au nadir maximum hebdomadaire de Avril 1995 a Avril 2005 e Temp ratures de surface minimum et maximum de tout le continent africain basse r solution spatiale de 1995 a 2004 images quotidienne ou d cadaire par METEOSAT Infra rouge 5 km de r solution au nadir En ce qui concerne les m ningites au Niger le recueil pid miologique des cas pr sum s est hebdomadaire et par CSI Il est compl t par la base des donn es microbiologiques du CERMES et l ensemble est g r par la
13. de d velopper des bandelettes pour le diagnostic des 3 germes responsables de plus de 80 des cas de m ningites bact riennes en Afrique N meningitidis S pneumoniae et H influenzae b Quatre anticorps monoclonaux sont 17 d j disponibles a partir desquels quatre tests monovalents ont t mis au point Ils permettent le diagnostic des m ningocoques des s rogroupes A C Y et Y W135 En 2005 deux bandelettes duplex TDR1 A et Y W135 et TDR2 C et Y ont t test es en conditions de laboratoire sur des chantillons de cultures de LCR et de sang Leur seuil de d tection tait de Ing PS ml ou 10 cfu ml La sensibilit comme la sp cificit taient de 100 sur les cultures et variaient de 93 8 a 100 avec les chantillons de LCR pour les s rogroupes A W135 et Y Pour le s rogroupe A la valeur du positive likelihood ratio LR tait 31 9 16 1 63 1 et celle du LR tait 0 065 0 04 0 104 avec un diagnostic odds ratio de 492 9 207 2 1172 5 La valeur du LR pour le s rogroupe W135 tait 159 7 La performance des TDR tait aussi bonne 45 C qu 25 C L valuation de ces tests doit tre compl t e pour le s rogroupe Y peu fr quent au Niger et le s rogroupe C rare au Niger avec des chantillons venus de l tranger Les r sultats sont en cours de publication Les tapes suivantes seront L valuation des bandelettes dans les formations sanitaires dans les conditions r elles pr
14. de techniciens de laboratoire et de l ISP cole de formation de technicien en pid miologie pour des stages pratiques de courte dur e ou pour la pr paration de m moires de fin d tudes Nous avons aussi accueilli des tudiants de 1 ou 2 cycle des Universit s Fran aises 1 Montanan MHT Daoud technicien de laboratoire Minist re Sant Publique du Tchad Stage s rologie VIH F vrier 2005 2 Audrey Defossey Etude des corr lations dans le temps et dans l espace entre les v nements de poussi res et la dynamique des cas de m ningites m ningocoque stage de 2 ann e du cycle ing nieurs et travaux de l Ecole Nationale des Sciences G ographiques Marne la Vall e 2005 3 Carine Ngoagouni Institut Pasteur de Bangui stage initiation entomologie m dicale 2005 4 Lydie H r D termination de l index sporozo tique de vecteurs du paludisme au Niger par r action ELISA M moire 2 ann e IUT Brest D partement G nie biologique 2005 5 Illa Kakal Ahmed Abakar amp Ibrahim Boukary Stage d application de 2 ann e de technicien sup rieur en pid miologie de l Institut de Sant Publique de Niamey 2005 1 3 Organisation d ateliers cours et colloques Il s agit de r pondre la demande en formation des institutions nig riennes ou de la sous r gion Mais le CERMES se heurte l insuffisance en personnel d encadrement et l exiguit de ses locaux C est pou
15. est ainsi que le CERMES forme chaque ann e une dizaine de jeunes en bact riologie biologie entomologie pid miologie dans le cadre des projets de recherche 2 Formation du personnel du CERMES 2 1 Formation dipl mante pour les cadres Dr Amina Amadou Hamidou Cours OMS CERMES Immunologie et Maladies Tropicales Niamey 2005 Mme Ciss Rahamatou Moustapha Boukary Cours OMS CERMES Immunologie et Maladies Tropicales Niamey 2005 Dr Tohon Zilhatou Techniques d analyse multivari e appliqu es l pid miologie Ecole de Sant Publique Universit Libre de Bruxelles Coop ration Technique Belge 2005 Dr Amina Amadou Hamidou Master 2 Maladies Transmissibles et Pathologies Tropicales Universit de Marseille Bourse R seau International Institut Pasteur 2005 Mr Oumarou Alto CESAM Universit Paris VI France 2005 Mr Hamza Iro Ma trise de Sciences et Techniques Comptables et Financi res Ecole Sup rieure de Commerce et d Administration des Entreprises ESCAE Niamey 2005 Mr Sani Haladou Formation a distance en maintenance informatique CNFDI Paris France 2005 Mr Alto Oumarou Dipl me Universitaire de Gestion des Donn es Universit de Bordeaux 2 en pr paration 2 2 Formations non dipl mantes l Mme Hadiza Hassane Atelier sur le paludisme Institut Pasteur de Madagascar Antananarivo Madagascar Bourse RIIP et projet Pal 2005 Mr Ali Elhadj Mamane Atelier de M trologi
16. paludisme et schistosomose Les tudes de mesure de l impact proprement dit du programme ont d but en octobre 2005 Les enfants des 4 villages de la zone du fleuve ayant particip a l enqu te initiale ont t revus un an apr s administration de PZQ en m me temps qu une nouvelle cohorte d enfants de 7 ans et 11 ans tait incluse dans ces villages L objectif tait de comparer d une part l volution avant apr s chez les m mes enfants en analyse appari e et d autre part les donn es recueillies chez des enfants de m me ge inclus avant et apr s le d marrage du programme Le bilan clinique parasitologique et chographique a t fait selon les m mes modalit s que lors du recueil des donn es avant traitement Le taux de retour des participants de l enqu te initiale d environ 85 tait consid r comme tr s satisfaisant Les donn es pr liminaires montrent d ores et d j une am lioration tr s importante des indicateurs parasitologiques et chographiques tandis que les taux d h moglobine avaient significativement augment Ainsi chez 763 enfants r examin s la pr valence globale de l infection par S haematobium est pass e de 84 7 33 2 tandis que la pr valence des infections s v res gt 50 ufs 10 ml d urine est pass e de 27 5 2 9 La pr valence globale des an mies lt 11 g d h moglobine dl de sang est pass e de 54 5 41 9 tandis que la val
17. troite collaboration avec l Unit Sant Environnement et Climat pour la gestion des bases de donn es de sant paludisme m ningites Documentation Responsable Sani Haladou L entr e du CERMES dans le r seau des Instituts Pasteur en qualit d Institut Associ a redynamis ce service et permis l acc s des revues scientifiques en ligne travers le CIS Centre d Informations Scientifiques de l Institut Pasteur et Health InterNetwork Access Research Initiative HINARI L acquisition de nouveaux ouvrages commenc e en 2003 s est poursuivie Une formation interne au logiciel Endnote a t organis e a l attention des chercheurs et cadres 39 ACTIVITES DE FORMATION Il faut distinguer des activit s de formation effectu es par le personnel du CERMES pour le compte de personnes ext rieures au centre des activit s de formation du personnel du CERMES 1 Formations dispens es par le personnel du CERMES 1 1 Encadrement th ses 3 cycle et autres m moires l 10 11 12 Fati Amadou Evolution de la r sistance de P falciparum chez la femme enceinte Doctorat en m decine Facult des Sciences de la Sant Niamey Niger 2005 Idrissa Hamani Vente des m dicaments anti infectieux dans le circuit informel Niamey Doctorat de Pharmacie Facult de Pharmacie et de Stomato odontologie Bamako Mali 2005 Souleymane Mamadou Aouami Mise au point et valuation d une techniq
18. vu de mettre en place une telle plate forme en 2006 2 Surveillance de la r sistance aux anti infectieux des agents bact riens responsables de m ningites Le programme multicentrique R sistance aux anti infectieux d marr en 2004 et pr vu pour durer 3 ans sur un financement du Fonds de Solidarit Prioritaire FSP du minist re des Affaires Etrang res s est poursuivi en 2005 Le CERMES est impliqu dans le volet Menira pour la surveillance de la sensibilit des principaux agents des m ningites bact riennes N meningitidis A pneumoniae et H influenzae avec l Institut Pasteur de Paris et les instituts du RIIP Vietnam Cameroun R publique Centrafricaine S n gal et Cote d Ivoire L objectif g n ral tait de suivre dans l espace et dans le temps l volution de la sensibilit Les objectifs sp cifiques taient de standardiser les m thodes d antibiogramme d actualiser les 15 connaissances sur les niveaux de r sistance d actualiser les recommandations th rapeutiques pour les infections dues ces germes et de d tecter l mergence de nouveaux m canismes de r sistance La m thodologie associe la r daction de proc dures communes pour la r alisation et l interpr tation des antibiogrammes conformes aux recommandations du CASFM la formation de sp cialistes de chaque institut la mise en uvre de ces proc dures le choix d un mat riel identique pour la r alisation des exa
19. vues pour leur usage futur d une part en contexte pid mique et d autres part en contexte end mique lors de la saison 2006 La construction et l quipement de nouveaux laboratoires et le transfert de technologie au CERMES sont pr vus en 2006 financement Sanofi Pasteur Des tests seront produits pour poursuivre leur valuation en conditions de terrain et pour la recherche pid miologique Le d veloppement de nouveaux anticorps monoclonaux pour N meningitidis s rogroupe X S pneumoniae et H influenzae 5 Epid miologie des m ningites a pneumocoques s rotypes en cause au Niger et implications pour une politique de pr vention vaccinale Plusieurs vaccins destin s pr venir les infections invasives par S pneumoniae sont disponibles Ils ciblent un nombre restreint de s rotypes dont le choix a g n ralement t fait pour r pondre l pid miologie du pneumocoque dans les pays d velopp s Les s rotypes int ressants peuvent tre fort divers selon les r gions et avant d envisager des mesures de pr vention vaccinale forc ment co teuses pour un pays en d veloppement une bonne connaissance des s rotypes circulant est un pr alable incontournable Dans le but de d terminer si une vaccination syst matique avec un vaccin existant peut tre propos e aux groupes risque en particulier patients atteints de dr panocytose anomalie fr quente au Niger une tude d taill e des caract ristiques d
20. 43 473 F En r sum le budget 2005 a t r alis a 90 9 des pr visions et ex cut a 93 du budget disponible Les indicateurs de d penses en investissement et en fonctionnement hors charges en personnel respectivement de 22 et 56 sont une preuve de la vitalit du centre 2 4 Les pr visions 2006 Le budget pr visionnel 2006 tient compte d un important projet d extension des laboratoires pour le renforcement de nos capacit s de recherche et de surveillance des m ningites Ce projet d investissements financ par Sanofi Pasteur 300 k dont 200 k pour 2006 comporte une extension de 200 m2 de laboratoires et l achat d quipements scientifiques pour la production de tests de diagnostic rapide des m ningocoques Par ailleurs nous attendons des cr dits de la Coop ration Fran aise pour un programme de recherche r gional de 3 ans sur les m ningites Niger Mali Burkina Faso C te d Ivoire Centre Afrique d un montant d un Million dont 100 K sont attendus pour le CERMES Les pr visions 2006 s l vent un total de 670 532 432 F CFA dont 90 M de report 2005 10 11 LES MENINGITES BACTERIENNES Coordinatrice Suzanne Chanteau Docteur en Sciences Directrice Responsable du programme Pascal Boisier M decin Chef de Il Unit Epid miologie Chercheurs associ s du CERMES Saacou Djibo M decin Chef du Laboratoire d Analyses M dicales Amina Amadou Hamidou Pharmacie
21. Fandeur T Durand R Randrianarivelojosia M Jambou R Legrand E Ekala MT Bouchier C Cojean S Duchemin JB Robert V Le Bras J Mercereau Puijalon O Malar J 2006 Invasion of Africa by a single pfcrt allele of South East Asian type Malaria Journa sous presse Ceccato P Connor SJ Jeanne I amp Thomson MC 2006 Application of Geographical Information System and Remote Sensing Technologies for Assessing and Monitoring Malaria Risk Parasitologia sous presse Czeher C Labbo R Dyibrilla A Here L Arzika I amp Duchemin JB 2006 ELISA study of oocyst sporozoite transition in malaria vectors Parasite sous presse VIH Hamidou AA Kouka N Elhaj Mahamane A amp Chanteau S 2005 Evaluation de cinq tests rapides et de deux algorithmes pour le diagnostic de l infection VIH au Niger Bulletin de la Soci t de Pathologie Exotique 98 5 8 Ouwe Missi Oukem Boyer ON Hamidou A Sidikou F Garba A Louboutin Croc J P 2005 D pistage du VIH en zone sah lienne partir de sang s ch sur s robuvard Bulletin Soci t Pathologie Exotique 98 343 346 Tohon Z Garba A Amadou Hamidou A Sidikou F Ibrahim ML Elhadj Mahamane A Bohari A amp Louboutin Croc JP 2006 Enqu te comportementale et de s ropr valence du VIH chez les professionnelles du sexe de Dirkou Niger en 2002 Bulletin de la Soci t de Pathologie Exotique 99 sous presse Mamadou S Laouel Kader A Rabiou S Aboubacar A Soumana O Garba A De
22. International Medicine and Health in the Tropics Poster Marseille France Septembre 2005 Boisier P Djibo S Sidikou F Nicolas P Kairo KK amp Chanteau S Meningococcal meningitis in Niger how is the risk related to the serogroup W135 evolving XVI me Congr s International Medicine and Health in the Tropics Communication orale Marseille France Septembre 2005 Boisier P Nicolas P Djibo S Amadou Hamidou A Sidikou F amp Chanteau S Self contained outburst of meningitis due to Neisseria meningitidis serogroup W135 ST 2881 in Niger with high rate of asymptomatic carriage in the community XVI me Congr s International Medicine and Health in the Tropics Poster Marseille France Septembre 2005 Amadou Hamidou A Djibo S Moussa A Sidikou F Elhay Mahamane A Ciss R Garba A Borrow R Nicolas P Chanteau S amp Boisier P Asymptomatic carriage of serogroup W135 meningococcus in Niamey Niger relationship with acquired protective immunity XVI me Congr s International Medicine and Health in the Tropics Communication orale Marseille France Septembre 2005 Nato F Dartevelle S Sidikou F Djibo S Boisier P amp Chanteau S A new multiplex dipstick for the rapid diagnosis of Neisseria meningitidis serogoups A and Y W 35 XVI me Congr s International Medicine and Health in the Tropics Communication orale Marseille France Septembre 2005 Chanteau S amp Nato F Diagnostic biological t
23. MA Afrique et dans comit national AMMA Niger Nous intervenons dans les groupes de travail T l d tection Hydrologie A rosols et V g tation AMMA EU Le projet int gr europ en AMMA EU a d marr officiellement en janvier 2005 Il regroupe 42 institutions dont quatre seulement s int ressent a l impact de la mousson sur la sant CERMES Universit de Liverpool IRD au B nin et MEDIAS France Les partenaires Africains impliqu s dans AMMA EU sont le CERMES AGRHYMET ASECNA EIER et ACMAD Les objectifs du CERMES sont d une part d analyser les relations entre les param tres hydrom t orologiques et les donn es de transmission entomologique et d autre part d analyser les conditions atmosph riques avec la dynamique des pid mies de m ningites Le recueil de donn es entomologiques et pid miologiques du paludisme dans le supersite de Fakara en est sa troisi me ann e En ce qui concerne la m ningite nous avons d finit une m thodologie pour l analyses des images de poussi res projet ESA EPIDEMIO avec les donn es nationales des cas de m ningites pendant la saison m ningite pour dix ann es cons cutives 1995 2005 Un travail de validation a permis de cat goriser les images et de pr parer les modalit s de leur utilisation pour la d finition des zones et des p riodes plus grand risque de survenue de cas de m ningites Les premiers r sultats confirment que 1 les
24. O Harare Zimbabwe St phane Hoyer OMS AFRO F d ration International Croix Rouge et Croissant Rouge Harare Zimbabwe Howard Thompson Schistosomiasis Control Initiative Imperial College London Ndione JA et Gaye A Centre de Suivi Ecologique Dakar S n gal Faye O Meert JP Delacolette C Tohon S RBM Paludisme OMS Gen ve et Lom Thomson Madeleine IRI New York Ginoux K project manager AMMA EU Dalaise M r alisateur de films scientifiques CNRS Wassilia Thiaw Responsable projet NOAA Washington Katlama C Calvez V Courtotin C H pital Piti Salp tri re SOLTHIS Carnevale Pierre Comit Scientifique OMNI Weise Kathrin Program manager ESA Epidemio Jena Optronik 49
25. REPUBLIQUE DU NIGER Minist re de la Sant Publique et de la Lutte Contre les End mies Centre de Recherche M dicale et Sanitaire R seau International des Instituts Pasteur BP 10887 634 Bd de la Nation YN034 Niamey NIGER Tel 227 20 75 20 40 45 Fax 227 20 75 31 80 email cermes cermes org RAPPORT ANNUEL 2005 PERSPECTIVES 2006 Niamey Ao t 2006 Directrice Dr Suzanne CHANTEAU chanteau cermes org SOMMAIRE Page ANAL DIOPOS Et 2 OO ANNA AMIS ads eds ne elas td nee nn no 3 EE La an ei td eee ne 4 5 Rapport Administratif et Financier 6 10 ACTIVITES DE RECHERCHES E 11 Les M ninoites E 12 19 S LER EE 20 25 e Sant Environnement et Climat sise seeseeseeeseeseeeseseee 26 33 ACTIVITES DE SANTE PUBLIQUE nine ais ed dela 34 DCHISIOSOMOSCS EE 35 36 VIA SIDA EE 37 38 INFORMATIQUE DOCUMENTATION iii 39 ACTIVITES DE FORMATION cc cccccccccccccccccceceeeeeeeeaaeeaaaseesessssssseseeesseeeeeeeeeeeees 40 42 PUBLICATIONS COMMUNICATIONS RAPPORTS 43 48 EE 49 Avant propos L ann e 2005 se situe dans le prolongement de cette p riode dynamique et tr s progressive que conna t le CERMES depuis sa cr ation en tant qu tablissement de recherches nig rien il y a 3 ans Cependant il s est notablement renforc et maitrise mieux les moyens de son d veloppement L ann e a t marqu e par une forte croissance des activit s de recherche acc
26. Vulgarisation scientifique Sciences au Sud et Francophonie Exposition de posters au Mus e National Niamey Co organisation IRD Coop ration Francaise Mars 2005 Num ro sp cial sur les m ningites Journal de l Institut de Formation aux Techniques de l Information de la Communication 8 pages Financement Coop ration Fran aise CERMES IFTIC Novembre 2005 Tournage d un reportage pour France 2 Compl ment d enqu te sur le changement climatique Novembre 2005 47 5 Site WEB du CERMES Le site web du CERMES a t mis a jour avec un nouveau design Site web http www cermes net Bue cremes BW Pr sentation i PEROU E Lait Li le Ring E iehi Fi sant Pubbqos d E remous D Aceierg o E Occuerants CERAIES Carre de Repverchs Meckeale ei Garage P trenu fever Ger frat Paneer BF LOBET M tt HIGER T l phone 227 20 75 2040 fat Zgl cegsg RIF 20 PL AL d E mim CermeNRETISES CEFTE FANTIE ini re Man du ste Mise A ant HI hd Zo pui mii EPELA INTIENATIONAL DES IMATITUTR FATE GA Fl Fr sesraues FA LIT reg ee pl el nie re 48 oY H SR SS es 10 11 12 13 14 15 16 e 18 19 20 241 22 VISITEURS Ary Ibrahim Ministre de la Sant Publique et de la Lutte Contre les End mies du Niger Sambo Luis Gomez Directeur R gional de POMS AFRO Harare Zimbabwe Mich le Boccoz Directrice des Affaires Internationales Institut Pasteur Pa
27. adagascar Cote d Ivoire Centre Afrique Financements en 2005 PAL RBM Sahel FSP RAI NOAA AMMA EU Global Fund Contexte Deux axes principaux de recherche ont t d finis en accord avec le Programme National de lutte contre le Paludisme PNL V tude de la transmission et le suivi de la chimior sistance Le Niger comprend plusieurs faci s bioclimatiques qui influent a la fois sur la distribution des vecteurs mais aussi sur les conditions de d veloppement du parasite lors de sa phase extrins que Nos tudes visent a pr ciser les conditions de transmission du paludisme et les rapporter aux variations environnementales L cologie et la biologie des vecteurs sont prises en compte ainsi que l tude du r servoir et du portage de parasites Ces tudes sont financ es par plusieurs cr dits RBM Sahel NOAA AMMA EU et sont int gr es dans le projet CLIMPAL d crit dans les activit s de l unit Sant Environnement et Climat SEC La zone de Dantiandou b n ficie d une attention particuli re car elle est galement la zone choisie par d autres institutions de recherches sur l environnement et le climat En collaboration avec l unit d Epid miologie un suivi de l activit de 4 dispensaires de la m me zone a t mis en place pour une approche globale du paludisme depuis l environnement jusqu au malade En 2005 le Niger a modifi sa politique de contr le et de traitement de premi re ligne des acc s palust
28. ance la chloroquine et dhfr pyrim thamine Les r sultats des tudes de la transmission permettront galement d tudier l impact du niveau de transmission sur la pr valence de la r sistance Impact de la pr valence des souches mut es sur le statut clinique des patients de Niamey Les chantillons ont t pr lev s chez des malades r f r s l h pital national de Niamey et analys s pour les marqueurs pfcrt KT 76 et dhfr SN 108 Les pr valences ne montrent pas de diff rence significative selon l origine du pr l vement Tableau 2 Tableau 2 Pr valences de souches P falciparum mut es Pfcrt Dfhr H pital national 49 57 116 55 66 119 Niamey Acc s simple 48 14 29 48 15 31 dispensaire Asymptomatiques 44 20 45 61 23 38 Les modalit s de recueil de souches pour l obtention de CI50 interpr tables ont t r vis es en 2005 notamment le seuil de parasit mie et la notion de traitement antipaludique ant rieur L h pital communal de Niamey constitue un nouveau site de recrutement de patients 3 Conclusions et perspectives Les r sultats quantitatifs de la transmission du paludisme au Niger au del de la description de base des indicateurs permettent d appr hender l chelle du village et de la r gion les m canismes de distribution du parasite Si la liaison de la transmission du paludisme avec les pluies est vidente l h t rog n it de l abondance d
29. atiques pour Afrique avec un souci de p rennit des actions 28 OMNI GF est le suivi de la morbidit li e au paludisme et le suivi de la transmission entomologique avant et apr s la distribution nationale de moustiquaires impr gn es toutes les meres d enfant de moins de 5 ans au Niger La transmission des donn es cliniques et m t orologiques depuis les centres de sant est facilit e par des balises Argos L ensemble du projet distribution des moustiquaires et tudes d impact est financ par le Global Fund En plus de ces activit s nous coordonnons au sein du R seau International des Instituts Pasteur une Action Concert e Inter Pasteurienne SIG t l d tection ACIP pour cr er un r seau d utilisateurs de ces outils d analyses spatiales PARSAC Sahel Partenariat Sant Climat au Sahel Les informations sur l environnement le climat et la sant sont disponibles mais l tat dispers dans de nombreuses institutions en Afrique Ces institutions ont la volont de partager des connaissances entre les diff rentes disciplines C est dans ce contexte qu ont t organis s plusieurs forums sur les pr visions saisonni res avec la sant pour th me associ les r unions PRESAO l initiative MARA ARMA l initiative RBM Sahel l atelier Sant amp Climat Niamey Meningitis Forecasting Project Ce projet comprend d abord un inventaire des ressources disponibles au Niger au Mali
30. autres instituts partenaires pour le programme m ningite Instituts Pasteur de Paris Madagascar Bangui Cameroun Les d penses 2005 par grandes rubriques budg taires figurent dans le tableau 3 et la figure 3 Rubrique Budg taire Montant D penses 2005 par masses bug taires 3 19 56 B Personnel BFonctionnement Ulnvestissement O Partenariat Il faut noter qu une plus grande partie des charges de formation et de participation des congr s et ateliers sont financ es indirectement par des organismes ext rieurs Institut PasteurParis Sanofi Pasteur Coop ration Belge OMS Les charges de fonctionnement 56 sont indiqu es dans le tableau 4 Tableau 4 D penses en fonctionnement hors charges en personnel Pourcentage au Rubrique Montant total des charges de fonctionnement Charges de structure Eau Electricit T l communication Gaz 61 309 113 22 49 Charges li es aux activit s de recherche r actifs et consommables labo per diem transport Autre charges communes entretien consommables bureau carburant TOTAL 272 655 768 100 00 Dans les charges de fonctionnement li es aux activit s de recherche les d penses les plus importantes concernent e R actifs et autres consommables de laboratoire 65 543 584 F e Per diem et autre frais de terrain 60 821 680 F e Frais de transport et de transit 15 883 266 F e Transport mission 11 3
31. diza Hassane doctorants Halima Maizoumbou Ibrahim Issa Anzika Kaililou Maimouna Aboubacar Mahamadou Aissa Moumouni TS laboratoire Amadou Dyibrilla Saasou Kadri techniciens laboratoire Tankari Dan Kountch manoeuvre sp cialis Unit SIG T l d tection Dr Isabelle Jeanne Chef d Unit m decin sp cialis en g omatique chercheur M lina Kalache ing nieur agronome sp cialis e informatique et SIG Volontaire International Dr Maimouna Boulama m decin stagiaire de recherches Oumaro Alto TS pid miologiste G rard Tchibozo ing nieur informatique SIG prestataire Unit SEC Alkali Amadou ing nieur informatique SIG prestataire Unit SEC Moussa Mouhaimini ing nieur m t orologiste prestataire Unit SEC Ahmed Abdou enqu teur prestataire Unit SEC Hamani Idrissa enqu teur prestataire Unit SEC Documentation Informatique Sani Haladou TS Documentation M lina Kalache ing nieur agronome sp cialis e en informatique et SIG Dispensaire Dr Zilhatou Tohon m decin stagiaire de recherches Dr Halima B Mainassara m decin stagiaire de recherches RAPPORT ADMINISTRATIF ET FINANCIER 1 Situation du personnel En 2005 la forte croissance des activit s de recherches et l ouverture du Laboratoire National de R f rence VIH SIDA ont n cessit un renforcement de personnel technique et administratif A la fin de l ann e le CERMES comptait 57 agents soit une augme
32. e Institut Pasteur de Dakar S n gal Bourse RITP CERMES 2005 Formation interne a la recherche bibliographique et utilisation du logiciel Endnote par Sani Haladou JB Duchemin 2005 Mme Halima Zamanka Atelier OMS Tests de chimiosensibilit de Plasmodium falciparum pat m thode colorim triques D cembre 2005 Lyon France Bourse RIP Mr Amadou Moussa Stage pour le renforcement des capacit s de laboratoire pour le diagnostic des maladies potentiel pid mique OMS P le Lyon et MDSC OMS Ouagadougou Formation sur 2 ans 2004 2006 avec stages a Ouagadougou Bourse OMS Mr Ali Elhadj Mahamane Stage sur la production de tests de diagnostic rapide des m ningites Plateforme PTS Institut Pasteur Paris France Sanofi Pasteur 2005 42 1 PUBLICATIONS COMMUNICATIONS RAPPORTS Publications 1 1 M ningites 10 11 Boisier P Djibo S Sidikou F Mindadou A Kairo KK Djibo A Goumbi K amp Chanteau S 2005 Epidemiological patterns of meningococcal meningitis in Niger in 2003 and 2004 under the threat of N meningitidis serogroup W135 Tropical Medicine amp International Health 10 435 443 Nicolas P Djibo S Moussa A Tenebray B Boisier P amp Chanteau S 2005 Molecular epidemiology of meningococci isolated in Niger in 2003 shows serogroup A Sequence Type ST 7 and serogroup W135 ST 11 or ST 2881 strains Journal of Clinical Microbiology 43 1437 1438 Nathan N Borel T Djibo A Evans D Dyibo S
33. e Unit SEC Ahmed Abdou enqu teur prestataire Unit SEC Hamani Idrissa enqu teur prestataire Unit SEC Collaborations locales Ibrahim Ousmane Coordonnateur du Programme National Lutte contre le Paludisme PNLP Minist re Sant Publique et de la Lutte contre les End mies Kairo Kaka Kiari Mahamane Zaneidou Service National des Informations Sanitaires SNIS Minist re Sant Publique et de la Lutte contre les End mies Andr Nonguierma Job Andiguet Unit t l d tection AGRHYMET Some Bonaventure Unit climatologie AGHRYMET Arona Diedhiou Luc Descroix Jean Louis Rajot IRD Niamey Bruno G rard ICRISAT Marie Christine DUFRESNE Abdallah Nassor Andr Kamga ACMAD 26 Collaborations ext rieures Institut Pasteur de Madagascar Fanjasoa Rakotomanana Rindra Randremanana Institut Pasteur de Dakar Laurence Marrama Institut Pasteur de Tunis Afif Ben Salah Institut Pasteur d Alger Soufi Abderrazak Zoubir Harrat Institut Pasteur du Maroc Tanger Khalid Abarrah Chafik Merrouch CIRMF Gabon Ghislain Moussavou Institut Francilien G osciences U Marne La Vall e Jean Paul Rudant Pierre Louis Frison Jacob L Kouame Ecole Nationale des Sciences G ographiques ENSG IGN Marne La Vall e Audrey Defossey Epicentre Christine Dubray International Research Institute for climate prediction IRI Madeleine Thomson Pietro Ceccato OMS Geneve Jean Pierre Meert Agenc
34. e bi appartenant enseignant chercheur Facult de M decine Dr Amina Amadou Pharmacienne chercheur temps partiel au LNR VIH Moustapha Boukary Rahamatou DEA Biotechnologie Mahamadou Izamn TS laboratoire surveillant temps partiel Adamou Lagare TS laboratoire Ali Maazou Roufai ma trise microbiologie service civique Amadou Halilou Ibrahim TS laboratoire service civique Unit de Biologie Recherches Dr Suzanne Chanteau Chef d Unit Docteur en Biologie HDR Dr Amina Amadou Pharmacienne chercheur temps partiel au LNR VIH Dr Mindadou Habsatou Pharmacienne jusqu en juillet 2005 Fati Sidikou ing nieur biologiste surveillante Ali Elhadj Mahamane ing nieur biologiste Saadou Kadri technicien laboratoire temps partiel Bassira Issaka maitrise biochimie en service civique Unit Epid miologie Dr Pascal Boisier Chef d Unit m decin pid miologiste chercheur Dr Zilhatou Tohon m decin stagiaire de recherches Dr Halima B Mainassara m decin stagiaire de recherches Abdoulkarim Amina TS pid miologiste service civique Yahaya Ramatou TS pid miologiste service civique Ali Sidiki technicien en formation l ISP pour 3 ans Unit de Parasitologie Dr Jean Bernard Duchemin Chef d Unit m decin entomologiste chercheur Dr Rabiou Labbo ing nieur des techniques de l levage fonctionnaire chercheur Dr Ibrahim Lamine v t rinaire chercheur Cyril Czeher Ha
35. e CERMES a test 1312 LCR re us de 37 des 42 districts du pays Parmi les LCR test s environ 600 venaient des h pitaux de Niamey essentiellement des services de p diatrie alors que les 3 districts de Niamey n avaient notifi que 140 cas de m ningite Beaucoup de ponctions lombaires sont probablement faites des fins de diagnostic diff rentiel En excluant Niamey ce sont 55 9 des cas d clar s comme m ningites dans le pays qui on fait l objet de l examen d un chantillon de LCR au CERMES Parmi les 1312 LCR analys s au CERMES en 2005 1308 l ont t par m thode PCR et 184 par les 13 m thodes bact riologiques classiques les deux m thodes ayant t appliqu es simultan ment 128 chantillons Figure 1 Notifications hebdomadaires de cas de m ningite suspicions cliniques Niger ann es 2003 2004 2005 900 ee Ann e 2003 oe Ann e 2004 600 Ann e 2005 S O TD Bei Z 300 Wm Ms 0 rT T TT TOT TT OT TT TT TTT TT TTT TT TTT TT TT TT rT To TO TT TT TT TT S01 S05 S09 S13 S17 S21 S25 S29 S33 S37 S41 S45 S49 Semaine Au cours des mois de f vrier mars et d avril ont t re us 60 des chantillons test s en 2005 Un r sultat positif en bact riologie et ou en PCR a t obtenu pour 435 chantillons 33 4 Comme d habitude N meningitidis diagnostiqu dans 206 LCR tait le plus fr quent repr sentant 47 4 des chantillons positifs et le s rogro
36. e Spatiale Europ enne ESA ESRIN ESTEC Simon Pinnock Jena Optronik Allemagne Kathrin Weise Silogic Toulouse Christelle Barbey Liverpool University UK Andy Morse Alexandre Gagnon MEDES Laurent Braak Yann Lapeyre Collecte Localisation Satellites Aline Duplaa Marie Cecile Delmas Centre National d Etudes Spatiales Toulouse Nathalie Ribeiro IRSS Ouagadougou Burkina Faso L on Savadogo Prodig Paris Pascal Yaka M t orologie Malaria Research Training Center Bamako Mali Seydou Doumbia Centre National Recherche et Formation sur Paludisme Ouagadougou Burkina Faso Eric Diboulo Centre de Suivi Ecologique Dakar S n gal Jacques Andr Ndione F d ration Internationale de la Croix Rouge et Croissant Rouge OMS St phane Hoyer Laboratoire Optiques de l Atmosph re Universit Lille Zsabelle Chiapello Michaela Kotiecka 27 Contexte Au Sahel le climat est un facteur tr s important de l volution pid miologique de plusieurs pathologies Ces maladies sont souvent des fl aux sanitaires reconnus prioritaires en sant publique tels que le paludisme et les m ningites Une meilleure connaissance des relations entre le climat et ces pathologies associ e l tablissement de proc dures utilisant les produits climatiques environnementaux peut contribuer optimiser les programmes de surveillance et de contr le sanitaires Les deux th matiques principales de l Unit
37. e la population nig rienne Les donn es issues de cette surveillance renforc e sont mises a profit aussi bien pour la recherche dans l objectif de mieux comprendre l pid miologie de N meningitidis et ses volutions dans la ceinture de la m ningite que pour la sant publique en mettant la disposition des autorit s sanitaires des informations valides pour l ensemble du pays La surveillance microbiologique est assur e en troite collaboration avec le Service National de l Information Sanitaire Niamey la repr sentation de POMS au Niger le Multi disease Surveillance Center de POMS a Ouagadougou et le Centre collaborateur OMS pour les m ningocoques du Pharo Marseille En 2005 le r seau de centres participant au recueil d chantillons biologiques et de donn es pid miologiques mis sur pied en 2002 a t entretenu et renforc Le CERMES a continu d assurer lui m me la collecte des chantillons sur le sud ouest du pays Les LCR ont t test s en bact riologie conventionnelle coloration de gram test latex type Pastorex et culture et ou par PCR selon qu ils taient achemin s frais sur milieu de transport Trans Isolate T1 ou conserv s au froid L ann e 2005 a t caract ris e par une incidence exceptionnellement faible des m ningites Figure 1 Au total 1404 cas cliniquement suspects ont t notifi s au syst me de surveillance pid miologique par 39 districts Sur la m me p riode l
38. e mais effectu e par la m thode de dissection consid r e comme un peu moins sensible que l ELISA Aucune valuation entomologique longitudinale quantitative de la transmission n avait t effectu e au Niger En 2004 nous avons estim environ 250 le nombre de piq res infect es par an et par habitant dans la zone de Dantiandou Ce chiffre est lev par rapport a ce que nous attendions 2 Etude de la chimior sistance L ann e 2005 est une p riode charni re pour le Niger puisque la politique nationale de traitement de premi re ligne du paludisme a t revue par l introduction des combinaisons base de d riv s de l art misinine Cependant une p riode interm diaire de maintien de la chloroquine a t admise en attendant les stocks suffisants de nouveaux traitements De plus une politique de traitement intermittent de la femme enceinte par association sulfadoxine pyrim thamine SP est mise en place Dans ce contexte non uniforme la chimior sistance est extr mement int ressante et importante suivre Une de nos actions est l tablissement d une cartographie de donn es de base de la r sistance la chloroquine et SP l chelle du pays Les pr l vements seront effectu s dans les diff rentes strates pid miologiques dans le Sud Ouest d abord puis sur l ensemble du pays puis analys es par des techniques mol culaires de d tection de mutations ponctuelles des g nes Pfcrt li e la r sist
39. e r f rence du S n gal Dakar Une cha ne ELISA a t fournie par le Minist re de la Sant Publique et du mat riel bureautique par l Institut National de la Statistique 38 SERVICE INFORMATIQUE ET DOCUMENTATION Service Informatique Responsables M lina Kalache et Sani Haladou La mission du Service Informatique est d assurer le fonctionnement et la maintenance des postes informatiques du CERMES de fournir une assistance technique aux utilisateurs et de g rer les commandes de mat riel consommables ou non Le CERMES dispose d un r seau informatique comprenant un serveur Linux un routeur firewall CISCO 800 une trentaine de postes informatiques et des imprimantes r seau Quelques pannes dues aux conditions difficiles dans lesquelles ces postes fonctionnent chaleur et poussi re ont parfois pu ralentir les activit s mais globalement les r sultats sont satisfaisants Au cours de l ann e 2005 le parc informatique a t r actualis plus de 10 postes ont t remplac s par du mat riel neuf L acquisition d un nouveau r partiteur a permis galement de renouveler le cablage r seau et d augmenter les possibilit s de connections L acc s internet est assur par un op rateur local La liaison radio sp cialis e 64 kbs fournie par Afripa Telecom n est pas suffisante Ainsi la possibilit d utiliser une liaison Vsat devra tre tudi e nouveau Le Service Informatique travaille en
40. emier Ministre Ball Boubacar Unit Sectorielle de Lutte contre les IST VIH SIDA Minist re de la Sant publique et de la Lutte contre les End mies Maman Elhadj Maty Direction de la Pharmacie des Laboratoires et de la M decine Traditionnelle Minist re de la Sant publique et de la Lutte contre les End mies Louis et Vanina Pizarro ONG SOLTHIS Fatimata Moussa Sanata Diallo UNFPA Beidou Abdoulaye et Sani Oumarou Institut National de la Statistique Le Laboratoire National de R f rence LNR VIH SIDA a t cr au sein du CERMES par Arr t n 62 MSP DGSP DPHL MT du 23 Juin 2004 Son responsable Pr Saidou Mamadou a t nomm par Arr t n 0092 MSP LCE CABINET du 27 juillet 2004 Les missions confi es au LNR sont assurer le suivi biologique des patients sous traitement dans le cadre de l Initiative Nig rienne pour l Acc s aux anti r troviraux INAARV assurer le contr le de qualit et l assurance qualit du diagnostic biologique de l infection VIH mener des recherches op rationnelles Les activit s du LNR font partie int grante du programme national de lutte contre le VIH dans le cadre de la Coordination Intersectorielle de Lutte contre les IST VIH SIDA financements Banque Mondial et Fonds Global Les besoins du LNR font l objet de requ tes aupr s de la coordination CILSS via la Direction des Pharmacies et Laboratoires du MSP Les travaux de r habilitation des laboratoires d marr
41. ence des balises Argos au Niger et au Burkina Faso pour la transmission rapide de donn es depuis les CSI a donn des r sultats satisfaisants en 2003 2004 Un s minaire de fin de projet a t organis Ouagadougou en 2005 en pr sence de tous les partenaires Il a t d cid alors d inclure dans le projet OMNI l achat et le fonctionnement de 44 balises pour aider au suivi par le CERMES de la morbidit et de la mortalit palustres dans 44 CSI apr s la campagne de distribution des moustiquaires toutes les m res d enfants de moins de 5 ans Le Niger est le premier pays ou une telle exp rience est r alis e l chelle nationale Cette campagne a t faite en d cembre 2005 int gr e aux Journ es nationales de vaccination contre la poliomy lite Les balises Argos permettent le monitorage de l activit de chacun des 44 CSI et l obtention de donn es de qualit Parall lement dans les m mes centres un protocole de confirmation biologique des cas pr sum s de paludisme a t mise en place cf Unit parasito Cette activit s int gre compl tement au projet RBM pour la surveillance des pid mies Le projet OMNI a d marr officiellement le 1 juillet 2005 mais les balises Argos ne sont arriv es au CERMES qu a la fin janvier 2006 Elles n ont t op rationnelles qu a partir du mois d Avril 2006 Entre temps afin d obtenir des donn es de base avant la distribution des moustiquaires le recue
42. er que cette discipline tait strictement nouvelle au CERMES en 2003 lorsque cette unit fut cr e Pendant les premi res ann es il lui a fallu obtenir des cr dits s quiper former des techniciens et lier de multiples collaborations partenariales pour recueillir au plus tot les nombreuses donn es climatiques et environnementales qui lui sont n cessaires pour ses recherches D autre part il n est pas inutile de rappeler que pour l ensemble des donn es sanitaires sur laquelle elle travaille elle est tributaire des r sultats recueillis par les programmes m ningites et paludisme et par le service national des informations sanitaires du Minist re de la Sant Or ces tudes demandent un certain temps surtout en ce qui concerne les tudes sur la transmission du paludisme qui doivent in vitablement couvrir au moins deux saisons de transmission Quoiqu il en soit on doit consid rer que la difficile et longue p riode de mise en place de l Unit SEC s est termin e en 2005 De tr s nombreuses tudes sont a pr sent en cours et d ja en fin d ann e nous pouvions pr senter quelques r sultats partiels Nul doute que dans le rapport de l ann e prochaine ils se seront accumul s 33 34 LES SCHISTOSOMOSES Responsable du programme Pascal Boisier m decin pid miologiste Chercheurs associ s du CERMES Zilahatou Tohon m decin Unit d Epid miologie Halima Boubacar m decin Unit d Epid miolog
43. es et frottis minces a t d termin e deux fois pendant la saison s che en p riode fra che en D cembre Janvier et en p riode chaude en Avril En zone sah lienne cette pr valence a t en plus d termin e pendant la saison des pluies Deux autres villages Dantiandou et Banizoumbou situ s de cette zone sah lienne ont fait l objet d un suivi entomologique longitudinal renforc pendant toute la p riode de 6 mois encadrant la saison des pluies collaboration MIT Harvard IRD Niamey Kilometres Figure 1 Les trois zones bioclimatiques du Niger en vert fonc e zone soudanienne en vert clair zone sah lienne en jaune zone saharienne en noir Les sites d investigation entomologique et parasitologique de 2004 2005 sont indiqu s en noir ceux de 2005 2006 en blanc Pr valence parasitaire et portage asymptomatique Les r sultats montrent Tableau 1 en saison s che et en zones soudanienne et sah lienne une homog neit des pr valences parasitaires et une baisse d environ 30 a 50 des indices plasmodiques par rapport a la saison 21 des pluies En zone pr saharienne on observe une persistance des pr valences parasitaires a un niveau bas en saison des pluies une h t rog n it confirm e des indices plasmodiques dans la bande sah lienne avec un maximum de 48 l Ouest Banizoumbou et un minimum de 0 l Est Bosso Tableau 1 Portage plasmodial asymptomatique P falciparum
44. es souches de pneumocoques l origine de m ningites t entreprise Quarante huit souches de pneumocoques isol es de LCR ont t adress es au CNR des pneumocoques h pital G Pompidou Paris pour s rotypage g notypage et contr le de la r sistance aux antibiotiques Les r sultats pr liminaires ne concernant que les s rotypes montrent une grande h t rog n it On a cependant le sentiment que la proportion des souches de s rotype 1 s est accrue entre 2003 04 31 et 2005 62 5 La petite taille de l chantillon ne permet pas de porter de conclusion en terme de significativit statistique La s rie sera compl t e en 2006 Les donn es issues de ce travail seront galement exploit es pour tenter de d crire les liens entre certains s rotypes et l importance de la l talit 6 Perspectives de recherches court et moyen termes Les th matiques Surveillance microbiologique et Mise au point et valuation de tests de diagnostic rapide seront poursuivies en 2006 18 Le programme Appui a la recherche sur les m ningites bact riennes en Afrique sah lienne d velopp dans le cadre du Fonds de Solidarit Prioritaire FSP Minist re Affaires Etrang res France financement pour 36 mois est acquis et le d blocage des fonds est attendu courant 2006 Projet Etude des facteurs de risque de m ningite dans l infection N meningitidis facteurs immunologiques facteurs
45. es vecteurs pluviom trie gale appara t tr s li e au milieu environnant Au sein de celui ci les facteurs d occupation des sols riziculture d forestation zones sableuses ou argileuses semblent tre d terminants pour la permanence ou a 24 contrario la disparition rapide des gites anoph liens potentiels constitu s par les eaux superficielles Ces derni res donn es ont t collect es par l unit SEC et vont permettre de concevoir des outils de gestion du risque plus solide court terme nos tudes vont d sormais se concentrer dans la zone sah lienne o la variation de la transmission est la plus forte et la population la plus dense A moyen terme nous nous int resserons davantage aux zones tr s instables ou les variations inter annuelles sont extr mes D autre part en 2006 les tudes cliniques confirmation biologique du paludisme dans les syndromes f briles an mies en collaboration avec l Unit Epid miologie seront intensifi es Sur le plan de la chimior sistance la recherche de triple mutants dhfr accompagnera la mise en place du programme de TPI chez la femme enceinte Les collaborations mises en place au sein du R seau des Instituts Pasteur permettront la d finition et la mise au point d indicateurs plus fiables notamment des indicateurs mol culaires pour le suivi de l impact de la nouvelle politique de traitement de premiere ligne Au total l activit de recherche de l Unit de Parasitol
46. et au Burkina Faso et a l issue un manuel d utilisation bilingue des donn es environnementales et climatiques l attention des acteurs de la sant Il contiendra les informations adapt es trois niveaux principaux d utilisateurs niveau op rationnel niveau central et niveau de la recherche Les enqu tes sont termin es une derni re validation reste faire ainsi que la fusion des donn es du Mali et du Burkina avant la publication sur Internet N anmoins la base a t diffus e aux membres d un comit national SIG dont le CERMES fait partie Ce comit a t cr avec comme objectif de la mise en commun des donn es g or f renc es et l homog n isation des codages SIG Niger Apr s le SIG de Niamey l chelle des flots en 2004 un SIG l chelle du Niger a t constitu cette ann e r unissant toutes les principales donn es disponibles Ils serviront galement de fonds cartographiques d autres projets du CERMES ainsi qu d autres institutions Un SIG SAHEL est en projet Exemple de SIG dans la r gion de Maradi Pour chaque point de la r gion de Maradi la distance vol d oiseau au CSI le plus proche a t calcul e Tous les CSI 50 100 km recens s de la r gion et dans une couronne gt 100 km de 40 km autour ont t pris en compte sauf au Sud qui est la fronti re avec le Nigeria A noter la distance moyenne est de 16 km on consid re l acc s
47. eur moyenne de l h moglobin mie est pass e de 10 8 g dl 11 2 g dl Enfin la pr valence des anomalies chographiques de la vessie paississements masses pseudo polypes a chut de 42 5 9 2 M me si pour les sp cialistes cette am lioration tait attendue car conforme aux r sultats de travaux ant rieurs le fait de la confirmer large chelle au Niger est un l ment d terminant pour d montrer au bailleur de fonds que le programme nig rien fonctionne qu il produit les r sultats esp r s et que son investissement a t b n fique pour la sant publique Les 4 villages de la zone de Tahoua vont tre revus en avril 2006 et les donn es des 8 villages seront analys es ensemble Ce suivi sera renouvel chaque ann e tant que le bailleur le souhaitera 36 LABORATOIRE NATIONAL DE REFERENCE VIH SIDA Chef du laboratoire Sa dou Mamadou pharmacien biologiste Professeur Agr g de Bact riologie Virologie Facult Sciences de la Sant Universit A Moumouni de Niamey Personnel permanent Ciss Rahamatou Moustapha ing nieur biologiste Lagare Adamou ma trise microbiologie Ali Maazou Roufai ma trise microbilogie service civique Amadou Halilou Ibrahim technicien sup rieur service civique Surveillant Izamn Mahamadou technicien sup rieur surveillant de laboratoire Collaborations Bagnou Abdoulaye Coordination Intersectorielle de Lutte Contre les IST VIH SIDA CISLS Cabinet du Pr
48. h needs malaria and meningitis Animation du groupe Health and climate break out the gap between information and need Atelier AMMA Impacts 3 4 d cembre 2005 Ngor Dakar 2 4 Autres l Tohon Z ElHaj Mahamane A Garba A Chanteau S amp Boisier P Relationship between Schistosoma haematobium infection and anaemia in Nigerien children not so simple Colloque international Medicine and Health in the Tropics Poster Marseille 11 15 septembre 2005 Idrissa H Absi M amp Boisier P Street vending of anti infectious drugs in Niamey Niger profile of hawkers and quality of drugs Colloque international Medicine and Health in the Tropics Poster Marseille 11 15 septembre 2005 3 Rapports oy E EE Ve Rapport interm diaire 6 mois AMMA Europe Jeanne I amp Duchemin JB Juillet 2005 Rapport sur la surveillance microbiologique des m ningites bact riennes au Niger Bilan de la saison 2004 2005 P riode du ler novembre 2004 au 30 juin 2005 Boisier P Djibo S Sidikou F Chanteau S Octobre 2005 Rapport de fin de projet S2E Argos Jeanne I Alto O Kiari KK Octobre 2005 Rapport interm diaire PARSAC Sahel Kalache M lina amp Jeanne I Octobre 2005 Rapport interm diaire RBM Sahel Jeanne I Duchemin JB Labbo R Novembre 2005 Rapport sur le volet nig rien de l tude des ventes de m dicaments anti infectieux dans le circuit informel ACIP Boisier P D cembre 2005
49. i es 14 Onze des 12 souches isol es de LCR ont t exp di es au CCOMS du Pharo Marseille P Nicolas Les r sultats rendus par le CCOMS ont confirm les identifications du laboratoire de microbiologie du CERMES Seuls 2 s rogroupes taient repr sent s A et W135 Les 4 m ningocoques de s rogroupe W135 de ph notype W135 NT P1 5 2 taient tous de s quence type ST ST 2881 non r put pid miog ne la diff rence du ST 11 incrimin dans les pid mies li es aux p lerinages du Hadj en 2000 et 2001 et les pid mies du Burkina Faso en 2002 et 2003 Les 7 souches de m ningocoques de s rogroupe X de ph notype X NT P1 5 taient de s quence type ST 181 et taient donc identiques celles qui avaient occasionn une pid mie s rogroupe X Niamey dans les ann es 90 Figure 2 Distribution des s rogroupes de m ningocoque selon la r gion de provenance des chantillons de LCR Niger ann e 2005 S rogroupe A MI S rogroupe X BI S rogroupe W135 DRSP Agadez DRSP Tillaberi Si d DRSP Zinder n 7 DRSP Niamey n 18 DRSP Dosso n 6 DRSP Maradi n 144 Enfin suite un atelier de formation au CERMES les Instituts Pasteur de Bangui et d Abidjan ont transf r avec succ s la PCR m ningites permettant un renforcement de la surveillance microbiologique dans ces 2 pays en 2005 Le Centre Pasteur du Cameroun annexe de Garoua a galement pr
50. ia and urinary schistosmiasis co infection in nigerien foci XVI me Congr s International Medicine and Health in the Tropics Poster Marseille France Septembre 2005 Ibrahim ML H Hassane F Gay Andrieu E Adehossi I Ousmane amp JB Duchemin Plasmodium falciparum resistances association with different clinical profiles in Niamey Niger Poster XVI me Congr s International Medicine and Health in the Tropics Poster Marseille France Septembre 2005 Labbo R I Jeanne amp JB Duchemin Malaria transmission in Sahel zone which markers are reliable XVI me Congr s International Medicine and Health in the Tropics Poster Marseille 11 15 septembre 2005 amp IV me Congr s MIM Nov 2005 Yaound Cameroun Ibrahim ML H Hassane I Ousmane E Adehossi amp JB Duchemin Scaling up of the surveillance of Plasmodium falciparum resistance in Niger using molecular markers Poster XVI me Congr s International Medicine and Health in the Tropics Poster Marseille 11 15 septembre 2005 amp IV me Congr s MIM Nov 2005 Yaound Cameroun Hassane H R Labbo P Boisier amp JB Duchemin Malaria and urinary schistosmiasis in Niger Links with anemia Poster Veme Congr s MIM Nov 2005 Yaound Cameroun Sant Environnement et Climat Alto O I Jeanne S2E Argos Bilan et perspectives S minaire de fin de projet S2E ARGOS Ouagadougou avril 2005 Jeanne I O Alto KK Kiari L G Savadogo Sant et climat
51. ie Collaborations locales Minist re de la Sant Publique Amadou Garba Coordonnateur du Programme National de Lutte contre les bilharzioses et g ohelminthes Collaborations ext rieures Schistosomiasis Control Initiative Imperial College London Department of Infectious Diseases Epidemiology Londres UK RISEAL R seau International Schistosomoses Environnement Am nagement et Lutte Institut national de la recherche scientifique et technique Institut national de recherche en sciences de la sant Ouagadougou Burkina Faso Depuis 1991 le CERMES est Centre Collaborateur OMS pour la recherche et la lutte contre les schistosomoses qui constituent un probl me de sant publique important au Niger o S haematobium est hyperend mique dans de nombreuses r gions Bien que le CERMES n ait plus de programme de recherche sur les schistosomoses son expertise dans ce domaine l a fait retenir pour assurer l valuation scientifique de l efficacit du Programme National de Lutte contre la Bilharziose et les G ohelminthes PNLBG qui a t cr en f vrier 2004 Le CERMES avait d j apport son appui au Minist re de la Sant Publique et de la Lutte contre Les End mies pour la conception et l laboration du PNLBG en 2003 Ce programme est appuy par l Imperial College of London qui coordonne la e Schistosomiasis Control Initiative SCI financ e par la Fondation Bill et Melinda Gates Le programme nig rien a d marr
52. ient favoriser ces pid mies ne sont pas lucid s Nous cherchons identifier ces param tres afin de pouvoir si possible fournir aux services de contr le des maladies des outils de pr vision et d aide la d cision Les activit s de l Unit SEC sont de deux types et leur financement est assur par des projets compl mentaires l Celles qui ont pour but l am lioration des outils pour le recueil des donn es PARSAC Sahel constitution et animation d un r seau de partenaires pour faciliter les changes multidisciplinaires SIG pour le suivi des pid mies de m ningite l chelle des CSI et des villages ESA Epidemio valuation de produits de t l d tection pour le secteur de la sant 2 Celles qui sont plus proprement dites des recherches sur les relations entre le climat et le paludisme et la m ningite en fonction de l environnement RBM Sahel pour l tude de la transmission du paludisme et de la m ningite afin de constituer un SIG avec des donn es de base n cessaires l analyse des risques pid miques et au d veloppement d outils d aide la d cision AMMA EU Analyses Multidisciplinaires de la Mousson Africaine financ par l Union Europ enne et constitu par consortium de 42 partenaires Le CERMES est l un des partenaires charg des tudes d impact sur la sant AMMA Afrique est un prolongement r gional de AMMA EU Ce projet prend en compte les retomb es pr
53. il des informations a t fait manuellement Les missions sur le terrain mise en place du projet information et formation des agents supervision ont pu d marrer d s le d but du mois de juillet Les 44 CSI ont t s lectionn s d un commun accord avec le service national des informations sanitaires du Minist re de la Sant Les bilans hebdomadaires num ris s sont transmis au centre spatial de Toulouse par le satellite Argos et sont accessibles au CERMES et aux partenaires sur un site web s curis dans un d lai moyen de 2 h En plus du paludisme les maladies d claration obligatoire et d autres pathologies importantes surveiller ont t galement retenues les m ningites les diarrh es sanglantes les fi vres ict riques la rougeole le chol ra etc Le nombre de cas hebdomadaires est transmis par sexe par tranche d ge et par zone 8 zones par CSI Ces param tres sont tr s proches de ceux relev s dans les registres habituels Des donn es environnementales quotidiennes ont t ajout es les temp ratures et hydrom trie minimum et maximum ainsi que la pluviom trie Une grande partie du second semestre a t consacr e a l tablissement d un nouveau questionnaire en collaboration avec CLS en fonction de nos besoins tout en respectant les contraintes de programmation du syst me Argos Par rapport au projet pilote le formulaire de saisie des donn es est a la fois plus simple souple tout en tant pl
54. ise avec PUNFPA pour une tude sur la s ropr valence du VIH et la facturation des frais de v hicules pr lev s sur les projets L activit du Laboratoire d Analyses M dicales LAM est en diminution constante depuis 3 ans 12 4 M en 2005 Le maintien d un LAM exige des normes de qualit dont la mise en ceuvre est actuellement incompatible avec les moyens humains et budg taires du CERMES Par contre une r flexion doit tre men e sur le r le que pourrait jouer le CERMES dans le R seau National des laboratoires La formation recyclage des techniciens et la supervision des laboratoires p riph riques pour la surveillance des maladies potentiel pid mique correspondent un besoin national Le projet de construction du centre de formation P Moussa dans le campus du CERMES s int grerait parfaitement dans cette optique 2 3 Le budget ex cut L ann e 2005 a t marqu e par une croissance importante des activit s de recherche impliquant de tr s nombreuses missions de terrain Au total 2417 homme jours HJ de mission ont t comptabilis s essentiellement au b n fice des programmes paludisme 1260 HJ et bilharziose 720 HJ Le montant total des d penses au titre de l ann e 2005 s l ve quatre cent quatre vingt six million huit cent soixante huit mille vingt 486 868 020 francs CFA 473 748 880 CFA en d penses propres au CERMES auquel il faut ajouter 13 119 140 CFA de cr dits revers s d
55. laporte E Mboup S 2006 Prevalence of the HIV infection and five other sexually transmitted infections among sex workers in Niamey Niger Bulletin Soci t Pathologie Exotique sous presse 1 4 Autres publications I Duplantier JM Duchemin JB Chanteau S amp Carniel E 2005 From the recent lessons of the Malagasy foci towards a global understanding of the factors involved in plague reemergence Veterinary Research 36 3 437 53 Groupe d Etudes sur la Peste 2006 Atlas de la peste a Madagascar Coordination scientifique Suzanne Chanteau 94 pages Editions IRD IP AUF ISBN 2 7099 1569 3 sous presse Duchemin JB Fournier PE amp Parola P 2006 Les puces et les maladies transmises l homme M decine Tropicale sous presse Migliani R Chanteau S Rahalison L Ratsitorahina M Boutin JP Ratsifasoamanana L amp Roux J 2006 Epidemiological trends for human plague in Madagascar during the second half of the 20th Century a survey of 20 900 notified cases Tropical Medicine International Health sous presse Rahalison L et Chanteau S Manuel de laboratoire pour le diagnostic rapide de la peste Document technique OMS Gen ve sous presse 44 Ferdinand S Sola C Chanteau S Ramarokoto H Rasolonavalona T Rasolofo Razanamparany V amp Rastogi N 2005 A study of spoligotyping defined Mycobacterium tuberculosis clades in relation to the origin of peopling and the demographic history in Madagascar Infection
56. mens et l exploitation des donn es un contr le de qualit r gulier interne et externe et l change p riodique des donn es La tr s faible incidence des m ningites n a permis de recueillir qu un petit nombre de souches en 2005 12 N meningitidis 25 S pneumoniae et 3 H influenzae b En cumulant les deux ann es 2004 et 2005 198 souches ont t analys es Les r sultats sont les suivants 111M meningitidis tous sensibles l amoxicilline et au chloramph nicol antibiotique de l re intention le plus souvent utilis en cas de suspicion de m ningite au Niger 63 S pneumoniae dont 10 r sistantes au chloramph nicol 1 r sistante l oxaciline et 2 pr sentant une r sistance diminu e la p nicilline et oxaciline La r sistance du pneumocoque de 15 8 au chloramph nicol est particuli rement inqui tante quand on sait que pour de nombreux agents de sant au Niger le traitement d une m ningite bact rienne consiste administrer une dose unique de chloramph nicol huileux traitement qui n est recommand que pendant les pid mies m ningocoque 24 H influenzae b dont aucune n est r sistante au b ta lactamines et une seule est r sistante au chloramph nicol Le CERMES poursuivra cette activit de surveillance en 2006 3 Etude de la l talit des m ningites bact riennes au Niger Dans tous les pays de la ceinture africaine de la m ningite la l talit des m ningites proportio
57. microbiologiques facteurs g n tiques de l h te facteurs g n raux Projet Impact de la vaccination par le vaccin conjugu anti m ningocoque A en Afrique sur le portage asymptomatique Etude multipays qui pourrait d marrer d s la fin 2006 sous la coordination scientifique du Meningococcal Vaccine Project et PATH Enfin le CERMES continuera collaborer avec le Centre Collaborateur OMS de Marseille Le Pharo pour des tudes g n tiques sur les souches de m ningocoques du Niger en concertation avec l Unit des Neisseria de l Institut Pasteur Paris 19 PALUDISME Responsable du programme Jean Bernard Duchemin m decin Chef de I Unit Parasitologie Chercheurs associ s du Cermes Rabiou Labbo entomologiste charg de recherche Unit Parasitologie Laminou Ibrahim Maman v t rinaire assistant de recherche Unit Parasitologie Isabelle Jeanne m decin Chef Unit Sant Environnement Climat Pascal Boisier M decin chef Unit Epid miologie Cyrille Czeher chercheur stagiaire Unit Parasitologie Collaborations locales Ibrahim Ousmane Boubakar Fouta Salissou Adamou Programme National Lutte contre le Paludisme Luc Descroix IRD Niger Eric Adehossi Facult des Sciences de la Sant Collaborations internationales Pr Philippe Brasseur IRD S n gal Dr Daniel Parzy Le Pharo Marseille Dr Didier Fontenille IRD Montpellier Institut Pasteurs Paris Cambodge S n gal M
58. n des sujets qui meurent de la maladie parmi ceux qui la contractent est une donn e tr s incertaine alors que c est le meilleur estimateur de l efficacit de la prise en charge des malades Les chiffres publi s se r f rent aux d c s rapport s parmi les suspicions cliniques de m ningites Or entre la suspicion clinique et la r alit d une m ningite le foss peut tre norme La l talit peut tre influenc e par la nature du germe en cause par la rapidit du diagnostic et par le traitement administr La l talit officielle des m ningites au Niger tait de 8 en 2004 et 11 en 2005 Une tude a t d marr e pour mesurer la l talit des m ningites au Niger partir des cas suspects notifi s pour lesquels un chantillon biologique de liquide c phalorachidien LCR avait t adress au CERMES Les informations disponibles dans la base de donn es aliment e depuis 2002 ont t compl t es par un recueil actif de donn es dans les formations sanitaires Les donn es actuellement disponibles portant sur 1408 dossiers document s montrent des r sultats tr s contrast s Figure 3 Alors que la l talit est de 6 2 pour les m ningites m ningocoques elle bondit 34 6 pour les m ningites a H influenzae et 52 5 pour celles dues a S pneumoniae Ces trois germes sont les principaux agents des m ningites bact riennes En p riode pid mique c est le m ningocoque qui cause la majorit
59. nne Assistante de Recherche Fati Sidikou Ing nieur Biologiste Ali ElHadj Mahamane Ing nieur Biologiste Isabelle Jeanne M decin Chef Unit SIG t l d tection Collaborations locales Ali Djibo Directeur G n ral de la Sant Publique Minist re de la Sant Publique LCE Kairo Kan Kaka Chef du Service National de l Information Sanitaire SNIS Minist re de la Sant Publique Zaneidou Maman Technicien au SNIS Minist re de la Sant Publique Soga Garba M decin DPC Bureau OMS a Niamey Adamou Oumarou M decin chef du Pavillon R Madras H pital National de Niamey Diatta Aissa M decin Chef P diatrie B Hopital National de Niamey Kourna Mamadou P diatre Coordonnateur du R seau National Hib Francoise Gay Andrieu M decin Chef du laboratoire de biologie H pital National de Niamey Collaborations internationales Plate forme technique PTS Institut Pasteur Paris France Farida Nato CNR et Unit Neisseria Institut Pasteur Paris France Jean Michel Alonso et Muhamed K Taha Centre Collaborateur OMS pour les m ningocoques IMTSSA Le Pharo Marseille France Pierre Nicolas Multi disease Surveillance Center OMS Ouagadougou Burkina Faso Mamadou Djingarey Denis Kandolo Brehima Koumar MMMP Manchester Grande Bretagne Ray Borrow CNR Pneumocoques H pital G Pompidou Paris France Emmanuelle Varon AAMP Paris Judith Muller Betty Lafourcade Alfred Da Sylva R seau International des Ins
60. ntation de 24 par rapport a 2004 Parmi les 11 agents recrut s on compte 8 contractuels 2 fonctionnaires et un appel du service civique Trois contractuels 2 m decins 1 pharmacienne ont t int gr s dans la Fonction Publique et re affect au CERMES Il y a eu galement trois d parts dont deux contractuels une pharmacienne et un chauffeur et un appel de service civique national Si l on ajoute la dizaine de stagiaires et d tudiants en pr paration de m moire le CERMES compte 65 a 70 personnes soit le double par rapport 2002 Une bonne partie des nouveaux agents ont t recrut s en contrat dur e d termin CDD pris en charge sur des cr dits de projets Il s agit souvent de jeunes dipl m s ing nieurs techniciens sup rieurs form s au CERMES pendant 2 ans le temps du service civique national Dans l impossibilit de cr er des postes dans le budget de l Etat la prolongation de leur contrat est tributaire des projets Entre 2002 et 2005 le nombre de cadres de cat gorie AI m decins chercheurs ing nieurs et A2 agents ma trise techniciens sup rieurs a augment significativement tableau 1 et figure 1 Tableau 1 Evolution des effectifs par cat gorie de 2002 2005 KH EE 20 ree teapot pe pe fa 2009 pete tststststs a Total 2005 a 15 cadres dont 5 expatri s 6 fonctionnaires et 4 contractuels b 22 techniciens sup rieurs dont 5 fonctionnaires et 10 appel s du service ci
61. ocartes de la zone d tude de Ingall Stage de DEA Sciences de l information g ographique Institut francilien des g osciences Universit de Marne la Vall e 2005 Arne Bomblies Hydrologie et paludisme mod lisation Stage de terrain 6 mois au CERMES 2005 PhD Massassuchets Institute of Technology amp Harvard Medical School En pr paration Boubacar Koroney Schistosomiase urinaire an mie et d veloppement staturo pond ral Etude chez les coliers nig riens Doctorat en m decine Facult des Sciences de la Sante Niamey Niger En pr paration Zakou Abdou Applicabilit de la technique d autopsie verbale a l tude de la mortalit sp cifique par paludisme en zone rurale Doctorat en m decine Facult des Sciences de la Sant Niamey Niger En pr paration 40 13 Moise Gabriel Part du paludisme et paludismes graves dans les hospitalisations a Hopital National de Niamey Doctorat en m decine Facult des Sciences de la Sant Niamey Niger En pr paration 14 Mamane Laminou Ibrahim Chimior sistance de P falciparum au Niger Doctorat de Biologie Animale Universit Cheikh Anta Diop Dakar S n gal En pr paration 15 Hadiza Hassane Polymorphisme g n tique de P falciparum au Niger Doctorat de Biologie Animale Universit Cheikh Anta Diop Dakar S n gal En pr paration 1 2 Encadrement de stages de techniciens Le CERMES accueille des tudiants de P ENSP cole de formation
62. ogie est bien ancr e dans la r alit sanitaire du pays et correspond aux pr occupations du Minist re de la Sant Publique et du PNLP Mais il est vident que d autres pays sah liens b n ficieront de ces connaissances Les perspectives de financements des tudes li es a l environnement sont r elles compte tenu du tissu de collaborations tablis depuis trois ans pla ant le CERMES dans une situation tout a fait privil gi e Notre appartenance a plusieurs r seaux internationaux et r gionaux de surveillance de la chimior sistance est un facteur favorisant pour assurer la p rennit de cette activit 25 SANTE ENVIRONNEMENT ET CLIMAT Responsable du programme Isabelle JEANNE m decin chef Unit Sant Environnement Climat SEC Chercheurs et autres personnels associ s du CERMES Jean Bernard Duchemin M decin chef Unit Parasitologie M lina Kalache agronome informaticienne Unit SEC Maimouna Boulama m decin stagiaire de recherche Unit SEC Oumarou Alto Technicien sup rieur en pid miologie Unit SEC Pascal Boisier M decin chef Unit Epid miologie Rabiou Labbo entomologiste charg de recherche Unit Parasitologie Laminou Ibrahim Maman v t rinaire assistant de recherche Unit Parasitologie G rard Tchibozo ing nieur informatique SIG prestataire Unit SEC Alkali Amadou ing nieur informatique SIG prestataire Unit SEC Moussa Mouhaimini ing nieur m t orologiste prestatair
63. ompagn e d un nombre important d tudes de terrain Le personnel a ainsi t renforc de fa on notable Au terme de 3 ans de reprise des activit s de recherche de nombreux travaux scientifiques ont t publi s et d autres sont en cours de parution ou de soumission Lors du congr s international de m decine tropicale en septembre a Marseille la participation du CERMES a t importante par le nombre de chercheurs nig riens et de communications pr sent es Enfin l organisation par le CERMES et l Institut Pasteur d un grand colloque international sur les m ningites Niamey a marqu la fin de l ann e 2005 Le recyclage et la formation de son propre personnel sont rest s une priorit tandis que de nombreux tudiants et stagiaires se sont succ d s et plusieurs ateliers r gionaux ont t organis s Tous ces progr s n auraient pu tre obtenus sans l adh sion et la motivation de l ensemble du personnel qui se sent partie prenante de son institut Mais au del c est avec beaucoup de satisfaction que nous soulignons le soutien permanent du Minist re de la Sant tr s conscient de l apport du CERMES au sein de ses structures mais aussi la sollicitude notre gard de l Ambassade de France et de son Service de Coop ration Cette volution favorable de l tablissement s est traduite galement au niveau de son budget Les indicateurs de d penses en investissement et en fonctionnement hor
64. ools for the surveillance of epidemic meningococcal diseases Colloque International Challenges in the African Meningitis Belt Communication orale Niamey Niger Novembre 2005 45 2 2 2 3 Boisier P Boubacar H Sidikou F Djibo S Kairo KK amp Chanteau S Case fatality rate of bacterial meningitis with regard to the situation in Niger Colloque international Challenges in the African Meningitis Belt Communication orale Niamey Niger Novembre 2005 Amadou Hamidou A Djibo S Elhaj Mahamane A Moussa A Findlow H Sidikou F Cisse R Garba A Borrow R Chanteau S amp Boisier P Carriage of N meningitidis and protective immunity to meningococci in schoolchildren in Niamey with focus on serogroup W135 Colloque International Challenges in the African Meningitis Belt Communication orale Niamey Niger Novembre 2005 Paludisme Duchemin JB Le portage asymptomatique du paludisme de l enfant au Niger Journ es Nationales de P diatrie Communication orale Niamey Niger F vrier 2005 Duchemin JB Pr valence parasitaire quel int r t pour l valuation de la transmission Atelier Paludisme Antananarivo Madagascar Mars 2005 Labbo R Hassane H amp Boisier P Coinfection paludisme et schistosomose urinaire en milieu rural au Niger XVI me Congr s International Medicine and Health in the Tropics Poster Marseille France Septembre 2005 Labbo R H Hassane JB Duchemin amp P Boisier Malar
65. ouches de portage asymptomatique montre en saison s che un nombre moyen de clones identiques 2 01 aussi bien dans deux villages de la zone de Tahoua que dans la zone de Gaya n 84 22 Part du paludisme dans les syndromes f briles Un suivi des syndromes f briles avec une confirmation biologique recherche d antig ne HRP2 par test rapide a t mis en place dans la zone de Dantiandou en collaboration avec les unit s Epid miologie et SEC La surveillance hebdomadaire de l activit de quatre dispensaires et d une case de sant complete le dispositif de suivi de la transmission La figure 3 montre l exemple du CSI de Dantiandou La saisonnalit appara t tr s bien marqu e au niveau clinique de mani re synchrone avec les marqueurs paludom triques de transmission En parall le nous avons galement mis en place un suivi hebdomadaire similaire en zone urbaine dans 3 services hospitaliers a Niamey Ce suivi nous permettra d avoir des donn es sur les cas graves de paludisme CSI de Dantiandou Activit s li es au paludisme 50 age HRP2 positifs N 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 Figure 3 Recueil hebdomadaire d une journ e d activit s du CSI de Dantiandou de la semaine 20 d but Mai la semaine 52 fin D cembre en 2005 En ligne pointill e figure le nombre de consultants pr lev s et en ligne continue le pourcentage de patient
66. poussi res ne suffisent pas elles seules expliquer l apparition des cas de m ningites 11 cependant la plupart des pics de m ningites sont pr c d s d un pic de poussi res dans les 2 4 semaines pr c dentes Les vents de poussi res constituent un facteur favorisant mais non d terminant D autres tudes sur la physique et la chimie des particules de poussi res collaboration avec l IRD pourraient permettre de pr ciser le m canisme par lequel elles interviennent Les premiers r sultats ont t pr sent s la conf rence internationale AMMA Dakar en D cembre 2005 AMMA Afrique Le CERMES est membre du comit scientifique et coordonne avec le CSE Centre de Suivi Ecologique de Dakar la th matique Impacts sur la sant La strat gie pour r aliser les projets du plan scientifique AMMA Afrique a t d finie en Novembre a Dakar Le CERMES est charg d tudier l impact de l environnement sur le paludisme une micro chelle Nos actions se d roulent dans les villages de Banizoumbou et de Zindarou en collaboration avec le MIT Harvard et l IRD au Niger Le financement est assur par NOAA et le CERMES 31 OMNI GF Suivi de la morbidit li e au paludisme avant et apr s la campagne de distribution de masse de moustiquaires impr gn s au Niger Utilisation de balises Argos pour la transmission des donn es sanitaires et environnementales L tude pilote de faisabilit et d effici
67. res simples Le CERMES appuie le PNLP pour suivre au mieux la r sistance aux 20 traitements dans le pays Ces derni res tudes s effectuent en collaboration avec les r seaux constitu s au sein du RIIP projet FSP RAI Par ailleurs en d cembre 2005 a eu lieu une grande campagne nationale de distribution de 2 5 M de moustiquaires impr gn es int gr e ad une campagne de vaccination contre la poliomy lite Le CERMES est charg de suivre l volution de la morbidit li e au paludisme avant et apr s distribution des moustiquaires projet financ par le Global Fund 1 Etude de la transmission En 2004 des zones d tudes sur la transmission du paludisme avaient t cibl es comme sites sentinelles du PNLP Cependant pour des raisons logistiques le site d Agadez en zone saharienne avait t remplac par le site d Ingall situ en zone pr saharienne voir sur la figure les zones bioclimatiques du Niger et les sites d investigation du CERMES La zone sah lienne avait montr alors une forte h t rog n it entomologique justifiant en 2005 un chantillonnage transversal d Est en Ouest dans 12 villages centr s sur cette bande bioclimatique Les techniques standardis es d chantillonnage utilis es sont les pi ges lumineux les captures de faune r siduelle dans les maisons et les captures actives l atterrissage Dans chacune des trois zones co climatiques la pr valence parasitaire goutte paiss
68. ris Vincent Turbat Repr sentant Banque Mondiale au Niger Marlene Lays Repr sentante FNUAP au Niger Enseignants du Cours R gional OMS TDR Immunologie Andr et Monique Capron Institut Pasteur Lille Launois P Tacchini Cottier F Perea W OMS Gen ve Cazenave PA Louis J Milon G Alonso JM Buffet P Institut Pasteur Paris Cha Orbea H Corradin G Universit de Lausane Debard N Corneille Y Kraehenbuhl JP Institut Suisse Recherche Cancer Delaporte E IRD Montpellier Genton B Institut Tropical Suisse B le Wild F Inserm U 404 Lyon ect Chercheurs dans le cadre du projet AMMA Analyse Multidisciplinaire Mousson Africaine Konne K NOAA Lebel T Descroix L Rajot JL Boulain N Gignoux J IRD Trishka S et Ceccato P IRI New York Participants du Colloque International M ningites Niamey B Greenwood M Laforce Teyssou R Darshna T Alonso JM Caugant D Nicolas P Maiden M Mayer L Stephens D Nassif X Sow I Ndihokubwayo JB Olcen P Traore R Sanou S Dodet B Koumare B Sow S Borrow R Block C Bertherat E Perea W Preciosi MP Soriano M Boudougou F Cadoz M Da Silva A De Wals P Fermon F Girard M Hewison C Hodgson A Issabre Y Glennie L Kandolo D Deme I Trotter C Welsch JA Zombre S ect Marcel Hommel Liverpool School of Tropical Medicine Comit Scientifique OMNI Eltahir Elfatih Massachusset Institute Technology Boston Barryson Andriamahefazafy Section Paludisme OMS AFR
69. rquoi un projet de construction d un centre de formation et d accueil est en cours d laboration et de soumission En plus des cours et des s minaires nous pourrons galement y organiser des ateliers th matiques pour le recyclage des techniciens de la p riph rie dans le cadre du R seau National des Laboratoires Un renforcement du personnel d encadrement sera n cessaire Un poste de volontaire international a t demand la Coop ration Fran aise l Cours OMS de recyclage en Immunologie et Maladies Infectieuses Tropicales OMS DDC CERMES IPP IUIS 8 pays participants Niamey Niger Mars 2005 2 Atelier Paludisme de l Institut Pasteur de Madagascar Antananarivo Madagascar Participation de Jean Bernard Duchemin comme formateur Avril 2005 3 Atelier Pr visions saisonni res co organis avec l ACMAD PRESAO 08 climat et sant Niamey Niger 2005 4 Atelier Climat et Sant co organis avec l IRI New York et ACMAD Niamey Niger Novembre 2005 5 Colloque International sur les m ningites Challenge in the African meningitis belt Organis par l Institut Pasteur et le CERMES en partenariat avec la Fondation M rieux 27 pays participants Novembre 2005 41 1 4 Formation des agents en service civique national Les jeunes dipl m s nig riens techniciens ma trise ing nieurs ont la possibilit d effectuer un service civique volontaire dans une structure de l Etat C
70. rvention du FNUAP Le LNR a labor un protocole pour valuer la s ropr valence du VIH chez 400 femmes enceintes des districts sanitaires suivants Loga r gion de Dosso Gour Magaria Mirriah Tanout r gion de Zinder et Arlit r gion d Agadez Pour les professionnelles du sexe un effectif de 200 sujets est pr vu a Dirkou r gion d Agadez et Maimoudjia r gion de Zinder Les r actifs et petits mat riels ont t r ceptionn s en novembre et les activit s de terrain ont d marr fin d cembre d s la mise en place effective des fonds du FNUAP Les r sultats seront disponibles m1 2006 S ropr valence en population g n rale dans le cadre de PEDSN MICS IIL La premi re enqu te nationale de s ropr valence du VIH a t r alis e par le CERMES et PONG CARE en 2002 La premi re enqu te d mographique sanitaire au Niger EDSN r alis e en 2000 n incluait pas le VIH Elle est pr vue tous les cing ans La deuxi me enqu te EDSN est plac e sous la responsabilit de l Institut National de la Statistique et MACRO Elle devait se d rouler en 2005 mais pour des raisons logistiques elle n aura lieu qu en 2006 Le LNR a particip l laboration du protocole aux r unions du Comit technique de pilotage et a la formation des enqu teurs en 2005 Toutes les s rologies VIH 12 000 tests seront effectu es au CERMES Le contr le externe de qualit sera assur par le laboratoire national d
71. s porteurs d antig ne plasmodial Entomologie Pr sences et abondances de vecteurs Anopheles funestus bon vecteur du paludisme a t retrouv pour la troisi me ann e cons cutive dans trois villages en zone sah lienne confirmant sa r implantation dans cette zone Anopheles gambiae sl est toujours le principal vecteur du paludisme au Sahel En 2005 il repr sente globalement 91 des anoph les captur s en saison s che Dans la zone de Dantiandou An arabiensis repr sente 64 des sp cimens captur s au long de l ann e Tout comme Niamey 2004 la forme mol culaire M d An gambiae ss y est majoritaire 80 Dans le reste du pays la proportion de gambiae arabiensis est variable avec une forte majorit de gambiae ss dans la zone de Gaya et plus quilibr e dans les autres zones Tessaoua et In Gall Outre An gambiae sl et An funestus il a t captur d autres anoph les dont An rufipes An pharoensis et An hervyi esp ce end mique de r partition troite Index sporozoitiques La proportion de moustiques infect s dans la zone de Dantiandou a t d termin e par d tection de l antig ne CSP par ELISA n 2092 Ces index sont proches pour les deux vecteurs An gambiae sl IS 2 50 et An funestus 1 96 Ces index sont pour la m me p riode de 23 capture et la m me zone sah lienne deux fois plus lev s que celui relev il y a une vingtaine d ann es lors d une enqu te transversal
72. s serogroup A during a clinical trial in Niger Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene sous presse Amadou Hamidou A Dyibo S Elhaj Mahamane A Moussa A Findlow H Sidikou F Cisse R Garba A Borrow R Chanteau S amp Boisier P 2006 Prospective survey on carriage of Neisseria meningitidis and protective immunity to meningococci in schoolchildren in Niamey Niger with focus on serogroup W135 Microbes and Infection sous presse Alonso JM Bertherat E Borrow R Chanteau S Cohet C Dodet B Greenwood B Laforce M Muros Le Rouzic E Teyssou R Ouedraogo Traore R amp Sow I 2006 From genomics to surveillance prevention and control new challenges for the African Meningitis belt Meeting report Niamey November 2005 Vaccine sous presse Chanteau S Dartevelle S Elhadj Mahamane A Djibo S Boisier P amp Nato F 2006 New rapid diagnostic tests for Neisseria meningitidis serogroups A C Wis and Y PloS Medicine sous presse 43 1 2 l Paludisme Dia I Diallo D Duchemin JB Ba Y Konate L Costantini C amp Diallo M 2005 Comparisons of human landing catches and odor baited entry traps for sampling malaria vectors in Senegal J Med Entomol Mar 4 2 2 104 9 Gay Andrieu F Adehossi E Lacroix V Gagara M Ibrahim M L Kourma H amp Boureima H 2005 Epidemiological clinical and biological features of malaria among children in Niamey Niger Malaria Journal 4 1 10 Ariey F
73. s charges en personnel respectivement de 22 et 56 sont la preuve de la vitalit du centre La subvention de l Etat a t port e 100 millions CFA mais cette progression reste encore insuffisante pour couvrir l ensemble des charges structurelles 150 millions CFA Il faut relever que 86 du budget r alis en 2005 ont t repr sent s par des cr dits ext rieurs g n r s gr ce au dynamisme des quipes et la pertinence des projets En mars 2005 le statut g n ral du CERMES a t adopt en Conseil des Ministres mais il n a t rendu officiel qu en 2006 Les deux organes de d cision le Conseil d Administration et le Conseil Scientifique vont donc tre cr s Tout s annonce pour que nous consid rions l ann e 2006 venir avec beaucoup d optimisme malgr la persistance de certaines difficult s Il faut s en r jouir car en effet 2006 sera marqu e par l valuation du CERMES au terme de la Convention de Coop ration Scientifique qui lie le Gouvernement du Niger et l Institut Pasteur a Paris Dr Suzanne CHANTEAU Directrice Organigramme du CERMES Institut Associ du R seau International des Instituts Pasteur Institut Pasteur Direction Dr Suzanne CHANTEAU Service Adm Fin Hamza IRO Services Unites de Recherche Epid miologie Labo Analyses M dicales Dr Pascal BOISIER Dr Saacou Djibo ae Biologie i IOOU u Dispensaire Parasitologie Dr Zilahatou Tohon Informatique Doc
74. talit p a 100 A H influenzae S pneumoniae Autre LJ Gu ri LJ D c d 4 Mise au point et valuation de tests bandelettes pour le diagnostic rapide des m ningites bact riennes Au Niger comme quasiment partout dans les pays de la ceinture africaine de la m ningite le diagnostic tiologique des m ningites bact riennes est exceptionnel au niveau des formations sanitaires de base l o est prise en charge la majorit des malades Dans les structures de niveau plus lev les laboratoires sont rarement op rationnels et les examens de base tels que la coloration de gram et la num ration des cellules dans le LCR sont souvent indisponibles Actuellement les tests dits rapides sont repr sent s par les tests d agglutination de particules de latex qui ont comme gros handicap d tre co teux et de n cessiter des tapes de pr paration du LCR non r alisables dans les structures d nu es d quipement Il y a donc un besoin pressant d un test de diagnostic rapide simple peu co teux et facile mettre en uvre dans les centres de sant de base par des agents de sant sans formation particuli re Ce test contribuerait am liorer la pr cocit de l alerte en cas d pid mie de m ningite m ningocoque et permettrait une meilleure prise en charge des malades Le projet associant la plateforme technique PTS de l IP Farida Nato et le CERMES Suzanne Chanteau a d marr en 2003 avec l objectif
75. tituts Pasteur Yaound Bangui Dakar Abidjan Ho Chi Minh Ville Financements 2005 Institut Pasteur Paris Sanofi Pasteur Minist re Fran ais des Affaires Etrang res Repr sentation OMS au Niger Minist re de la Sant Publique LCE du Niger OMS Gen ve 12 Contexte Les m ningites bact riennes sont un probl me sanitaire de premier plan au Niger 1 27 millions Km 12 millions d habitants pays situ en pleine ceinture africaine de la m ningite Cette zone est caract ris e par la forte incidence des m ningites Neisseria meningitidis A la recrudescence saisonni re des cas observ e chaque ann e en saison s che viennent s ajouter p riodiquement des pid mies d vastatrices durant lesquelles on peut observer des taux d attaque atteignant 1000 cas pour 100000 habitants En p riode inter pid mique les milliers de cas annuels sont dus N meningitidis mais aussi S pneumoniae et H influenzae b germes dont le poids en sant publique est trop sous estim Les pid mies d m ningocoque taient classiquement li es au s rogroupe A Depuis quelques ann es le s rogroupe W135 tait observ l occasion de cas sporadiques dans les pays de la ceinture mais en 2002 il a r v l son potentiel pid miog ne par une pid mie de grande ampleur au Burkina Faso Les vaccins contre le s rogroupe W135 A C W135 A C Y W135 tant produits en quantit r duite et tant encore assez co teux leur
76. ue Dot Blot pour le diagnostic et le s rogroupage de Neisseria meningitidis s rogroupe A et W135 Doctorat de Pharmacie Facult de M decine Pharmacie et Odonto stomatologie Bamako Mali 2005 Ciss Rahamatou Moustapha Boukary Mise au point d une m thode ELISA pour le diagnostic de Neisseria meningitidis A et W135 partir de liquide c phalo rachidien DEA Biotechnologie Universit de Ouagadougou Burkina Faso 2005 Rabiou Dare Facult des Sciences de la Sant Niamey Niger Validation d un test de diagnostic rapide sur bandelette pour les m ningites m ningocoques r sultats pr liminaires Doctorat en m decine Facult des Sciences de la Sant Niamey Niger 2005 Cyrille Czeher Utilisation de l ELISA CSP dans l tude du developpement sporogonique P falciparum dans deux esp ces vectrices au Niger Master biologie sp cialit h te et vecteur infectieux option parasitologie Universit de Versailles St Quentin 2005 Partha Sarathy Banerjee Tests colorim triques de chimior sistance in vitro de P falciparum au Niger M moire de Masters of Science of Biology of Control of Parasites amp Disease Vectors Liverpool School of Tropical Medicine 2005 Kalil Ba D veloppement et valuation d un test ELISA p nicillinase pour le diagnostic et le s rogroupage des m ningocoques M moire fin d Etudes d Ing nieur Agronome option biotechnologie Universit A IBN Badis Alg rie 2005 Thomas Dupuy Spati
77. umentation M lina Kalache amp Sani Haladou Dr Jean Bernard DUCHEMIN SIG T l d tection Dr Isabelle JEANNE PERSONNEL DU CERMES Le personnel du CERMES est compos en 2005 de 57 agents dont 4 assistants techniques 3 MAE 1 IPP 1 volontaire international MAE 13 fonctionnaires 29 contractuels et 10 agents en service civique Des prestataires de service des tudiants et des stagiaires compl tent cette quipe Directrice Dr Suzanne Chanteau Service Administratif et Financier Moyens g n raux Hamza Iro Chef de Service Issaka Seydou TS Adjoint Sani Tankari Barmou TS en service civique Mahamadou Moustapha Mallam Moussa Comptable Aissa Seyni standardiste accueil Sahabi Alhach Boubacar Daouda Issaka Mossi agents d entretien Hamissou Garba gardien Alhad Islamane in memorium manceuvre sp cialis Modi Seyni Maman Lawan Yacouba Falalou Mahamadou Yombo K chauffeurs coursiers Laboratoire Analyses M dicales et bact riologie m ningites Dr Saacou Dyibo Chef de Service m decin biologiste chercheur Mahamadou Izamn TS laboratoire surveillant temps partiel Amadou Moussa Moumouni Ousse ni AdamouYacouba Techniciens laboratoire Kaltouma Salifou TS laboratoire en service civique Adama Moussa aide laborantine secr taire accueil Boureima Amadou manceuvre pour laverie Laboratoire National R f rence VIH SIDA Pr Saidou Mamadou Chef de servic
78. upe A comptait pour 66 des m ningocoques Le s rogroupe W135 identifi dans des LCR re us de 13 districts comptait pour 12 1 des m ningocoques soit moins que le s rogroupe X 21 8 des m ningocoques identifi s L age moyen des patients ayant fait l objet d un examen de LCR au CERMES tait 10 2 ans et 82 1 avaient moins de 15 ans Les patients chez lesquels N meningitidis a t identifi avaient en moyenne 9 1 ans et 92 4 avaient moins de 15 ans Les patients de sexe masculin taient les plus nombreux 59 5 La distribution des s rogroupes A X et W135 selon le sexe du patient n tait pas significativement diff rente La distribution des s rogroupes de N meningitidis variait suivant les r gions A l ouest Niamey Tillaberi Dosso les seuls s rogroupes identifi s taient X et W135 tandis que dans les r gions de l est Maradi et Zinder le s rogroupe A tait le plus fr quent Figure 2 Le nombre d identifications de pneumocoques a t comparable a celui de l ann e 2004 166 pour 146 en 2004 Par contre A pneumoniae repr sentait en 2005 une proportion bien plus lev e des cas confirm s 37 4 des germes identifi s qu en 2004 en raison de la faible incidence des m ningites m ningocoque en 2005 L ge moyen des patients tait de 12 4 ans et 58 2 des malades taient de sexe masculin Une infection par H influenzae a t identifi e sur 44 LCR 10 1 des tiologies identif
79. urs images satellites cartes et aux informations climatiques afin d identifier les param tres les plus pertinents Le but ultime est de fournir un outil de suivi pid miologique et de pr vision des pid mies aux services sanitaires du pays Cette base de donn es sera mise en relation avec le logiciel Health Mapper d j utilis par certains services du Minist re de la Sant Un technicien a t form pour mettre en lien les diff rentes bases de donn es Les proc dures d acquisition de donn es m t orologiques et la n gociation d un protocole de collaboration avec la Direction de la M t orologie Nationale du Niger DMN sont en cours Un atelier mi parcours s est d roul Niamey en Juillet 2005 rassemblant l OMS le CERMES et les repr sentants des programmes nationaux des pays sah liens participants Plusieurs spatiocartes de sites d tudes ont d j t r alis es La conception des outils Web mapping et de sa base de donn es a t finalis e 30 L int gration r gionale du projet doit tre d velopp e dans la prochaine phase AMMA Analyses Multidisciplinaires de la Mousson Africaine AMMA est un ambitieux projet de recherche mondial et multidisciplinaire pour tudier la mousson africaine Plusieurs supersites d observation sont implant s en Afrique de l Ouest dont l un se trouve au Niger a 80 km de Niamey supersite de Fakara Le CERMES est impliqu dans les composantes AMMA EU AM
80. us complet et proche des activit s de routine des infirmiers par ailleurs tr s sollicit s par d autres programmes Les bilans hebdomadaires les alertes et les messages informations caract re logistique sanitaire ou de s curit ont t cod s Ils sont modifiables en fonction de l actualit exemple la grippe aviaire a pu tre incluse d s la semaine de sa confirmation au Niger 32 Transmission fiable et rapide de donn es pid miclogiques d j num ris es NIAMEY Syst me Argos Districts e ean heures ee eee er ae Sites sentinelles Centres de sante ne RE e 3 2 Za es Lots er er ZA ACIP SIG T l d tection Il s agit d une action inter pasteurienne incluant les Instituts Pasteur d Alg rie du Maroc site de Tanger de Tunis de Dakar de Madagascar en collaboration avec l Universit de Marne la Vall e Son but est de cr er et d animer un r seau d utilisateurs des outils SIG t l d tection a travers un exemple d application propre a chaque institut Un atelier de formation a eu lieu en 2004 suivi de 2 autres r unions en 2005 avec les quipes de l Institut Pasteur de Dakar et celle de l Institut Pasteur de Madagascar Le projet a atteint son objectif en ayant contribu a former des utilisateurs de ces m thodes au sein du RIIP Plusieurs publications sont en cours Perspectives Pour terminer sur les activit s 2005 de l Unit SEC nous ferons remarqu
81. vique et 7 contractuels c 6 techniciens dont I fonctionnaire et 5 contractuels d 14 agents d ex cution contractuels Figure 1 Evolution de la structure du personnel par grade de 2002 a 2005 Evolution Personnel par Grade 2002 2003 2004 2005 Med amp Cherch E Ing TSL amp TA O Tech O Auxiliaires On note galement un rajeunissement du personnel ge m dian pass de 39 ans 35 ans dont le manque d exp rience professionnelle est un handicap r el pour l avancement des projets Il faut signaler le d part la retraite en 2006 de deux chercheurs fonctionnaires le chef du laboratoire de bact riologie et entomologiste de l unit de parasitologie Il est urgent de programmer la formation de jeunes chercheurs nig riens dans ces sp cialit s 2 Situation budg taire et comptable 2 1 Les pr visions budg taires 2005 Le projet de budget 2005 avait t arr t pour un montant global de cinq cent soixante sept millions trois cent soixante huit mille six cent soixante six 567 368 666 CFA Il inclut un report 2004 de cr dits de projets de 91 200 827 CFA Les nouvelles pr visions de projets s l vent a 326 167 839 CFA Figure 2 Evolution du budget de 2002 2005 et pr visions 2006 Evolution du Budget CERMES 2002 2006 en million de CFA 1 000 900 800 700 600 500 400 300 200 100 2002 2003 2004 2005 2006 B Subventions W Ress Propres OProjets

RAPPORT ANNUEL 2005

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