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MANUEL D`UTILISATION et TUTORIEL

1. s Fons Sealistics at Table fae ether or beatin Hra clea dae dee eee rene p re urs Ls ue Sie Fi TE Fe Inout value raster iritan arms ERS Cart table S Cirian Pak Taala Diaa n LAS Tae Le Ignore Holma in calet opara alatis ypa apanan LL tableau peut maintenant tre utilis pour joindre nouveau le fichier de forme du polygone en faisant un clic droit sur le fichier de forme de l unit de planification et en allant sur Joindre et relier gt Joindre Lorsque la fen tre de dialogue Joindre donn es appara t s lectionnez JD comme champ sur lequel sera bas le fichier joint assurez vous que le tableau de r sultat est bien le tableau joindre puis choisissez le champ JD dans le tableau comme base pour le fichier joint Cliquez sur OK si un message appara t vous demandant si vous souhaitez cr er automatiquement un index pour le tableau joint dans le champ joint Si vous utilisez les polygones d habitat et souhaitez galiser spatialement vos valeurs moyennes ERS vous pouvez envisager d attribuer un poids par zone aux moyennes de l ERS en cr ant un champ zone ex hectares ou m tres carr s dans le tableau d attribut du polygone d habitat et en divisant la valeur moyenne du polygone par la zone du polygone Cancel treercemeres Shaw Help gt gt Join Data Join lets you append additional data to this layer s attribute table so you can For examp
2. d finis n avec parall le ou groupes consid r es nombre ou a l objectif la place de valides comme total donn est target SERRES s par es d objecti en dessous DEFAUT 1 DEFAUT 1 fs qui de cette doit tre taille il ne pr serv compte pas e pour ce ia but D FAUT 1 Les valeurs sont s par es par des virgules La structure de ce fichier se pr sente sous la forme type target target2 targetocc sepnum sepdistance prop spf 1 1 1 1 1 1 0 25 10000 2 1 1 1 1 1 0 30 10000 Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 54 The Nature Conservancy d cembre 2011 5 Fichier de p rim tre de d limitation bound dat FACULTATIF Le fichier de p rim tre de d limitation contient les informations sur les co ts de d limitation des unit s de planification adjacentes Bien qu il s agisse d un fichier facultatif son utilisation est vivement recommand e car il aide d terminer le niveau de fragmentation dans la solution Ce co t est g n ralement le p rim tre de d limitation r el cependant il peut tre remplac par une valeur de co t ou de p rim tre effectif prenant en compte des limitations qui sont particuli rement souhaitables ou non Bound dat peut tre cr automatiquement en utilisant le G n rateur de donn es d entr e Marxan Ce tableau peut contenir des tabulations ou des virgules entre les colonnes Si vous remar
3. PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 9 The Nature Conservancy d cembre 2011 Introduction De nombreux pays cherchent a obtenir une aide technique afin de remplir les conditions concernant les zones prot g es Protected Areas PAs tablies par le programme de travail mondial Global Program of Work PoW lors de la septi me conf rence des parties Seventh Conference of the Parties COP 7 Le programme de travail tablit le besoin imminent d un r seau mondial de zones prot g es repr sentatives et g r es efficacement au niveau national et r gional sur terre d ici 2010 et sur mer d ici 2012 CBD 2001 TNC tient particuli rement aider les pays d velopper des r seaux de zones prot g es scientifiquement tablies et s est engag d velopper des comp tences via le d veloppement de programmes nationaux de soutien la mise en place National Implementation Support Programs NISP un programme soutenant la convention sur la diversit biologique Une fa on de surmonter les d fis techniques pos s par le processus d valuation et de traitement des carences en mati re de zones prot g es repose sur le d veloppement et l utilisation d outils pratiques bas s sur le protocole GIS pour soutenir le processus de traitement de ces carences Le d veloppement d un syst me d aide la d cision pour les carences en mati re de zones prot g es Protected Area Gap Decision Support System DSS a t con u comme partie int
4. chantillon d objectifs en faisant un clic droit sur la couche et en choisissant Ouvrir le tableau d attributs Vous verrez qu en plus des champs TARGET NAM et TARGET_ID ilya des champs suppl mentaires qui sont d crits dans le tableau ci dessous Ces champs suppl mentaires sont cr s en utilisant l outil de pr paration des objectifs et seront utilis s au cours de la prochaine tape le G n rateur de donn es d entr e Marxan MIG pour extraire les informations des champs et cr er les fichiers d entr e Marxan Vous trouverez plus d informations sur chacun de ces param tres dans Game and Grantham 2008 Ball amp Possingham 2000 et Possingham et al 2000 La proc dure de pr paration des objectifs Marxan g n re tous les champs list s en dessous des champs Target_Nam et Target_ID Une fois remplis ces champs peuvent tre utilis s dans le G n rateur de donn es d entr e Marxan MIG CHAMP TYPE DESCRIPTION Nom de l objectif C est le nom de l objectif de conservation Ce champ peut comprendre des espaces mais tous les mots TARGET_NAM TEXTE doivent commencer par une lettre Essayez de limiter le nom de l objectif 50 caract res Un double de ce champ sera cr par l outil de pr paration des objectifs et appel TNAME TARGET ID NOMBRE Identifiant de l objectif L identifiant unique attribu chaque ENTIER objectif de conservation L identifiant devrait tre limit a 16 Outils TNC pour zones prot
5. Gee pes re M RE Ds GER BUT File Bali BOL GERS Ds BBR Lit his Maur O tear et finn Bs ree Des ve TER eee ses BR CUT ee FH ieee TE 7S So See ee a e pee BLN a Er LENS Ce NUE Sa GS TH B24 ae ni LOU CR IE High RBI Planning Units at Low Risk Levels oi a O Tonton Pe A eS a PEL E br Lai Biotec i rae Bj ee GB sare i e mipi iij miti i iii Wirin iii EUR Een ri Bs Ss see Wa rae po O Pe ee eT La am 5 D a a z 3 _ THAE HE Se ee ii st OP et ee Ee EE ee ts MURALE EN ABs ieee 17 Ny Pag AR coe cio Lo a a oe 82 C tO 2 SASS Ry es PEL eo foyers 5 faeries BETI Bers a ea e aL FES 1 Be ae ee ee nu ea gt High RBI Planning Units robinet MORE p 3 EA SO n MERE 1 arf SM at High Risk Levels Bree woe OP ee au i 3 Mwah women ry rec j a ert cert FL eee sn Ms weer Bu TT weg ITS CORRE RS ET Mis PER URSS rai E et 2 DT e i TS De oe Du DOTE Os CELL Pee e A HA eve ee ee ANT Thi Meus worn wen crs P im mare Oo e a E Ten A E A a BELL i Boot pry i Bow are ny j Bi cee Lane bu fn Bi p e 1 ape EI Ge OU Lab s un 1 Beini j rg Le ii es LL RTE a Ei a Ea in aF BPs H Bar RE D 20 S ON Tapie Fu ROM PA A IT CAT los cag i aol T em 1 1 MHETRE a ee Un exemple de s lection d unit s de planification au dessus de la moyenne RBI gt 8524 et en dessous de l
6. Le but de repr sentation sera atteint pour cet objectif mais 1l pourrait l tre uniquement en aires de basse terre Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 49 The Nature Conservancy d cembre 2011 3 2 Preparation du fichier d entr e Marxan Vous trouverez dans le sch ma de la page suivante les tapes que nous vous recommandons de suivre lorsque vous conduisez une analyse Marxan Pour ex cuter les outils Marxan l utilisateur doit pr parer quatre couches de donn es de base Ces couches incluent 1 Les objectifs de conservation Ce sont les habitats ou esp ces pour lesquels des buts de conservation ont t fix s et peuvent tre repr sent s par des points des lignes ou des polygones Ces l ments doivent d abord tre s lectionn s comme des sites candidats potentiels pour atteindre les buts de conservation exprim s en nombre d occurrences points zones polygones ou p rim tre lignes sur les unit s de la carte par ex des hectares Si vous utilisez un fichier de d finition de groupes ces buts peuvent tre exprim s en pourcentage d unit s totales de l objectif Des facteurs de p nalit d esp ces peuvent tre attribu s chaque objectif en fonction de l importance de la r alisation du but de conservation pour chacun d eux Il vous est recommand d utiliser l outil de pr paration des objectifs lors que vous pr parez vos objectifs pour le G n rateur de
7. d finition Puis utilisez le LJ ee g n rateur de requ tes pour cr er ana Lite te une requ te affichant uniquement Cu Cu le les informations pour l objectif qui SELECT Patio Ttan Pak ABIL ALL_TARGETS WHERE vous int resse Une fois cette tape FOL TARIET What Limest re Feras accomplie vous pouvez symboliser cette couche en utilisant l onglet symbole dans ces Cent Comp _ Cases save les propri t s de la couche C cd i ee he Me poy Cee nae i De E aes ad on ites tae 7 du il ii S en Ae a H a Aid Tee Se ee MUR UT ee fl ii arn EL a eian Bo NE BI ES HN Bo nA E RH E i E EHN a AU LS C ELEGE ee CE jen mice Pa a F Peis Park H uit di ad HES Mineur ou au Mecs res ain eus Ba eee HAE ee CIO LEO AE pal Er nt LG Tr i mira EPS Tee BAM tre re ee DE Ft ai eg pate Bir Be IPL eA SS Fe ee ue See ess 2 D tep lire tata 0O lm pete bi E CI tien dirir rii E DHA nu E E ed Valeurs RBI classifi es uniquement selon l objectif de conservation For t_calcaire_humide Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 39 The Nature Conservancy d cembre 2011 Nous sommes maintenant pr ts ajouter les r sum s de surface statistiques du mod le de risque environnemental ERS et identifier les unit s de planification ayant une valeur RBN
8. du portefeuille L algorithme a pour but de minimiser les co ts totaux du portefeuille tout en atteignant les buts de conservation dans un r seau de sites g ographiquement r duit Cet ensemble d objectifs constitue la fonction de co ts de l objectif et se compose de trois co ts d finis par l utilisateur Co t total gt Co t de l unit gt P nalit s d esp ces gt P rim tre de d limitation o le Co t total est l objectif qui doit tre r duit le Co t d unit est un co t affect chaque unit de planification les P nalit s d esp ces sont les co ts imput s lorsque les buts d un objectif de biodiversit ne sont pas atteints et P rim tre de d limitation est un co t d termin par le p rim tre total de d limitation du portefeuille Des tentatives sont faites afin de r duire les co ts totaux de portefeuille en s lectionnant le plus petit nombre d unit s de planification ayant le co t total d unit s de planification le plus bas pour atteindre Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 43 The Nature Conservancy d cembre 2011 tous les buts de biodiversit et en s lectionnant des unit s de planification qui sont regroup es g ographiquement plut t que dispers es r duisant ainsi le p rim tre de d limitation Cette t che est accomplie en modifiant les unit s de planification s lection
9. g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 57 The Nature Conservancy d cembre 2011 chiffres Un double de ce champ sera cr par l outil de pr paration des objectifs et appel TID But de l objectif Le but de conservation pour chaque objectif indiqu en nombre d occurrences points p rim tre lignes ou zones polygones Une autre fa on de d finir le but est d utiliser le champ PROP proportion dans le fichier de BUT FLOTTANT d finition de groupe N utilisez pas les deux m thodes choisissez l une des deux Assurez vous que les unit s correspondent a ce qui est indiqu dans la fen tre de conversion du MIG les hectares et kilometres par d faut Le champ a une longueur totale de 15 chiffres Type de l objectif C est un nombre d fini par l utilisateur TYPE NOMBRE employ dans le fichier de d finition de groupe Il peut tre ENTIER identique au Target_ID La longueur totale du champ est de 16 chiffres Facteur de p nalit des esp ces Les nombres les plus lev s par ex 100 000 garantissent la r alisation des buts vis s Il NOMBRE i Re i A a SPF ENTIER peut tre ajust en fonction de la priorit des objectifs Le champ a une longueur totale de 16 chiffres Le champ a une longueur totale de 16 chiffres Occurrence de l objectif Le nombre d occurrences requises Occ NOMBRE pour l objectif de conservation Il peut tre utilis en parall le ENTIER ou a la place du but vis Le champ
10. impliquent qu il y a une abondance ou une port e des objectifs plus grandes que ce quoi l on aurait pu s attendre compte tenu de la taille de l unit d analyse au regard du reste de l environnement La plage et les valeurs des notes RBI seront diff rentes selon la combinaison et le nombre de types de donn es utilis s Ouvrez le tableau des attributs en faisant un clic droit sur la couche votre _nom_de r sultat RBI_ SUMMARY et vous pourrez observer une s rie de colonnes RBI CHAMP DESCRIPTION RBITI Moyenne de valeurs RBINon normalis e bas e sur la somme du nombre total d objectifs trouv s dans le domaine d univers ex environnement total CHAMP Moyenne de valeurs RBINon normalis e bas e sur la somme du nombre total d objectifs trouv s dans le domaine de recherche ex unit de planification hexagone Moyenne de valeurs RBINormalis e bas e sur la somme du nombre total d objectifs trouv s dans le domaine d univers ex environnement total RBNT2 Moyenne de valeurs RBI Normalis ebas e sur la somme du nombre total d objectifs trouv s dans le domaine de recherche ex unit de planification hexagone Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 37 The Nature Conservancy d cembre 2011 Une autre cat gorie de donn e appel e votre_nom_ de r sultat_ RBJ_LALL_TARGETS est cr e parmi les r sultats RBI Si nous observons le r sultat de mod le RBI l unit d
11. indique qu il est install L extension Analyste g ographique doit galement tre activ e Outils gt Extensions Une fois que vous avez proc d toutes ces v rifications vous tes pr t lancer le MIG Pour cet exercice nous utiliserons les unit s de planification tydixton_planning_units shp tous les fichiers d entr e d objectifs farget_ point species shp target_line_habitats shp target_polygon_ habitat shp les aires prot g es tydixton_protected_areas shp et le mod le de grille chantillon ERS tydixton_ers Lorsque la bo te de dialogue du MIG appara t vous devrez saisir plusieurs champs et choisir entre plusieurs options qui indiquent au programme o extraire les valeurs qu il utilisera pour cr er les fichiers texte d entr e pour Marxan MARXAN INPUT GENERATOR Analysis Unit tydiston_planning_units Status Options Use Layer Use PU Field Analysis ID Field 10 v ZE E Inputs tydixton_protected areas target_point_species status Value target_line_habitats Status 2 target polygon habitats tdixton_protected areas Status Overlap Threshold 50 Ee editor planning units Cost Options tydiston_ers Fr Method Sum Mean Max Cost Surface Field i Create Bound File Create Black Det File E Area Conversion Factor 10000 Output Directory Length Conversion Factor 1000 0 Mworkspace FES OF Cancel Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PA
12. s de planification a d importantes cons quences sur le processus de s lection du portefeuille ainsi que sur l impl mentation de ses r sultats Le choix de la taille et de la configuration d une unit de planification pour une analyse grande chelle comme chelle locale doit tre effectu en gardant l esprit beaucoup de facteurs Parmi ceux ci on peut citer La faille de l unit de planification par rapport l chelle des l ments sous jacents par ex les unit s de planification qui sont beaucoup plus grandes que des fragments de v g tation sous jacents peuvent masquer la taille la forme et l tendue de ce fragment les unit s de planification qui sont beaucoup plus petites que les types de v g tation seront principalement homog nes par ex les zones d habitat r duites ne pourront pas tre diff renci es des zones d habitat importantes Le nombre d unit s de planification qui peuvent tre trait es par l ordinateur d analyse en un temps raisonnable pour le processus vis par ex le calcul d une zone d objectifs l int rieur des unit s de planification des tests d agglom ration Marxan 1 8 1 ne peut traiter qu un certain nombre d unit s de planification Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 47 The Nature Conservancy d cembre 2011 Cependant ce nombre n est pas fixe car 1l d pend galement du nombre d l ments de conservation que vou
13. termin s sur la biodiversit dul aquicole en cr ant une grille d intensit s de risque cumul es s coulant dans chaque cellule du bassin hydrographique Pour cela l utilisateur doit d abord cr er un mod le ERS en utilisant les l ments de risque dul aquicoles tels que d cris ci dessus puis configurer le mod le de grille de r sultat comme grille de source de donn es pour la fonction d accumulation des courants voir fonction de grille pour accumulation des courants dans l aide d ArcGIS Pour cette fonction l utilisateur doit configurer une grille de direction des courants indiquant le sens de l coulement de l eau cellule par secumulation des courante cellule en commen ant par les points les VALEUR DE RISQUE plus lev s et en allant vers l aval de la LE a m me fa on que l eau s coule sur une in 8 surface pentue Afin de d finir un r seau BE oh 7 de drainage le trajet de pente descendante le plus raide entre chaque cellule est ir parmi les huit cellules voisines Une fois que le sens de l coulement est tabli les valeurs d intensit de l ensemble des l ments de risque dul aquicoles ex agriculture zones urbanis es et points de rejet des eaux us es peuvent tre cumul es dans la mesure o le mod le s ex cute de haut en bas pour chaque bassin hydrographique La surface de grille cumul e finale calcule le risque cumul en valeurs d intensit en amont depuis tous l
14. 260 1300 3 Fixer le co t pour que les aires prot g es g r es par ex des MPA compensent le co t afin que le co t dans ces aires soit r duit par un facteur par ex 0 33 Dans ce cas si vous avez une unit de planification o les activit s de chalutage font augmenter le co t les aires prot g es g r es auront un co t d unit plus bas De cette fa on il existe une diff rence quantitative entre le chalutage l int rieur et en dehors d une aire g r e Cela devrait produire de meilleurs r sultats que les sc narios qui s enferment dans des aires prot g es Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 AS The Nature Conservancy d cembre 2011 f Essai du modificateur de p rim tre de d limitation BLM Le BLM est indiqu dans le fichier de param tre d entr e utilisant Inedit exe Avant que le p rim tre de d limitation d un portefeuille soit ajout la fonction de co t de Marxan comme tant le co t de d limitation il est mis l chelle par le BLM Il n existe pas de valeur correcte en soit lui attribuer car les mesures de co t et de p rim tre sont toutes deux arbitraires Ball amp Possingham 2000 Le BLM peut tre difficile comprendre mais 1l remplit plusieurs fonctions importantes Indiquer l importance relative de la fragmentation dans la fonction de co t Les valeurs les plus basses rendent la fragmentation moins importante que la
15. 476 634552002 120 012 301693 3797 0040590538 n20 734680176 1128 01 27301693 3797 004059535 C oo ma ne oo w w m ooo m 540104614258 1112 0127301693 3751 564056538 21 700660964644 3 D 20 421 547973633 o 11420 0127301693 3781 584058539 1128 01 273016953 3781 584055536 Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 74 The Nature Conservancy d cembre 2011 A ce stade vous pouvez tester Marxan pour vous assurer qu il y a au moins une ex cution dans le syst me Ex cutez Marxan en appuyant sur le bouton vert Ex cuter Marxan ou en choisissant Ex cuter Marxan dans le menu Ex cuter Lors de l ex cution de Marxan la fen tre ressemble ceci Elle affiche la barre de progression har Deus Sujana Fun Ling Calculated Tint 257326127 Teed 0 35006 Marsan Progress La dur e de traitement sera plus ou moins longue en fonction de la complexit des donn es d entr e Lorsque l ex cution de Marxan est termin e il cr e un cran par d faut o s afficheront les r sultats Le MSD affichera toujours les derniers r sultats avec le m me symbole Markan Decision Support Marsan File to Edit Replace the values in the yloc column with this value Replace id cost status oc ploc w o rammes ssas C a E so w o p manzo aessa w p enzo ass so w h Penzos esse eo w TT r CT e
16. 6 Affichage et analyse des r sultats de Marxan Vous pouvez d sormais analyser chacun des six types de fichiers de sortie que Marxan a produit pendant l ex cution Ball amp Possingham 2000 l Solutions pour chaque ex cution par ex tydixton_runl_best txt Un fichier contenant les unit s de planification qui constituent la solution finale produit par l algorithme est g n r chaque ex cution de cet algorithme Le fichier consiste en une liste d identifiants d unit de planification qui constituent le portefeuille Informations de valeurs manquantes pour chaque ex cution par ex tydixton_run1_mvbest txt Le fichier contient des informations sur la qualit du portefeuille final issu de chaque ex cution et aussi celle de la meilleure ex cution au regard du but de l objectif de conservation La derni re colonne est la quantit r elle de cet objectif qui appara t dans le portefeuille Vous trouverez un chantillon de cette liste dans le tableau 3 Meilleures solution de toutes les ex cutions par ex tydixton_run1_best txt Il contient la meilleure solution d un ensemble d ex cutions Le fichier consiste en une liste d identifiants des unit de planification qui constituent le portefeuille Informations r sum es par ex tydixton_runl_sum txt Il contient les informations r sum es sur chaque ex cution avec un en t te d crivant ce qui se pr sent chaque ligne D tails du sc nario par ex tyd
17. Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 50 The Nature Conservancy d cembre 2011 d entr e Marxan permet aux utilisateurs d indiquer une couche d tat utiliser lors de l attribution de l identifiant Les utilisateurs peuvent galement indiquer un champ dans un tableau d attributs d unit de planification existant D finition de la port e de la zone tudier Identifier strate a zones d importance biologique unique b S lection de zones doit tre bas e sur las besoins d finis par les objectifs concernant habitat Definition des Definition des cibles elements de risq ue a Examen d expert afin d affiner les filtres a bas s sur l examen des experts fins et gros b chaque l ment de risque doit tre attribu b Chaque classe de cible doit tre attribu e 1 INTENSIT et 1 ID UNIQUE num ro 2 DISTANCE D INFLUENCE 2 NOM DE CIBLE texte t t D veloppement de Etablir des objectifs surface c ti re de cible D terminer la plage de c te appropri e 2 m thodes 1 zone longueur ou num ro de la zone ou 2 pourcentages proportions Chaque unit de planification doit avoir un ID unique Zones prot g es ou zone d int r t particulier t Lancer Marxan tapes recommand es pour la pr paration des donn es d entr e et la conduite d une analyse Marxan Les quatre couches de donn es de base comprennent les objectifs de conservation la fourchette de co t les unit s de planification et
18. Cliquez sur le bouton parcourir du r pertoire d entr e qui se trouve dans la Necessary Input Files aay Input File Editor for Marxan Sele Problem Run Options Annealing Input Output Cost Threshold Misc partie inf rieure de l cran et naviguez dans le dossier de See E sortie o sont situ s vos nouveaux fichiers d entr e ED 5 Planning Unit versus Species puvspr dat Browse Les fichiers input dat peuvent alors tre sp cifi s en cliquant sur le bouton parcourir pr s de chaque nom de frionalimputFiles fichier d entr e et en navigant vers le fichier noces I correspondant Les fichiers n cessaires sont les W Bounda Length bounddat Browse suivants Nom de fichier d esp ces spec dat Nom de fichier d unit de planification pu dat et Unit de jr Directoy planification par rapport aux esp ces puvspr dat Comme nous n ex cuterons pas cette fois de d finition de groupe vous pouvez d cocher le localisateur de fichier D finitions de groupe sous Fichiers Load Save Saves d entr e facultatifs Cliquez sur la case pour v rifier p workspaceimarxantinput dat l option de fichier de p rim tre de d limitation et naviguez vers le fichier bound dat Cliquez sur le bouton Enregistrer pour enregistrer les informations dans le fichier input dat 5 Cliquez sur l onglet Sortie de l cran Inedit Cet cran EAOa Bai permet l utilisateur de sp cifier les fichiers de sortie
19. Inedit en cliquant sur le bouton Sortir Vous tes maintenant pr t ex cuter Marxan Seles Problem Fun Options Annealing Input Output Cost Threshold Misc ai Input File Editor for Marxan Cost Threshold Threshold Penalty Factor 4 exp Bt A t wanes from 0 to 1 Penalty Factor 4 Penalty Factor B Load cave Save As E wit ai Input File Editor for Marxan Problem Run Options Annealing Input Output Cost Threshold Misc Advanced Options Starting Prop 0 Random Seed Clumping Rule Partial clumps do not count Out dated Options Best Score Speedup Exit Load Ciiworkspace mar lt aniinput dat Save Save As Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 70 The Nature Conservancy d cembre 2011 3 3 2 Execution de Marxan Tydixton_Park mxd ArcMap ArcInfo L ex cutable Marxan exe doit se trouver dans le m me r pertoire que votre fichier input dat Vous pouvez File Edit View Insert Selection Tools Window Help lancer Marxan exe soit depuis le menu d roulant des outils Marxan en indiquant son emplacement soit en gt ll amp B A i double cliquant sur Marxan exe depuis l explorateur ERs Fer MARXAN Tools Spatial Analyst Windows Un cran s affichera et montrera la dcr progression de l algorithme Le programme devrait s ex cuter durant moins de 5 minutes avec l
20. MARINE COST SURFACE La cr ation de la surface marine de co t de la Jama que utilis e dans le mod le MARXAN comprend la combinaison de quatre cat gories de risques contamination impacts directs accumulation des courants et extraction Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 29 The Nature Conservancy d cembre 2011 premi re tape consiste s assurer que votre mod le d l vation num rique soit pr trait ex bassins remplis puis d ex cuter un mod le de direction du courant Le mod le de direction du courant est alors utilis dans la routine d accumulation de courant et vous pouvez configurer le mod le ERS comme grille de poids Ce processus accumulera les valeurs d intensit des reliefs les plus lev s aux embouchures c ti res indiquant le chemin de moindre r sistance bas sur des calculs de pente cellule par cellule Les valeurs d intensit cumul es aux embouchures c ti res repr sentent le total de l impact sur terre selon le mod le Les points GIS repr sentant les embouchures c ti res peuvent tre cr s la fin des canaux cumul s de courants dul aquicoles et les valeurs d intensit peuvent tre extraites puis transf r es au tableau d attribution des points Les valeurs d intensit attach es ces points c tiers peuvent alors se voir attribuer une distance d influence et tre utilis es comme partie int grante du processus de cr ation d u
21. Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 73 The Nature Conservancy d cembre 2011 la derni re case indiquez le champ d identifiant d unit de planification n cessaire au regroupement des fichiers de sortie Marxan avec les donn es spatiales des couches de donn es des unit s de planification Markan Decision Support Marsan File to Edit Replace the values in the column with this value Replace Directory new is best EDS En Marsan input dat file CA connectivity marmankmtinpudat et Planning Unit Features C connectivity marsands m2 GI _Datagdb Planning Units 0 El Planning Unit ID Field AR Cancel OF Apr s avoir compl t toutes les valeurs cliquez sur OK L installation de tous les l ments sur le disque peut prendre quelques instants Une fois l op ration termin e votre cran ressemblera ceci il affiche le fichier d entr e pu dat par d faut Cela signifie que vous avez copi avec succ s tous les fichiers n cessaires dans le r pertoire du projet et que Marxan est pr t tre ex cut Markan Decision Support Marsan File to Edit pu Replace the values in the ploc r column with this value Replace cost loc ploc 499 149261475 1128 0127301693 3805 58405556 S00 468048096 1136 0127301693 S805 584055536 B04 33380127 1144 0127301693 3505 584055536 Bob 55531 787 1154 0127301693 S505 584055536
22. PASS Sa Parsi Sean Fo UM E LA Pohrani I E AH353 AATA 111371 Dry Linede Fores TS MDs 41 Potraon 1 SRR ZM EME Bat Phir F6 QT 42 Polen 1 50 ST6S87 795194 Bat_Pteronutus 78 0013263 43 Potraon 1 oOo NEITINS Cave PG DOTI __ 53 Pobyer 1 6400445 65596 901518 Karstic_Streams 78 0013263 Porn 1 Gesu LA 2 edi rer Mon Karib F6 Wa 123 Pon 113261770966 194307425169 Cry Ahri Forest 76 0013263 1 Potraon 1 22696901 172641622983 Ory Limestors Foen 76 013363 132 Pon i 4474811 33740106762 Cry Limesione Forest 77 0013263 El 187 Ayn 1 a On 71 AE 207073 rt ein Forse Pr MHI 69 Polen S072287 684105725728 Medium River Mon Karsu 78 0013262 C 111 Pon 1 073 1865 H4074 Emal Fiera Pon Karati 7A fui aah BO Poyon 0338138 2549579701 Karslic_Sheams 60 0013262 188 Pon i AOF OM 21929 Pt Limemonrs Forest AO nai 1 Bono I SUSAR ARMAS ede Pet K1 MIRAKA ba 4 4 O 6 m IE Pout of 205 Selected Tydheton_Park ABT ABT SUMP Tydhton Pah ABI ASTAL TARGETS Selon les r sultats du mod le nous pouvons voir que presque toutes les notes RBN pour cette unit de planification sont tr s sup rieures a 1 Il y a donc une grande abondance d occurrences zones d objectif unique dans cette unit de planification au regard de la pr sence de ce s m me s objectif s dans le reste du bassin hydrographique du Tydixton Park Gardez l esprit que ces scores sont relatifs et que leur plage de valeur peut largement
23. Risk 12 98 Bac ds oars Le ee Brea tiie IN eee Beh Shae a Beis Gi PES Dim LAE BB LE SSF 47 1 ae Be aa DL ted ei Em i ioe rii Higher Mean Risk Planning Units O rw NT LL a CI rai ioma Ci 2 LJ i eh Pi ig H js s O mi apc af 2 voa Lower Mean Risk Planning Units CI rhea rm MIROIR Bee ITS Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 25 The Nature Conservancy d cembre 2011 1 3 4 Creer des surfaces de risque environnemental dulcaquicoles et marines Comme nous l avons pr c demment voqu les mod les ERS peuvent aussi tre personnalis s pour repr senter les risques concernant les habitats des r gnes dul aquicole et marin Les experts dans le domaine de ces regnes doivent identifier les l ments de risque ayant un impact sur la sant de ces syst mes et les classer selon leur valeur d intensit et leur distance d influence Par exemple les habitats dulcaquicoles peuvent tre touch s par des l ments tels que les points de rejet des eaux us es les barrages le captage de l eau et les esp ces envahissantes Les habitats marins peuvent tre affect s par la pression caus e par la p che ou certaines pratiques de p che les ports les marinas et la pollution marine et terrienne 1 3 4 1 Mod les d ERS dulcaquicoles Un mod le d accumulation des courants peut tre utilis pour mesurer l impact d l ments de risques d
24. au but de conservation l ment de Quantit Occurrence Occurrences Objectif de S paration Objectif conservation Nom de l l ment Objectif retenue de l objectif retenues s paration obtenue atteint 5172 Wet Limestone Forest 2422 14 2440 04 0 21 0 0 oul 5132 Wet_Alluvial_ Forest 61 39 60 76 0 4 0 0 non 5112 Dry_Limestone_Forest 472 05 549 85 0 6 0 0 oui 5082 Dry Alluvial_ Forest 34 91 38 48 0 3 0 0 oui 639 Printemps 3 3 0 3 0 0 oui 91 Huitas 4 4 0 4 0 0 oul 80 Endemic_ Turtle 2 2 0 2 0 0 oul 70 Endemic_Fish 2 2 0 1 0 0 oul 638 Grotte 7 13 0 7 0 0 oul 47 Blk_Bill_ Parrot 3 3 0 3 0 0 oul 524 Bat_Pteronotus 1 1 0 1 0 0 oui 531 Bat_Phyllonycter 2 2 0 2 0 0 oui 720 Small_Rivers Non Karstic 8442 21 9570 59 0 6 0 0 oui 710 Medium_River_Non_Karstic 11270 7 12538 22 0 12 0 0 oui 700 Karstic_Streams 11606 12 18360 14 0 8 0 0 oui Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 78 The Nature Conservancy d cembre 2011 References Araujo M B P H Williams and A Turner 2002 A sequential approach to minimize threats within selected conservation areas Biodiversity and Conservation 11 1011 1024 Ball I R and H P Possingham 2000 MARXAN V1 8 2 Marine Reserve Design Using Spatially Explicit Annealing a Manual Convention on Biological Diversity 2001 Global Biodiversity Outlook CBD Montreal Canada Dudley N and J Parrish 2006 Closing the Gap Creating ecologically representati
25. couche d tat facultative par ex les aires prot g es si vous utilisez un marqueur d tat pour enfermer des zones et d une m thode d extraction du param tre de co t optionnel par ex le mod le ERS Une fois que vous cliquez sur l outil de pr paration des bee Sod A MARXAN PREP FORM objectifs Marxan une boite de dialogue vous demande de s lectionner la couche d objectif 4 pr parer et les Target Layer to Prepare forest types champs de nom et identifiant d objectif Target Name Field TARGET_NAM correspondants Vous devez galement indiquer une Target ID Field TARGET_ID cat gorie de sortie par ex fichiers de formes Une Output Location D workspace forest_ypes_p nouvelle cat gorie sera cr e Assurez vous par cons quent de lui donner un nom descriptif et de oo __ Cancel l inscrire votre r pertoire Marxan Lorsque vous tes pr t cliquez sur OK La nouvelle cat gorie sera cr e avec tous les champs suppl mentaires et une nouvelle bo te de dialogue appara tra et listera les objectifs uniques sur le c t gauche et les champs remplir dans la partie sup rieure L utilisateur peut maintenant saisir les valeurs de Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 60 The Nature Conservancy d cembre 2011 chaque champ en utilisant le tableau pr par auparavant Chaque champ contient d ja une valeur attribu e par d faut mais ces
26. cr er les fichiers d entr e vous n avez pas besoin d ex cuter la pr paration des objectifs Marxan Si vous souhaitez vous entra ner utiliser cet outil une copie des chantillons d objectifs sans les huit derniers attributs list s dans le tableau ci dessus se trouve dans le r pertoire Tydixton_Park_Tutorial_Data Sample Models MARXAN For_Target_Prep qui peut tre ex cut avec l outil de pr paration des objectifs Vous pouvez utiliser les chiffres list s dans le Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 58 The Nature Conservancy d cembre 2011 tableau ci dessous pour pr parer ces objectifs Il est vivement recommand d utiliser la proc dure de pr paration des objectifs si vous avez de nouveaux l ments d objectifs qui requi rent l ajout de nouveaux champs d entr e Marxan et l attribution de valeurs dans le tableau d attributs Toutefois si vous utilisez de nouvelles donn es d objectifs il y a deux champs que vous devez d finir manuellement avant d utiliser la pr paration des objectifs Marxan 1 TARGET_NAM Un nom en texte doit tre attribu a chaque point ligne ou polygone qui d crit chaque cat gorie unique d objectif de conservation Ce champ peut comprendre des espaces mais tous les mots doivent commencer par une lettre par ex for ts semi caduques Dendrocygne des Antilles etc Lorsque vous utilisez vos propres donn es assurez vous qu aucune entr e dans
27. de conservation en r alisant un choix d habitat distance des zones de risque lev o la diminution de la pression sur la biodiversit semble peu probable Les surfaces compos es ou les surfaces individuelles d compos es peuvent tre utilis es pour parvenir une meilleure TERRESTRE DULCAQUICOLE MARIN compr hension des risques environnementaux Sp cifi ques p ouvant Exemples de mod les de surface de risque environnemental ERS personnalis s pour les r gnes terrestre dul aquicole et marin de Jama que Les zones rouges endommager la durabilit de la conservation d signent un risque important pour l habitat bas sur l agr gation des intensit s des de certains habitats esp ces ex obj ectifs l ments de risque sous jacents McPherson et al 2008 Les r sultats des mod les d ERS peuvent aussi tre utilis s pour assister le processus de s lection des habitats et la cr ation de surfaces de co ts pour l ex cution de Marxan La cr ation d un mod le ERS implique tout d abord de rassembler un ensemble des meilleures donn es GIS disponibles afin de repr senter de fa on spatiale les l ments de risque sp cifiques ex activit humaine les plus susceptibles d avoir un impact sur les habitats et les esp ces cl s Ceci signifie que tous les composants des l ments de risque doivent tre cartographi s sur Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour Arc
28. de la meilleure qualit possible r alis un inventaire cologique et que ces couches de donn es aient t valu es par des experts en tenant compte de toutes les param tres des sc narios mod lis s Les trois modules pr sent s dans ce tutoriel guideront l utilisateur travers le processus de 1 D veloppement d une Surface de risque environnemental ERS personnalis e bas e sur une cartographie des l ments de risques ex activit s socio conomiques identifi s par les r visions d experts comme ayant un impact n gatif sur la sant des habitats des esp ces ou des syst mes cologiques cibl s 2 Calcul de l indice de biodiversit relative RBI d un environnement qui mesure la raret ou la singularit relative mesur e d apr s l abondance de la biodiversit en comparaison avec l ensemble de la r gion d tude Les notes de chaque occurrence de biodiversit peuvent tre utilis es comme valuation ind pendante de chaque unit de planification ou de chaque sous ensemble d unit s ex hexagones bassins hydrographiques 3 Cr ation de fichiers d entr e et de r sultats de mod les d affichage valuation pour Marxan un logiciel puissant fournissant aux utilisateurs un moyen facile de manipulation des param tres des donn es et de test examen de plusieurs sc narios de conservation afin d obtenir une configuration optimale des zones prot g e r pondant aux objectifs de conservation d finis par l utilisateu
29. donn es d entr e Marxan et fait dispara tre tous les objectifs c est dire qu il ne reste qu un tableau pour chaque type d objectif Toutes les fonctions d entr e doivent avoir leur projection d finie et elles doivent toutes avoir la m me projection N utilisez pas de Projection g ographique ex des degr s d cimaux car les surfaces ou p rim tre des unit s ne seront pas calcul es correctement Souvenez vous qu en fonction de la taille et du niveau de d tail requis par l utilisateur les outils Marxan peuvent n cessiter une quantit importante d espace de disque pour fonctionner et prendre un certain temps pour s ex cuter Vous pouvez temporairement d sactiver les contr les anti virus tant donn que le programme acc de fichiers ex cutables et n ouvre que ces m mes fichiers Lorsque vous utilisez vos propres donn es assurez vous qu aucune entr e dans le champ du nom de l objectif ne contient de caract re sp cial par ex 6 ou le programme pourrait chouer Si vous ne l avez pas encore fait vous devez vous enregistrer et t l charger Marxan sur http www uq edu au marxan Vous aurez besoin d environ 2 MB d espace disponible sur le disque pour installer Marxan et ses fichiers associ s Lorsque vous t l chargez Marxan vous recevrez les fichiers suivants a Marxan exe le programme ex cutable Marxan b Inedit exe un programme qui vous permet de cr er facilement le Fichier de param tres d
30. donn es d entr e Marxan Cet outil cr e tous les champs n cessaires et supprime toutes les couches d objectifs afin qu il ne reste plus qu un tableau pour chaque type d objectifs La fourchette de co ts C est galement une couche facultative mais obligatoire si l utilisateur veut inclure une mesure de co t d unit dans chaque unit de planification comme indiqu dans l algorithme Marxan Toutes sortes de mesures peuvent tre utilis es comme par exemple les risques ou la pertinence des strat gies de conservation ou un substitut au co t r el comme la zone Le module de surface de risques environnementaux ERS peut tre utilis pour cr er des grilles personnalis es qui peuvent tre synth tis es dans les unit s de planification et utilis es comme une mesure de co t Marxan tente de r duire le co t total de portefeuille en s lectionnant le nombre le plus bas d unit s de planification ayant le plus bas co t d unit total n cessaire pour atteindre tous les buts de biodiversit Le G n rateur de donn es d entr e Marxan permet aux utilisateurs d attribuer un co t chaque unit de planification en extrayant les valeurs d une grille en utilisant un champ d unit de planification existant en prenant la zone de l unit de planification ou en saisissant un co t fixe attribu uniform ment toutes les unit s de planification Les unit s de planification Ce sont les unit s qui contiennent toutes les informati
31. e une grille de r sultat pour chaque valeur d intensit unique c est pourquoi cela peut prendre BEAUCOUP de temps si vous disposez de centaines de combinaisons a virgules flottantes Si vous disposez de valeurs d intensit virgules flottantes veuillez les transformer en nombres entiers avec un nombre adapt de valeurs uniques en fonction de l espace disponible sur le disque dur et de la puissance de traitement de votre ordinateur Toutes les distances d influence inf rieures la taille de cellule indiqu e par l utilisateur se verront automatiquement attribuer la taille de cellule par d faut indiqu e par l utilisateur N oubliez pas de taper une taille de cellule de sortie correspondant aux distances d influence que vous aurez d finies V rifiez la quantit d espace dont vous disposez sur votre disque dur le programme ne fonctionnera pas si vous n avez pas assez de place ex 2 3 Go disponibles en fonction de l chelle de la r solution et de la complexit de vos donn es d entr e Tous les l ments de risque fichiers de forme bases de donn es spatiales et rasters doivent tre configur s dans la m me projection et avoir la m me projection d information d finie Lors de l utilisation de grilles la valeur des grilles est utilis e comme valeur d intensit chantillon de donn es Bassin hydrographique de Tydixton Park Jama que Les chantillons de donn es spatiales utilis es dans ces exercices provienne
32. fichier se pr sente sous la forme species pu amount 26 263 535739 34 27 271 228479 37 4 Fichier de d finition de groupe block dat FACULTATIF Ce fichier facultatif peut tre utilis pour regrouper des objectifs ou pour utiliser la fonction permettant de d terminer le but en tant que proportion sans calculer la quantit r elle de surface p rim tre ou nombre d occurrences Lorsque vous utilisez ce fichier le type de chaque objectif doit tre d fini dans le fichier spec dat Si vous n avez pas besoin de regrouper les objectifs les noms de type peuvent tre les m mes que l identifiant de l objectif Si vous utilisez un fichier de d finition de groupe il est fortement recommand de lire Game and Grantham 2008 pour mieux comprendre comment fonctionne ce fichier Le contenu de ce fichier est le suivant type target target2 targetocc sepnum sepdistance prop spf objectif objectif2 Une Le le type Le but Taille Le nombre Nombre Distance pour vis pour minimale d occurrence d objectifs minimale alternati facteur lequel l objectif du groupe s requises d unit s de pour laquelle ve de les du type Si un pour planification les unit s de l objectif p nalit autres donn groupe l objectif Il mutuellemen planification C estla pour cet attribut d unit s de peut tre t s par es dot es de proporti objectif s sont planificatio utilis en dans des l objectif sont on du 7 oo
33. la rang e W Include Only Overlap Heres Step 1 d hexagones que le programme est en train de traiter et 12 1 Output Dataset EATemp iyditon_park_pus shp IE la barre d tat montrera le pourcentage C ee Il est pr f rable de ne pas travailler sur l ordinateur n1 de cliquer sur ArcMap lorsque le mod le est en cours K Cancel d ex cution Cela prend environ 1 minute pour g n rer Input Area in units 10000 e g in hectares if meters Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 56 The Nature Conservancy d cembre 2011 100 hexagones selon l ordinateur Une fois que le mod le est termin une fen tre contextuelle indiquant Traitement termin appara tra et les r sultats seront charg s dans la section de visualisation de la carte 3 2 3 Pr paration des objectifs Marxan Tydixton_Park mxd ArcMap Arcinfo Apr s avoir pass en revue les l ments de base de ade Ce ac eee ede ae le Marxan et les fichiers d entr e n cessaires nous sommes pr ts commencer le processus de pr paration leks B zi sl des donn es d objectif de conservation pour cr er les ERs FBr MARXAN Tools Spatial Analyst fichiers d entr e Marxan Si l utilisateur a d j cr ses Hexcen unit s de planification c est a dire les hexagones la premi re tape d utilisation des outils Marxan consiste cr er et remplir les couches d objectifs avec les champs correc
34. la raret d un habitat ou d une esp ce dans un environnement donn nRBI RAI RBI abondance de l objectif dans l unit de planification abondance de l objectif dans la zone d tude RAI zone de l unit de planification zone de la zone d tude eee Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 31 The Nature Conservancy d cembre 2011 Query Domain Hexagon a ti Target Abundance 22 47 ha se Wi S S Universal Domain Study Area as Bi Target Abundance 445 07 ha iacrar SEA ia mA Relative Biodiversity Index RBI 2 SI 2247 445 97 100 5 038 Er b mS WSO RESO MS Query Domain Hexagon ame 8 Total Area 260 ha oe Universal Domain Study Area uns Total Area 76 388 ha a i rot RELATIVE AREA INDEX RAI Eu 260 75 388 0 0034 Mit tien Aif f 11 curl CE THAI NORMALIZED RELATIVE BIODIVERSITY INDEX nRBI 9 038 0 0034 1481 76 1 Target set is proportional to its area gt 1 Target set over represented in this query domain lt 1 Target set is under represented in this query domain L indice de biodiversit relative normalis Normalized Relative Biodiversity Index nRBD est calcul l aide d une fonction bas e sur le rapport zone poids Lors de l utilisation d objectifs polygones les valeurs sup rieures 1 indiquent un niveau lev de singularit de l habitat lorsque l ensemble de l environ
35. les habitats marins Les activit s humaines qui sont des l ments de risque doivent tre divis es en quatre cat gories en fonction de leur impact marin impacts directs ex densit de la population contamination ex industrie c ti re ports marinas extraction ex pratiques de p che et de r colte et s dimentation vacuation en bassins hydrographique pollution terrestre et marine Ce processus a t suivi pour des mod les d ERS marins d velopp s pour l analyse marine de planification cor gionale de Jama que Jamaica Ecoregional Planning Marine Analysis Zenny 2006 Chaque l ment de risque identifi et cartographi par des experts s est vu attribuer une valeur d intensit et une distance d influence ensuite combin es pour cr er une surface de risque globale Une fa on de mod liser la s dimentation potentielle de la terre en environnements c tiers consiste utiliser l accumulation des courants du mod le ERS dul aquicole afin d en mesurer l intensit aux embouchures c ti res Comme nous l avons montr dans la section pr c dente la fonction d accumulation des courants additionne et coordonne les intensit s de risque vers les embouchures des bassins hydrographiques qui se d versent souvent dans l oc an La CONTAMINATION FLOW ACCUMULATION CE bested deere fut EXTRACTION Ph anny wigs aubaines no a ad r and fee of boat ao fe 3 EEE JAMAICA
36. les rasters d entr e sur une base cellule par cellule STD D termine la d riv e standard des valeurs entre les rasters d entr e sur une base cellule par cellule La d riv e standard est la racine carr e de la variance Elle d crit l tendue des donn es concernant la moyenne dans les m mes unit s que les mesures originales Plus la variance et la d riv e standard sont petites plus l essaim de mesures concernant la valeur moyenne est troit VARIETE D termine le nombre de valeurs uniques entre les rasters d entr e sur une base cellule par cellule g Vous pouvez aussi utiliser la fonction R sultat d chelle pour reconfigurer l chelle du mod le de r sultat final sur une plage sp cifique Cela peut se r v ler utile pour d finir des plages d chelles dans les surfaces de co t utilis es dans Marxan Il est souvent utile d utiliser une chelle entre 0 et 1 lors du calibrage du mod le de sortie dans Marxan Dans le cadre de l exemple du tutoriel nous n utiliserons pas cette option mais elle peut tre utile si vous essayez de conserver vos valeurs d intensit dans une certaine plage pour r aliser des comparaisons h Introduire la valeur tendre la port e par Cette valeur repr sente la distance laquelle la port e finale sera tendue au del de la port e spatiale maximale de toutes les couches de donn es Cela permet d viter que les valeurs d intensit des grilles de r sultats proches des limites ne s
37. moyenne est de 12 98 et pour le fichier votre_nom_de r sultat_ RBI SUMMARY la moyenne est de 6524 Nous utiliseront maintenant ces chiffres pour d terminer le seuil des poches hautes RBI ayant une valeur de risque faible Allez a S lection gt S lectionner par attributs dans la barre d outil principale d ArcGIS Lorsque la fen tre de dialogue appara t introduisez la formule suivante votre nom de r sultat RBI SUMMARY RBNTI gt 8524 AND ers stats MEAN lt 12 98 Cette routine de s lection choisira les unit s de planification surlign es en bleu clair se trouvant au dessus de la valeur RBI moyenne et en dessous de la valeur de risque moyenne repr sentant une valeur de conservation lev e avec un risque faible selon les donn es d entr es du mod le tel que cela apparait dans le sch ma ci dessous Cette approche est un exemple de perspective introduite au sein des zones de conservation potentielle et de mise en place de sites prioritaires en fonction de strat gies d objectifs sp cifiques pour un retour maximum sur investissement de conservation Une analyse similaire peut tre r alis e en utilisant les valeurs chiffres d irrempla abilit de Marxan Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 AO The Nature Conservancy d cembre 2011 fe My ee cum ce LE de o imit Beh i mur Bets i Loa i ee i PS Lac Baie con tien BE PEF CSS ete Dit ARE RE
38. nalit des esp ces SPF par ex 100000 p nalit car les objectifs n atteignent pas les buts vis s pour tous les objectifs rendra d autant plus importante la repr sentation de l objectif au regard du co t total du portefeuille la combinaison du p rim tre de d limitation et de son modificateur du co t par unit de planification et du SPF for ant ainsi les buts de repr sentation tre atteint Huggins 2005 Consultez galement tydixton_100runs_sum txt pour obtenir le score de chaque ex cution Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 77 The Nature Conservancy d cembre 2011 tydixton_100runs hydixton_100runs NUMBER SOLUTION Em E a gt i DM 2 i s En 2 75 M 100 Figure 12 R sultats du regroupement de tydixton_l00runs_best txt champ Solution et tydixton_100runs_ssoln txt Champ Nombre avec le champ Identifiant de l unit de planification Ce sont les unit s de planification qui constituent le portefeuille Solution qui atteint tous les buts et le nombre de fois o cette unit de planification a t choisie sur 100 ex cutions Table 3 Analyse des r sultats de Marxan fydixton_100runs_mvbest txt qui dresse la liste de plusieurs r sultats de mod les par l ment dont la quantit d objectif retenue et si le but a t atteint Souvenez vous que le terme objectif dans ces r sultats correspond
39. nom raster valide Vous pouvez sauvegarder le r sultat Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 18 The Nature Conservancy d cembre 2011 comme GRID IMG base de donn es spatiales personnelle fichier base de donn es spatiales base de donn es spatiales ArcSDE ou formats non g or f renc s BMP GIF JPEG JPEG 2000 PNG TIFF Lors de la sauvegarde d un ensemble de donn es raster dans une base de donn es spatiales il ne faut ajouter aucune extension de fichier au nom de l ensemble de donn es raster Lors de la sauvegarde d un ensemble de donn es raster en format fichier il est n cessaire d ajouter une extension de fichier bmp pour BMP gif for GIF img pour un fichier ERDAS IMAGINE jpg pour JPEG jp2 pour JPEG 2000 png pour PNG tif pour TIFF ou sans extension pour GRID Les fichiers de format GRID ne doivent pas tre inscrits dans un r pertoire contenant un espace dans le nom ou dans le chemin de r pertoire et doivent respecter les r gles suivantes Le nom de r sultat ne doit pas contenir plus de 13 caract res Le nom de r sultat ne doit pas contenir d espaces Les tirets bas sont autoris s Le nom de r sultat ne peut pas contenir de caract res sp ciaux tels que Le nom de la grille de r sultat ne peut pas commencer par des chiffres Vous pouvez aussi configurer l emplacement d un catalogue de raster pour sauvegarder vos r sultats Si vous confi
40. plut t qu un autre en fonction de la pr sence d activit s donn es par rapport d autres l ments de risque Pour cet exercice nous utilisons une chelle de 0 100 100 tant le plus haut degr de risque pour un habitat donn C est l utilisateur de d finir une chelle mais 1l devra utiliser des nombres entiers pour des raisons informatiques La distance d influence devra tre mesur e selon l unit que vous avez choisi pour vos donn es d entr e ex information de projection Dans les chantillons de donn es les unit s sont exprim es en metres En ce qui concerne les valeurs d intensit l opinion des experts doit tre utilis e pour attribuer une distance d influence maximale de l l ment de risque vis a vis d un habitat ou d un r gne Le programme calcule la diminution de l intensit depuis la limite de chaque l ment de risque en utilisant la distance d influence fix e par l utilisateur et la fonction d augmentation de la distance Par exemple dans le fichier appel 1 z ptt p88 Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 15 The Nature Conservancy d cembre 2011 risk_ag_sugarcane shp la distance d influence terrestre est de 1000 metres ou 1 kilom tre Si l utilisateur choisit d utiliser une fonction de diminution lin aire d faut la valeur d intensit de 11 lui sera assign e proximit des limites de chaque polygone d
41. pour indiquer si une unit de planification sera choisie ou non et si la valeur d tat indiqu e lui sera attribu e La valeur par d faut est 50 ce qui signifie que la couche d tat qui chevauche une unit de planification d au moins 50 sera marqu e de la valeur d tat indiqu e Vous pouvez contr ler le pourcentage utilis simplement en saisissant la valeur en pourcentage Il y a quatre fa ons d attribuer une valeur de co t chaque unit de planification a Indiquer une grille par ex le mod le ERS qui se trouve actuellement dans votre section de visualisation de carte b S lectionner Surface d unit de plamification pour attribuer la surface de l unit de planification chaque unit de planification correspondante c S lectionner Champ d unit de planification pour choisir un champ pr d fini dans la couche d unit de planification contenant une valeur de co t et d Saisir un co t fixe qui sera attribu chaque unit de planification M thode Si vous choisissez une grille pour calculer le co t par unit de planification vous devez choisir une fonction de grille de zone somme moyenne ou maximum qui sera utilis e pour chaque unit de planification Par d faut la fonction Somme consid re la somme de toutes les cellules de grilles sous jacentes d une unit de planification comme tant le co t de cette unit de planification La fonction Moyenne attribue la valeur moyenne e
42. r alisation des buts et la r duction des aires Si le BLM est fix z ro le p rim tre de d limitation n a alors aucun impact sur la s lection du portefeuille et la solution de sortie sera tr s fragment e Plus vous augmentez le BLM plus vous augmentez l importance de la concentration de la solution de portefeuille mod lis e Convertir des unit s Si le co t d unit de l analyse de base est indiqu en hectares et le p rim tre de d limitation en kilom tres le BLM doit servir convertir le p rim tre en unit s comparables Pour rendre l aire et le p rim tre comparables La forme la moins fragment e possible est un cercle et le rapport entre aire et circonf rence peut servir de guide pour cela En raison d un grand nombre de facteurs incompatibles dans le BLM la meilleure fa on d arriver un chiffre correct est de r aliser des essais Pour tester la capacit du BLM atteindre les buts il y a quelques l ments importants prendre en consid ration et notamment la mani re dont le fichier mvbest est param tr L ajustement du BLM d pend principalement de la mani re dont les buts sont atteints non atteints exactement atteints ou d pass s Ferdana 2006 Veuillez consulter Game and Grantham 2008 pour obtenir une excellente description de la bonne mani re d employer le BLM g Unit s flexibles a faible irremplacabilit Les aires qui ne sont pas indiqu es comme tant hautement irrempla
43. repr sentent un compromis entre toutes les meilleures zones pour chaque objectif Les solutions Marxan excluent souvent certaines des meilleures zones restantes pour des objectifs simples et se concentrent sur les zones contenants plusieurs objectifs La plupart du temps les zones exclues par les meilleures solutions sont consid r es de mani re intuitive comme tant importantes prot ger En tant qu analyse compl mentaire Marxan un indice de biodiversit relative normalis peut tre calcul afin de quantifier la contribution relative par zone et par poids pour chaque unit de planification au regard de la distribution totale de chaque objectif de conservation En d autres termes le nRBI de chaque unit de planification est directement proportionnel la somme des objectifs de conservation pr sents dans l unit de planification ex hectares d habitat longueur du courant ou nombre d occurrences L index j peut tre calcul pour de p nombreux objectifs afin de cr er un indice total L avantage de cette approche repose sur le fait qu elle peut tre utilis e pour identifier les meilleures zones restantes en termes d abondance d objectifs pour chaque objectif ou ensemble d objectifs au sein de l unit de planification domaine de recherche ou l chelle de l environnement domaine d univers comme le montre le sch ma ci dessous TNC 2005 En d autres termes vous calculez la singularit relative ou
44. simul et Am lioration it rative Cliquez sur le bouton Enregistrer dans la partie inf rieure de l cran Inedit va Input File Editor for Marxan Sele Problem Aun Options Annealing Input Output Cost Threshold Misc W Simulated Annealing Options for Simulated Annealing appear on nest tab Heuristic Hewistic x W lterative Improvement Normal Iterative Improvement Save As Exit C iworkspace matx lt aninput dat 3 Cliquez sur l onglet Recuit se trouvant en troisi me position a partir de la gauche dans la partie sup rieure de l cran Inedit La valeur par d faut pour les commandes de recuit devrait tre utilis e Ce sont 1000000 six z ros It rations de l algorithme avec 10000 quatre z ros Diminutions de temp rature utilis s avec le Recuit adaptatif ai Input File Editor for Marxan Problem Run Options Annealing Input Output Cost Threshold Misc Annealing Controls Number of Iterations 1000000 Temperature Decreases 100000 MW Adaptive Annealing Initial Temperature Cooling Factor Final Temperature adaptive annealing ones Save LE Exit C iworkspaceimar lt antinput dat Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 68 The Nature Conservancy d cembre 2011 4 Cliquez sur l onglet Entr e de l cran Inedit Le dossier d entr e doit tre param tr avant de naviguer dans les fichiers d entr e
45. unit s de planification L utilisateur peut galement enfermer des unit s de planification en indiquant une valeur de champ d unit de planification pr d termin e 0 1 2 3 extraite et crite dans le fichier pu dat Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 61 The Nature Conservancy d cembre 2011 4 Couche de co t galement une couche facultative mais n cessaire si vous utilisez des valeurs de co t d unit de planification dans votre analyse Marxan Pour d finir le co t l utilisateur dispose des options suivantes a choisir une grille par ex le mod le ERS dont la valeur moyenne d unit de planification sera extraite et crite dans le fichier pu dat b s lectionner un champ de co t pr d termin dans la couche d unit de planification c utiliser la surface de l unit de planification comme co t ou d donner un co t fixe qui sera attribu toutes les unit s de planification Avant d ex cuter le MIG souvenez vous que toutes les couches d entr e doivent tre dans la m me projection et que cette derni re doit tre d finie Vous devez en outre vous assurer que vous avez une licence de niveau ArcGIS ArcInfo avec le poste de travail ArcInfo install La barre de titre de votre programme ArcGIS devrait indiquer ArcMap ArcInfo V rifiez galement que le poste de travail ArcInfo figure dans votre menu de d marrage ArcGIS ce qui
46. veloppement durable ainsi que la conservation et l utilisation durable de la diversit biologique dans les Am riques par le biais d une gestion plus efficace de l information biologique Dans le cadre de partenariats tablis pour ce projet des organismes et des programmes de la r gion aux objectifs similaires ont particip au financement des activit s afin d atteindre les objectifs pr cis du programme Connectivit Nous souhaitons remercier particuli rement Vince Abreu Douglas Graham Ivan Valdespino Boris Ramirez Rodrigo Tarte et Sandra Ann Icaza pour l aide et le soutien qu ils ont apport s pendant toute la dur e de ce projet Nous remercions aussi particuli rement Rick Tingey et le Dr Richard Jeo qui ont d velopp l indice de biodiversit relative et ont fourni une grande partie des bases techniques sur lesquelles ces outils ont t d velopp s Nous esp rons que les PAT continueront d tre d velopp s et affin s gr ce au soutien de fonds externes Un ensemble de nouvelles fonctionnalit s on t ajout es la version 4 0 qui inclut les nouveaux outils avanc s Marxan Nous esp rons qu elles vous seront utiles Si vous souhaitez nous signaler la pr sence de d fauts ou si vous avez des recommandations nous faire veuillez envoyer vos commentaires aux auteurs Dr Steven R Schill Dr George T Raber Scientifique senior Professeur adjoint The Nature Conservancy D partement de g ographie et de g ologie Pr
47. w ph penzom ss so w TT ors wo w TT arses noo w p enzo arses oo w p o enze oas CT CT asss CS p o nenza areas wooo o w p anze oas pu Par d faut la meilleure solution est affich e avec les unit s de planification de la solution en bleu et les autres en vert Vous pouvez modifier la variable de r sultat repr sent e ainsi que les couleurs de la repr sentation Cette action entra nera un chargement suppl mentaire pour afficher la repr sentation choisie Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 75 The Nature Conservancy d cembre 2011 Dans la bo te de dialogue MSD vous pouvez modifier le fichier d entr e Marxan que vous voyez en s lectionnant le fichier dans la liste d roulante Maran Decision Suppor File Edit Run Marsan File to Edit Replar r Vous pouvez galement modifier manuellement toutes les valeurs des fichiers sauf les champs d identifiant Vous pouvez s lectionner les enregistrements en cliquant c t de la rang e De mani re alternative les utilisateurs peuvent utiliser une m thode plus interactive en s lectionnant les unit s de planification sur la carte puis en s lectionnant Tirer les s lection de la carte dans le menu diter Une fois que vous avez s lectionn les enregistrements vous pouvez mettre jour toutes les valeurs s lectionn es en utilisant le bouton Remplacer dans la partie sup rieure 3
48. 1998 Un tape essentielle de pr traitement consiste diviser votre r gion de planification en un ensemble d unit s de planification Les unit s de planification sont des zones pour lesquelles des donn es relatives la probabilit la fr quence et l tendue des objectifs existent d j Sous leur forme la plus simple les unit s de planification peuvent tre d finies en superposant une grille de carr s ou un treillis d hexagones sur votre r gion de planification Elles doivent prendre en compte toutes les zones qui pourraient tre s lectionn es comme faisant partie du syst me de r serve et leur taille doit tre adapt e aussi bien pour les l ments cologiques que vous d sirez saisir que pour la taille des aires prot g es pouvant tre mises en place En g n ral elles ne doivent pas tre de r solution plus fine que les donn es des l ments de conservation et pas irr alistes pour des d cisions de gestion Les unit s de planification n ont cependant pas tre uniformes Il n est pas non plus vrai que les plus petites unit s de planification sont les meilleures Dans certains cas cela aura plus de sens d avoir des unit s de planification en fonction de divisions cologiques naturelles comme des unit s hydrologiques ou m me de divisions politiques publiques comme les parcelles cadastrales Pour d autres utilisations des unit s de planification uniformes donneront de meilleurs r sultats Le choix des unit
49. CATION AVEC VALEUR D ACCUMULATION MOYENNE Processus d coulement par tape utilisant un mod le d l vation num rique Digital Elevation Model DEM ainsi qu une ERS comme grille de poids pour valeurs d intensit cumul es lors de l valuation des risques pour des habitats dul aquicoles et marins Dans les zones pente nulle ou faible la cr ation d une grille de direction adapt e peut repr senter un v ritable d fi Les utilisateurs peuvent r aliser un traitement pr liminaire du DEM en int grant des r seaux de courants l aide d une vari t d outils disponibles sur le Web ex ArcHydro AGREE Rivertools est un logiciel de mod lisation hydrographique exceptionnel disposant d outils puissants pour cr er avec une grande pr cision des r seaux de courants et des bassins hydrographiques ordonn s ArcHydro http www crwr utexas edu giswr hydro index html AGREE http www ce utexas edu prof maidment gishyd97 terrain agree agree htm Logiciel Rivertools http www rivix com Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 97 The Nature Conservancy d cembre 2011 Ah Xe Nuh e SE AA EN R seaux d accumulation d s Courants Grille d accumulation d s courants Processus de cr ation de direction de courant et d accumulation de courant Chaque cellule peut s couler dans chacune des huit directions La grille de direction du courant est calcul e selon la pente des
50. GIS 10 9 The Nature Conservancy d cembre 2011 l environnement avec des emplacements et des limites le cas ch ant pr cises d apr s l opinion d un expert ou en obtenant ou en cr ant par le biais de la num risation l cran des couches GIS aussi pr cises que possible Les activit s humaines sont souvent les l ments de risque les plus commun ment utilis s pour la cr ation de mod les ERS Les activit s telles que l agriculture l urbanisation les zones touristiques ainsi que les h tels les routes l industrie et la densit de la population sont des exemples d l ments de risque pouvant tre utilis s pour la cr ation d un ERS Ces mod les peuvent tre sp cialement d velopp s pour les r gnes terrestre dul aquicole et marin en fonction des donn es disponibles et des valuations d experts pour chaque l ment de risque Une fois que toutes les donn es sont rassembl es les experts doivent examiner et classer chaque l ment de risque selon le degr de menace qu il repr sente pour l habitat les esp ces en question Ceci est r alis via l attribution de quatre variables chaque point ligne ou polygone repr sentant l l ment de risque correspondant Les quatre variables attribu es sont la valeur de l intensit la distance d influence l effet d augmentation de la distance et les fonctions de superposition Ces valeurs peuvent tre d riv es d apr s l valuation r alis e par des experts de la po
51. I otis Te don Lorsque le programme a termin de nu g ile ing Calculated Tinit 25099 7208 Ail Teool A 979ARLLR i P gt Creat ini wm initial r strus S executer appuyez sur lt Entree gt pour mi A LEE Pile A Tiwidary 16 4 Mi sing 49 Shartlal fermer la fen tre Marxan crit les r sultats aR At fs 71 Boundary 216 8 Missing 17 Shortfall J831 dans des fichiers de texte qui se trouvent as fu Cost Med 9 Ps die Boundary 3988 06 Missing 1 Shortfall 8 06 dans le dossier de sortie indiqu Ces eles ctl T Pv 4616 Mmdars 9960 0 Haa 2 Ghorsfall 0 09 2e fichiers peuvent tre visualis s avec le Bloc A Pom i 9 Pile 4516 Toundary 398A Missing A Shortfall notes ou Excel Si vous d cidez de changer a lue tu H2968 9 Pls 4616 Boundary 2988 8 Missing D Bhortfall 00B Pe les parametres des tableaux d attributs il pais 14 f CA Catt ASAGA F Pile 516 Boundary 3988 A Aiszeing A ShorLfall 8 88 Pa y Hi gt 1H vaut mieux extraire nouveau les valeurs et a i 3 Using Calculated Tinie 2SGASRIAT AAA Timi l AIPA dG Us fol Doundary 27H Niseing 8 Shortfall HHH I s 2 e 2 A ing the initial r strus creer un nouveau fichier d entr e dans un h InitUa lus ZAS P25 th Fa Cee is ays 8 Pile 7i Aouwndary 216 0 Aicsing 19 Ehoartfal nouveau repertoire Mais 7842 8 Gor iW ie 71 Boundary 216 0 Missing 17 Shortfall 3891 Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 71 The Nature Conserv
52. MPORTANT PLUS IBR FAIBLE RISQUE IMPORTANT l RISQUE IBR LEV IBR LEV RISQUE RISQUE FAIBLE IMPORTANT MOINS PLUS URGENT UD RISQUE R sultats d une analyse de RBI et de risque pour les habitats terrestres en Jama que Ce type d analyse quartile peut tre combin aux r sultats de Marxan afin d orienter les priorit s en termes de zones de conservation Les zones sont class es de la plus haute la plus faible priorit Les zones haut risque haut RBI peuvent tre plus ch res mais ces habitats sont susceptibles d tre irr m diablement perdus si aucune mesure n est prise dans l imm diat Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 34 The Nature Conservancy d cembre 2011 EXERCICE 2 Calcul de l indice de biodiversit relative RBI RAPPEL Toutes les couches utilis es dans l analyse doivent tre dans la m me VN projection et leur information de projection doit tre d finie N utilisez pas de Projection g ographique ex des degr s d cimaux car les surfaces ou p rim tres des unit s ne seront pas calcul s correctement Ee Le module RBI n exige PAS de niveau ArcInfo d ArcGIS Le domaine d univers est l ensemble de la zone d tude ou environnement ex grand bassin hydrographique fronti res politiques Le domaine de recherche est la couche d unit d analyse ou d unit de planification ex hexagones ou sous bassin hydrographique
53. Output File D workspace maran puyspr_combined dat ES OF Cancel 3 2 5 Executer la conversion de fichiers de matrice s Tydixton_Park mxd ArcMap Arcinfo File Edit View Insert Selection Tools Window Help Les utilisateurs de Marxan 2 0 2 et ult rieur Marxan Optimised doivent se procurer une copie de l ex cutable Le el amp i at jf convert_mtx exe disponible sur le site Web de Marxan ERs Re marxan Toos Spatial Analyst pour convertir les fichiers de matrice Marxan dans un format compatible avec Marxan Optimised Ces versions de Marxan SE eee eens FREF sont sensibles l ordre des identifiants d unit de a E en planification dans la matrice creuse ou relationnelle a et eo d unit s de planification par esp ces et ne peuvent utiliser 40 Ce qu une matrice creuse incompatible avec une matrice IF RUMINEDIT tabulaire Une fois que l ex cutable est disponible sur un MZ RUN MARXAN disque dur local les utilisateurs peuvent employer cet outil JOIN AND DISPLAY MARKMAN OUTPUT pour indiquer l ex cutable et convertir la matrice tabulaire horizontale en une matrice creuse relationnelle ou verticale Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 66 The Nature Conservancy d cembre 2011 3 3 Installation du fichier input dat avec Inedit et execution de Marxan 3 3 1 Ex cuter Inedit Tydixton_Park mxd ArcMap Arcinfo Vous t
54. Problem Run Options Annealing Input Output Cost Threshold Misc n cessaires l analyse des r sultats Ecran de sortie 2 2 ae Screen Output General Progress Progression g n rale donne une id e de l avancement de l algorithme Cliquez sur les fichiers de sorties apparaissant sur droite dans le graphique L enregistrement de chaque ex cution n est pas d une ae A We Save Scenaro Details grande utilit et produit de nombreux fichiers de texte 7 Save each n Steps We Save Missing Values Info Les fichiers les plus importants sont Meilleur globalement le R sum et la Solution additionn e Entrez 1 dans la case Esp ces manquantes si la Species missing if proportion of target lowerthan 1 proportion de l objectif est inf rieure a Cette option SaveFileName tant permet a Marxan de consid rer qu un objectif est atteint 1 1A A s il est tr s proche de l tre Elle peut tre utile lorsque Output Directoy Enorme les buts sont lev s et que le co t pour compl ter une petite derni re partie du but se r v le tr s co teux Save Each Run MW rcwieu Format MW Save Overall Best Ww Save Summed Solution We Save Summary J Save Log File Save each n Changes Load Save Save As C iworkspaceimarx lt antinput dat Le texte se trouvant dans la case Enregistrer le nom du fichier pr c dera le nom de tous les fichiers de texte de sortie Saisissez un nom descrip
55. R L amp Logan V S 1998 Size of selection units for future reserves and its influence on actual vs targeted representation of features a case study in Western New south Wales Biological Conservation 85 305 319 McPherson M S Schill G Raber K John N Zenny K Thurlow and A Sutton 2008 GIS Based Modeling of Environmental Risk Surfaces ERS for Conservation Planning in Jamaica Journal of Conservation Planning Vol 4 60 89 Possingham H P I R Ball and S Andelman 2000 Mathematical methods for identifying representative reserve networks dans S Ferson and M Burgman eds Quantitative methods for conservation biology Springer Verlag New York pp 291 305 Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 79 The Nature Conservancy d cembre 2011 Schill S 2005 Coastal Transport Modeling Using HYCOM Data Compte rendu de la 8 Conf rence internationale sur la t l d tection pour les environnements marins et c tiers du 17 au 19 mai Halifax Nouvelle Ecosse Theobald D M 2003 Targeting conservation action through assessment of protection and exurban threats Conservation Biology 17 1624 1637 The Nature Conservancy 2006 South America Threat Assessment Arlington VA The Nature Conservancy 2005 A Regional Conservation Assessment for the Greater Caribbean Basin Arlington VA The Nature Conservancy 2003 Alaska Yukon Arctic Ecoregional Ass
56. T Version 4 0 pour ArcGIS 10 62 The Nature Conservancy d cembre 2011 Nous allons maintenant expliquer chaque item du menu du G n rateur de donn es d entr e Marxan Unit de planification Champ d identifiant de planification Donn es d entr e de l objectif Cr er un fichier li Cr er un fichier de d finition de groupe Conversions de surface p rimetre Options d tat Indiquez la cat gorie d unit de planification polygone Indiquez le champ qui contient l identifiant unique de chaque unit de planification Choisissez toutes les couches d objectifs points lignes ou polygones qui seront utilis s pour cr er les fichiers d entr e Marxan Cliquez sur la couche pour la s lectionner plus cliquez encore pour la d s lectionner Toutes les couches dans la section actuelle de visualisation de la carte apparaitront Vous ne pouvez pas utiliser de couches ayant le m me nom Cochez cette case si vous souhaitez cr er un fichier de d limitation bound dat Vous aurez besoin de ce fichier si vous souhaitez indiquer un param tre de modification du p rim tre de d limitation BLM pendant l ex cution de Marxan Cochez cette case si vous souhaitez cr er un fichier de d finition de groupe block dat Si vous choisissez cette option vous devez attribuer les champs suivants dans vos fichiers d objectifs Type TYPE Facteur de p nalit d esp ces SPF Occurrence de l objectif OCC T
57. The Nature C C onservancy Protecting nature Preserving Ii Southern Miss o la bi n FH nr ri Outils pour zones prot g es Protected Area Tools PAT pour ArcGIS 10 Version 4 0 MANUEL D UTILISATION et TUTORIEL R dig par Steve Schill et George Raber Avec le soutien du R seau interam ricain d informations sur la biodiversit Inter American Biodiversity Information Network IABIN et du Fonds pour le d veloppement de la Banque Mondiale DGF D cembre 2011 Remerciements L id e de d velopper un outil pour venir en aide aux pays s effor ant de d terminer des m thodes d valuation des carences dans le domaine des zones nationales prot g es a t soulev e lors du congr s de l Alliance g ospatiale m soam ricaine et carib enne Mesoamerica and Caribbean Geospatial Alliance de Port d Espagne Trinit en mai 2004 La conception et le d veloppement du syst me ont t pris en charge par le programme scientifique m soam ricain et carib en de The Nature Conservancy et soutenu par le projet de Fonds pour le d veloppement DGF de la Banque Mondiale Le projet DGF a t con u pour aider le R seau interam ricain d informations sur la biodiversit Inter American Biodiversity Information Network IABIN a tablir le programme Connectivit dont le principal objectif est d encourager la collecte de donn es biologiques et g ospatiales L objectif de l TABIN est de promouvoir le d
58. a moyenne de risque lt 12 98 HAUT et au dessus de la moyenne de risque gt 12 98 BAS Ces unit s de planification indiquent des zones a forte valeur de conservation au sein de zones risque faible et de zones risque lev selon les donn es d entr e du mod le Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 A The Nature Conservancy d cembre 2011 MODULE 3 Outils Marxan Marxan est un programme logiciel gratuit qui fournit une aide a la d cision aux quipes de planificateurs en conservation et d experts locaux pour identifier des portefeuilles efficients de zones de planification qui remplissent un certain nombre d objectifs cologiques sociaux et conomiques Ball and Possingham 2000 Marxan est utilis comme aide a la d cision pour l tude de projets de conception de r serves terrestres et marines par plus de 1100 utilisateurs enregistr s issus de 600 organismes gouvernementaux acad miques et non gouvernementaux a travers 95 pays C est probablement le logiciel d optimisation de s lection de site disponible le plus populaire et le plus largement diffus Il s agit d un programme autonome qui ne requiert aucun autre logiciel pour fonctionner bien qu un SIG facilite la pr paration des donn es la production des fichiers d entr e requis et la visualisation des r sultats Pour conna tre l actualit de Marxan le utilisateurs doivent s enregistrer et t l charg
59. a une intensit une distance d influence un effet d augmentation de la distance et une fonction de superposition attribu s en fonction de la menace potentielle qu il repr sente pour la sant de la biodiversit Le rouge d signe des valeurs de risque plus lev es qui diminuent de fa on lin aire au fur et mesure que la distance par rapports aux l ments de risque combin s augmente ex le bleu d signe le risque le plus bas 1 0 1 Valeur d intensit Une fois les l ments de risque identifi s les experts classent tous les l ments les uns par rapport aux autres et attribuent une valeur d intensit en termes de niveau de risque pour les habitats esp ces en question Par exemple certains types d exploitations mini res comme la Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 10 The Nature Conservancy d cembre 2011 bauxite peuvent avoir des effets plus d vastateurs sur les syst mes dul aquicoles c est pourquoi ils se voient attribu une valeur d intensit sup rieure compar s aux sites d excavation de calcaire pouvant avoir des effets moins n fastes Les valeurs d intensit et la distance d influence de chaque l ment de risque peuvent tre d finies en utilisant des donn es issues de la litt rature scientifique existante et ou d opinion d experts s agissant de l impact de ces activit s ou l ments sur les cosyst mes Il est possible d attribuer diff rentes valeu
60. a une longueur totale de 16 chiffres Taille minimum du groupe Si un groupe d unit s de CLUMP NOMBRE planification dot de l objectif de conservation donn est en ENTIER dessous de cette taille il ne compte pas pour ce but Le champ a une longueur totale de 16 chiffres Nombre de s paration Nombre de buts vis s d unit s de NOMBRE en ae RE planification mutuellement s par es dans des groupes valides Le champ a une longueur totale de 16 chiffres Distance de s paration Distance minimale pour laquelle les SEPDIS NOMBRE unit s de planification dot es de l objectif de conservation ENTIER sont consid r es comme s par es Le champ a une longueur totale de 16 chiffres Proportion C est une alternative au BUT vis qui est utilis e dans le fichier de d finition de groupe C est la proportion de la quantit totale de l objectif de conservation qui doit tre PROP FLOTTANT pr serv e Elle est exprim e par un chiffre entre 0 et 1 Si elle est indiqu e elle est utilis e la place du nombre indiqu dans le champ BUT Le champ a une longueur totale de 15 chiffres REMARQUE Dans le manuel Marxan de Ball amp Possingham 2000 veuillez noter que les auteurs utilisent le terme l ment de conservation pour ce que nous appelons objectif et qu ils appellent objectif ce que nous d signons par but Puisque les donn es des objectifs du tutoriel sont d j fournies dans les champ requis pour extraire et
61. aille minimale du groupe CLUMP Nombre de s paration SEPNUM Distance de s paration SEPDIS et Proportion PROP Les unit s par d faut sont exprim es en hectares surfaces et en kilom tres p rim tre Si vous utilisez la surface de l unit de planification en tant que co t ce co t sera indiqu en hectares Vous devrez changer les chiffres par d faut uniquement si vous utilisez des unit s autres que les hectares 10 000 m pour les polygones et que les kilom tres 1 000 m tres pour les p rim tres Par exemple si vous souhaitez utiliser des acres et des milles au lieu des pieds pour les unit s de votre carte vous devrez modifier ces champs de la mani re suivante surface 43 560 nombre de pieds carr s dans une acre et p rimetre 5 280 nombre de pieds dans une mille Si vous saisissez la valeur dans l un de ces champs le fichier puvspr dat file aura les m mes unit s que votre carte c est dire qu il n y aura pas de conversion L utilisateur doit galement s assurer que les unit s de but sp cifi es sont les m mes que les unit s calcul es L tat est facultatif mais n cessaire si vous pensez utiliser une couche de zone prot g e ou d autres aires d int r t particulier pour enfermer des unit s de planification Cliquez sur l option Utiliser couche pour indiquer un polygone de zone prot g e ou d aires d int r t particulier Cliquez sur Utiliser champ d unit de pla
62. ancy d cembre 2011 3 4 Regrouper et afficher les resultats de Marxan 3 4 2 Regrouper les fichiers de sortie gt Tydixton_Park mxd ArcMap ArcInfo Marxan File Edit View Insert Selection Tools Window Help D HS Le fh Regardons maintenant les r sultats avec ArcMap en za is anano E regroupant les nouveaux fichiers de sortie Marxan run_name_best txt et run_name_ssoln txt avec les identifiants d unit s de planification L identifiant d unit de planification sert de cl commune pour regrouper ces fichiers de texte Pour ce faire cliquez sur l item du menu Regrouper et afficher les r sultats de Marxan Cela fera appara tre une nouvelle bo te de dialogue et vous devrez renseigner la cat gorie d unit de plamification le champ identifiant de l unit de planification le fichier de sortie Marxan que vous souhaitez regrouper et le nom du champ de regroupement ainsi que le nouveau champ de sortie qui stockera les nouvelles informations Vous devrez r p ter cette proc dure deux fois une premi re fois pour run_name_best txt le nom de champ doit tre SOLUTION et une seconde fois pour run_name_ Ssoln txt le nom de champ doit tre NOMBRE La SOLUTION fait r f rence aux unit s de planification qui font r ellement partie du portefeuille final Les unit s de planification avec le chiffre 1 en font partie et celles avec le chiffre 0 en sont exclues Le NOMBRE fait r f rence au nombre de fois o l
63. cables ne sont pas sans importante pour la conservation Elles sont plus flexibles tant donn qu il existe d autre unit s de planification qui comportent une biodiversit similaire Une aire hautement irrempla able peut ne pas tre localement connue pour sa valeur de biodiversit mais peut par exemple contenir 100 des occurrences pour un objectif en particulier et peut donc tre irrempla able car elle atteint le but de repr sentation de cet objectif Marxan est galement utile pour mettre en vidence les aires qui ont t n glig es dans le pass Par exemple l o les buts de beaucoup d objectifs peuvent tre atteints d une mani re g ographiquement coh sive augmentant ainsi la probabilit d efficacit de la strat gie h R sultats inattendus Les objectifs les buts vis s et les fourchettes de co ts sont essentiels pour cr er les meilleurs portefeuilles Si des aires connues pour tre importantes ne sont pas repr sent es dans le portefeuille c est peut tre parce que les objectifs ou la fourchette de co t ne sont pas d finis de mani re diff rencier ces aires des autres Par exemple s il n y a pas d objectifs de hautes terres repr sent s dans les portefeuilles cela peut tre d au fait que les objectifs n ont pas t stratifi s en fonction de la hauteur ces zones en haute terre ne peuvent donc pas tre distingu es comme n cessitant une repr sentation diff rente de celle des aires en basse terre
64. cellules adjacentes existantes Une fois que la direction du courant est tablie la grille de poids c est dire l intensit peut tre cumul e dans le r seau Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 28 The Nature Conservancy d cembre 2011 1 3 4 2 Modeles d ERS marin Le d veloppement de mod les ERS pour le r gne marin est souvent le plus difficile parmi les trois r gnes en raison du manque de donn es et de la nature dynamique de l oc an un environnement en mouvement perp tuel L attribution de limites de risque l oc an est une t che complexe et difficile Des tentatives de mod lisation du transport c tier visant tablir des distributions des risques marin d apr s les donn es oc aniques actuelles ont t entreprises par Schill 2005 partir de la vitesse par cellule du mod le de donn es Mod le oc anique coordonn hydride Hybrid Coordinate Ocean Model HYCOM Le mod le fonctionne en utilisant des vitesses allant vers l est et le nord sur une base cellule par cellule afin de calculer une surface de co t de transport repr sentant le nombre de secondes n cessaires pour traverser une cellule Des recherches suppl mentaires sont actuellement en cours l aide du nouveau mod le de donn e en r seau d ArcGIS Network Analyst Comme c est le cas pour d autres mod les ERS les experts marins doivent commencer par identifier les l ments de risque pour
65. chiffres peuvent tre modifi s en fonction du sc nario de conservation qui a t d termin dans le tableau de pr paration des donn es Si vous devez attribuer la m me valeur a beaucoup d objectifs vous pouvez utiliser l option Remplir la premi re rang e pour automatiser le calcul des champs avec n importe quelle valeur que vous aurez saisie dans la premiere rang e Ces valeurs seront copi es dans toutes les autres rang es MARXAN TARGET PREP Taga an ID Goal asie rhaa LU 11606 12 Ss Haim Anm Hon Farc 710 1127070 mal F s Mon Kasie 720 844221 Fal C sar Fest Fi au Lorsque vous avez termin de saisir toutes les valeurs v rifiez nouveau les chiffres et appuyez sur OK Ajoutez maintenant la nouvelle cat gorie la section de visualisation de la carte et ouvrez le tableau des attributs pour vous assurer que les champs ont t cr s et qu ils ont t remplis avec les valeurs correctes Ces valeurs seront utilis es pour g n rer les fichiers d entr e que Marxan utilisera Vous pouvez remarquer que les champs suppl mentaires TNAME et TID ont t cr s Ils sont cr s pour permettre une attribution coh rente des noms lors que vous utiliserez le G n rateur de donn es d entr e Marxan lequel est d sormais pr t tre lanc pour cr er les fichiers d entr e que Marxan utilisera 3 2 3 G n rateur de donn es d entr e Marxan MIG Tydixton_Park mxd ArcMap Arcinfo Mai
66. cr er plusieurs champs repr sentant les valeurs d intensit et de distance d influence pour chaque esp ce ou cosyst me Comme nous l avons expliqu auparavant le type de diminution d signe la fonction spatiale appliqu e aux valeurs d intensit mesure que la distance par rapport l l ment de risque augmente ex fonction LIN AIRE CONCAVE CONVEXE et CONSTANTE La fonction de superposition sur cet cran permet l utilisateur de choisir la fa on de combiner les l ments de risque individuels contenus dans chaque couche Par exemple si l utilisateur a introduit des routes ayant diff rents niveaux d intensit la fonction de superposition d crite ici sera utilis e pour calculer la fa on d aborder les zones travers es par deux routes d intensit diff rente au sein du m me l ment de risque Bien que la SOMME soit la fonction par d faut dans certain cas le MAXIMUM peut repr senter une meilleure option Vous pouvez choisir toutes les fonctions de superposition pr c demment d crites ex moyenne majorit maximum m diane minimum plage d riv standard et vari t Le champ poids est utilis pour attribuer un crit re de poids plus lev aux l ments de risque individuels Le poids est r gl sur 1 par d faut ce qui signifie que tous les l ments ont le m me poids lors de l laboration du mod le final de surface de risque La valeur de poids fonctionne pratiquement de la m me fa on que la valeu
67. d finition par groupe Le nom de la colonne peut contenir des espaces ou autres s parateurs de mot mais tout s parateur sera remplac par un espace simple S il existe des d finitions en double elles seront toutes ignor es sauf la derni re Le contenu de ce fichier est le suivant id target target2 sepdistance identifia objectif objectif2 nt nom de Recherche Repr sentation Facteurde Taille Distance l objectif des du but de p nalit minimum minimum de doit p d finitions l objectif d esp ces du groupe s paration corresponare D FAUT 1 puvspr dat de groupe pour facultative facultative fi le DEFAUT 1 cha qu e DEFAUT 1 DEFAUT 1 CRITIQUE objectif DEFAUT 1 suivre Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 52 The Nature Conservancy d cembre 2011 Nombre d objectifs d unit s Nom en mots peut Nombre d occurrences de planification comprendre des espaces tous requises pour l objectif mutuellement s par es au les mots doivent commencer facultatif sein d un groupe valide par une lettre facultatif PERRET facultatif D FAUT no_name D FAUT 1 Les valeurs sont s par es par des virgules Le format de ce fichier se pr sente sous la forme id type target spf target2 sepdistance sepnum name targetocc 334 334 877676 56 10000 443 1000 2 limestone_forest O 335 335 639282 62 63928 26 227 1000 2 alluvia
68. d signe les situations o les zones prot g es existent mais ne sont pas en mesure d offrir la protection ad quate car les objectifs de gestion ne sont pas adapt s ou les zones sont g r es de fa on inefficace Utiliser une approche participative en collaborant avec les experts cl et les parties prenantes pour prendre des d cisions concernant les zones prot g es Faire de la conception de syst mes de zones prot g es un processus it ratif dans lequel l analyse des carences soit document e r vis e et am lior e au fur et mesure de l accumulation des savoirs et des changements des conditions environnementales Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 7 The Nature Conservancy d cembre 2011 R unir les quipes ar d experts R valuer une lois gue de nouvel o identifier et engager donn es sont dispon naires es prenantes entier les p de ation r les eas ri x cibles des exp ts rvation f les ies P tiques Ses tion El cr er l nn es Y spatiales fonction des trev d experts La majeure partie du travail d valuation des carences d une zone prot g e comprend la d limitation spatiale et l valuation critique des habitats esp ces des zones prot g es et des risques concernant les habitats en question Les outils PAT sont con us pour tre utilis s uniquement apr s que les utilisateurs aient rassembl des donn es
69. de configuration gt Comptes d utilisateur gt Modifier configuration de compte d utilisateur R gler le niveau sur Ne jamais signaler Vous pouvez aussi ex cuter ArcGIS en tant qu administrateur en cliquant droit sur le fichier ArcGIS exe et en s lectionnant Ex cuter en tant qu administrateur Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 5 The Nature Conservancy d cembre 2011 La barre d outils PAT devrait maintenant tre toujours disponible dans le menu d roulant de votre Barre d outils moins que vous ne d sinstalliez et r installiez ArcGIS Vous pouvez l activer et la d sactiver comme toutes les autres extensions de la barre d outil en allant sur Personnaliser gt Barre d outils gt TNC Outils pour zone prot g e ou en cliquant droit sur une zone vide de la barre sup rieure d ArcMap Cette nouvelle barre d outils vous donne acc s toutes les fonctionnalit s dans les trois modules des PAT ERS Environmental Risk Surface Surface de risque environnemental RBI Relative Biodiversity Index Indice de biodiversit relative et les outils Marxan N oubliez pas de d sinstaller les PAT avant d installer une nouvelle version d ArcGIS IMPORTANT Avant de commencer travailler avec les PAT n oubliez pas de configurer le r pertoire de travail PAT _SCRATCH C est l que les PAT sauvegarderont les fichiers temporaires lors de l ex cution de vos mod les Vou
70. des zones protegees L identification des carences des zones prot g es est l une des tapes du processus exigeant et souvent Aiden tification de la biodiversit focale et tablissement des cibles cl d courageant de cr ation d un r seau f de zones prot g es cologiquement Evaluation et mise plat des exemplaires kS et du statut de la biodiversite repr sentatives au niveau national Fa Bien qu il existe une grande vari t N analyser et cartographier la pr sence d approches et de m thodes A et l etat des aires proteg es d valuation des carences des zones FA p P A i Utilisation des in formations i protegees certains principes et pour identifier les carences certaines m thodes d organisation eee RAN if sont d cris dans Dudley and Parrish A oman 4 one 2006 Les outils pr sent s dans ce rain une tutoriel ont pour objectif de vous sd P P prendre assister dans la r alisation de les mesures 2 orrespondantes plusieurs tapes de ce processus mais die ul les utilisateurs doivent toujours garder bs a l esprit que la qualit du modele Fs f Fi i tapes de r alisation d une valuation des carences r obtenu d pend essentiellement de la qualit des donn es d entr e La r gle selon laquelle la qualit du r sultat d pend de la qualit des ingr dients est ici particuli rement pertinente Il est recommand que 80 90 de l ensemble du
71. doivent galement tre inform s qu une version optimis e 2 0 2 utilise uniquement un format de matrice creuse et a t red velopp e pour traiter des probl mes complexes et de grande envergure comprenant plus de 20 000 unit s de planification Cette version est sensible a l ordre des identifiants d unit de planification dans l unit de planification par matrice d esp ces creuse ou relationnelle et n est pas compatible avec le format de matrice tabulaire classique Veuillez consulter le site Web de Marxan http www uq edu au marxan pour obtenir une copie du programme de ligne de commande convert_mtx exe qui convertit les fichiers de matrice tabulaire existants en un format compatible avec Marxan Optimised 3 1 Etablissement d un sc nario et consid rations sur le projet Marxan Avant d ex cuter une mod le Marxan les experts en conservation doivent tablir un sc nario qui pourra comprendre a l ensemble des donn es utiliser et b les conditions appliqu es la fonction d objectifs que Marxan va utiliser Ball and Possingham 2000 Les utilisateurs doivent bien conna tre les donn es qui vont entrer dans le mod le et les buts de conservation assign s La d termination des buts des mesures de co t des unit s de planification etc est une t che difficile et souvent abstraite Mais ce sont des d cisions essentielles qui doivent tre prises Souvenez vous que Marxan produit des solutions flexibles qui r ponden
72. e planification num ro 76 obtient le score RBNT1 le plus lev Si nous ouvrons le tableau votre_nom_ de r sultat_RBI_All_ TARGETS nous pouvons voir une liste des objectifs et la note qui leur est associ e dans l unit de planification 76 rf ich B JB mobtion part Pama HSM P O A E 7 1 S706 20 TETE EEEE 47 civgon AT 1 neis dora CERTES du N E Pean eS 1 Tioga tesi Sagarga 1 37SeT Poses D Form Lx 1 IAS agn AIDE SBT 440004 70 Foro 70 16243796 10H37 ATRIA 140 ENS Fion 75 1 4510008 S ET EME e 44 Pom 4 1 40200 10068 SOOT OTS 757 aA O Gi Forge Bi 1 23008 17667707 ZA SIM MAIS 788508 E 2 agen 7 1 14666 ATR SSS AST Ti Fan 71 15287008 AmS PASSA OMR TEA LT a Fer 3 ie Oe HTE EANTA 72 reyn 72 1 SRI TON EME ORR S011 68 Popen ea 1 SRIRAM ISSIR TANT SAT 48 Fenm 45 1 LANUS THOT PSS TAIA Si Poygen 54 ee ee ITAR 119 MEN Ex di 1 Ime SSR ISTRA ATENI ATAM REBT 4S foe 55 1 9069007 AaS eT dE ENS GRA ET AP 73 1 17001 RIE ISSO RaT AT RA Phone AA 1 OA MTR IR SOWA TAT bal m4 oom m UE fo cae of a Selected a ere mat en eT TENT iriton Park Full Bie SUMMARY Tyddhon Pek PY RI ML Tae hs Table EJ dJ Gopnik Tydoton Fark RUL ROL ALL TARGETS _ Fin shape Teour pem me BF Pnkygon 1 PRAM 7er S40 Meri Fier Mon Knrstir 7a fue A 110 Poon 1 11a SAMOA Sara beer Mon Heer stk ra DUD Bea Sf 40054 MSA Fricka Fih F5 Nas SU Potro 1 Ti SUF
73. e ces l ments de risque et la sant cologique des sites de conservation offre une perspective importante pour la gestion de la conservation Cependant l valuation et la pr vision des risques pour les habitats repr sente l une des dimensions les plus probl matiques de la planification de la conservation en raison de l impr visibilit de l importante variation et du manque d information sur les rapports fonctionnels entre les processus cologiques et leurs impacts sur les r gnes terrestre dul aquicole et marin Les m thodes standards et g n ralement accept es de quantification des degr s relatif d impact et d utilisation de mesures de risque pour fixer la priorit des zones conserver en sont leurs balbutiements et se d velopperont probablement dans les ann es venir Une surface de risque environnemental ERS est un mod le de surface d velopp en utilisant la cartographie d l ments de risque ex des informations socio conomiques pour explorer le chevauchement entre ces l ments de risque et les composants de la biodiversit Un l ment de risque peut tre d fini comme tout ce qui est identifi par les experts comme ayant une influence n gative sur la sant d un habitat ou d esp ces cl On peut aussi d signer un l ment de risque comme tant une menace L ERS mesure les niveaux cumulatifs de l impact des risques sur l environnement et peut tre utilis pour d limiter la s lection de sites
74. e sucre de canne mais mesure que vous vous loignez de ces polygones l intensit diminue progressivement jusqu ce l intensit soit r duite z ro 0 une distance de 1000 m tres Dans le sch ma ci dessous on trouve un exemple de mod le ERS obtenu pour une route pav e avec une valeur d intensit de 30 et une distance d influence de 300 m tres Observez la fonction de diminution lin aire appliqu e comme une zone tampon entourant enti rement l l ment de risque dans toutes les directions Vous pourrez trouver plus d instructions concernant la configuration des valeurs d intensit et des distances d influence pour une vari t d activit s socio conomiques dans McPherson et al 2008 Zones risque lev Zones risque faible Intensit ELEMENT DE RISQUE ZONE PAVEE 30 VALEUR D INTENSIT 30 VALEUR D INFLUENCE 300 metres 0 Un exemple de mod le d ERS obtenu pour l l ment de risque d une route pav e avec une valeur d intensit de 30 et une distance d influence de 300m Observez la fonction de diminution lin aire appliqu e comme une zone tampon entourant enti rement l l ment de risque dans toutes les directions Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 16 The Nature Conservancy d cembre 2011 1 2 Ajouter et attribuer une valeur d intensit et une distance d influence a chaque element de risque Avant d ex cuter un mod le ERS il e
75. ement la matrice de risque ERS pr par e pr c demment devra tre ouverte pour que les valeurs correctes de chaque l ment puissent tre saisies Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 21 The Nature Conservancy d cembre 2011 Environmental Risk Surface ERS Generator Selected Layer Intensity Influence Distance Decay Type Rate Overlay TERR_INTEN TERR_DISTA w SUM x we oo os rsk_Quamnies Convex TERR_INTEN TERR_DISTA Ww lt Z rsk_bowns Linear risk_roads TERELINTEN TERR_DISTA s Linear tisk_ag_emall_scale TERR_INTEN TERR_DISTA Linear TERR_INTEN TERR_DISTA w Ea risk_ag_ sugarcane Linear TERR_INTEN w TERR_DISTA w in Cc 4 risk_Dausite_ mines Convex TERR_INTEN TERR_DISTA w lt un risk_urban_areas Linear i id iil ooo Pour cet exercice nous allons utiliser la distance d influence et les valeurs d intensit qui ont pr c demment t assign es dans les champs attribut des fichiers de forme Comme nous sommes en train de r aliser un modele ERS pour un exemple terrestre les champs ont t baptis s Terr_Inten pour l intensit et Terr_Dista pour la distance d influence Dans l hypoth se o l utilisateur doit g n rer une vari t de sc narios ERS pour la mod lisation de risques concernant plusieurs esp ces ou cosyst mes 1l est possible de
76. ent repr senter des surfaces plus 3 2 a 2 2P Z ay r guli res et naturelles L outil HexGen a t concu tn Does ER RES MARSAN Tools Spatial Analyst Hexen hi comme une fa on simple de g n rer des hexagones sur ma aa Se la base d une taille d finie par l utilisateur et auxquels MI COMBINE MARAM INPUT FILES x ont attribue des identifiants uniques personnalis s S PUR CERME TS TARA LF RUN INEDIT ME RUN MARYAN O O O O O O Vous n aurez pas besoin de cr er des hexagones pour ex cuter les donn es du tutoriel car elle sont d j fournies Pour cr er des hexagones pour une nouvelle analyse Marxan vous devez d abord d terminer une couche d tendue qui repr sente votre tendue maximale HexGen utilisera la couche d tendue que vous avez d finie pour cr er un fichier d hexagone correspondant aux limites spatiales de votre couche d tendue Cette couche repr sente la surface totale sur laquelle vous souhaitez cr er des hexagones Avant de cliquer sur le bouton HexGen assurez vous que la couche d tendue soit dans la section de visualisation de la carte Une fois que vous cliquez sur le bouton HexGen suivez ces tapes pour cr er des unit s de planification hexagonales 1 Indiquez la couche d tendue que vous souhaitez utiliser 2 D terminez si vous souhaitez cr er les hexagones en indiquant une Surface ou en indiquant le Nombre d hexagones 3 Si vous indiquez la
77. entr e le fichier qui contr le la mani re dont fonctionne Marxan c input dat un exemple de Fichier de param tres d entr e d Un dossier appel chantillon contenant des exemples des autres fichiers d entr e utilis s pour ex cuter Marxan e Le manuel d utilisation Marxan Ces fichiers peuvent tre sauvegard s n importe o sur l ordinateur Pour une utilisation plus facile lorsque vous ex cutez Marxan l ex cutable Marxan exe devrait tre situ dans le m me dossier que les fichiers d entr e pour ce projet Plut t que de changer les fichiers d emplacement Game and Grantham 2008 Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 45 The Nature Conservancy d cembre 2011 recommande de simplement copier l ex cutable Marxan dans chaque dossier contenant un projet Marxan 11 Il est important de noter qu il existe un certain nombre de variantes de Marxan ayant des fonctionnalit s modifi es qui ont t d velopp es au fil des ans Game and Grantham 2008 Il existe une version autorisant les informations probabilistes sur les menaces ou sur la pr sence d l ments de conservation pour des sites devant tre compris dans l tude de la conception de la r serve et Marxan with Zones qui permet le d coupage par zones de plusieurs objectifs La version la plus largement utilis e est Marxan 1 8 10 qui utilise un format de matrice tabulaire classique Les utilisateurs
78. er le logiciel sur http www ug edu au marxan Les premi res valuations de conservation reposaient sur une cartographie manuelle pour d limiter les sites et d pendaient souvent de l avis des experts quant aux aires de conservation a privil gier Le grand nombre d ensembles de donn es d crivant les objectifs leur taille ainsi que leur vari t ont finalement demand l utilisation d une proc dure de s lection de site plus syst matique et efficace Le logiciel Marxan est un programme d optimisation qui fournit une aide la d cision aux quipes d experts qui doivent choisir entre des centaines d objectifs de biodiversit et des milliers de zones candidates d unit s de planification Il identifie les portefeuilles efficients d unit s de planification et offre la flexibilit qui permet aux quipes d adapter des solutions efficaces aux situations de la vie r elle Gr ce l utilisation d un processus transparent orient vers des objectifs quantitatifs l analyse est reproductible et objective Les r sultats de Marxan peuvent illustrer un patron de sites prioritaires soumis de faibles pressions politiques et sociales mais qui peuvent cependant satisfaire les objectifs explicites de biodiversit Il peut galement identifier un r seau de sites o les ressources n cessaires pour mettre en place des strat gies de conservation ou de r duction des menaces sont moindres TNC 2005 Les unit s de planification font partie d
79. es paysages terrestres et marins consid r s comme la pierre angulaire potentielle d un syst me largi de r serves ou aires de conservation prioritaires Elles permettent de comparer les diff rentes aires candidates Les unit s de planification peuvent tre des unit s syst matiques telles que des hexagones des aires naturelles comme des bassins hydrographiques des limites administratives ou encore des sous divisions arbitraires du paysage Il existe de grandes diff rences de taille entre les tudes et entre les r gions qui d pendent principalement de l chelle de l analyse et de la r solution de donn es TNC 2005 Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 42 The Nature Conservancy d cembre 2011 3 0 L algorithme Marxan L un des algorithme les plus populaires mis en place par Marxan est l algorithme d optimisation de site de recuit simul Les valeurs de toutes les unit s de planification sont tudi es afin de concevoir un r seau de r serves optimal Pris s par ment les l ments d une unit de planification peuvent tre pr cieux tout en n tant pas le meilleur choix d un point de vue plus g n ral selon la r partition et la r p tition des autres l ments de l ensemble de la zone de planification Durant la proc dure de recuit simul un premier portefeuille d unit s de planification est s lectionn Des unit s de planification sont ensu
80. es d sormais pr t cr er le fichier input dat en utilisant le programme Inedit exe le programme de File Edit View Insert Selection Tools Window Help modification de fichiers d entr e Marxan cr par lan eas me r Ball Le fichier input dat sera lu avec Marxan en utilisant les param tres d finis par l utilisateur Cette section a t adapt de Huggins 2005 et vous guidera Hexen ER Per MARYAN Tools Spatial Analyst travers le processus de cr ation du fichier input dat en utilisant les fichiers de texte que vous venez de cr er Le MARXAN INPUT GENERATOR avec l outil MIG a 0O Mi COMBINE Marsan INPUT FILES HO RUN CONVERT TO MATRIX FILE Vous pouvez soit ex cuter Inedit exe et Marxan exe en dehors d ArcGis soit utiliser l option fournie par les Z RUN MARZAN outils Marxan permettant de sp cifier l emplacement des 42 JOIN AND DISPLAY MARXAN OUTPUT fichiers ex cutables l aide des options Ex cuter Inedit et Ex cuter Marxan du menu d roulant Si vous n avez pas encore indiqu l emplacement de ces fichiers ex cutables l outil vous demandera de les localiser Vous devez r aliser cette op ration chaque nouvelle session d ArcGIS Il convient de disposer du fichier ex cutable Inedit dans le r pertoire Marxan que vous souhaitez utiliser Si un fichier input dat ne se trouve pas d j dans le m me r pertoire une erreur appara tra Cliquez sur OK et ignorez l erreur No
81. es donn es du tutoriel en fonction de la vitesse et des ressources disponibles sur votre ordinateur ay M PREF MARSAN TARGET PREP MARAM INPUT GENERATOR COMBINE MARSAM INPUT FILES RUM CONVERT TO MATRTE FILE 5 amp es a OOOOOOS IE vx RUM INEDIT Les messages d erreurs apparaissant au d but et signalant blockdefname et highdata sont normaux Pour le tutoriel il devrait y avoir 113 unit s de planification 22 esp ces objectifs 334 d limitations et 85 l ments de conservation lus par l algorithme v RON MARKAM JOIN AND DISPLAY MARAM OUTPUT t L cran d information affichera ensuite les informations suppl mentaires Cela peut aider a identifier d ventuels probl mes avec les fichiers d entr e Un message appara tra ce moment si un ou plusieurs objectifs sont d j correctement repr sent s dans un LOR par ex dans le cas o des unit s de planification sont PAPE enferm es au d but de l ex cution ou nr s il y a un probl me avec le formatage des ee ee fichiers dat qui les rend illisibles Si cela RSR arrive v rifiez le formatage et notamment SSSR ans ing y eu l emplacement des virgules v rifiez que M FHTHG unable Eo Find HIGHGATE defamdt value will be war tous les en t tes sont en minuscule les en Rae Janina nets A 14 la i nan read t tes ne peuvent pas comporter de is aera ion 9 7 alue iak ait majuscules PS anding tn eke B
82. es points cellules du bassin hydrographique Les cellules de sortie pr sentant une accumulation de courants lev e sont des zones d coulement concentr et peuvent tre utilis es pour identifier les cours d eau ainsi que les zones de risque lev Les cellules de sortie pr sentant une accumulation de courants nulle sont des sommets topographiques Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 26 The Nature Conservancy d cembre 2011 locaux et peuvent tre utilis s pour identifier des cr tes Cette m thode permet aussi l utilisateur de calculer l intensit de risque totale par bassin hydrographique et ainsi de quantifier le risque au niveau du bassin hydrographique Si les experts dul aquicoles pensent que les valeurs hautes accumul es sont trop lev es pour les grands fleuves l effet peut tre r duit en soustrayant un facteur de dilution certaines parties du bassin hydrographique Une fonction maximum zonal peut tre appliqu e pour localiser la valeur cumul e d coulement maximale pour chaque unit de planification ou bassin hydrographique unique et ainsi quantifier la valeur cumul e d coulement maximale par unit VERIFICATION ET AJUSTEMENTS UNITES DE DU MODEL PLANIFICATIONS MEN CR DIRECTION DE COURANT CR ATION R SUME D ACCUMULATION LES ZONES na MODEL DES COURANTS ELEMENT HYDROGRAPHIQUE DES D VELOPPEURS bus UNIT S DE PLANIFI
83. essment Zenny N 2006 Technical Summary of the Jamaica Ecoregional Planning JERP Marine Analysis The Nature Conservancy Kingston Jamaica 16 pages Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 g0 The Nature Conservancy d cembre 2011
84. est pas garantie d tre dans la r serve initiale ou d origine Toutefois elle peut aussi bien l tre Ses chances d appartenir la r serve initiale est exactement la proportion de d part du fichier de param tres d entr e L unit de planification sera comprise dans la r serve d origine ou la r serve initiale Elle peut tre ou non dans la r serve finale L unit de planification est fix e dans la r serve Elle commence dans la r serve initiale et ne peut pas en tre supprim e enferm e l int rieur L unit de planification est fix e hors de la r serve Elle commence hors de la r serve initiale et ne peut pas y tre ajout e enferm e l ext rieur Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 53 The Nature Conservancy d cembre 2011 3 Fichier d unit de planification par rapport aux esp ces puvspr dat Ce fichier contient les informations sur la r partition des objectifs au travers des unit s de planification Il est parfois appel fichier d abondance Le contenu de ce fichier est le suivant Species esp ces pu unit de amount quantit planification Identifiant des objectifs de Identifiant de l unit de Nombre zone ou conservation doit tre un planification p rim tre d un objectif de chiffre Pre conservation CRITIQUE CRITIQUE Les valeurs sont s par es par des virgules Le format de ce
85. et doit disposer d un identifiant champ avec un num ro unique attribu chaque unit Les couches hexagones peuvent tre g n r es en utilisant l outil Marxan HexGen Le mot objectif d signe un habitat ou une esp ce de conservation et peut tre repr sent sous la forme d un point d une ligne ou d un polygone Lors de l utilisation de vos propres donn es assurez vous que chaque saisie dans les champs de nom d objectif ne contiennent aucun caract re sp cial ex 6 Dans le cas contraire le programme peut ne pas fonctionner La couche objectif doit avoir un nom unique ou un identifiant de champ repr sentant le type ou la cat gorie de chaque unique objectif ex type de for t type de courant esp ce 2 1 Ex cuter le module RBI L outil RBI requiert trois couches de donn es pour PAP E Et si eee eer Ali fonctionner La premi re couche est la couche objectif Fie Edit viem Bookmarks Insert Selection ou la couche qui repr sente les objectifs de m Ax old conservation Il peut s agir de points de lignes ou de polygones La deuxi me couche est le domaine d univers un polygone repr sentant la port e totale de l analyse prendre en compte Il peut s agir des ri amp fronti res d un pays ou d un bassin hydrographique La Layers derni re couche est le domaine de recherche galement M Sean Planning Unis ay LH target_point_species un polygone repr sentant la couche d u
86. eurs de conservation est la suivante o puis je obtenir le meilleur retour sur investissement cologique pour chaque dollar d di la conservation Cette question a orient la conception d un ensemble d outils syst matiques logiques et r utilisables afin d aider les planificateurs valuer les activit s ou les v nements pouvant menacer la sant des habitats identifier une repr sentation int grale de la biodiversit prot ger et configurer un portefeuille de solutions optimales pour atteindre les objectifs de conservation des habitats Les PAT sont trois modules de conservation qui op rent au sein du logiciel ArcGIS 10 0 1 Surface de risque environnemental Environmental Risk Surface ERS 2 Indice de biodiversit relative Relative Biodiversity Index RBI 3 Outils Marxan Le logiciel ArcGIS a t choisi comme application pour les outils car ESRI soutient fortement les missions de TNC et propose un accord de subvention dans le cadre duquel les partenaires de conservation peuvent obtenir gratuitement le logiciel pour leurs op rations relatives la conservation Chacun des trois modules a t d velopp en utilisant Visual Basic NET ArcObjects Les PAT op rent sur trois couches de donn es de base a habitats esp ces b l ments de risque pour les habitats esp ces et c zones prot g es Comme il s agit d un processus it ratif les utilisateurs sont encourag s continuer d affiner leurs do
87. euvent avoir besoin de plus d espace libre sur le disque pour fonctionner Assurez vous de v rifier la quantit d espace dont vous disposez sur votre disque dur le programme ne fonctionnera pas si vous n avez pas assez de place C est particuli rement le cas lors de l utilisation du module ERS qui peut cr er des couches raster tr s nombreuses et de grande taille ERs Per MARSAN Tools Options al Settings 8 Vous pouvez aussi configurer l emplacement Fait ichi ex cuti i Many of the took svalsbie in PAT reqa a agrficant number of proces 7 des fichiers d ex cution de Marxan InEdit et loss ne pet jad rufa dorage tac WARNE The ents Gpterte ol fhe decoy pri Convert to Matrix en utilisant le menu ely vl eet perena ed chan eae Seriya d roulant Options gt Configuration Si rey cue an vous ne configurez pas l emplacement de ces ce fichiers sur votre ordinateur vous ne serez ranger crc ph printer mer hk pas en mesure d utiliser ces processus avec stared ton and teary iat TE EN Sete ore ES ArcGIS Vous pouvez obtenir ces fichiers yc pau Fr d ex cution gratuitement depuis leur source MEd Emecutsis Eat om sur http www uq edu au marxan Ceci permet de garantir que ces outils soient ok Cod obtenus autoris s et cit s correctement Corvette Emule C Marat irral eae IMPORTANT Si vous utilisez Windows 7 et que la barre d outil PAT n appara t pas une fois que le chargement du fichier tbl allez sur Panneau
88. gmentation de la distance et le risque pour cgi l habitat s amoindrit Certains l ments peuvent Hiinaga contenir des activit s haut risque dont la E port e s tend une grande distance du centre tandis que d autres repr sente un risque moindre la port e plus limit e Il est pr f rable d tablir un tableau des l ments de risque indiquant l intensit et la distance d influence de chaque l ment de risque Cela sera repris en d tail dans la prochaine section Hasse Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 11 The Nature Conservancy d cembre 2011 1 0 3 Types d effets de l augmentation de la distance Les cologistes ont d termin que selon l cosyst me certains l ments de risque peuvent avoir un impact diff rent que d autres l ments de risque Ervin and Parish 2006 Theobald 2003 Araujo et al 2002 Dans certains cas on peut trouver un rapport lin aire direct entre un l ment de risque et la r action de l cosyst me la menace en question Souvent plus l expression d un l ment de risque est grande plus la menace qu il repr sente pour l cosyst me est grande Cependant a n est pas toujours le cas car certains cosyst mes pr sentent diff rentes caract ristiques qui d terminent leur fa on de r agir face une certaine menace Par exemple dans certains cosyst mes le feu peut avoir des effets d vastateurs et d truire imm dia
89. gories de donn es cr es par le modele Les deux nouvelles cat gories de donn es cr es l emplacement du r sultat seront intitul es votre_nom_de r sultat RBI SUMMARY et votre nom de r sultat RBI ALL TARGETS Relative Biodiversity Index RBI Calculator Lorsque vous cliquez sur OK une autre fen tre apparaitra et vous demandera de configurer les champs identifiant unique pour Target Layer ID Field chacune des couches d entr e d objectif Pour ei SB A a les trois fichiers de forme d habitat TARGET_NAM choisissez le champ TARGET_NAM Ce TARGET NAM champ peut aussi tre un num ro de code unique attribu a chaque cat gorie ou type d objectif mais il est plus facile d interpr ter les tableaux de r sultat si vous utilisez un texte descriptif pour les habitats et les esp ces tels que For t_calcaire_humide Courants _karstiques ou Poisson_end mique Lors de l utilisation de vos propres donn es assurez vous que chaque saisie dans les champs de nom d objectif ne contiennent aucun caract re sp cial ex fi 6 Dans le cas contraire le programme peut ne pas fonctionner Choose Field for Target Layers Lorsque vous aurez configur le champ objectif de chaque couche de donn es et appuy sur OK le processus de calcul RBI pourra commencer Le processus peut prendre un certain temps en fonction du nombre d unit s d analyse du nombre total d objectifs uniques et de la comple
90. grante d un processus permanent pour aider combler le vide technique existant dans de nombreux pays Le d veloppement de ces outils a t soutenu par le r seaux interam ricain d informations sur la biodiversit et le DGF de la Banque Mondiale Cela fait partie du processus men pour soutenir les objectifs de l TABIN et aider les planificateurs de conservation m soam ricain et carib ens valuer le statut actuel des zones prot g es et tablir des priorit s pour la future gestion de la conservation La version 1 0 de ces outils a t achev e en septembre 2006 et fonctionne avec l ArcGIS 9 1 d Esri En novembre 2008 les modifications apport es avec la version 2 0 l ont rendue compatible avec ArcGIS 9 2 En novembre 2009 la version 3 0 rebaptis e Protected Area Tools PAT est devenue compatible avec ArcGIS 9 3 La version 4 0 a t mise jour pour fonctionner avec ArcGIS 10 0 la demande de nos utilisateurs elle comprend plusieurs fonctionnalit s nouvelles y compris les outils avanc s Marxan Nous esp rons que les PAT continuerons d voluer et d tre utiles l valuation de l achat acquisition de parcelles ce pour obtenir un retour sur investissement maximum en termes de contribution g n rale aux objectifs de conservation d un pays En plus des questions portant sur le meilleur habitat essentiel restant ou recouvrant une repr sentation int grale de la biodiversit la grande question que se posent les planificat
91. gurez un catalogue de r sultat raster vous devez sp cifier le nom de l item catalogue raster dans le bo tier Item de catalogue raster d crit ci dessous Ce bo tier sera inutilisable moins que vous ne configuriez un catalogue de r sultat raster En cas de configuration d un emplacement de catalogue raster pour les r sultats votre r sultat final ne sera pas ajout la carte Vous devrez t l charger manuellement les donn es dans ArcMap Si vous avez configur votre r sultat comme catalogue raster sp cifiez un nom pour l item de catalogue raster qui sera cr Remplissez le champ chelle d intensit maximale Il repr sente le maximum th orique de la valeur d intensit C est la valeur maximale dans l chelle de toutes vos valeurs d intensit En d autres termes si vous avez tabli vos valeurs d intensit sur une chelle de 1 100 tapez 100 dans le champ de valeur d intensit maximum L outil ne prend pas en charge l utilisation d une valeur autre que 0 comme valeur d chelle minimale Vous pouvez ou non attribuer des valeurs d intensit la valeur que vous saisissez 1c1 Dans le cadre de ce tutoriel nous utiliserons une chelle de 0 100 Saisissez donc 100 dans le champs de valeur d intensit maximum Tapez la taille de cellule de sortie C est la taille de cellule d sir e pour la grille de r sultat finale La valeur par d faut est de 30m Gardez l esprit que plus la taille de cellule est petite p
92. i vos fichiers sont en projections g ographiques par ex en degr s d cimaux Vous devez utiliser une projection utilisant des unit s telles que des m tres ou des pieds par ex UTM State Plane 6 Pour une performance optimale votre ordinateur doit disposer d un processeur de 1 0 GHz ou plus et d au moins 1Go de m moire RAM Il est aussi conseill de compter sur un espace libre de 5 10 Go sur votre disque dur Il est recommand d utiliser ce programme avec Windows 7 ou XP car des probl mes peuvent survenir en cas d utilisation avec Windows 2000 ou Vista 7 Un grand nombre d outils disponibles dans les PAT fonctionnent en plusieurs tapes Vous devez configurer un emplacement sur votre disque dur local avec un acc s criture et une quantit suffisante d espace de stockage Veuillez utiliser le menu d roulant Options gt Configuration pour configurer l emplacement du dossier temporaire sur votre ordinateur ex C temp Ce r pertoire servira de dossier PAT SCRATCH C est la que les fichiers temporaires seront sauvegard s ATTENTION l int gralit des contenus du r pertoire que vous configurerez sera quotidiennement supprim e Par cons quent ne sauvegardez pas d information importante dans ce r pertoire ou choisissez un r pertoire d j pr sent sur votre disque contenant des informations importantes N oubliez pas qu en fonction de la taille et du niveau de pr cision exig par l utilisateur ces programmes p
93. ifs Marxan mesure que vous saisissez les valeurs de chaque cat gorie d objectif dans les champs L attribution de ces valeurs est tr s importante car ces derni res d termineront les r sultats de votre analyse Marxan et par cons quent l valuation de conservation Par cons quent ces chiffres doivent tre r vis s par des experts de conservation qui comprennent aussi bien le fonctionnement de Marxan que les objectifs de votre exercice de planification de conservation Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 59 The Nature Conservancy d cembre 2011 Exemple de tableau listant les objectifs de conservation pr par avant l ex cution de l outil de pr paration des objectifs Marxan Souvenez vous que vous pouvez aussi bien utiliser le champ BUT que PROP proportion pour d finir vos buts mais choisissez l un ou l autre Si vous choisissez PROP vous devez d finir un fichier de d finition de groupe 1 TARGET Nam rarGer 1 But type spr occ cump SepNUM seppis Prop L nt none ah x 4 4 0 Bat Pteronotus s 4 100 524 100000 a 1 BK Bil Parrot 47 3 00 47 100000 1 ne fat tne __i__e __s_tsee at 80 200 80 100000 7 4 00 N utilisez le champ PROP proportion que si vous ne saisissez pas de quantit exacte dans le champ BUT Si vous utilisez le champ PROP vous devez cocher la case dans le G n rateur de donn es d entr e Mar
94. isque seront combin s selon un plan de fonctions statistiques alg briques ex moyenne majorit maximale m diane minimale plage d riv e standard et vari t Cela est repris en d tail dans la prochaine section mais si la superposition des distances d influence d l ments de risque est pr vue il est important de r fl chir la meilleure fa on de r soudre ce type d accumulation avant d utiliser l outil La fonction par d faut pour la superposition des distances d influence est la SOMME qui calcule la somme des valeurs de toutes les couches La plupart du temps les fonctions SOMME ou MAX sont les plus utilis es Le sch ma ci dessous donne des exemples de chaque cas de figure Type de Type de superposition superposition MAXIMUM SOMME Exemples de types de fonctions de superposition les plus utilis es maximum et somme pour la r solution de zones de superposition des distances d influence entre l ments de risque voisins Veuillez remarquer la diff rence entre la fa on dont chaque fonction traite le calcul des valeurs d intensit dans les zones superpos es Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 13 The Nature Conservancy d cembre 2011 EXERCICE 1 Etablir une surface de risque environnemental ERS RAPPEL Chaque champ d intensit doit tre repr sent par un nombre entier PAS de aes virgule flottante avec d cimales Le programme cr
95. ite ajout es et supprim es afin d am liorer l efficience du portefeuille D s le d but de la proc dure il est possible d effectuer des modifications du portefeuille qui n am liorent pas sa rentabilit pour obtenir une meilleure efficience de l ensemble du portefeuille Cette obligation d accepter uniquement les modifications qui am liorent l efficience devient plus stricte mesure que l algorithme d veloppe un ensemble d it rations Veuillez noter que pour chaque ensemble d objectifs et de buts de conservation il peut y avoir beaucoup de portefeuilles efficients et repr sentatifs r alisant tous ces objectifs Cependant la plupart de ces r seaux devraient avoir un certain nombre d unit s de planification en commun Il faut ex cuter l algorithme plusieurs fois pour trouver le portefeuille le plus rentable et calculer le degr d irremplacabilit utilis ici pour indiquer le nombre de fois qu une unit de planification en particulier est choisie Dans certains cas les objectifs de conservation sont identifi s uniquement dans un petit nombre de sites des aires haute irremplacabilit qui sont toujours choisies dans tous les portefeuilles repr sentatifs En outre les aires haute irrempla abilit comprennent des unit s de planification dont l exclusion conduirait requ rir un r seau d aire de conservation d autant plus grand pour atteindre le m me niveau de repr sentation avec pour cons quence une perte de rentabilit
96. ixton_runl_sen dat Il contient une liste document e des options qui ont donn naissance ce sc nario Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 76 The Nature Conservancy d cembre 2011 6 Solutions additionn es pour toutes les ex cutions par ex tydixton_run1_ssoln txt Chaque ligne comprend le num ro d identifiant d une unit de planification et le nombre de fois o celle ci a t comprise dans une solution Etudions maintenant quelques uns de ces nouveaux fichiers de sortie Marxan Double cliquez sur tydixton_100runs_mvbest txt ou tout autre nom de fichier qui lui a t attribu dans l explorateur Windows pour l ouvrir avec le Bloc notes choisissez le Bloc notes dans la liste de programmes s il ne s ouvre pas automatiquement Il sera sans doute plus facile de visualiser les donn es dans des colonnes en important les fichiers de texte de sortie s par s par des virgules dans Excel V rifiez si tous les objectifs ont atteint leur but souvenez vous que le but est appel objectif par Marxan dans la derni re colonne du fichier mvbest Un exemple du r sultat de l chantillon mvbest se trouve dans le tableau 3 Dans ce tableau l objectif Wet_Alluvial_ Forest n a pas atteint son but Vous pouvez d terminer la quantit manquante en comparant le champ Quantit retenue au champ Objectif qui est en fait le but Une valeur lev e de Facteurs de p
97. l_forest 0 2 Fichier d unit de planification pu dat Ce fichier contient toutes les informations relatives aux unit s de planification l exception de la r partition des objectifs L en t te de colonne peut inclure id cost status xloc et yloc La colonne id est la seule qui est obligatoire Les colonnes cost co t et status tat possibilit d enfermer prendront les valeurs par d faut de 1 et O respectivement si les colonnes n existent pas Les colonnes xloc et yloc sont critiques s il existe des obligations de s paration g ographique pour l un des objectifs distance ou nombre de s paration Ces valeurs repr sentent l emplacement des unit s de planification et sont g n ralement les centro des des polygones Le contenu de ce fichier est le suivant id Cost co t status tat xloc yloc identifiant Identifiant De chaque S1 l unit de Centro des X de Centro de Y unique de unit de planification est l unit de de l unit de l unit de planification enferm e planification planification planification P FAUT l int rieur ou es ia se ere l ext rieur du syst me DEFAUT 0 Les valeurs sont s par es par des virgules Le format de ce fichier se pr sente sous la forme id cost status 1 2 3 0 2 4 8 0 L tat de chaque unit de planification peut prendre une des 4 valeurs D faut 0 Status Meaning signification tat L unit de planification n
98. la couche d tat Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 51 The Nature Conservancy d cembre 2011 3 2 1 Fichiers d entr e Marxan Le G n rateur de donn es d entr e Marxan MIG peut produire jusqu cinq fichiers texte d entr e trois obligatoires et deux facultatifs que Marxan utilise lors de son ex cution Ces fichiers sont automatiquement g n r s en utilisant les quatre couches de donn es d crites ci dessus et se pr sente sous un format de matrice tabulaire qui est compatible avec Marxan 1 8 10 et les versions ant rieures De nouvelles versions de Marxan 2 0 2 Marxan Optimised et 2 43 sont sorties en 2007 et en 2011 respectivement et sont con ues pour des recherches Marxan de plus grande envergure et plus complexes Ces versions sont sensibles l ordre des identifiants d unit s de planification dans la matrice creuse ou relationnelle d unit de planification par esp ces Marxan En outre elles ne peuvent qu utiliser un format de matrice creuse et ne sont pas compatibles avec un format de matrice tabulaire Veuillez consulter le site Web de Marxan pour obtenir une copie du programme de ligne de commande convert_mtx exe qui convertit les fichiers de matrice tabulaire Marxan existants en un format de matrice creuse compatible avec Marxan Optimised tant donn que les exercices Marxan peuvent n cessiter plusieurs ex cutions pour tester diff rents param tre
99. la decision Marxan MDS L outil d aide la d cision Marxan MDS a t con u pour faciliter l ex cution et l organisation des sc narios Marxan Cet outil fonctionne sur des fichiers de texte d entr e Marxan qui ont t cr s avec le g n rateur de donn es d entr e Marxan MIG ou toute autre m thode Cependant vous devez g n rer un fichier input dat avant de proc der l ex cution du MDS L autre condition est que vous disposiez d une version de l ex cutable Marxan sur votre syst me En outre vous devez indiquer le chemin d acc s de l ex cutable dans le menu Options Param tres dans la barre d outils PAT L outil d aide la d cision Marxan importera aussi bien les informations spatiales de l unit de planification que les fichiers de texte d entr e Marxan dans le fichier de base de donn es spatiales personnel Cette base de donn es spatiales stockera ces informations avec les diff rentes ex cutions de Marxan et les symboles fichiers couches que vous associerez avec ces ex cutions Chaque ex cution de Marxan est automatiquement enregistr e dans la base de donn es spatiales Vous pourriez tre amen enregistrer manuellement un projet seulement dans l hypoth se o vous r aliseriez une modification des fichiers d entr e tout en d cidant de ne pas ex cuter Marxan Pour ouvrir MDS s lectionnez Aide la d cision Marxan dans la barre d outils PAT C est le dernier item dans le menu d outils Marxa
100. le symbolize the laver s features using this data What do you want to join to this laver Join attributes From a table ka 1 Choose the field in this layer that the join will be based on ID 2 Choose the table to join to this layer or load the table From disk tydixton_ers_table Show the attribute tables of layers in this list 3 Choose the field in the table to base the join on ID Join Options Keep all records All records in the target table are shown in the resulting table Unmatched records will contain null values for all Fields being appended into the target table from the join table Keep only matching records IF a record in the target table doesn t have match in the join table that record is removed From the resulting target table Validate Join About Joining Data Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 24 The Nature Conservancy d cembre 2011 Une fois que vous avez joint les statistiques du tableau au Classification Css ste a fichier de forme de l unit de the TAMPON om pu planification fermez le ee Hair 103 220726 tableau et faites un double 7 mean TERR clic sur la couche de l unit ma Dada Orion 17 487008 de planification afin de faire appara tre les Propri t s de asss gs 448 Bra sues la couche Cliquez sur en ll a l onglet Symbole et el configurez les Quantit s gt ern Couleur gradu s Ch
101. le champ du nom de l objectif ne contient de caract re sp cial par ex 6 ou le programme pourrait chouer Essayez de limiter le nom de l objectif 50 caract res 2 TARGET_ID Un nombre entier unique doit tre attribu chaque cat gorie unique d objectif par ex 1 2 3 etc Prenez bien soin de ne pas attribuer le m me identifiant vos cat gories d objectif Voici un exemple de ce quoi devrait ressembler un tableau d attributs avant l utilisation de l outil de pr paration des objectifs Marxan Attributes of new _polygon_ habitats ME olx Hi Shape TARGET NAM TARGET_ID T J Polygon Cry Alluvial Forest AUG 14 Polygon Dry Alluvial Forest 5082 15 Palygan Dry Alluvial Forest AUG f Polygon Dry Limestone Forest ia 8112 a Polygon Ory Lirnestone_Forest 5112 Avant d ex cuter l outil de pr paration des objectifs Marxan il est pr f rable de cr er un tableau maitre qui dresse la liste de toutes les cat gories uniques d objectifs de conservation avec chaque champ d entr e et la valeur correspondante qui sera attribu e Ce tableau peut tre cr avec Excel ou tout autre type d application de feuilles de calcul Vous trouverez ci dessous un exemple de ce quoi ce tableau devrait ressembler Ces valeurs peuvent tre attribu es par des experts qui comprennent les besoins de conservation de chaque objectif Ce tableau permet de faciliter l utilisation de la pr paration des object
102. le langage de programmation Pascal Objet qui pr sente une interface vers la famille de logiciels Marxan ainsi qu un syst me d information g ographique int gr Il est con u comme une fa on simple et robuste d ex cuter des analyses Marxan et de visualiser les r sultats En raison de l int gration du logiciel open source de SIG il limine le besoin pour une personne ou un organisme d acheter un logiciel de SIG co teux pour pouvoir utiliser Marxan Avec ZC vous pouvez Modifier les parametres et les fichiers d entr e Marxan Ex cuter des analyses Marxan et visualiser les r sultats de mani re interactive Modifier des solutions Marxan de mani re interactive Calibrer les parametres Marxan L utiliser comme un SIG pour le Syst me de planification de conservation C Plan Ex cuter l ensemble du logiciel Marxan y compris Marxan classique Marxan with Zones Probabilit de risques et analyse d agglom ration des solutions Marxan Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 55 The Nature Conservancy d cembre 2011 3 2 2 G n ration d hexagones HexGen Tydixton_Park mxd ArcMap ArcInfo Les hexagones sont les polygones les plus souvent Eie Eak Mew insett elect on loob window Hep utilis s pour repr senter les unit s de planification dans D Hg FR is les analyses Marxan Les cologistes ont adopt les hexagones car ils ont plus de facettes pour la connectivit et peuv
103. les autorisations ne sont pas correctement configur es vous recevrez un message affirmant que vous devez ajouter le raster de sortie manuellement 1 3 3 Visualisation des r sultats de l ERS et resume des statistiques spatiales Lorsque le mod le ERS a termin de traiter les informations la grille finale appara t dans votre section de visualisation de la carte la port e spatiale des limites de toutes les couches d entr e tant configur es La grille de r sultat est affich e dans la section de visualisation avec les valeurs d arri re plan a z ro mais l utilisateur peut modifier ce parametre d affichage parmi d autres en utilisant le menu Propri t s des couches gt Symboles Toutes les tapes de traitement interm diaires sont sauvegard es dans le r pertoire sp cifi PAT temporaire Ce r pertoire est effac chaque lancement d ArcMap E Bi MARAA Pums huis i Ta 24 i neal LT i k Fe i Cara x FE ei ee Ga RAR ee La fonction Statistique zonale dans Analyse spatiale peut maintenant tre utilis e pour r sumer les statistiques de la surface ERS par hexagone d unit de planification ou par polygone d habitat Ce faisant les unit s de planification peuvent se voir attribuer une valeur de co t a utiliser dans Marxan et les polygones lignes points d habitat peuvent tre class s selon les statistiques poids zone d ERS sous jacentes Pour cela chaque unit de planification ou l ment c est dire p
104. leurs MINIMUM D termine la valeur de grilles minimale pour chaque cellule dans toutes les couches d intensit calcul es Par exemple si les valeurs des cellules entre les couches sont de 35 78 et 21 le nombre de cellules final sera de 21 Ce n est pas une option souvent utilis e car toute valeur de O sans risque sur un emplacement quelconque pour tout l ment de risque donn produira une valeur de 0 a cet emplacement dans la grille de r sultat finale ind pendamment des autres valeurs d entr e En d autres termes dans les zones sans superposition entre l ments de risque le risque attribu sera de 0 MAJORIT D termine la valeur majoritaire ou la valeur qui apparait le plus souvent entre les rasters d entr e sur une base cellule par cellule MEDIANE D termine la valeur m diane correspondant a une proportion cumulative de 0 5 Si chaque valeur de cellule d entr e tait class e par ordre croissant 50 pour cent des valeurs seraient en dessous de la m diane et 50 pour cent des valeurs seraient au dessus de la m diane La m diane fournit une autre mesure du centre de distribution Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 20 The Nature Conservancy d cembre 2011 MINORITE D termine la valeur qui appara t le moins souvent entre les rasters d entr e sur une base cellule par cellule PLAGE D termine la plage de valeur de la plus haute a la plus basse entre
105. lev e au dessus de la moyenne et une valeur de risque faible en dessous de la moyenne Ces unit s de planification peuvent tre des sites candidats grande valeur de conservation dont l environnement est relativement peu risqu selon notre surface ERS mod lis e Si vous n avez pas encore lanc les statistiques zonales l aide d une surface ERS mod lis e suivez les instructions du premier module en utilisant le fichier de forme votre_nom_de r sultat_ RBI_SUMMARY comme ensemble de donn es de zone et joignez le tableau statistique r sultat au fichier de forme de r sultat votre_nom_de r sultat RBI SUMMARY Select By Attributes Layer a Tydixton_Park_RBI_RBI_SUMMARY be C Only show selectable layers in this list Method Create new selection w ers _table_tydiston MIN erz _table_tudiskon Max ers _table_tydiston ARANGE ers table_tydiston MEAN ers table tydixton S TD ers table_tydixtorn SUM Get Unique Values Go To SELECT FROM Tydixton Park RB ABL SUMMARY ers_table_tydixton Tydiston_Park_ ABI ABIL SUMMARY RENTI gt 8524 AND ers table_tydiston MEAN gt 12 94 D terminez maintenant les valeurs moyennes de la surface ERS et du fichier de forme RBI Cela peut tre fait en double cliquant sur chaque couche et en allant sur Symbole gt Classer ou Histogramme Dans chaque cas vous obtiendrez la moyenne de l ensemble des donn es Pour la surface ERS la
106. lus le temps de calcul est long exponentiellement et plus l espace de disque disponible n cessaire est grand Le temps d ex cution d pend aussi de l chelle laquelle vous travaillez et du nombre de valeurs d intensit unique que vous avez d finies Nous vous conseillons de faire des tests avec diff rentes tailles de cellules afin d avoir un aper u du temps d ex cution et de l espace n cessaire Toutes les distances d entr e doivent tre sp cifi es dans les m mes unit s que les donn es d entr e c est dire que toutes les donn es doivent tre exprim es dans les m mes unit s De plus si la distance d influence que vous avez d finie est inf rieure la taille de cellule le r sultat sera automatiquement calcul avec la taille de cellule par d faut d finie par l utilisateur Par exemple si les routes ont une distance d influence de 15m et que la taille de cellule utilis e est de 30m la taille de cellule d passe celle du syst me et la distance d influence de la route sera de 30m Dans le cas de l exemple du tutoriel nous utilisons une taille de cellule de 30 ce qui correspond l chelle des donn es d entr e Vous pouvez tester diff rentes tailles de cellules afin d avoir un aper u de la fa on dont la r solution et la taille du fichier changent Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 19 The Nature Conservancy d cembre 2011 Configurez la fonction de super
107. male soit atteinte s interrompant alors de fa on abrupte Les utilisateurs doivent consulter les experts en cologie qui ont examin chaque l ment de risque et d fini les types de diminution a appliquer en fonction de l cosyst me en question INTENSITE INTENSITE INTENSITE INTENSITE DISTANCE DISTANCE DISTANCE DISTANCE TYPE LIN AIRE TYPE CONCAVE TYPE CONVEXE TYPE CONSTANT a TAUX 1 b TAUX 3 C TAUX 3 d TAUX 1 Dilaraa dinfu n e 1000m Dislarnce ginfeuence Distance d oifluente 1000m Intense 100 intensil biisnau 100 Famjin de mule ehair Fonction de denimin sancave Foncion de diminution convex Taux 1 Taus Taux 4 Distance d influence 1000en intensit 100 Fonchon de diminution masini Taux 1 Exemples de fonctions d augmentation de la distance et de r sultats obtenus bas s sur une occurrence un point et une distance d influence de 1000m Les teintes rouge et orange indiquent des valeurs d intensit plus lev es tandis que les teintes en vert et bleu repr sentent des valeurs d intensit plus faibles Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 12 The Nature Conservancy d cembre 2011 1 0 4 Fonction de superposition Un autre l ment prendre en compte est la fa on d aborder les superpositions des distances d influence d l ments de risque voisins L outil ERS permet l utilisateur de configurer la mani re dont les l ments de r
108. n Cette fen tre s affichera Marxkan Decision Support File Edit Run Marsan File to Edit Replace the values in the column with this value Replace La premi re t che effectuer est de cr er un projet De cette mani re MDS cr era le fichier de base de donn es spatiales susmentionn Pour cr er un projet cliquez sur Cr er un projet dans le menu de fichier Edit Run La boite de dialogue suivante apparaitra Open Project e the Save Project Vous verrez dans la partie inf rieure la bo te de dialogue MSD contenant les valeurs de donn es correctes Dans la premi re case indiquez un r pertoire de pr f rence un nouveau r pertoire Il deviendra la base du projet MDS et tous les fichiers d entr e Marxan cr s pour ce projet seront copi s a cet emplacement Un nouveau fichier de base de donn es spatiales sera cr dans ce dossier Le nom du dossier doit tre le nom du projet Dans la case suivante vous devrez s lectionner l emplacement du fichier Marxan input dat que vous allez utiliser pour le projet Le programme lira le fichier input dat pour d terminer les emplacements des autres fichiers d entr e Marxan afin de les copier dans le dossier du projet Dans la case suivante indiquez l emplacement de la couche de donn es de l unit de planification qui sera galement copi dans le fichier de base de donn es spatiales nouvellement cr dans le dossier du projet Enfin dans
109. n es et en r valuant la fonction de co t via plusieurs it rations Diff rents sc narios peuvent tre valu s en variant les donn es d entr e de la fonction de co ts totaux Par exemple le facteur du co t de p rim tre de d limitation peut tre augment ou r duit en fonction de l importance attendue d un portefeuille de sites g ographiquement coh sif TNC 2005 Des portefeuilles de conservation r alisant les buts indiqu s en mati re de repr sentation des objectifs de biodiversit peuvent tre identifi s L objectif final est de trouver un portefeuille qui atteint les buts de conservation indiqu s pour tous les groupes d objectifs de mani re efficiente tout en remplissant les crit res g n raux de conception d une r serve par ex connectivit fragmentation minimale Ce tutoriel ne couvrant pas tous les aspects de Marxan vous pouvez trouver des informations compl mentaires dans Ball and Possingham 2000 Manuel d utilisation de Marxan pour la version 1 8 10 de Marxan L Association d analyse et de recherche marine du Pacifique PacMARA et l Universit du Queensland ont r dig un manuel d utilisation augment de Marxan publi en f vrier 2008 Game and Grantham 2008 La documentation ant rieure tait compos e de th orie math matique et d exigences techniques pour la saisie de donn es qui ne satisfaisait pas les besoins de tous les utilisateurs de l outil Il est vivement recommand tous les u
110. ne surface globale de risques marins Les valeurs raster peuvent tre extraites en utilisant l outil Extraire valeur au point se trouvant dans ArcToolbox sous Outils analyste spatial gt Extraction SURFACE DE RISQUE TERRESTRE A SURFACE D ACCUMULATION DES COURANTS SURFACE DE RISQUE MARINE Utilisation de l accumulation des courants pour les surfaces de risques terrestres afin d valuer l intensit de risque des embouchures c ti res sur l environnement marin aux embouchures c ti res de R publique Dominicaine Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 30 The Nature Conservancy d cembre 2011 MODULE 2 Calculatrice de l indice de biodiversit relative Relative Biodiversity Index RBI Bien que Marxan puisse identifier un portefeuille efficace r pondant aux buts de conservation de plusieurs objectifs de conservation dans beaucoup de cas il est n cessaire de fournir des informations plus pr cises concernant les objectifs pour pouvoir prendre une d cision de gestion Marxan identifie la meilleure solution d apr s la repr sentation de multiples objectifs de conservation Cette solution optimale est souvent contre intuitive et difficile interpr ter et expliquer aux gestionnaires et aux parties prenantes L une des raisons de ce ph nom ne est que Marxan trouve des solutions pour les repr sentations de tous les l ments et les solutions de Marxan
111. nement est pris en compte La plage et l chelle des valeurs RBI seront diff rentes en fonction des donn s d entr e ex ligne point L indice calcule l abondance relative pour que l abondance puisse tre mesur e selon plusieurs unit s de mesure telles que les hectares d objectif l habitat le nombre d occurrences la longueur du courant etc Il est important d observer que les calculs d abondance relative diff rent en fonction du type de l objectif Pour les objectifs polygones de zone les valeurs pour nRBI sup rieures a indiquent proportionnellement une abondance sup rieure dans une unit de planification par rapport aux pr visions attendues du fait de la taille de l unit de planification Pour les objectifs lin aires qui utilisent des longueurs lin aires et les objectifs points qui n ont pas de zones les valeurs sont beaucoup plus r duites compar es aux cibles polygones Les valeurs de l indice de biodiversit relative normalis peuvent tre additionn es pour de multiples objectifs de fa on calculer le nRBI cumul des r gnes terrestre dul aquicole et marin voir sch ma ci dessous Un r sultat de RBI sup rieur gt 1 pour les donn es polygones implique qu il y a une repr sentation ou une tendue des objectifs plus importante que pr vue pour une unit de planification de cette taille ce qui peut ou non justifier une action de conservation N nkRBl nRBir N ou ensemble de cibles T t t
112. ner facilement des fichiers d entr e Marxan L outil Combiner des fichiers d entr e Marxan peut tre utilis pour combiner plusieurs fichiers d entr e tels que les fichiers puvspr dat et spec dat ainsi block dat si vous ex cutez une d finition de groupe C est le sixi me l ment du menu d roulant dans la liste d outils Marxan Il suffit d ajouter les fichiers dat que vous souhaitez combiner d indiquer un nouveau nom de fichier de sortie et de cliquez sur OK Si vous faites cela il est important d indiquer le type d l ment dans le nom du fichier par ex puvspr_points dat spec_polys dat afin de pouvoir d terminer quels fichiers de texte correspondent quels types d l ments Vous ne devrez combiner que des s ries de fichiers puvspr dat spec dat et block dat car les fichiers pu dat et bound dat seront les m mes entre les diff rents l ments Tydixton_Park mxd ArcMap Arcinfo File Edit View Insert Selection Tools Window Help List of Files to Combine Add File D Hag Tal KS E D Wworkspace marianpuyepr lines dat C workspace marsan puv pr_ points dat C workspace marsan puvepr_polus dat Combine Marxan Input Files ERs Reg MARXAN Tools Spatial Analyst a Hexen Lay Mie MARYAN TARGET PREP C1 7 My MARYAN INPUT GENERATOR o COMBINE MARAN INPUT FILES O O O E RUN CONVERT TO MATRIX FILE LF RUN INEDIT 8 MF RUN MARZAN 2 JOIN AND DISPLAY MARYAN OUTPUT
113. nification si vous avez d j attribu une valeur de champ d tat 0 1 2 3 dans votre fichier d unit de planification Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 63 The Nature Conservancy d cembre 2011 Options de co ts Si vous utilisez une couche pour calculer les valeurs d tat choisissez la couche par ex tydixton_protected_areas shp dans le menu d roulant Si vous utilisez l option de champ d unit de planification choisissez le champ correct dans le menu d roulant Valeur d tat Si vous utilisez une couche pour calculer la valeur d tat choisissez la valeur d tat que vous souhaitez attribuer dans le menu d roulant Pour enfermer des unit s de planification la valeur d tat par d faut et la plus commune est 2 Les valeurs d tat sont QO L unit de planification n est pas assur e de se trouver dans la r serve ou portefeuille initiale ou d origine 1 L unit de planification sera comprise dans la r serve d origine ou la r serve initiale 2 L unit de planification est bas e ou enferm e dans la r serve 3 L unit de planification est bas e ou enferm e l ext rieur de la r serve Seuil de chevauchement d tat Utilisez ce champ pour indiquer le seuil de chevauchement que vous souhaitez utiliser pour l intersection de la couche d tat avec votre couche d unit de planification Ce seuil est utilis
114. nit de E l target ine habitats planification ou d analyse et l unit de base recevant le amp M target polygon habitats calcul RBI Il peut s agir d hexagones ou d autres E M tydixton_watershed polygones tels que des bassins hydrographiques E M tydixton_ers img Avant de cliquer sur le bouton RBI assurez vous que vous disposez des fichiers de donn es utiliser t l charg s dans l affichage Pour cet exercice cela inclut notamment les fichiers de forme cible target_point_species shp target_line_habitats shp et target polygon_habitats shp les fronti res du bassin hydrographique du Tydixton Park tydixton_watershed shp et les hexagones d unit d analyse tydixton_planning_units shp Gardez l esprit que la port e de l analyse est aussi d sign e sous le terme domaine d univers et que l unit d analyse est aussi appel e le domaine de recherche La couche cible doit avoir un nom unique ou un champ code repr sentant chaque type ou cat gorie Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 35 The Nature Conservancy d cembre 2011 Gi L ARXAN Tools Options r _ als d objectif ex type de for t type de courant esp ce La couche d unit d analyse doit avoir un identifiant de champ avec un code unique ou un identifiant attribu a chaque unit de planification ou bassin hydrographique Une fois que vous avez charg les couches n cessaires dans Ta
115. nn es sur les habitats esp ces buts et l ments de risque de mani re r valuer les carences cologiques au fil du temps Ces outils permettent aux pays de poursuivre le processus d affinement de fa on syst matique et reproductible Les PAT continueront d tre d velopp s en fonction des besoins des utilisateurs et affin s pour la recherche sur a la vuln rabilit des habitats esp ces aux l ments de risque tel que la transformation de la couverture terrestre la fragmentation et les changements des limites des zones prot g es ou des pratiques de gestion b la distribution des habitats esp ces dans l espace pour s assurer qu il y ait suffisamment de cas dans les gammes environnementales au sein des PA et c niveau g n ral de l tat de protection des sites irrempla ables selon les mod lisations de Marxan Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 3 The Nature Conservancy d cembre 2011 Conditions d utilisation n cessaires des outils PAT v4 0 1 L utilisateur doit avoir install ArcGIS 10 0 Desktop sur son ordinateur Les versions pr c dentes de l outil ArcGIS 9 1 9 2 9 3 et 9 3 1 peuvent tre t l charg es sur http www gispatools org V rifiez le niveau de votre version d ArcGIS en vous rendant sur Aide gt A propos d ArcMap Vous aurez besoin d un niveau ArcView Level pour utiliser les modules ERS et RBI Vous aurez besoin d un niveau ArcInfo Level po
116. nt du bassin hydrographique du Tydixton Park au centre de la Jama que Les donn es contiennent des l ments d habitat repr sent s par des lignes fleuves des points emplacement d esp ces end miques et des polygones types de for ts En plus des habitats esp ces 1l existe des fichiers de forme repr sentant plusieurs activit s socio conomiques ou des l ments de risque pour l habitat Ils incluent l agriculture l exploitation mini re les routes et les zones urbanis es Les autres fichiers sont les unit s de planification hexagones les zones prot g es et les limites du bassin hydrographique du Tydixton Park Tous ces fichiers doivent tre utilis s pour r aliser une valuation pr liminaire des carences de zones prot g es en fonction des r sultats des trois exercices Comme c est le cas pour tous les fichiers de donn es utilis s dans les PAT les erreurs g om triques doivent tre corrig es et les informations de projection doivent tre configur es pour chaque fichier de donn es Cet chantillon d ensemble de donn es a t projet pour Lambert Conformal Conin en utilisant le Jamaican Datum 2001 JAD2001 LI Sample Models Fobder Eo risk_ag_small_scale shp Shape ie et G5 risk_ag_sugarcane shp Shapethe ia A Gad risk_bauxite_mines shp Shapefile k VE ES risk_quarnies sho Shapefile Ge risk _roads shp Shapefile BS rish_towns shp Shapefide rick_urban_areas cho Shapef le Bel target line habitats ch
117. ntenant que les champs requis et les valeurs correspondantes sont assign es aux couches d objectifs DER AN ae eee Er ne QE cela vous tes pr t pour utiliser le G n rateur de donn es D Hg be a 2 2 e 2 d entr e Marxan MIG pour cr er les fichiers d entr e que Pee aans UE Marxan utilisera Avant de poursuivre avec le MIG E assurez vous que les couches de donn es suivantes se Lay LS MARSAM TARGET PREP trouvent dans le sommaire de votre section de visualisation Ours de la carte les couches d tat et de co t sont facultatives A oe pour l ex cution de Marxan O E RUN CONVERT TO MATRIX FILE TS RUN INEDIT 1 Unit s de planification un polygone par ex des E RUN MARKAN hexagones avec un identifiant unique attribu 4 JOIN AND DISPLAY MARXAN OUTPUT 2 Couches d objectif elles doivent d abord passer par l outil de pr paration des objectifs ou tre dot es des valeurs d finies par l utilisateur dans tous les champs requis Les objectifs doivent galement tre supprim s pour qu il n y ait qu un enregistrement par cat gorie d objectif unique l outil de pr paration des objectifs le fait pour vous S ils ne sont pas supprim s des objectifs en double seront list s dans les fichiers spec dat et block dat 3 Couche d tat il s agit d une couche facultative mais n cessaire si vous pensez utiliser une couche de zone prot g e ou d autres aires d int r t particulier pour enfermer des
118. ntensit et de distance d influence correspondantes Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 17 The Nature Conservancy d cembre 2011 1 3 Ex cuter le module ERS Une fois les valeurs d intensit et de distance d influence attribu es tous les l ments de risque et une fois que les couches sont configur es dans la m me projection l utilisateur est pr t ex cuter le module ERS Avant de cliquer sur le bouton ERS de la barre d outil PAT assurez vous que tous les l ments de risque ont t ajout s a la section de visualisation de la carte et que l extension analyste spatial est allum e en allant sur Personnaliser gt Extensions Gardez l esprit que les fichiers de forme les bases de donn es spatiales et les grilles peuvent tous tre utilis s dans le module ERS Lors de l utilisation de grilles la valeur des grilles est utilis e comme valeur d intensit Pour cet exercice ajoutez a la section de visualisation de la carte les l ments de risque compris dans la figure ci dessous Ces l ments font partie de l chantillon d ensemble de donn es sur le Tydixton Park et sont dans la m me projection JAD2001 que les informations de projection d finies ex fichiers prj Untitled ArcMap ArcInfo Fie Edit View Bookmarks Insert Selection i MAX LOL E e l i A amp amp E E Layers risk_quarries Ez risk_bowns Il est important d obse
119. o ts tn N nombre de cibles Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 32 The Nature Conservancy d cembre 2011 Aggregated Target Domains Can sum up individual target RBIs across eam enim a sel of targets T LEE ty A abe RBI RBI N T can be defined as e All targets All forest matrix targets All riparian targets N can be defined as The count of targets in the set T e The count of targets in the set T that occur in that Query Domain Les valeurs de l indice de biodiversit relative normalis peuvent tre additionn es pour de multiples objectifs au niveau de l environnement et de l unit de planification afin de calculer le nRBI cumul pour les r gnes terrestre dul aquicole et marin L indice de biodiversit relative calcul au niveau des unit s de planification peut tre combin aux r sultats de Marxan et la mod lisation de la surface de risque environnemental Cette approche permet d obtenir une perspective plus pr cise et plus pouss e du potentiel des actions de conservation comme le fait d tablir des sites prioritaires int grant des strat gies sp cifiques aux habitats Plus encore cette combinaison peut tre utilis e pour pr dire le retour maximal sur les investissements de conservation s agissant des buts d habitat long terme et fournir de fa on syst matique des informations de s quence pour tablir un r sea
120. o Shapefde El target _point_species shp Shapefite Sul target polygon habitats cho Shapefile El tydicton_planning units hp Shapefile Efliydixton_protected_aness chp Shapefile Tydixton Park Watershed Ebi eydicton_watershed shp Shapetile JAMAICA ools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 14 1 1 Configurer un tableau ERS La r ussite de la planification de la conservation implique la gestion du risque Les mod les ERS servent cat goriser et classer les risques potentiels pour les habitats ou les l ments en danger La premi re tape de cr ation d une surface de risque environnemental consiste cr er un tableau de valeur d intensit et de distance d influence pour tous les l ments de risque identifi s et les classes associ es Ces valeurs peuvent tre personnalis es sp cifiquement pour la cr ation de mod les ERS pour les r gnes terrestre dul aquicole ou marin Gardez l esprit que chaque l ment de risque doit tre interpr t d apr s son impact sur les habitats ou les esp ces du r gne en question ex terrestre dul aquicole ou marin Un exemple de tableau matriciel de risque sur tableur Excel intitul Sample_Intensity_Table xls est fourni avec les donn es du tutoriel Ouvrez ce tableau matriciel de risque et vous verrez six colonnes repr sentant l l ment de risque la classe associ e chaque l ment de risque suivies des colonnes de valeur d intensit terrestre et dul aquicole e
121. ogramme carib en Ecole des sciences oc aniques et de la Terre sschill tnc org Universit du Mississippi du Sud graber gmail com CLAUSE DE NON RESPONSABILITE Les auteurs souhaitent tablir express ment que ces scripts ont t plac s dans le domaine public et qu ils sont donc gratuits et a disposition de tous CES SCRITPS SONT FOURNIS TELS QUELS SANS GARANTIE D AUCUNE SORTE EXPRESSE OU IMPLICITE CE QUI INCLUT MAIS SANS S Y LIMITER TOUTES LES GARANTIES DE QUALITE MARCHANDE ET D ADEQUATION A UN USAGE PARTICULIER LES AUTEURS NE GARANTISSENT PAS QUE L UTILISATION DE CES SCRIPTS SOIT ININTERROMPUE OU SANS ERREURS L UTILISATEUR ASSUME TOUS LES RISQUES EN TERMES DE QUALITE ET DE FONCTIONNEMENT DE CES SCRIPTS EN AUCUN CAS LES AUTEURS NE POURRONT ETRE TENUS RESPONSABLES DES COUTS DE FOURNITURE DE BIENS OU DE SERVICES DE REMPLACEMENT PERTES DE BENEFICES PERTES DE VENTES OU DEPENSES D AFFAIRES INVESTISSEMENTS OU ENGAGEMENTS PRIS DANS LE CADRE D UNE ENTREPRISE PERTE DE TOUT ECART D ACQUISITION OU DE TOUT DOMMAGE INDIRECT PARTICULIER ACCIDENTEL OU CONSECUTIF SURVENU EN DEHORS DE CET ACCORD OU DE L UTILISATION DE CES SCRIPTS PEU IMPORTE LA CAUSE QUELLE QUE SOIT LA THEORIE DE RESPONSABILITE ET QUE LES AUTEURS AIENT ETE OU NON INFORMES DE LA POSSIBILITE DE TELS DOMMAGES CES LIMITATIONS S APPLIQUERONT INDEPENDAMMENT DE TOUT MANQUEMENT A LA VOATION ESSENTIELLE DE TOUT RECOURS LIMITE Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools
122. oient coup es par inadvertance En g n ral c est la distance d influence maximale qui est utilis e sur n importe lequel des l ments de risque d entr e Dans le cadre du tutoriel nous utiliserons la valeur par d faut de 1000 m Dans certaines occasions 1l est souhaitable d introduire une port e plus importante en cas de besoin pour l utilisation d ensemble de donn es ayant une port e d passant la port e actuelle Une fois que tous les param tres des donn es sont configur s cliquez sur OK 1 3 2 Configurer l intensit la distance d influence le type de diminution la superposition et le poids de chaque l ment de risque Une fois que vous avez cliqu sur OK dans le menu pr c dent une nouvelle fen tre de dialogue appara tra permettant l utilisateur de configurer les valeurs d intensit de distance d influence de type de diminution taux de superposition et de poids pour chaque l ment de risque d entr e Le nom de chaque l ment de risque s lectionn appara tra sur la gauche de cette fen tre de dialogue L utilisateur a la possibilit de saisir ces valeurs ou de cliquer sur la fl che d roulante pour choisir le champ contenant les valeurs correspondantes Lors de l utilisation d ensembles de donn es issus d l ments de bases de donn es spatiales assurez vous que les noms de champs contiennent moins de 12 caract res pour viter de provoquer des erreurs Si l utilisateur introduit les valeurs manuell
123. oisissez Leach la Valeur de champ 47 195309 DT EU FE MOYENNE ainsi qu une gamme de couleurs Avant de cliquer sur OK param trez le nombre de dus i 15 R0518 51 810363 TT 415545 1032720726 cat gories sur 10 puis appuyez sur le bouton Classer pour visualiser le r sum de l histogramme de MOYENNE de statistiques La valeur moyenne du champ MOYENNE sera affich e dans la bo te Statistiques de classement Il s agit de la repr sentation de la valeur de risque moyenne pour tous les polygones d habitat Ce nombre peut tre utilis comme un seuil de coupure afin de d terminer un seuil pour les habitats pouvant tre le plus touch s en raison de l intensit et des distances d influence des l ments de risque sous jacents Par exemple si la valeur moyenne est de 12 98 toutes les unit s de planification polygones d passant cette valeur peuvent tre des unit s haut risque ou potentiellement touch es des niveaux de risque sup rieurs selon le mod le ERS et les port es spatiales des l ments de risque Il est possible d exclure ces l ments de la section de visualisation de la carte en cliquant sur Exclure donn e dans la fen tre de dialogue de Classement et en param trant ce seuil comme formule de s lection ex MOYENNE gt 12 98 fe i ie few Feet se eg COMENT Pee y i Bk RE TELL eee te fel Lae ee ee ee eh BE p rar wim IUT iy hy MAG i AR E EE oe i QE _ Mean
124. olygone doit avoir un identifiant de champ unique Si vous ne disposez pas d identifiant de champ unique vous devez ajouter un nouveau champ de nombre entier au tableau et calculer la valeur unique du champ en question ex champ FID Dans cet exemple nous utiliserons le fichier tydixton_planning_units shp pour ex cuter les statistiques zonales de la grille ERS Ce fichier a t cr l aide de l outil HexGen dans la liste des outils Marxan Ajoutez ce fichier de forme a la section de visualisation et rendez vous sur le menu ArcToolbox puis s lectionnez Analyste spatial gt Zonal gt Statistiques zonales en tableau Assurez vous que les champs suivant aient t d finis avant de cliquer sur OK Raster d entr e ou donn e de zone tydixton_planning_units shp Champ zone dentifiant Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 23 The Nature Conservancy d cembre 2011 Valeur de raster d entr e Votre grille de r sultat ERS Tableau de r sultat Configurer le r pertoire et le nom du tableau ex Tydixton_ERS_Table Ignorer donn e vide lors du calcul v rifi Une fois que vous cliquez sur OK les statistiques uni vari es de surface de l ERS sont calcul es dans les limites de chaque hexagone unique d unit de planification Le tableau appara tra dans votre fen tre de r sultat qui peut ensuite tre d plac e dans votre fen tre Tableau des contenus Ce
125. ommand aux utilisateurs de commencer par tester le mod le en utilisant un ou deux fichiers d l ments de risque afin d avoir un aper u de la taille de cellule optimale du temps d ex cution n cessaire et de l espace de disque n cessaire Avant de lancer le module ERS vous devez aussi songer la mani re de traiter les zones de superposition sur la distance d influence et vous assurer que l l ment de risque soit dans la m me projection avec les informations de projection correctement configur es Les fonctions de superposition des l ments de risque doivent tre d termin es par des experts qui comprennent la fa on dont ces l ments interagissent dans l espace risk_ roads _ FID Shape NAME TERR_INTEN TERR_DISTA FW_INTEN FW_DISTA WEIGHT _ 229 Polyline Road CLASS 4 30 60 BO 120 1 236 Polyine Road CLASS 30 60 GO 120 239 Polyine Road CLASS A 30 60 60 120 242 Polyline Road CLASS 4 30 BO BO 420 245 Polyline Road CLASS 4 30 60 BO 120 250 Polyine Road CLASS A 30 60 60 120 253 Polyine Road CLASS 4 30 60 60 120 256 Polyine Road CLASS A 30 60 BO 120 263 Polyine Road CLASS A 30 60 BO 120 265 Polyine Road CLASS 30 60 BO 120 267 Polyine Road CLASS A 30 60 60 120 Palline Finard Cl ASS A AA AM An 120 HT 0 FI Bs 0 out of 781 Selected w Un exemple de tableau d attribut pour risk_roads shp indiquant la cat gorie type de route et les valeurs d i
126. ons n cessaires l ex cution de Marxan et qui permettent la comparaison et la s lection des aires candidates Les unit s de planification peuvent tre des unit s syst matiques comme des hexagones ou des sous divisions du paysage non syst matiques comme des bassins hydrographiques ou des limites administratives La taille des unit s doit tre repr sentative de l chelle de l analyse et de la r solution des donn es d entr e Pour les utilisateurs qui voudraient utiliser des hexagones comme unit s de planification l outil HexGen est disponible dans le menu d roulant d outils Marxan Les aires prot g es ou aires d int r t particulier C est une couche facultative utilis e dans Marxan pour ce qui est appel la Couche d tat ou Identifiant d tat Cette couche doit tre un l ment de type polygone Elle est obligatoire si l utilisateur souhaite ex cuter un sc nario o les unit s de planification qui chevauchent des aires prot g es d clar es ou des aires d int r t particulier vont tre enferm es ou tablies dans la r serve par cons quent toujours comprises dans la solution Ces unit s de planification sont prises en compte en premier lorsque Marxan tente d atteindre les buts de conservation Si des objectifs sont atteints dans ces aires aucune autre unit de planification ne sera s lectionn e pour ce but en particulier Le G n rateur de donn es Outils TNC pour zones prot g es Protected
127. p rim tre de d limitation BLM et du co t L efficacit du BLM sera galement affect e par des modifications de co t Si une gamme de co ts doit tre utilis e la valeur de BLM doit tre test e avec les co ts en place Le facteur de p nalit d esp ces SPF repr sente l importance que l utilisateur attribue chaque but atteint et influence galement la s lection des unit s de planification Tous ces facteurs doivent tre correctement quilibr s pour obtenir un portefeuille optimal de mani re ce que l utilisateur puisse d cider quelle influence il veut accorder chaque facteur Certaines situations de planification demandent une fourchette de co ts ayant plus ou moins d influence ce qui vaut galement pour la quantit d agglom ration n cessaire La quantit d essais relatifs la fourchette de co ts avec le BLM d pend de l ampleur de la limitation au regard de l importance attribu e chaque but atteint Il est recommand aux utilisateurs d essayer trois sc narios relatifs la fourchette de co ts Huggins 2006 1 D terminer un co t fixe pour toutes les unit s appartenant la zone de l unit de planification par ex 260 ha 2 Une id e consiste en la fixation d une fourchette de valeurs de co ts en prenant pour base la zone de votre unit de planification puis en augmentant avec un multiplicateur par ex 5 co t de base afin d obtenir une fourchette plut t troite par ex
128. position C est ici que vous configurez la fonction alg brique de carte que vous souhaitez utiliser lors de la combinaison de tous les r sultats de groupes d l ments de risque Un groupe d l ment de risque d signe tous les l ments de risque cr s par une seule couche de donn es ex routes villes carrieres Plus tard vous aurez la possibilit de configurer la fonction de superposition au sein d un groupe d l ments de risque ex types de routes Dans le cadre de l exemple du tutoriel nous utiliseront la fonction SOMME par d faut qui est la fonction la plus utilis e car elle additionne les valeurs d intensit de tous les l ments de risque MAXIMUM D termine la valeur de grille maximale pour chaque cellule dans toutes les couches d intensit calcul es Par exemple si les valeurs des cellules entre les couches sont de 35 78 35 et 21 le nombre de cellules final sera de 78 zt RESULTAT 78 SOMME D termine la somme des valeurs de grilles pour chaque cellule dans toutes les couches d intensit calcul es Par exemple si les valeurs des cellules entre les couches sont de 35 78 et 21 le nombre de cellules final sera de 134 Il existe d autres fonctions de superposition moins utilis es R SULTAT 4134 notamment MOYENNE D termine la moyenne arithm tique des valeurs entre les rasters d entr e sur une base cellule par cellule La moyenne fournit une mesure du centre de distribution des va
129. processus d valuation soit soigneusement examin par des experts nationaux s agissant de la description des habitats esp ces de la d termination des buts de conservation et de la d finition et du classement des l ments mena ant la sant des habitats ou des esp ces cl cibl es Les principes directeurs de r alisation d une analyse des carences d une zone prot g e comprennent Dudley and Parrish 2004 l 2 S assurer d une repr sentation globale des diff rentes chelles biologiques esp ces et cosyst mes et des r gnes biologiques terrestre dul aquicole et marin Rechercher la redondance des exemplaires d esp ces et d cosyst mes dans un m me r seau de zones prot g es afin de capter les variations g n tiques et d viter les pertes inattendues Pr voir une conception flexible afin de garantir que les syst mes de zones prot g es supportent les tensions et les changements tel que le changement climatique Tenir compte des carences de repr sentation des carences cologiques et des carences de gestion lors de l analyse L expression carences de repr sentation d signe les esp ces cosyst mes et processus cologiques compl tement ignor s par un syst me de zones prot g es carences cologiques d signe la biodiversit existante dans les zones prot g es mais insuffisante en qualit et en quantit pour fournir une protection long terme tandis que carences de gestion
130. quez des identifiants d unit s de planification qui se r petent dans un fichier de d limitation ce sont des unit s de planification de lisi re Les r p ter dans le fichier bound dat vous aide a viter les biais dans le BLM car ils ont des limites partag es plus courtes Il n est pas n cessaire d indiquer les p rim tres de d limitation pour toutes les unit s de planification lorsqu ils ne sont pas indiqu s Marxan supposera qu il n existe pas de d limitation entre les unit s de planification Toutefois toute valeur manquante dans le fichier emp chera l ex cution de Marxan Par exemple si idl et 1d2 sont indiqu s alors qu aucune valeur n est saisie pour limite Game and Grantham 2008 Le contenu de ce fichier bound dat est le suivant id1 identifiant 1 id2 identifiant 2 identifiant de l unit identifiant de l unit de le p rim tre de d limitation de planification planification voisine ou CRITIQUE CRITIQUE le m me que l idl pour une limite inamovible CRITIQUE Les valeurs sont s par es par des virgules La structure de ce fichier se pr sente sous la forme id1 id2 boundary 1 2 33453 5 1 3 334536 2 Logiciel Zonae Cogito ZC v1 7 4 ZC a t con u par Matthew Watts et Romola Stewart de The Ecology Centre de l Universit du Queensland et vous pouvez le t l charger gratuitement sur le site de Marxan C est un syst me d aide a la d cision crit dans
131. r Ce tutoriel n a pas pour objectif de traiter tous les aspects de l valuation des carences des zones prot g es Pour un examen int gral de ce processus et pour plus de recommandations et de principes directeurs portant sur la conduite de l valuation des carences des zones prot g es veuillez vous r f rer Dudley and Parrish 2004 MODULE 1 Surface de risque environnemental Environmental Risk Surface ERS Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 g The Nature Conservancy d cembre 2011 L un des objectifs principaux de la plupart des approches de la s lection de portefeuilles de conservation est de cr er un environnement fonctionnel ou un r seau de sites adapt s a tous les l ments de la biodiversit L un des aspects fondamentaux de cette approche consiste a minimiser le risque environnemental pour les habitats critiques et les esp ces cl Bien que toutes les activit s humaines ne puissent pas tre consid r es comme dangereuses pour la biodiversit l impact direct ou indirect des activit s humaines est en derni re instance responsable de la plupart des alt rations des processus cologiques qui alimentent la biodiversit De plus il existe d autres v nements qui repr sentent un risque important pour les habitats et les esp ces ex les ouragans l activit volcanique le changement climatique Par cons quent le fait de comprendre le rapport spatial entr
132. r d intensit il faut donc faire attention au moment d alt rer ces valeurs Maintenant s lectionnez les correctes valeurs d intensit et de distance d influence manuellement ou en configurant les champs d attributions appropri s l aide du menu d roulant Pour cet exercice choisissez le champ TERR_DISTA pour la distance d influence et TERR_INTEN pour les valeurs d intensit de toutes les couches de donn es groupes d l ment de risque et laisser les valeurs par d faut pour vous rappeler des parametres de donn es Gardez l esprit que lors de l utilisation du format base de donn es spatiales vous devez vous assurer que les noms de champs contiennent moins de 10 caract res pour viter de provoquer des erreurs Vous pouvez aussi configurer le type de diminution et la fonction de superposition a l aide du menu d roulant La fonction de poids op re comme multiplicateur Elle est g n ralement laiss e sur 1 Lorsque vous tes pr t cliquez sur OK pour ex cuter le mod le Dans le coin inf rieur gauche d ArcMap vous pourrez observer le nombre de couches d l ment de risque en cours de traitement Une fois le mod le termin une fen tre de dialogue marquant Processus ERS termin appara tra et les r sultats seront charg s dans la section de visualisation de la carte Si Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 99 The Nature Conservancy d cembre 2011
133. rgets l AMEN la section de visualisation de target_point_species seat tee tee M la carte appuyez sur le bouton angel pogon Maka tydiston_planning_units RBI et une fen tre de dialogue de vEY Enaysi Entent de la calculatrice RBI Output Location C Tydiston_Park_Tutorial_Ca ul apparaitra Dans le bo tier de gauche cliquez sur les Output Mame Todixton_Park_REI fichiers objectifs que vous souhaiter utiliser dans votre analyse RBI Gardez l esprit que cet outil a t con u de fa on ce que vous puissiez r aliser des calculs de point de ligne et de polygones en m me temps Pour cette exercice choisissez farget_point_species target_line_habitats et target_polygon_habitats Puis choisissez une couche unit d analyse ou de domaine de recherche dans la liste du menu d roulant tydixton_planning_units shp Ensuite choisissez le champ de cette couche contenant l identifiant unique pour les unit s d analyse ZD Dans la liste du menu d roulant choisissez la couche de d limitation du bassin hydrographique tydixton_watershed shp La port e de l analyse est le domaine d univers total de l aire de l environnement a prendre en compte dans les calculs RBI Puis configurez l emplacement du r sultat ainsi que le nom du r sultat L emplacement du r sultat est un fichier une base de donn es spatiales ou un ensemble de donn es Le nom de r sultat que vous introduirez sera le nom racine des deux cat
134. rs d intensit un l ment de risque en fonction de son impact sur la biodiversit terrestre dul aquicole ou marine Les intensit s doivent tre normalis es en fonction d une chelle relative ex de 0 0 1 0 ou de 0 100 afin d tre comparable travers tous les l ments et cat gories de risque ex diff rents types de route Les notes d intensit normalis es ne sont pas repr sentatives de la mesure absolue de l impact des activit s sur la biodiversit Ces valeurs doivent tre interpr t es comme un degr relatif de probabilit de survie de la biodiversit un endroit plut t qu un autre en fonction de la pr sence d activit s donn es par rapport d autres activit s Il est possible de trouver des exemples d utilisation de valeurs d intensit dans l valuation de la conservation en Jama que dans McPherson et al 2008 1 0 2 Distance d influence Une fois que les valeurs d intensit ont t attribu es la prochaine tape consiste d terminer la distance d influence de chaque l ment de risque La distance d influence est la port e spatiale ou empreinte de l activit et repr sente la distance maximale sur laquelle un l ment produit un impact n gatif sur la biodiversit En d autres termes mesure que la distance tampon augmente a partir du centre point ligne polygone de l activit les valeurs d intensit des cellules au sein des tampons diminuent progressivement effet d au
135. rt e la s v rit et la r versibilit de chaque l ment de risque par rapport aux cibles de conservation En plus des donn es socio conomiques les donn es d v nements naturels tels que les ouragans l activit volcanique et le changement climatique peuvent aussi tre utilis es pour cr er un ERS bien qu il soit difficile de classer et d assigner ces valeurs en raison de l extr me impr visibilit et de la complexit de ces v nements Le sch ma ci dessous montre des exemples d l ments de risques repr sent s par des polygones des lignes et des points repr sentant les surfaces de risque model es avec diff rentes valeurs d intensit et de distance d influence Les zones rouges d signent des combinaisons de risque important et les zones bleues claires des zones de risque inf rieur telles que mod lis es par les fonctions de cartographie des l ments de risque Les prochaines sections expliquent par le biais d exemples la fa on d attribuer des valeurs d intensit de distances d influence diff rents effets d augmentation de la distance ainsi que des fonctions de superposition POLYGONES LIGNES POINTS a 1 N pe s Ne erie t nE ritur i T li ys Th bende She aie RL tee 2 Li du Es pau in ton Exemples d ERS d riv s d apr s des l ments de risque repr sent s par des polygones des lignes et des points Chaque l ment de risque
136. rver qu tant donn qu ArcGIS labore les projections au fur et mesure les couches peuvent appara tre dans la m me projection alors qu en r alit ce n est pas le cas Ce point est important car lors de l ex cution d un mod le ERS toutes les couches sont finalement transform es en grilles avant qu une s rie de calculs de carte ne soit r alis e Etant donn que l analyste spatial ne r alise pas de projection instantan e il est fondamental d avoir le m me syst me de coordonn es pour toutes les couches d entr e afin que les calculs de carte soient r alis s avec succ s 1 3 1 Lancer le module ERS et confiqurer les param tres des couches de donn es et des r sultats Environmental Risk Surface ERS Generator Vous tes maintenant pr t lancer le nputLavers module ERS en cliquant sur le bouton ERS Ki m e de la barre d outils Cela fera appara tre tk ads jo risk_ag_small_scale l interface ERS suivante fisk_ag_sugarcane risk_bausite_ mines risk_urban_ areas a S lectionnez les couches de risque que vous souhaitez inclure dans l analyse ERS en cliquant dessus dans la fen tre d interface de l ERS Dutput Raster Une fois s lectionn es elles Raster Catalog Item e apparaissent surlign es et seront gout Cal Size Overlay Function utilis es dans le mod le Cliquez dessus pour les d s lectionner b Configurez un raster de sortie Il est n cessaire de fournir un
137. s une gestion efficace des fichiers est essentielle pour rester organis tout au long de l analyse Nous vous recommandons que le r pertoire de travail Marxan soit organis avec deux sous r pertoires l un contenant les fichiers d entr e et l autre les fichiers de sortie Trois fichiers doivent tre situ s dans le dossier racine de travail le fichier de param tres d entr e input dat le programme ex cutable Marxan Marxan exe et l ex cutable InEdit Le fichier de param tres d entr e input dat doit galement tre conserv a la m me place que le programme ex cutable Marxan cf Game and Grantham 2008 Avant d aborder l utilisation de l outil pour la pr paration des l ments et la cr ation de ces fichiers l utilisateur doit comprendre l utilit et le contenu de chacun de ces fichiers Voici comment Huggins 2005 les d crit 1 Fichier d l ment de conservation spec dat Ce fichier contient les informations sur chaque objectif et notamment son but et son nom Seuls l identifiant le type et l objectif sont essentiels toutes les autres variables sont facultatives bien que l attribution d un facteur de p nalit d esp ces SPF lev par ex 10 000 contribuera garantir que vos buts seront atteints S il manque une colonne les valeurs par d faut seront utilis es Pour certaines colonnes la valeur 1 indique que la valeur par d faut est utilis e ou que la valeur est donn e dans le fichier de
138. s Personnaliser gt Extensions 4 Assurez vous que vos donn es soient topologiquement correctes en ex cutant la fonction v rification r paration de la g om trie pour chaque donn e d entr e Ces outils peuvent tre trouv s dans ArcToolbox sous Outils de gestion des donn es gt Fonctions gt V rifier et r parer g om trie Si le probl me persiste apr s la r paration de la g om trie le fait de transformer les fichiers de forme en format de couverture puis de les retransformer en fichier de forme permet souvent de r soudre le probleme Les PAT traiteront les cat gories de bases de donn es spatiales et de fichiers de forme Contrairement aux autres modules le module ERS travaille avec des grilles et d autres formats raster pris en charge par ArcGIS 5 Toutes les fonctions d entr e doivent avoir leur projection d finie et elles doivent toutes avoir la m me projection tant donn qu ArcGIS labore les projections au fur et mesure les couches peuvent appara tre dans la m me projection alors qu en r alit ce n est pas le cas Vous pouvez v rifier la configuration des projections en cliquant droit sur la couche de donn es et en Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 The Nature Conservancy d cembre 2011 allant sur Propri t gt Source source de donn es Gardez l esprit que vous ne serez pas en mesure de calculer les zones ou les longueurs correctes s
139. s pouvez configurer cet espace de travail g n ralement C temp PAT_SCRATCH en allant sur Options gt Configuration et en tapant le chemin que vous souhaitez utiliser Assurez vous d avoir un acc s criture ce r pertoire N attribuez aucun fichier de sortie ce r pertoire car les fichiers sont quotidiennement effac s par le programme pour limiter la quantit d espace disque dur utilis par les PAT Utilisez le menu Options pour configurer l emplacement du r pertoire des fichiers d ex cution Marxan Pour plus d information consultez la section des conditions d utilisation n cessaires ci dessus IMPORTANT Pour les utilisateurs des pays hispanophones Des probl mes peuvent survenir si l ordinateur n est pas configur avec les pr f rences num riques nord am ricaines Par exemple on utilise une virgule la place d un point pour s parer les d cimales num riques Les PAT fonctionnent avec l anglais US l espagnol Puerto Rico et l espagnol Mexico mais pas avec l espagnol Cuba Exemple de num ro fonctionnant avec les PAT 123 456 789 00 Exemple de num ro ne fonctionnant PAS avec les PAT 123 456 789 00 Ceci peut tre r solu en reconfigurant les pr f rences de langue dans Panneau de configuration gt Options r gionales et linguistiques Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 6 The Nature Conservancy d cembre 2011 Le processus d valuation des carences
140. s souhaitez planifier et m me dans une certaine mesure de la puissance de votre ordinateur Marxan 2 0 2 et 2 43 peuvent traiter un tres grand nombre de projets Marxan plus de 20 000 unit s de planification et n est r ellement limit que par la m moire disponible La faille des unit s de planification par rapport la fiabilit de la cartographie par ex de grandes unit s de planification peuvent tre n cessaires lorsque l emplacement des objectifs repr senter est impr cis ou lorsque les limites des unit s de planification sont inexactes La capacit des grilles r guli res ou des hexagones montrer des valeurs d unit d aire par crit res tels que la richesse des objectifs non prot g s L galit de taille des unit s de planification sur d importantes zones g ographiques lorsque des facteurs tels que la projection cartographique est probl matique L opportunit de la conversion des unit s de planification en unit s de gestion au sol lorsque l analyse se fait petite chelle La justesse des limites pour la gestion de la conservation lorsque l analyse se fait petite chelle e Planification de la fourchette de co ts de l unit La fourchette des co ts doit permettre d influencer la s lection des unit s de planification Cela doit tre mis en rapport avec le p rim tre de d limitation tant donn que la fonction objectif est une combinaison du p rim tre de d limitation du modificateur de
141. st n cessaire d attribuer une valeur d intensit et une distance d influence chaque l ment de risque Comme l explique la section pr c dente la cr ation d une matrice de risque ERS est utile lors de la comparaison des valeurs d intensit et des distances d influence ainsi que lors du classement de risque potentiel entre l ments de risque L utilisateur a la possibilit d introduire ces valeurs manuellement en utilisant l outil ERS ou en d finissant ces valeurs dans le champ du fichier de forme ou base de donn es spatiales correspondant Pour des ensembles de donn es plus vastes ou plus complexes il est toujours plus facile de d finir des valeurs en utilisant des champs d attribution Les champs intensit et distance d influence doivent tre d finis comme tant de type entier et intitul s de fa on ce que l utilisateur puisse les reconna tre Si l l ment de risque a une d finition de cat gorie list e dans le tableau d attribution il est important d attribuer les valeurs correctes chaque type de cat gorie correspondant La matrice de risque peut vous aider au moment de calculer ces champs Gardez l esprit qu un ensemble de donn es raster sera cr pour chaque combinaison unique de valeurs d intensit et de distance d influence de cat gorie d l ment de risque Si vous observez un grand nombre de cat gories de valeurs d intensit et de distance d influence le calcul peut prendre beaucoup de temps I est rec
142. t la fonction Maximum la valeur maximale de co t par unit de planification Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 64 The Nature Conservancy d cembre 2011 Champ de fourchette de co ts R pertoire de sortie Si vous choisissez l option Champ d unit de planification pour le co t vous devez alors sp cifier le champ co t dans le menu d roulant Indiquez le r pertoire o les fichiers de sortie Marxan seront crits Si vous ex cutez diff rents sc narios il est utile d attribuer des noms descriptifs aux fichiers par ex buts_eleves_pas_enferme_avec_cout Il vaut mieux ne pas utiliser de r pertoire contenant un espace dans son chemin d acc s par ex C Document and Settings User Quand tous les param tres ont t r gl s v rifiez les nouveau et cliquez sur le bouton OK Cela ex cutera le programme et cr era les fichiers texte de sortie spec dat puvspr dat pu dat bound dat le cas ch ant et block dat le cas ch ant dans le r pertoire de sortie indiqu Le traitement peut durer un certain temps en fonction du nombre d unit s de planification des objectifs et des options indiqu es Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 65 The Nature Conservancy d cembre 2011 3 2 4 Combiner les fichiers d entr e Marxan Si n cessaire les outils Marxan offrent la possibilit de combi
143. t a des buts de repr sentation quantitative sp cifiques tout en r duisant les contraintes de risques Etant donn qu il s agit d un processus it ratif l utilisation de Marxan permet la formulation et l exploration d un grand nombre de sc narios de conservation Il existe galement diff rentes mani res de tester et trouver des solutions en utilisant l algorithme heuristique ou recuit En plus de l tablissement de sc narios de conservation il y a plusieurs consid rations propos du projet qui doivent tre tudi es avant de terminer la d finition des objectifs de conservation des unit s de planification des aires prot g es et de l tendue des co ts Id alement ces consid rations doivent tre formul es en consultant les experts en conservation et certaines peuvent tre d termin es en ex cutant des mod les exp rimentaux Voici des suggestions provenant de Huggins 2005 a tendue de l analyse Les zones d int r t devraient tre d finies en fonction de l tendue de tous les objectifs et des donn es socio conomiques qui ont t rassembl es et valu es L tendue doit tre d finie par un polygone pour que tous les l ments qui vont tre utilis s par le mod le soient rattach s l tendue de la zone d analyse b S lection des objectifs Tous les objectifs de r partition qui vont tre saisis dans l analyse doivent tre consid r s comme tant des occurrences viables assez solides pour Ou
144. t de la distance d influence Par exemple le fichier risk_quarries shp contient deux classes Min raux de rivi re et Calcaire Selon les experts l exploitation mini re du calcaire est plus dangereuse pour les syst mes terrestres que l exploitation des min raux de rivi re En cons quence l exploitation du calcaire se voit attribuer une valeur d intensit de 40 par rapport celle des min raux de rivi re fix e 30 De la m me fa on le fichier risk_roads shp dispose de quatre types de classe de routes et des valeurs d intensit correspondantes ont t attribu es selon l opinion des experts concernant le degr de risque potentiel pour les habitats critiques L MENT DE INTENSIT DISTANCE INTENSIT DISTANCE FONCTION FONCTION DE RISQUE CAT GORIE TERRESTRE D INFLUENCE DULCAQUICOLE D INFLUENCE DE SUPERPOSITION TERRESTRE DUL AQUICOLE DIMINUTION risk_ag_small_scale shp 25 3000 risk_bauxite_mines shp 8000 Min raux de Convexe Maximale risk_quarries shp riviere 30 10 1000 PT Po f LT oussses LT onnsse a o Il est important de garder l esprit que lors de l assignation des valeurs d intensit et des distances d influence vous utilisez une chelle relative et non pas une repr sentation de la mesure absolue de l impact des activit s sur la biodiversit Ces valeurs doivent tre interpr t es comme un degr relatif pour lequel la biodiversit a plus de chance de survivre a un endroit
145. tement ou endommager profond ment l environnement en question par exemple les for ts tropicales telles que l Amazonie Mais dans les prairies comme celles du bassin de l Or noque une certaine fr quence et une certaine intensit les incendies sont n cessaires L insuffisance d incendies et l exc s d incendies sont tous deux mauvais pour l cosyst me Il existe un rapport de r action non lin aire entre les prairies et le feu qui doit tre identifi et mod lis TNC 2006 Avant de mod liser un ERS les experts doivent identifier la mani re dont le risque pour chaque l ment diminue avec la distance ou s il existe un facteur de diminution Les PAT fournissent quatre types de diminution exprimant la fonction de l effet d augmentation de la distance Ces mod les de diminution sont a lin aire b concave c convexe et d constant et sont repr sent s dans le sch ma ci dessous La fonction de d faut est un type de diminution lin aire o le taux d intensit de la diminution est constant jusqu ce que la distance maximum soit atteinte et que l intensit s annule Le mod le concave repr sente une diminution initiale rapide de l intensit tandis que le mod le convexe a l effet contraire une diminution d intensit progressive suivie d une diminution rapide mesure que la distance maximale est atteinte Le mod le de diminution constante ne montre pas de changement de la valeur d intensit jusqu ce que la distance maxi
146. tif qui vous aidera a vous souvenir de l ex cution laquelle les fichiers de sortie font r f rence par ex tydixton__execution100 Dans le R pertoire de sortie saisissez le m me chemin d acc s que celui du dossier o se trouvent les fichiers d entr e Il est pr f rable regrouper tous les fichiers associ s la m me ex cution C est le dossier o les fichiers de sortie seront crits par Marxan Cliquez sur le bouton Enregistrer pour enregistrer les informations dans le fichier input dat Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 69 The Nature Conservancy d cembre 2011 6 Cliquez sur l onglet Seuil de co t de l cran Inedit Cet cran doit garder ses valeurs par d faut et la case Seuil activ doit tre d coch e comme indiqu ici 7 Cliquez sur l onglet Divers de l cran Inedit Cet onglet permet l utilisateur d indiquer une proportion de d part pour les unit s de planification inclure dans le portefeuille al atoire de d part Entrez 0 dans cette case et d cochez la case Indiquer origine al atoire Nous n utiliserons pas la R gle d agglom ration ni l option Meilleure note d acc l ration donc vous pouvez les laisser d coch s comme indiqu dans l image Cliquez sur le bouton Enregistrer pour mettre Jour et enregistrer les informations dans le fichier input dat C est le fichier que le fichier Marxan exe lira Sortez du programme
147. tilisateurs de Marxan de t l charger ce manuel sur http www uq edu au marxan index html page 77823 amp p 1 1 4 2 et de l tudier en d tail tant donn qu il facilite grandement la compr hension du logiciel de base au del de ce pourquoi le pr sent tutoriel a t con u Marxan 2 0 2 Marxan Optimised avril 2007 Marxan Optimised n est pas compatible avec les types de fichiers Marxan ant rieurs Les versions Marxan 2 et ult rieures ne sont pas compatibles avec les fichiers de matrice Marxan ant rieurs Vous devez convertir votre Unit de planification vs fichier Fonction de conservation en un format relationnel en utilisant le convertisseur de matrice fourni Les versions Marxan 2 et ult rieures ne sont pas compatibles avec le format tabulaire du fichier de la Fonction conservation Marxan 2 43 et Marxan with Zones 2 01 mai 2011 Cette variante comprend des versions 32 et 64 bits des ex cutables natifs compil s pour Windows Linux et MacOSX Marxan exe Marxan version 2 43 32 bit Windows Marxan_x64 exe Marxan version 2 43 64 bit Windows MarZone exe Marxan with Zones version 2 01 32 bit Windows MarZone_x64 exe Marxan with Zones version 2 01 64 bit Windows Utilisation de Zonae Cogito Si vous utilisez Zonae Cogito 1 74 l ex cutable Windows adapt a votre syst me d exploitation sera automatiquement copi depuis votre dossier de programme Zonae Cogito vers votre dossier de base de donn es Marxan et ex cut lorsque vo
148. tils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 46 The Nature Conservancy d cembre 2011 influencer la s lection du portefeuille La s lection des plans de r partition de la biodiversit doit servir am liorer les probabilit s d inclure uniquement des occurrences viables Parmi les m thodes av r es on trouve notamment la s lection de la v g tation d apr s l avis des experts la suppression de tous les zones en dessous d un certain seuil de taille et la s lection utilisant des facteurs de risques tels que les surfaces de risques environnementaux ERS ou les mod les d accumulation du d bit d eau douce c Stratification des objectifs Les objectifs peuvent tre stratifi s pour permettre une repr sentation de l tendue g ographique ou pour repr senter des sous groupes d objectifs biologiquement diff rents Le portefeuille sera grandement influenc par la mani re dont les objectifs sont d finis Par exemple si le portefeuille doit contenir des zones aussi bien en haute terre qu en basse terre pour un objectif particulier il doit tre d fini de mani re inclure cette information La stratification peut se faire par l vation ou bathym trie g ologie de surface ou par d autres unit s g ographiques qui repr sentent des diff rences significatives d un point de vue biologique d Conception des unit s de planification adapt de Game and Grantham 2008 et Pressey and Logan
149. ts que Marxan utilisera pour produire les fichiers SE RUN CONVERT TO MATRIX FILE d entr e Il n est pas n cessaire d ex cuter cette tape LE RUN INEDIT avec les donn es fournies dans le tutoriel car ces ME RUN MARKAN fichiers d objectif ont d j t pr par s c est dire 1 JOIN AND DISPLAY MARZAN OUTPUT qu ils sont d j t supprim s et que les champs requis ont d j t ajout s et les valeurs correspondantes calcul es Cette tape ne vaut que pour les utilisateurs qui ont besoin de cr er des fichiers Marxan utilisant de nouvelles donn es d objectifs pour lesquelles les champs requis n ont pas encore t ajout s ni les valeurs calcul es gt MARXAN INPUT GENERATOR J ar M Marsan TARGET PREP 0 O 3 0O COMBINE MARXAN INPUT FILES O O O Dans la barre d outils PAT vous trouverez le menu d roulant Outils Marxan L outil de pr paration des objectifs Marxan se trouve en deuxi me position dans le menu Avant de lancer cet outil assurez vous que vos fichier d objectifs de conservation sont d j charg s dans la section de visualisation de la carte Pour avoir une id e de ce que l outil de pr paration des objectifs peut faire vous pouvez charger un des fichiers de formes d chantillon d objectifs dans la section de visualisation target_point_species shp target_line_ habitats shp ou target_polygon_habitats shp Maintenant ouvrez les tableaux d attributs de l un des fichiers de formes d
150. u de zones de conservation Il est souvent recommand que les unit s de planification qui pr sentent aussi bien des notes nRBI lev es ex ayant une abondance d objectifs relativement lev e qu un taux d irrempla abilit Marxan important re oivent une attention prioritaire lors de la mise en s quence des actions de conservation Ce sont des zones potentiellement riches en habitats d cosyst mes rares intacts ou importants pour une mo o raison ou une autre De plus les habitats rares dans les RISQUE RISQUE zones a haut risque peuvent tre d limit s en s lectionnant moms PLUS les zones au dessus de la valeur m diane nRBI et en URGEN URGENT dessous de la valeur m diane de risque ERS Le sch ma d x CTT sata ine sur la page suivante montre un exemple d analyse de RBI et RTAR de risque r cemment r alis e pour les habitats terrestres en Jamaique Une analyse suppl mentaire peut tre r alis e au sein des strates afin d identifier une gamme de zones mieux RISQUE distribu e g ographiquement TNC 2005 IBR Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 33 The Nature Conservancy d cembre 2011 IBR LEV Wir LEVEN RISQUE FAIBLE MOINS URGENT IBR FAIBLE RISQUE IMPORTANT oo RISQUE VE IBR LEV RISQUE RISQUE FAIBLE IMPORTANT PLUS URGENT IBR FAIBLE RISQUE IMPORTANT RISQUE IBR LEV RISQUE I
151. unit de planification a t choisie par rapport au nombre d ex cutions indiqu Par exemple si vous avez saisi 200 ex cutions et que le champ NOMBRE d une unit de planification est 153 cela signifie que l unit de planification a t choisie 153 fois sur 200 ex cutions Le NOMBRE est galement appel niveau d irrempla abilit amp Hexisen Ly MARYAN INPUT GENERATOR o COMBINE MARXAN INPUT FILES CT XE RUN CONVERT TO MATRIX FILE I RUN INEDIT MF RUN MARSAN JOIN AND DISPLAY MARSAN OUTPUT MARXAN OUTPUT JOIN AND DISPLAY Planning Unit tydiston_plarning_units E Planning Unit Field 10 Fr Lorsque vous regroupez le champ d identifiants d unit de planification avec les fichiers de texte MARSAN File D workspace marsan tydiston_ E un nouveau champ est cr dans la cat gorie d unit de planification et les r sultats s affichent MAMAN PU Field planning uni dans la section de visualisation de la carte Les MAXAN Join Field saluion i unit s de planification ayant une valeur de z ro 0 sont exclues de cette classification Vous pouvez Output Field Name solution garder une copie du fichier d unit de planification pour chaque sc nario ex cut par ex Ok Cancel cost_palock cost_nopalock nocost_palock nocost_nopalock Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 72 The Nature Conservancy d cembre 2011 3 5 Aide a
152. ur utiliser les outils Marxan et Marxan avanc s Pour une efficacit optimale de ces outils veuillez installer le dernier pack de services ArcGIS sur www esri com 2 La version 3 3 pour ArcGIS 9 3 1 et ant rieures fonctionnent avec Microsoft NET Framework 2 0 Celui ci est automatiquement install avec le systeme d exploitation Windows 7 Si vous utilisez Windows XP et ne disposez pas de Microsoft NET Framework 2 0 suivez ces instructions a T l chargez Microsoft NET Framework 2 0 sur http www microsoft com downloads details aspx familyid 0856eacb 4362 4b0d 8edd aab 1 5c5e04f5 amp displaylang en b Installez ArcGIS avec NET support cette possibilit appara t uniquement apr s l tape a Si vous avez d j install ArcGIS 10 0 introduisez le DVD d installation dans votre lecteur DVD et rendez vous sur D marrage gt Panneau de configuration gt Ajouter ou supprimer un programme Parcourez la liste jusqu atteindre ArcGIS Desktop et cliquez sur le bouton Modifier Une fois que le Menu de modification appara t cliquez sur Modifier et installez le NET Framework Support Cette option est uniquement disponible une fois install le Microsoft NET Framework 2 0 suite l tape a Une fois que vous avez ajout cette fonction d assistance vous tes pr t a installer les PAT 3 L utilisateur doit disposer de l extension Spatial Analyst et celle ci doit tre activ e V rifiez sa disponibilit et activez la dan
153. us appuyez sur le bouton Ex cuter Zonae Cogito est uniquement compatible avec les syst mes d exploitation Windows La version actuelle de Zonae Cogito est compatible avec les syst mes d exploitation Windows 32 bits et x64 Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 44 The Nature Conservancy d cembre 2011 EXERCISE 3 Execution d un chantillon d analyse Marxan 10 N OUBLIEZ PAS L utilisateur doit avoir install l ArcMap d ArcGIS 10 pour utiliser cette version de PAT 9 0 9 1 9 2 et 9 3 ont leur propre version ant rieure de PAT Assurez vous galement d avoir install la derni re version du pack de service Un Niveau ArcInfo est n cessaire l ex cution des outils Marxan L utilisateur doit disposer de l extension Analyste g ographique qui doit tre activ e Personnaliser gt Extensions L utilisateur doit s assurer que tous les fichiers d entr e ont leur g om trie v rifi e r par e Si des probl mes persistent apr s avoir r par la g om trie la conversion des fichiers de formes en fichiers de couverture puis de nouveau en fichiers de formes permettra souvent de r soudre le probl me Les outils Marxan traitent les bases de donn es g ographiques et les fichiers de formes mais PAS les couches raster Il est vivement recommand d utiliser l outil de pr paration des objectifs car il cr e tous les champs n cessaires utilis s par le G n rateur de
154. us cr erons ce fichier pour que l erreur n apparaisse plus la prochaine fois que vous lancerez Inedit aa Input File Editor for Marxan 5 Probl i i i 1 Le premier cran sert a param trer le Probl me robiem Run Options Annealing Input Output Cost Threshold Misc Les options renvoient au nombre d ex cutions effectuer et au niveau d agglom ration souhait Saisissez 100 ex cutions dans la premi re case Divers r p titions d ex cution 200 ex cutions Miscellaneous Repeat Runs 100 Boundaries sont galement souvent utilis es mais demandent le 3 oundary Modifier 0 double de temps pour s ex cuter 100 ex cutions sont utilis es ici en raison des restrictions de temps Input file type Saisissez 0 dans la case Modificateur de d limitation mousse et comme montr ici Le type de fichiers d entr e utiliser est le Style libre nouveau f New Freeform Style This program edits an input file for MARXAN v1 6 Created by lan Ball 1999 Modified by lan Ball 2007 Save As Exit G workspaceimarx lt antinput dat Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 67 The Nature Conservancy d cembre 2011 2 Cliquez sur l onglet Ex cuter Options se trouvant en deuxi me position dans la partie sup rieure de l cran Inedit Vous devriez voir les options pour le type d algorithme ex cuter par Marxan Cliquez dans les cases Recuit
155. varier en fonction des donn es d entr e utilis es Les deux notes les plus lev es concernent deux esp ces rares de chauve souris dont il existe tr s peu d exemplaires dans le reste du bassin hydrographique De m me vous remarquerez que les for ts alluviales s ches repr sentent un type d habitat tr s rare et n apparaissent qu en tr s faible quantit au sein du bassin hydrographique total de 38 8 hectares Les valeurs RBNTI les plus lev es sont dans les unit s de planification 76 47 et 65 Si vous observez de pr s ces unit s de planification vous remarquerez qu une grande majorit des occurrences de ces habitats se trouvent dans ces unit s Veuillez remarquer que si vous n utilisez Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 The Nature Conservancy d cembre 2011 38 que des cat gories d objectifs sous forme de points vos notes RBI seront beaucoup plus basses tant donn qu il n y a pas de zone calculer pour les points Vous pouvez choisir de symboliser P ayer Properties Phx les valeurs RBI d un objectif EEE ICE Fase Garaion usy Labels Jina k Falate Tina HTML Papap unique en utilisant la classe de Don Ce LUE PU ES LEA ESF aid donn es votre_nom_de TABI TARGET Wet meshira Pornit a AS r sultat RBI ALL TARGETS wer Pour ce faire allez sur la fen tre de mais propri t des couches et srr s lectionnez l onglet Requ te de ES ET ua
156. ve protected area systems A guide to conducting gap assessments of protected area systems for the Convention on Biological Diversity Secretariat of the Convention on Biological Diversity Montreal Technical Series no 24 vi 108 pages Ervin J and J Parrish 2006 Toward a Framework for Conducting Ecoregional Threats Assessments dans Monitoring Science and Technology Symposium Unifying Knowledge for Sustainability in the Western Hemisphere Proceedings C Aguirre Bravo J P Pellicane P D Burns and S Draggan eds Fort Collins CO U S Department of Agriculture Forest Service Rocky Mountain Research Station p 105 112 Ferdana Z 2006 Document personnel Game E T and H S Grantham 2008 2008 Manuel d utilisation Marxan Pour la version 1 8 10 de Marxan Universit du Queensland St Lucia Queensland Australie et Association d analyse et de recherche de la c te du Pacifique Vancouver Colombie Britannique Canada Huggins A 2006 Document personnel Huggins A 2005 Marxan Conservation Planning Decision Support Software Tutorial for GIS Beginners The Nature Conservancy 18 pages Huggins A E S Keel P Kramer F N ez S Schill R Jeo A Chatwin K Thurlow M McPearson M Libby R Tingey M Palmer and R Seybert 2007 Biodiversity Conservation Assessment of the Insular Caribbean Using the Caribbean Decision Support System Rapport technique The Nature Conservancy Pressey
157. xan pour cr er un fichier de d finition de groupe En plus d ajouter les champs de nom et d identifiant d objectif vous pouvez vous assurer que tous les objectifs qui vont tre utilis s par l analyse Marxan ont bien t v rifi s par des experts et stratifi s le cas ch ant Par exemple la stratification est n cessaire si l utilisateur veut attribuer diff rents buts a la m me cat gorie d objectifs qui est r partie sur plusieurs param tres g ographiques par ex limites politiques zones en altitude ou g ologiques Ces objectifs stratifi s doivent avoir un nom unique et un identifiant d finis Les objectifs doivent au moins avoir leur but de conservation d fini Souvenez vous que vous pouvez utiliser soit le champ BUT pour d finir les buts de certaines unit s nombre d occurrences p rim tre ou zone soit le champ PROP pour fixer des proportions pourcentages Si vous utiliser le champ PROP Marxan calculera la quantit correcte d objectif en fonction de la proportion indiqu e en utilisant un fichier de d finition de groupe Si BUT et PROP sont tous deux param tr s la variable PROP aura la priorit et la variable de BUT sera ignor e dans la d finition de groupe Veuillez galement noter que la proportion est bas e sur la quantit totale d finie dans le fichier puvspr dat Avant de continuer avec l tape suivante vous allez galement avoir besoin de vos unit s de planification avec leur identifiant unique de la
158. xit des objectifs polygones plusieurs c t s Une fois le mod le termin une fen tre contextuelle indiquant Processus RBI termin appara tra et les r sultats seront charg s dans la section de visualisation de la carte Outils TNC pour zones prot g es Protected Area Tools PAT Version 4 0 pour ArcGIS 10 36 The Nature Conservancy d cembre 2011 mE EE FES FE CS EES lel eA s PE Fe a 1 E Cu de a ht ENS na a EE nn Les CCE M CO ER PC RCE EE PT j El High RBI Planning Units Low RBI Planning Units 2 2 Interpreter les r sultats RBI Lorsque le processus est termin la cat gorie votre nom_ de r sultat RBI SUMMARY appara tra dans la section de visualisation de la carte du tableau des contenus Le r sultat est organis par couleur et affich sous la forme d un classement intervalles gales utilisant le champ RBINT1 c est dire la somme des valeurs RBI normalis es additionn es au nombre total d objectifs trouv s dans le domaine d univers ou la port e totale de l environnement Dans le cas pr sent il s agit de la fronti re du bassin hydrographique du Tydixton Park Le champ RBNT2 est la somme des valeurs RBI normalis es additionn es au nombre total d objectifs trouv s dans le domaine de recherche ou unit de planification hexagone Comme nous l avons pr c demment expliqu lors de l utilisation d objectifs polygones les scores de somme RBI sup rieurs gt 1
159. zone saisissez la surface souhait e en hectares pour chaque hexagone La valeur par d faut est 100 ha Si vous indiquez le nombre d hexagones saisissez le nombre d hexagones qui vous souhaitez cr er 4 Saisissez un nombre de d part pour les identifiants de vos unit s La valeur par d faut est 1 5 Si vous d cochez Inclure uniquement les hexagones chevauchant la couche le programme retournera l ensemble des unit s de planification contenues entre les coordonn es sup rieures gauches et inf rieures droites de la couche d tendue La plupart des utilisateurs laissent la case coch e car ils ne veulent que les unit s de planification qui chevauchent les l ments de la couche d tendue par ex bassins hydrographiques objectifs 6 Indiquez un intervalle pour le calcul d identifiants uniques L intervalle par d faut est 1 par ex 1 2 3 4 etc Ceci est souvent utile lorsque plus tard vous regroupez les identifiants en utilisant des multiples de dix c est dire en utilisant un intervalle de 10 ou de 100 JOIN AND DISPLAY MARSAM OUTPUT 7 Indiquez un fichier de sortie Ce sera le nom du nouvel hexagone 8 Cliquez sur OK pour ex cuter Extent Laver tudixtor_watershed E fe Specify Hex Area f Specify Number of Henes Le processus peut prendre un certain temps en Area Hectares 100 fonction de la taille et du nombre d hexagones g n r s Start UNIT ID 1 La partie inf rieure gauche indiquera

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