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Rapport de stage 2012

1. Les ronds oranges symbolisent les pi ges plac s en fonction des indices et les ronds verts sont les pi ges plac s uniquement selon les l ments du paysage d apr s la carte IGN Ces derniers sont tr s probablement ceux qui auront le plus besoin d tre d plac s pour trouver leur position optimale 18 Sources Scanzz GIGN rook Reserves Naturelles tatalanes amp AGRXN Illustration 16 carte IGN maillage de 1 km et emplacement initial des pi ges photographiques Le placement des stations de suivi sur MapInfo fournit donc une base th orique permettant d estimer le nombre de pi ges n cessaires Ce travail est compl mentaire du travail de terrain qui permettra de pr ciser l emplacement de chaque station selon les l ments du paysage 19 Discussion A Int r t du pi geage photographique pour les r serves catalanes 1 D tection d esp ces donn es de presence absence Le pi geage photographique est une technique caract re non invasif Elle constitue un apport consid rable aux scientifique des espaces naturels et des sites de recherche Le nombre de publications s accroit de jour en jour et cette technique a m me permis de r v ler l existence d une nouvelle esp ce musaraigne l phant de Tanzanie d apr s Rovero et al 2008 L utilisation de cet outil pour d tecter les esp ces est plut t efficace sur les r serves catalanes puisqu elle a permis entre autre de compl ter la
2. carte de pr sence du chat sauvage dont la pr sence avait pr alablement t confirm e g n tiquement Toutefois les photos seules n auraient pas prouv la pr sence de l esp ce car la morphologie seule ne d finit pas automatiquement l appartenance l esp ce chat sauvage En effet nous avons vu que les hybrides chat sauvage x chat domestique pouvaient tre morphologiquement tr s proches des souches pures En revanche pour les autres esp ces directement identifiables selon leur morphologie cette technique est tr s int ressante puisqu elle permet de fournir des donn es fiables de pr sence Ainsi les esp ces sur lesquelles aucun suivi sp cifique n est men genette isard chevreuil sont observ es Le pi geage photographique fournit donc des donn es permettant de compl ter des cartes de r partition sp cifique C est une technique compl mentaire des analyses g n tiques pour les esp ces qui ont des morphologies proches M me si celles ci ne sont pas utilis es dans l imm diat elles pourraient le devenir si le statut de ces esp ces volue 2 Production de supports pour la communication Les clich s d esp ces discr tes ou rares permettent d aider les quipes des r serves duquer et sensibiliser le grand public et en priorit les habitants des villages alentours Les supports visuels sont g n ralement plus parlants que les preuves g n tiques La communication est fondamentale pour la cr dibi
3. d absence ou si l animal est en dehors de la zone de d tection de l appareil Toutefois le temps de pose minimum de l appareil permettant de valider l absence de l esp ce reste encore d finir Dans les mailles o il y a des indices traces f ces ces derniers doivent tre pris en compte pour la disposition des pi ges En revanche l o aucun indice n est pr sent les pi ges sont plac s al atoirement tout en respectant la topographie du milieu noter que si les stations sont plac es uniquement dans des zones de pr sence connues gr ce aux indices un biais important peut survenir En effet le chat sauvage est une esp ce sociable et certains individus laissent des indices ais ment rep rables alors que d autres se font plus discrets De plus si certaines zones apparaissent a priori comme non fr quent es par l esp ce tr s haute altitude milieux ouverts il faudra tout de m me s assurer que l absence de l esp ce est r elle en pla ant quelques stations toujours pour viter les biais 2 Maillage des stations de suivi Les tables cartographiques du site de Nohedes carte IGN et les limites de la r serve au format tab sont disponibles Il existe aussi un maillage de r f rence de 1 km du Madres Coronat qui sera utilis Illustration 13 12 Illustration 13 carte IGN et maillage de I km de la R serve de Noh des Les zones de pr sence du chat sauvage connues gr
4. possible utilisant un minimum de logiciels et permettant un gain de temps 1 C Estimation de l abondance sp cifique exemple pour le chat sauvage dans la R serve de Noh des 1 tude pr liminaire Le protocole de cette tude pr liminaire a t d velopp en se basant sur les propositions de D Pontier enseignante chercheuse au CNRS de Lyon Le suivi photographique sera mis en place prioritairement pour le chat sauvage Toutefois les autres petits carnivores genette martre et fouine essentiellement peuvent tre int gr s au suivi s il s av re qu ils utilisent des patrons de d placement similaires ceux du chat sauvage Une tude pr liminaire visant d terminer la variabilit du taux de capture en fonction des l ments du paysage est souhaitable Les chats sauvages visitent de fa on non al atoire leurs territoires De ce fait m me si les pi ges sont places r guli rement il y a un risque de faux ze ro l animal passe aux alentours du pi ge mais jamais dans son champ de d tection il est donc consid r tort comme absent Pour cette tude pr liminaire un maillage initial des stations de suivis de 1 km environ est sugg r le territoire vital minimum du chat tant de 1 3 km selon Stahl Les pi ges seront d plac s r guli rement tout en restant dans un p rim tre restreint tant qu aucun animal n aura t captur Cela permet de d terminer s il s agit r ellement de zone
5. 11 2 Cr ation d une base de donn es dir cl ss antenne E bia 11 3 Cr ation d une base de donn es partir des m tadonn es 1 C Estimation de l abondance sp cifique exemple pour le chat sauvage dans la R serve de Noh des 12 Leude me mna Och Sy a D Mn cis hd hash Ses tien oi tt ae 12 DVIQTIACC ACS STATIONS CS SUV EE ea eme nd ed DR ia hee ed et eee A ne tien 12 3 Analyse des donn es la m thode de capture recapture 13 4 Application de la m thode la R serve Naturelle de Noh des ss 14 DESumanon de la denSu SD CiQues san CN A E a Re entend 15 l M thode de capture recapture pour l estimation de densit 15 2 Application la R serve Naturelle de NoOhedes ssisssnisenn tentent 15 EFr ducion d outils de COMMUNICATION trsesisesanmastiacediionds n a aa a NN aa 16 SGT OMACIICIIC OCS CUES th aaa iia lenin TE ne don ad ion 16 2 OS GU OW CN VISA CCADIC xi sisi fa RSR RS rh clea feat aah doo Seana a meek aot mn ee 16 COST LE EEE 17 A Utilisation des m tadonn es pour compl ter la base de donn es Serena 17 B Cr ation d un maillage de 1 kim des stations de suivi 18 DISCUSSION msn eu Gate cae ices tn een idee ent A ne con dti et 20 A Int r t du pi geage photographique pour les r serves catalanes cece eee e ee eeeeeeee ae eeeeeaeeeeesaaes 20 l D tection d esp ces donn es de pr sence absence cece cece eeee eee e tees seek cee eee een EE EEG EAE ee EEE EE ES 20 2 Production de supports pour l
6. 2 photos dont seulement 22 pr sentaient un int r t 2 M thodologie Pour r pondre aux probl matique nonc es les axes suivants ont t d velopp s recherche bibliographique sur l utilisation de pi ges photographiques mise en relation avec des personnes ressources d finition d un protocole et discussion sur les potentialit s et les perspectives offertes par le pi geage photographique gestion des stations de suivi et des photos d j existantes La participation aux missions de suivis hivernaux du loup et du chat sauvage prospections en montagne reconnaissance des traces et indices est faite en compl ment La m thode de capture recapture consiste faire des s ries successives espac es dans le temps de pi geages d animaux Les donn es ainsi obtenues peuvent tre extrapol es pour estimer l abondance ou la densit sp cifique Le terme de capture signifie ici et pour la suite la capture photographique et non capture physique 4 Materiel A Les pi ges photographiques 1 Les d buts de la photographie de la faune sauvage La faune sauvage a commenc tre photographi e a la fin du XIXe si cle par le biologiste George Shiras Illustration 2 Il choisit d utiliser un appareil photographique coupl un flash d clench manuellement Ses photos Midnight Series lui valurent une m daille d or l exposition de Paris de 1900 Certaines d entre elles Illus
7. 3 carte IGN et maillage de 1 km de la R serve de Noh des cc cceeeeeeeeeeeeeeeeeees 13 Illustration 14 photographie d un loup esp ce dont la presence intrigue la population 16 Illustration 15 carte IGN maillage de 1 km et indices de pr sence du Chat cececeeessseeeeeeees 18 Illustration 16 carte IGN maillage de 1 km et emplacement initial des pi ges photographiques 19 Index des figures Figure 1 Localisation des 11 r serves naturelles catalanes l Figure 2 R partition des unit s cologiques modifi depuis le plan de gestion Collectif 2012 2 Figure 3 tapes de la m thode cr e pour trier renommer et stocker les photographies protocole d taille enrAnNExe A junar E a T een ee 17 24 Bibliographie Publications Collectif 2012 Plan de gestion de la R serve Naturelle de Noh des 2012 2016 Farhadinia M S 2007 Ecology and Conservation of the Asiatic Cheetah in Miandasht Wildlife Refuge Iran 65 Germain E 2007 Approche co thologique de l hybridation entre le Chat forestier d Europe et le Chat domestique Universit de Reims Champagne Ardenne Harmsen B J Foster R J and Doncaster C P 2010 Heterogeneous capture rates in low density populations and consequences for capture recapture analysis of camera trap data Population Ecology 53 253 259 Harris G Thompson R Childs J L and Sanders
8. Dans le cadre de l tude f d rale lanc e en 2009 2010 des pi ges photographiques ont t mis en place en collaboration avec F Salgues propri taire du site piegephotographique fr et principal importateur en France Ils sont g n ralement coupl s un piquet de bois rugueux pi ge poils arros de teinture m re de val riane app t olfactif suppos e attirer les chats L ensemble de ces l ments constitue une station de suivi Illustrations 4 et 5 Illustration 4 pose d un pi ge photo Illustration 5 station de suivi station de Font Eyxen Jujols le 13 f vrier 2012 de Montellg nord Noh des Source D Sannier Source O Salvador Le pi geage photographique a permis d obtenir entre autres une dizaine de clich s de chats Toutefois la morphologie ne permet pas elle seule de confirmer l appartenance l esp ce chat sauvage L ger et al op cit les hybrides ou les chats tigr s domestiques pouvant pr senter des motifs de pelage tr s proches des souches pures Illustrations 6 et 7 Illustration 6 chat la morphologie Illustration 7 chat domestique au pelage typiquement sauvage proche de celui du chat sauvage station de suivi de Montell nord Noh des Source personnelle le 3 juillet 2011 Les pi ges sont donc utilis s actuellement dans un but de d tection de la faune Au vu de l int r t de cette technique non invasive les r serves naturelles catalanes ont souhait la d velo
9. MASTER I Sciences Technologies Sant CD Mention Biologie Int gr e Mol cules Uvesti de Peniamina Ta Donii Populations et D veloppement Durable ann e 2011 2012 Rapport de stage Proposition de protocole pour le suivi de la faune sauvage par pi geage photographique sur les r serves naturelles catalanes Nina Merciez wa tuteur Olivier Salvador R serves Naturelles du 30 janvier au 20 avril 2012 R serve Naturelle CATALANES NOHEDES Remerciements Je tiens remercier en premier lieu Alain MaxGror conservateur de la R serve Naturelle de Noh des de m avoir accueilli la maison de la r serve pendant la dur e de mon stage Je remercie naturellement mon tuteur Olivier Satvapor pour tout ce qu il m a appris mais aussi pour la confiance qu il a su m accorder Un grand merci galement Juliette LANGAND et a Maria Martin qui m ont permis de d couvrir la r serve et ainsi de m initier a la connaissance de la faune sauvage Merci aussi Andr Pitter et Mathias Toster qui m ont orient pour le d veloppement de la m thode de stockage Je remercie galement Claire Lucile et David stagiaires a la r serve chacun pour leur sp cialit s culinaires leur bonne humeur et leurs relectures Enfin une pens e pour Philippe Magalie et mes parents pour leur soutien et leurs ravitaillements tant appr ci s Table des mati res OO 00 M a da N l A Pr sentation d
10. a communication sienne en near chica Meet st aies 20 3 Estimation d abondance SPECI IU SES telat ive AM Dies us ea clin oleae ei A ll en 21 Bi Application deta technique dans leS reSel Veste Re ei M ne 21 LAVES SS EIET RSS ent e tte ea an D a 21 A ROLE deS PI DCS Cl COUT CLONS ru ie deu Se Su etd en tte Dire ici a als 22 3 Gesuon des donnees et coul en OMS en cecal i tc MR der tete rte MTS ent et NA tien es 22 CF CVS POCIIVES ren essaient als Re MR ee A NC 23 SPIES Cl ADO va TONS 2 ni eine ee a dt D Uni eme 24 Index des illustrations hac oa raha ge en A dr necessite sr oe ent 24 Index des ON ES incon E O 24 BiDHOSTAD NIE raen Pe eC E E E 25 Introduction A Pr sentation de la R serve Naturelle de Nohedes 1 Historique et localisation Les montagnes des Pyr n es Orientales sont reconnues depuis longtemps pour leur patrimoine exceptionnel C est l association Charles Flahault qui y initie un projet de Parc National dans les ann es soixante Toutefois les lus s opposent a ce projet Une vingtaine d ann es plus tard cette m me association propose un projet de r serves naturelles commune par commune Apr s l accord de certains des lus concern s des enqu tes publiques sont men es et les r serves naturelles de Py et Mantet voient le jour en 1984 Suivent ensuite celles de Prats de Mollo Conat Jujols et Noh des le 23 octobre 1986 et enfin Eyne en 1993 En 2002 la RN de Noh des est class e R serve Naturelle Nationa
11. a population nuit du 11 janvier 2012 pi ge photographique de la R serve Naturelle de Mantet Le pi geage photographique est utilis depuis plusieurs ann es par l Equipe Technique Ours de l ONCEFS et le R seau Ours Brun pour le suivi annuel de l esp ce F Decaluwe comm pers 16 Resultats A Utilisation des m tadonn es pour compl ter la base de donn es Serena Les photos d j obtenues ont pu tre utilis es pour d velopper la m thode de r f rencement Le logiciel ExifTool Harvey 2012 et sa version graphique ExifToolGUI a t choisi car 1l est libre tr s complet et qu il existe un forum d aide d di La version graphique est utilis e par l utilisateur pour faguer manuellement les photos avec entre autres l esp ce le site le nom du suivi et son responsable Une commande sp cifique lancer via ExifTool a t crite pour renommer les photos sous la forme date esp ce jpg trier toutes les photos dans un sous dossier nomm selon le nom du site classer les sous dossiers des sites dans des dossiers au nom du suivi extraire les m tadonn es des photos sous forme tabul e L utilisateur doit simplement lancer cette commande pour que les actions s effectuent sur les photos fagu es L automatisation du tri et de la d nomination des fichiers permet d obtenir un r f rencement rapide et standardis des photos Les donn es extraites sous forme tabul e sont adapt es autom
12. ables 2 cartes m moire de 2 Go et un caisson antivol anti chocs est de 522 euros ttc Production de donn es pour la veille cologique et de supports de communication Il est vident que plus le nombre de pi ges sera important plus le nombre de donn es g n r es sera grand En revanche l exploitation de ce type de donn es ne n cessite pas d avoir des stations de suivi dispos es de fa on relationnelle chaque pi ge est donc ind pendant Le co t de l appareil n est donc pas limitant car on peut par exemple imaginer que les r serves ach tent un ou deux pi ges par ann e en fonction du budget qui leur est consacr e L obtention de supports de communication d pend de la qualit des photos et de leur int r t Il faut donc veiller utiliser des appareils qui fournissent des photos de bonne r solution Estimation d abondance ou de densit du chat sauvage L estimation de l abondance d pend en grande partie du nombre de donn es obtenues et donc surtout du nombre de pi ges Ce nombre doit tre suffisamment lev pour que les donn es puissent tre exploit es Il faut aussi que l individualisation soit possible et donc que la r solution soit suffisamment bonne et que les photos de nuit soient en couleur Sur la base de la m thode propos e le nombre de pi ges minimum n cessaire initialement serait de 22 appareils Le seul co t mat riel s l verait donc 11484 euros Cette som
13. at sauvage Felis silvestris silvestris Schreber 1777 est une sous esp ce distincte du chat domestique Felis silvestris catus et du chat haret F s catus retourn a l tat sauvage Son pelage varie du gris au fauve clair avec des rayures lat rales noires peu marqu es Sa queue annel e 2 a 5 anneaux se termine par un manchon noir Il poss de aussi une bande noire dorsale l ar te spinale Illustration 1 C est un animal tr s Illustration I caract ristiques du pelage du chat sauvage et du chat domestique tigre B discret difficile observer dans la nature 8e 4 q gre B Son activit est principalement cr pusculaire extrait de Leger et al 2008 L hybridation entre ces trois taxons est tout fait possible et la descendance est fertile Germain 2007 De ce fait les indices de pr sence trouv s de fa on opportuniste ne peuvent pas tre attribu s de fa on certaine au taxon chat sauvage s ils n ont pas fait l objet d analyses g n tiques Une tude f d rale est men e depuis 2009 pour pr ciser le statut de ce f lin au sein des r serves catalanes Des itin raires sp cifiques sont pratiqu s afin de rechercher plus efficacement les indices de 3 passage Les analyses des f ces retrouv es ont t faites par le laboratoire Antagene en partenariat avec le CNRS de Lyon La pr sence de l esp ce a t confirm e par la comparaison des profils microsat
14. atiquement tableur mod le au format de Serena et peuvent tre import es dans la base de donn es g n rale Figure 3 Commande generale bat Cr er les champs non existants relev source Importer les m tadonn es partir de Extraction txt Rendre les valeurs du Tagger les photos ssimuler l importation des sRenomnrer les z donnees wae tableau compatibles Corriger les erreurs ventuelles dr ris Importer les donn es Exporter les m tadonn es Figure 3 tapes de la m thode cr e pour trier renommer et stocker les photographies protocole d taill en Annexe Cette m thode a t test e et valid e sur plusieurs centaines de photos Les logiciels sont plac s sur le r seau de la F d ration pour que chaque personnel concern puisse y acc der 17 B Cr ation d un maillage de 1 km des stations de suivi Les indications d j r pertori es dans Serena ont t extraites vers une table MapInfo Illustration 15 Les indices sont repr sent s par des triangles jaunes et sont pr cis ment g olocalis s Pin des Gourgs 2851 24624 A X y K ei F 4 R D jections crottes Individu vu Illustration 15 carte IGN maillage de I km et indices de pr sence du chat f ces traces observations Les pi ges ont ensuite t plac s selon la m thode propos e Illustration 16
15. ce aux feces aux traces ou aux photographies d ja relev es sont enregistr es dans Serena Etant donn que tous ces indices sont g olocalis s il est possible de faire un extrait et cr er une nouvelle table MapInfo C Hurson comm pers Une station de suivi est plac e par maille Si des indices de pr sence ont t localis s dans la maille alors la station est plac e en fonction de ces derniers En revanche si aucun indice n est connu alors la station est dispos e de fa on al atoire tout en vitant les abords de la route et ventuellement en s approchant des cours d eau D Pontier comm pers 3 Analyse des donn es la m thode de capture recapture Les pi ges photographiques sont tr s souvent utilis s pour estimer l abondance d esp ces rares et discr tes De ce fait ce type d tude est tr s focalis e sur le sous ordre des f liformes Sarmento et al 2009 pour la genette et sp cialement sur la famille des f lid s f lins On peut notamment citer Karanth 1995 puis Karanth et Nichols 1998 pour le jaguar Jackson et al 2005 pour le l opard des neiges Zimmermann et al 2007 pour le lynx suisse et tr s r cemment Kilshaw et Macdonald op cit pour le chat sauvage d cosse Ces tudes utilisent la m thode de capture recapture cr e au d part pour les populations trop importantes o le d nombrement de tous les individus tait impossible insectes poissons oiseaux 13 et petits ma
16. d h t rog n it prend en compte les diff rences de probabilit s de capture d un individu l autre Mi mod le de variation temporelle estime que la probabilit de capture varie avec le temps uniquement M mod le de r ponse consid re que les individus d j captures ont une probabilit de capture diff rente de ceux Jamais captur s Me Mi Mhn et Min combinaisons des mod les pr c dents Les donn es sont analys es par le programme CAPTURE White et al 1978 pour d terminer lequel correspond le mieux un score de 0 1 est donne chacun des mod les L estimateur correspondant au mod le avec le meilleur score est utilis pour r chantillonner les donn es Cela permet d obtenir une estimation de l abondance avec un intervalle de confiance pour la population tudi e Malheureusement n1 le mode d emploi du programme n1 aucune des publications l utilisant ne d taille le fonctionnement de ce logiciel Ainsi il est pour le moment impossible d attester de sa fiabilit 4 Application de la m thode la R serve Naturelle de Noh des La m thode de capture recapture est bas e sur l individualisation des animaux Pour le chat sauvage cela est possible en se basant sur les motifs du pelage Kilshaw et Macdonald op cit si les photos sont d assez bonne qualit Toutefois certaines photos ne permettent pas l identification 14 et ne peuvent donc pas tre directement int gr es a l e
17. disposer en maillage mais toujours en prenant compte des indices de pr sence Cette r gularit permettrait de couvrir un maximum de territoires vitaux 10 B Productions de donn es pour la veille cologique 1 Stockage des observations au sein des r serves catalanes Le r seau RNF R serves Naturelles de France a cr e l outil Serena Systeme de gestion et d Echange des R seaux d Espaces Naturels une base de donn es naturalistes Elle permet de g rer et d changer des donn es d observations L ensemble des r serves naturelles catalanes fonctionne avec ce logiciel Aussi nous avons consid r que les pi ges photographiques apportent des donn es fiables pouvant tre enregistr es au sein de cette base Nous avons donc cherch comment faire pour que ces donn es puissent tre int gr es Serena 2 Cr ation d une base de donn es directe Plusieurs bio informaticiens se sont r cemment pench s sur les probl mes de traitements et de stockage des photos On peut notamment citer le programme libre CameraBasel 4 Tobler 2010 r guli rement mis jour Il s agit d une base de donn es Access o les photos peuvent tre enregistr es rapidement L utilisateur a simplement pr ciser l esp ce observ e et les informations sur le suivi Des analyses de fr quence de capture ou des historiques de vie peuvent ensuite tre g n r s automatiquement Bien que ce programme apparaisse comme tr s prometteur 1l n est pa
18. e la R serve Naturelle de Noh des sen l VINSON CLI OCAIS OUI ON r EEEE TE ATE E O O a O E OA E E A EN l UAI ONIRE E AET OOIE E E E E ENEE E TE AA A AE EE EEE A E EE 2 ED ACS OTIS E REEE AIE T dan On eo die ET I A EET A A EOE N 2 A Diversit DIOLOSIGUC ACS VEC DTE S aac SRE NN ER Rene RS AR ee a 3 BLObD CH SSI Cee isc ts pate ele ee ci Dette teed Re edad 4 POUSER dde N ete ee te er D PO en 4 MOOD ed nr lies de LUE CARRE LR E lee re ei 4 Materiel caine co ea aiden ca A E eee ice becca ice nds ea ie OTA 5 ALES pieces PNOLO SF ADINIG UES sr renier terme nl 5 l Les d buts de la photographie de la faune sauvage tees eee e cee eee seeneaaeaaaeeeeeeeeeeeeaas 5 2 Notori t grandissante des pi ges photographiques 5 KDVO deS ADDOVCUS RSR ERT RSR RE ne Sn Sn A N nn 6 B Les pi ges photographiques dans les r serves catalanes cece cece eee ee ee eee cece cee ceee eee aae eee eeeaaeeeeeas 6 LD 2009 AMONT UN sacs alle ata ER Nae oe ibaa a Is me eS gee a aetna a teen a aes 6 2 MOUCLES APATE S AR Rss ete ia PO ere ne Deere nr dise te Le 8 Proposition GE m thode anus a en tt ti anis a mia n 10 ALG DOSE ACS pieces photographies RE nee dental 10 I OU OCCO aps SES SEE Cr RSS Pen MN A er a 10 2 Cuhsanondeleurres on Tappal ss ia een ane nn manette andre 10 PVE DUOC RE tah weal nec a aa cote hl atl ttes 10 B Productions de donn es pour la veille cologique 11 1 Stockage des observations au sein des r serves catalanes
19. ellites B Objectifs du stage L objectif global du stage est de proposer un protocole de pi geage photographique adapt aux r serves naturelles catalanes 1 Probl matiques La principale probl matique est de d finir quelles sont les utilisations potentielles des pi ges photographiques En effet leur premier int r t est la collecte des donn es de pr sence ce qui permet de construire des cartes de r partition En outre le pi geage photographique peut aussi fournir des donn es de type capture recapture De ce fait les donn es pourraient ventuellement servir faire des estimations d abondance et de densit L ensemble des photos obtenues peuvent aussi participer la veille cologique ou aider l aspect communication de la r serve De tous ces aspects 1l s agit de d terminer lesquels sont envisageables dans les r serves catalanes et de quelle fa on les mettre en place Cela engendre in vitablement des probl matiques secondaires savoir comment trier classer stocker et traiter la grande quantit de photos En effet un seul pi ge peut produire des centaines de captures en quelques semaines dont la plupart ne pr sentent pas d int r t ex photos prises lors de la pose de l appareil ne sont pas exploitables ex esp ce non identifiable ou portent atteinte au droit l image ex randonneurs A titre d exemple un appareil mis en place du 3 au 15 novembre 2011 sur le lieu dit Coma Del Mallet a fourni 17
20. es ONCES Office National de la Chasse et de la Faune Sauvage ONF Office National des For ts RN R serve Naturelle RNF r seau des R serves Naturelles de France Serena Syst me de gestion et d Echange des R seaux d Espaces Naturels UMR Unit Mixte de Recherche Index des illustrations Illustration 1 caract ristiques du pelage du chat sauvage A et du chat domestique tigr B 3 Illustration 2 G Shiras utilisant son appareil photo et un flash sur une embarcation 0066 5 Illustration 3 clich de G Shiras parmi les plus connus une biche et ses deux faons 00668 5 Ilustrators POSS UI DISC pho O gsi are teeters oa ech esp e es Gade ventas wpa ey E 4 Illustration 5 station de suivi de Montella nord Noh des T Illustration 6 chat la morphologie typiquement sauvage 7 Illustration 7 chat domestique au pelage proche de celui du chat sauvage 7 Illustration 8 mod le Reconyx Hyperfire flash infrarouge 8 Illustration 9 mod le Cuddeback Attack a flash incandescent A 8 Illustration 10 martre ou fouine photographi e avec un flash infrarouge 9 Illustration 11 fouine photographi e avec un flash incandescent 9 Illustration 12 Exemple d une photo prise apr s le passage de l animal 9 Illustration 1
21. i oncfs gouv fr Pontier Dominique Enseignante chercheuse l UMR 5558 cologie volutive des populations Lyon 69 dominique pontier univ lyonl fr 04 72 43 13 37 Tobler Mathias Chercheur en cologie et cr ateur de CameraBase au Botanical Research Institute of Texas matobler brit org 25 Resume Le pi geage photographique est de plus en plus utilis mondialement par les scientifiques des espaces naturels Les r serves naturelles catalanes Pyr n es Orientales ont choisi de utiliser depuis 2009 Technique non invasive elle permet de fournir des preuves de la pr sence d animaux souvent discrets sans les perturber Ce type de pi geage a d abord et mis en place pour pr ciser le statut du chat sauvage Felis silvestris silvestris sous esp ce distincte de celle du chat domestique Les r serves ont ensuite souhait poursuivre son usage et viser des objectifs plus larges Ainsi ce stage a permis de d finir un outil pour stocker et trier la grande quantit de photographies g n r es par cette technique Un protocole a ensuite t amen pour compl ter la veille cologique apporter des supports de communication et tenter d estimer l abondance sp cifique Pour cela le chat sauvage sur la R serve Naturelle de Noh des a t pris pour exemple Mots cl s pi ges photographiques chat sauvage r serve naturelle Noh des Jujols Abstract Camera trapping scientific 1s becoming more and more widespread in nat
22. la charte graphique depuis 2008 Les missions de police et de surveillance ainsi que la gestion financi re sont mutualis es Un service de soutien technique est galement apport pour les op rations de cartographie Le regroupement des r serves en f d ration a donc permis une meilleure coh rence scientifique mais aussi le renforcement de leur image aupr s du public En outre la pr servation des organismes locaux gestionnaires des r serves comme l AGRNN est primordiale car 1ls permettent de prendre en compte la diversit des contextes sociaux conomiques et cologiques Les gestions f d rale et locale sont compl mentaires 3 Diversit des habitats La r serve comprend 3 tages distincts de v g tation tage supra m diterran en ch ne pubescent ch nes acidiphiles tage montagnard pin sylvestre sapin h tre tage subalpin pin crochets rhododendron Ces milieux peuvent tre exprim s en unit s cologiques selon la figure suivante Figure 2 Pelouses subalpines s 7 Eboulis g w O e Falaises continentales et rochers exposes 4 Landes et frutic For ts de Pins crochets 26 ruticees scl rop 1 Forets d cidues de feuillus 18 For ts de Fins sylvestre 18 Figure 2 R partition des unit s cologiques modifi depuis le plan de gestion Collectif 2012 4 Diversit biologique des vert br s Ensemble des vert br s Parmi
23. la faune la r serve compte 44 esp ces de mammif res 18 chiropt res 8 carnivores dont le chat sauvage Felis s silvestris le loup Canis l italicus et la genette Genetta genetta 7 rongeurs 5 insectivores 5 artiodactyles et 1 lagomorphe Le lynx et l ours font partie des esp ces dites douteuses Pour le lynx chaque ann e des t moignages cr dibles parviennent provenant de chasseurs accompagnateurs de montagne leveurs p cheurs et naturalistes Les restes osseux retrouv s dans les grottes pyr n ennes permettent de dire que l animal f t pr sent mais depuis 1917 o deux lynx furent abattus sur le Canigou aucun indice de pr sence n a t certifi Pour l ours le r seau Ours brun estime apr s v rification que 80 des t moignages sont faux Toutefois un ours a t observ en 1999 en limite nord du massif du Madres puis deux autres sur le massif du Carlit En 2005 deux ours ont fr quent la Haute Ari ge le plateau de Sault et une partie du massif du Carlit mais aucune observation n a t faite sur la commune de Noh des L avifaune est compos e de 117 esp ces 142 pour toute la commune parmi lesquelles des rapaces et des galliformes patrimoniaux dont le grand t tras La r serve est galement riche en reptiles une quinzaine d esp ces En revanche on ne compte que deux esp ces de poissons et quatre d amphibiens Cas sp cifique du chat sauvage Le ch
24. le et le Parc Naturel R gional des Pyr n es Catalanes est cr e en 2004 La cr ation de la R serve Naturelle de Noh des en 1986 a permis de contrer la cr ation d une route reliant Noh des au Capcir ainsi que la mise en place d un lotissement touristique Montilla 1700 pr vu autour de Estany del Clot 1700m La r serve se trouve sur le massif du Madres Coronat tout comme les r serves de Jujols et Conat Figure 1 Son p rim tre comprend 2 137 ha situ s de 750 2 459 m d altitude vrs tat Ferpignan l erpignan P A ee See gt 4 4 N1 14 N Ari ge r PLAINE DU ROUSSILLON why UN Ce ret con A a N XN ah PP r me S gt For t e Ne os Prats d Mollo Bs tg ee Fa de la Massane i amp tn Figure 1 Localisation des 11 r serves naturelles catalanes 2 Gestion Localement l organisme de gestion est Association Gestionnaire de la R serve Naturelle de Noh des AGRNN dont le conseil d administration est compos de 5 lus municipaux et 6 associ s L int gration au sein de la Conf d ration puis F d ration des R serves Naturelles Catalanes FRNC ex CRNC a lieu en 1991 Cette derni re est dor navant co gestionnaire de la reserve La FRNC est maintenant incontournable pour la plupart des activit s d velopp es elle a d fini un sch ma de coordination scientifique g re le sch ma f d ral de communication et fait appliquer
25. lit et l acceptation sociale des r serves en cr ant un lien entre leurs activit s et les habitants Les photos de chat sauvage ont fait conna tre l esp ce certains et ont pr cis son statut d autres La production de support de communication est donc un atout important apport par le pi geage photographique Les photos sont donc pour l instant utilis es sans restriction mais une nouvelle probl matique concernant leur diffusion pourrait appara tre si des esp ces pol miques ours lynx taient photographi es 20 3 Estimation d abondance sp cifique L estimation de l abondance reste pour l instant th orique Pour que des r sultats puissent tre obtenus 1l faudrait des donn es suffisamment nombreuses et donc une probabilit de d tection correcte Cet aspect est le principal probl me qui pourrait s opposer la concr tisation du projet Ce type d tude ne peut pas tre lanc si la probabilit de r ussite obtention de r sultats int ressants est faible En effet le co t de l investissement financier et de la main d ceuvre est tr s important et ne peut tre justifi que si les r sultats sont pertinents B Application de la technique dans les r serves 1 Investissement Le co t d un appareil est estim en se basant sur le mod le Aftack de la marque Cuddeback Son co t actuel en comptant en plus 1 cadenas haute s curit 1 c ble autobloquant 2 lots de piles recharge
26. me semble relativement lev e mais pourrait cependant tre d bloqu e si par exemple il existait un plan d action pour le chat sauvage et ou s il s agissait d un travail enti rement d di tel qu un sujet de th se Toutefois la r ussite du projet reste incertaine car 1l est probable que le nombre de photos soit insuffisant et ou que l individualisation s av re d licate De plus le projet devrait obligatoirement rester corr l des analyses g n tiques Pour information le g notypage des microsatellites sur la base d un profil de 6 micro satellites est estim 2300 euros pour 50 chantillons ce qui peut tre atteint en plusieurs mois 21 en supposant une tude sp cifique Le budget salarial pour une tude sp cifique men e par exemple sur 6 mois serait au minimum de 2620 euros s il s agit d un stagiaire 2 Relev s des pi ges et co t en temps Production de donn es pour la veille cologique et de supports de communication Le co t en temps pour obtenir des donn es de d tection est variable puisqu il n y a pas de nombre de pi ges minimum requis Toutefois le moment de la pose des appareils et leurs relev s peuvent tre coupl s avec d autres sorties de terrain limitant ainsi le temps d di ces stations de suivi Ces stations n ont pas besoin d tre relev es r guli rement puisque la veille cologique s effectue en continu et que les informations n ont pa
27. mmif res Pour le pi geage photographique cela consiste photographier un individu une premi re fois l individualiser puis le re photographier au cours du temps L individualisation se fait gr ce aux motifs du pelage propres l individu L usage de cette m thode impose que la population soit close g ographiquement pas d immigration ou d migration dans la zone d tude et d mographiquement pas de naissance n1 de d c s Cette condition est g n ralement contourn e par le fait que l tude n est men e que durant quelques semaines Il faut aussi que chaque individu ait une probabilit non nulle d tre captur ce qui est th oriquement le cas si les pi ges sont dispos s selon un maillage couvrant tous les territoires vitaux Dans ces tudes les donn es obtenues par les pi ges sont traduites sous forme binaire 0 pour absence 1 pour capture cr ant ainsi un historique de vie de chaque animal Cela permet d indiquer quels individus ont t captur s durant chaque v nement ou occasion de capture Un v nement de capture se caract rise par la dur e durant laquelle un individu au minimum est captur Pour les f lins il s agit donc g n ralement de un plusieurs jours Il existe sept mod les diff rents pour traiter les donn es de capture recapture M mod le de r f rence consid re que la probabilit de capture est gale pour tous les individus et constante au cours du temps M mod le
28. nchocyon highlights the exceptional biodiversity of the Udzungwa Mountains of Tanzania Journal of Zoology 274 126 133 Sarmento P B Cruz J P Eira C I and Fonseca C 2009 Habitat selection and abundance of common genets Genetta genetta using camera capture mark recapture data European Journal of Wildlife Research 56 59 66 Stahl P Artois M and Aubert M F A 1988 Organisation spatiale et d placements des chats forestiers adultes en Lorraine Revus d Ecologie Terre amp Vie 113 132 Sundaresan S R Riginos C and Abelson E S 2011 Management and Analysis of Camera Trap Data Alternative Approaches Response to Harris et al 2010 Bulletin of the Ecological Society of America 92 188 195 Tobler M 2010 User Guide for Camera Base 1 4 White G C Burnham K P Otis D L and Anderson D R 1978 User s manual for program Capture Zimmermann F Fatterbert J Breitenmoser Wursten C and Breitenmoser U 2007 Abondance et densite du lynx estimation par capture recapture photographique dans le Nord du Jura suisse Kora Communications personnelles Decaluwe Fr deric Equipe Ours de l ONCFS CNERA PAD frederic decaluwe oncfs gouv fr 05 62 00 81 09 Hurson Christophe SIGiste a la F d ration des R serves Naturelles Catalanes Longis Sandrine Statisticienne a Anastats Loubaut 09 sandrine_longis yahoo fr Menoni Emmanuel Sp cialiste du grand t tras l ONCFS emmanuel menon
29. on J G 2010 Automatic storage and analysis of camera trap data Bulletin of the Ecological Society of America 97 352 360 Harvey P 2012 ExifTool 8 85 Jackson R M Roe J D Wangchuk R and O Hunter D 2005 Surveying Snow Leopard populations with emphasis on camera trapping a handbook The Snow Leopard Conservacy Sonome California 73 Karanth K U 1995 Estimating tiger Panthera tigris populations from camera trap data using capture recapture models Biological Conservation 7 333 338 Karanth K U and Nichols J D 1998 Estimation of tiger densities in India using photographic captures and recaptures Ecology 79 2852 2862 Kilshaw K and Macdonald D W 2011 The use of camera trapping as a method to survey for the Scottish wildcat Scottish Natural Heritage Kraft S 2008 Relev de pr sence du Felis s silvestris dans le Kaiserstuhl et les for ts rh nanes limitrophes l aide de pi ges poils AgroParisTech Engref L ger F Stahl P Ruette S and Wilhelm J L 2008 La r partition du chat forestier en France volutions r centes Faune Sauvage 280 24 39 Marker L L Fabiano E and Nghikembua M 2008 The Use of Remote Camera Traps to Estimate Density of Free ranging Cheetahs in North Central Namibia Cat News 49 23 Rovero F Rathbun G B Perkin A Jones T Ribble D O Leonard C and Doggart N 2008 A new species of giant sengi or elephant shrew genus Rhy
30. ong Le temps estim pour la gestion des donn es de veille cologique est donc proportionnel au nombre de pi ges pos s En revanche les photos retenues pour la communication sont directement rep r es lors du tri pour la veille cologique En outre aucun temps suppl mentaire n est requis moins que les photos n cessitent d tre retouch es Estimation d abondance ou de densit du chat sauvage Les photos concern es par l estimation d abondance sont uniquement celles o le chat sauvage appara t Aussi elles peuvent tre facilement extraites partir des donn es de veille cologique produites pr c demment Aucun temps suppl mentaire n est donc compt pour le tri des photos Cependant l exploitation des photos risque en elle m me d tre chronophage puisque les animaux doivent pr alablement tre individualis s un par un tant qu aucun logiciel de reconnaissance n est sp cifiquement d velopp Cette t che est fastidieuse et doit de pr f rence tre effectu e par 2 agents pour attester les r sultats Les estimations doivent ensuite se faire selon des tests statistiques Ces derniers ne sont pas forc ment intuitifs mais 1l est possible que ce travail puisse tre r alis avec l aide du CNRS pour plus d efficacit Toutefois si les estimations d abondance ou de densit arrivent conclure sur des r sultats pertinents alors le temps pass aura t productif Il serai
31. outils de communication 1 Utilisation actuelle des clich s Le suivi d but depuis 2009 a d ores et d j permis de sensibiliser le public local la pr sence du chat sauvage dans la r serve Fin 2011 puis en f vrier 2012 des soir es chat l heureuses ont t organis es a Noh des 60 hab puis a Jujols 40 hab Le statut de l esp ce et les tudes en cours ont pu tre pr sent s a la population locale avec l appui des premi res photos obtenues Ces r unions ont connu un succes remarquable par la pr sence d une grande partie des villageois 2 Utilisation envisageable Les t moignages de la population locale nous encouragent r ellement poursuivre ce type de r unions Il est primordial pour la r serve et la population d entretenir un lien troit Aussi les missions d informations doivent tre maintenues voire se renforcer Les missions d informations sur le chat sauvage peuvent continuer ainsi Le pi geage photographique pourrait galement permettre de communiquer sur d autres esp ces pour peu que les photos obtenues soit de qualit suffisante Ce concept a d j t utilis en cosse E Menoni comm pers pour le grand t tras photographi sur les places de chants Le loup Illustration 14 l ours ou le desman des Pyr n es pourraient ainsi tre d mystifi s aupr s de la population pyr n enne Illustration 14 photographie d un loup esp ce dont la pr sence intrigue l
32. p cit pour le chat sauvage Tous ces auteurs ont utilis le programme CAPTURE pour l estimation de densit Des historiques de vie pr cisant en plus les coordonn es g ographiques des pi ges sont cr s puis analys s Toutefois 1l est consid r que les animaux d tect s aux stations situ es aux fronti res de la zone ont une zone d activit sortant de la zone d tude Pour palier ce biais une zone tampon W est ajout e correspondant la moiti de la moyenne de la distance maximum parcourue par les animaux d apr s Karanth et Nichols op cit La densit de la population est donc estim e pour la zone d tude comprenant les pi ges plus la zone tampon A W La taille de la population N est d abord valu e cf chapitre C 3 puis la densit D est calcul e selon la formule D N A W 2 Application la R serve Naturelle de Noh des Pour que cette m thode puisse tre appliqu e la r serve il faudrait d une part qu elle soit valid e par une entit scientifique et d autre part que la population soit suffisamment grande A noter aussi que l estimation de la densit de population de chats peut n avoir que peu de sens En effet les chats sont des animaux territoriaux et leurs espaces vitaux sont tr s variables suivant le 15 sexe et la p riode aussi ils ne se r partissent pas uniform ment Se restreindre l estimation de l abondance para t donc plus pertinent E Production d
33. pper et l utiliser des fins plus sp cifiques 2 Mod les d appareils Les premi res donn es de pi geage photographique ont permis de tester diff rents mod les de pi ges Cela a permis d optimiser le choix des appareils les plus appropri s pour la suite des tudes Le choix se fait sur plusieurs crit res tant donn que dans notre cas les stations de suivi sont plac es g n ralement plusieurs heures de marche 1l faut que les batteries aient une longue dur e de vie et qu une carte m moire de capacit correcte plusieurs Gb puisse tre utilis e Il existe 2 types de flashs infrarouges Illustration 8 ou incandescent Illustration 9 Le flash incandescent ayant besoin d un laps de temps de recharge les d clenchements ne peuvent pas tre encha n s Cependant les photos de nuit obtenues par ce flash sont plus int ressantes car elles sont en couleur et de meilleure qualit Ce crit re facilite l identification de l esp ce Illustrations 10 et 11 et ventuellement l individualisation des animaux Toutefois la lumi re incandescente est connue pour surprendre ou effrayer les animaux Farhadinia 2007 mais ce ph nom ne n a jamais t observ durant le d but de l tude f d rale les animaux photographi s ne semblent pas perturb s par la lumi re Illustration 8 mod le Reconyx Illustration 9 mod le Cuddeback Hyperfire flash infrarouge Attack flash incandescent source piegepho
34. rche scientifique utilisant cette technique Les amateurs et certains scientifiques changent aussi leurs exp riences au sein de blogs tels que CameraTrapCodger ou NatureOfA Man tous deux tr s documentes L ensemble de ces sites est tr s actif montrant ainsi la notori t grandissante des pi ges photographiques Le BBC Wildlife Magazine va m me jusqu proposer un concours Camera trap Photo of the Year permettant de financer des projets 3 Diversit des appareils Il existe de nombreuses marques et des centaines de mod les d appareils disponibles sur le marche Les principales caract ristiques sont la vitesse de d clenchement de 0 25 2 sec la r solution des photos en m gapixels le type de flash incandescent photos en couleurs ou infrarouge le syst me de d tection infrarouges passifs ou actifs la dur e de vie des batteries le poids Le prix et le syst me de s curit cable cadenas et caisson antivol et antichocs sont galement des parametres a prendre en compte lors du choix A titre d exemple le mod le Attack de la marque Cuddeback permet d obtenir des clich s de bonne qualit r solution de 5 m gapixels et des photos de nuit en couleur flash incandescent Son autonomie est satisfaisante et sa vitesse de d clenchement fait partie des meilleures 0 25 sec B Les pi ges photographiques dans les r serves catalanes 1 De 2009 aujourd hui
35. s retenu dans le protocole car il presente trop d erreurs de programmation De plus les donn es des photos date esp ce suivi responsable ne sont pas int gr es dans les propri t s du fichier de la photo M Tobler comm pers 3 Cr ation d une base de donn es partir des m tadonn es Les m tadonn es d une photo sont les informations compl mentaires contenues dans le fichier de la photo Certaines sont inscrites automatiquement comme le mod le de l appareil le flash la r solution alors que d autres peuvent tre modifi es manuellement en taguant les photos Les m tadonn es permettent donc de conserver la tra abilit de la photo si cette derni re est d plac e ou envoy e Le mode de stockage propos par Harris et al 2010 et repris par Sundaresan et al 2011 a t test Ils recommandent d organiser les photos dans des dossiers du type NomduSite Num rodeStation Date puis de les tagger l aide d un logiciel type Picassa Une base de donn es peut ensuite tre cr e l aide d un logiciel qui extrait les m tadonn es Le concept de cette m thode est int ressant Cependant le d placement et le renommage manuel des photos engendre in vitablement des erreurs de classement L objectif a t de conserver la tra abilit de la photo via l enregistrement des informations dans les m tadonn es Nous avons aussi d velopp un processus de tri et de stockage de photos le plus automatis
36. s besoin d tre enregistr es directement L autonomie des batteries annonc e tant de 10000 photos une rel ve tous les 5 6 mois maximum est suffisante pour la veille cologique Estimation d abondance ou de densit du chat sauvage La carte de disposition des pi ges Illustration 16 a t reprise et les pi ges qui peuvent tre relev s ensemble ont t reli s Annexe B On estime qu une journ e est n cessaire pour effectuer les relev s de 1 3 pi ges simultan ment c est a dire r cup rer les photos remplacer la carte m moire et ventuellement les batteries Chaque pi ge doit tre relev au maximum tous les 2 mois Cependant les pi ges dispos s initialement sans l aide d indices de pr sence devront tre relev s plus souvent pour tre ventuellement d plac s et atteindre leur position optimale Le calcul de l estimation du temps n cessaire se base sur 1 visite par mois par pi ge en d pla ant le pi ge ou pas Neuf journ es minimum sont n cessaires pour relever l ensemble des 22 pi ges Le co t en temps s l ve donc environ neuf jours par mois uniquement pour la r colte de donn es ce qui para t tr s important sauf si une personne s occupe uniquement de ce sujet ce qui est improbable pour le moment au sein des r serves 3 Gestion des donn es et co t en temps Production de donn es pour la veille ecologique et de supports de communication La ges
37. stimation Les photos disponibles actuellement au sein de la r serve ne sont pas exploitables du fait de leur faible nombre et de leur qualit variable Pour que l estimation de l abondance par cette m thode puisse tre appliqu e a la r serve naturelle de Noh des le nombre de photos devra tre suffisamment grand et les photos non identifiables devront rester rares Harmsen et al 2010 mettent en garde sur le fait qu une population inf rieure 10 20 individus et qu une probabilit de capture inf rieure a 0 05 nombre de chats nombre d v nements de capture engendrent des estimations tr s impr cises Pour apporter davantage de pr cisions il faudrait valuer la probabilit de capture des animaux par pi geage photographique Pour cela des pi ges pourraient tre dispos s pendant un temps donn dans une zone o le nombre d animaux est connu par exemple le Parc des F lins de Nesles 77 Les donn es ainsi r colt es permettraient peut tre de rendre plus pr cise l estimation des effectifs S Longis comm pers malgr le biais introduit par la captivit D Estimation de la densit sp cifique 1 M thode de capture recapture pour l estimation de densit L estimation de la densit sp cifique a d j t r alis e gr ce au pi geage photographique On peut notamment citer Jackson et al op cit pour le leopard des neiges Marker et al 2008 pour les guepards ou encore Kilshaw et Macdonald o
38. t donc judicieux de d buter cette tude uniquement si le nombre de photos de chats est suffisant C Perspectives Ce stage a r v l les potentialit s du pi geage photographique au sein des r serves naturelles catalanes La production de supports de communication et de donn es de veille cologique apport e par cet outil doit tre maintenue et d velopp e sur l ensemble des r serves L estimation d abondance sp cifique d esp ces discr tes en revanche m riterait davantage d investigations en amont Une solution sugg r e serait d utiliser dans un premier temps les pi ges photographiques le long d un transect La concentration de plusieurs pi ges sur une m me zone permettrait de d limiter les endroits de passages r guliers de l esp ce recherch e avant m me de se lancer dans des tudes d estimation d abondance Ainsi si de telles tudes sont concr tis es elles seraient plus m me d aboutir des r sultats pertinents car le nombre de donn es permettrait une exploitation statistique 23 Sigles et abr viations AGRNN Association Gestionnaire de la R serve Naturelle de Noh des CNERA PAD Centres d tudes et de Recherche Appliqu e Pr dateurs Animaux D pr dateurs CNRS Centre National de la Recherche Scientifique CRNC Conf d ration des R serves Naturelles Catalanes EMR Effectif Minimum Retenu FNRC F d ration des R serves Naturelles Catalan
39. tion de donn es pour la veille cologique peut devenir rapidement lourde si le nombre de pi ges s accroit En effet toutes les donn es obtenues partir des photos exploitables sont conserver Nous avons vu que pour cela il existe d j l outil Serena La m thode propos e utilise Ex1fTool pour importer les donn es par lots dans la base de donn es d j existante Cette m thode permet de sauvegarder les donn es de 60 photos en moins d une heure en moyenne en incluant le classement et la d nomination des photos Toutefois la m thode de stockage l aide du programme ExifTool a t test e mais ne reste pas infaillible devant toutes les versions d explorateurs et les configurations de chaque ordinateur Aussi elle 22 m riterait gagner en stabilit mais ce travail ne peut tre effectu sans l aide d un sp cialiste De plus si le d veloppement d un logiciel de reconnaissance d images sp cifiques s av re n cessaire dans plusieurs ann es le cas ch ant cette m thode deviendra alors peut tre obsol te En attendant elle apporte un soutien technique aux agents charg s de r pertorier et sauvegarder les donn es A cette tape s ajoute le temps pour trier les photos environ 10 20 des photos obtenues lors d une session sont conserver Les autres photos floues sans animal avec des personnes ou 9 9 9 redondantes sont supprimer ce qui peut tre assez l
40. tographique fr source piegephotographique fr gt irae 4 ji Illustration 10 martre ou fouine Illustration 11 fouine photographi e photographi e avec un flash infrarouge avec un flash incandescent nuit du 21 juillet 2011 Coma Del Mallet Noh des nuit du 13 f vrier 2012 Font Eyxen Jujols La vitesse de d clenchement dur e entre l instant de d tection par infrarouges et la prise du clich est galement tr s importante Illustration 12 Elle doit tre id alement inf rieure 0 5 sec pour que l animal soit photographi aussit t apr s sa d tection Illustration 12 Exemple d une photo prise apr s le passage de l animal suite un d clenchement trop lent nuit du 28 f vrier 2012 Font Eyxen Jujols Proposition de methode A La pose des pi ges photographiques 1 Emplacement Les pi ges sont fixes a 30 40 cm de hauteur et quelques metres du lieu de passage vise Ils sont quip s d une bo te de protection elle m me fix e au support avec une sangle Le support doit tre suffisamment solide et surtout fixe ex un arbre vivant pour viter les fausses detections dues au vent Le pi ge est s curis par un cadenas am ricain accompagn d une petite fiche informant les autres usagers du territoire randonneurs chasseurs p cheurs qu il s agit d tudes men es par la r serve 2 Utilisation de leurres ou d app ts Durant l tude f d rale de la teint
41. tration 3 furent ensuite publi es dans le National Geographic de juillet 1906 qui dut tre r imprim du fait de son succ s Illustration 2 G Shiras utilisant son appareil Illustration 3 clich de G Shiras parmi les plus photo et un flash sur une embarcation connus une biche et ses deux faons Source National Geographic Source National Geographic Plus r cemment le photographe M Nichols reprit le concept et utilisa les premiers pi ges photographiques pour capturer tigres crocodiles leopards gorilles l phants et hy nes Il utilisa de simples appareils d clench s par des capteurs Ceux ci taient pour la plupart et sont toujours des capteurs infrarouges capables de d tecter le rayonnement de chaleur mis par les animaux 2 Notori t grandissante des pi ges photographiques De nos jours les pi ges photographiques sont utilis s par les chasseurs et les scientifiques mais aussi par les amateurs de la faune sauvage Aussi des espaces communautaires ont vu le jour principalement sur internet pour changer les photos et partager les techniques On peut notamment citer le site chasinggame com qui regroupe une s rie de tests de la plupart des appareils commerciaux Ce site et son forum ont t initi s pour les chasseurs chasingame chasser le gibier mais ils sont ouverts a tous On trouve egalement le groupe Yahoo camera traps permettant des conversations suivies entre les acteurs de la reche
42. ural spaces worldwide Catalanes natural reserves french Pyrenees chose to use it since 2009 This non invasive technique allows to get presence proofs of animals often discrete without disturbance This kind of trapping has first been used for the Wildcat Felis silvestris silvestris monitoring subspecie distinct from domestic cat Reserves wish to sustain it and target more larger objectives The work of this traineeship define a tool to stock and sort out the large amount of pictures generated A protocol has then been developed to fill out fauna monitoring data bring communication supports and try to estimate specific abundance To do so the Wildcat of the Natural Reserve of Noh des has been take as an example Keywords camera traps Wildcat natural reserve Noh des Jujols Photo de couverture chat photographi la nuit du 11 juin 2011 au lieu dit Coma Del Mallet R serve de Noh des
43. ure mere de val riane leurre olfactif a t appliqu e sur les pi ges poils des stations de suivis La val riane a des propri t s particuli res qui attirent les chats Kraft 2008 Cependant les chats presents sur le Madres Coronat semblent indiff rents a ce leurre Il est possible que l attirance pour cette substance soit transmise g n tiquement et donc qu elle ne soit observ e que dans certaines populations Kilshaw et Macdonald 2011 proposent d utiliser d autres leurres comme du castor um de castors ou des substances extraites de glandes de chats compos es pour les trappeurs ex le Hawbakers Wildcat Lure n 1 Des app ts nourriciers comme des plumes de faisans peuvent aussi tre envisag s L utilisation de ces leurres ou app ts permettrait d augmenter la probabilit de capture en plus d obtenir davantage de photos d un m me animal afin de faciliter l individualisation Toutefois cette m thode est susceptible de modifier le comportement des animaux et remet donc en question le caract re non invasif de la m thode de pi geage photographique De plus la plupart des leurres ou appats ont besoin d tre r approvisionn s tr s r guli rement ce qui peut demander beaucoup de temps 3 Maillage Jusqu maintenant les pi ges taient places de fa on al atoire et ind pendante suivant les indices trouv s Toutefois si la technique est utilis e pour une esp ce pr cise 1l peut tre pr f rable de les

Rapport de stage 2012

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