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Fiche_R4_ISA_Labo_Biogap - DRAAF Nord-Pas-de
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1. Projet Agricobio Agriculture corridor biologique et biodiversit a Gu nes o Evaluation de la recolonisation cologique de l espace agricole apr s la mise en place d am nagements haies et bandes enherb es o Evaluation de la fonctionnalit de cette biodiversit sur la protection des cultures vis a vis des bioagresseurs Personne ref rente A Siah Page sur 10 Version juin 2012 Recherche et enseignement superieur ecophyto2018 GROUPE i FICHE R1 METHODES DE LUTTES ALTERNATIVES Th me 4 D tection des activit s licitrices de bioproduits afin de mettre au point un nouveau SDP Stimulateur de D fense des Plantes Interaction stimulateurs de d fense des plantes g notypes de bl tendre dans la lutte contre la septoriose Mots cl s Stimulateurs de d fense septoriose Personne r f rente P Halama Cultures concern es Bl tendre Diffusion des r sultats Publications Th me 5 M ise en vidence d activit s biocides fongicides d extraits v g taux o Evaluation des propri t s fongicides d extraits v g taux contre des champignons phytopathog nes Septoria tritici Botrytis cinerea Fusarium oxysporum o Comparaison de l efficacit des extraits v g taux un fongicide triazole de r f rence le metconazole Mots cl s Activit s biocides fongicides champignons pathog nes Personne r f rente J M uchembled Diffusion des r sultats Publications Th me 6 M ise
2. appels projets Programme 1 Nom du programme RMT Elicitra Description Dur e Partenaires collaborateurs o INRA o Astredhor o Vegenov BBV o IFV o Institut Polytechnique o CTIFL LaSalle Beauvais o ITEIPMAI o Agrocampus Ouest o CETIOM o URCA o Chambres d agriculture 29 o ULCO et 71 o ISA o CATE o Lyc e viticole d Avize o CIVC o R seau Hortipaysage o INVINEO o P les de comp titivit IAR o Plan te l gumes o Valinov V g polys o CNRS Objectifs Comprendre d velopper et promouvoir les strat gies de d fenses des plantes en compl ment des autres strat gies de protection des plantes Axes de travail o Faire la synth se des besoins des fili res en mati re de lutte alternative Page 4 sur 10 Version juin 2012 Recherche et enseignement superieur ecophyto2018 FICHE R1 o Centraliser les informations sur les Stimulateurs de D fenses des Plantes SDP leur efficacit leur mode d application et la r glementation o Mettre en place des proc dures standardis es pour une valuation fiable des SDP o Comprendre en amont les principaux manques de connaissances scientifiques lever pour optimiser l efficacit de ce type de produit Lancer des projets de recherche collaborative afin de lever ces d ficits Communiquer les informations vers les fili res Produire des synth ses scientifiques sur ce type de produit Elaborer un guide de bonnes pratiques et de mode d emploi pour valuer et u
3. en vidence d activit s biocides bact ricides d extraits v g taux et comparaisons selon des m thodes d valuation des activit s Mots cl s Activit s biocides Personne r f rente C Choma Diffusion des r sultats Publications Moyens humains Effectifs Enseignant chercheur 6 Assistante de recherche 1 Nombre d ETP Technicien 1 ETP Recherche 4 5 Doctorant 4 Total 8 4 doctorants Page 2 sur 10 Version juin 2012 Recherche et enseignement superieur ecophyto2018 GROUPE us FICHE R1 Competences savoir faire et expertises Savoir faire comp tence dans le domaine de la recherche ou techniques com Savoir faire comp tence dans le domaine de la recherche ou techniques dans le domaine de la recherche ou techniques Comp tences techniques Microbiologie isolements des souches Biologie mol culaire Type de ee dsl AE Contamination plantes en conditions contr l es Domaines d expertise Domaines d expertise ou Prestations Caract risation de souches Evaluation activit s biocides fongicides et bact ricides Evaluation du pouvoir pathog ne Moyens mat riels Ru 1 aie Equipement significatif quipement scientifique plate forme technologique E Liste des quipements ci dessous Autres quipements significatifs Coulter counter comptage de cellules Unit s de micro et ultra filtration Thermocycleurs
4. s quenceur Mat riels biochimiques chromatographie lectrophorese spectrophotom trie enzymologie lecteur de microplaques Mat riels microbiologiques hottes flux laminaire tuves Mat riel d analyse physico chimique oxymetre conductimetre spectrophotom tre titrimetre centrifugeuse Mat riel de microscopie microscopie fond clair contraste d interf rence diff rentielle microscopie fluorescence loupe binoculaire Appareil de capture d images M icroforge et micromanipulateur Enceintes climatis es programmation r gulation temp rature et photop riode enceinte phytotronique programmation r gulation temp rature clairement humidit Serre avec humidificateur Page 3 sur 10 Version juin 2012 GROUPE TSA Recherche et enseignement superieur ecophyto2018 FICHE R1 Implications dans des programmes internationaux Interreg appels a projets Programme 1 Nom du programme Diversit g n tique des populations marocaines de Mycosphaerella graminicola agent causal de la septoriose du bl et recherche de sources de resistance dans le cadre d un Projet de Recherche Agronomique pour le D veloppement PHC Dur e Partenaires collaborateurs Universit de M ekn s M aroc Objectifs Axes de travail Budget Financement sources R alisation r sultats conclusions Remarques particuli res Implications dans des programmes nationaux
5. L CHARTOUNI L DEWEER C TISSERANT B HAFIDI M REIGNAULLT P and HALAMA P 2012 First report of the two mating types MAT1 1 and MAT1 2 of Mycosphaerella graminicola in Morocco Journal of Plant Pathology doi 10 4454 jpp fa 2012 018 EL CHARTOUNI L B TISSERANT A SIAH F DUYME R DURAND P HALAM A and PH REIGNAULT 2012 Evolution of Mycosphaerella graminicola at the wheat leaf level and at the field level Phytopathologia Mediterranea sous presse 2011 Sanssen J Selim S Roisin Fichter C Djerroud L Deweer C and Halama P 2011 Protective and curative efficacy of prothioconazole against isolates of Mycosphaerella graminicola differing in their in vitro sensitivity to DMI fungicides Pest Management Science in press Houssin T Faidherbe J Follet J Dei cas E and Senez V 2011 Viability discrimination of parasites infecting drinking water by electrochemical impedance biosensors and bioelectronics soumis EL CHARTOUNI L RANDOUX B DUYME F RENARD MERLIER D TISSERANT B BOURDON N PILLON V SANSSENE J DURAND R REIGNAULT PH and HALAMA P 2011 Correlation of cytological and biochemical parameters with resistance and tolerance to Mycosphaerella graminicola Plant Biology 14 11 21 Page 8 sur 10 Version juin 2012 Recherche et enseignement superieur ecophyto2018 GROUPE iin FICHE R1 El Chartouni L Tisserant B Siah A Duyme F Deweer C Fichter C San
6. R gion Nord Pas de Calais FRB AgricoBio Agriculture corridor biologique et biodiversit Guines Description Dur e Partenaires collaborateurs Page 6 sur 10 Version juin 2012 GROUPE Programme 3 D O O O 00 O 0 Recherche et enseignement sup rieur cophyto2018 FICHE R1 Lillel LGCgE ENE Groupe ISA LGCgE ESE BioGAP GRECAT UCL FLST Laboratoire Environnement et Sant Parc naturel r gional des Caps et M arais d Opale FREDON Nord Pas de Calais F d ration des chasseurs du Pas de Calais Chambre D partementale d Agriculture du Pas de Calais Syndicat mixte du Pays du Calaisis Objectifs Etude des conditions d acc l ration de la recolonisation cologique des milieux anthropis s Financement Conseil R gional Nord Pas de Calais Budget Financement sources R alisation r sultats conclusions Nom du programme PHYTENER Dur e 2010 2013 Partenaires collaborateurs O O Or O O U O O O Groupe ISA LGCgE ESE BioGAP GRECAT ADEME Lille 1 LGCE ENE et PC2A Lille 2 Laboratoire des Sciences V g tales et Fongiques ULCO UCEIV CCM Univ Franche Comt UMR UFC CNRS 6249 UsC INRA Labo Chrono Environnement INRA Laboratoire d Analyses des Sols d Arras Chambre r gionale d Agriculture NPDC Exploitation agricole du Lyc e Agricole de Tilloy les M offlaines Objectifs D veloppement des fins nerg tiques de la phytostabilisation su
7. Recherche et enseignement superieur ecophyto2018 GROUPE ii FICHE R1 Nom Halama Pr nom Patrice Institution Structure Laboratoire BioGAP Biotechnologies et gestion des agents pathog nes en agriculture Adresse 48 boulevard Vauban 59 046 LILLE T l phone 03 28 38 46 20 E mails patrice halama isa lille fr Site internet Champs d activit Le principal objectif du laboratoire BioGAP est le contr le et la gestion des agents pathog nes en agriculture Les th matiques de travail s orientent ainsi autour de 3 grands domaines La pathologie v g tale Les m thodes de lutte alternative La parasitologie animale PATHOLOGIE VEGETALE Th me 1 La septoriose du bl en r gion Nord Pas de Calais Etude des populations de M ycosphaerella graminicola de leurs niveaux de r sistance aux fongicides et de l expression des m canismes de d fense chez des cultivars de bl de niveaux de r sistance diff rents Mots cl s Septoriose Populations R sistances fongiques Personne r f rente P Halama Cultures concern es Bl Diffusion des r sultats Publications Th me 2 Diversit g n tique des populations marocaines de M ycosphaerella graminicola agent causal de la septoriose du bl et recherche de sources de r sistance Mots cl s Diversit Populations Septoriose Personne r f rente P Halama Cultures concern es Bl Diffusion des r sultats Publications Theme 3
8. hemibiotrophic fungus M ycosphaerella graminicola Plant Pathology 59 661 670 Houssin T Follet J Follet A Dei cas E and Senez V 2010 Label free analysis of water polluting parasite by electrochemical impedance spectroscopy biosensors and bioelectronics 25 5 1122 1129 Remarques particuli res Prospectives Thematiques futures Etude des populations de parasites fongiques M ethodes de lutte alternative SDP Projets d pos s ou se mettant en place Projets en d marrage Projet DiV RE Utiliser la Diversit Veg tale pour concevoir des syst mes de production R sistants et Economes Appel projets FESIA Projets d pos s Projet ANSES Alternastim Simulation des d fenses des plantes cultiv es pour une diminution de l utilisation de fongicides Page 9 sur 10 Version juin 2012 Recherche et enseignement superieur ecophyto2018 FICHE R1 Projet FSOV Contribution la s lection vari tale du bl tendre des populations fran aises de M ycosphaerella graminicola Programme PHC UTIQUE 2013 Stimulateurs de d fenses naturelles vis a vis de la septoriose du bl tendre en France et du bl dur en Tunisie Confidentialite Non Page 10 sur 10 Version juin 2012
9. p rieur d Agriculture ISA Institut Technique de la Betterave ITB Pole Legumes Region Nord PLRN O O OU Objectifs o Evaluation des r ductions des produits phytosanitaires o Etablir les r f rences techniques au cours des ann es o Evaluer les incidences des r ductions approche technico conomique et socio macro conomique Axes de travail o Suivi de la population de S tritici en exp rimentation pluriannuelle en fonction de deux conduites de culture une en conventionnelle IFT 100 et l autre bas intrants phytosanitaires IFT 50 voire moins Budget Financement sources o Minist re de l Agriculture et de la P che o ONEMA Office national de l eau et des milieux aquatiques R alisation r sultats conclusions en cours Implications dans des programmes r gionaux appels projets Programme 1 Nom du programme La septoriose du bl en r gion Nord Pas de Calais Etude des populations de Mycosphaerella graminicola de leurs niveaux de r sistance aux fongicides et de l expression des m canismes de d fense chez des cultivars de bl de niveaux de r sistance diff rents dans le cadre des Actions de Recherche Concert es d Initiative R gionale ARCIR Dur e Partenaires collaborateurs Objectifs Axes de travail Budget Financement sources R alisation r sultats conclusions Programme 2 Nom du programme Projet Biodiversit
10. r des sols contamin s par les m taux viabilit cologique int r t social et bilan conomique Partenaires collaborateurs Autres collaborateurs hors projet ULCO Universit du Littoral C te Bayer d Opale Equipe M ycologie de GROUPE CETAC Centre d Etudes l UCEIV Techniques pour l Am lioration des LaSalle Beauvais Laboratoire de C r ales Lemaire Deffontaines Pathologie v g tale Adrien M omont amp Fils UNISIGM A ARVALIS Institut du V g tal Svalof Weibull SARL Caussade Page 7 sur 10 Version juin 2012 Recherche et enseignement superieur GROUPE z ecophyto2018 du FICHE R1 Semences M onsanto SAS Saaten Institute of Electronics Union Recherche SARL Secobra Microelectronics and Recherches et GAE Recherche Nanotechnology IEM N GIE Recherches G n tiques Laboratoire environnement amp C r ales Club 5 sant FLS FLM Equipe d accueil INSERM Unit 42 Ecole Doctorale Biologie Sant EA Institut Pasteur of Lille 3609 Autres r seaux GIS RMT e RMT Elicitra e RMT Biomasse e GIS PhyNoPi Phytopathologie Nord Picardie o Partenaires UCEIV de l ULCO Biotechnologies des M icroorganismes de l ISA de Lille Dr Patrice Halama HDR Phytopathologie de l Institut Polytechnique Lasalle Beauvais Dr Sameh Selim Publications Publications majeures r centes 3 5 ans voir Annexe toutes les publications 2012 EL BEKALI A Y SIAH A RAM DANI A E
11. ssen J Durand R Halama P and Reignault P 2011 Genetic diversity and population structure in French populations of M ycosphaerella graminicola M ycologia 103 764 774 VILLENAVE C SAJ S ATTARD E KLUM PP K AND LE ROUX X 2011 Grassland management history affects the response of the nematode community to changes in above ground grazing regime Nematology 13 8 995 1008 FOLLET J GUYOT K LERUSTE H FOLLET DUMOULIN A HAMMOUMA GHELBOUN O DEI CAS E and HALAM A P 2011 Cryptosporidium infection in a veal calf cohort in France molecular characterization of species in a longitudinal study Veterinary Research 42 116 2010 Siah A Tisserant B El Chartouni L Duyme F Deweer C Fichter C Sanssen J Durand R Reignault P and Halama P 2010 Mating type idiomorphs from a French population of the wheat pathogen Mycosphaerella graminicola widespread equal distribution and low but distinct levels of molecular polymorphism Fungal Biology 114 11 980 990 Siah A Deweer C Morand E Reignault P and Halama P 2010 Azoxystrobin resistance of French M ycosphaerella graminicola strains assessed by four in vitro bioassays and by screening of G143A substitution Crop Protection 29 737 743 Siah A Deweer C Duyme F Sanssen J Durand R Halama P and Reignault P 2010 Correlation of in planta endo amp 1 4 xylanase activity with the necrotrophic phase of the
12. tiliser ces produits dans le respect de la r glementation o Proposer des actions de formation notamment au personnel des instituts techniques agricoles des l ves de l enseignement secondaire et sup rieur O O 0O O Budget Financement sources R alisation r sultats conclusions Programme 2 Nom du programme Projet FSOV Interaction stimulateurs de d fense des plantes genotypes de bl tendre dans la lutte contre la septoriose dans le cadre du Fonds de Soutien a Obtention V g tale dans le domaine du bl tendre o S lection des SDP candidats parmi des produits d ja commercialis s en cours de d veloppement ou se situant en amont en conditions contr l es et en plein champ o Recherche des interactions avec des g notypes de ble Description Dur e D but 2011 3 ans Partenaires collaborateurs o GIS Phynopi o ARVALIS o GIE Club 5 Objectifs Axes de travail Budget Financement sources R alisation r sultats conclusions Programme 3 Nom du programme Projet DEPHY EXPE ECOPHYTO Reconception durable de deux syst mes grandes cultures et l gumiers pour une r duction d au moins 50 de l utilisation des produits phytosanitaires Dur e 6 ans Page 5 sur 10 Version juin 2012 Recherche et enseignement superieur ecophyto2018 FICHE R1 Partenaires collaborateurs o Chambre d Agriculture Regionale CAR La FREDON Nord Pas de Calais Institut Su
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