Home
version PDF - Flash informatique
Contents
1. A5 AsciiDoc est un langage de balisage agile capable de transcrire un document accompagn d une syntaxe simple et naturelle vers un document destin aux pages Web ou l impression en s affran chissant des contraintes lourdes qu impose souvent ce type d ou til AsciiDoc se lit avec n importe quel diteur de texte de sorte que tout un chacun sans connaissance aucune du format de la pr sentation peut r diger un document AsciiDoc qui fournira une pr sentation lisible et de bonne facture Cet article ne traite pas exhaustivement tous les aspects du lan gage et les formats qu il est capable de fournir mais donne ce pendant tous les l ments n cessaires la r daction d un article complet au d my um h m mu ul ju ijn PP AsciiDoc pour la production rapide de documents Pascal Fabbri epfl ch EPFL responsable Unix au Domaine IT Introduction AsciDoc est tr s puissant open source riche en fonctionnalit s multi plateforme impl ment l aide de l interpr teur python natif sur bon nombre de syst mes d exploitation et destin tous ceux qui ont besoin de publier rapidement de la documentation technique ou plus g n raliste tout en simplifiant la vie du r dac teur autant que celle du mainteneur Encore peu connu mais disponible depuis plusieurs ann es son d veloppement demeure r gulier et soutenu tout en gardant le souci de proposer un outil stable la lecture
2. Tracking run Analyze Particles stack display run Set Measurements size 500 Infinity area center fit circularity for i 0 i lt nSlices it roiManager Select i run Measure Building the trace x newArray nResults y newArray nResults for i 0 i lt nResults it x i getResult XM i yli getResult YM i makeSelection polyline x y displacement Building the displacement plot t newArray nResults 1 d newArray nResults 1 for i l i lt nResults l i t ij i diij sgrt x i 1 x i x i 1 x i yli 1 y i yli 1 Y i Plot create Displacement t displacement t d fig 2 exemple d une macro ImageJ Avec une dizaine de lignes de code seule ment ce programme peut faire le tracking d une souris de laboratoire et tracer ses d placements dans des conditions particuli rement favorables une seule cible toujours visible et bien contrast e Dans ImageJ les macros assurent le premier niveau de program mation en permettant d automatiser une s quence de t ches de traitement d images Les macros offrent la possibilit d appeler des fonctions de ImageJ fig 2 L apprentissage du langage macro Analyse d image scientifique le monde ImageJ est ais car les appels des fonctions sont enregistrables dans des macros la fa on Excel Depuis quelques mois ImageJ reconna t aussi Javascript comme langage de macro M
3. droite de la page d accueil et effectuer l authentification Tequila Gaspar Parmi les fonctions nouvelles disponibles en mode dition I acc s au contenu en fran ais o anglais des onglets I des bo tes au contenu libre HTML I extraction des publications des donn es Infoscience 2 ou gestion de donn es de publications locales people I gestion des photos externes avec recadrage possible format 3x4 portrait I page de Recherche avec des bo tes au contenu libre pour parler de vos travaux Vous avez tout moment la possibilit de consulter la pr senta tion des pages en cliquant sur Aper u Si vous avez des donn es sp cifiques qui n ont pas t impor t es dans la nouvelle version vous pouvez les reprendre avec le lien Importer l ancien profil Bien videmment les donn es en cours seront cras es par le contenu de l importation Pour ce qui est de la visibilit de votre photo vous pouvez contr ler de mani re ind pendante l affichage I sur la page annuaire et I dans les listes de personnes des unit s La mise jour de toutes ces informations est personnelle ou sous le contr le des personnes qui ont le droit accred gestionprofils KERMIT LA GRENOUILLE Le but de ce projet est de donner chaque colla borateur la possibilit de g rer une carte de visite professionnelle personnalis e dans le cadre de ses activit s l EPFL Pour le confort de l internaute nous avons favo ris la
4. DIT info Arr t du service Usenet News Le DIT vous forme propos du mail Mot crois M MOIRE M Ouwehand E Rosales amp G Coutaz Distrilog2 FAQ 7 Charles Cloud priv de l EPFL F Figueras Un nouvel annuaire des personnes I Cionca amp M Macowicz Ras al Khaimah Ecublens si loin et si proche A El Fawal Arduino l autre circuit R Timsit Analyse d image scientifique le monde ImageJ D Sage AsciiDoc pour la production rapide de documents P Fabbri Pr sentation des logiciels Maplesoft N Cottereau No D lai de r daction 4 12 04 12 5 10 05 12 SP 21 06 12 tout public public averti expert Parution 01 05 12 12 06 12 24 07 12 12 11 16 20 22 19 3 27 03 2012 Richard Timsit epfl ch EPFL Domaine IT responsable des services r seau Arduino est une petite carte de d veloppement open source au succ s fabuleux Elle nous donne l occasion de r aliser qu il n y a presque plus de mat riel sans logiciel et qu ainsi le logiciel libre touche potentiellement l ensemble des objets techniques qui nous environnent Depuis quelques ann es nous sommes entou r s d un nouveau type d objets techniques dits intelligents ils r ussissent plus souvent nous abru tir ou nous ali ner qu nous faciliter la vie mais l volution du syst me de production industrielle a ses lois De nombreux acteurs sociaux tentent d analyser ce syst me p
5. d montrer l utilit de la carte dans mille et une situations en traduisant de la documentation en produisant des tutoriaux dans toutes les langues pour tous les ges en organisant des s ances pratiques d initiation au circuit des enseignants et pas des moindres 8 sont d ailleurs venus leur porter main forte Des revues comme Make 9 ne sortent plus un num ro sans qu un article ne soit consacr cette carte magique De multiples petites soci t s rivalisent d audace et de cr ativit pour proposer des composants utilisables avec un Arduino ou des cartes plus performantes avec la m me licence ouverte Snootlab 10 Les fabricants de composants lectroniques se font un plaisir de four nir les sch mas d interfa age de leurs produits avec un Arduino pour en d montrer les qualit s et la facilit d emploi ECLOCO CERCCLESEQQ cn o BOARD MODEL ve UNO R3 MA OPEN SOURCE ELECTRONICS ARDUINO PROTOTYPING PLATFORM MADE IN ITALY N ESE 2 Lun 4110 ss a MWw ARDUINO CC S ROHS COMPLIANT ZERO CARBON FOOTPRINT fig 2 le dos du circuit arduino cc en Main ArduinoBoardUno II n est pas dans mon intention de donner un mode d emploi ou des exemples d utilisation de la carte dans cet article les moteurs de recherche ram nent des r f rences d une trop grande richesse par rapport ce que je peux donner ici Le contenu du site du pro jet 11 est exemplaire de ce qu un t
6. En plus il supporte les communications unifi es Nous disposons de deux routeurs pour la redondance Acc s distant Nous mettons actuellement en place un syst me d acc s dis tance vers notre Infrastructure I est bas sur SSL VPN le m me standard que celui appliqu l EPFL R seau sans fil Actuellement l EPFL ME b n ficie de deux r seaux sans fil epfl extension du r seau epfl de Lausanne permet aux utili sateurs chercheurs professeurs de travailler et profiter des ressources de l EPFL comme s ils taient sur le campus lau sannois eduroam l EPFL ME fait aussi partie du r seau Eduroam T l phonie Nous disposons de t l phonie IP support e par notre infrastruc ture r seau Une salle quip e d un syst me de conf rences t l phoniques a t mise en place Infrastructure serveurs flexible efficace et s curis e Nous disposons d un rack contenant I un ch ssis IBM avec quatre serveurs lames pouvant en conte nir jusqu quatorze D deux serveurs physiques ESXi 8 c urs chacun qui consti tuent notre environnement de production Ils forment un cluster pour assurer une haute disponibilit D un serveur ESXi physique de test D un serveur physique Windows server 2008 R2 pour le backup I une Tape Library pour le backup I un SAN Storage Area Network 12 TB en RAID 5 E deux UPS 11KVA chacun avec 2 batteries ils assurent une protection des syst mes serveurs et de l
7. anode commune On ins re la platine master d un MaxM pour la programmer afin qu elle remplisse la fonction d sir e Une fois celle ci s par e de l Arduino aliment e et pourvue de ses trois po tentiom tres on a fabriqu un nouvel objet technique recyclable pour une tout autre application si besoin fig 5 gradateur termin et autonome Les modules de la soci t ThingM sont des ensembles de trois LED mont es sur un petit circuit autour d un microcontr leur dont la qualit du logiciel fait la richesse du composant Ce circuit n est pas du open hardware mais il n a pas fallu attendre bien long temps pour qu un projet se constitue et propose une alternative open source au logiciel embarqu sur le composant et open hard ware pour r aliser soi m me un dispositif de ce genre Quand Massimo Banzi a obtenu le prix Ars Electronica en 2006 il devait tre certain d avoir con u un instrument p dagogique prometteur meilleur que toutes les cartes de d veloppement exis tantes Le choix d ouvrir la description de la carte et de mettre celle ci sous une licence Creative Commons a permis de donner une vie au projet Aujourd hui force est de constater que cette d marche inaugure un tout autre circuit en ouvrant de nouvelles voies Les articles open hardware 13 et mat riel libre 14 de Wikip dia montrent parfaitement que nous sommes d sormais de plain pied dans un nouveau paradigme Cette toute petite histoire d but e
8. fabbri www AsciiDoc Fl 2012 03 Article du FI EPFL 2012 sous licence CC BY SA 3 0 P Fabbri GLOSSAIRE LL CSS Cascading Style Sheets langage informatique qui sert d crire la pr sentation des documents HTML et XML W URL Uniform Ressource Locator adresse Web d signant l endroit o sont stock es les informations sur Internet vim diteur de texte Vi IMproved W W tir de Wikip dia A votre service _ Distrilog2 Foire Aux Questions Thierry Charles epfl ch EPFL Domaine IT d veloppeur de Distrilog2 Frequently asked questions and answers about the new release of Distrilog2 Une nouvelle version du serveur de logiciels Distri log2 a t mise en place le 1er f vrier dernier d o des interrogations de la part des utilisateurs Voici les r ponses aux questions les plus fr quentes Dois je entrer une machine priv e dans l inventaire pour pouvoir commander sur Distrilog Oui non seulement la fiche d inventaire est indispensable mais une tiquette jaune doit tre coll e sur la machine et le num ro de cette tiquette associ e ladite fiche d in ventaire J ai une machine priv e qui avait t entr e dans l inventaire mais qui n a pas d tiquette jaune que dois je faire Vous devez contacter le responsable de l inventaire de votre unit et lui demander de modifier la fiche d inven taire pour y rajouter le code d une tiquette jaune Je suis accr dit a
9. patibility avec les plugins d ImageJ C est un d fi de taille car la repr sentation des images aux multiples facettes 3D 4D 5D multi canaux virtualisation doit satisfaire autant l utilisateur par sa rapidit que le d veloppeur par sa simplicit 2012 voit merger un tout nouveau logiciel Java d analyse d images ICY sp cialis en bioimagerie 16 ICY a d fini un mo d le homog ne des donn es pour la bioimagerie I s appuie sur la librairie VIK pour offrir un rendu efficace d images 2D et 3D Des tentatives de communication avec les plugins Image sont en cours de d veloppement Enfin l aspect logiciel d analyse est d sormais reconnu comme une infrastructure part enti re dans le domaine de l imagerie biom dicale en cons quence il fait l objet d un workpackage du projet europ en MEMET Notre laboratoire organisera le 30 avril et le Ter mai 2012 un workshop 17 consacr aux logi ciels Java d analyse d images biologiques pour tenter de dessiner les contours de l apr s ImageJ Si vous avez r alis un plugin c est une belle occasion de venir Barcelone pour le pr senter L ic ne de d marrage d Image est la reproduction d une photogra phie du microscope de Hartnack qui date des ann es 1870 C est un contraste assez saisissant que de double cliquer sur cette ic ne d un autre ge pour analyser des images provenant d appareils la pointe du progr s comme des microscopes 3D confocaux fluoresc
10. vidence par des d cisions politiques Le d bat ne se r sume pas comme on l a trop souvent invoqu des aspects techniques et financiers il ressort de la perception que l on se fait de la M moire d un tat ou d une collectivit II ne s agit pas seulement de constituer une M moire qui puisse r pondre Imm diatement aux demandes d aujourd hui mais d or ganiser et de structurer une M moire qui pourra t moigner dans 20 50 ans et bien plus lorsque les interrogations il faut encore savoir lesquelles seront formul es Le temps informatique n est pas ce jour le temps historique sauvegarde et archivage ne sont pas des termes synonymes Le v ritable indicateur de la M moire sera sa capacit porter de mani re durable et perp tuelle donc intelligible et visible les informations et des donn es et surmonter la contradiction entre approche consum riste et exigences conservatoires Les risques de rupture sont consid rables dans ce contexte au del de la volont politique il faudra assumer la continuit des investis sements financiers et s adapter aux bouleversements technolo giques Si jusqu pr sent la M moire avait un co t plus ou moins bien support on pouvait intervenir m me tar divement dans la conservation d sormais elle est entr e dans des surco ts r currents que seuls les plus riches et les plus puissants pourront satisfaire il est imp ratif d tre pr sent la conception et l la b
11. coh rence entre chaque pr sentation indi viduelle en employant une mise en page une na vigation et des libell s communs tout en pla ant tant que se peut les informations administratives au second plan M me s il reste possible de se limiter une infor mation minimum enrichir son profil garantit une image publique ma tris e soign e et cr dible Une derni re pr cision sur la notion de profil par d faut people epfl vous permet de g rer le contenu personnel dans les deux lan gues officielles de l EPFL fran ais et anglais Sans d finir un profil par d faut le contenu est donn selon la langue du navigateur de la personne qui consulte la page ou selon la valeur du param tre lang de l adresse Web de la page Si vous d finissez un profil par d faut c est son contenu qui sera pr sent dans tous les cas Vous trouverez plus de d tails propos de people epfl sur la page d aide en ligne help people epfl ch R f rences 1 accred epfl ch prestations 2 help infoscience epfl ch gerer les publications people D Contact Biography amp current work Research Main publications Help Biography and current work Fran ais Q Q Biographie Q Q Formation Q Q Parcours profesionnel Q Q Mission Travail en cours Visibility photo is visible on line on your people page photo is visible on staff lists gt gt add new content box ir lt Upload an ext
12. communication HD avec 1Mbps Salles de cours nos quatre salles de cours une de 100m et trois de 30 m sont quip es de projecteurs d crans de syst mes audio et d un microphone pour la grande salle Infrastructure s curit Un syst me de contr le d acc s utilisant les m mes cartes Cami pro que celles de l EPFL a t mis en place pour tous les bureaux De plus les couloirs sont surveill s par des cam ras Computer Lab Nous avons pr par un computer lab avec 6 machines pouvant supporter jusqu 10 machines Perspectives moyen terme Nous avons entam des tudes pour tester et valuer plusieurs applications y compris Sharepoint comme plate forme d Intranet et des pages Web pour les diff rents d partements de l EPFL ME Sharepoint comme plate forme pour la gestion des docu ments lectroniques Disaster Recovery Site Le travail achev au sein du d partement IT RAK est le fruit d une coordination troite avec diff rentes unit s de l EPFL comme les DIT CSIN OS DII et DSPS Je tiens remercier en particulier Jean Claude Berney directeur du DIT et Didier Rey coordinateur des syst mes d information pour leur soutien ainsi que pour le temps qu ils m ont accord s et les discussions fructueuses que nous avons chang es Je re mercie galement le personnel du DIT sans exception pour son encouragement son aide technique et son accueil dans ses locaux plusieurs reprises Je remercie le p
13. illustrer quelques unes de ces possibilit s prenons cet amas froid et inerte de ferraille de circuiterie et d lectronique qu est un PC teint et allumons le Le processeur va d abord lire et ex cuter la partie de la m moire morte du BIOS qui contient les ins tructions n cessaires pour lire son tour sur la m moire de masse disque CD ROM le contenu du noyau du syst me d exploitation et le charger en m moire vive Le noyau s ex cute alors et met en place la m moire virtuelle et la m moire tampon qui acc l re l acc s aux donn es stock es sur le disque Le PC est alors vigoureusement pr t et l utilisateur pourra lancer les programmes de son choix Leur ex cution est acc l r e par l utilisation de la m moire cache ce que l Acad mie fran aise appelle para t il ant m moire plac e entre le processeur et la m moire vive et qui sert att nuer les effets de la diff rence entre leurs vitesses de r action Le PC est sans doute dot d une connexion Internet et l utilisa teur peut alors acc der notre m moire commune au sens tra ditionnel de ce mot c est dire le souvenir d v nements d opi nions et d motions du pass il semble parfois que c est devenu le seul moyen de le faire mais n oublions pas les discussions au bistrot et l atmosph re feutr e des biblioth ques qui gardent tout leur charme II pourra encore y publier un article scientifique ou une page de blog tellement bien tourn s
14. le cas o elles souhaiteraient plus de ressources il est pos sible d en acheter un tarif convenu en d but d ann e Le graphique ci dessous montre le nombre de machines virtuelles par facult d but 2012 Depuis 2007 199 machines virtuelles ont t cr es puis suppri m es la dur e de vie moyenne de ces machines est de 212 jours 50 des machines ont eu une dur e de vie sup rieure 385 jours 3 6 9 1215 18 21 24 27 30 33 36 39 42 45 48 Dur e de vie en mois des machines virtuelles ENAC IC SB STI SV Nombre de machines virtuelles par facult au 09 f v 2012 La r partition globale du nombre de machines est de 27 pour les facult s et 73 pour les vice pr sidences et le support des services destination de l cole VP SC Le graphique ci apr s en montre la r partition d but 2012 GLOSSAIRE HH Fibre Channel connexion fibre au sens Fiber Channel Fibre Channel est un protocole d fini par la norme ANSI X3T1 permettant une connexion haut d bit de l ordre du gigabit fr wikipedia org wiki Gigabit par seconde entre un ordinateur et son syst me de stockage ou d autre type de p riph rique Il garantit l arriv e des donn es il permet de cr er un r seau pouvant transporter plusieurs protocoles de fa on native comme l IP Internet Protocol et il offre la possibilit d un mode canal utilis pour transporter le protocole SCSI dans le cas des SAN Il a t con u l origine pour les sup
15. me s il existe des macros tr s avanc es les limites de la pro grammation par macro sont vite atteintes dans le cadre d un tra vail professionnel pour des raisons de faible performance d in teraction homme machine limit e et pour le g nie logiciel tr s restreint des macros Les plugins constituent le niveau avanc de programmation 8 9 IIs sont crits en Java et permettent d acc der non seulement aux fonctions de ImageJ mais galement tout le langage Java et l ensemble de ses librairies En particulier il permet de cr er des interfaces utilisateurs GUI qui peuvent interagir avec les don n es image fig 3 II est galement possible d acc l rer certaines op rations en faisant appel au multithreading de Java Bien en tendu l criture de plugins s adresse des personnes qui ont une base de programmation suffisante en Java L acc s aux sources document es de Image facilite le d veloppement de plugins imagoj File MIN Object Scale e90 Select All 2A Deselect D Stow BT Forget 3X Nudge Right 3 Nudge Up t Nudge Left ge Nudge Down 4 fig 3 Mosaic Philippe Th venaz est un plugin pour l assemblage semi inte ractif d une mosa que d images L alignement pr cis des images est automatis en recourant au plugin TurboReg 18 ImageJ et ses distributions L architecture logicielle ouverte et la licence domaine public a sti mul la cr ativit des d veloppeurs et a pe
16. members Available Algorithms for Image and Fiji bigwww epfl ch algorithms html RUEDEN C and Imageldev team mageJ2 developer imagej net Institut Pasteur Icy The Open Source Community Software for Bio Imaging icy bioimageanalysis org Euro Bioimaging Workshop Bioimage Analysis Software Is there a Future Beyond ImageJ bigwww epfl ch eurobioima ging TH VENAZ P et al A Pyramid Approach to Subpixel Re gistration Based on Intensity IEEE Transactions on Image Processing 7 pp 27 41 January 1998 bigwww epfl ch the venaz turboreg Article du FI EPFL 2012 sous licence CC BY SA 3 0 D Sage 27 MARS 2012 N 3 I O0 CC Logiciel libre 2 e a e AsciiDoc is a software for writing documents from text format files AsciiDoc files can be translated into HTML PDF or EPUB Made for everyone even newbies AsciiDoc est un logiciel qui aide la r daction de documents partir de fichiers au format texte Les documents source AsciiDoc peuvent tre transcrits vers des formats comme HTML PDF ou EPUB Acces sible chacun sans connaissances particuli res Fiche descriptive AsciiDoc Domaine bureautique langage de balisage l ger Licence langue version GNU GPLv2 ou multilingue 8 6 6 suivante Autres alternatives libres Ixt2tags Docutils Six2any Markdown Sites Web www methods co nz asciidoc Plates formes g Unix POSIX based
17. que nos descendants les trouveront m morables M 27 MARS 2012 N 3 __14 Arduino l autre circuit Suite de la premi re page La prolongation du logiciel vers le monde physique paraissait l af faire de sp cialistes et l apanage d une industrie lourde Massimo Banzi 3 avec quelques amis a voulu montrer le contraire On peut on veut on doit pouvoir faire ce que l on veut avec du logi ciel libre ou open source il n y a pas de raison de ne pas commen cer le faire aussi avec du mat riel L id e de mettre disposition une carte d interface facilement programmable avec du logiciel libre et facilement r alisable par une petite industrie voire par un lectronicien seul tait n e La carte toute faite ne devait pas co ter plus cher qu une place de cin ma et ne devait rien avoir envier tout ce qui se fait de mieux dans le domaine Le langage de prototypage rapide mis au point par le MIT des tin des non informaticiens l ves des beaux arts graphistes ou designers Processing 4 logiciel libre mentionn dans l article du FI SR 11 Les logiciels libres pour vos tudes et la recherche 5 allait devenir l outil id al pour programmer la carte et lui faire faire des choses Des choses interroger des capteurs agir sur des actionneurs asservir des syst mes comprendre comment marchent les auto mates d mystifier les robots et mettre la port e de tous la ma ti re m me de ce qui nous enviro
18. revue toutes les fonctionnalit s d borderait largement du cadre de cet article En effet ImageJ dispose d un catalogue complet d op rations standards de traitement des images Si jamais une op ration venait manquer alors on trouvera bien quelqu un qui l aura programm e et mise disposition ImageJ est capable de lire un grand nombre de formats d images 2 soit par ses fonctions natives y compris le format m dical Dicom soit en utilisant un plugin sp cialis comme la tr s com pl te librairie BioFormats licence GPL 3 II y a m me des reverse engineering plugins qui permettent de d coder certains formats de fichiers propri taires tenus secrets pour des raisons mercan tiles Eoaea gt x 70 y 100 value 154 El m PM A O O O Result of street1 tiff 226x406 pixels 32 bit 358K street1 tiff street2 tiff 226x406 pixels 8 bit 30K 226x406 pixels 8 bit 30K 80 0 image Calculator LA Image1 street1 tiff o Operation Subtract Imagez sreza M Create new window 32 bit float result Help Cancel fig 1 illustration de la fonction Image Calculator L image r sultat droite est la soustraction des deux images gauche et au centre prises quelques secondes d intervalle Cette soustraction met clairement en vidence les objets en mouve ment 27 MARS 2012 N 3 3 Analyse d image scientifique le mo
19. s agit de l tiquette de l ordinateur lui m me et pas celui de l cran ou d un p riph rique raccord votre machine Si le num ro vous semble correct cela signifie que l tiquette n est pas li e une fiche d inventaire pour un ordinateur dans ce cas demandez au responsable de l inventaire de votre unit de v rifier ladite fiche en cons quence Pour qu un qui pement soit accept par Distrilog il faut qu il fasse par tie de l une des classes suivantes Serveurs Ordinateur de bureau Ordinateur portable Composant calcul Composant stockage Cluster de calcul Lors d une commande je rentre le num ro de l tiquette jaune de l ordinateur correctement mais Distrilog me dit qu aucune fiche d inventaire ne correspond ce num ro que faire Cela signifie qu aucune fiche d inventaire n est li e ce num ro d inventaire Contactez le responsable de l inven taire de votre unit pour qu il remplisse au plus vite ladite fiche AUTANT 11 12 Distrilog2 FAQ Je recherche dans l actuel Distrilog un logiciel qui existait dans la version pr c dente mais je le trouve pas que faire Certains logiciels distribu s par Distrilog1 n ont pas t report s vers Distrilog2 car le volume de commande de ces logiciels tait trop faible voire inexistant ou que le logiciel ait t abandonn par son diteur ou m me que l diteur du logiciel ait disparu Nous gardons cependant tous les binaires et toutes les lice
20. un navigateur Web et une ligne de commande Premier document Un document source AsciiDoc ressemble n importe quel texte accompagn de balises ne g nant que tr s peu la lecture lors de la r daction dont voici un exemple bref mais d j complet AsctiDoc pour la production rapide de documents Il articie 2012 03 EXT e AsciiDoc vite fait pour cr er des do AsciiDoc vite fait pour cr er des documents XHTML XHTML Picetir Lefous lt rictir lerous la bas ici version 1 0 r ycrier 2012 Commentaire de version avec ou Fictif Lefous sans marqueur Git eines ni fictif lefous la bas ici Ac dolor ac adipiscing amet bibendum nullam massa lacus molestie ut libero nec diam et pharetra sodales eget Yection version 1 0 f vrier 2012 Commentaire de version avec ou sans marqueur Git Table des mati res 1 Section 1 1 Sous section 1 2 Ligula suspendisse nulla pretium Maecenas aliquam maecenas ligula nostra accumsan taciti Sous gection Nisl rhoncus turpis est vel elit Congue _wisi_ enim nunc ultricies sit magna tincidunt Quam etiam erat Suspendisse morbi TL Tortor vitae tortor eros wisi racine Lig la g spendiesse nulla pretium Consectetuer arcu ipsum ornare pellentesque vehicula vehicula diam ornare magna erat felis wisi a risus Liste des trenza uf efed op ione header width 60r align center cols prore Dole E Et elie eee oee nea a a 2051 ac oroo S
21. a question de la virtualisa tion l EPFL Fin 2008 les conclusions de l tude men e avec un consultant ont conduit au lancement d un projet de mise dispo sition d un service d h bergement de machines virtuelles Une tude approfondie a t r alis e dans la deuxi me moiti de 2006 Elle a permis de d finir plus pr cis ment le nombre et le type de machines virtuelles supporter le choix technique de l hyperviseur Xen VMWare ou Microsoft et finalement l analyse des co ts et la rentabilit de la solution propos e Au printemps 2007 un pilote a t r alis au DIT la fin de l t tous les voyants tant au vert le service fut ouvert pour toute l cole 2 Le service tait compos d un site Web myvm epfl ch qui offrait aux utilisateurs la possibilit de demander des machines virtuelles Windows ou Linux de les modifier et de les supprimer La ma chine virtuelle de base propos e tait compos e d un CPU 64 bits de 2 GB de RAM de 36 GB de disque et d une carte r seau avec syst me d exploitation install ou non selon la volont de l utili sateur Des objectifs annuels de fiabilit et disponibilit ont t fix s un maximum de deux pannes et un total de cinq heures d interrup tion de service soit plus de 99 94 de disponibilit Ces objectifs ont toujours t d pass s Aujourd hui il est possible d avoir jusqu 4 CPU 32 GB de RAM et quelques centaines de GB de disque avec bien s
22. anique normale mais quand m me avec un taux de 17 en 2011 Sur l ensemble des machines 6 ont 4 VCPU 29 2 vCPU et 65 1 vCPU La machine virtuelle moyenne dispose de 1631 MHz de fr quence processeur 2 748 GB de m moire et 17 GB de disque 550 des syst mes d exploitation sont sous Linux et 45 sous Windows 72 sont en 64 bits et 28 en 32 bits 51 des Win dows sont encore en 32 bits alors que seulement 14 des Linux le sont 56 de la puissance CPU totale est allou e aux machines Windows et 44 aux machines Linux 49 de la m moire totale est allou e aux machines Windows et 51 aux machines Linux 62 de l espace disque est allou aux machines Windows et 38 aux machines Linux 99 machines virtuelles 21 du total ont t sauvegard es par le service de sauvegarde centralis Veritas Net backup dont 57 de Windows et 43 de Linux En 2011 108 TB ont t sauvegard s et le temps de sauvegarde journalier est en moyenne de 20 minutes par machine Les machines Windows re pr sentent 77 du volume sauvegard pour 87 du temps total contre 33 du volume et 13 du temps pour les machines Linux Ubuntu 1 Solaris 1 Suse 6 Other 1 RedHat A Debian 1 75 g Fedora 6 400 O So S 350 Pourcentage d OS Linux par distribution 300 2000 2 250 Seven 4 a Vista 2 200 150 100 50 Pourcentage d OS Windows par distribution 500 400 300 200 100 2007 2008 2009 2010 2011 Nombre
23. ation n est donc pas que le responsable contr le le prix mais qu il confirme par son accord que ce collaborateur est bien un expert dans le domaine et qu il fera une utilisation justifi e de ce celui ci D une mani re g n rale pour l instant ce n est pas le laboratoire qui paiera la facture Tant que nous arrivons supporter le co t des logiciels nous continuerons les proposer sans contrepartie Si notre budget logiciel venait diminuer drastiquement ou s il y avait une explosion des demandes pour les logiciels co teux nous nous verrions dans l obligation apr s vous en avoir averti bien l avance de r percuter tout ou une partie de ces co ts aux unit s Cela se fera alors au prorata des Crd consomm s J ai le droit d utiliser Microsoft Office la maison comment je fais pour le commander sur Distrilog En fait vous avez un droit d utilisation non concurrentiel de Microsoft Office pour autant que vous l utilisiez sur votre machine de l EPFL Comme vous avez donc command sur Distrilog une version pour votre ordinateur professionnel VOUS n avez pas le commander nouveau et vous pouvez utiliser les informations d installation fournies pr c dem ment par Distrilog pour votre ordinateur personnel Lors d une commande je rentre le num ro de l tiquette jaune de l ordinateur correctement mais Distrilog me dit que cet quipe ment ne peut recevoir de logiciels que faire Tout d abord v rifiez bien qu il
24. bilit pour acc der aux fichiers adminis tratifs I un off site backup Infrastructure pour la phase 1 Le projet RAK comporte deux phases E a phase 1 consiste pr parer l infrastructure de base et ac cueillir le personnel acad mique tudiants professeurs cher cheurs dans des locaux provisoire de 1000 m pour 3 4 ans Cette phase inclut la construction d un nouveau campus de 30 000 m I la phase 2 commence partir de la transition vers le nouveau campus Vous lirez dans ce qui suit l volution de l infrastructure dans le cadre de la phase 1 Connectivit Pour le moment nous utilisons une connexion ADSL 100 Mbps pour la production et une autre similaire pour les tests Nous avons r serv les adresses IPv4 91 198 19 0 24 et IPv6 2001 67c 2640 48 Nous avons mis en place une ligne d di e vers Ankabut le NREN local qui nous donne acc s au r seau d ducation et de recherche national ainsi qu international Elle permet que nos serveurs soient accessibles sur Internet par les adresses IP statiques r serv es Elle est d une capacit de 1Gbps aux mirats et d une vitesse similaire celle de l ADSL 100 Mbps vers Internet Cette ligne n est pas encore op rationnelle elle sera active dans quelques mois Un VPN site site a t tabli entre Lausanne et RAK Pour minimiser l overhead le m me routeur d acc s est utilis pour le VPN site site et encore pour les VPN SSL d acc s distant
25. certainement la distribution la plus aboutie d Image en termes de fonctionnalit s de d veloppement communautaire et de documentation fig 4 fig 4 montage illustrant la distribution Fiji de ImageJ En haut une reconstruction d une image IRM avec le plugin 3D Viewer Benjamin Schmid En bas segmentation d une image de cerveau d un drosophila avec le plugin TrakEM Albert Cardona Autres projets avec un coeur ImageJ Bio7 est un logiciel open source sous licence GPL EPL d di aux sciences de la terre et de l environnement Il d montre que Image est suffisamment polyvalent pour tre utilis en de hors de l imagerie biom dicale 6 SalsaJ est une spin off de ImageJ consacr e l astronomie ImageJ for Microscopy est une distribution populaire d Image avec des plugins sp cifiques pour le microscope Toutefois la maintenance de cette distribution a t interrompue ImageFlow est une tentative de construire un environnement de d veloppement pour ImageJ bas sur la programmation visuelle ImageJ l indispensable compagnon de bioimagerie Depuis les r centes d couvertes des prot ines fluorescentes et l apparition de nouvelles g n rations de microscopes haute r so lution 3D nous sommes dans une nouvelle re celle de l imagerie de cellules vivantes 12 Cette capacit de diff rencier in vivo des composants cellulaires et leurs interactions l chelle mol culaire r v le la complexit de la machiner
26. d acc s semaine 14 I Windows Server 2008 3 IIS SharePoint Server semaine 15 I Windows Server 2008 4 Terminal Server Remote Desktop Services semaine 15 I Windows s curit protection d acc s r seau semaine 18 I Windows s curit protection d acc s r seau semaine 18 I Windows Administration des serveurs et des stations de travail Windows pour d l gu s semaine 19 E Windows 7 1 Installation et configuration semaine 19 LabVIEW ou l acquisition de donn es E Corel semaine 17 I FPGA semaine 18 Programmation I PERL level 1 Eng semaine 16 I MPI an introduction to Parallel Programming Eng semaines 16 et 19 I intro la programmation pour iPhone et iPad semaine 19 Linux I Administration Linux RHEL Fedora UBuntu Eng semaine 17 Bureautique E EndNote introduction et importation de r f rences bibliogra phiques semaine 14 PowerPoint 2010 3 diaporama rapido semaine 14 Word 2011 les longs documents semaine 17 Excel 2010 2 feuilles de calcul semaine 17 Outlook 2010 calendrier t ches et notes semaine 17 Dreamweaver CS5 introduction semaine 18 FileMaker Pro 11 semaines 17 18 19 cours dit epfl ch Impressum Revue consacr e aux technologies de l information dit e par le Domaine IT de l EPFL DIT Les articles n engagent que leurs auteurs sauf ceux qui concernent de facon vidente des prestations officielles sous la responsabilit du DIT ou d autres ent
27. dans un bar d une petite ville du nord de l Italie d montre le fabuleux instrument d mancipa tion que repr sente la conjugaison de l ouverture du logiciel et du hardware avec le d veloppement d Internet Du Fablab de Lucerne 15 au futur Fablab de Neuch tel 16 en passant par les Hackerspaces de Lausanne ou de Gen ve vous aurez toujours les moyens de donner jour vos id es l re num rique dans laquelle nous sommes a ses maux terrifiants elle a aussi ses rem des miraculeux l Arduino l uvre R f rences L article comporte de nombreuses r f rences qui vous conduiront en trouver bien d autres 1 arsindustrialis org 2 fr wikipedia org wiki La_Cath drale_et_le_Bazar 3 massimobanzi com 4 processing org 5 flasinformatique epfl ch spip php article2483 6 arduino cc en Main Software 7 thingm com products blinkm 8 fr wikipedia org wiki Jean Daniel_Nicoud 9 makezine com 10 shop snootlab com 11 arduino cc 12 www ppur org livres 978 2 88074 942 2 html 13 en wikipedia org wiki Open_hardware 14 fr wikipedia otg wiki Mat riel_libre 15 luzern fablab ch 16 www fablab neuch ch J en ajoute encore deux concernant un sujet dont je n ai pas parl la liaison entre un circuit Arduino et un smartphone Android E wiki processing org w Android E www amarino toolkit net Article du FI EPFL 2012 sous licence CC BY SA 3 0 R Timsit AE NER 15 Oo ES
28. de machines virtuelles La courbe ci dessus ne donne malheureusement qu une image fig e en fin d ann e du nombre de machines virtuelles actives Ainsi on pourrait croire qu en 2011 il n y a eu que 71 demandes de nouvelles machines alors qu en fait c est plus de 300 demandes qui ont t trait es Le graphique ci dessous montre la r partition des diff rents pro cessus du service depuis 2007 Le processus de snapshot a t ajout en 2009 il repr sente 10 des processus en 2011 En 2011 les trois principaux processus sont les cr ations 39 les modifications 28 et les suppressions 16 Nous garantissons que pour fournir une machine virtuelle stan dard avec ou sans OS il ne s coulera en moyenne pas plus de 3 jours en 2011 la moyenne est de 1 92 jour Pour les demandes sp cifiques aucune limite de temps n est pr vue pour 2011 ces machines qui n cessitent des changes entre utilisateurs et administrateurs du service ont t fournies en moyenne en 2 27 jours E supression snapshot modification E mod lisation cr ation E clonage snapshot snapshot 13 supression T cr ation 221 E 4 cr ation 134 cr ation 144 cr ation cr ation 90 OLET 2007 2008 2009 2010 2011 R partition des processus du service 27 MARS 2012 N 3 32 122 17 18 Cloud priv de l EPFL bilan et perspectives Les facult s disposent d un quota annuel de machines virtuelles Dans
29. de sa documentation on constate d embl e un outil bien conceptualis solide et abouti Capable de produire na tivement du XHTML ou du HTML il est de plus en mesure d ajou ter une grande vari t de formats de pr sentation tr s r pandue incluant par exemple PDF EPUB pr sentation diapositive HTML HTML slideshows ou encore le format page de manuel Unix et tout ceci en partant d un m me fichier de texte txt Installation Dans la mesure o AsciiDoc est disponible sous forme de paque tage pour la plupart des distributions GNU Linux et dans l arbre des ports pour BSD il s installera sans coup f rir En prenant AsciiDoc directement son d p t on a l avantage d obtenir la derni re version en date sans attendre la mise jour des paquetages propos s par les distributions et de l installer localement sur le dossier de d part ou globalement au niveau du syst me pour tous les utilisateurs Comme AsciiDoc occupe peu d espace moins de 3 Mo tout compris on peut envisager de l inclure dans un d p t Git au m me titre que la production docu mentaire produite on aura ainsi p rennis l ensemble documen taire en ayant de ce fait l outil au m me endroit que la mati re M me si l installation AsciiDoc sous Windows n cessite l installa tion pr alable de Python cette tape ne devrait pas d courager un r dacteur press Tout le reste est d j disponible sur tous les syst mes savoir un diteur de texte
30. de traitement d images et qu il pouvait servir de plate forme d change pour nos collaborations avec les cher cheurs en sciences du vivant Au BIG nous avons port plusieurs nouveaux algorithmes sous forme de plugins fig 6 sous licence citationware Certains ont t d velopp s par des doctorants d autres par des tudiants 14 image Orientation Measure C1 x8769 1_Image006 40_hrm tif OST JOUR TES Create Mask Options Measure 2 No IXc iYc Zc ZonelElli Prefilter Energy Orientat Cohere 1 39 1722 1M M 0 00 206 80 86 85 0 239 2 176 54 1 M M 0 00 106 55 57 66 0 681 3 271 141 1 M 0 00 335 32 21 20 0 652 4 182 124 m M 0 00 106 41 82 37 0 417 S 242 2100 1 M M 0 00 157 51 75 71 0 386 6 260 300 1 M 0 00 191 40 78 36 0 562 7 204 382 1 M 0 00 103 77 52 52 0 565 8 137 423 1 M 0 00 67 48 49 36 0 687 9 123 242 1 M M 0 00 140 97 56 87 0 461 mage golap AEA e Refresh Copy Results Remove About M Mesure 30m a Close p Circular histogram of local orientations nd 800 EM pe A fa 30 90 fig 6 montage illustrant l analyse directionnelle d images En haut un outil mesure l orientation locale des fibres Au centre le plugin Orientation donne la distribution des orientations des fibres de collag ne En bas le plugin Monogenic repr sente l information d orientation dans diff rentes chelles obtenues par une d composition en ondelettes orien
31. dum nullam massa lacus molestie ut libero ne 1 Section Maecenas aliquam maecenas ligula nostra accumsan taciti 1 1 Sous section Nisl rhoncus turpis est vel elit congue wisi enim nunc ultricies sit magna tinci Quam etiam erat Suspendisse morbi LM 3 Tortor vitae tortor eros wisi facilisis 1 2 Ligula suspendisse nulla pretium Tableau 1 Liste des trenza uf efed en ae Justo fermentum id Malesuada eleifend tortor molestie a fusce a vel et Mauris faucibus adipiscing vivamus in Exemple 1 Titre lacus vestibulum Voici l exemple enim eros in vel Illustration du logo de l PFL p ECOLE POLYTECHNIQUE FEDERALE DE LAUSANNE Version 1 0 Derni re mise jour 2012 03 02 07 22 44 MET Contenu Le contenu textuel permet de d velopper la mati re dans son ensemble I est constitu d une suite de paragraphes et de blocs contenant le texte Les paragraphes sont simplement s par s par des lignes vides et les blocs sont envelopp s en d but et en fin par un d limiteur habituellement une suite de quatre caract res Les formes les plus courantes de bloc sont celles ci I Les paragraphes qui sont des blocs de texte qui commencent et finissent par une ligne vide E Le texte litt ral o chaque ligne commence par une indentation avec au moins un ou plusieurs espaces Ce type de bloc pr sente le texte sans modification avec une police chasse fixe I Dans les listes et num rations chaque
32. ee ae MI TE 0 Pt Justo rermentum ic Malesuada eleifend tortor molestie a r ugce a vel et Mauris at suspendisse neque aliquam tfaucibus t adipiscing yivam s in s o Ticre lacus veertibulum Voici l exemple enim eros in vel aseran da oeo de R image lise Oo oLPLE pne heint 100 Rin du document Sans entrer trop dans les d tails un document source se structure d une s rie de blocs d l ments en commen ant par un en t te suivi d un pr ambule et de sections Les l ments en ligne agissent dans l l ment bloc de type contenu textuel en accomplissant des t ches de formatage et de substitution En t te et pr ambule Il contient le titre du document les informations relatives l au teur ainsi que le suivi de l volution du document par le num ro et la date de la version Si l on choisit de regrouper la documen tation avec un logiciel de gestion de versions celui ci marquera la version l aide d un trigger chaque action de check in du document L en t te permet en outre de qualifier la langue plac e dans le document de pr sentation produit Le pr ambule sert pr senter la mati re tout en tant facultatif Sections Un document source est fractionn en sections et jusqu quatre niveaux de sous sections chaque section son titre form d une ou deux lignes selon la syntaxe se retrouve sans surprise dans la table des mati res WARNA A pa pi Ac dolor ac adipiscing amet biben
33. eijering est un plugin pour le trac interactif de l arbre dendritique d un r seau de neurones ImageJ l EPFL Des dizaines de laboratoires de l EPFL utilisent quotidiennement Image comme d autres instituts ou d autres entreprises ImageJ est tr s r pandu dans les plates formes de microscopie comme celle de la Facult SV la plate forme technologique de bio ima gerie et imagerie optique PTBIOP Dans le laboratoire d imagerie biom dicale BIG Biomedical Ima ging Group du Prof M Unser nous avons pris le virage ImageJ en l an 2000 en premier lieu pour r pondre aux besoins de l enseigne ment Nous avons mis en place une structure simple et didactique pour enseigner le codage des algorithmes usuels de traitement d images en nous appuyant sur une Classe ImageAccess que nous avons d velopp e 13 Dans le cadre des cours de Master Image Processing I et Il nous organisons des s ances de laboratoire qui se d roulent sur trois heures et en temps limit Chaque ann e ce sont presque cent cinquante tudiants au premier semestre j i et cinquante tudiants au second semestre qui suivent ces cours Tous ces tudiants sont amen s impl menter individuellement des algorithmes en Java et les tester sur des images En observant les performances la stabilit et la convivialit d Image nous avons compris que ImageJ offrait galement un excellent environnement de travail pour d velopper de nou veaux algorithmes
34. emin gt lt le fichier gt html Le m me document source se transcrit au format PDF en passant par l outil de gestion de transcription a2x de la suite logiciel Ascii Doc Il en r sulte un document de type DocBook au format PDF Ha r e a a a Ole reset Cependant au moins les logiciels DocBook et dblatex devront tre pr sents sur le syst me Ils s installent rapidement avec la com mande en ligne sudo yum install asciidoc dblatex SOUS Fedora et sudo apt get install asciidoc sous Ubuntu Publication Une fois le fichier de pr sentation disponible il peut tre employ tel quel dans un Wiki ou un site Web Afin de maintenir le style propre au site Web auquel la pr sentation est destin e on peut lui retirer sa feuille de style lors de la transcription en ajoutant les param tres s et unsafe De plus le fichier de pr sentation de vra contenir les marqueurs lt div class asciidoc gt en premi re ligne et son correspondant lt div gt en derni re ligne Maintenant le fichier XHTML est fin pr t pour tre publi Avantages E Prise en main tr s rapide sans connaissance pr alable du for mat de pr sentation E Le r dacteur dite le document source avec l diteur de son choix Pour certains diteurs la colorisation syntaxique est dis ponible en particulier vim 1 E La publication d un site Web enti rement en AsciiDoc est envi sageable I Plusieurs th mes sont d j fournis et peuvent servir en cr er d autr
35. ence capables de percevoir des prot ines R f rences 11 12 13 14 15 16 17 18 RASBAND W mageJ National Institutes of Health Bethes da MD USA imagej nih gov ij ABRAMOFF M D et al Image Processing with ImageJ Bio photonics International 11 pp 36 42 2004 LINKERT M et al Metadata Matters Access to Image Data in the Real World Journal of Cell Biology 189 pp 777 782 2010 loci wisc edu software bio formats JAHNEN A ImageJ Information and Documentation Portal CRP Henri Tudor Luxembourg imagejdocu tudor lu CARDONA A TrakEM2 fiji sc wiki index php TrakEM2 AUSTENFELD M BioZ bio7 org SAGE D et al MIJ fiji sc wiki index php Miji BURGER W and BURGE M J Digital Image Processing Springer Verlag 2008 www imagingbook com BAILER W Writing ImageJ Plugins A Tutorial www gm fh koeln de konen WPF BV tutorial ImageJ_V1 71 pdf EDELSTEIN A et al Computer Control of Microscopes Using uManager Current Protocols in Molecular Biology 14 2010 valelab ucsf edu lt MM MMwiki SCHINDELIN J Fiji Is Just ImageJ Batteries Included fiji se VONESCH C et al The Colored Revolution of Bioimaging IEEE Signal Processing Magazine 23 pp 20 31 2006 bi gwww epfl ch publications vonesch0601 htmlI SAGE D and UNSER M Teaching Image Processing Pro gramming in Java IEEE Signal Processing Magazine 20 pp 43 52 2003 bigwww epfl ch teaching iplab EPFL BIG
36. ernal image max size 150 KB image format portrait 3x4 Choose File No file chosen My external photos choisir 27 MARS 2012 N 3 21 N N ES A votre service Ras al Khaimah Ecublens si loin et si proche Alaeddine ElFawal epfl ae EPFL Middle East Ras al Khaimah directeur de IT Administration EPFL ME is an off shore branch of EPFL in the Middle East Being 5000 Km away from Lausanne creates new challenges In this article we describe these challenges and we explain the measures we have taken to solve them L EPFL Middle East www epfl ae est un centre de re cherches de l EPFL Son loignement g ographique Ras al Khaimah impose un nouveau mod le pour r pondre des besoins sp cifiques Dans cet article nous allons d velopper cette particularit Vision r flexion et strat gie Int gration dans l EPFL l EPFL ME pr voit de nombreux changes de personnel acad mique avec l EPFL les tudiants Master voyageront plusieurs re prises entre les deux campus ainsi que les professeurs et les doc torants Le Blended Learning aura lieu pour les programmes Master et PhD En outre les chercheurs de l EPFL ME auront besoin des ressources informatiques du campus lausannois Pour rendre possible cet change l infrastructure RAK doit tre bien int gr e dans celle de Lausanne Nous l avons donc con ue comme une extension de celle de Lausanne pour permettre une transiti
37. erordi nateurs mais il est maintenant devenu connexion fibre au sens m dia de transport une fibre optique est un fil en verre ou en plastique tr s fin qui a la propri t d tre un conducteur de la lumi re et sert dans la transmission de donn es Pour plus de d tails fr wikipedia org wiki Fibre_optique FCoE Fibre Channel over Ethernet technique de r seau de stockage SAN consistant faire passer les trames du protocole Fibre Channel sur un r seau Ethernet La norme FCoE a t publi e en juin 2002 Pour plus de d tails fr wikipedia org wiki FCoE g ai m m z m y ml i E E FE LE le protocole standard des SAN Pour plus de d tails fr wikipedia org wiki R partition du nombre de machines virtuelles au 09 f v 2012 Et pour la suite Du c t de l infrastructure le site Web utilisateur est en cours de re d veloppement La nouvelle version profitera du travail d j r alis pour les sites mynas sanas et backup La nouvelle version devrait tre en production au d but de l t une pr sentation sera organis e avant le passage en production La technologie FCoE d j pr sente en MA sera d ploy e au prin temps dans le nouveau centre informatique en INJ L hyperviseur sera mis jour au printemps pour la version la plus r cente vSphere 5 Cette version repousse les limites d une ma chine virtuelle 32 vCPU 1 TB de RAM et presque 2TB par disque vi
38. ersonnel d OS pour son sou tien et son enthousiasme pour ce projet et je cite en particulier Nils Panchaud Nils Rinaldi Nicolas Vuill me et Stefan Arnet Je remercie Eliette Zingre pour les bons changes que nous avons eus et pour le soutien qu elle m a apport Finalement je tiens remercier tous ceux qui ont aid mener bien le d partement IT de RAK Blended Learning enseignement qui m lange les m thodes traditionnelles cours magistral et les activit s sur ordinateurs le futur site de RAK sur le sable ISSN 1420 7192 Mi MA lN
39. es donnant une empreinte propre l organisation s ex posant sur le Web I Se marie ais ment un logiciel de gestion de version d cen tralis afin de travailler plusieurs et ainsi viter les conflits d dition concurrente E L int gration d illustration ne pose pas de probl me et utilise les formats standards I L organisation du document source permet de clairement s parer le style de pr sentation et le contenu de la mati re pr senter I Cha ne de publication tr s courte et automatisable scripts ou MakeFile I Feuille de style CSS A pr vue pour contourner les incom patibilit s de l explorateur IE6 Conclusion Cet article est encore loin de pr senter l ensemble des fonction nalit s d AsciiDoc mais en prenant un peu le temps d y go ter on aura rapidement l envie d adopter l outil et de produire des pr sentations vers d autres formats que XHTML comme EPUB Pour plus d informations E Installation d taill e pour tous les syst mes d exploitation www methods co nz asciidoc INSTALL html I Git un logiciel de gestion de version d centralis e FI 6 2011 flashinformatique epfl ch spip php article2316 E Diapositive slideshow en HTML csrp iut blagnac fr jmiweb site I G n ration de documents format s partir de texte clair andrewk webfactional com asciidoc php language_code fr E Aide m moire powerman name doc asciidoc L ensemble de l article AsciiDoc documents epfl ch users f fa
40. et user friendly et nous vitons ainsi tout d veloppement trop lourd vu la petite taille de l EPFL ME Choix de mat riel comme vous le verrez dans les sp cifications techniques notre mat riel est choisi d une mani re d livrer une infrastructure compacte tout en assurant flexibilit et efficacit One Stop Shop vu notre petite taille le d partement IT est de venu un one stop shop pour assurer une gestion efficace de l infrastructure et des ressources Il regroupe tous les services li s l IT y compris les parties serveurs r seaux impressions Ras al Khaimah Ecublens si loin et si proche t l phonie IP audiovisuel et l infrastructure pour le contr le d acc s Ceci permet un changement et ou une impl menta tion plus rapide des solutions potentielles assure une compa tibilit entre les diff rents services et l infrastructure IT ainsi qu une meilleure conformit avec les strat gies de l EPFL ME Autonomie Une infrastructure int gr e la fois avec celle de Lausanne et localement avec celle des mirats facilite l interaction de l EPFL ME avec son environnement Mais cette int gration n implique jamais la d pendance Notre infrastructure est autonome et g r e localement avec des expertises que nous d veloppons progressi vement RAK si le VPN entre Lausanne et RAK tombe pour une raison quelconque notre infrastructure continue fonctionner Si la connexion vers Ankabut NREN local est co
41. geJ Daniel Sage epfi ch EPFL STI Biomedical Imaging Group BIG responsable des d veloppements logiciels ImageJ Fiji Domaine Traitement d images et analyse d images Licence langue version Image do anglais 1 46f maine public Fiji GPL v2 ImageJ2 pas encore d fini Autres alternatives libres CellProfiler 42 A f Z f BiolmageXD 49 ICY WG A Alternatives non libres Metamorph 7 My Imaris a Sites Web ImageJ rsb info nih gov ij Fiji fiji sc ImageJ2 developer imagej net Plates formes Ay _ LNA Image est un fascinant logiciel de traitement d images et d ana lyse d image scientifique 1 autant par ses fonctions intrins ques que par le riche ensemble de fonctions d livr es sous forme de plugins Derri re une interface quelque peu d su te Image cache des fonctions simples d acc s directes et puissantes pour l analyse d image Ce logiciel s utilise dans tous les domaines scientifiques bien qu un accent particulier soit mis sur l imagerie biom dicale Dans un esprit totalement altruiste ImageJ a t d pos dans le domaine public Image poss de un m canisme simple pour la cr a tion de plugins Des centaines de traiteurs d images de program meurs de chercheurs avertis et d utilisateurs un peu d brouillards ont r alis des plugins et ont mis leurs contributions en ligne Que fait ImageJ Passer en
42. gins de rendu 3D ils demeurent n anmoins moins efficaces et moins interactifs que les logiciels sp cialis s I Retoucher une photo ou un montage Photoshop ou GIMP sont meilleurs pour cette t che Produire une analyse statistique Typiquement dans une cha ne compl te d analyse d images les r sultats bruts sont extraits par ImageJ et stock s sur fichiers Ils sont ensuite repris par un logiciel d analyse de donn es comme MS Excel Open Office Calc Matlab Octave ou R E R soudre directement votre probl me d analyse automatique d images Il est plut t rare qu une t che d analyse d images entre simplement dans une cat gorie standard IlI faut alors recourir au d veloppement d un programme sp cialis par macro ou par plugin et c est l qu intervient la programmabi lit de ImageJ D veloppement atypique Jusqu aujourd hui le d veloppement de ImageJ a repos sur les paules d un seul homme Wayne Rasband du National Ins titutes of Health En 1997 Wayne Rasband avait d j un logiciel d analyse d images tr s populaire mais tournant uniquement sur Macintosh NIH Image Il fait alors le pari risqu l poque de le porter en Java Ceci deviendra ImageJ Gr ce Java ImageJ devient naturellement un logiciel multi plateforme ce qui va en d cupler les usages D s sa conception ImageJ a t construit avec une architecture logicielle capable de recevoir des plugins un concept assez nova teur l poq
43. ie de la cellule La bioimage rie est la source de donn es hyper volum trique souvent jusqu 5D les trois dimensions spatiales la dimension multichannel et le temps 27 MARS 2012 N 3 D Analyse d image scientifique le monde ImageJ Dans ce nouveau secteur en permanente volution les logiciels commerciaux ont surtout brill par leur absence ImageJ s est im pos naturellement comme le logiciel ouvert et il demeure l outil privil gi pour l analyse d images en sciences du vivant titre d exemple on peut citer quelques applications o ImageJ Fiji se d marque Colocatisation observation des recoupements dans diff rents canaux fluorescents plugins JACoP Colocazation Cytom trie extraction des cellules ou des composants nucl aires en 2D ou 3D plugins TrakEM2 mage based Tool for Coun ting Nuclei Segmentation couleur segmentation bas e sur la couleur plu gins Threshold Colour Color Segmentation Color Inspector 3D Trac de neurone reconstitution de la morphologie neuronale fig 5 plugins Neuron J NeuriteTracer Super resolution by photoactivated localization localisation de mol cules fluorescences photo activ es PALM permet tant de gagner un ordre de grandeur dans la r solution spa tiale plugins Octane QuickPALM UV Lasers for Biotechnology BIOPHOTONICS mws INTERNATIONALS fermt Get the picture with Image Virtual Colonoscopy OCT fig 5 NeuronJ Erik M
44. ies de tous genre gr ce sa facilit d apprentissage il satisfait autant le pro grammeur chevronn qu une personne qui ne serait pas un pur programmeur Malgr les volutions permanentes de Java ImageJ est toujours compatible avec les toutes premi res versions du langage Cette volont de stabilit explique l interface d pouill e d ImageJ Quelques passerelles existent entre ImageJ Java et d autres envi ronnements vers MySQL vers Javascript vers Python vers ITK vers R avec Bio7 6 vers Matlab avec MIJ 7 et vers des pro duits commerciaux comme le logiciel de visualisation Imaris de Bitplane Andor Programmation macros ou plugins 000 Results l XM YM 239 1156 149 49 369 82 113 21 0 240 1231 150 43 369 87 52 73 29 72 108 70 0 62 241 1354 152 30 368 53 54 83 31 44 97 03 0 75 242 1456 152 56 363 30 58 68 31 59 69 68 0 69 243 1350 151 93 362 26 53 62 32 05 38 44 0 73 244 1347 151 85 362 52 54 24 31 62 11 80 0 75 245 1283 147 06 361 14 5204n a aana 246 1298 147 03 361 30 52 58 247 1303 147 12 361 49 52 47 90 248 1304 146 84 361 45 52 64 124Q 1239 14115 ISASA 47013 O sample tracking mouse tif pa070101220 400x400 pixels 8 bit 2 60e tracking single object txt ImageJ macros Tracking one object in a binary sequence of image Daniel Sage Biomedical Imaging Group EPFL Lausanne Switzerland Preprocessing setThreshold 0 41 run Median radius 3 stack
45. informatique epfl ch spip php article2464 E PP Pr sentation des logiciels Maplesoft Nicolas Cottereau ncottereau maplesoft com lundi 23 avril 2012 14h 17h salle de conf rences du DIT MA AO 364 accueil d s 13h45 Pr sentation de Maple 30 min E Ecriture naturelle et intuitive d expressions analytiques E Manipulations et r solutions symboliques de probl mes ma th matiques I Calcul num rique utilisant les nombreuses biblioth ques int gr es Maple I Visualisation avanc e I Cr ation de documents techniques interactifs et connectivit avec des programmes externes Les nouveaut s de Maple 15 16 30 min Calcul interactif Calcul parall le et performances am lior es Trac s graphiques intelligents Gestionnaire de variables Nouveaux algorithmes de calcul pour les quations diff ren tielles l optimisation la g om trie diff rentielle les matrices Creuses I Nouvelles applications math matiques interactives I Nouveaux outils de connectivit E iPad Player Pr sentation de MapleSim 1h00 I Construction d un mod le physique multi domaine et simula tion I G n ration automatique des quations du mod le et exporta tion dans Maple I Construction d un bloc utilisateur partir d un jeu d quations sous Maple I Analyse du syst me sous Maple temporelle fr quentielle sensibilit I Connecteurs permettant d exporter les mod les vers d autres environnements P
46. infrastructure r seau ANT PANNES 23 Ras al Khaimah Ecublens si loin et si proche et t l phonie En cas de panne lectrique les UPS commu niquent avec les serveurs physiques et machines virtuelles et ordonnent un graceful shutdown Le runtime des UPS est d une heure environ Nos serveurs tournent en tant que machines virtuelles sur l en vironnement de production Ils sont bas s sur Windows server 2008 R2 Parmi les serveurs install s citons radius OTRS ser veur de fichier et VCenter Nous avons test l environnement de virtualisation Hyper V par Microsoft mais il ne r pond pas nos besoins nous avons donc adopt celui de VMWare Tout en tant compacte cette architecture est flexible elle peut supporter jusqu quatorze serveurs lames au lieu de quatre ac tuellement Elle est efficace cause de l utilisation de l environ nement virtuel elle supporte jusqu 15 serveurs virtuels sur les deux serveurs physiques de production En outre elle assure une double s curit travers le syst me de backup et les UPS Support IT Un serveur OTRS a t mis en place pour assurer un bon suivi des probl mes IT Un ticket est ouvert lors d un envoi d un email it support epfl ae I sera class automatiquement selon sa priorit Audiovisuel Vid oconf rence notre syst me de vid oconf rence mobile est compos de lifesize 200 express Il supporte les deux stan dards H 323 et SIP et assure une qualit de
47. it s Toute reproduction m me par tielle n est autoris e qu avec l accord de la r daction et des auteurs R dacteur en chef Jacqueline Dousson fi epfl ch Mise en page amp graphisme Appoline Raposo de Barbosa Comit de r daction Jean Daniel Bonjour Patrice Fumasoli Florence Hagen Laurent Kling Julia Paolini Fran ois Roulet Christophe Salzmann Richard Timsit amp Predrag Vicei Arr t d finitif du service Usenet News Le Domaine IT a d cid d interrompre le service News d s le 1er juin 2012 pour les raisons suivantes E SWITCH a arr t son service et ne fournit plus les News depuis quelques mois E la technologie est vieillissante et son utilisation l EPFL r gu li rement d croissante principalement en ce qui concerne les forums locaux epfl I de nouveaux outils de communication remplacent certaines fonctionnalit s des News blogs forums Web E le mat riel h bergeant ce service devait tre renouvel Les forums internationaux tels que fr ou comp restent libre ment accessibles depuis Google Groups groups google com En local pour les logements utilisez logement epfl ch et pour les jobs tudiants utilisez myjob epfl ch tant donn qu il n y aura aucune archive profitez de ces quelques mois pour r cup rer d s maintenant les messages qui vous int ressent en utilisant le serveur actuel Franck Perrot epfl ch Domaine IT propos du mail Dor navant p
48. l ment commence par une puce un nombre ou une lettre Le bloc liste par un tiret simple ou un cinq ast risques suivis d un espace et du texte pouvant s tendre sur plus d une ligne Un titre peut tre ajout chaque bloc ou paragraphe avec au dessus du bloc une ligne commen ant par un point suivi du texte Joindre Le formatage du texte n est pas tr s riche mais suffisant pour augmenter le relief de la pr sentation avec les attributs de polices ordinaires italique gras chasse fixe exposant ou indice AU EMUPENER 9 Consectetuer arcu ipsum ornare pellentesque vehicula in vehicula diam ornai AsciiDoc pour la production rapide de documents Production Une fois la r daction termin e du document source AsciiDoc contenu dans un fichier dont le nom se termine par txt res pectant le jeu de caract res UTF 8 par d faut la transcription se lance en ligne de commande Auparavant on aura pris soin de cr er un dossier contenant le document source un sous dossier images regroupant les images r f renc es et un dernier sous dos sier images icones qui est une copie de celui que l on trouve dans l arborescence AsciiDoc Hasciidoc a dara uri a eoi 2 toc nuire tichier tzt La commande produit un fichier de pr sentation XHTML dans le m me dossier que le document source et portant le m me nom mais avec l extension htm1 La pr sentation s affiche directe ment avec un navigateur Web en prenant l URL file lt le ch
49. lic de nouvelles machines en plus de celles d j existantes dans notre cloud priv et ce si possible de mani re transparente pour l uti lisateur Conclusion Pour conclure cet article je souhaiterais simplement remercier tous les collaborateurs du groupe exploitation du DIT qui ont par ticip la mise en place de ce service le font vivre au jour le jour et voluer pour la plus grande satisfaction de ses utilisateurs En commen ant par son responsable Jean Claude De Giorgi puis par ordre alphab tique Patrice Beaud Lucien Chaboudez ric Krejci Julia Paolini et Alexandre Van Meteren J encourage aussi tous les utilisateurs de machines virtuelles t moigner aupr s de leur coll gues du temps qu ils ont gagn en ne s occupant plus d installer de maintenir et de remplacer des machines physiques J Agenda Et n oubliez pas si vous avez des questions sur le service de vir tualisation vous pouvez contacter les administrateurs l adresse vmadmin epfl ch ils se feront un plaisir de vous renseigner R f rences 1 P renne IT La virtualisation aide t elle la r duction du r chauffement climatique FI SP 08 flashinformatique epfl ch spip php article1516 2 Virtualisation 2 me partie FI 6 07 flashinformatique epfl ch spip php article1298 3 Configuration maximums for VMWare vSphere 5 0 www vmware com pdf vsphere5 r50 vsphere 50 configuration maximums pdf 4 HPC dans le Cloud FI 7 11 flash
50. migra tion et des co ts fixes Elle ne reproduit pas dans le long terme les r ussites des modes op ratoires ant rieures Elle pourrait tre tout simplement le fossoyeur de la M moire quand on lui oppose les exigences d authenticit d int grit et de lisibilit des donn es Pire elle pourrait nous rendre amn siques Le diagnostic a mis du temps CHoMP tre tabli les promoteurs et les utilisateurs de l informatique ayant constamment fait valoir les facilit s dans les changes les capacit s croissantes du stoc kage et l acc s en temps r el et chaque instant d un point de connexion l information l eldorado informatique d autres voix dont en particulier celle des archivistes oppose le chaos docu mentaire Des solutions matures commencent surgir et tre pratiqu es Elles font appel l harmonisation des pratiques et la mutualisation des ressources Le d fi relever est global il exige des strat gies SLA g n rales et ia nationales si ce n est internationales Il est heureux de relever que les administrations publiques en particulier la Conf d ration suisse et celle de plusieurs cantons ont r cemment introduit des politiques d archivage p renne leur organisation a d tre repen s e les proc dures et les processus ont t harmonis s et sont contraignants le personnel b n ficie de formations continues La prise de conscience passe l
51. nces pr c dentes si elles sont encore utilisables Si vous avez donc besoin de l un de ces logiciels faites simplement une demande au help desk du DIT En cas de probl me n h sitez pas appeler le help desk du DIT t l phone 1234 ou email 1234 epf ch E g f 7 my bs i zi ni mp F p ii I a Al HJ Analyse crois MEMOIRE Gilbert Coutaz vd ch directeur des Archives cantonales vaudoises Esteban Rosales bluewin ch g ologue et illustrateur Martin Quwehand epfl ch EPFL informaticien au Domaine IT Un mot m moire quelques regards archiviste informaticien et illustrateur M moire valeur talon GC Nous vivons plusieurs paradoxes avec la g n ralisation des tech nologies informatiques dans les changes et la globalisation de l information Si nous n avons jamais dispos d autant d informa tions la fois ni aussi rapidement celles ci n ont jamais t aussi fragiles et volatiles en raison de l obsolescence des technologies et de l inconstance des standards et des environnements Pour la premi re fois dans l Histoire les donn es ne sont plus solidaires d un support physique la d mat rialisation rend complexe et pr coce tout dispositif de capture et de maintenance des donn es L informatique constitue ce jour un outil r trograde dans la conservation et la p rennisation de l information dans la mesure o elle impose des calendriers rapproch s et r guliers de
52. nde ImageJ Image poss de une large panoplie d op rations usuelles de traitement d images dites pointwise et de transformation d his togramme Dans ce cadre une fonction Image Calculator qui au premier abord semble banale s av re en pratique tr s utile et intuitive Elle permet de combiner des images pixel pixel avec des op rations exactement comme on pourrait le faire avec des nombres fig 1 Les op rations de filtres dans le domaine spatial font partie de ImageJ aussi bien les filtres lin aires classiques que les filtres mor phologiques Pour la segmentation d images la fonction pr f r e des utilisateurs est Analyze Particles qui apr s binarisation va extraire tous les composants connexes objet d une image et caract riser leurs formes et leurs dimensions Un avantage de Image est la possibilit d appliquer certains trai tements dans une troisi me dimension Celle ci peut indiff rem ment repr senter le temps pour les s quences d images films ou une dimension spatiale suppl mentaire z stack pour les donn es volum triques qui sont courantes en imagerie biom dicale et ce que ImageJ ne fait pas Dans le monde des logiciels d imagerie num rique les genres sont souvent confondus et il n est pas inutile de mentionner ce que ne fait pas ImageJ I Acqu rir des images except pour les cam ras compatibles TWAIN FireWire Visualiser des images en 3D bien que ImageJ puisse tirer parti de certains plu
53. nne Apprendre pratiquer les objets techniques comme des instruments pour refuser un destin de consommateur de marchandises jetables tel est le sens que prend ce projet pour tous ceux qui de plus en plus nombreux empruntent ce circuit Gr ce un c ble USB la carte se connecte un ordinateur Linux Windows Mac sur lequel il suffit d installer le logiciel de d ve loppement disponible sur le site d Arduino 6 pour imm dia tement pouvoir lui faire faire ces choses dont nous parlions La carte poss de une quantit de ports sur lesquels on branchera les capteurs et actionneurs dont on aura besoin pour r aliser son projet Mesurer une temp rature une pression l humidit ou la radioactivit ambiante Faire tourner des moteurs programmer des LED RGB comme celles propos es par ThingM 7 Tout cela devient facilement r alisable si l on n est ni lectronicien ni infor maticien Le c ble USB fait fonction de cordon ombilical pendant la programmation C est lui qui alimente la carte Ensuite si le but du projet n est pas de fournir des informations l ordinateur le circuit devra tre aliment pour r aliser de fa on autonome son programme Les artistes qui ont os suivre ces pistes ont r ussi r aliser leurs d sirs les plus simples et ont trouv l aide n cessaire ou les partenaires ad quats quand les projets devenaient plus ambitieux Comme on pouvait s y attendre les hackers sont venus aider l quipe initiale
54. nne ou d une unit Parmi les changements majeurs par rapport la version pr c dente mentionnons Recherche plus pertinente l annuaire utilise les techniques de recherche floue bas es sur la similarit phon tique et les sug gestions a Google issues de pages Web les plus populaires Suggestions de noms de famille lors de la recherche de per sonnes partir de la troisi me lettre saisie dans le champ de recherche l annuaire propose une liste d roulante de suggestions corres pondant au terme de recherche Cette fonctionnalit est pour le moment pr sente sur search epfl ch nous l offri rons comme composant du bandeau de l EPFL utilisable donc dans les sites Web KERMIT LA GRE de l cole pe ln Recherche disponible travers des Orne webservices ouverts aux applications tierces Pagination de r sultats de recherche facilitant l utilisation de l annuaire et am liorant la lisibilit Nouveaut s pour le profil d une personne La recherche d une personne dans l annuaire nouvelle mouture aboutit sur une page qui pr sente la ou les fonctions prin cipales souhait es par la personne Exemple une personne qui est la fois professeur ordinaire doyen et responsable de quelques associations et qui d sire mettre en avant sa fonction de professeur peut masquer et ou r ordonner sur cette premi re page les autres accr ditations moins repr sentatives de son activit l EPFL Important cette page es
55. on transparente entre les deux campus les utilisateurs de Lausanne viennent RAK et b n ficient du m me r seau sans fil epfl ce qui leur permet de continuer leur travail comme s ils taient sur le campus lausannois De plus les m mes cartes Camipro sont utili s es dans les deux campus Une forte coordination entre le DIT de Lausanne et le d partement IT de RAK est mise en place pour garantir l int gration des nou veaux services en maintenant le standard suisse dans le cam pus de RAK malgr les milliers de kilom tres qui le s parent de Lausanne JR 4 n min E E W E E T emplacement de nos locaux provisoires RAK Int gration aux mirats l EPFL ME tout comme l EPFL Ecublens tablit des collaborations nationales au niveau des mirats ainsi qu internationales Le r le de d partement IT est de pr parer l infrastructure de communica tion n cessaire pour faciliter ce genre de collaborations Dans ce cadre plusieurs initiatives ont t prises Connexion physique l EPFL ME est connect e Ankabut le NREN National Research and Education Network local Quand cette connexion sera active dans deux mois environ l EPFL ME fera partie du r seau de la communaut acad mique nationale et internationale Communaut IT locale le d partement IT est un membre actif dans la communaut IT locale II fait partie du Higher Edu cation CIO Council ce qui lui permet d ouvrir avec les a
56. oration des donn es La v ritable fracture num rique sera entre la M moire du nanti et celle du pauvre l vidence les effets col lat raux de LR x Y g E PAA y f AARE Z AN oram 7 E 42 RSR ES amn l informatique n ont pas encore t tous mesur s leur juste titre La M moire s imposera de notre point de vue comme valeur ta lon dans l appr ciation des cons quences de l re technologique dans laquelle nous sommes entr s de mani re d finitive M moire et ant m meoire MO Les informaticiens appellent m moire tout moyen de stocker de l information digitale bien s r elle a t transform e d une mani re ou d une autre en suite de z ros et de un pour plus tard pouvoir y acc der la traiter la transformer avant de la stocker de nouveau peut tre dans une m moire d un type diff rent Il y a en effet toutes sortes de m moires qui se distinguent par la technologie utilis e lectronique magn tique optique et plus r cemment spintronique leur capacit la taille de l unit trai t e octet mot bloc leur rapidit le temps n cessaire acc der une quantit donn e d information par leur permanence ou leur volatilit cas o l information dispara t quand l alimentation lectrique est coup e la possibilit d critures multiples ou non le type d acc s direct ou s quentiel ce qui n est gu re le cas que pour les bandes magn tiques Pour
57. our I activer vote compte e mail epfl ch E changer votre adresse e mail E rediriger vos mails vers une autre adresse I v rifier l espace utilis de votre bo te E activer les gestionnaires d absence une seule interface ewa epfl ch tools D s le Ter avril 2012 le quota des bo tes tudiants sera port 1GB 500MB actuellement postmaster epfl ch Impression Atelier de Reprographie EPFL Tirage 4000 exemplaires Adresse Web flashinformatique epfl ch Adresse Domaine IT EPFL Station 8 CH 1015 Lausanne T l phone 41 21 69 32246 amp 32247 Abonnement au FI par e mail fi subscribe listes epfl ch CC Logiciel libre Image is a Java based image processing and image analysis software for scientific images Image is in the public domain It has made an important impact in biomedical imaging becoming the de facto refer ence Its open architecture has enabled the creation of hundreds of plugins which have sometimes inte grated the most advanced image processing tech niques ImageJ est un logiciel Java de traitement d images et d analyse d images scientifiques qui est dans le domaine public ImageJ a un impact important en imagerie biom dicale devenant de facto une r f rence Son architecture logicielle ouverte a permis la r alisation de centaines de plugins int grant par fois les techniques de traitement d images les plus avanc es Fiche descriptive Analyse d image scientifique le monde Ima
58. our faire des proposi tions visant transfor mer le poison en rem de Ars ndustrialis 1 d autres se sont empar s de toutes ces techniques num riques pour construire ce qui ressemble plus un bazar qu une ca th drale 2 mais qui avec le temps s av re fabuleusement important Le mot libre dans le titre de cette rubrique venait qualifier ce qui avait trait une activit purement Intellectuelle celle de l criture du logiciel Cette activit s est av r e de moins en moins immat rielle jusqu s introduire dans tous les objets qui nous entourent et qui commencent envahir nos corps en de nouvelles formes de proth ses Le choix d un objet technique commence donc d pendre intimement de notre conception de la libert C est dans ce contexte qu est n ce tout autre circuit oo Row mari t CRE Se y DIGITAL PWM E LOS fig 1 vue de face du circuit arduino cc en Main ArduinoBoardUno N DIT info Le DIT vous forme Dans notre site Web dit epfl ch formation vous trouverez semaine apr s semaine notre calendrier complet pour le 1er semestre consultez le r guli rement Plusieurs cours sont organis s Ja demande faites nous part de vos d sirs et nous ferons notre pos sible pour vous donner la formation correspondant au mieux vos besoins Voici un aper u des formations propos es prochainement Windows E Windows Server 2008 Cloud identit s et contr le
59. r sentation de MapleTA outil d ensei gnement et d examen en ligne 45 min Structure de MapleTA et principe de fonctionnement Cr ation de questions utilisant le moteur de calcul Maple Cr ation d examens avec notation automatique par Maple Gestion des r sultats avec le carnet de notes Pour vous inscrire allez sur www maplesoft com lausanne et parti cipez ainsi au tirage au sort pour gagner un cadeau Maplesoft E Manlesoft Mathematics e Modeling Simulation AXES 19 N ES A votre service personnes Un nouvel annuaire des lon Cionca epfl ch amp Maciej Macowicz epfl ch EPFL d veloppeurs Web au Domaine IT The new version of the EPFL directory recently up dated offers a unified vision of official and personal LER OUI EL CSL ELEC Set up according to web2010 graphical chart your profile management provides updated and new functions Get a glimpse here below or explore your personal profiles on people epfi ch La nouvelle version de l annuaire mise en produc tion le 22 f vrier permet d effectuer des recherches sur des personnes et des unit s de l EPFL Offrant une pr sentation conforme la charte graphique Web2010 le nouvel annuaire int gre d sormais l application people utilis e pour afficher les infor mations sur une personne particuli re Il offre une nouvelle pr sentation des informations et propose de nouvelles fonctionnalit s Nouveaut s pour la recherche d une per so
60. r toutes les combinaisons possibles des ressources Les ressources demand es sont garanties contrairement au cloud public qui pour d videntes raisons financi res partage au maximum les ressources physiques entre les machines virtuelles Comme l augmentation des ressources ne prend que quelques mi nutes il est bien s r recommand de commencer avec la machine la plus petite possible et d augmenter les ressources en fonction des besoins des statistiques d taill es des ressources consom m es par les machines sont disponibles en temps r el pour les utilisateurs L utilisateur a aussi acc s une console bien utile en cas de plantage de l OS de la machine virtuelle volutions techniques 2007 2012 En 2007 les machines virtuelles fonctionnaient avec la version 3 de l hyperviseur de VMWare ESX Les serveurs pour l hyperviseur taient des Dell PE6950 quadri processeur bi cores AMD 64 bits avec 32 GB de m moire vive 6 connexions pour r seau IP 1Gbps et deux connexions fibre 2Gbps pour le r seau de stockage Les disques des machines virtuelles taient stock s sur une baie EMC Depuis son ouverture en 2007 tous les composants de l infrastruc ture sous jacente ont volu librement et chacun leur propre rythme de mani re quasi transparente pour les utilisateurs Les quatre g n rations de serveurs qui se sont succ d es PE6950 R805 et R805_2 R715 ont permis de passer de onze machines virtuelles par serve
61. ravail collaboratif peut offrir Je voudrais cependant vous inviter oser vous lancer sans vous ruiner car Massimo a tenu son pari l clairage est en pleine r volution les LED offrent de nombreux avantages qui surpasseront bient t les inconv nients qu un ensei gnant de l EPFL descendant direct des lumi res a su mettre en vidence dans un beau petit livre 12 Le sch ma donn par la BlinkM MaxM Ww V m XD CO HT UN Pug NGU D u3M0d S 4 INY GND ce BlinkM BlinkM MinM fig 3 montage d un BlinkM sur Arduino Arduino l autre circuit soci t ThingM pour programmer les composants de la famille BlinkM dont j ai donn les r f rences un peu plus haut avec un Arduino montre bien la simplicit laquelle on peut arriver Moyennant quelques petites astuces de conception et de pro grammation il est possible de placer les platines de LED directe ment sur un bornier de l Arduino pour les programmer Utiliser un ou plusieurs BlinkM MinM pour se fabriquer un clairage original dont la lumi re variera dans le temps selon un certain programme avec des couleurs bien d finies devient extr mement simple il suffit d ins rer ce qui deviendra la source lumineuse sur l Arduino comme indiqu dans les sch mas et de les programmer sur son ordinateur On peut aussi utiliser l Arduino pour programmer un MaxM tou jours de ThingM et en faire un gradateur de bande LED RGB
62. rmis l mergence de diff rentes distributions qui rencontrent un grand succ s dans leurs domaines respectifs ImageJ le classique La version Image du NIH est la plus l g re Pour un Mac la ver sion actuelle 1 46f ne p se que 5 5 Mo autant dire qu il faut moins d une minute entre l intention d utiliser Image et l ouver ture de la premi re image sur ImageJ Pas de librairie exotique Installer pas de DEL Tout Image est contenu dans un seul r pertoire que l on peut d placer La version pour Windows vient avec une machine virtuelle Java JVM ou JRE ainsi tout marche apr s quelques clics Manager le pro pour l acquisition uManager est un logiciel open source licence BSD Lesser GPL pour le contr le et l automatisation des t ches d un microscope 10 Combin avec ImageJ il offre une large gamme de pilotes drivers pour les microscopes les plus communs pour les cam ras scientifiques les plus courantes et pour les actionneurs motoris s de platine de microscopes Fiji Fiji is just ImageJ batteries included Fiji est un logiciel open source sous licence GPL enti rement bas sur ImageJ I est h berg sur un GIT version control par une pe tite communaut de d veloppeurs passionn s 11 On y retrouve tout ce qui fait ImageJ compl t par un ensemble coh rent et document de plugins d di s aux sciences du vivant et par de nombreux langages de scripting tels Javascript Jython Jruby Fiji est
63. rtuel Pour plus de d tail voir 3 Nous avons pendant l t 2011 compar les caract ristiques et le prix du cloud priv de l EPFL aux offres du cloud public Amazon Les r sultats ont montr qu caract ristiques identiques et pour une utilisation permanente pendant un an le prix d une machine virtuelle chez Amazon tait 30 plus cher que celui d une ma chine h berg e dans notre cloud priv Pour le calcul scientifique hautes performances actuellement point de salut dans le cloud public non plus 4 Cependant dans le cadre de d ploiements massifs mais de courte dur e l utilisation de ressources externes pourrait tre utile Nous allons donc tudier la faisabilit technique d un Hybrid Cloud SAS Serial Attached SCSI technique d in terface pour disques durs elle constitue une volution des bus SCSI en termes de performances et apporte le mode de transmission en s rie de l interface SATA Pour plus de d tails fr wikipedia org wiki Serial_Attached_SCSI SSD solid state drive mat riel infor matique permettant le stockage de donn es constitu de m moire flash Le terme anglais solid state signifie que ce mat riel est constitu de m moires semi conducteurs l tat solide par opposition aux disques durs HDD Pour plus de d tails fr wikipedia org wiki Solid state_drive Cloud priv de l EPFL bilan et perspectives c est dire la possibilit de d ployer dans un cloud pub
64. t sous la responsabilit de chaque personne pour rendre accessibles les principales informations de contact En suivant le lien SRI EEE EE on retrouve toutes les accr ditations actives dans l ordre officiel Depuis cette page il est aussi possible d acc der l interface de mise jour offerte par l application prestations de base 1 En haut de la page le bandeau menu rouge donne acc s aux in formations officielles et personnelles travers des onglets I Contact I Biographie amp travail en cours E Recherche E Publications I Enseignement et PhD Depuis la page qui est une page personnelle on arrive sur la page des fonctions accr ditations qui correspond l an cienne version de l annuaire La page contient les informations respectives pour les personnes ayant une activit d enseignement enregistr e aet L rente Un nouvel annuaire des personnes dans le service IS Academia ISA Les demandes de mise jour de ces informations doivent tre soumises au support ISA isa epfl ch Les pages BIXITETIIS et sont dis ponibles seulement pour les personnes ayant au sens de l accr ditation le statut personnel ou tudiant ou avec une fonction de type professeur h te acad mique doctorant ma tre d ensei gnement ou charg de cours ces pages reprennent plus ou moins les informations de l ancien people Pour la mise jour de ces informations il faut suivre le lien Login en bas
65. table steerable wavelets Images provenant du laboratoire LHTC de l EPFL PureDenoising d bruitage multi canaux bas sur des transfor m es en ondelettes wavelets DeconvolutionLab outil pour la d convolution 3D en microsco pie qui rivalise avec les produits commerciaux Analyse d image scientifique le monde ImageJ PSFGenerator cr ation de Point Spread Function 3D pour la microscopie EDF extension de profondeur de champ pour microscopie champ large TurboReg StackReg MosaicJ alignement d images et de s quences d images SteerableJ Orientation MonogenicJ analyse directionnelle par des ondelettes orientables Snakuscule Ovuscule famille de contours actifs snakes pour la segmentation SpotTracker suivi tracking de particules individuelles dans des images bruit es registration 2012 l ann e du renouveau pour ImageJ Wayne Rasband est d sormais la retraite Avec sa g n rosit habituelle il continue maintenir ImageJ et faire voluer Image en y int grant les contributions de d veloppeurs Main tenant tous les regards se tournent vers l quipe de ImageJDev 15 qui s est constitu e en 2010 autour d un projet f d rateur de d veloppement de la nouvelle g n ration d Image nomm ImageJ2 L ambition est de reconstruire toute l architecture logi cielle ImageJ y compris le mod le des donn es tout en garan tissant une presque parfaite r tro compatibilit backward com
66. ue Le succ s ne s est pas fait attendre De nombreux d veloppeurs se sont attel s la cr ation de plugins souvent pour leur propre usage et habituellement ils les mettent dis position gratuitement Toutefois en l absence de coordination et de contr le de qualit on trouve de tout dans le monde ImageJ des plugins au sommet de l tat de l art dans leur domaine aux plugins de quelques lignes non document s souffrant parfois de bugs D ailleurs le principal souci de l utilisateur est de se retrou ver dans la jungle des plugins Tout de m me il convient de sou ligner la courageuse tentative de documentation entreprise par le portail ImageJ 4 Ce d veloppement communautaire non hi rarchis a tout de m me permis des centaines de plugins de devenir tr s populaires tel point que l on peut consid rer Image comme une coquille r ceptacle de plugins Certains d entre eux sont si volu s qu ils sont plus grands que ImageJ lui m me l instar de TrakEM2 5 J comme Java Vous l aurez compris l trange J de ImageJ provient du langage de programmation Java dans lequel ImageJ est crit En traitement d images un ternel d bat oppose les partisans de C C ceux de Java En pratique Java se pr sente comme un excellent lan gage pour l imagerie rapide r gulier dans sa structure capable de manipulations graphiques m me s il pr sente quelques d fauts dans sa gestion de m moire Java est riche en librair
67. up e on profite de notre connexion vers l EPFL pour acc der travers SWITCH NREN Suisse aux r seaux acad miques internationaux Profiter des contrats cadres cause de sa petite taille l EPFL ME n a aucune marge de n go ciation pour les achats informatiques Elle n arrive m me pas attirer les grands revendeurs de la r gion qui seuls seraient ca pables d offrir des contrats de support d une qualit acceptable Pour surmonter ce probl me nous avons ouvert des canaux de communication vers les grands acteurs informatiques de la r gion par le truchement de Lausanne en profitant du poids de l EPFL en Europe et des contrats cadres qu elle poss de avec des entreprises comme Cisco DELL et HP Dans la plupart des cas nous avons r ussi obtenir le prix EPFL et profiter d un niveau de support acceptable Sp cifications techniques Infrastructure temporaire L EPFL ME a d but avec neuf personnes pour mettre en place l infrastructure de base pour accueillir le personnel acad mique Pour r pondre ses besoins informatiques imm diats une petite infrastructure IT temporaire a t mise en place comprenant I un acc s internet ADSL 100 Mbps M un serveur de fichier 11B RAID1 un UPS pour le serveur pour assurer un graceful shutdown en cas de panne d lectricit ce qui arrive souvent RAK I un serveur d impression I un acc s HPs distant utilis en particulier par la soci t char g e de notre compta
68. upr s de plusieurs unit s Lors du login Tequila celui ci me propose la liste de ces unit s mais selon le choix que je fais Distrilog m affiche une page Acc s refus Que se passe t il Cela signifie simplement que vous n tes pas accr dit avec le droit distrilog pour cette unit Actuellement Tequila proposera toujours la liste de toutes les unit s aupr s desquelles vous tes accr dit malgr le fait qu on lui exige le droit distrilog au login Je dois r installer un logiciel sur une machine mais je dois le re commander sur Distrilog2 alors que je l avais d j command sur Distrilog1 Le logiciel sera t il d compt deux fois Non Dans un d lai raisonnable tous les logiciels com mand s sur Distrilog1 devront tre rapport s sur Distri log2 et seul celui ci fait foi pour les d comptes de logiciel Astuce vous pouvez encore consulter les logiciels com mand s sur la version pr c dente de Distrilog via l URL d1 epfl ch Je dois valider une commande pour un logiciel co teux Je vois le co t de celui ci en CrD Cr dits Distrilog Quel est son co t r el en francs Suisses nest contractuellement pas possible de donner les prix des logiciels sur Distrilog pour des raisons de confidentialit D autre part la d cision d autoriser un lo giciel ne doit pas tre fonction de son co t mais fonction de son utilit r elle dans le contexte dans lequel il doit tre utilis Le but de la valid
69. ur trente six aujourd hui Les huit connexions IP et fibre ont t remplac es par deux connexions FCoE 10GBps La baie de stockage utilise au jourd hui des disques SSD et des disques SAS W Ces volutions ont permis d augmenter les performances de r duire le nombre de serveurs physiques et de faire r guli rement baisser le co t de la machine virtuelle depuis 2007 un rythme l g rement sup rieur celui de la loi de Moore loi qui divisant par deux le prix tous les 18 mois sur 5 ans donnerait un ratio de 3 33 alors que nous sommes 3 81 Le service offert s est aussi enrichi avec entre autres la possibilit de faire une image snaps hot de la machine virtuelle un instant pr cis Initialement uniquement h berg e dans la salle informatique du b timent MA l infrastructure s est tendue la salle informatique du b timent INJ Ce qui permet aux utilisateurs dont le service supporte un fonctionnement sur plusieurs machines de les r par tir sur les deux sites et d obtenir ainsi un haut niveau de r sistance aux sinistres Cloud priv de l EPFL bilan et perspectives Statistiques d utilisation du service 2007 2012 Le service a connu pendant les quatre premi res ann es une crois sance tr s forte elle s est cependant consid rablement infl chie en 2011 La virtualisation des machines physiques vieillissantes doit tre presque termin e et on rentre maintenant dans une Croissance org
70. utres entit s II des canaux de communication et d velopper avec elles les outils collaboratifs n cessaires En plus il participe aux v nements IT r gionaux o il repr sente l EPFL ME Promouvoir la technologie suisse ceci se manifeste par des pr sentations qui ont eu lieu au sein des r unions r gionales Cet effort a t couronn par l invitation de Dr Constentin Toenz Directeur g n ral adjoint de SWITCH pour donner une pr sentation sur Federated Identity lors du Ankabut Users Meeting le 12 janvier 2012 Infrastructure simple g rer l EPFL et l EPFL ME partagent pratiquement les m mes besoins IT avec la diff rence que les utilisateurs de l EPFL ME ne d passent pas 5 de ceux du campus lausannois D o la n cessit d avoir une infrastructure qui d livre tous les services requis compacte et simple g rer pour convenir la petite taille du campus de RAK Plusieurs d cisions ont t prises dans cette direction Plate forme homog ne pour simplifier la gestion de l infras tructure nous avons adopt uniquement les produits Micro soft pour nos serveurs tant qu ils arrivent d livrer la per formance requise L avantage de ce choix est que Microsoft est compatible avec les syst mes d exploitation Windows de la majorit des utilisateurs Ces produits sont maintenus r guli rement et automatiquement par Microsoft travers des patchs En outre avec Microsoft nous nous limitons aux produits standards
71. votre service E perspectives PP Cloud priv de l EPFL bilan et Fabien Figueras epfl ch EPFL Domaine IT chef du groupe Exploitation The hosting of virtual machines at the EPFL this is a private cloud that goes largely unnoticed by the me dia Its 5th birthday deserves a celebrating article Le service d h bergement de machines virtuelles de l EPFL voil un cloud priv qui ne fait pas de bruit m diatique son premier quinquennat m ritait bien un article pour f ter cet anniversaire introduction Les avantages de la virtualisation sont nombreux citons en seu lement trois qui nous semblent les plus significatifs elle permet d am liorer l efficacit nerg tique 1 en consolidant les ins tances de diff rents syst mes d exploitation sur une m me ma chine Elle permet de gagner en flexibilit et en dynamique dans la gestion des ressources T en disposant rapidement de machines les modifiant selon les besoins et les rendant lorsqu elles ne sont plus utilis es Dans cet article nous reviendrons sur l historique du projet de mise en production de ce service et nous verrons quelles volutions ont t apport es depuis son lancement Ensuite nous pr senterons quelques statistiques d utilisation Enfin nous terminerons par quelques perspectives d avenir Historique du projet 2006 2007 D s 2004 l initiative du directeur du DIT un groupe de r flexion a t mis sur pied pour se pencher sur l
Download Pdf Manuals
Related Search
Related Contents
Instruction Manual DR130/DR231/DR241 ハイブリッド XTZ EarPhone-12 Règlement jeu The Fray VDEF Manuel d`utilisation GE GXRTDR Filtre à eau pour Frigo américain Bedienungsanleitung ME-PAT100-Serie (pdf, 5,81MB, deutsch) Hampton Bay 27003 Installation Guide Lexmark Optra T610 Laser Printer Benq FP91G Black/Silver Collection Bills (Cobranza) User Manual Magnetic - inductive flowmeter type PEM Copyright © All rights reserved.