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Eppendorf BioSpectrometer® basic

1. 0 cece eee eee ee eee teen e eee eens 8 1 4 E Ee Det EE agg ads 9 2 Allgemeine Sicherheitsbhlnmwelse 0 cee cee eee cee eee eee eee e rece ee eeee 11 2 1 Bestimmungsgem er Gebrauch 11 2 2 Anforderung an den Anwender 0 cee cence nent een nes 11 2 3 Gef hrdungen bei bestimmungsgem em Gebrauch 11 2 3 1 Personenischaden NEEN ENEE NENNEN EN ee a anne 11 2 3 2 Gef tesch den u N en AE Fa eee ee agree 13 2 4 Hinweise zur Produkthaftumng 2 eee ar 14 2 5 Sicherheitshinweise am Ger t 14 3 Prod ktbeschreibung essere sc SIN a 15 3 1 Gesamtillustr ti n dove ENER Wor A ep ass woe ee Pa ne oe ee ee gr 15 3 2 Lieferumfang EE edel cabs oe Ng Scere a E 15 3 3 Produkteigenschatten 0 0 ee eee ee eee ro 16 3 3 1 Methoden ta 16 33 2 Bedienung res ti 16 232 Ergebnisausgabes ci ae bo eed ew 16 3 3 4 Selbsttest des Ger te 16 4 Installation 2002 22m ei en ira So Eeer ashes 17 4 1 Installation vorbereiten 2 0 ce cee teen ee rennen nen 17 4 2 St ndortw hlen zu ENEE SEENEN a aaa gs waa esd ada ase esas eae re 17 4 3 Gerat an das Netz anschliefen oo oooooooocooro nooo 17 4 4 Ger t mit einem Netzwerk verbinden 0 cece ce eee ete ee eee 18 4 5 Drucker am USB Anschluss anschlie en 20 cece eee eens 18 4 5 1 Thermodrucker DPU S445 2 eee nee e een en 18 4 6 PC oder USB Stick fur Datenexport anschlie en 0 2 eee 19 5 Bedien
2. Scans e Nukleins uren und Proteine OD600 Dye Methoden parallele Messung von Biomolek l und Farbstoff Markierung e Methoden mit Auswertung ber Faktor Standard und Standardreihe e Zweiwellenl ngen Verfahren mit Subtraktions und Divisionsauswertung Methodenabh ngige Auswertung Extinktion Konzentration ber Faktor und Standard Konzentration ber Standardreihe e Lineare Regression e Nichtlineare Regression Polynom 2 und 3 Grades e Spline Auswertung e Lineare Interpolation Punkt zu Punkt Auswertung Extinktionsverrechnungen ber Subtraktion und Division Zusatzdaten f r Nukleins uren Ratio 260 280 und 260 230 Molare Konzentration Gesamtausbeute Zusatzdaten f r Dye Methoden FOI Frequency of incorporation Markierungsdichte Scans Zoom Peak Auswertung Methodenspeicher gt 100 Methodenprogramme Messwertspeicher und Kalibrationsspeicher Speicher f r gt 1 000 Ergebnisse mit allen Daten der Ergebnis und Standardauswertung Probennummer Probenname Datum und verwendetem Parametersatz des Methodenprogramms Die Anzahl der gespeicherten Ergebnisse ist abh ngig von der Anzahl der gespeicherten Methoden Auswerteverfahren Eppendorf BioSpectrometer basic 93 Deutsch DE 12 Auswerteverfahren Dieses Kapitel beschreibt die in den Methodenprogrammen verf gbaren Auswerteverfahren sowie die Berechnung einer Verd nnung durch die Ger te Software O Beachten Sie beim Vergleich von
3. Abhilfe gt Stellen Sie sicher dass die Methodenparameter richtig eingegeben sind gt Stellen Sie sicher dass der richtige Standard benutzt wird und die Messl sung f r den Standard richtig vorbereitet wird gt Bei instabiler Reagenzextinktion und Endpunkt Methoden Messen Sie bei der Messung einer langen Probenserie den Reagenzleerwert nicht nur zu Beginn sondern auch w hrend der Probenserie Bei st rkerer Drift des Reagenzleerwerts ist das Reagenz nicht geeignet f r fehlerfreie Messungen und muss durch neues Reagenz ersetzt werden Positionieren Sie die K vette so im K vettenschacht dass die optischen Fenster in Lichtwegrichtung zeigen Lichtweg Photometrie von hinten nach vorn 9 2 Fehlermeldungen Problembehebung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 79 Ger teanzeigen mit Fehlermeldungen k nnen Sie mit dem Softkey OK verlassen Systemfehler erfordern eine Beurteilung durch den Technischen Service Diese Fehler werden in Englisch dargestellt System error Bitte wenden Sie sich in diesen Fallen an den Technischen Service Andere Fehlermeldungen bei denen Sie selbst Ma nahmen ergreifen k nnen sind in der folgenden Tabelle erl utert Symptom Meldung Selbsttest fehlgeschlagen M gliche Ursache e K vettenschachtabdeckung war beim Selbsttest offen e Der K vettenschacht war beim Selbsttest nicht leer Abhilfe Wiederholen Sie den Selbsttest mit le
4. C 25 75 70 kPa 106 kPa ohne 5 C 45 C 25 75 70 kPa 106 kPa Transportverpackung 87 88 Transport Lagerung und Entsorgung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 10 3 Entsorgung Bei einer Entsorgung des Produkts sind die einschlagigen gesetzlichen Vorschriften zu beachten Hinweise zur Entsorgung von elektrischen und elektronischen Geraten in der Europaischen Gemeinschaft Innerhalb der Europ ischen Gemeinschaft wird die Entsorgung von elektrischen Geraten durch nationale Vorschriften geregelt die auf der EU Richtlinie 2012 19 EU ber Elektro und Elektronik Altgerate WEEE basieren Nach diesen Vorschriften durfen alle nach dem 13 August 2005 gelieferten Ger te im Business to Business Bereich in den dieses Produkt einzuordnen ist nicht mehr im kommunalen Abfall oder Hausmull entsorgt werden Um dies zu dokumentieren sind sie mit folgendem Symbol gekennzeichnet Da sich die Entsorgungsvorschriften innerhalb der EU von Land zu Land unterscheiden k nnen bitten wir Sie sich bei Bedarf bei Ihrem Lieferanten zu informieren Technische Daten Eppendorf BioSpectrometer basic 89 Deutsch DE 11 Technische Daten 11 1 Stromversorgung Spannungsversorgung 100 V bis 240 V 10 50 Hz bis 60 Hz berspannungskategorie Verschmutzungsgrad 2 Leistungsaufnahme Maximal auftretende Leistung laut Typenschild 25 W Ca 15 W im Bedienablauf Ca 5 W mit gedimmtem Display
5. Gen method param Abs spectra library Device settings Device calibration Funktionen Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Unter dem Men punkt Copyright finden Sie Lizenzinformationen zur Open Source Software 67 Funktionen 68 Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Instandhaltung Eppendorf BioSpectrometer basic 69 Deutsch DE 8 Instandhaltung 8 1 Reinigung A GEFAHR Stromschlag durch eintretende Fl ssigkeit Schalten Sie das Ger t aus und trennen Sie es vom Stromnetz bevor Sie mit der Reinigung oder Desinfektion beginnen gt Lassen Sie keine Fl ssigkeiten in das Geh useinnere gelangen F hren Sie keine Spr hreinigung Spr hdesinfektion am Geh use durch Schlie en Sie das Ger t nur innen und au en vollst ndig getrocknet wieder an das Stromnetz an ACHTUNG Korrosion durch aggressive Reinigungs und Desinfektionsmittel gt Verwenden Sie weder tzende Reinigungsmittel noch aggressive L sungs oder schleifende Poliermittel gt Inkubieren Sie das Zubeh r nicht l ngere Zeit in aggressiven Reinigungs oder Desinfektionsmitteln 1 Wischen Sie die Oberfl chen mit einem Tuch ab das Sie mit einem milden Reinigungsmittel befeuchtet haben K vettenschacht reinigen 2 Reinigen Sie den K vettenschacht nur mit einem mit Ethanol oder Isopropanol befeuchteten fusselfreien Wattest bchen Vermeiden Sie dass Fl ssigkeit in den K vettenscha
6. Zul ssige Netzunterbrechung Ca 10 ms bei 90 V Ca 20 ms bei 230 V Schutzklasse Sicherungen T 2 5 A 250 V 5 mm x 20 mm 2 St ck 11 2 _Umogebungsbedingungen Betrieb Umgebungstemperatur 15 C bis 35 C Rel Luftfeuchte 25 bis 70 Luftdruck 86 kPa bis 106 kPa Luftdruck Verwendung bis zu einer H he von 2000 m ber Meeresh he Vor direktem Sonnenlicht sch tzen 11 3 Gewicht Ma e Gewicht 5 kg Abmessungen Breite 295 mm Tiefe 400 mm Hohe 150 mm Benotigter Raum Breite 500 mm mit Thermodrucker 750 mm Tiefe 500 mm 90 Technische Daten Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 11 4 Photometrische Eigenschaften Messprinzip Absorptions Einstrahlspektralphotometer mit Referenzstrahl Lichtquelle Xenon Blitzlampe Spektrale Zerlegung Holographisches Aberations korrigiertes Konkavgitter Strahlungsempfanger CMOS Photodiodenarray Wellenlangen 200 nm bis 830 nm Wellenlangenwahl Methodenabh ngig frei w hlbar Spektrale Bandbreite lt 4nm Kleinste Schrittweite 1nm Systematische Messabweichung der 1 nm Wellenl nge Zufallige Messabweichung der lt 0 5 nm Wellenl nge Photometrischer Messbereich 0 A bis 3 0 A bei 260 nm Ablesegenauigkeit AA 0 001 Zufallige Messabweichung des Photometers lt 0 002 bei A 0 lt 0 005 0 5 bei A 1 Systematische Messabweichung des Photometer
7. e Page dn und Page up Zwischen den 1 bis 3 Parameterseiten wechseln e Edit In den Editiermodus f r Parameter wechseln Editiermodus fur Parameter Geanderte Parameter werden mit einem roten Stern markiert solange die Anderung nicht gespeichert wurde Softkeys Save und Save as nderungen speichern Bei Save as m ssen Sie der Methode einen neuen Namen geben Das ist immer der Fall wenn Sie die von Eppendorf vorprogrammierten Methoden der Gruppe Routine andern e Cancel Editiermodus ohne Speicherung der Anderungen verlassen Speichern der Methode unter neuem Namen Sie k nnen die Methode entweder im selben Ordner speichern in dem Sie die Methode aufgerufen haben oder in der Methodengruppe Favorites in einem frei w hlbaren Ordner speichern Den Namen maximal 20 stellig k nnen Sie ber eine eingeblendete Tastatur Softkey Keyboard oder direkt ber den Tastenblock siehe Text eingeben auf S 23 eingeben Nach dem Speichern gelangen sie zur ck in die Anzeige check parameters 42 Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 6 4 2 measure standards A measure standards new Conc Abs Linear regression pg ml Asos not calculated Standard 1 100 SC K Standard 2 250 x Standard 3 500 x randard 4 Curve Fit Graph ee Der erste zu messende Standard ist in der Anzeige markiert Messen Sie nach dem Leerwert Taste blank der Reihe nach alle Standa
8. llen um Verschleppung zu minimieren Wenn aufgrund von hohen Konzentrationsunterschieden Verschleppung von einer Probe zur n chsten Probe zu erwarten ist sp len Sie die K vette zwischen den Messungen e Bei Temperaturunterschieden zwischen Lampe und Umgebung kann photometrische Drift auftreten Bringen Sie daher ein Ger t das aus einer k lteren Umgebung kommt zun chst auf Umgebungstemperatur Vermeiden Sie schnelle Temperaturwechsel F hren Sie bei l ngeren Messreihen oder bei Messungen nach einem l ngeren Zeitraum eine neue Leerwertmessung durch Bedienung 30 Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic 31 Deutsch DE 6 Methoden 6 1 Methode auswahlen Methoden und Methoden Templates sind bereits mit Auslieferung vorprogrammiert Die Methoden sind in Haupt und Untergruppen geordnet Method Selection E dsDNA 1mm ssDNA E RNA Bi Oligo lt New Method gt copy _ I J unction Schreibgesch tzte Methoden Die wichtigsten Methoden der Molekularbiologie Sie k nnen die Parameter zwar ver ndern dann aber nur unter neuem Methodennamen abspeichern Nicht schreibgesch tzte Methoden Sie k nnen die Parameter beliebig ver ndern und nach Speichern direkt mit der Messung beginnen D Templates f r neue Methoden Jede Methodengruppe enth lt ein Template das zur Erleichterung der Programmierung neuer Methoden bereits mit komplet
9. 2 Um ebungsbedingungens resres sep fect 2 2a eee ee bese wae ida 89 UNE een KE EE 89 11 4 Photometrische Eigenschaften 90 11 5 Weitere technische Parameter ed 2 ea een EN ANN 91 11 6 Anwendungsparame ters 2s als wih Se NEE we 92 Auswerteverfahren 2 0 ccc ce eee ee eee roo 93 12 1 Extinktionswerte u cd ca He ee EE En A ee ee a 93 PA aaa a a ee een 93 12 1 2 Background Korrektur 2 22220 cee nennen nenn 93 12 1 3 K vettenkorrektutr es een De ee eae pe 94 12 2 Auswertung mit Faktor oder Standard 95 12 3 Auswertung mit Standardkurve gerade 22220 eee eee 96 12 4 Verd nnung EE ENEE ee ee en es 97 12 5 Spezielle Auswerteverfahren f r Nukleins uren und Protein UV 97 12 5 1 Korrektur A260 und Korrektur Aaen 97 12 5 2 Ratio A260 A280 und Ratio A260 A230 22 22 eee nenn 98 12 5 3 Umrechnung in molare Konzentrationen und Nukleinsauremengen 98 12 5 4 Berechnung des Faktors f r Protein in General Method Parameter 100 12 6 Spezielle Auswerteverfahren f r die Dye Methoden 100 12 6 1 Berechnung des Faktors f r den Farbstoff aus dem Extinktionskoeffizienten 100 126 2 Berechnung der Fol energie 101 12 6 3 Umrechnung in Farbstoffmengen 0 0 0 eee 101 12 7 Dualewavelength x oceanside ws ie ati le ee ace ele ei 102 Bestellinformationen sosesc 2 Bie E A ee eg ae ee ee 103 Zertifikate 232 28 a TR ehe BS 105 6 Inhaltsverzeichnis Eppendorf BioSpectrome
10. A 0 3 280 nm 1 384 A 0 1 320 nm 1 382 A 0 3 405 nm 1 423 A 0 1 550 nm 1 412A 0 3 562 nm 1 406 A 0 3 595 nm 1 396 A 0 5 700 nm 1 359 A 0 2 ene ung 800 nm 1 342 A 0 3 4 Ergebnisanzeige nach Messung eines Pr ffilters zum Test auf Photometrische Richtigkeit Messen Sie die beiden anderen Pruffilter A2 und A3 Ergebnisanzeige nach Messung aller 3 Pr ffilter zum Test auf Photometrische Richtigkeit Mit den Tasten O und k nnen Sie sich nochmals die Ergebnisse f r die verschiedenen Pr ffilter ansehen Mit Finish beenden sie die Pr fung Vergleichen Sie die Mittelwerte und VK Werte mit der mitgelieferten Tabelle Sollten die gemessenen Werte nicht mit dem zul ssigen Wertebereich bereinstimmen wenden Sie sich an den Eppendorf Service Lassen Sie die Filter nach 2 Jahren vom Eppendorf Service neu zertifizieren 8 3 1 2 Wellenl ngenrichtigkeit berpr fen gt F r die berpr fung der Wellenl ngenrichtigkeit verfahren Sie entsprechend Hier messen Sie mit 3 Pr ffiltern bei der entsprechenden Wellenl nge Instandhaltung Eppendorf BioSpectrometer basic 75 Deutsch DE 8 3 2 Selbsttest des Gerats Die Haufigkeit des automatischen Selbsttests Dauer ca 1 Minute k nnen Sie mit der Funktion Device settings einstellen siehe Device Settings auf S 64 Ab Werk ist als Selbsttest Intervall w chentlich eingestellt Beim Selbsttest werden die folgenden Punkte berpr ft e berpr fung de
11. Calc Data Finish Backs Next gt CONTA process results zoom Abs A 0 460 0 400 0 340 0 280 0 220 dsDNA 2010 07 16 16 32 54 a em e A260 A280 1 86 Change image section amp and Y keys Move A cursor d and gt keys Would you like to apply Apply to all samples the change to all samples in the dsDNA 2010 07 02 14 series of measurements Yes Apply to all samples No Apply only to the current sample lI Jl Yes No Cancel Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic 51 Deutsch DE Nach Anderungen k nnen Sie den aktuellen Modus mit den beiden rechten Softkeys verlassen Save nderung speichern und zum Methodenschritt process results zur ckkehren e Cancel Abbrechen und zum Methodenschritt process results zur ckkehren Nach Speicherung der nderungen k nnen Sie diese mit Yes auf alle Proben der Messreihe bertragen Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 6 4 6 process results Optionen Zoom Drucken Sie den Softkey Zoom und wahlen Sie eine der folgenden Varianten aus EE eege e Cursor Tasten und Wellenl ngen Cursor Abs A 01 a ID bewegen Dieser bestimmt den Zoom Mittelpunkt 0 460 ber der x Achse 0 400 25 Que e Cursor Tasten und Angezeigten Ausschnitts SE a der x Achse stufenweise nach dem A260 A2
12. Check photometric accuracy Device Calibration Spectrometer unit Device Calbration Check photometric accuracy ID ONO U Insert filter AO and press blank EEE EEE H Abort lt Back Next gt J Instandhaltung Eppendorf BioSpectrometer basic 73 Deutsch DE Wahlen Sie in der Gruppe Device calibration die Funktion Spectrometer unit und bestatigen Sie mit enter Wahlen Sie aus ob Sie die Wellenlangenrichtigkeit oder die Photometrische Richtigkeit Uberprufen wollen und best tigen Sie mit enter Wechseln Sie mit Next gt zur Messung Folgen Sie den Anweisungen in der Gerateanzeige und messen Sie zunachst das Leerwertfilter AO und danach das erste Pr ffilter Al Das Gerat misst das Pruffilter 15 mal bei 9 Wellenl ngen und zeigt anschlie end die Mittelwerte sowie die VK Werte der Messreihe f r alle 9 Wellenl ngen an 74 Instandhaltung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE EH spectrometer Unit Device Calibration Check photometric accuracy 01 1D SAMPLE A1 Wavelength Mean VK 260 nm 0 192 A 1 1 280 nm 0 190 A 12 320 nm 0 167 A 1 4 405 nm 0 154 A 0 7 550 nm 0 164 A 0 7 562 nm 0 163 A 0 8 595 nm 0 165A 0 7 700 nm 0 168 A 0 5 filter SAM and 800 nm 0 169 A 15 ca nt pe Abort lt Back Next Device Calibration Device Caltvation Check photometric accuracy 03 ID SAMPLE A3 Wavelength Mean VK 260 nm 1 404
13. Gerat nach dem Offnen justieren Adjust device after opening Wenn das Ger t ge ffnet wird muss es neu justiert werden gt Ger t nicht ffnen Unterseite des Gerats Produktbeschreibung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 3 Produktbeschreibung 3 1 Gesamtillustration 1 2 3 3 Abb 3 1 Vorder und Ruckansicht md O an A U N Display 7 Netzanschluss K vettenschacht 8 USB Anschluss f r PC K vettenschachtabdeckung 9 Anschluss RS 232 Drucker USB Anschluss f r USB Stick und Drucker 10 Anschlussbuchse Ethernet Netzschalter 11 Bedienelemente Sicherungshalter Das Typenschild befindet an der Unterseite des Ger ts links hinten 3 2 Lieferumfang Anzahl Beschreibung 1 BioSpectrometer basic 1 Netzkabel 4 4 UVetten Original Eppendorf Kunststoffk vette einzeln verpackt PCR clean Protein free Bedienungsanleitung mehrsprachig 15 16 Produktbeschreibung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 3 3 Produkteigenschaften Das BioSpectrometer basic ist ein UV Vis Spektralphotometer fur die Messung von Flussigkeiten in Kuvetten im Wellenlangenbereich von 200 nm bis 830 nm Es ist fur den Einsatz im molekularbiologischen biotechnologischen biochemischen und zellbiologischen Bereich in Entwicklung und Forschung vorgesehen Sie k nnen Glask vetten und Kunststoffk vetten im Volumenbereich von 1 uL bis 300
14. der Berechnung Division durch Null Bei der Auswertung musste durch ein Extinktionsergebnis mit dem Wert Null geteilt werden Das ist mathematisch nicht zul ssig Beispiele Berechnung eines Faktors bei Einpunktkalibrierung Berechnung einer Ratio 260 280 bei Nukleins uremessungen gt berpr fen Sie die verwendeten Reagenzien und Proben und wiederholen Sie die Messung Berechnung ist nicht m glich weil durch Null geteilt wird Extinktionsergebnis oder Parameter Formula b ist Null Bei der Auswertung einer Methode des Typs Division Methodengruppe Dual wavelength musste durch ein Extinktionsergebnis mit dem Wert Null geteilt werden Das ist mathematisch nicht zul ssig gt berpr fen Sie die verwendeten Reagenzien und Proben und wiederholen Sie die Messung gt Geben Sie als Wert f r den Parameter Formula b nicht Null ein Problembehebung 86 Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 10 10 1 Transport Transport Lagerung und Entsorgung Eppendorf BioSpectrometer basic Transport Lagerung und Entsorgung gt Verwenden Sie die Originalverpackung fur den Transport Deutsch DE Lufttemperatur Relative Luftfeuchte Luftdruck Allgemeiner Transport 25 C 60 C 10 95 30 kPa 106 kPa Luftfracht 40 C 55 C 10 95 30 kPa 106 kPa 10 2 Lagerung Lufttemperatur Relative Luftfeuchte Luftdruck in Transportverpackung 25 C 55
15. die weitere Auswertung mit Faktor oder mit Standard eingeht Fur die Ermittlung der berechneten Extinktion kann in den Parametern eine Auswertung uber Division oder uber Subtraktion definiert werden axA cale T xc d bxA A ax A bx A xc d cale A1 A2 gemessene Extinktionen a b c d Faktoren die in den Parametern eingegeben werden Es k nnen auch negative Zahlen eingegeben werden 13 Bestellinformationen Bestellinformationen Eppendorf BioSpectrometer basic 103 Deutsch DE Best Nr International 6135 000 009 Best Nr Nordamerika Beschreibung Eppendorf BioSpectrometer basic 230 V 50 60 Hz Netzstecker Europa weitere Netzanschlussvarianten erhaltlich 6135 000 017 6135000017 120 V 50 60 Hz Netzstecker Nordamerika BioSpectrometer Referenzfiltersatz 6135 928 001 6135928001 Filtersatz zur berpr fung der photometrischen Richtigkeit und Wellenl ngenrichtigkeit gem NIST Eppendorf uCuvette G1 0 6138 000 018 6138000018 Eppendorf Mikrovolumen Messzelle f r die Eppendorf BioPhotometer und BioSpectrometer Thermodrucker DPU S445 inkl Netzteil und Druckerkabel 6135 011 000 230 V EU 6135 010 004 6135010004 115 V 110V USA JP 6135 012 007 230 V UK Thermopapier 0013 021 566 952010409 5 Rollen Eppendorf UVette 220 nm 1 600 nm Original Eppendorf Kunststoffk vette PCR clean Protein free 0030 106 300 952010051 50 2 000 uL 80 St ck einzeln ver
16. einem Netzwerk verbunden ist k nnen die Ergebnisse auf einem Netzwerkdrucker ausgedruckt oder per E Mail verschickt werden Es ist nicht m glich die Ergebnisse auf einem Netzlaufwerk zu speichern 3 3 4 Selbsttest des Ger ts Direkt nach dem Einschalten berpr ft das Ger t selbstt tig die Funktion der Spektrometereinheit Um das Ger t umfassender zu pr fen rufen Sie die Funktion Device calibration auf siehe Selbsttest des Ger ts auf S 75 Installation Eppendorf BioSpectrometer basic 17 Deutsch DE 4 Installation 4 1 Installation vorbereiten Heben Sie den Transportkarton und das Verpackungsmaterial fur einen sp teren sicheren Transport oder fur eine Lagerung auf Kontrollieren Sie anhand der Angaben zum Lieferumfang die Vollst ndigkeit der Lieferung siehe Lieferumfang auf S 15 gt Pr fen Sie alle Teile auf eventuelle Transportbeschadigungen 4 2 Standort w hlen W hlen Sie den Standort f r das BioSpectrometer basic nach folgenden Kriterien 2 Steckdosen mit Schutzleiter f r das BioSpectrometer basic und f r den Drucker Fester Labortisch mit waagerechter Arbeitsplatte Platzbedarf des Ger tes 50 cm mit Drucker 75 cm Breite 50 cm Tiefe e Temperatur 15 C bis 35 C e Vermeiden Sie Temperaturschwankungen z B durch ge ffnete Fenster e Vermeiden Sie direktes Sonnenlicht e Luftfeuchtigkeit 25 bis 70 relative Feuchtigkeit i Achten Sie darauf dass keine Gegenstande unter d
17. einer PC Tastatur konnen Sie mit der Shift bzw der Feststelltaste fur Target directory Favorites MyMethods RR e die nachstfolgende bzw fur alle folgenden Eingaben OFavorites MyMethods v f zwischen Gro und Kleinschreibung wechseln Softkeys l lalalals ie 78 eo e Numbers Zur Eingabe ber den Tastenblock A 9 wje r t Yjulijo P i 5 Current entry wechseln Y a s a 9 h J k 1 3 gt Keyboard EI T H h tt z x elvipln m 4p Numeric keypad e Save Eingegebenen Text speichern Numbers Space pads Cancel Texteingabe abbrechen Numbers abc Save H Cancel 24 Bedienung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 52 K vette einsetzen In die K vettenaufnahme k nnen Sie handels bliche Rechteckk vetten aus Glas oder Kunststoff einsetzen e Au enma e 12 5 mm x 12 5 mm e Lichtweghohe 8 5 mm ber dem K vettenboden e Gesamth he mindestens 36 mm Die K vetten m ssen bei der jeweiligen Messwellenl nge optisch transparent sein F r Messungen im UV Bereich bietet Eppendorf mit der UVette eine Kunststoffk vette an die bei Wellenl ngen ab 220 nm transparent und damit auch f r die Messung von Nukleins uren geeignet ist Eppendorf mi i mi Cuvettes uCuvette G1 0 Hellma TrayCell UVette Ultra micro Semi micro Macro Basic area 12 5 mm x 12 5 mm Min overall height 36 mm Min filling level 10 mm Light path 8 5 mm Max
18. gt Anderes Curve Fit Verfahren w hlen Einige Extinktionswerte bei Nebenwellenl ngen sind zu hoch und werden nicht angezeigt Bei mindestens einer Nebenwellenl nge war die Extinktion oberhalb des Messbereichs Nebenwellenl ngen werden nicht f r die Berechnung des Konzentrationsergebnisses herangezogen sondern f r andere Zwecke benutzt Z B Methode dsDNA Extinktion bei 280 nm f r die Berechnung von Ratio 260 280 Tr bungen in der Messl sung Messungen an den Grenzen des photometrischen Messbereichs gt Wenn die Extinktionswerte der Nebenwellenl ngen relevant sind Probe verdunnen bzw durch Zentrifugation Trubung beseitigen und Messung wiederholen Das Ergebnis liegt au erhalb des Bereichs der Standardkonzentratio nen Bei Methoden mit Auswertung uber Standardkurven nichtlineare Auswerteverfahren Das Probenergebnis liegt um bis zu 5 au erhalb des Bereichs der Standardkonzentrationen gt Messergebnis akzeptieren oder Probe unter Bedingungen neu messen bei denen das Ergebnis im Bereich der Standardkonzentrationen liegt Probe verd nnen oder Standardkonzentrationen ver ndern und neu messen 84 Problembehebung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Symptom Meldung Das Bestimmtheitsma ist lt 0 8 M gliche Ursache Bei Methoden mit Auswertung von Standardreihen ber Regressionsverfahren Das Bestimmtheitsma f r die Regressionsauswert
19. height of base 7mm 0 mm Min volume Photometry See manufacturer See manufacturer 50 uL 70 uL 400 uL 1000 uL information information or similar microliter cuvette Voraussetzung K vette ist frei von Verschmutzung durch Staub oder Fingerabdr cke und frei von Kratzern e K vettenschacht ist frei von Partikeln Staub und Fl ssigkeit e Messvolumen in der K vette ist ausreichend Minimales Messvolumen beachten Messl sung ist frei von Partikeln und Blasen K vettentemperatur ist oberhalb der Temperatur des Taupunktes der f r die Umgebungsbedingungen Feuchte und Temperatur gilt O Die Richtung des Lichtwegs ist mit einem Pfeil auf dem Gehause gekennzeichnet 1 Positionieren Sie die Kuvette so dass das optische Fenster der K vette in Richtung des Lichtwegs zeigt 2 Drucken Sie die Kuvette beim Einsetzen gegen einen leichten Widerstand ganz nach unten Bedienung Eppendorf BioSpectrometer basic 25 Deutsch DE 5 3 Ubersicht Uber den Messablauf 5 3 1 Messung vorbereiten 1 Schalten Sie das Gerat und gegebenenfalls den Drucker ein Das Ger t f hrt einen Selbsttest durch Dauer ca 1 Minute und zeigt die Methodenauswahl an 2 Stellen Sie die K vetten fur die Messungen bereit siehe K vette einsetzen auf S 24 3 Stellen Sie die Messl sungen f r die Messungen der Leerwerte ggf der Standards und der Proben bereit 4 ffnen Sie die Abdeckung des K vettenschachts W hrend der Messungen kann d
20. immer bertragen werden Data Zus tzliche Ergebnisdaten die in den Ergebnisanzeigen w hrend der Messung mit dem Softkey Datal angezeigt werden Graph Extinktions Wellenl ngen Spektrum Graph data Die nummerischen Basisdaten f r den Graphen export only Nur f r den Export nicht f r den Ausdruck verf gbar Parameters Methodenparameter Standards Results Ergebnisdaten der Standardauswertung Standards Graph Nur bei Standardauswertungen mit mehreren Standards Extinktions Konzentrations Graph In Abh ngigkeit von der Methode und von der Parametereinstellung werden nur die jeweils verf gbaren Datenpakete angeboten 56 Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Einzelne Probenergebnisse auswahlen ee e Dr cken Sie den Softkey Samples um die Probenauswahl aufzurufen Sample selection 01 0 000 Azs ae i 01 0 33mg mL e Navigieren Sie mit den Cursor Tasten und 02 1 34mg mL best tigen Sie mit enter 03 0 33mgmL 04 0 89 mg mL 05 0 11mg mL Softkeys e Select all Alle Proben ausw hlen De Sel alll Auswahl zur cksetzen Print Export Select all De sel alll OK Cancel Export starten Die Daten werden als Excel Datei xls oder als PDF bertragen Excel Dateien sind mit Excel Versionen ab Excel 97 lesbar F r jedes der ausgew hlten Datenpakete wird ein Tabellenblatt in Excel angelegt Der Dateiname setzt sich aus dem Methodenamen der Uhrzeit und d
21. in General Method Parameter ist nicht definiert Wahlen Sie einen anderen Parameter aus der vorhandenen Liste Falls erforderlich programmieren Sie in General Method Parameter einen neuen Listeneintrag um bei der Programmierung einer Methode darauf zur ckgreifen zu k nnen Ung ltiges Zoom Intervall Beim Zoom Vorgang mit freier Eingabe der Grenzen Softkey Free e Die Untergrenzen f r den Zoombereich wurden unterschritten gt Werte so eingeben dass das Intervall nicht die Berreichsgrenzen von 0 02 A und 10 nm unterschreitet Die eingegebenen Standardkonzentratio nen sind nicht monoton steigend bzw monoton fallend Bitte Standardkonzentratio nen korrigieren e Siehe Fehlertext gt Die Standardkonzentrationen so eingeben dass der erste Standard die niedrigste Konzentration erh lt und die weiteren Standardkonzentrationen eine aufsteigende Folge bilden Problembehebung Eppendorf BioSpectrometer basic 81 Deutsch DE Symptom Meldung Mindestens zwei eingegebene Standardkonzentratio nen sind gleich Bitte Standardkonzentratio nen korrigieren Mogliche Ursache e Siehe Fehlertext Abhilfe gt Die Standardkonzentrationen so eingeben dass der erste Standard die niedrigste Konzentration erhalt und die weiteren Standardkonzentrationen eine aufsteigende Folge bilden Die Messwerte sind nicht streng monoton Fehler bei der Messung einer Standardreihe Die geme
22. 0 uL benutzen 3 3 1 Methoden Zahlreiche Methoden f r die Konzentrationsbestimmung von Nukleins uren Proteinen und Farbstoff markierten Nukleins uren und Proteinen sowie die Methode OD 600 f r die Bestimmung der Bakteriendichte durch Tr bungsmessung sind bereits vorprogrammiert Weiterhin sind Methoden Templates f r unterschiedliche Mess und Auswerteverfahren Ein und Mehrwellenl ngenmessungen Spektrenaufnahmen Auswertungen mit Faktor Standard und Standardkurve vorprogrammiert Eigene Methoden k nnen auf Basis der vorprogrammierten Methoden und Templates erstellt werden Mit den Templates der Methodengruppe Absorbance k nnen Sie schnell Extinktionen oder Spektren ohne weitere Auswertung messen 3 3 2 Bedienung Die vorprogrammierten Methoden und Templates sind in bersichtlichen Gruppen zusammengefasst aus denen Sie schnell Ihre gew nschte Methode ausw hlen k nnen Nach Methodenaufruf werden Sie in bersichtlichen Schritten durch den Messablauf gef hrt Eine Hilfebox in der Anzeige gibt Ihnen bei Bedarf Hinweise Die 3 runden Messtasten standard blank sample erm glichen den schnellen direkten Start einer Messung 3 3 3 Ergebnisausgabe Das BioSpectrometer basic gibt die Ergebnisse ber die Ger teanzeige oder ber einen bei Eppendorf erh ltlichen Drucker aus ber den USB Anschluss k nnen Sie Ergebnisdaten aus dem Ger t auf einen USB Stick einen Drucker oder direkt auf einen PC bertragen Wenn das Ger t mit
23. 04 10 16 00 Manual time setting Date 2015 06 04 YYYY MM DD Time 10 15 10 HH MM SS ONetwork time Time server pool ntp org L AE E JO Js Jl cancel 7 1 5 Device Calibration E Mail Settings Fragen Sie hren Netzwerk Administrator welche Einstellungen erforderlich sind e SMTP Server E Mail Server eingeben Port eintragen e Absender Ger tenamen eingeben e SMTP Authentifizierung verwenden Falls eine Authentifizierung erforderlich ist muss ein Benutzername und ein Passwort vergeben werden e Empf nger E Mail Adresse Liste mit E Mail Adressen E Mail Adressen bearbeiten Wahlen Sie in der Dropdownliste Edit und best tigen Sie mit enter Es ffnet sich ein Fenster in dem die E Mail Adressen bearbeitet werden k nnen Softkeys e Edit E Mail Adresse bearbeiten New Neue E Mail Adresse anlegen e Delete E Mail Adresse l schen Date and Time Settings e Region ausw hlen e Stadt ausw hlen e Anzeige der aktuellen Zeit e ManuelleZeiteinstellung Datum und Zeit eingeben Netzwerkzeit Zeitserver Gew nschten Zeitserver eintragen Softkeys e Save nderungen speichern und in die Funktionsauswahl zur ckkehren Cancell In die Auswahl der Parametergruppe ohne nderung zur ckkehren Die Ger te berpr fung ist separat beschrieben siehe Ger t berpr fen auf S 77 7 1 6 Functions Main Groups Info Sub Groups Functions Results memory
24. 21110510 0 1 mm Werteeingabe Bereich 2 bis 6 Erl uterung Optische Schichtdicke der K vette Extinktionswerte werden vom Ger t immer automatisch auf die Schichtdicke 10 mm einer Standardk vette umgerechnet siehe Extinktionswerte auf S 93 Faktoren wie 50 f r die Berechnung von dsDNA Konzentrationen m ssen daher nicht von Ihnen ver ndert werden wenn Sie den Parameter Cuvette ver ndern Nur f r die Methodengruppe Multi A Anzahl der Wellenl ngen bei denen gemessen werden soll Wavelength Werteeingabe Messwellenl nge in nm Bereich 200 bis 830 nm Messwellenl nge Auf der Basis der bei dieser Wellenl nge gemessenen Extinktion wird die Konzentration ausgerechnet Bei den Methodengruppen Multi A sowie Dual wavelength geben Sie mehr als eine Wellenl nge ein F r einige Methodengruppen z B Nucleic acids und Proteins direct UV sind die Wellenl ngen fest vorprogrammiert Bei der Methodengruppe Dye labels geben Sie die Messwellenl ngen nicht einzeln im Methodenablauf ein Sie importieren sie ber die einfache Auswahl von Biomolek l sowie Farbstoff automatisch aus der Funktion General Method Parameters 36 Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Parameter Unit Eingabe Auswahl mg mL pg mL ng mL pg mL pg L mg dL umol mL nmol mL pmol mL pmol uL I U U mL U L Abs A min Zusatzlich freie Programmierbarkeit weiterer Einhe
25. 5 2 4 W hlen Sie mit den Cursor Tasten O und 0 270 gezielt Ergebnisse der Messreihe f r die 0 180 a Nachbearbeitung aus 0 090 SS Ge 230 260 290 320 Mm Zoom More Calc Data Finish lt Back Next gt 28 Bedienung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 5 3 2 7 Drucken und exportieren dsDNA Hmeasure samples process results print amp export few series dsDNA 2015 06 04 10 16 30 Data packets Samples Results Format data Ox s Graph OPDF Graph data XLS only OXLS 4 PDF Method GParameters Select data packets Key SE Print Export Samples Finish lt Back Next gt Stellen Sie Datenpakete f r alle oder f r ausgew hlte Proben zusammen Drucken Sie die Daten aus speichern Sie sie auf einem USB Stick bertragen Sie sie ber ein USB Kabel an einen PC oder exportieren Sie sie per E Mail 5 3 3 d Bedienung Eppendorf BioSpectrometer basic 29 Deutsch DE Wichtige Hinweise fur die Messungen Beachten Sie bei jeder Messung Bei Kunststoffk vetten Wie viele Messungen nacheinander k nnen in der Kuvette zuverl ssig durchgef hrt werden e Messen Sie vor Proben oder Standardmessungen den Leerwert der K vette um neben dem Reagenzleerwert auch den K vettenleerwert zu kompensieren Leerwertergebnisse bleiben f r eine Messreihe gespeichert eine neue Leerwertmessung ist aber jederzeit auch zwischen Probenmessungen m
26. 59 7 1 Funktionen der Hauptgruppe User 59 7 1 1 Results MEMORY ii ee ee end bao 60 7 1 2 General Method Parameter 61 7 1 3 Absorbance Spectra Library ei eie ea e ee eee 64 FON Mee LEE 64 FAS Device Calibrations rs Sief Batti tere a EE oe 66 FG ln Lt EE 67 8 Tins tari alt 27 sais Ne A Bee aire snk Da ps A EE Neger 69 8 1 Reinigung it sr re ur Hartl ha 69 8 1 1 K vettenschachtabdeckung rengen 70 8 2 Desinfektion Dekontamination 0 0 0 0 cece ee eee eee 71 SS Gerais hee his ee E 71 8 3 1 Spektrometereinheit berpr fen 2 2 0 0 eee eee 71 83 2 Selbsttest des Ger ts tee deier oh speedos ake beens Malina Metin as ug 75 8 4 Sicherungen Ersetzen epi ENEE AA A ee ee eee E 75 8 5 Dekontamination vor Versand 76 9 ProblembehebunG Assel A EE EB pe KEER 77 9 1 Allgemeine Fenle rss gege teh sees ote terrae latte dealt darted m er 77 9 2 Fehlermeldungen ss ama an eg a Ze age a Be A EN HR RS 79 9 3 Ergebniskennzeichnungen evo e e E mes 2 4 2 Sa a 2 Gee eg aber ba AR Sy See Sa toe See SR 83 10 Transport Lagerung und Entsorgung ccc ccc cee cee eee eee tener nese tees 87 LOSI VII el 87 10 2 aerer bt tos Seege aie EE aa cog ans ct A ns ne A ek ee 87 1 0532 Eeler DEE a RES A oR en BEL aU heals bas A 88 11 12 13 Inhaltsverzeichnis Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Technische Datei att at te ote Month aar p SEa eeh iene e 89 REN Ire Une EE 89 11
27. 80 1 86 SpectraZoom Verfahren vergr ern und Lc verkleinern 0 220 Der angezeigte Ausschnitt der y Achse wird bei 238 246 254 282 270 eil jedem Schritt automatisch so angepasst dass SE Maximum und Minimum der darzustellenden spectra wee Jesse save _J cancer Daten den Ausschnitt optimal ausnutzen ESNA Variante spectra 0 dsDNA 2010 07 16 16 32 54 Entspricht der Variante spectra mit der Ausnahme Abs A Die untere Grenze des dargestellten Ausschnitts der W er y Achse entspricht immer 0 A 0 360 25 2 00m 0 270 0 504 Ase 0 180 A260 A280 1 86 0 090 0 000 arante feel DNA 201007 16 163254 Intervallgrenzen fur beide Achsen konnen frei Lerma E eingegeben werden 3 Navigation zwischen den Eingabefeldern mit den adi 25 P Cursor Tasten O O 0 370 0 504 As 0 280 f A260 A280 1 86 0 190 235 248 257 266 275 Sep gt spectra spectra 0 tree eset z Save Cancel Bei allen 3 Varianten f hrt der Softkey reset zoom zur Ausgangsdarstellung des Spektrums zur ck More calculations Drucken Sie den Softkey More calc process results more calc Gs DNA 2012 06 01 17 04 47 Entries 13 Total volume of sample 100 pL ID Molecular mass 287 basepairs 196 kDa 6 0 Calculations s UugimL dsDNA 6 0 pg mL 0 120 Ay 0 6 Hg total amount in sample 30 7 pmol mL 3 1 pmol total amount in sample Jl H Wi Save H Cancel pro
28. 80 Auswahl Nur fur Nukleinsauren ein aus Anzeige der Ratio A260 A280 zusatzlich zum Ergebnis bei der Probenmessung A260 A230 Auswahl Nur fur Nukleinsauren ein aus Anzeige der Ratio A260 A230 zusatzlich zum Ergebnis bei der Probenmessung Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic 39 Deutsch DE Parameter FOI Eingabe Auswahl none dye kb pmole ug Erlauterung Nur fur die Methodengruppe Dye labels Anzeige des FOI zusatzlich zum Ergebnis bei der Probenmessung Der FOI Frequency of Incorporation ist ein Ma f r die Zahl der in die Nukleins ure eingebauten Farbstoffmolek le pro Molek l der Nukleins ure Einheiten sind dye kb Molek le Farbstoff pro 1000 Basen oder pmole ug pmol Farbstoff pro ug Nukleins ure none keine FOl Berechnung Background Auswahl ein aus Vor der Ergebnisberechnung einer Probe wird die Extinktion einer Background Wellenl nge bei der der zu messende Analyt die Extinktion Null zeigen soll von der Extinktion der Messwellenl nge subtrahiert H ufige Anwendung Partielle Tr bungskorrektur bei Messung von Nukleins uren Background Wellenl nge hierf r 320 nm oder 340 nm Wavelength Wellenl nge in nm Bereich 200 bis 830 nm Wellenl nge bei der der Background gemessen werden soll Der zu messende Analyt sollte hier in reiner Form den Extinktionswert Null haben Background for dyes Auswahl ein aus Nur f r die Metho
29. A sind vorprogrammiert Die Parameter unterscheiden sich durch den Faktor Vorprogrammierte Methode fur Mikroliterkuvetten Messung von DNA in Probenvolumen im Mikroliterbereich mit Lichtweg 1 mm mit Mikroliterk vetten wie Eppendorf uCuvette G1 0 oder Hellma TrayCell Zusatzinformationen zur Reinheit der gemessenen Nukleins ure Ratio A260 A280 Ratio A260 A230 Extinktions Wellenlangen Spektrum der Nukleinsaure Extinktion der Background Wellenlange voreingestellt 320 nm die Extinktion der reinen Nukleins ure sollte hier annahernd Null betragen Partielle Trubungskorrektur ber Parameter Background m glich Umrechnung der Konzentrationen in molare Konzentrationen sowie nach Eingabe des Probenvolumens in Nukleins uremengen m glich Methodenschritt process results Proteins direct UV Konzentrationsbestimmung von Proteinen durch Messung bei 280 nm und Auswertung Uber Faktor oder Standard Vorprogrammierte Methoden zur direkten Ausgabe der Extinktionen als Ergebnis Protein A 280 sowie zur Auswertung ber Albumin spezifischen Extinktionskoeffizienten Albumin A 280 Vorprogrammierte Methode f r Mikroliterk vetten Messung von Protein in Probenvolumen im Mikroliterbereich mit Lichtweg 1 mm mit Mikroliterk vetten wie Eppendorf uCuvette G1 0 oder Hellma TrayCell Zusatzinformationen zur Reinheit des gemessenen Proteins Extinktion der Background Wellenl nge voreingestellt 320 nm die Extinktion des reinen Proteins sollte h
30. Messergebnissen mit den Ergebnissen anderer Photometer Spektralphotometer dass die Werte von der Bandbreite der Ger te abh ngen k nnen In den folgenden F llen k nnen die Unterschiede erheblich sein Das Extinktionsspektrum weist bei der Messwellenl nge einen schmalen Peak auf e Es wird nicht am Maximum sondern auf der Flanke eines Peaks gemessen Kontrollieren Sie daher die Richtigkeit der Methode durch die Messung von Standards 12 1 Extinktionswerte Extinktionswerte werden als Axxx XXX steht f r die Wellenl nge dargestellt Diese Anzeigen entsprechen immer den direkt gemessenen Werten d h ohne Korrekturen die in die anschlie ende Auswertung einflie en wie z B Korrekturen f r optische Schichtdicken der K vette oder Background Korrekturen 12 1 1 Blank Alle Extinktionswerte sind immer auf den zuletzt gemessenen Blank Leerwert bezogen Eine Blank Messung ist daher zu Beginn einer jeden Messreihe obligatorisch und auch w hrend einer Messreihe jederzeit m glich Die Blank Messung sollte idealerweise alle Einflussm glichkeiten auf den Extinktionswert der Messl sung kompensieren k nnen Der Blank sollte daher mit dem auch f r die Probenmessung benutzten Puffer sowie in derselben K vette wie der Probenwert gemessen werden es sei denn die f r Blank und Probenmessung benutzten K vetten sind optisch gegeneinander abgeglichen haben also denselben Extinktionswert bei der Messwellenl nge 12 1 2 Background Korrek
31. Messpunkte legen dass fur die Messpunkte moglichst geringe Abweichungen von der Funktion resultieren Bei den Regressionsverfahren wird neben der berechneten Regressionsgleichung auch das Bestimmtheitsma coefficient of determination als Ma f r die Streuung der Messpunkte um die berechnete Funktion angezeigt Bei einem Wert von lt 0 8 f r das Bestimmtheitsma wird das Ergebnis mit einer Warnung versehen Wenn der erste Standard die Konzentration 0 hat w hlen Sie die Einstellung dass die Regressionsgerade Regressionskurve durch den Nullpunkt geht Wenn keines der f r kurvenf rmige Verl ufe empfohlenen Verfahren zufriedenstellende Ergebnisse bringen w hlen Sie das Verfahren linear interpolation Auswerteverfahren Eppendorf BioSpectrometer basic 97 Deutsch DE 12 4 Verd nnung Im Methodenschritt measure samples eingegebene Verd nnungen werden bei der Ergebnisberechnung ber cksichtigt C Dil korr C x Lou korr Mit Verd nnungsfaktor umgerechnetes Ergebnis Vp Volumen der Probe in der Messl sung Vpi Volumen des Diluents in der Messl sung 12 5 Spezielle Auswerteverfahren f r Nukleins uren und Protein UV Dieser Abschnitt bezieht sich auf die Auswertung von Nukleins uren bzw Proteinen in den Methodengruppen Nucleic acids und Proteins direct UV sowie der entsprechenden Biomolek lkomponenten in der Methodengruppe Dye labels 12 5 1 Korrektur A260 und Korrektur A280 Anwendung Korrektur des Einfluss
32. Spectrometer basic Deutsch DE Peak detection Drucken Sie den Softkey Peaks Zur Peak Erkennung k nnen Sie zwei Kriterien variieren e A Raster Beurteilungsraster auf der Wellenl ngenskala fur die Peak Erkennung z B 10 nm Beispiel 10 nm Der Spektrenausschnitt von 5 nm bis 5 nm in Bezug auf den zu erkennenden Peak wird beurteilt e Mind A Abs Minimale Differenz zwischen dem zu erkennenden Peak und der niedrigsten Extinktion im Beurteilungsraster Gleichzeitig darf kein Extinktionswert im Raster hoher sein als der Wert des Peaks z B 0 5 Beispiele Sean 2010 07 09 16 01 35 Abs A 03 ID 0 800 IN A Raster Es 100 nm gem IT iech Min A Abs 0 050 oan Sa d 4 j gt ke y 0 000 nn 230 260 290 320 350 mm Move A curso A and Y keys Peak table Save Cancel process results peak detect Sean 2010 07 09 16 01 35 Abs A 03 ID 0 800 ffi LA A Raster A 20 nm 0 600 Min A Abs Vs 0 400 Dam 0 200 en a and key R 230 260 290 320 350 Aimm GER A and Y keys Peak table Save Cancel process results peak detect Scan 2010 07 09 16 01 35 Abs A 03 ID A Raster 20 nm Min A Abs 0 050 0 400 S 4 and P key 0 000 A 230 260 290 320 350 Bu Ac Peak table Save Cancel A Raster 100 nm Mind A Abs 0 050 Der Peak wird nicht erkannt da das A Raster z
33. Spektrum Bildausschnitt ver ndern Verfahren SpectraZoom siehe Tab 6 3 auf S 52 delete Aktuelle Auswahl in die nachsthohere Ebene verlassen Eingabe l schen Innerhalb einer Zeichenfolge wird das Zeichen links vom Cursor geloscht Ausgew hlte Methode oder Funktion aufrufen Auswahlliste ffnen Eingabe oder Auswahl best tigen standard Standardmessung starten Leerwertmessung starten Probenmessung starten Bedienung Eppendorf BioSpectrometer basic 23 Deutsch DE 5 1 1 Text eingeben Texte k nnen Sie bei der Vergabe von Methodennamen und Ergebniseinheiten eingeben Einschr nkung F r Methodennamen sind nur Ziffern und Buchstaben sowie der Unterstrich _ erlaubt a es Mit den Cursor Tasten und navigieren Sie im edd Eingabefeld und k nnen einzelne Positionen im Method name dsDNA Namen ver ndern Target directory mavantasvyMetnods E REY l OFavorites MyMethods e Keyboard Tastatur einblenden e abc Wechsel zwischen Gro und Kleinbuchstaben bei Eingabe ber den Tastenblock e Save Eingegebenen Text speichern W hlen Sie EE Verzeichnis e Cancel Texteingabe abbrechen oder ein Zielverzeichnis in Favorites Keyboard abc Save Cancel a al ale ee Mit den Cursor Tasten w hlen Sie die Enter tha namei and storagallocation eingeblendeten Zeichen aus und best tigen jeweils Method name PGRipred mit der Taste enter Wie bei
34. ards e Verschiedene Auswerteverfahren Curve fit wie lineare Regression nichtlineare Regression sind ausw hlbar Grafische und tabellarische Anzeige der Standardergebnisse e Nutzung der letzten gespeicherten Standardauswertung ist m glich Eine Methode f r die Auswertung mit Standardkurve ist vorprogrammiert 6 2 4 Methodengruppe Advanced Dual wavelength Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic 35 Deutsch DE e Messung bei zwei Wellenl ngen und Auswertung der gemessenen Extinktionswerte Uber zwei Grundformeln Subtraktion Division e Varianten der Grundformeln k nnen definiert werden Des Resultat kann mit einem Faktor mit einem Standard oder mit einer Standardreihe ausgewertet werden e Methoden f r die Berechnung ber Subtraktion sowie ber Division und nachfolgender Auswertung mit Faktor sind vorprogrammiert 6 3 Methodenparameter In diesem Kapitel werden die Parameter f r die Programmierung der Methoden erl utert Die Reihenfolge der Parameter in der Ger teanzeige kann im Vergleich zur Reihenfolge in der Tabelle bei einigen wenigen Methoden leicht ver ndert sein um die Parameter in der Anzeige bersichtlich darzustellen Die Tabelle stellt die Gesamtheit aller f r die verschiedenen Methoden verf gbaren Parameter dar F r die jeweilige Methode wird davon nur ein geringer Teil ben tigt und in der Anzeige dargestellt Parameter Cuvette No of wavelengths Eingabe Auswahl 10151
35. auf die Berechnung der molaren Nukleinsaurekonzentration siehe Umrechnung in molare Konzentrationen und Nukleinsduremengen auf S 98 Dyes Diese Parameter werden bei der Auswahl eines Farbstoffs Dyes bei der Programmierung einer Methode der Gruppe Dye labels in die Methodenparameter geladen e Dye name Neben dem Namen k nnen Sie zur Definition des Faktors fur die e Wavelength Berechnung der Konzentration aus der Extinktion die folgenden Daten e Ext coeff eingeben Factor Faktor oder Extinktionskoeffizient e Corr A260 Die Korrekturfaktoren fur die Extinktionen bei 260 bzw 280 nm werden e Corr A280 benutzt wenn die Korrekturfunktion in den Methodenparametern aktiviert ist Genaueres ist im Kapitel zur Auswertung beschrieben siehe Korrektur A269 und Korrektur Azgo auf S 97 Units Aus allen verfugbaren Einheiten konnen Sie bei der Programmierung von Methodenparametern eine Einheit auswahlen e Unit Eine noch nicht programmierte Einheit fur das Konzentrationsergebnis eingeben O e Kenndaten fur Proteine die nicht ab Werk vorprogrammiert sind k nnen in der Datenbank expasy ermittelt werden http www expasy org tools protparam html e Eine Tabelle mit A o Werten f r viele Proteine finden Sie auch in C N Pace et al Protein Science 1995 4 2411 2423 Tabelle 5 Die A1o Werte m ssen mit 0 1 multipliziert werden um die ben tigten Ag 19 Werte zu erhalten Funktionen Eppendorf BioSpectrometer basic Deuts
36. bei der Anwendung von chemischen Substanzen gt Wenden Sie sich in Zweifelsf llen an den Hersteller dieses Produktes ACHTUNG Sch den durch unsachgem e Verpackung Die Eppendorf AG haftet nicht f r Sch den durch unsachgem e Verpackung gt Lagern und transportieren Sie das Ger t nur in der Originalverpackung ACHTUNG Sch den durch unsachgem e Reinigung des K vettenschachts gt Reinigen Sie den K vettenschacht nur mit einem feuchten Wattest bchen siehe Reinigung auf S 69 gt Lassen Sie keine Fl ssigkeit in den K vettenschacht gelangen gt Fassen Sie nicht mit dem Finger in den K vettenschacht 2 4 Hinweise zur Produkthaftung In den folgenden F llen kann der vorgesehene Schutz des Ger ts beeintr chtigt sein Die Haftung f r entstehende Sach und Personensch den geht dann auf den Betreiber ber Das Ger t wird nicht entsprechend der Bedienungsanleitung benutzt Das Ger t wird au erhalb des bestimmungsgem en Gebrauchs eingesetzt Das Ger t wird mit Zubeh r oder Verbrauchsartikeln verwendet die nicht von Eppendorf empfohlen werden Das Ger t wird von Personen die nicht von Eppendorf autorisiert wurden gewartet oder instand gesetzt e Am Ger t werden vom Anwender unautorisiert nderungen vorgenommen 2 5 Sicherheitshinweise am Ger t Darstellung A Bedeutung Gefahrenstelle Beachten Sie die Bedienungsanleitung Ort Ruckseite des Ger ts
37. cess results more calc ssDNA Cy 3 2010 11 29 12 08 12 Entries 03 Total volume of sample 50 yL 1D Molecular mass 1309 bases 0 kDa 9 0 Calculations Upgimt ssDNA 9 0 pg mL 0 244 Aso 0 5 Hg total amount in sample Dye 1 0 214 pMolyl Cy3 0 214 pMol uL 10 7 pmol total amount in sample d H Save H SE H Jl Jl Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic 53 Deutsch DE Methodengruppe Nucleic acids Nach Eingabe der Molmasse alternativ in Basen Basenpaaren oder in kDa Konzentrationsergebnis in die molare Konzentration umrechnen Nach Eingabe des Probenvolumens Gesamtmenge in der Probe berechnen Methodengruppe Dye labels Nukleins ure e Nach Eingabe der Molmasse alternativ in Basen Basenpaaren oder in kDa Konzentrationsergebnis in die molare Konzentration umrechnen Nach Eingabe des Probenvolumens Gesamtmenge in der Probe berechnen Farbstoff Nach Eingabe des Volumens der Probe Gesamtmenge in der Probe berechnen O e Fur dsDNA wird bei der Berechnung der molaren Konzentration eine doppelstrangige Nukleinsaure angenommen Fur die Methoden ssDNA RNA und Oligo wird eine einzelstrangige Nukleinsaure angenommen e F r Methoden die in der Hauptgruppe Routine Methodengruppe Nucleic acids ber lt New Method gt neu programmiert wurden werden fur die Berechnung der molaren Konzentration immer doppelstrangige Nukleinsauren angenommen 54 Methoden Eppendorf Bio
38. ch DE 12 6 2 Berechnung der FOI Als Wert fur das Verh ltnis von Farbstoffmolek len zur Menge der Nukleotide in der Nukleins ure wird bei den Dye Methoden die Einbaurate FOI Frequency of Incorporation berechnet und angezeigt Die Berechnung kann fur zwei verschiedene Ergebniseinheiten ausgewahlt werden Einheit MOLEKULE dye kb _ Any 10 xMM A FOI E Dye xxx F NA Einheit pmol ug DNA bzw RNA FOI Zon x 10 Dye Aaen xF NA Ayyy Extinktion des Farbstoffs Axxx Extinktion der Nukleins ure MM y durchschnittliche Molmasse der Nukleotide 330 g mol Eva Faktor zur Berechnung der Nukleins ure Epye Extinktionskoeffizient f r den Farbstoff Einheit cm1M71 12 6 3 Umrechnung in Farbstoffmengen Die Berechnung der Menge Masse an Farbstoff im gesamten Probenvolumen erfolgt im Methodenschritt process results More calculations M C x V pioa M berechnete Gesamtmenge Masse des Farbstoffs im Probengef Einheit pmol C aus der Messung berechnete Konzentration des Farbsroffs Einheit pmol uL Vp gesamt Gesamtvolumen der Probe im Probengef wird vom Anwender in More calculations eingegeben Einheit uL 101 Auswerteverfahren 102 Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 12 7 Dual wavelength Fur Methoden der Gruppe Dual Wavelength konnen Extinktionen die bei zwei Wellenl ngen gemessen wurden miteinander verrechnet werden bevor die berechnete Extinktion in
39. ch DE 7 1 3 Absorbance Spectra Library In der rechten Spalte wahlen Sie das Spektrum aus Functions Sub Grease RE das Sie aufrufen m chten und best tigen Sie mit i Results memory enter Nitrophenol Softkeys Export und Print Auf einen USB Stick oder per USB Kabel zu einem PC exportieren bzw drucken siehe print amp export auf S 55 e OK In die Funktionsauswahl zur ckkehren 7 1 4 Device Settings Folgende Einstellungen k nnen angepasst werden Functions Main Groups Sub Groups Functions Results memory Device Settings Gen method param Network e General Abs spectra library E Mai Device sanas TAERE e Network Device calibration e E Mail into Date and Time Language Engel Device name BioSpectrometer bes Self test interval Weekly iz last self test 2015 06 04 09 52 46 Spectrometer unit OIJ Lasel Jl Save Cancel IP Get iP settings via DHCP IP address 192 168 20 61 Subnet mask 255 255 255 0 Default gateway 192 168 20 1 DNS MGet DNS settings via DHCP Primary DNS server 192 168 20 1 Secondary DNS server 192 168 20 1 Test MAC Info Save Cancel Funktionen Eppendorf BioSpectrometer basic 65 Deutsch DE General Device Settings Sprache ausw hlen Deutsch Englisch Franz sisch Spanisch Italienisch e Geratename H ufigkeit der automatischen Selbst berpr fung nac
40. cht gelangt Sofern zur Beseitigung der Verunreinigung mit Wasser befeuchtet werden musste reinigen Sie abschlie end mit einem mit Ethanol oder Isopropanol befeuchteten Wattest bchen um das Trocknen des K vettenschachts zu beschleunigen 70 Instandhaltung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 8 1 1 Kuvettenschachtabdeckung reinigen Wenn Sie nicht nur die direkt zug ngliche Oberfl che der K vettenschachtabdeckung reinigen m chten k nnen Sie die Abdeckung ausbauen O gt Weichen Sie die K vettenschachtabdeckung nicht in Reinigungsmittel ein gt Reinigen Sie die K vettenschaftabdeckung wie beschrieben 1 Heben Sie die K vettenschachtabdeckung mit einer Hand an 2 Fassen Sie mit der anderen Hand die Abdeckung auf H he des Haltestifts und ziehen Sie die Abdeckung nach rechts bis der Haltestift ganz herausgezogen ist O e Ziehen Sie die Abdeckung im 90 Grad Winkel nach rechts 3 Reinigen Sie die Abdeckung mit einem Tuch oder einem fusselfreien Wattest bchen das Sie mit einem milden Reinigungsmittel befeuchtet haben 4 Schieben Sie den Haltestift bis zum Anschlag wieder in das Geh use hinein Der Haltestift ist im Geh use ganz verschwunden O Verschlie en Sie bei Nichtgebrauch des Photometers den K vettenschacht mit der blauen K vettenschachtabdeckung um ihn vor Staub und anderen Verschmutzungen zu sch tzen Instandhaltung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 8 2 Des
41. den Parametern aktiviert Scan Navigieren Sie zwischen den Messpunkten im Graphen mit und Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 49 Methodengruppe Hauptgruppe Basic Ergebnisanzeige Erlauterung Factor standard Analog zu Protein direct UV siehe oben Ergebnisanzeige e Konzentrationsergebnis mit Extinktion bei der Messwellenlange Calibration curve Analog zu Proteins with reagent siehe oben Ergebnisanzeige e Konzentrationsergebnis mit Extinktion bei der Messwellenlange e Graph der Standardauswertung mit eingezeichnetem Probenergebnis Hauptgruppe Advanced Dual wavelength aaa measure samples printa export new series Division 2010 07 02 14 27 47 02 Dil 10 90 pL ID 20 08 worn 0 803 A Ai 0 679 mo Dino A2 0 845 Ass A v Dilution Edit ID Finish lt Back Next gt Ergebnisanzeige e Konzentrationsergebnis Wird aus Acalc Mit Faktor oder Standardauswertung berechnet e Acaic Wird mit der in den Parametern definierten Formel aus den bei den beiden Wellenlangen gemessenen Extinktionen berechnet e Extinktionswerte die bei den beiden Messwellenlangen gemessen wurden Zusatzdaten Softkey Data Sofern die entsprechenden Parameter aktiviert wurden e Extinktionswert fur die Background Wellenl nge 50 Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 6 45 process r
42. dengruppe Dye labels Anwendung der Background Korrektur auf die Messung des Farbstoffs siehe Parameter Background Wavelength Wellenl nge in nm Nur f r die Methodengruppe Dye labels Bereich 200 bis 830 nm Wellenl nge bei der der Background f r den Farbstoff gemessen werden soll Der zu messende Farbstoff in reiner nicht kontaminierter Form sollte bei dieser Wellenl nge den Extinktionswert Null haben Autoprint Auswahl Ausdruck eines Messergebnisses direkt nach der Messung ein aus mit dem Thermodrucker Es werden nur die wesentlichen Ergebnisdaten ausgedruckt F r die Ausgabe detaillierterer Daten k nnen Sie zum Abschluss der Messserie im Methodenschritt print amp export die gew nschten Datenpakete zusammen stellen und ausdrucken 40 Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 6 4 Methodenablauf Bradtord oc parameters E Der Wizard am oberen Rand der Anzeige fuhrt Sie durch den Methodenablauf Der jeweils aktive Se sc ase RR Methodenschritt ist hervorgehoben Wavelength 595 nm Unit pg mL Calculation Standard Standards 6 Replicates 1 Decimal places 0 Autoprint off Edit Pave up Pagedn Abort lt Back Next gt Ein Methodenablauf umfasst maximal 5 Schritte Der jeweils aktive Schritt ist optisch hervorgehoben Nach dem letzten Schritt print amp export einer Messreihe wird als weiterer Schritt der Start einer neuen Messreihe angeboten Diese beginnt wiede
43. durchzuf hren S Copy oder Copy Softkey drucken um eine beschriebene Handlung durchzufuhren bi Zusatzliche Informationen 1 4 Abkurzungen A Absorbance Extinktion DNA Deoxyribonucleic acid Desoxyribonukleins ure DNS dsDNA double stranded DNA doppelstr ngige DNS Dye Methoden Anwendungshinweise Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Methoden der Gruppe Dye labels fur die Messung von farbstoffmarkierten Biomolek len FOI Frequency of Incorporation Ma f r die Menge an Farbstoffmolek len bezogen auf die Zahl der Nukleotide in farbstoffmarkierten Biomolek len M mol L molar OD600 Optische Dichte bei der Wellenl nge 600 nm RNA Ribonucleic acid Ribonukleins ure RNS ssDNA single stranded DNA einzelstr ngige DNS UV Ultraviolette Strahlung Vis Visible light sichtbares Licht VK Variationskoeffizient Standardabweichung Mittelwert in Prozent 9 Anwendungshinweise 10 Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Allgemeine Sicherheitshinweise Eppendorf BioSpectrometer basic 11 Deutsch DE 2 Allgemeine Sicherheitshinweise 2 1 Bestimmungsgem er Gebrauch Einsatzgebiet des BioSpectrometer basic ist das Forschungslabor in Molekularbiologie Biochemie und Zellbiologie Das BioSpectrometer basic ist ausschlie lich f r die Verwendung in Innenr umen bestimmt Die l nderspezifischen Sicherheitsanforderungen f r den Betrieb elektrisc
44. e of unauthorized modifications to the product A O 3 i or an unintended use this declaration becomes invalid C AA ac ce c 3 ce ce CE et ce Get a 1 cc C C A Ge er Produktbezeichnung Product name x dech GL A wet vr er ce ee ce doch Get y ce c L e HA er cE t c c ce Ck Wi g ce Ce ci en d ec ka Sch ee o e e 2006 95 EG d oi i tes Cc a e Se 2004 108 EG EN re E E ei E e ac C amp 2011 65 EU EE e ce 2 ce oa E h ed ec c EC tE ce ce Ce Cc Vorstand Board of Management Projektmanagement Proje t Management Go LC et cE e C ete 21 09 2012 e ce ai e Hamburg Date t ce c cl e c ce e C ri ce ER 4 c ce a si c e E e dech ce ce H Geht A ce e Ce c i 3 d AA endorf A E C Go a Eppendorf AG Barkhausenweg 1 22339 Hamburg Germany ei 3 Le AT Er CE Te ANS L gt LETRA Ce e Le ye CE c Es Go SC Cot E Go Go Go o ok er Se ce Go Le us Cc E EE CE ae CE E EE EE Ee CE e E e ce cee Ce Evaluate Your Manual Give us your feedback www eppendorf com manualfeedback Your local distributor www eppendorf com contact Eppendorf AG 22331 Hamburg Germany eppendorf eppendorf com www eppendorf com eppendorf
45. em Datum der Messreihe zusammen FREE Van ale Navigieren Sie mit den Cursor Tasten und Select an export method ey g OExport to external storage medium bestatigen Sie mit enter OExport to PC endosar email E Export to external storage medium Daten auf email example com e einen USB Stick speichern Wenn kein USB Stick angeschlossen ist ist diese Variante nicht anwahlbar Export to PC Daten auf einem PC speichern deen Export via email Daten an eine E Mail Adresse schicken ji Jl ie IRSCH RR Export auf USB Stick 1 Schlie en Sie einen USB Stick FAT 32 formatiert an den USB Anschluss 4 an siehe Gesamtillustration aufS 15 2 Starten Sie mit Export den Export auf ein externes Speichermedium Export auf PC Voraussetzung f r das Betriebsystem des PC Windows XP SP2 oder h here Version 1 Verbinden Sie das Ger t mit dem PC ber das USB Kabel am USB Anschluss 8 siehe Gesamtillustration aufS 15 2 Stellen Sie bei wiederholtem Export sicher dass zuvor exportierte Daten auf die Festplatte des PC gespeichert wurden da diese sonst durch den erneuten Export berschrieben w rden Starten Sie mit Export den Export auf den PC 4 Das exportierte Datenpaket wird auf Ihrem PC als Wechseldatentr ger mit dem Namen eppendorf angezeigt ffnen Sie die Datei in diesem Laufwerk und speichern Sie sie auf der Festplatte Ka Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic 57 Deutsch DE E
46. em Gerat liegen z B lose Blatter Hefte die die Luftzufuhr behindern konnen 4 3 Ger t an das Netz anschlie en 1 Stellen Sie das BioSpectrometer basic auf eine geeignete Arbeitsflache 2 Uberzeugen Sie sich dass Netzspannung und Netzfrequenz mit den Angaben auf dem Typenschild bereinstimmen 3 Verbinden Sie das Ger t mit dem Stromnetz und schalten Sie es mit dem Netzschalter ein 4 Entfernen Sie die Schutzfolie vom Display 18 Installation Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 4 4 Gerat mit einem Netzwerk verbinden O Die Verbindung des Ger ts mit einem Netzwerk ist optional Sie k nnen das Ger t auch ohne Netzwerkverbindung betreiben Informationen zu Netzwerkeinstellungen siehe Device Settings auf S 64 Voraussetzung Ethernet Kabel RJ45 1 Verbinden Sie das Ethernet Kabel mit der Anschlussbuchse des Netzwerks 2 Verbinden Sie das Ethernet Kabel mit der Anschlussbuchse Ethernet 10 siehe Gesamtillustration auf S 15 Netzwerkdrucker Ein Netzwerkdrucker wird unter folgenden Voraussetzungen automatisch vom Ger t erkannt e Drucker befindet sich im gleichen Netzwerksegment wie das Ger t e Drucker unterst tzt das Zeroconf Protokoll e Drucker ist PostScript f hig 4 5 Drucker am USB Anschluss anschlie en 4 5 1 Thermodrucker DPU S445 Voraussetzung Auf dem Ger t ist die Software Version 3 4 4 0 oder h her installiert In den Druckereinstellungen ist der Thermodrucker DPU S445 aus
47. eneral Method Parameter Proteins f r jedes Protein eingegeben wird Alternativ zur Eingabe des Faktors kann entweder Ag 79 oder der Extinktionskoeffizient plus die Molmasse des Proteins eingegeben werden In diesem Fall wird der Faktor wird wie folgt berechnet 1 F Aoa F Faktor f r das Protein Einheit g L Ag 1 Extinktion des Proteins bei einer Konzentration von 0 1 1 g L Bei Eingabe des molaren Extinktionskoeffizienten und der relativen Molmasse des Proteins kann Ag 1 hieraus berechnet werden E P An ue MM ep molarer Extinktionskoeffizient des Proteins Einheit cm 1M 1 MMp relative Molmasse des Proteins Einheit Da Eingabe in General Method Parameter in kDa 12 6 Spezielle Auswerteverfahren f r die Dye Methoden 12 6 1 Berechnung des Faktors fur den Farbstoff aus dem Extinktionskoeffizienten Bei den Dye Methoden wird die Konzentration des Farbstoffs mit einem Faktor aus der gemessenen Extinktion errechnet siehe Auswertung mit Faktor oder Standard auf S 95 Der Faktor wird in der Funktion General Method Parameter Dyes f r jeden Farbstoff eingegeben Alternativ zur Eingabe des Faktors kann der Extinktionskoeffizient eingegeben werden In diesem Fall wird der Faktor wird wie folgt berechnet 6 Be Dye Dye F Faktor f r den Farbstoff Einheit pmol uL e Extinktionskoeffizient f r den Farbstoff Einheit cm Mol L Auswerteverfahren Eppendorf BioSpectrometer basic Deuts
48. engruppe Dual wavelength sowie Berechnung von Ratios wie A26 A2g0 bei Nukleins uremessungen 10 Arata Mass x Cuv Axxx korrCuv rechnerisch korrigierte Extinktion bei der Wellenl nge XXX nm Axxx gemessene Extinktion bei der Wellenl nge XXX nm Cuv Schichtdicke der K vette Auswerteverfahren Eppendorf BioSpectrometer basic 95 Deutsch DE 12 2 Auswertung mit Faktor oder Standard C AxF C berechnete Konzentration A Extinktion F Faktor Der Faktor ist in der Parameterliste programmiert und kann ver ndert werden Er bezieht sich immer auf die K vettenschichtdicke 10 mm Wenn Sie den Parameter Cuvette ndern wird die nderung vom Ger t bei der Ergebnisberechnung ber cksichtigt Sie m ssen den Faktor f r die Auswertung also nicht ndern Wenn Sie die Konzentrationseinheit ndern m ssen Sie dagegen darauf achten dass der Faktor an die gew hlte Einheit angepasst ist Der Faktor wird entweder beim Auswerteverfahren Factor direkt als Parameter eingegeben oder beim Auswerteverfahren Standard Auswertung mit einer Standardkonzentration berechnet F berechneter Faktor Cs Konzentration des Standards als Parameter eingegeben As gemessene Extinktion des Standards Wurde f r den Standard Mehrfachmessung 2 oder 3 Replikate programmiert wird aus den gemessenen Extinktionen der Replikate der Mittelwert gebildet und als As eingesetzt 96 Auswerteverfahren Eppendorf BioSpectr
49. eppendorf Register your instrument www eppendorf com myeppendorf seeeeeee e seeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeseeeeeeeeeg ses eeseseeseeseeseeeeseesgessesseseeseeseseeseeeesses ee 0101020011001 101811 TE LT Tr 0 Te IIA Bedienungsanleitung Copyright 2015 Eppendorf AG Germany All rights reserved including graphics and images No part of this publication may be reproduced without the prior permission of the copyright owner Trademarks Cy is a registered trademark of GE Healthcare UK Ltd UK Hellma is a registered trademark of Hellma GmbH amp Co KG Germany Eppendorf and the Eppendorf logo are registered trademarks of Eppendorf AG Germany Eppendorf BioSpectrometer Eppendorf SpectraZoom and UVette are registered trademarks of Eppendorf AG Germany Registered trademarks and protected trademarks are not marked in all cases with or in this manual This product is manufactured under license to issued U S Patent No 6 122 052 Protected by U S Patent No 8 464 171 6135 900 050 04 062015 Inhaltsverzeichnis Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Inhaltsverzeichnis T Amwendungshinweise cece cee cece cere tere cette reece tenses eens 7 1 1 Anwendung dieser Anleitung 7 1 2 Gefahrensymbole und GefahrenstufeN 2 2 0 0 00 ee eee eee 7 1 2 1 Gef hrensymbole ssas cts ees ere a aa re E Pade E 7 ES SC Geelen EC sons cc tet ceca EE 7 1 3 Darstellungskonventionen
50. er h her dem Laboratory Biosafety Manual Quelle World Health Organization Laboratory Biosafety Manual in der jeweils aktuell g ltigen Fassung WARNUNG Gesundheitsgefahr durch kontaminiertes Ger t und Zubeh r gt Dekontaminieren Sie Ger t und Zubeh r vor dem Lagern oder Versenden VORSICHT Sicherheitsm ngel durch falsche Zubeh r und Ersatzteile Zubeh r und Ersatzteile die nicht von Eppendorf empfohlen sind beeintr chtigen die Sicherheit Funktion und Pr zision des Ger ts F r Sch den die durch nicht empfohlene Zubeh r und Ersatzteile oder unsachgem en Gebrauch verursacht werden wird jede Gew hrleistung und Haftung durch Eppendorf ausgeschlossen gt Verwenden Sie ausschlie lich von Eppendorf empfohlenes Zubeh r und Original Ersatzteile 2 3 2 Allgemeine Sicherheitshinweise Eppendorf BioSpectrometer basic 13 Deutsch DE Ger teschaden amp x ACHTUNG Sch den durch aggressive Chemikalien gt Verwenden Sie am Ger t und Zubeh r keine aggressiven Chemikalien wie z B starke und schwache Basen starke S uren Aceton Formaldehyd halogenierte Kohlenwasserstoffe oder Phenol gt Reinigen Sie das Ger t bei Verunreinigungen durch aggressive Chemikalien umgehend mit einem milden Reinigungsmittel ACHTUNG Ger teschaden durch Begasung mit aggressiven Chemikalien gt F hren Sie am Ger t keine Desinfektion durch Begasung durch ACHTUNG Korrosion durch ag
51. erem K vettenschacht und geschlossener K vettenschachtabdeckung e Ger t ist defekt Wenden Sie sich an den Eppendorf Service Die Datei konnte nicht exportiert werden Beim Export von Daten e USB Stick falsch formatiert oder defekt e USB Stick zu fr h w hrend des Exports aus dem Ger t entfernt USB Stick neu formatieren oder ersetzen USB Stick erneut anschlie en und Export wiederholen Der Drucker konnte nicht initialisiert werden e Drucker nicht angeschlossen oder ausgeschaltet e Drucker falsch konfiguriert gt gt Drucker anschlie en und anschalten Drucker neu konfigurieren Die Druckereinstellungen zur richtigen Konfiguration finden Sie in der Installationsbeschreibung siehe Drucker am USB Anschluss anschlie en auf S 18 Blank Messung Eine Intensit t an einem eine Haupt oder Neben oder Scanwellenl nge beeinflussenden Pixel ist zu niedrig e Die f r die Blank Messung benutzte Leerwertl sung hat eine zu hohe Extinktion Falsche oder tr be Leerwertl sung e Bei Scans Wellenlangenbereich zu gro da die Probe in einem Teil des Wellenlangenbereichs sehr stark absorbiert Leerwertl sung Uberprufen und Blank ggf neu messen Bei Scans Wellenlangenbereich an Spektrum der Probe anpassen Der eingegebene Name ist nicht gultig e Fehler bei der Eingabe von Namen Verschiedene Ursachen sind m glich Zur konkreten Ursache bitte die I
52. es der Farbstoffextinktion auf die Nukleins ure bzw Proteinextinktion bei 260 und 280 nm bei den Methoden der Gruppe Dye labels Die Anwendung des Auswerteverfahrens kann in den Parametern Correct A260 bzw Correct A280 aktiviert werden A yyy cor Axor CF x Ayyy Axxx korr rechnerisch korrigierte Extinktion bei der Wellenl nge 260 nm bzw 280 nm Axxx gemessene Extinktion bei der Wellenl nge 260 nm bzw 280 nm CF Korrekturfaktor fur die Wellenlange 260 nm bzw 280 nm die beiden Korrekturfaktoren fur 260 nm und fur 280 nm sind fur einen Farbstoff spezifisch und werden in General Method Parameter Dyes im Bereich Functions programmiert Ayyy gemessene Extinktion bei der Wellenlange des Farbstoffs i Die in den Ergebnisanzeigen dargestellten Extinktionswerte sind die direkt gemessenen nicht korrigierten Extinktionswerte 98 Auswerteverfahren Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 12 5 2 Ratio A260 A280 und Ratio A260 A230 Anwendung Information zur Reinheit der gemessenen Nukleins ure Die Anwendung des Auswerteverfahrens kann in den Parametern A260 280 beziehungsweise A260 A230 aktiviert werden Ratio bezeichnet den Quotienten der gemessenen Extinktionen bei den genannten Wellenlangen Literaturwerte fur die Ratio Werte bei reinen Nukleinsauren A260 A280 e DNA 1 8 bis 1 9 e RNA 1 9 bis 2 0 Current Protocols in Molecular Biology 1994 A260 A230 Fur die Ratio A260 A230 findet man in der Literat
53. esults Nach der Probenmessung folgen im Methodenablauf zwei optionale Schritte process results und print amp export Im Schritt process results k nnen Sie bei einigen Methoden die Ergebnisse nachbearbeiten Beispiel Ver nderung des Spektrenausschnitts eines Scans Wie in der Ergebnisanzeige k nnen Sie mit den Cursor Tasten und zwischen den Probenergebnissen der Messreihe navigieren und gezielt Ergebnisse zur Nachbearbeitung ausw hlen Tab 6 3 Optionen bersicht Option Erl uterung Verf gbar in Methode Zoom Achsenbegrenzung bei Grunds tzlich alle Methoden f r die Extinktions Wellenl ngen Graphen der Parameter Scan angeboten wird ver ndern um die Darstellung auf und aktiviert wurde vergr erte Ausschnitte des Graphen zu e Multi A beschranken Scan e Nucleic acids e Proteins direct UV e Dye labels Nucleic acids Dye labels mit Nukleins uren als More calculations Konzentrationsergebnisse in molare Konzentrationen sowie nach Volumeneingabe in Gesamtmengen Biomolek l umrechnen Peak detection Peaks in Extinktions Wellenlangen Spektren e Scan erkennen asona HH measure prcs reu See Optionen fur die Nachbearbeitung werden auf den dsDNA 2010 07 16 16 32 54 beiden linken Softkeys angeboten In diesem EE Beispiel Zoom und More Calculations 0 450 vn 25 2 0 270 0 180 0 090 0 000 _________ ____ 4 y 230 260 290 329 Alam Zoom More
54. gew hlt siehe Device Settings auf S 64 Schlie en Sie den Thermodrucker DPU S445 an den USB Anschluss f r Drucker an 1 Verbinden Sie das Druckerkabel mit dem USB Anschluss f r Drucker 4 siehe Gesamtillustration auf S 15 2 Verbinden Sie das Druckerkabel mit dem Drucker 3 Schlie en Sie den Drucker ber das mitgelieferte Steckernetzteil und Netzkabel Zubeh r des Druckers an das Stromnetz an und schalten Sie ihn ein Hinweise zum Drucker finden Sie in der Bedienungsanleitung des Druckers Installation Eppendorf BioSpectrometer basic 19 Deutsch DE 4 6 PC oder USB Stick fur Datenexport anschlie en Sie k nnen einen USB Stick FAT 32 formatiert an den USB Anschluss 4 anschlie en siehe Gesamtillustration auf S 15 Alternativ k nnen Sie das Ger t f r den Datenexport ber ein USB Kabel direkt mit einem PC verbinden Voraussetzung e PC mit Windows Version XP SP2 oder h here Version USB Kabel mit je einem Stecker Typ A und Typ B gt Verbinden Sie das Ger t mit dem PC ber das USB Kabel am USB Anschluss 8 siehe Gesamtillustration auf S 15 O Sie ben tigen keine spezielle PC Software f r die Daten bertragung Ubertragene Datenpakete werden vom PC wie ein USB Stick als Wechseldatentr ger erkannt Um die Daten sichtbar zu machen m ssen Sie das angemeldete Datenpaket nur ffnen e Die bertragung von Daten auf den USB Stick oder an den PC starten Sie nach Abschluss der Messreihe im Meth
55. glich e Die angezeigten Extinktionswerte entsprechen immer den direkt gemessenen Werten Verd nnungs oder K vettenfaktor sowie Background Extinktionen werden erst f r die anschlie ende Ergebnisberechnung einbezogen siehe Extinktionswerte auf S 93 e Die Dauer vom Start einer Messung bis zur Anzeige eines Messergebnisses betr gt typischerweise ca 2 bis 3 Sekunden Wenn bei hohen Extinktionswerten wenig Licht auf den Empf nger gelangt kann die Messzeit automatisch auf bis zu 9 Sekunden verl ngert werden um die Pr zision der Messung zu erh hen e Achten Sie darauf dass die gemessenen Extinktionswerte die Obergrenze des photometrischen Messbereichs nicht berschreiten Verwerfen Sie in diesem Fall das Messergebnis Die Obergrenze des photometrischen Messbereichs ist nicht nur von der Wellenl nge siehe Photometrische Eigenschaften auf S 90 sondern auch vom K vettenleerwert abh ngig Ultramikrok vetten mit kleiner Blende wie TrayCell Hellma k nnen einen K vettenleerwert bis ca A 1 besitzen Um diesen Betrag wird der verf gbare photometrische Messbereich reduziert Den K vettenleerwert k nnen Sie absch tzen wenn Sie die mit demineralisiertem Wasser gef llte K vette als Probe gegen den leeren K vettenschacht als Blank messen Der K vettenleerwert der Eppendorf uCuvette G1 0 ist zu vernachl ssigen nahe A 0 Entfernen Sie nach der Messung die Messl sung vollst ndig bevor Sie die n chste Messl sung einf
56. gressive Reinigungs und Desinfektionsmittel gt Verwenden Sie weder tzende Reinigungsmittel noch aggressive L sungs oder schleifende Poliermittel gt Inkubieren Sie das Zubeh r nicht l ngere Zeit in aggressiven Reinigungs oder Desinfektionsmitteln ACHTUNG Sch den an elektronischen Bauteilen durch Kondensatbildung Nach dem Transport des Ger ts von einer k hlen in eine warmere Umgebung kann sich im Ger t Kondensat bilden gt Warten Sie nach dem Aufstellen des Ger ts mindestens 3 h Schlie en Sie das Ger t erst danach an das Stromnetz an ACHTUNG Beeintr chtigung der Funktion durch mechanische Sch den gt Stellen Sie nach einer mechanischen Besch digung des Ger tes durch eine berpr fung sicher dass die Mess und Auswertefunktionen des Ger tes korrekt ablaufen ACHTUNG Sch den durch berhitzung gt Stellen Sie das Ger t nicht in der N he von W rmequellen z B Heizung Trockenschrank auf gt Setzen Sie das Ger t keiner direkten Sonneneinstrahlung aus gt Gewahrleisten Sie eine ungehinderte Luftzirkulation Halten Sie um alle L ftungsschlitze einen Abstand von mindestens 5 cm frei Allgemeine Sicherheitshinweise 14 Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE ACHTUNG Sachschaden durch falsche Anwendung gt Setzen Sie das Produkt nur f r den in der Bedienungsanleitung beschriebenen bestimmungsgem en Gebrauch ein gt Achten Sie auf eine ausreichende Materialbest ndigkeit
57. h dem Einschalten des Ger ts einstellen e Informationen zum letzen Selbsttest werden angezeigt Softkeys Save nderungen speichern und in die Funktionsauswahl zur ckkehren e Cancel In die Auswahl der Parametergruppe ohne nderung zur ckkehren Network Settings Fragen Sie ihren Netzwerk Administrator welche Einstellungen erforderlich sind Auswahl ob IP Einstellungen automatisch per DHCP erfolgen sollen Die IP Einstellungen k nnen auch manuell eingegeben werden IP Adresse Subnetzmaske Standardgateway Auswahl ob DNS Einstellungen automatisch per DHCP erfolgen sollen Nur verf gbar wenn IP Einstellungen automatisch per DHCP bezogen werden Folgende DNS Einstellungen k nnen manuell eingegben werden Prim rer DNS Server Sekund rer DNS Server Softkeys e MAC Info Informationen zu Netzwerkeinstellungen e Save nderungen speichern und in die Funktionsauswahl zur ckkehren e Cancel In die Auswahl der Parametergruppe ohne nderung zur ckkehren 66 Funktionen Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE E Mail Settings mailserver example com Port 25 Sender e mail address biospec example com use SMTP authentication rer Password ed Recipient e mail address gmailOexample com jv SMTP server Test ABC Save Cancel E mail address eat Jl New Delete ok Region Europe City Berlin 5 Current time 2015 06
58. her Ger te im Laborbereich m ssen eingehalten werden Das BioSpectrometer basic dient zur photometrischen Konzentrationsbestimmung von Analyten in Fl ssigkeiten und zur Aufnahme von Extinktions Wellenl ngen Spektren in K vetten Verwenden Sie ausschlie lich Eppendorf Zubeh r oder von Eppendorf empfohlenes Zubeh r 2 2 Anforderung an den Anwender Ger t und Zubeh r d rfen nur von ausgebildetem Fachpersonal bedient werden Lesen Sie vor der Anwendung die Bedienungsanleitung und die Gebrauchsanweisung des Zubehors sorgfaltig und machen Sie sich mit der Arbeitsweise des Gerats vertraut 2 3 Gef hrdungen bei bestimmungsgem em Gebrauch 2 3 1 Personenschaden IN GEFAHR Stromschlag durch eintretende Flussigkeit A gt Schalten Sie das Ger t aus und trennen Sie es vom Stromnetz bevor Sie mit der Reinigung oder Desinfektion beginnen gt Lassen Sie keine Fl ssigkeiten in das Geh useinnere gelangen gt F hren Sie keine Spr hreinigung Spr hdesinfektion am Geh use durch gt Schlie en Sie das Ger t nur innen und au en vollst ndig getrocknet wieder an das Stromnetz an GEFAHR Explosionsgefahr A gt Betreiben Sie das Ger t nicht in R umen in denen mit explosionsgef hrlichen Stoffen gearbeitet wird gt Bearbeiten Sie mit diesem Ger t keine explosiven oder heftig reagierenden Stoffe gt Bearbeiten Sie mit diesem Ger t keine Stoffe die eine explosive Atmosph re erzeugen k nnen 12 Al
59. hneten Verd nnungsfaktor multipliziert 20 yl sample BQ yL diluent I 1 Clear ai 1 ok J cancel Softkeys e Clear dil Werte f r die Probenverd nnung l schen OK Probenverd nnung best tigen und zur Probenmessung zur ckkehren e Cancel Eingabe abbrechen und zur Probenmessung zur ckkehren Die Verd nnung wird f r alle nachfolgenden Probenergebnisse angewendet bis sie durch erneute Eingabe ge ndert wird Proben ID eingeben Die ID wird f r das nachfolgende Probenergebnis angewendet Bei Eingabe einer ID wird die zuletzt eingegebene ID vorgegeben um so schnell fortlaufend strukturierte IDs eingeben zu k nnen Eine doppelte Vergabe derselben ID innerhalb einer Messreihe ist nicht m glich 1 Dr cken Sie den Softkey Edit ID 2 Geben Sie die Proben ID maximal 12 stellig ein Enter a sample ID for the next sample Alternativen zur Texteinga be e Tastenblock Bei mehrmaligem Dr cken der Taste sample 0 EEE direkt hintereinander werden die Eingabemoglichkeiten dieser Taste durchlaufen Tastatur mit Softkey Keyboard einblenden Zeichen mit den Cursor Tasten auswahlen und mit enter best tigen Keyboard H se I 1 op Cancel Softkeys e Keyboard Tastatur einblenden e abc Wechsel zwischen Gro und Kleinbuchstaben bei Eingabe ber den Tastenblock OK ID Eingabe best tigen und zur Probenmessung zur ckkehren e Cancel Eingabe abbrechen und zur Probe
60. ichen Ursachen neu messen Das berechnete Ergebnis ist negativ Messl sung falsch angesetzt Faktor falsch eingegeben falsches Vorzeichen gt Unter Ber cksichtigung der m glichen Ursachen neu messen Mindestens eines der Ergebnisse ist negativ Bei Methoden mit mehreren Ergebnissen z B Dye labels Messl sung falsch angesetzt Faktor falsch eingegeben falsches Vorzeichen gt Unter Ber cksichtigung der m glichen Ursachen neu messen Problembehebung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 85 Symptom Meldung Ergebnis hat mehr als 6 Vorkommastellen Mogliche Ursache Sehr hohe Probenkonzentration Konzentrationseinheit passt nicht zu dem erwarteten Bereich der Probenkonzentrationen Abhilfe gt Probe verd nnen und neu messen gt Konzentrationseinheit Parameter Unit andern und neu messen Das Ergebnis liegt um mehr als 5 au erhalb des Bereichs der Standardkonzentratio nen Bei Methoden mit Auswertung uber Standardkurven nichtlinearen Auswerteverfahren Das Probenergebnis liegt um mehr als 5 au erhalb des Bereichs der Standardkonzentrationen gt Probe unter Bedingungen neu messen unter denen das Ergebnis im Bereich der Standardkonzentrationen liegt Probe verdunnen Standardkonzentrationen verandern und neu messen Berechnung ist nicht m glich weil durch Null geteilt wird Extinktionsergebn is ist Null Fehler bei
61. ie Abdeckung ge ffnet bleiben O Messlosungen fur Standards und Proben mit geringeren Extinktionen als 0 05 A sollten nicht eingesetzt werden Die Nachweisgrenze des Gerats liegt zwar wesentlich niedriger jedoch ist der Einfluss von Storungen aus den Messlosungen z B Partikel Blasen Trubungen auf die Zuverl ssigkeit des Ergebnisses bei diesen geringen Extinktionen sehr gro Weitere Informationen wie z B den Userguide Nr 013 finden Sie auf unserer Internetseite www eppendorf com 5 3 2 Messablauf 5 3 2 1 Methode ausw hlen Wahlen Sie mit den Cursor Tasten die gew nschte Methode und rufen Sie die Methode Method Selection Main Groups Sub Groups Methods o A Bradford mit der Taste enter auf a ren Eine bersicht und detaillierte Beschreibung der o O BCA mioro Methoden finden sie im nachsten Kapitel siehe RB Lowry Methoden auf S 31 BI Lowry micro B lt New Method gt 1 Copy 1 JU ostere Jl paste LL EN check parameters Mm o Wizard Der Wizard am oberen Rand der Anzeige f hrt Sie schrittweise durch den Methodenablauf Guvette 10mm RR Hilfebox Bei jedem Schritt des Ablaufs erhalten Sie Wavelength Sono unten rechts in der Anzeige Hilfetexte Sm adi Softkeys Mit den Softkeys lt Back und Next gt en anni bewegen Sie sich im Wizard einen Methodenschritt EIER vor oder zur ck Replicates 1 Decimal places 0 Autoprint off t paramet eat H Page dn J _Abo
62. ier ann hernd Null betragen Partielle Tr bungskorrektur ber Parameter Background m glich Bei der Methodenprogrammierung wird durch einfache Auswahl des Proteins aus einer vorgegebenen Liste der zugeh rige Faktor importiert Die Definition der Faktoren erfolgt separat in den Funktionen der Gruppe Gen method param Verschiedene Proteine sind in Gen method param vorprogrammiert Weitere k nnen Sie hinzuf gen Proteins with reagent Konzentrationsbestimmung von Proteinen durch Messung nach Farbreaktionen und Auswertung ber Standards oder Faktor typisch Auswertung mit Standardkurve e Die Methoden Bradford Bradford micro Lowry Lowry micro BCA und BCA micro sind bereits vorprogrammiert Je nach Reagenzhersteller muss gegebenenfalls der Curve fit Standardkurventyp ver ndert werden Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Dye labels Fur Farbstoff markierte Biomolekule Konzentrationsbestimmung des Biomolekuls Nukleinsaure oder Protein durch Messung bei 260 bzw 280 nm sowie des Farbstoffs in einem Messablauf Auswertung mit Faktor Neben dem Biomolekul k nnen bis zu zwei Farbstoffe bei zwei unterschiedlichen Wellenl ngen parallel gemessen werden Zus tzlich Auswertung der Einbaurate des Farbstoffes FOI Auswahl zwischen zwei verschiedenen FOI Berechnungsverfahren Bereits vorprogrammierte Methoden ssDNA markiert mit Cy 3 bzw Cy 5 Korrektur des Einflusses des Farbstoff Spektrums auf die Richt
63. iese f r die jeweiligen Farbstoffe bekannt sind Wird der Parameter eingeschaltet wird der Korrekturfaktor aus der Funktion General Method Parameters Dyes importiert Correct A 280 1 Auswahl Nur f r die Methodengruppe Dye labels ein aus Zur Erl uterung siehe Beschreibung des obigen Parameters Correct A 260 1 Dye 2 active Auswahl Nur f r die Methodengruppe Dye labels ein aus M glichkeit auch einen zweiten Farbstoff parallel zu messen Anwendung Markierung eines Biomolek ls mit zwei Farbstoffen Dye 2 Auswahl Nur fur die Methodengruppe Dye labels bei Messung von Liste von Farbstoffen die in der Funktion General Method Parameters Dyes hinterlegt sind 2 Farbstoffen Auswahl des zweiten Farbstoffs vgl Parameter Dye 1 Correct A260 2 Auswahl Nur fur die Methodengruppe Dye labels bei Messung von ein aus 2 Farbstoffen Analog zu Parameter Correct A 260 1 Correct A 280 2 Auswahl Nur fur die Methodengruppe Dye labels bei Messung von ein aus 2 Farbstoffen Analog zu Parameter Correct A 280 1 Show scan Auswahl Anzeige eines Scans Extinktions Wellenlangen Graphen ein aus zusatzlich zum Ergebnis bei der Probenmessung Start A Werteeingabe Startwellenlange fur die Aufnahme des Scans Wellenlange in nm Bereich 200 bis 830 nm Stop A Werteeingabe Stoppwellenlange fur die Aufnahme des Scans Wellenlange in nm Bereich 200 bis 830 nm Wert muss hoher sein als der Wert fur Start A A260 A2
64. igkeit der Biomolek lmessung ist m glich Partielle Tr bungskorrektur ber Parameter Background m glich Zusatzinformationen zur Reinheit der gemessenen Stoffe Ratio A260 A280 und Ratio A260 A230 Ratio Werte nur f r Nukleins uren Extinktions Wellenl ngen Spektrum Bei der Methodenprogrammierung werden durch einfache Auswahl des Biomolek ls sowie des Farbstoffs aus vorgegebenen Listen verschiedene zugeh rige Parameter wie Messwellenl ngen und Auswertefaktoren importiert Die Definition dieser Parameter erfolgt separat in den Funktionen der Gruppe Gen method param Verschiedene Nukleins uren Proteine und Farbstoffe sind in Gen method param vorprogrammiert Sie k nnen weitere Nukleins uren Proteine und Farbstoffe hinzuf gen Nur f r markierte Nukleins uren Umrechnung der Konzentrationen in molare Konzentrationen sowie nach Eingabe des Probenvolumens in Nukleins ure und Farbstoffmengen m glich Methodenschritt process results Bacterial density e Tr bungsmessung zur Bestimmung der Bakteriendichte e Messung bei 600 nm ist bereits vorprogrammiert e Zusatzinformationen Extinktions Wellenl ngen Spektrum 6 2 3 Methodengruppe Basic Factor Standard e Messung bei einer Wellenl nge und Auswertung ber Faktor oder Standard e Methoden f r die Auswertung ber Faktor und Standard sind vorprogrammiert Calibration curve e Messung bei einer Wellenl nge und nachfolgende Auswertung mit einer Reihe von 2 bis 12 Stand
65. infektion Dekontamination AN GEFAHR Stromschlag durch eintretende Fl ssigkeit A gt Schalten Sie das Ger t aus und trennen Sie es vom Stromnetz bevor Sie mit der Reinigung oder Desinfektion beginnen gt Lassen Sie keine Fl ssigkeiten in das Geh useinnere gelangen gt F hren Sie keine Spr hreinigung Spr hdesinfektion am Geh use durch gt Schlie en Sie das Ger t nur innen und au en vollst ndig getrocknet wieder an das Stromnetz an 1 Reinigen Sie das Ger t vor der Desinfektion mit einem milden Reinigungsmittel siehe Reinigung auf S 69 2 Wahlen Sie eine Desinfektionsmethode die den f r Ihren Anwendungsbereich geltenden gesetzlichen Bestimmungen und Richtlinien entspricht 3 Verwenden Sie z B Alkohol Ethanol Isopropanol oder alkoholhaltige Desinfektionsmittel 4 Wischen Sie die Oberflachen mit einem Tuch ab welches Sie mit Desinfektionsmittel befeuchtet haben 5 Wenn zur Desinfektion die Kuvettenschachtabdeckung ausgebaut werden muss verfahren Sie zum Ausbau und Zusammenbau wie beschrieben siehe K vettenschachtabdeckung reinigen auf S 70 6 Die demontierte K vettenschachtabdeckung k nnen Sie mittels Spr hdesinfektion desinfizieren 8 3 Ger t berpr fen Voraussetzungen e Umgebungsbedingungen einhalten siehe Umgebungsbedingungen auf S 89 Pr fung bei ca 20 C durchf hren Temperaturschwankungen vermeiden z B durch ge ffnete Fenster Filter nur kurzfristig dem Filterkasten e
66. ird Benutzen Sie f r die Vorbereitung sofern ben tigt sauberes demineralisiertes Wasser von ausreichender Qualit t Stellen Sie sicher dass die Pipette kalibriert ist und richtig pipettiert Sofern der Methodenablauf vor der Messung eine Inkubation erfordert stellen Sie sicher dass die Temperatur und Zeit f r die Inkubation korrekt eingehalten werden Reinigen und sp len Sie die K vette Achten Sie bei einem K vettenwechsel darauf dass das optische Fenster der K vette sauber bleibt und nicht mit den Fingern ber hrt wird Wenn das K vettenfenster durch Fingerabdr cke verschmutzt ist reinigen Sie es durch Abwischen mit einem fusselfreien Labortuch das mit Ethanol oder Isopropanol getr nkt ist Stellen Sie sicher dass das erforderliche Mindestvolumen der K vette f r eine Messung erreicht wird und dass keine Blasen in der Messl sung sind Zentrifugieren Sie tr be partikelhaltige Messl sungen und benutzen Sie den klaren berstand Wenden Sie sich an den Eppendorf Service Halten Sie die Umgebungsbedingungen ein Vermeiden Sie Temperaturschwankungen Reinigen Sie den K vettenschacht Problembehebung 78 Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Fehler Messergebnisse sind unrichtig Mogliche Ursache e Methode falsch programmiert e Standardl sung nicht richtig vorbereitet e Extinktion des Reagenz driftet e Die K vette ist nicht richtig positioniert
67. iten in der Funktion General Method Parameters Units Max 7 Stellen Erlauterung Einheit fur das Konzentrationsergebnis Die Auswahl ist bei den fest vorprogrammierten Methoden der Gruppe Routine auf fur diese Methoden sinnvolle Einheiten begrenzt Formula type Auswahl division subtraction Nur f r die Methodengruppe Dual wavelength Formeltyp f r die Verrechnung der Extinktionen bei den beiden Messwellenl ngen vor Auswertung mit Faktor oder Standard Formula a Werteeingabe Nur f r die Methodengruppe Dual wavelength Wert f r a in der Wert f r a in den Formeln a A1 b A2 c d und Auswerteformel a A1 b A2 c d Grenze max 5 stellig einschlie lich Dezimalpunkt Formula b Werteeingabe Nur f r die Methodengruppe Dual wavelength Wert f r b in der Wert f r b in den Formeln a A1 b A2 c d und Auswerteformel a A1 b A2 c d Grenze max 5 stellig einschlie lich Dezimalpunkt Formula c Werteeingabe Nur f r die Methodengruppe Dual wavelength Wert f r c in der Wert f r c in den Formeln a A1 b A2 c d und Auswerteformel a A1 b A2 c d Grenze max 5 stellig einschlie lich Dezimalpunkt Formula d Werteeingabe Nur f r die Methodengruppe Dual wavelength Wert f r d in der Wert f r d in den Formeln a A1 b A2 c d und Auswerteformel a A1 b A2 c d Grenze max 5 stellig einschlie lich Dezimalpunkt Calc
68. jmeasure stanc Bradford 2010 11 25 16 28 23 SS gt Leerwertergebnisse bleiben f r eine Messreihe ES 4 gespeichert Eine neue Leerwertmessung ist aber 0 900 Da jederzeit m glich tmder hier gezeigten Abbildung 0 393 Are eines Messablaufs mit Auswertung ber re ES Standardkurve wird zus tzlich zum Probenergebnis ER der Graph der Standardauswertung angezeigt e Measure blank or sample 0 300 600 900 1206 wm a and key Dilution Edit iD Dss Finish lt Back Next gt 5 3 2 5 Methode abschlie en Bradford measure BEER measure samples 3 samples print amp export new series 1 Dr cken Sie Finish um die Messreihe zu Bradtord 2010 11 25 16 28 23 beenden und zur Methodenauswahl Abs A A 15 aa SS zur ckzukehren 1 200 gt z K 2 Schalten Sie nach Abschluss aller Messungen 0 900 TOT das Ger t aus und schlie en Sie die 0 929 Arn Kuvettenschachtabdeckung um den gu K vettenschacht vor Verschmutzung zu SH sch tzen Measure blank or sample 9 000300 600 ag vc eee A and Dilution Edit ID Data Finish lt Back T Next gt 5 3 2 6 Optional Ergebnisse nachbearbeiten Bei einigen Methoden k nnen Sie im dsDNA keen samples process resulto print amp 0x s DNA 2010 07 16 163234 SE Methodenschritt process results Ergebnisse GE x nachbearbeiten Zum Beispiel k nnen Sie in 0 450 CZ Spektren die Zoom Funktion SpectraZoom nutzen 0 360 ji 2
69. l Methoden umbenennen Kopierte oder ausgeschnittene Methoden k nnen Sie entweder in einen anderen Ordner unter Favorites oder unter neuem Namen in den urspr nglichen Ordner einf gen Navigieren Sie mit den Cursor Tasten in die Spalte Methods des gew nschten Ordners und dr cken Sie paste zum Einf gen der Methode 6 2 Methodenbeschreibung Photometrie In diesem Kapitel werden die vorprogrammierten Methoden und Methoden Templates beschrieben 6 2 1 Methodengruppe Absorbance Single A Extinktionsmessung bei einer Wellenl nge e Keine nachgeschaltete Auswertung Multi A e Extinktionsmessungen bei zwei bis sechs Wellenl ngen e Keine nachgeschaltete Auswertung Scan e Messung eines Extinktions Wellenl ngen Spektrums ber einen definierten Wellenl ngenbereich e Anzeige von Wellenl nge und Extinktion im Spektrum durch Navigation mit einem Wellenl ngen Cursor Ver nderung des Spektrenausschnitts ber 3 verschiedene Zoom Varianten m glich e Peak Erkennung m glich Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 6 2 2 Methodengruppe Routine Die Methoden der Gruppe Routine sind als feste Methoden vorprogrammiert Nach Anderung von Methodenparametern in den fest vorprogrammierten Methoden muss daher ein neuer Methodenname vergeben werden Nucleic acids Konzentrationsbestimmung von Nukleinsauren durch Messung bei 260 nm und Auswertung uber Faktor Verschiedene Nukleinsauremethoden wie dsDNA oder RN
70. lgemeine Sicherheitshinweise Eppendorf Bi Deutsch DE oSpectrometer basic A A A WARNUNG Stromschlag durch Sch den am Ger t oder Netzkabel gt Schalten Sie das Ger t nur ein wenn Ger t und Netzkabel unbesch digt sind gt Nehmen Sie nur Ger te in Betrieb die fachgerecht installiert oder instand gesetzt wurden gt Trennen Sie das Ger t im Gefahrenfall von der Netzspannung durch Ziehen des Netzsteckers aus dem Ger t oder der Netzsteckdose oder mit Hilfe der vorgesehenen Trennvorrichtung z B Notschalter im Labor WARNUNG Schaden durch UV Strahlung Mikroliterk vetten wie z B Hellma TrayCell oder Mikroliterk vetten hnlicher Bauart leiten die Strahlung der Lichtquelle innerhalb der K vette um sodass die Strahlung der Lichtquelle bei nicht geschlossenem Deckel nach oben austreten kann gt Vergewissern Sie sich vor dem Start einer Messung dass der Deckel auf der Mikroliterk vette aufliegt WARNUNG Gesundheitssch digung durch giftige radioaktive oder aggressive Chemikalien sowie durch infekti se Fl ssigkeiten und pathogene Keime gt Beachten Sie die nationalen Bestimmungen zum Umgang mit diesen Substanzen die biologische Sicherheitsstufe Ihres Labors sowie die Sicherheitsdatenbl tter und Gebrauchshinweise der Hersteller gt Tragen Sie Ihre pers nliche Schutzausr stung Entnehmen Sie umfassende Vorschriften zum Umgang mit Keimen oder biologischem Material der Risikogruppe Il od
71. m xs ee Extinktionswerte vor der A4 0 006 Axo Umrechnung Dilution Edit 1D_ H Finish J lt Back JI Next gt Methoden 46 Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Methodengruppe Ergebnisanzeige Erlauterung Scan heck parameters measure samples process results print amp export fz Ergebnisanzeige Scan 2010 07 09 16 08 18 e Scan Graph mit SE a Extinktions Wellenlange Anzeige 0 800 e Navigieren Sie zwischen den Messpunkten im Graphen mit 0 600 i i und 0 400 0 200 info 0 000 St A am 230 260 290 320 350 t p A 305 Abs 0 012 a gt key o om 1 Finish lt Back Next gt Hauptgruppe Routine Nucleic acids wu check eeneg sr sampes AA Ergebnisanzeige dsDNA 2010 07 16 16 3254 e Konzentrationsergebnis mit ARIN 7 Extinktion bei der 0 450 N Messwellenl nge 0 360 V ees ml Falls in den Parametern aktiviert A Ze 0 504 Ass Ratio A260 A280 e Falls in den Parametern aktiviert 0 180 N A260 A280 1 86 Scan Kerg FEES Navigieren zwischen den 00 SE Messpunkten im Graphen die fur K 260 Abs 0 504 E 4 and gt key die Ergebnisberechnung Dilution Edit ID Data Finish lt Back Next gt herangezogen werden k nnen mit und O Zusatzdaten Softkey Data Sofern die entsprechenden Parameter aktiviert wurden Extinktionswert fur 280 nm Ratio A260 A230 und Extinktion
72. m Probenergebnis Methoden 48 Deutsch DE Eppendorf BioSpectrometer basic Methodengruppe Dye labels Ergebnisanzeige ssDNA Cy 3 Icheck parameters ssDNA Cy 3 2010 11 24 14 37 18 measure samples process results sa Abs A 02 0 440 ID 0 350 1 O Orom 0 260 A 0 269 Ave I 0 170 Dye 1 0 251pMoly l fi Vi oe N M blar 280 360 440 520 soo mm A 260 Abs 0 269 gt key Dilution Edit ID Data Finish lt Back Next gt Erlauterung Ergebnisanzeige e Konzentrationsergebnisse mit Extinktion bei der Messwellenlange des Biomolekuls e Falls in den Parametern aktiviert Scan Navigieren Sie zwischen den Messpunkten im Graphen mit und Zusatzdaten Softkey Data Sofern die entsprechenden Parameter aktiviert wurden e Ratio A260 A280 und Ratio A260 A230 e Extinktionswerte f r 280 nm und 230 nm sowie f r die Messwellenl nge des Farbstoffs e FOl Wert e Extinktionswerte fur die Background Wellenlangen Bei der Messung von Farbstoff markierten Proteinen werden Ratios und FOI nicht angezeigt Bacterial density OD 600 check parameters measure samples OD 600 2010 07 02 14 20 39 0 846 m 0 846 Aso print amp export 01 ID A vi Dilution Editio Finish H lt Back H Next gt Ergebnisanzeige e Berechnetes Ergebnis mit Extinktion bei der Messwellenlange e Falls in
73. mbehebung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Symptom Meldung Ungultiges Zoom Intervall Mogliche Ursache Fehler im Methodenschritt process results im Zoom Modus Zulassiger Zoom Bereich fur die Wellenlangenskala e Wellenlangenintervall mindestens 10 nm e Eingaben fur Wellenl ngen nur innerhalb des f r die Methode in den Parametern programmierten Bereichs Zul ssiger Zoom Bereich f r die Extinktionsskala e Extinktionsintervall mindestens 0 02 A Ober und Untergrenze f r Extinktionsintervall 3 A bzw 3A Abhilfe gt Beachten Sie beim Zoom Ablauf die genannten Grenzen 9 3 Ergebniskennzeichnungen Problembehebung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 83 Warnungen und Fehlermeldungen zu Ergebnissen erscheinen in der Hilfebox unten rechts im Display Bei Warnungen ist die Kopfzeile der Hilfebox gelb unterlegt bei Fehlermeldungen rot Warnungen Entscheiden Sie unter Berucksichtigung der angezeigten Warnung ob das Ergebnis fur Sie nutzbar ist Fehlermeldungen Es wird kein Ergebnis dargestellt die Begrundung wird in der Fehlermeldung angezeigt Symptom Meldung Standardkurve ist nicht monoton Bitte anderen Curve Fit wahlen Mogliche Ursache Bei Auswertung einer Standardkurve mit den Curve Fit Verfahren spline interpolation quadratical regression oder cubical regression wurde kein verwertbares Ergebnis erhalten Abhilfe
74. n Eppendorf BioSpectrometer basic 61 Deutsch DE gt Wenn Sie Ergebnisse drucken oder exportieren m chten w hlen Sie die Datenpakete aus Der Ablauf f r Druck und Export sowie die Bedeutung der Funktionstasten entspricht dem Methoden Schritt print amp export gt Wahlen Sie in der rechten Spalte die Parametergruppe aus fur die Sie Parameter editieren m chten gt Best tigen Sie mit enter In diesem Beispiel sind Parametergruppen f r verschiedene Dyes Farbstoffkomponenten fur die Dye Methoden zusammengefasst und jeweils unter einem Namen abgelegt Unter diesem Namen kann die gewunschte Parametergruppe bei der Editierung einer Dye Methode in das Methodenprogramm importiert werden Display links Name des Dyes W hlen Sie mit O und e rechts zugeh rige Parameter 62 Funktionen Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Um eine Parametergruppe zu editieren w hlen Sie mit O und den zu editierenden Dyename New dye s Parameter Wavelength 550 nm u gt Best tigen Sie mit enter 5 Ext coeft 100000 L mol cm Factor 10 pMol pL k Corr A260 0 0 Corr A280 lo op be Keyboard abe OK Cancel Softkeys OK Eingabe speichern und in die Auswahl der Parametergruppe zur ckkehren Cancel In die Auswahl der Parametergruppe ohne nderung zur ckkehren Bei der Programmierung einer Methode der Methodengruppen Dye labels oder Proteins direct UV k n
75. n_ l e SS 26 Bedienung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 5 3 2 2 Parameter pr fen CH check parameters measure standards measure samples L Cuvette 10 mm Page 1 2 Wavelength 595 nm Unit pg mL Calculation Standard Standards 6 Replicates 1 Decimal places 0 Autoprint 5 3 2 3 Blank und Standards messen gt berpr fen Sie die Parametereinstellung Mit den Softkeys Page dn und Page up rufen Sie die Seiten der Parameterliste auf Mit Edit ndern und speichern Sie Parameter O Bei Auswertung ohne Standards z B DNA Messungen entf llt dieser Methodenschritt Standard 1 Linear regression not calculated Standard 2 250 Standard 3 Quadratical regression Conc 924 41 A 134 52 A 123 14 Standard 4 3 Coefficient of determination Standard 5 1000 R 0 9970 Standard 6 1 Messen Sie zunachst einen Leerwert Taste blank 2 Messen Sie der Reihe nach alle Standards Taste standard In der Anzeige ist jeweils der nachste zu messende Standard markiert Mit den Softkeys Graph bzw Table konnen Sie die Ergebnisansicht wechseln gt Mit Next akzeptieren Sie die aus den Standardergebnissen errechnete Auswertung Bedienung Eppendorf BioSpectrometer basic 27 Deutsch DE 5 3 2 4 Proben messen gt Mit der Taste sample messen Sie der Reihe nach Ihre Proben Bradford j
76. nen Sie auf die Eintr ge in General Method Parameter zugreifen a N es md zugeh rige Parametergruppe in das SR Inn SE Methodenprogramm zu importieren Uber die Unit woimL v nen hat n qu I Auswahl edit beim Parameter Nucleic acid Nucleic acid ssDNA Y N z N Ke k nnen Sie auch direkt in die Funktion General Decimal places il Method Parameter gelangen und dort die Dye 1 Newdyel Parameter ansehen sowie editieren Correct A260 1 oO Correct A280 1 a Funktionen Eppendorf BioSpectrometer basic 63 Deutsch DE Tab 7 2 Parameter in General Method Parameter Parameter Proteins Erlauterung Diese Parameter werden bei der Auswahl eines Proteins bei der Programmierung einer Methode der Gruppe Dye labels sowie Proteins direct UV in die Methodenparameter geladen e Protein name e Factor A01 e Ext coeff e Molecular mass Neben dem Namen und der Wellenl nge k nnen Sie zur Definition des Faktors fur die Berechnung der Konzentration aus der Extinktion die folgenden Daten eingeben Faktor oder An 10 oder Extinktionskoeffizient und Molmasse Nucleic acids Diese Parameter werden bei der Auswahl einer Nukleins ure bei der Programmierung einer Methode der Gruppe Dye labels in die Methodenparameter geladen e NA name e Factor e Double stranded Der Faktor wird zur Berechnung der Konzentration aus der Extinktion benutzt Der Parameter Double stranded hat Einfluss
77. nformation in der Hilfebox beachten Siehe Information in der Hilfebox Problembehebung 80 Deutsch DE Eppendorf BioSpectrometer basic Symptom Meldung Es existiert bereits eine Methode oder ein Ordner Dye Protein Nucleic acid Unit mit diesem Namen Mogliche Ursache e Der Name unter dem die Methode abgespeichert werden soll wurde bereits fur eine andere Methode in demselben Ordner verwendet e Die Meldung erscheint auch wenn bereits vergebene Namen fur einen Ordner oder unter General Method Parameter fur eine Nukleinsaure Farbstoff Protein Konzentrationseinheit editiert wurden Abhilfe gt Anderen Namen vergeben Folgende Parameterwerte sind in General Method Parameter nicht definiert Beim ffnen einer Methode deren Parameter auf General Method Parameter zur ckgreift wurde festgestellt dass mindestens ein Parameter Farbstoff Nukleins ure Protein Einheit dort nicht mehr existiert also vermutlich gel scht wurde W hlen Sie einen anderen Parameter aus der vorhandenen Liste Falls erforderlich programmieren Sie in General Method Parameter einen neuen Listeneintrag um bei der Programmierung einer Methode darauf zur ckgreifen zu k nnen Der Wert des mit markierten Parameters ist nicht in den Gen Meth Param definiert Bitte korrigieren Sie den Parameter Diese Fehlermeldung erscheint beim Editieren von Methodenparametern e Parameter
78. nmessung zur ckkehren Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic 45 Deutsch DE Ergebnisbild mit Verd nnung und ID Ergebnisbild mit Verd nnung und Proben ID UI u ENEE measure samples print amp export ew series Bradiord 2010 12 02 17 08 03 Abs A 09 Dil 20 80 pL at w E 3 1D B12 a go 0 900 1 71 6 pg mL ei 0 566 A 0 600 0 300 M blank or sample 0 000 k K 0 300 600 900 1206 ns ymt Conc Abs 0 566 Aland key Dilution Edit iD H Data Finish lt Back Next gt 6 4 4 measure samples Ergebnisanzeigen In diesem Abschnitt erhalten Sie fur alle Methodengruppen eine Darstellung typischer Ergebnisanzeigen sowie einen Uberblick Ober weitere Ergebnisdaten die Sie ber den Softkey Data erreichen Methodengruppe Ergebnisanzeige Erlauterung Hauptgruppe Absorbance Single A ST eee oe edo measure Samples A ET new series Ergebnisanzeige Single A 2010 07 02 14 15 18 e Extinktion bei der 01 ee SE Messwellenlange e Nur bei Verd nnung oder anderer Kuvette als 10 mm Zusatzliche Anzeige des Extinktionswerts vor 4 390 Be DAI Ano er Umrechnung Dilution Edit 1D H Finish lt Back J _next gt Multi A Ergebnisanzeige cd yy measure samples Multi A 2010 07 09 16 08 45 SES SES e Extinktionen bei den Messwellenlangen ID Zusatzdaten Softkey Data x BESSE e Nur bei Verd nnung oder anderer 12 0 735 Axo Kuvette als 10 m
79. ntnehmen und vor Verschmutzung oder Besch digung der Filteroberfl chen sch tzen Filter vor Staub Hitze Fl ssigkeit und aggressiven D mpfen sch tzen Filter ist so eingesetzt dass der Aufkleber mit der Filterbezeichnung zum Detektor hin zeigt Bei berpr fung der Spektrometereinheit Aufkleber zeigt nach vorn K vettenschacht ist frei von Verschmutzungen 8 3 1 Spektrometereinheit berpr fen Zur berpr fung der photometrischen Richtigkeit und der Wellenl ngenrichtigkeit wird von Eppendorf ein Filtersatz BioSpectrometer Referenzfiltersatz angeboten Der Satz enth lt ein Leerwertfilter AO und drei Filter A1 A2 und A3 zur berpr fung der photometrischen Richtigkeit sowie 3 Filter zur berpr fung der Wellenl ngenrichtigkeit im Bereich von 260 nm bis 800 nm Die Extinktionen der Filter werden gegen das Leerwertfilter AD gemessen Zus tzlich zu den Informationen ber die Richtigkeit erhalten Sie auch Informationen ber die Pr zision Aus den jeweils 15 Messungen pro Wellenl nge wird neben dem Mittelwert auch der Variationskoeffizient VK Wert berechnet Zur Messung setzen Sie zun chst das Leerwertfilter f r die Leerwertmessung und anschlie end die Pr ffilter wie K vetten in den K vettenschacht ein Die f r die Pr ffilter gemessenen Extinktionswerte werden gegen den zul ssigen Wertebereich verglichen Die Grenzwerte f r den zul ssigen Bereich sind f r die einzelnen Filter in einer Tabelle im Deckel des Filterkasten
80. odenschritt print amp export siehe print amp export auf S 55 Installation 20 Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Bedienung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 5 Bedienung 5 1 Ubersicht Bedienelemente Abb 5 1 Bedienelemente des BioSpectrometer basic 21 22 Bedienung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Taste Funktion Tastenblock Zahlen und Text eingeben Tasten 1 bis 9 sowie 0 Bei Texteingabe konnen Sie neben Ziffern auch Buchstaben und Sonderzeichen durch mehrmaliges Drucken der Taste eingeben Alternativ wechseln Sie mit Keyboard zu einer eingeblendeten Tastatur Au erhalb von Eingabefeldern Methodenauswahl aufrufen Au erhalb von Eingabefeldern Funktionsauswahl aufrufen Coe d 900000 Softkey Funktionen anwahlen Die Belegung der Taste wechselt mit dem Software Dialog Die aktuelle Funktion wird im Display direkt ber der Taste angezeigt Cursor nach links rechts oben unten bewegen Navigieren zwischen Eingabefeldern e Cursor Tasten und innerhalb eines Eingabefeldes Innerhalb der Zeichenfolge navigieren Tasten und in einer Ergebnisanzeige Zwischen den Probenergebnissen der Messreihe navigieren e Tasten und innerhalb eines Graphen Auf der x Achse des Graphen navigieren um z B in einem Scan die Wellenlangen abhangigen Extinktionswerte anzuzeigen Tasten und in einem Extinktions Wellenl ngen
81. ometer basic Deutsch DE 12 3 Auswertung mit Standardkurve gerade Wird mit mehr als einem Standard ausgewertet konnen mit dem Curve fit im Methodenschritt measure standards new folgende Auswerteverfahren fur die Standardkurve gerade ausgewahlt werden Auswerteverfahren Beschreibung Erforderliche Mindestzahl an Standardpunkten linear interpolation Lineare Mindestens 2 Standards Punkt zu Punkt Verbindung im Extinktions Konzentrations Graph en der Standardauswertung linear regression Polynomregression f r Polynom Mindestens 3 Standards ersten Grades quadratical regression Polynomregression f r Polynom Mindestens 4 Standards zweiten Grades cubical regression Polynomregression f r Polynom Mindestens 5 Standards dritten Grades spline interpolation Interpolation durch nat rliche Mindestens 3 Standards kubische Splines Zus tzlich kann f r Regressionsverfahren gew hlt werden dass die Regressionsgerade Regressionskurve durch den Nullpunkt geht d Verwenden Sie fur Kalibrationsgeraden das Verfahren linear regression Testen Sie bei kurvenformigen Verlaufen welches Auswerteverfahren quadratische Regression kubische Regression Spline Interpolation die fur die Standardauswertung am besten geeignete Funktion ergibt Die Spline Interpolation verbindet die Messpunkte durch kubische Polynome wahrend die Regressionsverfahren eine quadratische bzw kubische Funktion so zwischen die
82. on Ergebnissen fur die Auswertung mit dem gew hlten Verfahren Curve fit vorliegt wird das Auswertungsergebnis im rechten Teil der Anzeige dargestellt Eine vorzeitige Speicherung der Auswertung und Wechsel zur Probenmessung ber die Taste Next gt ist dann m glich Grafische Ansicht der Standardauswertung Mit den Cursor Tasten und navigieren Sie zwischen den Standards um die Ergebnisse anzuzeigen Bei mehr als einem Replikat pro Standard k nnen Sie mit O und zwischen den Replikatergebnissen wechseln Auch aus der grafischen Anzeige k nnen Sie einzelne Standards anw hlen und messen oder neu messen e Table In die tabellarische Anzeige der Standardergebnisse wechseln Next gt Standardauswertung speichern und zur Probenmessung wechseln Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic 43 Deutsch DE 6 4 3 measure samples Mit der Taste sample messen Sie der Reihe nach Ihre Proben Leerwertergebnisse bleiben fur eine Messreihe gespeichert eine neue Leerwertmessung ist aber jederzeit m glich Mit den Tasten O und k nnen Sie zwischen den bisher in der Messreihe erzielten Probenergebnissen navigieren Se EE WEE Bradtord 2010 11 25 16 28 23 e Das Konzentrationsergebnis 6 stellig mit Abs Ar Se Flie komma wird deutlich hervorgehoben SS e Mit Grafik Ergebnis rechts in der Anzeige 0 900 ps 213 a Ohne Grafik Ergebnis zentral in der Anzeige A 0 393 As e Zus tzlich zum Ergebnis wird der z
83. packt Eppendorf UVette routine pack 220 nm 1 600 nm Eppendorf Quality 0030 106 318 952010069 50 2 000 uL 200 St ck wiederverschlie bare Box Eppendorf macro Vis Cuvettes 0030 079 345 0030079345 10 x 100 St ck Eppendorf semi micro Vis Cuvettes 0030 079 353 0030079353 10 x 100 St ck 4308 078 006 940001102 K vettenst nder f r 16 K vetten Bestellinformationen 104 Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE e CE we CE pe CO pe amp e E g CE ve CE sek ce SS CASAR A ce re ce ze ie Ce ce e d A e e E Es A ei ce Se ce Se e Es ox A KE ce ei ce Se ce ec ce ce rd ce ce Get ce Le cE CE CE ze CO ce SS ce Se cee CE e CE eg SS eS ce EN CE k ei c ce er eS ce re ARS OK eS cS Ce e ce ce E ce ua E D cE e 3 C Su ee oe ce eK EG Konformit tserkl rung a C y de EC Conformity Declaration ARA ce ce S cl eE ce CL D ce CO e ce Das bezeichnete Produkt entspricht den einschl gigen grundlegenden Anforderungen der er C E ce Cc aufgef hrten EG Richtlinien und Normen Bei einer nicht mit uns abgestimmten nderung des 3 C i ce ce Produktes oder einer nicht bestimmungsgem en Anwendung verliert diese Erkl rung ihre G ltigkeit vi ce ce ce c The product named below fulfills the relevant fundamental requirements of er 3 L the EC directives and standards listed In the cas
84. r mit der Probenmessung Methodenschritt Erlauterung check parameters Methodenparameter berpr fen nderung bei Bedarf measure standards Nur bei Methoden mit Standardauswertung Standards messen und auswerten Alternativ Nutzung der zuletzt gespeicherten Standardauswertung m glich measure samples Proben messen process results Nur bei einigen Methoden Ergebnisse nachbearbeiten z B Scan Graphen zoomen print amp export Datenpakete f r Druck oder Export der Daten zusammenstellen Mit den Softkeys Next gt und lt Back navigieren Sie zwischen den Methodenschritten Mit Abort und Finish k nnen sie den Messablauf abbrechen bzw beenden Der Name dieses Softkeys wechselt nach der ersten Probenmessung von Abort auf Finish 6 4 1 check parameters Cuvette 10mm Page 1 2 Wavelength 595 nm Unit pg mL Calculation Standard Standards 6 Replicates 1 Beca piacot Autoprint off Edit paramoto Edit Page Page dn Abort lt Back Next gt Cuvette 10mm y Page 1 2 Wavelength 595 nm Unit pg mL v Calculation Standard Y Standards 6 Replicates a MENO 2 Pino Autoprint G Number of repeat Jl Page dn Save Save As Cancel IECH check parameters save as OFavorites MyMethods Enter the name and storage location Method name Bradford 1 Target drectory C EaWortesiMy Methods v Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic 41 Deutsch DE Softkeys
85. rds Taste standard Wenn Sie mehr als ein Replikat pro Standard messen wird der Mittelwert f r jeden Standard automatisch errechnet und angezeigt Mit den Cursor Tasten O und k nnen Sie auch gezielt bestimmte Standards zur Messung auswahlen Auch eine Neumessung einzelner Standards ist so moglich e Last call Die zuletzt gespeicherte Standardauswertung f r diese Methode aufrufen um diese fur Probenmessungen zu nutzen e Curve fit Verfahren zur Standardauswertung ausw hlen Sie k nnen das Verfahren auch nachtr glich ndern solange das Ergebnis nicht gespeichert wurde Hinweise zur Auswahl des Auswerteverfahrens finden Sie im Kapitel Auswerteverfahren siehe Auswertung mit Standardkurve gerade auf S 96 e Graph In die grafische Anzeige der Standardergebnisse wechseln Conc Abs Quadratical regression pg mt Asos Conc 532 44 A g 234 21 A X 0 393 71 562 0 710 Standard 3 500 0 708 Coefficient ot determination X 0 709 R 0 9998 0 927 Standard 4 750 0 929 X 0 928 Info Standard 5 1000 ER X E Nex ftkey Last C Curve Fit Graph Abort lt Back 1 Next gt Abs A 7 Quadratical regression 1 200 u Cone 924 41 A E H 34 52 A Pad 1 Wei 14 0 900 all A j Coefticient of Pad 4 determination 0 600 y R 0 9970 0 300 j 4 i j 0 000 A and 4 and gt E EES ES Next gt Softkeys Sobald die minimale Zahl v
86. reich 1 bis 3 Std Conc Werteeingabe Je nach Zahl der Standards wird dieser Parameter f r alle Konzentrationswerte der Standards Grenze Max 6 stellig einschlie lich Dezimalpunkt Standards angeboten z B Std Conc 1 Std Conc 2 Decimal places Werteeingabe Zahl der Nachkommastellen f r das Ergebnis Bereich 0 bis 3 Zahl der Nachkommastellen f r das berechnete Konzentrationsergebnis Dye 1 Auswahl Liste von Farbstoffen die in der Funktion General Method Parameters Dyes hinterlegt sind Nur f r die Methodengruppe Dye labels Bei der Auswahl des Farbstoffs werden aus der Funktion General Method Parameters Dyes auch die dort programmierten dem Farbstoff zugeh rigen Parameter importiert Faktor Wellenl nge ggf Korrekturfaktoren f r die Messung bei 260 bzw 280 nm siehe Beschreibung des folgenden Parameters 38 Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Parameter Eingabe Erlauterung Correct A260 1 Auswahl Nur fur die Methodengruppe Dye labels ein aus Korrektur des Einflusses des Farbstoffspektrums auf die Extinktion bei der Messwellenlange des Biomolekuls 260 bzw 280 nm Die Farbstoffspektren haben z T eine geringe Extinktion bei 260 und 280 nm Diese Extinktionen verfalschen die Berechnungen f r die Nukleins uren bzw Proteine dieser Methoden Zur Minimierung dieser Verf lschung werden Korrekturfaktoren benutzt sofern d
87. s 1 bei A 1 Falschlichtanteil lt 0 05 Technische Daten Eppendorf BioSpectrometer basic 91 Deutsch DE 11 5 Weitere technische Parameter Kuvettenmaterial Fur Messungen im UV Quarzglas oder UV transparenter Kunststoff UVette von Eppendorf 220 nm bis 1600 nm Fur Messungen im sichtbaren Bereich Glas oder Kunststoff Kuvettenschacht 12 5 mm x 12 5 mm untemperiert Gesamth he der K vetten Mind 36 mm H he des Lichtstrahls in der K vette 8 5 mm Tastatur 22 Folientasten 6 Folientasten als Softkeys Ergebnisausgabe Extinktion Konzentration Scan Extinktions Wellenl ngen Spektrum Methodenabh ngig weitere Zusatzdaten Ratio FOI Background Extinktionen Display VGA TFT Display 5 7 Sprachen f r Bedienerf hrung Englisch Franz sisch Spanisch Italienisch Deutsch Schnittstellen USB Master F r USB Stick und Thermodrucker DPU S445 USB Slave F r Verbindung mit einem PC Serielle Schnittstelle RS 232 F r Thermodrucker DPU 414 Ethernet Schnittstelle RJ45 F r Verbindung mit einem Netzwerk Angeschlossene Ger te m ssen den Sicherheitsanforderungen gem IEC 60950 1 entsprechen Technische Daten 92 Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 11 6 Anwendungsparameter Methoden Vorprogrammierte und frei programmierbare Methoden fur alle Mess und Auswerteverfahren e Extinktionsmessungen bei einer oder mehreren Wellenl ngen
88. s ure Einheit pmol mL C aus der Messung berechnete Massenkonzentration der Nukleins ure Einheit ug mL oder ng uL MM relative Molmasse Einheit kDa Falls in More calculations statt der relativen Molmasse die Zahl der Basen bzw Basenpaaren pro Nukleins uremolek l eingegeben wurde wird MM aus der Zahl der Basen bzw Basenpaaren berechnet F r dsDNA MM bpx 2x330x10 F r ssDNA RNA Oligo MM bx330x10 MM berechnete relative Molmasse Einheit kDa bp eingegebene Zahl der Basenpaare pro Molek l b eingegebene Zahl der Basen pro Molek l O e Fur dsDNA wird bei der Berechnung der molaren Konzentration eine doppelstrangige Nukleinsaure angenommen Fur die Methoden ssDNA RNA und Oligo wird eine einzelstr ngige Nukleins ure angenommen e F r Methoden die in der Hauptgruppe Routine Methodengruppe Nucleic acids ber lt New Method gt neu programmiert wurden werden f r die Berechnung der molaren Konzentration immer doppelstr ngige Nukleins uren angenommen 100 Auswerteverfahren Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 12 5 4 Berechnung des Faktors fur Protein in General Method Parameter Dieser Abschnitt gilt nur fur Berechnung der Proteinkomponente in den Methodengruppen Dye labels und Proteins direct UV Bei diesen Methodengruppen wird in den Parametern die Proteinkomponente ausgewahlt siehe Methodenparameter auf S 35 Der Proteinkomponente ist ein Faktor zugeordnet der in der Funktion G
89. s Detektors Bestimmung der zuf lligen Messabweichung ber das gesamte verf gbare Spektrum e berpr fung der Lichtquelle berpr fung der maximal verf gbaren Energie der Lichtquelle und der Qualit t der Lichtleitung durch das Ger t Bestimmung der zuf lligen Messabweichung eines Signals am Referenzsensor Bestimmung der Signalh he am Referenzsensor Separate Bestimmung der Lichtintensit t im UV Bereich Bestimmung der systematischen und zuf lligen Messabweichung der Wellenl nge Position eines Intensitatspeaks im UV Bereich des Spektrums Pr zision der Position eines Intensitatspeaks im UV Bereich des Spektrums Wahlen Sie in der Gruppe Device calibration die Funktion Perform selftest und best tigen Sie mit enter Nach Ablauf des Selbsttest zeigt das Display die Meldung PASSED Wenn das Display die Meldung FAILED zeigt ist der Selbsttest fehlgeschlagen Wenn sich dieser Fehler nicht beheben l sst siehe Fehlermeldungen auf S 79 wenden Sie sich an den Eppendorf Service 8 4 Sicherungen ersetzen DM GEFAHR Stromschlag Schalten Sie das Ger t aus und ziehen Sie den Netzstecker bevor Sie mit der Wartung bzw Reinigung beginnen Der Sicherungshalter befindet sich zwischen der Netzanschlussbuchse und dem Netzschalter EA 1 Ziehen Sie den Netzstecker 2 Dr cken Sie die Kunststofffedern 1 oben und unten zusammen und ziehen Sie den Sicherungshalter 2
90. s abgedruckt Wenn Sie die Werte dokumentieren wollen schlie en Sie den Eppendorf Thermodrucker an 71 Instandhaltung 72 Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE BioSpectrometer reference filter set eppendorf Function Device calibration Spectrometer unit Order No Best Nr 6135 928 001 Set No Satz Nr 006 Limits measured against Blank A 0 at approx 20 C SN 6135 914 006 916 006 917 006 937 006 i 922 006 Sample Sample Sample Sample 260 nm 280 nm 800 nm A2 0 197 0 221 1 078 1 101 1 857 1 888 0 193 0 217 1 024 1 047 1 717 1 749 0 173 0 196 0 923 0 947 1 478 1 509 0 161 0 184 0 903 0 926 1 429 1 461 0 172 0 195 0 930 0 959 1 487 1 526 0 172 0 195 0 941 0 968 1 496 1 530 0 172 0 195 0 943 0 969 1 503 1 538 0 169 0 192 0 935 0 984 1 517 1 570 pC 0 58 1 124 Random error of wavelength Random error of photometer Zuf llige Messabweichung der Wellenl nge Zuf llige Messabweichung des Photometers Limiting values CV Grenzwerte VK lt 3 0 lt 2 0 lt 15 lt 3 0 lt 2 0 lt 3 0 Wavelength and photometric accuracy Wellenl ngen und photometrische Richtigkeit traceable to r ckf hrbar auf NIST SRM 2034 SN 04 A und SN 667 Wave a K ers All characteriz reference UV Vis spectrophotometer SN EL 99023107 The instrument is requalified regularly by the manufacturer and is confirmed and documented to perform within manufacturer s specifications The current instrument q
91. ssenen Extinktionswerte der Standardreihe sind nicht kontinuierlich steigend oder fallend gt Standardmessungen wiederholen oder einzelnes fehlerhaft gemessenes Standardergebnis l schen Die ID kann nicht gesetzt werden Fehler bei der Eingabe der Proben ID Verschiedene Ursachen sind m glich Zur konkreten Ursache bitte die Information in der Hilfebox beachten gt Siehe Information in der Hilfebox Die Verd nnung kann nicht gesetzt werden Fehler bei der Eingabe der Verd nnung Verschiedene Ursachen sind m glich Zur konkreten Ursache bitte die Information in der Hilfebox beachten gt Siehe Information in der Hilfebox Berechnung ist nicht m glich weil durch Null geteilt wird Extinktionsergebnis oder Parameter Formula b ist Null Bei der Auswertung einer Methode des Typs Division Methodengruppe Dual wavelength musste durch ein Extinktionsergebnis mit dem Wert Null geteilt werden Das ist mathematisch nicht zul ssig gt berpr fen Sie die verwendeten Reagenzien und Proben und wiederholen Sie die Messung gt Geben Sie als Wert f r den Parameter Formula b nicht Null ein Es kann nur noch eine Messung in dieser Messreihe durchgef hrt werden Die maximale Anzahl an Messungen in einer Messreihe ist erreicht Die Zahl an Messungen in einer Messreihe ist auf 99 begrenzt Nach maximal 99 Messungen eine neue Messreihe starten 82 Proble
92. strukturiert abrufbar und konnen aus dem Speicher heraus gedruckt und exportiert werden General method parameters Parameter die Ubergreifend fur verschiedene Methoden genutzt werden sind im Bereich Functions zentral gespeichert Diese Parameter k nnen hier editiert ge ndert oder neu erstellt werden Im Methodenschritt Check parameters sind die bergreifenden Parameter ber Auswahlboxen dann einfach ausw hlbar e Proteins Nucleic acids Dyes enthalten Parameter die f r Methoden der Gruppe Dye labels und Proteins direct UV genutzt werden e Units Einheiten f r Konzentrationsergebnisse die f r viele Methoden genutzt werden k nnen Absorbance spectra library Extinktions Wellenl ngen Spektren wichtiger Substanzen z B DNA Die Spektren dienen der Information und k nnen als Vergleich zum Spektrum eines Probenergebnisses herangezogen werden Device settings Editierbare Ger teeinstellungen z B Sprache Device calibration e M glichkeit zur berpr fung des Spektralphotometers Hierzu ben tigen Sie einen Filtersatz von Eppendorf Info Open Source Lizenzen und Informationen zu eingetragenen Warenzeichen 60 Funktionen Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 7 1 1 Results Memory Functions Main Groups Sub Groups Functions dsDNA parameters ample results L D dsDNA 2010 07 09 15 07 35 B dsDNA 2010 07 08 11 02 35 Cuvet
93. swert fur 230 nm Extinktionswert f r die Background Wellenlange Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 47 Methodengruppe Proteins direct UV Ergebnisanzeige Albumin A 280 check Parameters ef measure samples BEES ER Albumin A 280 2010 12 16 18 05 23 Abs A 30 ID 0 800 1 46 mg mL 0 600 0 966 As 0 400 0 200 Inte 0 000 E A nm ng x and key Dilution Edit 1D Data Finish lt Back Next gt Erlauterung Ergebnisanzeige e Konzentrationsergebnis mit Extinktion bei der Messwellenlange e Falls in den Parametern aktiviert Scan Navigieren zwischen den Messpunkten im Graphen die fur die Ergebnisberechnung herangezogen werden k nnen mit und O Zusatzdaten Softkey Data Sofern die entsprechenden Parameter aktiviert wurden e Extinktionswert f r 260 nm e Extinktionswert fur die Background Wellenl nge Proteins with reagent Bradford Bradford 2010 11 25 16 28 23 Abs A MESURE SU measure samples MEA export 1 200 0 900 pe 0 600 9 300 A 0 000 D 300 600 900 Conc 213 Abs 0 393 120g OL ew series 08 ID 2 1 3 pg mL 0 393 Ass A ar Dilution Edit 1D ia Finish Ergebnisanzeige e Konzentrationsergebnis mit Extinktion bei der Messwellenl nge e Bei Auswertung mit Standardreihe Graph der Standardauswertung mit eingezeichnete
94. te 10 mm Page 1 2 Unit pg mL Molar Unit pmol mL Factor 50 Decimal places 1 A260 A280 on Aha di Autoprint off Pago up oF Page dn Wahlen Sie in der rechten Spalte die Methode aus f r die Sie gespeicherte Ergebnisse aufrufen m chten gt Best tigen Sie mit enter gt Wahlen Sie die gew nschte Messreihe mit den Cursor Tasten gt Best tigen Sie mit enter Wie im Methodenablauf k nnen Sie auch hier der Reihe nach durch die Anzeigen der Parameter der Standards der Probenergebnisse und zuletzt der Datenpakete f r Druck und Export wechseln Die Belegung der Softkeys entspricht der Belegung im Methodenablauf dsDNA parameters DNA 2012 06 29 155728 Data packets Samples Results sample results print 4 export OData Graph data not for printing Method GParameters Print J Export_ Samples Finish lt Back Nox 7 1 2 General Method Parameters Functions Main Groups Sub Groups Functions Proteins HIE Nucleic acids Dye name eys Wavelength 650 nm Ext coeff 250000 L mol cm Factor la pMol pL Corr A260 lo Corr A280 0 05 dil the selected Edit Jl New H Delete I OK Softkeys e Edit Ausgew hlte Parametergruppe editieren e New Neue Parametergruppe erstellen e Delete Ausgew hlte Parametergruppe l schen e OK In die Funktionsauswahl zur ckkehren Funktione
95. ten Parameters tzen vorprogrammiert ist Die Parameter k nnen beliebig ver ndert und unter neuem Namen abgespeichert werden Um eine Methode aufzurufen w hlen Sie mit den Cursor Tasten zun chst die Hauptgruppe Untergruppe und die Methode aus Best tigen Sie jeweils mit enter Tab 6 1 Photometrische Methoden Absorbance Methoden f r schnelle einfache Extinktionsmessungen ohne weitere Auswertungen Routine H ufig genutzte Methoden der Molekularbiologie Die Methoden sind fest vorprogrammiert Eine nderung von Parametern ist aber mit Speichern unter neuem Namen m glich Basic Methoden f r die Auswertung von Extinktionsmessungen mit Faktor Standard oder Standardkurve gerade Advanced Methoden f r die Auswertung von Zwei Wellenl ngen Messverfahren Favorites In Favorites k nnen Sie mit lt New Folder gt eigene Ordner einrichten und Ihre h ufig benutzten Methoden in diese Ordner kopieren um schnell auf diese Methoden zugreifen zu k nnen In allen Ordnern k nnen Sie mit lt New Method gt neue Methoden erstellen In Favorites k nnen Sie eigene Ordner erstellen z B f r personenorientierte Zuordnung umbenennen und l schen 32 Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Tab 6 2 Softkeys in der Methodenauswahl Cut und Paste Methoden ausschneiden und einfugen Copy und Paste Methoden kopieren und einfugen Delete Methoden l schen Rename
96. ter basic Deutsch DE Anwendungshinweise Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 1 Anwendungshinweise 1 1 Anwendung dieser Anleitung gt Lesen Sie diese Bedienungsanleitung vollst ndig bevor Sie das Ger t das erste Mal in Betrieb nehmen Beachten Sie ggf die Gebrauchsanweisungen des Zubeh rs Diese Bedienungsanleitung ist Teil des Produkts Bewahren Sie sie gut erreichbar auf F gen Sie diese Bedienungsanleitung bei Weitergabe des Ger ts an Dritte bei gt Die aktuelle Version der Bedienungsanleitung in den verf gbaren Sprachen finden Sie auf unserer Internetseite www eppendorf com 1 2 Gefahrensymbole und Gefahrenstufen Die Sicherheitshinweise in dieser Anleitung haben die folgenden Gefahrensymbole und Gefahrenstufen 1 2 1 Gefahrensymbole Stromschlag Explosionsgefahr Giftige Stoffe Be Sachschaden 1 2 2 Gefahrenstufen Gefahrenstelle GEFAHR Wird zu schweren Verletzungen oder zum Tod f hren WARNUNG Kann zu schweren Verletzungen oder zum Tod f hren VORSICHT Kann zu leichten bis mittelschweren Verletzungen f hren ACHTUNG Kann zu Sachsch den f hren Anwendungshinweise Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 1 3 Darstellungskonventionen Darstellung Bedeutung 1 Handlungen in vorgegebener Reihenfolge 2 gt Handlungen ohne vorgegebene Reihenfolge Liste oder sample Taste dr cken um eine beschriebene Handlung
97. tt new series Albumin A 280 2010 11 19 18 32 05 aufrufen Softkey New Methodenschritt measure samples aufrufen und eine neue Messreihe starten i Info new IL _Finisn lt Back 1 Messreihe abschlie en und eine neue Methode w hlen e Softkey Finish Messreihe abschlie en und Methodenauswahl aufrufen Funktionen Eppendorf BioSpectrometer basic 59 Deutsch DE 7 Funktionen 7 1 Funktionen der Hauptgruppe User Mit der Taste function oder dem Softkey Function gelangen Sie in ein Menu mit Funktionen wie Ger teeinstellungen oder Abrufen gespeicherter Ergebnisse Die Funktionen sind analog zur Methodenauswahl in 3 Spalten strukturiert F r Sie sind die Funktionen in der Hauptgruppe User zug nglich Wie in der Methodenauswahl navigieren Sie mit den Cursor Tasten um zun chst die gew nschte Untergruppe und danach in der rechten Spalte die gew nschte Funktion auszuw hlen Mit enter rufen Sie die Funktion auf Functions Sub Groups Main Groups Results memory Gen method param Abs spectra library Device settings Device calibration Info ino 1 Jl Jl Jl Method Softkey Info Firmware Version und Seriennummer des BioSpectrometer basic aufrufen Tab 7 1 bersicht ber die Funktionen Untergruppe Erlauterung Results memory Gespeicherte Ergebnisse anzeigen Die Ergebnisse sind nach Methoden und nach Messreihen
98. tur Hauptanwendung Partielle Korrektur von Verf lschungen der Extinktion bei Nukleins uremessungen durch Tr bungen in der Messl sung Beispielsweise wird die Extinktion bei 320 nm die bei reinen Nukleins uren etwa bei 0 A liegen sollte von der Extinktion bei 260 nm der Messwellenl nge f r Nukleins uren subtrahiert A A A XXX corrBkgr XXX Bkgr AXxx korrBkgr rechnerisch korrigierte Extinktion bei der Wellenl nge XXX nm Axxx gemessene Extinktion bei der Wellenl nge XXX nm ABkgr gemessene Extinktion bei der Background Wellenl nge 94 Auswerteverfahren Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 12 1 3 Kuvettenkorrektur Samtliche Extinktionswerte die in Ergebnisberechnungen eingehen sind auf die Kuvetten Schichtdicke 10 mm normiert Wird eine Kuvette mit einer anderen Schichtdicke benutzt muss diese Schichtdicke im Parameter Cuvette definiert werden In diesem Fall werden die gemessenen Extinktionen vor der Umrechnung in Probenergebnisse auf Messergebnisse mit einer Kuvette der Schichtdicke 10 mm korrigiert Diese Korrektur wird angewendet auf e Methoden mit Auswertung ber Faktor e Methoden der Gruppe Absorbance bei denen nur Extinktionswerte ausgegeben werden Die Korrektur wird nicht angewendet auf e Methoden mit Auswertung ber Standards da vorausgesetzt wird dass Standards und Proben in K vetten derselben Schichtdicke gemessen werden e Berechnungen mit Division Methode Division Method
99. u gro ist Die Extinktionen am linken Rand des Rasters sind gr er als die Extinktion des Peaks A Raster 20 nm Mind A Abs 0 200 Der Peak wird nicht erkannt da der vorgegebene Wert f r Mind A Abs zu gro ist Die Differenz der Extinktion des Peaks und der niedrigsten Extinktion im Raster ist kleiner als 0 2 A A Raster 20 nm Mind A Abs 0 050 Der Peak wird erkannt Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic 55 Deutsch DE 6 4 7 print amp export Im letzten optionalen Methodenschritt konnen Sie Datenpakete fur alle oder fur ausgewahlte Proben einer Messreihe zusammenstellen e f r den Ausdruck auf dem Drucker e f r den Export auf einen USB Stick e f r den Export ber USB Kabel direkt zu einem PC e f r den Export per E Mail Freasure sampies process results prn a opon Beer Datenpakete auswahlen dsDNA 2015 06 04 10 16 30 Navigieren Sie mit den Cursor Tasten und para paoro best tigen Sie mit enter Samples Ek Format OXLS Format auswahlen nl lad e XLS Als Excel Tabelle exportieren oder Graph data XLS only OXLS amp PDF d k a ausdrucken l DParameters PDF Als PDF exportieren oder ausdrucken Softkeys Print Ausdruck starten Print Export Samples Finish H lt Back Next gt Exportl Export starten e Sample Einzelne Probenergebnisse ausw hlen Datenpakete ausw hlen Results Prim re Ergebnisdaten nicht ausw hlbar da sie
100. ualification is valid through April 2015 For the current instrument qualification the following NIST traceable certified secondary spectrometric calibration standards were used Nellenl ngen un me he Bestimmung der Filter Alle Messungen werden auf einem Cary 100 Bio Referenz UV Vis Spektrophotometer Seriennummer EL99023107 durchgef hrt Dieses Instrument wird regelm ig vom Hersteller requalifiziert und die spezifikationsgem e Funktion dokumentiert Die aktuelle Qualifizierung ist bis April 2015 g ltig und verwendet folgende NIST r ckf hrbare und zertifizierte spektrometrische Sekund rstandards Starna RM O660HLKCSITX Hellma 666 F1 666 F2 666 F3 666 F4 SRM 2031a SN 667 valid through g ltig bis 12 2014 The valid certificates are part of the requalification documentation Die G ltigkeitszertifikate sind Teil der Qualifizierungsdokumentation Please protect against dust heat cold and liquid The limits are valid for max 2 years Bitte vor Staub Hitze K lte und Fl ssigkeiten sch tzen Signature Die Grenzwerte gelten fiir max 2 Jahre Unterschrift Abb 8 1 Deckel Innenseite des Filterkastens Muster 8 3 1 1 Photometrische Richtigkeit berpr fen Functions Main Groups Sub Groups Functions OC y B Spectrometer unit a thod p Perform selftest Abs sf brary t Device calibration into A IOO OO JO ws A Spectrometer Unit 260 nm 280 nm 800 nm
101. ugrunde soul as liegende Extinktionswert kleiner angezeigt 0 300 l d i TT en e00 a ec Wm i A and Y key Dilution Editio Finish lt Back Next gt Weitere Daten e oben rechts 1 Zeile Probennummer wird fortlaufend gez hlt und f r jede neue Messreihe wieder auf 1 gesetzt Probenverd nnung sofern eingegeben e oben rechts 2 Zeile Probenidentifikation ID sofern eingegeben e oben links Dateiname unter dem die Daten im Methodenschritt print and export als Excel Datei exportiert werden siehe S 55 Softkeys e Dilution Probenverd nnung eingeben e Edit ID Proben ID eingeben e Data Zus tzliche Ergebnisdaten anzeigen nicht bei allen Methoden e Finish Messreihe beenden und zur Methodenauswahl zur ckkehren O Die angezeigten Extinktionswerte entsprechen immer den direkt gemessenen Werten Verd nnungs oder Kuvettenfaktor sowie Backgroundextinktionen werden erst fur die anschliefende Ergebnisberechnung einbezogen siehe Extinktionswerte auf S 93 Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE Verd nnung eingeben Der Softkey Dilution ist aktiviert nachdem der Leerwert Taste blank gemessen worden ist 1 Dr cken Sie den Softkey Dilution Enter dilution for next sample 2 Geben Sie die Volumina f r die Probe maximal 3 stellig und f r den Verd nnungspuffer maximal 4 stellig ein Die nachfolgenden Probenergebnisse werden vom Ger t mit dem errec
102. ulation Auswahl Auswerteverfahren f r die Berechnung der Factor Standard Probenkonzentration aus der gemessenen Extinktion Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic 37 Deutsch DE Parameter Eingabe Erlauterung Factor Werteeingabe Faktor fur die Umrechnung von Extinktionswerten in die Faktor Konzentration Grenze max 6 stellig Bei den folgenden Methodengruppen konnen Sie auch einschlie lich negative Faktoren eingeben Dual wavelength Factor Dezimalpunkt Bei der Methodengruppe Dye labels geben Sie die Faktoren nicht einzeln im Methodenablauf ein Sie importieren sie ber die einfache Auswahl von Biomolek l sowie Farbstoff automatisch aus der Funktion General Method Parameters Protein Auswahl Nur f r die Methodengruppen Dye labels und Proteins Liste von Proteintypen die direct UV in der Funktion General Bei der Auswahl des Proteins wird aus der Funktion Method Parameters General Method Parameters Proteins auch der dort Proteins hinterlegt sind programmierte zugeh rige Parameter Factor importiert Standards Werteeingabe Zahl der verschiedenen Standardkonzentrationen f r die Zahl der Standards Auswertung mit Standards Bereich 1 bis 12 Bei einigen Methoden ist der Bereich f r die Anzahl der Standards auf einen kleineren Bereich als 1 bis 12 begrenzt Replicates Werteeingabe Zahl der Wiederholungsmessungen f r die verschiedenen Zahl der Replikate pro Standardkonzentrationen Standard Be
103. ung deutet auf eine erhebliche Abweichung der Messpunkte von der Regressionsgeraden hin Tr bungen in der Messl sung Messungen an den Grenzen des photometrischen Messbereichs Abhilfe gt Ergebnis der Standardauswertung akzeptieren oder Standards neu messen gt Auf klare Messl sungen achten Das Bestimmtheitsma f r die Regressionsauswertu ng der Standardreihe ist lt 0 8 Bei Methoden mit Auswertung von Standardreihen uber Regressionsverfahren Warnung erscheint nach Messungen von Proben wenn die Regressionsauswertung fur die Standardreihe nichtlinear war die Standardauswertung aber vom Anwender akzeptiert wurde gt Probenergebnisse unter dem genannten Vorbehalt verwenden oder Standardreihe und Proben neu messen Scan Einige gemessene Extinktionen sind zu hoch und werden nicht angezeigt Bei mindestens einer Wellenlange des Scans war die Extinktion oberhalb des Messbereichs Tr bungen in der Messl sung Messungen an den Grenzen des photometrischen Messbereichs Wenn die nicht angezeigten Bereiche des Scans relevant sind Probe verdunnen bzw durch Zentrifugation Trubung beseitigen und Messung wiederholen Extinktion bei der Messwellenlange ist zu hoch Trubungen in der Messl sung Optische Flachen der Kuvette verschmutzt Kuvette in falscher Orientierung in den Kuvettenschacht gesteckt Zu hohe Extinktion der Messlosung gt Unter Ber cksichtigung der m gl
104. ung ee Ee EA 5 1 bersicht Bedicmelementecc4 yo 46 ko bed hs et eee Ah Ia ce ded da u falls ns De e 21 5 1 1 TexXteingeben Hrn mi ra ge TT TA AAA ita 23 5 2 K v tt amp einsetzen san ine tetsu chance ts anol trainee tel nce Gas coos Wa Seed al baw Saeed Bee RS 24 5 3 bersicht ber den Messablaut o cs 25 5 3 1 Messung vorbereiten 25 53 2 Messablauf ir una TA A TA 25 5 3 3 Wichtige Hinweise f r die Messungen 0 0c ee eee 29 Inhaltsverzeichnis Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 6 Methoden ON 31 6 1 Methode auswanhleni sc us Hr aa A 31 6 2 Methodenbeschreibung Photometrie cece tenn ee een nee 32 6 2 1 Methodengruppe Absorbance 32 6 2 2 Methodengruppe Routine 33 6 2 3 Methodengruppe Basic 34 6 2 4 Methodengruppe Advanced 35 6 3 MethodenpardMetens see ramio A EN Hh eee ae eee eben Me rer 35 G Meth denablauf anna nes ae Sls og tea pts an Ia eh 3 Bar Weihe 40 6 4 1 check parameters 0 0 ee eee teen nee rennen 41 6 4 2 Measure standards ENEE see esse eh 42 6 4 3 measure Samples 2 0 eee essen sehen ernennen 43 6 4 4 measure samples Ergebnisanzeigen 0 eee eee eee 45 64 5 PROCESS FESURS rn ccd ee leds E a Ble Ae Cae eae a 50 6 4 6 process results Optionen 2 semere tos tE EEEE i e e a eee 52 6 4 7 print MEXpOrt ENNEN ee E E OE Ble ee Go E ee te 55 6 4 8 Messreihe abschlie en 2 eee eens 58 7 CRUNK OMEN e Soca NEE Ee E adas
105. ur unterschiedliche Angaben fur reine Nukleinsauren e DNA 2 3 bis 2 5 The Nucleic Acids 1955 e DNA 1 9 Current Protocols in Molecular Biology 1994 Die Werte sind stark vom pH Wert abh ngig Nukleinsauren sollten daher nicht in Wasser sondern in einem Puffer mit pH Wert 7 bis 7 2 gemessen werden z B TE Puffer 12 5 3 Umrechnung in molare Konzentrationen und Nukleinsauremengen Die Umrechnung kann nur f r Nukleins uren und Dye Methoden mit Nukleins uren als Biomolek lkomponente angewendet werden Sie erfolgt im Methodenschritt process results More calculations 12 5 3 1 Berechnung der Menge Anwendung Berechnung der Menge Masse an Nukleinsaure im gesamten Probenvolumen M CxV gesamt M berechnete Gesamtmenge Masse der Nukleins ure im Probengef Einheit ug C aus der Messung berechnete Konzentration der Nukleins ure Einheit ug mL oder ng uL Vp gesamt Gesamtvolumen der Probe im Probengef Geben Sie diesen Wert in More calculations ein Einheit uL Auswerteverfahren Eppendorf BioSpectrometer basic 99 Deutsch DE 12 5 3 2 Berechnung der molaren Konzentration Anwendung Berechnung der molaren Konzentration der Nukleinsaure aus Massenkonzentration und relativer Molmasse Die Molmasse wird entweder direkt eingegeben oder vom Gerat aus der eingegebenen Zahl der Basen bzw Basenpaare pro Nukleinsauremolekul errechnet oe Cx10 Mol MM Cryo berechnete molare Konzentration der Nuklein
106. vollstandig heraus 3 Ersetzen Sie defekte Sicherungen und setzen Sie den Sicherungshalter wieder ein Achten Sie auf die korrekte Position der Fuhrungsschiene 3 76 Instandhaltung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 8 5 Dekontamination vor Versand Wenn Sie das Ger t im Reparaturfall zum autorisierten Technischen Service oder im Entsorgungsfall zu Ihrem Vertragshandler schicken beachten Sie Folgendes N WARNUNG Gesundheitsgefahr durch kontaminiertes Ger t A 1 Beachten Sie die Hinweise der Dekontaminationsbescheinigung Sie finden diese als PDF Datei auf unserer Internetseite www eppendorf com decontamination 2 Dekontaminieren Sie alle Teile die Sie versenden 3 Legen Sie der Sendung die vollst ndig ausgef llte Dekontaminationsbescheinigung bei 9 Problembehebung 9 1 Allgemeine Fehler Problembehebung Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 77 Fehler Messergebnisse sind unprazise Mogliche Ursache e Haltbarkeit des Reagenzes berschritten Reagenz nicht richtig vorbereitet Pipettierung nicht richtig Ablauf der Inkubation vor der Messung nicht richtig K vette verschmutzt K vette nicht vollst ndig und blasenfrei mit Messl sung bef llt Tr bungen in der Messl sung Spektralphotometer driftet K vettenschacht verschmutzt Abhilfe gt gt Stellen Sie sicher dass das Reagenz noch haltbar ist und richtig vorbereitet w
107. xport an eine E Mail Adresse 1 Wahlen Sie aus der Liste eine E Mail Adresse oder wahlen Sie Edit um eine neue E Mail Adresse einzurichten 2 Starten Sie mit Export den Versand an eine EMail Adresse une e W hlen Sie in der Dropdownliste Edit und E mail address best tigen Sie mit enter Es ffnet sich ein Fenster in dem die E Mail Adressen bearbeitet werden k nnen email example com e Edit E Mail Adresse bearbeiten e New Neue E Mail Adresse anlegen e Delete E Mail Adresse l schen Edit New Delete OK Ausdruck starten Die Daten k nnen ber Drucker im Netzwerk oder ber einen angeschlossenen USB Drucker ausgedruckt werden Wenn das Ger t an ein Netzwerk angeschlossen ist werden automatisch alle kompatiblen Drucker im Netzwerk erkannt und angezeigt Besteht keine Verbindung zum Netzwerk steht nur ein angeschlossener USB Drucker zur Auswahl zn 2 Starten Sie mit Print den Ausdruck der Daten Ah HP Color LaserJet 2605dn IP address Seiko DPU S445 192 168 20 10 Seiko DPU 414 Refresh Print Cancel 58 Methoden Eppendorf BioSpectrometer basic Deutsch DE 6 4 8 Messreihe abschlie en Im Anschluss an den letzten Methodenschritt print amp export k nnen Sie eine neue Messreihe mit der gew hlten Methode starten oder eine neue Methode w hlen Messreihe abschlie en und neue Messreihe starten Paes Softkey Next gt Methodenschri

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