Bio Mérieux mise à jour du Thésaurus Bio : conception d
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1. Cr en 1963 par Alain M rieux et G Trouyez bioM rieux est d s son origine une entreprise consacr e au d veloppement et la production de r actifs standardis s en bact riologie s rologie biochimie et h mostase Pendant 25 ans sa croissance s est appuy e sur ses propres ressources en recherche et en industrialisation Puis les achats d Api et de Vitek lui ont permis de faire face l volution des technologies et la globalisation du march du diagnostic Aujourd hui bioM rieux est un groupe leader mondial dans l automation en microbiologie Avec un chiffre d affaires de 2 milliards de francs environ le groupe bioM rieux rassemble aujourd hui pr s de 2500 personnes implant es dans le monde entier dont l activit est totalement orient e vers le diagnostic m dical Par son savoir faire industriel et son orientation vers le d veloppement de syst mes et la recherche le groupe bioM rieux SA offre une large gamme de produits 1500 r actifs et plusieurs automates et apporte une garantie de qualit et un potentiel d adaptation aux besoins vari s des laboratoires Le concept Api est devenu la r f rence en identification bact rienne et antibiogramme Les syst mes Vitek apportent une automatisation compl te en microbiologie et galement dans les laboratoires de contr le industriel agroalimentaire environnement BioM rieux offre donc aux biologistes la souplesse et la s curit de syst mes modulaires e2. FICHIER M U M DBBn 1 2 EDIiTiONS DIFFEREES ETS FICHIER BIBLIOGRAPHIQUE m gt COMAND FUCAT FICHIER RECHERCHE FUCTI gt RELATIONS BASE SEGMENT CHAMP SEGMENTS un PAR TYPE DE DOCUMENT SEGMT 1 SEGMT 4 FA BASES 1 2 4 SEGMENTS autant que n cessaires par base CHAMPS maximun 678 AN CHAMPS DONNEES ELEMENTAIRES O UNE NOTICE BIBLIOGRAPHIQUE AUTEURS TITRE MOTS CLES SEGMT 1 BASE 3 GES Py s REGROUPENT LES TYPES JE DE OOCUMENT AYANT LES MEMES FONCTIONS ANNEXE 5 TAMIL THESAURUS Editions Fonctions Editions du Th saurus Exemples Edition tend avec n niveaux sp cifiques DIGESTIVE SYSTEM NEOPLASM TS COLON NEOPLASM LIVER HEOPLASM MOUTH NEOPLASM PANCREATIC HEOPLASH EMP Colorectal neoplasm Digestive neopiasm ORUG SENSITIVITY VA DRUG RESISTANCE Drug sensitivity test EM DRUG SENSITIVITY TESTING ORUG SEIISITIVITY TESTING EMP Drug sensitivity test DRUG TARGET DRUG THERAPY OUCHEIIHE DISEASE TG GENETIC DISEASE DUODENAL ULCER TG DIGESTIVE SYSTEM DISEASE Editi t Editi iphab ti dna binding protein RNA POLYMERASE D GLUCCSE DNA PROTEIN INTERACTION OHA RHA HYBRID DACROH RNA HYBRID dnase DAIRY PRODUCT dna insertion element DNA EXPRESSION DANAZOL DNA EXTRACTION dna fingerprinting Dangerous compound dna sequence homology DHA PHA HYBRID DAHGEROUS PRODUCT DNA RNA HYBRID dna insertion ele
3. dition la biblioth que en diff r des notices r pondant une interrogation Commande LExique permet de visualiser l environnement alphab tique d un mot 8 termes adjacents Ces termes re oivent un num ro d ordre permettant leur s lection et leur fr quence d utilisation ainsi que leur champ d origine respectif dans la base sont pr cis s Commande Historique permet de revoir le listing r capitulatif de toutes les questions de la recherche quations num rot es Pour chaque tape le r sultat est affich Commande TExte permet de restreindre une question pr c dente par d faut la derni re l aide de crit res de recherche secondaires ANN VOL NRE PAG et CLA Aucune interrogation ne peut tre faite directement sur ces champs soit parce qu ils ne sont pas index s soit parce qu ils donnent un nombre de r ponses trop lev Tamil indique alors avec un compteur le nombre de documents trait s et ceux qui conviennent Commande CHamps permet de limiter une recherche enti re au contenu de un ou plusieurs type de champs choisis L emploi du Code champ suivi de mot cl limite la question pos e au champ donn uniquement pour le terme indiqu Si rien n est pr cis la recherche se fait sur l ensemble des champs ind x s Commande Num rO de r f rence permet de s lectionner des notices par leur num ro de r f rence interne Commande ARchiver permet d archiver le r sultat d une
4. The purpose of the pre indexing card project are studied These cards serve partly to imprive the simple and efficient organization of indexing tasks and also to simplify exchanges betwen the documentation departement and its subscribers The result of this study and its advantages are analysed KEY WORDS Thesaurus _ Indexing _ information retrieval system _ Update 1 BioM rieux Histori Pr sentation p1 2 Pr sentation rvi mentation bioM rieux p2 2 1 Le Service le personnei L Organisation 2 1 L Informatique p4 2 1 1 TAMIL Recherche p5 2 1 2 Pr sentation de la B Donn es Intern bioM rieux p6 Structure des Bases Alimentation du syst me p7 Mi jour du th saur 1 3 1 introduction 3 2 Pr sentation p11 Construction V rifications p12 Relations Editions p14 3 3 Principes d indexation S lection des articles pour la Base BIO Classification p15 Choix des descripteurs 3 4 Mise jour p16 3 4 1 Proc dures p17 EFFACEMENT D UN TERME CREATION D UNE RELATION P18 INVERTION D UNE RELATION E 1 3 5 Conclusion p20 4 D ment d aide l indexation p21 FICHE D INDEXATION POUR LE SEGMENT PUB DE LA BASE BIO P22 FICHE D INDEXATION POUR LE SEGMENT BRE DE LA BASE BIO P23 Remplacement de la Documentalist ientifiqu 24 5 1 Gestion des p riodiques 5 2 Achats 5 3 Recherches bibliographiques p25 5 4 Editions ANNEXES BIBLIOGRAPHIE 1 BioM rieux Historique Pr sentation
5. une relation d quivalence est alors cr er automatiquement entre le descripteur et le terme non descripteur qui peut tre sup rieur 30 caract res Les caract res alphab tiques grecs sont exprim s en toutes lettres Les noms de Soci t s et de Produits sont pr c c s d un sigle amp et respectivement De fa on g n rale le but est d essayer de pr ciser les mots du titre avec le contenu du r sum ou des sch mas tableaux mat riels et m thodes du texte 15 Cependant j ai t confront e un probl me d uniformit de pr coordination des Descripteurs Ceci est une des grandes difficult s rencontr es lors de l tablissement d un th saurus Les analyses s mantiques et morphologiques syntaxiques des termes complexes permettent alors d en ressortir des notions simples et des liens valider De plus au fur et mesure de l indexation pour pouvoir mettre r guli rement le th saurus jour par la fonction qui permet d y acc der directement J ai rassembl toutes les fiches d indexation renvoy es par les chercheurs et qui impliquent une modification de saisie des r f rences D autre part j ai not progressivement sur un cahier les liens qui seront cr er entre les termes pour actualiser toutes les relations du th saurus 3 4 Mise jour La mise jour courante du Th saurus comprend l ajout de termes le retrait d autres la verification des synonymies et la pr ci
6. 001 002 T 0008 RP DET DATE DE DESTRUCTION 04 0004 N YN 0 Y 001 004 N RQ PRX PRIX 01 0007 N N N X N 001 007 N RR BFE BON DE FOURNITURE EXTERIEUR 96 0006 Y Y N 0Y 001 006 N RS ADR ADRESSE DE L AUTEUR 01 0040 NNN X N 001 040 N Z Z Zone archivage Prets ZA BIE Bibliotheque Exemplaire 02 0013 N N N X N 001 001 T 0800 X N 002 012 N ZB EMA Emprunteurs en Attente 01 0012 N N N X N 001 006 N X N 007 006 N ZC EMH Historique emprunts 01 0026 NNN X N 001 006 N X N 007 006 N X N 013 004 N EDITION DES CHAMPS Tri par libeile RS ADR ADRESSE DE L AUTEUR RH ANN ANNEE PUBLICATION AAAA MM JJ C SYM ANNONCE DE CONGRES OA AUT AUTEURS RR BFE BON DE FOURNITURE EXTERIEUR ZA BIE Bibliotheque Exemplaire OI CLA CLASSIFICATION OD COL COLLECTION OK CNG CONGRES Nom AAAA MM Jd Lieu A Champs reserves AB COC Code confidentialite OF DAT DATE D EDITION AAAA BG DDE DATE DE DEPOT 22 RP DET DATE DE DESTRUCTION BE DPR DATE DE PRIORITE 30 RF REL DATE RELANCE CD COM DEBUT CONGRES AAAA MM CC PER DEBUT FIN AAAA MM JJ MM JJ BA DEP DEPOSANT RM DIS DISPONIBILITE AC DAS Date de saisie AAMMJJ RA AU2 EDITEURS SCIENTIFIQUES in ZB EMA Emprunteurs en Attente ZC EMH Historique emprunts BD INV INVENTEUR S OH LAN LANGUE OG VIL LIEU D EDITION CI RES LOCALISATION DU R
7. ANNEXE 1 Classification ANNEXE 2 TAMIL D finitions des Bases amp Sous Bases ANNEXE 3 TAMIL D finitions des champs ANNEXE A TAMIL Structure du Syst me de Gestion de Base de Donn es ANNEXE 5 TAMIL THESAURUS Editions amp Fonction ANNEXE 6 TAMIL D finition des principales commandes d interrogation ANNEXE 1 TAMIL EDITION DES TABLES Tables 0002 TABLE CLASSIFICATION Libelle IMMUNOLOGY BACTERIOLOGY VIROLOGY PARASITOLOGY BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOGY PRODUCTION DATA PROCESSING ENDOCRINOLOGY IMMUNOASSAY VETERINARY MEDICINE ANIMAL ENZYMOLOGY INSTRUMENT MYCOLOGY ANTIMICROBIAL AGENT QUALITY ASSURANCE COAGULATION CANCER ORGANIC CHEMISTRY TOXICOLOGY DRUG HEMATOLOGY CYTOLOGY GENETICS LEGISLATION HYGIENE SECURITY ECONOMY SATISTICS GENERALITY MANAGEMENT MARKETING COMMUNICATION PURIFICATION COUPLING ANNEXE 2 TAMIL DEFINITIONS DES BASES amp SOUS BASES Base BIO Sous Bases PUB BRE et NME Base VOL Base SYM TAMIL Jui 1992 Edition des bases Base BIO DOCUMENTS SCIENTIFIQUES Segment PUB SOUS BASE ARTICLES Niveau NNN Niveau sous base CH RE LGM CL1 LIBELLE LANGUE 1 AA 01 0007 NOR Numero de reference AC 01 0006 DAS Date de saisie AAMMJJ 20 0100 AU1 AUTEURS OB 02 0500 TI1 TITRE OC 01 0020 TOM TOME EDITION chiffres arabes OD O1 0100 COL COLLECTION OE 01 0050 EDI MAISON D EDITION OF 01 0004 DAT DATE D EDITION AAAA OG 01 003
8. O S specifique L T tables E Vzvaleurs AAA to OL OM RB RC RD RE RF RG RH RI RJ RK RL RM THE ART AU2 TI2 REV VOL NRE REL ANN TYP MOC DEM BIB DIS CONGRES Nom AAAA MM JJ Lieu TITRE PUBLICATION EN SERIE THESE Faculte date sout vill Zone articles EDITEURS SCIENTIFIQUES in TITRE DE L OUVRAGE NOM DE LA REVUE VOLUME REVUE NUMERO DE REVUE DATE RELANCE PAGES NNNNN NNNNN ANNEE PUBLICATION AAAA MM J TYPE DE DOCUMENTS MOTS CLES NOMS DES DEMANDEURS ORGANISME DETENTEUR DISPONIBILITE 01 0150 3 01 0100 01 0200 01 0100 01 0500 3 01 0100 01 0005 01 0010 06 0006 01 0015 2 04 0010 01 0002 01 0050 01 0050 01 0002 01 0001 N INDEX lt ATION 222 2 DU L IN 5 5 CE E TR N Y X X X YN X YN X X X NN X NN X Y N N N X N N Y N 0 N N Y N 0 X Y N X Y N X Y N Y N 0 N N 3 ue ce out ue au EDITION DES CHAMPS CODES LONGUEUR INDEX lt SOUS CHAMP gt mm P ATION A E E 1 M M M D O 0 D descripteur N N LIBELLE CHAMP I EDU LN R N N L limites T E N X SIN AD E G T Mzmot cle E M I I ERI SE S U R N non R 0 M M NET Sx E 0 S specifique N N U U U L T tables E I M M ETR R E V valeurs RN COD Revue BIOMERIEUX 01 0005 N Y N X Y 001 005 T 0005 RO BUL NUMERO DE BULLETIN 02 0002 N Y N 0Y
9. de facturation arrivant directement chez bioM rieux Cette t che a t beaucoup facilit e par l utilisation du service t t matique d Europ riodiques auquel a souscrit bioM rieux cependant j ai d consacrer un temps important l aspect v rification et recherche d historique 5 2 Achats Toutes les demandes d achats de livres normes rapports catalogues etc de tous les services de bioM rieux sont normalement centralis es par la Biblioth que Apr s avoir v rifi sur la base de donn es interne si l ouvrage demand n est pas d j disponible la commande est pass e avec son prix en essayant de limiter au maximum le nombre des fournisseurs A la r ception les demandes d achats correspondantes sont envoy es au service de comptabilit pour facturation Ceci se fait manuellement bien que l informatisation du service permettent d enregistrer les demandes d s leur d part de m me que pour les publications cependant le syst me n est pas encore utilis 24 Les Ouvrages re us sont alors tous enregistr s sur la Base VOL de Tamil d apr s une indexation suppl mentaire comprenant un num ro de liste le type la localisation demandeur une classe m me table de classification utilis e que pour les publications et aussi la d cision de garder ou pas une photocopie du sommaire la biblioth que Enfin ces commandes parviennent aux demandeurs 5 3 Recherches bibliographiques Les demandes
10. fonction documentaire est d assurer le passage des informations d un document vers un demandeur selon le sch ma suivant Perception de Document l information demand e indexer S lection des termes S lection des termes d crivant le document exprimant ANALYSE le concept Transformati br ti TERMES TERMES langage documentaire THESAURUS Transformation des termes de la question en un langage documentaire THESAURUS Enregistrement de l information Comparaison termes d indexation termes la question R PONSE la question Ce sch ma fait apparaitre la n cessit de rassembler un langage commun normalis et structur utilis pour l indexation L ensemble de ces termes descripteurs ou non et des relations qui pr cisent leur environnement s mantique constitue donc le th saurus Cet ouvrage sert alors traduire en mots cl s de recherche tout concept devant entrer ou sortir d un syst me documentaire donn Toutefois pour faire face tout nouveau mot id e ou concept apparaissant dans la litt rature ce document doit tre dynamique D s lors la mise jour du th saurus apparait comme n cessaire Elle est faite dans un but d largissement de l impact dans la recherche d information N anmoins ces changements peuvent aussi parfois compliquer les d marches pour retrouver d anciennes r f rences Un quilibre est donc trouver entre les besoins d adaptabilit et de stabil
11. mot cl Celles ci sont retrouv es en recherche et peuvent tre transform es en une seule fois par une modification en s rie et si il y en a effacer toutes les relations avec d autres termes Cf Effacement d une relation page suivante 17 1 Annuler le mot cl Le syst me propose l annulation mais si c est un Descripteur qui a encore des termes reli s son effacement est alors impossible 2 Indexer le Th saurus Un terme ne sera d finitivement annul du th saurus et du lexique qu apr s une Indexation CREATION D UNE RELATION Pour les Relations Hi rarchiques et Associatives il n y a pas de probl me 0 Les Candidats Descripteurs doivent obligatoirement tre valid s 1 Choisir le Code Relation d termin 2 Indiquer le terme reli Cas des Relations d Equivalence Si l on veut cr er une relation de type DEscRIPTEUR Non descripteur entre deux termes d j tous les deux DESRIPTEURS dans le Th saurus le cas est plus complexe 0 Transformer le mot cl passer de non descripteur en DESCRIPTEUR dans les notices n cessaires 1 Effacer du Th saurus le terme qui doit descendre en non descripteur 2 Faire une Indexation du Th saurus 3 Recr er la relation partir du mot cl DESCRIPTEUR sous la forme DESCRIPTEUR EMP non descripteur INVERTION D UNE RELATION Il est rare que l on inverse une relation Hi rarchique terme G n rique terme Sp cifique Je n ai pas rencont
12. 0 VIL LIEU D EDITION OH 01 0003 LAN LANGUE OI 05 0002 CLA CLASSIFICATION OJ 10 0050 LOC LOCALISATION PHYSIQUE OK 01 0150 CNG CONGRES Nom AAAA MM JJ Lieu RA 05 0100 AU2 EDITEURS SCIENTIFIQUES in RB 02 0500 TI2 TITRE DE L OUVRAGE RC O1 0100 REV NOM DE LA REVUE RD 01 0005 VOL VOLUME REVUE RE 01 0010 NRE NUMERO DE REVUE RF 01 0006 REL DATE RELANCE RG 01 0015 PAG PAGES NNNNN NNNNN RH 01 0010 ANN ANNEE PUBLICATION AAAA MM JJ RI 03 0002 TYP TYPE DE DOCUMENTS RJ 20 0050 MOC MOTS CLES RK 10 0050 DEM NOMS DES DEMANDEURS RL O1 0002 BIB ORGANISME DETENTEUR RM O1 0001 DIS DISPONIBILITE RN 01 0005 COD Revue BIOMERIEUX RO 01 0002 BUL NUMERO DE BULLETIN RP 01 0004 DET DATE DE DESTRUCTION RS 10 0010 ADR ADRESSE DE L AUTEUR Champ index ou non CH Code Interne RE Nombre de r p titions du champ LGM Taille maximale du champ CL Code Mn monique Libell Nom du champ Base BIO DOCUMENTS SCIENTIFIQUES Segment NME SOUS BASE NORMES Niveau NNN Niveau sous base CH RE LGM CLI LIBELLE LANGUE 1 AA 01 0007 NOR Numero de reference AC 01 0006 DAS Date de saisie AAMMJJ NA 05 0030 NDN NUMERO DE NORME NB 05 0050 ORG ORGANISME DE NORMALISATION OA 20 0100 AUI AUTEURS OB 02 0500 TI1 TITRE OH 01 0003 LAN LANGUE OI 05 0002 CLA CLASSIFICATION OJ 05 0050 LOC LOCALISATION PHYSIQUE RC 01 0100 REV NOM DE LA REVUE RD 01 0005 VOL VOLUME REVUE RE 01 0010 NRE NUMERO DE REVUE RG 01 0
13. 015 PAG PAGES NNNNN NNNNN RH 01 0010 ANN ANNEE PUBLICATION AAAA MM JJ RI 01 0002 TYP TYPE DE DOCUMENTS RJ 10 0050 MOC MOTS CLES RK 10 0050 DEM NOMS DES DEMANDEURS RM 01 0001 DIS DISPONIBILITE RN 01 0005 COD Revue BIOMERIEUX RO 01 0002 BUL NUMERO DE BULLETIN Champ index ou non Code Interne RE Nombre de r p titions du champ LGM Taille maximale du champ CL Code Mn monique Libell Nom du champ Base BIO DOCUMENTS SCIENTIFIQUES Segment BRE SOUS BASE BREVETS Niveau NNN Niveau sous base CH RE LGM CL1 LIBELLE LANGUE 1 AA 01 0007 NOR Numero de reference AC 01 0006 DAS Date de saisie AAMMJJ BA 10 0100 DEP DEPOSANT BB 01 0009 NOB NUMERO PUBLICATION AAXXXXXXX BC 05 0002 ORI PAYS D ORIGINE BD 10 0080 INV INVENTEUR S BE 01 0006 DPR DATE DE PRIORITE 30 BF 01 0010 NPR NUMERO DE PRIORITE 30 BG 01 0006 DDE DATE DE DEPOT 22 BH 01 0020 NDE NUMERO DE DEPOT 21 OB 02 0500 TI1 TITRE OH 01 0003 LAN LANGUE OI 05 0002 CLA CLASSIFICATION 0J 05 0050 LOC LOCALISATION PHYSIQUE RH 01 0010 ANN ANNEE PUBLICATION AAAA MM JJ RJ 20 0050 MOC MOTS CLES RK 05 0050 DEM NOMS DES DEMANDEURS RM 01 0001 DIS DISPONIBILITE Champ index ou non CH Code Interne RE Nombre de r p titions du champ LGM Taille maximale du champ CL Code Mn monique Libell Nom du champ Base VOL OUVRAGES Segment VOL SOUS BASE OUVRAGES Niveau NNN Niveau sous base CH RE LGM CL1 LIBE
14. ESUME OJ LOC LOCALISATION PHYSIQUE OE EDI MAISON D EDITION RJ MOC MOTS CLES CA MAN NOM DE LA MANIFESTATION RC REV NOM DE LA REVUE CH PAR NOM PARTICIPANT RK DEM NOMS DES DEMANDEURS RO BUL NUMERO DE BULLETIN BH NDE NUMERO DE DEPOT 21 CK LIS NUMERO DE LA LISTE NA NDN NUMERO DE NORME BF NPR NUMERO DE PRIORITE 30 RE NRE NUMERO DE REVUE BB NOB NUMERO PUBLICATION AAXXXXXXX AA NOR Numero de reference NB ORG ORGANISME DE NORMALISATION RL BIB ORGANISME DETENTEUR RG PAG PAGES NNNNN NNNNN BC ORI PAYS D ORIGINE RQ PRX PRIX CG PRG PROGRAMME O N P CF INF RENSEIGNEMENTS contact adr tel RN COD Revue BIOMERIEUX CE SUJ SUJET OM THE THESE Faculte date sout ville OB TIl TITRE RB TI2 TITRE DE L OUVRAGE OL SER TITRE PUBLICATION EN SERIE OC TOM TOME EDITION chiffres arabes Jui 1992 u ba Fa EDITION DES CHAMPS Tri par libeile RI TYP TYPE DE DOCUMENTS C LIE VILLE PAYS LIEU EXACT RD VOL VOLUME REVUE B BRE ZONE BREVET N NME ZONE NORME 0 OUV ZONE OUVRAGE Z Z Zone archivage Prets R ART Zone articles ANNEXE 4 TAMIL STRUCTURE Du SYSTEME DE GESTION DE BASE DE DONNEES Et Relations Base segment champ STRUCTURE DU SYSTEME TERMINAL SAISI INTERACTIVE FICHIER MOTS VIDES MISE JOUR DES BASES 2 PROGRAMMES DE EDITIONS DIFFEREES FICHIER RECHERCHE INTERACTIVE EDITIONS IMPRES FUIMP TERMINAL RECHERCHE INTERACTIVE ERMINAL PRET INTERACTIFS FICHIER M U M ms us es MISE JOUR PRETS
15. ICIPANT CI 01 0050 RES LOCALISATION DU RESUME CK 01 0001 LIS NUMERO DE LA LISTE OI 05 0002 CLA CLASSIFICATION Champ index ou non CH Code Interne RE Nombre de r p titions du champ LGM Taille maximale du champ CL Code Mn monique Libell Nom du champ ANNEXE 3 TAMIL DEFINITIONS DES CHAMPS Editions Tri par Libell O Dzdescripteur N L limites T Mzmot cle R N non O S specifique L T tables E V valeurs AB AC BB BC CB CC CD CE DAS BRE DEP NOB INV DPR NPR DDE NDE SYM MAN LIE PER COM SUJ INF PRG me a me ue ee e one vm M e e E EDITION DES CHAMPS LONGUEUR INDEX zz zzzz P ATION M M LIBELLE CHAMP I RI EDU L N X SIN A I I ERI S M M NET S U CCE E M M ETR Champs reserves Numero de reference 07 0007 Y NN X Code confidentialite 01 0001 N N N Date de saisie AAMMJJ 06 0006 N Y N ZONE BREVET DEPOSANT 01 0100 N Y N X NUMERO PUBLICATION AAXXXXXX 09 0009 Y Y N X X PAYS D ORIGINE 02 0002 N N N INVENTEUR S 01 0080 N Y N X DATE DE PRIORITE 30 06 0006 N Y N 0 NUMERO DE PRIORITE 30 01 0010 N Y N X DATE DE DEPOT 22 06 0006 N N N 0 NUMERO DE DEPOT 21 01 0020 N N N X ANNONCE DE CONGRES NOM DE LA MANIFESTATION 01 0500 N N Y X VILLE PAYS LIEU EXACT 01 0200 N Y N X X X DEBUT FIN AAAA M
16. LLE LANGUE 1 AA 01 0007 NOR Numero de reference AC 01 0006 DAS Date de saisie AAMMJJ CK 01 0001 LIS NUMERO DE LA LISTE 10 0100 AUI AUTEURS OB 02 0500 TI1 TITRE OC 01 0020 TOM TOME EDITION chiffres arabes OD 01 0100 COL COLLECTION OE 01 0050 EDI MAISON D EDITION OF 01 0004 DAT DATE D EDITION AAAA OG 01 0030 VIL LIEU D EDITION OH 01 0003 LAN LANGUE OI 05 0002 CL CLASSIFICATION SO 10 0050 LOC LOCALISATION PHYSIQUE OK 01 0150 CNG CONGRES Nom AAAA MM JJ Lieu OL 01 0100 SER TITRE PUBLICATION EN SERIE OM 01 0200 THE THESE Faculte date sout ville RF 01 0006 REL DATE RELANCE RI 02 0002 TYP TYPE DE DOCUMENTS RK 05 0050 DEM NOMS DES DEMANDEURS RM 01 0001 DIS DISPONIBILITE RQ 01 0007 PRX PRIX RR 01 0006 BFE BON DE FOURNITURE EXTERIEUR Champ index ou non CH Code interne RE Nombre de r p titions du champ LGM Taille maximale du champ CL Code Mn monique Libell Nom du champ Base i SYM CALENDRIER CONGRES Segment SYM SOUS BASE CALENDRIER CONGRES Niveau NNN Niveau sous base CH RE LGM CLi LIBELLE LANGUE 1 AA 01 0007 NOR Numero de reference AC 01 0006 DAS Date de saisie AAMMJJ CA 05 0500 MAN NOM DE LA MANIFESTATION SCH 01 0200 LIE VILLE PAYS LIEU EXACT CC 01 0016 PER DEBUT FIN AAAA MM JJ MM JJ CD 01 0016 COM DEBUT CONGRES AAAA MM CE 01 0500 SUJ SUJET CF 01 0500 INF RENSEIGNEMENTS contact adr tel CG 05 0001 PRG PROGRAMME 0 N P CH 05 0050 PAR NOM PART
17. M JJ MM JJ 01 0016 Y Y N X X DEBUT CONGRES AAAA MM 01 0016 N Y N X SUJET 01 0500 N N N X RENSEIGNEMENTS contact adr t 01 0500 N N N X PROGRAMME 0 N P 01 0001 N N N X EDITION DES CHAMPS LIBELLE CHAMP LONGUEUR M M I A I I M M U U M M Pi BA Di CO zzzzzzz SOUS CHAMP z gt Dzdescripteur Lzlimites Mzmot cle N non S specifique T tables Vevaleurs lt Cim COO Fm O maw CR N NA OB oC OD OE OF OG OH OI Od RES LIS NME NDN ORG 401 TIi TOM COL EDI DAT NOM PARTICIPANT LOCALISATION DU RESUME NUMERO DE L LISTE ZONE NORME NUMERO DE NORME ORGANISME DE NORMALISATION ZONE OUVRAGE AUTEURS TITRE TOME EDITION chiffres arabes COLLECTION MAISON D EDITION DATE D EDITION AAAA LIEU D EDITION LANGUE CLASSIFICATION LOCALISATION PHYSIQUE 01 0050 01 0050 01 0001 01 0030 01 0050 A mm ee ces me one 01 0100 01 0500 N 01 0020 01 0100 01 0050 04 0004 01 0030 03 0003 01 0002 01 0050 N N INDEX lt ATION C DU L IN R I 5 5 YN X YN YN YN X YN YN X N Y X NN NN N N X Y N N N X YN YN Y N EDITION DES CHAMPS Jui 1992 LIBELLE CHAMP LONGUEUR Ui C lt p rg zzzzzzz SOUS CHAMP gt O D descripteur N L limites T Mzmot cle R N non
18. OLE NATIONALE SUPERIEURE UNIVERSITE CLAUDE BERNARD DES SCIENCES DE L INFORMATION LYON 1 ET DES BIBLIOTHEQUES ENSSIB UCBL bioM rieux MISE A JOUR DU THESAURUS BIO CONCEPTION D UNE FICHE D AIDE A L INDEXATION Memoire de stage Dipl me d Etudes Sup rieures Sp cialis es INFORMATIQUE DOCUMENTAIRE sous la Direction de Mme M Estour et Mme A BlancMichaud Mars Juin 1992 Sophie TOULEMONDE TOURNEUR ECOLE NATIONALE SUPERIEURE UNIVERSITE CLAUDE BERNARD DES SCIENCES DE L INFORMATION LYON 1 ET DES BIBLIOTHEQUES ENSSIB UCBL bioM rieux MISE A JOUR DU THESAURUS BIO CONCEPTION D UNE FICHE D AIDE A L INDEXATION Memoire de stage Dipl me d Etudes Sup rieures Sp cialis es INFORMATIQUE DOCUMENTAIRE sous la Direction de Mme M Estour et Mme A BlancMichaud ST 19 Mars Juin 1992 Sophie TOULEMONDE TOURNEUR Je tiens ici remercier Mr Pozet Directeur du service Recherche et D veloppement pour avoir tenu m accueillir chez bioM rieux pour la r alisation de mon stage de fin d tude et le remplacement de Mme BlancMichaud et Mme Estour Responsable du service Visas Enregistrements et Biblioth que pour sa disponibilit et son appr ciable encadrement Je remercie galement Mme BlancMichaud pour son aide et ses pr cieux claircissements dans l tude du Th saurus BIO et pour la pr sentation de sa fonction de Documentaliste scientifique Melle H Durieu pour son efficac
19. chaque question Tamil r pond en donnant le num ro de la question le nombre de r ponses obtenues dans la base et pour les termes multisens les champs index s dans lesquels la r ponse est trouv e On peut alors choisir de limiter la recherche un ou plusieurs champs s lection s ou aucun ou tous La commande Visualiser sert analyser la pertinence des r ponses trouv es afin de pouvoir restreindre la recherche en cas de bruit trop important avec la commande TExte donnant acc s m me aux champs non index s ou de pouvoir l largir en cas de silence trop important avec la commande ETendre 1 2 Pr sentation la B Donn es Intern ioM rieux Structure des Bases La Base de Donn es Interne de bioM rieux sous TAMIL comprend 3 Bases Cf Annexe 2 VOL r serv e aux Catalogues Compte rendus de congr s Dictionnaires Livres Rapports Revues n hors s rie et Th ses SYM pour les annonces et programmes de Congr s et BIO La Base BIO est segment e en 3 sous bases correspondant respectivement aux Articles Publi s Segment PUB aux Normes Segment NME aux Brevets Segment BRE Elle comprend actuellement plus de 30000 r f rences Ces diff rentes Bases et Sous bases facilitent l organisation de chaque type de Notice bibliographique selon la nature des documents g rer Chaque Notice a un Num ro de r f rence unique et comporte toutes les rubriques ou champs n cessaires la d fin
20. de bibliographie des chercheurs ou des autres services de bioM rieux assistance technique service commercial sur des sujets nouveaux sont trait es par la documentaliste Le travail est alors de pr parer la recherche en d terminant les descripteurs anglais et l orientation de l information d sir e afin de choisir la strat gie de recherche Ceci n cessite donc souvent de faire pr ciser ou reformuler la demande en posant les questions ad quates afin de d finir les produits recherch s type de document nombre de r f rences esp r la p riode les langages Et de facon aussi essayer de limiter le prix de la recherche La biblioth que dispose pour cela de diff rents outils Services t l matiques sur Minitel mais galement accessibles sur l cran du microordinateur gr ce une carte de communication Korex en particulier les bases Meeting Joel pour les journaux officiels et Pascal en vid otext La Base de Donn es Interne sur TAMIL en r seau interne et l acc s plus de 200 Banques de Donn es de sources am ricaines ou europ ennes principalement Medline repr sent es par le serveur de l Europ enne de Donn es Data Star 5 4 Editions La biblioth que dite r guli rement plusieurs documents BULLETIN Au cours du mois toutes les r f rences d int r t particulier g n ral ou nouveau sont index es avec un num ro de Bulletin photocopi es et gard es la biblioth que Chaqu
21. e collaboration dans mon travail et dans la r alisation de ce rapport Ainsi que Melle N Epinat et Mme Mourier avec lesquelles j ai travaill en quipe et pour leurs remarques avis es dans la conception des fiches d indexation J aimerai d autre part exprimer ma sinc re reconnaissance tous les professeurs du DESS qui m ont permis cette ann e d acqu rir les bases n cessaires en Informatique Documentaire Merci enfin aussi tous les chercheurs et autre personnes de bioM rieux avec lesquelles j ai eu d agr ables relations de travail et qui m ont permis de faire ce stage enrichissant et interessant RESUME Ce rapport pr sente le travail r alis chez BioM rieux pendant le stage de fin de DESS Informatique Documentaire de Mars Juin 1992 Le service de documentation est pr sent son organisation et son informatisation La Mise Jour du Th saurus BIO sur le Syst me de Gestion de Base de Donn es TaMiL et la Conception d un document d aide l indexation pour les utilisateurs sont d velopp s Puis le travail de la documentaliste scientifique est rapidement d crit Les choix m thodologique de construction du Th saurus BIO ainsi que ses valuations et que sa structure s mantique sont expos s L analyse statistico comparative en indexation et en recherche de ses descripteurs est d crite Et les proc dures de transformations terminologiques et relationnelles sont expliqu es Enfin les difficult s
22. e mois gr ce au syst me de gestion de base de donn es Tamil toutes les r f rences du Bulletin correspondant sont alors tir es part d apr s leur disponibilit et transf r es dans une Base 25 particuli re BUL Apr s v rification de toutes les notices une dition est faite selon un format appropri Le Bulletin est alors envoy mensuellement aux destinataires qui peuvent y faire un choix d articles Ceci constitue donc une source d information pr s lectionn e importante pour le personnel int ress de bioM rieux Liste des LIVRES De m me la liste des Nouvelles Acquisitions Base VOL est dit e partir de Tamil tous les trimestres avec la localisation des ouvrages et est distribu e aux demandeurs Liste des CONGRES Un Agenda de tous les congr s susceptibles de correspondre un domaine exploit par bioM rieux est tabli par la documentaliste d apr s les demandes ou participations des chercheurs et tous les documents passant par la biblioth que Celui ci fait l objet d une dition semestrielle Bilan et Compte rendu d activit Le nombre de r f rences saisies sur Tamil d apr s leur nature publication norme brevet et leur origine abonnement bioM rieux tir part photocopie de la bibiiotheque universitaire est tabli mensuellement En moyenne environ 500 nouvelles saisies par mois alimentent la base BIO Un compte rendu d activit est fait tous les deux mois 26 ANNEXES
23. ensemble de ces relations donne une image de la richesse structurale du th saurus ratio entre le nombre de relations s mantiques et le nombre total de descripteurs Celle ci est aussi li e directement l exhaustivit et la pr cision de l indexation 13 Editions Tamil permet l dition de plusieurs formes du Th saurus Cf Annexe 5 Edition alphab tique avec uniquement les termes descripteurs Edition tendue avec le nombre de niveaux d sir s c est celle que j ai utilis e pour mon travail de correction Edition permut e De plus deux listes annexes sont tenues jour Soci t s amp et Produits 96 3 3 Principes d indexation Comme on l a vu dans l organisation de la biblioth que une indexation particuli re est attribu e aux notices de chaque base ou sous base Pour les publications ce travail se fait maintenant sur la fiche que j ai mise au point Cf 82 3 pr voyant une classification l attribution de mots cl s les parutions dans le bulletin Cf 83 4 ou conservation la biblioth que et les noms des demandeurs S lection des articles pour la Base BIO Exemple de lecture d une revue Un choix de r f rences est fait dans les Sommaires d apr s la lecture des Titres si n cessaire du R sum et de la partie Mat riels et M thodes Ceci en fonction de diff rents crit res Articles d int r t g n ral ou Synth ses Sujets suivis depuis longtemps en cours ou q
24. es liminer pour utilisation nulle Ceux transformer en un synonyme soit avec effacement soit avec conservation et cr ation d une relation d quivalence entre termes Les liens s mantiques modifier annulation ou inversement ou cr er En pratique chacune de ces op rations est cependant effectuer avec prudence car elles d clenchent des corrections en avalanche dans tout l ouvrage Toutes les modifications qui ont t faites dans le th saurus sont finalement prises en compte apres une indexation en diff r l index et les lexiques sont alors de m me mis jour et le systeme affiche les termes chang s 3 4 1 Proc dures Dans la fonction Th saurus Les r gles de coh rences appliqu es par Tamil au cours des mises jour manuelles du th saurus ne prennent pas en compte un contr le r gressif ou en amont partir des descripteurs modifi s jusqu aux notices respectives Une tape de correction directement dans les champs mots cl s des r f rences o une modification est pr vue est donc n cessaire au pr alable Sans quoi l indexation de la base n est plus rationnelle et certains anciens documents peuvent tre perdus L objet de mon stage a donc t dans un premier temps de d terminer clairement les diff rentes tapes pr voir pour chaque type de mise jour Plusieurs cas se pr sentent EFFACEMENT D UN TERME 0 Corriger le terme dans les notices ind x es avec ce
25. es dans le Thesaurus 43 Donnees generales section thesaurus a modifier 0 N 0 Libelle Thesaurus Section Thesaurus d essais Indexation au terme generique 0 N N Code relation 1TG 2TS 3EMP 4ER 7UA BNE SNH SCOP amp CO 1TG 2T8 3ERP 4EM UA BNE 9NH SCUP amp CO Long max Descripteur 5 Chanos concernes Liste codes internes champs separes par AU DF DJ Menu Th saurus Thesaurus 9 Fin 1 Saisie 2 Edition etendue 4 dition alphapetique 4 Edition pergutee S Indexation du thesaurus Reponse 9 Thesaurus Base INS INSERM Section A Section Thesaurus d essais Descripteur ORDINATEUR pode relation s L B TS ERP ER VA NE NH COP CO Terme relie 1 MICRO ORDINATEUR MINI ORDINATEUR SUPER ORDINATEUR TG NFORMATIQUE NE erme introduit en 1986 THIS termes ssocies 2 suivant 3 saisie 4 annuler tout 1 ANNEXE 6 TAMIL DEFINITIONS DES PRINCIPALES COMMANDES D INTERROGATION PRINCIPALES COMMANDES DE RECHERCHE TAMIL Commande BAse permet de se connecter une base diff rente de celle o l on se trouve automatiquement La base la plus utilis e BIO est m moris e Commande Visualisation permet d obtenir l cran l affichage de toutes les notices trouv es par une question donn e la derni re par d faut Commande V P pour obtenir le r sultat sur papier possible uniquement pour le poste de la biblioth que Commande EDiter permet l
26. inword Cf page suivante Ce document est donc utilis d un bout l autre de la chaine par la documentaliste pour une premi re indexation puis pour la mise jour du th saurus par les secr taires pour la saisie et par les chercheurs De par sa clart il a fait progresser tout le travail de la biblioth que en efficacit plus d oublis ni d erreurs ni de pertes En particulier il a aussi permis un gain de temps important au secr tariat gr ce la suppression des photocopies des 1 pages des articles D autre part il a apport un r el change int ressant entre le service de documentation et les propositions de mots cl s des demandeurs Par la suite et selon les m mes bases j ai concu un m me type de fiche destin e l indexation des Brevets Ceci a t fait en troite collaboration avec le laboratoire de biologie mol culaire fort 21 demandeur et selon un syst me suppl mentaire de pr indexation permettant une encore plus grande autonomie des chercheurs pour le rep rage de documents souvent assez techniques Cf page suivante FICHE D INDEXATION POUR LE SEGMENT PUB DE LA BASE BIO NUM lona de b P MOTS CLES biblio A paraitre dans BUL n Gui N 4 Bulletin Aen salads du odiis pan la MOTS CLES Personnels la di ki de dus du aulas demanda A retourner compl t la biblioth que MERCI CLA Classement s NUM Nu
27. iographiques arrivent la biblioth que S lection de r f rences tir es des current contents sur papier ou sur disquette R f rences bibliographiques t l d charg es provenant d interrogation th matique sur Base de Donn es Internationales Sp cialis es Demandes ponctuelles Toutes ces demandes font alors l objet d une saisie soit manuelle et parfois de facon incompl te selon les renseignements communiqu s soit par t l d chargement en particulier pour les demandes tir es des Current Contents sur Disquette CCOD gr ce au syst me de compatibilit de formats r alis par le Logiciel de Gestion de Base de Donn es utilis par bioM rieux Tamil Un num ro de r f rence interne leur est attribu et un travail de localisation est r alis Dans l ordre trois principaux cas se pr sentent 1 La r f rence est tir e d un abonnement bioM rieux ou existe d j dans la base de donn es interne Tamil signale l apparition de doublons lors de la saisie L article est alors retrouv aux archives dans une revue en circulation en photocopie la biblioth que ou chez un chercheur et photocopi 2 Sil adresse des auteurs apparait sur la r f rence cas des articles s lectionn s dans les current contents ces publications sont alors demand es directement aux auteurs sous forme de tir s part Ceci est fait dans un but d conomie pour respecter le budget 3 Enfin dans le cas ch ant les a
28. is il est possible d obtenir comme renseignements pour chaque mot cl les nombres d occurence d utilisation et de recherche V rifications Par la suite les descripteurs sont retenus d apr s leur valuation V rification des synonymies efficacit en recherche documentaire et importance par rapport au document indexer Relations Enfin l tablissement des relations ne s est pas fait partir de la constitution d un corpus mais de facon artisanale La notion de th me ou domaine a t transform e dans la Base de donn es interne par un classement en 28 grands domaines Cf Annexe 1 auxquels appartient chaque notice Saisie une ou plusieurs classes par r f rence D autre part les rapports entre concepts sont repr sent s par l indication des corr lations entre les termes Ces relations doivent tre choisies selon un plan d ensemble qui replace tous les l ments les uns par rapport aux autres et avec comme principal souci de supprimer au maximum les causes possibles de silence ou de bruit soit l indexation soit l interrogation 12 Les relations prendre en consid ration sont Relation d Equivalence EM EMployer CO COde EMP EMployer Pour COP COde Pour Ce type de lien est tabli entre les synonymes Il ob it plusieurs crit res pour le choix des mots utiliser comme descripteur D veloppement des abr viations Dans les cas o la longueur du descripteur est inf rieur ou ga
29. it du th saurus D autre part la d signation des descripteurs doit tre faite avec pr cision et pertinence car la qualit de l indexation est galement importante 10 3 2 Pr sentation Construction Existe t il d j un thesaurus couvrant le sujet ou une partie du sujet ETABLIR UNE LISTE DE MOTS CANDIDATS M THODE M THODE ANALYTIQUE SYNTHETIQUE Extraire le vocabulaire del Collecter les mots partir l indexation exp rimen de sources de r f rences dictionnaires index d ouvrages tables des mati res nomenciatures listes diverses Dans la langue tudier le vocabulaire pour en extraire les termes utiles QUI ments Extraire les mots significa tifs des questions et des textes NON Le vocabulaire est il complet COMPL TER LA LISTE en faisant appel aux sp cialit s de chaque domaine S LECTIONNER LES DESCRIPTEURS en appliquant les crit res de choix Normaliser ia forme des descripteurs STRUCTURER LA LISTE DES DESCRIPTEURS tablir les relations hi rarchiques ettablir les rela tions d quiva lence pour viter le doubie emploi pour indiquer toutes ies synonymies e tab r les reia Facettes tions associati liste des facettes tri par facette un terme dans une seule facette hi rarchisation dans chaque face
30. ition du document Les Champs sont d finis par Cf Annexe 3 un Code Interne 2 caract res un Code Mn monique 3 caract res et un Libell en clair 30 caract res au maximum De plus les param tres de Longueur min max Pr sence obligatoire Indexation Nature des caract res Formats Validation et nombre de r p titions sont pr cis s la cr ation de chaque Champ La Stucture du syst me est repr sent e en sch ma 1 Cf Annexe 4 ll comprend donc 8 grandes sortes de Fichiers g r s par le Thoroughbred Basic de Concept Omega 8 Fichiers Bibliographiques DBBn de type index 1 par base 8 Fichiers Lexique LXBn dictionnaire de tous les mots cl s 1 Fichier Index IXBn fichier invers 8 Fichiers de Saisie XXBn Th saurus B1TH 8 Fichiers de Doublons Fichiers Tables Mots vides Utilisateurs Alimentation du syst me Mise jour La Base de Donn es Interne est aliment e tous les jours avec la saisie des nouveaux articles s lectionn s La fonction Mise jour permet la cr ation la modification ou l annulation de notices bibliographiques au sein de la base Les notices mises jour sont plac es dans un fichier temporaire de saisie et transf r es en diff r chaque soir au moment de l indexation pour devenir accessibles en recherche et l dition La s lection de l option Mise jour permet d acc der directement au menu de sai
31. le 30 caract res taille autoris e par Tamil Choix des racines latines ou grecques ou des noms scientifiques exprimant les m me notions qu un nom commun Choix du terme le moins polys mique Relation Hi rarchique TG Terme G n rique TS Terme Sp cifique Cette relation hi rarchique plus abjecte que celle th matique correspond la notion de facettes Elle repr sente un ensemble de liens de m me nature du type genre esp ce Une notion ne devrait trouver sa place que dans une seule facette quand un terme apparait sous plus d une facette sa signification exacte m riterait d tre red finie Ce type de corr lation est caract ristique des th saurus documentaires il constitue l ossature de l ouvrage et assure sa coh rence interne Relation Associative VA Voir Aussi NH Note Historique NE Note Explicative Contrairement aux autres ces rapports ne sont pas toujours r ciproques ils indiquent des analogies de signification associations mentales 15 sont importants pour l indexeur car ils l aiguillent dans le th saurus entre les id es voisines d un descripteur donn mais ne doivent tre tablis qu en cas de n cessit pour la recherche documentaire Tous ces liens sont g r s par Tamil gr ce des r gles de coh rence r ciprocit s automatiquement g n r es ou annul es par le syst me pas de polyhi rarchie descripteurs automatiquement pass s en Majuscules Enfin l
32. lle est partie en cong s maternit L Organisation Description g n rale de la documentation scientifique chez bioM rieux P riodiques La biblioth que est abonn e 160 revues scientifiques Tous les abonnements 200 sont actuellement centralis s par H l ne Durieu L organisation d une salle de lecture est pr vue mais sa mise en place n en est qu son d but Un listing de ces abonnements est propos aux lecteurs de bioM rieux qui choisissent soit de recevoir une photocopie des sommaires sur lesquelles une s lection d articles peut tre faites soit de recevoir directement la revue en s inscrivant sur la liste de circulation Une premiere s lection d articles est faite dans ces p riodiques avant leur d part en circulation par Mme Estour Mme BlancMichaud ou moi m me et sur les sommaires envoy s d s l arriv e des revues aux demandeurs et qui doivent les retourner la biblioth que dans les 48 heures Ces articles sont index s par la documentaliste scientifique avec un classement en 28 grandes mati res Cf Annexe 1 des mots cl s extraits du th saurus BIO et le choix de leur apparition dans le bulletin Cf 3 4 ou de leur conservation la biblioth que d apr s la fiche d indexation que j ai cr e lis sont alors saisis par une des secr taires pour l alimentation de la Base de Donn es Interne Les revues sont ensuite mises en circulation Autres D autres types de demandes bibl
33. m ro de r f rence interne BUL Bulletin DEM Demandeur s 8 1 Photocopie de l article est conserv e la Bibliotheque FICHE D INDEXATION POUR LE SEGMENT BRE DE LA BASE BIO FICHE D INDEXATION BREVETS E N S Sondes Nucleiques R f rence Interne N de Publication 11 MOTS CLES au choix X Sample Preparation X Capture X Transcription X Detection X Identification X Apparatus Mots cl s Personnels en Anglais Classification CLA 06 Localisation LOC ENS a si classement dans les boites X Nucleic acid Sequencing X Bacterium X Nucleic acid Sequence X Genetic Disease X Target Amplification X Virus X Signal Amplification X Virulence X Modified Base X Ribosomal RNA X Antibiotic Resistance X Enzyme A retourner compl t la biblioth que MERCI Remplacement la D mentalist ientifi Mon stage a galement compris pendant 2 mois le remplacement de la documentaliste scientifique Ce travail s est compos de diff rentes fonctions 5 1 Gestion des p riodiques BioM rieux a pass un contrat avec la soci t Europ riodiques pour g rer l ensemble de ses abonnements 200 cela correspondant un budget d environ 400000 francs annuel Mon activit au niveau des abonnements a donc consist r clamer tous les d fauts de r ception essayer d orienter au maximum tous les nouveaux abonnements vers Europ riodiques mettre au clair tous les probl mes
34. ment DHA INTEGRATION DANSYL ACTIVATION Edition du lexique TAMIL Edition du lexique Jui 1992 page Base DOCUMENTS SCIENTIFIQUES Descripteur S Rech Cha Result Cha Result Cha Result Cha Result DAIRY PRODUCT 0 MOC 25 DAKAR 0 TI 2 DALIA 0 1 DALTOH 1 1 3 DAMAGE 0 17 DAMAGE BINDING 0 TI 1 DAMAGE SPECIFIC o 1 DAMAGES 0 TII 1 DAMMINI 0 3 DANACH 1 TIf z DAHAZOL 1 MOC 1 DANE 1 2 DANGER 2 DANGEREUSES 1 12 DANGEREUX 1 1 DANGEROUS COMPOUND 2 MOC 0 DANGEROUS PRODUCT 2 MOC 20 DANGERS 1 TI1 2 DANGEUREUSES 0 1 DANISH 0 1 DANNO 0 1 DAHSYL TI1 2 DANSYL ACTIVATION 0 MOC 1 DANSYL GROUP MOC 2 DAPI Q TI 1 DAPTOMYCIN Q HOC 1 2 DARAUS Q TII 1 DARKENING o 2 DARKNESS o TI 1 DARSTELLUNG TI 1 DAS o TI 8 DAT O 2 DATA Q 85 3 DATA ACQUISITION D 3 DATA ANALYSIS Q MOC DATA BASE MOC 3 DATA MANAGEMENT MOC 2 DATA PROCESSING 9 MOC 31 DATA FITTING 1 DATA PROCESSING OTI 1 DATABASE O MOC 7 5 DATABASES O TII 5 DATE O T11 4 Fonction THESAURUS Ecrans de Menu Entr e saisie avec statistique et param trage section TAMIL Thesaurus Base INS ERA Section Thesaurus Ee Thesaurus d essais Indexation au terme generigue Nombre d enreqistrenents dans le Thesaurus 48 Nombre de termes dans le Section Thesaurus 43 Nombre de term
35. on au service de documentation On distingue les crit res de recherche primaires directement accessibles des secondaires pour lesquels une recherche pr alable est n cessaire PRINCIPALES COMMANDES La recherche interactive utilisateur syst me en mode conversationnel se fait par un dialogue utilisant un vocabulaire limit Une vingtaine de commandes peuvent tre employ es en combinaison avec les mots cl s pour retrouver les notices bibliographiques pertinentes Pour d buter 10 commandes principales sont connaitre Cf Annexe 6 Les autres commandes sont cit es ici LAngue OPtion SOs DOmaine CAtaloguer NUm roter QUestion ETendre HEure FOrmat SYnonymes de passe Leur utilisation est d velopp e dans le manuel d utilisation Tamil Strat gie Exploitation Plusieurs param tres servent l laboration des quations de recherche Les questions simples peuvent tre enrichies gr ce au masque ou au signe de troncature illimit e Celui ci peut aussi tre employ au centre du terme jamais gauche Le systeme affiche tous les termes engendr s par la troncature et leur fr quence puis le r sultat de la recherche La combinaison d tapes simples permet de poser des questions complexes gr ce aux op rateurs de comparaison mais surtout aux op rateurs bool ens Et intersection d ensembles Ou union d ensembles Sauf exclusion d ensemble Apr s
36. pratiques qui d coulent de ces op rations apparaissent avec les probl mes d s au progiciel documentaire Tamil Les buts pour la r alisation du projet de fiche de pr indexation sont examin s II s agit d une part d am liorer la clart et l efficacit du travail d indexation Et d autre part de faciliter les changes entre le service de documentation et ses utilisateurs Les r sultats de cette tude et ses avantages sont analys s DESCRIPTEURS _ Th saurus _ Indexation _ Syst me de recherche d information _ Mise jour _ ABSTRACT This report represents the work undertaken at bioM rieux during the final training period of the DESS Computing Information Course fron March to June 1992 The organisation and computerization of the documentation departement is described The BIO Thesaurus Update on the Data Base Management System and the creation of an Indexing Guide for users have been treated in detail Then a brief description of the position of Scientific Librarian is given The methodological choices made during the compilation of the BIO Thesaurus as well as its assessments and its semantic structure are described The indexing and research statistico comparative analysis for the key words is given and terminological and relational transformation procedures are explained Finally the practical problems arising from these operations are represented together with problems caused by the Tamil documentory software package
37. question dans un fichier magn tique nomm Cette commande s utilise donc en vue de t ches particuli res t l d chargement ou modifications en s rie Commande TH saurus permet d obtenir laffichage de lenvironnement s mantique d un terme Pour chaque terme apparaissant avec un num ro d ordre on a ses relations leur fr quence d utilisation dans la base leur champ d origine Fin ou Stop ou pour finir toute session sur Tamil BIBLIOGRAPHIE 1 Bachrach C A Charen T _ Selection of Medline contents the development of its thesaurus and indexing process Medical informatics London 1987 vol 3 n 3 p 237 254 2 Fishel C C Graham K E Greer D M Gupta A D Lockwood D K Prime EE CINAHL List of subject headings A nursing thesaurus revised Bulletin of the medical library association 1985 vol 73 n 2 p 153 159 8 Janick S Brunet La mise jour d un th saurus Documentaliste 1987 vol 24 n 6 p 215 229 4 Kayser K Ramish W Von Kenne H Hopker W W _ Thesaurus and information Medical informatics London 1980 vol 5 n 2 p 155 166 5 Norme Afnor NF Z 47 100 _ Documentation R gles d tablissement des Th saurus monolingues D cembre 1981 p 1 20
38. r ce cas D autre part les relations Associatives ne sont pas syst matiquement r ciproques Il n y a donc pas d invertion proprement dite mais cette situation s apparente plut t aux cr ations et effacements de relation Cf SCr ation amp Effacement de relation Le cas des relations d Equivalence EM EMP est le plus complexe Il est trait ici l aide d un exemple pour plus de clart 18 Exemple Descripteur CORTICOTROPHIN RELEASING FACTO R Descripteur en MAJUSCULES avec la relation EMP CRF Tamil tronque les descripteurs au del de 30 caract res celui ci apparait donc sans r dans le th saurus Si l on annule une relation DESCRIPTEUR non descripteur ce dernier est automatiquement effac du th saurus Il faut donc commencer par 0 Faire une modification en s rie dans les notices concern es CRF est transform en CORTICOTROPHIN RELEASING FACTOR Puis 1 Effacer le Lien DEscRIPTEUR Non descripteur Pour cela faire comme si on voulait cr er cette m me relation et le syst me propose alors son annulation Et Indexer le Th saurus 2 Recr er le non descripteur en Descripteur Crf devient CRF 3 Faire une modification en s rie dans les notices concern es CORTICOTROPHIN RELEASING FACTOR est transform en CRF 4 Effacer le DESCRIPTEUR dans le Th saurus et l indexer 5 Recr er la Relation EM EMP dans le sens inverse Corticotrophin releasing factor non descrip
39. r le menu g n ral Indexation Les 3 fichiers de saisie de chaque base sont ind x s une fois par jour tous les soirs Sauvegardes Des sauvegardes sont faites continuellement dans la journ e sur disquette 2 jeux de 5 disquettes Lundi Vendredi servent alternativement une semaine sur deux Et une sauvegarde suppl mentaire de tous les fichiers est faite sur bande tous les Vendredis soirs 4 bandes sont utilis es cons cutivement de facon avoir constamment le dernier mois de travail sauvegard sur support magn tique amovible Utilitaires Les fichiers utiles pour le bon fonctionnement du syst me sont class s sous ce module Messages Mots vides Synonymes Tables de validation Th saurus Th saurus La Base de Donn es Interne de BioMerieux n a qu un fichier th saurus g n ral BIO Celui ci comprend maintenant 8500 mots environ il peut tre quotidiennement aliment en mise jour avec la cr ation de nouveaux descripteurs d indexation La fonction th saurus permet l initialisation et la mise jour imm diate du fichier Th saurus et ses indexation et dition Cf Annexe 5 Uti Ce fichier permet de limiter l acc s aux fonctions du syst me ainsi qu aux notices bibliographiques H permet galement de suivre l emploi des fonctions d interrogation et d dition en diff r par l obtention de statistiques d utilisation Mi jour th r 3 1 Introduction Le r le du Th saurus dans la
40. sie Celui ci offre galement des fonctions d aide telles que visualisation dernier document cr Modifications en s rie ou Masques de saisie Pour limiter l entr e de donn es erron es des op rations de validation sont pr vues chaque tape et une d tection automatique des doublons est signal e Les Modifications en s rie permettent des corrections ajouts ou suppressions de donn es dans un champ en une seule fois sur une s rie de notices archiv es ou dans un fichier entier automatiquement ou avec validation La fonction Masques de saisie permet de modifier l apparition d un choix de champs dans un ordre d termin afin de faciliter l op ration de saisie Le contr le des doublons permet d viter la saisie du m me document sous deux num ros de r f rence diff rents Pour ce faire le gestionnaire du syst me permet de d crire les modalit s de constitution de la cl de contr le plusieurs d buts de champs Editions L option Edition permet de d terminer un titre pour chaque dition correspondant une mise en page avec les champs concern s et des crit res de tri Cette fonction est utilis e pour chaque type d dition r guli re faite la biblioth que et a servi param trer les commandes EDiter et Visualisation Traitements en diff r Ces fonctions concernent la vie m me de la base Indexation Sauvegarde de ce fait les modalit s d acc s ce module ne se font pas pa
41. sion de certains concepts addition de relations s mantiques La cr ation de nouveaux descripteurs se fait de facon simple en saisie apr s validation des mots cl s non trouv s dans le lexique En revanche le retrait de termes et la mise jour des liens ne se font pas de fa on directe Ces proc dures interviennent apr s des preuves d essai des applications du th saurus Ce travail tant de grande ampleur il a t fractionn en 24 grandes tapes c est dire lettre par lettre Pour cela j ai dit chaque fois deux formes extraits du th saurus dition tendue liste des descripteurs avec leur fr quence d utilisation l indexation et en recherche Les op rations de v rification consistent alors en une relecture approfondie en parall le de chaque extrait par une personne sp cialis e en documentation scientifique Ces essais doivent montrer si les relations tablies entre les notions sont correctes et suffisantes Et ce niveau les occurences d utilisation de chaque terme constituent un outil pr cieux pour juger le th saurus Par exemple l utilisation trop importante d un mot cl est viter car celui ci perd en sp cificit l inverse les subdivisions trop fines du th saurus ne servent jamais 16 Pour finir chaque fois qu une information ne peut tre r cup r e les mots cl s doivent tre re valu s A la suite de cette tape sont donc d termin s les term
42. st me supportant 1 10 Bases avec plusieurs sous bases Segments entierement param trables par l utilisateur et de capacit importante permettant jusqu plus de 100000 notices par base ll permet la saisie interactive de notices en r seau et une mise jour en diff r des fichiers bibliographiques Un contr le d acc s aux fonctions du syst me et aux notices peut tre accord diff remment selon les droits des utilisateurs du r seau Diverses ditions sont param trables en fonction des besoins Le mode de recherche tente de se rapprocher de celui des centres serveurs conversationnel bilingue et multi crit res Enfin la gestion des pr ts avec r servation et lettres de relances a t pr vue Depuis sa cr ation Tamil a volu Les fonctions suivantes se sont ajout es la version initiale Connexion avec serveurs ext rieurs possible avec t l d chargement Contr le des Doublons Gestion du Th saurus Gestion des p riodiques avec commandes bulletinage et dition de fichiers de circulation Recherche La recherche sous Tamil est proche de celle utilis e par les gros serveurs comme Questel en particulier Crit res Les champs de chaque notice permettent de retrouver les r f rences souhait es Cf Annexe 3 Certains permettent d identifier le document D autres informent sur le contenu scientifique du document D autres enfin informent sur la nature physique de l article et l aspect gesti
43. t volutifs de haut niveau scientifique adapt s la routine du laboratoire d analyse et des tudes sp cifiques comme l pid miologie gr ce aux syst mes experts Le d veloppement du groupe bioM rieux s est fait en int grant les r alit s conomiques d un contr le de plus en plus s v re des d penses de la sant Les quipes pluridisciplinaires de recherche bact riologistes immunologistes biochimistes travaillent actuellement tout particuli rement dans les domaines du g nie g n tique vers lesquels S oriente l avenir du diagnostic A toutes ces comp tences se joignent des sp cialistes en microm canique lectronique et informatique Au stade de la production les services de contr les doivent enfin tre garants de la qualit des produits 2 Pr sentation rvi mentation bioM rieux 2 1 LeService le personnel La Biblioth que de bioM rieux d pend de l unit de Recherche et D veioppement sous la direction de Mr Pozet Mme Estour est responsable du service Enregistrements Visas et Biblioth que Mme A BlancMichaud occupe le poste de documentaliste scientifique Elle travaille avec Melle H Durieu qui s occupe de la r ception et de la circulation de toutes les revues et deux secretaires Melle N Epinat et Mme M Mourier Je suis arriv e dans le service le 02 Mars 92 en tant que stagiaire et ai pris le remplacement de Mme BlancMichaud partir du 24 Avril date laquelle e
44. teur en minuscules EM CRF EFFACEMENT D UNE RELATION Pour les Relations Hi rarchiques et Associatives il n y a pas de probl me Cas des Relations d Equivalence 1 Transformer dans les notices tous les Non descripteurs en DESCRIPTEUR En recherche le pointeur travaille sur les termes DESCRIPTEURS index s seuls 2 Effacer la relation 19 3 5 Conclusion Le th saurus tant un outil volutif ces v rifications doivent tre r alis es p riodiquement de fa on l adapter sa fonction documentaire Depuis sa cr ation 10200 enregistrements ont t fait dans le Th saurus de la Base de Donn es Interne de bioM rieux Celui ci n en contient cependant que 8400 actuellement Statistiquement cela signifie que 16 596 des termes cr s dans BIO ont ensuite t modifi s Cependant et comme il est possible de le voir par exemple pour inverser une relation 6 importantes tapes le Syst me de Gestion de Base de Donn es Tamil est relativement peu convivial et mal adapt cette fonction et les corrections sont tr s longues Au cours de mon stage je n ai eu le temps que de corriger les 6 premi res lettres de l alphabet A F En moyenne 23 de mots cl s sont modifi s par lettre 7 6 de termes supprim s 3 1 ou transform s en synonyme 4 5 10 6 de relations cr es entre termes et 4 7 de relations modifi es invers es ou effac es Cela correspond donc en tout environ 470 correc
45. tions pour lesquelles les tapes de v rifications prennent galement un temps important Tout en tenant compte des r flexions pr c dentes un effort a t fait pour liminer tous les termes synonymes et les regrouper sous ie plus significatif Cette mise jour a eu pour r suitat un th saurus de volume peu pr s quivalent mais enrichi en relations s mantiques 20 4 Document d aide l indexation L objet de mon stage a aussi t de cr er une fiche d aide l indexation pour les utilisateurs de la Base de Donn es Interne de bioM rieux Auparavart ce travail d indexation tait fait simplement sur de petits papillons de couleur fix s par un trombone sur les articles saisir Les chercheurs avaient aussi l opportunit de donner leurs propres mots cl s en renvoyant une feuille blanche compl t e qui leur parvenait agraf e chaque page de garde des articles demand s Les inconv nients de ce syst me taient multiples trop peu de place papillons de 24 cm risque de perte des papillons manque vident de clart pr paration des feuilles d indexation pour les chercheurs longue et fastidieuse A partir de ces constatations et avec l aide du personnel de la biblioth que j ai donc essay d imaginer un nouvel outil d indexation pour les publications qui alimenteraient le segment PUB de la Base BIO De cette r flexion est n le document suivant r alis avec le traitement de texte W
46. tte ESSAI DU THESAURUS Mise jour p riodique est il satisfaisant MISE EN APPLICATION du DU THESAURUS 11 Le nombre de th saurus dans le domaine documentaire m dical est relativement faible un large consensus semble en effet s exprimer travers le Medical Subject Headings MeSH L objectif pour le th saurus BIO n a donc pas t de sauvegarder une compatibilit avec d autres ouvrages d j existant sur le m me sujet mais sa construction s est faite au fur et mesure de la cr ation de la Base de donn es interne sur Tamil C est un th saurus posteriori non normatif dans lequel la collecte des mots cl s est tablie d apr s une m thode analytique partir de l indexation chaque terme contenu a servi au d part au minimum une fois Ce choix se justifie par l int r t de bioM rieux ax surtout sur le diagnostic en maladies infectieuses bact riologie virologie parasitologie h mostase et biochimie faisant appel des techniques telles que la biologie mol culaire et les immunoenzymoessais De nombreux termes pr cis appartenant des disciplines sp cialis es sont donc pr sents dans cet ouvrage La validation de nouveaux descripteurs a t constante au d part puis s est stabilis e Le th saurus BIO comprend maintenant 8500 mots environ 3 ans apr s le d marrage de la Base de donn es interne Les dates de cr ation de chaque terme ne sont pas sp cifi es ma
47. ui mergent Techniques m thodes Noms de genres scientifiques Produit s bioM rieux cit s 14 Classification La classification correspond un rangement thematique qui permet de classer tous les articles en 28 grands domaines Cf Annexe 1 Cependant pour les sujets suivants Environnement Ecologie Agroalimentaire Neurologie Cerveau et Biotechnologies Technique M thode Materiel il m a parfois manqu une classe ad quate La cr ation de ces 3 chapitres me parait necessaire Choix des descripteurs Les mots cl s sont attribu s partir du Th saurus BIO et d apr s des crit res pr cis Principes resp cter pour le choix des descripteurs Mots ci s Anglais uniquement toujours au Singulier et la forme Substantive pour les descriptions d activit Un descripteur peut comprendre 1 ou plusieurs mots mais il faut de pr f rence d composer le plus possible chaque expression Un descripteur ne doit repr senter qu une seule notion Pour les synonymes un seul terme doit tre choisi comme descripteur et utilis pour l indexation Lors de la saisie de mots cl s synonymes relation EM EMP Tamil les transforme automatiquement par le terme Descripteur qui a t choisi Les abr viations ou sigles sont viter sauf s ils sont connus universellement Tamil tronque les descripteurs au del de 30 caract res dans ce cas les abr viations sont syst matiquement pr f r es
48. utres demandes sont command es la Biblioth que Universitaire des Sciences qui peut aussi les obtenir gr ce au Pr t Entre Biblioth ques Tout article de moins de 10 pages est alors factur 40 Francs et au del davantage Tous les tir s part et les photocopies sont recus la biblioth que o ils sont index s de la m me facon que les articles tir s des abonnements avec la fiche pr tablie La saisie est compl t e en mise jour avec le classement les mots cl s et d apr s les coordonn es exactes de larticle Les documents sont alors adress s aux demandeurs 2 1 L Informatique La documentation bioM rieux a t informatis e en Novembre 1988 l aide du syst me de gestion de base de donn es TAMIL Ce logiciel a t choisi pour son enti re autonomie de parametrage et aussi pour son interessant rapport qualit prix qui correspondaient au besoin de la soci t BioM rieux est quip d un r seau interne sous Xenix permettant aux lecteurs de se connecter en 8 sites Le mat riel dont dispose la Biblioth que est un IPC 386 avec une m moire de 300 MegaOctets reli un cran muni de deux fen tres et une imprimante aiguilles sur le r seau Mme BlancMichaud a un poste suppl mentaire dans son bureau 2 1 1 TAMIL Le progiciel documentaire TAMIL a t cr en 1982 par Mr Demians sous environnement Unix et en multiposte puis il a t adapt en monoposte sous MS DOS C est un sy
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