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1. S lection g nomique une volution r cente depuis 20 ans aux 3R BARBEZANT M 1 BOICHARD D 2 1 UNCEIA 149 rue de Bercy 75595 Paris 2 INRA UMR1313 GABI 78352 Jouy en Josas Durant ses vingt ann es les 3R ont vu l mergence de l utilisation des marqueurs g n tiques jusqu la mise en uvre de la s lection g nomique en 2009 et ont accompagn la diffusion des connaissances et des applications D s 1995 la session de g n tique a t largement d di e la pr sentation des marqueurs g n tiques et les possibilit s th oriques offertes pour diss quer le d terminisme g n tique d un caract re et s lectionner les animaux Il y a vingt ans le concept de s lection g nomique n existait pas On parlait de d tection des r gions du g nome importantes pour le d terminisme d un caract re QTL et de s lection sur la base de la transmission de ces r gions entre g n rations aussi appel e s lection assist e par marqueurs En 1999 ont t pr sent s les premiers r sultats de d tection de QTL en bovins laitiers conduits en collaboration entre l INRA et les professionnels et les premi res simulations des possibilit s de s lection assist e par marqueurs A cette poque la pr cision attendue tait limit e et on attendait surtout un outil d aide la pr selection pour diminuer le co t des programmes sans les remettre en cause fondamentalement Les premi res applications de s lecti2. nd les conditions ne sont pas aussi favorables La m me ann e sont pr sent s la possibilit technique d une valuation g nomique des embryons ainsi que des r sultats sur de nouveaux caract res dont la s lection peut tre envisag e gr ce la g nomique sur la composition en acides gras du lait dans le programme Ph nofinlait ou sur le comportement des ovins la Fage Nul doute que ce sujet de la s lection g nomique marquera le futur des 3R tant dans son contenu m thodologique que dans son extension de nouveaux caract res et diff rentes esp ces et populations Renc Rech Ruminants 2013 20 17
3. on assist e par g nes ont vu le jour le meilleur exemple tant pr sent en 2002 avec le programme de r sistance la tremblante impliquant un g ne majeur mais unique L ann e 2007 a t marqu e par une session riche pr sentant un bilan de la s lection assist e par marqueurs chez les bovins laitiers mise en place depuis 2001 et les premiers r sultats de d tection de QTL des programmes Qualvig ne et du Pin L ann e 2008 a fait l objet d une session d di e aux technologies omiques qui s taient fortement d velopp es en recherche les ann es pr c dentes dans le cadre du GIS Agenae montrant l effet de certains g nes majeurs sur des caract res importants illustr s sur la tremblante caprine ou la muscularit bovine Elle a aussi montr l int r t de la cartographie fine de QTL sur l efficacit de la s lection assist e par marqueurs permettant de tirer profit des associations marqueurs QTL l chelle de la population et pas seulement intra famille ouvrant la voie une forte augmentation de l efficacit de la s lection Lors de cette session fut galement montr e la faisabilit et l int r t du g notypage des embryons En 2009 ann e marqu e par la mise en place pratique de la s lection g nomique les 3R ont consacr une session d di e ce sujet consid r comme une r volution en s lection Parmi les expos s marquants deux synth ses sur le principe de la s lection g nomique et
4. sur l importance des populations de r f rence et donc du ph notypage pour de nouveaux caract res consid r s comme difficilement s lectionnables ainsi qu une affiche discr te mais tr s marquante pour la suite d crivant le mode d emploi de la s lection g nomique avec l arr t du testage sur descendance pour maximiser le progr s g n tique tout en maitrisant la consanguinit Au cours de cette session plusieurs belles histoires comme le bilan de dix ann es du programme tremblante la d couverte du g ne Texel belge en ovins les r sultats de Qualvig ne ainsi que l annonce de plusieurs gros projets qui allaient marquer les ann es suivantes 3SR ou Ph nofinlait Les ann es qui ont suivi ont fait l objet de pr sentations r guli res montrant l avancement de la th orie et des applications pratiques qui ont t rapides En 2010 ont t pr sent s les premiers r sultats validant la s lection g nomique chez les bovins laitiers ainsi que le principe des puces de basse densit pour r duire le co t du g notypage En 2011 ont t illustr s l int r t de la collaboration internationale au sein d Eurogenomics ainsi qu une validation des estimations g nomiques avec des r sultats sur descendance En 2012 sont pr sent s les premiers r sultats de la s lection g nomique en ovins laitiers montrant la possibilit de mettre en uvre au del des bovins laitiers mais aussi les difficult s surmonter qua
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