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0508 N. gonorrhoeae qPCR

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1. Limpeza limpe normalmente a rea afectada n o s o necess rios cuidados adicionais Protec o da pele use uma bata de laborat rio 12 Informa o ecol gica N o existem dados dispon veis 13 Informa o sobre a elimina o Elimine o material de acordo com toda a regulamenta o aplic vel Grupo IV res duos hospitalares espec ficos 14 Informa o sobre o transporte No transporte dos Kits devem estar a seguradas as temperaturas n o devendo ultrapassar os 15 C A dura o do transporte n o deve ser superior a 3 dias de modo a garantir que todos os componentes do Kit cheguem em perfeitas condi es aos seus destinat rios 15 Contactos teis N mero Nacional de Emerg ncia 112 Centro de Informa o Anti Venenos 808 250 143 16 Outras informa es As informa es a cima dispon veis s o baseados no n vel de conhecimento actual devendo ser utilizado apenas como guia A geneBOX R amp D Diagnostic Tests n o se responsabiliza por qualquer dano causado pela manipula o inapropriada ou pelo contacto com os referidos produtos Para mais esclarecimentos por favor contactem com o apoio t cnico para o 351 231 410 946 15 Refer ncias 1 Espy M Uhl J Sloan L Buckwalter S Jones M Vetter E Yao J Wengenack N Rosenblatt J Cockerill F Smith F Real Time PCR in Clinical Microbiology Applications for Routine Laboratory Testing Clin Microbiol Rev 2006 19 1 165 256 2 Geraats Peters C
2. Brouwers M Schneeberger P Zanden A Bruisten S Weers Pothoff G Boel C Brule A Harmsen H Hermans M Specific and Sensitive Detection of Neisseria gonorrhoeae in Clinical Specimens by Real Time PCR Clin Microbiol 2005 43 11 5653 5659 oqo eUe geneBox 000 DESENVOLVIMENTO E PRODU O DE TESTES DE DIAGNOSTICO geneBOX R amp D Diagnostic Tests biocant centro de inova o em biotecnologia n cleo 4 lote 3 3060 197 Cantanhede Portugal tel 351 231 410 946 fax 351 231 410 947 e mail info genebox com 16
3. Odor Mistura de primers l quido incolor nenhum Mistura de reac o l quido incolor nenhum Controlo Interno l quido incolor nenhum Controlo Positivo l quido incolor nenhum Controlo Negativo l quido incolor nenhum 13 Folha de Dados de Seguran a 2 3 Material Safety Data Sheet MSDS 4 Informa o Toxicol gica Qu mico Toxicidade ROX Contacto cut neo Provoca irrita o cut nea Absor o cut nea Pode ser nocivo se absorvido atrav s da pele Contacto ocular Provoca irrita o nos olhos Inala o Pode ser nocivo se inalado O material irritante para o trato respirat rio superior Ingest o Pode ser nocivo se deglutido 5 Estabilidade e reactividade Condi es a evitar Calor e humidade Incompatibilidades Bases e agentes oxidantes fortes 6 Protec o pessoal Protec o das m os use luvas apropriadas resistentes a qu micos Protec o dos olhos recomenda se o uso de culos de protec o qu mica 7 Manipula o e armazenamento Manipula o evite o contacto directo com a subst ncia Armazenamento armazene temperatura aconselhada proteja do contacto com a luz Danifica o da embalagem protectora rejeitar o constituinte contido na embalagem 8 Perigos Os componentes da mistura de reac o podem ser perigosos se inalados ingeridos ou absorvidos pela pele Este material pode causar irrita o da pele dos olhos e do tracto respirat rio A ingest o de grandes quantidades d
4. C digo do Produto 0508 Neisseria gonorrhoeae Qual qPCR Box 1 0 Dispositivo para utiliza o in vitro Manual de I nstru es fo ee genesox 000 DESENVOLVIMENTO E PRODU O DE TESTES DE DIAGN STICO Vers o1 2 Maio de 2010 1 Apresenta o Neisseria gonorrhoeae bact ria respons vel pela segunda doen a infecciosa sexualmente transmiss velmais comum a Gonorreia Diplococo Gram negativo de transmiss o sexual ou perinatal e com per odo de incuba o m dio de 2 a 4 dias Neisseria gonorrhoeae Qual qPCR Box 1 0 um teste para diagn stico molecular desta infec o genital com maior sensibilidade especificidade e rapidez do que os m todos tradicionais por cultura Neisseria gonorrhoeae Qual qPCR Box 1 0 detecta o gene opa Os genes opa codificam a fam lia de prote nas opa opacity proteins prote nas externas da membrana que se ligam s c lulas do hospedeiro presentes nas infec es causadas por Neisseria gonorrhoeae Altera es e melhoramento do Produto Este produto pode ser melhorado de modo a aumentar o seu rendimento As altera es adi es ou modifica es de NEIG Mix Controlo Interno Controlo Positivo ou Controlo Negativo em rela o ao lote anterior est o detalhadas na tabela abaixo Tubo Modifica o Motivo N A Controlo de Qualidade O kit Neisseria gonorrhoeae Qual qPCR Box 1 0 foi testado com DNAs extra dos de Culturas celulares das linhas ATCC43069 e AT
5. CC 49226 de Neisseria gonorrhoeae e outras esp cies de bact rias obtendo amostras positivas e negativas A Genebox garante a qualidade e a fiabilidade do seu kit Neisseria gonorrhoeae Qual qPCR Box 1 0 N Especificidade O kit Neisseria gonorrhoeae Qual qPCR Box 1 0 espec fico para a detec o do gene opa de Neisseria gonorrhoeae em DNA de amostras biol gicas A sua especificidade foi comprovada com DNAs extra dos de culturas celulares das linhas ATCC43069 e ATCC 49226 de Neisseria gonorrhoeae e outras esp cies de bact rias obtendo amostras positivas e negativas A especificidade do kit Neisseria gonorrhoeae Qual qPCR Box 1 0 conferida por NEIG mix que apresenta 100 de homologia com todas as sequ ncias de Neisseria gonorrhoeae registadas em bases de dados Sensibilidade A sensibilidade do kit Neisseria gonorrhoeae Qual qPCR Box 1 0 foi testada e a Genebox garante a detec o de n veis m nimos do gene opa do genoma de Neisseria gonorrhoeae at 10 ng de DNA Componentes do Neisseria gonorrhoeae Qual o e Mistura de reac o NEIG 1 tubo NEIG mix 2 ml conservar de 30 a 152C e Controlo Interno CI 1 tubo CI 500 ul conservar de 30 a 15 2C e Controlo Positivo CP ltubo CP 25 ul conservar de 30 a 15 2C e Controlo Negativo CN ltubo CN 25u4l conservar de 30 a 15 0 e Manual de instru es 1 Manual de Instru es Componentes da qPCR Master Mix Primers e sonda Concentra o fina
6. Como especificado na embalagem Se os problemas persistirem por favor contactem com o apoio t cnico para o 351 231 410 946 geneBOX investiga o e desenvolvimento de teste diagn sticos garante que os primers presentes no Neisseria gonorrhoeae Qual qPCR Box apresentam as especificidades dadas nas folhas e tabelas de interpreta o de resultados do produto 1 NEIG mix CI CP e CN Armazenamento a 202C NEIG mix Cl CP e CN permanecem est veis durante 12 meses a partir da data de produ o ver validade do lote na embalagem Armazenamento a 4 C de NEIG mix Cl CP e CN permanecem est veis durante 15 dias a partir da data de recep o temperatura ambiente NEIG mix CI CP e CN permanecem est veis durante 3 dias a partir da data de recep o NEIG mix Cl CP e CN nunca devem ser deixados ou armazenados com a tampa aberta 2 DNA O DNA extra do por salting out ou por qualquer outro m todo deve ser armazenado a 4 C ou 202C Ao optar pela congela o das amostras devem ser evitadas ciclos repetidos de congela o descongela o de modo a impedir a degrada o da amostra As amostras de DNA armazenadas em dH 0 permanecem est veis durante pelo menos 4 semanas a 4 C ou 2 anos a 20 C As amostras de DNA armazenadas em tamp o TE permanecem est veis durante pelo menos 2 anos a 42 C ou 5 anos a 202C 10 Aviso de garantia geneBOX investiga o e desenvolvimento de teste diagn sticos re
7. esta mistura pode causar dores de est mago v mitos ou diarreia 9 Medidas de Primeiros Socorros No caso de contacto com os olhos deve lavar imediatamente os olhos com gua abundante por cerca de 15 minutos Deve consultar o seu m dico No caso de contacto com a pele deve lavar imediatamente a zona afectada com gua corrente e sab o Lave a roupa contaminada antes da sua utiliza o No caso de ingest o lave a boca com gua abundante Deve contactar o seu m dico se necess rio No caso de inala o mudar a v tima para um local arejado Se encontrar inanimado aplique respira o artificial Se apresentar dificuldades respirat rias aplique oxig nio Deve consultar o seu m dico 10 Medidas a tomar em caso de inc ndio Meios de extin o gua di xido de carbono p qu mico seco ou espuma apropriada Meios de extin o n o aconselhados n o existem restri es conhecidas Perigos espec ficos de exposi o em caso de inc ndio podem emitir fumos t xicos de di xido e mon xido de carbono nitrog nio f sforo cloreto de hidrog nio e g s hidrog nio Equipamento especial de combate ao inc ndio quando s o libertadas grandes quantidades de subst ncia trabalhe apenas com protec o adequada para olhos e pele 14 Folha de Dados de Seguran a 3 3 Material Safety Data Sheet MSDS 11 Medidas a tomar no caso de derrame acidental Precau es pessoais evite o contacto directo com a subst ncia
8. l de cada 0 3 mM Nucle tidos Concentra o final de cada dNTP 0 5 mM Tamp o da PCR concentra es finais s o 4 mM MgCl e 0 4 u ul hot start Taq DNA polimerase pH 8 3 Rox Concentra o final de 15 nM Protocolo de amplifica o por PCR Reagentes e Amostra de DNA 100 200 ng ul e Mistura de reac o NEIG mix e Controlo interno CI e Controlo positivo CP e Controlo negativo CN e gua bi destilada est ril n o fornecida Este componente apresenta alto potencial contaminante dado conter DNA de Neisseria gonorrhoeae recomenda se o m ximo cuidado no seu manuseamento Extrac o de DNA Para a detec o de Neisseria gonorrhoeae por PCR em tempo real necess rio DNA extra puro Recomenda se que o isolamento de DNA seja efectuado utilizando kits de extrac o com marca o CE que garantam um r cio DO 260 280 maior do que 1 6 e uma concentra o entre 100ng 200 ng u Amplifica o por PCR 1 Agite brevemente todos os tubos do kit e os tubos de DNA 2 Para cada detec o pipete de acordo com a tabela Tubo NEIG mix Tubo Controlo Interno CI 2 5 ul DNA de amostra 2 54 Volume final 3 Para o controlo positivo proceder como em 2 substituindo o DNA de amostra por 2 5 ul de Tubo Controlo Positivo CP 4 Para o controlo negativo proceder como em 2 substituindo o Controlo Interno por 2 5 ul de gua bidestilada est ril e o DNA de amostra por 2 5 ul de Tubo controlo
9. m de DO superior a 1 6 e uma por o de DNA superior a 9 4 kb A elevada degrada o do DNA ou uma raz o 260nm 280nm inferior a 1 5 requer uma nova extrac o de DNA Cada amostra de DNA deve ter aproximadamente 100 a 200 ng ul Concentra es elevadas de DNA provocam um decl nio consider vel na especificidade da PCR Recomenda se o uso de qualquer kit de extrac o de DNA que apresente marca o CE de modo a obter um DNA extra puro 2 DNA Polimerase O Neisseria gonorrhoeae Qual qPCR Box 1 0 foi intensivamente testado utilizando a DNA polimerase da Reagente 5 Reagente 5 Lisboa Portugal 3 NEIG mix Para uma boa performance detec o de Neisseria gonorrhoeae com o Neisseria gonorrhoeae Qual qPCR Box 1 0 obrigat ria a utiliza o da NEIG Mix fornecida com o Kit 4 Procedimentos de amplifica o Para uma correcta utiliza o do kit aconselha se a seguir o programa de PCR apresentado neste Manual de Instru es 5 Termociclador Este kit foi optimizado em Applied Biosystems 7500 Recomenda se utiliza o de um equipamento de qPCR que apresente as seguintes caracter sticas Excita o e emiss o pelo menos at 494 nm e 521 nm heating rate m nima de 1 6 C seg cooling rate m nima de 1 6 C seg gama de temperaturas 4 1002C uniformidade de temperaturas 0 52C heated lid superior a 1002C calibrado para fluoresc ncias ROX FAM e JOE e Software de an lise de resultados 6 Validade
10. negativo CN NOTA Cada detec o deve ser realizada com pelo menos duas reac es em duplicado Por cada utiliza o do kit deve correr pelo menos uma reac o CP Programa PCR Fim 4 C Infinito 1 A detec o de fluoresc ncia nos canais FAM e JOE deve ser coleccionada no final de cada extens o An lise de resultados Tabela de Interpreta o de resultados Tabela I Interpreta o de an lises v lidas Po o Neisseria Controlo gonorrhoeae Interno Interpreta o Valida o Fluoresc ncia Fluoresc ncia FAM JOE pe RR Positivo Negativo esfe e Te e positive Negativo Tabela Il Interpreta o de an lises n o v lidas Po o AGES Controlo gonorrhoeae Interno Interpreta o Valida o Fluoresc ncia Fluoresc ncia FAM JOE Positivo reac o negative reac o O ea o positivo invalido reac o positivo invalido reac o positivo invalido reac o Controlo Repetir negativo reac o inv lido Controlo Repetir negativo reac o inv lido Controlo Repetir negativo reac o inv lido Guia de resolu o de problemas PROBLEMAS 1 Valores de Ct para a amostra muito elevados 2 Os controlos internos falharam em diversos po os 3 Falsos negativos e Controlo Interno normal 4 Falsos positivos e Controlo Interno normal 5 Resultados amb guos 6 Ru do de fluoresc ncia 7 Aus ncia total de fluoresc ncia Poss veis Causas a Concent
11. om o Anexo IV transposto para as leis nacionais dos estados membros da Uni o Europeia Europeia A ficha e os documentos t cnicos deste produto s o mantidos na geneBOX biocant centro de inova o em biotecnologia 3060 197 Cantanhede Portugal Cantanhede Portugal 21 Maio 2010 Sandra Balseiro Directora T cnica 12 Folha de Dados de Seguran a 1 3 Material Safety Data Sheet MSDS geneBOX R amp D Diagnostic Tests qPCR Kits Produtos qPCR da geneBOX Esta folha de dados de seguran a aplic vel a todos os produtos de qPCR da geneBOX 1 Produtos Qu micos e dentifica o da Companhia Data de realiza o Maio 2010 Grupo do produto Produtos de PCR em tempo real da geneBOX Manufactura o geneBOX R amp D Diagnostic Tests biocant centro de inova o em biotecnologia n cleo 4 lote 3 3060 197 Cantanhede Portugal tel 351 231410946 fax 351 231 410947 e mail info genebox com 2 Composi o e Informa o sobre os reagentes Componente Qu mico Nome vulgar N de lote Mistura de primers Acido Desoxiribonucleico Oligonucle tido Mistura de reac o Desoxiribonucle tidos Nucle tidos Tamp o Cloreto de Magn sio MgCI2 Carboxi x rodamina Rox DNA polimerase Controlo interno Acido Desoxiribonucleico Oligonucle tido Controlo positivo Acido Desoxiribonucleico DNA Controlo negativo H20 gua bidestilada est ril 3 Propriedades f sico qu micas Componente Aspecto Cor
12. ra o do DNA baixa b Degrada o do DNA c Presen a de inibidores da Taq polimerase nas amostras de DNA d Excesso de DNA e Contamina o com outros produtos de PCR ou outras amostras de DNA durante a prepara o das reac es de PCR f Equipamento descalibrado g Contamina o dos reagentes do kit SUGEST ES 1 Verifique a qualidade e concentra o do DNA 2 Re purifique o DNA e dilua o em gua desionisada destilada 3 Ajuste a concentra o do DNA para a desejada 4 Repita a detec o reac o com o DNA com maior qualidade 5 Separe a zona de extrac o de DNA da zona de prepara o das reac es 6 Vista uma bata diferente para cada sala 7 Esterilize bem a zona de trabalho 8 Mude v rias vezes de luvas especialmente na transi o da zona de manuseamento de amostras cl nicas para a zona de prepara o da reac o 9 Verifique a compatibilidade das placas de PCR em tempo real e respectivos selantes com o equipamento de PCR em tempo real utilizado 10 Verifique a correcta utiliza o do equipamento de PCR em tempo real e respectivo software de an lise 11 Verifique a calibra o do equipamento par metros t rmicos e de fluoresc ncia e calibra o de pipetas Guia T cnico 1 Pureza e Concentra o do DNA Para obter bons resultados com o Neisseria gonorrhoeae Qual qPCR Box 1 0 a pureza da amostra de DNA cr tica Ter uma amostra pura significa obter uma raz o 260nm 280n
13. sponsabiliza se perante os seus clientes pelos defeitos no material e componentes dos seus produtos aplicados em condi es normais Os produtos da empresa que apresentam esta garantia devem ser substitu dos sem encargos para o cliente Esta garantia aplica se s para produtos que sejam manipulados e armazenados de acordo com as especifica es e recomenda es de utiliza o As reclama es devem ser enviadas por escrito directamente para a geneBOX e devem ser acompanhadas por uma c pia da guia de transporte ou factura do produto Este produto n o pode ser reformulado reembalado ou revendido em nenhuma forma sem o expresso consentimento da geneBOX investiga o e desenvolvimento de teste diagn sticos 11 Declara o de Conformidade Nome do Produto Neisseria gonorrhoeae Qual qPCR Box 1 0 Numero do Produto GB 05 08 Utiliza o Detec o de Neisseria gonorrhoeae Produ o geneBOX R amp D Diagnostic Tests biocant centro de inova o em biotecnologia n cleo 4 lote 3 3060 197 cantanhede portugal N s geneBOX investiga o e desenvolvimento de testes de diagn stico indubitavelmente declaramos que este produto ao qual se relaciona esta declara o de conformidade est em conformidade com os seguintes documentos normativos ISO 9001 2008 e ISO 13485 2004 Seguindo ainda as indica es da Directiva Europeia 98 79 CE sobre dispositivos m dicos de diagn stico in vitro conformidade de acordo c

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